View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8294A_low_196 (Length: 253)

Name: NF8294A_low_196
Description: NF8294A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8294A_low_196
NF8294A_low_196
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (6-253)||(14991-15241)
scaffold0328 (65-199)||(13048-13182)
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (6-199)||(9238975-9239171)
chr6 (6-199)||(34147346-34147542)
chr6 (6-199)||(34159962-34160158)
chr6 (6-199)||(11448871-11449067)
chr6 (6-199)||(15360099-15360295)
chr6 (6-199)||(3222637-3222831)
chr6 (13-199)||(654147-654336)
chr6 (6-199)||(21982322-21982517)
chr6 (6-199)||(21148512-21148707)
chr6 (6-199)||(1344937-1345131)
chr6 (6-199)||(9843938-9844134)
chr6 (6-199)||(28672067-28672263)
chr6 (6-199)||(5360072-5360268)
chr6 (18-199)||(17081055-17081239)
chr6 (14-199)||(11840909-11841096)
chr6 (46-174)||(12390465-12390596)
chr6 (18-199)||(9208264-9208448)
chr6 (18-191)||(11007177-11007353)
chr6 (6-119)||(12591637-12591750)
chr6 (17-199)||(14212903-14213078)
chr6 (12-199)||(9690639-9690829)
chr6 (6-112)||(13753240-13753346)
chr6 (6-199)||(33499474-33499671)
chr6 (6-89)||(22576067-22576150)
chr6 (30-174)||(17149482-17149629)
chr6 (12-191)||(33718478-33718649)
chr6 (104-199)||(15730496-15730594)
chr6 (29-191)||(17706328-17706481)
chr6 (134-199)||(14504083-14504148)
chr6 (23-112)||(28968133-28968222)
chr6 (138-175)||(32596211-32596248)
chr6 (130-198)||(10377843-10377911)
chr6 (6-97)||(8479312-8479403)
chr6 (135-186)||(27866217-27866268)
chr6 (118-190)||(21903629-21903703)
chr6 (6-157)||(31039020-31039173)
chr6 (166-199)||(4797260-4797293)
chr6 (134-199)||(17225797-17225862)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (7-199)||(26174114-26174309)
chr3 (6-199)||(52821637-52821832)
chr3 (6-199)||(53424178-53424373)
chr3 (12-199)||(15566501-15566690)
chr3 (6-199)||(35492911-35493107)
chr3 (6-199)||(30807154-30807350)
chr3 (6-199)||(8456151-8456347)
chr3 (6-199)||(45529756-45529951)
chr3 (6-199)||(46576348-46576544)
chr3 (6-199)||(40133450-40133646)
chr3 (6-199)||(49258263-49258459)
chr3 (6-199)||(21362943-21363139)
chr3 (6-199)||(25289716-25289911)
chr3 (6-191)||(25379761-25379949)
chr3 (6-191)||(30257624-30257812)
chr3 (6-199)||(48977388-48977584)
chr3 (6-199)||(45272417-45272613)
chr3 (6-191)||(18176896-18177084)
chr3 (18-199)||(53233912-53234095)
chr3 (23-199)||(10190743-10190922)
chr3 (6-199)||(31537839-31538035)
chr3 (6-199)||(34492576-34492772)
chr3 (23-199)||(10083820-10083999)
chr3 (27-199)||(39041853-39042028)
chr3 (6-199)||(40940825-40941021)
chr3 (13-156)||(26108299-26108445)
chr3 (12-199)||(32151430-32151620)
chr3 (12-182)||(29915288-29915460)
chr3 (12-182)||(29964441-29964613)
chr3 (6-199)||(52455650-52455846)
chr3 (6-199)||(7485532-7485722)
chr3 (46-199)||(8097280-8097436)
chr3 (6-172)||(7470244-7470412)
chr3 (6-199)||(4462633-4462828)
chr3 (105-199)||(24165716-24165812)
chr3 (58-199)||(24407313-24407457)
chr3 (58-191)||(2511306-2511442)
chr3 (30-191)||(33398477-33398641)
chr3 (35-199)||(1692863-1693029)
chr3 (12-188)||(53288725-53288903)
chr3 (133-199)||(53848435-53848501)
chr3 (6-199)||(25344059-25344254)
chr3 (29-199)||(8958036-8958210)
chr3 (12-191)||(19857058-19857239)
chr3 (62-199)||(1178228-1178366)
chr3 (6-191)||(11390602-11390790)
chr3 (13-92)||(9853623-9853702)
chr3 (59-199)||(17579136-17579280)
chr3 (105-199)||(54475780-54475877)
chr3 (38-174)||(51532821-51532960)
chr3 (6-191)||(4252405-4252593)
chr3 (133-191)||(26158941-26158999)
chr3 (133-199)||(48105007-48105073)
chr3 (137-191)||(55371303-55371357)
chr3 (138-199)||(4048085-4048146)
chr3 (139-199)||(50731238-50731298)
chr3 (139-199)||(50781556-50781616)
chr3 (6-90)||(55287803-55287887)
chr3 (60-199)||(48972715-48972854)
chr3 (6-174)||(50582992-50583162)
chr3 (66-199)||(6041671-6041809)
chr3 (58-174)||(34844430-34844548)
chr3 (152-199)||(3747730-3747777)
chr3 (12-119)||(38732972-38733079)
chr3 (6-92)||(9842921-9843006)
chr3 (69-169)||(1242036-1242139)
chr3 (134-199)||(25017620-25017684)
chr3 (118-175)||(33793567-33793624)
chr3 (20-96)||(49167070-49167146)
chr3 (58-100)||(11092144-11092186)
chr3 (6-51)||(16140297-16140342)
chr3 (118-170)||(26599429-26599481)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (6-199)||(7275281-7275477)
chr7 (6-199)||(22119892-22120088)
chr7 (6-199)||(40542911-40543107)
chr7 (6-191)||(7175871-7176059)
chr7 (6-199)||(2751275-2751471)
chr7 (12-199)||(21835161-21835351)
chr7 (6-199)||(21217834-21218030)
chr7 (12-199)||(11997859-11998049)
chr7 (6-199)||(2103059-2103253)
chr7 (6-199)||(10091192-10091387)
chr7 (6-199)||(18044111-18044307)
chr7 (19-191)||(22703503-22703678)
chr7 (6-199)||(28089820-28090019)
chr7 (6-199)||(17196951-17197147)
chr7 (12-199)||(23012509-23012699)
chr7 (44-199)||(654706-654863)
chr7 (6-199)||(2344303-2344499)
chr7 (6-191)||(17212057-17212245)
chr7 (6-199)||(27312156-27312352)
chr7 (6-199)||(27704006-27704201)
chr7 (12-199)||(28950878-28951071)
chr7 (12-199)||(42913514-42913704)
chr7 (6-199)||(27009363-27009560)
chr7 (42-199)||(16374034-16374194)
chr7 (29-199)||(31273941-31274113)
chr7 (6-199)||(22638296-22638488)
chr7 (6-199)||(19421235-19421431)
chr7 (58-199)||(29861726-29861870)
chr7 (6-131)||(7799902-7800029)
chr7 (12-191)||(39145661-39145843)
chr7 (6-199)||(31197595-31197790)
chr7 (6-199)||(32849595-32849791)
chr7 (6-116)||(13332510-13332620)
chr7 (86-199)||(3851841-3851957)
chr7 (34-199)||(36772304-36772471)
chr7 (73-199)||(23092167-23092296)
chr7 (6-196)||(43785303-43785496)
chr7 (16-97)||(22299863-22299944)
chr7 (6-189)||(25333423-25333593)
chr7 (58-199)||(41907515-41907658)
chr7 (6-74)||(23854400-23854468)
chr7 (6-199)||(31712903-31713092)
chr7 (6-119)||(42814868-42814981)
chr7 (12-187)||(9683836-9684014)
chr7 (6-199)||(23330740-23330936)
chr7 (6-199)||(28646973-28647169)
chr7 (12-199)||(22696330-22696521)
chr7 (105-191)||(8943410-8943500)
chr7 (12-119)||(9718071-9718178)
chr7 (30-154)||(14199713-14199839)
chr7 (6-76)||(21370601-21370671)
chr7 (121-199)||(33137826-33137904)
chr7 (6-199)||(21574103-21574300)
chr7 (6-97)||(40332103-40332194)
chr7 (30-191)||(22643351-22643515)
chr7 (6-50)||(577683-577727)
chr7 (6-97)||(8435801-8435892)
chr7 (6-92)||(12211646-12211732)
chr7 (18-56)||(28003852-28003890)
chr7 (134-191)||(1766153-1766210)
chr7 (70-119)||(6491675-6491724)
chr7 (81-174)||(21373789-21373885)
chr7 (145-198)||(30345511-30345564)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (6-199)||(8484662-8484858)
chr5 (6-199)||(11926502-11926699)
chr5 (7-191)||(38684209-38684395)
chr5 (6-199)||(15641107-15641302)
chr5 (6-199)||(27498732-27498928)
chr5 (6-199)||(32059441-32059637)
chr5 (23-199)||(19456212-19456389)
chr5 (30-199)||(18207231-18207403)
chr5 (6-199)||(30485828-30486024)
chr5 (12-191)||(33709512-33709692)
chr5 (6-191)||(13038464-13038651)
chr5 (6-191)||(13108459-13108646)
chr5 (17-199)||(37495058-37495250)
chr5 (6-199)||(34310142-34310338)
chr5 (12-199)||(31287947-31288137)
chr5 (11-191)||(42193490-42193671)
chr5 (6-199)||(19145413-19145608)
chr5 (14-199)||(7085627-7085815)
chr5 (6-191)||(36954818-36955006)
chr5 (12-199)||(6014281-6014471)
chr5 (12-191)||(11464917-11465098)
chr5 (6-199)||(4603777-4603973)
chr5 (6-191)||(23270531-23270719)
chr5 (12-191)||(10869574-10869756)
chr5 (6-155)||(25586932-25587085)
chr5 (6-199)||(38630980-38631158)
chr5 (12-178)||(15971144-15971313)
chr5 (23-199)||(12398449-12398628)
chr5 (6-191)||(27487563-27487752)
chr5 (6-199)||(22392701-22392884)
chr5 (6-199)||(25750614-25750808)
chr5 (6-117)||(1827616-1827727)
chr5 (6-199)||(12317156-12317347)
chr5 (6-156)||(15931059-15931211)
chr5 (133-199)||(22693065-22693131)
chr5 (81-191)||(35425088-35425201)
chr5 (86-199)||(9659312-9659428)
chr5 (118-199)||(41351105-41351186)
chr5 (58-187)||(5049189-5049320)
chr5 (6-199)||(34049822-34050007)
chr5 (12-199)||(21236363-21236553)
chr5 (133-191)||(13659254-13659312)
chr5 (134-189)||(5067392-5067447)
chr5 (16-199)||(26009265-26009451)
chr5 (6-96)||(37397713-37397803)
chr5 (6-199)||(930487-930682)
chr5 (23-114)||(7151346-7151437)
chr5 (136-199)||(36895558-36895621)
chr5 (149-199)||(10631290-10631340)
chr5 (20-199)||(28614487-28614667)
chr5 (6-73)||(5067301-5067368)
chr5 (6-56)||(3715056-3715106)
chr5 (23-199)||(17015420-17015593)
chr5 (12-97)||(40330639-40330724)
chr5 (140-199)||(41084120-41084179)
chr5 (58-199)||(31206294-31206439)
chr5 (7-44)||(19230476-19230513)
chr5 (138-191)||(42006868-42006921)
chr5 (139-199)||(8821120-8821180)
chr5 (135-199)||(25548535-25548599)
chr5 (139-199)||(33737878-33737937)
chr5 (6-50)||(42006793-42006837)
[»] chr1 (68 HSPs)
chr1 (12-199)||(7766728-7766918)
chr1 (6-199)||(4621238-4621434)
chr1 (6-191)||(24674393-24674581)
chr1 (6-199)||(24122023-24122219)
chr1 (6-199)||(46607810-46608006)
chr1 (6-199)||(15059403-15059599)
chr1 (6-191)||(27454873-27455063)
chr1 (6-198)||(8077647-8077841)
chr1 (6-199)||(7197248-7197443)
chr1 (6-199)||(30677176-30677372)
chr1 (6-199)||(34778342-34778535)
chr1 (14-199)||(17935777-17935965)
chr1 (28-199)||(9500356-9500530)
chr1 (16-199)||(7578419-7578605)
chr1 (6-191)||(168201-168389)
chr1 (12-196)||(1378904-1379090)
chr1 (6-199)||(32729545-32729740)
chr1 (6-191)||(23734116-23734305)
chr1 (6-191)||(23741308-23741497)
chr1 (21-199)||(37351454-37351643)
chr1 (28-191)||(45859052-45859218)
chr1 (17-171)||(7946855-7947011)
chr1 (30-199)||(36155889-36156061)
chr1 (23-199)||(33905511-33905690)
chr1 (12-191)||(21726735-21726917)
chr1 (6-191)||(18646853-18647041)
chr1 (58-199)||(8254753-8254897)
chr1 (13-157)||(23232304-23232455)
chr1 (6-110)||(46113495-46113599)
chr1 (6-191)||(2272344-2272532)
chr1 (133-199)||(48699889-48699955)
chr1 (30-191)||(8779745-8779909)
chr1 (6-96)||(20487297-20487387)
chr1 (6-191)||(25496503-25496685)
chr1 (6-174)||(29057364-29057534)
chr1 (5-191)||(32930748-32930937)
chr1 (122-199)||(26513149-26513226)
chr1 (13-92)||(14258538-14258617)
chr1 (86-199)||(45331622-45331739)
chr1 (133-199)||(22910001-22910067)
chr1 (133-199)||(35138118-35138184)
chr1 (12-97)||(25237095-25237180)
chr1 (6-199)||(1486420-1486616)
chr1 (123-199)||(27159205-27159281)
chr1 (136-199)||(23041655-23041718)
chr1 (130-180)||(2537820-2537870)
chr1 (6-191)||(18533733-18533921)
chr1 (6-98)||(24216978-24217070)
chr1 (62-191)||(40145890-40146027)
chr1 (6-76)||(1818734-1818804)
chr1 (137-199)||(50202680-50202741)
chr1 (150-199)||(5315478-5315527)
chr1 (154-199)||(14603947-14603992)
chr1 (6-51)||(47091690-47091735)
chr1 (12-51)||(6776150-6776189)
chr1 (133-171)||(12876965-12877003)
chr1 (133-191)||(47091751-47091809)
chr1 (12-97)||(809228-809313)
chr1 (28-97)||(15581119-15581188)
chr1 (60-97)||(16899557-16899594)
chr1 (20-97)||(19034492-19034569)
chr1 (58-115)||(39964564-39964621)
chr1 (105-199)||(40802070-40802166)
chr1 (138-191)||(52135261-52135314)
chr1 (6-94)||(1378745-1378833)
chr1 (118-199)||(36921513-36921595)
chr1 (134-190)||(43769975-43770031)
chr1 (6-50)||(52135130-52135174)
[»] chr8 (53 HSPs)
chr8 (6-199)||(4718649-4718845)
chr8 (6-199)||(28193478-28193674)
chr8 (6-199)||(34237656-34237852)
chr8 (6-191)||(39349260-39349448)
chr8 (6-199)||(3734624-3734820)
chr8 (13-199)||(21603241-21603430)
chr8 (6-199)||(2618190-2618386)
chr8 (6-199)||(19471613-19471810)
chr8 (6-199)||(19542537-19542734)
chr8 (6-199)||(19589962-19590159)
chr8 (28-199)||(8765527-8765701)
chr8 (6-199)||(15259407-15259603)
chr8 (6-199)||(20305912-20306108)
chr8 (6-199)||(21092545-21092741)
chr8 (6-199)||(32879283-32879479)
chr8 (6-199)||(42643119-42643315)
chr8 (6-191)||(264409-264596)
chr8 (6-191)||(651325-651512)
chr8 (6-191)||(837060-837247)
chr8 (6-199)||(42328009-42328204)
chr8 (6-187)||(27746348-27746532)
chr8 (23-191)||(14632975-14633146)
chr8 (12-191)||(28088296-28088478)
chr8 (12-199)||(4698724-4698914)
chr8 (12-187)||(26168862-26169039)
chr8 (28-199)||(20469943-20470116)
chr8 (6-199)||(7557952-7558140)
chr8 (58-199)||(6953009-6953152)
chr8 (6-199)||(18532111-18532298)
chr8 (21-199)||(34610688-34610869)
chr8 (30-199)||(2166727-2166896)
chr8 (60-199)||(25248407-25248546)
chr8 (18-199)||(24018398-24018583)
chr8 (133-199)||(2639412-2639478)
chr8 (12-181)||(21667560-21667731)
chr8 (6-187)||(28964037-28964220)
chr8 (6-199)||(34694576-34694773)
chr8 (58-199)||(10292111-10292254)
chr8 (119-199)||(12312965-12313045)
chr8 (6-191)||(8042658-8042834)
chr8 (58-199)||(18128569-18128713)
chr8 (58-157)||(24999290-24999392)
chr8 (130-191)||(13749187-13749248)
chr8 (6-191)||(36848759-36848946)
chr8 (133-199)||(33747016-33747082)
chr8 (18-116)||(34639295-34639391)
chr8 (12-97)||(15974916-15974999)
chr8 (6-97)||(8387550-8387641)
chr8 (119-199)||(3403503-3403584)
chr8 (154-199)||(9713609-9713654)
chr8 (138-191)||(16990722-16990775)
chr8 (118-187)||(42332025-42332094)
chr8 (133-190)||(43817759-43817816)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (12-199)||(33696280-33696470)
chr4 (6-199)||(32986197-32986393)
chr4 (6-199)||(34844759-34844955)
chr4 (6-199)||(40058853-40059049)
chr4 (6-199)||(52983619-52983815)
chr4 (6-199)||(5609203-5609399)
chr4 (6-199)||(19660533-19660729)
chr4 (12-199)||(27528796-27528986)
chr4 (6-199)||(46714392-46714589)
chr4 (6-199)||(20566349-20566546)
chr4 (6-199)||(25852214-25852411)
chr4 (6-191)||(54127351-54127539)
chr4 (28-198)||(20077986-20078159)
chr4 (6-199)||(45787705-45787900)
chr4 (6-199)||(44343513-44343710)
chr4 (12-191)||(35229174-35229356)
chr4 (23-199)||(7391966-7392143)
chr4 (20-191)||(49287872-49288045)
chr4 (12-191)||(51535619-51535809)
chr4 (6-199)||(36131511-36131707)
chr4 (61-199)||(34723854-34723995)
chr4 (6-174)||(13873321-13873492)
chr4 (12-119)||(22625154-22625261)
chr4 (6-185)||(32942370-32942552)
chr4 (60-199)||(18875518-18875659)
chr4 (6-187)||(34835529-34835713)
chr4 (59-187)||(32990488-32990619)
chr4 (13-199)||(1985843-1986030)
chr4 (6-199)||(35674750-35674938)
chr4 (12-150)||(33992632-33992773)
chr4 (44-191)||(27574356-27574506)
chr4 (58-191)||(9517650-9517786)
chr4 (30-199)||(12500060-12500231)
chr4 (13-117)||(2351020-2351124)
chr4 (30-191)||(30879175-30879338)
chr4 (6-114)||(43719154-43719262)
chr4 (12-187)||(13550214-13550392)
chr4 (13-187)||(55961767-55961932)
chr4 (137-199)||(23639758-23639820)
chr4 (137-199)||(23645416-23645478)
chr4 (138-199)||(52494623-52494684)
chr4 (133-191)||(4064990-4065048)
chr4 (133-199)||(9978510-9978576)
chr4 (64-191)||(25969512-25969639)
chr4 (38-199)||(20527035-20527198)
chr4 (60-191)||(21387496-21387628)
chr4 (12-119)||(13584338-13584445)
chr4 (133-191)||(43719096-43719154)
chr4 (62-199)||(4911978-4912122)
chr4 (134-199)||(55158344-55158409)
chr4 (139-199)||(23131437-23131497)
chr4 (129-191)||(33289180-33289242)
chr4 (6-56)||(34722170-34722220)
chr4 (6-116)||(41621684-41621793)
chr4 (6-76)||(42245746-42245816)
chr4 (86-191)||(22488037-22488145)
chr4 (134-199)||(51595153-51595218)
chr4 (139-199)||(17637853-17637912)
chr4 (139-191)||(37302623-37302675)
chr4 (140-199)||(7093508-7093567)
chr4 (136-199)||(9646217-9646280)
chr4 (121-199)||(45302953-45303032)
chr4 (119-181)||(4585732-4585793)
chr4 (133-187)||(13017843-13017897)
chr4 (137-191)||(13716459-13716513)
chr4 (138-191)||(12824535-12824588)
chr4 (58-110)||(3392759-3392810)
chr4 (7-47)||(10125783-10125823)
chr4 (139-199)||(41621583-41621643)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (6-199)||(5083-5279)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (6-199)||(44946054-44946250)
chr2 (6-199)||(11941211-11941407)
chr2 (6-199)||(33827574-33827770)
chr2 (6-199)||(15037959-15038155)
chr2 (6-199)||(17324766-17324960)
chr2 (12-199)||(25293172-25293355)
chr2 (6-199)||(30466831-30467027)
chr2 (6-181)||(44976172-44976351)
chr2 (6-199)||(24196004-24196198)
chr2 (6-199)||(19054025-19054222)
chr2 (37-199)||(35171831-35171996)
chr2 (23-199)||(43374331-43374505)
chr2 (22-191)||(34516423-34516589)
chr2 (19-174)||(10582018-10582174)
chr2 (6-191)||(4567438-4567634)
chr2 (23-191)||(36242321-36242492)
chr2 (6-191)||(41313992-41314179)
chr2 (6-199)||(41329843-41330038)
chr2 (53-199)||(2140487-2140633)
chr2 (6-199)||(8192353-8192548)
chr2 (16-199)||(27290598-27290770)
chr2 (6-199)||(36390570-36390763)
chr2 (22-191)||(8258913-8259085)
chr2 (23-191)||(5394034-5394205)
chr2 (6-199)||(27269345-27269547)
chr2 (23-199)||(13266507-13266685)
chr2 (23-184)||(1191530-1191694)
chr2 (79-199)||(28668946-28669069)
chr2 (6-97)||(32845091-32845182)
chr2 (6-76)||(18976552-18976622)
chr2 (6-91)||(4852558-4852643)
chr2 (23-191)||(45271401-45271572)
chr2 (133-199)||(18692090-18692156)
chr2 (93-199)||(31778114-31778227)
chr2 (58-191)||(3943792-3943928)
chr2 (134-191)||(18976464-18976521)
chr2 (133-199)||(14486955-14487021)
chr2 (58-152)||(23787056-23787153)
chr2 (133-199)||(44929847-44929913)
chr2 (18-119)||(40997434-40997535)
chr2 (30-199)||(29361578-29361744)
chr2 (136-199)||(39957891-39957954)
chr2 (13-75)||(6714409-6714471)
chr2 (12-93)||(4618795-4618876)
chr2 (12-97)||(19605951-19606036)
chr2 (106-199)||(44610139-44610235)
chr2 (134-190)||(4852660-4852716)
chr2 (60-191)||(19174817-19174950)
chr2 (135-199)||(6714296-6714360)
chr2 (20-187)||(19849847-19850017)
chr2 (133-199)||(714126-714192)
chr2 (133-191)||(9400970-9401028)
chr2 (133-199)||(28194139-28194205)
chr2 (133-191)||(45132417-45132475)
chr2 (28-97)||(28194239-28194308)
chr2 (139-199)||(19605847-19605907)
chr2 (133-181)||(32845206-32845254)
[»] scaffold0623 (1 HSPs)
scaffold0623 (6-199)||(1058-1253)
[»] scaffold0366 (2 HSPs)
scaffold0366 (6-199)||(9301-9496)
scaffold0366 (6-182)||(12019-12197)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (6-199)||(40325-40520)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (6-199)||(10696-10890)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (28-199)||(161831-162005)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (6-191)||(7318-7506)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (13-199)||(52872-53061)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (6-199)||(97367-97563)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (6-191)||(41654-41841)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (45-199)||(39131-39288)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (60-199)||(32342-32483)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (13-199)||(66769-66950)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (6-97)||(8513-8604)
scaffold0199 (138-199)||(8452-8513)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (30-199)||(20246-20417)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (13-199)||(29144-29332)
[»] scaffold0460 (1 HSPs)
scaffold0460 (6-96)||(8286-8376)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (12-157)||(1-149)
[»] scaffold1175 (1 HSPs)
scaffold1175 (105-199)||(2427-2524)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (6-199)||(27776-27966)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (13-73)||(12884-12944)


Alignment Details
Target: scaffold0328 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 14991 - 15241
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |    
T  14991 tttggggttggcctagtggttggcctgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgctaatttcggtgggttaagtcc 15090  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt-nn 201  Q
    || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       
T  15091 atccagagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtgggcgg-gggattggtctcctcggattagtcaattcttggatcggataacaagtttaaa 15189  T
Q  202 nnnnntgacaatattataagatggtaaatttaaaaaatgctattgatgatga 253  Q
         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15190 aaaaatgacaatattataagatggtaaatttgaaaaatgctattgatgatga 15241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13182 - 13048
Alignment:
Q  65 ggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccc 163  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13182 ggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagagcttgcta-ctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcccc 13084  T
Q  164 tcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    || |||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  13083 tcagattagttgattcttggatcggataccgagttt 13048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 9238975 - 9239171
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |    
T  9238975 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtcc 9239074  T
Q  106 atacagagcttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9239075 atatagagcttgctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 9239171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 34147346 - 34147542
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  34147346 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 34147445  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34147446 atacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34147542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 34159962 - 34160158
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  34159962 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 34160061  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34160062 atacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34160158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 11448871 - 11449067
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  11448871 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 11448970  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  11448971 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggatatcgagttt 11449067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15360295 - 15360099
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  15360295 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 15360196  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15360195 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 15360099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3222831 - 3222637
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  3222831 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctc-agaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 3222733  T
Q  106 atacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3222732 atacagagcttgctctgtctttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 3222637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 654336 - 654147
Alignment:
Q  13 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 112  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  654336 ttggcctagtggctgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaga 654237  T
Q  113 gcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||  |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  654236 gcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattattggatcggataccgagttt 654147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21982517 - 21982322
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| | |    
T  21982517 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgaagtttgctcctccagaggtctgaggttcgattcccgatggtgccaatttcagtgggctaagtcc 21982418  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21982417 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 21982322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21148707 - 21148512
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| |||| ||| | |    
T  21148707 tttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctttttcagaggtctcaagttcgattccctctagtgccaatttcgatgggctaagtcc 21148608  T
Q  106 atacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  21148607 atacagagcttgctctgactttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 21148512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 1344937 - 1345131
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| | |    
T  1344937 tttggggttgacctagtggttgg--tgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtcc 1345034  T
Q  106 atacagagcttgct--ggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1345035 atacaaagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 1345131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 9843938 - 9844134
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | || ||||||  ||||| |||||||||| | |    
T  9843938 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgacttcctctggtgtcaattttggtgggttaagtcc 9844037  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9844038 atacagagcttgttctggctttaaacggggccccctcaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 9844134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 28672067 - 28672263
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||| | |    
T  28672067 tttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctctagaggtcttaggttcgattccctctggtgtcaattttggtgggctaagtcc 28672166  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||   ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  28672167 atacagagcttgttttggctttaaacgggcccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 28672263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5360268 - 5360072
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||| | |    
T  5360268 tttggagttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgcttctcaagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggctaagtcc 5360169  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  5360168 atacagagcttgctctgactttaaacggaacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcggataccgagttt 5360072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17081239 - 17081055
Alignment:
Q  18 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg 117  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  17081239 ctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaagtttgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttg 17081140  T
Q  118 --ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
      ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||   ||||||||||| ||| |||||||    
T  17081139 ctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaataagttgtttcttggatcgaataccgagttt 17081055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 11840909 - 11841096
Alignment:
Q  14 tggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag 113  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||    
T  11840909 tggccaagtggttggcttgggatattagaatttgctcctccagaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacaaag 11841008  T
Q  114 cttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||  ||| |||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  11841009 cttgctttggttttaaacggggccccataagtggacggtgggattagtcccctcgaattagtcgattattggatcggataccgagttt 11841096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 174
Target Start/End: Original strand, 12390465 - 12390596
Alignment:
Q  46 tgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaag 142  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||    
T  12390465 tgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaag 12390564  T
Q  143 tgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12390565 tgggcggtgggattggtcccctcggattagtc 12390596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Original strand, 9208264 - 9208448
Alignment:
Q  18 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag-ctt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | ||||||||| |||    
T  9208264 ctagtggttggattgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattccccctggtgccaatttcggtggg-caagtccatacagagcctt 9208362  T
Q  117 gc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  9208363 gctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcagaatagtcgattcttggatcaaataccgagttt 9208448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 11007177 - 11007353
Alignment:
Q  18 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||| |   |||||||||||| ||| | |||||| ||||||    
T  11007177 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcactctgctctcaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttg 11007276  T
Q  118 --ctggctttaa-atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
      || |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11007277 ctctagctttaagcggggcccccgcaagtgggcggtgggattggccccctcggattagtcgattctttgatcggata 11007353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 119
Target Start/End: Original strand, 12591637 - 12591750
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||| | |    
T  12591637 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctcgtgccaatttcagtgggctaagtcc 12591736  T
Q  106 atacagagcttgct 119  Q
    ||||||||||||||    
T  12591737 atacagagcttgct 12591750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 199
Target Start/End: Original strand, 14212903 - 14213078
Alignment:
Q  17 cctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt 116  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||| | |||| ||||||     
T  14212903 cctaatggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagtccatatagagct- 14213001  T
Q  117 gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
          || ||  ||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14213002 ------ttaaacgggggccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 14213078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9690829 - 9690639
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||| |||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| |  || |||  |||||||||||| ||| | |||||||    
T  9690829 gttgacctagtggttggtttgagattttggagtttgctcttccagaggtcttaggttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccatacag 9690730  T
Q  112 agcttgct--ggctttaaatggccccc-cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||  ||||||||| ||  ||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9690729 agcttgctctggctttaaacggggccctcacaagtggacggtgggattggtcctctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 9690639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 112
Target Start/End: Original strand, 13753240 - 13753346
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  13753240 tttggggttggcctagtggttggctttggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggctaaatcc 13753339  T
Q  106 atacaga 112  Q
    |||||||    
T  13753340 atacaga 13753346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 33499474 - 33499671
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttc-gattccccctggtgctaatttcggtgggttaaatt 104  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||| ||  |     
T  33499474 tttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcagattccctctggtgtcaatttcggtgggctag-tc 33499572  T
Q  105 catacagagctt-gct--ggctttaaatggcccc-ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||| | ||| |||  |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||| |||||||    
T  33499573 catacaaatctttgctttggctttaaatgggccctccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcagttgatggaccggataccgagttt 33499671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 89
Target Start/End: Original strand, 22576067 - 22576150
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatt 89  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  22576067 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatt 22576150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17149629 - 17149482
Alignment:
Q  30 ttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag-cttgc--tggcttta 126  Q
    ||||||||||||||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || | ||||||||| |||||  ||||||||    
T  17149629 ttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggttgg-caagtccatacagagccttgctttggcttta 17149531  T
Q  127 aat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 174  Q
    ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17149530 aatggggcccccgcaagtgaacggtgggattggtcccctcgaattagtc 17149482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33718649 - 33718478
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||   ||| | |||||||    
T  33718649 gttggtctagtggttggtttgggatcttggagtttacttctccagagatctcaggttcgattctctctggtgcaaattttggtgaactaagtacatacag 33718550  T
Q  112 agcttgctggctttaaatggcccccc-gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||         |||||| ||  || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33718549 ag---------tttaaacggggcctctgcaagtggacggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggata 33718478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15730594 - 15730496
Alignment:
Q  104 tcatacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | | ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  15730594 tcatacagagcttgttctggctttaaacgtggcccccacacgtgggcggtgggattggtcacctcggattagtcgattctttgatcggatatcgagttt 15730496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17706481 - 17706328
Alignment:
Q  29 cttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctggctttaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||  ||| ||        |||  |||||||||||    
T  17706481 cttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaagttcgattccttctggtgtcaatttcggtggactaattt--------gct--ctggctttaaa 17706392  T
Q  129 -tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
     ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17706391 ctgggccctcgcaagtggacggtgtgattggtttcctcggataagtcaattcttggatcggata 17706328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14504148 - 14504083
Alignment:
Q  134 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  14504148 ccccgcaagtgggcggtgggattgatcctctcgaattagtcgatccttgtatcggataccgagttt 14504083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28968222 - 28968133
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||| | || | |  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  28968222 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcagattcgattctctctagcgtcaatttcggtgggttaagtccatacaga 28968133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 175
Target Start/End: Original strand, 32596211 - 32596248
Alignment:
Q  138 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtca 175  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32596211 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtca 32596248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Original strand, 10377843 - 10377911
Alignment:
Q  130 ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 198  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  | ||||||| ||||| ||||||    
T  10377843 ggccccccacaagtgggcggtggcattggtcccctcggagtagtcggtccttggattggataccgagtt 10377911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 97
Target Start/End: Original strand, 8479312 - 8479403
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |    | | |||||||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  8479312 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctcttaagatttcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcggtggg 8479403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27866268 - 27866217
Alignment:
Q  135 cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  27866268 cccgcaagtgggcggtgggattagtcccctcgaattagtcgatttttggatc 27866217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21903703 - 21903629
Alignment:
Q  118 ctggctttaaatggcccccc-gcaagtgggcggtgggattgttcccc-tcggattagtcaattcttggatcggat 190  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  21903703 ctggctttaaatggggcaccagcaagtgggcggtgggaatggtccccctcagattagtcgattcttggatcggat 21903629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 31039020 - 31039173
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||| || ||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||  | ||||| ||| ||||||| || ||   ||||||| |||| ||| | |    
T  31039020 tttggggttgacccagtagttggctttgaatcttggagtttgctccaccaaagatctcaagtttgattccctctagtatcaatttcgatgggctaagtcc 31039119  T
Q  106 atacagagcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattg 157  Q
    |||||||| ||||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  31039120 atacagagtttgctatggctatgaatggacccccacaagtgggcggtgtgattg 31039173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 199
Target Start/End: Original strand, 4797260 - 4797293
Alignment:
Q  166 ggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4797260 ggattagtcgattcttggatcggataacgagttt 4797293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 199
Target Start/End: Original strand, 17225797 - 17225862
Alignment:
Q  134 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||  | ||| ||||||||| |||||||    
T  17225797 ccccgcaaatgggcggtgggattgatctcctcagattagtcggtccttagatcggatatcgagttt 17225862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 199
Target Start/End: Original strand, 26174114 - 26174309
Alignment:
Q  7 ttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattca 106  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  26174114 ttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggttaagtcca 26174213  T
Q  107 tacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26174214 tacagagcttgctctggctttaaatagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 26174309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 52821832 - 52821637
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| | |    
T  52821832 tttggtgttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgagctaagtcc 52821733  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52821732 atacagagcttgctctggctttaaacggggccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 52821637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 53424373 - 53424178
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| | |    
T  53424373 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtcc 53424274  T
Q  106 atacagagcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  53424273 atacagagtttgctatggctttaaacgggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 53424178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15566690 - 15566501
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  15566690 gttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacag 15566591  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15566590 agcttgctctggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 15566501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 35492911 - 35493107
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  35492911 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 35493010  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  35493011 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattgaataccgagttt 35493107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30807350 - 30807154
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  30807350 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 30807251  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30807250 atacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtaggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 30807154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8456347 - 8456151
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  8456347 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 8456248  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  8456247 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 8456151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45529951 - 45529756
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| ||| | |    
T  45529951 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcgatgggctaagtcc 45529852  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  45529851 atacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 45529756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 46576348 - 46576544
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| | |    
T  46576348 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtcc 46576447  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46576448 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtcggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 46576544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40133646 - 40133450
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | |    
T  40133646 tttggggttggcctagtggttggcttgggattttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtcc 40133547  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40133546 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40133450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 49258459 - 49258263
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| | |    
T  49258459 tttggggtttgcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtcc 49258360  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  49258359 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 49258263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 21362943 - 21363139
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || ||| | |    
T  21362943 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggctaagtcc 21363042  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  21363043 atacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcggattaatcgattcttggatcggataccgagttt 21363139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25289911 - 25289716
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| | |    
T  25289911 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtcc 25289812  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25289811 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 25289716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 25379761 - 25379949
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||||| ||| ||| | |    
T  25379761 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggagggctaagtcc 25379860  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25379861 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagcgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 25379949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 30257624 - 30257812
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||  ||| | |    
T  30257624 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggactaagtcc 30257723  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30257724 atacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtggcattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 30257812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 48977388 - 48977584
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |    
T  48977388 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggttaagtcc 48977487  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  48977488 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 48977584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45272613 - 45272417
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  45272613 tttggggttggcctagtcgttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcagtttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 45272514  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||| |||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  45272513 atacggagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgactcttggatcggataccgagttt 45272417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18177084 - 18176896
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| | |    
T  18177084 tttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcttccagaggtatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagtcc 18176985  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18176984 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagtcgattcttggatcggata 18176896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 53234095 - 53233912
Alignment:
Q  18 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  53234095 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttg 53233996  T
Q  118 --ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
      |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  53233995 ctctggctctaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 53233912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10190922 - 10190743
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||    
T  10190922 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10190823  T
Q  121 gctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10190822 gctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 10190743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31538035 - 31537839
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| |      
T  31538035 tttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgtttgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtct 31537936  T
Q  106 atacagagctt--gctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31537935 atacagagcttactctggctttaaacggagcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcaattcttggatcggatatcgagttt 31537839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 34492772 - 34492576
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||| ||| | |    
T  34492772 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctctgctgccaatttcgttgggctaagtcc 34492673  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  34492672 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtccattcagattagttgattcttggatctgataccgagttt 34492576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10083999 - 10083820
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||    
T  10083999 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10083900  T
Q  121 gctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10083899 gctttaaacggggcccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 10083820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39042028 - 39041853
Alignment:
Q  27 agcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | ||| |||||||||  |||||||    
T  39042028 agcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatgcagagcttgctctggctt 39041929  T
Q  125 taaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||  || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  39041928 taaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 39041853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 40940825 - 40941021
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| | |    
T  40940825 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagtcc 40940924  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||  || ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  40940925 atacagagcttgctctgactttaaacggggcccccacaagtgggtggtaggattggtcccctcgaattactcaattcttgaatcagataccgagttt 40941021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 156
Target Start/End: Original strand, 26108299 - 26108445
Alignment:
Q  13 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  26108299 ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaga 26108398  T
Q  113 gcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggatt 156  Q
    |||||  |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  26108399 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggctgtgggatt 26108445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 32151430 - 32151620
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||  |||||||| | || |||| |||||||||||| |||  ||||||||    
T  32151430 gttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtttcaaattcgattctctctagtgccaatttcggtgggctaagctcatacag 32151529  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32151530 agcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 32151620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29915460 - 29915288
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||| ||| | |||||||    
T  29915460 gttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggctaagtacatacag 29915361  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 182  Q
    ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  29915360 agcttgccctggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttg 29915288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29964613 - 29964441
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||| ||| | |||||||    
T  29964613 gttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggctaagtacatacag 29964514  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 182  Q
    ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  29964513 agcttgccctggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttg 29964441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 52455846 - 52455650
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||| |      
T  52455846 tttggggttggcctagtggttggctagggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagtct 52455747  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    | ||||||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  52455746 acacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgactggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattggataccgagttt 52455650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7485722 - 7485532
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| |||    
T  7485722 tttggggttggcatagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagttc 7485623  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||    ||||||  |||||||||||  | |||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7485622 at----agcttgatctggctttaaacaggcccctgcaagtggccggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 7485532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8097436 - 8097280
Alignment:
Q  46 tgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaag 142  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||  ||||||||| ||  ||||||||||    
T  8097436 tgctcctccagaggcctcaggttcgattccctcttgtgctaatttcgatgggctaagtccatacagagcatgctctggctttaaacggggcccccgcaag 8097337  T
Q  143 tgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8097336 tgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 8097280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 7470412 - 7470244
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||| |||    
T  7470412 tttggggtttgcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggctaagttc 7470313  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattag 172  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  7470312 atacagagcttgctctggctttaaacggggccctgcaagtgggcagtgggattggtcccctcagattag 7470244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 4462633 - 4462828
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  ||   |||||| ||||||||||| ||||  | ||||||| |||| ||| |||    
T  4462633 tttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctacttcaaaagtctcatgttcgattccctctggcaccaatttcgatgggctaagttc 4462732  T
Q  106 atacagagcttgctg--gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||| ||   |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||    
T  4462733 atacagagcttactctagctttaaacggggccccgcaagtggacggtgggattgatccactcggattagtttattcttggattggataccgagttt 4462828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24165812 - 24165716
Alignment:
Q  105 catacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24165812 catacagagcttgctctggctttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 24165716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Original strand, 24407313 - 24407457
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccc-cgcaagtgggcggtggga 154  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||  | ||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||    
T  24407313 ggtctcagattcgattctctctggtgctaatttcggtgggttaagtatatacagaatttgctctgactttaaacggggccatcgcaagtgggcggtggga 24407412  T
Q  155 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24407413 ttggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 24407457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2511442 - 2511306
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtggga 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||| |||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  2511442 ggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctcgctctgactttaaacgggacctccgcaagtgggcggtggga 2511343  T
Q  155 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||| || ||||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  2511342 ttggtctcctcgaattagtagattcttgaatcggata 2511306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33398641 - 33398477
Alignment:
Q  30 ttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gctttaa 127  Q
    ||||||||||| |||||||||  | |  | ||||| ||||||||||| || |||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||   |||||||    
T  33398641 ttgggatcttgtagtttgctcttctaaagatctcaagttcgattccctctagtgccaattttggtgggttatgtccatacagagcttgctctagctttaa 33398542  T
Q  128 atggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  33398541 acggggcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagtcgattcttggatcggata 33398477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 199
Target Start/End: Original strand, 1692863 - 1693029
Alignment:
Q  35 atcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc 132  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   | |||  |||||||||||  ||| |  ||||||| ||||||  ||||||| |  |     
T  1692863 atcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccatttagtgtcaatttcggtggactaagtctatacagaacttgctctggctttagacagg 1692962  T
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  1692963 cccccgcaagtgggcggtgggatttgccccctcagattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 1693029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 53288903 - 53288725
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| | ||||||     
T  53288903 gttggccaagtggttggtttgggatattagagtttgctcctccaaaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagtccatacaa 53288804  T
Q  112 agcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcgg 188  Q
    |||||||  |||||||||| ||  ||||||||  || ||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  53288803 agcttgctttggctttaaacggggccccgcaaacggacggtgagattagtcccctcgaattagtcgattattggatcgg 53288725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 53848501 - 53848435
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  53848501 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 53848435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25344254 - 25344059
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||  |||||  |||||  ||||  ||| | |    
T  25344254 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggtttgattccctttggtgtcaatttttgtggtctaagtcc 25344155  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||| |||  |||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||    
T  25344154 atacagagtttgctctggctttaaacggggcccccgctagtgggcgatgggattggt-tcctcggattagtcgattcttagatcgaataccgagttt 25344059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8958210 - 8958036
Alignment:
Q  29 cttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gcttta 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| | |||||||| || ||||||  ||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||   ||||||    
T  8958210 cttgggatcttggagtctgctccttcaaaggtcttatgttcgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtccatacaaagcttgctctagcttta 8958111  T
Q  127 aat--ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||    
T  8958110 aaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgattaatcgattcttggatcagataccgagttt 8958036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 19857058 - 19857239
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| ||| ||||   ||    
T  19857058 gttggcctggtggttggcttgg-atcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctttggtgtcaatttcggtgggctaagttcagttag 19857156  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||  ||  |||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||| || |||||    
T  19857157 agcttgctctaactttaaatggggtctccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcgcaatagtcgattcttgaattggata 19857239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Original strand, 1178228 - 1178366
Alignment:
Q  62 tcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg---ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgt 158  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || | |||||||| |||    ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||     
T  1178228 tcaggttcgattctccctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagaactttgctctggctttaaatggggccccacacgtgggcggtgggattgg 1178326  T
Q  159 tcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  1178327 tccc-tcggattagtcgaatcttggatcggataccgagttt 1178366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 11390602 - 11390790
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||  | | ||||||| |||| || ||||||  ||||| |||||| ||| | |    
T  11390602 tttggggttggcctagtggttggtttgagatcttggagttttctcctccaaagatttcaggtttgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtcc 11390701  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| || || |||||| ||    ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11390702 atacagagcttgctctgtctttaaatgggtcctccgcaaatgattcgtgagattattcccctcggattagtcgattcttggatcggata 11390790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 9853623 - 9853702
Alignment:
Q  13 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcg 92  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  9853623 ttggtctagtggttagtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcccaccggtgccaatttcg 9853702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17579280 - 17579136
Alignment:
Q  59 gtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtggga 154  Q
    |||||||||| |||| || || ||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||   |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||    
T  17579280 gtctcaggtttgatttcctctagtgttaattttggtgggctaagtccatacagagcttgctttagctttaaacgggaccctccgcaagtgggcggtgaga 17579181  T
Q  155 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| |||||||    
T  17579180 ttggtcccctcagattagtcgatttttggatcgaatatcgagttt 17579136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 199
Target Start/End: Original strand, 54475780 - 54475877
Alignment:
Q  105 catacagagcttgct--ggctttaaatggcccc-ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  54475780 catacagagcttgctttggctttaaacggggccaccgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 54475877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 174
Target Start/End: Original strand, 51532821 - 51532960
Alignment:
Q  38 ttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccc 134  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||| ||||||||| | ||  ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||  |||||||| || ||    
T  51532821 ttggagtttgcttctccaaaggtctcatgttcgattctctctaatgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctaactttaaatgggacc 51532920  T
Q  135 cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51532921 cccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattagtc 51532960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4252593 - 4252405
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |    ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||  | || | |    
T  4252593 tttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaagtttgattccctctggtgccaatttcagtga-tcaagtcc 4252495  T
Q  106 atacagagcttg---ctggctttaaatggccccccg-caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||| |||||    |||| ||  || ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  4252494 atacaaagctttactctggtttagaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgatccttggatcggata 4252405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 191
Target Start/End: Original strand, 26158941 - 26158999
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  26158941 cccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcggtccttggatcggata 26158999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Original strand, 48105007 - 48105073
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48105007 cccccacaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 48105073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 55371357 - 55371303
Alignment:
Q  137 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  55371357 cgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatccttggatcggata 55371303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 199
Target Start/End: Original strand, 4048085 - 4048146
Alignment:
Q  138 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  4048085 gcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttggatcggataccgagttt 4048146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 50731298 - 50731238
Alignment:
Q  139 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  50731298 caagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgatccttggatcggataccgagttt 50731238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 199
Target Start/End: Original strand, 50781556 - 50781616
Alignment:
Q  139 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  50781556 caagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgatccttggatcggataccgagttt 50781616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 90
Target Start/End: Original strand, 55287803 - 55287887
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaattt 90  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  55287803 tttggggttggcatagtggttggcttggaatcttagagtttgctccttcagaggtttcaggttcgattccctctggtgccaattt 55287887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 48972854 - 48972715
Alignment:
Q  60 tctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||||| ||  |||  |||||||| ||||  ||||    
T  48972854 tctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggttaagttcatatagagtttgctctgactttaaacggatccc--caagtggggggtgaaattg 48972757  T
Q  158 ttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
     |||  ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  48972756 gtccattcgaattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 48972715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 50582992 - 50583162
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||| ||| | |    
T  50582992 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcttaaggtttcaggttcgatttcctctgttgccaatttcgttggg-taagtcc 50583090  T
Q  106 atacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 174  Q
    ||||| | |||     || ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  50583091 atacaaaactttgatttgactttaaatggagccccgtaagtgagcggtgggattggtcctctcgaattagtc 50583162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6041809 - 6041671
Alignment:
Q  66 gttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagct-tgct--ggctttaaatg--gccccccgcaagtgggcggtgggattgttc 160  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||| | ||||  | ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  6041809 gttcgattgcccctagtgccaatttcggtggattaagtccatacagagttatgctctgactttaaacgaagcccccctcaaatgggcggtgagattgttc 6041710  T
Q  161 ccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||  ||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  6041709 cccttagattagtcggttcttggatcagataccgagttt 6041671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 174
Target Start/End: Original strand, 34844430 - 34844548
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt-gct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtggga 154  Q
    ||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||  ||  | |||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  34844430 ggtctcaggttcgattccctccagagccaatttcggtggactag-tacatacagagctttgctatggctttaaatgggcccccgcaagtggatggtggga 34844528  T
Q  155 ttgttcccctcggattagtc 174  Q
    |||  |||||||||||||||    
T  34844529 ttggacccctcggattagtc 34844548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 199
Target Start/End: Original strand, 3747730 - 3747777
Alignment:
Q  152 ggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3747730 ggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 3747777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 119
Target Start/End: Original strand, 38732972 - 38733079
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| | ||| ||  |||||||||||| | | |||||||||    
T  38732972 gttgggctaatggttgacttggaatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggtccgattctctctgttgtcaatttcggtgggctgagttcatacag 38733071  T
Q  112 agcttgct 119  Q
    || |||||    
T  38733072 aggttgct 38733079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 92
Target Start/End: Original strand, 9842921 - 9843006
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcg 92  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||  |||||||    
T  9842921 tttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggagttttctcctccagaggtctc-gattcgattcccactggtgtcaatttcg 9843006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 169
Target Start/End: Original strand, 1242036 - 1242139
Alignment:
Q  69 cgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctc 165  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||    ||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  1242036 cgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagctttgctctggctttaaacggggtcccgcaagtgggcggtggaattggtcccctt 1242135  T
Q  166 ggat 169  Q
    ||||    
T  1242136 ggat 1242139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 199
Target Start/End: Original strand, 25017620 - 25017684
Alignment:
Q  134 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  25017620 ccccgcaagtgggcggtgggattggt-tccttggattagtcgattcttggatcgaataccgagttt 25017684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 175
Target Start/End: Original strand, 33793567 - 33793624
Alignment:
Q  118 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtca 175  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33793567 ctggcttaaaaagggctcccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtca 33793624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 96
Target Start/End: Original strand, 49167070 - 49167146
Alignment:
Q  20 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgg 96  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  | | ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  49167070 agtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaagatatcaggttcgattctctctggtgtcaatttcggtgg 49167146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 11092186 - 11092144
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggtta 100  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11092186 ggtctcaacttcgattctccctggtgctaatttcggtgggtta 11092144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 51
Target Start/End: Original strand, 16140297 - 16140342
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 51  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  16140297 tttggggttggcctagtgattagtttgggatcttggagcttgctcc 16140342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 170
Target Start/End: Original strand, 26599429 - 26599481
Alignment:
Q  118 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatt 170  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  26599429 ctggctttaaatggcgccccacaagtggacggtgggattggacccctcagatt 26599481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 7275281 - 7275477
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  7275281 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 7275380  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7275381 atacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 7275477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 22119892 - 22120088
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  22119892 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 22119991  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22119992 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 22120088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40543107 - 40542911
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  40543107 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 40543008  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40543007 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40542911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7176059 - 7175871
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  7176059 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 7175960  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7175959 atacagagcttgctctggctttaaacaggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 7175871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 2751275 - 2751471
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  2751275 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 2751374  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2751375 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 2751471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 21835161 - 21835351
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  21835161 gttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacag 21835260  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21835261 agcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 21835351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21218030 - 21217834
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| | |    
T  21218030 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagtcc 21217931  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  21217930 atacagagcttgctctagctttaaacgggccccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagttgattcttggatcggataccgagttt 21217834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 11997859 - 11998049
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| | ||||||     
T  11997859 gttgggctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggttggctaagtccatacat 11997958  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11997959 agcttgctctggctttaaactgggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 11998049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 2103059 - 2103253
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| | |    
T  2103059 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 2103158  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  2103159 atacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcat-gatcggataccgagttt 2103253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 10091192 - 10091387
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| | |    
T  10091192 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 10091291  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||    
T  10091292 atacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt-gatccgataccgagttt 10091387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 18044111 - 18044307
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| | |    
T  18044111 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcccaggttcgattccctcttgtgccaatttcggtgggctaagtcc 18044210  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18044211 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggtggtggaattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 18044307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 22703503 - 22703678
Alignment:
Q  19 tagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg- 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | |||||| ||||||     
T  22703503 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgc 22703602  T
Q  118 -ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22703603 tctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctttgatcggata 22703678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 28089820 - 28090019
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||| ||| | |    
T  28089820 tttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgataccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtcc 28089919  T
Q  106 ataca----gagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  28089920 atacaaagtgagcttgctctggctttaaatgggcccccgcaagtgggcgatgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 28090019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17197147 - 17196951
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| || |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| | |    
T  17197147 tttggggtcggcctagtggttggtttgcgatcttggagtttgctcctccataggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgagctaagtcc 17197048  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17197047 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 17196951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23012699 - 23012509
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  23012699 gttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtcttaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacag 23012600  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  23012599 agcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcaattcattgatcggataccgagttt 23012509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 654863 - 654706
Alignment:
Q  44 tttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaa 141  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  654863 tttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggcccccgcaa 654764  T
Q  142 gtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  654763 gtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggatcggataccgagttt 654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 2344303 - 2344499
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||| | |    
T  2344303 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagctctcagattcgattccttctggtgccaattttggtgggctaagtcc 2344402  T
Q  106 atacagagc--ttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||  ||  ||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  2344403 atacagagctttttttggctttaaacgggacccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 2344499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 17212057 - 17212245
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  17212057 tttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 17212156  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||| |||  ||||||| |||  || |||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17212157 atacagagattgctctggcttaaaacgggacccctgcaagtgagtggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagata 17212245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 27312156 - 27312352
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| || |  || | |    
T  27312156 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtttcaggttcgattccctctagtgccaatttcgatgtgccaagtcc 27312255  T
Q  106 atacagagct--tgctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||    ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27312256 atacagagctacctctgactttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 27312352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 27704006 - 27704201
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||| | |    
T  27704006 tttggagttggtccagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctacagaggtctcaggttcgatttcctttggtgccaatttcggtgggctaagtcc 27704105  T
Q  106 atacagagcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||    
T  27704106 atagagagcttgctttggctttaaatggacccccgcaagtgggtggtgtgattgatcccctcagattagtcgattcttgaatcagataccgagttt 27704201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 28950878 - 28951071
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagt---ttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcata 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  28950878 gttggcctagtggttggcttggggtcttggagtagtttgctccttcagaggtctcaggttcgactccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcata 28950977  T
Q  109 cagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
     ||||||||  |||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28950978 tagagcttgctctggctttaaacgggtccctcgcaagtcggcggtgggattggtcccctcgaactagacaattcttggatcggataccgagttt 28951071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 42913704 - 42913514
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |   |||||| ||||||| |||| ||| | ||||| |    
T  42913704 gttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcatatggtgccaatttcgatgggataagtccatacgg 42913605  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    | ||||  |||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  42913604 aacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttagatcggataccgagttt 42913514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 27009363 - 27009560
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  27009363 tttggggttggcctagtggttggcttcggatcttggagtttgctcatccagaggtctcaggttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 27009462  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgc-aagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||  || |||| || |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  27009463 atacagagcttgctctgactttaaacggggcccctgcaaagtggacggtgggattggtcccctcaaattagtcgattcttggattggataccgagttt 27009560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 199
Target Start/End: Original strand, 16374034 - 16374194
Alignment:
Q  42 agtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccg 138  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||  ||||||||| ||  ||||||    
T  16374034 agtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagaatttgctatggctttaaacgggacccccg 16374133  T
Q  139 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16374134 caaatggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 16374194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 199
Target Start/End: Original strand, 31273941 - 31274113
Alignment:
Q  29 cttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  31273941 cttgggatcttggagtttgctcctccagagctctcaagttcgattccctctggagctaatttcggcgggctaagtccatacagagcttgctctggcttta 31274040  T
Q  127 aatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    || ||  | |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  31274041 aacggggctccgcaagtgggcagtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggaccggataccgagttt 31274113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 22638296 - 22638488
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |||| |||||| ||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  22638296 tttggggttggtctagtggttgacttgagatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaagttc 22638395  T
Q  106 atacagagcttgct--ggctttaaatggcccc-ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |    |||||||||  ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22638396 a----gagcttgctctggctttaaacggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatctcctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 22638488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 19421235 - 19421431
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |  ||||||  ||||||| |||| ||| | |    
T  19421235 tttggggttgacttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcttctggtgtcaatttcgatgggctaagtcc 19421334  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||    
T  19421335 atacagagcttgctctgactttaaatggggcgcccacaagtgggcggtgggattggtctcctcggattagtcgattcttgaatcagataccgagttt 19421431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Original strand, 29861726 - 29861870
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtggga 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  29861726 ggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggga 29861825  T
Q  155 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  29861826 ttgatcccctcgaattagtcgattcttagatcggataccgagttt 29861870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7800029 - 7799902
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | |    
T  7800029 tttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggttaagtcc 7799930  T
Q  106 atacagagcttgc--tggctttaaatgg 131  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  7799929 atagagagcttgctatggctttaaatgg 7799902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39145843 - 39145661
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcat-aca 110  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |  || |||    
T  39145843 gttgacctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagatgtcttcggttcgattccctgtggtgccaatttcggtgggctaagtcaataaca 39145744  T
Q  111 gagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||  ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  39145743 gagcttgctctggctttaaacgggcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttgaatcagata 39145661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 31197595 - 31197790
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||    || ||  ||||||||||| |||| | |    
T  31197595 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccagatgtctcaggtttgattcattatg-tgtcaatttcggtggattaagtcc 31197693  T
Q  106 atacagagcttgctg--gctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||| ||||||   |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31197694 atacagatcttgctcttgctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 31197790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 32849595 - 32849791
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||| || ||   ||||| |||||| ||| | |    
T  32849595 tttggggttagcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcgggtttgattccctctagtctcaattttggtgggctaagtcc 32849694  T
Q  106 atacagagcttgct--ggctttaaatggccc-cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    | || |||||||||  ||||||||||||  | |||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32849695 acactgagcttgctctggctttaaatgggactcccataagtgggcagtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 32849791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 13332620 - 13332510
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||| ||| | |    
T  13332620 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctcctgaggtctcaggtacgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 13332521  T
Q  106 atacagagctt 116  Q
    |||||||||||    
T  13332520 atacagagctt 13332510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 199
Target Start/End: Original strand, 3851841 - 3851957
Alignment:
Q  86 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 182  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3851841 aatttcggtgggctaagtccatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 3851940  T
Q  183 gatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||| |||||||    
T  3851941 gatcggataccgagttt 3851957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36772471 - 36772304
Alignment:
Q  34 gatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg 131  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  36772471 gatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggtttgatttccccta-tgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacgg 36772373  T
Q  132 c-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
      ||||||  |||||||||||| |||  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  36772372 ggcccccgggagtgggcggtggaattagtcctctcggattagtcgattctttgatcggataccgagttt 36772304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 199
Target Start/End: Original strand, 23092167 - 23092296
Alignment:
Q  73 tccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggat 169  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23092167 tccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggat 23092266  T
Q  170 tagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  23092267 tagtcgattcatggatcggataccgagttt 23092296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43785496 - 43785303
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||| | |    
T  43785496 tttggggttgacctaatggttggcttgggatctttgagattgctcctccaaaggtctcaagttcgattcccacttgtgctaatttcagtggactaagtcc 43785397  T
Q  106 atacagagctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgag 196  Q
    |||||||||||   |||| ||||||  || || |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  43785396 atacagagcttactctggttttaaacggggcctccgcaagtggacggtgagattggtccccttggattagtcgatttttggatcggataccgag 43785303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 22299863 - 22299944
Alignment:
Q  16 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22299863 gcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 22299944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 189
Target Start/End: Original strand, 25333423 - 25333593
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||  | ||||||| |||||||| |      
T  25333423 tttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgataccctctggcaccaatttcgttgggttaact-- 25333520  T
Q  106 atacagagcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcgga 189  Q
                ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25333521 ------------ctgactttaaacaggccccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcgga 25333593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 41907658 - 41907515
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtggga 154  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||| | ||||||||| |||  ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||    
T  41907658 ggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagaggttgctctggctttaaacgtggcccccgcaagtgggtggtggga 41907559  T
Q  155 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  41907558 ttggtcccc-cagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 41907515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 74
Target Start/End: Original strand, 23854400 - 23854468
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattc 74  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23854400 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattc 23854468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31713092 - 31712903
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | |||| || ||||||| |||        | ||| | |    
T  31713092 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggattgatttcctctggtgccaata-------gataagtcc 31713000  T
Q  106 atacagagcttgct--ggctttaaatggccccc-cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||  |||| ||  ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31712999 atacaacgcttactctggctttaagcgggaccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 31712903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 119
Target Start/End: Original strand, 42814868 - 42814981
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | |    
T  42814868 tttggagttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcttgaagtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtcc 42814967  T
Q  106 atacagagcttgct 119  Q
    ||||| ||||||||    
T  42814968 atacaaagcttgct 42814981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 9683836 - 9684014
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||    |||||| || |||| |||||||||||| ||| | ||||| |    
T  9683836 gttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccataccg 9683935  T
Q  112 agcttgct--ggctttaaatggcc-ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 187  Q
    ||||| ||  ||||||||| ||   |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9683936 agcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggattaatcgattcttggatcg 9684014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23330936 - 23330740
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| |    |||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||  || | |    
T  23330936 tttggggttagcctagtggttggcttgggattttagagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgactccctccggtgccaatttcggtgggc-aagtcc 23330838  T
Q  106 atacagagcttg---ctggctttaaatggcccc-ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||    ||||||| ||| ||  || |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23330837 atacagagctttgctctggcttaaaacgggacctccgcaagtgggcggtaagattggtcccctcaaattagtcaatccttggatcggataccgagttt 23330740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 28646973 - 28647169
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| | |    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |      
T  28646973 tttggggttggcctagtgattgacttgggatcttggagtgtgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc-aagtca 28647071  T
Q  106 atacagagcttg---ctggctt-taaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||| ||    ||||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  28647072 atacagagttttgctctggcttataacggggcccccacaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagtctgtccttggatcggatatcgagttt 28647169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 22696330 - 22696521
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||   | | |||||||    
T  22696330 gttggcctagtggttgatttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtggg--gactccatacag 22696427  T
Q  112 agctt---gctggctttaaa--tggccccc-cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||    |||||||  ||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  22696428 agctttgctctggcttagaacgaggcccccgcgcaagtaggcggcgggattggtcctctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 22696521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8943500 - 8943410
Alignment:
Q  105 catacagagcttg--ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  8943500 catacagagcttggtctggttttaaacgggcccccccgcaagtgggcggtgtgattggtccccttgaattagtcgattcttggatcggata 8943410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 9718178 - 9718071
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||   |||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||| | |||| ||    
T  9718178 gttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagtccatagag 9718079  T
Q  112 agcttgct 119  Q
    ||||||||    
T  9718078 agcttgct 9718071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14199839 - 14199713
Alignment:
Q  30 ttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 127  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||| ||| |  ||| ||||||||  ||| ||||||    
T  14199839 ttggaatcttggagtttcctcctccagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaattttggtgggctaagtctatatagagcttgctctgcctttaa 14199740  T
Q  128 atggccccccgcaagtgggcggtggga 154  Q
    | ||  ||||||||||||| |||||||    
T  14199739 acggggccccgcaagtgggtggtggga 14199713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 76
Target Start/End: Original strand, 21370601 - 21370671
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccc 76  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  21370601 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttactccttcagatgtctcaggttcgattccc 21370671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33137904 - 33137826
Alignment:
Q  121 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  33137904 gctttaaatggggccctgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcggatatcgagttt 33137826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21574300 - 21574103
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccct-ggtgctaatttcggtgggttaaatt 104  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||| |    |||| ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||  || |     
T  21574300 tttggggttggcctagtggttggtttgggattttggagtgtgctcctctcaaggtcacaggttcgattcccctttggtgccaacttcggtgggc-aagtc 21574202  T
Q  105 catacagagcttg---ctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||    | |||||  || ||  ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  21574201 catacagagctttgcccaggcttagaacggggcccccacaagtaggcggtgagattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 21574103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 97
Target Start/End: Original strand, 40332103 - 40332194
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| || ||||||  ||||||| ||||    
T  40332103 tttggagttggtctagtggttggcttgaaatcttggagtttgctcctctaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcgatggg 40332194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22643515 - 22643351
Alignment:
Q  30 ttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 127  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | || ||||| | |||||||| || ||| ||  ||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| ||||||    
T  22643515 ttgggatcttgaagtttactccactagaggtcttatgttcgatttcctctgatgtcaatttcggtaggctaagtccatacagagcttgctctgactttaa 22643416  T
Q  128 atgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    | ||  ||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| || |||||| |||| ||||    
T  22643415 acggagccctcgcaagtggccggtgtgattagtcccctcggattaatcgattctttgatcagata 22643351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 577683 - 577727
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctc 50  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  577683 tttggggttggcctagtggtttgcttgggatcttagagtttgctc 577727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8435892 - 8435801
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||      | ||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  8435892 tttggggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctttgaagatcttaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtggg 8435801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 12211732 - 12211646
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcg 92  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |    | ||||||||| |||| || ||||||| |||||||    
T  12211732 tttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtgtgctcctctcaagatctcaggtttgatttcctctggtgccaatttcg 12211646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 56
Target Start/End: Original strand, 28003852 - 28003890
Alignment:
Q  18 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccag 56  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28003852 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccag 28003890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1766210 - 1766153
Alignment:
Q  134 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||    
T  1766210 ccccacaagtgggcggttggattggtcccctcggattagtcggtacttgaatcggata 1766153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 119
Target Start/End: Original strand, 6491675 - 6491724
Alignment:
Q  70 gattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct 119  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6491675 gattccctctggtgtcaatttcgatgggctaaattcatacagagcttgct 6491724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 174
Target Start/End: Original strand, 21373789 - 21373885
Alignment:
Q  81 gtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 174  Q
    |||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  21373789 gtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgagattggtcctcacggattagtc 21373885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30345564 - 30345511
Alignment:
Q  145 ggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  30345564 ggcggtgggattggtcccctcgggttagtcggttcttagatcggataccgagtt 30345511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8484858 - 8484662
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  8484858 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttc 8484759  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8484758 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 8484662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11926699 - 11926502
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  11926699 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttagattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 11926600  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11926599 atacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 11926502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 191
Target Start/End: Original strand, 38684209 - 38684395
Alignment:
Q  7 ttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattca 106  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | ||    
T  38684209 ttggggttggcccagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcca 38684308  T
Q  107 tacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38684309 tacagagcttgctctggctttaaacgggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 38684395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15641302 - 15641107
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| | |    
T  15641302 tttggggttagcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 15641203  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  15641202 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 15641107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27498928 - 27498732
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  27498928 tttggggttgacctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 27498829  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27498828 atacatagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 27498732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32059637 - 32059441
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  32059637 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 32059538  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  32059537 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 32059441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19456389 - 19456212
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--g 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |    
T  19456389 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgat-ccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 19456291  T
Q  121 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19456290 gctttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 19456212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 199
Target Start/End: Original strand, 18207231 - 18207403
Alignment:
Q  30 ttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  18207231 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgttctggctttaa 18207330  T
Q  128 atg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18207331 acgaggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 18207403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 30485828 - 30486024
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| | |    
T  30485828 tttggggttggcccagcggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattcactctggtgtcaatttcggtgggctaagtcc 30485927  T
Q  106 atacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30485928 atacagagcttgctctggctttaaacgatgcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcaattcttggatcggataccgagttt 30486024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33709692 - 33709512
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  33709692 gttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacag 33709593  T
Q  112 agcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||    |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33709592 agagctctggctttaaacgggacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 33709512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13038651 - 13038464
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||| |||    
T  13038651 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagttc 13038552  T
Q  106 atacagagcttg-ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||||  |  ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13038551 atacagagcaagtatggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 13038464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13108646 - 13108459
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||| |||    
T  13108646 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagttc 13108547  T
Q  106 atacagagcttg-ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||||  | ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13108546 atacagagcaagtctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 13108459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 199
Target Start/End: Original strand, 37495058 - 37495250
Alignment:
Q  17 cctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt 116  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||    
T  37495058 cctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagctt 37495157  T
Q  117 g--ctggctttaaatggccc--------cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |  ||||||||||| | |||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  37495158 gctctggctttaaacgcccccccccccgcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 37495250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 34310142 - 34310338
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| | |    
T  34310142 tttggggttggcctagtggtcggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtcc 34310241  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  34310242 atacagagcttgctctggctttaaacgggacccccataagtggacggtgggattggtcccctcgaattaatcgattcttggatcggataccgagttt 34310338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31288137 - 31287947
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||||||     
T  31288137 gttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcggtgggttaagtccatacaa 31288038  T
Q  112 agcttgc--tggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  31288037 agcttgctttgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcgaattagtcggttcttggaccggataccgagttt 31287947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Original strand, 42193490 - 42193671
Alignment:
Q  11 tgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcataca 110  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||| |  |||||    
T  42193490 tgttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgcttccccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgccaatttcggtgggctaagtctataca 42193589  T
Q  111 gagcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||| ||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42193590 gagtttgctttggctttaaatgg-accccgcaagtgggcggtggggttggtcctctcggattagtcgattcttggatcagata 42193671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19145608 - 19145413
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || | |    
T  19145608 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtatgctcctctcaaggtctccggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc-aagtcc 19145510  T
Q  106 atacagagcttg---ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||    
T  19145509 atacagagctttgctctggctttaaatggtcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttggttcttggatcggataccgagttt 19145413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7085815 - 7085627
Alignment:
Q  14 tggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||| || |||  |||||||||||| ||| | |||||||||    
T  7085815 tggcttagtggttggcttgggatcttggagttttctcctccagaggtctccggttcgattccctctagtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagag 7085716  T
Q  114 cttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||  ||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  7085715 cttgctctgactttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 7085627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 36954818 - 36955006
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | | ||| | |    
T  36954818 tttggggttggcctagtggttgccttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggttctaatttcggcgtgctaagtcc 36954917  T
Q  106 atacagagcttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  36954918 atacagagtttgctttggctttaaatgggccccccgcaagtggactgtgggattagtcccctcatattagtcgattcttggatcggata 36955006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6014471 - 6014281
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  6014471 gttggcctagtgattggcttgggatcttggagtttgcttctccagagatctcaggttcgattacttctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacag 6014372  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||  |||||||||||  ||  || ||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6014371 agcttgctctggctttaaacggggtccacgcaagtgggcggtgagattagtcccctcgaattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 6014281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11465098 - 11464917
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  11465098 gttggcctagtgattggcttgaaatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgatttcctctggtgccaattttggtgggctaagttcatacag 11464999  T
Q  112 agctt--gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||   ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11464998 agcttactctggctttaaacggggccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 11464917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 4603777 - 4603973
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||| | |    
T  4603777 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaagttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaagtcc 4603876  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||| |  |||||||||||  || |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  4603877 atacagagctcgctctggctttaaacggggcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 4603973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23270719 - 23270531
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| |||||||| || | | ||| |||||||||||| ||| | |    
T  23270719 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccaaaggtctcaagttcgatttcctccgatgccaatttcggtgggctaagtcc 23270620  T
Q  106 atacagagcttgc--tggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  23270619 atacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttggattggata 23270531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10869756 - 10869574
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| ||| | || || |    
T  10869756 gttggcatggtggttgacttgcgatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccatctggttccaatttcggtgggctaagtccacactg 10869657  T
Q  112 agcttgct--ggctttaaatggcccc-ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10869656 agcttgctctggctttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggatcggata 10869574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 155
Target Start/End: Original strand, 25586932 - 25587085
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  25586932 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 25587031  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaa--atggccccccgcaagtgggcggtgggat 155  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  | | |||||| |||||||||||| ||||    
T  25587032 atacagagcttgctctggctttaaacaggaccccccccaagtgggcggtcggat 25587085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38631158 - 38630980
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| | |    
T  38631158 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaagtcc 38631059  T
Q  106 atacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||                | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  38631058 atacagagc---------------aggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggataccgagttt 38630980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15971313 - 15971144
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||| ||| | ||||||     
T  15971313 gttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgtcaatttcggtgggctaagtccatacat 15971214  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaatt 178  Q
    ||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15971213 agcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgagattgatcccctcggattaatcaatt 15971144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12398628 - 12398449
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||    
T  12398628 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgtcaatttcggtggcctaagttcatacagagcttgctctg 12398529  T
Q  121 gctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||  |||||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  12398528 gctttaaatggggcccccgcaaatggacggtgagattgatcctctcaaattagtcggttcttggattggataccgagttt 12398449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27487752 - 27487563
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||   |||||| |||||||||||  ||| | |    
T  27487752 tttggggttggcctagtggttgatttgggattttggagtttgctcttccagaggtctcaggtttgatcccatttggtgccaatttcggtggactaagtcc 27487653  T
Q  106 atacagagcttgctg--gctttaaatggcccccc--gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||   |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27487652 atacagagcttgctctagctttaaacgggggcccttgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 27487563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 22392701 - 22392884
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||| | || ||    
T  22392701 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctc---tgccaatttcggtgggct-aagtc 22392796  T
Q  106 atacagagcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
     |     |||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  22392797 tt-----gct--ctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcagattagtcgatttttggatcggataccgagttt 22392884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25750808 - 25750614
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcg--attccccctggtgctaatttcggtgggttaaat 103  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |  |||||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  25750808 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttggatattccttctggtgccaatttcggtgggttaagt 25750709  T
Q  104 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
     |||| ||||||||  ||||| ||||  || ||||  |||||||| |||| ||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25750708 ccatatagagcttgctctggc-ttaacgggacccc--caagtggggggtgagattggtcccttcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 25750614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 1827727 - 1827616
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| | |    
T  1827727 tttggggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgataccaatttcggtgggttaagtcc 1827628  T
Q  106 atacagagcttg 117  Q
    ||||||||||||    
T  1827627 atacagagcttg 1827616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12317347 - 12317156
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  | |||||| |||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||| | |    
T  12317347 tttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctcttgaggtctcgggtttgatttcatctggtgtcaatttcggtgggttaagtcc 12317248  T
Q  106 atacagagcttgct--ggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |    |||||||||  | ||||||  || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12317247 a----gagcttgctctgactttaagcgggccccccgcaagtgggtggtgggattgatccc-tcggattagtcaattcttagatcggataccgagttt 12317156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Original strand, 15931059 - 15931211
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || | |    
T  15931059 tttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgcttcttcacaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggct-aagtcc 15931157  T
Q  106 atacagagcttgct--ggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggatt 156  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||  || | | ||||||||||||||||||||    
T  15931158 atacagagcctgctctggctttaaacagggctctcgcaagtgggcggtgggatt 15931211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Original strand, 22693065 - 22693131
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22693065 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 22693131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Original strand, 35425088 - 35425201
Alignment:
Q  81 gtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaat 177  Q
    |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  35425088 gtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagctcgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcggattagtcgat 35425187  T
Q  178 tcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||||    
T  35425188 tcttggatcggata 35425201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9659428 - 9659312
Alignment:
Q  86 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 182  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||    
T  9659428 aatttcggtgggctaagtccatacacagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtggacggtgggattggtcccttcggattagttgattcttg 9659329  T
Q  183 gatcggataacgagttt 199  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  9659328 gatgggataccgagttt 9659312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 41351186 - 41351105
Alignment:
Q  118 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  41351186 ctggctttaaacggggctccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 41351105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 187
Target Start/End: Original strand, 5049189 - 5049320
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggat 155  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||    
T  5049189 ggtctcagattcaattccctctggtaccaatttcgatggtctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacgggcccccgcaaatggacggtgggat 5049288  T
Q  156 tgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 187  Q
    || |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  5049289 tggtcccatcgaattagtcgattcttggatcg 5049320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 34049822 - 34050007
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||      | |||     |||||| ||| | |    
T  34049822 tttggggttgggctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcc------ttcta-----ggtgggctaagtcc 34049910  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  |||||   |||||||| |||||||    
T  34049911 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtaggattggtcccctcggattagttgattctcaaatcggataccgagttt 34050007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21236553 - 21236363
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||  |||||||||| | || |||  ||||||  |||| ||| | |||||||    
T  21236553 gttggcttagtagttcgcttaggatcttggagttttctccttcagaggtcttcggttcgattctctctagtgtcaatttcaatgggctaagtccatacag 21236454  T
Q  112 agcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    || || ||  | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  21236453 agttttctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattagtcccctcagattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 21236363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13659312 - 13659254
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13659312 cccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattaatcgattcttggatcggata 13659254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 189
Target Start/End: Original strand, 5067392 - 5067447
Alignment:
Q  134 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcgga 189  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5067392 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgattagtcgattcttggatcgga 5067447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26009451 - 26009265
Alignment:
Q  16 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagct 115  Q
    ||||||||||| | |||||||||  |||||| |||| | |  ||| || ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| | ||| |||||||    
T  26009451 gcctagtggttggtttgggatctcagagtttactcctcgaaaggtttccggttcgattccctttggtgccaatttcagtgggctaagtccatgcagagct 26009352  T
Q  116 tgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    | ||  ||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||    
T  26009351 tactctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtagtgggattagtcccctcggattagtcggttcttgaatcgaatatcgagttt 26009265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 96
Target Start/End: Original strand, 37397713 - 37397803
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgg 96  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  37397713 tttggggttggtctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcctccaaaggtctaaggtttgattccccctggtgtcaattttggtgg 37397803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 930682 - 930487
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccct-ggtgctaatttcggtgggttaaatt 104  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |     |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||   |||||    
T  930682 tttggggttggcccagtggttggcttgagattttagagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattcccacttggtgccaatttcggtggac-aaatt 930584  T
Q  105 catacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||| ||||||||  |||||  ||    ||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  930583 catacatagcttgctccggcttagaacaagccctcgcaagtggacagtgtgattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggatatcgagttt 930487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 114
Target Start/End: Original strand, 7151346 - 7151437
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagc 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||| |||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  7151346 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctcaagaggtcttaggttcgactccctctggcgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc 7151437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 199
Target Start/End: Original strand, 36895558 - 36895621
Alignment:
Q  136 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  36895558 ccgcaagtgggcggggggattgttctcctcgaattagtcggttcttggatcggataccgagttt 36895621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10631340 - 10631290
Alignment:
Q  149 gtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10631340 gtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 10631290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28614667 - 28614487
Alignment:
Q  20 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg-- 117  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| |||  | |||||||||||||| || ||| ||  |||| ||||| | ||| | |||||| ||||||      
T  28614667 agtggttggcttgagatcttagagtttgttcctccaaagatctcaggttcgattacctctgatgtcaatt-cggtgagataagtccatacaaagcttgtt 28614569  T
Q  118 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| ||||||| ||   ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  28614568 ctgactttaaacgggatcccgcagatggacggtgggattgatcccctcgaattagtcgatttttggatcggataccgagttt 28614487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 73
Target Start/End: Original strand, 5067301 - 5067368
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgatt 73  Q
    ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  5067301 tttggagttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgatt 5067368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 3715106 - 3715056
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccag 56  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3715106 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccag 3715056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17015593 - 17015420
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctggc 122  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||| |||   ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| ||| | |||||   ||||  ||||    
T  17015593 ggttggcttgagatcttgaagtttcctctttcagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcattgggataagtccatactt-gctt--tggc 17015497  T
Q  123 tttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||| ||  ||||||||||  ||||| ||| || | ||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||    
T  17015496 tttaaacggatccccgcaagtaagcggtaggaatggtaccctcggattaattaattcttgaatcggataccgagttt 17015420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 40330639 - 40330724
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    ||||||| |||| |||| |  |||||||||||||| ||||    
T  40330639 gttggcttagtggttagcttgagatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaagttcaattctctatggtgctaatttcgttggg 40330724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 41084120 - 41084179
Alignment:
Q  140 aagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  41084120 aagtgggcggtaggattgatcccttcggattagtcggttcttgaatcggataccgagttt 41084179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Original strand, 31206294 - 31206439
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagct-tgctg--gctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtggg 153  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||  |||  ||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  31206294 ggtctcaggttttattccccctggtgccaatttcattggcctaagtccatacagagctatgctcttgctttaaatgggacccccacaagtggacggtggg 31206393  T
Q  154 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||  | |||||||||||||  | |||||  |||||| |||||||    
T  31206394 attggactcctcggattagtcggtccttgggccggataccgagttt 31206439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 44
Target Start/End: Original strand, 19230476 - 19230513
Alignment:
Q  7 ttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagt 44  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19230476 ttggggttggcctagtggttagtttgggatcttggagt 19230513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Original strand, 42006868 - 42006921
Alignment:
Q  138 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||||| |||||||||    
T  42006868 gcaagtgggcggtggaattgttccacttggattagttgattctttgatcggata 42006921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 199
Target Start/End: Original strand, 8821120 - 8821180
Alignment:
Q  139 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||| |||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  8821120 caagtgggtggtgggattggtcacttcgaattagtctattcttggatcagataccgagttt 8821180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25548599 - 25548535
Alignment:
Q  135 cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  25548599 cccgcaagtacgcggtgggattggtcatctcgaattagtcgattcttggatcgaataccgagttt 25548535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 199
Target Start/End: Original strand, 33737878 - 33737937
Alignment:
Q  139 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  33737878 caagtgggcggtgagattggtcccctcgg-ttagttgattcttgaatcggataccgagttt 33737937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 42006793 - 42006837
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctc 50  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42006793 tttggggttgggctagtggttggcttgagatcttggagtttgctc 42006837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 68)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7766918 - 7766728
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  7766918 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggctaagtccatacag 7766819  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  7766818 agcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggatatcgagttt 7766728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4621434 - 4621238
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  4621434 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 4621335  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4621334 atacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 4621238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 24674393 - 24674581
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  24674393 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 24674492  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24674493 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcgattcttggatcggata 24674581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 24122023 - 24122219
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  24122023 tttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 24122122  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24122123 atacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 24122219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 46607810 - 46608006
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  46607810 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 46607909  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  46607910 atacagagcttgctctgactttaaaaggcccccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcggtccttggatcggatatcgagttt 46608006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15059599 - 15059403
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  15059599 tttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 15059500  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15059499 atacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 15059403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27455063 - 27454873
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| | ||| | |    
T  27455063 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcactctgatgccaatttcggtgagctaagtcc 27454964  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatgg---ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27454963 atacagagcttgctctggctttaaacgggccccccccgcatgtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 27454873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 198
Target Start/End: Original strand, 8077647 - 8077841
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  8077647 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 8077746  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 198  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||| | ||||||    
T  8077747 atacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc-gattaatcgattattggatcggagaccgagtt 8077841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7197443 - 7197248
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| |      
T  7197443 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggg-taagtca 7197345  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  7197344 atacagaccttgctctggctttaaacgaggcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcgattcatggatcggataccgagttt 7197248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 30677176 - 30677372
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  30677176 tttggggttgacctagtggttggtttgggatctaggagtttgctcctccaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 30677275  T
Q  106 atacagagcttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  30677276 atacagagcttgctttggctttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcggttcttggaccggatatcgagttt 30677372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 34778342 - 34778535
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||||   | |    
T  34778342 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtaccaattttggtgggtt---tcc 34778438  T
Q  106 atacagagcttgc--tggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34778439 atacagagtttgctttggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34778535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 17935777 - 17935965
Alignment:
Q  14 tggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag 113  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||| ||| | |||||||||    
T  17935777 tggcatagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagag 17935876  T
Q  114 cttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
     |||  |||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17935877 tttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcgatgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 17935965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9500530 - 9500356
Alignment:
Q  28 gcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  9500530 gcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 9500431  T
Q  126 aaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9500430 aaacggagcccccacaagtgggcggtgagattggtctcttcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 9500356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Original strand, 7578419 - 7578605
Alignment:
Q  16 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagct 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  7578419 gcctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagct 7578518  T
Q  116 tg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||  ||| |||||||  || ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||    
T  7578519 tgctctgactttaaacggggccctcgcaagtgggtggtgggattggttccctcggattagttgatttttggatcggataccgagttt 7578605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 168201 - 168389
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  168201 tttggagttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttc 168300  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||  || | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  168301 atacagagcttgttctgactttaaacgggactcccgctagtggccggtgggattggtcccctcggattagttagttcttagaccggata 168389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 196
Target Start/End: Original strand, 1378904 - 1379090
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||| || ||||||  |||||||||||| ||| | |||||||    
T  1378904 gttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcatgttcgatttcctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacag 1379003  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgag 196  Q
    | ||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  1379004 aacttgctctggctttaaacgggcccccgcaagtggacggtgagattggtcccctcagattagtcgattcttagatcggataccgag 1379090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 32729545 - 32729740
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |     ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||  || | |    
T  32729545 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggc-aagtcc 32729643  T
Q  106 atacagagcttgct--ggctttaaatggcc-ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |  |||||||||||| |||||||    
T  32729644 atacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatccccttggattagtcggtctttggatcggataccgagttt 32729740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 23734116 - 23734305
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||  |||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| | |    
T  23734116 tttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagtcc 23734215  T
Q  106 atacagagcttgc--tggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||| ||||  || |||||||   ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  23734216 atacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcgattcttgaatcggata 23734305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 23741308 - 23741497
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||  |||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| | |    
T  23741308 tttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagtcc 23741407  T
Q  106 atacagagcttgc--tggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||| ||||  || |||||||   ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  23741408 atacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcgattcttgaatcggata 23741497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 37351643 - 37351454
Alignment:
Q  21 gtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--- 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||       
T  37351643 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgattccttctgatgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctc 37351544  T
Q  118 --------ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
            ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  37351543 tggaagctctggctttaaacgggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 37351454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45859218 - 45859052
Alignment:
Q  28 gcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||  || |||||    
T  45859218 gcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacatcgcttgctcttgcttt 45859119  T
Q  126 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||  || |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  45859118 aaacagggcccccgcaagtgggtggtaggattggtcccctcggattagttgattattggatcggata 45859052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Original strand, 7946855 - 7947011
Alignment:
Q  17 cctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt 116  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  7946855 cctagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagctt 7946954  T
Q  117 g--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatta 171  Q
    |  || |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||    
T  7946955 gctctcgctttaaatggggccccgcaagtgggtggtgagattggtcccctcagatta 7947011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36156061 - 36155889
Alignment:
Q  30 ttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc--tggctttaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || | ||| ||||||||||  | | |||||    
T  36156061 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgtcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggccaagtccatgcagagcttgctttagttttaa 36155962  T
Q  128 a-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |  || |||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  36155961 acagggcccccgcaggtgggcggtgggattggtcccttcaaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 36155889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33905690 - 33905511
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||    
T  33905690 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtatcaatttcggtgggttaagtccatacagagtttgttctg 33905591  T
Q  121 gctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||  || || ||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||  || |||||| ||||||||| |||||||    
T  33905590 gctttaaacggggcctccgtaagtggacggtgggattgatcccctcaaatttatcgattctttgatcggataccgagttt 33905511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 21726735 - 21726917
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||| ||||||||||   ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| | |||| ||    
T  21726735 gttgacctagtggttgatttgggttcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatgggttaagtccatatag 21726834  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||  || ||||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  21726835 agcttgttctagctttaaacgggtcccccacaagtgggcggtggggttgatcccctcagattaatcgattcttggatcggata 21726917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 18646853 - 18647041
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |      
T  18646853 tttggggttgacctagtggttggcttgtgatctttgagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtct 18646952  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||| || |||  ||||||||||| ||  |||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  18646953 atacaaagtttgctctggctttaaacggagcccctgtaagtgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttgaatcggata 18647041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8254897 - 8254753
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtggga 154  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  8254897 ggtctcaggttcgattatctctggtgtcaatttcggtgggctaagttcatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggga 8254798  T
Q  155 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  8254797 ttgatccccttgaattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 8254753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23232455 - 23232304
Alignment:
Q  13 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  23232455 ttggcctagtggttgacttgggatcttgaagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccctctggcgccaatttcggtgggctaagtccatacaga 23232356  T
Q  113 gcttg------ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattg 157  Q
    |||||      |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  23232355 gcttgcaagctctggctttaaatgggacccccgcaagtgggtggtgggattg 23232304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 46113599 - 46113495
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| | |    
T  46113599 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtaccaatttcggtgggctaagtcc 46113500  T
Q  106 ataca 110  Q
    |||||    
T  46113499 ataca 46113495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 2272344 - 2272532
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||| ||| |||    
T  2272344 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctacagaggtctcaggtttgattccctctgatgccaatttcgctgggctaagttc 2272443  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||| || |||  ||| |||||||  || ||||  |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  2272444 atacaaagtttgctctgactttaaacggggcccctacaagggggcggtaggattgatcccatcggattagtcgattctaagatcggata 2272532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Original strand, 48699889 - 48699955
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48699889 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccttcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 48699955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8779909 - 8779745
Alignment:
Q  30 ttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gctttaa 127  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||| |  || |||  |||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||   |||||||    
T  8779909 ttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcagcttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccatacacagcttactctagctttaa 8779810  T
Q  128 atggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    | ||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8779809 acggggcccccacaagtaggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttagatcggata 8779745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 20487387 - 20487297
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgg 96  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20487387 tttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 20487297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25496685 - 25496503
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |    ||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||| |  || |||    
T  25496685 tttggcgttggcctagtgattggcttgggatcttggagattgctcctcttaaggtctcaagttcgattccctctagtgcctatttcggtgag-caagttc 25496587  T
Q  106 atacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||  |||||| ||||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  25496586 atattgagcttactggcttaaaatggggctccgcaagtggacggtgggattgatcccct--gattagtctgtacttggatcggata 25496503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29057534 - 29057364
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||  |||| ||    
T  29057534 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctgctccaaaggtctcaggttcgattccctcttgtgccaatttcgatgg--taaagtc 29057437  T
Q  106 -atacagagcttg--ctggcttt-aaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 174  Q
     ||||||||||||  |||||||| ||  || ||||||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||    
T  29057436 tatacagagcttgctctggctttcaacgggacccccgcaaatgggcgatgtgattggtcccctcaaattagtc 29057364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 191
Target Start/End: Original strand, 32930748 - 32930937
Alignment:
Q  5 gtttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaatt 104  Q
    |||||| |||| |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||| || |||||||  |||| |||||| ||| |     
T  32930748 gtttggggttgacctagtggttggtttggaatcttggagtttactccttcagaggtctcaagttcgatttcctctggtgcccattttggtgggctaagtc 32930847  T
Q  105 catacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||  ||  ||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| || |||||| ||| |||||    
T  32930848 catgcagagcttgctctggctttaaacggggtccctgcaagtggatggtgggattgatcccctcagattaatcgattcttagattggata 32930937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26513226 - 26513149
Alignment:
Q  122 ctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  26513226 ctttaaacgggcccccacaagtgggcggtgggaatggtcccctcggattagtcgattcttggatcgaataccgagttt 26513149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 14258617 - 14258538
Alignment:
Q  13 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcg 92  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  14258617 ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagatgtctctggttcgattccctctggtaccaatttcg 14258538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45331739 - 45331622
Alignment:
Q  86 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 181  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  45331739 aatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggctccccgcaagtggacggtgggattaatcccctcagattaatcgattctt 45331640  T
Q  182 ggatcggataacgagttt 199  Q
    | |||||||| |||||||    
T  45331639 gaatcggataccgagttt 45331622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Original strand, 22910001 - 22910067
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||    
T  22910001 cccccgcaagtgggcggtgggatttgtcccctcggattagtcgatacttcgatcggataccgagttt 22910067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Original strand, 35138118 - 35138184
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  35138118 cccccgcaagtgggcggtgggattgattccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 35138184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 25237180 - 25237095
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  25237180 gttggcctaatggttagtttgggatcttggagtttgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtggg 25237095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 1486420 - 1486616
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| || | |    
T  1486420 tttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagt--gctactctcaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatgggt-aagtcc 1486516  T
Q  106 atacagagcttg---ctggctttaaatgg---ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||    ||| |||  || ||   |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  1486517 atacagagctttgctctgacttagaacggggcccccccgcaagtggacggtgggatcggtcccctccgattagtcggtccttggatcggataccgagttt 1486616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 199
Target Start/End: Original strand, 27159205 - 27159281
Alignment:
Q  123 tttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  27159205 tttaaacgggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattagtcgatctttggatcggatatcgagttt 27159281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 199
Target Start/End: Original strand, 23041655 - 23041718
Alignment:
Q  136 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23041655 ccgcaagtggacagtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 23041718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 180
Target Start/End: Original strand, 2537820 - 2537870
Alignment:
Q  130 ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattct 180  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2537820 ggccccccgcaagtgggcggagggattggtcccctcggattagtcagttct 2537870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18533921 - 18533733
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||| | ||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||| || ||||| | || |||| ||||||| |||  ||| | |    
T  18533921 tttggggttgacatagtggttgacttgagatcttagagtttgctcctccagaggtatcagatttgattctctctagtgccaatttcgatggactaagtcc 18533822  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||| ||||||||  ||| |||||||  || |||| |||||||||| ||||||||| |||||||  |||| || |||||| |||||||||    
T  18533821 atatagagcttgttctgactttaaacggggcccctgcaagtgggccgtgggattggtcccctcatattaatcgattcttagatcggata 18533733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 98
Target Start/End: Original strand, 24216978 - 24217070
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggt 98  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |    |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  24216978 tttggggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattacctttggtgccaatttcggtgggt 24217070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40146027 - 40145890
Alignment:
Q  62 tcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaa------gtgggcggtggg 153  Q
    |||||||||||| || || |||| |||||  ||||| ||| | |||||||||||||||  | |||||||||| ||||| |||      ||||| |||| |    
T  40146027 tcaggttcgatttcctctagtgccaatttatgtgggctaagtccatacagagcttgctctgactttaaatgggcccccacaaccacaagtgggtggtgag 40145928  T
Q  154 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40145927 tttggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 40145890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 76
Target Start/End: Original strand, 1818734 - 1818804
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccc 76  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  1818734 tttggggttggcctggtagttggcttaggatcttggagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccc 1818804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 199
Target Start/End: Original strand, 50202680 - 50202741
Alignment:
Q  137 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||    
T  50202680 cgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattaatcgattctt-gatcggatatcgagttt 50202741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 199
Target Start/End: Original strand, 5315478 - 5315527
Alignment:
Q  150 tgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5315478 tgggattggtcccctcggataagtcgattcttggatcggataccgagttt 5315527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 199
Target Start/End: Original strand, 14603947 - 14603992
Alignment:
Q  154 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14603947 attggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 14603992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 51
Target Start/End: Original strand, 47091690 - 47091735
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 51  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  47091690 tttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcc 47091735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 51
Target Start/End: Original strand, 6776150 - 6776189
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 51  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6776150 gttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcc 6776189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12877003 - 12876965
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatta 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12877003 cccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggatta 12876965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 191
Target Start/End: Original strand, 47091751 - 47091809
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  |||  ||||| |||||||||||||||||    
T  47091751 cccccgcaagtggggggtgggattggtccattcgatttagtaaattcttggatcggata 47091809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 809228 - 809313
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||| |    ||||||||||| |||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  809228 gttggcctcgtggttggtttgggatcttggagtttactcctcttaaggtctcaggtttgattacccctagtgtcaatttcggtggg 809313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15581188 - 15581119
Alignment:
Q  28 gcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |  |||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||    
T  15581188 gcttgggaccttggagtgtgctcctctaaaggtctcaggttcaattctccccggtgctgatttcggtggg 15581119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 97
Target Start/End: Original strand, 16899557 - 16899594
Alignment:
Q  60 tctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16899557 tctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 16899594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 19034569 - 19034492
Alignment:
Q  20 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| | |  ||| ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  19034569 agtggttggtttgggatcttggagtttgttcctcaaaaggtttcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtggg 19034492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 115
Target Start/End: Original strand, 39964564 - 39964621
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagct 115  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  39964564 ggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctgagttcacacagagct 39964621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40802166 - 40802070
Alignment:
Q  105 catacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||| ||| || | ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||    
T  40802166 catacagagcttgctctgactttaaacgggtccccgcaagtgggtggtgagattggtcctctagaattagtcgattcttgaatcgaataccgagttt 40802070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Original strand, 52135261 - 52135314
Alignment:
Q  138 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  52135261 gcaagtggacggtgggattggtcccctcatattagtcggttcttggatcggata 52135314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 94
Target Start/End: Original strand, 1378745 - 1378833
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggt 94  Q
    ||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||  ||||||| ||||||||  | ||||||  |||||||||    
T  1378745 tttggggttggtctagtggttgacttggaatcttggagtttactcctccaaaggtctcatgttcgattttctctggtgtcaatttcggt 1378833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36921595 - 36921513
Alignment:
Q  118 ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  | |||||  ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  36921595 ctggctttaaatgggaccccccgcaagtggacggtgggattagt-ccctcaaattagtcgattattgaatcggataccgagttt 36921513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43770031 - 43769975
Alignment:
Q  134 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggat 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  43770031 ccccacaaatgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcgattctaggatcggat 43769975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 52135130 - 52135174
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctc 50  Q
    ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52135130 tttggggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctc 52135174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 53)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 4718649 - 4718845
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  4718649 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 4718748  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4718749 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 4718845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 28193478 - 28193674
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |    
T  28193478 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtcc 28193577  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  28193578 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccctacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 28193674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 34237852 - 34237656
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  34237852 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 34237753  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34237752 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34237656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 39349260 - 39349448
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  39349260 tttggggttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 39349359  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39349360 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggata 39349448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3734820 - 3734624
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  3734820 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 3734721  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3734720 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 3734624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 21603241 - 21603430
Alignment:
Q  13 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||   ||||||||    
T  21603241 ttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagcccatacaga 21603340  T
Q  113 gcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21603341 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 21603430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 2618190 - 2618386
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| | |    
T  2618190 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttgggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtcc 2618289  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  2618290 atacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggattccgagttt 2618386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 19471613 - 19471810
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| | ||| | |    
T  19471613 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaagtcc 19471712  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  19471713 atacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggataccgagttt 19471810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 19542537 - 19542734
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| | ||| | |    
T  19542537 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaagtcc 19542636  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  19542637 atacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggataccgagttt 19542734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19590159 - 19589962
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| | ||| | |    
T  19590159 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaagtcc 19590060  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  19590059 atacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggataccgagttt 19589962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8765701 - 8765527
Alignment:
Q  28 gcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  8765701 gcttgagatcttggagtttgctcccccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 8765602  T
Q  126 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8765601 aaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 8765527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15259603 - 15259407
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  15259603 tttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggattttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 15259504  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  15259503 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgtaattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggatgccgagttt 15259407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 20305912 - 20306108
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||| | |    
T  20305912 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaagtcc 20306011  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  20306012 atacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgatccttggatcggataccgagttt 20306108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 21092545 - 21092741
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||| | |    
T  21092545 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaagtcc 21092644  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  21092645 atacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgatccttggatcggataccgagttt 21092741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 32879283 - 32879479
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  32879283 tttggggttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttggtcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttc 32879382  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  32879383 atacagagcttgctctgacattaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattggataccgagttt 32879479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 42643315 - 42643119
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| ||| | |    
T  42643315 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtcc 42643216  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  42643215 atacagagcttgctctgtcttgaaacgggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgcattagttgattcttggatcggataccgagttt 42643119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 264596 - 264409
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| |      
T  264596 tttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtct 264497  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  264496 atacatagcttgctctggctttaaacgggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 264409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 651325 - 651512
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| |      
T  651325 tttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtct 651424  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  651425 atacatagcttgctctggctttaaacgggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 651512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 837060 - 837247
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| |      
T  837060 tttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtct 837159  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  837160 atacatagcttgctctggctttaaacgggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 837247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 42328009 - 42328204
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| | |    
T  42328009 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagttt-ctcctccagaggtgtcaggtttgattccctctgttgccaatttcggtgggctaagtcc 42328107  T
Q  106 atacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42328108 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtggacgatgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 42328204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27746532 - 27746348
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| | |    
T  27746532 tttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtcc 27746433  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagt-gggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 187  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27746432 atacagagcttgctctggctttaaaaggggccccacaagtggggcgatggaattagtcccctcggattagtcgattcttggatcg 27746348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Original strand, 14632975 - 14633146
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||  |||    
T  14632975 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctg 14633074  T
Q  121 gctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||| || ||  |  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14633075 gctttgaacggagcgtccacaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggata 14633146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 28088296 - 28088478
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| | |||||||    
T  28088296 gttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgttcatccagaggtctcagattcgattccctttggtgtcaatttcggtgggttaagtccatacag 28088395  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||  ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  28088396 agcttgctctgactttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcagaatagtcgattcttggatcggata 28088478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4698914 - 4698724
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | |||  ||    
T  4698914 gttggcccagcggttggtttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatgaag 4698815  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    | ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  4698814 aacttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcatggattggataccgagttt 4698724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26169039 - 26168862
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||  || |||||||||    
T  26169039 gttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggtttgattcctcctgatgccaatttcggtggg-caagttcatacag 26168941  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 187  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26168940 agcttgttctggctttaaatgagcccctcgcaagtgggggatgagattggtcccctcggagtagtcgattcttggatcg 26168862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Original strand, 20469943 - 20470116
Alignment:
Q  28 gcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | || ||||| | |||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  20469943 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagagccaatttagatgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 20470042  T
Q  126 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  20470043 aaacagagcccccgcaagtgggcggtgggattggt-tcctcggattagtcgatttttggatcggataccgagttt 20470116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7558140 - 7557952
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||| | |    
T  7558140 tttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcagattcgatttcctctggtgccaattttggtgggctaagtcc 7558041  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
           |||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  7558040 -------gcttgttctggctttaaacggacccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgatttttgcatcggataccgagttt 7557952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6953152 - 6953009
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtggga 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||    
T  6953152 ggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagttggcggtggga 6953053  T
Q  155 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  6953052 ttggt-ccctcggattagtcgattcttggatcgaataccgagttt 6953009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 18532111 - 18532298
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||| ||| | |    
T  18532111 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcagatgtcaatttcggtgggctaagtcc 18532210  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||  || |||| |||||||||||||| ||||         ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18532211 atacagaacttgctctggatttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgagatt---------ggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 18532298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 34610869 - 34610688
Alignment:
Q  21 gtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct- 119  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||| ||  ||||  |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  ||| |  ||||||||||||||     
T  34610869 gtggttggcttaggattttggagtttgttcatccagatgtctgaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggtctaagtctatacagagcttgctc 34610770  T
Q  120 -ggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
     ||||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34610769 tggctttaaacgagcccctcgcaagtgggcggtagaattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34610688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 199
Target Start/End: Original strand, 2166727 - 2166896
Alignment:
Q  30 ttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaa 127  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| |  |||| |||||| || || ||| | |||||||||||||||  ||||||||    
T  2166727 ttgggatcttggagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgattccctc--gtgccaatttcagtaggctaagtccatacagagcttgctctggctttaa 2166824  T
Q  128 atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||| ||||| |||||||    
T  2166825 ataagaccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattttttgattggataccgagttt 2166896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 199
Target Start/End: Original strand, 25248407 - 25248546
Alignment:
Q  60 tctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || ||| | ||||||||| |||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  25248407 tctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggctaagt-catacagagtttgctctggctttaaacgggccctcgcaagtgggcggtgggattg 25248505  T
Q  158 ttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
     |||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  25248506 gtcccctcggattagtcgatt-tttgatcggataccgagttt 25248546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Original strand, 24018398 - 24018583
Alignment:
Q  18 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg 117  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| || ||  ||  |||||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  24018398 ctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctgaggttcgatttcctctaatgtcaatttcagtgggctaagtccatacagagcttg 24018497  T
Q  118 --ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
      ||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  24018498 ctctggctttaaacgggcctccccacaagtgggcggtgagattggtccccttgaattagtcggttcttggaccggatatcgagttt 24018583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2639478 - 2639412
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2639478 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 2639412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 181
Target Start/End: Original strand, 21667560 - 21667731
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||  | | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  21667560 gttggtctagtggttggcttggaatcttggaggttgctcctccaaagatttcaggttcgatttcctttggtgctaatttcggtgggctaagtccatacag 21667659  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 181  Q
    ||||||  ||| ||||||| ||  |  ||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||||    
T  21667660 agcttgctctgcctttaaacggagcatccgcaagtgggcggtggaattggt-ccctcagattagtcgattctt 21667731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Original strand, 28964037 - 28964220
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||| |    ||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  28964037 tttggggttggtctagtggttggtttgagatcttagagtttgctcctcttaaggtttcatgttcgattccatctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 28964136  T
Q  106 atacagagct-tg-ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 187  Q
    |||| ||||| || |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  28964137 atacggagctatgtctggctttaaacggggcccccgcaagtgggc-gtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcg 28964220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 34694773 - 34694576
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |    ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  34694773 tttggggttggtctagtggttgacttgtgatcttggagtttgctcctctcaaggtcttaggttcgattccatctggtgccaatttcggtggg-caaattc 34694675  T
Q  106 atacagagc-ttgct--ggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||| ||| |||||  |||||  || ||   ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  34694674 atacaaagctttgctccggcttagaacggaatccccctctagtggacggtgggattggtcccctcagattagtctgtccttggatcggataacgagttt 34694576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Original strand, 10292111 - 10292254
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtggga 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| | | | ||| ||||| |||||  ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  10292111 ggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctgagtccat-cagagattgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtggga 10292209  T
Q  155 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  10292210 ttggtcccttcggattagttgattcttggatcgaataccgagttt 10292254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 199
Target Start/End: Original strand, 12312965 - 12313045
Alignment:
Q  119 tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| || |||| | |||||||    
T  12312965 tggctttaaatgggcccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcggttcttagagcggaaaccgagttt 12313045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 8042658 - 8042834
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||       |||||| ||||| |||||| ||  | |    
T  8042658 tttggggttgacctagtgcttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcaggttcga-------tggtgccaattttggtgggctatgtcc 8042750  T
Q  106 atacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||  ||||||||||| | |||| | |||| ||  |||||||||||||||    
T  8042751 atacagagtttgctggcttttaatgg-tccccgcaaatgaacggtgggattggt-cccttgaattaatcggttcttggatcggata 8042834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Original strand, 18128569 - 18128713
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg---ctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtggg 153  Q
    ||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||||  || | |||| |||||||    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  18128569 ggtcttagattcgattctctctggtgccaatttcggtgggcgaa-tccataaagagctttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggg 18128667  T
Q  154 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  18128668 attggtcctctcagattagtcggttcttggatcgaataccgagttt 18128713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 157
Target Start/End: Original strand, 24999290 - 24999392
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtggga 154  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| | |||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  24999290 ggtcttaggttcgattccctctgatgccaattttgatgggctaagttcatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggga 24999389  T
Q  155 ttg 157  Q
    |||    
T  24999390 ttg 24999392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 13749187 - 13749248
Alignment:
Q  130 ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  13749187 ggccccccgcaagtgggcagtggaattggtcccctcggattagtcagtccttggatcagata 13749248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36848946 - 36848759
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||| |    ||| | || ||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  36848946 tttggggttggcatagtggttgacttgggtttttggagtttgctcctctcaaggttttagattccatttcctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 36848847  T
Q  106 atacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||| ||| |||||  |||||||||||   | || ||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  || ||||||||||||    
T  36848846 atacggagtttgctcgggctttaaatgaggcaccacaagtgggcggtgggattagtcccctcaaattagtcggtttttggatcggata 36848759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Original strand, 33747016 - 33747082
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  33747016 cccccgcaagtggacggtggaattggttctctcggattagtcgatccttggatcggataccgagttt 33747082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 34639391 - 34639295
Alignment:
Q  18 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  34639391 ctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggctcga-tccctctggtgccaatttcggtggg-taagtccatacagagctt 34639295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 15974916 - 15974999
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    ||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  15974916 gttggcctagtggtta-cttgggatcttggagtatgctcctctcaaggtctcaagttcgatt-cccctagtgcaaatttcggtggg 15974999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8387641 - 8387550
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| | |   |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||||||    
T  8387641 tttggggttggcctagtggttgtcttgagatcttagagtttgcttctctcagggtctcaagttcgatttcctctggtgccaattttggtggg 8387550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3403584 - 3403503
Alignment:
Q  119 tggctttaaatggccccc-cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || | |||| |||||||    
T  3403584 tggctttaaatggggccctcgtaagtgggcggtgaggttggtcccctcgaattagtcaattcttagaccagataccgagttt 3403503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 199
Target Start/End: Original strand, 9713609 - 9713654
Alignment:
Q  154 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9713609 attggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 9713654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Original strand, 16990722 - 16990775
Alignment:
Q  138 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  16990722 gcaagtgggcggtgggactggtccccttggattagtcggtccttggatcggata 16990775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42332094 - 42332025
Alignment:
Q  118 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 187  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  42332094 ctggctttaaacggtcctccgcaagtgggcgttaggattggtcccttcagataagtcaattattggatcg 42332025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43817816 - 43817759
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggat 190  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| || |||||||||||||||    
T  43817816 cccccgcaagtgggcggtggaattggtctcctcaaattaatcgattcttggatcggat 43817759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33696470 - 33696280
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  33696470 gttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacag 33696371  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33696370 agcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcggattagtcaattcttggatcggatatcgagttt 33696280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 32986197 - 32986393
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  32986197 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 32986296  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32986297 atacagagcttgctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggaatagtcgattcttggatcggataccgagttt 32986393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 34844955 - 34844759
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  34844955 tttggggttggcctagtggtttgcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 34844856  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34844855 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34844759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40059049 - 40058853
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  40059049 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 40058950  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40058949 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40058853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 52983619 - 52983815
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| | |    
T  52983619 tttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtcc 52983718  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52983719 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 52983815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5609399 - 5609203
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  5609399 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcattcagtggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 5609300  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5609299 atacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 5609203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19660729 - 19660533
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||| ||| | |    
T  19660729 tttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattctctctgatgcaaatttcggtgggataagtcc 19660630  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19660629 atacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 19660533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27528986 - 27528796
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  27528986 gttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacag 27528887  T
Q  112 agcttg--ctggcttta-aatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||  ||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27528886 agcttgctctggctttatacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 27528796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 46714392 - 46714589
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccct-ggtgctaatttcggtgggttaaatt 104  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||| |     
T  46714392 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttccctttggtgccaatttcggtgggctaagtc 46714491  T
Q  105 catacagagcttgc--tggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  46714492 catacagagcttgcccttgctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcaattcttgaatcggataccgagttt 46714589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 20566349 - 20566546
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtc-tcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaatt 104  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |     
T  20566349 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaaagtc 20566448  T
Q  105 catacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20566449 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcgctgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 20566546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 25852214 - 25852411
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  25852214 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 25852313  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   || ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  25852314 atacagagcttgctctggctttaaaacgggaccctcgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcggttcttggaccggataccgagttt 25852411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 54127539 - 54127351
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||| ||| |      
T  54127539 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcaattccctcttgtgccaatttcggtgggctaagtct 54127440  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  54127439 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggaccggata 54127351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20078159 - 20077986
Alignment:
Q  28 gcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  20078159 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattcccactggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 20078060  T
Q  126 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 198  Q
    |||  || |||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20078059 aaacggggcccccgtaagtgggcggtgggattagttccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtt 20077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45787900 - 45787705
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||| | |    
T  45787900 tttggggttggcctagtggttggcttggaatcttgga-tttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctaagtcc 45787802  T
Q  106 atacagagcttgct--ggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  45787801 atacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 45787705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 44343513 - 44343710
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttag-cttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaatt 104  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |     
T  44343513 tttggggttgggctagtggtttggcttgggatcttggagtttgctcccccaaaggactcaagttcgattccctctggtgctaattttggtgggctaagtc 44343612  T
Q  105 catacagagcttgct--ggctttaaatggccc-cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  44343613 catacagagcttgctctgactttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 44343710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 35229174 - 35229356
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||     
T  35229174 gttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttct-atgccaatttcggtgggctaagtccatacat 35229272  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||  ||| ||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35229273 agcttgctctgactttaaacgggtccccccacaagtgagcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 35229356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7392143 - 7391966
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||  |||    
T  7392143 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggt-ggttaagtccatacagagtttgctctg 7392045  T
Q  121 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||||||    
T  7392044 gctttaaatgggacccccatagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcggttcttcgattggataccgagttt 7391966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 49287872 - 49288045
Alignment:
Q  20 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc- 118  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | |||||| |  ||||     
T  49287872 agtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaaatttgct 49287971  T
Q  119 -tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
     |||||||||| || | |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  49287972 atggctttaaacgggctcccgcaagtgggcgctgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagata 49288045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 51535619 - 51535809
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg----ttaaattcat 107  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    |||| | |||    
T  51535619 gttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccacaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaattaagtccat 51535718  T
Q  108 acagagcttg-----ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||     |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  51535719 acagagcttgcagctctggctttaaacggggcccccagcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcggata 51535809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36131707 - 36131511
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||| | |    
T  36131707 tttggggttggcatagtggtttgcttgggattttggagttcgttcctccagatgtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtggcctaagtcc 36131608  T
Q  106 atacagagcttgc--tggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||  || |||||||  || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||    
T  36131607 atacagagcttgctatgactttaaacgggacccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattattagatcagataccgagttt 36131511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 199
Target Start/End: Original strand, 34723854 - 34723995
Alignment:
Q  61 ctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattg 157  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  34723854 ctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattg 34723953  T
Q  158 ttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34723954 gtcctctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34723995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13873492 - 13873321
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||    
T  13873492 tttggggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtaggctaagttc 13873393  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 174  Q
    |||||||| |||  || |||| |||  || |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||    
T  13873392 atacagagtttgctctagcttcaaacagggcccccgcaagtgggtggtggaattgatcctctgggattagtc 13873321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22625261 - 22625154
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| | |||||||    
T  22625261 gttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttactcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtccatacag 22625162  T
Q  112 agcttgct 119  Q
    ||||||||    
T  22625161 agcttgct 22625154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 32942370 - 32942552
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||| | ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||| | |    
T  32942370 tttggggttggtctagtggttggcttgagatcttggagtttactcctccagaggtttaaggttcgattctctctgatgccaatttcggtgggctaagtcc 32942469  T
Q  106 atacagagctt--gctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggat 185  Q
    |||||||||||   ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||    
T  32942470 atacagagcttactctggctttaaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggataaatcgattcttggat 32942552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18875659 - 18875518
Alignment:
Q  60 tctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||    
T  18875659 tctcaggttcgattccctctgatgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggcccccacaagtgggtagtgggattg 18875560  T
Q  158 ttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  18875559 atcccctcggattagtcaatttttggatcagataccgagttt 18875518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Original strand, 34835529 - 34835713
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | |    
T  34835529 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctcttaaggtctcatgttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtcc 34835628  T
Q  106 atacagagct-tg-ctggctttaaat--ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 187  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34835629 atacggagctatgtctggctttaaatagggccccccgcaagtgggc-gtgagattggtcccctcggattagtcgattcttagatcg 34835713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 187
Target Start/End: Original strand, 32990488 - 32990619
Alignment:
Q  59 gtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggat 155  Q
    ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  32990488 gtctcaggttcgattccctttagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggat 32990587  T
Q  156 tgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 187  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32990588 tggtcccctcggactagtcgattcttggatcg 32990619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 1985843 - 1986030
Alignment:
Q  13 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| ||| | ||||||||    
T  1985843 ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgcgaatttcgatgggctaagtccatacaga 1985942  T
Q  113 g----cttgctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |    ||  ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  1985943 gtaaact--ctggctttaaacggagcccccacaagtgggcggtggaattggt-ctatcggattagtcgattcttggat-ggataccgagttt 1986030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 35674938 - 35674750
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| | |    
T  35674938 tttggggttggccaagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccaaaggtcacaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 35674839  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||  || |||||||||||||||||| ||||       |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  35674838 atacagagcttgctctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggttggat-------ctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 35674750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 150
Target Start/End: Original strand, 33992632 - 33992773
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||     
T  33992632 gttgacctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacat 33992731  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggt 150  Q
    ||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  33992732 agcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 33992773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 27574356 - 27574506
Alignment:
Q  44 tttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgca 140  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||  | ||  | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||    
T  27574356 tttgctcctccataggtctcaggttcgattttctcttattccaatttcggtaggctaaattcatacagagcttgctctggctttaaaaggggcccccgca 27574455  T
Q  141 agtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27574456 agtgggcggtgagtttggtcccctcggattaatcaattcttggatcggata 27574506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9517786 - 9517650
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtggga 154  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||| ||||| |||| ||    
T  9517786 ggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaggtgggtggtgaga 9517687  T
Q  155 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9517686 ttggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 9517650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12500231 - 12500060
Alignment:
Q  30 ttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| ||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  12500231 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 12500132  T
Q  128 a-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |  || ||||||||||||||||||   |||| | | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12500131 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattagtcaattcttggaccggataccgagttt 12500060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Original strand, 2351020 - 2351124
Alignment:
Q  13 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 112  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||||| |||||| |    
T  2351020 ttggcctagtggttggcttggaatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtcgactaaatccatacata 2351119  T
Q  113 gcttg 117  Q
    |||||    
T  2351120 gcttg 2351124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30879338 - 30879175
Alignment:
Q  30 ttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| || |||  ||||||||||    
T  30879338 ttgggatcttgtagtttgctccttcatgggttttaggtttgattccctctggtgccaatttcgatgggttaaatccatacaaagtttgctctggctttaa 30879239  T
Q  128 atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    | ||   || |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  30879238 agggggtcctgcaagtggacggtgggattggttccctcagattaatcgattcttggatcagata 30879175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 43719262 - 43719154
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||| | |    
T  43719262 tttggggttggtctagtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattctctctagtgctaatttcggtgggctaagtcc 43719163  T
Q  106 atacagagc 114  Q
    |||||||||    
T  43719162 atacagagc 43719154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 13550214 - 13550392
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||    |||||| || |||| |||||||||||| ||| | ||||| |    
T  13550214 gttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccataccg 13550313  T
Q  112 agcttgct--ggctttaaatggcc-ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 187  Q
    ||||| ||  ||||||||| ||   |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13550314 agcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggattaatcgattcttggatcg 13550392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 55961932 - 55961767
Alignment:
Q  13 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||            || ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  55961932 ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctt-----------cctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaga 55961844  T
Q  113 gcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 187  Q
    |||||||  | ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| || ||||||| ||||    
T  55961843 gcttgctctgactttaaacggggccccacaagtgggcggtgggattggttccttcggattaatcgattcttgaatcg 55961767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 199
Target Start/End: Original strand, 23639758 - 23639820
Alignment:
Q  137 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23639758 cgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 23639820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 199
Target Start/End: Original strand, 23645416 - 23645478
Alignment:
Q  137 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23645416 cgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 23645478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 199
Target Start/End: Original strand, 52494623 - 52494684
Alignment:
Q  138 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52494623 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 52494684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 191
Target Start/End: Original strand, 4064990 - 4065048
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4064990 cccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatttttggatcggata 4065048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9978576 - 9978510
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  9978576 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagttgattcttagatcggataccgagttt 9978510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25969639 - 25969512
Alignment:
Q  64 aggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcc 161  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   || | |||||||| ||||||  ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  25969639 aggttggattccccctggtgccaatttcggtggcc-aagtccatacagaacttgctctggctttaaacgggcccccgtaagtgagcggtgggattggt-c 25969542  T
Q  162 cctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  25969541 cctcgaattagtcgattcttgaatcggata 25969512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20527198 - 20527035
Alignment:
Q  38 ttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggcccc 135  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||| | |||| ||||||||   | | ||||||  |  ||    
T  20527198 ttggagtttgttcctccagaggtctcaagtttgattccctctggcgccaatttcggtgggctaagtccatatagagcttgatttcggtttaaacagggcc 20527099  T
Q  136 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||    
T  20527098 ccgtaagtgggcggtaggattggtctcctcggattagtcgatttttggatcaaataccgagttt 20527035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21387628 - 21387496
Alignment:
Q  60 tctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggcc-ccccgcaagtgggcggtgggatt 156  Q
    |||||||||||||||||  | |||  ||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||  ||||||||| ||   ||||||||||||||||||||  |    
T  21387628 tctcaggttcgattccctatagtgtcaattttggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacgggatccccgcaagtgggcggtggg--t 21387531  T
Q  157 gttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21387530 ggtcccctcggattagtcgattattggatcggata 21387496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13584445 - 13584338
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||   |||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||| | |||| ||    
T  13584445 gttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagtccatagag 13584346  T
Q  112 agcttgct 119  Q
    ||||||||    
T  13584345 agcttgct 13584338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43719154 - 43719096
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43719154 cccccgaaagtgggcggtgggattggtcatctcggattagtcgattcttggatcggata 43719096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Original strand, 4911978 - 4912122
Alignment:
Q  62 tcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct------ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtggga 154  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||  | |||| ||||||||||      ||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||    
T  4911978 tcaggttcgattccctctggtgttaattttggtggcctatgtccatatagagcttgcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggtggtgtga 4912077  T
Q  155 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  4912078 ttgatccccccgaattagtcgattcttggatcagataccgagttt 4912122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 55158409 - 55158344
Alignment:
Q  134 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||    
T  55158409 ccccgcaaatgggtggtgggattggtcccctcggattagtcgatttttggatcggaaaccgagttt 55158344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23131497 - 23131437
Alignment:
Q  139 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  23131497 caagtgggcggtaggattggtcccctcgaattagtcgattcttcgatcggataccgagttt 23131437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 191
Target Start/End: Original strand, 33289180 - 33289242
Alignment:
Q  129 tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33289180 tggccccctacaagtggacggtgagattagtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 33289242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 56
Target Start/End: Original strand, 34722170 - 34722220
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccag 56  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34722170 tttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccag 34722220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 41621793 - 41621684
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |    ||||||| ||| |||| || ||||||| ||||| ||||||  |||| |    
T  41621793 tttggggttggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctctcaaggtctcatgtttgatttcctctggtgccaattttggtggg-caaatcc 41621695  T
Q  106 atacagagctt 116  Q
    |||||||||||    
T  41621694 atacagagctt 41621684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 76
Target Start/End: Original strand, 42245746 - 42245816
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccc 76  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||    
T  42245746 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctctaaaggtctcgggttcgattccc 42245816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22488145 - 22488037
Alignment:
Q  86 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 182  Q
    |||||||||||  ||| | |||| ||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||  | ||||    
T  22488145 aatttcggtggactaagtccatatagagcttgttctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattgatcccctcaaattagtcggtccttg 22488046  T
Q  183 gatcggata 191  Q
    |||||||||    
T  22488045 gatcggata 22488037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 199
Target Start/End: Original strand, 51595153 - 51595218
Alignment:
Q  134 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||| |||||| |||| || | |||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  51595153 ccccgcaagtggacggtggaattgatctcttcggattaatcgattcttggatcggataccgagttt 51595218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17637912 - 17637853
Alignment:
Q  139 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  17637912 caagtgggcggtgatattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 17637853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 37302623 - 37302675
Alignment:
Q  139 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37302623 caagtgggcgatgggattggtcccttcggattagtcgattcttgaatcggata 37302675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Original strand, 7093508 - 7093567
Alignment:
Q  140 aagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  7093508 aagtgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcggtccttggatcggatatcgagttt 7093567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9646280 - 9646217
Alignment:
Q  136 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| || |||||||    
T  9646280 ccgcaagtgggcagtgggattgatcccctcggattagtcggtcattggatcgggtaccgagttt 9646217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 199
Target Start/End: Original strand, 45302953 - 45303032
Alignment:
Q  121 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggatt-gttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||  || ||||||||| ||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45302953 gctttaaatggggcctcgcaagtggacggtgagatttggtcatctcggattagtcaattcttgaatcggataccgagttt 45303032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4585793 - 4585732
Alignment:
Q  119 tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 181  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  4585793 tggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggt-ggattggtcctttcggattagtcgattctt 4585732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 187
Target Start/End: Original strand, 13017843 - 13017897
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||    
T  13017843 cccccgcaagtgggcagtgggattggtccactcggattagtcggtccttggatcg 13017897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13716513 - 13716459
Alignment:
Q  137 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  13716513 cgcaagtgggcggtgggattggtcctcttggattggtcagttcttgaatcggata 13716459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Original strand, 12824535 - 12824588
Alignment:
Q  138 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12824535 gcaagtggacggtgggattggtctcatcgaattagtcgattcttggatcggata 12824588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 3392810 - 3392759
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcataca 110  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  3392810 ggtctcaggttcgatttcctctggtgttaatttcggtggg-aaaattcataca 3392759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 47
Target Start/End: Original strand, 10125783 - 10125823
Alignment:
Q  7 ttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttg 47  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10125783 ttggagttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttg 10125823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 41621643 - 41621583
Alignment:
Q  139 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  41621643 caagtgggtggtgggactaatcccctcagattagtcggtccttggatcggataacgagttt 41621583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5279 - 5083
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  5279 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 5180  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5179 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 5083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 44946250 - 44946054
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| | |    
T  44946250 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtcc 44946151  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44946150 atacagaacttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 44946054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11941407 - 11941211
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||| | |    
T  11941407 tttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctatggtgccaattttggtgggttaagtcc 11941308  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11941307 atacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 11941211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33827770 - 33827574
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| | |    
T  33827770 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagattgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgttgggctaagtcc 33827671  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33827670 atacagagcttgctctggctttaaacgggacccctgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 33827574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 15037959 - 15038155
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| | |    
T  15037959 tttggggttggcctagtggttgactcgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtcc 15038058  T
Q  106 atacagagcttgc--tggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15038059 atacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 15038155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 17324766 - 17324960
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  17324766 tttggggttggcctagtggttggtttggtatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 17324865  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  17324866 atacagagcttgctctggctttaaatgggcccccacaagtgggcggtgggattagtcccctcaaattagtcgattctt-gatcggatatcgagttt 17324960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 25293172 - 25293355
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||        
T  25293172 gttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcat---- 25293267  T
Q  112 agcttgctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25293268 agct--ctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 25293355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30467027 - 30466831
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||| | |    
T  30467027 tttggggttggcctagtggttggtttgggatattggagtttgttcctctagaggtctcaggttcgattctctctgctgccaatttcggtgggctaagtcc 30466928  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30466927 atacagagcttgctctggctttaaaccgggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 30466831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 44976351 - 44976172
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| | |    
T  44976351 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtcc 44976252  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 181  Q
    |||||||| |||  |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  44976251 atacagagtttgctctggctttaaacggggctccccgcaagtgggcggtgggattgatcccttcggattagtcgattctt 44976172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 24196004 - 24196198
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  24196004 tttggggttggcctagtggttggcttgggattttggggttcgctcctccagaggtttcaggttcgattccctctggtgcaaatttcggtgggctaagtcc 24196103  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||    
T  24196104 atacagaacttgctctggctttaaacgg-gccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattttttgattggataccgagttt 24196198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 19054025 - 19054222
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||| ||| | |    
T  19054025 tttggggtgggcctagtgattggcttgagatcttggagtctgctcctccaaaggtctcaggtttgattccttctggtgttaacttcggtgggctaagtcc 19054124  T
Q  106 atacagagcttgct--ggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  19054125 atacagagcttgctttggctttaaatggaaccccccgcaagtgggcggtgggattggtccgctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 19054222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 35171831 - 35171996
Alignment:
Q  37 cttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-c 133  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  |    
T  35171831 cttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggcaccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggc 35171930  T
Q  134 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  35171931 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 35171996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43374505 - 43374331
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||  |||    
T  43374505 ggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtttatacaaagcttgctctg 43374406  T
Q  121 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||     |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  43374405 gctttaa----gcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 43374331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34516589 - 34516423
Alignment:
Q  22 tggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg- 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||     |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||      
T  34516589 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattc-----ggtggtaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 34516495  T
Q  121 -gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
     |||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34516494 cgctttaaacgggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 34516423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10582174 - 10582018
Alignment:
Q  19 tagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg- 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||     
T  10582174 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 10582075  T
Q  118 -ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 174  Q
     || |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  10582074 tctagctttaaacgggccctcgcaagtgggc-gtgggattggtcccctcgaattagtc 10582018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4567634 - 4567438
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  4567634 tttggggttggcctagtagttggcttgggatcttgaagtttgctccttcagaagtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggctaaatcc 4567535  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgt--------tcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4567534 atacagagcttgttctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattgtgggattggtcctctcggattagtcaattcttggatcggata 4567438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36242492 - 36242321
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--g 120  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | ||  |||||||||||  |    
T  36242492 ggttggcttgggatcttgaaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccagccagagcttgctctg 36242393  T
Q  121 gctttaaatggcc-ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36242392 gctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggata 36242321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 41313992 - 41314179
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |      
T  41313992 tttggggttgccgtagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtct 41314091  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||    
T  41314092 atacagagcttgctctgactttaaacgggatcccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattaatcgattcttcgatcggata 41314179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 41329843 - 41330038
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||| | |    
T  41329843 tttggggttggcctagtggttagtttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtttcagattcgattccctctggtgccaattttggcgggctaagtcc 41329942  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  41329943 ata-agagcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgagattggtcccctcagattagtcggttcttggaccggataccgagttt 41330038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2140633 - 2140487
Alignment:
Q  53 ccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcg 148  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    | | |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2140633 ccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgg----agtccatacagagcttgctctggctttaaatgggcccccccgcaagtgggcg 2140538  T
Q  149 gtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  2140537 gtgggattggtcccctcggattagtcgattattggatcggataccgagttt 2140487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8192548 - 8192353
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  || | |    
T  8192548 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatgtcggtggg-caagtcc 8192450  T
Q  106 atacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| |||||||    |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  8192449 atatagagctttgctctggcttagaacggcccctcgcaagtgggcggtgggattgggcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 8192353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Original strand, 27290598 - 27290770
Alignment:
Q  16 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagct 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  27290598 gcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcccttcggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagct 27290697  T
Q  116 tgct--ggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||  ||||||||| || |||||||||||||              |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27290698 tgctctggctttaaacgggccccccgcaagtg--------------tcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 27290770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36390763 - 36390570
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| | |||  |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||| | |    
T  36390763 tttggggttggcctagtggttggtttgggatct--gagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtggactaagtcc 36390666  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || |||| |||||||| |||||||    
T  36390665 atacaaagcttgctctgactttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggatcagtcgatacttgaatcggataccgagttt 36390570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 191
Target Start/End: Original strand, 8258913 - 8259085
Alignment:
Q  22 tggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ct 119  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||||||| | |||||||| ||||  ||    
T  8258913 tggttagtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctctgacgccaattttggtgggttaagtccatacagatcttgttct 8259012  T
Q  120 ggctttaa-atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||   || ||||||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8259013 ggctttaatcggggcccccgcaagtaggcggtgggattagttccttcggattagtcgattcttggatcggata 8259085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Original strand, 5394034 - 5394205
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||| | ||||||||| |||  |||    
T  5394034 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagtccatacagagtttgctctg 5394133  T
Q  121 gctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  | ||| |||||||||    
T  5394134 actttaaatggggccgccgcaagtgggcggtgggattggtccgttcggattagtcggtccttagatcggata 5394205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27269547 - 27269345
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgct------aatttcggtgggtt 99  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |  ||| | ||||| ||||||| ||||||        |||||||||||| |    
T  27269547 tttggggttggcatagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctaaaggttttaggtttgattccctctggtgtcggtgtcaatttcggtgggct 27269448  T
Q  100 aaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccc-cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgag 196  Q
    || | |||| ||| ||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  27269447 aagtccatatagaacttgctctggctttaaacagccctcccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggataggataccgag 27269348  T
Q  197 ttt 199  Q
    |||    
T  27269347 ttt 27269345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 199
Target Start/End: Original strand, 13266507 - 13266685
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--g 120  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||   || ||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||  ||| | |||||||||||||||  |    
T  13266507 ggttggcttgagatcttggaatttgctcctttagaggtctcatgttcgattcactctggtgccaattccggtggactaagtccatacagagcttgctctg 13266606  T
Q  121 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||   |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13266607 gctttaaacggggccccgcaagtgggtaatgggattggtcccctcaaattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 13266685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Original strand, 1191530 - 1191694
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||| | ||||||||| |||  |||    
T  1191530 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgtttccctctagtaccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgctctg 1191629  T
Q  121 gctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttgga 184  Q
    |||||||| ||   ||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1191630 gctttaaacggtgtccccgaaagtgaacggtggaattgttcccctcgaattagtcgattcttgga 1191694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 199
Target Start/End: Original strand, 28668946 - 28669069
Alignment:
Q  79 tggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtca 175  Q
    |||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  28668946 tggtgccaatttcggtggactaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg 28669045  T
Q  176 attcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||| |||||||||||| |||||||    
T  28669046 atttttggatcggataccgagttt 28669069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 97
Target Start/End: Original strand, 32845091 - 32845182
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32845091 tttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 32845182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18976622 - 18976552
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccc 76  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  18976622 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccc 18976552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 91
Target Start/End: Original strand, 4852558 - 4852643
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttc 91  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4852558 tttggggttgacctagtggttgacttggaatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttc 4852643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Original strand, 45271401 - 45271572
Alignment:
Q  23 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||||  |||    
T  45271401 ggttggcttgggatcttagagtttgcttctccagaggtttcatgttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctg 45271500  T
Q  121 gctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||| |   |||| ||||||| |||| | ||||| |||||||  ||||||| |||||| ||| |||||    
T  45271501 gctttaaacgaagcccctgcaagtgagcggagagattgatcccctcaaattagtcgattctttgattggata 45271572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Original strand, 18692090 - 18692156
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18692090 cccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcgattcttggatcggataccgagttt 18692156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Original strand, 31778114 - 31778227
Alignment:
Q  93 gtgggttaaattcatacagagcttgct------ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggat 185  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  31778114 gtgggttaagttcatacagagcttgcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgagattggtcctctcagattagtcagttcttggat 31778213  T
Q  186 cggataacgagttt 199  Q
    |||||| |||||||    
T  31778214 cggataccgagttt 31778227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 191
Target Start/End: Original strand, 3943792 - 3943928
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccc-cccgcaagtgggcggtggga 154  Q
    |||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||    
T  3943792 ggtctcagattcgattttctctggtgccaatttcggttggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggtggtggga 3943891  T
Q  155 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  3943892 ttggtccccttggattagtcggttattggatcggata 3943928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18976521 - 18976464
Alignment:
Q  134 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18976521 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 18976464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Original strand, 14486955 - 14487021
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  14486955 cccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 14487021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23787153 - 23787056
Alignment:
Q  58 ggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgg 152  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  23787153 ggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaaatccatacagagtttgctctgactttaaatgggacctccgcaagtgggcggtgg 23787056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 44929913 - 44929847
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44929913 cccccgcaagtggacggtgggattggtccccttgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 44929847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 40997535 - 40997434
Alignment:
Q  18 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg 117  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||| | ||| |  ||||||||||||    
T  40997535 ctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcaattccccctagtaccaatttcggtgagataagtcaatacagagcttg 40997436  T
Q  118 ct 119  Q
    ||    
T  40997435 ct 40997434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 199
Target Start/End: Original strand, 29361578 - 29361744
Alignment:
Q  30 ttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc--tggctttaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||| || ||| ||  |||||||||||  ||| | ||    ||||||||  |||||||||    
T  29361578 ttgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaggt-cgatttcctctgatgtcaatttcggtggactaagtcca----gagcttgccgtggctttaa 29361672  T
Q  128 atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    | ||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||    
T  29361673 acggagccccgcaagtgggcagtgggattgatctcctcggattaattgattcctggatcggatatcgagttt 29361744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 199
Target Start/End: Original strand, 39957891 - 39957954
Alignment:
Q  136 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  39957891 ccgcaagtgggcgatgggattggttccctcggattagtcgattcttggattggataccgagttt 39957954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 6714471 - 6714409
Alignment:
Q  13 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattcc 75  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  6714471 ttggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattcc 6714409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 4618876 - 4618795
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcgg 93  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4618876 gttggcctagtggttggcttggaatcttggagtatgctcctctcaaggtttcaggttcgatttcccctggtgccaatttcgg 4618795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 19606036 - 19605951
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  19606036 gttgccctagtggttggcttgggatcttggagtgcgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctaatgctaatttcggtggg 19605951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 199
Target Start/End: Original strand, 44610139 - 44610235
Alignment:
Q  106 atacagagcttgctg--gctttaaatggcccccc-gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  44610139 atacagagcttgctctagctttaaatggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagtcggttcttggaccgaataccgagttt 44610235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Original strand, 4852660 - 4852716
Alignment:
Q  134 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggat 190  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4852660 ccccgcaagtggacggtggaattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggat 4852716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 191
Target Start/End: Original strand, 19174817 - 19174950
Alignment:
Q  60 tctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg---ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggatt 156  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||    |||||||  || ||  ||||| || ||||||||||||||    
T  19174817 tctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggt-aggtccatacagagctttgctctggcttagaacggagccccgtaaatgggcggtgggatt 19174915  T
Q  157 gttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    | ||||||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  19174916 gatcccctcggattaatcggtccttggatcggata 19174950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6714360 - 6714296
Alignment:
Q  135 cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  6714360 cccgcaagtggacggtgagattggtcccctcaaattagtcgattcttggattggataccgagttt 6714296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 19849847 - 19850017
Alignment:
Q  20 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct 119  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||   | |||  ||||| | |||  ||| |  ||||||||||||||    
T  19849847 agtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtcttaagttcgattccttttagtgtcaattttgatggactaagtctatacagagcttgct 19849946  T
Q  120 --ggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 187  Q
      |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||| || ||||||||||||    
T  19849947 ctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcaaattaatcgattcttggatcg 19850017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 714192 - 714126
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||    
T  714192 cccccgcaaatgggcggtgggtttcgtcccctcagattagtcgattcttagattggataccgagttt 714126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9401028 - 9400970
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |  |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  9401028 cccccgcaagtgggcagtgggattggtttccttagattagtcgattcttggatcggata 9400970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28194205 - 28194139
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | || ||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  28194205 cccccgcaagtaggcggtgggattggtctcgtcagattagtcggtccttggatcggataccgagttt 28194139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 191
Target Start/End: Original strand, 45132417 - 45132475
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45132417 cccccacaagtgggcagtaggattggtcctctcggattaatcgattcttggatcggata 45132475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 28194308 - 28194239
Alignment:
Q  28 gcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |    ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  28194308 gcttgggatcttggagtgtgctcctcttaaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtggg 28194239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19605907 - 19605847
Alignment:
Q  139 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |  ||||||||||||| |||||||    
T  19605907 caagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagttgacacttggatcggatatcgagttt 19605847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 181
Target Start/End: Original strand, 32845206 - 32845254
Alignment:
Q  133 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 181  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  32845206 cccctgcaagtgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcgattctt 32845254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0623 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0623
Description:

Target: scaffold0623; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1058
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| | |    
T  1253 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 1154  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  1153 atacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 1058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0366
Description:

Target: scaffold0366; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9496 - 9301
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| | |    
T  9496 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 9397  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  9396 atacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 9301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12197 - 12019
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| || |||||||||||| ||| | |    
T  12197 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 12098  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 182  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12097 atacagagcttgctctggctttaaatggggccccacaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcaattcttg 12019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 40325 - 40520
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  40325 tttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 40424  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40425 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10890 - 10696
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| || |||||||||||| ||| | |    
T  10890 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagtcc 10791  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10790 atacagagcttgctctggctttaaatggggccccacaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcaattctt-gatcggataccgagttt 10696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Original strand, 161831 - 162005
Alignment:
Q  28 gcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  161831 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 161930  T
Q  126 aaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  161931 taatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 162005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7506 - 7318
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| | |    
T  7506 tttggggttggcctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggctaagtcc 7407  T
Q  106 atacagagctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    |||||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7406 atacagagctttctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 7318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 53061 - 52872
Alignment:
Q  13 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||    
T  53061 ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggcttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaaaatccatacaga 52962  T
Q  113 gcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||  |||||||||||  || |||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  52961 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaggtgggcggtaggattggtcctctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 52872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 97563 - 97367
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  97563 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgtagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 97464  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  || ||||| |||||| |||||||    
T  97463 atacagagcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcgtattagtcggtttttggaccggataccgagttt 97367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41841 - 41654
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||| || | ||| | |    
T  41841 tttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcttgttccaatttcgttgtgctaagtcc 41742  T
Q  106 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 191  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41741 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggata 41654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 199
Target Start/End: Original strand, 39131 - 39288
Alignment:
Q  45 ttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggc-cccccgcaa 141  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  | |||||||| ||||  ||||||||||| ||  |||||||||    
T  39131 ttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctatgtccatacagaacttgttctggctttaaacggggcccccgcaa 39230  T
Q  142 gtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  39231 gtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 39288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 199
Target Start/End: Original strand, 32342 - 32483
Alignment:
Q  60 tctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggatt 156  Q
    |||||||||||||| || |||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  32342 tctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaatgtggcccccgcaagtgggtggtgggatt 32441  T
Q  157 gttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  32442 ggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 32483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 66769 - 66950
Alignment:
Q  13 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 112  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||| |             
T  66769 ttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcacgttcgattccttctggtgccaattttggtgggctaagtc-------- 66860  T
Q  113 gcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  66861 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 66950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8604 - 8513
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtggg 97  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  8604 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtggg 8513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8513 - 8452
Alignment:
Q  138 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  8513 gcaagtgggcggtgggattggtccgctcggattagtcgattcttagatcggataccgagttt 8452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 199
Target Start/End: Original strand, 20246 - 20417
Alignment:
Q  30 ttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| ||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  20246 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 20345  T
Q  128 a-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |  || ||||||||||||||||||   |||| | | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20346 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattagtcaattcttggaccggataccgagttt 20417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29332 - 29144
Alignment:
Q  13 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 112  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||| || ||| |    ||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| || | ||||||||    
T  29332 ttggcctagtggttggcttggaatcttgaagtgtgttcctctcaaggtcttaggttcgattcccgctgatgccattttcggtcggt-aagtccatacaga 29234  T
Q  113 gcttg---ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||    ||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29233 gctttgctctggcttaaaatggacccccgcaaatggacagtgggattggtcccctcagattagtcagtccttggatcggataccgagttt 29144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0460 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0460
Description:

Target: scaffold0460; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 8376 - 8286
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgg 96  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8376 tttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 8286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 149 - 1
Alignment:
Q  12 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 111  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||| |||| ||| | |||||||    
T  149 gttggcctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcgtccagaggtctcaggttcgattccctcttatgtcaatttcgatgggctaagtccatacag 50  T
Q  112 agcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattg 157  Q
    || |||  || ||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||    
T  49 agtttgctctagctttaaacggggcccccacatgtgggcggtgggattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1175 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1175
Description:

Target: scaffold1175; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2524 - 2427
Alignment:
Q  105 catacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||    
T  2524 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtccgtccttgaatcggataccgagttt 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 27776 - 27966
Alignment:
Q  6 tttggtgttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgattccccctggtgctaatttcggtgggttaaattc 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |    |||||| ||||||||||||  |||||| |||||  ||||| ||| | |    
T  27776 tttggggttggtctagtggttggtttgggattttggagtttgctcctctcaaggtctcgggttcgattccctgtggtgccaatttgagtgggctaagtcc 27875  T
Q  106 atacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 199  Q
    ||||  ||||     ||||||||| |  | ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  27876 atacgaagctat---gctttaaatagggcgccgcaagtgggtggtgagatttgtcccctcggattagtcggttcttggatcagataccgagttt 27966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 12944 - 12884
Alignment:
Q  13 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaggggtctcaggttcgatt 73  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  12944 ttggcctagtggttgacttgggatcttggagttcgctcctccagagatctcaggttcgatt 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University