View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8265_low_5 (Length: 336)

Name: NF8265_low_5
Description: NF8265
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8265_low_5
NF8265_low_5
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (119-218)||(18424223-18424322)
chr7 (120-218)||(2833474-2833572)
chr7 (120-218)||(7520208-7520306)
chr7 (120-215)||(20486733-20486828)
chr7 (120-218)||(10607313-10607411)
chr7 (120-218)||(13891618-13891716)
chr7 (120-218)||(39268306-39268404)
chr7 (120-217)||(11660271-11660368)
chr7 (122-218)||(1860016-1860112)
chr7 (122-218)||(13919407-13919503)
chr7 (120-218)||(31713-31811)
chr7 (120-218)||(12706115-12706213)
chr7 (120-218)||(12713528-12713626)
chr7 (120-218)||(12722186-12722284)
chr7 (120-218)||(16582409-16582507)
chr7 (120-218)||(16908502-16908600)
chr7 (120-218)||(18281946-18282044)
chr7 (120-218)||(25928364-25928462)
chr7 (121-218)||(39721183-39721281)
chr7 (122-218)||(13892001-13892097)
chr7 (120-216)||(14420777-14420873)
chr7 (120-216)||(16004994-16005090)
chr7 (120-216)||(18606328-18606424)
chr7 (120-216)||(18871287-18871383)
chr7 (120-218)||(26291144-26291243)
chr7 (120-218)||(9752500-9752598)
chr7 (120-218)||(12717275-12717373)
chr7 (120-218)||(18277982-18278080)
chr7 (120-207)||(838125-838213)
chr7 (120-207)||(1203305-1203393)
chr7 (120-216)||(10897889-10897985)
chr7 (120-218)||(15083213-15083312)
chr7 (139-218)||(45171512-45171591)
chr7 (120-217)||(16109967-16110065)
chr7 (120-217)||(834037-834135)
chr7 (120-217)||(1199217-1199315)
chr7 (127-216)||(41283635-41283724)
chr7 (120-216)||(146490-146586)
chr7 (139-218)||(72383-72462)
chr7 (139-218)||(76492-76571)
chr7 (120-214)||(2531325-2531418)
chr7 (128-218)||(15213036-15213126)
chr7 (120-184)||(18301373-18301437)
chr7 (127-206)||(16185524-16185603)
chr7 (163-216)||(11302297-11302350)
chr7 (163-216)||(15166240-15166293)
chr7 (127-185)||(11394878-11394936)
chr7 (138-206)||(23666463-23666530)
chr7 (121-178)||(455885-455942)
chr7 (121-178)||(11393817-11393874)
chr7 (121-178)||(11972051-11972108)
chr7 (121-178)||(14949671-14949728)
chr7 (121-178)||(15377263-15377320)
chr7 (121-178)||(16232075-16232132)
chr7 (121-178)||(16409623-16409680)
chr7 (121-178)||(20385672-20385729)
chr7 (121-178)||(21190145-21190202)
chr7 (121-178)||(24701810-24701867)
chr7 (121-178)||(24704260-24704317)
chr7 (121-178)||(26356500-26356557)
chr7 (121-178)||(26358952-26359009)
chr7 (121-178)||(27216430-27216487)
chr7 (121-178)||(32125054-32125111)
chr7 (121-178)||(41522492-41522549)
chr7 (121-178)||(41524954-41525011)
chr7 (180-218)||(9752728-9752766)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (119-218)||(15223534-15223633)
chr4 (120-218)||(17052438-17052536)
chr4 (120-218)||(12422931-12423029)
chr4 (120-218)||(22634919-22635017)
chr4 (120-217)||(24048377-24048474)
chr4 (120-218)||(20158440-20158538)
chr4 (120-218)||(20163891-20163989)
chr4 (120-218)||(4562766-4562864)
chr4 (120-218)||(5758448-5758546)
chr4 (120-218)||(9555057-9555155)
chr4 (120-218)||(13813825-13813923)
chr4 (120-218)||(13818313-13818411)
chr4 (120-218)||(14758984-14759082)
chr4 (120-218)||(14955752-14955850)
chr4 (120-218)||(17807042-17807140)
chr4 (120-218)||(23996959-23997056)
chr4 (120-218)||(33740824-33740922)
chr4 (120-216)||(15533209-15533305)
chr4 (120-206)||(631740-631826)
chr4 (120-206)||(10711825-10711911)
chr4 (120-206)||(10925595-10925681)
chr4 (120-218)||(20161116-20161214)
chr4 (120-218)||(25688430-25688528)
chr4 (120-217)||(30145772-30145870)
chr4 (122-218)||(12486259-12486355)
chr4 (120-216)||(18211594-18211690)
chr4 (120-216)||(36036942-36037038)
chr4 (120-206)||(27532752-27532838)
chr4 (127-216)||(28384841-28384930)
chr4 (120-216)||(49549075-49549172)
chr4 (121-206)||(38106946-38107031)
chr4 (163-206)||(14047318-14047361)
chr4 (180-218)||(22635063-22635101)
chr4 (121-178)||(1838053-1838110)
chr4 (121-178)||(12033681-12033738)
chr4 (121-178)||(14739599-14739656)
chr4 (121-178)||(15118902-15118959)
chr4 (121-178)||(29267218-29267275)
chr4 (121-178)||(44614843-44614900)
chr4 (121-178)||(50222889-50222946)
chr4 (121-178)||(18239969-18240026)
chr4 (147-184)||(37839211-37839248)
chr4 (147-184)||(42597940-42597977)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (116-218)||(31479451-31479553)
chr6 (119-218)||(16622825-16622922)
chr6 (120-218)||(2076274-2076372)
chr6 (120-218)||(23400665-23400764)
chr6 (120-218)||(8242400-8242498)
chr6 (120-218)||(11565389-11565487)
chr6 (120-218)||(11716933-11717031)
chr6 (120-218)||(12620326-12620424)
chr6 (120-218)||(27555528-27555625)
chr6 (120-218)||(22075379-22075481)
chr6 (120-216)||(27222822-27222918)
chr6 (120-206)||(18918573-18918659)
chr6 (120-218)||(22861743-22861841)
chr6 (120-217)||(23988292-23988389)
chr6 (120-207)||(12941220-12941307)
chr6 (139-218)||(19869175-19869254)
chr6 (139-218)||(23393629-23393708)
chr6 (139-218)||(23413537-23413616)
chr6 (140-218)||(27416540-27416618)
chr6 (120-206)||(18953476-18953562)
chr6 (124-218)||(23537969-23538063)
chr6 (120-204)||(28290887-28290971)
chr6 (133-216)||(4475785-4475868)
chr6 (143-218)||(14470869-14470944)
chr6 (139-218)||(22947655-22947734)
chr6 (139-218)||(22951611-22951690)
chr6 (139-218)||(23870099-23870178)
chr6 (139-218)||(23874055-23874134)
chr6 (127-216)||(23955359-23955448)
chr6 (139-218)||(16758703-16758782)
chr6 (128-218)||(25737880-25737970)
chr6 (128-218)||(34297773-34297863)
chr6 (142-218)||(1254147-1254223)
chr6 (127-185)||(28707880-28707938)
chr6 (121-178)||(12741881-12741938)
chr6 (121-178)||(2291730-2291787)
chr6 (121-178)||(8054584-8054641)
chr6 (121-178)||(18335142-18335199)
chr6 (121-178)||(19004601-19004658)
chr6 (121-178)||(24422102-24422159)
chr6 (121-178)||(26925189-26925246)
chr6 (121-178)||(33861350-33861407)
chr6 (121-178)||(33863833-33863890)
chr6 (127-184)||(9622913-9622969)
chr6 (121-178)||(22781827-22781884)
chr6 (132-184)||(14594666-14594718)
chr6 (162-218)||(23537885-23537940)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (116-218)||(10751805-10751907)
chr5 (120-218)||(15238110-15238208)
chr5 (120-218)||(20912245-20912343)
chr5 (120-218)||(22120584-22120682)
chr5 (120-218)||(18354785-18354883)
chr5 (120-218)||(24768555-24768653)
chr5 (120-218)||(19474165-19474263)
chr5 (120-218)||(20294502-20294600)
chr5 (120-216)||(28372074-28372170)
chr5 (120-216)||(37600001-37600097)
chr5 (120-216)||(38146411-38146507)
chr5 (120-216)||(19510452-19510548)
chr5 (120-216)||(22339002-22339098)
chr5 (120-216)||(23113395-23113491)
chr5 (139-218)||(11219543-11219622)
chr5 (120-218)||(22108442-22108539)
chr5 (120-216)||(22335472-22335568)
chr5 (120-216)||(41878644-41878740)
chr5 (139-218)||(11224129-11224208)
chr5 (139-218)||(11227951-11228030)
chr5 (139-218)||(11226145-11226224)
chr5 (139-218)||(11229941-11230020)
chr5 (120-206)||(22749161-22749247)
chr5 (127-216)||(33473931-33474020)
chr5 (128-193)||(36459561-36459626)
chr5 (120-214)||(40727392-40727485)
chr5 (132-206)||(9774941-9775014)
chr5 (127-184)||(19075911-19075968)
chr5 (121-178)||(265311-265368)
chr5 (121-178)||(10733481-10733538)
chr5 (121-178)||(20908567-20908624)
chr5 (121-178)||(29345536-29345593)
chr5 (121-178)||(29348017-29348074)
chr5 (121-178)||(29350490-29350547)
chr5 (121-178)||(31143843-31143900)
chr5 (121-178)||(42245906-42245963)
chr5 (120-176)||(22335577-22335634)
chr5 (120-176)||(22339107-22339164)
chr5 (120-176)||(28372008-28372065)
chr5 (147-184)||(31253230-31253267)
chr5 (121-178)||(39362970-39363027)
chr5 (132-184)||(43243764-43243816)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (116-218)||(41389653-41389755)
chr1 (120-218)||(41801271-41801369)
chr1 (119-218)||(39245162-39245259)
chr1 (119-218)||(39248717-39248814)
chr1 (120-218)||(22132091-22132189)
chr1 (120-217)||(33796022-33796119)
chr1 (120-218)||(1009250-1009348)
chr1 (120-218)||(1926788-1926886)
chr1 (120-218)||(16376808-16376906)
chr1 (120-218)||(20925802-20925900)
chr1 (120-216)||(16370915-16371011)
chr1 (120-218)||(20230131-20230230)
chr1 (120-206)||(21406253-21406339)
chr1 (120-218)||(52634256-52634354)
chr1 (133-216)||(32649057-32649140)
chr1 (142-217)||(29533876-29533951)
chr1 (127-203)||(11809949-11810025)
chr1 (163-205)||(20439188-20439230)
chr1 (127-184)||(11945016-11945073)
chr1 (121-178)||(13988465-13988522)
chr1 (121-178)||(21475629-21475686)
chr1 (121-178)||(21923841-21923898)
chr1 (121-178)||(23594277-23594334)
chr1 (127-184)||(43630992-43631049)
chr1 (121-178)||(41372669-41372726)
chr1 (132-184)||(20032180-20032232)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (116-218)||(19774186-19774288)
chr3 (116-218)||(16751890-16751992)
chr3 (120-218)||(12853356-12853454)
chr3 (120-218)||(16795491-16795589)
chr3 (120-218)||(5219835-5219933)
chr3 (122-215)||(14670017-14670110)
chr3 (121-207)||(10834935-10835021)
chr3 (120-218)||(11301658-11301756)
chr3 (120-218)||(11853694-11853792)
chr3 (120-217)||(13435807-13435904)
chr3 (122-218)||(15463866-15463962)
chr3 (120-218)||(7108226-7108324)
chr3 (120-218)||(7112161-7112259)
chr3 (120-218)||(11068601-11068699)
chr3 (120-218)||(14497935-14498033)
chr3 (120-218)||(14664413-14664511)
chr3 (120-218)||(14667577-14667675)
chr3 (120-218)||(22320117-22320215)
chr3 (120-218)||(22335172-22335270)
chr3 (120-218)||(55021364-55021462)
chr3 (120-216)||(3801960-3802056)
chr3 (120-216)||(14764788-14764884)
chr3 (120-216)||(20249842-20249938)
chr3 (120-216)||(54519587-54519683)
chr3 (120-207)||(18899452-18899539)
chr3 (120-218)||(30064372-30064471)
chr3 (120-206)||(4590153-4590239)
chr3 (120-218)||(8928860-8928958)
chr3 (120-218)||(11167086-11167184)
chr3 (122-215)||(14681541-14681632)
chr3 (120-218)||(15616165-15616263)
chr3 (120-218)||(28948449-28948547)
chr3 (120-218)||(18933348-18933447)
chr3 (120-216)||(9532248-9532344)
chr3 (120-216)||(23372536-23372632)
chr3 (120-216)||(29545931-29546027)
chr3 (120-216)||(51299523-51299619)
chr3 (127-206)||(8491732-8491811)
chr3 (120-207)||(12304173-12304260)
chr3 (120-206)||(17318502-17318588)
chr3 (127-216)||(41124-41213)
chr3 (139-218)||(4108800-4108880)
chr3 (139-218)||(4112649-4112729)
chr3 (139-218)||(15963485-15963564)
chr3 (139-218)||(15967409-15967488)
chr3 (139-218)||(15971333-15971412)
chr3 (128-218)||(11912415-11912505)
chr3 (120-206)||(14068055-14068141)
chr3 (127-216)||(16326041-16326130)
chr3 (138-207)||(38312868-38312937)
chr3 (120-215)||(12337248-12337340)
chr3 (120-206)||(23173297-23173384)
chr3 (128-218)||(16840204-16840294)
chr3 (120-178)||(37440673-37440731)
chr3 (127-185)||(5841187-5841245)
chr3 (127-184)||(2249216-2249273)
chr3 (121-178)||(9708156-9708213)
chr3 (127-184)||(45220962-45221019)
chr3 (121-178)||(7781858-7781915)
chr3 (121-178)||(13152325-13152382)
chr3 (121-178)||(16454822-16454879)
chr3 (121-178)||(17462733-17462790)
chr3 (121-178)||(34158881-34158938)
chr3 (121-178)||(45607441-45607498)
chr3 (121-178)||(55476077-55476134)
chr3 (121-178)||(55500506-55500563)
chr3 (148-178)||(15555343-15555373)
chr3 (121-178)||(13154790-13154847)
chr3 (121-178)||(15555371-15555428)
chr3 (132-184)||(14648275-14648327)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (118-215)||(37193-37290)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (120-218)||(6953-7051)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (120-218)||(8565-8663)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (120-218)||(14399085-14399183)
chr8 (120-218)||(23913253-23913351)
chr8 (120-218)||(44385826-44385924)
chr8 (120-217)||(23427815-23427912)
chr8 (120-218)||(21974176-21974274)
chr8 (120-218)||(43250190-43250288)
chr8 (120-206)||(21386159-21386245)
chr8 (120-218)||(21978286-21978384)
chr8 (139-218)||(18864116-18864195)
chr8 (120-218)||(21409888-21409987)
chr8 (120-218)||(21804380-21804479)
chr8 (139-218)||(21829472-21829551)
chr8 (139-218)||(30941576-30941655)
chr8 (120-217)||(27942677-27942775)
chr8 (127-206)||(21967992-21968071)
chr8 (127-206)||(21980832-21980911)
chr8 (127-206)||(21985815-21985894)
chr8 (127-206)||(22000778-22000857)
chr8 (139-218)||(22110589-22110668)
chr8 (128-218)||(21328554-21328644)
chr8 (127-216)||(11774286-11774375)
chr8 (127-206)||(22009196-22009275)
chr8 (127-216)||(8414976-8415065)
chr8 (147-216)||(363258-363327)
chr8 (128-218)||(42560882-42560972)
chr8 (163-216)||(8729645-8729698)
chr8 (127-184)||(44494223-44494280)
chr8 (121-178)||(1483957-1484014)
chr8 (121-178)||(4482867-4482924)
chr8 (121-178)||(4542922-4542979)
chr8 (121-178)||(5853841-5853898)
chr8 (121-178)||(14823330-14823387)
chr8 (121-178)||(18678574-18678631)
chr8 (121-178)||(18717763-18717820)
chr8 (121-178)||(20402782-20402839)
chr8 (121-178)||(22001316-22001373)
chr8 (127-168)||(34950124-34950165)
chr8 (132-184)||(11252087-11252138)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (120-218)||(9783982-9784080)
chr2 (120-218)||(24630040-24630138)
chr2 (120-218)||(27380986-27381084)
chr2 (120-218)||(27384956-27385054)
chr2 (120-218)||(27600359-27600457)
chr2 (120-218)||(30346650-30346748)
chr2 (120-216)||(19663550-19663646)
chr2 (120-216)||(20260247-20260343)
chr2 (120-207)||(21074500-21074587)
chr2 (120-218)||(10103289-10103387)
chr2 (120-218)||(12902599-12902697)
chr2 (120-218)||(24645139-24645237)
chr2 (120-218)||(24647915-24648013)
chr2 (120-216)||(6481774-6481870)
chr2 (120-216)||(6485241-6485337)
chr2 (121-216)||(9240664-9240759)
chr2 (139-218)||(41532454-41532533)
chr2 (120-214)||(31343909-31344003)
chr2 (127-216)||(37379026-37379115)
chr2 (139-218)||(24647082-24647161)
chr2 (153-216)||(10686272-10686335)
chr2 (121-178)||(23130433-23130490)
chr2 (121-178)||(23132900-23132957)
chr2 (121-178)||(18808498-18808555)
chr2 (121-178)||(23135147-23135204)
chr2 (121-178)||(23710082-23710139)
chr2 (121-178)||(24898753-24898810)
chr2 (121-178)||(24901228-24901285)
chr2 (121-178)||(24903705-24903762)
chr2 (121-178)||(24906182-24906239)
chr2 (121-178)||(24908657-24908714)
chr2 (121-178)||(26504935-26504992)
chr2 (121-178)||(26507413-26507470)
chr2 (121-178)||(32040040-32040097)
chr2 (121-178)||(34403049-34403106)
chr2 (121-178)||(39681869-39681926)
chr2 (121-170)||(570968-571017)
chr2 (120-176)||(6262206-6262263)
chr2 (120-176)||(19663484-19663541)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (120-216)||(25560-25656)
scaffold0124 (163-205)||(37568-37610)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (120-218)||(813-911)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (120-218)||(14832-14930)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (120-218)||(11052-11150)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (120-218)||(8732-8830)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (120-218)||(33925-34023)
scaffold0080 (120-212)||(28466-28558)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (123-206)||(74327-74410)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (120-218)||(6313-6411)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (120-218)||(11039-11137)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (120-218)||(60318-60416)
scaffold0028 (121-178)||(133767-133824)
scaffold0028 (121-178)||(136236-136293)
scaffold0028 (121-178)||(138705-138762)
scaffold0028 (121-178)||(141174-141231)
scaffold0028 (121-178)||(143643-143700)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (120-216)||(190-286)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (120-216)||(5232-5328)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (120-216)||(10814-10910)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (120-216)||(109591-109687)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (120-216)||(224135-224231)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (120-218)||(18811-18909)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (120-218)||(68548-68646)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (120-206)||(62832-62918)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (122-218)||(34122-34218)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (139-218)||(15586-15665)
[»] scaffold0380 (1 HSPs)
scaffold0380 (124-206)||(3974-4056)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (120-206)||(37190-37276)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (120-218)||(11765-11863)
scaffold0023 (121-178)||(93966-94023)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (140-218)||(70743-70821)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (120-216)||(3509-3605)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (127-206)||(23937-24016)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (120-218)||(5523-5621)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (120-215)||(5817-5909)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (128-218)||(4109-4199)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (120-184)||(21332-21396)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (139-218)||(10755-10834)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (172-218)||(115390-115435)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (121-178)||(12947-13004)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (121-178)||(20302-20359)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (121-178)||(13510-13567)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (121-178)||(9304-9361)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (121-178)||(37377-37434)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (121-178)||(39956-40013)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (148-193)||(163588-163633)
[»] scaffold1873 (1 HSPs)
scaffold1873 (180-218)||(595-633)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (127-181)||(35-89)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (127-177)||(3265-3315)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (120-176)||(19066-19123)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (127-180)||(173225-173278)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (132-184)||(444-496)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18424322 - 18424223
Alignment:
Q  119 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18424322 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 18424223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 2833474 - 2833572
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2833474 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 2833572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 7520208 - 7520306
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7520208 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 7520306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20486828 - 20486733
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20486828 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 20486733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 10607313 - 10607411
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10607313 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgataatgag 10607411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13891716 - 13891618
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13891716 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgag 13891618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 39268306 - 39268404
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  39268306 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgag 39268404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11660368 - 11660271
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatga 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11660368 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttggtaagttgtcttttattcatgaattgctaatga 11660271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 122 - 218
Target Start/End: Original strand, 1860016 - 1860112
Alignment:
Q  122 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1860016 tgatgattacaggatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 1860112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 122 - 218
Target Start/End: Original strand, 13919407 - 13919503
Alignment:
Q  122 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13919407 tgatgattacaggatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 13919503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31811 - 31713
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31811 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 31713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 12706115 - 12706213
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12706115 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 12706213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12713626 - 12713528
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12713626 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 12713528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12722284 - 12722186
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12722284 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 12722186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16582507 - 16582409
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16582507 gatgatgattacatgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgataagttgataagttgtctttttttcatgaattgataatgag 16582409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 16908502 - 16908600
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16908502 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 16908600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18282044 - 18281946
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18282044 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgag 18281946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 25928364 - 25928462
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  25928364 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtactttatgatggttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgctaatgag 25928462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39721281 - 39721183
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt-aagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39721281 atgatgattacatgatgatatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 39721183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13892097 - 13892001
Alignment:
Q  122 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||    
T  13892097 tgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttttgcatgaattgctaatgag 13892001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14420873 - 14420777
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14420873 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 14420777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16005090 - 16004994
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16005090 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 16004994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18606424 - 18606328
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18606424 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 18606328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18871383 - 18871287
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18871383 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 18871287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26291243 - 26291144
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt-aagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26291243 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgag 26291144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 9752500 - 9752598
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  9752500 gatgataattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttggtgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgag 9752598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12717373 - 12717275
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12717373 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgctgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 12717275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18278080 - 18277982
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18278080 gatgatgattgcatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgag 18277982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 207
Target Start/End: Original strand, 838125 - 838213
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  838125 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 838213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 207
Target Start/End: Original strand, 1203305 - 1203393
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1203305 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 1203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 10897889 - 10897985
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10897889 gatgatgattatgtgatgttatctatgagtcgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 10897985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15083312 - 15083213
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt-aagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15083312 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 15083213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Original strand, 45171512 - 45171591
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45171512 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 45171591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Original strand, 16109967 - 16110065
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatga 217  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  16109967 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgctaatga 16110065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Original strand, 834037 - 834135
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatga 217  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  834037 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaattctacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 834135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Original strand, 1199217 - 1199315
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatga 217  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1199217 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaattctacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 1199315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41283724 - 41283635
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41283724 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 41283635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 146586 - 146490
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||    
T  146586 gatgatgattatgcgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctactcatgaattgctaatg 146490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Original strand, 72383 - 72462
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  72383 tatctatgaattgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 72462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Original strand, 76492 - 76571
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  76492 tatctatgaattgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 76571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 214
Target Start/End: Original strand, 2531325 - 2531418
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataa 214  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2531325 gatgatgattatatgaagatatctatgagttgttaggtgtacttgatgatgtt-atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataa 2531418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15213126 - 15213036
Alignment:
Q  128 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||||||    
T  15213126 ttacatgatgttatccatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgag 15213036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18301437 - 18301373
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18301437 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 18301373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16185603 - 16185524
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16185603 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggtcatgttaagttgataagtcgtcttctattcatga 16185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11302350 - 11302297
Alignment:
Q  163 tgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11302350 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtaatgctaatg 11302297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15166293 - 15166240
Alignment:
Q  163 tgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15166293 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 15166240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 185
Target Start/End: Original strand, 11394878 - 11394936
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttga 185  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11394878 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttga 11394936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 206
Target Start/End: Original strand, 23666463 - 23666530
Alignment:
Q  138 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  23666463 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg-ttacgtatagttgctaagttgtcctctattcatga 23666530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 455942 - 455885
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  455942 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 455885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 11393817 - 11393874
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  11393817 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 11393874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11972108 - 11972051
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  11972108 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 11972051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 14949671 - 14949728
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  14949671 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 14949728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 15377263 - 15377320
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  15377263 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 15377320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16232132 - 16232075
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  16232132 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 16232075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16409680 - 16409623
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  16409680 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 16409623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 20385672 - 20385729
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  20385672 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 20385729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 21190145 - 21190202
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  21190145 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 21190202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24701867 - 24701810
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24701867 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24701810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24704317 - 24704260
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24704317 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24704260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 26356500 - 26356557
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  26356500 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 26356557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 26358952 - 26359009
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  26358952 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 26359009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27216487 - 27216430
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  27216487 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 27216430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32125111 - 32125054
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  32125111 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 32125054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41522549 - 41522492
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  41522549 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 41522492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41525011 - 41524954
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  41525011 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 41524954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 218
Target Start/End: Original strand, 9752728 - 9752766
Alignment:
Q  180 agttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9752728 agttgataagttatcttttattcatgaattgataatgag 9752766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15223633 - 15223534
Alignment:
Q  119 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15223633 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 15223534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 17052438 - 17052536
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17052438 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 17052536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12423029 - 12422931
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12423029 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 12422931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 22634919 - 22635017
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22634919 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaatttataatgag 22635017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Original strand, 24048377 - 24048474
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatga 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24048377 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 24048474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 20158440 - 20158538
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20158440 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgcttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 20158538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 20163891 - 20163989
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20163891 gatgacgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 20163989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 4562766 - 4562864
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4562766 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 4562864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 5758448 - 5758546
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5758448 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 5758546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9555155 - 9555057
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9555155 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 9555057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 13813825 - 13813923
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  13813825 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttgttcatgaatttataatgag 13813923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 13818313 - 13818411
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  13818313 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgcattttattcatgaatttataatgag 13818411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 14758984 - 14759082
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14758984 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 14759082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 14955752 - 14955850
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14955752 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 14955850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17807140 - 17807042
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17807140 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 17807042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 23996959 - 23997056
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23996959 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatg-taagttgataagttctcttttattcatgaattgataatgag 23997056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33740922 - 33740824
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33740922 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 33740824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15533305 - 15533209
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15533305 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 15533209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Original strand, 631740 - 631826
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  631740 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattctattcatga 631826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10711911 - 10711825
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10711911 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 10711825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10925681 - 10925595
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10925681 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 10925595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 20161116 - 20161214
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20161116 gatgacgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgataatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaattgataatgag 20161214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25688528 - 25688430
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  25688528 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgag 25688430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30145870 - 30145772
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatga 217  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30145870 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 30145772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12486355 - 12486259
Alignment:
Q  122 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  12486355 tgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatgatgag 12486259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18211690 - 18211594
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18211690 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 18211594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36037038 - 36036942
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  36037038 gatgatgattatgagatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 36036942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27532838 - 27532752
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27532838 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttctattcatga 27532752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28384930 - 28384841
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28384930 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 28384841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 49549075 - 49549172
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgata-agttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||    
T  49549075 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataccgttgtcttttattcatgaattgctaatg 49549172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38107031 - 38106946
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  38107031 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgtttatgttaagttgataaattgtctttcattcatga 38106946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14047361 - 14047318
Alignment:
Q  163 tgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14047361 tgatgatgattatgttaagttgataagttgtattttattcatga 14047318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 218
Target Start/End: Original strand, 22635063 - 22635101
Alignment:
Q  180 agttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22635063 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 22635101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 1838053 - 1838110
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  1838053 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 1838110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 12033681 - 12033738
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  12033681 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 12033738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 14739599 - 14739656
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  14739599 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 14739656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 15118902 - 15118959
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  15118902 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 15118959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 29267275 - 29267218
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  29267275 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 29267218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44614900 - 44614843
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  44614900 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 44614843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 50222889 - 50222946
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  50222889 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 50222946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 18239969 - 18240026
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  | ||||||| |||||||    
T  18239969 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgatcgatgatgcttatgtt 18240026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 184
Target Start/End: Original strand, 37839211 - 37839248
Alignment:
Q  147 agttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37839211 agttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 37839248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 184
Target Start/End: Original strand, 42597940 - 42597977
Alignment:
Q  147 agttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  42597940 agttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 42597977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Original strand, 31479451 - 31479553
Alignment:
Q  116 gggagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31479451 gggagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtatttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 31479550  T
Q  216 gag 218  Q
    |||    
T  31479551 gag 31479553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16622922 - 16622825
Alignment:
Q  119 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16622922 agatgatgattacatgatattatctatgaattgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagt--tcttttattcatgaaatgataatgag 16622825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2076372 - 2076274
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2076372 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatgattatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgataatgag 2076274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23400764 - 23400665
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt-aagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23400764 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcctttattcatgaattgataatgag 23400665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8242498 - 8242400
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8242498 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 8242400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11565487 - 11565389
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11565487 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 11565389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 11716933 - 11717031
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11716933 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 11717031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 12620326 - 12620424
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12620326 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 12620424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27555625 - 27555528
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27555625 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-agttgtcttttattcatgaattgataatgag 27555528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 22075379 - 22075481
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgat---at-tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 215  Q
    |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22075379 gatgatgattacatgatgatatatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 22075478  T
Q  216 gag 218  Q
    |||    
T  22075479 gag 22075481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27222918 - 27222822
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27222918 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 27222822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Original strand, 18918573 - 18918659
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18918573 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 18918659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22861841 - 22861743
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22861841 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttggtgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 22861743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23988389 - 23988292
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatga 217  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23988389 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatattaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatga 23988292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12941307 - 12941220
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 207  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12941307 gatgatgattatgagatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 12941220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19869254 - 19869175
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19869254 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 19869175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23393708 - 23393629
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23393708 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 23393629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23413616 - 23413537
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23413616 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 23413537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 218
Target Start/End: Original strand, 27416540 - 27416618
Alignment:
Q  140 atctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27416540 atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgag 27416618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Original strand, 18953476 - 18953562
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18953476 gatgatgattacatgatgtcatctaggagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 18953562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23538063 - 23537969
Alignment:
Q  124 atgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||||    
T  23538063 atgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcccttattcgtgaattgttaatgag 23537969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 204
Target Start/End: Original strand, 28290887 - 28290971
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcat 204  Q
    |||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28290887 gatgatgattatgagatgttatctataagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcat 28290971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4475868 - 4475785
Alignment:
Q  133 tgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4475868 tgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 4475785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14470944 - 14470869
Alignment:
Q  143 tatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14470944 tatgagttgttaggtgtacttgatgatgtttatgttaggttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 14470869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22947734 - 22947655
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  22947734 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgag 22947655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22951690 - 22951611
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  22951690 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgag 22951611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23870178 - 23870099
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  23870178 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgag 23870099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23874134 - 23874055
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  23874134 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgag 23874055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23955448 - 23955359
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23955448 attacatgaggttacccatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatg 23955359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16758782 - 16758703
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  16758782 tatctatgagttattaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatagtgag 16758703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25737970 - 25737880
Alignment:
Q  128 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | || |||||||    
T  25737970 ttacatgatgttatctatgagttggtaaatgtacttgatgatgattatgctaagttgataagttgtcccttattcatgtattgctaatgag 25737880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 218
Target Start/End: Original strand, 34297773 - 34297863
Alignment:
Q  128 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||||||    
T  34297773 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgctgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgag 34297863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1254223 - 1254147
Alignment:
Q  142 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||||||    
T  1254223 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgttaatgag 1254147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28707938 - 28707880
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttga 185  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28707938 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttga 28707880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12741938 - 12741881
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  12741938 atgatgattacatgatattgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 12741881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 2291730 - 2291787
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  2291730 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 2291787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8054641 - 8054584
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  8054641 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 8054584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 18335142 - 18335199
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  18335142 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 18335199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19004658 - 19004601
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  19004658 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 19004601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24422159 - 24422102
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24422159 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24422102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 26925189 - 26925246
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  26925189 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 26925246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33861407 - 33861350
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  33861407 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 33861350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33863890 - 33863833
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  33863890 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 33863833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 184
Target Start/End: Original strand, 9622913 - 9622969
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  9622913 attacatgatgttacctatgagttgtt-aatgtacttgatgagggttatgtaaagttg 9622969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22781884 - 22781827
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  22781884 atgatgattatatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 22781827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 184
Target Start/End: Original strand, 14594666 - 14594718
Alignment:
Q  132 atgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  14594666 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg 14594718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23537940 - 23537885
Alignment:
Q  162 ttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23537940 ttgatgatgtttattata-gttgctaagttgtcttttattcatgaattgctaatgag 23537885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10751907 - 10751805
Alignment:
Q  116 gggagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10751907 gggagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaaatgataat 10751808  T
Q  216 gag 218  Q
    |||    
T  10751807 gag 10751805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 15238110 - 15238208
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15238110 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 15238208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 20912245 - 20912343
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20912245 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtgtatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 20912343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 22120584 - 22120682
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22120584 gatgatgattatatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 22120682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18354883 - 18354785
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18354883 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataaattgtcttttattcatgaattgataatgag 18354785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 24768555 - 24768653
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24768555 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacctgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 24768653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 19474165 - 19474263
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19474165 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 19474263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20294600 - 20294502
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20294600 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 20294502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 28372074 - 28372170
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28372074 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 28372170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 37600001 - 37600097
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  37600001 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 37600097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 38146411 - 38146507
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  38146411 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 38146507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19510548 - 19510452
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  19510548 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatg 19510452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22339098 - 22339002
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22339098 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 22339002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 23113395 - 23113491
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23113395 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattgtgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 23113491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11219622 - 11219543
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11219622 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 11219543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 22108442 - 22108539
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22108442 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg-ttacgtataattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 22108539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22335568 - 22335472
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22335568 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 22335472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 41878644 - 41878740
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  41878644 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttatttatgaattgctaatg 41878740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11224208 - 11224129
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11224208 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgag 11224129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11228030 - 11227951
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11228030 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgag 11227951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11226224 - 11226145
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11226224 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgatcatgag 11226145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11230020 - 11229941
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11230020 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgatcatgag 11229941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22749247 - 22749161
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22749247 gatgatgattatgtgatgttatctatgagtggttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcctatattcatga 22749161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 216
Target Start/End: Original strand, 33473931 - 33474020
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33473931 attacatgaggttacccatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatg 33474020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36459626 - 36459561
Alignment:
Q  128 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36459626 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttaatgatgattatgttaagttgataagttgt 36459561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 214
Target Start/End: Original strand, 40727392 - 40727485
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataa 214  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| |||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  40727392 gatgatgattacatgaagatatctataagttgtttggtgtacttgatgatgtt-atgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgataa 40727485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9775014 - 9774941
Alignment:
Q  132 atgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  9775014 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg-ttacgtatagttgctaagttgtcctctattcatga 9774941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19075968 - 19075911
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19075968 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 19075911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 265311 - 265368
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  265311 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 265368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 10733481 - 10733538
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  10733481 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 10733538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20908624 - 20908567
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  20908624 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 20908567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 29345593 - 29345536
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  29345593 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 29345536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 29348074 - 29348017
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  29348074 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 29348017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 29350547 - 29350490
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  29350547 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 29350490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31143900 - 31143843
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  31143900 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 31143843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 42245906 - 42245963
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  42245906 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 42245963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22335634 - 22335577
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatg-tacttgatgatgtttatg 176  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  22335634 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgttacatgatgatgattatg 22335577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22339164 - 22339107
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatg-tacttgatgatgtttatg 176  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  22339164 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgttacatgatgatgattatg 22339107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 176
Target Start/End: Original strand, 28372008 - 28372065
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatg-tacttgatgatgtttatg 176  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  28372008 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgttacatgatgatgattatg 28372065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 184
Target Start/End: Original strand, 31253230 - 31253267
Alignment:
Q  147 agttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31253230 agttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 31253267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 39363027 - 39362970
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||    
T  39363027 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaagtatgattgatgatgcttatgtt 39362970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 184
Target Start/End: Original strand, 43243764 - 43243816
Alignment:
Q  132 atgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  43243764 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg 43243816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Original strand, 41389653 - 41389755
Alignment:
Q  116 gggagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41389653 gggagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaaatgataat 41389752  T
Q  216 gag 218  Q
    |||    
T  41389753 gag 41389755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 41801271 - 41801369
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41801271 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 41801369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Original strand, 39245162 - 39245259
Alignment:
Q  119 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39245162 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagt--tcttttattcatgaaatgataatgag 39245259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Original strand, 39248717 - 39248814
Alignment:
Q  119 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39248717 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagt--tcttttattcatgaaatgataatgag 39248814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 22132091 - 22132189
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22132091 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 22132189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33796119 - 33796022
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatga 217  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33796119 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatga 33796022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1009348 - 1009250
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1009348 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 1009250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 1926788 - 1926886
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1926788 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 1926886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 16376808 - 16376906
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16376808 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 16376906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 20925802 - 20925900
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20925802 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 20925900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16371011 - 16370915
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16371011 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 16370915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 20230131 - 20230230
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt-aagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20230131 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgag 20230230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21406339 - 21406253
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21406339 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21406253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 52634354 - 52634256
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||    
T  52634354 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttattttttattaatgaattgataatgag 52634256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32649140 - 32649057
Alignment:
Q  133 tgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  32649140 tgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 32649057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29533951 - 29533876
Alignment:
Q  142 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatga 217  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29533951 ctatgagttgttaaatgtgtttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 29533876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 203
Target Start/End: Original strand, 11809949 - 11810025
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattca 203  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11809949 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggtcatgttaagttgataagtcgtcttctattca 11810025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 205
Target Start/End: Original strand, 20439188 - 20439230
Alignment:
Q  163 tgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatg 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20439188 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatg 20439230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11945073 - 11945016
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11945073 attacatgaggttacctacgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 11945016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13988522 - 13988465
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  13988522 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 13988465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 21475629 - 21475686
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  21475629 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 21475686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 21923841 - 21923898
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  21923841 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 21923898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 23594277 - 23594334
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  23594277 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 23594334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 184
Target Start/End: Original strand, 43630992 - 43631049
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  43630992 attacatgaggttacctacgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 43631049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41372726 - 41372669
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  41372726 atgatgattacaagatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 41372669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 184
Target Start/End: Original strand, 20032180 - 20032232
Alignment:
Q  132 atgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  20032180 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg 20032232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19774288 - 19774186
Alignment:
Q  116 gggagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774288 gggagatgatgattacatgatattgtctgtgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 19774189  T
Q  216 gag 218  Q
    |||    
T  19774188 gag 19774186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Original strand, 16751890 - 16751992
Alignment:
Q  116 gggagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16751890 gggaaatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttatcttttattcatcaaatgataat 16751989  T
Q  216 gag 218  Q
    |||    
T  16751990 gag 16751992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 12853356 - 12853454
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12853356 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 12853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16795589 - 16795491
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16795589 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 16795491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5219933 - 5219835
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5219933 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 5219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 122 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14670110 - 14670017
Alignment:
Q  122 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14670110 tgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14670017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 121 - 207
Target Start/End: Original strand, 10834935 - 10835021
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834935 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 10835021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 11301658 - 11301756
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11301658 gatgatgattgcatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 11301756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11853792 - 11853694
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11853792 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcacgaattgataatgag 11853694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13435904 - 13435807
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatga 217  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13435904 gatgatgattacatgatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 13435807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 122 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15463962 - 15463866
Alignment:
Q  122 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15463962 tgatgattacaggatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 15463866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7108324 - 7108226
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7108324 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 7108226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7112259 - 7112161
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7112259 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 7112161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11068699 - 11068601
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11068699 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 11068601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14498033 - 14497935
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14498033 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 14497935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14664511 - 14664413
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14664511 gatgatgattacataatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgag 14664413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14667675 - 14667577
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14667675 gatgatgattacatgatgagatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgag 14667577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22320215 - 22320117
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22320215 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 22320117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22335270 - 22335172
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22335270 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 22335172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 55021462 - 55021364
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  55021462 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 55021364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3802056 - 3801960
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3802056 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 3801960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 14764788 - 14764884
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14764788 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 14764884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 20249842 - 20249938
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20249842 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 20249938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54519683 - 54519587
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  54519683 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 54519587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18899539 - 18899452
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 207  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18899539 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 18899452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30064471 - 30064372
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt-aagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  30064471 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgag 30064372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Original strand, 4590153 - 4590239
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4590153 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 4590239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 8928860 - 8928958
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  8928860 gatgatgattgcatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatggtggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatggactgctaatgag 8928958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 11167086 - 11167184
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11167086 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtttacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 11167184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14681632 - 14681541
Alignment:
Q  122 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14681632 tgatgattacatgatgttatct--gagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14681541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15616263 - 15616165
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15616263 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgaagatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 15616165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28948547 - 28948449
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28948547 gatgatgattacatgatgatatctataagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 28948449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 18933348 - 18933447
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt-aagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  18933348 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtattttattcatgaattaataatgag 18933447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9532344 - 9532248
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9532344 gatgatgattatgagatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatg 9532248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 23372536 - 23372632
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23372536 gatgatgattatgtgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 23372632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 29545931 - 29546027
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  29545931 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttgtgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgctaatg 29546027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51299619 - 51299523
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  51299619 gatgatgattatgtgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 51299523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 8491732 - 8491811
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8491732 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 8491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12304260 - 12304173
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 207  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12304260 gatgatgattatgagatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatgaa 12304173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Original strand, 17318502 - 17318588
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17318502 gatgatgaatacatgaagttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 17318588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41213 - 41124
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41213 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 41124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Original strand, 4108800 - 4108880
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaa-tgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4108800 tatctatgagttgttaaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 4108880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Original strand, 4112649 - 4112729
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaa-tgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4112649 tatctatgagttgttaaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 4112729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15963564 - 15963485
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15963564 tatctatgagttattaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 15963485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15967488 - 15967409
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15967488 tatctatgagttattaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 15967409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15971412 - 15971333
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15971412 tatctatgagttattaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 15971333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11912505 - 11912415
Alignment:
Q  128 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||||||    
T  11912505 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgag 11912415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Original strand, 14068055 - 14068141
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14068055 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgctaaatgtatttgatgatggttatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 14068141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 216
Target Start/End: Original strand, 16326041 - 16326130
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16326041 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgtcaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 16326130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 207
Target Start/End: Original strand, 38312868 - 38312937
Alignment:
Q  138 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38312868 ttatctatgagtggttaaatgtacttgatgatggttatgttaagtttataagttgtcttttattcatgaa 38312937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12337340 - 12337248
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 215  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12337340 gatgatgattacatgatgatat--atgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgat-agttgtcttttattcatgaattgataat 12337248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23173384 - 23173297
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23173384 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatatacttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 23173297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 218
Target Start/End: Original strand, 16840204 - 16840294
Alignment:
Q  128 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||||||    
T  16840204 ttacatgattttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgag 16840294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Original strand, 37440673 - 37440731
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37440673 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgtt 37440731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5841245 - 5841187
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttga 185  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5841245 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttga 5841187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 184
Target Start/End: Original strand, 2249216 - 2249273
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2249216 attacatgatgttacctatgagttattaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 2249273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 9708156 - 9708213
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  9708156 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgtttatgtt 9708213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 184
Target Start/End: Original strand, 45220962 - 45221019
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  45220962 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 45221019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 7781858 - 7781915
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  7781858 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 7781915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 13152325 - 13152382
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  13152325 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 13152382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 16454822 - 16454879
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  16454822 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 16454879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17462790 - 17462733
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  17462790 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 17462733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34158938 - 34158881
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  34158938 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 34158881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 45607441 - 45607498
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  45607441 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 45607498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 55476134 - 55476077
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  55476134 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 55476077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 55500563 - 55500506
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  55500563 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 55500506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15555373 - 15555343
Alignment:
Q  148 gttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15555373 gttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 15555343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 13154790 - 13154847
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  13154790 atgatgattacatgatgtagtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 13154847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15555428 - 15555371
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  15555428 atgatgattacatgatgttgtctatgaattgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 15555371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 184
Target Start/End: Original strand, 14648275 - 14648327
Alignment:
Q  132 atgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  14648275 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg 14648327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 215
Target Start/End: Original strand, 37193 - 37290
Alignment:
Q  118 gagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37193 gagatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 37290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 6953 - 7051
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6953 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 7051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8663 - 8565
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8663 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttaataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 8565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 14399085 - 14399183
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14399085 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 14399183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23913351 - 23913253
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23913351 gatgatgattacatgatgttatctataagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 23913253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 44385826 - 44385924
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44385826 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaacttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 44385924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23427912 - 23427815
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatga 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23427912 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttaatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatga 23427815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 21974176 - 21974274
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21974176 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 21974274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 43250288 - 43250190
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43250288 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 43250190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21386245 - 21386159
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21386245 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21386159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 21978286 - 21978384
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21978286 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttatattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 21978384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Original strand, 18864116 - 18864195
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18864116 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 18864195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21409987 - 21409888
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt-aagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21409987 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 21409888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21804479 - 21804380
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt-aagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21804479 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 21804380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Original strand, 21829472 - 21829551
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21829472 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 21829551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Original strand, 30941576 - 30941655
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30941576 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcataaattgataatgag 30941655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Original strand, 27942677 - 27942775
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatga 217  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27942677 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgataagttaataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 27942775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 21967992 - 21968071
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21967992 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21968071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 21980832 - 21980911
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21980832 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21980911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 21985815 - 21985894
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21985815 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21985894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 22000778 - 22000857
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22000778 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 22000857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22110668 - 22110589
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22110668 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatttttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 22110589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21328644 - 21328554
Alignment:
Q  128 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||||||    
T  21328644 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgag 21328554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11774375 - 11774286
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11774375 attacatgaggttacccatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatg 11774286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 22009196 - 22009275
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22009196 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 22009275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 216
Target Start/End: Original strand, 8414976 - 8415065
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8414976 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgattagggttattttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 8415065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 363327 - 363258
Alignment:
Q  147 agttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  363327 agttgttaaatgtacttgttgatggttatgttaagatgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 363258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 218
Target Start/End: Original strand, 42560882 - 42560972
Alignment:
Q  128 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||   ||||||||| | || |||||||    
T  42560882 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacgtgatggtggttatgttaagttgacaagttgttccttattcatgcattgctaatgag 42560972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Original strand, 8729645 - 8729698
Alignment:
Q  163 tgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8729645 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 8729698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 184
Target Start/End: Original strand, 44494223 - 44494280
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44494223 attacatgatgttacctatgaattgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 44494280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1484014 - 1483957
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  1484014 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 1483957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4482924 - 4482867
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  4482924 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 4482867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 4542922 - 4542979
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  4542922 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 4542979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 5853841 - 5853898
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  5853841 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 5853898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14823387 - 14823330
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  14823387 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 14823330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 18678574 - 18678631
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  18678574 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 18678631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 18717763 - 18717820
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  18717763 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 18717820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20402839 - 20402782
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  20402839 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 20402782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22001373 - 22001316
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  22001373 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 22001316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34950165 - 34950124
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 168  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34950165 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 34950124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 184
Target Start/End: Original strand, 11252087 - 11252138
Alignment:
Q  132 atgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11252087 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga-ggttatgttaagttg 11252138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9784080 - 9783982
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9784080 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgtttaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 9783982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 24630040 - 24630138
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24630040 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 24630138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 27380986 - 27381084
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27380986 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 27381084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 27384956 - 27385054
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27384956 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 27385054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27600457 - 27600359
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27600457 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 27600359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 30346650 - 30346748
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30346650 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 30346748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 19663550 - 19663646
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19663550 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 19663646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20260343 - 20260247
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20260343 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 20260247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 207
Target Start/End: Original strand, 21074500 - 21074587
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 207  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21074500 gatgatgacaacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 21074587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 10103289 - 10103387
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10103289 gatgatgattacatgttgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 10103387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 12902599 - 12902697
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12902599 gatgatgattacataatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 12902697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24645237 - 24645139
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  24645237 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgag 24645139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24648013 - 24647915
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  24648013 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgag 24647915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6481870 - 6481774
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  6481870 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatg 6481774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6485337 - 6485241
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  6485337 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatg 6485241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9240759 - 9240664
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  9240759 atgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgctaatg 9240664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Original strand, 41532454 - 41532533
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41532454 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 41532533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31344003 - 31343909
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataa 214  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31344003 gatgatgattacatgaagatatctatgagttgttaggtgtacttgatgatgtatatgttaagttgataagctgtcttttattcatgaattgataa 31343909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37379115 - 37379026
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  37379115 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 37379026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24647161 - 24647082
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  24647161 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgag 24647082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 216
Target Start/End: Original strand, 10686272 - 10686335
Alignment:
Q  153 taaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10686272 taaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 10686335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23130490 - 23130433
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  23130490 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgtttatgtt 23130433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23132957 - 23132900
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  23132957 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgtttatgtt 23132900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18808555 - 18808498
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  18808555 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 18808498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23135204 - 23135147
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  23135204 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 23135147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 23710082 - 23710139
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  23710082 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 23710139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 24898753 - 24898810
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24898753 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24898810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 24901228 - 24901285
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24901228 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24901285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 24903705 - 24903762
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24903705 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24903762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 24906182 - 24906239
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24906182 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24906239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 24908657 - 24908714
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24908657 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24908714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26504992 - 26504935
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  26504992 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 26504935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26507470 - 26507413
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  26507470 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 26507413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 32040040 - 32040097
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  32040040 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 32040097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 34403049 - 34403106
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  34403049 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 34403106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 39681926 - 39681869
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  39681926 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 39681869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 571017 - 570968
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 170  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  571017 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 570968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 176
Target Start/End: Original strand, 6262206 - 6262263
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatg-tacttgatgatgtttatg 176  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  6262206 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgttacatgatgatgattatg 6262263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 176
Target Start/End: Original strand, 19663484 - 19663541
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatg-tacttgatgatgtttatg 176  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  19663484 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgttacatgatgatgattatg 19663541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 25560 - 25656
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25560 gatgatgaatacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 25656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 205
Target Start/End: Original strand, 37568 - 37610
Alignment:
Q  163 tgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatg 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37568 tgatgatggttatgttaagttgatacgttgtcttttattcatg 37610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 813 - 911
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  813 gatgatgattgcatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14930 - 14832
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14930 gatgatgattacatgaagatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 14832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 11052 - 11150
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11052 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacctgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 11150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 8732 - 8830
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8732 gatgatgattacatgatgttatctacgagttgttaaatgtacatgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 8830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34023 - 33925
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  34023 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgag 33925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28558 - 28466
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgat 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28558 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgat 28466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 206
Target Start/End: Original strand, 74327 - 74410
Alignment:
Q  123 gatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74327 gatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 74410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 6313 - 6411
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6313 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 6411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11137 - 11039
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11137 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 11039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 60318 - 60416
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  60318 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 60416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 133824 - 133767
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  133824 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 133767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 136293 - 136236
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  136293 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 136236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 138762 - 138705
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  138762 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 138705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 141231 - 141174
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  141231 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 141174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 143700 - 143643
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  143700 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 143643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 286 - 190
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  286 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5328 - 5232
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5328 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtctattattcatgaaatgctaatg 5232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 10814 - 10910
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10814 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 10910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 109687 - 109591
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  109687 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 109591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 224135 - 224231
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  224135 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 224231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18909 - 18811
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18909 gatgatgattatgtgatgttatctataagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcatttattcatgaattgataatgag 18811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 68548 - 68646
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  68548 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatggtgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgag 68646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Original strand, 62832 - 62918
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  62832 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 62918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 218
Target Start/End: Original strand, 34122 - 34218
Alignment:
Q  122 tgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  34122 tgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatgatgag 34218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Original strand, 15586 - 15665
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15586 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 15665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0380 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:

Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4056 - 3974
Alignment:
Q  124 atgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4056 atgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 3974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Original strand, 37190 - 37276
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37190 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 37276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11863 - 11765
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11863 gatgatgattacatgatgaaatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgcttatgttaagttgatatgttgtcttttatacatgaattgataatgag 11765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 94023 - 93966
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  94023 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 93966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 70821 - 70743
Alignment:
Q  140 atctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  70821 atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgag 70743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 3509 - 3605
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatg 216  Q
    |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3509 gatgatgattatgtgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 3605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 23937 - 24016
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 206  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23937 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 24016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Original strand, 5523 - 5621
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||| ||||   ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5523 gatgatgattatatgaagatatttatgagttcttaggtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgag 5621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5909 - 5817
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 215  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5909 gatgatgattacatgatgatat--atgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-agttgtcttttattcatgaattgataat 5817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4199 - 4109
Alignment:
Q  128 ttacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||||||    
T  4199 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgag 4109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 184
Target Start/End: Original strand, 21332 - 21396
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21332 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 21396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10834 - 10755
Alignment:
Q  139 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  10834 tatctaagagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatgaatagataatgag 10755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Original strand, 115390 - 115435
Alignment:
Q  172 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  115390 ttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataatgag 115435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13004 - 12947
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  13004 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 12947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20359 - 20302
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  20359 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 20302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13567 - 13510
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  13567 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 13510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9361 - 9304
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  9361 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 9304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37434 - 37377
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  37434 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 37377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40013 - 39956
Alignment:
Q  121 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgtt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  40013 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 39956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 193
Target Start/End: Original strand, 163588 - 163633
Alignment:
Q  148 gttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  163588 gttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataacttgt 163633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 633 - 595
Alignment:
Q  180 agttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  633 agttgataagttgtcttttattcatgaatcgataatgag 595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 89 - 35
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaag 181  Q
    |||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  89 attacatgaggttacctttgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaag 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 177
Target Start/End: Original strand, 3265 - 3315
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgt 177  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3265 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgt 3315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19123 - 19066
Alignment:
Q  120 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatg-tacttgatgatgtttatg 176  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  19123 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgttacatgatgatgattatg 19066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 180
Target Start/End: Original strand, 173225 - 173278
Alignment:
Q  127 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaa 180  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  173225 attatatgatgttacctattagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaa 173278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 184
Target Start/End: Original strand, 444 - 496
Alignment:
Q  132 atgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttg 184  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  444 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg 496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University