View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8277_high_2 (Length: 303)

Name: NF8277_high_2
Description: NF8277
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8277_high_2
NF8277_high_2
[»] chr4 (84 HSPs)
chr4 (15-303)||(2830610-2830899)
chr4 (15-303)||(44889643-44889932)
chr4 (25-303)||(16630167-16630446)
chr4 (18-300)||(5292063-5292345)
chr4 (18-300)||(5301722-5302004)
chr4 (18-300)||(21846913-21847195)
chr4 (18-300)||(21856505-21856787)
chr4 (18-300)||(21902776-21903058)
chr4 (18-300)||(21912368-21912650)
chr4 (18-300)||(27679728-27680010)
chr4 (18-300)||(27689383-27689665)
chr4 (27-303)||(16210123-16210398)
chr4 (25-303)||(17827146-17827426)
chr4 (25-303)||(17836537-17836817)
chr4 (25-303)||(53945261-53945539)
chr4 (36-300)||(16250092-16250355)
chr4 (18-300)||(3486602-3486884)
chr4 (18-300)||(3495925-3496207)
chr4 (25-303)||(4837148-4837428)
chr4 (25-300)||(15670714-15670989)
chr4 (15-271)||(17162213-17162470)
chr4 (25-262)||(10422417-10422654)
chr4 (15-262)||(17144353-17144601)
chr4 (25-300)||(7845892-7846167)
chr4 (25-300)||(16253870-16254145)
chr4 (25-300)||(16059004-16059280)
chr4 (25-299)||(17984025-17984299)
chr4 (25-299)||(18104575-18104849)
chr4 (25-299)||(40922477-40922751)
chr4 (28-300)||(13401939-13402212)
chr4 (25-303)||(8841818-8842096)
chr4 (25-300)||(13792187-13792462)
chr4 (27-303)||(41526936-41527210)
chr4 (25-299)||(6692852-6693126)
chr4 (25-299)||(6703258-6703532)
chr4 (22-300)||(30652303-30652576)
chr4 (25-271)||(16397883-16398129)
chr4 (25-271)||(521377-521624)
chr4 (25-271)||(17420483-17420730)
chr4 (28-300)||(14599809-14600083)
chr4 (75-271)||(518871-519068)
chr4 (25-300)||(6404980-6405255)
chr4 (25-271)||(26459052-26459300)
chr4 (186-300)||(7843012-7843126)
chr4 (170-299)||(16081433-16081562)
chr4 (22-99)||(17162132-17162209)
chr4 (22-99)||(17144272-17144349)
chr4 (15-99)||(2830434-2830518)
chr4 (15-99)||(4837442-4837526)
chr4 (70-167)||(11477582-11477680)
chr4 (25-99)||(44889565-44889639)
chr4 (27-99)||(30652220-30652292)
chr4 (25-99)||(2830268-2830342)
chr4 (25-99)||(16058916-16058990)
chr4 (25-99)||(3486894-3486969)
chr4 (25-99)||(3486987-3487062)
chr4 (25-99)||(3496217-3496292)
chr4 (25-99)||(3496310-3496385)
chr4 (25-99)||(5292355-5292430)
chr4 (25-99)||(5292448-5292523)
chr4 (25-99)||(5302014-5302089)
chr4 (25-99)||(5302107-5302182)
chr4 (25-99)||(21846735-21846810)
chr4 (25-99)||(21846828-21846903)
chr4 (25-99)||(21856327-21856402)
chr4 (25-99)||(21856420-21856495)
chr4 (25-99)||(21902598-21902673)
chr4 (25-99)||(21902691-21902766)
chr4 (25-99)||(21912190-21912265)
chr4 (25-99)||(21912283-21912358)
chr4 (25-99)||(27680020-27680095)
chr4 (25-99)||(27680113-27680188)
chr4 (25-99)||(27689675-27689750)
chr4 (25-99)||(27689768-27689843)
chr4 (25-99)||(2830532-2830606)
chr4 (201-256)||(30626053-30626109)
chr4 (25-63)||(2830356-2830394)
chr4 (25-63)||(4837566-4837604)
chr4 (25-63)||(16210450-16210488)
chr4 (25-99)||(41526846-41526920)
chr4 (25-99)||(53945553-53945627)
chr4 (201-256)||(14932672-14932728)
chr4 (201-256)||(14941877-14941933)
chr4 (27-99)||(16397721-16397793)
[»] chr2 (60 HSPs)
chr2 (18-303)||(28450954-28451239)
chr2 (15-303)||(22678816-22679105)
chr2 (15-303)||(16901286-16901576)
chr2 (15-303)||(16994677-16994967)
chr2 (15-303)||(3604712-3605001)
chr2 (25-303)||(45191471-45191750)
chr2 (44-303)||(22671677-22671936)
chr2 (18-300)||(4468630-4468912)
chr2 (18-300)||(4459005-4459287)
chr2 (18-300)||(5345784-5346066)
chr2 (18-300)||(5335932-5336214)
chr2 (25-303)||(44637722-44638001)
chr2 (36-300)||(32935857-32936120)
chr2 (25-300)||(45015347-45015622)
chr2 (25-300)||(38929578-38929853)
chr2 (25-300)||(24695655-24695927)
chr2 (25-300)||(38956920-38957195)
chr2 (25-300)||(29423987-29424262)
chr2 (25-246)||(12571231-12571452)
chr2 (25-261)||(37862223-37862459)
chr2 (25-299)||(2997768-2998042)
chr2 (25-299)||(17489324-17489598)
chr2 (25-299)||(18651852-18652126)
chr2 (25-299)||(18663970-18664244)
chr2 (25-299)||(9501831-9502105)
chr2 (25-299)||(9513197-9513471)
chr2 (22-259)||(21109845-21110083)
chr2 (25-271)||(27159103-27159350)
chr2 (25-271)||(27169451-27169698)
chr2 (25-262)||(41026013-41026251)
chr2 (25-300)||(69243-69518)
chr2 (25-271)||(19342949-19343196)
chr2 (25-271)||(22907974-22908221)
chr2 (25-271)||(22902773-22903020)
chr2 (25-246)||(15474683-15474905)
chr2 (18-99)||(5346076-5346157)
chr2 (18-99)||(33432477-33432558)
chr2 (18-99)||(33432568-33432649)
chr2 (21-99)||(5336224-5336302)
chr2 (162-266)||(40408123-40408227)
chr2 (98-246)||(22146487-22146634)
chr2 (248-303)||(12580175-12580230)
chr2 (25-99)||(3605093-3605167)
chr2 (25-99)||(16901668-16901742)
chr2 (25-99)||(16995059-16995133)
chr2 (25-99)||(4458827-4458902)
chr2 (25-99)||(4458920-4458995)
chr2 (25-99)||(4468452-4468527)
chr2 (25-99)||(4468545-4468620)
chr2 (25-99)||(5336407-5336482)
chr2 (25-99)||(5346167-5346242)
chr2 (25-99)||(5346260-5346335)
chr2 (25-99)||(3605005-3605079)
chr2 (25-99)||(16901580-16901654)
chr2 (25-99)||(16994971-16995045)
chr2 (189-262)||(38461298-38461369)
chr2 (25-63)||(22679145-22679183)
chr2 (201-256)||(22635001-22635057)
chr2 (220-256)||(25891130-25891166)
chr2 (201-256)||(41896403-41896459)
[»] chr6 (66 HSPs)
chr6 (15-303)||(30657028-30657317)
chr6 (15-303)||(26019558-26019847)
chr6 (15-303)||(1597782-1598072)
chr6 (15-300)||(18202171-18202456)
chr6 (25-303)||(18705474-18705752)
chr6 (25-303)||(18711409-18711687)
chr6 (25-303)||(26169049-26169325)
chr6 (25-300)||(790176-790451)
chr6 (28-303)||(16321959-16322234)
chr6 (28-303)||(16334107-16334382)
chr6 (25-300)||(22222634-22222910)
chr6 (25-300)||(22248469-22248745)
chr6 (25-300)||(20968476-20968751)
chr6 (25-299)||(9034051-9034322)
chr6 (25-300)||(17826486-17826761)
chr6 (18-303)||(7753872-7754158)
chr6 (29-300)||(29541084-29541355)
chr6 (25-299)||(3286480-3286754)
chr6 (25-299)||(12455687-12455961)
chr6 (25-299)||(14792236-14792510)
chr6 (25-299)||(16898580-16898854)
chr6 (25-299)||(18160695-18160969)
chr6 (25-299)||(20912916-20913190)
chr6 (25-299)||(16909233-16909507)
chr6 (25-299)||(18170507-18170781)
chr6 (36-299)||(31358207-31358469)
chr6 (36-299)||(31367937-31368199)
chr6 (25-299)||(24930187-24930461)
chr6 (22-300)||(15504066-15504345)
chr6 (25-299)||(24921151-24921425)
chr6 (25-271)||(34765991-34766238)
chr6 (22-262)||(27786697-27786936)
chr6 (25-271)||(8562483-8562730)
chr6 (163-303)||(12989007-12989148)
chr6 (25-271)||(24692444-24692691)
chr6 (112-303)||(19363790-19363981)
chr6 (136-303)||(18335661-18335825)
chr6 (108-271)||(28093346-28093503)
chr6 (108-271)||(6314668-6314831)
chr6 (228-303)||(24502728-24502802)
chr6 (236-303)||(26169438-26169503)
chr6 (25-99)||(18202093-18202167)
chr6 (25-99)||(26019939-26020013)
chr6 (25-99)||(30657321-30657395)
chr6 (27-104)||(790460-790537)
chr6 (113-248)||(9760737-9760870)
chr6 (25-134)||(18333349-18333459)
chr6 (25-99)||(1597616-1597690)
chr6 (25-99)||(1597704-1597778)
chr6 (25-99)||(9033875-9033949)
chr6 (29-99)||(9033967-9034037)
chr6 (25-99)||(18202005-18202079)
chr6 (25-99)||(22222924-22222998)
chr6 (25-99)||(22248759-22248833)
chr6 (201-256)||(27741219-27741274)
chr6 (201-256)||(27750400-27750455)
chr6 (189-262)||(25537699-25537769)
chr6 (25-63)||(26019887-26019925)
chr6 (221-262)||(26045124-26045165)
chr6 (255-303)||(26169646-26169692)
chr6 (255-303)||(26169835-26169881)
chr6 (255-303)||(26170024-26170070)
chr6 (255-303)||(26170213-26170259)
chr6 (255-303)||(26170402-26170448)
chr6 (255-303)||(26170591-26170637)
chr6 (201-256)||(17556354-17556410)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (15-303)||(19887031-19887320)
chr5 (15-303)||(37646674-37646964)
chr5 (15-303)||(37537563-37537853)
chr5 (25-300)||(4037325-4037601)
chr5 (26-303)||(22172595-22172873)
chr5 (15-303)||(22245235-22245523)
chr5 (25-303)||(37818233-37818512)
chr5 (25-303)||(13571022-13571301)
chr5 (25-303)||(27273524-27273803)
chr5 (18-300)||(21754162-21754444)
chr5 (18-300)||(21763449-21763731)
chr5 (44-303)||(19781256-19781515)
chr5 (25-303)||(30942632-30942912)
chr5 (25-303)||(30952054-30952334)
chr5 (25-303)||(34129832-34130111)
chr5 (36-300)||(18208609-18208872)
chr5 (36-300)||(18217947-18218210)
chr5 (25-303)||(37298157-37298436)
chr5 (25-303)||(42089848-42090128)
chr5 (36-300)||(21682833-21683096)
chr5 (25-303)||(20807871-20808150)
chr5 (25-303)||(204810-205088)
chr5 (25-300)||(31917446-31917721)
chr5 (23-300)||(27578503-27578779)
chr5 (25-300)||(36317080-36317356)
chr5 (25-299)||(18390868-18391142)
chr5 (25-299)||(18361911-18362185)
chr5 (25-299)||(26191176-26191450)
chr5 (25-299)||(26201758-26202032)
chr5 (25-299)||(27412782-27413056)
chr5 (25-299)||(32071074-32071348)
chr5 (25-299)||(33939954-33940228)
chr5 (25-299)||(33950354-33950628)
chr5 (25-299)||(11410262-11410536)
chr5 (25-299)||(8764518-8764792)
chr5 (25-271)||(20948485-20948732)
chr5 (25-271)||(20958854-20959101)
chr5 (25-268)||(19547627-19547871)
chr5 (25-300)||(23376111-23376390)
chr5 (25-271)||(20897588-20897837)
chr5 (161-262)||(20904008-20904109)
chr5 (22-99)||(22245154-22245231)
chr5 (25-99)||(19887412-19887486)
chr5 (25-99)||(36316992-36317066)
chr5 (25-99)||(37537945-37538019)
chr5 (25-99)||(37647056-37647130)
chr5 (25-99)||(21754077-21754152)
chr5 (25-99)||(21763364-21763439)
chr5 (25-99)||(37537857-37537931)
chr5 (25-99)||(37646968-37647042)
chr5 (25-63)||(19887360-19887398)
chr5 (201-256)||(29958777-29958833)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (15-303)||(4781597-4781886)
chr3 (15-303)||(20743859-20744148)
chr3 (15-303)||(2488023-2488313)
chr3 (25-303)||(20293680-20293958)
chr3 (25-300)||(19827384-19827660)
chr3 (18-300)||(4372167-4372449)
chr3 (18-300)||(4381908-4382190)
chr3 (15-303)||(13118595-13118882)
chr3 (25-303)||(14801577-14801858)
chr3 (25-300)||(51977639-51977915)
chr3 (23-300)||(20492663-20492940)
chr3 (23-300)||(4023283-4023559)
chr3 (25-300)||(12386867-12387143)
chr3 (25-300)||(11143-11418)
chr3 (25-300)||(25433743-25434019)
chr3 (25-299)||(8973480-8973754)
chr3 (25-299)||(8984035-8984309)
chr3 (25-299)||(5654783-5655057)
chr3 (25-299)||(9537769-9538043)
chr3 (25-299)||(9548095-9548369)
chr3 (25-300)||(10507824-10508099)
chr3 (25-262)||(16334610-16334847)
chr3 (25-299)||(1684408-1684682)
chr3 (87-300)||(10002581-10002794)
chr3 (25-299)||(6433368-6433642)
chr3 (25-271)||(24872406-24872653)
chr3 (25-299)||(6422941-6423215)
chr3 (25-271)||(49386562-49386810)
chr3 (88-300)||(10507010-10507222)
chr3 (25-300)||(11459773-11460047)
chr3 (175-300)||(24773549-24773674)
chr3 (137-262)||(38817154-38817279)
chr3 (116-268)||(23503052-23503205)
chr3 (170-299)||(682966-683095)
chr3 (27-183)||(24794073-24794230)
chr3 (196-303)||(24814638-24814745)
chr3 (25-207)||(17734772-17734955)
chr3 (25-207)||(19036041-19036224)
chr3 (169-265)||(11043899-11043995)
chr3 (25-99)||(51977929-51978003)
chr3 (25-99)||(4371989-4372064)
chr3 (25-99)||(4372082-4372157)
chr3 (25-99)||(4381730-4381805)
chr3 (25-99)||(4381823-4381898)
chr3 (25-91)||(10011572-10011638)
chr3 (25-99)||(2488317-2488391)
chr3 (25-99)||(2488405-2488479)
chr3 (25-99)||(13118886-13118960)
chr3 (25-99)||(20744152-20744226)
chr3 (25-99)||(20744240-20744314)
chr3 (25-99)||(25433655-25433729)
chr3 (25-94)||(51978022-51978091)
chr3 (189-243)||(20649569-20649621)
chr3 (25-63)||(4781926-4781964)
chr3 (25-63)||(4782014-4782052)
chr3 (25-63)||(13119010-13119048)
chr3 (189-271)||(13430703-13430785)
chr3 (199-256)||(25510693-25510750)
chr3 (220-248)||(29708514-29708542)
[»] chr7 (65 HSPs)
chr7 (15-303)||(45554181-45554470)
chr7 (15-303)||(24539613-24539903)
chr7 (25-303)||(19586381-19586660)
chr7 (15-300)||(27989717-27990003)
chr7 (15-303)||(10416608-10416897)
chr7 (18-300)||(43984287-43984569)
chr7 (23-300)||(14946743-14947020)
chr7 (23-300)||(15374336-15374614)
chr7 (70-303)||(19800779-19801013)
chr7 (25-303)||(8340842-8341118)
chr7 (25-271)||(9534420-9534665)
chr7 (25-271)||(9544703-9544948)
chr7 (25-262)||(42621726-42621963)
chr7 (25-300)||(15987817-15988092)
chr7 (22-300)||(14247654-14247933)
chr7 (25-299)||(5380966-5381240)
chr7 (25-299)||(5390604-5390878)
chr7 (25-299)||(5927769-5928043)
chr7 (25-299)||(16131068-16131342)
chr7 (25-299)||(16141617-16141891)
chr7 (25-299)||(26304189-26304463)
chr7 (25-299)||(26362355-26362629)
chr7 (25-299)||(46497748-46498022)
chr7 (25-299)||(46508360-46508634)
chr7 (23-264)||(7018593-7018834)
chr7 (23-264)||(7033955-7034196)
chr7 (25-299)||(6535118-6535392)
chr7 (25-299)||(6545439-6545713)
chr7 (25-299)||(8501683-8501957)
chr7 (25-299)||(8512153-8512427)
chr7 (25-299)||(11625518-11625792)
chr7 (25-299)||(26307749-26308023)
chr7 (25-299)||(44897932-44898206)
chr7 (25-299)||(44908357-44908631)
chr7 (25-299)||(32099014-32099288)
chr7 (25-299)||(32109451-32109725)
chr7 (25-271)||(5614634-5614882)
chr7 (25-296)||(2991045-2991315)
chr7 (25-300)||(9007579-9007854)
chr7 (75-271)||(41028283-41028480)
chr7 (75-271)||(13284888-13285085)
chr7 (75-271)||(31825402-31825599)
chr7 (117-303)||(12574909-12575095)
chr7 (75-268)||(12826562-12826756)
chr7 (138-303)||(12516011-12516175)
chr7 (138-303)||(12492206-12492370)
chr7 (25-262)||(12770717-12770954)
chr7 (75-271)||(42596066-42596263)
chr7 (159-300)||(13130605-13130746)
chr7 (136-271)||(12088072-12088206)
chr7 (25-133)||(12515869-12515977)
chr7 (169-233)||(40703335-40703399)
chr7 (25-99)||(27989639-27989713)
chr7 (25-134)||(12492064-12492173)
chr7 (25-99)||(24539995-24540069)
chr7 (25-99)||(45554015-45554089)
chr7 (178-233)||(40703188-40703246)
chr7 (169-233)||(40703579-40703643)
chr7 (25-99)||(43984109-43984184)
chr7 (25-99)||(43984202-43984277)
chr7 (25-99)||(12515781-12515855)
chr7 (201-256)||(28392105-28392160)
chr7 (201-256)||(34143960-34144015)
chr7 (25-63)||(10416530-10416568)
chr7 (25-63)||(45554103-45554141)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (10-254)||(19747437-19747681)
chr1 (18-301)||(25038547-25038830)
chr1 (15-303)||(20316839-20317128)
chr1 (15-303)||(20327321-20327610)
chr1 (18-301)||(25043759-25044042)
chr1 (15-303)||(41542977-41543266)
chr1 (25-301)||(22961538-22961814)
chr1 (25-303)||(20315065-20315344)
chr1 (25-303)||(27066714-27066993)
chr1 (25-303)||(49336383-49336661)
chr1 (18-303)||(18096068-18096354)
chr1 (25-303)||(4951064-4951342)
chr1 (15-265)||(26192275-26192526)
chr1 (22-271)||(8540892-8541141)
chr1 (22-271)||(8606131-8606380)
chr1 (25-270)||(25822346-25822591)
chr1 (25-300)||(2117489-2117765)
chr1 (25-300)||(30548777-30549052)
chr1 (25-300)||(2369574-2369849)
chr1 (25-271)||(42034848-42035094)
chr1 (70-300)||(18384023-18384253)
chr1 (25-299)||(21459262-21459536)
chr1 (46-299)||(25020124-25020376)
chr1 (25-299)||(16155517-16155791)
chr1 (25-263)||(37012986-37013224)
chr1 (25-303)||(34823602-34823880)
chr1 (93-300)||(13965749-13965955)
chr1 (25-271)||(1973866-1974113)
chr1 (25-271)||(1988653-1988900)
chr1 (161-303)||(12420179-12420322)
chr1 (25-271)||(52948879-52949126)
chr1 (44-271)||(21793402-21793632)
chr1 (171-303)||(25868126-25868259)
chr1 (25-262)||(21820651-21820890)
chr1 (18-99)||(25822605-25822686)
chr1 (75-265)||(22957140-22957331)
chr1 (110-303)||(34000586-34000777)
chr1 (169-233)||(22892357-22892421)
chr1 (199-262)||(21904518-21904581)
chr1 (15-99)||(41543270-41543354)
chr1 (23-90)||(13965501-13965568)
chr1 (169-228)||(22892615-22892674)
chr1 (25-99)||(26192618-26192692)
chr1 (109-233)||(22892145-22892268)
chr1 (214-298)||(22959167-22959252)
chr1 (27-99)||(37012812-37012884)
chr1 (25-99)||(20317220-20317294)
chr1 (221-262)||(19867790-19867831)
chr1 (250-300)||(19735715-19735766)
chr1 (25-63)||(20317168-20317206)
chr1 (25-63)||(20327650-20327688)
chr1 (25-99)||(20327702-20327776)
chr1 (25-63)||(26192566-26192604)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (15-300)||(8761-9047)
scaffold0118 (25-99)||(8595-8669)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (15-303)||(28168-28457)
scaffold0058 (15-303)||(49372-49660)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (15-301)||(20211-20499)
scaffold0234 (25-99)||(20503-20576)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (25-303)||(14893183-14893462)
chr8 (25-303)||(31990800-31991079)
chr8 (25-303)||(14880833-14881112)
chr8 (25-303)||(31998389-31998668)
chr8 (15-303)||(20530019-20530308)
chr8 (28-303)||(33773276-33773550)
chr8 (25-300)||(13675394-13675669)
chr8 (36-300)||(21986901-21987164)
chr8 (36-300)||(21996435-21996698)
chr8 (25-303)||(11429618-11429896)
chr8 (21-303)||(23014192-23014462)
chr8 (22-300)||(2689433-2689712)
chr8 (25-299)||(9324187-9324461)
chr8 (25-295)||(21334932-21335202)
chr8 (25-262)||(21202024-21202261)
chr8 (25-262)||(21212440-21212677)
chr8 (75-271)||(26361520-26361717)
chr8 (25-271)||(14438057-14438304)
chr8 (175-300)||(3988296-3988421)
chr8 (169-300)||(12900460-12900591)
chr8 (145-264)||(6760572-6760692)
chr8 (25-131)||(17269457-17269563)
chr8 (162-271)||(12840635-12840744)
chr8 (178-300)||(21461892-21462014)
chr8 (178-303)||(18537438-18537562)
chr8 (223-300)||(17269564-17269641)
chr8 (15-63)||(20530348-20530396)
chr8 (25-99)||(11429910-11429984)
chr8 (25-103)||(20530484-20530562)
chr8 (25-157)||(20852118-20852252)
chr8 (27-63)||(20530436-20530472)
chr8 (186-232)||(37817847-37817892)
chr8 (201-253)||(33273244-33273296)
chr8 (201-256)||(45489579-45489635)
chr8 (201-256)||(45498537-45498593)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (25-297)||(1-274)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (25-303)||(19404-19683)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (25-303)||(110923-111202)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (25-300)||(73886-74161)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (31-300)||(1-270)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (25-262)||(55041-55278)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (25-300)||(92037-92312)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (25-299)||(233149-233423)
scaffold0014 (25-300)||(147341-147616)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (22-300)||(8742-9020)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (25-262)||(1154-1391)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (128-303)||(395014-395190)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (25-299)||(7003-7277)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (25-300)||(165-440)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (25-262)||(18560-18798)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (25-262)||(309217-309454)
scaffold0005 (28-300)||(217295-217569)
[»] scaffold0811 (3 HSPs)
scaffold0811 (25-264)||(2500-2739)
scaffold0811 (25-99)||(2753-2827)
scaffold0811 (25-99)||(2841-2915)
[»] scaffold0591 (2 HSPs)
scaffold0591 (22-300)||(1579-1859)
scaffold0591 (178-300)||(1-123)
[»] scaffold0313 (3 HSPs)
scaffold0313 (25-271)||(6403-6650)
scaffold0313 (75-271)||(10235-10432)
scaffold0313 (25-230)||(20560-20766)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (97-303)||(8127-8334)
scaffold0034 (25-80)||(8072-8127)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (22-300)||(27934-28212)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (25-300)||(16075-16354)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (25-247)||(55274-55495)
scaffold0018 (25-247)||(59223-59444)
scaffold0018 (25-247)||(60651-60872)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (25-262)||(6205-6443)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (25-262)||(11919-12158)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (188-300)||(30814-30926)
[»] scaffold0764 (1 HSPs)
scaffold0764 (25-229)||(1-206)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (147-271)||(19725-19848)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (75-300)||(39727-39953)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (71-271)||(950-1149)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (75-300)||(196550-196777)
scaffold0015 (214-298)||(189943-190028)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (186-266)||(67014-67094)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (201-256)||(1386-1441)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (273-303)||(4-34)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (220-256)||(163892-163928)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 84)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 2830610 - 2830899
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2830610 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 2830709  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2830710 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctc 2830809  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2830810 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 2830899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 44889643 - 44889932
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44889643 gaaaaacaaatctcatttagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 44889742  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44889743 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcagttgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctc 44889842  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44889843 acaagattgtgaggagtggactaacacccattgggggaactactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 44889932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 16630167 - 16630446
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16630167 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 16630266  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16630267 gagaatacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 16630366  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16630367 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 16630446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5292345 - 5292063
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5292345 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 5292246  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5292245 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 5292146  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  5292145 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 5292063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5302004 - 5301722
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5302004 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 5301905  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5301904 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 5301805  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  5301804 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 5301722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 21846913 - 21847195
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21846913 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 21847012  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847013 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 21847112  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  21847113 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 21847195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 21856505 - 21856787
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21856505 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 21856604  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21856605 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 21856704  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  21856705 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 21856787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 21902776 - 21903058
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21902776 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 21902875  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21902876 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 21902975  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  21902976 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 21903058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 21912368 - 21912650
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21912368 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 21912467  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21912468 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 21912567  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  21912568 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 21912650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27680010 - 27679728
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27680010 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 27679911  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679910 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 27679811  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  27679810 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 27679728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27689665 - 27689383
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27689665 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 27689566  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27689565 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 27689466  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  27689465 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 27689383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 27 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16210398 - 16210123
Alignment:
Q  27 tcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttaga 126  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16210398 tcatctagctttaggggtactaaagtgttagtctgagtaaagattgtaaaagtataagtggttaacttagcaacatggtgcaagcctgctgaggcttaga 16210299  T
Q  127 gaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtga 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16210298 gaatacagaggtgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtacaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatttaga 16210199  T
Q  227 ggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16210198 ggagtggactaacccacatt-ggggaaccactataaatctctttgtgtttattctctcttccctatactctttactt 16210123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17827426 - 17827146
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17827426 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 17827327  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17827326 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 17827227  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17827226 tgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 17827146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17836817 - 17836537
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17836817 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 17836718  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17836717 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 17836618  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17836617 tgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 17836537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 53945539 - 53945261
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||    
T  53945539 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaagattgtaaaagtctaagtggtcaacttagaaacatgatgcaagtctgctgaggctta 53945440  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53945439 gagaataaagaggtgtaagtgtttaggtgagcacgaattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 53945340  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53945339 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatctctgtgcgtttattctctcttccctatactctttactt 53945261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 300
Target Start/End: Original strand, 16250092 - 16250355
Alignment:
Q  36 tttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga 135  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16250092 tttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagg 16250191  T
Q  136 gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 235  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16250192 attgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 16250290  T
Q  236 taacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  16250291 taacccacattgggtgaaccactataaatttctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 16250355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3486884 - 3486602
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3486884 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 3486785  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3486784 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtagaaactctcaca 3486685  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | |  |||  ||||| ||||||||||||    
T  3486684 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgctatttccttcttctctatactcttta 3486602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3496207 - 3495925
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3496207 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 3496108  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3496107 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtagaaactctcaca 3496008  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | |  |||  ||||| ||||||||||||    
T  3496007 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgctatttccttcttctctatactcttta 3495925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4837428 - 4837148
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  4837428 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagaaacaaggtgcaagcctgctgttgctta 4837329  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4837328 gagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcataatagaaactctcacaagattg 4837229  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactat-aaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837228 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaaatctctgtgtattgattctctcttccctatactctttactt 4837148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 15670714 - 15670989
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15670714 tctcatatagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaatgttgtaaaagtctaagtggttaactaagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 15670813  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15670814 gagaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 15670913  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  15670914 gaggagtggactaacccacatagggtgaaccactataattctctgtgtgttctttccttcttctctatactcttta 15670989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 17162213 - 17162470
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17162213 gaaaaacaaatctcatatagttttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggttcaagcctg 17162312  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacag-agttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactct 213  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17162313 ctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgataggttatctcaagcatcatagtggaaactct 17162412  T
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  17162413 cagaagattatgaggagtggactatcccacattgggtgaaccactataattctctgtg 17162470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Original strand, 10422417 - 10422654
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10422417 tctcatctagctctaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttataaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctta 10422516  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10422517 gagaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcataatggaaactctcacaagattgt 10422616  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10422617 gaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataa 10422654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 262
Target Start/End: Original strand, 17144353 - 17144601
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17144353 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggaactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaccttagcaataaggtgcaagcctg 17144452  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacag-agttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactct 213  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17144453 ctgaggtttagagaatacagttgttgtaattgttccggtgaacaaggattgtaaggtgtaggatttgagaggttatctcaagcatcgtagtgaaaactct 17144552  T
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17144553 cacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataa 17144601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7846167 - 7845892
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7846167 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtttaagtggttaacttagcaacaaggtgcaatcctgctgaggctta 7846068  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7846067 gaaaatacagaattgtaagtattcaggtgaacataaattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcataggggaaactctcataagattgt 7845968  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | | |||| |||  ||| |||||| ||||||||||||    
T  7845967 gaggagtggactagcccacgttgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttccctcttctctatactcttta 7845892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 16253870 - 16254145
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16253870 tctcatctagcttgaggggtactaaagtattagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtagttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 16253969  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16253970 gagaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtgaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaactctcacaaaattgt 16254069  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  16254070 gaggagtagactagcccacgttgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttccttcttctctatactcttta 16254145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 16059004 - 16059280
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||| | | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16059004 tctcatctaactttagaggtactaaagtgatagtttgagcagaagttgtaaaagtctaaataggtaacttagaaagaaggtgcaagcctgctgaggctta 16059103  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||  |  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16059104 gagaatacagttggcgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaattcttacaagattg 16059203  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||  ||||||||||| |||||||||||    
T  16059204 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatctttgtgtgttctttctctcttccttatactcttta 16059280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17984299 - 17984025
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17984299 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 17984200  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17984199 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 17984101  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  17984100 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 17984025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18104849 - 18104575
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18104849 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 18104750  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18104749 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 18104651  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  18104650 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 18104575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 40922477 - 40922751
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40922477 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 40922576  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40922577 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 40922675  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  40922676 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 40922751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13402212 - 13401939
Alignment:
Q  28 catctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagag 127  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13402212 catctagctttaagggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagag 13402113  T
Q  128 aatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtga 226  Q
    |||||||  | ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13402112 aatacagttggtgtaattgttcagttgaacaaagattgtaaggtgcggaatttgagaggttatctcaagcatcgtagtggaaactctcacaagattgtga 13402013  T
Q  227 ggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||  |  | ||||||||||||| ||||    
T  13402012 ggagtggactaacccacatttggtgaaccactataaatttttgtgtgttcttcttatcttccctatacttttta 13401939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 8841818 - 8842096
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||     
T  8841818 tctcatctagctt-aggggtactaaagtgttagtttgagcagaaggtgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggcta 8841916  T
Q  124 agagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatt 222  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8841917 agagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagtgcagaatttgagaggttatctcaagcatcatagtgaaaactctcacaagatt 8842015  T
Q  223 gtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  8842016 gtgaggagtggactaacccatagtgggtgaaccactataaatttccgtgtgttcatcttctcttccctatactctatactt 8842096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13792462 - 13792187
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13792462 tctcatctaactttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaagttataaaagtctaagtgggtaacttagaaagaaggtgcaagcctgctgaggctta 13792363  T
Q  125 gagaataca-gagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||    |||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13792362 gagaatacattttttgtaatttttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcatgatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 13792264  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||  |  ||||||||||||||||||||    
T  13792263 tgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataaatctttgtgtgttcttcttctcttccctatactcttta 13792187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 303
Target Start/End: Original strand, 41526936 - 41527210
Alignment:
Q  27 tcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttaga 126  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41526936 tcatctaactttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaagattgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttaga 41527035  T
Q  127 gaatacagagt-tgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtg 225  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41527036 gaatacaggttgtgtaactgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaagatttgagaggttatctttagcatcatagtggaaactct--caagattgtg 41527133  T
Q  226 aggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  41527134 agaagtggactaa-ccacattgggtgaaccactataaatttatgtgtgttcttcttctcttccctatactctttactt 41527210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 6692852 - 6693126
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6692852 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 6692951  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6692952 agagaatacaggagtgtaattgttcaggagaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 6693050  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  6693051 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 6693126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 6703258 - 6703532
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6703258 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 6703357  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6703358 agagaatacaggagtgtaattgttcaggagaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 6703456  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  6703457 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 6703532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 300
Target Start/End: Original strand, 30652303 - 30652576
Alignment:
Q  22 aaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggc 121  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  30652303 aaatctcatctagctttaggggtattaaagtgttagtttgagcagaaattgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaggtacaagcctgctgatgc 30652402  T
Q  122 ttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaaga 220  Q
    |||||||||||||  |  |||| |||||||||||||| |||||| ||      ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30652403 ttagagaatacagttggcgtaattgttcaggtgaacaaagattgcaa------ggatttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaactctcacaaga 30652496  T
Q  221 ttgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  30652497 ttgtgaggagttgactaaccaacattgggggaaccactataaatctttgagtgttctttctctcttccctatactcttta 30652576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Original strand, 16397883 - 16398129
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16397883 tctcaactagctttaggggtactaaagtattagtttgaacaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaaaaaggtgtaagcctgctgaggctta 16397982  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||   | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16397983 gagaatacaattgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagtgcaggatttgagaggttacctcaaacatcatagtgaaaactctcacaagatcg 16398081  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16398082 tgaggagtggactaaaccacattggatgaaccactataaatttctgtg 16398129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 521624 - 521377
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  521624 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 521526  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  521525 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 521427  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  521426 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 521377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17420730 - 17420483
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  17420730 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagtagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 17420632  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  17420631 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaaaac 17420533  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17420532 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 17420483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14600083 - 14599809
Alignment:
Q  28 catctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaa--gtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttag 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||    
T  14600083 catctagctttagaggtactaaagtgttagtttgagtaaaggttgtaaaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaggtgcaagccagttgtggcttag 14599984  T
Q  126 agaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtg 225  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||||||| || ||||||  |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  14599983 agaatacatggttataattgttcaggtgaacaaaggttgtaagatgcaggatttaagaggttatctcaagtatcatagttgaaactctcataggattgtg 14599884  T
Q  226 aggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| | |||| |||  |||| |||||| |||||||||||    
T  14599883 aggagtggaccagcccacattaggtgaaccactataaatatttgtgtgttctttctttcttccttatactcttta 14599809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 519068 - 518871
Alignment:
Q  75 aaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgc 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  519068 aaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgc 518970  T
Q  173 aggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  518969 aggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 518871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6405255 - 6404980
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  6405255 tctcatctagctttaggggtattaaagtgttattttgagcagaagttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaggtgcaagattgctgaggctta 6405156  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||   ||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6405155 gagaatacaattgttgtaatttttcaggtgaaca-agattgtaaggtgaaatatttgagaggttatctcaagcatcatattggaaactctcacaagattg 6405057  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||| | |||| |||  |  ||||||||||||||| ||||    
T  6405056 tgaggagtggactagcccatattgtttgaaccactataaatctttgtgtgtttttcttctcttccctatactattta 6404980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Original strand, 26459052 - 26459300
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagaga-tactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggc 121  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||    |||||| |||||||||| ||||||||||  || |||| ||||| | ||||||    
T  26459052 tctcatctagctttagggggtactaaagtgttagtttgagtagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcattaaaggtgtaagcccgatgaggc 26459150  T
Q  122 ttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaaga 220  Q
    | ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  26459151 taagagaatactgttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaaacatcatagtggaaaatctcacaaaa 26459249  T
Q  221 ttgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26459250 ctgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 26459300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7843126 - 7843012
Alignment:
Q  186 ttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctct 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | | |||| |||  ||| ||||    
T  7843126 ttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttccctct 7843027  T
Q  286 tccctatactcttta 300  Q
    || ||||||||||||    
T  7843026 tctctatactcttta 7843012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16081562 - 16081433
Alignment:
Q  170 tgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctg 269  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||    
T  16081562 tgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttg 16081463  T
Q  270 tgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  16081462 tgtgttctttctttcttctctatactcttt 16081433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Original strand, 17162132 - 17162209
Alignment:
Q  22 aaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17162132 aaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagccgagtttgtaaaagtctaagtggataacttagcaa 17162209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Original strand, 17144272 - 17144349
Alignment:
Q  22 aaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17144272 aaatctcatctagctttaggggtactaaaatgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtaggtaacttagcaa 17144349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 99
Target Start/End: Original strand, 2830434 - 2830518
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  2830434 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 2830518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 4837526 - 4837442
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4837526 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaggagtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 4837442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 167
Target Start/End: Original strand, 11477582 - 11477680
Alignment:
Q  70 ttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca-gagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaa 167  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||    
T  11477582 ttgtaaaagtgtaagtaggtaacttagcaagaaggtgcaagtctgccaaggcttatagaatacatgagttgtaattgttcaagtgaacaaagatcgtaa 11477680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 44889565 - 44889639
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44889565 tctcatctaactttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 44889639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Original strand, 30652220 - 30652292
Alignment:
Q  27 tcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30652220 tcatctagctttaggggtactaaagtgttagtctgagctgaaggtgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 30652292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 2830268 - 2830342
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  2830268 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 2830342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 16058916 - 16058990
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16058916 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtctgagctgaaggtgtaaaagtctaagtgagtaacttagcaa 16058990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3486969 - 3486894
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3486969 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 3486894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3487062 - 3486987
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3487062 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 3486987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3496292 - 3496217
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3496292 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 3496217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3496385 - 3496310
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3496385 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 3496310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5292430 - 5292355
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5292430 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 5292355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5292523 - 5292448
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5292523 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 5292448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5302089 - 5302014
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5302089 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 5302014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5302182 - 5302107
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5302182 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 5302107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 21846735 - 21846810
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21846735 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 21846810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 21846828 - 21846903
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21846828 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 21846903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 21856327 - 21856402
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21856327 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 21856402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 21856420 - 21856495
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21856420 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 21856495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 21902598 - 21902673
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21902598 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 21902673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 21902691 - 21902766
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21902691 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 21902766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 21912190 - 21912265
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21912190 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 21912265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 21912283 - 21912358
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21912283 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 21912358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27680095 - 27680020
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27680095 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 27680020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27680188 - 27680113
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27680188 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 27680113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27689750 - 27689675
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27689750 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 27689675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27689843 - 27689768
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27689843 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 27689768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 2830532 - 2830606
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  2830532 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaggagcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 2830606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30626109 - 30626053
Alignment:
Q  201 tagtggaaactctcacaagatt-gtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30626109 tagtggaaaatctcacaagttttgtgaggactggactaacccacgttgggggaacca 30626053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Original strand, 2830356 - 2830394
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2830356 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgag 2830394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 4837604 - 4837566
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4837604 tctcatctagctttagaggtgctaaagtgttagtttgag 4837566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16210488 - 16210450
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16210488 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgag 16210450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 41526846 - 41526920
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||  ||   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41526846 tctcatctagctttagggttgctaaaggtttagtttgagcagaaggtgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 41526920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 53945627 - 53945553
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    ||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  53945627 tctcatctatctttaggggtattaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 53945553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Original strand, 14932672 - 14932728
Alignment:
Q  201 tagtggaaactctcacaag-attgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14932672 tagtggaaaatctcacaagcattgtggggactggactaacccacgttgggtgaacca 14932728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Original strand, 14941877 - 14941933
Alignment:
Q  201 tagtggaaactctcacaag-attgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14941877 tagtggaaaatctcacaagcattgtggggactggactaacccacgttgggtgaacca 14941933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Original strand, 16397721 - 16397793
Alignment:
Q  27 tcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |   || |||| ||||||||| ||| |||||||    
T  16397721 tcatctagctttaggagtactaaagtgttagtttgagttaaaggtgaaaaattctaagtgggtaatttagcaa 16397793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 60)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Original strand, 28450954 - 28451239
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28450954 aaacaaatctcatctagctttaagggtaccaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 28451053  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28451054 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcatgtgaacacagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 28451153  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28451154 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttatgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 28451239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22679105 - 22678816
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22679105 gaaaaacaaatctcatctagctttaagggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 22679006  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22679005 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcattatagtggaaactctc 22678906  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22678905 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgagggaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 22678816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16901576 - 16901286
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16901576 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgcgtttgtaaaattctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 16901477  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactct 213  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16901476 ctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaagtgcaggatttgagaggttatctcaaccatcatagtggaaactct 16901377  T
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16901376 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 16901286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16994967 - 16994677
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16994967 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgcgtttgtaaaattctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 16994868  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactct 213  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16994867 ctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaagtgcaggatttgagaggttatctcaaccatcatagtggaaactct 16994768  T
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16994767 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 16994677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3605001 - 3604712
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3605001 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaaatgttagtttgagctgaatttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcttg 3604902  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3604901 ctgaggcttagagaatacaaagttgtaagtgttcaggtgaacgcatattgtaaggtgcgggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctc 3604802  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3604801 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactcttcactt 3604712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 45191471 - 45191750
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45191471 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 45191570  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45191571 gagaatacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 45191670  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45191671 gaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 45191750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 44 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22671936 - 22671677
Alignment:
Q  44 tactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaag 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22671936 tactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaag 22671837  T
Q  144 tgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccac 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22671836 tgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcattatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccac 22671737  T
Q  244 attgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22671736 att-ggggaacgactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 22671677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 4468630 - 4468912
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4468630 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 4468729  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4468730 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 4468829  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  4468830 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 4468912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 4459005 - 4459287
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4459005 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 4459104  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4459105 aggcttagagaatacatgattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 4459204  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  4459205 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 4459287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5346066 - 5345784
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5346066 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 5345967  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5345966 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacgaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 5345867  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  5345866 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 5345784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5336214 - 5335932
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5336214 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 5336115  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5336114 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacgaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 5336015  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  5336014 agattgtgaggagtagactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 5335932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 44638001 - 44637722
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44638001 tctcatctagctttaggggtgttaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 44637902  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44637901 gagaatacagtgttgtaagtgttcaggtgatcacagatggtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcaaagtggaaactctcacaagattgt 44637802  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccacta-taaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44637801 gaggagtgggctaacccacattgggggaaccactacaaaatctctatgttttgattctctcttccctatactctttactt 44637722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32936120 - 32935857
Alignment:
Q  36 tttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga 135  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32936120 tttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagg 32936021  T
Q  136 gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 235  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32936020 attgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactttcacaagattgtgaggagtggac 32935922  T
Q  236 taacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||    
T  32935921 taacccacattgggtgaaccactataaatttctgtgtgttctttctctcttccatatactcttta 32935857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 45015347 - 45015622
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45015347 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaagctta 45015446  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45015447 gagaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaactctcacaagattgt 45015546  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  45015547 gaggagtggactagcccacgttgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttccttcttctctatactcttta 45015622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38929853 - 38929578
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38929853 tctcatctacctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgttgaggctta 38929754  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38929753 gagaatacaaagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaactctcacaagattgt 38929654  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  38929653 gaggagtggactagcccacgttgggtgaaccactataattctctgtgtgttttttccttcttctctatactcttta 38929578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24695927 - 24695655
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695927 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 24695828  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24695827 gagaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaactctcacaagattgt 24695728  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
       |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  24695727 ---gagtggactagcccacgttgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttccttcttctctatactcttta 24695655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38957195 - 38956920
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38957195 tctcatctacctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtttaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 38957096  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38957095 gagaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaactctcacaagattgt 38956996  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| | |||||| |||   ||  ||||| ||||||||||||    
T  38956995 gaggagtggactagcccacgttggatgaaccactataattctctgtgtgttctctccttcttctctatactcttta 38956920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 29423987 - 29424262
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29423987 tctcatctaactttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaatgttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgttgaggctta 29424086  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29424087 gagagtacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcatgacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 29424186  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | |  |||  ||||| ||||||||||||    
T  29424187 gaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattatctgtgtgctctttccttcttctctatactcttta 29424262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 12571231 - 12571452
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12571231 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagcttgagcaaagattgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 12571330  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12571331 gagaatacataattgtaagtgtttaggtgaacatagattgtaaggtgtaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 12571430  T
Q  225 gaggagtggactaacccacatt 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  12571431 gagtagtggactaacccacatt 12571452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37862459 - 37862223
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37862459 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagttttagtggttaacttagcaaaaaggtgcaagcctgttgaggctta 37862360  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37862359 gagaatacagaattgtaattgttcaggtgaacaatgattgtaaggtgcaggacttgagaggtcatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 37862260  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactata 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37862259 gaggagtggactaacccacattgggtgaaccactata 37862223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2998042 - 2997768
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2998042 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 2997943  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2997942 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 2997844  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  2997843 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 2997768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 17489324 - 17489598
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17489324 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagaaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 17489423  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17489424 agagaatataggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 17489522  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  17489523 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 17489598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 18651852 - 18652126
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18651852 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 18651951  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18651952 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 18652050  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  18652051 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 18652126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 18663970 - 18664244
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18663970 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 18664069  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18664070 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 18664168  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  18664169 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 18664244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9502105 - 9501831
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9502105 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgattaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 9502006  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9502005 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 9501907  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  9501906 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 9501831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9513471 - 9513197
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9513471 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgattaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 9513372  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9513371 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 9513273  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  9513272 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 9513197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 259
Target Start/End: Original strand, 21109845 - 21110083
Alignment:
Q  22 aaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggc 121  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  21109845 aaatctcatatagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaagtttgtaaaagtctaagtgggtaacttaacaagaaggtgcaagcctgctgagac 21109944  T
Q  122 ttagagaataca-gagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaaga 220  Q
    |||||||||| | | ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21109945 ttagagaatatatgtgttgtaattgttcagttgaacaaagattgtaaggtgtaggatttgagaggttatctcaagcatcatagttgaaactctcacaaga 21110044  T
Q  221 ttgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 259  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  21110045 ttgcgaggagtggactagtccacattgggtgaaccacta 21110083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27159350 - 27159103
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  27159350 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagaagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 27159252  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27159251 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 27159153  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27159152 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 27159103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27169698 - 27169451
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  27169698 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagaagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 27169600  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27169599 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 27169501  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27169500 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 27169451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41026251 - 41026013
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41026251 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaagattgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaggtgcaagcctgatgaggctta 41026152  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||   | | ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  41026151 gagaatacaattgatataattgtttaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttgtctcaagcatcatgatggaaactctcgcaagattg 41026052  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41026051 tgaagagtggactaacccacattggatgaaccactataa 41026013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 69518 - 69243
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   ||  ||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  69518 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaagggtgtaaaattctaagtgggtaacttagtaagaaggtgcaagcctgctgaggctta 69419  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||| | | ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  69418 gagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaata-atattttaaggtgcatgatttgagaggttatctcaaacatcatagttgaaattctcacaagattg 69320  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||| |||||| |||  |  |||||||| || ||||||||    
T  69319 tgaggagtggactagccaacattggataaaccactataaatctctgtgtgttcttcttctcttccatacactcttta 69243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Original strand, 19342949 - 19343196
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  19342949 tctcatctagctttaggggtattaaagtgttagtttgagcagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 19343047  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||    
T  19343048 tagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgtaggatttgagaagttatctaaatcatcatagtcaaaaatctcacaagat 19343146  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19343147 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttatgtg 19343196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22908221 - 22907974
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  22908221 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 22908123  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     ||||||||||   ||||||| |  ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22908122 aagagaatacaattgttgtaattaatcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcataatggaaaatctcacaagat 22908024  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22908023 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttatgtg 22907974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Original strand, 22902773 - 22903020
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||| | |||||||| || || |||| || |||| |||||||    
T  22902773 tctcatctagcttaagaggtactaaagtgttagtttgagaagaaaggtgtaaa-gtctaagtaggtaacttagtaagaaaggtgtaaacctgttgaggct 22902871  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22902872 aagagaatatagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaatgtgtatgatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 22902970  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22902971 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 22903020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15474905 - 15474683
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaag-gtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||  ||| || |||||| |||||    
T  15474905 tctcatctagctttacaggtactaaagtgatagtttgagcagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaaattagcaagaaaagtgtaatcctgctaaggct 15474807  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
    |||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15474806 tagagaatacaattgttgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcatgatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 15474708  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacatt 246  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  15474707 tgtaaggagtggactaacccacatt 15474683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5346157 - 5346076
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5346157 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 5346076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 33432558 - 33432477
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33432558 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 33432477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 33432649 - 33432568
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33432649 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 33432568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5336302 - 5336224
Alignment:
Q  21 caaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5336302 caaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 5336224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40408227 - 40408123
Alignment:
Q  162 ttgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactata 261  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    ||||||||||    
T  40408227 ttgtaaggtgcaggagttgagaggttatctcaaacatcataatggaaaatctcacaagattgtgaggagtggactagaccacattgaataaaccactata 40408128  T
Q  262 aattt 266  Q
    |||||    
T  40408127 aattt 40408123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 22146487 - 22146634
Alignment:
Q  98 aacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttc-aggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagc 196  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| | | |||||  | |||||   || |||| |||||||||||||||||||    
T  22146487 aacaagttgtaagcctgctgagacttagagaatacag-gttgtaattgttccaagggaacaatg-ttgtacgatgtaggagttgagagattatctcaagc 22146584  T
Q  197 atcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacatt 246  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  22146585 atcatagtggaaattcttacaagattgtgagaagtggattaacctacatt 22146634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 248 - 303
Target Start/End: Original strand, 12580175 - 12580230
Alignment:
Q  248 ggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12580175 ggggaaccactataaatttctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 12580230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3605167 - 3605093
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  3605167 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 3605093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16901742 - 16901668
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  16901742 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 16901668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16995133 - 16995059
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  16995133 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 16995059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 4458827 - 4458902
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4458827 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 4458902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 4458920 - 4458995
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4458920 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 4458995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 4468452 - 4468527
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4468452 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 4468527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 4468545 - 4468620
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4468545 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 4468620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5336482 - 5336407
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5336482 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 5336407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5346242 - 5346167
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5346242 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 5346167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5346335 - 5346260
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5346335 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 5346260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3605079 - 3605005
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||||||||||| | |||||||||||    
T  3605079 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaggagtaaaagtctaagtagataacttagcaa 3605005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16901654 - 16901580
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  16901654 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaggagcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 16901580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16995045 - 16994971
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  16995045 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaggagcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 16994971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 262
Target Start/End: Original strand, 38461298 - 38461369
Alignment:
Q  189 tctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  |||||||||  |||||| |||||    
T  38461298 tctcaagcatcatagtggaaactctcaca--gttgtgaggagtggattagtccacattggatgaaccaatataa 38461369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22679183 - 22679145
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22679183 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgag 22679145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Original strand, 22635001 - 22635057
Alignment:
Q  201 tagtggaaactctcacaag-attgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22635001 tagtggaaaatctcacaagtattgtggggactggactaacccacgttgggtgaacca 22635057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25891166 - 25891130
Alignment:
Q  220 attgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25891166 attgtggggactggactaacccacattgggggaacca 25891130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Original strand, 41896403 - 41896459
Alignment:
Q  201 tagtggaaactctcacaag-attgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41896403 tagtggaaaatctcacaagtattgtggggactggactaacccacgttgggtgaacca 41896459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 66)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30657317 - 30657028
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30657317 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcgtg 30657218  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30657217 ctgaggcttagagaatacagggttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctc 30657118  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30657117 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgagggaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 30657028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26019847 - 26019558
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26019847 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 26019748  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26019747 ctgaggcttagagaatacagaattgtaactgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctc 26019648  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaa-tttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26019647 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaactctccgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 26019558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 1597782 - 1598072
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1597782 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 1597881  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactct 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1597882 ctgaggcttagagaatacagatgttgtaattgttcatgtgaacaaggattgtaaggtgcagggtttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactct 1597981  T
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1597982 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaattctcggtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 1598072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 300
Target Start/End: Original strand, 18202171 - 18202456
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18202171 gaaaaacaaatctcatctaactttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaaattagcaacaaggtgcaagcctg 18202270  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18202271 ctgaggcttagaaaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaagatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctc 18202370  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18202371 acaagattgtgaggagtggactaacccacattggggaaaccactataattctctgtgtgtttattctctcttacctatactcttta 18202456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18705752 - 18705474
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18705752 tctcatctaacttttggggtactaaagtgttagcttgagctaagattgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgtaatcctgctgaggctta 18705653  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18705652 gagaatacagaattgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtgcaagatttgagaggttatctcaagcatcatagttgaaactctcacaagattgt 18705553  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18705552 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 18705474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18711687 - 18711409
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18711687 tctcatctaacttttggggtactaaagtgttagcttgagctaagattgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgtaaacctgctgaggctta 18711588  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18711587 gagaatacagaattgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtgcaagatttgagaggttatctcaagcatcatagttgaaactctcacaagattgt 18711488  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18711487 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 18711409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 26169049 - 26169325
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26169049 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagcttgagcaaagattgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 26169148  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26169149 gagaatacagaattgtaagtgttcaggagaacacggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggagactctcacaagattgt 26169248  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26169249 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatctctgt--gtttattctctcttccctatactctttactt 26169325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 790451 - 790176
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  790451 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaagattgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaagttgcaagcctgctgaggctta 790352  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  790351 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgagcacaaattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaaaattgt 790252  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  790251 gaggagtggactaacccacattggaggaaccactataaatctttgtgtgtcctttctctcttccctatactcttta 790176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 303
Target Start/End: Original strand, 16321959 - 16322234
Alignment:
Q  28 catctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagag 127  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||| |||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16321959 catctagctttaggagtactaaagtgttagcttgagcaaatattgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgttgaggcttagag 16322058  T
Q  128 aatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgag 227  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16322059 aatacataattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtacatgatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgag 16322158  T
Q  228 gagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16322159 gagtggactaacccacattgggggaaccaccataaatctctgtgtgtttattctctcttccttatactctttactt 16322234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 303
Target Start/End: Original strand, 16334107 - 16334382
Alignment:
Q  28 catctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagag 127  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||| |||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16334107 catctagctttaggagtactaaagtgttagcttgagcaaatattgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgttgaggcttagag 16334206  T
Q  128 aatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgag 227  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16334207 aatacataattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtacatgatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgag 16334306  T
Q  228 gagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16334307 gagtggactaacccacattgggggaaccaccataaatctctgtgtgtttattctctcttccttatactctttactt 16334382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22222910 - 22222634
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22222910 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaagttgtaaaagtctatgtgggtaacttagcaagaaagtgcaagcctgctgaggctta 22222811  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||  |  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22222810 gagaatacagttggcgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 22222711  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  22222710 tgaggagtggactaactcacattgggggaaccactataaatctttgtgcgttcttcttctcttccctatactcttta 22222634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22248745 - 22248469
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22248745 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaagttgtaaaagtctatgtgggtaacttagcaagaaagtgcaagcctgctgaggctta 22248646  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||  |  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22248645 gagaatacagttggcgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 22248546  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  22248545 tgaggagtggactaactcacattgggggaaccactataaatctttgtgcgttcttcttctcttccctatactcttta 22248469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 20968476 - 20968751
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20968476 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaaatggttaacttagaaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 20968575  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20968576 gagaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaactctcacaagattgt 20968675  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||  ||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  20968676 gaggagtggactagcccacgttgggtgaaccactataattctctgtgtattctttccttcttctctatactcttta 20968751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 9034051 - 9034322
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9034051 tctcatctagctttagaggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctta 9034150  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9034151 gagaatacagagttgtaattgttcgggcgaaca-agattgtaaattgcaggatttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaactcccacaagattgt 9034249  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||   | |||||||||| ||||||||    
T  9034250 gtggagtggactaactcacattgggtgaaccactataaatttatgtgtgtt--ctttctcttccctttactcttt 9034322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 17826486 - 17826761
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17826486 tctcatctagctttatgggtactaaagtgttagtttgagcgaaggttgtaaaattctaagtggttcatttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 17826585  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17826586 gagaatacagagttataattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 17826685  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  17826686 gaggagtggactagcccacgttgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttccttcttctctatactcttta 17826761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7754158 - 7753872
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7754158 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagttagtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 7754059  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    ||||||||||||||||||     || |  | |    || | | |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  7754058 aggcttagagaatacagaaaaaaaaataataaaaaaaaaaaaaattgtaaagtgcaggatttgagaggttatctaaaacatcatagaggaaactcacaca 7753959  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattt-ctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7753958 agattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttgttgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 7753872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 300
Target Start/End: Original strand, 29541084 - 29541355
Alignment:
Q  29 atctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagaga 128  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||   || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29541084 atctaactttaggggtactaaagtgttagtttaagcaaaggttctaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagaga 29541183  T
Q  129 atacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgagg 228  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29541184 atacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtgaaaactctcacaagattgtgagg 29541283  T
Q  229 agtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  29541284 agtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctatgtgttctttccttcttctctatactcttta 29541355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 3286480 - 3286754
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3286480 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 3286579  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3286580 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 3286678  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  3286679 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 3286754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 12455687 - 12455961
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12455687 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 12455786  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12455787 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 12455885  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  12455886 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 12455961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 14792236 - 14792510
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14792236 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 14792335  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14792336 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 14792434  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  14792435 tggggagtggactatcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 14792510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 16898580 - 16898854
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16898580 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 16898679  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16898680 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 16898778  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  16898779 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 16898854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 18160695 - 18160969
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18160695 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 18160794  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18160795 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 18160893  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  18160894 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 18160969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 20912916 - 20913190
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20912916 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 20913015  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20913016 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 20913114  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  20913115 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 20913190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 16909233 - 16909507
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16909233 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 16909332  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16909333 agagaatacaggattgtaattgttcaggtaaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 16909431  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  16909432 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 16909507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 18170507 - 18170781
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18170507 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 18170606  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18170607 agagaatacaagattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 18170705  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  18170706 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 18170781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 299
Target Start/End: Original strand, 31358207 - 31358469
Alignment:
Q  36 tttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga 135  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31358207 tttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagg 31358306  T
Q  136 gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 235  Q
      ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31358307 agtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattgtggggagtggac 31358405  T
Q  236 taacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  31358406 tagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 31358469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 299
Target Start/End: Original strand, 31367937 - 31368199
Alignment:
Q  36 tttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga 135  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31367937 tttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagg 31368036  T
Q  136 gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 235  Q
      ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31368037 agtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattgtggggagtggac 31368135  T
Q  236 taacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  31368136 tagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 31368199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24930461 - 24930187
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24930461 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggctaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 24930362  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24930361 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 24930263  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| || || |||||||||||    
T  24930262 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcctctctatactcttt 24930187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 300
Target Start/End: Original strand, 15504066 - 15504345
Alignment:
Q  22 aaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggc 121  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15504066 aaatctcatctagctttaagggtactaaagtgttagtttaaggaaagtttgtaaaagtctaagtggataacttagcaagaaggtggaagcctgctgaggc 15504165  T
Q  122 ttagagaataca-gagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaaga 220  Q
    |||||||||| | | ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15504166 ttagagaatatatgtgttgtaattgttcagctgaacaaagattgtaaggtgcaagatttgagtggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaaga 15504265  T
Q  221 ttgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||| | ||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||| | |||| |||  ||||||||| | | |||||||||    
T  15504266 ttgtgggaagtggactagcccatattaggtgaacctctataaatctttgtgtgttccttctctcttgcatgtactcttta 15504345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24921425 - 24921151
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   |  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24921425 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaatgttgtaaaagtctaagtggctaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 24921326  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24921325 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 24921227  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| || || |||||||||||    
T  24921226 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcctctctatactcttt 24921151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Original strand, 34765991 - 34766238
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  34765991 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 34766089  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34766090 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 34766188  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34766189 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttatgtg 34766238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27786936 - 27786697
Alignment:
Q  22 aaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggc 121  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||   |  |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27786936 aaatctcatatagctttaggggtactaaattgttagtttgagcaaatgttgtgaaagtctaagtgggtaacttagcaa-aaggtgcaagcctgctgaggc 27786838  T
Q  122 ttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaaga 220  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27786837 ttagagaatacaatcgttgtaagtgttcaggtgaaca-atattgtaaggtgcaagagttgagaggttatctcaagtatcatagtggaaactctcacaaga 27786739  T
Q  221 ttgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||||    
T  27786738 ttgtgaggagtggactagcccatattggatgaatcactataa 27786697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8562730 - 8562483
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  8562730 tctcatatagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtataagcctgctgaggct 8562632  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  8562631 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaaaac 8562533  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8562532 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccaatataaatttctgtg 8562483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 163 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12989148 - 12989007
Alignment:
Q  163 tgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12989148 tgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataa 12989049  T
Q  263 att-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12989048 attctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 12989007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Original strand, 24692444 - 24692691
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    ||||||  ||||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  24692444 tctcatctagctttagaggtactaaagtgttagtttgagcagaaaggtgtaaat-tctaagtaggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 24692542  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24692543 aagagagtacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcatgatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 24692641  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24692642 tgtgaggagttgactaacccacattgggtgaaccactataaatttatgtg 24692691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 112 - 303
Target Start/End: Original strand, 19363790 - 19363981
Alignment:
Q  112 ctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaac 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19363790 ctgctgaggctaagagaatacatttgttgaaattgttcaggcgaaca-agattgtaaggtgcatgatttgagaggttatctcaagcatcatagtgaaaac 19363888  T
Q  211 tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||| |||||||||||||||    
T  19363889 tctcacaatattgtgagaagtggactaacccacattgggcgaaccactataaatttatgtgtgttcttcttctcttctctatactctttactt 19363981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 303
Target Start/End: Original strand, 18335661 - 18335825
Alignment:
Q  136 gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 235  Q
    ||||||| |||||||||||| |  | |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18335661 gttgtaattgttcaggtgaaaa--ggttgtaaggtgtaggatttgagaaattatcttaagcatcatagtggaaaatctcacaagattgtgaggagtggac 18335758  T
Q  236 taacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||  || ||||||| || ||||||||||||    
T  18335759 taacccacattggttgaacctctataaatttctgtgtgttctttttctcttctct-tactctttactt 18335825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 271
Target Start/End: Original strand, 28093346 - 28093503
Alignment:
Q  108 aagcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtgga 207  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||| |||| |    
T  28093346 aagcctgccgagacttagagaatacag-gttgtagttgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggatttgaga----atctcaagcatcacagtgaa 28093439  T
Q  208 aactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || ||||  || || |||||||||||||||| ||||    
T  28093440 aattctcacaagattgtgaggagtggattagcccatgttaggtgaaccactataaatttatgtg 28093503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6314831 - 6314668
Alignment:
Q  108 aagcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttc-aggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtgg 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| | | ||||| | |||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  6314831 aagcctgctgaggcttcgagaatacagttttgtaattgttccaagggaacaaa-attgtttggtgcaggatttgagagggtatctcaagcatcataatgg 6314733  T
Q  207 aaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  6314732 aatttctcacaagattgtgaggagtagattatcccacattgggtgaactactataaatttttgtg 6314668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24502802 - 24502728
Alignment:
Q  228 gagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24502802 gagtggactaacccacattgggggaaccactataaa-ttctctgtgttgattctctcttccctatactctttactt 24502728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 236 - 303
Target Start/End: Original strand, 26169438 - 26169503
Alignment:
Q  236 taacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26169438 taacccacattgggggaaccactataaatctctgt--gtttattctctcttccctatactctttactt 26169503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 18202093 - 18202167
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18202093 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagaagaagaagtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 18202167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26020013 - 26019939
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  26020013 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 26019939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 30657395 - 30657321
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  30657395 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 30657321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 790537 - 790460
Alignment:
Q  27 tcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaagg 104  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  790537 tcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaagg 790460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9760870 - 9760737
Alignment:
Q  113 tgctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgtt-caggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgag-agattatctcaagcatcatagtgg-aaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||||| || |||||| |||||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||| |||    
T  9760870 tgctgaggcttagagaatacag-gttgtaattgttccaagggaacaaag-ttgtaaggtgcaggagttgagaatgttgtctcaagcatcgtagtggaaaa 9760773  T
Q  210 ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgg 248  Q
    |||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9760772 ctctcac---attgtgaggagtggactagcccacgttgg 9760737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 134
Target Start/End: Original strand, 18333349 - 18333459
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttg-agtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa-caaggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | |   ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  18333349 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaaggtgt-aaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagtctgctgaggct 18333447  T
Q  123 tagagaatacag 134  Q
     ||| |||||||    
T  18333448 aagataatacag 18333459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 1597616 - 1597690
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || ||||||||||| || |||||||||||    
T  1597616 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagataaaggtgcaaaagtctaagagggtaacttagcaa 1597690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 1597704 - 1597778
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  1597704 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaggagcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 1597778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 9033875 - 9033949
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  9033875 tctcatctaactttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 9033949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Original strand, 9033967 - 9034037
Alignment:
Q  29 atctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  9033967 atctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 9034037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 18202005 - 18202079
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |   || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18202005 tctcatctagctttagggatactaaagtgttagtttgggctaaaggtgcaaaagactaagtgggtaacttagcaa 18202079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22222998 - 22222924
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| | |   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22222998 tctcatctagctttaggagtactaaagtgttaatttgagcttaaggtgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 22222924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22248833 - 22248759
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| | |   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22248833 tctcatctagctttaggagtactaaagtgttaatttgagcttaaggtgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 22248759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27741274 - 27741219
Alignment:
Q  201 tagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    ||||||| | |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27741274 tagtggataatctcacagtattgtggggactggactaacccacattgggggaacca 27741219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27750455 - 27750400
Alignment:
Q  201 tagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    ||||||| | |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27750455 tagtggataatctcacagtattgtggggactggactaacccacattgggggaacca 27750400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 262
Target Start/End: Original strand, 25537699 - 25537769
Alignment:
Q  189 tctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25537699 tctcaagcatcatagtaaaaa-tctcacaa--ttgggaggagtgaactaacccacattggatgaaccactataa 25537769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26019925 - 26019887
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26019925 tctcatctagctttagaggtgctaaagtgttagtttgag 26019887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Original strand, 26045124 - 26045165
Alignment:
Q  221 ttgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  26045124 ttgtgaggagtggaataacccacattaggtgaaccactataa 26045165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 303
Target Start/End: Original strand, 26169646 - 26169692
Alignment:
Q  255 cactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26169646 cactataaatctctgtg--tttattctctcttccctatactctttactt 26169692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 303
Target Start/End: Original strand, 26169835 - 26169881
Alignment:
Q  255 cactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26169835 cactataaatctctgtg--tttattctctcttccctatactctttactt 26169881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 303
Target Start/End: Original strand, 26170024 - 26170070
Alignment:
Q  255 cactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26170024 cactataaatctctgtg--tttattctctcttccctatactctttactt 26170070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 303
Target Start/End: Original strand, 26170213 - 26170259
Alignment:
Q  255 cactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26170213 cactataaatctctgtg--tttattctctcttccctatactctttactt 26170259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 303
Target Start/End: Original strand, 26170402 - 26170448
Alignment:
Q  255 cactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26170402 cactataaatctctgtg--tttattctctcttccctatactctttactt 26170448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 303
Target Start/End: Original strand, 26170591 - 26170637
Alignment:
Q  255 cactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26170591 cactataaatctctgtg--tttattctctcttccctatactctttactt 26170637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17556410 - 17556354
Alignment:
Q  201 tagtggaaactctcacaag-attgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17556410 tagtggaaaatctcacaagcattgtggggactggactaacccacgttgggtgaacca 17556354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19887320 - 19887031
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887320 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 19887221  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19887220 ctgaggcttagagaatacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagaggaaactctc 19887121  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887120 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 19887031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37646964 - 37646674
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37646964 gaaaaacaaatctcatctagctttagaggtactaaagtgttagtttaagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 37646865  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactct 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37646864 ctgaggcttagagaatacagatgttgtaattgttcaggtgaacaaggaatgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactct 37646765  T
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37646764 caaaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 37646674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37537853 - 37537563
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37537853 gaaaaacaaatctcatctagctttagaggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagtctg 37537754  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactct 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37537753 ctgaggcttagagaatacagatgttgtaattgttcaggtgaacaaggaatgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcataatggaaactct 37537654  T
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37537653 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaattctctatgtgttgattctctcttccctatactctttactt 37537563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4037601 - 4037325
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4037601 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 4037502  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4037501 gagaatacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 4037402  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4037401 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgtttattctctcttccctatactcttta 4037325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22172873 - 22172595
Alignment:
Q  26 ctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttag 125  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22172873 ctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttag 22172774  T
Q  126 agaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtg 225  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22172773 agaatacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtg 22172674  T
Q  226 aggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22172673 aggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaattctctgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 22172595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 22245235 - 22245523
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22245235 gaaaaacaaatctcatgtagctttagaggtactaaagtgttggtttgagtcgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacatggtgcaagcctg 22245334  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22245335 ctgaggcttagagaatacagaggtgtaagtgttcaggtgagcacatattgtaaggtgcatgatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctc 22245434  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22245435 ataagattgtgaggaattgactaacccgcattgggggaaccactataaatttgtgtgtgtttattctctcttccctatactatttactt 22245523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 37818233 - 37818512
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37818233 tctcatctagctttaggcgtactaaagtgttagtttgagtaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 37818332  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37818333 gagaatacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttctctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 37818432  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37818433 gaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaattctctgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 37818512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13571301 - 13571022
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13571301 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagtaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 13571202  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13571201 gagaatacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagattataaggtgcaggatttgagaggttctctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 13571102  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13571101 aaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaattctctgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 13571022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27273803 - 27273524
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27273803 tctcatctagctttagggatactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 27273704  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27273703 gagaatacaaaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcagaatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattat 27273604  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27273603 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctttgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 27273524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 21754162 - 21754444
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21754162 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 21754261  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754262 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 21754361  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  21754362 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 21754444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 21763449 - 21763731
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21763449 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 21763548  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21763549 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 21763648  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  21763649 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 21763731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 44 - 303
Target Start/End: Original strand, 19781256 - 19781515
Alignment:
Q  44 tactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaag 143  Q
    |||||||||||||| || ||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  19781256 tactaaagtgttagcttaagcaaagattgtgaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgccgaggcttagagaacacaaaattgtaag 19781355  T
Q  144 tgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccac 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19781356 tgttcaggtgaacacagattgtaagatgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccac 19781455  T
Q  244 attgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19781456 attgggggaaccactataaatttctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 19781515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30942912 - 30942632
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30942912 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 30942813  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30942812 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 30942713  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30942712 tgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 30942632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30952334 - 30952054
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30952334 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 30952235  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30952234 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 30952135  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30952134 tgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 30952054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34130111 - 34129832
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34130111 tctcctctagctttaggagtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 34130012  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||| | |||||  |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34130011 gagaatacataattgtagttgttcaggtgaacaaaaattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 34129912  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34129911 gacgagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatattctttactt 34129832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18208872 - 18208609
Alignment:
Q  36 tttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga 135  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18208872 tttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagg 18208773  T
Q  136 gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 235  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18208772 attgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 18208674  T
Q  236 taacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  18208673 taacccacattgggtgaaccactataaatttctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 18208609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18218210 - 18217947
Alignment:
Q  36 tttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga 135  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18218210 tttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagg 18218111  T
Q  136 gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 235  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18218110 attgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 18218012  T
Q  236 taacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  18218011 taacccacattgggtgaaccactataaatttctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 18217947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37298436 - 37298157
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37298436 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttatcaataaggtgcaagcctgctgaggctta 37298337  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37298336 gagaatacagaattataactgttcaggtgaacaaagtttgtaaggtgcatgatttgagagtttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 37298237  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37298236 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattcttcgtgtgtttattctctcttccctgtactctttactt 37298157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 42090128 - 42089848
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42090128 tctcatctagcttttggggtactaaagtgttagcttgagcaaagattgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 42090029  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42090028 gagaatacataattgtaagtgttcaggtgaacaaagactgtaaagtgcaggatttaagaggttatctcaagcatca-agtggaaactctcacaagattgt 42089930  T
Q  225 gaggag---tggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42089929 gaggagtgctggactaacccacatcgggggaaccactataaatctctgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 42089848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 300
Target Start/End: Original strand, 21682833 - 21683096
Alignment:
Q  36 tttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga 135  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21682833 tttagaaatcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgttgaggcttagagaatacagg 21682932  T
Q  136 gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 235  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21682933 attgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 21683031  T
Q  236 taacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  21683032 taacccacattgggtgaaccactataaatttctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 21683096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 20807871 - 20808150
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20807871 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagcttgaacaaagattgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 20807970  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  20807971 gagaatatagaattgtaagtgttcaggtgaatacagattctaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatggtggaaactctcacaagagtgt 20808070  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactat-aaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20808071 gaggagtggactaacccacattcgaggaaccactataaaatttatgtgtgttcattctctcttccctatactcattactt 20808150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 205088 - 204810
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  205088 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagcttgagcaaagattgtaaaattctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 204989  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||| | |||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  204988 gagaatacaaaattgtaaatgttaaggagaacaaagattgtaaggtgcaagaattaagagattatctcaagcaacatagtggaaactctcacaagattgt 204889  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  204888 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaacttctgtgtattgattccctcttccttatactctttactt 204810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 31917446 - 31917721
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31917446 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 31917545  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31917546 gagaatacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagtttgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggcaactctcacaagattgt 31917645  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  31917646 gaggattggactagcccacgttgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttccttcttctctatactcttta 31917721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27578779 - 27578503
Alignment:
Q  23 aatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27578779 aatctcatttaattttaggggtactaaagtgttagtttgagtaaa-tgtgtaaaagtctaagtggataacttagtaacaaggtgcaagtctgctgaggct 27578681  T
Q  123 tagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatt 222  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27578680 tagagaatacagggttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaagatttaagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaagatt 27578581  T
Q  223 gtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  27578580 gtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatctttgtgcgttctttctctcttctctatactcttta 27578503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 36317080 - 36317356
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  36317080 tctcatctagctttaggggtactaaagtgatagtttgagcagaagttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaagatgcaagcctgctgaggctta 36317179  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||  |  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36317180 gagaatacagttggcgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 36317279  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||  |  |||||||||||| |||||||    
T  36317280 tgaggagtggactaacccacattggaggaaccactataaatctttgtgtgttcttcttctcttccctatcctcttta 36317356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 18390868 - 18391142
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18390868 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 18390967  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18390968 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 18391066  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  18391067 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 18391142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 18361911 - 18362185
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18361911 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 18362010  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18362011 agagaatacaggattgtaattgtttaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 18362109  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  18362110 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 18362185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26191450 - 26191176
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26191450 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 26191351  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26191350 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 26191252  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  26191251 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 26191176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26202032 - 26201758
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26202032 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 26201933  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26201932 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 26201834  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  26201833 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 26201758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 27412782 - 27413056
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27412782 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 27412881  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27412882 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgataggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 27412980  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  27412981 tgaggagtggactagcccacattaggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 27413056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 32071074 - 32071348
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32071074 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 32071173  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32071174 agagaatacatgattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 32071272  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  32071273 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 32071348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 33939954 - 33940228
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33939954 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 33940053  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33940054 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 33940152  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  33940153 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 33940228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 33950354 - 33950628
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33950354 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 33950453  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33950454 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 33950552  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  33950553 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 33950628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11410536 - 11410262
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11410536 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 11410437  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11410436 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggtcatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 11410338  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  11410337 tggggagtggactagcccacattggatgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 11410262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8764792 - 8764518
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8764792 tctcatctagcttttagaggttctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgattaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 8764693  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8764692 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 8764594  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  8764593 tggggagtggactagcccatattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 8764518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Original strand, 20948485 - 20948732
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  20948485 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 20948583  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20948584 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgtaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 20948682  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20948683 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 20948732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Original strand, 20958854 - 20959101
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  20958854 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 20958952  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20958953 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgtaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 20959051  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20959052 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 20959101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19547871 - 19547627
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||    
T  19547871 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgagact 19547773  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19547772 aagagaatatagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaagtgtaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 19547674  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttct 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19547673 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttct 19547627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23376390 - 23376111
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggtta----acttagcaacaaggtgcaagcctgctgagg 120  Q
    |||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||    ||||||||| |||| ||||||||| ||| |    
T  23376390 tctcatctagatttaggagtaccaaagtgttagtttgagtaaaggttgtaaaagtctaagtgggtacgtaacttagcaagaaggagcaagcctgttgacg 23376291  T
Q  121 cttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaag 219  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23376290 cttagagaatacagttgttgtacttgttcagctgaaca-agattgtaaggtgcaggaattgagaggttatctcaagcatcataggggaaactctcacaag 23376192  T
Q  220 attgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| | |||| |||  |  ||||||||||||||||||||    
T  23376191 attgtgaggagtggactagcccatattgggttaaccactataaatctttgtgtgttcttcttctcttccctatactcttta 23376111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Original strand, 20897588 - 20897837
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaag-gtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||   |   ||||||||||||||||  |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  20897588 tctcatctacctataggggtactaaagtgttagtttgagcaaaaggtgtaaaagtctaagtgtgtaacttagtaagaaaagtgcaagcctgctgaggctt 20897687  T
Q  124 agagaatacagagtt-gtaagt-gttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
    |||||||||||  || |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20897688 agagaatacaggttttgtaaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaagatttgagaggttatctaaagcatcatagtggaaactctcacaagat 20897787  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  20897788 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccagtataactttttgtg 20897837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20904109 - 20904008
Alignment:
Q  161 attgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactat 260  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20904109 attgtaaggtgaaggatttgagaggttatctcaagcatcatagttgaaactttcacaagattgggaggagtggactaacccacattgggtgaaccactat 20904010  T
Q  261 aa 262  Q
    ||    
T  20904009 aa 20904008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Original strand, 22245154 - 22245231
Alignment:
Q  22 aaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22245154 aaatctcatatagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 22245231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19887486 - 19887412
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  19887486 tctcatctagctttagaggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 19887412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 36316992 - 36317066
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36316992 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtctgagctgaaggtgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 36317066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 37538019 - 37537945
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  37538019 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 37537945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 37647130 - 37647056
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  37647130 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 37647056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 21754077 - 21754152
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21754077 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 21754152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 21763364 - 21763439
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21763364 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 21763439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 37537931 - 37537857
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  37537931 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaggagaaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 37537857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 37647042 - 37646968
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  37647042 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaggagaaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 37646968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19887398 - 19887360
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19887398 tctcatctagctttagaggtgctaaagtgttagtttgag 19887360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Original strand, 29958777 - 29958833
Alignment:
Q  201 tagtggaaactctcacaag-attgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29958777 tagtggaaaatctcacaagtattgtggggactggactaacccacgttgggtgaacca 29958833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4781886 - 4781597
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4781886 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 4781787  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4781786 ctgaggcttagagaatacagaattgtaactgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctc 4781687  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4781686 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctccgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 4781597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20744148 - 20743859
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20744148 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagactg 20744049  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20744048 ctgaggcttagaaaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtgaaaactctc 20743949  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20743948 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattgtctgtgtgttgattttctcttccctatactctttactt 20743859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2488313 - 2488023
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2488313 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 2488214  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacag-agttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactct 213  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2488213 ctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaagatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactct 2488114  T
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2488113 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattggatgaaccactataaattctccgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 2488023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 20293680 - 20293958
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| |||  |||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20293680 tctcatctagcttcaggggtactaaagtattaacttgagaagagattgtaaaaatctaagtggttaacttagcaacaaggtgtaagcctgctgaggctta 20293779  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20293780 gagaatacagaattgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 20293879  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20293880 gaggagtggactagcccacgttgggtgaaccactataaatttctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 20293958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19827660 - 19827384
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19827660 tctcatctaactttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 19827561  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19827560 gagaatacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttctctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 19827461  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19827460 gaggagtggactaacccacattgggcgaaccactataaattctctgtgtgtttattctctcttccctatactcttta 19827384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 4372167 - 4372449
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4372167 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 4372266  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4372267 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacgaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 4372366  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  4372367 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 4372449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 4381908 - 4382190
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4381908 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 4382007  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4382008 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacgaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 4382107  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  4382108 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 4382190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13118882 - 13118595
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13118882 gaaaaacaaatctcatctagttttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaaccgggtgcaagcctg 13118783  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactct 213  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13118782 ctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaacgtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactct 13118683  T
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattt-ctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13118682 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttgctat--gttgattctctctt-cctatactctttactt 13118595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14801858 - 14801577
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14801858 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagcttgagcaaagattgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgttgaggctta 14801759  T
Q  125 gagaatacaga---gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     | |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14801758 cacaatacataattattgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 14801659  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14801658 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactattaatttccgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 14801577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 51977915 - 51977639
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51977915 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaaatggttaactccgcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 51977816  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51977815 gagaatacagagttgtaggtgttcaggtgaacacaaattgtaaggtgcaagatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcactagattgt 51977716  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactat-aaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51977715 gaggagtgaactaacccacattgggggaaccactataaaatctctgtgtgttgattctctcttccctatactcttta 51977639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 300
Target Start/End: Original strand, 20492663 - 20492940
Alignment:
Q  23 aatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20492663 aatctcatctaactttaggggtactaaagtgttagtttgagtaaagattgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggct 20492762  T
Q  123 tagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatt 222  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20492763 tagagaatacaaggttgtaattgttcaggtgaataaagtttgtaaggtgcaggatttgagaggttttctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatt 20492862  T
Q  223 gtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  20492863 gtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatctctgtgtgttctttctctctttcctatactcttta 20492940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 23 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4023559 - 4023283
Alignment:
Q  23 aatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4023559 aatctcatctaactttaggggtactaaagtgttagtttgagtaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggct 4023460  T
Q  123 tagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatt 222  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  4023459 tagagaatacagggttgtaattattcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaatatcatagtggaaactctctcaagatt 4023360  T
Q  223 gtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  4023359 gtg-ggagtggactaacccacattggctgaaccactataaatctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 4023283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 12386867 - 12387143
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12386867 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagcctgagccgaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagactgctaaggctta 12386966  T
Q  125 gagaatacagagt-tgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12386967 gagaatacaggttgtgtaactgttcaggtgaacaaaaattgtaaggtgtaggatttgaaaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 12387066  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  12387067 tgaggagtggactaacccacgttgggtgaaccactataaatctctgtgtttttattctctcttccctatactcttta 12387143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11418 - 11143
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagcttgagcaaaggttgtaaaaatctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 11319  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11318 gagaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaactctcacaagattgt 11219  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||  ||||| ||||||| ||||    
T  11218 gaggagtggactagcccacgttgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttccttcttctctatacttttta 11143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 25433743 - 25434019
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25433743 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtttaagtgggtaacttagcaacagggtgcaagcctgctgaggctta 25433842  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25433843 gagaatacaattgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 25433942  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | |  |||  ||||| ||||||||||||    
T  25433943 tgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactttaattctctgtgtgctctttccttcttctctatactcttta 25434019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 8973480 - 8973754
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8973480 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 8973579  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8973580 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 8973678  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  8973679 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 8973754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 8984035 - 8984309
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8984035 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 8984134  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8984135 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 8984233  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  8984234 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 8984309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5655057 - 5654783
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5655057 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 5654958  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5654957 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 5654859  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  5654858 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 5654783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 9537769 - 9538043
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9537769 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 9537868  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9537869 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 9537967  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  9537968 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 9538043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 9548095 - 9548369
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9548095 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 9548194  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9548195 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 9548293  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  9548294 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 9548369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10508099 - 10507824
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||   || |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||| |||||||||    
T  10508099 tctcatctaactttaggcttactaaagtgttaatttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagtaagaaggtgcagacctgttgaggctta 10508000  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10507999 gagaatacagggttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggttcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaacactcacaagattgt 10507900  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||  ||||||||| | |||||||||||    
T  10507899 gaggagtggactagcccacattgggtgaaccattataaatctttgtgtgttctttctctctttcttatactcttta 10507824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16334847 - 16334610
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16334847 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 16334748  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16334747 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 16334649  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16334648 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataa 16334610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1684682 - 1684408
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1684682 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgccgaggctt 1684583  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1684582 agagaatacaagattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 1684484  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  1684483 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 1684408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10002794 - 10002581
Alignment:
Q  87 gttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagat 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  10002794 gttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggt 10002695  T
Q  187 tatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctctt 286  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||  ||||    
T  10002694 tatctcaagtaccatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttccttctt 10002595  T
Q  287 ccctatactcttta 300  Q
    | ||||||||||||    
T  10002594 ctctatactcttta 10002581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 6433368 - 6433642
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6433368 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggctaacttagcaagaaggtgcaatcctgctgaggctt 6433467  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6433468 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 6433566  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  6433567 tggggagtggactagcctacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 6433642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24872653 - 24872406
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  24872653 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 24872555  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24872554 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 24872456  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24872455 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 24872406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 6422941 - 6423215
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   |  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6422941 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaatgttgtaaaagtctaagtggctaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 6423040  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6423041 agagaatacaggagtgtaattgttctggtgaaca-agattgtaagctgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 6423139  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  6423140 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 6423215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 49386810 - 49386562
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagt-tgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | |   ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||||||    
T  49386810 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcataaaggtgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcttgctgaggct 49386711  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  49386710 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcatgatttgagaagttatctcaaacatcatagtggaaaatctcacaagat 49386612  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49386611 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 49386562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 88 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10507222 - 10507010
Alignment:
Q  88 ttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagatt 187  Q
    |||| |||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  10507222 ttaatttagtaagaaggtgcagacctgttgaggcttagagaatacagggttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggttcaggatttgagaggtt 10507123  T
Q  188 atctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttc 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||  |||||||||     
T  10507122 atctcaagcatcatagtggaaacactcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccattataaatctttgtgtgttctttctctcttt 10507023  T
Q  288 cctatactcttta 300  Q
    | |||||||||||    
T  10507022 cttatactcttta 10507010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 11459773 - 11460047
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||   |   ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11459773 tctcatatagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaaagtgtaaaagtgtaagcgggtaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctta 11459872  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| | ||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11459873 gagaatacagttgttgtaattgtttaggtgaaca-atattgtaggatgcaggatttgagaggttatctcaaacatcatagtgaaaactctcataagattg 11459971  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||| |||  |  |||||||| |||||||||||    
T  11459972 tgagaagtggactaacccacaatgggtgaaccactataaactt-tgtgtgttcttcttctcttccttatactcttta 11460047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 300
Target Start/End: Original strand, 24773549 - 24773674
Alignment:
Q  175 gatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgt 274  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  24773549 gatttgaaaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttttgtgtgt 24773648  T
Q  275 tgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  24773649 tgattctctctttcctatactcttta 24773674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 137 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38817279 - 38817154
Alignment:
Q  137 ttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggact 236  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38817279 ttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaaacatcatagtggaaactctcacaagattgtgagaagtggact 38817180  T
Q  237 aacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  38817179 aacccacattgggtgaaccactataa 38817154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23503205 - 23503052
Alignment:
Q  116 tgaggcttagagaatacagag--ttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactct 213  Q
    |||||||||||||||||||    |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23503205 tgaggcttagagaatacagttgtttgtaattgttcagatgaaca-agattgtaaggtgcaaaatttgatagggtatcttaagcatcatagtgaaaactct 23503107  T
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttct 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23503106 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataactttct 23503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 683095 - 682966
Alignment:
Q  170 tgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctg 269  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||    
T  683095 tgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttg 682996  T
Q  270 tgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  682995 tgtgttctttctttcttctctatactcttt 682966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 183
Target Start/End: Original strand, 24794073 - 24794230
Alignment:
Q  27 tcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa-caaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    |||||| |||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |    
T  24794073 tcatctagctttagaggtactaaagtgttagtttgagctgaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgatgaggctaa 24794171  T
Q  125 gagaatacag-agttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgaga 183  Q
    || |||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  24794172 gataatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgaga 24794230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 303
Target Start/End: Original strand, 24814638 - 24814745
Alignment:
Q  196 catcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatact 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||  |  ||||||| || ||||    
T  24814638 catcatagtggaaaatctcacaagattgtgagtagtggactaacccacattgggtgaaccactataaattcatgtgtgttcttcttctcttctctttact 24814737  T
Q  296 ctttactt 303  Q
    ||||||||    
T  24814738 ctttactt 24814745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 207
Target Start/End: Original strand, 17734772 - 17734955
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaagg-tgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||   || ||||||| |||||||    
T  17734772 tctcatatagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaatatgtaagcctggtgaggct 17734870  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtgga 207  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17734871 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggcgaaca-aggttgtaaggtgtaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtgga 17734955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 207
Target Start/End: Original strand, 19036041 - 19036224
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaagg-tgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||   || ||||||| |||||||    
T  19036041 tctcatatagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaaatgtaagcctgatgaggct 19036139  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtgga 207  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19036140 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggcgaaca-aggttgtaaggtgtaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtgga 19036224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11043995 - 11043899
Alignment:
Q  169 gtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt 265  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||    
T  11043995 gtgcaggagttgagaggttatctcaagcattatagtgaaaattctcataagattgtgaggagtggattagcccatattgggtgaaccattataaatt 11043899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 51978003 - 51977929
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  51978003 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaggagtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 51977929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 4371989 - 4372064
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4371989 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 4372064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 4372082 - 4372157
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4372082 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 4372157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 4381730 - 4381805
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4381730 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 4381805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 4381823 - 4381898
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4381823 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 4381898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 10011638 - 10011572
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag-ttgagtttgtaaaagtctaagtggttaa 91  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10011638 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaagag-ttgtaaaagtctaagtggttaa 10011572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2488391 - 2488317
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  2488391 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaggagcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 2488317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2488479 - 2488405
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || ||||||||||| || |||||||||||    
T  2488479 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagagggtaacttagcaa 2488405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 13118960 - 13118886
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  13118960 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaagaagaaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 13118886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20744226 - 20744152
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  20744226 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaggagaaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 20744152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20744314 - 20744240
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| ||| |||||||    
T  20744314 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaaattagcaa 20744240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 25433655 - 25433729
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  25433655 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgaggtaaaggtgcaaaactctaagtgggtaacttagcaa 25433729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 51978091 - 51978022
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaactt 94  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| ||||||    
T  51978091 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaactt 51978022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20649621 - 20649569
Alignment:
Q  189 tctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccac 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  20649621 tctcaaacatcatagtggaaactctcaca--attgtaaggagtgcactaacccac 20649569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 4781964 - 4781926
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4781964 tctcatctagctttagaggtgctaaagtgttagtttgag 4781926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 4782052 - 4782014
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4782052 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgag 4782014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 13119048 - 13119010
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13119048 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgag 13119010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13430785 - 13430703
Alignment:
Q  189 tctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||| | || ||| |||||||||||||||| |||| || || |||||||||    ||||||||||||||| ||||    
T  13430785 tctcaagcatcagattgaaaattctcacaagattgtgaagagtagattagcccacattgaattaaccactataaatttttgtg 13430703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25510750 - 25510693
Alignment:
Q  199 catagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25510750 catattggaaaatctcacagtattgtgggaactggactaacccacattgggggaacca 25510693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29708542 - 29708514
Alignment:
Q  220 attgtgaggagtggactaacccacattgg 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29708542 attgtgaggagtggactaacccacattgg 29708514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 65)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 45554181 - 45554470
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45554181 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgggctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 45554280  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45554281 ctgagacttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctc 45554380  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45554381 acaagattgtgaggagtggactaacctacattgggggaaccactataaattctccgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 45554470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24539903 - 24539613
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24539903 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 24539804  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactct 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24539803 ctgaggcttagagaatacagatgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactct 24539704  T
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24539703 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactatttactt 24539613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 19586381 - 19586660
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19586381 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 19586480  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19586481 gagaatacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcatgatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagaatgt 19586580  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19586581 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 19586660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 300
Target Start/End: Original strand, 27989717 - 27990003
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989717 gaaaaacaaatctcatatagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 27989816  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactct 213  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989817 ctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactct 27989916  T
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  27989917 cacgagattgtgaggagtggactaacgcacattgggtgaaccactataaatttctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 27990003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 10416608 - 10416897
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10416608 gaaaaaaaaatatcatctagctttaggggtactaaaatgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagactg 10416707  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10416708 ctgaggcttagagaatatagagttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcatgatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctc 10416807  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  10416808 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctccgtgtgttgagtctctcttccctacattctttactt 10416897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 43984287 - 43984569
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43984287 aaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctg 43984386  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43984387 aggcttagagaatacaggattgtaattgttcaggtgaacgaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 43984486  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  43984487 agattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 43984569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 300
Target Start/End: Original strand, 14946743 - 14947020
Alignment:
Q  23 aatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14946743 aatctcatctagatttagggatactaaagtgttagtttgtgtaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaagtgcaagcctgctgaggct 14946842  T
Q  123 tagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatt 222  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14946843 tagagaatacaaggttgtaattgttcaggtgaataaagtttgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatt 14946942  T
Q  223 gtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  14946943 gtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 14947020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 23 - 300
Target Start/End: Original strand, 15374336 - 15374614
Alignment:
Q  23 aatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15374336 aatctcatctagatttagggatactaaagtgttagtttgtgtaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaatgtgcaagcctgctgaggct 15374435  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15374436 tagagaatacagttgttgtaattgttcaagtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 15374535  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  15374536 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatctctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 15374614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 70 - 303
Target Start/End: Original strand, 19800779 - 19801013
Alignment:
Q  70 ttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaag 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||      
T  19800779 ttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaga 19800878  T
Q  170 tgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tct 268  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19800879 tgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctct 19800978  T
Q  269 gtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19800979 gtgtgttgattctttcttccctatactccttactt 19801013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 8340842 - 8341118
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  |||    
T  8340842 tctcatctaattttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaaattgtaaaagtctaagtggttaacttatcaacaaggtgcaagcctgccaagattta 8340941  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8340942 gagaatacagaattgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 8341041  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8341042 --ggagtggaataacccacattgggggaaccactataaatatttgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 8341118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9534665 - 9534420
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9534665 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 9534566  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9534565 gagaatacagagttgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaactctcacaagattgt 9534467  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  9534466 gaggagtggactagcccacgttgggtgaaccactataattctctgtg 9534420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9544948 - 9544703
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544948 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 9544849  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9544848 gagaatacagagttgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaactctcacaagattgt 9544750  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  9544749 gaggagtagactagcccacgttgggtgaaccactataattctctgtg 9544703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Original strand, 42621726 - 42621963
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42621726 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaagtgcaagcctgctgaggctta 42621825  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42621826 gagaatacagagttgttattgttcagatgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaactctcacaagattgt 42621925  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||    
T  42621926 gaggagtggactagcacacgttgggtgaaccactataa 42621963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15988092 - 15987817
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15988092 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaagttgtaaaattctaagtgggtaacttagcaagaaggtgcaagcctgcttaggctta 15987993  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15987992 gagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-acattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcatagtagaaactctcacaagattg 15987894  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||  | |||||||||||||||||||||    
T  15987893 tgaggagtggactagctcacattgggtgaaccactataaatctttgtgtgttcttcctctcttccctatactcttta 15987817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14247933 - 14247654
Alignment:
Q  22 aaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggc 121  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  14247933 aaatctcatctaactttagtggtactaaagtgttagtttgagcaaagattgtaaaagtctaagtgggtatcttagcaagaaggtgcaagcctgctgatgc 14247834  T
Q  122 ttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaaga 220  Q
    ||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14247833 ttagagaattcaggtgttgtaattgttcaagtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaaaaga 14247734  T
Q  221 ttgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||  |||||||||  ||| ||||||||    
T  14247733 ttgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataaatatttgtgtgttccttctctcttttctacactcttta 14247654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5381240 - 5380966
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5381240 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 5381141  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5381140 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 5381042  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  5381041 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactttttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 5380966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5390878 - 5390604
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5390878 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 5390779  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5390778 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 5390680  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  5390679 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactttttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 5390604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 5927769 - 5928043
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5927769 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 5927868  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5927869 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 5927967  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  5927968 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 5928043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16131342 - 16131068
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16131342 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 16131243  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16131242 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 16131144  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  16131143 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 16131068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16141891 - 16141617
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16141891 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 16141792  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16141791 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 16141693  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  16141692 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 16141617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 26304189 - 26304463
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26304189 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 26304288  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26304289 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 26304387  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  26304388 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactttttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 26304463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26362629 - 26362355
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26362629 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 26362530  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26362529 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 26362431  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  26362430 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactttttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 26362355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 46497748 - 46498022
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46497748 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 46497847  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  46497848 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 46497946  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  46497947 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 46498022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 46508360 - 46508634
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46508360 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 46508459  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  46508460 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 46508558  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  46508559 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 46508634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7018834 - 7018593
Alignment:
Q  23 aatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  7018834 aatcacatctagctttaggggtactaaaatgttagtttgagaaaaggttgtaaaagtctaaatagttaacttagcaataaggtgcaagactgttgaggct 7018735  T
Q  123 tagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatt 222  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  7018734 tagagaatgcagagttgtaattgttgaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaccttcacaagatt 7018635  T
Q  223 gtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7018634 gtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaat 7018593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7034196 - 7033955
Alignment:
Q  23 aatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  7034196 aatcacatctagctttaggggtactaaaatgttagtttgagaaaaggttgtaaaagtctaaatagttaacttagcaataaggtgcaagactgttgaggct 7034097  T
Q  123 tagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatt 222  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  7034096 tagagaatgcagagttgtaattgttgaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaccttcacaagatt 7033997  T
Q  223 gtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7033996 gtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaat 7033955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 6535118 - 6535392
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6535118 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 6535217  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6535218 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 6535316  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  6535317 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 6535392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 6545439 - 6545713
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6545439 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 6545538  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6545539 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 6545637  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  6545638 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 6545713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 8501683 - 8501957
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8501683 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 8501782  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8501783 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 8501881  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  8501882 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 8501957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 8512153 - 8512427
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8512153 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 8512252  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8512253 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 8512351  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  8512352 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 8512427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11625792 - 11625518
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11625792 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaagttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 11625693  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11625692 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 11625594  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  11625593 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 11625518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 26307749 - 26308023
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26307749 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 26307848  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26307849 agagaatacaggagtgtaattgtttaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 26307947  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  26307948 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactttttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 26308023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 44897932 - 44898206
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44897932 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaagattgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 44898031  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44898032 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 44898130  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  44898131 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 44898206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 44908357 - 44908631
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44908357 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaagattgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 44908456  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44908457 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 44908555  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  44908556 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 44908631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 32099014 - 32099288
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32099014 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 32099113  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  32099114 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcattttagtggaaactctcacaggattg 32099212  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  32099213 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 32099288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 32109451 - 32109725
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32109451 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaaatctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 32109550  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32109551 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 32109649  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  32109650 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 32109725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5614882 - 5614634
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  5614882 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaaggtgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctactgaggct 5614783  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5614782 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 5614684  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5614683 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 5614634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2991315 - 2991045
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |  || ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2991315 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagtaaatattctaaaattctaagtgggtaacttagcaagaatgtgcaagcctgctgaggctta 2991216  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||  ||||||  ||| ||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2991215 ga--atacaggtgttataattgttcaagtgaacaaaggttgtaaagtgtaggatttgagaggttatctcaagaatcatagtggaaattctcacaatattg 2991118  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactc 296  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  2991117 tgagtagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatcttagtgtgttctttctctcttccctatactc 2991045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 9007579 - 9007854
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9007579 tctcatctagctttagaggtactaaagtgttagtttgagcagtaggtgtagaagtctaagtgggtaacttaacaagaaggtgcaagcctgctgaggctta 9007678  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9007679 gagaatacagttgttgtaattgttcaactgaaca-aggttgtcatgtgcatgatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctctcaagattg 9007777  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattc-tctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9007778 tgaggagtggactggcccacattggatgaaccactataaatctttgtgtgtt-attcttctcttccctatactcttta 9007854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 271
Target Start/End: Original strand, 41028283 - 41028480
Alignment:
Q  75 aaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgc 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  41028283 aaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatactgttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgc 41028381  T
Q  173 aggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41028382 aggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 41028480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13285085 - 13284888
Alignment:
Q  75 aaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgc 172  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  13285085 aaagtctaagtgggtaactgatcaagaaaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacaattgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgc 13284987  T
Q  173 aggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13284986 aggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccattataaatttctgtg 13284888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 271
Target Start/End: Original strand, 31825402 - 31825599
Alignment:
Q  75 aaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagag-ttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||| |||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  31825402 aaagtctaagtggttaacttagcaagaaaggtgtaagcttgctgtggctaagagaatacagttattgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgc 31825500  T
Q  173 aggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31825501 aggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaaaattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 31825599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 117 - 303
Target Start/End: Original strand, 12574909 - 12575095
Alignment:
Q  117 gaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctca 215  Q
    ||||||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12574909 gaggcttggagaatacagttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaactctca 12575007  T
Q  216 caagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12575008 caagatcgtgaggagtggagtaacccacattgggggaaccattataaatctctgtgtttttattctctattccatatactctttactt 12575095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12826756 - 12826562
Alignment:
Q  75 aaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgc 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| || |||||||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  12826756 aaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaatcctgctgaggctaagagaatacaattgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgc 12826658  T
Q  173 aggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttct 268  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12826657 aagatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagattgtgagtagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttct 12826562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 138 - 303
Target Start/End: Original strand, 12516011 - 12516175
Alignment:
Q  138 tgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggacta 237  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  12516011 tgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagtgcgggatttgagaggttatcttaaacatcatagtgggaactctcacaagatcgtgaggagtggagta 12516109  T
Q  238 acccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12516110 acccacattgggggaaccactataaatctgtgtgtgtttattctctcttccctatactctgtactt 12516175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 138 - 303
Target Start/End: Original strand, 12492206 - 12492370
Alignment:
Q  138 tgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggacta 237  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  12492206 tgtaattgtttaggtgaaca-agattgtaaagtgcagaatttgaaaggttatctcaaacatcatagtaggaactctcacaagatcgtgaggagtggagta 12492304  T
Q  238 acccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12492305 acccacattggaggaaccactataaatctctgtgtgtttattctctcttccctatactctgtactt 12492370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Original strand, 12770717 - 12770954
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaag-gtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||   |   ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||| |||  || ||||||||    
T  12770717 tctcatctagctataggggtactaaagtgttagtttgagcaaaaggtgtaaaagtttaagtgggtaacttagcaagaaaagtgtaagt-tgttgaggctt 12770815  T
Q  124 agagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatt 222  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12770816 agagaatataggtgttgtaactgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaagatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatt 12770914  T
Q  223 gtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||    
T  12770915 gtgaggagtggactagcccatgtcgggtgaaccactataa 12770954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 271
Target Start/End: Original strand, 42596066 - 42596263
Alignment:
Q  75 aaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgc 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || ||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||    
T  42596066 aaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctactaaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcacgtgaaca-aggttgtaaggtgc 42596164  T
Q  173 aggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42596165 aggatttgagaagttatctcaagcatcatagtgaaaaatctcacaaaactgtgaggagtagactgacccacattgggggaaccactataaatttttgtg 42596263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 159 - 300
Target Start/End: Original strand, 13130605 - 13130746
Alignment:
Q  159 agattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccact 258  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  13130605 agattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtgcaaactctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccact 13130704  T
Q  259 ataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||| | |||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  13130705 ataattctctgtgtgttctttccttcttctctatactcttta 13130746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 271
Target Start/End: Original strand, 12088072 - 12088206
Alignment:
Q  136 gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 235  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12088072 gttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcttattggaaaatctcacaagattgtgaggagtggac 12088170  T
Q  236 taacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  12088171 taacccacattgggtgaaccgctataaatttttgtg 12088206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Original strand, 12515869 - 12515977
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  12515869 tctcaactagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaagattgtaaaagactaagtgggtaacttagaaagaagctgcaagcatgccgaggctta 12515968  T
Q  125 gagaataca 133  Q
    |||||||||    
T  12515969 gagaataca 12515977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 233
Target Start/End: Original strand, 40703335 - 40703399
Alignment:
Q  169 gtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtgg 233  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40703335 gtgcaggaattgagaggttatctcaagcatcatagtggaaattctcacaagattgtgaggagtgg 40703399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 27989639 - 27989713
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27989639 tctcatctagctttagaggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 27989713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 134
Target Start/End: Original strand, 12492064 - 12492173
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  12492064 tctcaactagctttaggggtattaaagtgttagtttgagcaaagattgtaaaagactaagtgggtaacttagaaagaagctgcaagcatgccgaggctta 12492163  T
Q  125 gagaatacag 134  Q
    ||||||||||    
T  12492164 gagaatacag 12492173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24540069 - 24539995
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | | | || ||||||||||| || |||||||||||    
T  24540069 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaatgtgcaaaagtctaagagggtaacttagcaa 24539995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 45554015 - 45554089
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  45554015 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 45554089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 233
Target Start/End: Original strand, 40703188 - 40703246
Alignment:
Q  178 ttgagagattatctcaagca---tcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtgg 233  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40703188 ttgagaggttatctcaagcaacatcatagtggaaattctcacaagattgtgaggagtgg 40703246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 233
Target Start/End: Original strand, 40703579 - 40703643
Alignment:
Q  169 gtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtgg 233  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||    
T  40703579 gtgcaggaattgagaagttatctcaagcatcatagtggaaattcttacaggattgtgaggggtgg 40703643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 43984109 - 43984184
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43984109 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 43984184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 43984202 - 43984277
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43984202 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 43984277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 12515781 - 12515855
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  12515781 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttattttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 12515855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Original strand, 28392105 - 28392160
Alignment:
Q  201 tagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    ||||||| | |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28392105 tagtggataatctcacagtattgtggggactggactaacccacattgggggaacca 28392160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Original strand, 34143960 - 34144015
Alignment:
Q  201 tagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    ||||||| | |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34143960 tagtggataatctcacagtattgtggggactggactaacccacattgggggaacca 34144015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Original strand, 10416530 - 10416568
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10416530 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgag 10416568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Original strand, 45554103 - 45554141
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  45554103 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgag 45554141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19747681 - 19747437
Alignment:
Q  10 gagatgaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19747681 gagaagaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacctagcaacaaggtgcaa 19747582  T
Q  110 gcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19747581 gcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacaaattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaa 19747482  T
Q  210 ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaac 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19747481 ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaac 19747437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25038830 - 25038547
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25038830 aaacaaatctcatctagctttacgggtactatagtgttagtttgagttaagtttgtaaaaatctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgttg 25038731  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25038730 aggcttagagaatacagaattgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 25038631  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttac 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25038630 agattgtgaggagtggactaacacacattgggggaaccactataaatttctgtgtgttgattctctcttccatatactctttac 25038547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20317128 - 20316839
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20317128 gaaaaacaaatctcatctagttttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 20317029  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20317028 ctgaggcatagagaatacagaattgtaattgtttaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtgggaactctc 20316929  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20316928 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgttgattctttcttccctatactccttactt 20316839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20327610 - 20327321
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20327610 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 20327511  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20327510 ctgaggcatagagaatacataattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtgggaactctc 20327411  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20327410 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctatgtgttgattctttcttccctatactccttactt 20327321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25044042 - 25043759
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25044042 aaacaaatctcatctagctttacgggtactatagtgttagtttgagttaagtttgtaaaaatctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgccg 25043943  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 217  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25043942 aggcttagagaacacaaaattgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaagatgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcaca 25043843  T
Q  218 agattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttac 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25043842 agattgtgaggagtggactaacacacattgggggaaccactataaatttctgtgtgttgattctctcttccatatactctttac 25043759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41543266 - 41542977
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41543266 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagccta 41543167  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41543166 ctgaggcttagagaatacatagtagtaagtgttcatgtgaacatagattgtaaggtgcaggatttgaggggttatctcaaacatcatagtggaaactctc 41543067  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactat-aaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41543066 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccattataaaatctatgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 41542977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 301
Target Start/End: Original strand, 22961538 - 22961814
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22961538 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagtaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaactaggtgcaagcctgctgaggctta 22961637  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22961638 gagaatatagagtggtaagtgtttaggtgaacacagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaactctcacaagattgt 22961737  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22961738 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttatgtgtgttgattctctcttccttatactctttac 22961814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 20315065 - 20315344
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20315065 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 20315164  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20315165 gagaatacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaactctcacaagattgt 20315264  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20315265 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 20315344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 27066714 - 27066993
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27066714 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 27066813  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27066814 gagaatacataattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 27066913  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27066914 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 27066993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 49336383 - 49336661
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49336383 tctcatctagctttagggatactaaagtgttagtttgagcaaatattgtaaaagtctaagtggtcaacttagcaacatggtgcaagcctgctgaggctta 49336482  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49336483 gagaatacagaggtgtaagtgttcaggtgagcacagattgtaaggtacaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 49336582  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49336583 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatctctgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 49336661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18096354 - 18096068
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18096354 aaacaaatctcatctagctttaggggtactatagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctg 18096255  T
Q  118 aggcttagagaatacagagttgt--aagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctca 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18096254 aggcttagagaataca-agttgtgtaattgttcaggtgaacaaagattctaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcatagtgcaaactctca 18096156  T
Q  216 caagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18096155 caagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 18096068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 4951064 - 4951342
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4951064 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagcttgagcaaagattgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagtctgctgaggctta 4951163  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4951164 gagaatacaaaattgtaagtgttcaggtgaactcagattgtaaggtgcatgatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactttcacaagattgt 4951263  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4951264 gaggagtggactaacccacattaggggaaccactataaatttatgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 4951342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26192526 - 26192275
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||| || |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26192526 gaaaaacagatttcatctagctttaggggtactaaaatgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacagggtgcaagcctg 26192427  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactct 213  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192426 ctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactct 26192327  T
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192326 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt 26192275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 8540892 - 8541141
Alignment:
Q  22 aaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggc 121  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8540892 aaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagaaaaggttgtaaacgtctaagtagttaacttagcaacaaggtgcaagtctgctgatgc 8540991  T
Q  122 ttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  8540992 ttagagaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagatgttatctcaagcatcgtagtggaaactctcacaatct 8541091  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8541092 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaacctctataaatctctgtg 8541141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 8606131 - 8606380
Alignment:
Q  22 aaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggc 121  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8606131 aaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagaaaaggttgtaaacgtctaagtagttaacttagcaacaaggtgcaagtctgctgatgc 8606230  T
Q  122 ttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  8606231 ttagagaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagatgttatctcaagcatcgtagtggaaactctcacaatct 8606330  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8606331 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaacctctataaatctctgtg 8606380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25822591 - 25822346
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25822591 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaaattgtaagagtctaagtggttaacttatcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 25822492  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25822491 gagaatacagaggtgcaagtgttcaggtgagcacatattgtaaggtgcaagattagagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 25822392  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgt 270  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25822391 gaggagtggactaacccacattggaggaaccactataaatctctgt 25822346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 2117489 - 2117765
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2117489 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagtaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 2117588  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2117589 gagaatacagagttgtaatttttcaggtgaacaaggattgaaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaactctcacaagattgt 2117688  T
Q  225 gaggagtggacta-acccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  2117689 gagaagtggactagccccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttccttcttctctatactcttta 2117765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30549052 - 30548777
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30549052 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagtctgcttaggctta 30548953  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30548952 gagaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgttatgtgcaggacttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaactcttacaagattgt 30548853  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  30548852 gaggagtggactagcccacgttgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttccttcttctctatactcttta 30548777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2369849 - 2369574
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2369849 tctcatctaactttaggggtactaaagtgtttgtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctta 2369750  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||| | |||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2369749 gagaatacatatttgtaattgttcacgtgaacaaaaattgtaaggtgcatgattttagaggttatctaaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 2369650  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||||    
T  2369649 gaggagtggactagtccacattaggtgaaccactataaatctctgtgtgttctttctctcttctctatactcttta 2369574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Original strand, 42034848 - 42035094
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42034848 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcgaaggttgcaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctta 42034947  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42034948 gagaatacagaattgtaattgttctggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgaaaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 42035047  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  42035048 gaggagtggactagcccacgttgggtgaactactataattctctgtg 42035094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 300
Target Start/End: Original strand, 18384023 - 18384253
Alignment:
Q  70 ttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaag 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| ||||||||| |    
T  18384023 ttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacatggtgcaagcctgctcaggcttagagaatacaaagttgtaattgtttatgtgaacaaagattgtaagg 18384122  T
Q  170 tgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctg 269  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  18384123 tgtaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtagaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatatgtg 18384222  T
Q  270 tgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    || |||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  18384223 tgtgttctttctctcttccttatactattta 18384253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 21459262 - 21459536
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21459262 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 21459361  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21459362 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 21459460  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  21459461 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 21459536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Original strand, 25020124 - 25020376
Alignment:
Q  46 ctaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaagtg 145  Q
    |||||||||||| |||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  25020124 ctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagaggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggattgtaattg 25020223  T
Q  146 ttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacat 245  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25020224 ttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattgtgaggagtggactagcccacat 25020322  T
Q  246 tgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    |||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  25020323 tgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 25020376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 16155517 - 16155791
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16155517 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcttgctgaggctt 16155616  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16155617 agagaatacatgattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 16155715  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  16155716 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 16155791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 263
Target Start/End: Original strand, 37012986 - 37013224
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37012986 tctcaactagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtgggtaacttaacaagaaggtgcaagcctgctgaggctta 37013085  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37013086 gagaatacagttgatgtaattgttcaagtgaaca-agattgtaaagtgcaggatttgagaggttatctataacatcgtagtggaaactctcacaagattg 37013184  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37013185 tgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaa 37013224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 34823602 - 34823880
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  34823602 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcataatgtgtaaaagtctaagtggataacttagcaagaaggtgtaagcctgttgaggctta 34823701  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  34823702 gagaatacagttgttgtcattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggatttgagcggttatctcaaacatcatagtagaaactctcataagattg 34823800  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||| |||||||||||||||    
T  34823801 tgagaaatggactaacccacattggatgaaccactataaatttttgtgtgttcttcttctcttctctatactctttactt 34823880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 93 - 300
Target Start/End: Original strand, 13965749 - 13965955
Alignment:
Q  93 ttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13965749 ttagcaacaaggtgcaaacctgctgaggcttagagaatacatggttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctc 13965848  T
Q  193 aagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctat 292  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||    
T  13965849 aattatcatagtggaaactctctcaagattgtg-ggagtggactaacccacattggctgaaccactataaatctttgtgtgttctttctctcttccctat 13965947  T
Q  293 actcttta 300  Q
    ||||||||    
T  13965948 actcttta 13965955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1974113 - 1973866
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  1974113 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 1974015  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1974014 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 1973916  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1973915 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttatgtg 1973866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1988900 - 1988653
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  1988900 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 1988802  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1988801 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 1988703  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1988702 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttatgtg 1988653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Original strand, 12420179 - 12420322
Alignment:
Q  161 attgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactat 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12420179 attgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactat 12420278  T
Q  261 aaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12420279 aaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 12420322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 52949126 - 52948879
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtt-tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  52949126 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagtctgctgaggct 52949028  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |     
T  52949027 aagagaatacaattgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcagaatttgagaagttatctcaagcatcataatggaaaatctcacaaaac 52948929  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52948928 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 52948879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 271
Target Start/End: Original strand, 21793402 - 21793632
Alignment:
Q  44 tactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaag-gtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagtt-gta 141  Q
    ||||||||||||||||||||   |   ||||||||||||||||  |||||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  21793402 tactaaagtgttagtttgagcaaaaggtgtaaaagtctaagtgtgtaacttaataagaaaagtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggttttgta 21793501  T
Q  142 agt-gttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacc 240  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  21793502 aattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgtaggatttgagaggttatctaaagcatcatagtggaaactcccacaagattgtgaggagtggactaaac 21793601  T
Q  241 cacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  21793602 cacattgggtgaaccactataactttttgtg 21793632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 171 - 303
Target Start/End: Original strand, 25868126 - 25868259
Alignment:
Q  171 gcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctg 269  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  25868126 gcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactcttacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctgtg 25868225  T
Q  270 tgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25868226 tgtgttgattctctcttccctatactttttactt 25868259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21820890 - 21820651
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaag-gtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||    || | ||||||||  |||||  ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||    
T  21820890 tctcatctaacattaggggtactaaagtgttagtttgacaaaaggt-gtaaaagtagaagtgtgtaacttagcaagaaaagtgcaagcctggtgaggctt 21820792  T
Q  124 agagaatacagagttgt---aagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaaga 220  Q
    ||||||||||| |||||   || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21820791 agagaatacag-gttgtgtaaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagtatcatagtggaaactttcacaaga 21820693  T
Q  221 ttgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21820692 ttgggaggagtggactaacccacattgggtgtaccactataa 21820651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 25822686 - 25822605
Alignment:
Q  18 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25822686 aaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgaactgagtttgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 25822605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 265
Target Start/End: Original strand, 22957140 - 22957331
Alignment:
Q  75 aaagtctaagtggttaacttagc-aacaaggt-gcaagcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgc 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    ||||  ||||||| | ||||    |||||||||||    
T  22957140 aaagtctaagtgggtaacttagccaagaaggttgtaagcctgctgaggtttagagaatacaattgtgtatatgttcagattaacattt-ttgtaaagtgc 22957238  T
Q  173 aggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt 265  Q
    ||||| |||||   ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22957239 aggatctgagaaggtatctcaaataccatagtgcaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattggatgaaccactataaatt 22957331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 303
Target Start/End: Original strand, 34000586 - 34000777
Alignment:
Q  110 gcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggt-gaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaa 208  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||   | ||||| || ||||| | ||||||| || |||  |||| |||| || ||||||||||    
T  34000586 gcctgctgaagtttagagaatacag-gttgtaattgttccaatagaacaaag-ttgtacaatgcaggaattaagatgttatatcaaacaacatagtggaa 34000683  T
Q  209 actctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||  |  ||||||| |||||||||||||||    
T  34000684 actcttacaagattgtgacgagtagactaacccacattgggtgaaccactataaatta-tgtgtgttcttcttctcttctctatactctttactt 34000777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 233
Target Start/End: Original strand, 22892357 - 22892421
Alignment:
Q  169 gtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtgg 233  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22892357 gtgcaggaattgagaggttatctcaagcatcatagtggaaattctcacaagattgtgaggagtgg 22892421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21904581 - 21904518
Alignment:
Q  199 catagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  21904581 catagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccactataa 21904518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 41543354 - 41543270
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41543354 gaaaaaaaagtctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaggagtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 41543270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 90
Target Start/End: Original strand, 13965501 - 13965568
Alignment:
Q  23 aatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggtta 90  Q
    ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  13965501 aatctcatctaactttaggggttctaaagtgttagtttgagtaaaggttgtaaaagtctaagtggtta 13965568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Original strand, 22892615 - 22892674
Alignment:
Q  169 gtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgagg 228  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22892615 gtgcaggaattgagaagttatctcaagcatcatagtggaaattcttacaagattgtgagg 22892674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26192692 - 26192618
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  26192692 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 26192618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 233
Target Start/End: Original strand, 22892145 - 22892268
Alignment:
Q  109 agcctgctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttc-aggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtgga 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||| || ||||   ||||  || ||||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  22892145 agcctgctgaggcgtagagaatacag-gttgtaattgttctaagggaaca-aggttgttcggtgctagagttgagaagttatcttaagcatcatggtgga 22892242  T
Q  208 aactctcacaagattgtgaggagtgg 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  22892243 aattctcacaagattgtgaggagtgg 22892268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 298
Target Start/End: Original strand, 22959167 - 22959252
Alignment:
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||| |||  || |||||||  |||||||||    
T  22959167 cacaagattgtgaggagtggactaacccatattggatgaaccattataaattctctgtgtgttatttttctcttctttatactctt 22959252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Original strand, 37012812 - 37012884
Alignment:
Q  27 tcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  37012812 tcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 37012884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20317294 - 20317220
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  20317294 tctcatctacctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 20317220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19867831 - 19867790
Alignment:
Q  221 ttgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19867831 ttgtgaggagtggactaacccatattgggtgaaccactataa 19867790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19735766 - 19735715
Alignment:
Q  250 ggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19735766 ggaaccactataaaatctatgtgtgttgattctctcttccctatactcttta 19735715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20317206 - 20317168
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20317206 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgag 20317168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20327688 - 20327650
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20327688 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgag 20327650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20327776 - 20327702
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  20327776 tctcatctacctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtcttagtgggtaacttagcaa 20327702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26192604 - 26192566
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26192604 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgag 26192566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 300
Target Start/End: Original strand, 8761 - 9047
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8761 gaaaaacaaatctcatatagctttaggggtactaaagtgttagtttgagatgagtttgtaaaagactaaatggttaacttagcaataaggtgcaagcttg 8860  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8861 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcatgatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctc 8960  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8961 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactcttta 9047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 8595 - 8669
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | | | || ||||||||||| || |||||||||||    
T  8595 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaatgtgcaaaagtctaagagggtaacttagcaa 8669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28457 - 28168
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28457 gaaaaacaaatctcatctagctttcggggtactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtagttaactaaccaacaaggtgcaagcctg 28358  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357 ctgaggcttagaaaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctc 28258  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28257 acaagactgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctatgtgtgttgattttctcttccctttactctttactt 28168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 49660 - 49372
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  49660 gaaaaacaaatcccatctagctttaggggtactaaattgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaa-ttagcaacaaggtgcaagtctg 49562  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49561 ctgaggcttagaaaatatagagttgtatgtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctc 49462  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49461 acaagactgtaaggtgtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgttgattttctcttccctatactctttactt 49372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20499 - 20211
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20499 gaaaaacaaatctcatatagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 20400  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactct 213  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20399 ctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactct 20300  T
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactat-aaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaaatctctgcgtgttgattctctcttccctatactctttac 20211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20576 - 20503
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20576 tctcatctagctttaggggtattaa-gtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtataagtgggtaacttagcaa 20503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14893462 - 14893183
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14893462 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 14893363  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14893362 gagaatacagtattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgtaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 14893263  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14893262 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 14893183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31991079 - 31990800
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31991079 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 31990980  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31990979 gagaatacagaattgtaattgttcaggtgaacagagattgtaagatgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 31990880  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31990879 gaggagtagactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 31990800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14881112 - 14880833
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14881112 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtttaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 14881013  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14881012 gagaatacataattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcagaatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 14880913  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14880912 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 14880833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31998668 - 31998389
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31998668 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgccgaggctta 31998569  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31998568 gagaatacagaattgtaattgttcatgtgaacaaagattgtaagatgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaattctcacaagattgt 31998469  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31998468 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 31998389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20530308 - 20530019
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctg 114  Q
    |||||||| || |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20530308 gaaaaacagatttcatctagctttaggggtactaaaatgttagtttgagctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgtaagcctg 20530209  T
Q  115 ctgaggcttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctc 214  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20530208 ttgaggcttagagaatacagaattgtaattgttcaggagaacaaagattgtaaggtgcaggatttgataggttatctcaagcatcatagtggaaaatctc 20530109  T
Q  215 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  20530108 acaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgttgattctctttttcttatactctttactt 20530019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 28 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33773550 - 33773276
Alignment:
Q  28 catctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagag 127  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  33773550 catctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaaga--gctgaggcttagag 33773453  T
Q  128 aatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgag 227  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33773452 aatacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgag 33773353  T
Q  228 gagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33773352 gagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccttatactctttactt 33773276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 13675394 - 13675669
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13675394 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 13675493  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13675494 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 13675592  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  13675593 tgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 13675669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21987164 - 21986901
Alignment:
Q  36 tttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga 135  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21987164 tttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagg 21987065  T
Q  136 gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 235  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21987064 attgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 21986966  T
Q  236 taacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  21986965 taacccacattgggtgaaccactataaatttctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 21986901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21996698 - 21996435
Alignment:
Q  36 tttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga 135  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21996698 tttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagg 21996599  T
Q  136 gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 235  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21996598 attgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggac 21996500  T
Q  236 taacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  21996499 taacccacattgggtgaaccactataaatttctgtgtgttctttctctcttccctatactcttta 21996435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11429896 - 11429618
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11429896 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaaattgtaaaagtctaagtggtcaacttagcaacatggtgcaagcttgctgaggctta 11429797  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||  || || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11429796 gagaatacagatgtgcaactgttcaggtgagcacaaattgtaaggtgcaggatttgagtggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 11429697  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11429696 gaggagtggactaacccaccttgggggaaccactataaatctctgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 11429618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23014462 - 23014192
Alignment:
Q  21 caaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgagg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  23014462 caaatttcatctagctttagaagtactaaagtgttagtttgtgctgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttaacagcaaggtgcaagcctgttgagg 23014363  T
Q  121 cttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaaga 220  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23014362 cttaaagaatacagaattgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaaga 23014263  T
Q  221 ttgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||            ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23014262 ttgtgaggagttgactaacccacgttgggggaacca------------gtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 23014192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2689712 - 2689433
Alignment:
Q  22 aaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggc 121  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||     
T  2689712 aaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaagtttgtaaaagtctaagtgggtaactgagcaagaaggtgcaagtatgctgagga 2689613  T
Q  122 ttagagaataca-gagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaaga 220  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2689612 ttagagaatacatgtgttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaagatttgagaggttatctcaagcataatagtggaaactttcacaaga 2689513  T
Q  221 ttgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||  |||||||||| ||||||||||||    
T  2689512 ttgtgagaagtggactagcccacattgggcgagccactataaatctttgtgtgttctttctctcttcactatactcttta 2689433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9324461 - 9324187
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9324461 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 9324362  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9324361 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 9324263  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  9324262 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 9324187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Original strand, 21334932 - 21335202
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21334932 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 21335031  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21335032 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 21335130  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatact 295  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||    
T  21335131 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatact 21335202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21202261 - 21202024
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21202261 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 21202162  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21202161 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 21202063  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21202062 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataa 21202024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21212677 - 21212440
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21212677 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 21212578  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21212577 agagaatacaggagtgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 21212479  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21212478 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataa 21212440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26361717 - 26361520
Alignment:
Q  75 aaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgc 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||    
T  26361717 aaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgctcaggtgaaca-aggttgtaaggtgc 26361619  T
Q  173 aggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26361618 aggatttgagaagttatcttaagcatcatagtggaaaatctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 26361520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Original strand, 14438057 - 14438304
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagt-tgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | |   |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  14438057 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcataaaggtgtaaa-gtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 14438155  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| || ||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14438156 aagagaatacagttgttgtaattgatcaggtgaaca-aggttgtaaggtgaaggatttgagaagatatctaaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 14438254  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14438255 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 14438304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 300
Target Start/End: Original strand, 3988296 - 3988421
Alignment:
Q  175 gatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgt 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  3988296 gatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtgtgt 3988395  T
Q  275 tgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  3988396 tctttctctcttccctatactcttta 3988421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 169 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12900591 - 12900460
Alignment:
Q  169 gtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttct 268  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  12900591 gtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctct 12900492  T
Q  269 gtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  12900491 gtgtgttctttctctcttccctatactcttta 12900460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 145 - 264
Target Start/End: Original strand, 6760572 - 6760692
Alignment:
Q  145 gttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccaca 244  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6760572 gttcaggtgagcacaaattgtaaagtgcatgatttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaactctcacaagattgtaaggagtggactaacccaca 6760671  T
Q  245 ttgggg-gaaccactataaat 264  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  6760672 ttggggcgaaccactataaat 6760692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Original strand, 17269457 - 17269563
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17269457 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcttagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaaacctgctgaggatta 17269556  T
Q  125 gagaata 131  Q
    |||||||    
T  17269557 gagaata 17269563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 162 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12840744 - 12840635
Alignment:
Q  162 ttgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactata 261  Q
    |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12840744 ttgtaaggtacaggatttgagagggtatctcaagcatcataatggaaattctcacaagattgtgaggagtggattaacccacattgggtgaaccactata 12840645  T
Q  262 aatttctgtg 271  Q
    ||||| ||||    
T  12840644 aatttgtgtg 12840635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 178 - 300
Target Start/End: Original strand, 21461892 - 21462014
Alignment:
Q  178 ttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttga 277  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||      
T  21461892 ttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccactataattctctgtgtgttct 21461991  T
Q  278 ttctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||  ||||| ||||||||||||    
T  21461992 ttccttcttctctatactcttta 21462014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 178 - 303
Target Start/End: Original strand, 18537438 - 18537562
Alignment:
Q  178 ttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttga 277  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||| |||      
T  18537438 ttgagaggttatttcaagcattatagtggaaattctcacaagattgtgaggagtggattaacccacattggatgaaccactataaatta-tgtgtgttct 18537536  T
Q  278 ttctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||    
T  18537537 tattctcttccttatactctttactt 18537562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 300
Target Start/End: Original strand, 17269564 - 17269641
Alignment:
Q  223 gtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||    
T  17269564 gtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatcgctgtgtgttctttctctcttccctagactcttta 17269641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20530396 - 20530348
Alignment:
Q  15 gaaaaacaaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20530396 gaaaaacaaatctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgag 20530348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11429984 - 11429910
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  11429984 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagctaaaggtgcaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 11429910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 20530562 - 20530484
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaag 103  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |   || |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20530562 tctcatctagctttaggggtactgaagtgttagtttgagttaaaggtgcaaaagtctaagtgggtagcttagcaacaag 20530484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 157
Target Start/End: Original strand, 20852118 - 20852252
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa-caaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||   |   ||| ||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  20852118 tctcatctagctttagggacacttaagtgctagtttgagcaaaaggtgtcaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaagtgtaagcctgctgaggctt 20852217  T
Q  124 agagaataca-gagttgtaagtgttcaggtgaaca 157  Q
     ||||||| | | ||||||| | ||||||||||||    
T  20852218 ggagaatataggtgttgtaatttttcaggtgaaca 20852252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20530472 - 20530436
Alignment:
Q  27 tcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgag 63  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20530472 tcatctagctttagggatactaaagtgttagtttgag 20530436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 232
Target Start/End: Original strand, 37817847 - 37817892
Alignment:
Q  186 ttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtg 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37817847 ttatctcaagcatcatagt-gaaaatctcagaagattgtgaggagtg 37817892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 253
Target Start/End: Original strand, 33273244 - 33273296
Alignment:
Q  201 tagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaa 253  Q
    ||||||| | |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33273244 tagtggataatctcacagtattgtggggactggactaacccacattgggggaa 33273296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45489635 - 45489579
Alignment:
Q  201 tagtggaaactctcacaag-attgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  45489635 tagtggaaaatctcacaagcattgtggggactggactaacccacgttgggtgaacca 45489579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45498593 - 45498537
Alignment:
Q  201 tagtggaaactctcacaag-attgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  45498593 tagtggaaaatctcacaagcattgtggggactggactaacccacgttgggtgaacca 45498537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 274 - 1
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  274 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagactaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 175  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174 gagaatacaaaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaagatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 75  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  74 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctgtgtgttgattctctcttccctatactct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 19404 - 19683
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagaga-tactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19404 tctcatctagctttagcgggtactaaagtgttagcttgagcaaagattgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctactgaggctt 19503  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504 agagaatacataattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaggcatcatagtggaaactctcacaagattg 19603  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19604 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatctctgtgtgtttattctctcttccctatactctttactt 19683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 111202 - 110923
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111202 tctcatctagctttaggggtactatagtgttagtttgagcaaaggttataaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 111103  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  111102 gagaatacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtgaaaaatctcacaagattgt 111003  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  111002 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctctttgtgtttattctctcttccatatactctttactt 110923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 74161 - 73886
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74161 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 74062  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  74061 gagaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggttcaggacttgagagattatctcaagcaccatagtggaaactctcacaagattgt 73962  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  73961 gaggagtggactaacccacgttgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttccttcttctctatactcttta 73886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 300
Target Start/End: Original strand, 1 - 270
Alignment:
Q  31 ctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaat 130  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 ctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaat 100  T
Q  131 acagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggag 230  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 acagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaactctcacaagattgtgaggag 200  T
Q  231 tggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  201 tggactagcccacgttgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttccttcttctctatactcttta 270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 55278 - 55041
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55278 tctcatctagctttaggggtattaaagtattagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagtctgctgaggctta 55179  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55178 gagaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaactctcacaagattgt 55079  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  55078 gaggagtggactagcccacgttgggtgaaccactataa 55041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 92312 - 92037
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  92312 tctcatctagatttagaggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtagttaacttagcaacaaggtgcaagcctactgaggctta 92213  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  92212 gagaatacagaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgataggttatctcaagcaccatagtggaaactctcacaagattgt 92113  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||  ||||| || |||||||||    
T  92112 gaggagtggactagctcacgttgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttccttcttctctttactcttta 92037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 233423 - 233149
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  233423 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 233324  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  233323 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 233225  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  233224 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 233149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 147341 - 147616
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  147341 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttaagcaaaggttgtaaaagtctaagtagttaacttagcaggaaggtgcaagcatgctgaggctta 147440  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||    
T  147441 gagaatacataattgtaattgttcagttgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaaacatcatagtaataactctcagaagattgt 147540  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | | |||| | |  |||| ||||| ||||||||||||    
T  147541 gaggagtggactaaccgacattggatgaaccactataattctttgtgtgctctttctttcttctctatactcttta 147616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 300
Target Start/End: Original strand, 8742 - 9020
Alignment:
Q  22 aaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggc 121  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  8742 aaatctcatctagcttgaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtagttaacttagcaacaaggtgcaagtcttctgaggc 8841  T
Q  122 ttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  8842 ttagagaatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtgaggtgcaggacttgagaggttatctcaaacaccatagtgaaaactctcacaagat 8941  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||  ||||| |||| |||||||    
T  8942 tgtgaggagtggactagtccacgttgggtgaaccactataattctctgtgtgttctttccttcttctctattctcttta 9020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1391 - 1154
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1391 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagaaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacgtagcaacaaggtgcaaggctgttgaggctta 1292  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1291 tataatacagagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaagatgcaggacttcagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 1192  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
     |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  1191 taggagtggactatcccacgttgggtgaaccactataa 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 128 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 395190 - 395014
Alignment:
Q  128 aatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  395190 aatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtccaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgag 395091  T
Q  228 gagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  395090 gagtggactaacccacattgggggaaccactataaattctttgtgtgttgattctctcttccctatactctttactt 395014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7277 - 7003
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7277 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 7178  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7177 agagaatacaggagtgtaattgttcaggagaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 7079  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttt 299  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||    
T  7078 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataactctttgtgtgttctttctttcttctctatactcttt 7003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 440 - 165
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  440 tctcttctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaggttgtaaatgtctaagtggttaacttagaaacaaggtgcaagccagctgaacctta 341  T
Q  125 gagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 224  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  340 gagaatacagagttgtaattgtttaggtgaacaaatattgtaagatgcaggacttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgt 241  T
Q  225 gaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||| | |||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  240 gaggagttgactagcccacgttgggtgaaccacaataattctctgtgtgttctttccttcttctctatactcttta 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18798 - 18560
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18798 tctcatctagcttttagaggtcctaaagtgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaggctt 18699  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18698 agagaatacaagattgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcgggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 18599  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18598 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataa 18560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 309454 - 309217
Alignment:
Q  25 tctcatctagcttt-agagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  309454 tctcatctagcttttagaggtcctaaaatgttaggttgagcaaaggttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaagaaggtgcaagcctgttgaggctt 309355  T
Q  124 agagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  309354 agagaatacaggattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaactctcacaggattg 309256  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  309255 tggggagtggactagcccacattgggtgaaccactataa 309217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 217295 - 217569
Alignment:
Q  28 catctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaa--gtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttag 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||    
T  217295 catctagctttagaggtactaaagtgttagtttgagtaaaggttgtaaaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaggtgcaagccagttgtggcttag 217394  T
Q  126 agaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtg 225  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||||||| || ||||||  |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  217395 agaatacatggttataattgttcaggtgaacaaaggttgtaagatgcaggatttaagaggttatctcaagtatcatagttgaaactctcataggattgtg 217494  T
Q  226 aggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| | |||| |||  |||| |||||| |||||||||||    
T  217495 aggagtggaccagcccacattaggtgaaccactataaatatttgtgtgttctttctttcttccttatactcttta 217569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2739 - 2500
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggctta 124  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2739 tctcgtctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaagatgtaaaagtctaagtgggtcacttagcaagaaggtgcaatcctgctgaggctta 2640  T
Q  125 gagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 223  Q
    ||||||||||  | ||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2639 gagaatacagttgatgtaattgttcagttgaaca-acattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattg 2541  T
Q  224 tgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaat 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||    
T  2540 tgaggagtggactagcccacattgaatgaaccactataaat 2500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2827 - 2753
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2827 tctcatctagctttaggtgtactaaagtggtagtttgagttgaaggtgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaa 2753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2915 - 2841
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaa 99  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2915 tctcatctagctttacgggtactaaagtggtagtttgagctgaaggtgtaaaagtctaagtgggtaactcagcaa 2841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0591
Description:

Target: scaffold0591; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 300
Target Start/End: Original strand, 1579 - 1859
Alignment:
Q  22 aaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaa-gtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgagg 120  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1579 aaatctcatttagctttaggggtactaaagtgttagtttgagtaaaggttgtaaaaagtctacgcgggtaacttagcaagaaggtgcaagcctgctgaag 1678  T
Q  121 cttagagaataca-gagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaag 219  Q
    ||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1679 cttagagaatacatgtgctgtaattgttcaagtgaacaaagattgcaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaag 1778  T
Q  220 attgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| | |||| |||  |  |||||||| |||||||||||    
T  1779 attgtgaggagttgactagcccacattcagtgaaccactataaatctttgtgtgttcttcttctcttccttatactcttta 1859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 178 - 300
Target Start/End: Original strand, 1 - 123
Alignment:
Q  178 ttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttga 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||      
T  1 ttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccactataattctctgtgtgttct 100  T
Q  278 ttctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  101 ttctctcttccctatactcttta 123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Original strand, 6403 - 6650
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgta-aaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  6403 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaag-gtataaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 6501  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6502 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 6600  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6601 tgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttatgtg 6650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 271
Target Start/End: Original strand, 10235 - 10432
Alignment:
Q  75 aaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgc 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  10235 aaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgc 10333  T
Q  173 aggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10334 aggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttatgtg 10432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 20560 - 20766
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgta-aaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  20560 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaag-gtataaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 20658  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20659 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 20757  T
Q  222 tgtgaggag 230  Q
    |||||||||    
T  20758 tgtgaggag 20766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 303
Target Start/End: Original strand, 8127 - 8334
Alignment:
Q  97 caacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagt-tgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||||||| |||||||||     
T  8127 caacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatgttgtgtaattgttcaagtgaacaaggattgtaaggtgccagatttgagaggttatctcaaa 8226  T
Q  196 catcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatact 295  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  8227 catcataatggaaactctcataagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatctctatttgttgattctctcttccctatact 8326  T
Q  296 ctttactt 303  Q
    ||||||||    
T  8327 ctttactt 8334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Original strand, 8072 - 8127
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtc 80  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  8072 tctcatctagctttagggctactaaagtgttagcttgagctgaggttgtaaaagtc 8127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28212 - 27934
Alignment:
Q  22 aaatctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgcaagcctgctgaggc 121  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||   || |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  28212 aaatctcatctagctttaggcgtagtaaagtgctagtttgagcaaagcttgtaaaattctaagtgggtaacttagcaagaaggtgcgagcctactgaggc 28113  T
Q  122 ttagagaatacagagttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28112 ttaaagaatacagggttgtaattactcaggtgaacaaagattgtaagatgcaggatttgaagggttatgtcaagcatcatagtggaaactctgacaagat 28013  T
Q  222 tgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||| | |||| |||  ||||||||||| |||||||||||    
T  28012 tgcgaggagtggactagcccaaattggatgaagcactataaatctttgtgtgttatttctctcttccttatactcttta 27934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 16075 - 16354
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggtta----acttagcaacaaggtgcaagcctgctgagg 120  Q
    |||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||    ||||||||| |||| ||||||||| ||| |    
T  16075 tctcatctagatttaggagtaccaaagtgttagtttgagtaaaggttgtaaaagtctaagtgggtacgtaacttagcaagaaggagcaagcctgttgacg 16174  T
Q  121 cttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaag 219  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16175 cttagagaatacagttgttgtacttgttcagctgaaca-agattgtaaggtgcaggaattgagaggttatctcaagcatcataggggaaactctcacaag 16273  T
Q  220 attgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| | |||| |||  |  ||||||||||||||||||||    
T  16274 attgtgaggagtggactagcccatattgggttaaccactataaatctttgtgtgttcttcttctcttccctatactcttta 16354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 55274 - 55495
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaag-gtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  55274 tctcatctagttttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaatgtgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaagtgcaagcctgctgaggctt 55373  T
Q  124 agagaatacagagt-tgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatt 222  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||    
T  55374 agagaatacaggttgtgtaattgttcaggtgaacgtagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaactctcac---att 55470  T
Q  223 gtgaggagtggactaacccacattg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  55471 gtgaggagtggactaacccacattg 55495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 59223 - 59444
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaag-gtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  59223 tctcatctagttttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaatgtgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaagtgcaagcctgctgaggctt 59322  T
Q  124 agagaatacagagt-tgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatt 222  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||    
T  59323 agagaatacaggttgtgtaattgttcaggtgaacgtagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaactctcac---att 59419  T
Q  223 gtgaggagtggactaacccacattg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  59420 gtgaggagtggactaacccacattg 59444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 60651 - 60872
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaag-gtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  60651 tctcatctagttttaggggtactaaagtgttagtttgagcaaaatgtgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaagtgcaagcctgctgaggctt 60750  T
Q  124 agagaatacagagt-tgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatt 222  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||    
T  60751 agagaatacaggttgtgtaattgttcaggtgaacgtagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaactctcac---att 60847  T
Q  223 gtgaggagtggactaacccacattg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  60848 gtgaggagtggactaacccacattg 60872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6443 - 6205
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaag-gtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||   |   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||    
T  6443 tctcatttagctttaggggtactaaagtgttagtctgagcaaaaggtgtaaaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaagtgtaagcctgctgaggttt 6344  T
Q  124 agagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagatt 222  Q
     ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6343 tgagaatacaggtgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgtaggatttgagaggttatctcaagcattatagtggaaactctcacaagatt 6245  T
Q  223 gtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  6244 gtgaggagtggactagcccacattggatgaaccactataa 6205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Original strand, 11919 - 12158
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaag-gtgcaagcctgctgaggctt 123  Q
    ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||    || | ||||||||  |||||  ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||    
T  11919 tctcatctaacattaggggtactaaagtgttagtttgacaaaaggt-gtaaaagtagaagtgtgtaacttagcaagaaaagtgcaagcctggtgaggctt 12017  T
Q  124 agagaatacagagttgt---aagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaaga 220  Q
    ||||||||||| |||||   || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12018 agagaatacag-gttgtgtaaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagtatcatagtggaaactttcacaaga 12116  T
Q  221 ttgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataa 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12117 ttgggaggagtggactaacccacattgggtgtaccactataa 12158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30926 - 30814
Alignment:
Q  188 atctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgcgttgattctctcttc 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  30926 atctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtgtgttctttctctcttc 30827  T
Q  288 cctatactcttta 300  Q
    |||||||||||||    
T  30826 cctatactcttta 30814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0764 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0764
Description:

Target: scaffold0764; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 206 - 1
Alignment:
Q  25 tctcatctagctttagagatactaaagtgttagtttgagttgagtttgta-aaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  206 tctcatctagctttaggggtactaaagtgttagtttgagcagaaag-gtataaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcctgctgaggct 108  T
Q  123 tagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagat 221  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  107 aagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagat 9  T
Q  222 tgtgagga 229  Q
    ||||||||    
T  8 tgtgagga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Original strand, 19725 - 19848
Alignment:
Q  147 tcaggtgaacacagattgtaaagtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacatt 246  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19725 tcaggtgaaca-aggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaatctcacaagattgtgaggagtggactaacccacatt 19823  T
Q  247 gggggaaccactataaatttctgtg 271  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  19824 gggtgaaccactataaatttctgtg 19848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39953 - 39727
Alignment:
Q  75 aaagtctaagtggttaacttagcaacaa-ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagag-ttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagtgc 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||| || |||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39953 aaagtctaagtgggtaacttagcaagaaaggtgtaagcatgttgaggcttagagaatatagttattgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaggtgc 39855  T
Q  173 aggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtgc 272  Q
      |||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |     
T  39854 gtgatttgagaagttatctcaagcatcatcgtggaaaaactcacaagattgtgagaaggggactaacccacattgggtgaaccactataagtttctgcgt 39755  T
Q  273 gttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    |||  || ||||||| || |||||||||    
T  39754 gttctttttctcttctctttactcttta 39727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 71 - 271
Target Start/End: Original strand, 950 - 1149
Alignment:
Q  71 tgtaaaagtctaagtggttaacttagcaacaaggtgc-aagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaa 168  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||| || |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  950 tgtaaaagtctaagtggg--atttagcaagaaagtgctaagcctgttgaggcttacagaatatagttgttgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaag 1046  T
Q  169 gtgcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttct 268  Q
    | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || || ||| | ||||||||||||||||||    
T  1047 gcgcaggagttgagagggtatctcaagcatcatagtggaaattctcacaagattgtgaggaatggattagcctacgttgagtgaaccactataaatttct 1146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 196777 - 196550
Alignment:
Q  75 aaagtctaagtggttaacttagc-aacaaggt-gcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gt-tgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaagt 170  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||  ||||||| | ||||    |||||||||    
T  196777 aaagtctaagtgggtaacttagccaagaaggttgcaagcctgccgaggcttagagaatacaattgtgtgtatatgttcagattaacattt-ttgtaaagt 196679  T
Q  171 gcaggatttgagagattatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgt 270  Q
    | ||||| |||||   ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  196678 gaaggatctgagaaggtatctcaaataccatagtgtaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaa-ctctgt 196580  T
Q  271 gcgttgattctctcttccctatactcttta 300  Q
    | |||  || |||||||| |||||||||||    
T  196579 gtgttatttttctcttccttatactcttta 196550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 190028 - 189943
Alignment:
Q  214 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatt-tctgtgcgttgattctctcttccctatactctt 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||  |||||||||    
T  190028 cacaagattgcgaggagtggactaacccatattgggtgaaccactataaattctctgtgtgttatttttctcttctttatactctt 189943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 186 - 266
Target Start/End: Original strand, 67014 - 67094
Alignment:
Q  186 ttatctcaagcatcatagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaattt 266  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  67014 ttatctgaagcatcatagtgaaaattctcacaagattgtgaggagtgtactaacccacattgagtgaaccactatatattt 67094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1441 - 1386
Alignment:
Q  201 tagtggaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    ||||||| | |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1441 tagtggataatctcacagtattgtggggactggactaacccacattgggggaacca 1386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 303
Target Start/End: Original strand, 4 - 34
Alignment:
Q  273 gttgattctctcttccctatactctttactt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4 gttgattctctcttccctatactctttactt 34  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 256
Target Start/End: Original strand, 163892 - 163928
Alignment:
Q  220 attgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 256  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  163892 attgtggggactggactaacccacattgggggaacca 163928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University