View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8294A_low_197 (Length: 252)

Name: NF8294A_low_197
Description: NF8294A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8294A_low_197
NF8294A_low_197
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (1-193)||(18431322-18431514)
chr6 (1-193)||(18004256-18004448)
chr6 (3-193)||(25646112-25646302)
chr6 (1-189)||(35016964-35017152)
chr6 (1-193)||(15736464-15736656)
chr6 (1-189)||(18569280-18569467)
chr6 (1-189)||(27655370-27655555)
chr6 (1-186)||(31627134-31627319)
chr6 (1-189)||(16827159-16827346)
chr6 (1-179)||(11214842-11215020)
chr6 (3-186)||(32897419-32897602)
chr6 (1-186)||(16230278-16230461)
chr6 (1-189)||(18087994-18088182)
chr6 (1-189)||(23976263-23976448)
chr6 (1-189)||(33315865-33316050)
chr6 (1-186)||(16105254-16105440)
chr6 (1-189)||(4989591-4989776)
chr6 (1-185)||(25174253-25174433)
chr6 (1-189)||(16239057-16239246)
chr6 (1-189)||(1658994-1659182)
chr6 (1-189)||(10487573-10487756)
chr6 (1-193)||(13622396-13622589)
chr6 (1-189)||(16377571-16377754)
chr6 (1-189)||(16384895-16385078)
chr6 (1-186)||(23151956-23152140)
chr6 (1-189)||(14627893-14628079)
chr6 (1-186)||(18775907-18776089)
chr6 (1-179)||(19984488-19984664)
chr6 (37-186)||(18128981-18129129)
chr6 (1-186)||(15861425-15861610)
chr6 (10-189)||(17343578-17343754)
chr6 (3-193)||(13016071-13016260)
chr6 (3-189)||(16557301-16557483)
chr6 (3-189)||(16650531-16650713)
chr6 (1-185)||(18825044-18825225)
chr6 (1-185)||(18843104-18843286)
chr6 (3-189)||(29870760-29870943)
chr6 (3-186)||(26088532-26088713)
chr6 (6-186)||(18397622-18397803)
chr6 (1-189)||(1651234-1651420)
chr6 (10-186)||(23993858-23994032)
chr6 (1-186)||(22430944-22431129)
chr6 (1-148)||(25745615-25745763)
chr6 (20-186)||(1554536-1554701)
chr6 (68-189)||(19609191-19609310)
chr6 (3-189)||(22226926-22227111)
chr6 (83-186)||(16084112-16084215)
chr6 (20-179)||(22866871-22867031)
chr6 (83-191)||(28196147-28196255)
chr6 (88-186)||(25368728-25368827)
chr6 (1-80)||(16084882-16084962)
chr6 (4-53)||(1554817-1554866)
chr6 (88-149)||(16889122-16889183)
chr6 (88-161)||(33323532-33323605)
chr6 (88-161)||(35137326-35137399)
chr6 (128-186)||(18741146-18741203)
chr6 (91-147)||(22846867-22846923)
[»] chr5 (65 HSPs)
chr5 (1-193)||(21652685-21652877)
chr5 (1-189)||(11582564-11582752)
chr5 (1-193)||(21392874-21393066)
chr5 (1-186)||(1169944-1170129)
chr5 (3-193)||(20710823-20711012)
chr5 (1-193)||(28258286-28258479)
chr5 (1-189)||(1221134-1221319)
chr5 (1-189)||(22367887-22368072)
chr5 (1-189)||(7424367-7424553)
chr5 (1-189)||(11341326-11341512)
chr5 (1-189)||(17473172-17473360)
chr5 (1-189)||(21074892-21075077)
chr5 (1-189)||(4201368-4201554)
chr5 (1-189)||(23513486-23513674)
chr5 (1-189)||(25192399-25192586)
chr5 (1-179)||(16535006-16535183)
chr5 (4-186)||(24184499-24184681)
chr5 (1-185)||(11044-11224)
chr5 (1-186)||(9732069-9732252)
chr5 (1-189)||(22884583-22884771)
chr5 (1-185)||(29192023-29192203)
chr5 (1-189)||(110385-110572)
chr5 (1-189)||(10779582-10779767)
chr5 (1-189)||(43445155-43445342)
chr5 (1-189)||(21234808-21234994)
chr5 (1-179)||(4863967-4864145)
chr5 (1-189)||(18779396-18779583)
chr5 (1-189)||(25425312-25425495)
chr5 (3-189)||(23327643-23327825)
chr5 (3-189)||(24595191-24595373)
chr5 (13-186)||(20615305-20615476)
chr5 (1-186)||(21649523-21649707)
chr5 (20-193)||(23510676-23510846)
chr5 (20-186)||(35792554-35792719)
chr5 (4-186)||(37051677-37051857)
chr5 (1-189)||(21933565-21933748)
chr5 (1-189)||(21939735-21939918)
chr5 (1-189)||(35580944-35581127)
chr5 (1-189)||(37010569-37010752)
chr5 (1-191)||(19404268-19404459)
chr5 (15-189)||(19498490-19498659)
chr5 (1-186)||(27185116-27185301)
chr5 (1-191)||(23453638-23453829)
chr5 (1-191)||(23465143-23465334)
chr5 (1-193)||(11338149-11338341)
chr5 (1-186)||(25901728-25901911)
chr5 (3-163)||(11213007-11213167)
chr5 (22-186)||(27008705-27008867)
chr5 (29-105)||(24474367-24474443)
chr5 (88-161)||(7727296-7727369)
chr5 (88-161)||(23492722-23492794)
chr5 (88-149)||(32967547-32967608)
chr5 (1-53)||(1169796-1169848)
chr5 (91-163)||(3672708-3672780)
chr5 (1-53)||(17473023-17473075)
chr5 (89-149)||(37189501-37189561)
chr5 (88-160)||(431149-431221)
chr5 (89-149)||(28888649-28888709)
chr5 (6-53)||(43445013-43445060)
chr5 (132-186)||(24470996-24471049)
chr5 (91-160)||(21615735-21615804)
chr5 (91-160)||(24226842-24226911)
chr5 (91-186)||(5452190-5452285)
chr5 (91-149)||(19860967-19861025)
chr5 (1-53)||(35792404-35792456)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (1-237)||(821395-821646)
chr4 (1-193)||(33738948-33739140)
chr4 (1-186)||(12901055-12901240)
chr4 (1-186)||(44054612-44054797)
chr4 (1-186)||(53909053-53909238)
chr4 (1-189)||(53706073-53706261)
chr4 (1-193)||(44345510-44345703)
chr4 (1-186)||(16521479-16521663)
chr4 (1-189)||(19999215-19999400)
chr4 (1-193)||(7133732-7133924)
chr4 (1-186)||(8873777-8873961)
chr4 (1-189)||(10642874-10643062)
chr4 (1-189)||(18167481-18167665)
chr4 (1-193)||(45460239-45460432)
chr4 (1-189)||(15288293-15288479)
chr4 (1-186)||(110171-110355)
chr4 (1-186)||(15274043-15274226)
chr4 (1-186)||(21960851-21961036)
chr4 (1-189)||(9294212-9294398)
chr4 (1-189)||(10487358-10487544)
chr4 (1-189)||(22355847-22356033)
chr4 (1-189)||(13245139-13245325)
chr4 (1-189)||(15295403-15295589)
chr4 (1-189)||(16329207-16329393)
chr4 (3-189)||(26338173-26338355)
chr4 (1-185)||(18246881-18247061)
chr4 (1-189)||(47356013-47356201)
chr4 (1-189)||(14950707-14950893)
chr4 (1-188)||(8373042-8373228)
chr4 (1-185)||(14994888-14995070)
chr4 (35-189)||(54119579-54119732)
chr4 (1-186)||(25120405-25120589)
chr4 (1-172)||(30233826-30233998)
chr4 (1-186)||(34393744-34393929)
chr4 (1-186)||(5684185-5684370)
chr4 (1-186)||(15212032-15212217)
chr4 (1-191)||(18495689-18495880)
chr4 (45-186)||(13049491-13049630)
chr4 (1-189)||(26678732-26678908)
chr4 (1-137)||(23271207-23271342)
chr4 (83-191)||(13810995-13811103)
chr4 (118-193)||(13751694-13751769)
chr4 (1-136)||(18294450-18294580)
chr4 (88-186)||(43282757-43282855)
chr4 (88-186)||(52266840-52266938)
chr4 (1-113)||(8044021-8044134)
chr4 (88-161)||(15852696-15852769)
chr4 (1-53)||(5684036-5684088)
chr4 (3-53)||(18294304-18294354)
chr4 (4-53)||(19019390-19019439)
chr4 (88-149)||(27959759-27959820)
chr4 (88-149)||(34197544-34197605)
chr4 (6-53)||(8373431-8373478)
chr4 (96-186)||(15043631-15043721)
chr4 (96-186)||(15110703-15110793)
chr4 (6-52)||(47356297-47356343)
chr4 (88-141)||(37958436-37958489)
chr4 (88-149)||(41167314-41167375)
chr4 (1-53)||(34394020-34394072)
chr4 (91-160)||(41257728-41257797)
chr4 (1-53)||(18109986-18110038)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (1-193)||(22407484-22407676)
chr1 (1-193)||(49966331-49966523)
chr1 (1-186)||(2422260-2422445)
chr1 (1-189)||(18506043-18506230)
chr1 (8-189)||(41210732-41210913)
chr1 (1-186)||(20826513-20826696)
chr1 (1-186)||(44036189-44036373)
chr1 (1-189)||(15862722-15862908)
chr1 (4-186)||(35523713-35523894)
chr1 (1-189)||(22250242-22250430)
chr1 (1-186)||(37845755-37845939)
chr1 (3-189)||(22034535-22034717)
chr1 (1-186)||(21858246-21858430)
chr1 (1-189)||(22352814-22353002)
chr1 (1-189)||(22365441-22365629)
chr1 (1-189)||(17147468-17147654)
chr1 (1-189)||(20894983-20895169)
chr1 (1-189)||(7641884-7642068)
chr1 (3-179)||(20444443-20444618)
chr1 (3-179)||(20530208-20530383)
chr1 (3-189)||(21651228-21651412)
chr1 (1-186)||(5675890-5676074)
chr1 (1-189)||(18060898-18061085)
chr1 (1-189)||(51451299-51451485)
chr1 (1-186)||(21716895-21717077)
chr1 (1-179)||(35053539-35053714)
chr1 (1-189)||(17003511-17003694)
chr1 (1-186)||(20526808-20526992)
chr1 (1-189)||(45050370-45050556)
chr1 (2-186)||(41218143-41218328)
chr1 (3-189)||(22029383-22029566)
chr1 (10-189)||(22226667-22226846)
chr1 (22-186)||(20930163-20930327)
chr1 (1-189)||(41393138-41393324)
chr1 (29-186)||(9785551-9785707)
chr1 (20-186)||(18602353-18602518)
chr1 (20-186)||(5073610-5073775)
chr1 (2-193)||(51657604-51657805)
chr1 (20-151)||(20121967-20122098)
chr1 (88-161)||(38034997-38035070)
chr1 (3-74)||(22031007-22031078)
chr1 (88-161)||(36357713-36357786)
chr1 (88-163)||(20956341-20956416)
chr1 (91-186)||(22836628-22836723)
chr1 (88-186)||(27673543-27673641)
chr1 (88-149)||(19601911-19601972)
chr1 (4-53)||(20253246-20253295)
chr1 (1-53)||(22353097-22353149)
chr1 (91-160)||(37235336-37235405)
chr1 (91-149)||(5471758-5471816)
chr1 (92-160)||(8539328-8539396)
chr1 (92-160)||(8604567-8604635)
[»] chr8 (76 HSPs)
chr8 (1-189)||(24718699-24718887)
chr8 (1-193)||(25121227-25121419)
chr8 (1-189)||(6775514-6775701)
chr8 (1-193)||(41245348-41245540)
chr8 (1-193)||(19994433-19994626)
chr8 (1-189)||(3432858-3433044)
chr8 (1-192)||(22908767-22908956)
chr8 (1-189)||(43374865-43375051)
chr8 (1-189)||(224443-224631)
chr8 (1-189)||(700856-701044)
chr8 (1-189)||(738066-738254)
chr8 (1-189)||(861961-862149)
chr8 (1-189)||(13663918-13664105)
chr8 (1-189)||(13723193-13723380)
chr8 (1-193)||(22322717-22322909)
chr8 (1-189)||(5236883-5237069)
chr8 (1-189)||(16874221-16874407)
chr8 (1-189)||(24662529-24662715)
chr8 (1-189)||(43684342-43684528)
chr8 (3-186)||(20648723-20648906)
chr8 (1-186)||(24930396-24930582)
chr8 (1-186)||(24386991-24387175)
chr8 (3-186)||(20655308-20655491)
chr8 (1-189)||(272488-272671)
chr8 (1-189)||(643178-643361)
chr8 (1-189)||(828984-829167)
chr8 (1-193)||(16416945-16417138)
chr8 (1-185)||(24107869-24108050)
chr8 (3-189)||(22089729-22089911)
chr8 (1-186)||(37610059-37610244)
chr8 (1-186)||(29758984-29759168)
chr8 (1-184)||(16195019-16195202)
chr8 (3-189)||(15320345-15320527)
chr8 (3-189)||(15500714-15500896)
chr8 (6-186)||(20568553-20568734)
chr8 (6-186)||(20574746-20574927)
chr8 (1-189)||(24547909-24548095)
chr8 (29-186)||(270429-270585)
chr8 (29-186)||(645335-645491)
chr8 (29-186)||(831070-831226)
chr8 (29-189)||(22007788-22007948)
chr8 (1-186)||(21696253-21696439)
chr8 (1-191)||(21679889-21680080)
chr8 (1-191)||(17730746-17730936)
chr8 (1-119)||(28836353-28836468)
chr8 (1-186)||(20480365-20480546)
chr8 (6-186)||(28543628-28543806)
chr8 (20-186)||(16675626-16675791)
chr8 (22-186)||(21853199-21853361)
chr8 (87-186)||(37605685-37605783)
chr8 (22-186)||(21845794-21845956)
chr8 (1-106)||(16040642-16040748)
chr8 (1-106)||(16042318-16042424)
chr8 (88-186)||(18768135-18768233)
chr8 (88-161)||(39448198-39448271)
chr8 (120-186)||(16203739-16203804)
chr8 (88-149)||(21199547-21199608)
chr8 (88-149)||(31195658-31195719)
chr8 (1-191)||(38532336-38532536)
chr8 (4-53)||(18618138-18618187)
chr8 (1-53)||(13663771-13663823)
chr8 (1-53)||(13722306-13722358)
chr8 (1-53)||(13722454-13722506)
chr8 (1-53)||(13722602-13722654)
chr8 (1-53)||(13722750-13722802)
chr8 (1-53)||(13722898-13722950)
chr8 (1-53)||(13723046-13723098)
chr8 (6-53)||(224301-224348)
chr8 (6-53)||(700714-700761)
chr8 (6-53)||(737924-737971)
chr8 (6-53)||(861819-861866)
chr8 (6-53)||(17151288-17151335)
chr8 (91-149)||(23148624-23148682)
chr8 (88-149)||(21192120-21192181)
chr8 (88-162)||(22737250-22737324)
chr8 (91-149)||(23835950-23836008)
[»] chr7 (65 HSPs)
chr7 (1-193)||(13867360-13867552)
chr7 (1-192)||(44863930-44864121)
chr7 (1-186)||(45453542-45453728)
chr7 (1-193)||(7291540-7291731)
chr7 (1-193)||(12544998-12545190)
chr7 (1-193)||(47288461-47288653)
chr7 (1-186)||(369580-369765)
chr7 (1-185)||(15952382-15952563)
chr7 (1-193)||(26071552-26071743)
chr7 (1-193)||(26095339-26095530)
chr7 (1-193)||(15823692-15823888)
chr7 (1-193)||(142313-142506)
chr7 (1-186)||(3058741-3058925)
chr7 (1-186)||(112583-112767)
chr7 (1-186)||(2027250-2027435)
chr7 (1-185)||(16417162-16417342)
chr7 (1-189)||(18981192-18981379)
chr7 (1-189)||(2191982-2192169)
chr7 (1-189)||(13757270-13757456)
chr7 (1-189)||(15442845-15443031)
chr7 (1-189)||(16210471-16210657)
chr7 (1-179)||(13038392-13038568)
chr7 (1-186)||(32495840-32496025)
chr7 (1-186)||(11582128-11582311)
chr7 (1-186)||(11285904-11286091)
chr7 (1-189)||(36051355-36051541)
chr7 (1-186)||(13912399-13912582)
chr7 (1-189)||(15525769-15525957)
chr7 (1-189)||(27102836-27103019)
chr7 (1-189)||(27110184-27110367)
chr7 (1-189)||(27175307-27175490)
chr7 (1-189)||(38784928-38785111)
chr7 (1-189)||(16480222-16480408)
chr7 (1-186)||(1938057-1938240)
chr7 (1-186)||(125520-125704)
chr7 (1-189)||(7821615-7821798)
chr7 (1-189)||(7828926-7829109)
chr7 (1-186)||(12753575-12753759)
chr7 (1-186)||(12249398-12249584)
chr7 (1-189)||(15926058-15926242)
chr7 (1-186)||(11514816-11514999)
chr7 (1-186)||(30263410-30263593)
chr7 (1-189)||(26010477-26010663)
chr7 (10-186)||(42057458-42057632)
chr7 (1-186)||(3893789-3893971)
chr7 (3-189)||(18255108-18255295)
chr7 (20-186)||(15761674-15761839)
chr7 (47-189)||(2436315-2436456)
chr7 (9-186)||(13571525-13571701)
chr7 (1-191)||(16571375-16571568)
chr7 (1-191)||(16594094-16594287)
chr7 (45-186)||(25293608-25293747)
chr7 (22-189)||(10988303-10988468)
chr7 (1-66)||(39047977-39048042)
chr7 (83-191)||(13273431-13273539)
chr7 (83-191)||(15629459-15629567)
chr7 (83-191)||(49049169-49049277)
chr7 (91-160)||(9058007-9058076)
chr7 (4-53)||(15761509-15761558)
chr7 (1-42)||(15851163-15851204)
chr7 (1-47)||(15629613-15629659)
chr7 (92-149)||(15913817-15913874)
chr7 (88-126)||(13376423-13376461)
chr7 (1-42)||(13273590-13273631)
chr7 (1-53)||(2191832-2191884)
[»] chr3 (82 HSPs)
chr3 (1-192)||(6148124-6148315)
chr3 (1-189)||(13816200-13816388)
chr3 (1-189)||(19572054-19572242)
chr3 (1-193)||(16183292-16183489)
chr3 (1-189)||(15860430-15860617)
chr3 (1-189)||(16819597-16819781)
chr3 (1-189)||(18909378-18909562)
chr3 (1-186)||(22145557-22145740)
chr3 (1-193)||(50113415-50113602)
chr3 (1-189)||(8269686-8269870)
chr3 (1-189)||(8276797-8276981)
chr3 (1-193)||(17099397-17099590)
chr3 (1-186)||(17957618-17957802)
chr3 (1-185)||(22273737-22273917)
chr3 (1-186)||(33340534-33340718)
chr3 (1-186)||(53769350-53769533)
chr3 (3-186)||(8630538-8630720)
chr3 (4-186)||(35122377-35122559)
chr3 (1-189)||(49230901-49231089)
chr3 (1-186)||(51159761-51159945)
chr3 (10-189)||(27839394-27839573)
chr3 (1-186)||(318896-319081)
chr3 (1-186)||(2048751-2048936)
chr3 (1-185)||(2450612-2450791)
chr3 (1-186)||(7852499-7852683)
chr3 (1-186)||(19230751-19230935)
chr3 (1-163)||(17913534-17913696)
chr3 (1-189)||(1468938-1469121)
chr3 (1-193)||(25057531-25057723)
chr3 (3-189)||(30152023-30152205)
chr3 (1-186)||(19945317-19945502)
chr3 (1-186)||(16259732-16259916)
chr3 (1-185)||(15469751-15469931)
chr3 (1-189)||(16745454-16745639)
chr3 (1-191)||(14294114-14294305)
chr3 (1-186)||(14522589-14522775)
chr3 (55-193)||(30205137-30205274)
chr3 (1-189)||(44228115-44228302)
chr3 (4-179)||(14297195-14297371)
chr3 (4-179)||(14302822-14302998)
chr3 (1-189)||(15574730-15574916)
chr3 (1-179)||(11198854-11199033)
chr3 (1-191)||(14299741-14299932)
chr3 (4-179)||(53899808-53899982)
chr3 (1-189)||(15613749-15613935)
chr3 (1-179)||(11062319-11062497)
chr3 (1-179)||(23491204-23491382)
chr3 (1-149)||(47786166-47786314)
chr3 (3-189)||(12265775-12265960)
chr3 (1-186)||(12351127-12351312)
chr3 (1-193)||(17523694-17523884)
chr3 (46-186)||(10737247-10737386)
chr3 (91-189)||(14846034-14846131)
chr3 (3-186)||(5227406-5227585)
chr3 (6-186)||(40938421-40938602)
chr3 (20-186)||(55315085-55315250)
chr3 (45-186)||(45859709-45859848)
chr3 (1-179)||(12562760-12562940)
chr3 (5-126)||(16935168-16935286)
chr3 (3-189)||(15939743-15939930)
chr3 (90-189)||(8305693-8305790)
chr3 (91-189)||(18905171-18905267)
chr3 (20-186)||(41268931-41269096)
chr3 (1-98)||(12031266-12031364)
chr3 (49-186)||(13976964-13977101)
chr3 (49-186)||(13956132-13956269)
chr3 (89-149)||(15874893-15874953)
chr3 (90-186)||(17138157-17138253)
chr3 (89-149)||(11330382-11330442)
chr3 (94-186)||(12951743-12951835)
chr3 (4-53)||(9303753-9303802)
chr3 (91-160)||(38812367-38812436)
chr3 (88-160)||(12490105-12490177)
chr3 (1-40)||(17937333-17937372)
chr3 (98-163)||(39654630-39654695)
chr3 (143-191)||(14287780-14287828)
chr3 (3-66)||(18897982-18898045)
chr3 (96-186)||(11883645-11883735)
chr3 (156-189)||(11813553-11813586)
chr3 (88-149)||(14060614-14060675)
chr3 (89-161)||(55442145-55442218)
chr3 (1-53)||(16260014-16260066)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (1-186)||(8125-8310)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (1-193)||(6232-6424)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (1-193)||(15149-15338)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (1-189)||(28574-28761)
scaffold0116 (1-53)||(28857-28909)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (1-193)||(256192-256384)
scaffold0011 (1-178)||(262798-262975)
scaffold0011 (1-189)||(124576-124762)
scaffold0011 (1-189)||(193303-193489)
scaffold0011 (1-189)||(75977-76163)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (1-193)||(95006-95198)
scaffold0044 (22-186)||(66745-66907)
scaffold0044 (1-53)||(95294-95346)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (1-189)||(78241-78429)
scaffold0034 (1-186)||(38903-39089)
scaffold0034 (1-163)||(44513-44676)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (1-189)||(109366-109553)
scaffold0032 (29-186)||(54330-54486)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (8-179)||(686-857)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (1-193)||(38616-38807)
scaffold0078 (1-186)||(40184-40368)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (1-193)||(2124-2317)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (1-193)||(6644-6837)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-186)||(21351-21536)
scaffold0008 (22-186)||(129504-129668)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (1-193)||(13025-13217)
scaffold0359 (1-42)||(161-202)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-193)||(26009-26200)
scaffold0037 (1-193)||(70681-70873)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-185)||(155640-155821)
scaffold0023 (3-189)||(732-914)
scaffold0023 (47-189)||(35023-35163)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (5-193)||(36891998-36892185)
chr2 (1-189)||(5889580-5889765)
chr2 (1-189)||(34822886-34823072)
chr2 (1-189)||(3800396-3800581)
chr2 (1-189)||(21275810-21275995)
chr2 (1-186)||(25600652-25600837)
chr2 (1-189)||(12726741-12726927)
chr2 (1-187)||(24966987-24967173)
chr2 (1-189)||(8942334-8942522)
chr2 (4-186)||(4449517-4449698)
chr2 (1-186)||(8886832-8887016)
chr2 (1-185)||(19888063-19888243)
chr2 (1-185)||(21140569-21140749)
chr2 (1-185)||(43644259-43644442)
chr2 (4-189)||(461426-461609)
chr2 (1-186)||(12643308-12643491)
chr2 (1-186)||(22862179-22862363)
chr2 (1-189)||(14907721-14907907)
chr2 (1-189)||(20013810-20013996)
chr2 (1-189)||(23818867-23819053)
chr2 (1-167)||(25877233-25877399)
chr2 (1-189)||(12637448-12637633)
chr2 (1-186)||(22273577-22273761)
chr2 (1-189)||(11232537-11232720)
chr2 (1-189)||(22514384-22514567)
chr2 (3-189)||(23773225-23773407)
chr2 (3-189)||(24686954-24687136)
chr2 (1-185)||(24827852-24828034)
chr2 (1-189)||(28776985-28777168)
chr2 (4-186)||(15632088-15632269)
chr2 (1-189)||(20628681-20628864)
chr2 (1-186)||(22282810-22282994)
chr2 (1-191)||(7320174-7320365)
chr2 (1-186)||(6878134-6878319)
chr2 (83-193)||(22691316-22691426)
chr2 (83-193)||(22695963-22696073)
chr2 (45-186)||(27260274-27260415)
chr2 (1-186)||(22581216-22581402)
chr2 (83-186)||(269878-269981)
chr2 (5-191)||(24572678-24572865)
chr2 (29-186)||(9654140-9654296)
chr2 (3-191)||(28972727-28972914)
chr2 (47-186)||(17397924-17398061)
chr2 (88-161)||(23822894-23822967)
chr2 (88-161)||(23824838-23824911)
chr2 (88-161)||(23831973-23832046)
chr2 (91-186)||(721162-721257)
chr2 (88-149)||(19670515-19670576)
chr2 (91-149)||(24088752-24088810)
chr2 (88-161)||(4663-4735)
chr2 (10-103)||(22693040-22693133)
chr2 (10-103)||(22697687-22697780)
chr2 (88-161)||(24295958-24296031)
chr2 (139-189)||(22692978-22693028)
chr2 (139-189)||(22697625-22697675)
chr2 (88-149)||(19658678-19658739)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (1-193)||(14364-14557)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (1-193)||(87127-87316)
scaffold0021 (1-193)||(138096-138286)
scaffold0021 (1-192)||(10351-10543)
scaffold0021 (138-193)||(77069-77124)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-186)||(71736-71921)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (1-189)||(18862-19050)
scaffold0234 (1-53)||(18715-18767)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (1-193)||(32268-32460)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (1-189)||(90169-90353)
scaffold0028 (1-189)||(129075-129260)
scaffold0028 (88-149)||(78410-78471)
[»] scaffold0383 (3 HSPs)
scaffold0383 (1-186)||(1057-1241)
scaffold0383 (1-186)||(5926-6108)
scaffold0383 (1-53)||(1336-1388)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (1-186)||(8771-8956)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-189)||(4530-4718)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-189)||(2861-3045)
scaffold0124 (10-186)||(22997-23168)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (1-189)||(27797-27983)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (1-186)||(17340-17524)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (1-186)||(145223-145407)
scaffold0025 (22-186)||(147482-147646)
scaffold0025 (1-53)||(145502-145554)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (1-180)||(2416-2594)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (8-186)||(40291-40468)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-189)||(2975-3163)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-185)||(5874-6054)
scaffold0003 (1-186)||(217033-217218)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (1-189)||(1873-2059)
[»] scaffold0195 (4 HSPs)
scaffold0195 (3-179)||(7940-8116)
scaffold0195 (3-179)||(13329-13505)
scaffold0195 (1-186)||(18000-18184)
scaffold0195 (1-186)||(20084-20268)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (1-188)||(69456-69643)
scaffold0031 (9-186)||(30768-30946)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (1-189)||(244-432)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (1-186)||(32476-32660)
scaffold0184 (82-193)||(34037-34147)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-186)||(52559-52743)
scaffold0018 (1-186)||(56511-56695)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-189)||(6434-6620)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (1-189)||(25591-25777)
scaffold0141 (1-189)||(21336-21522)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (3-186)||(12891-13074)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (3-189)||(30041-30223)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (1-178)||(5893-6069)
[»] scaffold0138 (6 HSPs)
scaffold0138 (20-189)||(14568-14735)
scaffold0138 (1-113)||(28261-28375)
scaffold0138 (1-113)||(40257-40371)
scaffold0138 (88-149)||(23801-23862)
scaffold0138 (3-53)||(28472-28522)
scaffold0138 (3-53)||(40468-40518)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-189)||(37977-38160)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-186)||(248824-249008)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (1-186)||(7485-7671)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (1-186)||(154-338)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-186)||(11210-11394)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (1-186)||(3352-3537)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (7-179)||(1916-2088)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (3-186)||(41399-41582)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (1-186)||(3318-3500)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-186)||(27714-27899)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-186)||(46819-47003)
scaffold0068 (1-186)||(60267-60451)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (10-189)||(106689-106867)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (10-189)||(16132-16311)
scaffold0396 (1-179)||(13478-13656)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (1-113)||(20580-20692)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-186)||(270813-270999)
scaffold0009 (1-186)||(236874-237059)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (10-179)||(51729-51897)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (38-174)||(4834-4970)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (10-189)||(6441-6620)
scaffold0022 (88-161)||(106297-106370)
scaffold0022 (1-42)||(113842-113883)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (3-186)||(11322-11504)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (61-178)||(58899-59016)
scaffold0051 (23-65)||(59375-59417)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (22-186)||(7673-7837)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-189)||(17375-17561)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (22-178)||(4902-5059)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (10-186)||(6634-6805)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-123)||(29942-30065)
scaffold0120 (117-193)||(27260-27336)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (10-151)||(1078-1219)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (76-186)||(771-880)
scaffold0269 (76-186)||(15027-15136)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (1-191)||(6570-6770)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (3-173)||(5700-5867)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (82-189)||(9291-9397)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (103-189)||(14987-15073)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (59-186)||(4092-4218)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (59-186)||(48932-49058)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (72-186)||(4534-4648)
[»] scaffold0150 (4 HSPs)
scaffold0150 (88-186)||(20391-20489)
scaffold0150 (88-186)||(27220-27318)
scaffold0150 (1-59)||(20527-20586)
scaffold0150 (1-59)||(27356-27415)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (1-113)||(17684-17797)
scaffold0244 (3-113)||(24105-24216)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (10-179)||(145628-145794)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (95-186)||(197482-197572)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (45-151)||(4498-4603)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-113)||(34334-34447)
[»] scaffold0808 (2 HSPs)
scaffold0808 (88-191)||(2839-2942)
scaffold0808 (1-42)||(2742-2783)
[»] scaffold0092 (2 HSPs)
scaffold0092 (88-179)||(2118-2209)
scaffold0092 (1-47)||(2260-2306)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (88-161)||(4728-4801)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (88-161)||(7041-7114)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (1-53)||(23898-23950)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (88-161)||(71655-71728)
[»] scaffold1734 (2 HSPs)
scaffold1734 (1-53)||(164-216)
scaffold1734 (1-66)||(1-67)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (88-160)||(3667-3739)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (89-186)||(7290-7387)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (88-149)||(4759-4820)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (4-53)||(53279-53328)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (91-163)||(6021-6093)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (88-160)||(117977-118049)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (150-189)||(991-1030)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (1-48)||(3077-3124)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (88-138)||(12936-12986)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (89-148)||(78206-78265)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (91-149)||(34203-34261)
[»] scaffold1752 (1 HSPs)
scaffold1752 (1-42)||(429-470)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18431514 - 18431322
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18431514 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 18431415  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18431414 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 18431322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 18004256 - 18004448
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  18004256 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatggacatgttttcttgataatg 18004355  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18004356 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 18004448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 193
Target Start/End: Original strand, 25646112 - 25646302
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25646112 ttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgtttccttgataatgca 25646211  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25646212 aatgttgtggagataatcaataaaattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcaagtccttgtac 25646302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 35016964 - 35017152
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35016964 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataat 35017063  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  35017064 gcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 35017152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 15736464 - 15736656
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15736464 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 15736563  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  15736564 caaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggtcgcattatcgagtccgtgtac 15736656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18569467 - 18569280
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18569467 agttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 18569368  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18569367 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 18569280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 27655370 - 27655555
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  27655370 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 27655467  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27655468 caa-tgttgtggaaataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 27655555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31627319 - 31627134
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  31627319 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtggtgatgaatactatgatttgtttgtgtatggacatgttttcttgataatg 31627220  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  31627219 caaatgttgtggagatgatcaatataattggggattgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattggtgtcgcattatcgagtc 31627134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 16827159 - 16827346
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  16827159 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataata 16827258  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16827259 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 16827346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11215020 - 11214842
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||    
T  11215020 agttgttgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatctatttgtgtgtgggcatgttttcttgataat 11214921  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11214920 gcaa-tgttgtggaaataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcatta 11214842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32897602 - 32897419
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  32897602 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattaatgtgtgatgatgaataccatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgta 32897503  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  32897502 aatgttgtggagatgatcaataaaattgagagttgtcctatatattgtggtgaaaattgggaattgttgtcgcattatcgagtc 32897419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16230461 - 16230278
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||    
T  16230461 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatg 16230362  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  16230361 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 16230278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 18087994 - 18088182
Alignment:
Q  1 agttgatg-ttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  18087994 agttgatgattgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgttttcttgataat 18088093  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  18088094 gc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgttgcattatcgagtcctt 18088182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23976448 - 23976263
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||| ||||||||||    
T  23976448 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgctgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgtttgcttgataatg 23976351  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  23976350 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgccgcattatcgagtcctt 23976263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 33315865 - 33316050
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  33315865 agttgatgttgcatgacatggttgattattgataatcatgtggatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 33315962  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33315963 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 33316050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16105440 - 16105254
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16105440 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgattgatgtgtggtgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 16105341  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  16105340 gcaaatgatgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttgtcgcgttatcgagtc 16105254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4989776 - 4989591
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  4989776 agttgatgttggatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatgctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 4989679  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  4989678 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgttaattgttgtcgcattatcgagtcctt 4989591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25174433 - 25174253
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  25174433 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 25174336  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25174335 c-aatgttgtggagataatcaatataattgagtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 25174253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16239246 - 16239057
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16239246 agttgatgttgaatgacattattgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatacgatgatctatttgtgtgtgggcatgttttcttgataat 16239147  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgga-ttgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16239146 gcaa-tgttgtggagataatcaatataatttggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggatttgttgtcgcattatcgagtcctt 16239057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 1658994 - 1659182
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1658994 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgaccatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 1659093  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  1659094 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcacattatcgagtcctt 1659182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10487756 - 10487573
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  10487756 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 10487660  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  10487659 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 10487573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 13622396 - 13622589
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgtttt-cttgataat 99  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||| | ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  13622396 agttaatgttgaatgatgttgttgattagtaataatcatgataatgtgtggtgatgaatactatgatttatttgtgtatggacatgtttttcttgataat 13622495  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  13622496 gcaaatgttgtggagataatcaatataattgggagttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggttgcattatcgagtccgtgtac 13622589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 16377571 - 16377754
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  16377571 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 16377667  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  16377668 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 16377754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 16384895 - 16385078
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  16384895 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 16384991  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  16384992 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 16385078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23152140 - 23151956
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23152140 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgaggatgaatactatgattcaattgtgaatgagcatgttttcttgataatg 23152041  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | || ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  23152040 caaatgatgtggagatgaacagtataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattattgtcgcattatcgagtc 23151956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 14627893 - 14628079
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||  || ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  14627893 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgttatgatgtaattgtgtatgggcatgtttccttggtaatg 14627992  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  14627993 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtcctt 14628079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18776089 - 18775907
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  18776089 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatg 18775992  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18775991 caaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18775907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 19984488 - 19984664
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  19984488 agttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatg 19984587  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19984588 caaatgatgtggaaatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggag-aaattgt-gattgttgtcgaatta 19984664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18129129 - 18128981
Alignment:
Q  37 catgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgtt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||    
T  18129129 catgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgtttccttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataatcgggtgtt 18129030  T
Q  137 gtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18129029 gtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18128981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15861610 - 15861425
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatg--acagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 97  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  15861610 agttgatgttgaatataacattgttgattgttgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgagcatgtttccttgata 15861511  T
Q  98 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15861510 atgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-aaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 15861425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Original strand, 17343578 - 17343754
Alignment:
Q  10 tgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 109  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17343578 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgtttgcttgataatgcaa-tgttg 17343674  T
Q  110 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17343675 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgtattgttgtcgcattatcgagtcctt 17343754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 193
Target Start/End: Original strand, 13016071 - 13016260
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagt-gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 101  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||| |||| ||||||||| |  || |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13016071 ttgatgttgagtgacatttgttgatt-ttgagaatcatgttgacatgagatgatgaatactatgaattaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 13016169  T
Q  102 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13016170 aa-tgttgtggaggtaatcaatataattggatatagacctatatattgaggtgaaaattatggattgtagtcgcattatcgagtccttgtac 13016260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 16557301 - 16557483
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  16557301 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 16557397  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  16557398 aatgttgtggagataatcaatatacttgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgtattatcgagtcctt 16557483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 16650531 - 16650713
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  16650531 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 16650627  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  16650628 aatgttgtggagataatcaatatacttgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgtattatcgagtcctt 16650713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 18825044 - 18825225
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18825044 agttgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatg-tttcttgataatg 18825142  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    | |||| |||||| || |  ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  18825143 c-aatgatgtggagatgaataatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gtttgttgtcgcattatcgagt 18825225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 18843104 - 18843286
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18843104 agttgatgttgaataaaattgttgatttttgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatg 18843203  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    | |||| |||||| || | || ||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||| ||||||||| |||||    
T  18843204 c-aatgatgtggagatgaacattataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gtttgtcgtcgcattatcgagt 18843286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 29870760 - 29870943
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  29870760 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 29870856  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29870857 aatgttgtggagataatcaatataatggtggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 29870943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26088713 - 26088532
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||     
T  26088713 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgctttcttggtaatgc- 26088615  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||| |||||| ||||||    
T  26088614 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgttgcattatcgagtc 26088532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18397803 - 18397622
Alignment:
Q  6 atgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 104  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| || ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||| |||    
T  18397803 atgttgaatgacattgttgagtattgatgatcatattgatgtggtgatgatgagtattatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgaaaa 18397704  T
Q  105 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18397703 tgttgtggggataatcaatataattgggagttgccctatatattgtggtgaaaattgtagattgttgtcgcattatcgagtc 18397622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 1651234 - 1651420
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||  || ||| || ||  ||||||| |||| |||||    
T  1651234 agttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatataattgtgtgtggacatgtttccttggtaatg 1651333  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  1651334 c-aatgttgtggagatgatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 1651420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23994032 - 23993858
Alignment:
Q  10 tgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 109  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23994032 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttg 23993934  T
Q  110 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  23993933 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 23993858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22431129 - 22430944
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  22431129 agttgatgtagaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgattaatgctatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataat 22431030  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22431029 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtttaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22430944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 25745615 - 25745763
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  25745615 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataat 25745714  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatatt 148  Q
    ||||||| |||| | || | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25745715 gcaaatgatgtgtagatgaacaatataattgggtgttgtcctatttatt 25745763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1554701 - 1554536
Alignment:
Q  20 tgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| || |    
T  1554701 tgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgatgcggagatga 1554602  T
Q  119 tcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1554601 acaatataattgggtgttgtcctatatattgtggag-aaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 1554536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19609310 - 19609191
Alignment:
Q  68 ttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 167  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||    
T  19609310 ttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaatt 19609213  T
Q  168 gttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  19609212 gttgtcgcattatcgagtcctt 19609191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 22226926 - 22227111
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||| | |||||||| ||| |||| ||| ||||||| || ||   |||||| |||| |||||||    
T  22226926 ttgatgttggatgacattgttgattactgataaatatgttgacgtgtgatgatgagtactttgatttatttgtgtgtggatatgtttccttggtaatgca 22227025  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  22227026 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattttcgagtcctt 22227111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16084215 - 16084112
Alignment:
Q  83 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  16084215 catgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttttcgcattatcg 16084116  T
Q  183 agtc 186  Q
    ||||    
T  16084115 agtc 16084112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22867031 - 22866871
Alignment:
Q  20 tgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataa 118  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||  ||| | ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22867031 tgttgatttttgataatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatcatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatga 22866932  T
Q  119 tcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22866931 tcaatttatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatttcgcatta 22866871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 191
Target Start/End: Original strand, 28196147 - 28196255
Alignment:
Q  83 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccg 182  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28196147 catgatttcttgataatgcaattggtgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggagtgttgtcgcattatcg 28196246  T
Q  183 agtccttgt 191  Q
    |||| ||||    
T  28196247 agtctttgt 28196255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Original strand, 25368728 - 25368827
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa-ttgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||    
T  25368728 tttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaatttgtggagtgatgtcgcattatcgagtc 25368827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 16084962 - 16084882
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 80  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| || ||| ||| |||||    
T  16084962 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgattgatgtgtggtgatgaatactacgatttaattgtgtatg 16084882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 1554866 - 1554817
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1554866 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 1554817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Original strand, 16889122 - 16889183
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16889122 tttcttgataatgcaaatgatgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 16889183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33323605 - 33323532
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  33323605 tttcttgataatgcgaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagatgtcctttatattgttgtgaaaattg 33323532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 35137326 - 35137399
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  35137326 tttcttgataatgcgaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagatgtcctttatattgttgtgaaaattg 35137399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18741203 - 18741146
Alignment:
Q  128 ttggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18741203 ttgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18741146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22846923 - 22846867
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatat 147  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  22846923 cttgataattcaattgttgtggagataatcaatatatttggaagttatcctttatat 22846867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 65)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 21652685 - 21652877
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21652685 agttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgaacatgttttcttgataatg 21652784  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21652785 caaatgttgtggaaataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 21652877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11582752 - 11582564
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11582752 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 11582653  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11582652 caaatgttgtggagataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 11582564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21393066 - 21392874
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21393066 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 21392967  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21392966 caaatgttgtggagataatcaatataattgggttttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatggagtccttgtac 21392874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 1169944 - 1170129
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  1169944 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatggacatgttttcttgataatg 1170043  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  1170044 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattttggattgttgtcgcgttatcgagtc 1170129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20711012 - 20710823
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  20711012 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcg 20710914  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20710913 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 20710823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28258479 - 28258286
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagt-gttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 98  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28258479 agttgatgttgaatgacatttgttgattaatgataatcatgattgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataa 28258380  T
Q  99 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28258379 tgcaa-tgttgtggaggtaatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtcgtcgcattatcgagtccttgtac 28258286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 1221134 - 1221319
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  1221134 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 1221231  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1221232 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaagttgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 1221319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 22367887 - 22368072
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  22367887 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 22367984  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22367985 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22368072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7424553 - 7424367
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7424553 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 7424454  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7424453 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 7424367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11341512 - 11341326
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11341512 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatg 11341413  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  11341412 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattattgagtcctt 11341326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 17473172 - 17473360
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17473172 agttaatgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtataagcatgttttcttgataatg 17473271  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17473272 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 17473360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 21074892 - 21075077
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  21074892 agttgatgttgaacgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 21074989  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21074990 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 21075077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 4201368 - 4201554
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4201368 agttgatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 4201467  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4201468 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 4201554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23513674 - 23513486
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||    
T  23513674 agttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgattactatgatctatttgtgtgtgggcatgttttcttgataat 23513575  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23513574 gcaa-tgttgtggatataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 23513486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 25192399 - 25192586
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25192399 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 25192498  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  25192499 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gtttgttgtcgcattatcgagtcctt 25192586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16535183 - 16535006
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  16535183 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttgattgtatatgggcatgttttcttgataatg 16535084  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16535083 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 16535006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Original strand, 24184499 - 24184681
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  24184499 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattccatgatttggttgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 24184598  T
Q  104 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24184599 atgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgtattgttgtcgcattatcgagtc 24184681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11224 - 11044
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  11224 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 11127  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11126 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 11044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 9732069 - 9732252
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||    
T  9732069 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatg 9732168  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  9732169 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 9732252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 22884583 - 22884771
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22884583 agttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataat 22884682  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22884683 gcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22884771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 29192023 - 29192203
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  29192023 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 29192120  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29192121 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 29192203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 110385 - 110572
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  110385 agttgatgttggatgacattgttgattattaataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttgattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 110484  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  110485 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctgtatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 110572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 10779582 - 10779767
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  10779582 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatattatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 10779679  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10779680 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttatcatatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 10779767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 43445155 - 43445342
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    ||||||||||||||  || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  43445155 agttgatgttgaatatcattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatga-ttatttgtgtatgggcatgttttcttgataat 43445253  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  43445254 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 43445342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 21234808 - 21234994
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21234808 agttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 21234907  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  21234908 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 21234994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4864145 - 4863967
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4864145 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 4864046  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4864045 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 4863967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 18779396 - 18779583
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  18779396 agttgatgttgaatgacattgttgattatcgataatcatgattgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatggacatgttttcttgataat 18779495  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18779496 gc-aatgttgtggagataatcaatataattggttgtcgtcatatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18779583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25425495 - 25425312
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| |||||||||||||    
T  25425495 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatg-tttcttgataatg 25425399  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  25425398 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 25425312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23327825 - 23327643
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || ||  |||||||||||||||||||     
T  23327825 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtggacatgttttcttgataatgc- 23327729  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23327728 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 23327643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24595373 - 24595191
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  24595373 ttgattttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 24595277  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24595276 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 24595191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20615476 - 20615305
Alignment:
Q  13 atgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgg 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20615476 atgacattgttgattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtgg 20615378  T
Q  113 aaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  20615377 agataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20615305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21649707 - 21649523
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  21649707 agttgatgttgaatgacatcgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatg 21649608  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21649607 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttatcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 21649523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23510846 - 23510676
Alignment:
Q  20 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 119  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| |||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23510846 tgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgcatgtgggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataat 23510750  T
Q  120 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23510749 caatataattgggtgttgtcctatatattgaggtagaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 23510676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 35792554 - 35792719
Alignment:
Q  20 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |     
T  35792554 tgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaa 35792653  T
Q  120 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  35792654 caatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 35792719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37051857 - 37051677
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 103  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  37051857 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattacgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 37051759  T
Q  104 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  37051758 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37051677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 21933565 - 21933748
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  21933565 agttgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 21933661  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  21933662 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 21933748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 21939735 - 21939918
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  21939735 agttgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 21939831  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  21939832 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 21939918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35581127 - 35580944
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  35581127 agttgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 35581031  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  35581030 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 35580944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 37010569 - 37010752
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  37010569 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgacgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 37010665  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  37010666 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 37010752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19404459 - 19404268
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  19404459 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataat 19404360  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgt 191  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19404359 gcaaatgtggtggagatgaacaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgt 19404268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19498659 - 19498490
Alignment:
Q  15 gacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  19498659 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatg-tttcttgataatgc-aatgttgtggag 19498564  T
Q  115 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19498563 atgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 19498490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 27185116 - 27185301
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||| ||| ||||   |||||||||||||||||    
T  27185116 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgaagatgaatgctatgatttaattgtgtatagacatgttttcttgataat 27185215  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27185216 gcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggtgagaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 27185301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23453829 - 23453638
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  23453829 agttgattttgaatgacattgttggtttttgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataat 23453730  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgt 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  23453729 gcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattattgagtccttgt 23453638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23465334 - 23465143
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  23465334 agttgattttgaatgacattgttggtttttgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataat 23465235  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgt 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  23465234 gcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattattgagtccttgt 23465143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 11338149 - 11338341
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||| ||  ||  |||||  |||||||||||||||||    
T  11338149 agttaatgttgaatgaccttgttgattattgataatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttatgatttgattatgtatggacatgttttcttgataat 11338248  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  11338249 gcaaatgttgtggagatgatcaatatatatggaa-ttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtctttgtac 11338341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 25901728 - 25901911
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||  |||||    
T  25901728 agttgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttagtaatg 25901827  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  25901828 c-aatgttgaggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 25901911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Original strand, 11213007 - 11213167
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  || ||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  11213007 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatctaattgtgtgcgggcatgttttcttgataatgca 11213106  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 163  Q
    |||| ||| |  || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  11213107 aatgatgttgtgatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtgttgaaaattgtg 11213167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27008867 - 27008705
Alignment:
Q  22 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 121  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||| |||  ||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  27008867 ttgattgttgataatcaaattgttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtatatgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgtggtggagataatca 27008769  T
Q  122 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  27008768 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 27008705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24474443 - 24474367
Alignment:
Q  29 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24474443 ttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaat 24474367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7727369 - 7727296
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  7727369 tttcttgataatgcaaatgttatggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 7727296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23492794 - 23492722
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23492794 tttcttgataatg-aaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23492722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Original strand, 32967547 - 32967608
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  32967547 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 32967608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 1169796 - 1169848
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1169796 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 1169848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3672780 - 3672708
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  3672780 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatacttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtg 3672708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 17473023 - 17473075
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17473023 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 17473075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 149
Target Start/End: Original strand, 37189501 - 37189561
Alignment:
Q  89 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  37189501 ttcttgatgatgcaaatgttgtggaaatgatcaatatatttggaggttgtcctttatattg 37189561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 431221 - 431149
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| | |||||  |||||||||    
T  431221 tttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttgtattgttgtgaaaatt 431149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 28888709 - 28888649
Alignment:
Q  89 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  28888709 ttcttgataatgcaaatgtagtggatatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 28888649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Original strand, 43445013 - 43445060
Alignment:
Q  6 atgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43445013 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 43445060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24471049 - 24470996
Alignment:
Q  132 atgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24471049 atgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 24470996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21615804 - 21615735
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 160  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  21615804 cttgataatgcaattgttgaggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 21615735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Original strand, 24226842 - 24226911
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 160  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  24226842 cttgataatgcaattgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtcgtgaaaatt 24226911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 186
Target Start/End: Original strand, 5452190 - 5452285
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| |||||||| |||| |||| || ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||| ||||||    
T  5452190 cttggtaatgcaattgttctggagatgatcaatatgtttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 5452285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19861025 - 19860967
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19861025 cttgataatgcaattgttgaggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 19860967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 35792404 - 35792456
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35792404 agttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 35792456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 821395 - 821646
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  821395 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 821494  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgg---------------attgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||| |||||    
T  821495 caaatgttgtgaagataatcaatataattggatgttgtcgtatatattgaggtgaaaattgtggaggtgaaaattatgaattgttgtcgcattatcgagt 821594  T
Q  186 ccttgtacgagtcctttattatannnnnnnggtaattcaatagccttattat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  821595 ccttgtacgagtcctttattatctttttttggtaattcaatagccttattat 821646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33739140 - 33738948
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  33739140 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgaaggtgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 33739041  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33739040 caaatgttttggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 33738948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 12901055 - 12901240
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12901055 agttgatgtttaatgatattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatgctatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 12901154  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12901155 caaatgatgtggagatgatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 12901240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44054797 - 44054612
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44054797 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 44054698  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  44054697 caaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgggaattgttgtcgcattatcgagtc 44054612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 53909053 - 53909238
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  53909053 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatg 53909152  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53909153 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctgtatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 53909238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 53706073 - 53706261
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  53706073 agttggtgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 53706172  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  53706173 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattattattgcattatcgagtcctt 53706261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44345703 - 44345510
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  44345703 agttgatgttgaatgacattgttgattattaataatcatgttaatgtggtgaagatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgatttcttgataat 44345604  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44345603 gcaaatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcccatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 44345510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16521663 - 16521479
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16521663 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatagtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 16521564  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16521563 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 16521479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19999400 - 19999215
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||| ||||||||||    
T  19999400 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgtttgcttgataatg 19999303  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19999302 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 19999215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 7133732 - 7133924
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  7133732 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgcgatggtgaatactatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 7133831  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7133832 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaaatgttgtcgcattatcgagtccttgtac 7133924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 8873777 - 8873961
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8873777 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 8873876  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8873877 caaattttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 8873961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10643062 - 10642874
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10643062 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 10642963  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10642962 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 10642874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18167665 - 18167481
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  18167665 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 18167568  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18167567 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18167481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 45460239 - 45460432
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  45460239 agttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatcttatgatttaattgtgtacggacatgttttcttgataat 45460338  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  45460339 gcaaatgttgtagagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgaattgtcgtcgcattattgagtccttgtac 45460432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 15288293 - 15288479
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15288293 agttgatgttgaatgacattgttgattattcataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 15288392  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15288393 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agtttgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15288479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 110355 - 110171
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  110355 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatg 110256  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  110255 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 110171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 15274043 - 15274226
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||    
T  15274043 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatg 15274142  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  15274143 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 15274226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 21960851 - 21961036
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21960851 agttgatgttaaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtggtgatgaatactatgatttatttgtgtatgagcatgttttcttgataatg 21960950  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  21960951 caaatgatgtggagatgatcaatataatcaagagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgttgcattatcgagtc 21961036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9294398 - 9294212
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9294398 agttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatg 9294299  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9294298 c-aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 9294212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10487544 - 10487358
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10487544 agttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatg 10487445  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  10487444 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 10487358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 22355847 - 22356033
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22355847 agttgatgttgaatgacattgttgaatattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 22355946  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  22355947 c-aatgttgtggagataaccaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaactgttgtcgcattatcgagtcctt 22356033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13245325 - 13245139
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  13245325 agttgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatgttgatttgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatg 13245226  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13245225 c-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtttcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13245139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 15295403 - 15295589
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  15295403 agttgatgttgaatgacattgttgattattcataatcatgttgataggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgagaatg 15295502  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15295503 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agtttgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15295589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 16329207 - 16329393
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16329207 agttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 16329306  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  16329307 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 16329393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26338355 - 26338173
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  26338355 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 26338259  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26338258 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 26338173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18247061 - 18246881
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  18247061 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 18246964  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  || ||||||||||| |||||    
T  18246963 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgattttttgtcgcattatcgagt 18246881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 47356201 - 47356013
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  47356201 agttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggaatgttttcttgataat 47356102  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  47356101 gcaa-taatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 47356013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14950893 - 14950707
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||  || || |||||||||||||||||||    
T  14950893 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattttgtgtgggcatgttttcttgataatg 14950794  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14950793 c-aatattgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 14950707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8373228 - 8373042
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  8373228 agttgatgttgaatgacattgttggttattgataatcatgttgcggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttctcttgataatg 8373129  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcct 188  Q
    |||||| |||| | || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8373128 caaatgatgtgaagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcct 8373042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14995070 - 14994888
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  14995070 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataat 14994973  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14994972 gcaa-tgttgtggagataatctatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 14994888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Original strand, 54119579 - 54119732
Alignment:
Q  35 atcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatg 134  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  54119579 atcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtg 54119677  T
Q  135 ttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54119678 ttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 54119732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 25120405 - 25120589
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  25120405 agttgatgttgaatgacattgacgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatg 25120504  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25120505 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 25120589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 30233826 - 30233998
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||  ||| | ||  ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  30233826 agttaatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgttgatgtggtgatgatgaatcttataatttgattgtgtatggacatgttttcttgataat 30233925  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgt 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30233926 gcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatatcgaggtgaaaattgtggattgttgt 30233998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 34393929 - 34393744
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||     
T  34393929 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataaa 34393830  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34393829 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 34393744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 5684185 - 5684370
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5684185 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 5684284  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5684285 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggacaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 5684370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15212217 - 15212032
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||    
T  15212217 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgttatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataat 15212118  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  15212117 gcaaatgatgtgaagatgaacaatataatcggatgttgtcctatatattgtggataaaattgt-aattgttgtcgcattatcgagtc 15212032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 18495689 - 18495880
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  18495689 agttgttgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgggtatggacatgttttcttgataat 18495788  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgt 191  Q
    |||||||||||| | || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||    
T  18495789 gcaaatgttgtgaagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggaaagatgtcgcattatcgagtctttgt 18495880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 186
Target Start/End: Original strand, 13049491 - 13049630
Alignment:
Q  45 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 144  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13049491 tgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctata 13049589  T
Q  145 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  13049590 tattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13049630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26678908 - 26678732
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||| | | ||| ||||| ||||||          |||    
T  26678908 agttgatgttgcatgacattgttgattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatatcatgattaaattgtgtatgggcatgt----------atg 26678819  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26678818 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 26678732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 23271207 - 23271342
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  23271207 agttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttgttgtgcgatgatgaatactacgatttatttgtgtgtgggcatgttttcttgttaatg 23271306  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttg 137  Q
    | ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||    
T  23271307 c-aatgttgtgaagataattaatataattgaatgttg 23271342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 191
Target Start/End: Original strand, 13810995 - 13811103
Alignment:
Q  83 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccg 182  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||| ||    
T  13810995 catgatttcttgataatggaattgttgtggaaataatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtaatgtcgcattatcg 13811094  T
Q  183 agtccttgt 191  Q
    |||| ||||    
T  13811095 agtctttgt 13811103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 193
Target Start/End: Original strand, 13751694 - 13751769
Alignment:
Q  118 atcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13751694 atcaatataattgggagttgtgttatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 13751769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 18294450 - 18294580
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||      |||||| |||||  ||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  18294450 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgtg-----gtgatgatgaatgttatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatg 18294544  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgtt 136  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||    
T  18294545 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtt 18294580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Original strand, 43282757 - 43282855
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||| ||||||    
T  43282757 tttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 43282855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Original strand, 52266840 - 52266938
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  52266840 tttcttgataatgcaattgttgtagagatgatcaatatatttggaagttatcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 52266938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 8044134 - 8044021
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  8044134 agttgatgttgaataacattgttgattgtttatgatcatgttgaggtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataat 8044035  T
Q  100 gcaaatgttgtgga 113  Q
    ||||||| ||||||    
T  8044034 gcaaatgatgtgga 8044021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 15852696 - 15852769
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  15852696 tttcttgataatgcaaatgttgtagagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 15852769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 5684036 - 5684088
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5684036 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatttttatgtgtgatg 5684088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Original strand, 18294304 - 18294354
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18294304 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18294354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 19019439 - 19019390
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19019439 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 19019390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 27959820 - 27959759
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27959820 tttcttgataatgcaaacgtagtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 27959759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Original strand, 34197544 - 34197605
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  34197544 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaccaatatatttggaagttgtcctttatattg 34197605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 8373478 - 8373431
Alignment:
Q  6 atgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8373478 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 8373431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15043721 - 15043631
Alignment:
Q  96 taatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||| ||||||    
T  15043721 taatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 15043631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 186
Target Start/End: Original strand, 15110703 - 15110793
Alignment:
Q  96 taatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||| ||||||    
T  15110703 taatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 15110793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 47356343 - 47356297
Alignment:
Q  6 atgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 52  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  47356343 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgat 47356297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 141
Target Start/End: Original strand, 37958436 - 37958489
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcct 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  37958436 tttcttgataatgcaaatgttgtagagatgatcaatatatttggaagttgtcct 37958489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Original strand, 41167314 - 41167375
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | |||||| | |||||||    
T  41167314 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcatttatattg 41167375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 34394072 - 34394020
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  34394072 agttgattttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 34394020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Original strand, 41257728 - 41257797
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 160  Q
    ||||||||||||| ||| || || || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||    
T  41257728 cttgataatgcaattgtggttgagatgatcaatataattggaagttatcctttatattgttgtgaaaatt 41257797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 18109986 - 18110038
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18109986 agttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18110038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 22407484 - 22407676
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22407484 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtatgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 22407583  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22407584 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatccagtccttgtac 22407676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 49966523 - 49966331
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  49966523 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtttatggacatgttttcttgataatg 49966424  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49966423 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 49966331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 2422260 - 2422445
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2422260 agttgatgttgaatgacattgtcgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatattatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 2422359  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2422360 caaatgtggtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaagttgtggattgttgtcgcattatcgagtc 2422445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18506230 - 18506043
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18506230 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttacttgtgtgtgggcat-ttttcttgataatg 18506132  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18506131 ctaatgttgcggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18506043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 41210913 - 41210732
Alignment:
Q  8 gttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 107  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41210913 gttgaatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggccatgttttcttgataatgcaaatgt 41210814  T
Q  108 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41210813 tgtggagataatcaatataattaggtgttgtcctatatattaaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 41210732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 20826513 - 20826696
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||    
T  20826513 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatg 20826612  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  20826613 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 20826696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 44036189 - 44036373
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44036189 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatgttttcttgataatg 44036288  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  44036289 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatacattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 44036373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 15862722 - 15862908
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| || || |||||||| ||||||||||    
T  15862722 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttgattgtgtgtgggcatgtttccttgataatg 15862821  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  15862822 c-aatgttgtggagatattcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 15862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Original strand, 35523713 - 35523894
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 103  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35523713 tgatgttgggtgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatga-ttggttgcgtatggacatgttttcttgataatgcaa 35523811  T
Q  104 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35523812 atgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 35523894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 22250242 - 22250430
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22250242 agttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatttaattgtgtatgaacatgttttcttgataat 22250341  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22250342 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtagtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 22250430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 37845755 - 37845939
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  37845755 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatg 37845854  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37845855 caaatgatgtggaggtaaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37845939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22034717 - 22034535
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  22034717 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 22034621  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22034620 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22034535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21858430 - 21858246
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  21858430 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatg 21858331  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  21858330 caaatgatgtggaggtaaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgttgcattatcgagtc 21858246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22353002 - 22352814
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22353002 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtaatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 22352903  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  22352902 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgttgtttgttgtcgcattatcgagtcctt 22352814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22365629 - 22365441
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22365629 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgataatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgaacatgttttcttgataat 22365530  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22365529 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgtattgttgtcgcattatcgagtcctt 22365441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17147654 - 17147468
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  17147654 agttgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatg 17147555  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17147554 c-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcctt 17147468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 20894983 - 20895169
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  20894983 agttgatgt-gaatgatattgttgattattgaaaatcatgttgatgtgtgatgatgaatactattatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatg 20895081  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20895082 caa-tgttgtggagataatcaatataattgtgtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtggcattatcgagtcctt 20895169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 7641884 - 7642068
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || | ||||||||||||||||     
T  7641884 agttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggtatgttttcttgataata 7641981  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7641982 c-aatgttgtggagatcatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 7642068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20444618 - 20444443
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  20444618 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgca 20444519  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    |||  |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  20444518 aatcatgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattat-gattgttgtcgcatta 20444443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20530383 - 20530208
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  20530383 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgca 20530284  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    |||  |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  20530283 aatcatgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattat-gattgttgtcgcatta 20530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 21651228 - 21651412
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||     
T  21651228 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgcatgggcatgttgtcttgataatgc- 21651326  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  21651327 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgtattatcgagtcctt 21651412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 5675890 - 5676074
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||  |||  |||   ||||||||||||||||||    
T  5675890 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgaaggtggatactatgaattgattgtatatagacatgttttcttgataatg 5675989  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5675990 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 5676074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 18060898 - 18061085
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  18060898 agttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgtttccttggtaat 18060997  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18060998 gcaa-tgttgtggatataatcaatataattgggtgtagtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18061085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 51451485 - 51451299
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||| ||| |||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  51451485 agttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatgctatgatttaattgtttatgggcatgttctcttgataatg 51451386  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  51451385 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 51451299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21717077 - 21716895
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  21717077 agttgatgttgaatgacattgttgatt---gataatcatgttgatatgtgatgatgaattctatgatttggttgtgtatggacatgtttttttgataatg 21716981  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21716980 caaatgttgtggagatgagcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 21716895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35053714 - 35053539
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  35053714 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatg 35053617  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35053616 caaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcatta 35053539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17003694 - 17003511
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  17003694 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgggatgatgaattctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 17003598  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  17003597 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 17003511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20526992 - 20526808
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||    
T  20526992 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgtcttcttgataatg 20526893  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
     ||||  |||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20526892 taaatcatgtggagatgaacaatataactgggtggtgtcctatatattgtggagaaagttgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20526808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 45050556 - 45050370
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||    
T  45050556 agttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatg 45050457  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  45050456 c-aatgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 45050370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41218328 - 41218143
Alignment:
Q  2 gttgatgttgaatgacagtg-ttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41218328 gttgatgtagaataacaatgattgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaattctatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataat 41218229  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||  |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41218228 gcaaataatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 41218143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22029566 - 22029383
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  22029566 ttgatgttgaatgacattgttgactattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 22029470  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22029469 aatgttgtggagataatcaatataatggtggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22029383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22226846 - 22226667
Alignment:
Q  10 tgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 108  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  22226846 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgtt 22226748  T
Q  109 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22226747 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22226667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20930327 - 20930163
Alignment:
Q  22 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 120  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |    
T  20930327 ttgattgttgataatcatgttgatgtgcggtgatgaatactatgattttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaac 20930228  T
Q  121 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20930227 aatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20930163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 41393324 - 41393138
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||  ||  || || |   ||||||| ||||||||||    
T  41393324 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatgtaactgtgtgtagacatgtttccttgataatg 41393225  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  41393224 caa-tgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatactgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 41393138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 186
Target Start/End: Original strand, 9785551 - 9785707
Alignment:
Q  29 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 128  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||    
T  9785551 ttgataatcatgttgatgtgcgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgtgcatgctttcttgataatgcaaatgatgtggagaggaacaatataat 9785650  T
Q  129 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9785651 tgagtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 9785707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 18602353 - 18602518
Alignment:
Q  20 tgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataa 118  Q
    |||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  18602353 tgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataa 18602451  T
Q  119 tcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  18602452 tcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 18602518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 5073610 - 5073775
Alignment:
Q  20 tgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataa 118  Q
    |||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  5073610 tgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataa 5073708  T
Q  119 tcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  5073709 tcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattggtgtcgcattatcgagtc 5073775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 51657604 - 51657805
Alignment:
Q  2 gttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgttttc 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||         | ||||| ||  ||| |||||  |||| ||||    
T  51657604 gttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttaattgaattatgatttgattgtgtatggacatgatttc 51657703  T
Q  92 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgt 191  Q
     ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||| |||||| |||||| ||||    
T  51657704 atgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgttgcattatcgagtctttgt 51657803  T
Q  192 ac 193  Q
    ||    
T  51657804 ac 51657805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 151
Target Start/End: Original strand, 20121967 - 20122098
Alignment:
Q  20 tgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataa 118  Q
    |||||||| |||||||||| |||  || |||||||  ||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  20121967 tgttgattgttgataatcaagttgttggtgtgatgaggaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataa 20122065  T
Q  119 tcaatataattggatgttgtcctatatattgag 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20122066 tcaatataattgggtgttgtcctatatattgag 20122098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 38034997 - 38035070
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  38034997 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 38035070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 22031007 - 22031078
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttg 74  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  22031007 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgaggaatactatgatttatttg 22031078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 36357713 - 36357786
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  36357713 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 36357786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 163
Target Start/End: Original strand, 20956341 - 20956416
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 163  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  20956341 tttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtg 20956416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 186
Target Start/End: Original strand, 22836628 - 22836723
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||   || |||||||||| ||||||    
T  22836628 cttggtaatgcaattgttgtggaaatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattatgaggtgatgtcgcattatcgagtc 22836723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27673641 - 27673543
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||| ||||||    
T  27673641 tttcttgataatacaattgttttggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtggtgtcgcattatcgagtc 27673543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19601972 - 19601911
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19601972 tttcttgacaatgcaaatgttgtggagatcatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 19601911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 20253295 - 20253246
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20253295 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 20253246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 22353149 - 22353097
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22353149 agttgatgttgaatgatattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 22353097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Original strand, 37235336 - 37235405
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| || ||||  |||||||||    
T  37235336 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttaaattgttgtgaaaatt 37235405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Original strand, 5471758 - 5471816
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5471758 cttgataatgcaattgtggtggaggtgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 5471816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Original strand, 8539328 - 8539396
Alignment:
Q  92 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 160  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||| || | |||||||  |||||||||    
T  8539328 ttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttatcatttatattgtcgtgaaaatt 8539396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Original strand, 8604567 - 8604635
Alignment:
Q  92 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 160  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||| || | |||||||  |||||||||    
T  8604567 ttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttatcatttatattgtcgtgaaaatt 8604635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 76)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 24718699 - 24718887
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24718699 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 24718798  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24718799 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcacattatcgagtcctt 24718887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25121419 - 25121227
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25121419 agttgatgttgaatgaccttgttgattattgataattatgttaatgtgtgatggtgaatattatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 25121320  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25121319 caaatgttgtggagataatcaatataattggaagttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtccttgtac 25121227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 6775514 - 6775701
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6775514 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 6775613  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  6775614 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgttgcattatcgagtcctt 6775701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41245540 - 41245348
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  41245540 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgaagaagaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 41245441  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41245440 caaatgttatggagataatcaatataattgggagtagtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 41245348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 19994433 - 19994626
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19994433 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 19994532  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    | |||||   |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19994533 gtaaatgaaatggagataatcaatatagttgtgtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtccttgtac 19994626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 3432858 - 3433044
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3432858 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatattatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 3432957  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3432958 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 3433044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 22908767 - 22908956
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  22908767 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttatttg--tatgggcatgttttcttgataat 22908864  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgta 192  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22908865 gcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtccttgta 22908956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 43374865 - 43375051
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  43374865 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatg 43374964  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43374965 c-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 43375051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 224443 - 224631
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  224443 agttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataat 224542  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  224543 gcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 224631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 700856 - 701044
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  700856 agttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataat 700955  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  700956 gcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 701044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 738066 - 738254
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  738066 agttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataat 738165  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  738166 gcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 738254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 861961 - 862149
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  861961 agttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataat 862060  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  862061 gcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 862149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 13663918 - 13664105
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13663918 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgtga-tgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 13664016  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13664017 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13664105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 13723193 - 13723380
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13723193 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgtga-tgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 13723291  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13723292 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13723380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 22322717 - 22322909
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgtt-gattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  22322717 agttgatgttgaatgacattttttgattattgataatcatgttgatgtgagatgatgaatactatgaattaattgtgtatgggcatgttttcttaataat 22322816  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  22322817 gcaa-tgttgtggaggtaatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattatggattattgtcgcattatcaagtccttgtac 22322909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5237069 - 5236883
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5237069 agttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 5236970  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  5236969 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 5236883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 16874221 - 16874407
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  16874221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatg 16874320  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16874321 c-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 16874407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 24662529 - 24662715
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24662529 agttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 24662628  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  24662629 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 24662715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43684528 - 43684342
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43684528 agttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 43684429  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  43684428 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 43684342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Original strand, 20648723 - 20648906
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  20648723 ttgatgttggatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatgggtatgttttcttgataatgca 20648822  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20648823 aatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgttctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 20648906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 24930396 - 24930582
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||| |  ||||||| |||||||||    
T  24930396 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtagggacatgtttccttgataat 24930495  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24930496 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 24930582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 24386991 - 24387175
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||     
T  24386991 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataata 24387090  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24387091 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 24387175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Original strand, 20655308 - 20655491
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  20655308 ttgatgttggatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 20655407  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  20655408 aatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 20655491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 272488 - 272671
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  272488 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 272584  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  272585 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 272671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 643361 - 643178
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  643361 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 643265  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  643264 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 643178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 829167 - 828984
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  829167 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 829071  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  829070 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 828984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16417138 - 16416945
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |  ||  |||||||||||||||||    
T  16417138 agttgatgtggaataacattgttgagtattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgcgtggacatgttttcttgataat 16417039  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  16417038 gcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggataattgtcacattatcgagtctttgtac 16416945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 24107869 - 24108050
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  24107869 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtacgggcatgttttcttgataatg 24107968  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    | |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  24107969 c-aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgg--tgttgtcgcattatcgagt 24108050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 22089729 - 22089911
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  22089729 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 22089826  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22089827 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22089911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37610244 - 37610059
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||||    
T  37610244 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatattttcttgataat 37610145  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37610144 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37610059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29759168 - 29758984
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  29759168 agttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatg 29759069  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | ||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29759068 caaatgatgtggagatgaacaacataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 29758984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 16195019 - 16195202
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttat-ttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||  ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  16195019 agttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatattgatgtgtgatgatgaatactatgatttaaattgtgaatgggcatgttttcttgataat 16195118  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgag 184  Q
    ||||||| ||| || || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16195119 gcaaatgatgtagagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgag 16195202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 15320345 - 15320527
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  15320345 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 15320441  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15320442 aatgttgtggagataatcaatacaattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15320527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 15500714 - 15500896
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  15500714 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 15500810  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15500811 aatgttgtggagataatcaatacaattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15500896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Original strand, 20568553 - 20568734
Alignment:
Q  6 atgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||| |  ||||| ||  ||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  20568553 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatatggtgatgatgagtgttatgatttgattgtgtatggacatgctttcttgataatgcaaa 20568652  T
Q  105 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20568653 tgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 20568734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Original strand, 20574746 - 20574927
Alignment:
Q  6 atgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||| |  ||||| ||  ||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  20574746 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatatggtgatgatgagtgttatgatttgattgtgtatggacatgctttcttgataatgcaaa 20574845  T
Q  105 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20574846 tgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 20574927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24548095 - 24547909
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||    
T  24548095 agttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatg 24547996  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  24547995 c-aatgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 24547909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 270585 - 270429
Alignment:
Q  29 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 128  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||    
T  270585 ttgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtagagatgaacaatataat 270486  T
Q  129 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  270485 tgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 270429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 186
Target Start/End: Original strand, 645335 - 645491
Alignment:
Q  29 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 128  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||    
T  645335 ttgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgttgagatgaacaatataat 645434  T
Q  129 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  645435 tgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 645491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 186
Target Start/End: Original strand, 831070 - 831226
Alignment:
Q  29 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 128  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||    
T  831070 ttgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtagagatgaacaatataat 831169  T
Q  129 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  831170 tgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 831226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 189
Target Start/End: Original strand, 22007788 - 22007948
Alignment:
Q  29 ttgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataa 127  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  22007788 ttgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaattctatgatttaattgtgtatgggaatgttttcttgataatgcaa-tgttgtgaagataatcaatataa 22007886  T
Q  128 ttggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22007887 ttgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 22007948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21696439 - 21696253
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||  |||||  ||||| || |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  21696439 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgcgataatgaatcttatgatttgtttgtgtatgggcatattttcttgataat 21696340  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  21696339 gcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaatactgtggattgatgttgcattatcgagtc 21696253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21680080 - 21679889
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||| ||||||||||    
T  21680080 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgtcgatgttgtgataatgaatcttatgatttcattgtgtatggacatgttctcttgataat 21679981  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgt 191  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21679980 gcaaatgtggtggagatgaacaatatatttggaagttgtcatctatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgt 21679889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 17730746 - 17730936
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||| ||||    
T  17730746 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgttaat 17730845  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgt 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||    
T  17730846 gcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtgg-gaaaattgtggggtgatgtcgcattatcgagtctttgt 17730936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 28836468 - 28836353
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  28836468 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 28836371  T
Q  101 caaatgttgtggaaataat 119  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  28836370 c-aatgttgtggagataat 28836353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20480546 - 20480365
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||   || |||||  ||||| ||| ||| ||||   ||||||||||| ||||||    
T  20480546 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgttatgatttaattgtgtatagacatgttttctttataatg 20480449  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20480448 caaatgttgtggagatgaacaatataattaggtgttgtcctatatattgtggtgaaaa-tgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20480365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28543806 - 28543628
Alignment:
Q  6 atgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 105  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |  |  |||||| ||| || ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28543806 atgttgaataacattgttgattattgatgatcatgat--ttggtgatgatgagtattatgatttgattgtgtatgaacatgttttcttgataatgcaaat 28543709  T
Q  106 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  28543708 gttgtggagatgatcaatatatgtggaagttgtcctctatattgtggtgataattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 28543628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 16675626 - 16675791
Alignment:
Q  20 tgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataa 118  Q
    |||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  16675626 tgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataa 16675724  T
Q  119 tcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  16675725 tcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 16675791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Original strand, 21853199 - 21853361
Alignment:
Q  22 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 121  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| || ||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  21853199 ttgattgttgataatcaatttgttgtgtgatgatggatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatca 21853297  T
Q  122 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  21853298 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgctgtcgcattatcgagtc 21853361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37605783 - 37605685
Alignment:
Q  87 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37605783 ttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37605685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Original strand, 21845794 - 21845956
Alignment:
Q  22 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 121  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| || ||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||    
T  21845794 ttgattgttgataatcaatttgttgtgtgatgatggatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtgttgataatca 21845892  T
Q  122 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  21845893 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 21845956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 16040642 - 16040748
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| |||    
T  16040642 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgagaat 16040741  T
Q  100 gcaaatg 106  Q
    |||||||    
T  16040742 gcaaatg 16040748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 16042318 - 16042424
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| |||    
T  16042318 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgagaat 16042417  T
Q  100 gcaaatg 106  Q
    |||||||    
T  16042418 gcaaatg 16042424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Original strand, 18768135 - 18768233
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  18768135 tttcttgataatgcaattgttgtggagatgataaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 18768233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 39448198 - 39448271
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  39448198 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataatttgaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 39448271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 186
Target Start/End: Original strand, 16203739 - 16203804
Alignment:
Q  120 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16203739 caatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 16203804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Original strand, 21199547 - 21199608
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21199547 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 21199608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Original strand, 31195658 - 31195719
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31195658 tttcttgataatgcaaatgttgcggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 31195719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38532536 - 38532336
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgtttt 90  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||         ||||| | ||  ||| |||||   ||| |||    
T  38532536 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatttgaactataacttgattgtgtatggatatgattt 38532437  T
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttg 190  Q
    |||||||||  || ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||| | || |||||||||| |||||| |||    
T  38532436 cttgataatataattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtagaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtctttg 38532337  T
Q  191 t 191  Q
    |    
T  38532336 t 38532336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 18618187 - 18618138
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18618187 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18618138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13663771 - 13663823
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13663771 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13663823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13722306 - 13722358
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722306 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13722454 - 13722506
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722454 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13722602 - 13722654
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722602 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13722750 - 13722802
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722750 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13722898 - 13722950
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722898 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13723046 - 13723098
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13723046 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13723098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Original strand, 224301 - 224348
Alignment:
Q  6 atgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  224301 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 224348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Original strand, 700714 - 700761
Alignment:
Q  6 atgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  700714 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 700761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Original strand, 737924 - 737971
Alignment:
Q  6 atgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  737924 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 737971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Original strand, 861819 - 861866
Alignment:
Q  6 atgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  861819 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 861866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Original strand, 17151288 - 17151335
Alignment:
Q  6 atgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17151288 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 17151335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23148682 - 23148624
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23148682 cttgataatgcaaatgttgttgaggtgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 23148624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Original strand, 21192120 - 21192181
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  21192120 tttcttgataatacaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcatttatattg 21192181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 22737250 - 22737324
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgt 162  Q
    ||||||| |||||||  ||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22737250 tttcttggtaatgcatttgtggtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatatggtggtgaaaattgt 22737324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23836008 - 23835950
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  23836008 cttgataatgcaattgttgaggaaatgatcaatatatttggaagttttcctttatattg 23835950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 65)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 13867360 - 13867552
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13867360 agttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 13867459  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13867460 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgttctatatattgaagtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 13867552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44864121 - 44863930
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44864121 agttgatgttgaatgacattgttgatcattgataatcatgctaatgtgtgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 44864022  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgta 192  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44864021 caaatgctgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 44863930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 45453542 - 45453728
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45453542 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 45453641  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataatt-ggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45453642 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggaagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 45453728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7291731 - 7291540
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7291731 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 7291632  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7291631 caaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 7291540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 12544998 - 12545190
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  12544998 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 12545097  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12545098 gaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatatttaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 12545190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 47288653 - 47288461
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  47288653 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 47288554  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  47288553 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatattttgaggtgaaaattgtggattgttgttgcattatcgagtccttgtac 47288461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 369765 - 369580
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  369765 agttgatgttaaaggacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 369666  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  369665 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 369580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 15952382 - 15952563
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  15952382 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 15952479  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15952480 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 15952563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 26071552 - 26071743
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26071552 agttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 26071650  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26071651 caaatgttgtggagataatcaatataattgggcgtggtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 26071743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 26095339 - 26095530
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26095339 agttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 26095437  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26095438 caaatgttgtggagataatcaatataattgggcgtggtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 26095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 15823692 - 15823888
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaata----ctatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgat 96  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  15823692 agttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatatgtgatggtgaatatatactatgatttatttgtgtatggacatgttttcttgat 15823791  T
Q  97 aatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15823792 aatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctttatattgaggtgaagattgttaattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 15823888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 142506 - 142313
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  142506 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgattatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataat 142407  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  142406 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 142313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3058925 - 3058741
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3058925 agttgatgttgaatgatactgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatgttttcttgataatg 3058826  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3058825 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 3058741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 112583 - 112767
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |    
T  112583 agttgatgttgaatgacactgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataaag 112682  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  112683 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgatgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 112767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2027435 - 2027250
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  2027435 agttgatgttcaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcgtgttttcttgataatg 2027336  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  2027335 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaatttgtgattgttgtcgcattatcgagtc 2027250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16417342 - 16417162
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  16417342 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 16417245  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16417244 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 16417162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 18981192 - 18981379
Alignment:
Q  1 agttgatg-ttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  18981192 agttgatgattgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtatgtgggcatgttttcttgataat 18981291  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18981292 gc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18981379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 2191982 - 2192169
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  2191982 agttaatgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttatttttgtatgggcatgttttcttgataatg 2192081  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  2192082 caaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgctgtcgcattatcgagtcctt 2192169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13757456 - 13757270
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  13757456 agttgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatg 13757357  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13757356 c-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13757270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 15442845 - 15443031
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15442845 agttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 15442944  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  15442945 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 15443031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16210657 - 16210471
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  16210657 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataaacatgttgatgtgtgttggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatg 16210558  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16210557 c-aatg-tgtggagataatcaatataattaggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcctt 16210471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 13038392 - 13038568
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  13038392 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatg 13038491  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13038492 c-aatg-tgtggagataatcaatataatcgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcatta 13038568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 32495840 - 32496025
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32495840 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 32495939  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  32495940 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 32496025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 11582128 - 11582311
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  11582128 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtggtgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatg 11582227  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11582228 c-aatg-tgtggagataatcaatataattgagtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcacattatcgagtc 11582311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11286091 - 11285904
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtg--atggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  11286091 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataa 11285992  T
Q  99 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11285991 tgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttctcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 11285904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 36051541 - 36051355
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||| ||||||    
T  36051541 agttgatgttgaatgacattgttgattattgaaaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttacttaataatg 36051442  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36051441 caa-tgt-gtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtagaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 36051355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 13912399 - 13912582
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  13912399 agttgatgttgcatgacattgttgattattgataattatgttgaaatgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttggtaatg 13912498  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  13912499 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13912582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 15525769 - 15525957
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||    
T  15525769 agttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattatgtgaatgatgaatactatgatctatttgtgtgtgtgcatgttttcttgataat 15525868  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  15525869 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaatcgttgtcgcattatcgagtcctt 15525957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 27102836 - 27103019
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  27102836 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 27102932  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  27102933 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 27103019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 27110184 - 27110367
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  27110184 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 27110280  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  27110281 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 27110367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27175490 - 27175307
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  27175490 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 27175394  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  27175393 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 27175307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 38784928 - 38785111
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  38784928 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 38785024  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  38785025 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 38785111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 16480222 - 16480408
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  || |||  |||| |||||||| |||| |||||    
T  16480222 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatgtaattgtatatgggcatgtttccttggtaatg 16480321  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  16480322 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtcctt 16480408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 1938057 - 1938240
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  1938057 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataataatgttgatgtgtaatgatgaatattatgatttaattatgaatgagcatgttttcttgataatg 1938156  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||||| ||||||    
T  1938157 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaat--tgaattgttgtcgcattatcgagtc 1938240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 125704 - 125520
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| | | | ||| |||||||||||||||||||    
T  125704 agttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaatcgtgaatgggcatgttttcttgataatg 125605  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| | |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  125604 caaaggatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 125520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7821798 - 7821615
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  7821798 agttgatgttgagtgacattgttgattattgatatt-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 7821702  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  7821701 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 7821615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7829109 - 7828926
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  7829109 agttgatgttgagtgacattgttgattattgatatt-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 7829013  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  7829012 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 7828926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12753759 - 12753575
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| | || |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  12753759 agttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttaatgtgtggagatgagtactataatttgtttgtgtatggacatgttttcttgataatg 12753660  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12753659 caaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagatgtcctttatattgtggtg-aaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 12753575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 12249398 - 12249584
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  12249398 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataat 12249497  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  12249498 gcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggtagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 12249584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15926242 - 15926058
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||| |||||||||    
T  15926242 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgatgatgatgaatgctatgatttatttgtgt--gggcatgttt-cttgataat 15926147  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15926146 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15926058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11514999 - 11514816
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||    
T  11514999 agttgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatg 11514900  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  11514899 c-aatgttgaggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 11514816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 30263410 - 30263593
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||    
T  30263410 agttgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatg 30263509  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  30263510 c-aatgttgaggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 30263593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 26010477 - 26010663
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||  ||  || || ||  ||||||| ||||||||||    
T  26010477 agttgatgttgaatgacattgtggattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctttgatgtaactgtgtgtggacatgtttccttgataatg 26010576  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26010577 caa-tgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 26010663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Original strand, 42057458 - 42057632
Alignment:
Q  10 tgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 109  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42057458 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttg 42057556  T
Q  110 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  42057557 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 42057632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3893971 - 3893789
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  3893971 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatg 3893874  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
     |||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3893873 taaatgttgtggagatgaacaatataaatgggtgttgtcatatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 3893789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 18255108 - 18255295
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgtttt-cttgataatg 100  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| |||||||||| ||||  |||||| || |||||||||| |  ||||||  | || ||||||||| ||||||||||    
T  18255108 ttgaagttgaatgtctttgttgattgttgataatcaagttatggtgtgaatgatgaatactataatctatttgtatgtgggcatgttttgcttgataatg 18255207  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
     || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18255208 taa-tgttgtggggataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 18255295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 15761674 - 15761839
Alignment:
Q  20 tgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| || |    
T  15761674 tgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgatgaggagatga 15761773  T
Q  119 tcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15761774 acaatataattgggtgttgtcctatatattgtggag-aaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 15761839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2436456 - 2436315
Alignment:
Q  47 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 146  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2436456 tgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtgtggacatttttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 2436358  T
Q  147 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2436357 ttgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 2436315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13571701 - 13571525
Alignment:
Q  9 ttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 107  Q
    |||||||| | | |||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| |||    
T  13571701 ttgaatgatattattgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtttgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgt 13571603  T
Q  108 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  13571602 tgtggagataatcaatataattgggtgttgtcttatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13571525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 16571375 - 16571568
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  16571375 agttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgaggttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataat 16571474  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatata-at-tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgt 191  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| || || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||    
T  16571475 gcaaatgttgttgagatgatcaatatatatatgaaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtctcattatcgagtctttgt 16571568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16594287 - 16594094
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  16594287 agttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgaggttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataat 16594188  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatata-at-tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgt 191  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| || || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||    
T  16594187 gcaaatgttgttgagatgatcaatatatatatgaaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtctcattatcgagtctttgt 16594094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 186
Target Start/End: Original strand, 25293608 - 25293747
Alignment:
Q  45 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 144  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25293608 tgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtgaagataatcaatataattgggtgttgtcctata 25293706  T
Q  145 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  25293707 tattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 25293747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10988468 - 10988303
Alignment:
Q  22 ttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 120  Q
    |||||| |||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  10988468 ttgattgttgataatcaagttgttggtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttc-cttggtaatgcaa-tgttgtggagataatc 10988371  T
Q  121 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  10988370 aatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtcctt 10988303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 39047977 - 39048042
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 66  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39047977 agttgatgttgaatggcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatga 39048042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13273539 - 13273431
Alignment:
Q  83 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccg 182  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| | |  |||||||||| ||    
T  13273539 catgatttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaagttgtgaagtaatgtcgcattatcg 13273440  T
Q  183 agtccttgt 191  Q
    |||| ||||    
T  13273439 agtctttgt 13273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15629567 - 15629459
Alignment:
Q  83 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccg 182  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||||| ||    
T  15629567 catgatttcttgataatacaattgttgtggaaatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgacgtcgcattatcg 15629468  T
Q  183 agtccttgt 191  Q
    |||| ||||    
T  15629467 agtctttgt 15629459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 191
Target Start/End: Original strand, 49049169 - 49049277
Alignment:
Q  83 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccg 182  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||| ||    
T  49049169 catgatttcttgataatgcaattgtggtggagatgatcaacatatttgaaagttgtcctttatattgtggtggaaattgtgagttgatgtcgcattatcg 49049268  T
Q  183 agtccttgt 191  Q
    |||| ||||    
T  49049269 agtctttgt 49049277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Original strand, 9058007 - 9058076
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  9058007 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 9058076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Original strand, 15761509 - 15761558
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15761509 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 15761558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 15851204 - 15851163
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15851204 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 15851163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 15629659 - 15629613
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt 47  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15629659 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 15629613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Original strand, 15913817 - 15913874
Alignment:
Q  92 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  15913817 ttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcatttatattg 15913874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 13376461 - 13376423
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatata 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13376461 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatata 13376423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 13273631 - 13273590
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgtt 42  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13273631 agttgatgttgaattacattgttgattattgatgatcatgtt 13273590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 2191832 - 2191884
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2191832 agttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 2191884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 6148124 - 6148315
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  6148124 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtaatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcttgttttcttgataatg 6148223  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgta 192  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6148224 taaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctacatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 6148315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13816388 - 13816200
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | | ||| || || |||||||||||||||||||    
T  13816388 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatgctatgattcaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatg 13816289  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13816288 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgagaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13816200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 19572054 - 19572242
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | | ||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  19572054 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgattcaattgtgtgtggccatgttttcttgataatg 19572153  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19572154 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcacattatcgagtcctt 19572242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 16183292 - 16183489
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16183292 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgacaat 16183391  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatat----attgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16183392 gcaaatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgattgaggtgtaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 16183489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 15860430 - 15860617
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  15860430 agttgatgttggatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgataaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatg 15860529  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15860530 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 15860617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16819781 - 16819597
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  16819781 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 16819684  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16819683 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 16819597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18909562 - 18909378
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || | |||||||||||||||||    
T  18909562 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgtggatgttttcttgataatg 18909465  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18909464 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18909378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 22145557 - 22145740
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | | ||| | |||||||||||||||||||    
T  22145557 agttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaatggtgtaggggcatgttttcttgataatg 22145656  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22145657 caaa-gttgtggagataatcaatataattgggtg-tgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttatcgcattatcgagtc 22145740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 50113415 - 50113602
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  50113415 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgagtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 50113514  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  50113515 caaatgttgtggaggtaatcaatataat----tgttgtcctatatattgaggtg-aaattgtggattgttgttgcattatcgagtccttgtac 50113602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 8269686 - 8269870
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  8269686 agttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 8269783  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8269784 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 8269870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 8276797 - 8276981
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  8276797 agttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 8276894  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8276895 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 8276981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17099590 - 17099397
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| | ||  |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  17099590 agttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttataatttgattgtttatggacatgttttcttgataat 17099491  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  17099490 gcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgctgacgcattatcgagtccttgtac 17099397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 17957618 - 17957802
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  17957618 agttgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatg 17957717  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17957718 caaatgatgtggacatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 17957802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22273917 - 22273737
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  22273917 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 22273820  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22273819 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 22273737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33340718 - 33340534
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  33340718 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatg 33340619  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33340618 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 33340534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 53769533 - 53769350
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||    
T  53769533 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatg 53769434  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  53769433 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 53769350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8630720 - 8630538
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8630720 ttgacgttgaatgactttgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatgtgcatgtcttcttgataatgca 8630621  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  8630620 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgttgcattatcgagtc 8630538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35122559 - 35122377
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  35122559 tgatgttgaatgacattgttgattattgacaatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatgatttggttgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 35122460  T
Q  104 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  35122459 atgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattatgaattgttgtcgcattatcgagtc 35122377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 49231089 - 49230901
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  49231089 agttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataat 49230990  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  49230989 gcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagattgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 49230901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 51159761 - 51159945
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  51159761 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatg 51159860  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  51159861 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattggtgtcgcattatcgagtc 51159945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27839573 - 27839394
Alignment:
Q  10 tgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 108  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  27839573 tgaatgataatgttgattgttgatgatcatgttaatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa-tgat 27839475  T
Q  109 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27839474 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 27839394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 318896 - 319081
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  318896 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgttatgatttaatcgtgtatgggcatgttttcttgataat 318995  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  318996 gcaaatgatgtggaaatgaacaatataattgggtgttatcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 319081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2048936 - 2048751
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2048936 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 2048837  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2048836 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 2048751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 2450612 - 2450791
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  2450612 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgg-gaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 2450708  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2450709 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 2450791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7852683 - 7852499
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  7852683 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataattatgttgatgtgtgatgaggaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatg 7852584  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
     ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7852583 taaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 7852499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19230935 - 19230751
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  19230935 agttgatgttgaatgacgttgttgattattgataattatgttgatgtgtgataatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatg 19230836  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19230835 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 19230751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 17913534 - 17913696
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  17913534 agttgatgttgaatggcattgttgattattgataagcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatg 17913633  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 163  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||    
T  17913634 caaatgttgtggagatgaacaatataattggatgtcgtcctatatattgtgttgacaattgtg 17913696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 1468938 - 1469121
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  1468938 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 1469034  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  1469035 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 1469121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25057723 - 25057531
Alignment:
Q  1 agttgatg-ttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||    
T  25057723 agttgatgattggatgacattgttgattattgataatcatattgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataat 25057624  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25057623 gcaaatgttgtagagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 25057531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30152205 - 30152023
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  30152205 ttgatgttggatgacattgttgattattgattaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 30152108  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30152107 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 30152023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19945502 - 19945317
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19945502 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgatatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataat 19945403  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19945402 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 19945317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16259916 - 16259732
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  16259916 agttaatgttgaatgatgttgttgattattgattatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatg 16259817  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16259816 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 16259732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 15469751 - 15469931
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||| || ||||||||||    
T  15469751 agttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatg-ttccttgataatg 15469849  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  15469850 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-aaattgt-gattattgtcgcattatcgagt 15469931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 16745454 - 16745639
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  16745454 agttgatgttgcatgact-tgttgattattgttaatcatgttgaagtgtgttggtgaatactatgatttaattgtgtttgggcatgttttcttgataatg 16745552  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  16745553 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gatggttgtcgcattatcgagtcctt 16745639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14294305 - 14294114
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  14294305 agttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataat 14294206  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgt 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  14294205 gcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctgtatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtctttgt 14294114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 14522589 - 14522775
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| || ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14522589 agttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgagtattatgatttgattgtgtatgggcatgttttcttgataat 14522688  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  14522689 gcaaatgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 14522775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30205274 - 30205137
Alignment:
Q  55 tgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtg 154  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  30205274 tgaatactatgaattaattgtgtatgtgcatgttttcttgataaagcaaa-gttgtggagataatcaatataattgggtgttgtccaatatattcaggtg 30205176  T
Q  155 aaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30205175 aaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 30205137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44228302 - 44228115
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| | | ||||| |||||||| |||| ||||    
T  44228302 agttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaatcgtgtatgggcatgtttccttggtaat 44228203  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  44228202 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 44228115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14297371 - 14297195
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||| || ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  14297371 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatattgatgtggtgataatgagtattatgatttgattgagtatggacatgttttcttgataatgca 14297272  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14297271 aatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcatta 14297195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14302998 - 14302822
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||| || ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  14302998 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatattgatgtggtgataatgagtattatgatttgattgagtatggacatgttttcttgataatgca 14302899  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14302898 aatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcatta 14302822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15574916 - 15574730
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||    
T  15574916 agttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatg 15574817  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  15574816 c-aatgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 15574730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 11198854 - 11199033
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  11198854 agttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataat 11198953  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11198954 gcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcatta 11199033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14299932 - 14299741
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  14299932 agttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgaggttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataat 14299833  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgt 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  14299832 gcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctgtatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtctttgt 14299741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 53899808 - 53899982
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 103  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  |||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  53899808 tgatgttgaatgatattgttgattattgataattatgttgatgtgtgatgatgaattctatga-ttggttgtatatggacatgttttcttgataatgcaa 53899906  T
Q  104 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53899907 atgtggtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatataatgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcatta 53899982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15613935 - 15613749
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||    
T  15613935 agttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatg 15613836  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  15613835 c-aatgttgtggagatgattaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 15613749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 11062319 - 11062497
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||| ||||||||    
T  11062319 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgtttt-ttgataat 11062417  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11062418 gcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcatta 11062497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23491382 - 23491204
Alignment:
Q  1 agttgatg-ttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||    
T  23491382 agttgatgattgaatgacatcgttgattattgataatcacgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataat 23491283  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23491282 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttttcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 23491204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 47786166 - 47786314
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  47786166 agttgatgttgaatgacaatgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgctttcttgataatg 47786265  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47786266 aaaatgtggtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattg 47786314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 12265775 - 12265960
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||  | ||  ||||||| |||| |||||||    
T  12265775 ttgatgttagatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgataaatactatgatttatttgtctgtggacatgtttccttggtaatgca 12265874  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  12265875 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 12265960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 12351127 - 12351312
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||  |  |||||||||||||||||    
T  12351127 agttgatgtggaataacattgttgattattgatgatcatgttgttgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtgcggacatgttttcttgataat 12351226  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  12351227 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgaattatcgagtc 12351312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 17523694 - 17523884
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |  |  |||||| ||| || ||||| ||| ||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  17523694 agttaatgttgaatgacattattgattattgatgatcatgat--ttggtgatgatgagtagtatgaattaattgtgtatggacatgatttcttgataatg 17523791  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17523792 cacatgttgcggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattggggtgaaaaccgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 17523884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10737386 - 10737247
Alignment:
Q  46 gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatat 145  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||| |||||| |||||||||||||    
T  10737386 gtgtcatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtgaagatgaacaatacaattgggtgttgtcctatat 10737287  T
Q  146 attgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  10737286 attgtggagaaaattgt-tattgttgtcgcattatcgagtc 10737247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 189
Target Start/End: Original strand, 14846034 - 14846131
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14846034 cttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 14846131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5227585 - 5227406
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||| ||| |||||||  |   | | |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5227585 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgaggtgtaatgatgaatacatt---tgaattgtatatgagcatgttttcttgataatgca 5227489  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5227488 aatgatgtggagattaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 5227406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 40938602 - 40938421
Alignment:
Q  6 atgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 104  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40938602 atgttgaatgacattgttgattgttgatgatcaagttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 40938503  T
Q  105 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||    
T  40938502 tgttatggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtaaattggtgtcgcattatcgagtc 40938421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 55315250 - 55315085
Alignment:
Q  20 tgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataa 118  Q
    |||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  55315250 tgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataa 55315152  T
Q  119 tcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  55315151 tcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 55315085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 45859848 - 45859709
Alignment:
Q  45 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 144  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45859848 tgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtgaagataatcaatataattggatgttgtcctata 45859750  T
Q  145 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  45859749 tattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 45859709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 12562760 - 12562940
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  12562760 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtacggacatgttttcttgataat 12562859  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa-ttgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| |||||  || |||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  12562860 gcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaatttttcctctatattgtggtgaaaatttgtgaagtgttgtcgcatta 12562940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 16935168 - 16935286
Alignment:
Q  5 gatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 104  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||    
T  16935168 gatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aa 16935264  T
Q  105 tgttgtggaaataatcaatata 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  16935265 tgttgtggagataatcaatata 16935286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 15939743 - 15939930
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgtttt-cttgataatg 100  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||||||||     
T  15939743 ttgaagttgaatgactttgttgattgttgataatcaagttatggtgtgaatgatgaatactatgatctatttgtatgtgggcatgttttgcttgataatt 15939842  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  15939843 caa-tgttatggggataatcaatataattgggtgttgtcatatacattgaggttgaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtcctt 15939930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 189
Target Start/End: Original strand, 8305693 - 8305790
Alignment:
Q  90 tcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8305693 tcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 8305790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 189
Target Start/End: Original strand, 18905171 - 18905267
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  18905171 cttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgt-gattgttttcgcattattgagtcctt 18905267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41269096 - 41268931
Alignment:
Q  20 tgttgattattgataatcatgttaa-tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataa 118  Q
    |||||||| |||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||| |||  || || || | ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  41269096 tgttgattgttgataatcaagttgtctgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggtatgttctcttggtaatgcaa-tgttgtggagataa 41268998  T
Q  119 tcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||| | | ||||||||||||| ||||||    
T  41268997 tcaatataattgggtgttgtcctatgtattgagttg-agattgagaaatgttgtcgcattatcgagtc 41268931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 12031266 - 12031364
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataa 98  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | ||| | ||| || ||||||||||||||    
T  12031266 agttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaaattgtgaatgggcgtgttttcttgataa 12031364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 186
Target Start/End: Original strand, 13976964 - 13977101
Alignment:
Q  49 tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatat- 147  Q
    ||||| |||||||||||| |||  || || || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  13976964 tgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatata 13977062  T
Q  148 -tgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
     |||| ||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  13977063 ttgagttgaca-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13977101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 186
Target Start/End: Original strand, 13956132 - 13956269
Alignment:
Q  49 tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatat- 147  Q
    ||||| |||||||||||| |||  || || || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  13956132 tgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaaaataattgggtgttgtcctatatata 13956230  T
Q  148 -tgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
     |||| ||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  13956231 ttgagttgaca-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13956269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15874953 - 15874893
Alignment:
Q  89 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  15874953 ttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 15874893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17138253 - 17138157
Alignment:
Q  90 tcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||| ||||||    
T  17138253 tcttgataattcaattgttgtggagatgatcaatatagttgggagttgtcctttatattgaggtgaaaattgtaaagtgatgtcgcattatcgagtc 17138157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 149
Target Start/End: Original strand, 11330382 - 11330442
Alignment:
Q  89 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11330382 ttcttgataatgcaaatgtggtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 11330442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12951835 - 12951743
Alignment:
Q  94 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||| ||||||    
T  12951835 gataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgagatgatgtcgcattatcgagtc 12951743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Original strand, 9303753 - 9303802
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9303753 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 9303802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Original strand, 38812367 - 38812436
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  38812367 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 38812436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 160
Target Start/End: Original strand, 12490105 - 12490177
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  12490105 tttcttgataatgaaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 12490177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 17937372 - 17937333
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatg 40  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17937372 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 17937333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39654695 - 39654630
Alignment:
Q  98 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 163  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  39654695 atgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtg 39654630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14287828 - 14287780
Alignment:
Q  143 tatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgt 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  14287828 tatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtctttgt 14287780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 66
Target Start/End: Original strand, 18897982 - 18898045
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 66  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  18897982 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatacgttgatgtgggatgatgaatactatga 18898045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 186
Target Start/End: Original strand, 11883645 - 11883735
Alignment:
Q  96 taatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||| ||| ||||   || |||||||||| ||||||    
T  11883645 taatgctaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtggaaagtgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 11883735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11813586 - 11813553
Alignment:
Q  156 aaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11813586 aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 11813553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Original strand, 14060614 - 14060675
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  14060614 tttcttgataatgcaaatattgtggggatgatcaatatagtttgaagttgtcctttatattg 14060675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 161
Target Start/End: Original strand, 55442145 - 55442218
Alignment:
Q  89 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattgg-atgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  55442145 ttcttaataatgcgaatgttgtggagatgatcaatataattggaaagatgtcctttatattgttgtgaaaattg 55442218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16260066 - 16260014
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16260066 agttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 16260014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8310 - 8125
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8310 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 8211  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8210 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgttctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 8125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6424 - 6232
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  6424 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 6325  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6324 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 6232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 15149 - 15338
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  15149 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 15246  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15247 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 15338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28761 - 28574
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  28761 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatg 28662  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28661 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 28574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 28909 - 28857
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28909 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 28857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 256192 - 256384
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagt-gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  256192 agttgaagttgaatgacatttgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtatgagcatgttttcttgataat 256291  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  256292 g-aaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 256384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 262798 - 262975
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagt-gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  262798 agttgaagttgaatgacatttgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtatgagcatgttttcttgataat 262897  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 178  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  262898 gc-aatgttgtggaggtaatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 262975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 124576 - 124762
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  124576 agttgatgttgaatgattttgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgatgaatactatgatttaattgggtgtgggcatgttttcttgataatg 124675  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  124676 c-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcacattatcgagtcctt 124762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 193489 - 193303
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||    
T  193489 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtgtgttgaagaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgttaatg 193390  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  193389 c-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 193303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 75977 - 76163
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  75977 agttgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgaagaatactatgatttaattgagtgtggacatgttttcttgataatg 76076  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  76077 c-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcatcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 76163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 95198 - 95006
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  95198 agttgatgttaaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaactgtgtatgggcatgttttcttgataatg 95099  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  95098 caaatgttgtggagataatcaatataattgagtgttgttctatatattaaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 95006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Original strand, 66745 - 66907
Alignment:
Q  22 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 121  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  66745 ttgattgttgataatcaaattgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatca 66843  T
Q  122 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  66844 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 66907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 95346 - 95294
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  95346 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 95294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 78429 - 78241
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  78429 agttgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatagtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 78330  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  78329 caaatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 78241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 39089 - 38903
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  39089 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataat 38990  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  38989 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttgttgcattatcgagtc 38903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44676 - 44513
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  44676 agttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatcctatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataat 44577  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 163  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44576 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtg 44513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 109366 - 109553
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  109366 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 109465  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  109466 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 109553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 54486 - 54330
Alignment:
Q  29 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  54486 ttgataatcatgttaatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgtgcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataat 54387  T
Q  129 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  54386 tgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 54330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 686 - 857
Alignment:
Q  8 gttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  686 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgtaaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgatttcttgataatgcaaatgt 785  T
Q  108 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  786 tgtggaggtaatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 38616 - 38807
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38616 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 38715  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38716 caaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 38807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 40368 - 40184
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  40368 agttgatgttgaatgacattgctgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatg 40269  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40268 caaatgatgtggagatgaacaatataattggctgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 40184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 2124 - 2317
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||| ||| || || ||||||||||||||||||    
T  2124 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctataatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataat 2223  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2224 gcaaatgatgtggagataatcaatataagtgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 6644 - 6837
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| ||| ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  6644 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatggatgctatgatttaattgtgtataggcatgttttcttgataat 6743  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6744 gcaaatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtagcattatcgagtccttgtac 6837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21536 - 21351
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21536 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatgtgcatgttttcttgataatg 21437  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  21436 caaatgttgtggagatgatcaatataattcggtgttgtcctatatactgaagtgaaaattgtggtttgttgtcgtattatcgagtc 21351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Original strand, 129504 - 129668
Alignment:
Q  22 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 120  Q
    |||||| ||||||| |||||| || || | ||  ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| || | |    
T  129504 ttgattgttgataaccatgttgatatgcggtgacgaatactatgattttaattgtgtatgggcatgttttgttgataatgcaaatgatgtggagatgaac 129603  T
Q  121 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  129604 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 129668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 13025 - 13217
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  13025 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgacaatg 13124  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13125 caaatgttgttgagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattatggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 13217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 202 - 161
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  202 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 26009 - 26200
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||   ||||||||||||||||||    
T  26009 agttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatctgtgtatagacatgttttcttgataatg 26108  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26109 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatatttaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 26200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 70681 - 70873
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||||     
T  70681 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatggacatgatttcttgataatt 70780  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  70781 caaatgttgtggagatgattaatataaatgggtgttatcctatatattgaggagaaacttgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 70873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 155640 - 155821
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  155640 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 155737  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  155738 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 155821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 732 - 914
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  732 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 828  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  829 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35163 - 35023
Alignment:
Q  47 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 146  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35163 tgtgatgatgaaaactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 35065  T
Q  147 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  35064 ttgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 35023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Original strand, 36891998 - 36892185
Alignment:
Q  5 gatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||| |||    
T  36891998 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgaaaa 36892096  T
Q  105 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36892097 tgttgtggagataatcaatataattgggagttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 36892185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 5889580 - 5889765
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  5889580 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 5889677  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5889678 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 5889765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34823072 - 34822886
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34823072 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 34822973  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  34822972 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 34822886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 3800396 - 3800581
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  3800396 agttgatgttgcatgacatggttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 3800493  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3800494 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 3800581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 21275810 - 21275995
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  21275810 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 21275907  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21275908 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 21275995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25600837 - 25600652
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  25600837 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 25600738  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25600737 caaatgttgcggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtaaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 25600652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12726927 - 12726741
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12726927 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactaagatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 12726828  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  12726827 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 12726741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24967173 - 24966987
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  24967173 agttaatgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgataacgtgtggtgatgaatactatgatttattcgtgtatgggcatgttttcttgataatg 24967074  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcc 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24967073 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggtcgcattatcgagtcc 24966987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8942522 - 8942334
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8942522 agttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgagcatgttttcttgataat 8942423  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8942422 gcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 8942334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Original strand, 4449517 - 4449698
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  4449517 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatga-ttggttgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 4449615  T
Q  104 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4449616 atgttgcgaaaatgatcaatataattggaagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 4449698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8887016 - 8886832
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  8887016 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatg 8886917  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  8886916 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttatcgcattatcgagtc 8886832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 19888063 - 19888243
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  19888063 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 19888160  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19888161 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 19888243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21140749 - 21140569
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| |||||||||||||    
T  21140749 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatg-tttcttgataatg 21140653  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21140652 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 21140569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 43644259 - 43644442
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  43644259 agttgatgttgaatgacaatgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatg 43644358  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43644359 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagt 43644442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 461609 - 461426
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 103  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  461609 tgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 461511  T
Q  104 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  461510 atg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 461426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 12643308 - 12643491
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||| |||||    
T  12643308 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtggccatgttttcttggtaatg 12643407  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  12643408 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 12643491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22862363 - 22862179
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22862363 agttgatattgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatgttttcttgataatg 22862264  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22862263 caaatgatgtggagataaacaatataattgagtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22862179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 14907721 - 14907907
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14907721 agttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 14907820  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  14907821 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 14907907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20013996 - 20013810
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20013996 agttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 20013897  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  20013896 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 20013810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23819053 - 23818867
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23819053 agttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 23818954  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  23818953 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 23818867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 25877233 - 25877399
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagt-gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  25877233 agttgatgttgaatgacattcgttgattattgataatcatgttgatgtgtgataatgaatactatgaattaattgtgtatggccatgttttcttgataat 25877332  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 167  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25877333 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 25877399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 12637448 - 12637633
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  12637448 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 12637545  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  12637546 c-aatgttgtggagataatcaatataatggtggtgttatcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 12637633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22273761 - 22273577
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  22273761 agttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgtgcatgttttcttgataatg 22273662  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    | |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22273661 cgaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22273577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 11232537 - 11232720
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  11232537 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 11232633  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  11232634 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 11232720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 22514384 - 22514567
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  22514384 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 22514480  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  22514481 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 22514567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23773407 - 23773225
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  23773407 ttgatgttgaatgacattgttgattatttataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 23773311  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23773310 aatgttgtcgagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 23773225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 24686954 - 24687136
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  24686954 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtagg--catgttttcttgataatgca 24687051  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24687052 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 24687136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 24827852 - 24828034
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  24827852 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataat 24827949  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24827950 gcaa-tgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtggattgttgtcgcattatcgagt 24828034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 28776985 - 28777168
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  28776985 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaattctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 28777081  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  28777082 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 28777168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15632269 - 15632088
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 103  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  15632269 tgatgttgaatgatgtcgttgattattgataatcatgttaatgtgggatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa 15632170  T
Q  104 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
     || |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15632169 ttgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtgttgagaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 15632088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 20628681 - 20628864
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  20628681 agttgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatg---atgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatg 20628777  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20628778 caa-tgt-gtggagataatcaatataattgggtatcgtcctatatattgaggttgaaatagtggattgttgtcacattatcgagtcctt 20628864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22282994 - 22282810
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |    
T  22282994 agttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataaag 22282895  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||| | || |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22282894 caaatgatgtggagatgaacaatataattaggtgctgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22282810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7320365 - 7320174
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||  |||||  |||||||||||||||||    
T  7320365 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattttgtatggacatgttttcttgataat 7320266  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgt 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  7320265 gcaaatgttgtggagattatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattggtgtcgcattatcgagtctttgt 7320174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 6878319 - 6878134
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgt-gatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||| |||||| ||| ||  |||||  |||||||||||||||||    
T  6878319 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatattgatgtggcgatgatgaatgctatgatttaattatgtatggacatgttttcttgataat 6878220  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  6878219 gcaaaggatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgtggtcgcattatcgagtc 6878134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 22691316 - 22691426
Alignment:
Q  83 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccg 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22691316 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaactgtggattgttgtcgcattatcg 22691415  T
Q  183 agtccttgtac 193  Q
    |||| ||||||    
T  22691416 agtctttgtac 22691426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 22695963 - 22696073
Alignment:
Q  83 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccg 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22695963 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaactgtggattgttgtcgcattatcg 22696062  T
Q  183 agtccttgtac 193  Q
    |||| ||||||    
T  22696063 agtctttgtac 22696073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27260415 - 27260274
Alignment:
Q  45 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 144  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  27260415 tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtatatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatggtcaatataattgggagttgtcctata 27260316  T
Q  145 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27260315 tattatggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 27260274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 22581216 - 22581402
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   |||||  ||||| ||  ||  |||||  |||||||||||||||||    
T  22581216 agttgatgttgaatgacattgttgattgttgatgatcatgttgatgttgtgagaatgaatcttatgatttgattatgtatggacatgttttcttgataat 22581315  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  22581316 gcaaacgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 22581402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 269981 - 269878
Alignment:
Q  83 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  269981 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgtggtcgcattatcg 269882  T
Q  183 agtc 186  Q
    ||||    
T  269881 agtc 269878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 191
Target Start/End: Original strand, 24572678 - 24572865
Alignment:
Q  5 gatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 103  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||  | ||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  24572678 gatgtcgaatgacattgttgatttttgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttgtgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 24572777  T
Q  104 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgt 191  Q
    |||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||    
T  24572778 atgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgttatcgcattatcgagtctttgt 24572865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 186
Target Start/End: Original strand, 9654140 - 9654296
Alignment:
Q  29 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 128  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  9654140 ttgataatcatgttgttatgtgatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgttaatgcaaatgatgtggagatgaacaatataat 9654239  T
Q  129 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9654240 tgggtgttgctctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 9654296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28972914 - 28972727
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||| |||  ||||||    
T  28972914 ttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcatgtcgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttt-cttagtaatgc 28972816  T
Q  102 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgt 191  Q
    |||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  28972815 aaatgt-gtggagatgatcaatatatatggatgttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattggtgtcgcattatcgagtctttgt 28972727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 186
Target Start/End: Original strand, 17397924 - 17398061
Alignment:
Q  47 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 146  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17397924 tgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgttgagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 17398022  T
Q  147 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||| || | |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  17398023 ttgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 17398061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 23822894 - 23822967
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23822894 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23822967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 23824838 - 23824911
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23824838 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23824911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 23831973 - 23832046
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23831973 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23832046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 721257 - 721162
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  721257 cttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgtagtgatgtcgcattatcgagtc 721162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Original strand, 19670515 - 19670576
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19670515 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 19670576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Original strand, 24088752 - 24088810
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24088752 cttggtaatgcaattgttgtggagataatcaatataattggaagttgtcctttatattg 24088810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 4663 - 4735
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  4663 tttcttgataatgcaa-tgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 4735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22693133 - 22693040
Alignment:
Q  10 tgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 103  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| |||| ||||||||    
T  22693133 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa 22693040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22697780 - 22697687
Alignment:
Q  10 tgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 103  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| |||| ||||||||    
T  22697780 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa 22697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 24295958 - 24296031
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  24295958 tttcttgataatgcaaatgttttggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 24296031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22693028 - 22692978
Alignment:
Q  139 cctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22693028 cctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcctt 22692978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22697675 - 22697625
Alignment:
Q  139 cctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22697675 cctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcctt 22697625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19658739 - 19658678
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||| |||||||| |||||||    
T  19658739 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaacatatctggaagttgtcctttatattg 19658678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14557 - 14364
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttga-ttattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||| ||||||||||||    
T  14557 agttgatgttgaatgacattgttgaattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatagacatgatttcttgataat 14458  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14457 gcaaatattgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggagaaaattgtgaattgttgtcgcattgtcgagtccttgtac 14364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 87316 - 87127
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||  |||    
T  87316 agttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactacgatttatttgtgtatggacatgttttcttga--atg 87219  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  87218 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 87127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 138096 - 138286
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||     
T  138096 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataata 138195  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  138196 c-aatgttgtggagataatcaatataattaggtgttgtcctatatattgaagtg-aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccctgtac 138286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10543 - 10351
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||  |||||  ||||  ||  ||| |||||   ||||||||||||||||    
T  10543 agttgatattgaatgacattgttgattgttgataatcatgttgatatggtgataatgaatcttatgctttgattgtgtatggatatgttttcttgataat 10444  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgta 192  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  10443 gcaaatgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtctttgta 10351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 77124 - 77069
Alignment:
Q  138 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  77124 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 77069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 71736 - 71921
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  71736 agttcatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattaatgtgcgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgagcatgttttcttgataatg 71835  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  71836 caaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttatcctatatattgtggtgaaaattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 71921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 18862 - 19050
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  18862 agttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtaattgtgaatactatgatttatttgtgcatgtgcatgttttcttgataatg 18961  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18962 caaatgatgtggacatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 19050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 18715 - 18767
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18715 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32460 - 32268
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  32460 agttgatgttgaatgacattgtcgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatgtacatgttttcttgataatg 32361  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  32360 caaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 32268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 90169 - 90353
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  90169 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatg 90268  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||| |||||||||    
T  90269 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtgga---ttgtcgcattatcgagtcctt 90353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 129260 - 129075
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  129260 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggcatgatggtgaatgctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 129163  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  129162 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgagattgttaattgttgtcgcattatcgagtcctt 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 78471 - 78410
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  78471 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 78410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1241 - 1057
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1241 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttgattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 1142  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1141 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 1057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 6108 - 5926
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  6108 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatg 6011  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  6010 caaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattg-agattgttgtcgcattatcgagtc 5926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 1388 - 1336
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1388 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8956 - 8771
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  8956 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgaacatgatgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtatggacatgttttcttgataatg 8857  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8856 caaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 8771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4718 - 4530
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||    
T  4718 agttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatctatttgtgtgtgggcatgttttcttgataat 4619  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4618 gcta-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 4530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 2861 - 3045
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  2861 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 2958  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2959 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 3045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Original strand, 22997 - 23168
Alignment:
Q  10 tgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||     |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22997 tgaatgacattgttgattattgatgatcatgtt-----gtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataaagcaaatgatg 23091  T
Q  110 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  23092 tggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 23168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 27797 - 27983
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  27797 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatg 27896  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27897 c-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcccattatcgagtcctt 27983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17524 - 17340
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17524 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgagttgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 17425  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17424 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattg-ggattgttgtcgcattatcgagtc 17340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 145407 - 145223
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  145407 agttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttatgtatgggcatgttttcttaataatg 145308  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    || ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  145307 catatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 145223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 147646 - 147482
Alignment:
Q  22 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttat-ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 120  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  ||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |    
T  147646 ttgattgttgataatcatgttgatgtgtggtgatgaatactatgatttaaattgtgaattggcatgttttcttgataatgcatatgatgtggagatgaac 147547  T
Q  121 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  147546 aatataattgggtgttttcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 147482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 145554 - 145502
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  145554 agttgatgttaaatgaccttgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 145502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 2416 - 2594
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||  ||||||||||||||||||    
T  2416 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattgatgtgtgatggtgaatactatgatttaaatgtgtatggacatgttttcttgataatg 2515  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattac 180  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2516 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattac 2594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 40468 - 40291
Alignment:
Q  8 gttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40468 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 40369  T
Q  108 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| | || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40368 tgtgtagatgaacaatataattgggttttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 2975 - 3163
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||    
T  2975 agtttatgttgaatgacattgttgattgttcataatcaagttaatgtgtgaatggtaaatactatgatctatttgtgtgtgggcatgttttcttgataat 3074  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3075 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgagtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 3163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6054 - 5874
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  6054 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatg 5957  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagt 185  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5956 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 5874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 217033 - 217218
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  217033 agttgattttgaatgacattgttgattattgataaacatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 217132  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  217133 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattat-gattgttgtcgcattatcgagtc 217218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2059 - 1873
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  2059 agttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgaagaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatg 1960  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1959 c-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 1873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Original strand, 7940 - 8116
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  7940 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 8039  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8040 aatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 8116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Original strand, 13329 - 13505
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  13329 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 13428  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13429 aatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 13505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18184 - 18000
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||| ||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  18184 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatcttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattgtggatgtgcttgttttcttgataatg 18085  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18084 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20268 - 20084
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||| ||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  20268 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatcttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattgtggatgtgcttgttttcttgataatg 20169  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20168 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 69643 - 69456
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  69643 agttgatgttgaatgacattgttgattattgattatcatgatgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 69544  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcct 188  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  69543 caaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggttaaaattgtgaattgttgtcgcactatcgagtcct 69456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30946 - 30768
Alignment:
Q  9 ttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30946 ttgaatgacattgttgattattgatgatcttgttcatgtggtgataatgaatgttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgt 30847  T
Q  108 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  30846 tgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 30768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 432 - 244
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || | ||||||||||||||||    
T  432 agttgatgttgaatgacattattgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatctatttgtgtgtgggtatgttttcttgataat 333  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |  | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  332 gtta-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 32476 - 32660
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  32476 agttgatgttgaatgacattgctgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatg 32575  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  32576 caaatgatgtggagatgaacaatataattggctgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 32660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34147 - 34037
Alignment:
Q  82 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattacc 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  34147 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatc 34049  T
Q  182 gagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||    
T  34048 gagtccttgtac 34037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 52559 - 52743
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  52559 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatg 52658  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    | |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  52659 cgaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcacattatcgagtc 52743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 56511 - 56695
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  56511 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatg 56610  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    | |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  56611 cgaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcacattatcgagtc 56695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 6434 - 6620
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  6434 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcttgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatg 6533  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6534 c-aatg-tgtggagataatcaatataattgggcgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattattgtcgcattatcgagtcctt 6620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25777 - 25591
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25777 agttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 25678  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  25677 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgacatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 25591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21522 - 21336
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21522 agttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 21423  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | || || ||||||| |||||||| |||||||||    
T  21422 c-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgacatggt-gattgttatcgcattatcgagtcctt 21336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13074 - 12891
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  13074 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgaggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgc 12975  T
Q  102 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12974 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 12891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30223 - 30041
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  30223 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 30127  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30126 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 30041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 5893 - 6069
Alignment:
Q  1 agttgatg-ttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||    
T  5893 agttgatgattgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatgataaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataat 5992  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 178  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5993 gc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcatt 6069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 6)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 14568 - 14735
Alignment:
Q  20 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14568 tgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttt-cttgataatgcaa-tgttgtggagataat 14665  T
Q  120 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14666 caatataattaggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggatttttgtcgcattatcgagtcctt 14735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28375 - 28261
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgt-tttcttgataa 98  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||| || ||||||||    
T  28375 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgtattgcttgataa 28276  T
Q  99 tgcaaatgttgtgga 113  Q
    |||||||| ||||||    
T  28275 tgcaaatgatgtgga 28261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 40371 - 40257
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgt-tttcttgataa 98  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||| || ||||||||    
T  40371 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgtattgcttgataa 40272  T
Q  99 tgcaaatgttgtgga 113  Q
    |||||||| ||||||    
T  40271 tgcaaatgatgtgga 40257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Original strand, 23801 - 23862
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23801 tttcttgataatgcaaatgttatggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 23862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 28522 - 28472
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  28522 ttgatgttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 28472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 40518 - 40468
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  40518 ttgattttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 40468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38160 - 37977
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  38160 agttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatg 38064  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  38063 caa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 37977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 248824 - 249008
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  248824 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatg 248923  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    || ||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||    
T  248924 cagatgatgtgggaatgaacaatataattgggtgttgtcttatatattgtggagaaaattgt-gatttttgttgcattatcgagtc 249008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7671 - 7485
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| ||  ||| | |||  |||||||||||||||||    
T  7671 agtttatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtggtgatgatgaatcttatgatttgattgtgcatggacatgttttcttgataat 7572  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7571 gcaaatgttttggagatgatcaatataattgggagtggtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 7485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 338 - 154
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| ||||||||||||||    
T  338 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtcgatgtgtgatggtggatactatgatttaattatgtatggacatattttcttgataatg 239  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  238 caaatgatgtggagatgaacaatataactgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 11210 - 11394
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  11210 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcttgttgatgtgtaatgttgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatg 11309  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  11310 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtcttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gatttttgtcgcattatcgagtc 11394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3537 - 3352
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||  ||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  3537 agttgatgctgaatgacattgttgattatcgataatcatgttgatgtgtgatgaggaatgctatgaattgattgtgtatggacatattttcttgataatg 3438  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  3437 caaatgttgtggatatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattttgtattgttgttgcattatcgagtc 3352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2088
Alignment:
Q  7 tgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatg 106  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1916 tgttgagtgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatg 2015  T
Q  107 ttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    |||| || || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2016 ttgtcgagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41582 - 41399
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  41582 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgagtgctatgacttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgc 41483  T
Q  102 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41482 aaatgatgtggagattaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 41399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3500 - 3318
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  3500 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatg 3403  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  3402 caaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattg-agattgttgtcgcattatcgagtc 3318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27899 - 27714
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  27899 agttgatgttgaatgacattgttgatttttgataaataagttattttgtgaatggtgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataat 27800  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27799 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 27714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 47003 - 46819
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||| |||||    
T  47003 agttgatgttgaatgacattgttaattattgataatcatgttaatgtggtgatgattaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttcataat 46904  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  46903 gcaaatgatgtggagatgaacaatat-attgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 60451 - 60267
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||| |||||    
T  60451 agttgatgttgaatgacattgttaattattgataatcatgttaatgtggtgatgattaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttcataat 60352  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||||| |||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  60351 gcaaatgatgtggagatgaacaatat-attgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 60267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 106867 - 106689
Alignment:
Q  10 tgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 109  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  106867 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttg 106769  T
Q  110 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  106768 tggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaactgtggatttttgtcgcattatcgagtcctt 106689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16311 - 16132
Alignment:
Q  10 tgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 108  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  16311 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgtt 16213  T
Q  109 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16212 gtgaagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 16132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 13478 - 13656
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||  ||| |||||||||||||    
T  13478 agttgatgtggaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgggtgtggacatattttcttgataat 13577  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13578 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 13656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 20580 - 20692
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20580 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 20679  T
Q  101 caaatgttgtgga 113  Q
    ||| |||||||||    
T  20680 caagtgttgtgga 20692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 270999 - 270813
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataa 98  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  || | ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  270999 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatactatggttttaattgtgtatgggcatgttttcttgataa 270900  T
Q  99 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||| | |||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  270899 tgcaaatgatatggagatgaacaatataattgggttttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 270813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 237059 - 236874
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgt-gatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||| |||||| ||| ||  |||||  ||| |||||||||||||    
T  237059 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatattgatgtggagatgatgaatgctatgatttaattatgtatggacatattttcttgataat 236960  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    ||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  236959 gcaaaagatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtggaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 236874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 51897 - 51729
Alignment:
Q  10 tgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 109  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  51897 tgaatgatattgttgattgttgataaccaagttattatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttg 51799  T
Q  110 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  51798 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgaattgttgtcgcatta 51729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4970 - 4834
Alignment:
Q  38 atgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttg 137  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  4970 atgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgcgtgtgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgatcaatataattgggagttg 4871  T
Q  138 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcg 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4870 tcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcg 4834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Original strand, 6441 - 6620
Alignment:
Q  10 tgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 108  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6441 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactttgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttgataatgcaa-tgtt 6539  T
Q  109 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  6540 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgaattgttgtcgcattattgagtcctt 6620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 106297 - 106370
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  106297 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 106370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 113842 - 113883
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  113842 agttgatgttgaatgacattgttgataattgataatcatgtt 113883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Original strand, 11322 - 11504
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||  | || |||||||| ||||||||||||    
T  11322 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgaggtgtgatgatgaatactatgatttaattgtatgtgggcatgtttccttgataatgca 11421  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  11422 aatgatgtggagattaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgttgcattatcgagtc 11504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 59016 - 58899
Alignment:
Q  61 ctatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 160  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  59016 ctatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgcggagatgatcaatataattgggtgtcgtcttatatattgaggtgaaaatt 58917  T
Q  161 gtggattgttgtcgcatt 178  Q
    ||||||||||||||||||    
T  58916 gtggattgttgtcgcatt 58899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 59417 - 59375
Alignment:
Q  23 tgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatg 65  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  59417 tgattattgatgatcatgatgatgtgtgatggtgaatactatg 59375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7837 - 7673
Alignment:
Q  22 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 120  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |    
T  7837 ttgattgttgataatcatgttgttgtgtggtgatgaatactatgattttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaac 7738  T
Q  121 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  7737 tatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgtattatcgagtc 7673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 17375 - 17561
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| || |||  ||  || || |   ||||||| ||||||||||    
T  17375 agttgatgttgaatgacattgttgattactgataatcgtgttgatgtgtgatgatgaatgctgtgatgtaactgtgtgtagacatgtttccttgataatg 17474  T
Q  101 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17475 caa-tgttgtggagatgatcaatatcattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 17561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 178
Target Start/End: Original strand, 4902 - 5059
Alignment:
Q  22 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttat--ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 119  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| || |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |     
T  4902 ttgattgttgataatcatgttgatgtgcggtgatgaatactatgatttttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaa 5001  T
Q  120 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  5002 caatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattattgtcgcatt 5059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Original strand, 6634 - 6805
Alignment:
Q  10 tgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||     |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  6634 tgaatgacattgttgattattgatgatcatgtt-----gtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcatgataatgcaaattttg 6728  T
Q  110 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  6729 tggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 6805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 30065 - 29942
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttga-ttattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||  |||||||    
T  30065 agttgatgttgaatgacattgttgaattattggtaatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatggacatgattttatgataat 29966  T
Q  100 gcaaatgttgtggaaataatcaat 123  Q
    |||||||||||||| || ||||||    
T  29965 gcaaatgttgtggagatgatcaat 29942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27336 - 27260
Alignment:
Q  117 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttgtac 193  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27336 aatcaatataattgggttttgtcctatatattgaggagaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 27260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 1078 - 1219
Alignment:
Q  10 tgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 108  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  1078 tgaatgataatgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgtt 1176  T
Q  109 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1177 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgag 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 880 - 771
Alignment:
Q  76 gtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgc 175  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  880 gtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgc 782  T
Q  176 attaccgagtc 186  Q
    |||| ||||||    
T  781 attatcgagtc 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15136 - 15027
Alignment:
Q  76 gtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgc 175  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  15136 gtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgc 15038  T
Q  176 attaccgagtc 186  Q
    |||| ||||||    
T  15037 attatcgagtc 15027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6770 - 6570
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgtttt 90  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||   ||||         | ||||| ||  ||| |||||  ||||||||    
T  6770 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataaggaatcttaattgaattatgatttgattgtgtatggacatgtttt 6671  T
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtccttg 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||    
T  6670 cttgataattcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtctttg 6571  T
Q  191 t 191  Q
    |    
T  6570 t 6570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5867 - 5700
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 102  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  5867 ttgattttgtatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 5771  T
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtc 173  Q
    |||||||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  5770 aatgttgttgagataatcaatataatggtggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtc 5700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 189
Target Start/End: Original strand, 9291 - 9397
Alignment:
Q  82 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattacc 181  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |    
T  9291 gcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgctgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtagcattatc 9389  T
Q  182 gagtcctt 189  Q
    ||||||||    
T  9390 gagtcctt 9397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15073 - 14987
Alignment:
Q  103 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15073 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaagttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 14987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 186
Target Start/End: Original strand, 4092 - 4218
Alignment:
Q  59 tactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa 158  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  4092 tactatgatttaattgtgtatgcgcatgttttcttggtaatgcaaatgatgtggagatgaacaatataatcgggtgttgtcatatatattgaggagaaaa 4191  T
Q  159 ttgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  4192 ttgt-gattcttgtcgcattatcgagtc 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 186
Target Start/End: Original strand, 48932 - 49058
Alignment:
Q  59 tactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa 158  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  48932 tactatgatttaattgtgtatgcgcatgttttcttggtaatgcaaatgatgtggagatgaacaatataatcgggtgttgtcatatatattgaggagaaaa 49031  T
Q  159 ttgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  49032 ttgt-gattcttgtcgcattatcgagtc 49058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4648 - 4534
Alignment:
Q  72 ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttg 171  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4648 ttgcgtatggacatattttattgatgatgcaaatgttgtggagatgatcaaaataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttg 4549  T
Q  172 tcgcattaccgagtc 186  Q
    || ||||| ||||||    
T  4548 tcacattatcgagtc 4534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20489 - 20391
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  20489 tttcttgataatgcaattgttgtggatatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgagttgatgtcgcattatcgagtc 20391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27318 - 27220
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  27318 tttcttgataatgcaattgttgtggatatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgagttgatgtcgcattatcgagtc 27220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 20586 - 20527
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat 59  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  20586 agttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgatgtgatagtgaat 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 27415 - 27356
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat 59  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  27415 agttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgatgtgatagtgaat 27356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 17684 - 17797
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  17684 agttgatgttgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataat 17783  T
Q  100 gcaaatgttgtgga 113  Q
    ||||||| ||||||    
T  17784 gcaaatgatgtgga 17797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Original strand, 24105 - 24216
Alignment:
Q  3 ttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 101  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  24105 ttgatattgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgttatgatttaattgtgtatggacatattttcttgataatgc 24204  T
Q  102 aaatgttgtgga 113  Q
    ||||| ||||||    
T  24205 aaatgatgtgga 24216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 145794 - 145628
Alignment:
Q  10 tgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||     |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  145794 tgaatgacattgttgattattgatgatcatgtt-----gtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgctaatgttg 145700  T
Q  110 tggaaataatcaatata-at-tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    |||| || ||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  145699 tggagatgatcaatatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaatcgtgaattgatgtcgcatta 145628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 186
Target Start/End: Original strand, 197482 - 197572
Alignment:
Q  95 ataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  197482 ataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 197572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 4603 - 4498
Alignment:
Q  45 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 144  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4603 tgtgtgatgataaatactgtgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctata 4505  T
Q  145 tattgag 151  Q
    |||||||    
T  4504 tattgag 4498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 34447 - 34334
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 99  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  34447 agttaatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataat 34348  T
Q  100 gcaaatgttgtgga 113  Q
     |||||| ||||||    
T  34347 acaaatgatgtgga 34334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 191
Target Start/End: Original strand, 2839 - 2942
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcc 187  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||     
T  2839 tttcttgataataaaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtct 2938  T
Q  188 ttgt 191  Q
    ||||    
T  2939 ttgt 2942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 2742 - 2783
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgtt 42  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2742 agttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgtt 2783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2209 - 2118
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 179  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2209 tttcttaataataaaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcatta 2118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 2306 - 2260
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt 47  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  2306 agttgatgttgaatgacattgttgattatagatgatcatgttgatgt 2260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 4728 - 4801
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  4728 tttcttgataatgctaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 4801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 7041 - 7114
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  7041 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataatttgaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 7114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23950 - 23898
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23950 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtatgatg 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Original strand, 71655 - 71728
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  71655 tttcttgataatgcgaatgttgtggagatgatcaatataattggaaggtgtcctttatattgttgtgaaaattg 71728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 216 - 164
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  216 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 67 - 1
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatga 66  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  67 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 160
Target Start/End: Original strand, 3667 - 3739
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  3667 tttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 3739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7387 - 7290
Alignment:
Q  89 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtc 186  Q
    |||||||||||| || |||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  7387 ttcttgataatgtaattgttgtagaggtgatcaatatatttggatgttgtcctttatattgttgtggaaattgtggggtgatgtcgcattatcgagtc 7290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 4820 - 4759
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  4820 tttcttgagaatgcagatgttgtggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 4759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 53328 - 53279
Alignment:
Q  4 tgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 53  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  53328 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 53279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 163
Target Start/End: Original strand, 6021 - 6093
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 163  Q
    |||||||||| || ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  6021 cttgataatgaaattgttgtggagattatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtg 6093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 160
Target Start/End: Original strand, 117977 - 118049
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  117977 tttcttaataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 118049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1030 - 991
Alignment:
Q  150 aggtgaaaattgtggattgttgtcgcattaccgagtcctt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1030 aggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 3077 - 3124
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgttaatgtg 48  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3077 agttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtg 3124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12986 - 12936
Alignment:
Q  88 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgt 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  12986 tttcttgataatgctaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgt 12936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 148
Target Start/End: Original strand, 78206 - 78265
Alignment:
Q  89 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatatt 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  78206 ttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaggctgtcctttatatt 78265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 34261 - 34203
Alignment:
Q  91 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  34261 cttgataatgcaattgttgaggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 34203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1752 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1752
Description:

Target: scaffold1752; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 470 - 429
Alignment:
Q  1 agttgatgttgaatgacagtgttgattattgataatcatgtt 42  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  470 agttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgtt 429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University