View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8263_low_1 (Length: 888)

Name: NF8263_low_1
Description: NF8263
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8263_low_1
NF8263_low_1
[»] scaffold0260 (2 HSPs)
scaffold0260 (25-520)||(2414-2909)
scaffold0260 (560-694)||(2949-3083)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (25-520)||(20340091-20340586)
chr1 (25-520)||(20461085-20461580)
chr1 (25-520)||(28151866-28152361)
chr1 (25-520)||(16207787-16208282)
chr1 (560-881)||(20460748-20461069)
chr1 (560-881)||(16208319-16208640)
chr1 (44-520)||(41793083-41793559)
chr1 (42-520)||(10962674-10963152)
chr1 (42-520)||(28584985-28585463)
chr1 (42-520)||(51638222-51638700)
chr1 (560-694)||(20340626-20340760)
chr1 (582-880)||(41793624-41793922)
chr1 (690-829)||(10962362-10962501)
chr1 (690-829)||(51637910-51638049)
chr1 (615-820)||(28584682-28584887)
[»] chr3 (120 HSPs)
chr3 (25-520)||(16626303-16626798)
chr3 (25-520)||(18530354-18530849)
chr3 (25-520)||(31033914-31034409)
chr3 (25-520)||(32292718-32293213)
chr3 (25-520)||(5652353-5652848)
chr3 (25-520)||(4625910-4626405)
chr3 (25-520)||(17993581-17994076)
chr3 (560-881)||(16626838-16627158)
chr3 (560-881)||(18529999-18530320)
chr3 (25-517)||(5713196-5713688)
chr3 (25-517)||(5724106-5724598)
chr3 (25-517)||(5767770-5768262)
chr3 (14-520)||(18051228-18051734)
chr3 (42-520)||(8295938-8296416)
chr3 (14-520)||(15892492-15892998)
chr3 (42-520)||(18330635-18331113)
chr3 (85-517)||(5756940-5757371)
chr3 (44-520)||(15740910-15741386)
chr3 (42-520)||(8301081-8301559)
chr3 (14-520)||(4796439-4796945)
chr3 (42-520)||(6192282-6192760)
chr3 (42-520)||(4721597-4722075)
chr3 (14-520)||(29148541-29149047)
chr3 (42-520)||(35880732-35881210)
chr3 (42-520)||(7073178-7073656)
chr3 (579-869)||(15893060-15893350)
chr3 (42-520)||(22387392-22387870)
chr3 (42-520)||(18292167-18292645)
chr3 (42-520)||(28115768-28116246)
chr3 (111-520)||(4416885-4417294)
chr3 (42-520)||(10396099-10396577)
chr3 (42-520)||(18276866-18277344)
chr3 (42-520)||(18307468-18307946)
chr3 (42-517)||(48465896-48466371)
chr3 (42-519)||(6542276-6542753)
chr3 (44-517)||(36996893-36997366)
chr3 (42-517)||(11110163-11110638)
chr3 (42-520)||(21674659-21675137)
chr3 (579-880)||(8301618-8301919)
chr3 (42-517)||(20576661-20577136)
chr3 (42-517)||(29664784-29665259)
chr3 (42-520)||(28021241-28021719)
chr3 (44-520)||(5609138-5609614)
chr3 (42-457)||(51782052-51782467)
chr3 (42-511)||(8211713-8212182)
chr3 (579-880)||(8295578-8295879)
chr3 (579-880)||(18050865-18051166)
chr3 (44-520)||(28339268-28339744)
chr3 (33-519)||(20066010-20066496)
chr3 (42-520)||(47023419-47023897)
chr3 (579-880)||(4797007-4797308)
chr3 (77-518)||(5466953-5467394)
chr3 (579-880)||(15741436-15741737)
chr3 (44-520)||(17984772-17985248)
chr3 (44-520)||(31964289-31964765)
chr3 (44-520)||(32439120-32439596)
chr3 (77-520)||(4346536-4346979)
chr3 (42-519)||(18242706-18243183)
chr3 (42-511)||(5013687-5014156)
chr3 (42-519)||(5596171-5596648)
chr3 (77-520)||(22870705-22871148)
chr3 (77-520)||(22885764-22886207)
chr3 (149-520)||(50133992-50134363)
chr3 (579-880)||(35880369-35880670)
chr3 (44-445)||(24328200-24328601)
chr3 (582-880)||(4721234-4721532)
chr3 (78-520)||(7996528-7996970)
chr3 (78-520)||(10643036-10643478)
chr3 (579-880)||(29149109-29149410)
chr3 (78-520)||(18225157-18225599)
chr3 (579-880)||(18330277-18330573)
chr3 (149-457)||(51797141-51797450)
chr3 (582-880)||(6191919-6192217)
chr3 (571-880)||(8211344-8211653)
chr3 (570-694)||(17994126-17994250)
chr3 (582-880)||(28116314-28116612)
chr3 (579-694)||(4625736-4625851)
chr3 (582-880)||(7072815-7073113)
chr3 (571-880)||(18277398-18277707)
chr3 (571-880)||(18292699-18293008)
chr3 (571-880)||(18308000-18308309)
chr3 (570-694)||(5652179-5652303)
chr3 (571-790)||(20065739-20065958)
chr3 (571-869)||(10395750-10396048)
chr3 (582-880)||(47023056-47023354)
chr3 (615-829)||(22871264-22871478)
chr3 (615-829)||(22886323-22886537)
chr3 (615-796)||(5466672-5466853)
chr3 (615-820)||(5596756-5596961)
chr3 (582-694)||(5713016-5713128)
chr3 (582-694)||(5723926-5724038)
chr3 (582-694)||(5757439-5757551)
chr3 (582-694)||(5768330-5768442)
chr3 (582-832)||(7996213-7996463)
chr3 (582-832)||(10642721-10642971)
chr3 (615-797)||(18224877-18225059)
chr3 (591-880)||(21674296-21674585)
chr3 (702-880)||(5013315-5013493)
chr3 (690-868)||(6542939-6543117)
chr3 (615-797)||(17985346-17985528)
chr3 (615-797)||(28020964-28021146)
chr3 (582-820)||(36997446-36997684)
chr3 (696-797)||(4347155-4347256)
chr3 (321-520)||(4893176-4893375)
chr3 (582-829)||(11110718-11110965)
chr3 (690-829)||(18242381-18242520)
chr3 (690-829)||(20577327-20577466)
chr3 (690-820)||(51781674-51781804)
chr3 (690-796)||(4416603-4416709)
chr3 (690-820)||(24327822-24327952)
chr3 (690-796)||(28338989-28339095)
chr3 (690-796)||(31964938-31965044)
chr3 (690-796)||(50134536-50134642)
chr3 (582-766)||(29665342-29665526)
chr3 (690-793)||(5609787-5609890)
chr3 (690-820)||(51796762-51796893)
chr3 (571-719)||(22387921-22388069)
chr3 (690-829)||(48465569-48465708)
chr3 (571-869)||(32438771-32439069)
chr3 (571-719)||(4892977-4893125)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (25-520)||(16449640-16450135)
chr7 (25-520)||(26484700-26485195)
chr7 (25-520)||(39210665-39211160)
chr7 (26-520)||(2775365-2775859)
chr7 (25-520)||(16041329-16041824)
chr7 (35-520)||(2108657-2109142)
chr7 (25-520)||(31088106-31088601)
chr7 (25-520)||(45733466-45733961)
chr7 (25-391)||(26682642-26683008)
chr7 (25-391)||(4200682-4201048)
chr7 (560-869)||(16040980-16041289)
chr7 (563-881)||(16450178-16450496)
chr7 (42-520)||(5127998-5128476)
chr7 (14-520)||(2154579-2155085)
chr7 (14-520)||(10916499-10917005)
chr7 (42-520)||(11424435-11424913)
chr7 (44-520)||(18540805-18541281)
chr7 (14-520)||(16518047-16518553)
chr7 (14-520)||(16503011-16503517)
chr7 (579-880)||(16518615-16518916)
chr7 (579-880)||(16503579-16503880)
chr7 (42-520)||(5146999-5147477)
chr7 (78-520)||(26274789-26275231)
chr7 (42-520)||(26435263-26435741)
chr7 (44-517)||(3445315-3445788)
chr7 (42-520)||(26319528-26320006)
chr7 (78-520)||(4144818-4145260)
chr7 (42-520)||(26669573-26670051)
chr7 (42-519)||(31564049-31564526)
chr7 (44-520)||(16736121-16736597)
chr7 (44-520)||(16751175-16751651)
chr7 (44-520)||(17523538-17524014)
chr7 (44-520)||(17529201-17529677)
chr7 (42-520)||(9618657-9619135)
chr7 (42-517)||(26537529-26538004)
chr7 (77-511)||(11441587-11442021)
chr7 (78-520)||(45387349-45387791)
chr7 (579-880)||(2154216-2154517)
chr7 (78-445)||(24592236-24592603)
chr7 (579-880)||(5127635-5127936)
chr7 (44-520)||(5159525-5160001)
chr7 (579-880)||(10917064-10917365)
chr7 (42-519)||(31124927-31125404)
chr7 (579-880)||(11424975-11425276)
chr7 (570-694)||(31088651-31088775)
chr7 (570-694)||(45733292-45733416)
chr7 (582-832)||(45387034-45387284)
chr7 (582-880)||(5147542-5147840)
chr7 (582-880)||(16736662-16736960)
chr7 (582-880)||(16751716-16752014)
chr7 (582-880)||(17523175-17523473)
chr7 (582-880)||(17529742-17530040)
chr7 (690-880)||(31124554-31124744)
chr7 (582-820)||(11441263-11441501)
chr7 (690-880)||(24592851-24593041)
chr7 (571-796)||(4145314-4145539)
chr7 (690-829)||(9618345-9618484)
chr7 (690-797)||(26275404-26275511)
chr7 (582-880)||(26434900-26435198)
chr7 (690-795)||(26320179-26320284)
chr7 (690-797)||(3445020-3445127)
chr7 (582-797)||(26485946-26486161)
chr7 (582-829)||(26538075-26538322)
chr7 (690-829)||(26670224-26670363)
chr7 (690-797)||(31564709-31564816)
chr7 (571-719)||(5159326-5159474)
chr7 (42-177)||(26513130-26513265)
[»] chr2 (84 HSPs)
chr2 (25-520)||(19456166-19456661)
chr2 (25-520)||(21702909-21703404)
chr2 (25-520)||(16163600-16164098)
chr2 (25-520)||(27118689-27119184)
chr2 (25-520)||(34303048-34303543)
chr2 (25-520)||(3784655-3785150)
chr2 (25-520)||(34157012-34157506)
chr2 (25-520)||(31891073-31891568)
chr2 (560-881)||(19456701-19457022)
chr2 (25-520)||(22925773-22926268)
chr2 (560-881)||(21703444-21703765)
chr2 (192-517)||(27392973-27393298)
chr2 (42-520)||(27434206-27434684)
chr2 (42-520)||(28882215-28882693)
chr2 (42-520)||(12655543-12656021)
chr2 (42-520)||(20837919-20838397)
chr2 (76-520)||(23128362-23128806)
chr2 (579-869)||(27434746-27435036)
chr2 (42-517)||(9349744-9350219)
chr2 (42-517)||(40233515-40233990)
chr2 (41-520)||(34286355-34286834)
chr2 (41-520)||(34291415-34291894)
chr2 (42-520)||(11634948-11635426)
chr2 (560-881)||(27392630-27392951)
chr2 (42-517)||(13936306-13936781)
chr2 (42-520)||(11641137-11641615)
chr2 (42-520)||(32049799-32050277)
chr2 (42-517)||(12586814-12587289)
chr2 (42-517)||(27777226-27777701)
chr2 (42-517)||(27816984-27817459)
chr2 (42-520)||(21676944-21677422)
chr2 (42-520)||(34861681-34862159)
chr2 (42-520)||(37685671-37686149)
chr2 (42-520)||(37700936-37701414)
chr2 (42-520)||(37925494-37925972)
chr2 (579-880)||(23128868-23129169)
chr2 (579-880)||(28881852-28882153)
chr2 (42-519)||(37375163-37375640)
chr2 (42-517)||(27803711-27804186)
chr2 (42-517)||(39051584-39052059)
chr2 (42-520)||(16829100-16829578)
chr2 (42-520)||(16891903-16892381)
chr2 (44-517)||(12716366-12716839)
chr2 (42-520)||(31876282-31876760)
chr2 (579-880)||(20837556-20837857)
chr2 (42-511)||(260515-260984)
chr2 (579-880)||(12655180-12655481)
chr2 (44-520)||(39890075-39890551)
chr2 (42-445)||(19416261-19416664)
chr2 (560-694)||(31891608-31891742)
chr2 (560-694)||(27118515-27118649)
chr2 (570-694)||(3784481-3784605)
chr2 (570-694)||(34156838-34156962)
chr2 (579-694)||(34303602-34303717)
chr2 (306-520)||(34279450-34279664)
chr2 (570-694)||(16163426-16163550)
chr2 (582-880)||(34279087-34279385)
chr2 (582-829)||(13936849-13937096)
chr2 (582-796)||(21677487-21677701)
chr2 (696-880)||(37374799-37374983)
chr2 (582-829)||(261070-261317)
chr2 (582-880)||(11635494-11635792)
chr2 (582-880)||(11641683-11641981)
chr2 (582-829)||(34286043-34286290)
chr2 (582-829)||(34291103-34291350)
chr2 (615-797)||(12716943-12717125)
chr2 (582-829)||(37925182-37925429)
chr2 (690-829)||(12586490-12586629)
chr2 (690-797)||(31876002-31876109)
chr2 (690-797)||(34861401-34861508)
chr2 (690-797)||(37686322-37686429)
chr2 (690-797)||(37701587-37701694)
chr2 (690-797)||(39889783-39889890)
chr2 (582-829)||(40233188-40233435)
chr2 (582-790)||(32049526-32049734)
chr2 (690-829)||(9350407-9350546)
chr2 (702-797)||(16829763-16829858)
chr2 (702-797)||(16891623-16891718)
chr2 (690-829)||(27776896-27777035)
chr2 (690-829)||(27803381-27803520)
chr2 (690-829)||(27816663-27816802)
chr2 (690-820)||(19416912-19417042)
chr2 (690-796)||(22926441-22926547)
chr2 (576-829)||(39052127-39052380)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (25-520)||(15284684-15285179)
chr4 (25-520)||(15227890-15228385)
chr4 (25-520)||(1900277-1900772)
chr4 (25-520)||(24460361-24460856)
chr4 (25-517)||(15391094-15391586)
chr4 (14-520)||(14235270-14235776)
chr4 (560-879)||(15285219-15285538)
chr4 (560-881)||(15227529-15227850)
chr4 (560-881)||(1899916-1900237)
chr4 (14-520)||(17014020-17014526)
chr4 (42-520)||(24592087-24592565)
chr4 (42-520)||(14665038-14665516)
chr4 (560-881)||(14235819-14236140)
chr4 (42-520)||(14763077-14763555)
chr4 (42-520)||(6569873-6570351)
chr4 (42-519)||(36344288-36344765)
chr4 (111-520)||(5005893-5006302)
chr4 (42-519)||(18800386-18800863)
chr4 (42-520)||(14098561-14099039)
chr4 (42-520)||(31126291-31126769)
chr4 (42-520)||(40105411-40105889)
chr4 (579-880)||(14664675-14664976)
chr4 (44-520)||(24112682-24113158)
chr4 (44-520)||(27163092-27163568)
chr4 (42-517)||(33673571-33674046)
chr4 (44-517)||(30753777-30754250)
chr4 (44-520)||(34188735-34189211)
chr4 (579-880)||(17013657-17013958)
chr4 (42-520)||(21969721-21970199)
chr4 (42-519)||(54833408-54833885)
chr4 (584-881)||(15391650-15391948)
chr4 (42-517)||(39850661-39851136)
chr4 (579-880)||(24592624-24592925)
chr4 (579-880)||(6569510-6569811)
chr4 (570-694)||(24460906-24461030)
chr4 (571-880)||(14763609-14763918)
chr4 (571-880)||(36344817-36345126)
chr4 (598-880)||(19372918-19373200)
chr4 (582-880)||(27163633-27163931)
chr4 (588-829)||(54833098-54833339)
chr4 (582-880)||(5005527-5005825)
chr4 (615-880)||(14098198-14098463)
chr4 (582-797)||(30753482-30753697)
chr4 (615-797)||(31126867-31127049)
chr4 (615-820)||(18800971-18801176)
chr4 (690-820)||(33674234-33674364)
chr4 (690-868)||(40106062-40106240)
chr4 (582-797)||(21969441-21969656)
chr4 (690-829)||(39850331-39850470)
chr4 (571-719)||(24112483-24112631)
chr4 (571-719)||(34189262-34189410)
[»] chr6 (92 HSPs)
chr6 (25-520)||(14142984-14143479)
chr6 (25-520)||(26787946-26788441)
chr6 (25-520)||(27196319-27196814)
chr6 (25-520)||(27252426-27252921)
chr6 (25-520)||(13521772-13522267)
chr6 (25-520)||(22456642-22457128)
chr6 (25-520)||(8892010-8892504)
chr6 (25-520)||(8903245-8903739)
chr6 (25-520)||(33373955-33374450)
chr6 (25-520)||(28162659-28163154)
chr6 (14-520)||(27290058-27290564)
chr6 (42-517)||(27272296-27272771)
chr6 (14-520)||(13298639-13299145)
chr6 (42-520)||(22934596-22935074)
chr6 (42-520)||(23857041-23857519)
chr6 (42-520)||(26989003-26989481)
chr6 (294-520)||(22477241-22477467)
chr6 (42-520)||(26918382-26918860)
chr6 (14-520)||(24304306-24304812)
chr6 (15-520)||(16749856-16750361)
chr6 (14-520)||(15424005-15424511)
chr6 (14-520)||(24863719-24864225)
chr6 (44-520)||(29549477-29549953)
chr6 (40-519)||(20160704-20161183)
chr6 (40-519)||(22171648-22172127)
chr6 (42-519)||(4773009-4773486)
chr6 (15-313)||(17092129-17092427)
chr6 (42-520)||(29573015-29573493)
chr6 (42-511)||(4545491-4545960)
chr6 (42-517)||(34463062-34463537)
chr6 (573-881)||(20160345-20160650)
chr6 (573-881)||(22172181-22172486)
chr6 (42-519)||(4757767-4758244)
chr6 (579-880)||(13299207-13299508)
chr6 (579-880)||(24863356-24863657)
chr6 (42-517)||(16674144-16674619)
chr6 (44-519)||(27007730-27008205)
chr6 (579-880)||(15424573-15424874)
chr6 (44-519)||(4525289-4525764)
chr6 (44-519)||(27359710-27360185)
chr6 (44-519)||(27450053-27450528)
chr6 (582-880)||(22935136-22935434)
chr6 (582-880)||(23857581-23857879)
chr6 (42-520)||(30557732-30558210)
chr6 (42-511)||(4723850-4724319)
chr6 (579-880)||(26988640-26988941)
chr6 (579-880)||(26999712-27000013)
chr6 (42-517)||(3696086-3696561)
chr6 (201-520)||(27000075-27000394)
chr6 (42-511)||(28207465-28207934)
chr6 (15-519)||(27485132-27485636)
chr6 (42-445)||(16943743-16944146)
chr6 (44-519)||(29501418-29501893)
chr6 (579-829)||(24304874-24305124)
chr6 (15-519)||(26116099-26116603)
chr6 (42-519)||(27044390-27044868)
chr6 (579-880)||(16749493-16749794)
chr6 (579-723)||(22477529-22477673)
chr6 (582-829)||(26918070-26918317)
chr6 (149-519)||(17025280-17025650)
chr6 (44-520)||(26777328-26777809)
chr6 (560-694)||(28162485-28162619)
chr6 (570-694)||(13522317-13522441)
chr6 (570-694)||(33374500-33374624)
chr6 (560-694)||(8892544-8892678)
chr6 (560-694)||(8903779-8903913)
chr6 (571-880)||(29549117-29549426)
chr6 (571-880)||(27044029-27044338)
chr6 (582-880)||(3695702-3696000)
chr6 (611-797)||(4525011-4525197)
chr6 (615-880)||(17024901-17025166)
chr6 (690-797)||(4757483-4757590)
chr6 (690-829)||(4772687-4772826)
chr6 (690-829)||(27007402-27007541)
chr6 (690-829)||(27484807-27484946)
chr6 (690-797)||(29572735-29572842)
chr6 (615-829)||(29501096-29501310)
chr6 (615-797)||(30558308-30558490)
chr6 (690-829)||(34463728-34463867)
chr6 (690-880)||(4546151-4546341)
chr6 (690-820)||(16944394-16944524)
chr6 (690-880)||(28207081-28207271)
chr6 (615-796)||(26777919-26778100)
chr6 (15-271)||(27629389-27629645)
chr6 (690-797)||(27360377-27360484)
chr6 (690-797)||(27450720-27450827)
chr6 (15-197)||(27019461-27019643)
chr6 (690-829)||(16673817-16673956)
chr6 (690-868)||(4724510-4724688)
chr6 (696-797)||(26116792-26116893)
chr6 (582-868)||(27629968-27630254)
chr6 (687-868)||(27272947-27273128)
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (25-520)||(33877261-33877756)
chr5 (25-520)||(22888484-22888979)
chr5 (25-520)||(25199043-25199538)
chr5 (25-520)||(13184302-13184796)
chr5 (25-520)||(29888735-29889230)
chr5 (15-520)||(23892220-23892725)
chr5 (25-520)||(11325808-11326303)
chr5 (25-520)||(13440147-13440642)
chr5 (560-882)||(23891855-23892177)
chr5 (560-881)||(25198682-25199003)
chr5 (25-520)||(9548196-9548691)
chr5 (17-520)||(23752095-23752598)
chr5 (42-520)||(24687827-24688305)
chr5 (14-520)||(30934647-30935153)
chr5 (17-520)||(33777501-33778004)
chr5 (42-520)||(23717658-23718136)
chr5 (42-520)||(11549368-11549846)
chr5 (14-520)||(24970032-24970538)
chr5 (42-520)||(22998784-22999262)
chr5 (42-520)||(15658430-15658908)
chr5 (579-880)||(24688367-24688668)
chr5 (42-520)||(12132169-12132647)
chr5 (44-511)||(31431463-31431930)
chr5 (42-520)||(9317465-9317943)
chr5 (42-519)||(18500400-18500877)
chr5 (42-519)||(28649250-28649727)
chr5 (42-519)||(37671153-37671630)
chr5 (44-520)||(2511065-2511541)
chr5 (42-520)||(6874319-6874797)
chr5 (42-520)||(41674723-41675201)
chr5 (44-517)||(31826079-31826552)
chr5 (44-520)||(30152032-30152508)
chr5 (42-520)||(30168483-30168961)
chr5 (42-517)||(43078269-43078744)
chr5 (42-519)||(37358313-37358790)
chr5 (44-520)||(32599144-32599620)
chr5 (46-517)||(40473223-40473694)
chr5 (42-520)||(8665145-8665623)
chr5 (42-520)||(26480406-26480883)
chr5 (42-520)||(33516370-33516848)
chr5 (579-880)||(23752660-23752961)
chr5 (44-517)||(24681457-24681930)
chr5 (44-517)||(24723984-24724457)
chr5 (579-880)||(30934287-30934588)
chr5 (44-520)||(15758529-15759005)
chr5 (42-445)||(30029504-30029907)
chr5 (78-520)||(5637924-5638366)
chr5 (42-520)||(18375082-18375560)
chr5 (686-880)||(24951761-24951955)
chr5 (42-519)||(13324499-13324976)
chr5 (44-520)||(33292539-33293015)
chr5 (579-880)||(23718198-23718500)
chr5 (42-520)||(34616532-34617010)
chr5 (42-519)||(3789556-3790033)
chr5 (579-880)||(11549005-11549306)
chr5 (560-717)||(22888287-22888444)
chr5 (42-519)||(37770657-37771134)
chr5 (42-520)||(28959456-28959934)
chr5 (111-445)||(29966805-29967139)
chr5 (579-880)||(33777138-33777439)
chr5 (42-519)||(37754995-37755472)
chr5 (579-879)||(22999324-22999624)
chr5 (570-694)||(13184846-13184970)
chr5 (570-694)||(13440692-13440816)
chr5 (570-694)||(33877087-33877211)
chr5 (582-829)||(9548756-9549003)
chr5 (560-694)||(11325634-11325768)
chr5 (582-880)||(15658973-15659271)
chr5 (582-820)||(41674420-41674658)
chr5 (582-829)||(31431130-31431377)
chr5 (615-829)||(2510753-2510967)
chr5 (582-796)||(8665688-8665902)
chr5 (690-868)||(40473873-40474051)
chr5 (690-829)||(9317153-9317292)
chr5 (582-829)||(30168171-30168418)
chr5 (615-797)||(24681171-24681353)
chr5 (615-797)||(24723698-24723880)
chr5 (582-880)||(43077900-43078198)
chr5 (615-880)||(18375658-18375923)
chr5 (690-829)||(6874004-6874143)
chr5 (690-797)||(12131889-12131996)
chr5 (582-829)||(18500961-18501208)
chr5 (690-797)||(37771320-37771427)
chr5 (582-880)||(3789177-3789475)
chr5 (690-880)||(5637561-5637751)
chr5 (690-832)||(15759178-15759320)
chr5 (579-677)||(24969878-24969976)
chr5 (702-880)||(30151669-30151847)
chr5 (690-868)||(37358976-37359154)
chr5 (690-829)||(26480094-26480233)
chr5 (690-797)||(31826740-31826847)
chr5 (690-797)||(37671813-37671920)
chr5 (690-829)||(37754670-37754809)
chr5 (615-797)||(33516090-33516272)
chr5 (615-829)||(34616223-34616437)
chr5 (615-797)||(32599715-32599897)
chr5 (690-829)||(13325165-13325304)
chr5 (702-820)||(28648937-28649055)
chr5 (691-797)||(28960120-28960226)
chr5 (690-820)||(29967387-29967517)
chr5 (690-820)||(30029126-30029256)
chr5 (571-719)||(33292340-33292488)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (25-520)||(44563106-44563599)
chr8 (25-520)||(19658755-19659249)
chr8 (25-520)||(33244670-33245165)
chr8 (26-517)||(22080594-22081085)
chr8 (25-520)||(18710591-18711086)
chr8 (77-520)||(9354627-9355071)
chr8 (42-520)||(16283454-16283932)
chr8 (14-520)||(16277559-16278065)
chr8 (14-520)||(27608609-27609115)
chr8 (42-520)||(19688103-19688581)
chr8 (14-520)||(2136963-2137469)
chr8 (14-520)||(14557629-14558135)
chr8 (579-880)||(16283091-16283392)
chr8 (44-520)||(31489484-31489960)
chr8 (42-519)||(3329239-3329716)
chr8 (44-520)||(19674446-19674922)
chr8 (42-520)||(19208092-19208570)
chr8 (579-880)||(16277196-16277497)
chr8 (579-880)||(19687740-19688041)
chr8 (42-520)||(28361687-28362165)
chr8 (560-881)||(22081125-22081446)
chr8 (44-520)||(31354529-31355005)
chr8 (44-519)||(29829328-29829803)
chr8 (579-880)||(2137531-2137832)
chr8 (42-519)||(12092456-12092933)
chr8 (42-519)||(19286468-19286945)
chr8 (579-880)||(14557269-14557570)
chr8 (42-445)||(33258803-33259206)
chr8 (579-880)||(27609177-27609478)
chr8 (106-363)||(189256-189513)
chr8 (570-694)||(19659299-19659423)
chr8 (579-694)||(44562932-44563047)
chr8 (570-694)||(9354453-9354577)
chr8 (582-880)||(18710228-18710526)
chr8 (582-880)||(19674080-19674378)
chr8 (588-829)||(19286158-19286399)
chr8 (582-820)||(31490025-31490263)
chr8 (571-796)||(31354250-31354475)
chr8 (690-797)||(19208743-19208850)
chr8 (702-829)||(28362350-28362477)
chr8 (690-868)||(3329902-3330080)
chr8 (690-868)||(29828967-29829145)
chr8 (690-829)||(19518526-19518665)
chr8 (690-820)||(33258425-33258555)
chr8 (690-880)||(12093116-12093306)
chr8 (14-125)||(18791107-18791218)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (35-517)||(21569-22051)
scaffold0109 (560-881)||(21208-21529)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (560-881)||(20053-20374)
scaffold0124 (183-520)||(20393-20729)
scaffold0124 (42-445)||(30532-30935)
scaffold0124 (579-880)||(30095-30396)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (242-520)||(1-279)
[»] scaffold0415 (3 HSPs)
scaffold0415 (183-455)||(1832-2103)
scaffold0415 (42-457)||(6080-6497)
scaffold0415 (690-829)||(5682-5821)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (42-379)||(391-728)
[»] scaffold0089 (6 HSPs)
scaffold0089 (42-520)||(46758-47236)
scaffold0089 (46-520)||(39846-40320)
scaffold0089 (14-520)||(29768-30274)
scaffold0089 (579-880)||(29405-29706)
scaffold0089 (582-880)||(40385-40683)
scaffold0089 (579-880)||(47298-47599)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (42-520)||(27297-27775)
scaffold0143 (579-880)||(26934-27235)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (42-520)||(9571-10049)
scaffold0336 (611-880)||(7874-8143)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (149-520)||(9-381)
scaffold0029 (579-880)||(443-744)
[»] scaffold0350 (2 HSPs)
scaffold0350 (42-520)||(7012-7490)
scaffold0350 (690-797)||(7663-7770)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (44-520)||(8841-9317)
scaffold0159 (44-520)||(20020-20496)
scaffold0159 (690-793)||(9490-9593)
[»] scaffold0144 (2 HSPs)
scaffold0144 (42-520)||(25974-26453)
scaffold0144 (690-880)||(26626-26816)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (42-520)||(14703-15181)
scaffold0237 (615-880)||(15279-15544)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (42-511)||(7963-8432)
scaffold0038 (690-880)||(7579-7769)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (686-880)||(48568-48769)
scaffold0099 (129-439)||(46659-46981)
[»] scaffold2173 (2 HSPs)
scaffold2173 (165-271)||(343-449)
scaffold2173 (15-92)||(518-595)


Alignment Details
Target: scaffold0260 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 2414 - 2909
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2414 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgatcatg 2513  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2514 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 2613  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  2614 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgt 2713  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  2714 acttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtgg 2813  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2814 aggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 2909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 560 - 694
Target Start/End: Original strand, 2949 - 3083
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2949 catttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 3048  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    || |||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  3049 gcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 20340091 - 20340586
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20340091 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgatcatg 20340190  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340191 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 20340290  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  20340291 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgt 20340390  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  20340391 acttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtgg 20340490  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20340491 aggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 20340586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20461580 - 20461085
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  20461580 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacgaaagcattctggacaactggcatgatcatg 20461481  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20461480 gtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcaagtctgcgagcttgctcatatacctcaatc 20461381  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20461380 atgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgt 20461281  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20461280 acttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 20461181  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20461180 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattagtatcggaggaaaggtaggtctagc 20461085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28152361 - 28151866
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28152361 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 28152262  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28152261 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctcaatc 28152162  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  28152161 atgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgt 28152062  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  28152061 atttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtgg 28151962  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28151961 aggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 28151866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 16207787 - 16208282
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  16207787 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctttggatgtcattttgaacgacatagcaccccaaaggattacggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 16207886  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16207887 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggagctttctcatatacctcaatc 16207986  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||    
T  16207987 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgt 16208086  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16208087 acttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 16208186  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16208187 aggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16208282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 560 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 20461069 - 20460748
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20461069 catttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 20460970  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20460969 gcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctatttctt 20460870  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20460869 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcattggcggaggattcaactttctcgaatataataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 20460770  T
Q  860 agtccccatgatgtccatctca 881  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  20460769 agtccccatggtgaccatctca 20460748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 560 - 881
Target Start/End: Original strand, 16208319 - 16208640
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16208319 catttgctgaacgatggcattaatgggtacctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 16208418  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
       ||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16208419 atgtactgatacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatctctacttctgtttctt 16208518  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16208519 tcttcttatgatgaccgttaccgtaactctttgatgcatttacagaggattcaactttctcaaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 16208618  T
Q  860 agtccccatgatgtccatctca 881  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  16208619 agtccccatggtgaccatctca 16208640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 41793083 - 41793559
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |    
T  41793083 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggttgaacagagaagctttg 41793182  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  41793183 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 41793282  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  41793283 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 41793382  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  41793383 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagtt 41793482  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  41793483 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 41793559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 10963152 - 10962674
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||     ||||||||| |||||||| |  ||| ||   || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  10963152 ttcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctaaacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 10963053  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||    
T  10963052 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatg 10962953  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  10962952 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 10962853  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  10962852 ccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 10962753  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | || | ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  10962752 ttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 10962674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28585463 - 28584985
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  28585463 ttcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 28585364  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  28585363 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 28585264  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  28585263 atttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 28585164  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || || ||||||||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  28585163 ccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 28585064  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28585063 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 28584985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 51638700 - 51638222
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  51638700 ttcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 51638601  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  51638600 tgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 51638501  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  51638500 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacac 51638401  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || |    
T  51638400 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgcctag 51638301  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    | || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  51638300 tcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcgaagggaaagtaggcctagc 51638222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 560 - 694
Target Start/End: Original strand, 20340626 - 20340760
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20340626 catttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 20340725  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    || |||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  20340726 gcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 20340760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Original strand, 41793624 - 41793922
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  41793624 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 41793723  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  41793724 tttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 41793823  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     ||||||||||||||| |  | |||| |||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  41793824 atacctctttgatgcactcacagaggtttcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 41793922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 10962501 - 10962362
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  10962501 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 10962402  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  10962401 tcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 10962362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 51638049 - 51637910
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  51638049 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 51637950  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | || ||| |||| || |||||| ||||||| || |||||    
T  51637949 tcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaat 51637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 615 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 28584887 - 28584682
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||||||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  28584887 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 28584788  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 814  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  28584787 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 28584688  T
Q  815 tttctc 820  Q
    ||||||    
T  28584687 tttctc 28584682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 120)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 16626303 - 16626798
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  16626303 cagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattatggaagcattccgggcaactggcatgatcatg 16626402  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626403 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 16626502  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16626503 atgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgt 16626602  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16626603 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 16626702  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16626703 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagtaactcgacatatatcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16626798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 18530849 - 18530354
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18530849 cagtcaaataattgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaacatagcaacccaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgatcatg 18530750  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18530749 gtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacgaacattaagtctgggagctccctcatatacctcaatc 18530650  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18530649 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgt 18530550  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18530549 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 18530450  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18530449 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagtaactcagcatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 18530354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 31033914 - 31034409
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31033914 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 31034013  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31034014 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatc 31034113  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  31034114 atgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgt 31034213  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  31034214 atttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtgg 31034313  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31034314 aggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31034409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 32293213 - 32292718
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  32293213 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 32293114  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32293113 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatc 32293014  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  32293013 atgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgt 32292914  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32292913 atttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtgg 32292814  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32292813 agacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 32292718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 5652848 - 5652353
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5652848 cagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 5652749  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5652748 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcacatacctcaatc 5652649  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5652648 atgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgt 5652549  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | |||||     
T  5652548 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtga 5652449  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5652448 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 5652353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 4626405 - 4625910
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4626405 cagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 4626306  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4626305 gtcaaacagagaggctcggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagctttctcatatacctcaatc 4626206  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4626205 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgt 4626106  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  4626105 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 4626006  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4626005 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 4625910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 17993581 - 17994076
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||  |  ||| || | || ||||||||||||||    
T  17993581 cagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 17993680  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993681 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatc 17993780  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17993781 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgt 17993880  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  17993881 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 17993980  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17993981 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 17994076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 560 - 881
Target Start/End: Original strand, 16626838 - 16627158
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  16626838 catttgctgaacgatggcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgt 16626937  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16626938 gcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttc-t 16627036  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16627037 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctaggcg 16627136  T
Q  860 agtccccatgatgtccatctca 881  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  16627137 agtccccatggtgaccatctca 16627158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 560 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 18530320 - 18529999
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18530320 catttgctgaacgacggcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 18530221  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530220 gcatacgggtacgatggaggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcagataccatccctacttctgtttctt 18530121  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18530120 tcttcttatgatgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 18530021  T
Q  860 agtccccatgatgtccatctca 881  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  18530020 agtccccatggtgaccatctca 18529999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 5713688 - 5713196
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5713688 cagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 5713589  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713588 gtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatc 5713489  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || |    
T  5713488 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatat 5713389  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5713388 acttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 5713289  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
     ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5713288 gggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5713196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 5724598 - 5724106
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5724598 cagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 5724499  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724498 gtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatc 5724399  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || |    
T  5724398 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatat 5724299  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5724298 acttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 5724199  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
     ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5724198 gggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5724106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 517
Target Start/End: Original strand, 5767770 - 5768262
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5767770 cagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 5767869  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5767870 gtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatc 5767969  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || |    
T  5767970 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatat 5768069  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5768070 acttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 5768169  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
     ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5768170 gggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5768262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 18051734 - 18051228
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||| | ||||||   | ||||||||||||||||||  |  ||| || ||||||||    
T  18051734 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaattg 18051635  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
     |||||||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  18051634 acatgatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagctttctcac 18051535  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  18051534 atacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 18051435  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||   |||||||||||||| |    
T  18051434 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcagc 18051335  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  18051334 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 18051235  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  18051234 gtctagc 18051228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 8296416 - 8295938
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  8296416 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 8296317  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  8296316 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatg 8296217  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  8296216 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 8296117  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8296116 ccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctgg 8296017  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||| | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8296016 ttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 8295938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 15892492 - 15892998
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||| |  ||| || |||| |||    
T  15892492 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacaaaggcatcctaggcacttg 15892591  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15892592 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 15892691  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  15892692 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 15892791  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||     
T  15892792 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaaa 15892891  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  15892892 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacattggtatcggagggaaagtag 15892991  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  15892992 gtctagc 15892998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 18331113 - 18330635
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||| ||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  18331113 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacctaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 18331014  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||    
T  18331013 tgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatg 18330914  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||     
T  18330913 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcac 18330814  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18330813 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 18330714  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | ||||  ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18330713 ttgtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18330635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 517
Target Start/End: Original strand, 5756940 - 5757371
Alignment:
Q  85 aaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacatt 184  Q
    ||||||||  ||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5756940 aaggattatggaagcattctggcaaactggcatgatcatg-tcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgtt 5757038  T
Q  185 acggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctca 284  Q
    ||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5757039 acaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctca 5757138  T
Q  285 aaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacact 384  Q
    || || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |    
T  5757139 aaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatt 5757238  T
Q  385 tgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggc 484  Q
    |||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||    
T  5757239 tgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagc 5757338  T
Q  485 atatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5757339 atataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5757371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 15740910 - 15741386
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |    
T  15740910 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttg 15741009  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  15741010 cacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 15741109  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||||||    
T  15741110 ttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatcc 15741209  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  15741210 ctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 15741309  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15741310 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 15741386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 8301081 - 8301559
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  8301081 ttcatcaagctttggatgtcattttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 8301180  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||    
T  8301181 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatg 8301280  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  8301281 atttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 8301380  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8301381 ccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 8301480  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8301481 ttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 8301559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 4796439 - 4796945
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  4796439 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 4796538  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  4796539 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 4796638  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  4796639 atacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 4796738  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  4796739 tttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 4796838  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  4796839 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 4796938  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  4796939 gtctagc 4796945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 6192760 - 6192282
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  6192760 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 6192661  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  6192660 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatg 6192561  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  6192560 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 6192461  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6192460 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctgg 6192361  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6192360 ttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 6192282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 4722075 - 4721597
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  4722075 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 4721976  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||| | || ||    
T  4721975 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcgagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacaacggcatg 4721876  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| || |  |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||| ||||||     
T  4721875 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaaagtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcac 4721776  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4721775 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 4721676  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4721675 ttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 4721597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 29148541 - 29149047
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||  |  ||| || | || |||    
T  29148541 gacatcactgacagtcaaagaattgtcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttg 29148640  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  29148641 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 29148740  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  29148741 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 29148840  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||    
T  29148841 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaac 29148940  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  29148941 ggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 29149040  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  29149041 gtctagc 29149047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 35881210 - 35880732
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  35881210 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 35881111  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||    
T  35881110 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatg 35881011  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
T  35881010 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcac 35880911  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  35880910 ccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttgg 35880811  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35880810 ttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 35880732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 7073656 - 7073178
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||| ||||  |  |||||| |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  7073656 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaagggttacgaaggcattctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 7073557  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||    
T  7073556 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatg 7073457  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  7073456 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 7073357  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| |    
T  7073356 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctag 7073257  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    | || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7073256 tcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagc 7073178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 579 - 869
Target Start/End: Original strand, 15893060 - 15893350
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||     
T  15893060 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 15893159  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  15893160 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 15893259  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 869  Q
    ||  |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  15893260 actatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacagcttcttccagacgagttcccatg 15893350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 22387392 - 22387870
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    |||||||||||| |||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  22387392 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaagaattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 22387491  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||| ||||||   | |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||    
T  22387492 tgcacagcttgttgtgtataagcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatg 22387591  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  22387592 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 22387691  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22387692 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 22387791  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22387792 ttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactctgcatacaacattggtataggaggaaaagtcggtctagc 22387870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 18292167 - 18292645
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  18292167 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 18292266  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  18292267 tgcacaacttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 18292366  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  18292367 atttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 18292466  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |    
T  18292467 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctag 18292566  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18292567 ttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18292645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 28115768 - 28116246
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    | ||||||||||||| || ||  ||| |  | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  28115768 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 28115867  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||    
T  28115868 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatg 28115967  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  28115968 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaatgtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 28116067  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |    
T  28116068 ccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctag 28116167  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28116168 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 28116246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 111 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 4417294 - 4416885
Alignment:
Q  111 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 210  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  4417294 ttggcatgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 4417195  T
Q  211 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 310  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||    
T  4417194 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgag 4417095  T
Q  311 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 410  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  4417094 cttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 4416995  T
Q  411 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 510  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  4416994 aacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 4416895  T
Q  511 taggtctagc 520  Q
    |||| |||||    
T  4416894 taggcctagc 4416885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 10396577 - 10396099
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  10396577 ttcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctt 10396478  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| |  |||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  10396477 tgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgatgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 10396378  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||| |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  10396377 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 10396278  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  10396277 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 10396178  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10396177 ttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtatcggagggaaagtaggtctagc 10396099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 18276866 - 18277344
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  18276866 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 18276965  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  18276966 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 18277065  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  18277066 atttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 18277165  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |    
T  18277166 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctag 18277265  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18277266 ttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18277344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 18307468 - 18307946
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  18307468 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 18307567  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  18307568 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 18307667  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  18307668 atttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 18307767  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |    
T  18307768 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctag 18307867  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18307868 ttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18307946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 48466371 - 48465896
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||     ||||||||||||||||| ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  48466371 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 48466272  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  48466271 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 48466172  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  48466171 atttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 48466072  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  48466071 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 48465972  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  48465971 tcgtgcagtgtcctctttggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 48465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Original strand, 6542276 - 6542753
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  6542276 ttcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 6542375  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||    
T  6542376 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatg 6542475  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  6542476 atttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 6542575  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  6542576 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 6542675  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    |||||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6542676 ttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 517
Target Start/End: Original strand, 36996893 - 36997366
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  36996893 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 36996992  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  36996993 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 36997092  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||||||||||||||  ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||    
T  36997093 ttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacaccc 36997192  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  36997193 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 36997292  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36997293 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Original strand, 11110163 - 11110638
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  11110163 ttcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 11110262  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||    
T  11110263 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatg 11110362  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  11110363 atttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 11110462  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  11110463 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctag 11110562  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11110563 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 11110638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21675137 - 21674659
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  21675137 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 21675038  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  21675037 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 21674938  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| ||    || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  21674937 atttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 21674838  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  21674837 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 21674738  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    | || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21674737 tcgtacaatgccctctttggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 21674659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 8301618 - 8301919
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| | ||||||||||     
T  8301618 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggag 8301717  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  8301718 gcatttgggcagcattgataggagcaacaatagccatggattgaccggctccggcagacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 8301817  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| ||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  8301818 accatacctctttgacgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 8301917  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  8301918 tc 8301919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Original strand, 20576661 - 20577136
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  20576661 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 20576760  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  20576761 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 20576860  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  20576861 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 20576960  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || |    
T  20576961 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctag 20577060  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  20577061 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 20577136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Original strand, 29664784 - 29665259
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  29664784 ttcattaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 29664883  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||    
T  29664884 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtg 29664983  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  29664984 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 29665083  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || |    
T  29665084 ccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctag 29665183  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  29665184 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 29665259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28021719 - 28021241
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||| ||||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  28021719 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 28021620  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||    
T  28021619 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatg 28021520  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  28021519 atttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 28021420  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |    
T  28021419 ccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctag 28021320  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28021319 ttgtacaatgccctctctggagtatagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 28021241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 5609138 - 5609614
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||||||| || ||  ||| || | || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |    
T  5609138 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggttgaacagagaagctttg 5609237  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  5609238 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 5609337  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  5609338 ttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 5609437  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
    ||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  5609438 ttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 5609537  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5609538 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 5609614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 51782467 - 51782052
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || ||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  51782467 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggttgaacagagaagctt 51782368  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  51782367 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 51782268  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  51782267 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 51782168  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  51782167 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 51782068  T
Q  442 ttgtgcagtgccctct 457  Q
    |||| || ||||||||    
T  51782067 ttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 8212182 - 8211713
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  8212182 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacatcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 8212083  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| |  ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  8212082 tgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 8211983  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  8211982 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 8211883  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || |    
T  8211882 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctag 8211783  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 511  Q
    | || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  8211782 tcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagt 8211713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 8295879 - 8295578
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  8295879 ttaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 8295780  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  8295779 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 8295680  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || ||  |||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  8295679 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccttgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 8295580  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  8295579 tc 8295578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 18051166 - 18050865
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  18051166 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 18051067  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  18051066 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 18050967  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  18050966 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 18050867  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  18050866 tc 18050865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28339744 - 28339268
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  28339744 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 28339645  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  28339644 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 28339545  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  28339544 ttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 28339445  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  28339444 ctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 28339345  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28339344 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 28339268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 33 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 20066496 - 20066010
Alignment:
Q  33 tgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaaca 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| || ||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||| |   |||||||||| |||||||    
T  20066496 tgattgctgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcattcaacatgatcatgttcaaaca 20066397  T
Q  133 gagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcac 232  Q
       | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||| | || ||| ||| ||||||||| |||||    
T  20066396 ataaagcttggcacaacttgatatggagtggtaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcacgggaacctcttcacatatctcaatcatattcac 20066297  T
Q  233 agcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaa 332  Q
     ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | |    
T  20066296 ggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttaga 20066197  T
Q  333 gcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgc 432  Q
    || ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || ||    |||||||||||||    
T  20066196 gcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggcccggtggaggcttgc 20066097  T
Q  433 cctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    |||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20066096 cctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 20066010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 47023897 - 47023419
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  47023897 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattaaacagagaagctt 47023798  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||    
T  47023797 tgcgcagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatg 47023698  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  47023697 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 47023598  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  47023597 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 47023498  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  47023497 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 47023419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 4797007 - 4797308
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  4797007 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 4797106  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  4797107 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 4797206  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  4797207 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 4797306  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  4797307 tc 4797308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 5467394 - 5466953
Alignment:
Q  77 gcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagtt 176  Q
    |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || ||||||||||||    
T  5467394 gcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtt 5467295  T
Q  177 gcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 276  Q
    || || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |    
T  5467294 gcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacat 5467195  T
Q  277 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 376  Q
    | |||||||| || | ||| ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  5467194 tattctcaaaagtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 5467095  T
Q  377 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 476  Q
     ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  5467094 gtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagg 5466995  T
Q  477 aactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtcta 518  Q
    |  || ||||| | ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  5466994 agttctgcatacaacataggtataagaggaaaagttggtcta 5466953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 15741436 - 15741737
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  15741436 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 15741535  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  15741536 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 15741635  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
     || |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  15741636 gccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 15741735  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  15741736 tc 15741737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 17984772 - 17985248
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||    |||||||| ||||||||  |  ||| || | || ||||||||||||||    |||||||| ||||      
T  17984772 catcaagctttggatgtcgtcttgaacaatatggcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatgactgaacagagaagcttta 17984871  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | |||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  17984872 cacagcttgatatgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 17984971  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||    
T  17984972 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatcc 17985071  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  17985072 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 17985171  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17985172 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 17985248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 31964289 - 31964765
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   ||||| || |||| |    
T  31964289 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctttg 31964388  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  31964389 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 31964488  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  31964489 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 31964588  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  31964589 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 31964688  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31964689 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 31964765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 32439596 - 32439120
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||   ||||||||||||||| | | |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||   | || |||    
T  32439596 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcactcagcatgatcatgttcaaacaataaagcctgg 32439497  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  32439496 cacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgat 32439397  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  32439396 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 32439297  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  32439296 ctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 32439197  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32439196 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 32439120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 77 - 520
Target Start/End: Original strand, 4346536 - 4346979
Alignment:
Q  77 gcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagtt 176  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || ||||||||||||    
T  4346536 gcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtt 4346635  T
Q  177 gcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 276  Q
    || || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  |    
T  4346636 gcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacat 4346735  T
Q  277 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 376  Q
    | |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  4346736 tattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 4346835  T
Q  377 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 476  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  4346836 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 4346935  T
Q  477 aactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4346936 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4346979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 18243183 - 18242706
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  18243183 ttcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 18243084  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  18243083 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 18242984  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  18242983 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 18242884  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  18242883 ccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 18242784  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    |||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18242783 ttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 18242706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5014156 - 5013687
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  5014156 ttcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 5014057  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  5014056 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 5013957  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  5013956 atttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 5013857  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  5013856 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 5013757  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 511  Q
    |||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || || | ||||||||| |||||||||||    
T  5013756 ttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagt 5013687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Original strand, 5596171 - 5596648
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    | ||||||||||||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  5596171 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 5596270  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||| ||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  5596271 tgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 5596370  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  5596371 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 5596470  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  5596471 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 5596570  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    |||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||    
T  5596571 ttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtctag 5596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 520
Target Start/End: Original strand, 22870705 - 22871148
Alignment:
Q  77 gcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagtt 176  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||  || ||||||||||||    
T  22870705 gcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagtt 22870804  T
Q  177 gcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 276  Q
    || || || |||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |    
T  22870805 gcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacat 22870904  T
Q  277 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 376  Q
    | |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  22870905 tattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 22871004  T
Q  377 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 476  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  22871005 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 22871104  T
Q  477 aactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22871105 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 520
Target Start/End: Original strand, 22885764 - 22886207
Alignment:
Q  77 gcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagtt 176  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||  || ||||||||||||    
T  22885764 gcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagtt 22885863  T
Q  177 gcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 276  Q
    || || || |||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |    
T  22885864 gcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacat 22885963  T
Q  277 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 376  Q
    | |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  22885964 tattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 22886063  T
Q  377 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 476  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  22886064 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 22886163  T
Q  477 aactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22886164 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 149 - 520
Target Start/End: Original strand, 50133992 - 50134363
Alignment:
Q  149 cttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcgga 248  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||     
T  50133992 cttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggt 50134091  T
Q  249 agaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaa 348  Q
    || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |    
T  50134092 agcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcga 50134191  T
Q  349 catcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgca 448  Q
    | |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  50134192 cgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtaca 50134291  T
Q  449 gtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
     ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  50134292 atgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 50134363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 35880670 - 35880369
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  35880670 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 35880571  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  35880570 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 35880471  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  35880470 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 35880371  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  35880370 tc 35880369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 24328601 - 24328200
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||| | ||||||||| |||| |    
T  24328601 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatgattaaacagagaagctttg 24328502  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  24328501 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 24328402  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || ||    
T  24328401 ttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacaccc 24328302  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  24328301 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 24328202  T
Q  444 gt 445  Q
    ||    
T  24328201 gt 24328200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 4721532 - 4721234
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  4721532 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 4721433  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  4721432 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 4721333  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  4721332 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 4721234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 7996970 - 7996528
Alignment:
Q  78 caacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 177  Q
    ||||||||||||| || || |||| |  | || ||||||||||||||    |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||    
T  7996970 caacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 7996871  T
Q  178 caacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagtt 277  Q
    | ||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||    
T  7996870 cgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacatt 7996771  T
Q  278 gttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaa 377  Q
     |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  7996770 attctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaag 7996671  T
Q  378 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 477  Q
    || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |    
T  7996670 tcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagca 7996571  T
Q  478 actcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  7996570 actcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 7996528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 10643478 - 10643036
Alignment:
Q  78 caacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 177  Q
    ||||||||||||| || || |||| |  | || ||||||||||||||    |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||    
T  10643478 caacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 10643379  T
Q  178 caacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagtt 277  Q
    | ||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||    
T  10643378 cgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacatt 10643279  T
Q  278 gttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaa 377  Q
     |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  10643278 attctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaag 10643179  T
Q  378 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 477  Q
    || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |    
T  10643178 tcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagca 10643079  T
Q  478 actcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  10643078 actcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 10643036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 29149109 - 29149410
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  29149109 ttaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 29149208  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  29149209 gcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 29149308  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  29149309 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 29149408  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  29149409 tc 29149410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 18225599 - 18225157
Alignment:
Q  78 caacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 177  Q
    ||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18225599 caacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttg 18225500  T
Q  178 caacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagtt 277  Q
    | || || ||||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  ||    
T  18225499 cgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacatt 18225400  T
Q  278 gttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaa 377  Q
     |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| ||     
T  18225399 attctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaag 18225300  T
Q  378 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 477  Q
    ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |    
T  18225299 tcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaa 18225200  T
Q  478 actcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
      || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  18225199 gttctgcatacaacattggtataggagggaaggtaggcctagc 18225157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 18330573 - 18330277
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  18330573 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagg-----gatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 18330479  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  18330478 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 18330379  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||  ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  18330378 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgagcacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 18330279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 51797450 - 51797141
Alignment:
Q  149 cttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcgga 248  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||    
T  51797450 cttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgga 51797351  T
Q  249 agaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaa 348  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |    
T  51797350 agaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcga 51797251  T
Q  349 catcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgc 447  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  51797250 catcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtac 51797151  T
Q  448 agtgccctct 457  Q
    | ||||||||    
T  51797150 aatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 6192217 - 6191919
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  6192217 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 6192118  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  6192117 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccaactgacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 6192018  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  6192017 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 6191919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 571 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 8211653 - 8211344
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  8211653 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggta 8211554  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 770  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  8211553 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 8211454  T
Q  771 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 870  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  8211453 tgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggactcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 8211354  T
Q  871 tgtccatctc 880  Q
    || |||||||    
T  8211353 tgaccatctc 8211344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 570 - 694
Target Start/End: Original strand, 17994126 - 17994250
Alignment:
Q  570 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 669  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  17994126 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 17994225  T
Q  670 acgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  17994226 acgacggaggtagctgagcagcatt 17994250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Original strand, 28116314 - 28116612
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  28116314 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 28116413  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  28116414 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 28116513  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     |||||||| |||||| | |  || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  28116514 atacctcttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 28116612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 579 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 4625851 - 4625736
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  4625851 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggag 4625752  T
Q  679 ataactgggcagcatt 694  Q
     || ||| ||||||||    
T  4625751 gtagctgagcagcatt 4625736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 7073113 - 7072815
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  7073113 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 7073014  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  7073013 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 7072914  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     |||||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7072913 atacctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7072815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 571 - 880
Target Start/End: Original strand, 18277398 - 18277707
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  18277398 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18277497  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 770  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18277498 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18277597  T
Q  771 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 870  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18277598 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18277697  T
Q  871 tgtccatctc 880  Q
    || |||||||    
T  18277698 tgaccatctc 18277707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 571 - 880
Target Start/End: Original strand, 18292699 - 18293008
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  18292699 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18292798  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 770  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18292799 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18292898  T
Q  771 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 870  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18292899 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18292998  T
Q  871 tgtccatctc 880  Q
    || |||||||    
T  18292999 tgaccatctc 18293008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 571 - 880
Target Start/End: Original strand, 18308000 - 18308309
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  18308000 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18308099  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 770  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18308100 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18308199  T
Q  771 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 870  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18308200 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18308299  T
Q  871 tgtccatctc 880  Q
    || |||||||    
T  18308300 tgaccatctc 18308309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 570 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 5652303 - 5652179
Alignment:
Q  570 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 669  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5652303 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 5652204  T
Q  670 acgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  5652203 acgacggaggtagctgagcagcatt 5652179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 571 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 20065958 - 20065739
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| |||||    
T  20065958 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggta 20065859  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 770  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  20065858 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtatctttcttcttgtga 20065759  T
Q  771 tgaccgttaccgtacctctt 790  Q
    || || ||||| ||||||||    
T  20065758 tgtccattaccatacctctt 20065739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 571 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 10396048 - 10395750
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||  ||  ||| |||||    
T  10396048 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggta 10395949  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 770  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  10395948 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 10395849  T
Q  771 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 869  Q
    || || ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||    
T  10395848 tgtccattaccatatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatg 10395750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 47023354 - 47023056
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  47023354 acgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 47023255  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  47023254 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 47023155  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||  ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  47023154 atacctcttcgatgcattcacagaggattcggctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 47023056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 615 - 829
Target Start/End: Original strand, 22871264 - 22871478
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22871264 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22871363  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 814  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22871364 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22871463  T
Q  815 tttctcgaatacaat 829  Q
    |||||| || |||||    
T  22871464 tttctcaaacacaat 22871478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 615 - 829
Target Start/End: Original strand, 22886323 - 22886537
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22886323 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22886422  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 814  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22886423 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22886522  T
Q  815 tttctcgaatacaat 829  Q
    |||||| || |||||    
T  22886523 tttctcaaacacaat 22886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 615 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 5466853 - 5466672
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  5466853 tactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 5466754  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 796  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  5466753 tagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgc 5466672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 615 - 820
Target Start/End: Original strand, 5596756 - 5596961
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||||||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  5596756 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 5596855  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 814  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||    
T  5596856 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcaac 5596955  T
Q  815 tttctc 820  Q
    ||||||    
T  5596956 tttctc 5596961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 582 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 5713128 - 5713016
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5713128 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5713029  T
Q  682 actgggcagcatt 694  Q
     ||| ||||||||    
T  5713028 gctgagcagcatt 5713016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 582 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 5724038 - 5723926
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5724038 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5723939  T
Q  682 actgggcagcatt 694  Q
     ||| ||||||||    
T  5723938 gctgagcagcatt 5723926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 582 - 694
Target Start/End: Original strand, 5757439 - 5757551
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5757439 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5757538  T
Q  682 actgggcagcatt 694  Q
     ||| ||||||||    
T  5757539 gctgagcagcatt 5757551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 582 - 694
Target Start/End: Original strand, 5768330 - 5768442
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5768330 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5768429  T
Q  682 actgggcagcatt 694  Q
     ||| ||||||||    
T  5768430 gctgagcagcatt 5768442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 582 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 7996463 - 7996213
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  7996463 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 7996364  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  7996363 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 7996264  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 832  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  7996263 atacctcttcgaggcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 7996213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 582 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 10642971 - 10642721
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  10642971 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 10642872  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  10642871 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 10642772  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 832  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  10642771 atacctcttcgaggcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 10642721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 615 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 18225059 - 18224877
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18225059 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 18224960  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 797  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  18224959 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 18224877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 591 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 21674585 - 21674296
Alignment:
Q  591 tgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcag 690  Q
    |||||| |||||| ||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||   |  || || |    
T  21674585 tgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctg 21674486  T
Q  691 cattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctt 790  Q
    |||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||    
T  21674485 cattgataggagccacggtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctctt 21674386  T
Q  791 tgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  21674385 cgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 21674296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 702 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 5013493 - 5013315
Alignment:
Q  702 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttg 801  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |    
T  5013493 gcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcg 5013394  T
Q  802 cggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
      || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5013393 tagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5013315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 690 - 868
Target Start/End: Original strand, 6542939 - 6543117
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  6542939 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 6543038  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 868  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  6543039 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 6543117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 615 - 797
Target Start/End: Original strand, 17985346 - 17985528
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  17985346 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 17985445  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 797  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||    
T  17985446 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctttttgatgca 17985528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 615 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 28021146 - 28020964
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  28021146 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagcca 28021047  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 797  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  28021046 tggattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccgttaccatacctctttgatgca 28020964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 582 - 820
Target Start/End: Original strand, 36997446 - 36997684
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| ||||||||| | || | ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  36997446 acgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 36997545  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  36997546 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 36997645  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 820  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  36997646 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 36997684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 696 - 797
Target Start/End: Original strand, 4347155 - 4347256
Alignment:
Q  696 ataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 795  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||    
T  4347155 ataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatg 4347254  T
Q  796 ca 797  Q
    ||    
T  4347255 ca 4347256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 4893375 - 4893176
Alignment:
Q  321 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 420  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |  |    
T  4893375 atgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccg 4893276  T
Q  421 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4893275 gtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4893176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 582 - 829
Target Start/End: Original strand, 11110718 - 11110965
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  11110718 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 11110817  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||    
T  11110818 tttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccattacc 11110917  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  11110918 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 11110965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 18242520 - 18242381
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  18242520 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 18242421  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  18242420 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 18242381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Original strand, 20577327 - 20577466
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  20577327 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 20577426  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  20577427 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 20577466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 51781804 - 51781674
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  51781804 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 51781705  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 820  Q
    | || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51781704 tcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51781674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 690 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 4416709 - 4416603
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4416709 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4416610  T
Q  790 ttgatgc 796  Q
    | |||||    
T  4416609 tcgatgc 4416603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 690 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 24327952 - 24327822
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  24327952 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 24327853  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 820  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  24327852 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 24327822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 690 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 28339095 - 28338989
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  28339095 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 28338996  T
Q  790 ttgatgc 796  Q
    | |||||    
T  28338995 tcgatgc 28338989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 690 - 796
Target Start/End: Original strand, 31964938 - 31965044
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  31964938 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 31965037  T
Q  790 ttgatgc 796  Q
    | |||||    
T  31965038 tcgatgc 31965044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 690 - 796
Target Start/End: Original strand, 50134536 - 50134642
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  50134536 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 50134635  T
Q  790 ttgatgc 796  Q
    | |||||    
T  50134636 tcgatgc 50134642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 582 - 766
Target Start/End: Original strand, 29665342 - 29665526
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  29665342 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggca 29665441  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 766  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29665442 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 29665526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 793
Target Start/End: Original strand, 5609787 - 5609890
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  5609787 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 5609886  T
Q  790 ttga 793  Q
    ||||    
T  5609887 ttga 5609890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 51796893 - 51796762
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg-accgttaccgtacctc 788  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||  || ||||| || |||    
T  51796893 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtgccattaccatatctc 51796794  T
Q  789 tttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 820  Q
    || || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51796793 ttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51796762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 571 - 719
Target Start/End: Original strand, 22387921 - 22388069
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||    
T  22387921 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggta 22388020  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 719  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22388021 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 22388069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 48465708 - 48465569
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  48465708 gcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 48465609  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  48465608 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 48465569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 32439069 - 32438771
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  32439069 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 32438970  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 770  Q
     |||||    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||   | ||| || | || ||| || || || || ||||||||||| |||    
T  32438969 ggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtga 32438870  T
Q  771 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 869  Q
    || || |||||||| ||||| |  |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| |||||||| |  | ||||||||| ||||| || ||||||    
T  32438869 tgtccattaccgtatctcttcgcagcatttgcagatgactcaatcttctcaaacacaatgatgccttcccgaacagcttcttccagacgtgttcccatg 32438771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 4893125 - 4892977
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  4893125 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 4893026  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 719  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  4893025 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 4892977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 16449640 - 16450135
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16449640 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggcatgatcatg 16449739  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449740 gtcaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacgtccagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 16449839  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| || |||||||    
T  16449840 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgt 16449939  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  16449940 acttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgggaggcaaaggatcaggtgg 16450039  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16450040 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16450135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 26485195 - 26484700
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26485195 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 26485096  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26485095 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatc 26484996  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  26484995 atgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgt 26484896  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26484895 atttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtgg 26484796  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26484795 aggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26484700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 39210665 - 39211160
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  39210665 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacacagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 39210764  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39210765 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatc 39210864  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  39210865 atgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgt 39210964  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39210965 atttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtgg 39211064  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39211065 aagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 39211160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 2775859 - 2775365
Alignment:
Q  26 agtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatgg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2775859 agtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattatagaatcattcttggcaattggcatgatcatgg 2775760  T
Q  126 tcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2775759 tcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatca 2775660  T
Q  226 tgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgta 325  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||     
T  2775659 tgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtg 2775560  T
Q  326 cttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgga 425  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2775559 tttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtgga 2775460  T
Q  426 ggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2775459 ggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagctactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2775365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16041824 - 16041329
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  16041824 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaagattacggaagcattctgggcaattggtatgatcgtg 16041725  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
     | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16041724 attaaacagagaggcttgacatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcgtatacctcaatc 16041625  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  16041624 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagctttttcacaatgt 16041525  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16041524 acttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 16041425  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16041424 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 16041329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Original strand, 2108657 - 2109142
Alignment:
Q  35 attgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacaga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2108657 attgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacaga 2108756  T
Q  135 gaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacag 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2108757 gaggcttggcataatttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtccagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacag 2108856  T
Q  235 cagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagc 334  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  2108857 cagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagc 2108956  T
Q  335 gtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccc 434  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  2108957 atagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccc 2109056  T
Q  435 tgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2109057 tgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2109142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 31088106 - 31088601
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||||||||  |||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31088106 cagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccgaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 31088205  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088206 gtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatc 31088305  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31088306 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgt 31088405  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  31088406 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 31088505  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31088506 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31088601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 45733961 - 45733466
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  45733961 cagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 45733862  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733861 gtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatc 45733762  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  45733761 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgt 45733662  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  45733661 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 45733562  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45733561 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagttaagagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 45733466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Original strand, 26682642 - 26683008
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26682642 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 26682741  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26682742 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatc 26682841  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  26682842 atgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaaatgt 26682941  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 391  Q
      |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26682942 gtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 25 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4201048 - 4200682
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  4201048 cagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 4200949  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4200948 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatc 4200849  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  4200848 atgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgt 4200749  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 391  Q
      |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4200748 gtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 560 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 16041289 - 16040980
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  16041289 catttgctgaacgacggaattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 16041190  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041189 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 16041090  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16041089 tcttcttatgatgaccgttaccatacctctttgatgcatttacggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 16040990  T
Q  860 agtccccatg 869  Q
    ||| ||||||    
T  16040989 agttcccatg 16040980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 563 - 881
Target Start/End: Original strand, 16450178 - 16450496
Alignment:
Q  563 ttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgca 662  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||     
T  16450178 ttgctgaacgacggcattaatgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcg 16450277  T
Q  663 tacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttct 762  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16450278 tacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagctatggattgaccggctccggcagataccatccctacttttgtttctttct 16450377  T
Q  763 tcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagt 862  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16450378 tcttatgatgaccgttaccgtatctttttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagt 16450477  T
Q  863 ccccatgatgtccatctca 881  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  16450478 ccccatggtgaccatctca 16450496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 5128476 - 5127998
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  5128476 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 5128377  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||    
T  5128376 tgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttatggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatg 5128277  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  5128276 atttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcat 5128177  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5128176 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctgg 5128077  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5128076 ttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagc 5127998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 2155085 - 2154579
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  2155085 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 2154986  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  2154985 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 2154886  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  2154885 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 2154786  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  2154785 cttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 2154686  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||     
T  2154685 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtat 2154586  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  2154585 gtctagc 2154579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 10916499 - 10917005
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  10916499 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 10916598  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||  || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  10916599 gcatgatcatggctaaacagagaagctttacacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 10916698  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  10916699 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 10916798  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  10916799 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 10916898  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  10916899 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 10916998  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  10916999 gtctagc 10917005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 11424435 - 11424913
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  11424435 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 11424534  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||    
T  11424535 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatg 11424634  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  11424635 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 11424734  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11424735 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 11424834  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||| ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11424835 ttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 11424913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 18541281 - 18540805
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||   ||| ||||||||||| | | |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||   | ||||||    
T  18541281 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcattcagcatgatcatgttcaaacaataaagcttgg 18541182  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  18541181 cacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgat 18541082  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  18541081 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 18540982  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||| ||    
T  18540981 ctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttcccctgtctgatt 18540882  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18540881 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtctagc 18540805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 16518047 - 16518553
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||| | ||||||     ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  16518047 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 16518146  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  16518147 gcatgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcac 16518246  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  ||||||||    
T  16518247 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagctt 16518346  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  16518347 cttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 16518446  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  16518447 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 16518546  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  16518547 gtctagc 16518553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 16503011 - 16503517
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||| | ||||||     ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  16503011 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 16503110  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  16503111 gcatgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcac 16503210  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  16503211 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 16503310  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  16503311 cttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 16503410  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  16503411 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 16503510  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  16503511 gtctagc 16503517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 16518615 - 16518916
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16518615 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggag 16518714  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16518715 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16518814  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16518815 accatacctctttgatgcatttacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16518914  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  16518915 tc 16518916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 16503579 - 16503880
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16503579 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggag 16503678  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16503679 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16503778  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16503779 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16503878  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  16503879 tc 16503880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 5146999 - 5147477
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  5146999 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 5147098  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||    
T  5147099 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatg 5147198  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  5147199 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 5147298  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  5147299 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 5147398  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5147399 ttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagc 5147477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 78 - 520
Target Start/End: Original strand, 26274789 - 26275231
Alignment:
Q  78 caacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 177  Q
    ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26274789 caacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttg 26274888  T
Q  178 caacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagtt 277  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  26274889 cgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacatt 26274988  T
Q  278 gttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaa 377  Q
     |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  26274989 attctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaag 26275088  T
Q  378 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 477  Q
    ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |    
T  26275089 tcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagca 26275188  T
Q  478 actcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26275189 actcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 26275231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 26435741 - 26435263
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||     ||||||||||||||||| ||  ||| || | || | |||||||||||||   |||||||| ||||    
T  26435741 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacactcggcatgatcatggctgaacagagaagctt 26435642  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  26435641 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 26435542  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  26435541 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 26435442  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  26435441 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 26435342  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26435341 ttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 26435263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 3445788 - 3445315
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| |    
T  3445788 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagagaagctttg 3445689  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  3445688 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgat 3445589  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||    
T  3445588 ttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacaccc 3445489  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  3445488 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 3445389  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3445388 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3445315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 26319528 - 26320006
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  26319528 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagtcacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 26319627  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||    
T  26319628 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatg 26319727  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  26319728 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 26319827  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  26319828 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 26319927  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26319928 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 26320006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 520
Target Start/End: Original strand, 4144818 - 4145260
Alignment:
Q  78 caacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 177  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||    
T  4144818 caacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 4144917  T
Q  178 caacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagtt 277  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  4144918 cgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacatt 4145017  T
Q  278 gttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaa 377  Q
     |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  4145018 attctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaag 4145117  T
Q  378 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 477  Q
    ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |    
T  4145118 tcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagca 4145217  T
Q  478 actcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  4145218 actcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 4145260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 26669573 - 26670051
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  26669573 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 26669672  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  26669673 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 26669772  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  26669773 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 26669872  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  26669873 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 26669972  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26669973 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 26670051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Original strand, 31564049 - 31564526
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||| |   ||||||| |||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  31564049 ttcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 31564148  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  31564149 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 31564248  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  31564249 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 31564348  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  31564349 ccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 31564448  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    |||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31564449 ttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 16736121 - 16736597
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  16736121 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 16736220  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || ||||    
T  16736221 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgat 16736320  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  16736321 tcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 16736420  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  16736421 ctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 16736520  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  16736521 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 16736597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 16751175 - 16751651
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  16751175 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 16751274  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || ||||    
T  16751275 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgat 16751374  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  16751375 tcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 16751474  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  16751475 ctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 16751574  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  16751575 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 16751651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 17524014 - 17523538
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  17524014 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 17523915  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || ||||    
T  17523914 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgat 17523815  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  17523814 tcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 17523715  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  17523714 ctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 17523615  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17523614 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 17523538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 17529201 - 17529677
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  17529201 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 17529300  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || ||||    
T  17529301 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgat 17529400  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  17529401 tcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 17529500  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  17529501 ctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 17529600  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17529601 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 17529677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 9619135 - 9618657
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||| ||||||   |||||||| ||||    
T  9619135 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgctcatggctgaacagagaagctt 9619036  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  9619035 tgcacagcttgatgtgtaggggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 9618936  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  9618935 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 9618836  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  9618835 ccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 9618736  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  9618735 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 9618657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Original strand, 26537529 - 26538004
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   ||||||| |||||| ||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  26537529 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 26537628  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  26537629 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 26537728  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  26537729 atttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 26537828  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  26537829 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 26537928  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |  || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  26537929 tcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 26538004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 11442021 - 11441587
Alignment:
Q  77 gcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagtt 176  Q
    |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || ||||||||||||    
T  11442021 gcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtt 11441922  T
Q  177 gcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 276  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  11441921 gcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacat 11441822  T
Q  277 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 376  Q
    | |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  11441821 tattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 11441722  T
Q  377 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 476  Q
     ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  11441721 gtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 11441622  T
Q  477 aactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 511  Q
    |  || || || | ||||||||| |||||||||||    
T  11441621 agttctgcgtacaacattggtataggaggaaaagt 11441587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 45387791 - 45387349
Alignment:
Q  78 caacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 177  Q
    ||||||||||||| || || |||| |  | || ||||||||||||||    |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||    
T  45387791 caacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 45387692  T
Q  178 caacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagtt 277  Q
    | ||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  45387691 cgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacatt 45387592  T
Q  278 gttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaa 377  Q
     |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  45387591 attctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaag 45387492  T
Q  378 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 477  Q
    || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |    
T  45387491 tcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagca 45387392  T
Q  478 actcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  45387391 actcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 45387349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 2154517 - 2154216
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  2154517 ttaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 2154418  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  2154417 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 2154318  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| ||  | || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  2154317 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatttcatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 2154218  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  2154217 tc 2154216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 445
Target Start/End: Original strand, 24592236 - 24592603
Alignment:
Q  78 caacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 177  Q
    ||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24592236 caacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttg 24592335  T
Q  178 caacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagtt 277  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  24592336 cgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacatt 24592435  T
Q  278 gttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaa 377  Q
     |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| ||     
T  24592436 attctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaag 24592535  T
Q  378 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 445  Q
    ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24592536 tcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 24592603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 5127936 - 5127635
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  5127936 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 5127837  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  5127836 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 5127737  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  5127736 accatacctcttcgatgcattcacagaggactcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 5127637  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  5127636 tc 5127635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 5160001 - 5159525
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||   ||| ||||||||||| | | |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||   | ||||||    
T  5160001 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcactcagcatgatcatgttcaaacaataaagcttgg 5159902  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| |||||| || ||||| ||||| | ||    
T  5159901 cacaacttgatatggagcggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaattatattcacggcagcatcat 5159802  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  5159801 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 5159702  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     | ||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  5159701 cttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 5159602  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5159601 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 5159525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 10917064 - 10917365
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  || |||| ||||| |||| |     
T  10917064 ttaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgaag 10917163  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  10917164 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 10917263  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| ||  | || || |  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  10917264 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgatttcatccctaacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 10917363  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  10917364 tc 10917365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 31125404 - 31124927
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| ||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  31125404 ttcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 31125305  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  31125304 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 31125205  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  31125204 atttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 31125105  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  31125104 ccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 31125005  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    |||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31125004 ttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 31124927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 11424975 - 11425276
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||     
T  11424975 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggag 11425074  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  11425075 gcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 11425174  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  11425175 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 11425274  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  11425275 tc 11425276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 570 - 694
Target Start/End: Original strand, 31088651 - 31088775
Alignment:
Q  570 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 669  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31088651 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 31088750  T
Q  670 acgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  31088751 acgacggaggtagctgagcagcatt 31088775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 570 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 45733416 - 45733292
Alignment:
Q  570 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 669  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  45733416 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 45733317  T
Q  670 acgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  45733316 acgacggaggtagctgagcagcatt 45733292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 582 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 45387284 - 45387034
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  45387284 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 45387185  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  45387184 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 45387085  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 832  Q
     |||||||| || ||| |||| || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  45387084 atacctcttcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 45387034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Original strand, 5147542 - 5147840
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| || || ||||||   |    
T  5147542 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggca 5147641  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  5147642 tttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 5147741  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     |||||||| |||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5147742 atacctcttcgatgcattcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5147840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Original strand, 16736662 - 16736960
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  16736662 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 16736761  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16736762 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16736861  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  16736862 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 16736960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Original strand, 16751716 - 16752014
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  16751716 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 16751815  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16751816 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16751915  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  16751916 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 16752014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 17523473 - 17523175
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  17523473 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 17523374  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  17523373 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 17523274  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17523273 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17523175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Original strand, 17529742 - 17530040
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  17529742 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 17529841  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  17529842 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 17529941  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17529942 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 690 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 31124744 - 31124554
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  31124744 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 31124645  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    | |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  31124644 tcgatgcattcgcagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 31124554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 582 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 11441501 - 11441263
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  11441501 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 11441402  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  11441401 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 11441302  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 820  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  11441301 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 11441263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 690 - 880
Target Start/End: Original strand, 24592851 - 24593041
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  24592851 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 24592950  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    | || |||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  24592951 tcgacgcatttacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 24593041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 571 - 796
Target Start/End: Original strand, 4145314 - 4145539
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| |||||    
T  4145314 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 4145413  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 770  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  4145414 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtgg 4145513  T
Q  771 tgaccgttaccgtacctctttgatgc 796  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  4145514 tgtccattaccatacctcttcgatgc 4145539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 9618484 - 9618345
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  9618484 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 9618385  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9618384 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9618345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Original strand, 26275404 - 26275511
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  26275404 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctct 26275503  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  26275504 tcgatgca 26275511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 26435198 - 26434900
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26435198 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26435099  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26435098 tttgagctgcactgataggagcaacagtggccatggactgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26434999  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     || ||||| | |||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26434998 atatctcttcggtgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 26434900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 690 - 795
Target Start/End: Original strand, 26320179 - 26320284
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  26320179 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctct 26320278  T
Q  790 ttgatg 795  Q
    | ||||    
T  26320279 tcgatg 26320284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 3445127 - 3445020
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  3445127 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 3445028  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  3445027 tcgatgca 3445020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 582 - 797
Target Start/End: Original strand, 26485946 - 26486161
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26485946 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26486045  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26486046 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26486145  T
Q  782 gtacctctttgatgca 797  Q
     |||||||| ||||||    
T  26486146 atacctcttcgatgca 26486161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 829
Target Start/End: Original strand, 26538075 - 26538322
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26538075 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26538174  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26538175 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26538274  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26538275 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26538322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Original strand, 26670224 - 26670363
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  26670224 gcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 26670323  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26670324 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26670363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Original strand, 31564709 - 31564816
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  31564709 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 31564808  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  31564809 tcgatgca 31564816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 571 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 5159474 - 5159326
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  5159474 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 5159375  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 719  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5159374 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 5159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26513265 - 26513130
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||| ||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  26513265 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccagaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 26513166  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 177  Q
     ||| | ||||||||| || || |||||||||||||    
T  26513165 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 26513130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 84)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 19456166 - 19456661
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  19456166 cagtcaaataattgtcgttcatcaaactctggatatcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattccgggcaactggcatgatcatg 19456265  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19456266 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcactagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatc 19456365  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19456366 atgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgt 19456465  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19456466 acttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 19456565  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19456566 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 19456661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 21702909 - 21703404
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  21702909 cagtcaaataattgccgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggtatgatcgtg 21703008  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703009 gttaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 21703108  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| || |||||||    
T  21703109 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgt 21703208  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21703209 acttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 21703308  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21703309 aggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 21703404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16164098 - 16163600
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  16164098 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacataatcattcttggcaattggcatgatcatg 16163999  T
Q  125 gtcaaacagagagg---cttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 221  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  16163998 gtcaaacagagaggaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 16163899  T
Q  222 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16163898 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 16163799  T
Q  322 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 421  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  16163798 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 16163699  T
Q  422 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16163698 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 16163600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 27119184 - 27118689
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27119184 cagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 27119085  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27119084 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacaaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctcaatc 27118985  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27118984 atgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgt 27118885  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  27118884 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtgg 27118785  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  27118784 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagc 27118689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 34303048 - 34303543
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  |   |||| ||||||||||||||||||||     
T  34303048 cagtcagataattgtcgttgatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattttgggcaattggcatgatcatt 34303147  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303148 gtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 34303247  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34303248 atgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgt 34303347  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  34303348 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtgg 34303447  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34303448 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 34303543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 3785150 - 3784655
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3785150 cagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 3785051  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3785050 gtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatc 3784951  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3784950 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgt 3784851  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  3784850 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 3784751  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3784750 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 3784655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 34157506 - 34157012
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  34157506 cagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 34157407  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157406 gtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatc 34157307  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34157306 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgt 34157208  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  34157207 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 34157108  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34157107 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 34157012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 31891073 - 31891568
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31891073 cagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 31891172  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891173 gtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtggtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatc 31891272  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31891273 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgt 31891372  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31891373 acctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 31891472  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31891473 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31891568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 560 - 881
Target Start/End: Original strand, 19456701 - 19457022
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19456701 catttgctaaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgc 19456800  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456801 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctt 19456900  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19456901 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 19457000  T
Q  860 agtccccatgatgtccatctca 881  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  19457001 agtccccatggtgaccatctca 19457022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 22925773 - 22926268
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22925773 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaagaattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 22925872  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22925873 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatc 22925972  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || |    
T  22925973 atgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatat 22926072  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22926073 acttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 22926172  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
     |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22926173 tggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 22926268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 560 - 881
Target Start/End: Original strand, 21703444 - 21703765
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  21703444 catttgttgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 21703543  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703544 gcatatgggtacgacggaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 21703643  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21703644 tcttcttatgatgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 21703743  T
Q  860 agtccccatgatgtccatctca 881  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  21703744 agtccccatggtgaccatctca 21703765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 192 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 27393298 - 27392973
Alignment:
Q  192 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 291  Q
    ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27393298 tcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagtta 27393199  T
Q  292 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 391  Q
    | ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27393198 actttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtc 27393099  T
Q  392 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 491  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||| | |    
T  27393098 agaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatacatc 27392999  T
Q  492 attggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27392998 attggtatcggaggaaaggtaggtct 27392973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 27434206 - 27434684
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  27434206 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 27434305  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  27434306 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatg 27434405  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  27434406 atttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 27434505  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27434506 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 27434605  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| || ||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27434606 ttgtacaatgccctctatggagtaaagccggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 27434684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28882693 - 28882215
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  28882693 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 28882594  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  28882593 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatg 28882494  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  28882493 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 28882394  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28882393 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 28882294  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28882293 ttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 28882215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 12656021 - 12655543
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |   || || |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  12656021 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggtatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctt 12655922  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||    
T  12655921 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatg 12655822  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||     
T  12655821 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcac 12655722  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12655721 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 12655622  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12655621 ttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 12655543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20838397 - 20837919
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  20838397 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 20838298  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||    
T  20838297 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcaaatttacagcggcatg 20838198  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  20838197 atttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 20838098  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||   |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |    
T  20838097 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttaaggtcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctag 20837998  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20837997 ttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 20837919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 76 - 520
Target Start/End: Original strand, 23128362 - 23128806
Alignment:
Q  76 agcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 175  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||||||  | |||| ||||||    
T  23128362 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaagcaccaaaggagt 23128461  T
Q  176 tgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaag 275  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||      
T  23128462 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggaca 23128561  T
Q  276 ttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatgga 375  Q
    || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23128562 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaa 23128661  T
Q  376 aatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 475  Q
    ||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||    
T  23128662 aatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaag 23128761  T
Q  476 taactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
     ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23128762 caactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 23128806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 579 - 869
Target Start/End: Original strand, 27434746 - 27435036
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||     
T  27434746 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 27434845  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  27434846 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 27434945  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 869  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  27434946 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatg 27435036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Original strand, 9349744 - 9350219
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||| |   ||||||||||| || || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  9349744 ttcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 9349843  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9349844 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggggttgtaacattacggacgtcaagaccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 9349943  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  9349944 atttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 9350043  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || |    
T  9350044 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctag 9350143  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  9350144 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 9350219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 40233990 - 40233515
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||     ||||||||||||||||| ||  ||| |  | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  40233990 ttcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcccagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 40233891  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  40233890 tgcacagtttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatg 40233791  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  40233790 atttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacat 40233691  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  40233690 ccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 40233591  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40233590 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 34286834 - 34286355
Alignment:
Q  41 gttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggct 140  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||     ||||||||||||||||| ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||    
T  34286834 gttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagct 34286735  T
Q  141 tggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgt 240  Q
    | ||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| |    
T  34286734 ttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcgatcatattcacggcagcat 34286635  T
Q  241 gattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagca 340  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||    
T  34286634 gatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataaca 34286535  T
Q  341 tccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctg 440  Q
     || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  34286534 cccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtcta 34286435  T
Q  441 gttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34286434 gttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 34286355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 34291894 - 34291415
Alignment:
Q  41 gttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggct 140  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||     ||||||||||||||||| ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||    
T  34291894 gttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagct 34291795  T
Q  141 tggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgt 240  Q
    | ||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| |    
T  34291794 ttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcgatcatattcacggcagcat 34291695  T
Q  241 gattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagca 340  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||    
T  34291694 gatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataaca 34291595  T
Q  341 tccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctg 440  Q
     || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  34291594 cccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtcta 34291495  T
Q  441 gttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34291494 gttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 34291415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 11634948 - 11635426
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    | ||||||||||||| || ||  ||| |  | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  11634948 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 11635047  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||    
T  11635048 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatg 11635147  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || ||     
T  11635148 atttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacac 11635247  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  11635248 ccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctag 11635347  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11635348 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 11635426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 560 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 27392951 - 27392630
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27392951 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 27392852  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
       ||| ||||||  |||  || ||| |||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27392851 atgtactggtacggtggaggtagctgagcagcatcgatgggggcaacagtagccacagattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 27392752  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||    
T  27392751 tcttcttatgatgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataatgccgtctctgacagcctcttctaagcg 27392652  T
Q  860 agtccccatgatgtccatctca 881  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  27392651 ggttcccatggtgaccatctca 27392630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Original strand, 13936306 - 13936781
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||  | ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  13936306 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcgcggaggcatcctagacatttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 13936405  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  13936406 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 13936505  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| || ||     
T  13936506 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacac 13936605  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || |    
T  13936606 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctag 13936705  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13936706 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 13936781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 11641137 - 11641615
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    | ||||||||||||| || ||  ||| |  | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  11641137 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 11641236  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||    
T  11641237 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatg 11641336  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || ||     
T  11641337 atttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacac 11641436  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  11641437 ccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctag 11641536  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  11641537 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatctgtatcggagggaaagtaggtctagc 11641615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 32050277 - 32049799
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  32050277 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattaaacagagaagctt 32050178  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||||| || ||    
T  32050177 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatg 32050078  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  32050077 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 32049978  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||| || || |||||||| |    
T  32049977 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctag 32049878  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  32049877 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 32049799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 12587289 - 12586814
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  12587289 ttcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 12587190  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  12587189 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 12587090  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  12587089 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacat 12586990  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || |    
T  12586989 ccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctag 12586890  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || ||  |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  12586889 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcgactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12586814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 27777701 - 27777226
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  27777701 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 27777602  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  27777601 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 27777502  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  27777501 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 27777402  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || |    
T  27777401 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctag 27777302  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27777301 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 27817459 - 27816984
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  27817459 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 27817360  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  27817359 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 27817260  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  27817259 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 27817160  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || |    
T  27817159 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctag 27817060  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27817059 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 21676944 - 21677422
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  21676944 ttcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 21677043  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||  || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  21677044 tgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 21677143  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  21677144 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 21677243  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21677244 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctag 21677343  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  21677344 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 21677422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 34862159 - 34861681
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  34862159 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 34862060  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  34862059 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatctagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 34861960  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  34861959 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 34861860  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  34861859 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 34861760  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  34861759 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 34861681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 37685671 - 37686149
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  37685671 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 37685770  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  37685771 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 37685870  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  37685871 atttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 37685970  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  37685971 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 37686070  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  37686071 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 37686149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 37700936 - 37701414
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  37700936 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 37701035  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  37701036 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 37701135  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  37701136 atttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 37701235  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  37701236 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 37701335  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  37701336 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 37701414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 37925972 - 37925494
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  37925972 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 37925873  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  37925872 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 37925773  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  37925772 atttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 37925673  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |    
T  37925672 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctag 37925573  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37925572 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggcctagc 37925494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 23128868 - 23129169
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  23128868 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 23128967  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  23128968 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 23129067  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  23129068 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 23129167  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  23129168 tc 23129169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 28882153 - 28881852
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  28882153 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 28882054  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  28882053 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 28881954  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  28881953 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacagcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 28881854  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  28881853 tc 28881852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 37375640 - 37375163
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||  |  ||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| ||||    
T  37375640 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgttcatggctgaacagagaagctt 37375541  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| |  ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||| || ||    
T  37375540 tgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttccccacacacttcgatcatattcacagcggcatg 37375441  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  37375440 atttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 37375341  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  37375340 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 37375241  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  37375240 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 37375163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 27804186 - 27803711
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  27804186 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 27804087  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  27804086 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggtcatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 27803987  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  27803986 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 27803887  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || |    
T  27803886 ccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctag 27803787  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27803786 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27803711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Original strand, 39051584 - 39052059
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   | |||||| ||||    
T  39051584 ttcatcaagctttggatgttgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgatcagagaagctt 39051683  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  39051684 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 39051783  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  39051784 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 39051883  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || |    
T  39051884 ccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctag 39051983  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  39051984 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 16829100 - 16829578
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  16829100 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 16829199  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  16829200 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatg 16829299  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  16829300 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 16829399  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  16829400 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 16829499  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16829500 ttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 16829578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16892381 - 16891903
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  16892381 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 16892282  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  16892281 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatg 16892182  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  16892181 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 16892082  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  16892081 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 16891982  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16891981 ttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 16891903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 517
Target Start/End: Original strand, 12716366 - 12716839
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| |    
T  12716366 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagagaagctttg 12716465  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  12716466 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 12716565  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  12716566 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 12716665  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  12716666 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 12716765  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  12716766 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12716839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 31876760 - 31876282
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| |   |||||||||||| | || || |||| |  | || |||||||||||||| |  ||||||||  |||    
T  31876760 ttcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagggtcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaaactt 31876661  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  31876660 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 31876561  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  31876560 atttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 31876461  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  31876460 ccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 31876361  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31876360 ttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 31876282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 20837857 - 20837556
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  20837857 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggat 20837758  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  20837757 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 20837658  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  20837657 accatacctctttgatgcattcacagtggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 20837558  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  20837557 tc 20837556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 511
Target Start/End: Original strand, 260515 - 260984
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||||||| || ||  ||| || | || ||||||||||| |||   |||||||| ||||    
T  260515 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcgtggctgaacagagaagctt 260614  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||| ||| |||||||  | || || ||||| |||||||| || ||    
T  260615 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatg 260714  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  260715 atttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 260814  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  260815 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtctag 260914  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 511  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  260915 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagt 260984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 12655481 - 12655180
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  12655481 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggag 12655382  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  12655381 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 12655282  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  12655281 accatacctctttgatgcattcacagagggttcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 12655182  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  12655181 tc 12655180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 39890551 - 39890075
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  39890551 catcaagccttggatgtcgtcttgaacaacatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 39890452  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  39890451 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 39890352  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||| ||| || || ||    
T  39890351 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacaccc 39890252  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  39890251 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagccctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 39890152  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39890151 gtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 39890075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 445
Target Start/End: Original strand, 19416261 - 19416664
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  19416261 ttcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattaaacagagaagctt 19416360  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  19416361 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 19416460  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || || |||||||| || ||     
T  19416461 atttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacac 19416560  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  19416561 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 19416660  T
Q  442 ttgt 445  Q
    ||||    
T  19416661 ttgt 19416664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 560 - 694
Target Start/End: Original strand, 31891608 - 31891742
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31891608 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 31891707  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  31891708 gcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 31891742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 560 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 27118649 - 27118515
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27118649 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 27118550  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    |||| |||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  27118549 gcatgcgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 27118515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 570 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 3784605 - 3784481
Alignment:
Q  570 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 669  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  3784605 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 3784506  T
Q  670 acgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  3784505 acgacggaggtagctgagcagcatt 3784481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 570 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 34156962 - 34156838
Alignment:
Q  570 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 669  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  34156962 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 34156863  T
Q  670 acgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  34156862 acgacggaggtagctgagcagcatt 34156838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 579 - 694
Target Start/End: Original strand, 34303602 - 34303717
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  34303602 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggag 34303701  T
Q  679 ataactgggcagcatt 694  Q
     || ||| ||||||||    
T  34303702 gtagctgagcagcatt 34303717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 306 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 34279664 - 34279450
Alignment:
Q  306 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 405  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |    
T  34279664 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttg 34279565  T
Q  406 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 505  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  34279564 gaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagg 34279465  T
Q  506 aaaagtaggtctagc 520  Q
     ||||||||||||||    
T  34279464 gaaagtaggtctagc 34279450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 570 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 16163550 - 16163426
Alignment:
Q  570 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 669  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16163550 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 16163451  T
Q  670 acgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  16163450 acgacggaggtagctgagcagcatt 16163426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 34279385 - 34279087
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34279385 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34279286  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34279285 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34279186  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     |||||||| || | |||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  34279185 atacctcttcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 34279087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 582 - 829
Target Start/End: Original strand, 13936849 - 13937096
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  13936849 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 13936948  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  13936949 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 13937048  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  13937049 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 13937096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 582 - 796
Target Start/End: Original strand, 21677487 - 21677701
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  21677487 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 21677586  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  21677587 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 21677686  T
Q  782 gtacctctttgatgc 796  Q
     |||||||| |||||    
T  21677687 atacctcttcgatgc 21677701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 696 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 37374983 - 37374799
Alignment:
Q  696 ataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 795  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||    
T  37374983 ataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatg 37374884  T
Q  796 catttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    ||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  37374883 cattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 37374799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 582 - 829
Target Start/End: Original strand, 261070 - 261317
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  261070 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 261169  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  261170 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 261269  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  261270 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 261317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Original strand, 11635494 - 11635792
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  11635494 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 11635593  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || |||||    
T  11635594 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtccattacc 11635693  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11635694 atacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 11635792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Original strand, 11641683 - 11641981
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  11641683 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 11641782  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || |||||    
T  11641783 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtccattacc 11641882  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11641883 atacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 11641981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 582 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 34286290 - 34286043
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||  | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34286290 acgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34286191  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34286190 tttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34286091  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34286090 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34286043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 582 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 34291350 - 34291103
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||  | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34291350 acgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34291251  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34291250 tttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34291151  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34291150 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34291103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 615 - 797
Target Start/End: Original strand, 12716943 - 12717125
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12716943 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 12717042  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 797  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  12717043 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 12717125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 582 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 37925429 - 37925182
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  37925429 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 37925330  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  37925329 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 37925230  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  37925229 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 37925182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 12586629 - 12586490
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  12586629 gcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 12586530  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  12586529 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 12586490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 31876109 - 31876002
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  31876109 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttt 31876010  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  31876009 tcgatgca 31876002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 34861508 - 34861401
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  34861508 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttt 34861409  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  34861408 tcgatgca 34861401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Original strand, 37686322 - 37686429
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  37686322 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttt 37686421  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  37686422 tcgatgca 37686429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Original strand, 37701587 - 37701694
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  37701587 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttt 37701686  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  37701687 tcgatgca 37701694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 39889890 - 39889783
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  39889890 gcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 39889791  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  39889790 tcgatgca 39889783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 582 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 40233435 - 40233188
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  40233435 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 40233336  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  40233335 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 40233236  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  40233235 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 40233188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 582 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 32049734 - 32049526
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  32049734 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 32049635  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||    
T  32049634 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccattacc 32049535  T
Q  782 gtacctctt 790  Q
     ||||||||    
T  32049534 atacctctt 32049526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Original strand, 9350407 - 9350546
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  9350407 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 9350506  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9350507 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9350546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 702 - 797
Target Start/End: Original strand, 16829763 - 16829858
Alignment:
Q  702 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 797  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  16829763 gcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 16829858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 702 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 16891718 - 16891623
Alignment:
Q  702 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 797  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  16891718 gcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 16891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 27777035 - 27776896
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27777035 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27776936  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27776935 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27776896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 27803520 - 27803381
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27803520 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27803421  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27803420 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27803381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 27816802 - 27816663
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27816802 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27816703  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27816702 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27816663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 690 - 820
Target Start/End: Original strand, 19416912 - 19417042
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  19416912 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 19417011  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 820  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  19417012 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 19417042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 690 - 796
Target Start/End: Original strand, 22926441 - 22926547
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  22926441 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 22926540  T
Q  790 ttgatgc 796  Q
    | |||||    
T  22926541 tcgatgc 22926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 576 - 829
Target Start/End: Original strand, 39052127 - 39052380
Alignment:
Q  576 gcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacg 675  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||    
T  39052127 gcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacg 39052226  T
Q  676 gaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 775  Q
    ||   |  || || |||||  |||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  39052227 gaggcatttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 39052326  T
Q  776 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39052327 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39052380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 15284684 - 15285179
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  15284684 cagtcaaataattgtcgttcatcaaactctagatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcatttcgggcaactggcatgatcatg 15284783  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15284784 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatc 15284883  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15284884 atgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgt 15284983  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15284984 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 15285083  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15285084 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcgaaatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 15285179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15228385 - 15227890
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15228385 cagtcaaataactgtcgttcatcaagctctggatgtcatttcgaacaacgtggcaacctaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgatcatg 15228286  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  15228285 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacatcaagtctgggagctatctcatataccccaatc 15228186  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||| || |||||||    
T  15228185 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgt 15228086  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15228085 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtgg 15227986  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15227985 aggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 15227890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 1900772 - 1900277
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  1900772 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatttcattttgaacaacgtagcaacccaaagtattatggaatcattctgggcaactggcatggtcatg 1900673  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900672 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttatgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 1900573  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||    
T  1900572 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgt 1900473  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||||||    
T  1900472 acttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtgg 1900373  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1900372 aggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 1900277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 24460361 - 24460856
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24460361 cagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 24460460  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24460461 gtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttcaatc 24460560  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24460561 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgt 24460660  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  24460661 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 24460760  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24460761 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 24460856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 517
Target Start/End: Original strand, 15391094 - 15391586
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||||  |   |||||||||||||||||||||| |||    
T  15391094 cagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgattatg 15391193  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||    ||| |||    
T  15391194 gtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggatgtcaagactgggaacttcttcatgactctcgatc 15391293  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||| ||||||||||    
T  15391294 atgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaatgt 15391393  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15391394 acttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtgg 15391493  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15391494 aggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 15391586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 14235270 - 14235776
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| || ||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||| |||| || |||||||||  ||  ||||| || |||  |    
T  14235270 gacatcactaacaatcagatatttgttgtccatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcagcctaaaggattatggaggcattccggacaaacg 14235369  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  14235370 gcatggtcatggtcaaacaaggaagcttggcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagtcgcaacgttacgaacgtcaagactgggagcttcttcat 14235469  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  14235470 aggtctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtctatgagctt 14235569  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||     
T  14235570 ctttacaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaa 14235669  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||    
T  14235670 gggttaggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagtcgggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtag 14235769  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  14235770 gtctagc 14235776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 560 - 879
Target Start/End: Original strand, 15285219 - 15285538
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15285219 catttgctgaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 15285318  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
    ||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15285319 gcatatgggtacaatggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccatacttctgtttctt 15285418  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15285419 tcttcttatgatgaccgttaccgttcctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 15285518  T
Q  860 agtccccatgatgtccatct 879  Q
    |||||||||| || ||||||    
T  15285519 agtccccatggtgaccatct 15285538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 560 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 15227850 - 15227529
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15227850 catttgctgaacgacagcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 15227751  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227750 gcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctt 15227651  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15227650 tcttcttatgatgaccgttaccatgcctctttgatgcatttgcggaggattcatctttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 15227551  T
Q  860 agtccccatgatgtccatctca 881  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  15227550 agtccccatggtgaccatctca 15227529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 560 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 1900237 - 1899916
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  1900237 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 1900138  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900137 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 1900038  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  1900037 tcttcttatgatgatcgttaccgtacctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcaaatacaataatgccttctctgacagcttcttccaaacg 1899938  T
Q  860 agtccccatgatgtccatctca 881  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  1899937 agtccccatggtgaccatctca 1899916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 17014526 - 17014020
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  17014526 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 17014427  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  17014426 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 17014327  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  17014326 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 17014227  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  17014226 cttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaac 17014127  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  17014126 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 17014027  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  17014026 gtctagc 17014020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 24592087 - 24592565
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||  | |||||||||||||||||   |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  24592087 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctt 24592186  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  24592187 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatg 24592286  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||     
T  24592287 attgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcac 24592386  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24592387 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 24592486  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24592487 ttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24592565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14665516 - 14665038
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  14665516 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 14665417  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  14665416 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatg 14665317  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  14665316 atttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 14665217  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14665216 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 14665117  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14665116 ttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 14665038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 560 - 881
Target Start/End: Original strand, 14235819 - 14236140
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| | | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14235819 catttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 14235918  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
      |||| |||||| | ||  |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14235919 atatactggtacggcagaggtaactgagcagcattaataggggtaacagtggccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 14236018  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||    
T  14236019 tcttcttatgatgaccattaccgtacttctttgatgtgcttgcagaggattcccctttctcgaacacaataatgtcttctctgacagcctcttctaagcg 14236118  T
Q  860 agtccccatgatgtccatctca 881  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  14236119 ggttcccatggtgaccatctca 14236140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 14763077 - 14763555
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  14763077 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 14763176  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  14763177 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 14763276  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  14763277 atttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 14763376  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  14763377 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctag 14763476  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14763477 ttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 14763555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 6570351 - 6569873
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||     ||||||||||||||||| ||  ||| || | || ||||||| |||||||   |||||||| ||||    
T  6570351 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcataatcatggctgaacagagaagctt 6570252  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  6570251 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 6570152  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  6570151 atttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 6570052  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  6570051 ccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 6569952  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6569951 ttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagc 6569873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Original strand, 36344288 - 36344765
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  36344288 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 36344387  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  36344388 tgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 36344487  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  36344488 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 36344587  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  36344588 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 36344687  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  36344688 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 36344765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 111 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 5006302 - 5005893
Alignment:
Q  111 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 210  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  5006302 ttggcatgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttaatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 5006203  T
Q  211 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 310  Q
    || | || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || || || ||||| |  |||||    
T  5006202 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcaacttcccttgatcgatgag 5006103  T
Q  311 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 410  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  5006102 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 5006003  T
Q  411 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 510  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5006002 aacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 5005903  T
Q  511 taggtctagc 520  Q
    |||| |||||    
T  5005902 taggcctagc 5005893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Original strand, 18800386 - 18800863
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  18800386 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 18800485  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  18800486 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 18800585  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  18800586 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 18800685  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  18800686 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 18800785  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    | || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18800786 tcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 18800863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14099039 - 14098561
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  14099039 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 14098940  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  14098939 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 14098840  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  14098839 atttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 14098740  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  14098739 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 14098640  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14098639 ttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 14098561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 31126291 - 31126769
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  31126291 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 31126390  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  31126391 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatg 31126490  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  31126491 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 31126590  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |    
T  31126591 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctag 31126690  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31126691 ttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 31126769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 40105411 - 40105889
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  40105411 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattaaacagagaagctt 40105510  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  40105511 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 40105610  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  40105611 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 40105710  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  40105711 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 40105810  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    | || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  40105811 tcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 40105889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 14664976 - 14664675
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  | ||||| ||||| ||||||     
T  14664976 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggag 14664877  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  14664876 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 14664777  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || |  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  14664776 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctaacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 14664677  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  14664676 tc 14664675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 24113158 - 24112682
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||   ||| ||||||||||| | | |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||   | ||||||    
T  24113158 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcacttagcatgatcatgttcaaacaataaagcttgg 24113059  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  24113058 cacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgat 24112959  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  24112958 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 24112859  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  24112858 ctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 24112759  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24112758 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 24112682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 27163092 - 27163568
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    | ||||||||||||| || ||  ||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| |||| |    
T  27163092 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctttg 27163191  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  27163192 cacaacttgatatgtagaggtaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 27163291  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || || |||||||| || || ||    
T  27163292 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacaccc 27163391  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  27163392 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 27163491  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  27163492 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 27163568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Original strand, 33673571 - 33674046
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  33673571 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 33673670  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  33673671 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 33673770  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  33673771 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 33673870  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |    
T  33673871 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctag 33673970  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33673971 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 30754250 - 30753777
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  30754250 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 30754151  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  30754150 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 30754051  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || ||    
T  30754050 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 30753951  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  30753950 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 30753851  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30753850 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 30753777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 34188735 - 34189211
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||   ||| |||||||| || | | |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||   | ||||||    
T  34188735 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcagcatgatcatgttcaaacaacaaagcttgg 34188834  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  34188835 cacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgat 34188934  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  34188935 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 34189034  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  34189035 ctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 34189134  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34189135 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 34189211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 17013958 - 17013657
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| || |||     
T  17013958 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggag 17013859  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  17013858 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 17013759  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  17013758 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 17013659  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  17013658 tc 17013657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21970199 - 21969721
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  21970199 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattaaacagagaagctt 21970100  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | |  |||||||| |||||||| || ||    
T  21970099 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacatttcaatcatattcacagcggcatg 21970000  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  21969999 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 21969900  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || |    
T  21969899 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctag 21969800  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    | || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21969799 tcgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 21969721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 54833885 - 54833408
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||     ||||||||| |||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  54833885 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 54833786  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  54833785 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 54833686  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  54833685 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 54833586  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |    
T  54833585 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctag 54833486  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  54833485 ttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 54833408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 584 - 881
Target Start/End: Original strand, 15391650 - 15391948
Alignment:
Q  584 gggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataac 683  Q
    ||||||||||||| ||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||| | |||| ||||  || |    
T  15391650 gggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagc 15391749  T
Q  684 tgggcagcattaataggggcaa-cagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccg 782  Q
    || ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  15391750 tgagcaacattgatgggggcaaacagtagccatggattgactggttccagcagataccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgaccattgcca 15391849  T
Q  783 tacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 881  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  || || |||||| || ||||||||    
T  15391850 tacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttcccaaacacaataatgccatctctgacagcctcttctaagcgggttcccatggtgaccatctca 15391948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 39851136 - 39850661
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||     |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  39851136 ttcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 39851037  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  39851036 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 39850937  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  39850936 atttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 39850837  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || |    
T  39850836 ccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctag 39850737  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  39850736 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 24592624 - 24592925
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  24592624 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 24592723  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24592724 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24592823  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  24592824 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 24592923  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  24592924 tc 24592925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 6569811 - 6569510
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||     
T  6569811 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggag 6569712  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  6569711 gcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 6569612  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  6569611 accatatctcttcgatgcattcgcagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatc 6569512  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  6569511 tc 6569510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 570 - 694
Target Start/End: Original strand, 24460906 - 24461030
Alignment:
Q  570 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 669  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24460906 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 24461005  T
Q  670 acgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  24461006 acgacggaggtagctgagcagcatt 24461030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 571 - 880
Target Start/End: Original strand, 14763609 - 14763918
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  14763609 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 14763708  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 770  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  14763709 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 14763808  T
Q  771 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 870  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  14763809 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 14763908  T
Q  871 tgtccatctc 880  Q
    || |||||||    
T  14763909 tgaccatctc 14763918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 571 - 880
Target Start/End: Original strand, 36344817 - 36345126
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  36344817 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 36344916  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 770  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  36344917 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 36345016  T
Q  771 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 870  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  36345017 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 36345116  T
Q  871 tgtccatctc 880  Q
    || |||||||    
T  36345117 tgaccatctc 36345126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 598 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 19373200 - 19372918
Alignment:
Q  598 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaat 697  Q
    |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||    
T  19373200 gacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 19373101  T
Q  698 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 797  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  19373100 aggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 19373001  T
Q  798 tttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    ||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  19373000 ttcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 19372918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Original strand, 27163633 - 27163931
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  27163633 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 27163732  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  27163733 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 27163832  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    |||||| || |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  27163833 gtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 27163931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 588 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 54833339 - 54833098
Alignment:
Q  588 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 687  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  54833339 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 54833240  T
Q  688 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 787  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  54833239 ctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 54833140  T
Q  788 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    ||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  54833139 cttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 54833098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 5005825 - 5005527
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  5005825 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 5005726  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  5005725 tttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 5005626  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     |||||||| || | | | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5005625 atacctcttcgacgtactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5005527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 615 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 14098463 - 14098198
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  14098463 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 14098364  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 814  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |    
T  14098363 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagc 14098264  T
Q  815 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  14098263 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 14098198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 582 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 30753697 - 30753482
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  30753697 acgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 30753598  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  30753597 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacatcatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 30753498  T
Q  782 gtacctctttgatgca 797  Q
     |||||||| ||||||    
T  30753497 atacctcttcgatgca 30753482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 615 - 797
Target Start/End: Original strand, 31126867 - 31127049
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31126867 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31126966  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 797  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  31126967 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 31127049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 615 - 820
Target Start/End: Original strand, 18800971 - 18801176
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18800971 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 18801070  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 814  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  18801071 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttctgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 18801170  T
Q  815 tttctc 820  Q
    ||||||    
T  18801171 tttctc 18801176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 820
Target Start/End: Original strand, 33674234 - 33674364
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  33674234 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 33674333  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 820  Q
    | || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  33674334 tcgacgcatttacagaggattcagctttctc 33674364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 868
Target Start/End: Original strand, 40106062 - 40106240
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |  ||||||||||| |    
T  40106062 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtctattaccgtaccttt 40106161  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 868  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| ||||||||    
T  40106162 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgactgcttcctcaagacgggtccccat 40106240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 582 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 21969656 - 21969441
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  21969656 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 21969557  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||    
T  21969556 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccattacc 21969457  T
Q  782 gtacctctttgatgca 797  Q
     |||||||| ||||||    
T  21969456 atacctcttcgatgca 21969441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 39850470 - 39850331
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  39850470 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 39850371  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | || | |||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39850370 tcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39850331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 571 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 24112631 - 24112483
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  24112631 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 24112532  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 719  Q
     |||||    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  24112531 ggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggat 24112483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 571 - 719
Target Start/End: Original strand, 34189262 - 34189410
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  34189262 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 34189361  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 719  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  34189362 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcgacagtagccttggat 34189410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 92)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 14142984 - 14143479
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14142984 cagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 14143083  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14143084 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatc 14143183  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  14143184 atgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgt 14143283  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14143284 atttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtgg 14143383  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14143384 aggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 14143479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 26788441 - 26787946
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26788441 cagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 26788342  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26788341 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatc 26788242  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  26788241 atgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgt 26788142  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26788141 atttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtgg 26788042  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26788041 aggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26787946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 27196814 - 27196319
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27196814 cagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 27196715  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27196714 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatc 27196615  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  27196614 atgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgt 27196515  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27196514 atttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtgg 27196415  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27196414 aggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27196319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 27252426 - 27252921
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27252426 cagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 27252525  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27252526 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatc 27252625  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  27252626 atgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgt 27252725  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27252726 atttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtgg 27252825  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27252826 aggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27252921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 13521772 - 13522267
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  13521772 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggtcatg 13521871  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13521872 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatc 13521971  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  13521972 atgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgt 13522071  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
      |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  13522072 gtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 13522171  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13522172 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13522267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 22456642 - 22457128
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22456642 cagtcaaataattgtcgttcatcaatctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattctggacaattggcatgatcatg 22456741  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456742 gtcaaacaaagaagctttgcatagcttgatgtg---------cagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 22456832  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  22456833 acgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaaagttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgt 22456932  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22456933 actttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 22457032  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22457033 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 22457128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 8892010 - 8892504
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  8892010 cagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 8892109  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8892110 gtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttcaatc 8892209  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8892210 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgt 8892308  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  8892309 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 8892408  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8892409 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 8892504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 8903245 - 8903739
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  8903245 cagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 8903344  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8903345 gtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttcaatc 8903444  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8903445 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgt 8903543  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  8903544 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 8903643  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8903644 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 8903739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 33373955 - 33374450
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  33373955 cagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcgtg 33374054  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374055 gtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatc 33374154  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33374155 atgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgt 33374254  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  33374255 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 33374354  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33374355 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33374450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28163154 - 28162659
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||| || |||||| || |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28163154 cagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaccgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 28163055  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28163054 gtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatc 28162955  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28162954 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgt 28162855  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| | ||||    
T  28162854 acctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaagtgg 28162755  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28162754 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 28162659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 27290058 - 27290564
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  27290058 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 27290157  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27290158 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcat 27290257  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||    
T  27290258 atacctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagctt 27290357  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  27290358 cttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacttgggaggtaac 27290457  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  27290458 ggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtag 27290557  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  27290558 gtctagc 27290564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Original strand, 27272296 - 27272771
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||||| ||  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  27272296 ttcatcaagctctggatgtcatcttgaacaataaagcaacccaaaggattacggaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 27272395  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| |||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  27272396 tgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttacaacgttacggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcgatcatattcacagcagcatg 27272495  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||||| |  || ||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
T  27272496 atttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcac 27272595  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  27272596 ccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctgg 27272695  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    |||| || ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27272696 ttgtacaatgccctctctggagtagagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 27272771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 13298639 - 13299145
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    | |||||||||||||||   |  ||| || |||| |||    
T  13298639 gacatcactgacagtcaaataattgtcattcatcaagctctggatgtcattttgaacagtataccaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttg 13298738  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  13298739 gcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 13298838  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  13298839 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 13298938  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  13298939 cttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 13299038  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  13299039 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 13299138  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  13299139 gtctagc 13299145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 22934596 - 22935074
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||     ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  22934596 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 22934695  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  22934696 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatg 22934795  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  22934796 atttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 22934895  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22934896 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 22934995  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22934996 ttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 22935074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 23857041 - 23857519
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||     ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  23857041 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 23857140  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  23857141 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatg 23857240  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  23857241 atttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 23857340  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23857341 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 23857440  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23857441 ttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 23857519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 26989481 - 26989003
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26989481 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctt 26989382  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  26989381 tgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatg 26989282  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||     
T  26989281 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcac 26989182  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26989181 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 26989082  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26989081 ttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 26989003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 294 - 520
Target Start/End: Original strand, 22477241 - 22477467
Alignment:
Q  294 tttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcag 393  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22477241 tttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttag 22477340  T
Q  394 aatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcat 493  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22477341 aacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcat 22477440  T
Q  494 tggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22477441 tggtatcagaggaaaggtaggtctagc 22477467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 26918860 - 26918382
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  26918860 ttcatcaagctttggatgttatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 26918761  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||    
T  26918760 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatg 26918661  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||     
T  26918660 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcac 26918561  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26918560 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 26918461  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26918460 ttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 26918382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 24304306 - 24304812
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  24304306 gacatcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 24304405  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||| ||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  24304406 gcatggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 24304505  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  24304506 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 24304605  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  24304606 cttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 24304705  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  24304706 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 24304805  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  24304806 gtctagc 24304812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16750361 - 16749856
Alignment:
Q  15 acatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattgg 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||  |  ||| || | || ||||    
T  16750361 acatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttgg 16750262  T
Q  115 catgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcata 214  Q
    |||||||||||   |||||||| |||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  16750261 catgatcatggctgaacagagaagctttgcaccgcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcgggcatcaagtctaggagcttcctcaca 16750162  T
Q  215 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 314  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||     
T  16750161 tacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttc 16750062  T
Q  315 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 414  Q
    || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  16750061 ttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 16749962  T
Q  415 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 514  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  16749961 gatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtagg 16749862  T
Q  515 tctagc 520  Q
    ||||||    
T  16749861 tctagc 16749856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 15424005 - 15424511
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| | |    
T  15424005 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactcg 15424104  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15424105 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 15424204  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| |  ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  15424205 atactttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 15424304  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  15424305 tttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 15424404  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  15424405 ggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 15424504  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  15424505 gtctagc 15424511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 24864225 - 24863719
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||| ||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  24864225 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggacgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 24864126  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||   |||||||||| || ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  24864125 gcatgatcatggctgaacagagaggatttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 24864026  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  24864025 atacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 24863926  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  24863925 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 24863826  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  24863825 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 24863726  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  24863725 gtctagc 24863719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 29549953 - 29549477
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  29549953 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 29549854  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||    
T  29549853 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtccaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgat 29549754  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  29549753 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 29549654  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  29549653 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 29549554  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29549553 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 29549477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 20161183 - 20160704
Alignment:
Q  40 tgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggc 139  Q
    ||||||||| ||||||||| || || || |||| ||| ||||| | |||||||  ||  ||||| |||||| || |||| ||||||  |||||  |||||    
T  20161183 tgttcatcaggctctggatatcattctgcacaatgcaacaacctagaggattaaggaggcattccgggcaactgacatggtcatggctaaacaacgaggc 20161084  T
Q  140 ttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcg 239  Q
    |||| | | |||||  ||||| ||||||| | ||||  | |  || || || |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| ||||     
T  20161083 ttggtagagcttgacatgtagcggtaccaaatgagtcacgatgttgcgaacgtcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagca 20160984  T
Q  240 tgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagc 339  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |  || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  20160983 tgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagc 20160884  T
Q  340 atccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 439  Q
    | ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  20160883 acccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcct 20160784  T
Q  440 ggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20160783 ggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctag 20160704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 519
Target Start/End: Original strand, 22171648 - 22172127
Alignment:
Q  40 tgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggc 139  Q
    ||||||||| ||||||||| || || || |||| ||| ||||| | |||||||  ||  ||||| |||||| || |||| ||||||  |||||  |||||    
T  22171648 tgttcatcaggctctggatatcattctgcacaatgcaacaacctagaggattaaggaggcattccgggcaactgacatggtcatggctaaacaacgaggc 22171747  T
Q  140 ttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcg 239  Q
    |||| | | |||||  ||||| ||||||| | ||||  | |  || || || |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| ||||     
T  22171748 ttggtagagcttgacatgtagcggtaccaaatgagtcacgatgttgcgaacgtcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagca 22171847  T
Q  240 tgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagc 339  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |  || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  22171848 tgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagc 22171947  T
Q  340 atccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 439  Q
    | ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  22171948 acccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcct 22172047  T
Q  440 ggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22172048 ggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctag 22172127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 4773486 - 4773009
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    |||| |||||||||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  4773486 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctt 4773387  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||| ||| || || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  4773386 tgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 4773287  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  4773286 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 4773187  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  4773186 ccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 4773087  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4773086 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 313
Target Start/End: Original strand, 17092129 - 17092427
Alignment:
Q  15 acatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattgg 114  Q
    ||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || |||  ||| ||||||| ||     
T  17092129 acatcactaacagtcagatagttgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaatgtagcaacccaaaggatcacggaagtattatgggcaactgc 17092228  T
Q  115 catgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcata 214  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  17092229 tatgatcatggtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtttagaggcaccagaggagttgcaacactgcggacatcaagtttggtagcttcctcaca 17092328  T
Q  215 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||   || |||||||| || || ||||| ||||  ||||||||    
T  17092329 tacctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaaagtcaactttccctggtcaatgagctt 17092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 29573493 - 29573015
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  29573493 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 29573394  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  29573393 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 29573294  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  29573293 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 29573194  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || |    
T  29573193 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctag 29573094  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29573093 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 29573015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 511
Target Start/End: Original strand, 4545491 - 4545960
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    |||| |||||||||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  4545491 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 4545590  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  4545591 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 4545690  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  4545691 atttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 4545790  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  4545791 ccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 4545890  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 511  Q
    |||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  4545891 ttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 4545960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Original strand, 34463062 - 34463537
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  34463062 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 34463161  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  34463162 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 34463261  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  34463262 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 34463361  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |    
T  34463362 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctag 34463461  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  34463462 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 573 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 20160650 - 20160345
Alignment:
Q  573 atggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacg 672  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||| || |||| |    
T  20160650 atggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatg 20160551  T
Q  673 acggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 772  Q
      |||  ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20160550 gtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccggca---gcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgatg 20160454  T
Q  773 accgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatg 872  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||| |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||    
T  20160453 accgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcacctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggtg 20160354  T
Q  873 tccatctca 881  Q
     ||||||||    
T  20160353 accatctca 20160345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 573 - 881
Target Start/End: Original strand, 22172181 - 22172486
Alignment:
Q  573 atggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacg 672  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||| || |||| |    
T  22172181 atggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatg 22172280  T
Q  673 acggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 772  Q
      |||  ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22172281 gtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccggca---gcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgatg 22172377  T
Q  773 accgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatg 872  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||| |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||    
T  22172378 accgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcacctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggtg 22172477  T
Q  873 tccatctca 881  Q
     ||||||||    
T  22172478 accatctca 22172486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 4758244 - 4757767
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  4758244 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 4758145  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||||||| || || |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  4758144 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 4758045  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  4758044 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacat 4757945  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  4757944 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 4757845  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    |||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4757844 ttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4757767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 13299207 - 13299508
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  13299207 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 13299306  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  13299307 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 13299406  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| || ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  13299407 accatatctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 13299506  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  13299507 tc 13299508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 24863657 - 24863356
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| || ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  24863657 ttaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggag 24863558  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24863557 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24863458  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| | |||| || |||||    
T  24863457 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttctcatggtgaccatc 24863358  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  24863357 tc 24863356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 16674619 - 16674144
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   || ||||| ||||    
T  16674619 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaatagagaagctt 16674520  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  16674519 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 16674420  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  16674419 atttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 16674320  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  16674319 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 16674220  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16674219 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 16674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 27008205 - 27007730
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||    |||| |||||||||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  27008205 catcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 27008106  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  27008105 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 27008006  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| ||||  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  27008005 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 27007906  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||     
T  27007905 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtc 27007806  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27007805 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 27007730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 15424573 - 15424874
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  15424573 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 15424672  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  15424673 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 15424772  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | || |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  15424773 accatacctctttgatgcattcacagaagattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 15424872  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  15424873 tc 15424874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 4525764 - 4525289
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||     |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  4525764 catcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 4525665  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    |||| |||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  4525664 catagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 4525565  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||    
T  4525564 ttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacaccc 4525465  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||| | |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  4525464 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgggatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 4525365  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    ||||| || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4525364 gtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4525289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 519
Target Start/End: Original strand, 27359710 - 27360185
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||    |||| |||||||||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  27359710 catcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctttg 27359809  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    |||| |||||| || || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  27359810 catagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 27359909  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||    
T  27359910 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatcc 27360009  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  27360010 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 27360109  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27360110 gtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctag 27360185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 519
Target Start/End: Original strand, 27450053 - 27450528
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||    |||| |||||||||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  27450053 catcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctttg 27450152  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    |||| |||||| || || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  27450153 catagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 27450252  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||    
T  27450253 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatcc 27450352  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  27450353 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 27450452  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27450453 gtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctag 27450528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Original strand, 22935136 - 22935434
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||  ||||||| ||||| ||||||   |    
T  22935136 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggca 22935235  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  22935236 tttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 22935335  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  22935336 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 22935434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Original strand, 23857581 - 23857879
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||  ||||||| ||||| ||||||   |    
T  23857581 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggca 23857680  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  23857681 tttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 23857780  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  23857781 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 23857879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 30557732 - 30558210
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  30557732 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 30557831  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  30557832 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatg 30557931  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  30557932 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 30558031  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  30558032 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 30558131  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30558132 ttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 30558210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 511
Target Start/End: Original strand, 4723850 - 4724319
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   ||| ||||||||||  | ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  4723850 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcagcccaaaggatctcggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 4723949  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  4723950 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 4724049  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  4724050 atttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 4724149  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |    
T  4724150 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctag 4724249  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 511  Q
    | || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  4724250 tcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 4724319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 26988941 - 26988640
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  26988941 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 26988842  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  26988841 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 26988742  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  26988741 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 26988642  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  26988641 tc 26988640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 27000013 - 26999712
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  27000013 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 26999914  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  26999913 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 26999814  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  26999813 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 26999714  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  26999713 tc 26999712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 3696561 - 3696086
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||||||| ||  |  ||| || | || ||||||||||| |||   |||||||| ||||    
T  3696561 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcatgatcgtggctgaacagagaagctt 3696462  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||    
T  3696461 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttcgatcatattcacagcggcatg 3696362  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  3696361 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 3696262  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  3696261 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 3696162  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3696161 tcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 201 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 27000075
Alignment:
Q  201 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttcctt 300  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  301 ggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 400  Q
    | |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaa 27000195  T
Q  401 cctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatc 500  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||    
T  27000194 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatc 27000095  T
Q  501 ggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  27000094 ggagggaaagtaggtctagc 27000075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 28207934 - 28207465
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   ||||||||||| || || ||  ||| || | || ||| |||||||||||   |||||||| ||||    
T  28207934 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcatgatcatggctgaacagagaagctt 28207835  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||||| |||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  28207834 tgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 28207735  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||     
T  28207734 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacac 28207635  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |    
T  28207634 ccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctag 28207535  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 511  Q
    | || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28207534 tcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 28207465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 27485636 - 27485132
Alignment:
Q  15 acatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattgg 114  Q
    ||||||||| |||||| | |||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || ||||    
T  27485636 acatcactaacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 27485537  T
Q  115 catgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcata 214  Q
    |||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  27485536 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcaca 27485437  T
Q  215 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 314  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| ||     
T  27485436 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 27485337  T
Q  315 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 414  Q
    || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  27485336 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 27485237  T
Q  415 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 514  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  27485236 gatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttgg 27485137  T
Q  515 tctag 519  Q
    |||||    
T  27485136 tctag 27485132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 445
Target Start/End: Original strand, 16943743 - 16944146
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  16943743 ttcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 16943842  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||    
T  16943843 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatg 16943942  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  16943943 atttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 16944042  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  16944043 ccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 16944142  T
Q  442 ttgt 445  Q
    ||||    
T  16944143 ttgt 16944146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 29501893 - 29501418
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||    |||| |||||||||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  29501893 catcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 29501794  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  29501793 cacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 29501694  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || ||    
T  29501693 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 29501594  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  29501593 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 29501494  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||    
T  29501493 gtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtctag 29501418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 579 - 829
Target Start/End: Original strand, 24304874 - 24305124
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  24304874 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 24304973  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24304974 gcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24305073  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  24305074 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 24305124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 519
Target Start/End: Original strand, 26116099 - 26116603
Alignment:
Q  15 acatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattgg 114  Q
    ||||||||  |||||| | |||| | ||||||| | || |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || ||||    
T  26116099 acatcactgacagtcagaagattatcgttcatcgaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 26116198  T
Q  115 catgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcata 214  Q
    |||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26116199 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 26116298  T
Q  215 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 314  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  ||||||||     
T  26116299 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 26116398  T
Q  315 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 414  Q
    || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  26116399 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacg 26116498  T
Q  415 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 514  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| |||||| || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  26116499 gatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagtcggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttgg 26116598  T
Q  515 tctag 519  Q
    |||||    
T  26116599 tctag 26116603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 27044868 - 27044390
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||     ||||||||| |||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  27044868 ttcattaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 27044769  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  27044768 tgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 27044669  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgt-agca 340  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| | | ||    
T  27044668 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacca 27044569  T
Q  341 tccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctg 440  Q
     || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||     
T  27044568 cccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtcta 27044469  T
Q  441 gttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27044468 gttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 27044390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 16749794 - 16749493
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  16749794 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 16749695  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
    | |  || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  16749694 acatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 16749595  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  16749594 accatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatcccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 16749495  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  16749494 tc 16749493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 579 - 723
Target Start/End: Original strand, 22477529 - 22477673
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||     
T  22477529 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacgggtacgacagag 22477628  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgac 723  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22477629 gtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattgac 22477673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 582 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 26918317 - 26918070
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  26918317 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 26918218  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26918217 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26918118  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  26918117 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 26918070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 17025650 - 17025280
Alignment:
Q  149 cttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcgga 248  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||    
T  17025650 cttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgga 17025551  T
Q  249 agaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaa 348  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |    
T  17025550 agaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcga 17025451  T
Q  349 catcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgca 448  Q
    ||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||    
T  17025450 catcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgca 17025351  T
Q  449 gtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    ||| |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17025350 gtgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 17025280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 26777328 - 26777809
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    |||| |||||||||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  26777328 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctttg 26777427  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtg-----gtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagc 238  Q
    || | ||||| ||| || |     | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||| | || || ||||| |||||||| ||    
T  26777428 cacagcttgacgtgcagagcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggattttcctcacacacttcgatcatattcacagcggc 26777527  T
Q  239 gtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtag 338  Q
     ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  26777528 atgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataa 26777627  T
Q  339 catccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtc 438  Q
    || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26777628 cacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtc 26777727  T
Q  439 tggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    | ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  |||||||| | ||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  26777728 tagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttcggcatacaacatcggtataggagggaaggttggtctagc 26777809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 560 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 28162619 - 28162485
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28162619 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 28162520  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    |||||||||||||| |||  || ||| ||||||||    
T  28162519 gcatacgggtacgatggaggtagctgagcagcatt 28162485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 570 - 694
Target Start/End: Original strand, 13522317 - 13522441
Alignment:
Q  570 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 669  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13522317 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13522416  T
Q  670 acgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13522417 acgacggaggtagctgagcagcatt 13522441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 570 - 694
Target Start/End: Original strand, 33374500 - 33374624
Alignment:
Q  570 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 669  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33374500 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33374599  T
Q  670 acgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  33374600 acgacggaggtagctgagcagcatt 33374624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 560 - 694
Target Start/End: Original strand, 8892544 - 8892678
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8892544 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 8892643  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  8892644 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8892678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 560 - 694
Target Start/End: Original strand, 8903779 - 8903913
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  8903779 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgc 8903878  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  8903879 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8903913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 571 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 29549426 - 29549117
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  29549426 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 29549327  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 770  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  29549326 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtga 29549227  T
Q  771 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 870  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  29549226 tgtccattaccatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 29549127  T
Q  871 tgtccatctc 880  Q
    || |||||||    
T  29549126 tgaccatctc 29549117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 27044338 - 27044029
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| |||||    
T  27044338 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 27044239  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 770  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  27044238 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 27044139  T
Q  771 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 870  Q
    || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  27044138 tgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 27044039  T
Q  871 tgtccatctc 880  Q
    || |||||||    
T  27044038 tgaccatctc 27044029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 3696000 - 3695702
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  3696000 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 3695901  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  3695900 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 3695801  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  3695800 atatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 3695702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 611 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 4525197 - 4525011
Alignment:
Q  611 aggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagta 710  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||    
T  4525197 aggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagta 4525098  T
Q  711 gccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 797  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  4525097 gccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 4525011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 615 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 17025166 - 17024901
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  17025166 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagcca 17025067  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 814  Q
    | | |||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||  |    
T  17025066 tagcttgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcggc 17024967  T
Q  815 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17024966 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17024901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 4757590 - 4757483
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4757590 gcattgataggagcgacagtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4757491  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  4757490 tcgatgca 4757483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 4772826 - 4772687
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  4772826 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 4772727  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  4772726 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 4772687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 27007541 - 27007402
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27007541 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27007442  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27007441 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27007402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 27484946 - 27484807
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  27484946 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctct 27484847  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27484846 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 29572842 - 29572735
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  29572842 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttt 29572743  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  29572742 tcgatgca 29572735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 615 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 29501310 - 29501096
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||||||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29501310 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 29501211  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 814  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  |  |||||||| |    
T  29501210 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacaaaggattcagc 29501111  T
Q  815 tttctcgaatacaat 829  Q
    |||||| || |||||    
T  29501110 tttctcaaacacaat 29501096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 615 - 797
Target Start/End: Original strand, 30558308 - 30558490
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  30558308 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 30558407  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 797  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  30558408 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 30558490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Original strand, 34463728 - 34463867
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  34463728 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 34463827  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34463828 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 690 - 880
Target Start/End: Original strand, 4546151 - 4546341
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4546151 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4546250  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  4546251 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 4546341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 690 - 820
Target Start/End: Original strand, 16944394 - 16944524
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  16944394 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 16944493  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 820  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  16944494 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 16944524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 690 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 28207271 - 28207081
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  28207271 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 28207172  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  28207171 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 28207081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 615 - 796
Target Start/End: Original strand, 26777919 - 26778100
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  26777919 tactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagcca 26778018  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 796  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  26778019 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 26778100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 27629389 - 27629645
Alignment:
Q  15 acatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattgg 114  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |  ||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||| ||||||  |   || || | |||| ||     
T  27629389 acatcactaacagtcagatgattatcattcatcaagctctggatatcctcttgcacaacgcggcaacccaagggattaagggcgcactcggagcaactgt 27629488  T
Q  115 catgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcata 214  Q
    |||||||||| | ||||| ||| || ||||| |  || |  || || || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  27629489 catgatcatgtttaaacaaagaagcctggcaaagtttaacatgcaggggcaccaaaggagtcgcaacattacggacatctagtttgggcgcttcttcata 27629588  T
Q  215 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagg 271  Q
      | ||||||||||| || ||||| || |  |||||||| || || |||||||||||    
T  27629589 cgcttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgagg 27629645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Original strand, 27360377 - 27360484
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27360377 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27360476  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  27360477 tcgatgca 27360484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Original strand, 27450720 - 27450827
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27450720 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27450819  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  27450820 tcgatgca 27450827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27019643 - 27019461
Alignment:
Q  15 acatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattgg 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||| | |||||||    | |||| ||||| |||||  |  ||| || |||| ||||    
T  27019643 acatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaactcaaagcattacgaaggcatcctaggcacttgg 27019544  T
Q  115 catgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagt 197  Q
    |||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  27019543 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaggggagttgcgacgttacggacatcaagt 27019461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 16673956 - 16673817
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  16673956 gcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 16673857  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  16673856 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 16673817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 868
Target Start/End: Original strand, 4724510 - 4724688
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| |    
T  4724510 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccataccttt 4724609  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 868  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  4724610 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 4724688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 696 - 797
Target Start/End: Original strand, 26116792 - 26116893
Alignment:
Q  696 ataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 795  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||    
T  26116792 ataggagcaacggtagctatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatg 26116891  T
Q  796 ca 797  Q
    ||    
T  26116892 ca 26116893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 582 - 868
Target Start/End: Original strand, 27629968 - 27630254
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| | |||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||| | ||| | | | | ||||| |  |||  ||    
T  27629968 acgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaacggtgggaagaatggatgctgagaatatggtgtacaggggtatggtggaggta 27630067  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
     ||| ||| |||||| |||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  27630068 gctgagcaacattaacaggggcgacagtagccgtagactgacctgctcccgaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtggtggccattgcc 27630167  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 868  Q
     |||||||| ||  || |||  || || ||| | ||||| |||||||| || || |||||||  || || |||||||||||||||||    
T  27630168 atacctcttcgacccacttgtagaagactcacccttctcaaatacaatgataccctctctgacggcctcctctagacgagtccccat 27630254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 868
Target Start/End: Original strand, 27272947 - 27273128
Alignment:
Q  687 gcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacc 786  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  | |  ||||| ||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || || ||||    
T  27272947 gcagcattaacaggggcgacagtagctgtagtctgacctgctccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtggtggccattgccatacc 27273046  T
Q  787 tctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 868  Q
    ||||  |  ||||||  || || ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  27273047 tcttcaacccatttgtagaagactcacccttctcaaatacaatgataccttccctgacggcttcctctagacgagtccccat 27273128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 33877756 - 33877261
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  33877756 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggtcatg 33877657  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33877656 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatc 33877557  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  33877556 atgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgt 33877457  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
      |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  33877456 gtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 33877357  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33877356 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33877261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22888979 - 22888484
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  22888979 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtaacaacccaaaggattacggaagcattctgggcaactagcatgatcatg 22888880  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22888879 gtcaaacaaagaggtttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctaggagcttcctcatatacctcaatc 22888780  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||    
T  22888779 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgt 22888680  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22888679 acttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 22888580  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22888579 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 22888484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 25199538 - 25199043
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25199538 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcatcttgaacgacgtagcaccccgaaggattacagaagcattctgggcaactggcatgatcatg 25199439  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25199438 gtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggggctttctcatatacctcaatc 25199339  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||    
T  25199338 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgt 25199239  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25199238 actttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtgg 25199139  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25199138 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagc 25199043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 13184302 - 13184796
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13184302 cagtcagataattgtcgttcatcat-ctctggatgtcattctgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 13184400  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184401 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatc 13184500  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13184501 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgt 13184600  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  13184601 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 13184700  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13184701 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13184796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 29888735 - 29889230
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||| |    
T  29888735 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcacg 29888834  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    || ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29888835 gttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatc 29888934  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||| |  |||||||| || || ||||    
T  29888935 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgt 29889034  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29889035 acttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtgg 29889134  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29889135 aggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcagcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 29889230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 15 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23892725 - 23892220
Alignment:
Q  15 acatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattgg 114  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||  |  ||| ||||||| ||||    
T  23892725 acatcactaacagttaaataattgtcattcatcaagctttggatgtcattttgaacgaagtagcaccccaaaggattacgaaggcatcctgggcagttgg 23892626  T
Q  115 catgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcata 214  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892625 catgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcata 23892526  T
Q  215 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttt 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||     
T  23892525 tacctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttc 23892426  T
Q  315 tttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacg 414  Q
    || || |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  23892425 ttcacgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcggaccggaacctgggaggcaacg 23892326  T
Q  415 gattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtagg 514  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  23892325 gatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagcaactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtagg 23892226  T
Q  515 tctagc 520  Q
    ||||||    
T  23892225 tctagc 23892220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 11326303 - 11325808
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11326303 cagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 11326204  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11326203 gtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatc 11326104  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  11326103 atgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgt 11326004  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  11326003 atttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 11325904  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11325903 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 11325808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 13440147 - 13440642
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13440147 cagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 13440246  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440247 gtcaaacagaaaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatc 13440346  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13440347 atgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgt 13440446  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  13440447 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 13440546  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13440547 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaatttagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13440642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 560 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 23892177 - 23891855
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  23892177 catttgctgaacgatggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggc 23892078  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
    ||||| ||||||||||||   |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892077 gcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 23891978  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  23891977 tcttcttatgatgtccgttaccatacctctttgatgcattcacggaggattcaactttctcgaatacaataattccttctctgacagcttcttccagacg 23891878  T
Q  860 agtccccatgatgtccatctcat 882  Q
    |||||||||| || |||||||||    
T  23891877 agtccccatggtgaccatctcat 23891855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 560 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 25199003 - 25198682
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  25199003 catttgctgaacgacggcgttaacgagtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggc 25198904  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
    ||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  25198903 gcatatgggtacgacggaggcaattgggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttcct 25198804  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  25198803 tcttcttatgatgtccgttaccgtacctctttgatgcattcacggaggattcaactttctcgaatacaataattccttctctgacagcttcttccagatg 25198704  T
Q  860 agtccccatgatgtccatctca 881  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  25198703 agtccccatggtgaccatctca 25198682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 9548196 - 9548691
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  9548196 cagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcataatcatg 9548295  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || |||    
T  9548296 gtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatc 9548395  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || |    
T  9548396 atattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatat 9548495  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9548496 acttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 9548595  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
     ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9548596 gggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 9548691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 520
Target Start/End: Original strand, 23752095 - 23752598
Alignment:
Q  17 atcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggca 116  Q
    ||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||||    |||||||||||||||||   |  ||| || |||| ||||||    
T  23752095 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggca 23752194  T
Q  117 tgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatata 216  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23752195 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 23752294  T
Q  217 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttt 316  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||    
T  23752295 cttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 23752394  T
Q  317 tacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 416  Q
     || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||||    
T  23752395 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacgga 23752494  T
Q  417 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtc 516  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23752495 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 23752594  T
Q  517 tagc 520  Q
    ||||    
T  23752595 tagc 23752598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 24687827 - 24688305
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || ||||  ||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  24687827 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacatggcatgatcatggctgaacagagaagctt 24687926  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  24687927 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatg 24688026  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
T  24688027 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcac 24688126  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24688127 ccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 24688226  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24688227 ttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaatatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24688305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 30935153 - 30934647
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||| | ||||||   | ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  30935153 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 30935054  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  30935053 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagcttcctcac 30934954  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  30934953 atacttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 30934854  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  30934853 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaac 30934754  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  30934753 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 30934654  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  30934653 gtctagc 30934647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 33778004 - 33777501
Alignment:
Q  17 atcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggca 116  Q
    ||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| ||||||    
T  33778004 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 33777905  T
Q  117 tgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatata 216  Q
    |||||||||   || ||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  33777904 tgatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 33777805  T
Q  217 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttt 316  Q
    | || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||    
T  33777804 cttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttttt 33777705  T
Q  317 tacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 416  Q
     || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||||    
T  33777704 cacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacgga 33777605  T
Q  417 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtc 516  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33777604 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtc 33777505  T
Q  517 tagc 520  Q
    ||||    
T  33777504 tagc 33777501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 23717658 - 23718136
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  23717658 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 23717757  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  23717758 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatg 23717857  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  23717858 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 23717957  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23717958 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 23718057  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23718058 ttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 23718136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 11549846 - 11549368
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  11549846 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 11549747  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  11549746 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatg 11549647  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  11549646 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 11549547  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11549546 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 11549447  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11549446 ttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 11549368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 24970538 - 24970032
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  24970538 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 24970439  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  24970438 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 24970339  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
     ||| |  ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||    |||||||| |  ||||||||    
T  24970338 gtactttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtccgctttccttgatcaatgagctt 24970239  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  24970238 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 24970139  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  24970138 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 24970039  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  24970038 gtctagc 24970032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 22998784 - 22999262
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  22998784 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 22998883  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  22998884 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatg 22998983  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  22998984 gtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 22999083  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22999084 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 22999183  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22999184 ttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 22999262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 15658430 - 15658908
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||||||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  15658430 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 15658529  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||||| |||||||| || ||    
T  15658530 cgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacatttcgatcatattcacagcggcatg 15658629  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  15658630 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 15658729  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  15658730 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 15658829  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15658830 ttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 15658908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 24688367 - 24688668
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  24688367 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 24688466  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24688467 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24688566  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  24688567 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 24688666  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  24688667 tc 24688668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 12132647 - 12132169
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| || | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  12132647 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 12132548  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  12132547 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 12132448  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  12132447 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 12132348  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  12132347 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 12132248  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  12132247 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 12132169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 31431930 - 31431463
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    |||| |||||||||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  31431930 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 31431831  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    |||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  31431830 catagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 31431731  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||    
T  31431730 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatcc 31431631  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||     
T  31431630 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtc 31431531  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 511  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  31431530 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 31431463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 9317943 - 9317465
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  9317943 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 9317844  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  9317843 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 9317744  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  9317743 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 9317644  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  9317643 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 9317544  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  9317543 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 9317465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Original strand, 18500400 - 18500877
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  18500400 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 18500499  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  18500500 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 18500599  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  18500600 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 18500699  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  18500700 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 18500799  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    | || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18500800 tcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 28649727 - 28649250
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||     ||||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  28649727 ttcatcaagctttggatgtcgtcctgaacggtatagcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 28649628  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  28649627 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 28649528  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  28649527 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 28649428  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  28649427 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 28649328  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    | || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28649327 tcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Original strand, 37671153 - 37671630
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  37671153 ttcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 37671252  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||||||| || || |||||||| |   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  37671253 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggcgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 37671352  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  37671353 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 37671452  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  37671453 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 37671552  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37671553 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 2511541 - 2511065
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  2511541 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 2511442  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  2511441 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 2511342  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  2511341 ttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 2511242  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  2511241 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagtt 2511142  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  2511141 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 2511065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 6874797 - 6874319
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || ||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  6874797 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggttgaacagagaagctt 6874698  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  6874697 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 6874598  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  6874597 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 6874498  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6874497 ccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctag 6874398  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  6874397 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcagctcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 6874319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 41675201 - 41674723
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    |||||||||||||||||| ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  41675201 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 41675102  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| |  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||    
T  41675101 tgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatg 41675002  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| |||||     
T  41675001 atttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcac 41674902  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  41674901 ccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 41674802  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41674801 ttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 41674723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 517
Target Start/End: Original strand, 31826079 - 31826552
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  31826079 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcttggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 31826178  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  31826179 cacagcttgatgtgcagaggcaccaaaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 31826278  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||    
T  31826279 ttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacaccc 31826378  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  31826379 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 31826478  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31826479 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 31826552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 30152508 - 30152032
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    | ||||||||||||| || ||  ||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| |||| |    
T  30152508 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctttg 30152409  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  30152408 cacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 30152309  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  30152308 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 30152209  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  30152208 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 30152109  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30152108 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 30152032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 30168961 - 30168483
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |  | ||||||||||||| || || |||| |  | || || ||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  30168961 ttcattaagctttggatgtcgtcttgaacagcataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttagcatgatcatgattgaacagagaagctt 30168862  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||| || ||||| |||||||| || ||    
T  30168861 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcttcacatacttcgatcatattcacagcggcatg 30168762  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  30168761 atttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaaagtgagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 30168662  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  30168661 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 30168562  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    | || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30168561 tcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 30168483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 43078744 - 43078269
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  43078744 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 43078645  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  43078644 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 43078545  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  43078544 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 43078445  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  43078444 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 43078345  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    | || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43078344 tcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 43078269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Original strand, 37358313 - 37358790
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  37358313 ttcatcaatctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 37358412  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  37358413 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 37358512  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||     
T  37358513 atttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacac 37358612  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  37358613 ccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 37358712  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    |||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37358713 ttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37358790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 32599144 - 32599620
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    |||| |||||||||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  32599144 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctttg 32599243  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  32599244 cacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggggcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 32599343  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  32599344 tcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 32599443  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||     
T  32599444 ctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtc 32599543  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32599544 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 32599620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 517
Target Start/End: Original strand, 40473223 - 40473694
Alignment:
Q  46 tcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggca 145  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||||||| || || |||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| |||    
T  40473223 tcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcatggtcatggctgaacagagaagctttgca 40473322  T
Q  146 taacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattc 245  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||     
T  40473323 cagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattt 40473422  T
Q  246 ggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcctt 345  Q
    || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || |    
T  40473423 gggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccct 40473522  T
Q  346 caacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 445  Q
    | ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  40473523 cgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgt 40473622  T
Q  446 gcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  40473623 gcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 40473694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 8665145 - 8665623
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   ||||| || ||||    
T  8665145 ttcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctt 8665244  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  8665245 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 8665344  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  8665345 atttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 8665444  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8665445 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctag 8665544  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  8665545 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 8665623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 26480883 - 26480406
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || | || |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  26480883 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagatatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 26480784  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  26480783 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagag-agttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 26480685  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  26480684 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 26480585  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  26480584 ccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctag 26480485  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26480484 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 26480406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 33516848 - 33516370
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  33516848 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 33516749  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  33516748 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatg 33516649  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  33516648 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 33516549  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  33516548 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 33516449  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33516448 ttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 33516370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 23752660 - 23752961
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  23752660 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 23752759  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  23752760 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 23752859  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  23752860 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 23752959  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  23752960 tc 23752961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 24681930 - 24681457
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| |    
T  24681930 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagagaagctttg 24681831  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  24681830 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 24681731  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  24681730 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 24681631  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  24681630 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 24681531  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24681530 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24681457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 24724457 - 24723984
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| |    
T  24724457 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagagaagctttg 24724358  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  24724357 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 24724258  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  24724257 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 24724158  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  24724157 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 24724058  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24724057 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24723984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 30934588 - 30934287
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  30934588 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 30934489  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  30934488 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattggccggctccggtagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 30934389  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  30934388 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 30934289  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  30934288 tc 30934287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 15758529 - 15759005
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| |   |||||| ||||||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   ||||| || |||| |    
T  15758529 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctttg 15758628  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  15758629 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 15758728  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  15758729 ttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 15758828  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15758829 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagtt 15758928  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  15758929 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 15759005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 30029907 - 30029504
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  30029907 ttcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcgtggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 30029808  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  30029807 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 30029708  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  30029707 atttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 30029608  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  30029607 ccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 30029508  T
Q  442 ttgt 445  Q
    ||||    
T  30029507 ttgt 30029504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 5638366 - 5637924
Alignment:
Q  78 caacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 177  Q
    ||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5638366 caacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttg 5638267  T
Q  178 caacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagtt 277  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  5638266 cgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacatt 5638167  T
Q  278 gttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaa 377  Q
     || ||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| ||     
T  5638166 attttcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaag 5638067  T
Q  378 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 477  Q
    ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |    
T  5638066 tcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagca 5637967  T
Q  478 actcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5637966 actcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 5637924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 18375082 - 18375560
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || ||  ||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  18375082 ttcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 18375181  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||    
T  18375182 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatg 18375281  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  18375282 atttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 18375381  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  18375382 ccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 18375481  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18375482 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 18375560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 686 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 24951955 - 24951761
Alignment:
Q  686 ggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtac 785  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  24951955 ggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttaccatac 24951856  T
Q  786 ctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  24951855 ctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 24951761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Original strand, 13324499 - 13324976
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  13324499 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 13324598  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  13324599 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 13324698  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  13324699 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 13324798  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || |    
T  13324799 ccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctag 13324898  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13324899 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 13324976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 33293015 - 33292539
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||   ||| |||||||| || | | |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||   | ||||||    
T  33293015 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcagcatgatcatgttcaaacaataaagcttgg 33292916  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  33292915 cacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcatcatgat 33292816  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  33292815 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 33292716  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  33292715 ctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 33292616  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33292615 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 33292539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 23718198 - 23718500
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  23718198 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 23718297  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  23718298 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 23718397  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagctt-cttctagacgagtccccatgatgtccat 877  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||| |||| |||||||| |||||| || ||||    
T  23718398 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttccttccagacgagttcccatggtgaccat 23718497  T
Q  878 ctc 880  Q
    |||    
T  23718498 ctc 23718500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 34617010 - 34616532
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||     ||||||||| |||||||| |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  34617010 ttcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 34616911  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||  || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  34616910 tgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 34616811  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  34616810 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 34616711  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  34616710 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 34616611  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34616610 ttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 34616532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 3790033 - 3789556
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  3790033 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 3789934  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  3789933 tgcacagcttgatgtgcagaggcactagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 3789834  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  3789833 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 3789734  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  3789733 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 3789634  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3789633 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3789556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 11549306 - 11549005
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  11549306 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgtgaatacggcacatatgggtatgacggag 11549207  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  11549206 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 11549107  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  11549106 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 11549007  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  11549006 tc 11549005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 560 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 22888444 - 22888287
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  22888444 catttgctgaacgacggcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 22888345  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 717  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888344 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Original strand, 37770657 - 37771134
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||    | ||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  37770657 ttcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacaaagaagctt 37770756  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  37770757 tgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 37770856  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || |  || ||||||||||| || ||     
T  37770857 atttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacac 37770956  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  37770957 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 37771056  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    | || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37771057 tcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 28959456 - 28959934
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||     ||| |||||||||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  28959456 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctt 28959555  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | ||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||  |||||| | || || ||||| || ||||| || ||    
T  28959556 tgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagtctcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatg 28959655  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  28959656 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 28959755  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  28959756 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 28959855  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28959856 ttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 28959934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 445
Target Start/End: Original strand, 29966805 - 29967139
Alignment:
Q  111 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 210  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  29966805 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 29966904  T
Q  211 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 310  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  29966905 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 29967004  T
Q  311 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 410  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  29967005 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 29967104  T
Q  411 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 445  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29967105 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 29967139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 33777439 - 33777138
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  33777439 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 33777340  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  33777339 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 33777240  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  33777239 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 33777140  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  33777139 tc 33777138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 37755472 - 37754995
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||    | ||||||||||||| || ||  ||  || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  37755472 ttcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcaccctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 37755373  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  37755372 tgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 37755273  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  37755272 atttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 37755173  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |    
T  37755172 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctag 37755073  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    | || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37755072 tcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 579 - 879
Target Start/End: Original strand, 22999324 - 22999624
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  22999324 ttaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 22999423  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  22999424 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 22999523  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  22999524 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 22999623  T
Q  879 t 879  Q
    |    
T  22999624 t 22999624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 570 - 694
Target Start/End: Original strand, 13184846 - 13184970
Alignment:
Q  570 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 669  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13184846 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13184945  T
Q  670 acgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13184946 acgacggaggtagctgagcagcatt 13184970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 570 - 694
Target Start/End: Original strand, 13440692 - 13440816
Alignment:
Q  570 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 669  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13440692 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13440791  T
Q  670 acgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13440792 acgacggaggtagctgagcagcatt 13440816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 570 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 33877211 - 33877087
Alignment:
Q  570 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 669  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33877211 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33877112  T
Q  670 acgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  33877111 acgacggaggtagctgagcagcatt 33877087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 582 - 829
Target Start/End: Original strand, 9548756 - 9549003
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  9548756 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 9548855  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  9548856 tttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 9548955  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
     |||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9548956 atacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9549003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 560 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 11325768 - 11325634
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11325768 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 11325669  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  11325668 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 11325634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Original strand, 15658973 - 15659271
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||| | ||  || |||| || || ||||||   |    
T  15658973 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatggatatgacggaggca 15659072  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  15659073 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 15659172  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  15659173 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 15659271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 582 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 41674658 - 41674420
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||   ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  41674658 acgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagcatacggcacatatgggtatgacggaggca 41674559  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  41674558 tttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 41674459  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 820  Q
     |||||||| || |||||  | ||||||||  |||||||    
T  41674458 atacctcttcgacgcattcacagaggattcggctttctc 41674420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 582 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 31431377 - 31431130
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  31431377 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 31431278  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  31431277 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 31431178  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  31431177 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 31431130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 615 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 2510967 - 2510753
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  2510967 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagcca 2510868  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 814  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||| |    
T  2510867 tggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcactcacagaggattcagc 2510768  T
Q  815 tttctcgaatacaat 829  Q
    |||||| || |||||    
T  2510767 tttctcaaacacaat 2510753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 582 - 796
Target Start/End: Original strand, 8665688 - 8665902
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  8665688 acgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 8665787  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  8665788 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 8665887  T
Q  782 gtacctctttgatgc 796  Q
     |||||||| |||||    
T  8665888 atacctcttcgatgc 8665902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 690 - 868
Target Start/End: Original strand, 40473873 - 40474051
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  40473873 gcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctct 40473972  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 868  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||    
T  40473973 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcttcaagacgggttcccat 40474051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 9317292 - 9317153
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  9317292 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 9317193  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    |||||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9317192 ttgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9317153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 582 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 30168418 - 30168171
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  30168418 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggca 30168319  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  30168318 tttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 30168219  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  30168218 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 30168171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 615 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 24681353 - 24681171
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24681353 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24681254  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 797  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24681253 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24681171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 615 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 24723880 - 24723698
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24723880 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24723781  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 797  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24723780 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24723698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 43078198 - 43077900
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||||||||||   |    
T  43078198 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtacgacggaggca 43078099  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  43078098 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagttgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 43077999  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  43077998 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcgagacgggttcccatggtgaccatctc 43077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 615 - 880
Target Start/End: Original strand, 18375658 - 18375923
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  18375658 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 18375757  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 814  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  18375758 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 18375857  T
Q  815 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18375858 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 18375923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 6874143 - 6874004
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  6874143 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 6874044  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    |||||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  6874043 ttgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 6874004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 12131996 - 12131889
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  12131996 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctct 12131897  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  12131896 tcgatgca 12131889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 582 - 829
Target Start/End: Original strand, 18500961 - 18501208
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  18500961 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 18501060  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18501061 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 18501160  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  18501161 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 18501208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Original strand, 37771320 - 37771427
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37771320 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 37771419  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  37771420 tcgatgca 37771427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 3789475 - 3789177
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| ||||||||  | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  3789475 acgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 3789376  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  3789375 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 3789276  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  3789275 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 3789177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 690 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 5637751 - 5637561
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  5637751 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 5637652  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5637651 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5637561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 690 - 832
Target Start/End: Original strand, 15759178 - 15759320
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  15759178 gcattgataggagcaacagtagccattgattgacctgctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 15759277  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 832  Q
    | || ||| |||| || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  15759278 tcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 15759320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 579 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 24969976 - 24969878
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacgga 677  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||    
T  24969976 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacgga 24969878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 702 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 30151847 - 30151669
Alignment:
Q  702 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttg 801  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |    
T  30151847 gcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcg 30151748  T
Q  802 cggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
      || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  30151747 tagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 30151669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 690 - 868
Target Start/End: Original strand, 37358976 - 37359154
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37358976 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 37359075  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 868  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| |||||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  37359076 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaatacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 37359154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 26480233 - 26480094
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  26480233 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 26480134  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26480133 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26480094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Original strand, 31826740 - 31826847
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  31826740 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 31826839  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  31826840 tcgatgca 31826847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Original strand, 37671813 - 37671920
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37671813 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 37671912  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  37671913 tcgatgca 37671920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 37754809 - 37754670
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  37754809 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 37754710  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | || ||| |||| || |||||| ||||||| || |||||    
T  37754709 tcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaat 37754670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 615 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 33516272 - 33516090
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  33516272 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatgggagcaacggtagcca 33516173  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 797  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  33516172 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 33516090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 615 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 34616437 - 34616223
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  34616437 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggtgcaacagtagcca 34616338  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 814  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  34616337 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 34616238  T
Q  815 tttctcgaatacaat 829  Q
    |||||| || |||||    
T  34616237 tttctcaaacacaat 34616223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 615 - 797
Target Start/End: Original strand, 32599715 - 32599897
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  32599715 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtca 32599814  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  32599815 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 32599897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Original strand, 13325165 - 13325304
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  13325165 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccagctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 13325264  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  13325265 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 13325304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 702 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 28649055 - 28648937
Alignment:
Q  702 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttg 801  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||      
T  28649055 gcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattca 28648956  T
Q  802 cggaggattcaactttctc 820  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  28648955 cagaggattcagctttctc 28648937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 691 - 797
Target Start/End: Original strand, 28960120 - 28960226
Alignment:
Q  691 cattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctt 790  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||    
T  28960120 cattgataggtgcaacagtagccgttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctt 28960219  T
Q  791 tgatgca 797  Q
     ||||||    
T  28960220 cgatgca 28960226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 690 - 820
Target Start/End: Original strand, 29967387 - 29967517
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||    
T  29967387 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctct 29967486  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 820  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  29967487 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 29967517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 690 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 30029256 - 30029126
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||    
T  30029256 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctct 30029157  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 820  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  30029156 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 30029126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 33292488 - 33292340
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  33292488 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 33292389  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 719  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  33292388 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 33292340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 44563599 - 44563106
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44563599 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 44563500  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563499 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatc 44563400  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  44563399 atgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaactttccttggtctatgag-ttttttacaatgt 44563302  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  44563301 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtgg 44563202  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44563201 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 44563106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 19658755 - 19659249
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19658755 cagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattttgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 19658854  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19658855 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgggtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctcaatc 19658954  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19658955 atgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgt 19659053  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | ||||||    
T  19659054 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtgg 19659153  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19659154 aggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 19659249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 33245165 - 33244670
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  33245165 cagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatg 33245066  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  || ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33245065 gtcaaacagagaggcttggcataatttgatgtgtagtggcaccataggagttgcaacgttacaaacgtccggtctgagagcttcctcatatacctcaatc 33244966  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33244965 atgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgt 33244866  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||| | ||||||    
T  33244865 acctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttaggaggcgacgggtcaggtgg 33244766  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33244765 aggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcaacatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33244670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 26 - 517
Target Start/End: Original strand, 22080594 - 22081085
Alignment:
Q  26 agtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatgg 125  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||||  |   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22080594 agtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctggacaattggcatgatcatgg 22080693  T
Q  126 tcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatca 225  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||    ||| ||||    
T  22080694 tcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacgaacgtcaagactgggaacttcttcatgagtctcgatca 22080793  T
Q  226 tgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||||    
T  22080794 tgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaatgta 22080893  T
Q  326 cttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgga 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22080894 cttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtgga 22080993  T
Q  426 ggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22080994 ggctttccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 22081085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 18711086 - 18710591
Alignment:
Q  25 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18711086 cagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatg 18710987  T
Q  125 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18710986 gtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatc 18710887  T
Q  225 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || |    
T  18710886 atgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatat 18710787  T
Q  325 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 424  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||| ||||| |||||     
T  18710786 acttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtga 18710687  T
Q  425 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
     ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18710686 gggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 18710591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 77 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 9355071 - 9354627
Alignment:
Q  77 gcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagtt 176  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||  || ||||||||||||    
T  9355071 gcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagtt 9354972  T
Q  177 gcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 276  Q
    || || || |||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |    
T  9354971 gcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacat 9354872  T
Q  277 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt-acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatgga 375  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  9354871 tattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagttttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatgga 9354772  T
Q  376 aatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 475  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9354771 aatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggag 9354672  T
Q  476 taactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9354671 taattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 9354627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16283932 - 16283454
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || ||||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  16283932 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaaatggtatgatcatggctaaacagagaagctt 16283833  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||||| |||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||    
T  16283832 tgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacattacggacaacaagtctaggagcttcctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatg 16283733  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  16283732 atttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 16283633  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16283632 ccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 16283533  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || |||||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16283532 ttgtacaatgccctctaaggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagc 16283454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16278065 - 16277559
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||| | |||||||    |||||| |||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  16278065 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaactcaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 16277966  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16277965 gcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 16277866  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  16277865 atacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 16277766  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  16277765 cttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaac 16277666  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  16277665 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtag 16277566  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  16277565 gtctagc 16277559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 27608609 - 27609115
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  27608609 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 27608708  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||   || || || |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27608709 gcatgatcatggctgaatagggaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 27608808  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  27608809 atacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 27608908  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  27608909 cttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 27609008  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  27609009 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 27609108  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  27609109 gtctagc 27609115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 19688581 - 19688103
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| |||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  19688581 ttcatcaagctttggatgtcatcttggacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 19688482  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  19688481 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatg 19688382  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
T  19688381 atttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcac 19688282  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19688281 ccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 19688182  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19688181 ttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 19688103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 2136963 - 2137469
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  2136963 gacatcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 2137062  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  2137063 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctttctcac 2137162  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    || | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  2137163 atgcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 2137262  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  2137263 tttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 2137362  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  2137363 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 2137462  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  2137463 gtctagc 2137469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14558135 - 14557629
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  14558135 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 14558036  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    |||||||||||    |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  14558035 gcatgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcac 14557936  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  14557935 atacttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 14557836  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  14557835 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 14557736  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14557735 ggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtag 14557636  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  14557635 gtctagc 14557629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 16283392 - 16283091
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||     
T  16283392 ttaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 16283293  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16283292 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16283193  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16283192 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaatacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16283093  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  16283092 tc 16283091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 31489484 - 31489960
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    |||| ||||||||||  ||||  ||| || | || |||||||||||||| |  |||||||| |||| |    
T  31489484 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcccagaggcatcctagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctttg 31489583  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  31489584 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 31489683  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  31489684 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 31489783  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  31489784 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 31489883  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31489884 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 31489960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Original strand, 3329239 - 3329716
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  3329239 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 3329338  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||  || ||    
T  3329339 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatg 3329438  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  3329439 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 3329538  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  3329539 ccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 3329638  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3329639 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 19674922 - 19674446
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  19674922 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 19674823  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  19674822 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 19674723  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || |     
T  19674722 ttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacct 19674623  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  19674622 ctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagtt 19674523  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  19674522 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 19674446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 19208092 - 19208570
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  19208092 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 19208191  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  19208192 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 19208291  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  19208292 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 19208391  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  19208392 ccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctag 19208491  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  19208492 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 19208570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 16277497 - 16277196
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16277497 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 16277398  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  16277397 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 16277298  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16277297 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16277198  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  16277197 tc 16277196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 19688041 - 19687740
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  19688041 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggag 19687942  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  19687941 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 19687842  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  19687841 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 19687742  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  19687741 tc 19687740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 28361687 - 28362165
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  28361687 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 28361786  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  28361787 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 28361886  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  28361887 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 28361986  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  28361987 ccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 28362086  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28362087 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 28362165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 560 - 881
Target Start/End: Original strand, 22081125 - 22081446
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22081125 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 22081224  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
       ||| | |||| ||||  || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22081225 atgtactgatacggcggaggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 22081324  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    |||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||    
T  22081325 tcttcttatgatgaccattgccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacatttttcaaacacaataatgccatctctgacagcctcttctaagcg 22081424  T
Q  860 agtccccatgatgtccatctca 881  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  22081425 ggttcccatggtgaccatctca 22081446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 31355005 - 31354529
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||| ||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   ||||| || |||| |    
T  31355005 catcaggctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctttg 31354906  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  31354905 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 31354806  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  31354805 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 31354706  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31354705 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagtt 31354606  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31354605 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcggcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 31354529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 29829803 - 29829328
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    |||| |||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  29829803 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 29829704  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  29829703 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 29829604  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  29829603 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 29829504  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||     
T  29829503 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtg 29829404  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || || || | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29829403 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttctgcgtacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 29829328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 2137531 - 2137832
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  2137531 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 2137630  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  2137631 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 2137730  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || | ||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  2137731 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattcattccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 2137830  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  2137831 tc 2137832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Original strand, 12092456 - 12092933
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   ||||||||||| || || ||  ||| || | || ||| |||||||||||   |||||||| ||||    
T  12092456 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcatgatcatggctgaacagagaagctt 12092555  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||||| |||||| || || || |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  12092556 tgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtgacaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 12092655  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  12092656 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 12092755  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  12092756 ccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 12092855  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    |||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12092856 ttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 19286945 - 19286468
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||     ||||||||| |||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  19286945 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 19286846  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  19286845 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 19286746  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  19286745 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 19286646  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |    
T  19286645 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctag 19286546  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 519  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19286545 ttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 19286468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 14557570 - 14557269
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  14557570 ttaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 14557471  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  14557470 gcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 14557371  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  14557370 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 14557271  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  14557270 tc 14557269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 33259206 - 33258803
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  33259206 ttcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 33259107  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||    
T  33259106 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatg 33259007  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  33259006 atttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 33258907  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  33258906 ccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 33258807  T
Q  442 ttgt 445  Q
    ||||    
T  33258806 ttgt 33258803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 27609177 - 27609478
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||   | |||| ||||| ||||||     
T  27609177 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgacacatatgggtatgacggag 27609276  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  27609277 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 27609376  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  27609377 accatacctctttgatgcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 27609476  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  27609477 tc 27609478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 106 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 189513 - 189256
Alignment:
Q  106 ggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagc 205  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  189513 ggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagc 189414  T
Q  206 ttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggttt 305  Q
    ||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |      
T  189413 ttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatca 189314  T
Q  306 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagag 363  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  189313 ataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 570 - 694
Target Start/End: Original strand, 19659299 - 19659423
Alignment:
Q  570 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 669  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19659299 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 19659398  T
Q  670 acgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  19659399 acgacggaggtagctgagcagcatt 19659423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 579 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 44563047 - 44562932
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  44563047 ttaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggag 44562948  T
Q  679 ataactgggcagcatt 694  Q
     || ||| ||||||||    
T  44562947 gtagctgagcagcatt 44562932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 570 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 9354577 - 9354453
Alignment:
Q  570 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggt 669  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9354577 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 9354478  T
Q  670 acgacggaaataactgggcagcatt 694  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  9354477 acgacggaggtagctgagcagcatt 9354453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 18710526 - 18710228
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  18710526 acgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggca 18710427  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18710426 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 18710327  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18710326 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 18710228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 19674378 - 19674080
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  19674378 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 19674279  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  19674278 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacgtccgtttctttcttcttgtgatgtccattacc 19674179  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  19674178 atacctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcgaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 19674080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 588 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 19286399 - 19286158
Alignment:
Q  588 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 687  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  19286399 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 19286300  T
Q  688 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 787  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  19286299 ctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 19286200  T
Q  788 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    ||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  19286199 cttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 19286158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 582 - 820
Target Start/End: Original strand, 31490025 - 31490263
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  31490025 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggca 31490124  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  31490125 tttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 31490224  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 820  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  31490225 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctc 31490263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 571 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 31354475 - 31354250
Alignment:
Q  571 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggta 670  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| |||||    
T  31354475 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 31354376  T
Q  671 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 770  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  31354375 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 31354276  T
Q  771 tgaccgttaccgtacctctttgatgc 796  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  31354275 tgtccattaccatacctcttcgatgc 31354250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Original strand, 19208743 - 19208850
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||| |||    
T  19208743 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacttct 19208842  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  19208843 tcgatgca 19208850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 702 - 829
Target Start/End: Original strand, 28362350 - 28362477
Alignment:
Q  702 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttg 801  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |      
T  28362350 gcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactca 28362449  T
Q  802 cggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  28362450 cagaggattcagctttctcaaacacaat 28362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 868
Target Start/End: Original strand, 3329902 - 3330080
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  3329902 gcattgataggagcaacgatagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 3330001  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 868  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||    
T  3330002 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgagttcccat 3330080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 690 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 29829145 - 29828967
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  29829145 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 29829046  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 868  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  29829045 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatctctgacggcttcctcaagacgggttcccat 29828967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Original strand, 19518526 - 19518665
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  19518526 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 19518625  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  19518626 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 19518665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 690 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 33258555 - 33258425
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  33258555 gcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgcccattaccatatctct 33258456  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 820  Q
    | || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  33258455 tcgacgcattcacagaggattcagctttctc 33258425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 880
Target Start/End: Original strand, 12093116 - 12093306
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  12093116 gcattgataggagcaatagtagccatagattggccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 12093215  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  12093216 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 12093306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18791218 - 18791107
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||| | |||| ||  | ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||    
T  18791218 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgagcagtgtagcaacccaaaggattacgaatgcatcctaggcacttg 18791119  T
Q  114 gcatgatcatgg 125  Q
    ||||||||||||    
T  18791118 gcatgatcatgg 18791107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 35 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 22051 - 21569
Alignment:
Q  35 attgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacaga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22051 attgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacaag 21952  T
Q  135 gaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacag 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||  |||||   ||| |||||||||||||    
T  21951 gaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagaccgggaactttttcataagtctcgatcatgttcacag 21852  T
Q  235 cagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21851 cagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaatctacttcaaagc 21752  T
Q  335 gtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccc 434  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21751 gtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttaggtggaggcttgccc 21652  T
Q  435 tgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 517  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21651 tgcctggttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 21569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 560 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 21529 - 21208
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21529 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 21430  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
       ||| |||||| ||||  || ||| | |||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21429 atgtactggtacggcggaggtagctgagaagcattgatgggggcaacagtagccacggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 21330  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||| ||| |||||||  ||    
T  21329 tcttcttatgatgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataattccgtctctgacagcctcttctaagcg 21230  T
Q  860 agtccccatgatgtccatctca 881  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  21229 ggttcccatggtgaccatctca 21208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 560 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 20374 - 20053
Alignment:
Q  560 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgc 659  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  20374 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggc 20275  T
Q  660 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 759  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20274 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 20175  T
Q  760 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 859  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20174 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaacacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 20075  T
Q  860 agtccccatgatgtccatctca 881  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  20074 agtccccatggtgaccatctca 20053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 183 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20729 - 20393
Alignment:
Q  183 ttacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttct 282  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20729 ttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttct 20630  T
Q  283 caaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 382  Q
    |||| |||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629 caaaagttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 20531  T
Q  383 cttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcg 482  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20530 cttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactca 20431  T
Q  483 gcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20430 gcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagc 20393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 30935 - 30532
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  30935 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctt 30836  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  30835 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatg 30736  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  30735 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 30636  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  30635 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 30536  T
Q  442 ttgt 445  Q
    ||||    
T  30535 ttgt 30532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 30396 - 30095
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  30396 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 30297  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  30296 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 30197  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||| | ||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  30196 accatacctcctcgatgcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 30097  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  30096 tc 30095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 242 - 520
Target Start/End: Original strand, 1 - 279
Alignment:
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctgg 200  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  201 ttgagcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 205; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 183 - 455
Target Start/End: Original strand, 1832 - 2103
Alignment:
Q  183 ttacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttct 282  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1832 ttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttct 1931  T
Q  283 caaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 382  Q
    |||| |||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1932 caaaagttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 2030  T
Q  383 cttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 455  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2031 cttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 6497 - 6080
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  6497 ttcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 6398  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  6397 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 6298  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttc-aaagcgtagca 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || |||||| ||||| || ||    
T  6297 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaagcataaca 6198  T
Q  341 tccttcaacatcatgacccagagcaccttgatg-gaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 439  Q
     || || ||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6197 cccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 6098  T
Q  440 ggttgtgcagtgccctct 457  Q
     || || || ||||||||    
T  6097 agtcgtacaatgccctct 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 690 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 5821 - 5682
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatg-gattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctc 788  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||    
T  5821 gcattgataggagcaacagtagccatttgattgaccggctccagctgacaccatccc-acttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctc 5723  T
Q  789 tttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 829  Q
    || || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  5722 ttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 5682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 178; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 379
Target Start/End: Original strand, 391 - 728
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||||||  |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  391 ttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtaacaaccccaaggattatggcggcattatgggcaattggcatgatcatggtcaaacaaggagactt 490  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  491 ggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtg 590  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  591 attcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacat 690  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatc 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  691 ccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 175; Significance: 9e-94; HSPs: 6)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 46758 - 47236
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||  |||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  46758 ttcatcaagccttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctt 46857  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  46858 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatg 46957  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||     
T  46958 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcac 47057  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47058 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 47157  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  47158 ttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 47236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 46 - 520
Target Start/End: Original strand, 39846 - 40320
Alignment:
Q  46 tcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggca 145  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |||    
T  39846 tcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgca 39945  T
Q  146 taacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattc 245  Q
     | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || |||||     
T  39946 cagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgattt 40045  T
Q  246 ggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcctt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||  || || || ||||||||||| ||||| || |    
T  40046 ggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccct 40145  T
Q  346 caacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 445  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40146 cgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 40245  T
Q  446 gcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
     || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40246 acaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 40320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 30274 - 29768
Alignment:
Q  14 gacatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattg 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||| | |||||||    |||||||||||||||| |  |  ||| || |||| |||    
T  30274 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattccgaaggcatcctaggcacttg 30175  T
Q  114 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcat 213  Q
    || |||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||     
T  30174 gcgtgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaagagcttcctcac 30075  T
Q  214 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 313  Q
    |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||    
T  30074 atacttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctt 29975  T
Q  314 ttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaac 413  Q
     || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  29974 cttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaac 29875  T
Q  414 ggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtag 513  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  29874 ggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtag 29775  T
Q  514 gtctagc 520  Q
    |||||||    
T  29774 gtctagc 29768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 29706 - 29405
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||     
T  29706 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggag 29607  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  29606 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 29507  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  29506 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 29407  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  29406 tc 29405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 582 - 880
Target Start/End: Original strand, 40385 - 40683
Alignment:
Q  582 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 681  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||| ||||   |    
T  40385 acgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacggcggaggca 40484  T
Q  682 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 781  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  40485 tttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 40584  T
Q  782 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||||    
T  40585 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatctc 40683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 47298 - 47599
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| || |||     
T  47298 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgatggag 47397  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  47398 gcatttgggctgcattgataagagcaacagtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 47497  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  47498 accatacctctttgatgcattcacggaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 47597  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  47598 tc 47599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 167; Significance: 6e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 27775 - 27297
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  27775 ttcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaatagagaagctt 27676  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||    
T  27675 tgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatg 27576  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| |||||     
T  27575 atttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcac 27476  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27475 ccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctgg 27376  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27375 ttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 27297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 27235 - 26934
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  27235 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 27136  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  27135 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 27036  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  27035 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 26936  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  26935 tc 26934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 135; Significance: 7e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 10049 - 9571
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||| ||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||| ||||||    
T  10049 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagaaaggctt 9950  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  9949 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 9850  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  9849 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacac 9750  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  9749 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctag 9650  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    | || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9649 tcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagc 9571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 611 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 8143 - 7874
Alignment:
Q  611 aggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagta 710  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||    
T  8143 aggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagta 8044  T
Q  711 gccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggatt 810  Q
    ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||    
T  8043 gccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggatt 7944  T
Q  811 caactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    || ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7943 cagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 149 - 520
Target Start/End: Original strand, 9 - 381
Alignment:
Q  149 cttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcgga 248  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||    
T  9 cttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttgga 108  T
Q  249 agaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaa 348  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |    
T  109 agaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcga 208  T
Q  349 catcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgca 448  Q
    ||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  209 catcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtaca 308  T
Q  449 gtgccctctgagaagtagagtcgggagtaact-cggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
     ||||||||  | |||| |||||| || ||||   ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  309 atgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 579 - 880
Target Start/End: Original strand, 443 - 744
Alignment:
Q  579 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaa 678  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||| ||||||     
T  443 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 542  T
Q  679 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 778  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  543 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 642  T
Q  779 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  643 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 742  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  743 tc 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 7012 - 7490
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  7012 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 7111  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||    
T  7112 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatg 7211  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  7212 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 7311  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  7312 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 7411  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  7412 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 7490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 690 - 797
Target Start/End: Original strand, 7663 - 7770
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  7663 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctct 7762  T
Q  790 ttgatgca 797  Q
    | ||||||    
T  7763 tcgatgca 7770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 8841 - 9317
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  8841 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 8940  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  8941 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 9040  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  9041 ttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 9140  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  9141 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 9240  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  9241 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 9317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20496 - 20020
Alignment:
Q  44 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 143  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  20496 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 20397  T
Q  144 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 243  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  20396 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 20297  T
Q  244 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 343  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  20296 ttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 20197  T
Q  344 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 443  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  20196 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 20097  T
Q  444 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  20096 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 20020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 793
Target Start/End: Original strand, 9490 - 9593
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  9490 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 9589  T
Q  790 ttga 793  Q
    ||||    
T  9590 ttga 9593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 120; Significance: 6e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 25974 - 26453
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  25974 ttcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 26073  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||    
T  26074 tgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatg 26173  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  26174 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 26273  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctg 440  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   ||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  26274 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaacctttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtcta 26373  T
Q  441 gttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26374 gttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 26453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 690 - 880
Target Start/End: Original strand, 26626 - 26816
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  26626 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 26725  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    | || |||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26726 tcgacgcatttacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 26816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 115; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 520
Target Start/End: Original strand, 14703 - 15181
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||||||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  14703 ttcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 14802  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||  |||||||| || ||    
T  14803 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcacattcacagcggcatg 14902  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  14903 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 15002  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  15003 ccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 15102  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 520  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15103 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 15181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 615 - 880
Target Start/End: Original strand, 15279 - 15544
Alignment:
Q  615 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgacagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 714  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  15279 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 15378  T
Q  715 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 814  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  15379 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 15478  T
Q  815 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  15479 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 15544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 8432 - 7963
Alignment:
Q  42 ttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggctt 141  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   ||||||||||| || || ||  ||| || | || ||| |||||||||||   |||||||| ||||    
T  8432 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcatgatcatggctgaacagagaagctt 8333  T
Q  142 ggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 241  Q
     ||||| |||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  8332 tgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 8233  T
Q  242 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 341  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||     
T  8232 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacac 8133  T
Q  342 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 441  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |    
T  8132 ccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctag 8033  T
Q  442 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 511  Q
    | || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  8032 tcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 690 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 7769 - 7579
Alignment:
Q  690 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 789  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  7769 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 7670  T
Q  790 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 880  Q
    | |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7669 tcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 686 - 880
Target Start/End: Original strand, 48568 - 48769
Alignment:
Q  686 ggcagcattaataggggcaacag-tagccatggattga--ccggctccggca-gataccatccc-tacttctgtttctttcttcttatgatgacc-gtta 779  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  48568 ggcagcattgataggagcaacaggtagccatggattggacccggctccggcaagacaccatcccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcccgtta 48667  T
Q  780 ccgtacctcttt-gatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 878  Q
    || ||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  48668 ccatacctcttttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 48767  T
Q  879 tc 880  Q
    ||    
T  48768 tc 48769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 439
Target Start/End: Original strand, 46659 - 46981
Alignment:
Q  129 aacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtc-tgggagctt-cctcatatac-ctcaatca 225  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||||||||||| | ||||||| |||||  |||  | | |||    
T  46659 aacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtcttaggagcttccctcacgtactttgattca 46758  T
Q  226 tgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctc--aaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatg 323  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||  ||||     ||||||||| |  |||||||| || || ||     
T  46759 tatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacgata 46858  T
Q  324 tacttcaaagcgta-gcatccttcaacat-cat--gacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga-atggaacctgggaggcaacggatt 418  Q
    ||||||||||| || ||| || || |||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||| |||||||||||||     
T  46859 tacttcaaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggaccttgaaccttggaggcaacggatc 46958  T
Q  419 aggtggaggc--ttgccctgtct 439  Q
    |||||| |||  |||||||||||    
T  46959 aggtgggggcgtttgccctgtct 46981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 449 - 343
Alignment:
Q  165 accagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagga 264  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  | ||||||||||| || ||||| || |  |||||||| || || ||||    
T  449 accaaaggagtcgcaacattacggacatctagtttgggtgcttcttcatacgcttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaagga 350  T
Q  265 catgagg 271  Q
    |||||||    
T  349 catgagg 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 595 - 518
Alignment:
Q  15 acatcactatcagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaaggatta 92  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |  ||||||||||||||||| || | ||| |||| || ||||||||| ||||||    
T  595 acatcactaacagtcagatgattatcattcatcaagctctggatatcctcttgcacaatgcggcaacccaagggatta 518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University