View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8264_low_8 (Length: 229)

Name: NF8264_low_8
Description: NF8264
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8264_low_8
NF8264_low_8
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (3-212)||(10326-10535)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (1-212)||(15158198-15158409)
chr7 (1-212)||(13688959-13689170)
chr7 (1-212)||(8710523-8710734)
chr7 (1-212)||(11234354-11234565)
chr7 (1-212)||(14335314-14335525)
chr7 (1-212)||(17703596-17703807)
chr7 (1-212)||(18587312-18587523)
chr7 (1-212)||(44788492-44788703)
chr7 (1-215)||(18180658-18180872)
chr7 (8-229)||(9591265-9591486)
chr7 (1-212)||(11550243-11550454)
chr7 (32-212)||(14957472-14957652)
chr7 (1-212)||(12690420-12690630)
chr7 (1-212)||(15146064-15146275)
chr7 (1-163)||(16726582-16726744)
chr7 (104-212)||(8200966-8201074)
chr7 (4-229)||(14042596-14042821)
chr7 (4-229)||(14352626-14352851)
chr7 (1-224)||(15627430-15627653)
chr7 (40-221)||(40924975-40925156)
chr7 (40-212)||(16947630-16947802)
chr7 (40-229)||(13676353-13676542)
chr7 (72-229)||(15099793-15099950)
chr7 (40-221)||(26091956-26092137)
chr7 (40-221)||(49155211-49155392)
chr7 (1-212)||(18051072-18051283)
chr7 (158-212)||(10873608-10873662)
chr7 (40-221)||(13965826-13966007)
chr7 (40-221)||(21755322-21755503)
chr7 (40-221)||(26115748-26115929)
chr7 (72-212)||(13024264-13024404)
chr7 (40-215)||(19149927-19150102)
chr7 (40-215)||(20749326-20749501)
chr7 (40-229)||(12459530-12459719)
chr7 (40-229)||(12798659-12798848)
chr7 (72-215)||(14261436-14261579)
chr7 (28-90)||(11984032-11984094)
chr7 (40-215)||(11385587-11385762)
chr7 (151-215)||(14140595-14140659)
chr7 (40-215)||(15343347-15343522)
chr7 (151-215)||(14283643-14283707)
chr7 (156-215)||(12204074-12204133)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (1-212)||(2872079-2872290)
chr6 (1-212)||(28312423-28312634)
chr6 (17-212)||(16574683-16574878)
chr6 (17-212)||(16620502-16620697)
chr6 (17-212)||(28260490-28260685)
chr6 (17-212)||(28285231-28285426)
chr6 (17-212)||(28339239-28339434)
chr6 (1-212)||(29589716-29589927)
chr6 (1-212)||(24293059-24293270)
chr6 (4-212)||(25115345-25115553)
chr6 (8-229)||(27559253-27559474)
chr6 (1-229)||(16924917-16925145)
chr6 (1-212)||(22436662-22436873)
chr6 (1-206)||(5836505-5836710)
chr6 (1-229)||(18405221-18405449)
chr6 (1-212)||(19867480-19867691)
chr6 (43-212)||(27190229-27190398)
chr6 (43-212)||(27258842-27259011)
chr6 (1-229)||(23081199-23081427)
chr6 (7-229)||(18182650-18182872)
chr6 (1-138)||(22829663-22829800)
chr6 (1-229)||(23085102-23085330)
chr6 (1-221)||(30678301-30678521)
chr6 (40-229)||(19437778-19437967)
chr6 (40-224)||(19455804-19455988)
chr6 (40-215)||(18797480-18797655)
chr6 (40-229)||(15462112-15462301)
chr6 (40-229)||(10466164-10466353)
chr6 (40-197)||(19465976-19466133)
chr6 (40-221)||(24367184-24367365)
chr6 (72-211)||(21474394-21474533)
chr6 (40-215)||(25770634-25770809)
chr6 (79-229)||(34642941-34643091)
chr6 (152-215)||(21567419-21567482)
chr6 (40-229)||(24515730-24515919)
chr6 (40-215)||(19486610-19486785)
chr6 (151-229)||(14377343-14377421)
chr6 (155-229)||(20010885-20010959)
chr6 (8-65)||(25756899-25756956)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (1-212)||(22330201-22330412)
chr5 (1-212)||(27682714-27682925)
chr5 (1-212)||(29473387-29473598)
chr5 (1-212)||(22137529-22137740)
chr5 (1-212)||(37288810-37289021)
chr5 (1-212)||(41773703-41773914)
chr5 (1-212)||(14997053-14997264)
chr5 (1-212)||(16359363-16359574)
chr5 (1-212)||(27521267-27521478)
chr5 (1-212)||(27613217-27613428)
chr5 (1-212)||(34569355-34569566)
chr5 (8-212)||(18781975-18782179)
chr5 (1-212)||(19772821-19773032)
chr5 (1-212)||(40711641-40711852)
chr5 (1-208)||(22350784-22350991)
chr5 (1-212)||(27665804-27666015)
chr5 (1-229)||(25429265-25429493)
chr5 (1-229)||(21882618-21882846)
chr5 (1-212)||(23460832-23461043)
chr5 (1-229)||(26736041-26736269)
chr5 (55-212)||(20803458-20803615)
chr5 (97-212)||(21342824-21342939)
chr5 (4-217)||(23474051-23474264)
chr5 (1-217)||(21631713-21631929)
chr5 (28-172)||(23525952-23526096)
chr5 (1-132)||(21332300-21332431)
chr5 (40-221)||(14884344-14884525)
chr5 (136-229)||(21336743-21336836)
chr5 (1-221)||(25850906-25851126)
chr5 (72-229)||(28892327-28892484)
chr5 (40-221)||(20345116-20345297)
chr5 (40-229)||(20778739-20778928)
chr5 (1-229)||(20824279-20824507)
chr5 (72-221)||(22505513-22505662)
chr5 (8-212)||(21409995-21410199)
chr5 (25-229)||(22464776-22464980)
chr5 (40-212)||(23078258-23078430)
chr5 (151-224)||(23563632-23563705)
chr5 (40-212)||(21983530-21983702)
chr5 (1-215)||(17266648-17266862)
chr5 (72-212)||(21561410-21561550)
chr5 (169-212)||(20311711-20311754)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (1-212)||(8050495-8050706)
chr4 (1-212)||(14300851-14301062)
chr4 (1-212)||(40475969-40476180)
chr4 (1-212)||(19635065-19635276)
chr4 (1-212)||(12479529-12479740)
chr4 (1-209)||(8389344-8389552)
chr4 (1-212)||(16233864-16234075)
chr4 (1-212)||(23958676-23958887)
chr4 (1-212)||(27714265-27714476)
chr4 (8-212)||(18224325-18224529)
chr4 (1-212)||(17092021-17092232)
chr4 (1-212)||(19775665-19775876)
chr4 (1-212)||(14683496-14683707)
chr4 (8-206)||(13513285-13513483)
chr4 (8-212)||(16250729-16250933)
chr4 (1-229)||(16350426-16350654)
chr4 (4-229)||(15910-16135)
chr4 (1-212)||(15144764-15144975)
chr4 (1-229)||(14697013-14697241)
chr4 (4-229)||(14162382-14162607)
chr4 (1-145)||(16219184-16219328)
chr4 (1-145)||(16222504-16222648)
chr4 (1-215)||(51603924-51604138)
chr4 (1-214)||(53750602-53750815)
chr4 (72-229)||(16154694-16154851)
chr4 (40-215)||(15073285-15073460)
chr4 (40-221)||(3261965-3262146)
chr4 (72-229)||(16150548-16150705)
chr4 (40-221)||(29450708-29450889)
chr4 (28-107)||(18604718-18604797)
chr4 (136-229)||(14188418-14188511)
chr4 (40-221)||(44659037-44659218)
chr4 (40-215)||(20892957-20893132)
chr4 (40-221)||(11204403-11204584)
chr4 (151-229)||(14993649-14993727)
chr4 (151-229)||(15354322-15354400)
chr4 (1-229)||(27903297-27903525)
chr4 (40-117)||(7357291-7357368)
chr4 (178-229)||(15258839-15258890)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (1-212)||(15713427-15713638)
chr3 (1-212)||(15358631-15358842)
chr3 (1-212)||(15399888-15400099)
chr3 (1-212)||(16754072-16754283)
chr3 (1-212)||(10008148-10008359)
chr3 (1-212)||(10908758-10908969)
chr3 (1-212)||(12889257-12889468)
chr3 (1-212)||(13255238-13255449)
chr3 (1-212)||(16638321-16638532)
chr3 (1-212)||(20059425-20059636)
chr3 (1-212)||(15345616-15345827)
chr3 (1-212)||(15586763-15586974)
chr3 (1-212)||(26790784-26790995)
chr3 (1-212)||(43165223-43165434)
chr3 (1-212)||(48427995-48428206)
chr3 (1-212)||(53382389-53382600)
chr3 (17-212)||(16804334-16804529)
chr3 (1-212)||(3688491-3688702)
chr3 (1-212)||(6603283-6603494)
chr3 (1-212)||(24185738-24185949)
chr3 (1-212)||(15065619-15065830)
chr3 (19-212)||(16694712-16694905)
chr3 (1-212)||(5422301-5422512)
chr3 (1-229)||(15262161-15262389)
chr3 (1-212)||(14873939-14874150)
chr3 (1-229)||(12843474-12843702)
chr3 (1-229)||(14578779-14579007)
chr3 (1-138)||(23079388-23079525)
chr3 (136-229)||(17492382-17492475)
chr3 (1-221)||(47126493-47126713)
chr3 (7-102)||(11861032-11861127)
chr3 (1-215)||(8744750-8744964)
chr3 (40-222)||(28756867-28757049)
chr3 (1-229)||(10417405-10417633)
chr3 (40-229)||(12357926-12358115)
chr3 (40-229)||(31692584-31692773)
chr3 (1-212)||(13944582-13944793)
chr3 (40-215)||(10408523-10408698)
chr3 (40-215)||(14290931-14291106)
chr3 (40-229)||(17494187-17494377)
chr3 (40-229)||(12180885-12181074)
chr3 (72-229)||(16825712-16825869)
chr3 (40-224)||(31941449-31941633)
chr3 (1-92)||(19727428-19727519)
chr3 (151-229)||(12272879-12272957)
chr3 (151-229)||(14575527-14575605)
chr3 (40-212)||(17188932-17189104)
chr3 (40-208)||(24189866-24190034)
chr3 (40-215)||(11949324-11949499)
chr3 (1-215)||(16831888-16832102)
chr3 (43-215)||(16327111-16327283)
chr3 (40-229)||(18131746-18131934)
chr3 (151-215)||(11958691-11958755)
chr3 (40-192)||(12509882-12510034)
chr3 (151-215)||(12858005-12858069)
chr3 (156-212)||(15013284-15013340)
chr3 (1-193)||(13317894-13318086)
chr3 (151-215)||(16378444-16378508)
chr3 (156-215)||(15230158-15230217)
chr3 (156-215)||(15236026-15236085)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (1-212)||(18859572-18859783)
chr8 (8-212)||(22031098-22031302)
chr8 (1-212)||(20015838-20016049)
chr8 (1-212)||(22126534-22126745)
chr8 (1-212)||(17671597-17671808)
chr8 (1-212)||(22117750-22117961)
chr8 (8-212)||(30310726-30310930)
chr8 (28-212)||(32603140-32603324)
chr8 (1-212)||(19115395-19115606)
chr8 (1-212)||(19481647-19481858)
chr8 (8-212)||(15536378-15536582)
chr8 (17-212)||(22042822-22043017)
chr8 (2-212)||(19980962-19981172)
chr8 (4-229)||(22421470-22421695)
chr8 (28-212)||(22129219-22129403)
chr8 (1-229)||(21164113-21164341)
chr8 (1-229)||(21253923-21254151)
chr8 (1-229)||(21391436-21391664)
chr8 (1-229)||(21780762-21780990)
chr8 (1-229)||(22990023-22990251)
chr8 (46-228)||(22523525-22523707)
chr8 (1-218)||(22245590-22245807)
chr8 (1-218)||(22246008-22246225)
chr8 (72-229)||(21786001-21786158)
chr8 (36-229)||(22375064-22375256)
chr8 (40-221)||(28983897-28984078)
chr8 (40-215)||(21928420-21928595)
chr8 (40-214)||(16268838-16269012)
chr8 (40-221)||(28989116-28989297)
chr8 (40-221)||(29301040-29301221)
chr8 (40-215)||(19985172-19985347)
chr8 (40-215)||(22373861-22374036)
chr8 (1-221)||(22053849-22054069)
chr8 (78-221)||(27357522-27357665)
chr8 (40-229)||(22027894-22028083)
chr8 (40-212)||(31414146-31414318)
chr8 (1-70)||(18881232-18881301)
chr8 (4-212)||(20391081-20391289)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-212)||(3382-3593)
scaffold0044 (8-227)||(17103-17322)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (1-212)||(22323014-22323225)
chr2 (1-212)||(24712594-24712805)
chr2 (1-212)||(9338142-9338353)
chr2 (1-212)||(9486776-9486987)
chr2 (1-212)||(10871410-10871621)
chr2 (1-212)||(16983800-16984011)
chr2 (1-212)||(17001560-17001771)
chr2 (1-212)||(24264930-24265141)
chr2 (1-212)||(24874422-24874633)
chr2 (1-212)||(27373829-27374040)
chr2 (1-212)||(44383242-44383453)
chr2 (2-229)||(23074406-23074633)
chr2 (2-229)||(22733447-22733674)
chr2 (1-212)||(24705154-24705365)
chr2 (8-212)||(11351390-11351594)
chr2 (1-212)||(22742638-22742849)
chr2 (34-212)||(27220576-27220754)
chr2 (8-229)||(24657337-24657558)
chr2 (2-212)||(23064973-23065183)
chr2 (28-229)||(45673711-45673912)
chr2 (8-212)||(23204874-23205078)
chr2 (1-229)||(23105400-23105628)
chr2 (1-229)||(24678030-24678258)
chr2 (28-229)||(23029160-23029361)
chr2 (40-212)||(21322977-21323149)
chr2 (49-212)||(21142761-21142924)
chr2 (1-229)||(24817512-24817740)
chr2 (8-108)||(23676582-23676682)
chr2 (92-212)||(41606155-41606269)
chr2 (40-221)||(20848140-20848321)
chr2 (40-229)||(23274136-23274325)
chr2 (72-215)||(19716760-19716903)
chr2 (72-215)||(23097761-23097904)
chr2 (72-212)||(12576913-12577053)
chr2 (80-218)||(30208671-30208809)
chr2 (72-212)||(23113283-23113423)
chr2 (1-53)||(21139653-21139705)
chr2 (8-52)||(22463160-22463204)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (1-212)||(22205-22416)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (1-212)||(7194-7405)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (1-212)||(16347799-16348010)
chr1 (1-212)||(21833246-21833457)
chr1 (1-212)||(51330696-51330907)
chr1 (28-212)||(17042246-17042430)
chr1 (1-212)||(21842156-21842367)
chr1 (1-212)||(41350872-41351083)
chr1 (1-212)||(33388233-33388444)
chr1 (1-212)||(22496460-22496671)
chr1 (1-212)||(19109312-19109523)
chr1 (1-212)||(24785061-24785272)
chr1 (29-212)||(20081608-20081791)
chr1 (1-188)||(21228760-21228947)
chr1 (1-229)||(16379021-16379249)
chr1 (4-216)||(21751987-21752199)
chr1 (1-127)||(22401621-22401747)
chr1 (1-229)||(22015949-22016177)
chr1 (72-221)||(20297347-20297496)
chr1 (40-221)||(31537240-31537421)
chr1 (40-221)||(52988707-52988888)
chr1 (40-215)||(21739279-21739454)
chr1 (40-214)||(20074952-20075126)
chr1 (40-221)||(48425839-48426020)
chr1 (40-215)||(21742795-21742970)
chr1 (8-95)||(22435944-22436031)
chr1 (40-221)||(37680015-37680196)
chr1 (40-221)||(38910069-38910250)
chr1 (25-229)||(20853988-20854192)
chr1 (40-215)||(24096858-24097033)
chr1 (1-101)||(21045328-21045428)
chr1 (78-229)||(19857232-19857383)
chr1 (40-229)||(18710343-18710532)
chr1 (4-79)||(22400397-22400472)
chr1 (151-221)||(12200484-12200554)
chr1 (151-229)||(20833254-20833332)
chr1 (8-53)||(21176531-21176576)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (4-229)||(18591-18816)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (8-229)||(17208-17429)
scaffold0017 (28-212)||(195000-195184)
scaffold0017 (80-212)||(24264-24396)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (8-212)||(13266-13470)
scaffold0109 (1-212)||(41113-41324)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (17-212)||(920-1115)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (8-229)||(10380-10601)
scaffold0080 (8-212)||(13035-13239)
scaffold0080 (1-229)||(54578-54806)
scaffold0080 (1-212)||(31841-32048)
scaffold0080 (1-212)||(37307-37514)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (8-212)||(622-826)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (16-212)||(14382-14578)
scaffold0010 (2-229)||(4856-5083)
scaffold0010 (40-221)||(39507-39688)
scaffold0010 (151-229)||(44712-44790)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (1-215)||(11424-11638)
scaffold0028 (42-215)||(17892-18065)
scaffold0028 (1-178)||(54996-55173)
scaffold0028 (174-215)||(53682-53723)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (8-212)||(7921-8125)
scaffold0130 (77-229)||(4100-4252)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (1-229)||(36439-36667)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-212)||(36955-37166)
scaffold0042 (1-229)||(26293-26521)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-212)||(424266-424477)
scaffold0003 (43-215)||(203336-203508)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (8-229)||(82-303)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (8-229)||(29070-29291)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-212)||(8216-8427)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-212)||(30709-30920)
scaffold0023 (4-229)||(47121-47345)
scaffold0023 (136-229)||(152022-152115)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (1-210)||(942-1151)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (28-229)||(11518-11719)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (1-229)||(513-741)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (1-209)||(1-209)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (4-229)||(4375-4600)
scaffold0621 (4-186)||(1-183)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-229)||(11015-11243)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-229)||(8164-8392)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-228)||(23668-23895)
scaffold0011 (72-229)||(151508-151665)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (40-212)||(1206-1378)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (5-229)||(2402-2626)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (4-212)||(50483-50691)
scaffold0102 (40-229)||(42639-42828)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (17-212)||(10309-10504)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-208)||(14873-15080)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-212)||(34850-35061)
scaffold0022 (1-229)||(41573-41801)
scaffold0022 (1-229)||(75293-75521)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (4-229)||(55608-55833)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-229)||(8351-8579)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (25-229)||(1930-2134)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (1-229)||(40642-40870)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-229)||(57749-57977)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (5-228)||(14026-14249)
scaffold0120 (1-127)||(11307-11433)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-228)||(495962-496189)
scaffold0001 (1-229)||(441594-441821)
scaffold0001 (40-221)||(514527-514708)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (4-229)||(10727-10952)
scaffold0476 (40-215)||(719-894)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-229)||(24847-25075)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (1-208)||(21566-21773)
scaffold0081 (1-208)||(36990-37197)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (1-229)||(8891-9116)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (8-173)||(2861-3026)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (4-229)||(7877-8102)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (1-181)||(15714-15894)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-229)||(104168-104396)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (2-184)||(48651-48833)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-229)||(17484-17712)
scaffold0114 (151-229)||(39999-40077)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (7-229)||(24086-24308)
scaffold0243 (72-229)||(9978-10135)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (1-226)||(15114-15339)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-229)||(14401-14629)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (1-229)||(6814-7042)
scaffold0270 (1-229)||(13944-14172)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-229)||(23433-23661)
scaffold0018 (1-229)||(9486-9714)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (4-200)||(3521-3717)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (28-227)||(111069-111268)
scaffold0040 (36-229)||(17819-18012)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-229)||(13614-13842)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (3-229)||(6054-6280)
scaffold0074 (40-229)||(15064-15253)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-229)||(216555-216783)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-229)||(5029-5257)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (61-225)||(4528-4692)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-229)||(15363-15579)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (8-107)||(229994-230093)
scaffold0009 (72-212)||(251580-251720)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (1-229)||(29565-29793)
scaffold0067 (151-229)||(49465-49543)
scaffold0067 (151-229)||(58499-58577)
scaffold0067 (151-229)||(64887-64965)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-229)||(94029-94257)
scaffold0029 (151-215)||(115517-115581)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (40-215)||(11915-12090)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (8-111)||(171177-171280)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (28-210)||(1959-2141)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (28-210)||(41270-41452)
scaffold0035 (151-229)||(5746-5824)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (40-229)||(5122-5311)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (40-229)||(1028-1217)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (40-221)||(41684-41865)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (40-229)||(325648-325837)
scaffold0004 (40-212)||(200642-200814)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (40-228)||(29-217)
[»] scaffold0501 (2 HSPs)
scaffold0501 (1-93)||(1-93)
scaffold0501 (155-212)||(12621-12678)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (149-229)||(3542-3622)
scaffold0413 (4-76)||(3636-3708)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (1-212)||(4439-4650)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (72-215)||(60694-60837)
scaffold0046 (72-197)||(70081-70206)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (1-215)||(43554-43768)
scaffold0104 (170-210)||(25176-25216)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (40-229)||(524-713)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (40-229)||(1485-1674)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (40-229)||(6979-7168)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-126)||(11072-11197)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (40-229)||(7685-7874)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (72-229)||(12668-12825)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (40-221)||(410-591)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (77-229)||(1026-1178)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (40-212)||(5319-5491)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-229)||(50046-50274)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (72-228)||(2158-2314)
scaffold0034 (3-229)||(70313-70539)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (72-224)||(98789-98941)
scaffold0020 (72-215)||(175943-176086)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (40-215)||(29482-29657)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (94-221)||(21413-21540)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (1-107)||(1-107)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (151-229)||(8747-8825)
scaffold0235 (151-229)||(18961-19039)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (151-229)||(1168-1246)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (1-215)||(63654-63868)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (40-229)||(65472-65661)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (40-221)||(11758-11939)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (40-229)||(8555-8744)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (40-229)||(20755-20944)
scaffold0222 (151-229)||(772-850)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (1-86)||(30371-30456)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (40-229)||(1061-1250)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (40-229)||(53988-54177)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (40-215)||(1446-1621)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (81-229)||(20743-20891)
scaffold0261 (155-229)||(12637-12711)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (40-215)||(28459-28634)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (40-215)||(67282-67457)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (72-210)||(1681-1819)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (40-229)||(5383-5572)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (40-213)||(5559-5732)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (40-229)||(9401-9590)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (72-229)||(36880-37037)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (40-197)||(29907-30064)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (72-229)||(110551-110708)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (72-215)||(6463-6606)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (40-215)||(4263-4438)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (151-229)||(3455-3533)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (43-215)||(263181-263353)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (151-215)||(2826-2890)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (1-224)||(17619-17842)
scaffold0348 (151-215)||(5134-5198)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (40-215)||(9960-10135)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (151-215)||(21806-21870)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (151-215)||(53708-53772)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (151-229)||(26053-26131)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (151-229)||(22063-22141)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (77-215)||(49088-49226)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (151-215)||(119-183)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (8-68)||(5100-5160)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (151-215)||(30611-30675)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (156-215)||(11785-11844)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-60)||(1-60)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-79)||(69556-69634)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (151-215)||(10932-10996)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (78-229)||(34278-34429)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (8-53)||(14174-14219)


Alignment Details
Target: scaffold0431 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10535 - 10326
Alignment:
Q  3 tttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacg 102  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10535 tttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacg 10436  T
Q  103 cattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10435 cattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtga 10336  T
Q  203 ctacttctct 212  Q
    ||||||||||    
T  10335 ctacttctct 10326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 15158198 - 15158409
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15158198 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 15158297  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15158298 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggt 15158397  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  15158398 gactacttctct 15158409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13689170 - 13688959
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689170 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 13689071  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689070 cgcattgttttattgctttcgattgtgtgtctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 13688971  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  13688970 gactacttctct 13688959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8710734 - 8710523
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710734 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 8710635  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710634 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 8710535  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  8710534 gactacttctct 8710523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 11234354 - 11234565
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11234354 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattaatactggtgcta 11234453  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234454 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 11234553  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  11234554 gactacttctct 11234565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14335525 - 14335314
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335525 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 14335426  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335425 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 14335326  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  14335325 gactacttctct 14335314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 17703596 - 17703807
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17703596 gctttggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgcta 17703695  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17703696 cacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggt 17703795  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  17703796 gactacttctct 17703807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 18587312 - 18587523
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18587312 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgcta 18587411  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587412 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 18587511  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  18587512 gactacttctct 18587523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 44788492 - 44788703
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788492 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 44788591  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788592 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 44788691  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  44788692 gactacttctct 44788703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18180872 - 18180658
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18180872 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgcta 18180773  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180772 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 18180673  T
Q  201 gactacttctcttgt 215  Q
    |||||||||||||||    
T  18180672 gactacttctcttgt 18180658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9591486 - 9591265
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9591486 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattg 9591387  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9591386 ctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 9591287  T
Q  208 tctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| || ||| | |||||||    
T  9591286 tctctcgtatgtttgagatgtc 9591265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 11550243 - 11550454
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11550243 gctttgactggtactcagacagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 11550342  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11550343 ctcattgctttattgcttttgattgtgtatctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 11550442  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  11550443 gactacttctct 11550454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14957652 - 14957472
Alignment:
Q  32 atcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttc 131  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14957652 atcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttc 14957553  T
Q  132 tgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14957552 tgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 14957472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12690630 - 12690420
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12690630 gctttgactggtactcagacagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattatt-atactagtgcta 12690532  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12690531 ctcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgagttgagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggt 12690432  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  12690431 gactacttctct 12690420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 15146064 - 15146275
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146064 gctttgactggtactcagactgagaatgaggatcgcttgagcagaggtacatgttatattaatagaacacctttagttgctattattgatactggtgcta 15146163  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146164 cgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttgctttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 15146263  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  15146264 gactacttctct 15146275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 16726582 - 16726744
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16726582 gctttggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgatatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgcta 16726681  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 163  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16726682 cacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 16726744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8201074 - 8200966
Alignment:
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8201074 attgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 8200975  T
Q  204 tacttctct 212  Q
    |||||||||    
T  8200974 tacttctct 8200966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14042821 - 14042596
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||||||||  |||| || |  |||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14042821 ttgactggtactcagaccgagagtgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgc 14042722  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |  |   |||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  14042721 attgttttattgctattgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgac 14042622  T
Q  204 tacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||    
T  14042621 tacttctcttgtgtgttcaagatgtc 14042596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14352851 - 14352626
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||||||||  |||| || |  |||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14352851 ttgactggtactcagaccgagagtgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgc 14352752  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |  |   |||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  14352751 attgttttattgctattgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgac 14352652  T
Q  204 tacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||    
T  14352651 tacttctcttgtgtgttcaagatgtc 14352626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15627653 - 15627430
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||| || ||||| | |||||| || |   |||||| ||| | |||| || |||||||||||||||||| ||    
T  15627653 gctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgattataggtacatgcttctttgatagtactcctttaattactattattgatactggtgata 15627554  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||  | ||||||| | ||   |||||||||||| ||||   ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15627553 cgcattgttttattgccgttgattgtgctcctatgttgggtcttgatatgtcgagtatgaatgaggaaatggttttcgaaactccagctaagggttcggt 15627454  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaag 224  Q
    |||||||||| | |||||||||||    
T  15627453 gactacttctttagtgtgtctaag 15627430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 40924975 - 40925156
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  40924975 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 40925074  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  40925075 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 40925156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Original strand, 16947630 - 16947802
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  16947630 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 16947729  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16947730 gtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 16947802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13676542 - 13676353
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  13676542 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 13676443  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13676442 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 13676353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 15099793 - 15099950
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||    
T  15099793 tttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatg 15099892  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15099893 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 15099950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 26091956 - 26092137
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  26091956 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 26092055  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  26092056 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 26092137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49155392 - 49155211
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  49155392 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 49155293  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  49155292 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 49155211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 18051072 - 18051283
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| |  || ||||| ||| | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  18051072 gctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 18051171  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgg 199  Q
    | ||||| || |||||||| ||  |||  | |   |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18051172 ctcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggt-ttgattgtgtctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 18051270  T
Q  200 tgactacttctct 212  Q
    |||||||||||||    
T  18051271 tgactacttctct 18051283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10873662 - 10873608
Alignment:
Q  158 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873662 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10873608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 13965826 - 13966007
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  13965826 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 13965925  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||    
T  13965926 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtct 13966007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21755503 - 21755322
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  21755503 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 21755404  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||| | || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  21755403 gtttggatgtatctgatatggaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 21755322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 26115748 - 26115929
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  26115748 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 26115847  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  26115848 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 26115929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13024404 - 13024264
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||  ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||    
T  13024404 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatg 13024305  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13024304 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 13024264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19150102 - 19149927
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   || |    
T  19150102 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttag 19150003  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19150002 gtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 19149927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20749501 - 20749326
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   || |    
T  20749501 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttag 20749402  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20749401 gtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 20749326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12459719 - 12459530
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  12459719 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactaattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 12459620  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  12459619 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtc 12459530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 12798659 - 12798848
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   ||||    
T  12798659 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 12798758  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||    
T  12798759 gtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctcttatttgtctaagttgtc 12798848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 14261436 - 14261579
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | ||||| |  | |   |||||||| | | | ||||||||||||||||| |||    
T  14261436 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgagcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatg 14261535  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  14261536 gttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgt 14261579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 11984094 - 11984032
Alignment:
Q  28 gaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgat 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11984094 gaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgat 11984032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 11385587 - 11385762
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || |||| |||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  11385587 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgatgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 11385686  T
Q  140 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||| |||| | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  11385687 gtct-gattgtatttgatatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgt 11385762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14140659 - 14140595
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14140659 tctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 14140595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15343522 - 15343347
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||    
T  15343522 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 15343423  T
Q  140 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||    
T  15343422 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtaaagtaactacttctcttgt 15343347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Original strand, 14283643 - 14283707
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  14283643 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgt 14283707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 215
Target Start/End: Original strand, 12204074 - 12204133
Alignment:
Q  156 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  12204074 tatgagtggagaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaataactacttctcttgt 12204133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 2872079 - 2872290
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872079 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 2872178  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872179 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 2872278  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  2872279 gactacttctct 2872290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28312634 - 28312423
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312634 gctttgactgggactcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 28312535  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312534 cgcattgctttattgctttcaattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 28312435  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  28312434 gactacttctct 28312423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16574878 - 16574683
Alignment:
Q  17 agacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgc 116  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16574878 agacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgc 16574779  T
Q  117 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574778 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16574683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 16620502 - 16620697
Alignment:
Q  17 agacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgc 116  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16620502 agacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgc 16620601  T
Q  117 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620602 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16620697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 28260490 - 28260685
Alignment:
Q  17 agacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgc 116  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260490 agacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgc 28260589  T
Q  117 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260590 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28260685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28285426 - 28285231
Alignment:
Q  17 agacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgc 116  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285426 agacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgc 28285327  T
Q  117 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285326 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28285231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 28339239 - 28339434
Alignment:
Q  17 agacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgc 116  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339239 agacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgc 28339338  T
Q  117 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339339 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28339434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 29589716 - 29589927
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589716 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 29589815  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589816 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 29589915  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  29589916 gactacttctct 29589927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 24293059 - 24293270
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293059 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 24293158  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293159 cgcacggttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 24293258  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  24293259 gactacttctct 24293270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25115553 - 25115345
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25115553 ttgactggtactcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtactacgc 25115454  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115453 attgctttattgctttcgattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 25115354  T
Q  204 tacttctct 212  Q
    |||||||||    
T  25115353 tacttctct 25115345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 27559253 - 27559474
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27559253 ctggtactcagacagagaatgaggatggtttgatcagaggtacttgttatattaataatactccatttgttgctattattgataatggtgctacgcattg 27559352  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27559353 ttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 27559452  T
Q  208 tctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| || ||| | |||||||    
T  27559453 tctctcgtatgtttgagatgtc 27559474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16924917 - 16925145
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16924917 gctttgacgggtacacagacagagagcgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 16925016  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16925017 cacattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggt 16925116  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||||    
T  16925117 gactacttctctcgtatgtttgagatgtc 16925145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22436873 - 22436662
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22436873 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggaccgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactagtgcta 22436774  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22436773 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22436674  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  22436673 gactacttctct 22436662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 5836505 - 5836710
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5836505 gctttgactggtactcagacatataatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcta 5836604  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5836605 cgcattgttttattgcttttgattgtgcttatactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 5836704  T
Q  201 gactac 206  Q
     |||||    
T  5836705 aactac 5836710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 18405221 - 18405449
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18405221 gctttgactagtacacagatagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgcta 18405320  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||| | ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18405321 tgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 18405420  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18405421 gactacttctcttgtgtgtttgagatgtc 18405449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19867691 - 19867480
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19867691 gctttgactggtactcagaccgagaacgaggatcgcttgatcaaaggtacatgttatattgataatactcctttagtttctattattgatactggtgcta 19867592  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19867591 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggccttgttatgtcttatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 19867492  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  19867491 gactacttctct 19867480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27190398 - 27190229
Alignment:
Q  43 agaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 142  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27190398 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27190299  T
Q  143 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27190298 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27190229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Original strand, 27258842 - 27259011
Alignment:
Q  43 agaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 142  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27258842 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27258941  T
Q  143 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27258942 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27259011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23081427 - 23081199
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23081427 gctttgactgatactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgcta 23081328  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||| ||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23081327 cacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggttttgctatgtcaaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagt 23081228  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23081227 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 23081199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 18182650 - 18182872
Alignment:
Q  7 actggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcatt 106  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18182650 actggtacacagacagataatgaggatcatttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatt 18182749  T
Q  107 gctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 206  Q
     | |||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18182750 tccttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 18182849  T
Q  207 ttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||| ||| |||||||||    
T  18182850 ttctcttgtttgtttaagatgtc 18182872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 22829663 - 22829800
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22829663 gctttgactggtactcagacggagaacggggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 22829762  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttg 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22829763 cgcattgcgttattgctttcgattgtgtttctgctttg 22829800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23085102 - 23085330
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23085102 gctttgactagtatgcagacagagaatgaggaccgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagtttctattattgaaactggtgcta 23085201  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||| | | |||| || ||||   |||||||||  | ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23085202 cacattgttttattgttgttgattatgcttctaagttgggtcttactatgtcaagtatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 23085301  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23085302 gactacttctctagtgtgtttaagatgtc 23085330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 30678301 - 30678521
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  | ||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||   || ||| |||   |||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  30678301 gctttgactggtacacaaacagtgaatgaggatcggttgatcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgtgcta 30678400  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||| ||| |||||||||   ||||||| ||||   |||||||||| | ||||   |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30678401 cgcgttgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggt 30678500  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtct 221  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  30678501 tactacttctctagtgtgtct 30678521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19437967 - 19437778
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||     
T  19437967 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttga 19437868  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19437867 gtctagttgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtc 19437778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19455988 - 19455804
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  19455988 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 19455889  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaag 224  Q
    |||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  19455888 gtctggttgtatctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 19455804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18797655 - 18797480
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  18797655 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 18797556  T
Q  140 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    || |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18797555 gt-ttgattgtatctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgt 18797480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15462301 - 15462112
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  15462301 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 15462202  T
Q  140 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15462201 gtct-gattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtc 15462112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 10466164 - 10466353
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  10466164 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgttgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 10466263  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  10466264 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtc 10466353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19466133 - 19465976
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  19466133 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 19466034  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 197  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19466033 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 19465976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24367365 - 24367184
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  24367365 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatatcagttgg 24367266  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    |||  ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| |||||    
T  24367265 gtccggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtct 24367184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21474533 - 21474394
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | |||||||||||||| || | |||    
T  21474533 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttgattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatagaaaaatg 21474434  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctc 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21474433 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctc 21474394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25770809 - 25770634
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||| || |||| | | ||||||| || |   ||||    
T  25770809 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctattcattgtttcattgttgttgattgtgcttataagttgg 25770710  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  25770709 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgt 25770634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 229
Target Start/End: Original strand, 34642941 - 34643091
Alignment:
Q  79 gctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtc 177  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||| || |    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  34642941 gctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcttataaactgggt-ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggtcgtt 34643039  T
Q  178 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  34643040 gaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtc 34643091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 215
Target Start/End: Original strand, 21567419 - 21567482
Alignment:
Q  152 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21567419 ctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 21567482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 24515730 - 24515919
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||| | | || |||| || |   ||||    
T  24515730 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgg 24515829  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||| ||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24515830 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagttaagtgttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 24515919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 19486610 - 19486785
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  19486610 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 19486709  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||| |   ||||   ||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  19486710 gtctggtcatgtcaagtatgagtagagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgt 19486785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 14377343 - 14377421
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14377343 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcaaagggtttagtagctacttctcttgtttgtctaaggtgtc 14377421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 20010885 - 20010959
Alignment:
Q  155 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20010885 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtc 20010959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 65
Target Start/End: Original strand, 25756899 - 25756956
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataa 65  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25756899 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataa 25756956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22330201 - 22330412
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330201 gctttgactggtactcagacagataacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 22330300  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330301 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22330400  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  22330401 gactacttctct 22330412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 27682714 - 27682925
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27682714 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 27682813  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27682814 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 27682913  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  27682914 gactacttctct 27682925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 29473387 - 29473598
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473387 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 29473486  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473487 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 29473586  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  29473587 gactacttctct 29473598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22137740 - 22137529
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22137740 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgata 22137641  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137640 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22137541  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  22137540 gactacttctct 22137529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 37288810 - 37289021
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37288810 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 37288909  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37288910 cacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 37289009  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  37289010 gactacttctct 37289021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41773914 - 41773703
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773914 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 41773815  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773814 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 41773715  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  41773714 gactacttctct 41773703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 14997053 - 14997264
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997053 gctttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 14997152  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14997153 cacattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggt 14997252  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  14997253 gactacttctct 14997264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16359574 - 16359363
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359574 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 16359475  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359474 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 16359375  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  16359374 gactacttctct 16359363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27521478 - 27521267
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521478 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 27521379  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521378 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttggtttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 27521279  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  27521278 gactacttctct 27521267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27613428 - 27613217
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27613428 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 27613329  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27613328 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggt 27613229  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  27613228 gactacttctct 27613217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34569566 - 34569355
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569566 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 34569467  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569466 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 34569367  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  34569366 gactacttctct 34569355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18782179 - 18781975
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18782179 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 18782080  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18782079 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactact 18781980  T
Q  208 tctct 212  Q
    |||||    
T  18781979 tctct 18781975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19773032 - 19772821
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773032 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcttttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 19772933  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19772932 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggt 19772833  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  19772832 gactacttctct 19772821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40711852 - 40711641
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711852 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatcttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 40711753  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711752 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 40711653  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  40711652 gactacttctct 40711641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22350991 - 22350784
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22350991 gctttgactggtactcagacggagaacgatgatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgcta 22350892  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350891 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22350792  T
Q  201 gactactt 208  Q
    ||||||||    
T  22350791 gactactt 22350784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 27665804 - 27666015
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665804 gctttgactgggactcagacagagaatgacgatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 27665903  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27665904 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggt 27666003  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  27666004 gactacttctct 27666015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25429493 - 25429265
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25429493 gctttgactggtacacagacatagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgcta 25429394  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || | ||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25429393 cgcattgttttattgcttttgattttgctactaagttgggtcttgttatgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 25429294  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25429293 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 25429265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21882846 - 21882618
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||| |||||||  ||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21882846 gctttggctggtacacagacaaagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttggtattattgatactggtgcta 21882747  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21882746 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 21882647  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||||    
T  21882646 gactacttctctcgtatgtttgagatgtc 21882618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23461043 - 23460832
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23461043 gctttgactggtacttagaccgagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctgtattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcta 23460944  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | |||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23460943 cccatgtttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 23460844  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  23460843 gactacttctct 23460832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26736041 - 26736269
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26736041 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgcta 26736140  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| |||||| || | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26736141 cacattgttttatttctattgattgtgcttctatgttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggt 26736240  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26736241 gactacttctcttgtatgtttaagatgtc 26736269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20803615 - 20803458
Alignment:
Q  55 tatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctg 154  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  20803615 tatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtctcgctttgtctg 20803516  T
Q  155 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20803515 atatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctct 20803458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 21342824 - 21342939
Alignment:
Q  97 gctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342824 gctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtt 21342923  T
Q  197 cggtgactacttctct 212  Q
    ||||||||||||||||    
T  21342924 cggtgactacttctct 21342939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23474264 - 23474051
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23474264 ttgactggtatgcagacagaaaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgattgtacacctttagttgctattattgataccggtgctacac 23474165  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||||  ||||   |||||||| | | || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23474164 attgttttattgctattgattgtacttctaagttgggtctggctatgacgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 23474065  T
Q  204 tacttctcttgtgt 217  Q
    ||||||||||||||    
T  23474064 tacttctcttgtgt 23474051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 21631713 - 21631929
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||  || ||||| || ||||| |||||||| |||||  |||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21631713 gctttgactggtacacagacagtgaatgaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattaatactggtgcta 21631812  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21631813 cgcattgttttattgctgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 21631912  T
Q  201 gactacttctcttgtgt 217  Q
    |||||||||||| ||||    
T  21631913 gactacttctctagtgt 21631929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23526096 - 23525952
Alignment:
Q  28 gaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  23526096 gaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtg 23525997  T
Q  128 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatgg 172  Q
     |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23525996 cttctacgttgggtcttgatatgtctgatatgaatggagagatgg 23525952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 21332300 - 21332431
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21332300 gctttgactggtactcagatagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgcta 21332399  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttct 132  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||||| ||||    
T  21332400 cacattgttttattgctattgattgtgcttct 21332431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 14884344 - 14884525
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  14884344 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 14884443  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  14884444 gtttagatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 14884525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 229
Target Start/End: Original strand, 21336743 - 21336836
Alignment:
Q  136 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21336743 ttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggtttggtgactacttctcgtgtgtgtttaagatgtc 21336836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25851126 - 25850906
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||    || ||||| ||| | ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25851126 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtgcta 25851027  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  25851026 ctcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttcagt 25850927  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtct 221  Q
     || ||||||||||| |||||    
T  25850926 aaccacttctcttgtttgtct 25850906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 28892327 - 28892484
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagat 170  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||    
T  28892327 tttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaaaggagaaat 28892425  T
Q  171 ggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28892426 ggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtc 28892484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20345297 - 20345116
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  20345297 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 20345198  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||    
T  20345197 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtct 20345116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20778928 - 20778739
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  20778928 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 20778829  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    | ||   | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20778828 gcctaattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtc 20778739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20824507 - 20824279
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||    || ||||||||  | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  20824507 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 20824408  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgg 199  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  20824407 cacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtct-gattatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcag 20824309  T
Q  200 tgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20824308 taactacttctctggtgtgtttaaggtgtc 20824279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22505662 - 22505513
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   |||||| | ||| | ||| ||||||| || || |||    
T  22505662 tttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctaatatgaaaggggaaatg 22505563  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  22505562 gttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtct 22505513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21410199 - 21409995
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |  ||| || |||| || ||||||||||||||  ||||    
T  21410199 ctggtacttagacagagaatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatcatagatactggtgctacatattg 21410100  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
     |||||||||   |||||||||||    |||||||||| | ||||   ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |    
T  21410099 ttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcatctattaatggggaaatggttgtcgaaaccccggctaaggcttcggtgactagt 21410000  T
Q  208 tctct 212  Q
    |||||    
T  21409999 tctct 21409995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22464980 - 22464776
Alignment:
Q  25 aacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 124  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  22464980 aacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaat 22464881  T
Q  125 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaag 224  Q
    |||  | |   ||||| ||   | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  22464880 gtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaag 22464781  T
Q  225 atgtc 229  Q
     ||||    
T  22464780 gtgtc 22464776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Original strand, 23078258 - 23078430
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  | || |||| || |   ||||    
T  23078258 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgcaattgaatgtgcttataagttgg 23078357  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23078358 gtttggatgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 23078430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 224
Target Start/End: Original strand, 23563632 - 23563705
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaag 224  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  23563632 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 23563705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Original strand, 21983530 - 21983702
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  21983530 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattactattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 21983629  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||| | | ||||   ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21983630 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 21983702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 17266648 - 17266862
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |  || ||||| ||| | |||| |||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  17266648 gctttgactggtacctagactgctaatgaggaccgtctcatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 17266747  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgg 199  Q
    | ||||| || |||||||| ||  |||  | |   |||||| ||| || ||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  17266748 ctcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggt-ttgtttgtgtctaacatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 17266846  T
Q  200 tgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  17266847 tgactacttctcttgt 17266862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 21561410 - 21561550
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   || ||| | | | ||||   ||||| |||||| |||    
T  21561410 tttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttaggtatggttatgtcaagtatgagtggagaaatg 21561509  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21561510 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 21561550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20311754 - 20311711
Alignment:
Q  169 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20311754 atggttgtcgaaaccccaactaagggttcggtgactacttctct 20311711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 8050495 - 8050706
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050495 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 8050594  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050595 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 8050694  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  8050695 gactacttctct 8050706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 14300851 - 14301062
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14300851 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 14300950  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14300951 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 14301050  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  14301051 gactacttctct 14301062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40476180 - 40475969
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40476180 gctttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 40476081  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40476080 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggt 40475981  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  40475980 gactacttctct 40475969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19635276 - 19635065
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635276 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 19635177  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635176 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 19635077  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  19635076 gactacttctct 19635065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12479740 - 12479529
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479740 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 12479641  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479640 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 12479541  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  12479540 gactacttctct 12479529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8389552 - 8389344
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389552 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 8389453  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389452 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 8389353  T
Q  201 gactacttc 209  Q
    |||||||||    
T  8389352 gactacttc 8389344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16233864 - 16234075
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233864 gctttgactgggactcagacagagagtgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 16233963  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233964 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 16234063  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  16234064 gactacttctct 16234075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23958887 - 23958676
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958887 gctttgactgggactcagacagagaatgacgatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 23958788  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958787 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 23958688  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  23958687 gactacttctct 23958676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27714476 - 27714265
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714476 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 27714377  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27714376 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggt 27714277  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  27714276 gactacttctct 27714265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Original strand, 18224325 - 18224529
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18224325 ctggtacttagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggatcttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattg 18224424  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18224425 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 18224524  T
Q  208 tctct 212  Q
    |||||    
T  18224525 tctct 18224529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 17092021 - 17092232
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092021 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 17092120  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092121 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 17092220  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  17092221 gactacttctct 17092232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 19775665 - 19775876
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775665 gctttgactgggactcagacagagaatgacgatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 19775764  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19775765 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggt 19775864  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  19775865 gactacttctct 19775876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14683707 - 14683496
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||| |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14683707 gctttgactggtactcagacaaaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 14683608  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14683607 ctcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggt 14683508  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  14683507 gactacttctct 14683496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13513483 - 13513285
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13513483 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattg 13513384  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13513383 ctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 13513285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Original strand, 16250729 - 16250933
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || || ||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16250729 ctggtactcagacagagaatgacgattgtttgataagaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactaatgctacgcattg 16250828  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16250829 ctttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 16250928  T
Q  208 tctct 212  Q
    |||||    
T  16250929 tctct 16250933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16350426 - 16350654
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||| |||||||  |||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16350426 gctttggctggtacacagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgcta 16350525  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350526 tgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 16350625  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||||    
T  16350626 gactacttctctcgtatgtttgagatgtc 16350654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 15910 - 16135
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15910 ttgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgc 16009  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    |||  ||||||||| | ||||||| | ||   |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16010 atttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 16109  T
Q  204 tacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  16110 tacttctcttgtgtgtttaagatgtc 16135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 15144764 - 15144975
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||  || || |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144764 gctttgactggtactcagatcgagaatgaggatcgcttgatcaaaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 15144863  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144864 agcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 15144963  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    |||||| |||||    
T  15144964 gactacgtctct 15144975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14697241 - 14697013
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| | |||||| |||||  |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14697241 gctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 14697142  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14697141 cacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 14697042  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14697041 gactacttctcttgtgtgcttaagatgtc 14697013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14162607 - 14162382
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    ||||| |||||  |||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14162607 ttgacgggtacccagactgagaacgaggatcgcctgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataccggtgctacgc 14162508  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    || | ||||||||| | ||||||| ||||   |||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14162507 atagttttattgctcttgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaac 14162408  T
Q  204 tacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  14162407 tacttctcttgtgtgtttaaggtgtc 14162382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16219328 - 16219184
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16219328 gctttgactggtacttagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgcta 16219229  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttg 145  Q
    | || || ||||||||| | ||||||| ||||   ||||||||||    
T  16219228 cacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttg 16219184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16222648 - 16222504
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16222648 gctttgactggtacttagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgcta 16222549  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttg 145  Q
    | || || ||||||||| | ||||||| ||||   ||||||||||    
T  16222548 cacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttg 16222504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 51603924 - 51604138
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| |  || ||||| ||| | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  51603924 gctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 51604023  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgg 199  Q
    | ||||| || |||||||| || |||| || |    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  51604024 ctcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggt-ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 51604122  T
Q  200 tgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  51604123 tgactacttctcttgt 51604138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 53750602 - 53750815
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| |  || ||||| ||| | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  53750602 gctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 53750701  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgg 199  Q
    | ||||| || |||||||| || |||| || |    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  53750702 ctcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggt-ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 53750800  T
Q  200 tgactacttctcttg 214  Q
    |||||||||||||||    
T  53750801 tgactacttctcttg 53750815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16154851 - 16154694
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   |||||| | | | ||||||||||||| || || |||    
T  16154851 tttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtgtctgatatgaaaggggaaatg 16154752  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16154751 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtc 16154694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15073460 - 15073285
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||    |   ||||    
T  15073460 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcacataagttgg 15073361  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
     ||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15073360 ctctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 15073285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 3261965 - 3262146
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  3261965 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 3262064  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  3262065 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 3262146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16150705 - 16150548
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||    
T  16150705 tttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatg 16150606  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16150605 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtc 16150548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 29450708 - 29450889
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  29450708 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 29450807  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  29450808 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 29450889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 107
Target Start/End: Original strand, 18604718 - 18604797
Alignment:
Q  28 gaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18604718 gaggatcatttgattagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 18604797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14188511 - 14188418
Alignment:
Q  136 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||    
T  14188511 ttgggtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaaggttcggttactacttctctcgtatgtttgagatgtc 14188418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 44659037 - 44659218
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  44659037 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 44659136  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  44659137 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 44659218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20893132 - 20892957
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||    
T  20893132 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 20893033  T
Q  140 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20893032 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 20892957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 11204403 - 11204584
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   || |    
T  11204403 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttag 11204502  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | |||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  11204503 gtttggatgtatctggtatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 11204584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 14993649 - 14993727
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14993649 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtctaagttgtc 14993727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 15354322 - 15354400
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15354322 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtc 15354400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27903525 - 27903297
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||    || ||||||||  | ||||||||||| ||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  27903525 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacatgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 27903426  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgg 199  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  27903425 ctcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtct-gattatatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttcag 27903327  T
Q  200 tgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    | ||||||||||| || ||| |||| ||||    
T  27903326 taactacttctctagtttgtttaaggtgtc 27903297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 7357368 - 7357291
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 117  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7357368 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgct 7357291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15258890 - 15258839
Alignment:
Q  178 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15258890 gaaactccagctaagagttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 15258839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 15713427 - 15713638
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713427 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 15713526  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713527 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 15713626  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  15713627 gactacttctct 15713638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15358842 - 15358631
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358842 gctttgactggtacgcagacggagaacgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 15358743  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358742 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 15358643  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  15358642 gactacttctct 15358631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 15399888 - 15400099
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15399888 gctttgactggtacgtagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttggttgctattattgatactggtgcta 15399987  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15399988 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggt 15400087  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  15400088 gactacttctct 15400099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16754072 - 16754283
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754072 gctttgactgggactcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 16754171  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754172 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 16754271  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  16754272 gactacttctct 16754283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10008359 - 10008148
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008359 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 10008260  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008259 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 10008160  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  10008159 gactacttctct 10008148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10908969 - 10908758
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908969 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 10908870  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908869 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 10908770  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  10908769 gactacttctct 10908758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12889468 - 12889257
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889468 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 12889369  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889368 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 12889269  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  12889268 gactacttctct 12889257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13255449 - 13255238
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255449 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 13255350  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255349 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 13255250  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  13255249 gactacttctct 13255238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16638532 - 16638321
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638532 gctttgactgggactcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 16638433  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638432 cgcattgctttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 16638333  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  16638332 gactacttctct 16638321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 20059425 - 20059636
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059425 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 20059524  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059525 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 20059624  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  20059625 gactacttctct 20059636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 15345616 - 15345827
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345616 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 15345715  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345716 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 15345815  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  15345816 gactacttctct 15345827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 15586763 - 15586974
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15586763 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 15586862  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15586863 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggt 15586962  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  15586963 gactacttctct 15586974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 26790784 - 26790995
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26790784 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 26790883  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26790884 cgcattgttttattgttttcgattgtgtttccgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggt 26790983  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  26790984 gactacttctct 26790995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43165434 - 43165223
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165434 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 43165335  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165334 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 43165235  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  43165234 gactacttctct 43165223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 48428206 - 48427995
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428206 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 48428107  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428106 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 48428007  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  48428006 gactacttctct 48427995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 53382389 - 53382600
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382389 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 53382488  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382489 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggt 53382588  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  53382589 gactacttctct 53382600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 16804334 - 16804529
Alignment:
Q  17 agacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgc 116  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16804334 agacagagaatgaggatcgtttgatcagatgtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgc 16804433  T
Q  117 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16804434 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctct 16804529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3688702 - 3688491
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688702 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 3688603  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3688602 cgcattgttttattgcttccgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggt 3688503  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  3688502 gactacttctct 3688491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6603494 - 6603283
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603494 gctttgactgggacccagacaaagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 6603395  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6603394 cccattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggt 6603295  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  6603294 gactacttctct 6603283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24185949 - 24185738
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24185949 gctttgactggtactcagacagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 24185850  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  24185849 ctcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggt 24185750  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  24185749 gactacttctct 24185738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15065830 - 15065619
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || || |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065830 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcaaaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgcta 15065731  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15065730 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggt 15065631  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  15065630 gactacttctct 15065619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16694905 - 16694712
Alignment:
Q  19 acagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctt 118  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16694905 acagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcccttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctt 16694806  T
Q  119 tcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16694805 tcgattgtgtttctgcgttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctct 16694712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 5422301 - 5422512
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |  || ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422301 gctttgactgggactcagacagagagtgacgatcgtttgatcaaaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 5422400  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5422401 cgcattgttttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggt 5422500  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  5422501 gactacttctct 5422512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15262389 - 15262161
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15262389 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgcta 15262290  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15262289 cacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggt 15262190  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15262189 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 15262161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 14873939 - 14874150
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || || |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  14873939 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcataggtacatgttatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcaa 14874038  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14874039 cacattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 14874138  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  14874139 gactacttctct 14874150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 12843474 - 12843702
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12843474 gctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgcta 12843573  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  12843574 cgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagt 12843673  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12843674 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 12843702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 14578779 - 14579007
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || || ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  14578779 gctttgactggtactcagactgagaatgaggatcatttgatcagagctacatgttttattgataatacacctttagttactattattgatcctagtgcta 14578878  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14578879 cacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttcccatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagt 14578978  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
     ||||||||| | || ||| |||||||||    
T  14578979 aactacttctatagtatgtttaagatgtc 14579007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 23079388 - 23079525
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  23079388 gctttgactggtactcagaccgaaaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgcaa 23079487  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttg 138  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23079488 cacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttg 23079525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17492475 - 17492382
Alignment:
Q  136 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17492475 ttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 17492382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47126713 - 47126493
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||| ||  | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47126713 gctttgactggtacgcagactcctaacgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 47126614  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||| | || |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  47126613 ctcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 47126514  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtct 221  Q
     || ||||||||||| |||||    
T  47126513 aaccacttctcttgtttgtct 47126493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 11861127 - 11861032
Alignment:
Q  7 actggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacg 102  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11861127 actggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacg 11861032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 8744750 - 8744964
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| |  || ||||| ||| | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  8744750 gctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 8744849  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgg 199  Q
    | ||||| || |||||||| ||  |||  | |   |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  8744850 ctcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggt-ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 8744948  T
Q  200 tgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  8744949 tgactacttctcttgt 8744964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28757049 - 28756867
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  28757049 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 28756950  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtcta 222  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  28756949 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtcta 28756867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 10417405 - 10417633
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||    || ||||||||  | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || || |||||||    
T  10417405 gctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgcta 10417504  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgg 199  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  10417505 cacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcag 10417603  T
Q  200 tgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10417604 tgactacttctctggtgtgtctaaggtgtc 10417633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 12357926 - 12358115
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||||| |||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  12357926 atcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 12358025  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12358026 gtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 12358115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 31692584 - 31692773
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   | ||    
T  31692584 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagtcgg 31692683  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31692684 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtc 31692773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13944793 - 13944582
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| |  || ||||| ||| | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  13944793 gctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 13944694  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgg 199  Q
    | ||||| || |||||||| || |||| || |    ||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13944693 ctcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggt-ttgattgtgtctgatatggaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 13944595  T
Q  200 tgactacttctct 212  Q
    |||||||||||||    
T  13944594 tgactacttctct 13944582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10408698 - 10408523
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  10408698 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 10408599  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  10408598 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 10408523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 14290931 - 14291106
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  14290931 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 14291030  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14291031 gtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 14291106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17494377 - 17494187
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  17494377 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataaattgg 17494278  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa-ctccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17494277 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtc 17494187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12181074 - 12180885
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  12181074 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 12180975  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12180974 gtctgtttgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtccaagatgtc 12180885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 16825712 - 16825869
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||| | |||    
T  16825712 tttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggataaatg 16825811  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16825812 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtc 16825869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31941633 - 31941449
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  31941633 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactcattttttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 31941534  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaag 224  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  31941533 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctcttgtgtgtctaag 31941449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 19727519 - 19727428
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatac 92  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  19727519 gctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctatagttgctattattcatac 19727428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12272957 - 12272879
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12272957 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 12272879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14575605 - 14575527
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14575605 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 14575527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17189104 - 17188932
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  17189104 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacgggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgg 17189005  T
Q  140 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    || |||||| | ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17189004 gt-ttgattgtatctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 17188932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24190034 - 24189866
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  24190034 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgg 24189935  T
Q  140 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 208  Q
    || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24189934 gt-ttgattgtatctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactactt 24189866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 11949324 - 11949499
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  11949324 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtggttataagttgg 11949423  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  11949424 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgt 11949499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 16831888 - 16832102
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||    || ||||| ||| | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  16831888 gctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 16831987  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgg 199  Q
    | ||||| || |||||||| ||  |||  | |   |||||| |||||| | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16831988 ctcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 16832086  T
Q  200 tgactacttctcttgt 215  Q
    | ||||||||||||||    
T  16832087 taactacttctcttgt 16832102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Original strand, 16327111 - 16327283
Alignment:
Q  43 agaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 142  Q
    |||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||||     
T  16327111 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt- 16327209  T
Q  143 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  16327210 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgt 16327283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 18131746 - 18131934
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  18131746 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagac-ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 18131844  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18131845 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 18131934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Original strand, 11958691 - 11958755
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11958691 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 11958755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 192
Target Start/End: Original strand, 12509882 - 12510034
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  12509882 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 12509981  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaag 192  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  12509982 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 12510034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Original strand, 12858005 - 12858069
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12858005 tctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 12858069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Original strand, 15013284 - 15013340
Alignment:
Q  156 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15013284 tatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctct 15013340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 13317894 - 13318086
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||    || ||||| ||| | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  13317894 gctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 13317993  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 193  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13317994 ctcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttggg-cttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Original strand, 16378444 - 16378508
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16378444 tctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 16378508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15230217 - 15230158
Alignment:
Q  156 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  15230217 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgt 15230158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15236085 - 15236026
Alignment:
Q  156 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  15236085 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgt 15236026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18859783 - 18859572
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859783 gctttgagtggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 18859684  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859683 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 18859584  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  18859583 gactacttctct 18859572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22031302 - 22031098
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22031302 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 22031203  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22031202 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactact 22031103  T
Q  208 tctct 212  Q
    |||||    
T  22031102 tctct 22031098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 20015838 - 20016049
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20015838 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 20015937  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20015938 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 20016037  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  20016038 gactacttctct 20016049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22126534 - 22126745
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126534 gctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 22126633  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126634 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22126733  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    || |||||||||    
T  22126734 gattacttctct 22126745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 17671597 - 17671808
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671597 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 17671696  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671697 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 17671796  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  17671797 gactacttctct 17671808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22117750 - 22117961
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22117750 gctttgactggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 22117849  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22117850 cgcattgttttattgctttcgatcgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22117949  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  22117950 gactacttctct 22117961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Original strand, 30310726 - 30310930
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30310726 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattg 30310825  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30310826 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactact 30310925  T
Q  208 tctct 212  Q
    |||||    
T  30310926 tctct 30310930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32603324 - 32603140
Alignment:
Q  28 gaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32603324 gaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtg 32603225  T
Q  128 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32603224 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 32603140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19115606 - 19115395
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115606 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 19115507  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19115506 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagt 19115407  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  19115406 gactacttctct 19115395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 19481647 - 19481858
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481647 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 19481746  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481747 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 19481846  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    |  |||||||||    
T  19481847 gcttacttctct 19481858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15536582 - 15536378
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15536582 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaatgatactccgttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 15536483  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15536482 ctttattgctttcgattatgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 15536383  T
Q  208 tctct 212  Q
    |||||    
T  15536382 tctct 15536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22043017 - 22042822
Alignment:
Q  17 agacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgc 116  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22043017 agacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatttc 22042918  T
Q  117 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22042917 ttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19981172 - 19980962
Alignment:
Q  2 ctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctac 101  Q
    |||||||||||||  |||| || || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19981172 ctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcggctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 19981073  T
Q  102 gcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtg 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19981072 gcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtg 19980973  T
Q  202 actacttctct 212  Q
    |||||||||||    
T  19980972 actacttctct 19980962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 22421470 - 22421695
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22421470 ttgactggtacttagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctacac 22421569  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22421570 attgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 22421669  T
Q  204 tacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  22421670 tacttctcttgtgtgtttaagatgtc 22421695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 22129219 - 22129403
Alignment:
Q  28 gaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22129219 gaggatcgtttgatcagaggtacttgctagattaataatactgctttagttgctattattgatactggtgttacacattgctttattgctttcgattgtg 22129318  T
Q  128 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22129319 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22129403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 21164113 - 21164341
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21164113 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgatcatactcctttagttgctattattgatactgatgcta 21164212  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21164213 cgcattgttttattgctttcaattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagt 21164312  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||||    
T  21164313 gactacttctctcgtatgtttgagatgtc 21164341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21254151 - 21253923
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21254151 gctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgcta 21254052  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||  ||||||||||  ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21254051 cgcattattttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 21253952  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21253951 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 21253923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 21391436 - 21391664
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21391436 gctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgcta 21391535  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21391536 cgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggt 21391635  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21391636 gaccacttctcttgtgtgtttaagatgtc 21391664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 21780762 - 21780990
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21780762 gctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgcta 21780861  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21780862 cgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggt 21780961  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21780962 gaccacttctcttgtgtgtttaagatgtc 21780990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22990251 - 22990023
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22990251 gctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgacagtacacctttagttgctattattgatactagtgcta 22990152  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
      ||||| ||||||||| | ||||||| |||    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22990151 aacattgttttattgctattgattgtgcttcaaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagggttcggt 22990052  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22990051 gactacttctcttgtatgtttaagatgtc 22990023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22523707 - 22523525
Alignment:
Q  46 ggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttg 145  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   ||||||||||    
T  22523707 ggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttg 22523608  T
Q  146 atttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgt 228  Q
     | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22523607 ctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgt 22523525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 22245590 - 22245807
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||  ||||||| ||| | ||||||    
T  22245590 gctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatattagtgcta 22245689  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22245690 cacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22245789  T
Q  201 gactacttctcttgtgtg 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22245790 gactacttctcttgtgtg 22245807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 22246008 - 22246225
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||  ||||||| ||| | ||||||    
T  22246008 gctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatattagtgcta 22246107  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22246108 cacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22246207  T
Q  201 gactacttctcttgtgtg 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22246208 gactacttctcttgtgtg 22246225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 21786001 - 21786158
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||    
T  21786001 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatg 21786100  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21786101 gttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtc 21786158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Original strand, 22375064 - 22375256
Alignment:
Q  36 tttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgct 135  Q
    |||||| |||||||| |||||  |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||| ||||       
T  22375064 tttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaag 22375163  T
Q  136 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  22375164 ttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc-cgtgtgtttaagatgtc 22375256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28984078 - 28983897
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  28984078 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 28983979  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  28983978 gtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 28983897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21928595 - 21928420
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  21928595 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 21928496  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||| | | | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21928495 gtctggttatatctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 21928420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Original strand, 16268838 - 16269012
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  16268838 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 16268937  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttg 214  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16268938 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 16269012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28989297 - 28989116
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  28989297 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 28989198  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  28989197 gtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 28989116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 29301040 - 29301221
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  29301040 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 29301139  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    ||||   | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  29301140 gtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 29301221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19985347 - 19985172
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   ||||    
T  19985347 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 19985248  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    || | | | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19985247 gtttggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 19985172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22374036 - 22373861
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||| | || |||| | | |||||||  | |   ||||    
T  22374036 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatagtttcattgatgttgattgtgcatataagttgg 22373937  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22373936 gtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 22373861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22054069 - 22053849
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||    || ||||| ||| | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  22054069 gctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 22053970  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgg 199  Q
    | ||||| || |||||||| ||  |||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22053969 ctcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 22053871  T
Q  200 tgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  22053870 taactacttctcttgtttgtct 22053849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27357665 - 27357522
Alignment:
Q  78 tgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtc 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||||||     
T  27357665 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 27357566  T
Q  178 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  27357565 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 27357522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 22027894 - 22028083
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   ||||    
T  22027894 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 22027993  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    || | | ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  22027994 gtttggttttatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtc 22028083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Original strand, 31414146 - 31414318
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||   || |||| || |   ||||    
T  31414146 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctaatgaatgtgcttataagttgg 31414245  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31414246 gtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 31414318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 18881232 - 18881301
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacac 70  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18881232 gctttgactggtacacagacagagaacggggatcgcttgatcaaaggtacttgttatattgataatacac 18881301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20391289 - 20391081
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||||||||| ||||||  || ||||| ||  | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  20391289 ttgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattattgatactggtgctacac 20391190  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    |||| || |||||| |  ||||||  | |   |||||||| | | ||||   ||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  20391189 attgattcattgctgttaattgtgaatataagttgggtctggttatgtcaagtattagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaac 20391090  T
Q  204 tacttctct 212  Q
    |||||||||    
T  20391089 tacttctct 20391081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3593 - 3382
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3593 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 3494  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3493 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgat 3394  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  3393 gactacttctct 3382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17322 - 17103
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17322 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattg 17223  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17222 ttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactact 17123  T
Q  208 tctcttgtgtgtctaagatg 227  Q
    ||||| || ||| |||||||    
T  17122 tctctcgtatgtttaagatg 17103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22323014 - 22323225
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323014 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 22323113  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323114 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22323213  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  22323214 gactacttctct 22323225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24712805 - 24712594
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712805 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 24712706  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712705 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 24712606  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  24712605 gactacttctct 24712594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9338353 - 9338142
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338353 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 9338254  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338253 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 9338154  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  9338153 gactacttctct 9338142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9486987 - 9486776
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486987 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 9486888  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486887 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 9486788  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  9486787 gactacttctct 9486776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10871621 - 10871410
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871621 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 10871522  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10871521 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggt 10871422  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  10871421 gactacttctct 10871410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16984011 - 16983800
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16984011 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 16983912  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983911 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 16983812  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  16983811 gactacttctct 16983800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17001771 - 17001560
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001771 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 17001672  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001671 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 17001572  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  17001571 gactacttctct 17001560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24265141 - 24264930
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24265141 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 24265042  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24265041 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgagtggatagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggt 24264942  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  24264941 gactacttctct 24264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 24874422 - 24874633
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24874422 gctttgactggtactcagacggagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgcta 24874521  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24874522 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggt 24874621  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  24874622 gactacttctct 24874633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27374040 - 27373829
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27374040 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagatgtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 27373941  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373940 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 27373841  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  27373840 gactacttctct 27373829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 44383242 - 44383453
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383242 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 44383341  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383342 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 44383441  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  44383442 gactacttctct 44383453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23074633 - 23074406
Alignment:
Q  2 ctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctac 101  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23074633 ctttcactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctac 23074534  T
Q  102 gcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtg 201  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |  |   |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23074533 gcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtg 23074434  T
Q  202 actacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23074433 actacttctcttgtgtgtttaagatgtc 23074406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 22733447 - 22733674
Alignment:
Q  2 ctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctac 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22733447 ctttgactggtacatagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 22733546  T
Q  102 gcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtg 201  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22733547 gcgttgatttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtg 22733646  T
Q  202 actacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22733647 actacttctcttgtgtgtataagatgtc 22733674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 24705154 - 24705365
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24705154 gctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgatattattgatactggtgcta 24705253  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24705254 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggt 24705353  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
     |||||||||||    
T  24705354 aactacttctct 24705365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Original strand, 11351390 - 11351594
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351390 ctggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 11351489  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351490 ttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 11351589  T
Q  208 tctct 212  Q
    |||||    
T  11351590 tctct 11351594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22742638 - 22742849
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22742638 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattggtactggtgcta 22742737  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22742738 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22742837  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  22742838 gactacttctct 22742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27220754 - 27220576
Alignment:
Q  34 cgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctg 133  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27220754 cgttngataagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctg 27220655  T
Q  134 ctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220654 ctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27220576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 24657337 - 24657558
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24657337 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactccattagttgctattattgatacagctgctacgcattg 24657436  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24657437 ttttattgctttcgattgtgtttctactttggatcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 24657536  T
Q  208 tctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| || ||| | |||||||    
T  24657537 tctctcgtatgtttgagatgtc 24657558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23065183 - 23064973
Alignment:
Q  2 ctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctac 101  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23065183 ctttcactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctac 23065084  T
Q  102 gcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtg 201  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |  |   |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23065083 gcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtg 23064984  T
Q  202 actacttctct 212  Q
    |||||||||||    
T  23064983 actacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Original strand, 45673711 - 45673912
Alignment:
Q  28 gaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45673711 gaggatcgattgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgctttcgattgtg 45673810  T
Q  128 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatg 227  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||    
T  45673811 attctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatg 45673910  T
Q  228 tc 229  Q
    ||    
T  45673911 tc 45673912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23205078 - 23204874
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23205078 ctggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattg 23204979  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23204978 catttttgctttccattgtgtttctgctttgggtcttgatgtgtctgatatgaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactact 23204879  T
Q  208 tctct 212  Q
    |||||    
T  23204878 tctct 23204874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23105400 - 23105628
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23105400 gctttgactggtacacagactgagaacgaggatcgtttgaccagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgttactggtgcta 23105499  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23105500 cgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 23105599  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23105600 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 23105628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24678258 - 24678030
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24678258 gctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatatgaataatactcctttagttgctattaatgatactggtgcta 24678159  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24678158 ggcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggt 24678059  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||||    
T  24678058 gactacttctctcgtatgtttgagatgtc 24678030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Original strand, 23029160 - 23029361
Alignment:
Q  28 gaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 127  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23029160 gaggatcgcttgatcagaggtacatcttatattaataatactcccttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtg 23029259  T
Q  128 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatg 227  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||    
T  23029260 cttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatg 23029359  T
Q  228 tc 229  Q
    ||    
T  23029360 tc 23029361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Original strand, 21322977 - 21323149
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21322977 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 21323076  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21323077 gtcttgttatgtctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21323149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Original strand, 21142761 - 21142924
Alignment:
Q  49 acttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt 148  Q
    ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21142761 acttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatt 21142860  T
Q  149 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21142861 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctct 21142924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 24817512 - 24817740
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| || |||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24817512 gctttgactggtacacagatagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgtcattttgaaagtactcctttagttgatattattgatactggtgcta 24817611  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24817612 cgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 24817711  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24817712 gactacttctctagtgtgtctaagatgtc 24817740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23676682 - 23676582
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23676682 ctggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattg 23676583  T
Q  108 c 108  Q
    |    
T  23676582 c 23676582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 212
Target Start/End: Original strand, 41606155 - 41606269
Alignment:
Q  92 ctggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaa 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41606155 ctggtgctacgcat-gctttat-gctttcgat-gtgtttctgctttgtgtct-gagt-gtctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaa 41606248  T
Q  192 gggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41606249 gggttcggtgactacttctct 41606269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20848321 - 20848140
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  20848321 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 20848222  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  20848221 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 20848140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23274325 - 23274136
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  23274325 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 23274226  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23274225 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 23274136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 19716760 - 19716903
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||||| | | | | |||||| |||| ||||| |||    
T  19716760 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatttgaaaggagaaatg 19716859  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19716860 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 19716903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 23097761 - 23097904
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   |||||||| | | |  |||| ||||| |||||||||    
T  23097761 tttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatttaagttgggtctggttgtaactgacatgaaaggagagatg 23097860  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23097861 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 23097904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12577053 - 12576913
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagat 170  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  12577053 tttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcctataaactgggt-ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaat 12576955  T
Q  171 ggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12576954 ggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctct 12576913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 218
Target Start/End: Original strand, 30208671 - 30208809
Alignment:
Q  80 ctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcga 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||    |||||||||| | ||||   |||||| || || |||||||||||    
T  30208671 ctattatagatactggtgctacacattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcgtctatgaaaggggaaatggttgtcga 30208770  T
Q  180 aactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtg 218  Q
    ||| || || |||||||||||||||| || ||| |||||    
T  30208771 aaccccggcaaagggttcggtgactaattttctagtgtg 30208809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23113423 - 23113283
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | ||||   ||||| |||||| |||    
T  23113423 tttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataaattgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatg 23113324  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  23113323 gttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctct 23113283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 21139653 - 21139705
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttg 53  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21139653 gctttgactggtactcagacggagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttg 21139705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 52
Target Start/End: Original strand, 22463160 - 22463204
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtactt 52  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22463160 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtactt 22463204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22416 - 22205
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22416 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 22317  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22316 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22217  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  22216 gactacttctct 22205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7405 - 7194
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7405 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 7306  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7305 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 7206  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  7205 gactacttctct 7194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16347799 - 16348010
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347799 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 16347898  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347899 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 16347998  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  16347999 gactacttctct 16348010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21833457 - 21833246
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833457 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 21833358  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833357 cgcattgttttatggctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 21833258  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  21833257 gactacttctct 21833246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 51330696 - 51330907
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330696 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 51330795  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330796 cgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 51330895  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  51330896 gactacttctct 51330907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 17042246 - 17042430
Alignment:
Q  28 gaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17042246 gaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtg 17042345  T
Q  128 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17042346 tttctgctttgggccttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 17042430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21842367 - 21842156
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21842367 gctttgactggtacgcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcta 21842268  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21842267 cgcattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttaggtcttgatttgtctgatatgaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggt 21842168  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  21842167 gactacttctct 21842156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 41350872 - 41351083
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41350872 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 41350971  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41350972 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 41351071  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    |  |||||||||    
T  41351072 gcttacttctct 41351083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 33388233 - 33388444
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagagg-tacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgct 99  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388233 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtt-gatcagagggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgct 33388331  T
Q  100 acgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgg 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388332 acgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgg 33388431  T
Q  200 tgactacttctct 212  Q
    |||||||||||||    
T  33388432 tgactacttctct 33388444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22496460 - 22496671
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22496460 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 22496559  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22496560 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttctacattgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22496659  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  22496660 gactacttctct 22496671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19109523 - 19109312
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19109523 gctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggtgcta 19109424  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
     |||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19109423 tgcattgttttattgcctatgattgtgcttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 19109324  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  19109323 gactacttctct 19109312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 24785061 - 24785272
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24785061 gctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgcta 24785160  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  24785161 cacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttatctgatatgaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggt 24785260  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  24785261 gactacttctct 24785272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 212
Target Start/End: Original strand, 20081608 - 20081791
Alignment:
Q  29 aggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgt 128  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20081608 aggatcgcctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttttattgctttcgattgtgc 20081707  T
Q  129 ttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20081708 ttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 20081791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 21228760 - 21228947
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||| |||||||  |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21228760 gctttggctggtactcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaatattactcctttagttgctattattgatactggtgcta 21228859  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21228860 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16379249 - 16379021
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16379249 gctttgactggtacgcaaacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattggtgcta 16379150  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||   ||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16379149 cgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 16379050  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16379049 gactacttctcttgtttgtttaagatgtc 16379021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21752199 - 21751987
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||| ||||  |||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21752199 ttgactagtactcagactgagaacgaggatcacttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgc 21752100  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21752099 attgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 21752000  T
Q  204 tacttctcttgtg 216  Q
    |||||||||||||    
T  21751999 tacttctcttgtg 21751987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22401747 - 22401621
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22401747 gctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagagatacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgcta 22401648  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtg 127  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||    
T  22401647 cgcattgttttattgcttaagattgtg 22401621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22015949 - 22016177
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||| ||  | ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  22015949 gctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgata 22016048  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22016049 ctcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 22016148  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22016149 aactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 22016177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20297496 - 20297347
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||    
T  20297496 tttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatg 20297397  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  20297396 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 20297347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 31537240 - 31537421
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  31537240 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 31537339  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  31537340 gtttggatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 31537421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52988888 - 52988707
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  52988888 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 52988789  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  52988788 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 52988707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 21739279 - 21739454
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  21739279 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 21739378  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  21739379 gtcttgttttatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgt 21739454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Original strand, 20074952 - 20075126
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  20074952 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 20075051  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttg 214  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20075052 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 20075126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48426020 - 48425839
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  48426020 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 48425921  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  48425920 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 48425839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 21742795 - 21742970
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   ||||    
T  21742795 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 21742894  T
Q  140 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21742895 gtct-gattgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctcttgt 21742970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 95
Target Start/End: Original strand, 22435944 - 22436031
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactgg 95  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22435944 ctggtacagagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactgg 22436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37680196 - 37680015
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  37680196 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 37680097  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  37680096 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 37680015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 38910069 - 38910250
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  38910069 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 38910168  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  38910169 gtttggatgtatctgatatgaaagggaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 38910250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 229
Target Start/End: Original strand, 20853988 - 20854192
Alignment:
Q  25 aacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 124  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  20853988 aacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaat 20854087  T
Q  125 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaag 224  Q
    |||  | |   ||||| ||   | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  20854088 gtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaag 20854187  T
Q  225 atgtc 229  Q
     ||||    
T  20854188 gtgtc 20854192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 24096858 - 24097033
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  24096858 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 24096957  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    || | ||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  24096958 gtttggatgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgt 24097033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 21045328 - 21045428
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| | |||||| |||||  |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21045328 gctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 21045427  T
Q  101 c 101  Q
    |    
T  21045428 c 21045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19857383 - 19857232
Alignment:
Q  78 tgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtc 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | || |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  19857383 tgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggtatggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgtt 19857284  T
Q  178 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19857283 gaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcctaaggtgtc 19857232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18710532 - 18710343
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||     
T  18710532 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataaacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgc 18710433  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18710432 gtctggttgtatctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 18710343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 22400472 - 22400397
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttg 79  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||    
T  22400472 ttgactggtactcagacggagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttg 22400397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12200554 - 12200484
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  12200554 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 12200484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 20833254 - 20833332
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20833254 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 20833332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21176576 - 21176531
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttg 53  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21176576 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttg 21176531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18816 - 18591
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18816 ttgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgatattattgatactagtgctacgc 18717  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18716 attgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 18617  T
Q  204 tacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||    
T  18616 tacttctctcgtgtgtttaagatgtc 18591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 17208 - 17429
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17208 ctggtactcagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattg 17307  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17308 ctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 17407  T
Q  208 tctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| || ||| | |||||||    
T  17408 tctctcgtatgtttgagatgtc 17429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 195000 - 195184
Alignment:
Q  28 gaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 127  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  195000 gaggatcgcctgattagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtg 195099  T
Q  128 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
     |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195100 cttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 195184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24396 - 24264
Alignment:
Q  80 ctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcga 179  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||| | | |||||||||||    |||| ||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  24396 ctattatagatactagggctacacattgttttattgttgttgattgtgtttcgaaattggatcttgttatgtcatatatgaatggagaaatggttgtcga 24297  T
Q  180 aactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24296 aaccccggctaagggttcagtgactacttctct 24264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Original strand, 13266 - 13470
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13266 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 13365  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13366 ctttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 13465  T
Q  208 tctct 212  Q
    |||||    
T  13466 tctct 13470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41324 - 41113
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41324 gctttgactggtactcagacggagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggggcta 41225  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41224 cgcattgctttattgctttggattatgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 41125  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  41124 gactacttctct 41113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 920 - 1115
Alignment:
Q  17 agacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgc 116  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  920 agacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgc 1019  T
Q  117 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1020 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgacatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctct 1115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 10380 - 10601
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10380 ctggtactcagacagagaatgaggattgtttgatcagaggtacttgctatattaataacactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 10479  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10480 ctttattactttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 10579  T
Q  208 tctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| || ||| | |||||||    
T  10580 tctctcgtatgtttgagatgtc 10601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Original strand, 13035 - 13239
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13035 ctggtactcagacagagaatgaggattgtttgatcagaggtacttgctatattaataaaactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 13134  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
     |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13135 atttataaatatcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 13234  T
Q  208 tctct 212  Q
    |||||    
T  13235 tctct 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54806 - 54578
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54806 gctttgactggttcacagaaagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatattggtgcta 54707  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||| | ||   |||||||||    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54706 cgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttttcatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 54607  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54606 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 54578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32048 - 31841
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |    |||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32048 gctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgct----cagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgtta 31953  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31952 cgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 31853  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
     |||||||||||    
T  31852 aactacttctct 31841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37514 - 37307
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |    |||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37514 gctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgct----cagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgtta 37419  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37418 cgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgt 37319  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
     |||||||||||    
T  37318 tactacttctct 37307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Original strand, 622 - 826
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  622 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatactaataatactcattaagttgctattattgatactggtgctacgcattg 721  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  722 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactact 821  T
Q  208 tctct 212  Q
    |||||    
T  822 tctct 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14578 - 14382
Alignment:
Q  16 tagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattg 115  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14578 tagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattg 14479  T
Q  116 ctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14478 ctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5083 - 4856
Alignment:
Q  2 ctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctac 101  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5083 ctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattaattagaggtacatgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctac 4984  T
Q  102 gcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtg 201  Q
     ||||| |||||| || | ||||||| ||||   |||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  4983 acattgttttatttctattgattgtgcttctaagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttagta 4884  T
Q  202 actacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4883 actacttctcttgtgtgtttaacatgtc 4856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 39507 - 39688
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  39507 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 39606  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  39607 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 39688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 44712 - 44790
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44712 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 44790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11638 - 11424
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||| ||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11638 gctttgaatggtacgcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 11539  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11538 ctcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 11439  T
Q  201 gactacttctcttgt 215  Q
    |||||||||||||||    
T  11438 gactacttctcttgt 11424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17892
Alignment:
Q  42 cagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggt 141  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||    
T  18065 cagaggtacttgctatattaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagt 17966  T
Q  142 cttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17965 cttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 17892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 55173 - 54996
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||| ||  |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55173 gctttgactggaactcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 55074  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcg 178  Q
    | |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55073 ctcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcg 54996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53723 - 53682
Alignment:
Q  174 tgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53723 tgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 53682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Original strand, 7921 - 8125
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7921 ctggtactcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagagttacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 8020  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8021 ctttattgcttttgattgggtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactact 8120  T
Q  208 tctct 212  Q
    |||||    
T  8121 tctct 8125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 229
Target Start/End: Original strand, 4100 - 4252
Alignment:
Q  77 ttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgt 176  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | ||||   ||||| |||||| ||||||||    
T  4100 ttgctattattgacactggtgctacactttgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgt 4199  T
Q  177 cgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  4200 tgaaactccagctaagggttcagtaactacttatcttgtttgtttaagatgtc 4252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36667 - 36439
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||| |||||||  |||| || || |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36667 gctttggctggtacacagaccgagaatgaggatcacttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 36568  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36567 cgcattgtttcattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 36468  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||||    
T  36467 gactacttctctcgtatgtttgagatgtc 36439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 36955 - 37166
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||| ||||  |||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36955 gctttgactagtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgatcatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 37054  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37055 cacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 37154  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  37155 gactacttctct 37166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26521 - 26293
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26521 gcttttactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtaaatgttattttgatagtactcttttagttgctattattgatattggtgcta 26422  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    |||| || ||||||| | | ||||||| ||||   |||||||||  | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26421 cgcaatgttttattgttgttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 26322  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26321 gactacttctctagtgtgtctaagatgtc 26293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 424477 - 424266
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  424477 gctttgacttgtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgcta 424378  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  424377 cgcattgttttattgcctacgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 424278  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  424277 gactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 203508 - 203336
Alignment:
Q  43 agaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 142  Q
    |||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  ||| || |   ||||||     
T  203508 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggt- 203410  T
Q  143 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  203409 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 203336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 303 - 82
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    ||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  303 ctggtacttagaaagagaatgaggatcgtttgattagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 204  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  203 tttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactact 104  T
Q  208 tctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| || ||| | |||||||    
T  103 tctctcgtatgtttgagatgtc 82  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 29070 - 29291
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29070 ctggtactcagacagagaatgaggatcaattgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgctacgcattg 29169  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 207  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29170 atttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 29269  T
Q  208 tctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| || ||| | |||||||    
T  29270 tctctcgtatgtttgagatgtc 29291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8427 - 8216
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8427 gctttgactggtactcagactgaggatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 8328  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8327 ctcattgctttattgctttcgattgtgtatctgctttaggtcttgaattgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 8228  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  8227 gactacttctct 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 30709 - 30920
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30709 gctttgactggtactcagactgagaatgaggatcgcttgatcagaggagcatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 30808  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30809 cgcattgttttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 30908  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    ||||||||||||    
T  30909 gactacttctct 30920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 47121 - 47345
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  47121 ttgactggtactcagactgagaacgaggatcgctttatcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttactattattgattctggtgctacac 47220  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| | ||   |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  47221 attgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaa-ggttcggtgac 47319  T
Q  204 tacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  47320 tacttctcttgtgtgtttaaggtgtc 47345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 152115 - 152022
Alignment:
Q  136 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  152115 ttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 152022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 942
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 gctttgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgattagagatacatgttatattaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgcta 1052  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1051 cgcattgttttattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 952  T
Q  201 gactacttct 210  Q
    ||||||||||    
T  951 gactacttct 942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Original strand, 11518 - 11719
Alignment:
Q  28 gaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11518 gaggatcgtttgattagaggtacttgttatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 11617  T
Q  128 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | |||||    
T  11618 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactacttgtctcgtatgtttgagatg 11717  T
Q  228 tc 229  Q
    ||    
T  11718 tc 11719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 513 - 741
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  513 gctttgactggtacacagacatagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgcta 612  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  613 cgcattgttttattgcttatgattgtgctactaaattgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgt 712  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  713 gactacttcacttgtgtgtttaagatgtc 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 209 - 1
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  209 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggttcatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 110  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109 cgcattgttttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 10  T
Q  201 gactacttc 209  Q
    |||||||||    
T  9 gactacttc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4600 - 4375
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600 ttgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgc 4501  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4500 attgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgac 4401  T
Q  204 tacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  4400 tacttctcttgtgtgtttaagatgtc 4375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 183 - 1
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 ttgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgc 84  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 186  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  83 attgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 11015 - 11243
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11015 gctttgactggtacacagacagagaacgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagtttctattattgatactagtgcta 11114  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||||  ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11115 cacattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 11214  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11215 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 11243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8392 - 8164
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8392 gctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattgtgatagtacgcctttagttgctattattgatactagtgcta 8293  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||| | ||   | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8292 cacattgttttattgcttttgattgtgctacttagtcgggacttgatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 8193  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8192 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 8164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 23668 - 23895
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23668 gctttgactggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgcta 23767  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23768 cacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 23867  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23868 gactacttctcttgtgtgtttaagatgt 23895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 151665 - 151508
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||||| | | | | ||| ||||||| ||||| |||    
T  151665 tttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatcttatatgaaaggagaaatg 151566  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  151565 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtc 151508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Original strand, 1206 - 1378
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  1206 atcagaggaacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgtattgctttattgctttcgactttgtttctactttgg 1305  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306 gtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 1378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 2402 - 2626
Alignment:
Q  5 tgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgca 104  Q
    ||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2402 tgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 2501  T
Q  105 ttgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgact 204  Q
    ||  ||||||||||  || |||| | ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2502 ttcttttattgcttatgaatgtgctactaagttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgact 2601  T
Q  205 acttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  2602 acttctcttgtgtgtttaagatgtc 2626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Original strand, 50483 - 50691
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||||||||  |||  || || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50483 ttgactggtactcagatcgagaatgaggatcgcctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgc 50582  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50583 attgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgac 50682  T
Q  204 tacttctct 212  Q
    |||||||||    
T  50683 tacttctct 50691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42828 - 42639
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||   | |||||||  | |   ||||    
T  42828 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttatttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgtagttgattgtgcatataagttgg 42729  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  42728 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 42639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 10309 - 10504
Alignment:
Q  17 agacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgc 116  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10309 agacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgc 10408  T
Q  117 tttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10409 tttcgattgtgcttctactttgggtctacatatgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctct 10504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15080 - 14873
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15080 gctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgcta 14981  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14980 cgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 14881  T
Q  201 gactactt 208  Q
    ||||||||    
T  14880 gactactt 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 34850 - 35061
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||  || || |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34850 gctttgactggtactcagatcgagaatgaggatcgcttgatcaaaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 34949  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34950 agcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 35049  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
    |||||| |||||    
T  35050 gactacgtctct 35061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41801 - 41573
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||||||| |||  |||| || || |||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41801 gctttgactgctactcagactgagaatgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgcta 41702  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||||| | ||   |||||||||| | |||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41701 cacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggt 41602  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41601 gactacttctctcgtgtgtttaagatgtc 41573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 75521 - 75293
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||||||| |||  |||| || || |||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  75521 gctttgactgctactcagactgagaatgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgcta 75422  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||||| | ||   |||||||||| | |||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  75421 cacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggt 75322  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  75321 gactacttctctcgtgtgtttaagatgtc 75293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 55608 - 55833
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55608 ttgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgc 55707  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    |||  ||||||||| | ||||||| | ||   |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55708 atttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 55807  T
Q  204 tacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||||||  |||||||||    
T  55808 tacttctcttgtgtgattaagatgtc 55833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8579 - 8351
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8579 gctttgactggtacacagacagagaacgaggattgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 8480  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8479 cgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaagggttcggt 8380  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8379 gactacttctcttgtgtgtttgagatgtc 8351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2134 - 1930
Alignment:
Q  25 aacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 124  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  2134 aacgaggatcgcttgatcagaagtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgatt 2035  T
Q  125 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaag 224  Q
    ||| | ||   |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2034 gtgctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaag 1935  T
Q  225 atgtc 229  Q
    |||||    
T  1934 atgtc 1930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 40642 - 40870
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40642 gctttgactcgtacacagaaagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgcta 40741  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40742 cgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggt 40841  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  40842 gactacttctcttgtgtgtttaatatgtc 40870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 57749 - 57977
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  57749 gctttgactggtacgcagacagagaatgaggctcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgcta 57848  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||| | | ||||||| ||||   || ||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57849 cacattgttttattgttattgattgtgcttctaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 57948  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  57949 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 57977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14249 - 14026
Alignment:
Q  5 tgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgca 104  Q
    ||||||||||  |||| || ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14249 tgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttggtcagaggtacatgttatataaatagtacacctttagttgctattattgatagtggtgctacgca 14150  T
Q  105 ttgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgact 204  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14149 ttgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgact 14050  T
Q  205 acttctcttgtgtgtctaagatgt 228  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||    
T  14049 acttctcttgtatgtttaagatgt 14026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11433 - 11307
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11433 gctttgactggtacatagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgcta 11334  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtg 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11333 cgcattgttttattgcttttgattgtg 11307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 496189 - 495962
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  496189 gctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtagacctttagttgctattattgatactagtgcta 496090  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||||| |||    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  496089 cacattgttttattgctattgattgtgcttcgaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 495990  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgt 228  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  495989 gactacttctcttgtgtttttaagatgt 495962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 441821 - 441594
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  441821 gctttgactggtacc-atacagagaatgaggatcgattgattagaagtacatgttattttgacagtactcctttagttgctattattgatactggtgcta 441723  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    || |||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||  | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  441722 cggattgttttattgctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 441623  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  441622 gactacttctctagtgtgtctaagatgtc 441594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 514527 - 514708
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  514527 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 514626  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  514627 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 514708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10952 - 10727
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10952 ttgactggtactcagatagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgc 10853  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    |||| ||||||| | | ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10852 attgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 10753  T
Q  204 tacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||| || ||| | |||||||    
T  10752 tacttctctcgtatgtttgagatgtc 10727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 719 - 894
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  719 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 818  T
Q  140 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  819 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagagatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgt 894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 24847 - 25075
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24847 gctttgactggtacacagacagagaacgaggatcacttgatcagaggtacttgctatattgacaatacgcctttagttgctattattgatactggtgcta 24946  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||| | ||   |  |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24947 cgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagtcaggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 25046  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  25047 gactacatctcttgtgtgtttaagatgtc 25075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21773 - 21566
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  21773 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgcta 21674  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673 cgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 21574  T
Q  201 gactactt 208  Q
    ||||||||    
T  21573 gactactt 21566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37197 - 36990
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  37197 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgcta 37098  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37097 cgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 36998  T
Q  201 gactactt 208  Q
    ||||||||    
T  36997 gactactt 36990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9116 - 8891
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9116 gctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgcta 9017  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | |||   ||||||||||   |||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  9016 cacat---tttattgcttattattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttcagt 8920  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8919 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 8891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3026 - 2861
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3026 ctggtacttagacagagattgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactccattagttgctattattgatactggtgctacgcattg 2927  T
Q  108 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggt 173  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2926 tttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggt 2861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 7877 - 8102
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7877 ttgactggtactcagactgagaacgaggatcacttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacac 7976  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 203  Q
    |||||||||||||| | ||||||| | ||    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7977 attgctttattgctattgattgtgctactaaggtgggtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaa 8076  T
Q  204 tacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
     ||||||||||||||| |||||||||    
T  8077 aacttctcttgtgtgtttaagatgtc 8102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 15714 - 15894
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    |||||| |||||||  |||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15714 gctttggctggtacacagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgcaattattgatactggtgcta 15813  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa 181  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15814 cgcattgtttaattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 104396 - 104168
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  104396 gctttgactggtactcagactgggaacgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagtttctattattgataatggtgcta 104297  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||  |||||||| || | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  104296 cgcattgttttattgctattgattgtgcttctaatttgggtcctgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggt 104197  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||    
T  104196 aactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 104168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 48833 - 48651
Alignment:
Q  2 ctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctac 101  Q
    |||||||||| ||  |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48833 ctttgactgggactcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 48734  T
Q  102 gcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactc 184  Q
     |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48733 tcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactc 48651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 17484 - 17712
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17484 gctttaactggtacacagacagaaaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatacacctttagttgctattattgatacaggtgcta 17583  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| || ||| |||  ||||||| | ||   |||||||||    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17584 cgcattgtttcatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttatcatgcctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgct 17683  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17684 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 17712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40077 - 39999
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  40077 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtc 39999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 24086 - 24308
Alignment:
Q  7 actggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcatt 106  Q
    ||||||||  |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24086 actggtactcagactgagaacaaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactagtgctacgcatt 24185  T
Q  107 gctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 206  Q
    | ||||||||| | ||||||| | ||   || ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24186 gttttattgctattgattgtgctactaagttaggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 24285  T
Q  207 ttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||| || | |||||||    
T  24286 ttctcttgtgcgtttgagatgtc 24308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 9978 - 10135
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || | || || |   |||||||| | | | ||||||||||| || || |||    
T  9978 tttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatttgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatg 10077  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  10078 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtctaagatgtc 10135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 15114 - 15339
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15114 gctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagttgctattattaatactggtgcta 15213  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||  | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15214 cgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 15313  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagat 226  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||    
T  15314 gactacttctttagtgtgtttaagat 15339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 14401 - 14629
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| | |||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  14401 gctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttattgatactggtgcta 14500  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| |||||| || | ||||||| | ||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14501 cacattgttttatttctattgattgtgctcctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 14600  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14601 gactacttctcttgtgtatttaagatgtc 14629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7042 - 6814
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||| | ||||  || ||||||||||||||||||||    
T  7042 gctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtgcta 6943  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6942 cgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggt 6843  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6842 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 6814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14172 - 13944
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||| | ||||  || ||||||||||||||||||||    
T  14172 gctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtgcta 14073  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14072 cgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggt 13973  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13972 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 13944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23433 - 23661
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| || || | || |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23433 gctttgactggtacgaaggcacagaatgaggatcgattaatcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtgcta 23532  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||   |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23533 cgcattgttttattgctcttgatagtgcttctaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggc 23632  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23633 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 23661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 9486 - 9714
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| || |||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9486 gctttgactggtacacagatagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgtcattttgaaagtactcctttagttgatattattgatactggtgcta 9585  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9586 cgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 9685  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9686 gactacttctctagtgtgtctaagatgtc 9714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3717 - 3521
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgc 103  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3717 ttgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctatcattgatactggtgctacgc 3618  T
Q  104 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3617 attgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggt 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Original strand, 111069 - 111268
Alignment:
Q  28 gaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 127  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  111069 gaggatcgcttgatcagaggtacatgttattttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtg 111168  T
Q  128 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatg 227  Q
     | ||   |||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  111169 ctactaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgtgtgtttaagatg 111268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18012 - 17819
Alignment:
Q  36 tttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgct 135  Q
    |||||| |||||||| |||||  |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||  |||       
T  18012 tttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaag 17913  T
Q  136 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||  | ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17912 ttgggtcttactatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 17819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 13614 - 13842
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| | |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  13614 gctttgactggtacacaaacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattgatgcta 13713  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| | ||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13714 cacattgttctattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagagttcggt 13813  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13814 gactacttctcttgtgtgattaagatgtc 13842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6280 - 6054
Alignment:
Q  3 tttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacg 102  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6280 tttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactgatgctacg 6181  T
Q  103 cattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtga 202  Q
    ||||| |||| |||| |  |||||| ||||   |||||||||  | ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6180 cattgttttaatgctatttattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtga 6081  T
Q  203 ctacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||    
T  6080 ctacttctctcgtgtgtttaagatgtc 6054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15253 - 15064
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   ||||    
T  15253 atcagaggtacttgtttcttttatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 15154  T
Q  140 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    || |||||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  15153 gt-ttgattgtatttgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtctaaggtgtc 15064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 216555 - 216783
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||  |||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  216555 gctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcaattgatcagaggtacatgttactttgatagtactactttaattgctattattgatactggtgcta 216654  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| ||||||| | | ||||||  |||    || ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  216655 cacattgttttattgttattgattgtacttcaaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtagaaactccagctaagggttcggt 216754  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  216755 gactacttctcttgtgtgtttcagatgtc 216783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5257 - 5029
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||  |||| || ||||| |||||||| |||||  |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5257 gctttgactggtacgcagacattgaataaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcttttaattgctattattgatactggtgcta 5158  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||| | | ||||||| ||||   |||||||||| | |||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5157 cgcattgttttattggtgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaaactccagctaagggttcggt 5058  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5057 gactacttctctagtgtgtctaaggtgtc 5029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4692 - 4528
Alignment:
Q  61 gataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatga 160  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| ||||||    
T  4692 gatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatga 4593  T
Q  161 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaaga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4592 atggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgtgtgtttaaga 4528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15579 - 15363
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15579 gctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgattgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgcta 15480  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| |||            | | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15479 cgcattgttttattgctattgattgtgcttc------------taagttgtcaaatatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggt 15392  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15391 gactacttctcttgtgtgtttaagatgtc 15363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Original strand, 229994 - 230093
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  229994 ctggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 230093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 251720 - 251580
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||    
T  251720 tttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatg 251621  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  251620 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 251580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29793 - 29565
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||  | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29793 gctttgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 29694  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | || || || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  29693 ctcaatgtttgattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 29594  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29593 aactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 29565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 49465 - 49543
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  49465 tctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtc 49543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 58499 - 58577
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  58499 tctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtc 58577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 64887 - 64965
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  64887 tctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtc 64965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 94029 - 94257
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||    || ||||||||  | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  94029 gctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 94128  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||||||   | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  94129 cgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 94228  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  94229 aactacttctctggtgtgtctaaggtgtc 94257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 115581 - 115517
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  115581 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgt 115517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12090 - 11915
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  12090 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 11991  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11990 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 11915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 171280 - 171177
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 107  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  171280 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagagttacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctatgcattg 171181  T
Q  108 cttt 111  Q
    ||||    
T  171180 cttt 171177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2141 - 1959
Alignment:
Q  28 gaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 127  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| | |||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||    
T  2141 gaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctacgcattgttttattgttgctgattgtg 2042  T
Q  128 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 210  Q
     | ||   |||||||||  | ||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2041 ctactaagttgggtcttattatgtcatatatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttct 1959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 41270 - 41452
Alignment:
Q  28 gaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 127  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |  ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||   |||||||    
T  41270 gaggatcatctgatcagaggtacatgttacattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgctgctgattgtg 41369  T
Q  128 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 210  Q
    ||||    |||||||||| | ||||   ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  41370 tttcgaaattgggtcttgttatgtcatctatgaatggggaaatggttgtcgaaacttcggctaagggttcggtgactacttct 41452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5824 - 5746
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5824 tctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtc 5746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5311 - 5122
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  5311 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 5212  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  5211 gtctggttatgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctgaggtttcagtaactatttctcttgtttgtctaagttgtc 5122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 1028 - 1217
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  1028 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 1127  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1128 gtctggttgtatatgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtc 1217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41865 - 41684
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  41865 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 41766  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  41765 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 41684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 325837 - 325648
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  325837 atcagaggtacttgtttctttaatattactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 325738  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  325737 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtc 325648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Original strand, 200642 - 200814
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   ||||    
T  200642 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 200741  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    |||| | | ||||   ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  200742 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 200814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 228
Target Start/End: Original strand, 29 - 217
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  29 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 128  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgt 228  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  129 gtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtataagatgt 217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 93 - 1
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatact 93  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  93 gctttgactggtactcagaccgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12621
Alignment:
Q  155 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 12621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3622 - 3542
Alignment:
Q  149 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3622 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtc 3542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 3708 - 3636
Alignment:
Q  4 ttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttag 76  Q
    ||||||||||   |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3708 ttgactggtattcagactgagaactaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgataatacacctttag 3636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 4439 - 4650
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |  || ||||| ||  | ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  4439 gctttgactggtacgcagacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaatttctattatagatactggtgcta 4538  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||  | | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4539 ctcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcgggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 4638  T
Q  201 gactacttctct 212  Q
     |||||||||||    
T  4639 aactacttctct 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 60837 - 60694
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||||||||| |||    
T  60837 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatg 60738  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  60737 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 60694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 70206 - 70081
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||||||||| |||    
T  70206 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatg 70107  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  70106 gttgttgaaactccagctaagggttc 70081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 43554 - 43768
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||| ||  | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  43554 gctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 43653  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  43654 ctcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagt 43753  T
Q  201 gactacttctcttgt 215  Q
     ||||||||||||||    
T  43754 aactacttctcttgt 43768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25216 - 25176
Alignment:
Q  170 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  25216 tggttgtcgaaactcgagctaagggttcgataactacttct 25176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 713 - 524
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  713 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 614  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  613 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 1485 - 1674
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   ||||    
T  1485 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgg 1584  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||    
T  1585 gtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtc 1674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7168 - 6979
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  7168 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 7069  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    || | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7068 gtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtc 6979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11197 - 11072
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  11197 gctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcatttaattgttattattgatactggtacta 11098  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgt 126  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||||    
T  11097 ctcattgttttattgctattgattgt 11072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7874 - 7685
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   ||||    
T  7874 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgg 7775  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||    
T  7774 gtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtc 7685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12825 - 12668
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||    
T  12825 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 12726  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  12725 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaagttgtc 12668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 591 - 410
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  591 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctagtcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 492  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  491 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 229
Target Start/End: Original strand, 1026 - 1178
Alignment:
Q  77 ttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgt 176  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1026 ttgctattatagacactagtgctactcattgttttattgctattgattgtgcatataagttgggtctggctgtatctgatatgaaaggagaaatggttgt 1125  T
Q  177 cgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||    
T  1126 tgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttttctaagatgtc 1178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Original strand, 5319 - 5491
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  5319 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 5418  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 212  Q
    || | ||| | |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5419 gtatggatgtatctgatatgaaaagagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 5491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 50274 - 50046
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||| ||  | || |||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  50274 gctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 50175  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||| || | | | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  50174 ctcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggggctagttgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactccagctaagggttcagt 50075  T
Q  201 gactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  50074 aactacttctcttgtttgtctaagttgtc 50046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Original strand, 2158 - 2314
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||  || |   |||||||| | | | ||||||||||| || || |||    
T  2158 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgttcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggatatg 2257  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgt 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2258 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgt 2314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 70539 - 70313
Alignment:
Q  3 tttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacg 102  Q
    ||||||||||||| ||||    || ||||||||  | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||| |||     
T  70539 tttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttact 70440  T
Q  103 cattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtg 201  Q
    ||||| ||  ||||||| || ||||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| ||     
T  70439 cattgtttctttgctttagaatgtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagta 70341  T
Q  202 actacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||| ||||    
T  70340 actacttctctagtttgtttaaggtgtc 70313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 224
Target Start/End: Original strand, 98789 - 98941
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || | || |||| || |   |||||||| | | | ||| ||||||| ||||| |||    
T  98789 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattactattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaagggagaaatg 98888  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaag 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  98889 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaag 98941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 176086 - 175943
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||||||||| |||    
T  176086 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaatggagaaatg 175987  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  175986 gttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgt 175943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29657 - 29482
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||  | |||||||  | |   ||||    
T  29657 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgcagttgattgtgcatataagttgg 29558  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  29557 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcacttgt 29482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 221
Target Start/End: Original strand, 21413 - 21540
Alignment:
Q  94 ggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||   ||||| |||| | ||||   |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21413 ggtgctacgcattgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggccttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagg 21512  T
Q  194 gttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21513 gttcggtgactacttctctagtgtgtct 21540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 107 - 1
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  107 gctttgattggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttaagtgctataattgatagtggtgcta 8  T
Q  101 cgcattg 107  Q
    |||||||    
T  7 cgcattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 8747 - 8825
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8747 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtc 8825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 18961 - 19039
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18961 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtc 19039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 1168 - 1246
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1168 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtc 1246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 63654 - 63868
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||| ||  | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  63654 gctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtgtta 63753  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 200  Q
    | ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  63754 ctcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 63853  T
Q  201 gactacttctcttgt 215  Q
     ||||||||||||||    
T  63854 aactacttctcttgt 63868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 65472 - 65661
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||  | |   ||||    
T  65472 atcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttccttgctttagaatgtgcatataagttgg 65571  T
Q  140 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  65572 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtc 65661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11939 - 11758
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  11939 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 11840  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtct 221  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  11839 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8744 - 8555
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   ||||    
T  8744 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 8645  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    || | | | | |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8644 gtttggttgtatctgatataaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 8555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20944 - 20755
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  20944 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 20845  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| |   | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20844 gtctggtcgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtc 20755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 772 - 850
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  772 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaaatgtc 850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 30456 - 30371
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattat 86  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30456 gctttgactggtactcagaccgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattat 30371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 1061
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  1250 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 1151  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1150 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 1061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54177 - 53988
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||     
T  54177 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgt 54078  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54077 gtctggttgtatctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtc 53988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 1446 - 1621
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |  ||||||  | |   ||||    
T  1446 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgg 1545  T
Q  140 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  1546 gtct-gattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgt 1621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Original strand, 20743 - 20891
Alignment:
Q  81 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 180  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  20743 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 20842  T
Q  181 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20843 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 20891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 12637 - 12711
Alignment:
Q  155 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12637 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 12711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 28459 - 28634
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |  ||||||  | |   ||||    
T  28459 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgg 28558  T
Q  140 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  28559 gtct-gattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgt 28634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 67282 - 67457
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||  |||  | |   ||||    
T  67282 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgccttagaaagtgcatataagttgg 67381  T
Q  140 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    || |||||| | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  67382 gt-ttgattgtatccgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 67457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1819 - 1681
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||    
T  1819 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatg 1720  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 210  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1719 gttcttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 5383 - 5572
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  5383 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 5482  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5483 gtctggttgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 5572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5732 - 5559
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | | || ||  | |   ||||    
T  5732 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgtttatgcatataagttgg 5633  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctt 213  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  5632 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctctt 5559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 9401 - 9590
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||  || |   ||||    
T  9401 atcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtacttataagttgg 9500  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| | | | |||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9501 gtctggttgtatctgatatgaaacgggaaatagttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 9590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37037 - 36880
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  |     |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||    
T  37037 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatacaagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatg 36938  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36937 gttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 36880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30064 - 29907
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  30064 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 29965  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 197  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29964 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 29907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 110708 - 110551
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 171  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | ||||||||||||| ||||| |||    
T  110708 tttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtctgatatgaaaggagaaatg 110609  T
Q  172 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  110608 gttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 6463 - 6606
Alignment:
Q  72 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagat 170  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  ||| || |   |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||    
T  6463 tttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaat 6561  T
Q  171 ggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6562 ggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgt 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 4263 - 4438
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  4263 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 4362  T
Q  140 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||   | ||||   ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  4363 gtctacttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgt 4438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 3455 - 3533
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  3455 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtc 3533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 263353 - 263181
Alignment:
Q  43 agaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 142  Q
    |||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||||     
T  263353 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt- 263255  T
Q  143 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  263254 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 263181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2890 - 2826
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2890 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 2826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 17619 - 17842
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||    || ||||||||| | ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || | ||||||||    
T  17619 gctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacattggtgcta 17718  T
Q  101 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgg 199  Q
    |  |||| || |||||||| ||  |||  | |   |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  17719 cttattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcag 17817  T
Q  200 tgactacttctcttgtgtgtctaag 224  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||    
T  17818 taactacttctcttgtctgtttaag 17842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Original strand, 5134 - 5198
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  5134 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 5198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 9960 - 10135
Alignment:
Q  40 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 139  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||    
T  9960 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 10059  T
Q  140 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  10060 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctcttgt 10135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21870 - 21806
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21870 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgt 21806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Original strand, 53708 - 53772
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53708 tctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgt 53772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26131 - 26053
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||    
T  26131 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtc 26053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22141 - 22063
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22141 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtc 22063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 215
Target Start/End: Original strand, 49088 - 49226
Alignment:
Q  77 ttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgt 176  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  49088 ttgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgt 49187  T
Q  177 cgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
     |||| || |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  49188 tgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgt 49226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Original strand, 119 - 183
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  119 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgt 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 5160 - 5100
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatac 68  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5160 ctggtacccagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 5100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Original strand, 30611 - 30675
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30611 tctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 30675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11844 - 11785
Alignment:
Q  156 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  11844 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgt 11785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 60 - 1
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatatt 60  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  60 gctttgactagtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 69556 - 69634
Alignment:
Q  1 gctttgactggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttg 79  Q
    |||||| |||||||  ||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||    
T  69556 gctttggctggtacacagacaaagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttg 69634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10996 - 10932
Alignment:
Q  151 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 215  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  10996 tctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgt 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34429 - 34278
Alignment:
Q  78 tgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtc 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || | ||| | |   |||||||  | | | ||||||||||| |  || ||||||||     
T  34429 tgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgaatatgtatataagttgggtccggttgtatctgatatgaaagtggaaatggttgtt 34330  T
Q  178 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtctaagatgtc 229  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  34329 gaaattccagctaagggttcagtagctatttctcttgtttgtctaaggtgtc 34278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 53
Target Start/End: Original strand, 14174 - 14219
Alignment:
Q  8 ctggtacgtagacagaaaacgaggatcgtttgatcagaggtacttg 53  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14174 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttg 14219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University