View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8294A_low_329 (Length: 229)

Name: NF8294A_low_329
Description: NF8294A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8294A_low_329
NF8294A_low_329
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (7-229)||(821196-821416)
chr4 (8-229)||(44054776-44054997)
chr4 (8-229)||(45460040-45460260)
chr4 (8-229)||(33739119-33739339)
chr4 (78-229)||(5683906-5684057)
chr4 (18-228)||(25120215-25120425)
chr4 (8-222)||(15273736-15273949)
chr4 (8-229)||(16521642-16521863)
chr4 (8-229)||(44345682-44345902)
chr4 (78-222)||(18247155-18247299)
chr4 (13-229)||(21960657-21960872)
chr4 (8-229)||(30233626-30233847)
chr4 (63-214)||(7133479-7133631)
chr4 (76-223)||(9294491-9294638)
chr4 (8-229)||(12900853-12901076)
chr4 (8-221)||(19698447-19698657)
chr4 (8-221)||(19709032-19709242)
chr4 (74-222)||(26679002-26679152)
chr4 (113-223)||(15212413-15212523)
chr4 (13-229)||(23271015-23271228)
chr4 (8-229)||(54119356-54119576)
chr4 (78-214)||(18167766-18167903)
chr4 (74-222)||(22355604-22355754)
chr4 (125-229)||(10643041-10643145)
chr4 (8-229)||(18294100-18294323)
chr4 (78-229)||(14995049-14995202)
chr4 (13-213)||(55377673-55377873)
chr4 (86-229)||(13245304-13245447)
chr4 (82-209)||(18251103-18251232)
chr4 (63-229)||(19999379-19999547)
chr4 (113-222)||(15212311-15212419)
chr4 (130-222)||(15288106-15288198)
chr4 (130-222)||(15295216-15295308)
chr4 (16-154)||(53705902-53706039)
chr4 (8-152)||(8873631-8873774)
chr4 (29-142)||(19019506-19019617)
chr4 (86-154)||(53908963-53909031)
chr4 (125-229)||(18495604-18495710)
chr4 (17-176)||(13810709-13810870)
chr4 (74-229)||(10487523-10487682)
chr4 (74-229)||(16329069-16329228)
chr4 (113-172)||(15212552-15212611)
chr4 (187-229)||(7133711-7133753)
chr4 (187-229)||(8373207-8373249)
chr4 (187-229)||(14950872-14950914)
chr4 (187-229)||(18167644-18167686)
chr4 (125-229)||(34394051-34394156)
chr4 (129-223)||(8373321-8373415)
chr4 (187-229)||(9294377-9294419)
chr4 (192-229)||(110334-110371)
chr4 (86-151)||(110391-110456)
chr4 (177-229)||(5684153-5684206)
chr4 (177-229)||(18294418-18294471)
chr4 (189-229)||(8044113-8044153)
chr4 (125-229)||(15273958-15274064)
chr4 (189-229)||(34393908-34393948)
chr4 (189-229)||(53706054-53706094)
chr4 (186-229)||(15212196-15212239)
chr4 (186-229)||(15288271-15288314)
chr4 (186-229)||(15295381-15295424)
chr4 (63-229)||(18109838-18110007)
chr4 (186-229)||(18247040-18247083)
chr4 (187-229)||(22355826-22355868)
chr4 (187-229)||(26678887-26678929)
chr4 (195-229)||(47356180-47356214)
chr4 (201-229)||(8873770-8873798)
chr4 (195-223)||(15212605-15212633)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (10-229)||(22407286-22407505)
chr1 (13-229)||(49966502-49966717)
chr1 (15-229)||(18506209-18506422)
chr1 (8-222)||(20826206-20826419)
chr1 (42-229)||(44036024-44036210)
chr1 (13-229)||(21717056-21717271)
chr1 (15-229)||(35053693-35053909)
chr1 (78-229)||(15862592-15862743)
chr1 (78-229)||(22353128-22353279)
chr1 (13-229)||(2422065-2422281)
chr1 (8-229)||(5675690-5675911)
chr1 (8-229)||(27330861-27331080)
chr1 (8-229)||(41210899-41211119)
chr1 (8-229)||(35523508-35523731)
chr1 (78-229)||(22250113-22250263)
chr1 (8-229)||(51657400-51657624)
chr1 (63-229)||(17147633-17147801)
chr1 (95-221)||(41218316-41218442)
chr1 (76-223)||(20956127-20956278)
chr1 (123-229)||(21858409-21858515)
chr1 (122-228)||(45050536-45050642)
chr1 (8-229)||(9785340-9785551)
chr1 (112-229)||(20894886-20895003)
chr1 (82-229)||(22365608-22365757)
chr1 (86-154)||(37845654-37845722)
chr1 (74-151)||(51451544-51451623)
chr1 (190-229)||(20526971-20527010)
chr1 (127-229)||(7641803-7641905)
chr1 (125-229)||(20826428-20826534)
chr1 (190-229)||(20444599-20444638)
chr1 (190-229)||(20530364-20530403)
chr1 (190-229)||(37845737-37845776)
chr1 (186-229)||(41393303-41393346)
chr1 (86-156)||(20930380-20930450)
chr1 (86-154)||(20444653-20444721)
chr1 (86-154)||(20527025-20527092)
chr1 (86-154)||(20530418-20530486)
chr1 (155-229)||(17003673-17003747)
chr1 (195-229)||(18060885-18060919)
chr1 (195-229)||(22352981-22353015)
chr1 (187-229)||(51451464-51451506)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (13-229)||(25121398-25121614)
chr8 (16-227)||(22322525-22322736)
chr8 (18-228)||(29759148-29759358)
chr8 (8-229)||(19994234-19994454)
chr8 (86-229)||(41245519-41245662)
chr8 (8-229)||(20480525-20480748)
chr8 (8-229)||(37610223-37610443)
chr8 (76-222)||(24107629-24107775)
chr8 (82-222)||(28836562-28836704)
chr8 (81-229)||(21680059-21680209)
chr8 (8-221)||(18611377-18611587)
chr8 (83-222)||(22908532-22908673)
chr8 (30-229)||(20648541-20648742)
chr8 (78-229)||(22007638-22007788)
chr8 (82-221)||(24930160-24930302)
chr8 (63-229)||(20655158-20655327)
chr8 (8-229)||(21696418-21696639)
chr8 (125-229)||(43374782-43374886)
chr8 (74-229)||(13663635-13663792)
chr8 (63-229)||(24386843-24387012)
chr8 (74-229)||(24718564-24718720)
chr8 (78-229)||(13722174-13722327)
chr8 (63-229)||(16874074-16874242)
chr8 (81-229)||(16417117-16417266)
chr8 (16-229)||(20568356-20568569)
chr8 (16-229)||(20574549-20574762)
chr8 (8-229)||(3432661-3432879)
chr8 (63-229)||(38532515-38532685)
chr8 (78-229)||(17730612-17730767)
chr8 (129-222)||(6775326-6775420)
chr8 (13-229)||(16042123-16042339)
chr8 (76-198)||(28556874-28556998)
chr8 (8-222)||(16040335-16040549)
chr8 (122-228)||(24548075-24548181)
chr8 (8-155)||(16406149-16406295)
chr8 (74-229)||(5237048-5237207)
chr8 (74-229)||(24662391-24662550)
chr8 (187-229)||(13722433-13722475)
chr8 (187-229)||(13722581-13722623)
chr8 (187-229)||(13722729-13722771)
chr8 (187-229)||(13722877-13722919)
chr8 (187-229)||(13723025-13723067)
chr8 (177-223)||(17151399-17151445)
chr8 (187-229)||(24107848-24107890)
chr8 (187-229)||(24930375-24930417)
chr8 (128-229)||(270585-270687)
chr8 (128-229)||(645233-645335)
chr8 (128-229)||(830968-831070)
chr8 (187-229)||(16040621-16040663)
chr8 (191-229)||(17151521-17151559)
chr8 (85-154)||(16194917-16194986)
chr8 (190-227)||(16195001-16195038)
chr8 (186-229)||(6775492-6775535)
chr8 (186-229)||(22908745-22908788)
chr8 (186-229)||(28836447-28836490)
chr8 (187-221)||(18618028-18618062)
chr8 (46-162)||(22144136-22144250)
chr8 (155-229)||(272435-272509)
chr8 (155-229)||(643340-643414)
chr8 (155-229)||(829146-829220)
chr8 (195-229)||(224430-224464)
chr8 (195-229)||(700843-700877)
chr8 (195-229)||(738053-738087)
chr8 (195-229)||(861948-861982)
chr8 (195-229)||(13663905-13663939)
chr8 (195-229)||(13723180-13723214)
chr8 (74-229)||(43684507-43684666)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (10-229)||(32897583-32897802)
chr6 (18-228)||(19984298-19984508)
chr6 (15-227)||(25645918-25646129)
chr6 (8-222)||(16230555-16230768)
chr6 (13-223)||(18824637-18824847)
chr6 (12-229)||(18431493-18431708)
chr6 (8-229)||(18776068-18776291)
chr6 (78-222)||(25174527-25174671)
chr6 (13-223)||(4989869-4990079)
chr6 (78-218)||(27655147-27655287)
chr6 (76-223)||(18840555-18840702)
chr6 (78-217)||(33315628-33315767)
chr6 (8-229)||(16105419-16105638)
chr6 (16-229)||(18569446-18569660)
chr6 (63-214)||(18004002-18004154)
chr6 (13-214)||(15736160-15736362)
chr6 (82-222)||(13622160-13622302)
chr6 (13-229)||(35016770-35016985)
chr6 (31-229)||(16084941-16085136)
chr6 (113-223)||(18824841-18824951)
chr6 (113-223)||(18840696-18840806)
chr6 (30-222)||(16826872-16827065)
chr6 (8-222)||(18582151-18582367)
chr6 (15-229)||(25745422-25745636)
chr6 (82-214)||(14627658-14627791)
chr6 (16-229)||(22431108-22431320)
chr6 (30-221)||(19628302-19628490)
chr6 (30-229)||(23152119-23152318)
chr6 (63-229)||(18087846-18088016)
chr6 (129-229)||(1658915-1659015)
chr6 (130-222)||(19609350-19609442)
chr6 (63-229)||(23976427-23976595)
chr6 (8-229)||(25368428-25368652)
chr6 (63-172)||(26088782-26088893)
chr6 (122-228)||(1651148-1651254)
chr6 (81-219)||(22867026-22867166)
chr6 (129-207)||(21776791-21776870)
chr6 (36-174)||(18397842-18397982)
chr6 (30-128)||(13015910-13016006)
chr6 (78-136)||(25903975-25904033)
chr6 (143-213)||(16301107-16301178)
chr6 (187-229)||(16827138-16827180)
chr6 (187-229)||(4989755-4989797)
chr6 (187-229)||(18825023-18825065)
chr6 (184-229)||(15736440-15736485)
chr6 (125-229)||(16230440-16230546)
chr6 (76-221)||(28195924-28196074)
chr6 (186-229)||(14627871-14627914)
chr6 (192-227)||(16239227-16239262)
chr6 (186-229)||(18004234-18004277)
chr6 (186-229)||(25174412-25174455)
chr6 (186-229)||(27655348-27655391)
chr6 (187-221)||(18843083-18843117)
chr6 (177-221)||(15861597-15861642)
chr6 (148-227)||(13016008-13016088)
chr6 (155-229)||(10487735-10487809)
chr6 (155-229)||(16377518-16377592)
chr6 (155-229)||(16384842-16384916)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (11-229)||(71539-71757)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (16-227)||(256001-256211)
scaffold0011 (16-227)||(262607-262817)
scaffold0011 (86-223)||(124454-124591)
scaffold0011 (86-229)||(75855-75998)
scaffold0011 (86-153)||(193515-193582)
scaffold0011 (189-229)||(193468-193508)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (16-229)||(6453-6665)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (12-229)||(44864100-44864316)
chr7 (8-227)||(12753740-12753958)
chr7 (20-228)||(125684-125892)
chr7 (8-229)||(47288632-47288852)
chr7 (78-229)||(15851183-15851334)
chr7 (8-222)||(14252277-14252491)
chr7 (8-229)||(3893950-3894173)
chr7 (10-229)||(12544801-12545019)
chr7 (8-229)||(369744-369965)
chr7 (53-229)||(11286070-11286247)
chr7 (30-229)||(15823514-15823713)
chr7 (10-229)||(45453346-45453563)
chr7 (78-222)||(16417436-16417580)
chr7 (53-229)||(26071396-26071573)
chr7 (53-229)||(26095183-26095360)
chr7 (8-225)||(112381-112600)
chr7 (8-222)||(32495532-32495747)
chr7 (13-229)||(13867163-13867381)
chr7 (78-214)||(15952144-15952280)
chr7 (74-222)||(13912155-13912305)
chr7 (83-222)||(7291825-7291966)
chr7 (8-229)||(142485-142708)
chr7 (78-223)||(11515198-11515345)
chr7 (8-222)||(2027529-2027742)
chr7 (76-223)||(7285361-7285510)
chr7 (125-229)||(36051520-36051624)
chr7 (16-229)||(39047785-39047998)
chr7 (63-229)||(13757435-13757603)
chr7 (76-229)||(12249263-12249419)
chr7 (8-229)||(13273610-13273833)
chr7 (63-229)||(18981044-18981214)
chr7 (76-229)||(49048942-49049099)
chr7 (8-229)||(15629638-15629860)
chr7 (81-229)||(16571246-16571396)
chr7 (81-229)||(16594266-16594416)
chr7 (123-229)||(1937973-1938078)
chr7 (8-229)||(10861927-10862150)
chr7 (129-214)||(16480034-16480120)
chr7 (113-212)||(7285504-7285603)
chr7 (86-154)||(11582027-11582095)
chr7 (74-229)||(15442707-15442866)
chr7 (74-151)||(30263272-30263351)
chr7 (177-223)||(11515092-11515138)
chr7 (187-229)||(32495819-32495861)
chr7 (189-229)||(11582109-11582149)
chr7 (189-229)||(13038373-13038413)
chr7 (86-154)||(16210691-16210759)
chr7 (63-126)||(3048688-3048751)
chr7 (95-146)||(13038299-13038350)
chr7 (189-229)||(16210636-16210676)
chr7 (63-229)||(2191684-2191853)
chr7 (186-229)||(7291710-7291753)
chr7 (186-229)||(15952360-15952403)
chr7 (186-229)||(16417321-16417364)
chr7 (186-229)||(16480200-16480243)
chr7 (186-229)||(26010455-26010498)
chr7 (86-146)||(3058966-3059026)
chr7 (189-229)||(15926221-15926261)
chr7 (8-116)||(35093783-35093890)
chr7 (186-229)||(2027414-2027457)
chr7 (192-223)||(3058910-3058941)
chr7 (155-229)||(7821777-7821851)
chr7 (155-229)||(7829088-7829162)
chr7 (155-229)||(27102783-27102857)
chr7 (155-229)||(27110131-27110205)
chr7 (155-229)||(27175469-27175543)
chr7 (155-229)||(38784875-38784949)
chr7 (187-229)||(13912378-13912420)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (8-229)||(25809-26030)
scaffold0037 (13-229)||(70486-70702)
scaffold0037 (81-221)||(93560-93701)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (8-229)||(21393045-21393265)
chr5 (8-222)||(9731762-9731975)
chr5 (13-229)||(1169602-1169817)
chr5 (30-215)||(23510859-23511044)
chr5 (78-223)||(10779344-10779489)
chr5 (78-222)||(11318-11462)
chr5 (78-229)||(16535162-16535313)
chr5 (8-229)||(20710993-20711214)
chr5 (16-227)||(28258460-28258669)
chr5 (78-222)||(29191785-29191929)
chr5 (13-222)||(11582846-11583055)
chr5 (8-229)||(17472823-17473044)
chr5 (8-229)||(24184295-24184517)
chr5 (76-223)||(110145-110292)
chr5 (8-229)||(4864124-4864343)
chr5 (81-229)||(19404438-19404588)
chr5 (74-222)||(1220890-1221040)
chr5 (74-222)||(4201124-4201274)
chr5 (30-222)||(27184830-27185023)
chr5 (13-222)||(23513767-23513977)
chr5 (78-222)||(18779155-18779301)
chr5 (82-222)||(25425589-25425732)
chr5 (10-229)||(21652485-21652706)
chr5 (63-226)||(21649689-21649855)
chr5 (83-229)||(11338021-11338170)
chr5 (78-222)||(22367647-22367793)
chr5 (78-223)||(11341605-11341749)
chr5 (78-229)||(22884454-22884604)
chr5 (78-223)||(25901488-25901635)
chr5 (8-229)||(23453808-23454032)
chr5 (8-229)||(23465313-23465537)
chr5 (130-222)||(7424648-7424740)
chr5 (129-219)||(19498764-19498855)
chr5 (8-229)||(24474443-24474654)
chr5 (74-229)||(21234670-21234829)
chr5 (125-229)||(11341491-11341597)
chr5 (13-151)||(23505663-23505802)
chr5 (74-151)||(20615547-20615626)
chr5 (187-229)||(110364-110406)
chr5 (187-229)||(1169923-1169965)
chr5 (125-229)||(25425474-25425580)
chr5 (187-229)||(27185095-27185137)
chr5 (125-229)||(9731984-9732090)
chr5 (82-229)||(35792275-35792425)
chr5 (74-151)||(37051919-37051998)
chr5 (186-229)||(11203-11246)
chr5 (186-229)||(1221112-1221155)
chr5 (186-229)||(7424532-7424575)
chr5 (186-229)||(10779560-10779603)
chr5 (186-229)||(11582731-11582774)
chr5 (186-229)||(18779374-18779417)
chr5 (186-229)||(22367865-22367908)
chr5 (189-229)||(11212986-11213026)
chr5 (189-229)||(23513653-23513693)
chr5 (189-229)||(29192004-29192044)
chr5 (186-229)||(21074870-21074913)
chr5 (155-229)||(21933512-21933586)
chr5 (155-229)||(21939682-21939756)
chr5 (155-229)||(35581106-35581180)
chr5 (155-229)||(37010516-37010590)
chr5 (187-229)||(4201347-4201389)
chr5 (199-229)||(25192390-25192420)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (9-229)||(16183094-16183313)
chr3 (8-222)||(18909656-18909869)
chr3 (8-222)||(53769627-53769840)
chr3 (8-229)||(50113218-50113436)
chr3 (8-229)||(6147927-6148145)
chr3 (78-222)||(22274011-22274155)
chr3 (78-222)||(2450374-2450518)
chr3 (8-215)||(13837733-13837938)
chr3 (8-229)||(17099569-17099789)
chr3 (13-229)||(22145362-22145578)
chr3 (74-218)||(17957375-17957520)
chr3 (8-229)||(318695-318917)
chr3 (85-225)||(47786041-47786183)
chr3 (16-229)||(12350934-12351148)
chr3 (78-223)||(49231180-49231326)
chr3 (8-228)||(15469552-15469771)
chr3 (78-214)||(16819882-16820019)
chr3 (8-229)||(35122541-35122763)
chr3 (86-229)||(13816367-13816511)
chr3 (10-229)||(53899605-53899826)
chr3 (8-222)||(7852777-7852993)
chr3 (9-229)||(11198653-11198875)
chr3 (13-229)||(12562563-12562781)
chr3 (30-223)||(51159475-51159669)
chr3 (76-229)||(11062184-11062340)
chr3 (86-229)||(19571932-19572075)
chr3 (63-226)||(23491363-23491530)
chr3 (8-229)||(14297353-14297574)
chr3 (8-229)||(14302980-14303201)
chr3 (13-158)||(54423001-54423145)
chr3 (8-229)||(8630701-8630920)
chr3 (86-229)||(15860308-15860451)
chr3 (81-229)||(40938586-40938736)
chr3 (81-229)||(14294284-14294434)
chr3 (81-229)||(14299911-14300061)
chr3 (89-229)||(17937351-17937492)
chr3 (86-222)||(33340812-33340949)
chr3 (78-229)||(25057701-25057856)
chr3 (8-217)||(17138342-17138553)
chr3 (8-146)||(17523552-17523690)
chr3 (122-228)||(15574896-15575002)
chr3 (122-228)||(15613915-15614021)
chr3 (13-229)||(19945481-19945700)
chr3 (76-229)||(39654768-39654925)
chr3 (186-229)||(33340697-33340740)
chr3 (63-126)||(38167007-38167070)
chr3 (187-229)||(16819760-16819802)
chr3 (85-154)||(12031164-12031233)
chr3 (189-229)||(51159742-51159782)
chr3 (125-176)||(14522487-14522538)
chr3 (191-229)||(2048915-2048953)
chr3 (85-154)||(2048969-2049038)
chr3 (125-213)||(10737388-10737476)
chr3 (8-121)||(16260149-16260261)
chr3 (125-229)||(18909541-18909647)
chr3 (86-154)||(19230968-19231036)
chr3 (125-229)||(53769512-53769618)
chr3 (186-229)||(2450590-2450633)
chr3 (190-229)||(19230914-19230953)
chr3 (186-229)||(22273896-22273939)
chr3 (191-227)||(12031249-12031285)
chr3 (125-229)||(17957533-17957639)
chr3 (155-229)||(1468885-1468959)
chr3 (186-229)||(7852662-7852705)
chr3 (155-229)||(44228281-44228354)
chr3 (195-229)||(8269673-8269707)
chr3 (195-229)||(8276784-8276818)
chr3 (187-229)||(11883518-11883560)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (18-228)||(22273741-22273951)
chr2 (18-228)||(22282974-22283184)
chr2 (8-222)||(21275503-21275716)
chr2 (8-222)||(12643001-12643214)
chr2 (8-222)||(42179342-42179555)
chr2 (78-222)||(19887825-19887969)
chr2 (8-229)||(36891794-36892015)
chr2 (78-222)||(21140843-21140987)
chr2 (53-229)||(27260416-27260592)
chr2 (63-222)||(3800036-3800195)
chr2 (89-225)||(16900224-16900361)
chr2 (89-225)||(16993615-16993752)
chr2 (16-229)||(6878298-6878513)
chr2 (8-229)||(4449312-4449535)
chr2 (76-198)||(25211866-25211988)
chr2 (16-229)||(8942501-8942715)
chr2 (16-229)||(12637255-12637469)
chr2 (89-229)||(22581094-22581237)
chr2 (13-203)||(270035-270226)
chr2 (78-223)||(34823165-34823309)
chr2 (78-223)||(12727126-12727270)
chr2 (125-229)||(8886995-8887099)
chr2 (63-229)||(24572526-24572695)
chr2 (8-229)||(28972895-28973118)
chr2 (63-229)||(9653983-9654140)
chr2 (125-229)||(7320344-7320450)
chr2 (125-229)||(22862342-22862446)
chr2 (74-229)||(20013975-20014131)
chr2 (86-153)||(20628580-20628647)
chr2 (74-229)||(14907583-14907742)
chr2 (74-229)||(23819032-23819191)
chr2 (187-229)||(25600816-25600858)
chr2 (185-227)||(25877210-25877252)
chr2 (127-229)||(12726906-12727010)
chr2 (148-229)||(22691175-22691257)
chr2 (148-229)||(22695822-22695904)
chr2 (8-229)||(22787108-22787331)
chr2 (187-229)||(24827831-24827873)
chr2 (86-154)||(461646-461714)
chr2 (125-229)||(12643223-12643329)
chr2 (189-229)||(20628662-20628702)
chr2 (186-229)||(19888041-19888084)
chr2 (186-229)||(21140728-21140771)
chr2 (186-229)||(21275788-21275831)
chr2 (160-229)||(721337-721407)
chr2 (187-229)||(34823051-34823093)
chr2 (177-222)||(3800257-3800302)
chr2 (192-225)||(43644243-43644276)
chr2 (125-223)||(12727020-12727118)
chr2 (86-154)||(43644158-43644226)
chr2 (155-229)||(11232484-11232558)
chr2 (155-229)||(22514331-22514405)
chr2 (155-229)||(28776932-28777006)
chr2 (187-229)||(5889559-5889601)
chr2 (125-229)||(24088566-24088672)
chr2 (189-229)||(461591-461631)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (53-229)||(7650-7827)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (18-228)||(32287-32496)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (18-228)||(40348-40557)
scaffold0078 (74-222)||(38372-38522)
scaffold0078 (186-229)||(38594-38637)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (8-222)||(14842-15055)
scaffold0251 (125-229)||(15064-15170)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (8-229)||(137897-138117)
scaffold0021 (8-229)||(87295-87504)
scaffold0021 (13-229)||(10522-10740)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (8-229)||(1925-2145)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (8-229)||(12826-13046)
scaffold0359 (8-229)||(181-400)
[»] scaffold0383 (3 HSPs)
scaffold0383 (78-229)||(1367-1518)
scaffold0383 (15-229)||(6087-6303)
scaffold0383 (187-229)||(1220-1262)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (57-229)||(2925-3098)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (37-229)||(6403-6594)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (8-229)||(44655-44875)
scaffold0034 (8-223)||(39178-39392)
scaffold0034 (113-229)||(39068-39184)
scaffold0034 (82-229)||(78408-78558)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (74-229)||(20446-20601)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (15-229)||(3479-3695)
scaffold0447 (15-69)||(8256-8309)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (8-229)||(95325-95545)
scaffold0044 (187-229)||(95177-95219)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (8-223)||(129353-129568)
scaffold0028 (86-222)||(89938-90075)
scaffold0028 (187-229)||(129239-129281)
scaffold0028 (186-229)||(90147-90190)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (78-222)||(6148-6292)
scaffold0003 (86-154)||(216932-217000)
scaffold0003 (186-229)||(6033-6076)
scaffold0003 (191-229)||(217016-217054)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (10-229)||(46982-47201)
scaffold0068 (10-229)||(60430-60649)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (78-222)||(155402-155546)
scaffold0023 (186-229)||(155618-155661)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (63-222)||(1507-1666)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (53-229)||(3516-3692)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (13-229)||(13283-13499)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (13-229)||(28888-29104)
scaffold0116 (189-229)||(28740-28780)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (16-229)||(43051-43263)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (8-229)||(237038-237261)
scaffold0009 (187-229)||(270978-271020)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (63-218)||(2162-2319)
scaffold0597 (187-229)||(2395-2437)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (17-229)||(113652-113863)
scaffold0022 (8-229)||(108517-108739)
[»] scaffold0195 (4 HSPs)
scaffold0195 (52-229)||(7781-7959)
scaffold0195 (52-229)||(13170-13348)
scaffold0195 (125-229)||(20247-20351)
scaffold0195 (125-229)||(18163-18267)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (8-229)||(13055-13275)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (8-229)||(145533-145757)
scaffold0025 (177-229)||(145386-145438)
scaffold0025 (85-156)||(147698-147769)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (9-221)||(17485-17697)
scaffold0244 (8-221)||(23903-24116)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (8-229)||(52361-52580)
scaffold0018 (8-229)||(56313-56532)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (8-229)||(18510-18736)
scaffold0234 (177-229)||(18831-18883)
[»] scaffold1734 (2 HSPs)
scaffold1734 (82-229)||(195-345)
scaffold1734 (189-229)||(46-86)
[»] scaffold0269 (3 HSPs)
scaffold0269 (82-222)||(935-1077)
scaffold0269 (82-222)||(15191-15333)
scaffold0269 (8-117)||(12021-12129)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (11-229)||(765-984)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (78-222)||(17618-17764)
scaffold0315 (187-229)||(17503-17545)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (63-229)||(54486-54653)
scaffold0032 (186-229)||(109344-109387)
scaffold0032 (82-135)||(14590-14645)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (78-229)||(27878-28028)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (82-222)||(2740-2882)
scaffold0761 (191-229)||(2958-2996)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (29-229)||(23929-24128)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (8-229)||(145782-146005)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (86-229)||(5770-5915)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (63-229)||(11062-11231)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (27-229)||(21515-21696)
scaffold0008 (95-156)||(129390-129451)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (8-156)||(18263-18410)
scaffold0120 (147-229)||(30044-30127)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (95-229)||(8289-8424)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (125-222)||(1575-1672)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (8-229)||(2540-2763)
[»] scaffold0138 (5 HSPs)
scaffold0138 (8-215)||(14350-14556)
scaffold0138 (189-229)||(28354-28394)
scaffold0138 (189-229)||(40350-40390)
scaffold0138 (187-229)||(28503-28545)
scaffold0138 (187-229)||(40499-40541)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (125-229)||(248741-248845)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (76-229)||(6749-6906)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (8-142)||(53462-53593)
scaffold0066 (187-229)||(53161-53203)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (76-229)||(2285-2442)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (134-229)||(59579-59675)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (129-229)||(32439-32541)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (153-229)||(14536-14613)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (82-229)||(317-467)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (162-222)||(41677-41737)
scaffold0132 (187-229)||(41563-41605)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (86-153)||(2085-2152)
scaffold1140 (189-229)||(2038-2078)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (52-119)||(1817-1884)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (74-229)||(2723-2882)
scaffold0124 (160-229)||(22940-23009)
[»] scaffold0750 (2 HSPs)
scaffold0750 (14-174)||(5515-5676)
scaffold0750 (160-229)||(6577-6646)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (16-229)||(505-700)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (189-229)||(6415-6455)
scaffold0218 (86-154)||(6332-6400)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (86-156)||(7890-7960)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (74-229)||(21501-21660)
scaffold0141 (74-229)||(25756-25915)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (192-229)||(4697-4734)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (97-154)||(40502-40559)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (186-229)||(17353-17396)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (82-137)||(330964-331021)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (194-227)||(413-446)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (95-156)||(4788-4849)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (192-229)||(27781-27818)
scaffold0162 (86-154)||(27696-27763)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (189-229)||(34426-34466)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (155-229)||(38139-38213)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 821196 - 821416
Alignment:
Q  7 cgccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  821196 cgccagttgccacttgatacggttt--ggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgaccaagtgaagttg 821293  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  821294 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtga 821393  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  821394 tagttgatgttgaatgacattgt 821416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44054997 - 44054776
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44054997 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttat 44054898  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||| ||    
T  44054897 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcacgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtgaagctaaatgtaat 44054798  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44054797 agttgatgttgaatgacattgt 44054776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 45460040 - 45460260
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45460040 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 45460138  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  45460139 atgattaaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaggtgtgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgagat 45460238  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  45460239 agttaatgttgaatgacattgt 45460260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33739339 - 33739119
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||   ||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  33739339 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatattt-cttgaaccaattgtattaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 33739241  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  33739240 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaagctatatgtgat 33739141  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33739140 agttgatgttgaatgacattgt 33739119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 5683906 - 5684057
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5683906 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 5684005  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5684006 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 5684057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Original strand, 25120215 - 25120425
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25120215 acttgatatgggttttgatcggcgatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaatttgtatgaatgaat 25120314  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25120315 gattataatggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgt 25120413  T
Q  217 tgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||    
T  25120414 tgaatgacattg 25120425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 15273736 - 15273949
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  15273736 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 15273834  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15273835 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 15273934  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  15273935 agttgatgttgaatg 15273949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16521863 - 16521642
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16521863 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 16521765  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16521764 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtga 16521665  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16521664 tagttgatgttgaatgacattgt 16521642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44345902 - 44345682
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  44345902 gccggtggccccttgatatggtttttggtcgaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 44345804  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44345803 atgaatgaatgattgttttggatatgttgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatgttgaaactatatgtgat 44345704  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44345703 agttgatgttgaatgacattgt 44345682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18247299 - 18247155
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18247299 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 18247200  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18247199 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 18247155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 21960657 - 21960872
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||    |  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21960657 ttgccacttgacatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgatctatcatgactatttttatatgactaagtgaagttgtatgaa 21960755  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21960756 tgaatgattgtattggatacgatgtttatcttgagatgtgtatgctaccttacttagaatgtatggaatgcttgaatggtgaaactatatgtaatagttg 21960855  T
Q  213 atgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| |||||||||||    
T  21960856 atgttaaatgacattgt 21960872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 30233626 - 30233847
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||    
T  30233626 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtggttactcttatatgactaagtaaatttg 30233723  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||| |    
T  30233724 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaatggcgaaactatatgag 30233823  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  30233824 atagttaatgttgaatgacattgt 30233847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 214
Target Start/End: Original strand, 7133479 - 7133631
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 161  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  7133479 cttacgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatc 7133578  T
Q  162 ttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7133579 ttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 7133631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9294638 - 9294491
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  9294638 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgta 9294539  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9294538 aggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgataattgatgttgaatga 9294491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 12900853 - 12901076
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||| | |||||||  |||| | ||||| ||| |||||||||    
T  12900853 gccgtttgccacttgacacggattttggtcggaaatgttt-cttgagcaaattgtcttatgatttgttgtgaccattcatgtatgactaattgaagttgt 12900951  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12900952 ataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 12901051  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||    
T  12901052 gatagttgatgtttaatgatattgt 12901076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Original strand, 19698447 - 19698657
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  19698447 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 19698544  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 205  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698545 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtg 19698641  T
Q  206 atagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  19698642 atagttgatgttgaat 19698657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Original strand, 19709032 - 19709242
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  19709032 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 19709129  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 205  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19709130 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtg 19709226  T
Q  206 atagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  19709227 atagttgatgttgaat 19709242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26679152 - 26679002
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26679152 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 26679053  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26679052 tgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 26679002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15212523 - 15212413
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212523 tgaatgattgtattagatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 15212424  T
Q  213 atgttgaatga 223  Q
    |||||||||||    
T  15212423 atgttgaatga 15212413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 23271015 - 23271228
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23271015 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgtt--cttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaa 23271111  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    || ||||| ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23271112 tggatgatcgtattggatatgatggttgtcatgagatatgtatgctatcttacttggaatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagtt 23271210  T
Q  212 gatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||| || |||||||    
T  23271211 gatgttggataacattgt 23271228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 54119356 - 54119576
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||| |  | ||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  54119356 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatattt-cttgagccaattatcttgtgagttatggtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 54119454  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  54119455 atgaatgaatgattgtattggatatgatatttatcttgagatgtgtaagctatcttacttagaatgt-aagaaatgttgaattggtgaaactatatgtga 54119553  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  54119554 tagttgatgtggaatgacattgt 54119576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18167903 - 18167766
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaa 176  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18167903 gattattcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgagtgattgtattggatatgatgtttatcaagagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaa 18167804  T
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18167803 ggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18167766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 22355604 - 22355754
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  22355604 ttgtgattattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagatatgtatgttatcttacttagaa 22355703  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22355704 tgtaaggaatgcttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 22355754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10643145 - 10643041
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10643145 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtggaactatatgtgatagttgatgttgaataac 10643046  T
Q  225 attgt 229  Q
    |||||    
T  10643045 attgt 10643041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 18294100 - 18294323
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||    
T  18294100 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtataactaagtgaagttgt 18294198  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattg--gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||| ||||| ||||   ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  18294199 atgaatgagtgattatatttttgatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatgcttgaaatcgtgaaactatatgt 18294298  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  18294299 gatatttgatgttgaatgacattgt 18294323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14995202 - 14995049
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgt 174  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | |  |||||||| |||| |    
T  14995202 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatat 14995103  T
Q  175 aaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14995102 -gagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 14995049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 55377673 - 55377873
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| |  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |     
T  55377673 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttaagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtaaaat 55377771  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  55377772 tgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagataagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatacgtgatagtt 55377871  T
Q  212 ga 213  Q
    ||    
T  55377872 ga 55377873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13245447 - 13245304
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||    
T  13245447 ttatataactaagtgaaaatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgt-aagaaatgtt 13245349  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13245348 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgtcattgt 13245304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Original strand, 18251103 - 18251232
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18251103 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggaaatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaagga 18251202  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatag 209  Q
    ||  |||||| |||||| ||||||||||||    
T  18251203 atgtttgaatagtgaaattatatgtgatag 18251232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19999547 - 19999379
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 161  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||    
T  19999547 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctc 19999448  T
Q  162 ttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||| |||| |  |||||  ||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  19999447 ttacttggaatat-gagaattgtttggaatggtgaaactatatcatatagttgatgttgaatgacattgt 19999379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15212419 - 15212311
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15212419 tgaatgattgtaatagatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctaaga-acttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttg 15212321  T
Q  213 atgttgaatg 222  Q
    ||||||||||    
T  15212320 atgttgaatg 15212311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Original strand, 15288106 - 15288198
Alignment:
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15288106 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatttgatagttgatgtttaatg 15288198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Original strand, 15295216 - 15295308
Alignment:
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15295216 tatgatgtatatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 15295308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 154
Target Start/End: Original strand, 53705902 - 53706039
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  53705902 ccacttgatatggtttttagtcggaaatgttt-ctcgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 53706000  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53706001 atgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgta 53706039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Original strand, 8873631 - 8873774
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||| || ||| |||| |||  |||||| | ||||||||||| |    
T  8873631 gccggtggccagttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaacggtggtgactatgtttatataactaagtgaagttat 8873729  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8873730 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtg 8873774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19019617 - 19019506
Alignment:
Q  29 tttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 128  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  19019617 ttttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttga 19019520  T
Q  129 atatgatgtttatc 142  Q
    || |||||||||||    
T  19019519 atgtgatgtttatc 19019506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 53908963 - 53909031
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53908963 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgta 53909031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Original strand, 18495604 - 18495710
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||  |||  ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18495604 ttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgctctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactatatgagatagttgttgttgaatg 18495703  T
Q  223 acattgt 229  Q
    |||||||    
T  18495704 acattgt 18495710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 13810709 - 13810870
Alignment:
Q  17 cacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| || | || ||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13810709 cacttgatacggtatt--gtcggaaatggttcttttaagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatggatga 13810806  T
Q  116 atgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaa 176  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||| |||||| | | |||||||||||||||    
T  13810807 atgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttcttttacttagaatgtaa 13810870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10487682 - 10487523
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  10487682 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 10487583  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  10487582 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 10487523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 16329069 - 16329228
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  16329069 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 16329168  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  16329169 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 16329228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15212611 - 15212552
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  15212611 tgaatgattgtatgggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaat 15212552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 7133711 - 7133753
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7133711 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 7133753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8373249 - 8373207
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373249 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 8373207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14950914 - 14950872
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14950914 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 14950872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18167686 - 18167644
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18167686 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 18167644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34394156 - 34394051
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || | |  |||||||| |||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34394156 ttggatatgatgtttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 34394058  T
Q  223 acattgt 229  Q
    |||||||    
T  34394057 acattgt 34394051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8373415 - 8373321
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || | || |||||||| |||| | | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373415 atatgatatttatcatgagatgttgttttctctcttacttggaatatga-gaatgctggaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 8373321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9294419 - 9294377
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9294419 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 9294377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 110371 - 110334
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110371 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 110334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 110456 - 110391
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  110456 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgt 110391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Original strand, 5684153 - 5684206
Alignment:
Q  177 agaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5684153 agaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 5684206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Original strand, 18294418 - 18294471
Alignment:
Q  177 agaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18294418 agaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 18294471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8044153 - 8044113
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8044153 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 8044113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Original strand, 15273958 - 15274064
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15273958 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 15274056  T
Q  222 gacattgt 229  Q
    ||||||||    
T  15274057 gacattgt 15274064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34393948 - 34393908
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34393948 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 34393908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 53706054 - 53706094
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53706054 tggtgaaactatatgtgatagttggtgttgaatgacattgt 53706094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15212239 - 15212196
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15212239 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 15212196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 15288271 - 15288314
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15288271 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 15288314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 15295381 - 15295424
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15295381 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 15295424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Original strand, 18109838 - 18110007
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaat-gtgtatgcta 159  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||| | |      
T  18109838 cttatgaattgtggtgaccattcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttataatgagatattgttttccc 18109937  T
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    | |||||| |||| |  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  18109938 tattacttggaatat-gataatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgt 18110007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18247083 - 18247040
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18247083 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 18247040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 22355826 - 22355868
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22355826 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 22355868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26678929 - 26678887
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  26678929 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 26678887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47356214 - 47356180
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47356214 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 47356180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 229
Target Start/End: Original strand, 8873770 - 8873798
Alignment:
Q  201 atgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8873770 atgtgatagttgatgttgaatgacattgt 8873798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15212633 - 15212605
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212633 aactatatgtgatagttgatgttgaatga 15212605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 22407286 - 22407505
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22407286 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttatat 22407385  T
Q  110 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22407386 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtgaaactaaatgtaatag 22407485  T
Q  210 ttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22407486 ttgatgttgaatgacattgt 22407505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 49966717 - 49966502
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49966717 ttgccacttgatacggtttttggtgcaaaatgttttcttgagtcaattaccttgtgaatggttatgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 49966618  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49966617 tga-tgattgtatttgatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtaatagttg 49966519  T
Q  213 atgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  49966518 atgttgaatgacattgt 49966502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18506422 - 18506209
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18506422 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaatggtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatg 18506324  T
Q  115 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18506323 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18506224  T
Q  215 gttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||    
T  18506223 gttgaatgacattgt 18506209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 20826206 - 20826419
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  20826206 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 20826304  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20826305 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 20826404  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  20826405 agttgatgttgaatg 20826419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Original strand, 44036024 - 44036210
Alignment:
Q  42 atgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttat 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44036024 atgttttcttgagtcaattaccttagaaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttat 44036123  T
Q  142 catgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44036124 catgagatgtgtatgctatcttac-tagaatataaggaat-gttgaattggtgagactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 44036210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21717271 - 21717056
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21717271 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgtttt-ttgagcgaattgtcttatgaattattgtgaatattcttatatgacgaagtgaagttgtatgaa 21717174  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||    
T  21717173 tgaatgattgtattggacatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatgttgaaactatatgatatagtt 21717074  T
Q  212 gatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21717073 gatgttgaatgacattgt 21717056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35053909 - 35053693
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35053909 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatg 35053811  T
Q  115 aatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35053810 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaattatatgtgatagtt 35053711  T
Q  212 gatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||| |||||||    
T  35053710 gatgttgaataacattgt 35053693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 15862592 - 15862743
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15862592 gattattcttgcatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatttttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 15862691  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862692 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 15862743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22353279 - 22353128
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22353279 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 22353180  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22353179 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgatattgt 22353128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 2422065 - 2422281
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  2422065 ttgccacttgacacggtctttggtcgcaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttctgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgac 2422163  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2422164 tgaatgattgtattgaatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttactcaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagtt 2422263  T
Q  212 gatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2422264 gatgttgaatgacattgt 2422281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 5675690 - 5675911
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  5675690 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 5675788  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5675789 atgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttaccttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 5675888  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  5675889 tagttgatgttgaataacattgt 5675911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 27330861 - 27331080
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27330861 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattacattataaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttg 27330958  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||  |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  27330959 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgcta--ttgattagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgag 27331056  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  27331057 atagttaatgttgaatgacattgt 27331080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41211119 - 41210899
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  | || |||| || ||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  41211119 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtttt-ttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgattatgtttatataactaagtgaagttgt 41211021  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  41211020 atgaaggaatgattgttttggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttgggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtga 41210922  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||  |||||||||||||||    
T  41210921 tagttggcgttgaatgacattgt 41210899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 35523508 - 35523731
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  35523508 gccgtttgccacttgatatggttttggatcggaaatgttt-cttgagccaatttacttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 35523606  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 204  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||     
T  35523607 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaaatggtgaaaccatatga 35523706  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||  ||||||||  |||||||||    
T  35523707 gataaatgatgttgggtgacattgt 35523731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 22250113 - 22250263
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  22250113 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 22250211  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22250212 gaatgcttgaattggtg-aactatttgtgatagttgatgttgaatgacattgt 22250263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 51657400 - 51657624
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaat-gttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||   || ||||||||  ||||||| |  | |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  51657400 gccggttgccacttggtacggtatt--gtcggaaatagttcatttaagtcaattgtcttatgatttatcgtgactgttcttatatgactaagtgaagttg 51657497  T
Q  107 tatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatat 202  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||    
T  51657498 tatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtcgtatgttctcttacttagaatgtaaccaatgcttgaaatggtgaaaatatat 51657597  T
Q  203 gtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    | | | |||||||||||||||||||||    
T  51657598 gaggtggttgatgttgaatgacattgt 51657624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17147801 - 17147633
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17147801 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 17147702  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
     |||||| |||| | | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17147701 attacttggaatatga-gaatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 17147633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41218442 - 41218316
Alignment:
Q  95 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtga 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  41218442 taagtgaagttgtatgtatgaatgattgtattggatatgattttgatcatgagaggtgtaggctatcttacctagtatgtaaggaatgcttgaatggtga 41218343  T
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41218342 aactatatgtgattgttgatgtagaat 41218316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 20956127 - 20956278
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  20956127 gtgactattcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttacttagaat 20956226  T
Q  173 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    || |  |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20956227 gtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatga 20956278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21858515 - 21858409
Alignment:
Q  123 tattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21858515 tattggatatgatgtttagcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgttagaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 21858417  T
Q  222 gacattgt 229  Q
    ||||||||    
T  21858416 gacattgt 21858409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45050642 - 45050536
Alignment:
Q  122 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 220  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45050642 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 45050544  T
Q  221 tgacattg 228  Q
    ||||||||    
T  45050543 tgacattg 45050536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 9785340 - 9785551
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||   ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||| ||||||    
T  9785340 gccggtggccacttgatatggtttttggtaaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgtagttgt 9785438  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||          ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9785439 atgaatgaatgat----------atgatatttatcatgagatgtatatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtga 9785528  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  9785529 tagttgatgttgaataacattgt 9785551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Original strand, 20894886 - 20895003
Alignment:
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagt 210  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||  |||  ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20894886 atgaatgattgtgtttgatatgatatttatcatgagatgtgtaagctaccttacttaaaatgtaagaaatgtttgaattcgtgaaactatatgtgatagt 20894985  T
Q  211 tgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| ||||||| |||||    
T  20894986 tgatg-tgaatgatattgt 20895003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22365757 - 22365608
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | |  |||||||| |||| |  ||    
T  22365757 attcttgtattactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatat-gag 22365659  T
Q  179 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22365658 aatgcttgaattggtg-aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 22365608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 37845654 - 37845722
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37845654 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 37845722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 51451623 - 51451544
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51451623 ttgtgattattcttgtatgaccaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 51451544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20527010 - 20526971
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20527010 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 20526971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 229
Target Start/End: Original strand, 7641803 - 7641905
Alignment:
Q  127 ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtat-gctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7641803 ggatgtgatgattatcatgagatgtattttgctatcttacttggaatgtga-gaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataac 7641900  T
Q  225 attgt 229  Q
    |||||    
T  7641901 attgt 7641905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Original strand, 20826428 - 20826534
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20826428 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 20826526  T
Q  222 gacattgt 229  Q
    ||||||||    
T  20826527 gacattgt 20826534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20444638 - 20444599
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20444638 ggtgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattgt 20444599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20530403 - 20530364
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20530403 ggtgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattgt 20530364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 229
Target Start/End: Original strand, 37845737 - 37845776
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37845737 ggtgagactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 37845776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41393346 - 41393303
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41393346 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 41393303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20930450 - 20930380
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20930450 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatggttatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 20930380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20444721 - 20444653
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20444721 ttatataactaagtgaaattgtataaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20444653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20527092 - 20527025
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20527092 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt-agtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20527025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20530486 - 20530418
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20530486 ttatataactaagtgaaattgtataaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20530418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17003747 - 17003673
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  17003747 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 17003673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 18060885 - 18060919
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18060885 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 18060919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22353015 - 22352981
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22353015 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 22352981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 51451506 - 51451464
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  51451506 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 51451464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25121614 - 25121398
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25121614 ttgccacttgatacggtttttggtcaaaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttgtataaa 25121515  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25121514 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgcatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtaaaactatatgtgatagttg 25121415  T
Q  213 atgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||| ||||    
T  25121414 atgttgaatgaccttgt 25121398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 227
Target Start/End: Original strand, 22322525 - 22322736
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22322525 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 22322624  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22322625 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagaggtgtatgctatcttacctagtatgtaaggaatgcttgaatggtgaaaccacatgtgatagttgatg 22322724  T
Q  216 ttgaatgacatt 227  Q
    ||||||||||||    
T  22322725 ttgaatgacatt 22322736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29759358 - 29759148
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29759358 acttgatatgggttttgatcggagatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 29759259  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29759258 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatataaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgt 29759160  T
Q  217 tgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||    
T  29759159 tgaatgacattg 29759148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 19994234 - 19994454
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  19994234 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaatcaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 19994332  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19994333 atgaatgaatgattgttttgaatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 19994432  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19994433 agttgatgttgaatgacattgt 19994454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41245662 - 41245519
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  41245662 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatataaagaatgctt 41245563  T
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41245562 gaatggtaaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 41245519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20480748 - 20480525
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  20480748 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaactgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 20480650  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| | |||||| |||||||    
T  20480649 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatttgtgaaattatatgt 20480550  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  20480549 gatagttgatgttgaataacattgt 20480525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37610443 - 37610223
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37610443 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcgtatatgactaagtgaagttgt 37610346  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  37610345 atgaatgaataattgtgttagatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatcggtgaatctatatgtga 37610246  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  37610245 tagttgatgttgaataacattgt 37610223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 222
Target Start/End: Original strand, 24107629 - 24107775
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107629 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtttgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 24107728  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107729 aggaatgtttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 24107775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28836704 - 28836562
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28836704 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagga 28836605  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28836604 atgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 28836562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21680209 - 21680059
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  21680209 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatg-ttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaga 21680111  T
Q  179 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680110 aatgcttgaaatggtgaaaatatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 21680059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18611587 - 18611377
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  18611587 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 18611490  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 205  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18611489 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtg 18611393  T
Q  206 atagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  18611392 atagttgatgttgaat 18611377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Original strand, 22908532 - 22908673
Alignment:
Q  83 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22908532 ttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaattattgtattttggatatgatttttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaa 22908631  T
Q  181 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22908632 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatggtgaatg 22908673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Original strand, 20648541 - 20648742
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttg 127  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||  |||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||     
T  20648541 ttttggccggaaatgttt-cttgagccgattggcttatgaattattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtattttt 20648639  T
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20648640 gatatgatgtttatcatgagttgggtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaagcatatgtgataattgatgttggatgacat 20648739  T
Q  227 tgt 229  Q
    |||    
T  20648740 tgt 20648742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 22007638 - 22007788
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |    
T  22007638 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttaacatgagatgtgtatgctatcttacttggaatat-ga 22007736  T
Q  178 gaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22007737 gaatgcttgaataggtg-aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 22007788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Original strand, 24930160 - 24930302
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24930160 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 24930259  T
Q  180 atacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930260 atccttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 24930302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Original strand, 20655158 - 20655327
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  20655158 cttatgaattattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttttataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagttgggtatggtat 20655257  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20655258 cttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaacgatatgtgataattgatgttggatgacattgt 20655327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21696639 - 21696418
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || ||||||||  ||||||  |  | |||| |||||||| |||  |||||||||||||    
T  21696639 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttaagtcaattgtcttatgt-tcatcgtgactattcttacatggctaagtgaagttgt 21696543  T
Q  108 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 204  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||      
T  21696542 atgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatataa 21696443  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21696442 ggtagttgatgttgaatgacattgt 21696418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Original strand, 43374782 - 43374886
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43374782 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 43374881  T
Q  225 attgt 229  Q
    |||||    
T  43374882 attgt 43374886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 13663635 - 13663792
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  13663635 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaa 13663734  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13663735 tgtgagaaatgcttgaattggtg-aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13663792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Original strand, 24386843 - 24387012
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  24386843 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatgataattatcatgagaagtgtatgctat 24386942  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24386943 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaattggtgaatccatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 24387012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 24718564 - 24718720
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | |||||||| ||||    
T  24718564 ttgtgattatttttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaat 24718663  T
Q  173 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
     |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24718664 at-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 24718720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 13722174 - 13722327
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||     
T  13722174 gattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtg 13722273  T
Q  176 aagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |  ||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722274 agaaatgcttgaattagtg-aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13722327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Original strand, 16874074 - 16874242
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16874074 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 16874173  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
     |||||| |||| | | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16874174 attacttggaatatga-gaatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 16874242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16417266 - 16417117
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  16417266 tattcttatatgactaagtgaaattgtatgattgaatgattgtatgagatatgatgcttatcgtgagatgtgcatgctaccttacttaggatgtaagaaa 16417167  T
Q  181 tacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16417166 tgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaataacattgt 16417117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 20568356 - 20568569
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||   | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20568356 ccacttgacacggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 20568454  T
Q  116 atgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    || |||||||  |  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||  |  |||||||| |||| ||| ||||||  |    
T  20568455 ataattgtatgattaatatgatg-atatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtgagacatgttgaaatggtgagactacatgagatagtaaa 20568553  T
Q  214 tgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  20568554 tgttgaatgacattgt 20568569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 20574549 - 20574762
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||   | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20574549 ccacttgacacggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 20574647  T
Q  116 atgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    || |||||||  |  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||  |  |||||||| |||| ||| ||||||  |    
T  20574648 ataattgtatgattaatatgatg-atatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtgagacatgttgaaatggtgagactacatgagatagtaaa 20574746  T
Q  214 tgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  20574747 tgttgaatgacattgt 20574762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 3432661 - 3432879
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||  |||    
T  3432661 gccgtttgccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaa--tgt 3432757  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | |  | |||||| |||| |  ||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  3432758 atgaatgaatgattgtattggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctattacttggaatat-gagaatgcttgaattggtg-aactatatgtg 3432855  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3432856 atagttgatgttgaatgacattgt 3432879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38532685 - 38532515
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgcta 159  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |     
T  38532685 cttatgaattatcgtgactattcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttc 38532586  T
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||| |||||||  ||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38532585 tcttacttataatgtaataaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgt 38532515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 17730612 - 17730767
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgt 174  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  17730612 gattattcttctatgattgagtgaatttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgt 17730711  T
Q  175 aaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||  |||  ||| ||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17730712 aagaaatgtttgaaatagtaaaactgtatgagatagttgatgttgaatgacattgt 17730767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 222
Target Start/End: Original strand, 6775326 - 6775420
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6775326 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 6775420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 16042123 - 16042339
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |   ||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16042123 ttgccacttgacacggtctt-ggtcggaaatgttt-cttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 16042220  T
Q  113 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgata 208  Q
    ||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | | || |||||| |||| | |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16042221 tgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccatattacttggaatatga--aatgcttgaattggtgaaactatatgtgata 16042318  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  16042319 gttgatgttgaataacattgt 16042339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28556998 - 28556874
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28556998 gtgactattcttatatgactaa-tgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgatgtttattatgagatgtgtatgatatcttacttagaatg 28556900  T
Q  174 taaagaatacttg-aatggtgaaact 198  Q
    |||  ||| |||| ||||||||||||    
T  28556899 taagaaatgcttgaaatggtgaaact 28556874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 16040335 - 16040549
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |   ||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  16040335 gccgtttgccacttgacacggtctt-ggtcggaaatgttt-cttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 16040432  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 203  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | | || |||||| |||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  16040433 atgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccatattacttggaatatga--aatgcttgaattggtgaaactatatg 16040530  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16040531 tgatagttgatgttgaatg 16040549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24548181 - 24548075
Alignment:
Q  122 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 220  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24548181 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 24548083  T
Q  221 tgacattg 228  Q
    ||||||||    
T  24548082 tgacattg 24548075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 16406149 - 16406295
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||  | || |||| |  |||| |||  || ||||| |||||||||||||    
T  16406149 gccggtggccacatgatatggtttttggtcgaaaacgttt-cttgaaccaattgtcctaagaattgaggtgactatgtttgtatgactaagtgaagttgt 16406247  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtat 155  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16406248 atgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtat 16406295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5237207 - 5237048
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  5237207 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 5237108  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  5237107 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 5237048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 24662391 - 24662550
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  24662391 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 24662490  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  24662491 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 24662550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 13722433 - 13722475
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722433 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13722475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 13722581 - 13722623
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722581 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13722623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 13722729 - 13722771
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722729 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13722771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 13722877 - 13722919
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722877 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13722919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 13723025 - 13723067
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13723025 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13723067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 17151399 - 17151445
Alignment:
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151399 agaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 17151445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 24107848 - 24107890
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107848 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 24107890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 24930375 - 24930417
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930375 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 24930417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 270687 - 270585
Alignment:
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||  || ||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  270687 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 270588  T
Q  227 tgt 229  Q
    |||    
T  270587 tgt 270585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 229
Target Start/End: Original strand, 645233 - 645335
Alignment:
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||  || ||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  645233 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 645332  T
Q  227 tgt 229  Q
    |||    
T  645333 tgt 645335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 229
Target Start/End: Original strand, 830968 - 831070
Alignment:
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||  || ||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  830968 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 831067  T
Q  227 tgt 229  Q
    |||    
T  831068 tgt 831070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 16040621 - 16040663
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16040621 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 16040663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 229
Target Start/End: Original strand, 17151521 - 17151559
Alignment:
Q  191 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151521 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 17151559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 16194917 - 16194986
Alignment:
Q  85 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  16194917 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcataagatgtgta 16194986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 227
Target Start/End: Original strand, 16195001 - 16195038
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195001 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 16195038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 6775492 - 6775535
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6775492 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 6775535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 22908745 - 22908788
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22908745 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 22908788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28836490 - 28836447
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28836490 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 28836447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18618062 - 18618028
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618062 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 18618028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22144250 - 22144136
Alignment:
Q  46 tttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatca 143  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||    ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22144250 tttcttgagtcatttgtcttatgatttatggtgaatattcttatatgactaagcgaagttg----aatgagtgattatattttggatatgatgtttatca 22144155  T
Q  144 tgaaatgtgtatgctatct 162  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  22144154 tgagatatgtatgctatct 22144136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 272435 - 272509
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  272435 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 272509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 643414 - 643340
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  643414 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 643340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 829220 - 829146
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  829220 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 829146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 224430 - 224464
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  224430 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 224464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 700843 - 700877
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  700843 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 700877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 738053 - 738087
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  738053 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 738087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 861948 - 861982
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  861948 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 861982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 13663905 - 13663939
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13663905 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 13663939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 13723180 - 13723214
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13723180 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 13723214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43684666 - 43684507
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  43684666 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaggttgcatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 43684567  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  43684566 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 43684507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32897802 - 32897583
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32897802 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttatgattattcttatatgactaagtgaagttatat 32897703  T
Q  110 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||| |||     
T  32897702 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgtttgaatggtgaaactaaatgtaataa 32897603  T
Q  210 ttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32897602 ttgatgttgaatgacattgt 32897583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Original strand, 19984298 - 19984508
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19984298 acttgatatgggttttgatcggagatgttttcttgagtaaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 19984397  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19984398 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgt 19984496  T
Q  217 tgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||    
T  19984497 tgaatgacattg 19984508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 25645918 - 25646129
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||| |||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  25645918 gccacttgatatggtgtttggtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatcttactaagtgaagttgtatgaatg 25646016  T
Q  115 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25646017 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgataattgat 25646116  T
Q  215 gttgaatgacatt 227  Q
    |||||||||||||    
T  25646117 gttgaatgacatt 25646129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16230768 - 16230555
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16230768 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 16230670  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16230669 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 16230570  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  16230569 agttgatgttgaatg 16230555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 18824637 - 18824847
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  18824637 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctattgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 18824735  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18824736 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 18824835  T
Q  212 gatgttgaatga 223  Q
    ||||||||||||    
T  18824836 gatgttgaatga 18824847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18431708 - 18431493
Alignment:
Q  12 gttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  18431708 gttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatcactaagtgaggttgtatga 18431610  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    | ||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18431609 aagaatgattgcattaaatatgatgtt-atcatgagatgtgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 18431511  T
Q  212 gatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18431510 gatgttgaatgacattgt 18431493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18776291 - 18776068
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  18776291 gccggtggccacttgatatggtttttggttggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttttatgactaagtgaagttgt 18776193  T
Q  108 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18776192 atgaatgaatgattgtattctggatatgatatttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 18776093  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  18776092 gatagttgatgttgaataacattgt 18776068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25174671 - 25174527
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  25174671 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 25174572  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174571 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 25174527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4990079 - 4989869
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  4990079 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtttga 4989981  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4989980 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 4989881  T
Q  212 gatgttgaatga 223  Q
    ||||||||||||    
T  4989880 gatgttgaatga 4989869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 218
Target Start/End: Original strand, 27655147 - 27655287
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  27655147 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 27655246  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27655247 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 27655287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 18840555 - 18840702
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840555 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 18840654  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840655 aggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 18840702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 217
Target Start/End: Original strand, 33315628 - 33315767
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  33315628 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 33315727  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 217  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33315728 gaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtt 33315767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16105638 - 16105419
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||| |||||| |||||   |||||| |  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16105638 gccgtttgccacttgatatggattt-ggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgttttatgagttattgtgatcatttttatatgactaagtgaagttgt 16105541  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    | |||   | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16105540 acgaaaagaagattgtattggatatgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtaat 16105441  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16105440 agttgatgttgaatgacattgt 16105419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18569660 - 18569446
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18569660 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatcttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatga 18569563  T
Q  116 atgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18569562 atgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattagtgaaactatatgtgatagttg 18569463  T
Q  213 atgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||| |||||||    
T  18569462 atgttgaataacattgt 18569446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 214
Target Start/End: Original strand, 18004002 - 18004154
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 161  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  18004002 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatc 18004101  T
Q  162 ttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18004102 ttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18004154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 15736160 - 15736362
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  15736160 ttgccacttgatacggcttttagtcggaaatgtttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtaaagttgtatgaa 15736259  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15736260 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtaaaactatatgtgatagtt 15736359  T
Q  212 gat 214  Q
    |||    
T  15736360 gat 15736362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Original strand, 13622160 - 13622302
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13622160 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgactgtattttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagga 13622259  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13622260 atgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 13622302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 35016770 - 35016985
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| || |||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35016770 ttgccacatgatttggatttttgttggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 35016868  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| |||| |  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  35016869 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgttatcttacttggaatat-gagaatgcttgaaatggttaaactatatgtgatagtt 35016967  T
Q  212 gatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35016968 gatgttgaatgacattgt 35016985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16085136 - 16084941
Alignment:
Q  31 tttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggat 130  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||   |||||| |  ||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  16085136 tttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgttttatgagttcttgtgatcatttttatatgactaagt--agttgtatgaatagaagattgtattggat 16085040  T
Q  131 atgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16085039 atgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaagggtgaaactatatgtaatagttgatgttgaatgacattgt 16084941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 18824841 - 18824951
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18824841 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 18824940  T
Q  213 atgttgaatga 223  Q
    |||||||||||    
T  18824941 atgttgaatga 18824951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 18840696 - 18840806
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840696 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 18840795  T
Q  213 atgttgaatga 223  Q
    |||||||||||    
T  18840796 atgttgaatga 18840806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 222
Target Start/End: Original strand, 16826872 - 16827065
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 127  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  16826872 tttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttg 16826970  T
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16826971 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 16827065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18582367 - 18582151
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  18582367 gccgtttgccacttgatatggtttttg-tcggaaaagtttcttttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatg 18582269  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgt 204  Q
    | |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18582268 tgtgaatgaatggttatatgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgt 18582169  T
Q  205 gatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18582168 gatagttgatgttgaatg 18582151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 25745422 - 25745636
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||| |||||| |||| ||   |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25745422 gccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaatggtggtgactacgtttatataactaagtgaagttgtatgaacg 25745520  T
Q  115 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||   ||| |||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  25745521 aatgattgtgtaggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaattagtaaaactatatgtgatagttga 25745620  T
Q  214 tgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  25745621 tgttgaatgacattgt 25745636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Original strand, 14627658 - 14627791
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  14627658 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtattggatatgacgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaagaaa 14627757  T
Q  181 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14627758 tgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 14627791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22431320 - 22431108
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| || | || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22431320 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgtggagactatttttatatgactaagtgaagttgtatgattga 22431223  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  22431222 atgattgtatggggtatgatgcttatcataagatgcgtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatatgaaagttgat 22431123  T
Q  215 gttgaatgacattgt 229  Q
    || |||| |||||||    
T  22431122 gtagaataacattgt 22431108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19628490 - 19628302
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 127  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||    ||||| ||||| ||||  |    
T  19628490 tttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagcgaagttg----aatgagtgattatattttg 19628396  T
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19628395 aatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 19628302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23152318 - 23152119
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 129  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23152318 tttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgattaagttaagttgtatgaatgaatgattgtgttgga 23152220  T
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    || ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||  |||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23152219 taagatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacctaggatgtaagaaatgtttgaattggtggagctatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 23152120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Original strand, 18087846 - 18088016
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||    
T  18087846 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtgtatgccat 18087945  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18087946 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgt 18088016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 129 - 229
Target Start/End: Original strand, 1658915 - 1659015
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1658915 atatgatgtttatcatgagatgtgtatggtatcttacttagaatgcaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 1659014  T
Q  229 t 229  Q
    |    
T  1659015 t 1659015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19609442 - 19609350
Alignment:
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19609442 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 19609350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23976595 - 23976427
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 161  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||    
T  23976595 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctc 23976496  T
Q  162 ttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||| |||| |  |||||  ||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  23976495 ttacttggaatat-gagaattgtttggaatggtgaaactatatcatatagttgatgttgaatgacattgt 23976427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 25368428 - 25368652
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||   ||||||||||   ||||||| |  | |||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  25368428 gccgtttgccacttgatacggtattta-tcggaaatgttcctttgagtcaatcgacttatgatttatcgtgactgttcttatatgactaagtgaagttgt 25368526  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| || || |  ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  25368527 atgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgtgatgttgtatgctctcttacttaaaaggtgagaaatgcttgaaatggtaaaactatatg 25368626  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
     | ||||| ||||||||||| |||||    
T  25368627 aggtagtttatgttgaatgatattgt 25368652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26088893 - 26088782
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  26088893 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 26088794  T
Q  161 cttacttagaat 172  Q
    ||||||| ||||    
T  26088793 cttacttggaat 26088782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Original strand, 1651148 - 1651254
Alignment:
Q  122 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 220  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1651148 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 1651246  T
Q  221 tgacattg 228  Q
    ||||||||    
T  1651247 tgacattg 1651254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22867166 - 22867026
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||  |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||    
T  22867166 tatttttatatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtatgttggatataatgaatatcatgagatgtgcatgttctcttatttagaacgtaaag 22867067  T
Q  179 aatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttga 219  Q
    |||  ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||    
T  22867066 aatgtttgaatgatgaaactatatgagatagtaaatgttga 22867026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 207
Target Start/End: Original strand, 21776791 - 21776870
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21776791 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 21776870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18397982 - 18397842
Alignment:
Q  36 tcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatat 132  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||   | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  18397982 tcggaaatggtttctttaagtcaattgtcttatgaagtatcgtgagtattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtatgattgatat 18397883  T
Q  133 gatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgt 174  Q
    ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18397882 gatg-atatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgt 18397842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 13015910 - 13016006
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 128  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  |||||  ||||||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13015910 ttttggtcggaaatgttt-cttaaaccaattgtcttatgaattgttatgat-attcctatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 13016006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25904033 - 25903975
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 136  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25904033 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatg 25903975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 213
Target Start/End: Original strand, 16301107 - 16301178
Alignment:
Q  143 atgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16301107 atgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagttga 16301178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 16827138 - 16827180
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16827138 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 16827180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4989797 - 4989755
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4989797 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggatgacattgt 4989755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 18825023 - 18825065
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18825023 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgt 18825065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Original strand, 15736440 - 15736485
Alignment:
Q  184 ttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15736440 ttgaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 15736485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16230546 - 16230440
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16230546 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 16230448  T
Q  222 gacattgt 229  Q
    ||||||||    
T  16230447 gacattgt 16230440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 221
Target Start/End: Original strand, 28195924 - 28196074
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||  | ||||||| |||||||||||||||   || |||||| | |||||||||| ||    
T  28195924 gtgactattcttatatgactaagtgaggttgtatgaataattgattatatattggacatgatgtttatcatgggttgttgtatgatctcttacttaggat 28196023  T
Q  173 gtaaagaatacttg--aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||  ||| ||||  |||||| ||||||||||   ||||||| |||||||    
T  28196024 gtaagaaatgcttgaaaatggtaaaactatatgaagtagttgaggttgaat 28196074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 14627871 - 14627914
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14627871 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 14627914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16239262 - 16239227
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16239262 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 16239227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 18004234 - 18004277
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18004234 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 18004277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25174455 - 25174412
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25174455 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 25174412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 27655348 - 27655391
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27655348 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 27655391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Original strand, 18843083 - 18843117
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18843083 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 18843117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15861642 - 15861597
Alignment:
Q  177 agaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861642 agaatgcttgaactggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 15861597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 227
Target Start/End: Original strand, 13016008 - 13016088
Alignment:
Q  148 atgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||| |||||||    
T  13016008 atgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaaccacatgtggtaattgatgttgagtgacatt 13016088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10487809 - 10487735
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  10487809 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 10487735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 16377518 - 16377592
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  16377518 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 16377592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 16384842 - 16384916
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  16384842 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 16384916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 71539 - 71757
Alignment:
Q  11 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatg 110  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  71539 ggttgccacttgatacaggttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatgattgttattattcttatatgactaagttaagttatatg 71638  T
Q  111 aatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  71639 aatgaatgattgtattggatataatgtttatcatgagatgtgtacgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtgaaactaaatgtaatagt 71738  T
Q  211 tgatgttgaatgacattgt 229  Q
    | |||||||||||||||||    
T  71739 tcatgttgaatgacattgt 71757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 227
Target Start/End: Original strand, 256001 - 256211
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  256001 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatga 256099  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  256100 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgaag 256199  T
Q  216 ttgaatgacatt 227  Q
    ||||||||||||    
T  256200 ttgaatgacatt 256211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 227
Target Start/End: Original strand, 262607 - 262817
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  262607 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaatagtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatga 262705  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  262706 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgaag 262805  T
Q  216 ttgaatgacatt 227  Q
    ||||||||||||    
T  262806 ttgaatgacatt 262817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 223
Target Start/End: Original strand, 124454 - 124591
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||   ||    
T  124454 ttatataactaagtgaagatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagattggtatgctatcttacttagaatgt-aagaaatgtt 124552  T
Q  186 gaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124553 gaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 124591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Original strand, 75855 - 75998
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | |||||| || |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||   ||    
T  75855 ttatataactaagtgcagatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagatatgtatgtaatcttacttagaatgt-aagaaatgtt 75953  T
Q  186 gaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  75954 gaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgt 75998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 193582 - 193515
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 153  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  193582 ttatataactaattgaagttgtatgaatgaatgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgt 193515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 193508 - 193468
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  193508 tggtgaaacgatatgtggtagttgatgttgaatgacattgt 193468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 6453 - 6665
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6453 ccacttgatatggtttttggtcggaaatggtt-cttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatataactaagtgaagttgtatgaatga 6551  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6552 atgattgttttggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 6651  T
Q  216 ttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||    
T  6652 ttgaatgacattgt 6665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44864316 - 44864100
Alignment:
Q  12 gttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44864316 gttgccacttggtatgatttttggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatgactaagtgacgttgtatga 44864218  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44864217 aagaatgattgtatgcgatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatacttgaatggtgaaagtatatgtgatagtt 44864118  T
Q  212 gatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44864117 gatgttgaatgacattgt 44864100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12753958 - 12753740
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12753958 gccgtttgccacttgatatgatttt-ggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttatgatttgttgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgt 12753861  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12753860 atgattgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatcttacttagaatgtaaataatgcttgaaatggtgaaactatatgtga 12753761  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12753760 tagttgatgttgaatgacatt 12753740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 125892 - 125684
Alignment:
Q  20 ttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatga 119  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  125892 ttgatatgggttttgatcggagatgttttattgagtcaattacctcatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatga 125793  T
Q  120 ttgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 218  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  125792 ttgtatttgatatgatgttaatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgttg 125694  T
Q  219 aatgacattg 228  Q
    ||||||||||    
T  125693 aatgacattg 125684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47288852 - 47288632
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||   ||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  47288852 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgtttt-ttgaaccaattgttttaagaattgtggtgaccatttttatataaataagtgaagttgt 47288754  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  47288753 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttataatgtaaggaatgcttgaatggtgaaaccatatgtgat 47288654  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47288653 agttgatgttgaatgacattgt 47288632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15851334 - 15851183
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15851334 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 15851235  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15851234 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 15851183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 14252277 - 14252491
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||||||||||    
T  14252277 gccgtttgccacttgatacggtttttagtcggaaatatttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgt 14252376  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14252377 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 14252476  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  14252477 agttgatgttgaatg 14252491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3894173 - 3893950
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  3894173 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 3894075  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3894074 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtacgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaagtggtgaaactatatgt 3893975  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  3893974 gatagttgatgttgaataacattgt 3893950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 12544801 - 12545019
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||||    
T  12544801 cggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgactaggtgaagttgtat 12544899  T
Q  110 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgata 208  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  12544900 tattgaatgattgtatcggatatgatgtttatcatgaggtgtgtatgctatcttac-tagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatttgata 12544998  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12544999 gttgatgttgaatgacattgt 12545019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 369965 - 369744
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  369965 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 369867  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  369866 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtga 369767  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||| || ||||||||    
T  369766 tagttgatgttaaaggacattgt 369744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11286247 - 11286070
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11286247 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtattggatatgatgtgtatcatgagatgtg 11286148  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11286147 tatgttatcttacttagaatataaggaatgattgaaatggtgaaactatatgagatagttgatgttgaatgacattgt 11286070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Original strand, 15823514 - 15823713
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||   || ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  15823514 ttttggtcggaaatgttttcttgagctaattgttttgtgaattgttgtgactattcttgtatgactaagtgaagtcgtatgagtgaatgattgtataaga 15823613  T
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15823614 tatgatgtttctcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgt 15823713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 45453346 - 45453563
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45453346 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaa---tgttcttgagccaattgtcttatgatttgttgtgaccattcttatatgactaagtaaagttgtat 45453442  T
Q  110 gaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgata 208  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||| |||    
T  45453443 gaatgagtgattatatttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatattatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatgggaaaattatatgtaata 45453542  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45453543 gttgatgttgaatgacattgt 45453563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16417580 - 16417436
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16417580 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaag 16417481  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16417480 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 16417436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 53 - 229
Target Start/End: Original strand, 26071396 - 26071573
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26071396 agtcaattaccttatgaattattgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtg 26071495  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  26071496 tatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaacggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgt 26071573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 53 - 229
Target Start/End: Original strand, 26095183 - 26095360
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26095183 agtcaattaccttatgaattattgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtg 26095282  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  26095283 tatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaacggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgt 26095360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Original strand, 112381 - 112600
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  112381 gccggtggccacttgatatggtttttgttcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 112479  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgt 204  Q
    | ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  112480 acgaatgaatggttgtattttggatatgataattatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgatttggtgaaactatatgt 112579  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  112580 gatagttgatgttgaatgaca 112600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 32495532 - 32495747
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||||||  ||||  ||| ||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32495532 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagcaaattgtcttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgt 32495630  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32495631 atgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttggatggtgaaactatatgtg 32495730  T
Q  206 atagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||    
T  32495731 atagttgatgttgaatg 32495747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 13867163 - 13867381
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||| || | || || |||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  13867163 ttgccgcttgatatgatttttggccggaaatgattcttttaagccaattgtcttatgaattatcgtgattattcttatatgaccaa-tgaagttgtatga 13867261  T
Q  112 atgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 209  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13867262 atgaatgattgttttttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgcaatcttacttagaatgtaaggaattcttgaatgatgaaactatatgtgatag 13867361  T
Q  210 ttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  13867362 ttgatgttggataacattgt 13867381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Original strand, 15952144 - 15952280
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  15952144 gattattcttgtatgactaagcgaagttgtatgaatgaatgtttgtattgaatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaag 15952243  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15952244 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 15952280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 13912155 - 13912305
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13912155 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 13912254  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13912255 tgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 13912305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7291966 - 7291825
Alignment:
Q  83 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7291966 ttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaa 7291867  T
Q  181 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7291866 tgcttgaatggtgaaactatatgtgttagttgatgttgaatg 7291825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 142708 - 142485
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||  |  || | ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  142708 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaactgaggttactattcttgtatgactaagtgaagttgt 142610  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgt 204  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||  |||||| |||||||||||||||    
T  142609 atgaatggatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgggtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatgt 142510  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  142509 gatagttgatgttgaataacattgt 142485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11515345 - 11515198
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  11515345 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgta 11515246  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11515245 aggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 11515198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2027742 - 2027529
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  2027742 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcaaaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 2027644  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||||||||||||    
T  2027643 atgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtatactattttacttagaatgt-aagaaatgttgagttggtgaaactatatgtga 2027545  T
Q  207 tagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||    
T  2027544 tagttgatgttgaatg 2027529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 7285361 - 7285510
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7285361 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcttgagatatgtatgctatcttacttagaatg 7285460  T
Q  174 taaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285461 taaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 7285510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36051624 - 36051520
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051624 ttggatatgatgtttatcatgagatatatatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 36051525  T
Q  225 attgt 229  Q
    |||||    
T  36051524 attgt 36051520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 39047785 - 39047998
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| |  |||  |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39047785 ccacttgatacaatttttagtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgcggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 39047883  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39047884 atgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctattatacttataaagtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgat 39047983  T
Q  215 gttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||| ||||||    
T  39047984 gttgaatggcattgt 39047998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13757603 - 13757435
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13757603 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 13757504  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
     |||||| |||| | | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13757503 attacttggaatatga-gaatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13757435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Original strand, 12249263 - 12249419
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||    
T  12249263 gtgactattctcatatgactaactaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcataagatgtgtatgttatcttacttaggatg 12249362  T
Q  174 taaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||  ||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  12249363 taagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgt 12249419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13273833 - 13273610
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||   ||| ||||||   |||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13273833 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcgaaaatgttcctttgtgtcaatctgcttatgaattatcgtgactattcttatatgactaagtaaagttgt 13273736  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  13273735 atgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatg 13273636  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
     | ||||||||||||||| |||||||    
T  13273635 agttagttgatgttgaattacattgt 13273610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Original strand, 18981044 - 18981214
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||    
T  18981044 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtgtatgccat 18981143  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18981144 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgt 18981214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Original strand, 49048942 - 49049099
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  49048942 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaat 49049041  T
Q  173 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||  ||| |||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  49049042 gtaagaaatgcttgaaatggtaaaactgtatgaggtagttgatgttgaatgacattgt 49049099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15629860 - 15629638
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||    ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15629860 gccgtttgccacttgatacggtat--ggtcggaaatgttcctttgagtcaaccgacttatgatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaagtggt 15629763  T
Q  108 atgaatgaatgat-tgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 204  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||  ||| |||| |||| | ||||||||||     
T  15629762 atgaatgaatgatatatgttgaatataatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatgataaaactatatga 15629663  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15629662 gatagttgatgttgaatgacattgt 15629638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Original strand, 16571246 - 16571396
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  16571246 tattcttatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgt-aag 16571344  T
Q  179 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16571345 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgt 16571396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16594416 - 16594266
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  16594416 tattcttatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgt-aag 16594318  T
Q  179 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16594317 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgt 16594266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 229
Target Start/End: Original strand, 1937973 - 1938078
Alignment:
Q  123 tattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1937973 tattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 1938070  T
Q  222 gacattgt 229  Q
    ||||||||    
T  1938071 gacattgt 1938078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 10861927 - 10862150
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||   |||||||||||| |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  10861927 gccgtttgccacttgatacggtacttg-tcggaaatgttcctttgagtcaattatcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgt 10862025  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
     |||||||||| || ||||  | ||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  10862026 gtgaatgaatggttatattttgaatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatg 10862125  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
      |||||||||||||||||| |||||    
T  10862126 -aatagttgatgttgaatgatattgt 10862150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 214
Target Start/End: Original strand, 16480034 - 16480120
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16480034 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgctcgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 16480120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Original strand, 7285504 - 7285603
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7285504 tgaatgattgtattgaatatgatgtt-atcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagtt 7285602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 11582027 - 11582095
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11582027 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattggatataatgtttatcatgaaatgtgta 11582095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 15442707 - 15442866
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  15442707 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 15442806  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  15442807 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 15442866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 151
Target Start/End: Original strand, 30263272 - 30263351
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30263272 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 30263351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11515138 - 11515092
Alignment:
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11515138 agaatccttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 11515092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 32495819 - 32495861
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32495819 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 32495861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 11582109 - 11582149
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582109 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 11582149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 13038373 - 13038413
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13038373 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13038413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16210759 - 16210691
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16210759 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatatttatcatgagatgtgta 16210691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3048751 - 3048688
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 126  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3048751 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtatt 3048688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Original strand, 13038299 - 13038350
Alignment:
Q  95 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatga 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  13038299 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtttatcatga 13038350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16210676 - 16210636
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16210676 tggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 16210636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Original strand, 2191684 - 2191853
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaat-gtgtatgcta 159  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||| |||| ||  ||| | |      
T  2191684 cttatgaattgtggtgaccattcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttattatgagatattgttttccc 2191783  T
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    | |||||| |||| |  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  2191784 tattacttggaatat-gataatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgt 2191853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7291753 - 7291710
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7291753 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 7291710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 15952360 - 15952403
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15952360 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 15952403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16417364 - 16417321
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16417364 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 16417321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 16480200 - 16480243
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16480200 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 16480243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 26010455 - 26010498
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26010455 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 26010498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3059026 - 3058966
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatga 146  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||||||||    
T  3059026 ttatataactaagtgaagttgtatgaacgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatga 3058966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15926261 - 15926221
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15926261 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 15926221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 35093890 - 35093783
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  35093890 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 35093792  T
Q  108 atgaatgaa 116  Q
    |||||||||    
T  35093791 atgaatgaa 35093783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2027457 - 2027414
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  2027457 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttcaatgacattgt 2027414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3058941 - 3058910
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3058941 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 3058910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7821851 - 7821777
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  7821851 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 7821777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7829162 - 7829088
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  7829162 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 7829088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 27102783 - 27102857
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  27102783 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 27102857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 27110131 - 27110205
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  27110131 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 27110205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27175543 - 27175469
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  27175543 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 27175469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 38784875 - 38784949
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  38784875 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 38784949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 13912378 - 13912420
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  13912378 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 13912420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 25809 - 26030
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25809 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgatgttgt 25907  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgat-gtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25908 atgattgaatgattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgaga 26007  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  26008 tagttaatgttgaatgacattgt 26030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 70486 - 70702
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  70486 ttgccacttgacacggtttttggtcgagaatgtat-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgat 70584  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  70585 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtacactatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 70684  T
Q  212 gatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  70685 gatgttgaatgacattgt 70702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 93701 - 93560
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  93701 tattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaa 93602  T
Q  181 tacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  93601 tgcttgaattggtgaaactatatgtgataattgatgttgaat 93560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21393265 - 21393045
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||| |||||    
T  21393265 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaattgttt-cttgagtcaattgtcttatgaattattgtgactattcttataagactaagtgacgttgt 21393167  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21393166 atgaaagaatgattgtatgagatatgttgtttatcatgaaatgtgtatgcgatcttacttagaatgtaaggagtacttgaatggtgaaactatatgtgat 21393067  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21393066 agttgatgttgaatgacattgt 21393045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 9731762 - 9731975
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  9731762 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 9731860  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9731861 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 9731960  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  9731961 agttgatgttgaatg 9731975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 1169602 - 1169817
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1169602 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgatttgttatgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 1169700  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169701 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgtcatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 1169800  T
Q  213 atgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  1169801 atgttgaatgacattgt 1169817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23511044 - 23510859
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 129  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23511044 ttttgatcggagaggttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgaatgtattgga 23510945  T
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23510944 tatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatattac-tagaatgtaaggaatgtttgaatcggtgaaactaaatgtgatagttgatg 23510859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Original strand, 10779344 - 10779489
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10779344 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 10779443  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10779444 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 10779489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11462 - 11318
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11462 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 11363  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11362 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 11318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16535313 - 16535162
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16535313 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 16535214  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16535213 aaatgcttaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 16535162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20711214 - 20710993
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  20711214 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgcccattcttatatgactaagtgaagttgt 20711116  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatga-tgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20711115 atgattgaatgattgtgttggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttac-tagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatgtg 20711017  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  20711016 ataattgatgttgaatgacattgt 20710993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28258669 - 28258460
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||   |||| ||  || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28258669 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtattataaactgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 28258572  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28258571 atgattgtgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttgagatgtaaggaatgattgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 28258472  T
Q  216 ttgaatgacatt 227  Q
    ||||||||||||    
T  28258471 ttgaatgacatt 28258460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 29191785 - 29191929
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  29191785 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 29191884  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29191885 gaacgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 29191929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11583055 - 11582846
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  11583055 ttgccacttgatacggtttttgtt-ggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 11582957  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582956 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 11582857  T
Q  212 gatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||    
T  11582856 gatgttgaatg 11582846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 17472823 - 17473044
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||| ||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  17472823 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaagtgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgt 17472921  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  17472922 atgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtga 17473021  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17473022 tagttgatgttgaatgacattgt 17473044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 24184295 - 24184517
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  24184295 gccgtttgccacttgatacggtttt-ggtcggaaatgctt-cttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 24184392  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 204  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||     
T  24184393 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaaccatatga 24184492  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  24184493 gataaatgatgttgaatgacattgt 24184517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 110145 - 110292
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  110145 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgatcgtattggatatgatgtttaccatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 110244  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  110245 aggaatgcttgaatggtgaaactgtatgtgatagttgatgttgaatga 110292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4864343 - 4864124
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  |||||  |||| | ||||| |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  4864343 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtt--cttgaaccaattgtcttaaggatggtggtgactatg-ttatataactaagtgaagttgt 4864247  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  4864246 atgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtga 4864147  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4864146 tagttgatgttgaatgacattgt 4864124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19404588 - 19404438
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  19404588 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatg-ttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaga 19404490  T
Q  179 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19404489 aatgcttgaaatggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 19404438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 1220890 - 1221040
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1220890 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 1220989  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1220990 tgtaaggaatgcttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 1221040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 4201124 - 4201274
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4201124 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 4201223  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4201224 tgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 4201274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 222
Target Start/End: Original strand, 27184830 - 27185023
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 127  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  27184830 tttttgtcggaaatgttt-ctttagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttg 27184928  T
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27184929 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 27185023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23513977 - 23513767
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||| ||| | |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23513977 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttgtgagttgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 23513879  T
Q  113 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagt 210  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23513878 tgagtgattatactttggatatgatgtttaccatgagatatgtgtgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagt 23513779  T
Q  211 tgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||    
T  23513778 tgatgttgaatg 23513767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 18779155 - 18779301
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18779155 gattactcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgta 18779254  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18779255 aggaatggttgaatggtgaaactatatgtggaagttgatgttgaatg 18779301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25425732 - 25425589
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25425732 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaagg 25425633  T
Q  179 aatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425632 aatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 25425589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 21652485 - 21652706
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||| |||| || |||  |||| |||||| | |||  ||||||||||    
T  21652485 cggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttc-cttgaaccaattatcttaagaattgtggtggctatttttatataactaaaagaagttgtat 21652583  T
Q  110 gaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  21652584 gaatgaatgattgtagtttgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactatacgtga 21652683  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  21652684 tagttaatgttgaatgacattgt 21652706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21649855 - 21649689
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  21649855 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 21649756  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21649755 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 21649689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Original strand, 11338021 - 11338170
Alignment:
Q  83 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  11338021 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgattgattgtagtttggatatgatgtttatcataaaatgtgtatgctatcttacttagaaggtaagaaa 11338120  T
Q  181 tacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    | |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  11338121 tgcttgaaatggtgcaactatatgagatagttaatgttgaatgaccttgt 11338170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 22367647 - 22367793
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||    
T  22367647 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagatatgtatgttatcttacttagaatgta 22367746  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    | ||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367747 aggaatgtttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 22367793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11341749 - 11341605
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  11341749 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 11341651  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11341650 gaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 11341605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 22884454 - 22884604
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |  |    
T  22884454 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatcttacttggaatat-ga 22884552  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22884553 gaatgcttgaattggtg-aactatatgtgacagttgatgttgaataacattgt 22884604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Original strand, 25901488 - 25901635
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgt 174  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||| |    
T  25901488 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatat 25901587  T
Q  175 aaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25901588 ga-gaatccttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 25901635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23454032 - 23453808
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttg--agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagtt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||  |||||||   ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23454032 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggtt-cttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattcttatatgactaagtgaagtt 23453936  T
Q  106 gtatgaatgaatgatt--gtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactata 201  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||  |||  ||| |||||| ||||||||    
T  23453935 gtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactata 23453836  T
Q  202 tgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||    
T  23453835 tgaggtagttgattttgaatgacattgt 23453808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23465537 - 23465313
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttg--agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagtt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||  |||||||   ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23465537 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggtt-cttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattcttatatgactaagtgaagtt 23465441  T
Q  106 gtatgaatgaatgatt--gtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactata 201  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||  |||  ||| |||||| ||||||||    
T  23465440 gtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactata 23465341  T
Q  202 tgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||    
T  23465340 tgaggtagttgattttgaatgacattgt 23465313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7424740 - 7424648
Alignment:
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7424740 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 7424648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19498855 - 19498764
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttga 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19498855 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgacagttgatgttga 19498764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24474654 - 24474443
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||   ||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  24474654 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtattaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 24474556  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||          ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24474555 atgaatgaatgat----------atgatatttatcattagatgtatatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtga 24474466  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||| |||||||| |||||||    
T  24474465 tagttgttgttgaataacattgt 24474443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 21234670 - 21234829
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  21234670 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 21234769  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  21234770 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 21234829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11341597 - 11341491
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11341597 ttggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatg 11341498  T
Q  223 acattgt 229  Q
    |||||||    
T  11341497 acattgt 11341491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23505802 - 23505663
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23505802 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgttttatgaattgtggagactattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 23505704  T
Q  113 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    ||| | ||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23505703 tgagtaattatattttggatatgatgattatcatgagatgt 23505663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20615626 - 20615547
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20615626 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttctcatgagatgt 20615547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 110364 - 110406
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  110364 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggatgacattgt 110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 1169923 - 1169965
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169923 aatggtgaaactacatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 1169965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25425580 - 25425474
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |  | || ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25425580 ttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttggaatatgagaattatttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatg 25425481  T
Q  223 acattgt 229  Q
    |||||||    
T  25425480 acattgt 25425474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 27185095 - 27185137
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27185095 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 27185137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Original strand, 9731984 - 9732090
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9731984 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 9732082  T
Q  222 gacattgt 229  Q
    ||||||||    
T  9732083 gacattgt 9732090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 229
Target Start/End: Original strand, 35792275 - 35792425
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaat-gtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||  ||| | |  | |||||| |||| |  |     
T  35792275 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatattgttttccctattacttggaatat-gat 35792373  T
Q  179 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  35792374 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgt 35792425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 37051998 - 37051919
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  37051998 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatatttctcatgagatgt 37051919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11246 - 11203
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11246 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 11203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 1221112 - 1221155
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1221112 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 1221155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7424575 - 7424532
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7424575 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 7424532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 10779560 - 10779603
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10779560 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 10779603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11582774 - 11582731
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11582774 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 11582731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 18779374 - 18779417
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18779374 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 18779417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 22367865 - 22367908
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22367865 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 22367908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 11212986 - 11213026
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11212986 tggtgaaactatatgcgataattgatgttgaatgacattgt 11213026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23513693 - 23513653
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23513693 tggtaaaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 23513653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 29192004 - 29192044
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29192004 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 29192044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 21074870 - 21074913
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  21074870 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaacgacattgt 21074913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 21933512 - 21933586
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  21933512 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 21933586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 21939682 - 21939756
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  21939682 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 21939756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35581180 - 35581106
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  35581180 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 35581106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 37010516 - 37010590
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  37010516 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 37010590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 4201347 - 4201389
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  4201347 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 4201389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 229
Target Start/End: Original strand, 25192390 - 25192420
Alignment:
Q  199 atatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25192390 atatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 25192420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 16183094 - 16183313
Alignment:
Q  9 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 108  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | ||||||||||||||    
T  16183094 ccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgta 16183192  T
Q  109 tgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgata 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16183193 tgaatgaatgattgttttggatatgatgtatatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatgatgaaactatatgtgata 16183292  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16183293 gttgatgttgaatgacattgt 16183313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18909869 - 18909656
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  18909869 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 18909771  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18909770 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 18909671  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  18909670 agttgatgttgaatg 18909656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 53769840 - 53769627
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  53769840 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 53769742  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53769741 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 53769642  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  53769641 agttgatgttgaatg 53769627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 50113218 - 50113436
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||  |||||| | |||||||||||||    
T  50113218 gccgtttgccacttgacacg--ttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatgtttatataactaagtgaagttgt 50113314  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50113315 atgaatgaatgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatataaagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 50113414  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  50113415 agttgatgttgaatgacattgt 50113436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 6147927 - 6148145
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||||| | |||||||  |   |||||||| |||||||||| ||    
T  6147927 gccggtggccacttgatatggtttttggttggaaatgttgtcttgagccaattgtcttatgatttgttgtgacca---ttatatgaataagtgaagtggt 6148023  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6148024 atgatttaatgattgtattggatatgatgtctatcatgaagtgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatacttgaatggtgaaactatatatgat 6148123  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6148124 agttgatgttgaatgacattgt 6148145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22274155 - 22274011
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22274155 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 22274056  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274055 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 22274011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 2450374 - 2450518
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  2450374 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgggtatgctatcttacttagaatgtaag 2450473  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450474 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 2450518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13837938 - 13837733
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13837938 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtt--cttgagtcaattgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 13837841  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13837840 atgaatgaatgtttgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 13837741  T
Q  208 agttgatg 215  Q
    ||||||||    
T  13837740 agttgatg 13837733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17099789 - 17099569
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17099789 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttataaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttg 17099692  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  17099691 tatgaatgaatgattgtattggatatgatg-ttatcatgtaatgtgtatgcaatcttgcttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgag 17099593  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  17099592 atagttaatgttgaatgacattgt 17099569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 22145362 - 22145578
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattctt-atatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||  ||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  22145362 ttgccacttgacatagttcttggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttatgaattgtcgtgaccattttttatatgactaagttaagttgtatga 22145460  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22145461 atgaatgattgtattggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttaagatgtaaggaatgcttggatgatgaaactatatgtgatagtt 22145560  T
Q  212 gatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||| |||||||    
T  22145561 gatgttgaataacattgt 22145578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 218
Target Start/End: Original strand, 17957375 - 17957520
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17957375 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattttattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatg 17957474  T
Q  174 taaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 218  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17957475 taaggaatgcttgaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 17957520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 318695 - 318917
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||  |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  318695 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 318793  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg- 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||     
T  318794 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatcagatgtgtatgctatcttacttaaggtgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 318893  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  318894 atagttgatgttgaatgacattgt 318917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 225
Target Start/End: Original strand, 47786041 - 47786183
Alignment:
Q  85 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaa-agaatac 183  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  47786041 cttatattactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagacgtgtatgctatcttacttagaatgtaagagaatgc 47786140  T
Q  184 ttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 225  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47786141 ttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 47786183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 12350934 - 12351148
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttgg-tcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12350934 ccactcgatatggtttttgggtcggatatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgtagagactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattg 12351032  T
Q  115 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12351033 aatgattgtataaaatatgatgcttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttga 12351132  T
Q  214 tgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |||| |||||||    
T  12351133 tgtggaataacattgt 12351148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 49231326 - 49231180
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaa 176  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  49231326 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgttatatgttatcttacttagaatgtaa 49231227  T
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  49231226 ggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgattatgaatga 49231180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 15469552 - 15469771
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||| ||| |  ||||||  |||| | ||||| |||||||||||||    
T  15469552 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcctgtatgactaagtgaagttgt 15469650  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  15469651 atgaatgaaagattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtga 15469749  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15469750 tagttgatgttgaatgacattg 15469771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16820019 - 16819882
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaa 176  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16820019 gattattcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaa 16819920  T
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16819919 ggaatgcttaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 16819882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35122763 - 35122541
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  35122763 gccgtttgccacttgatacggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaatcgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaaattgt 35122666  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 204  Q
    || |||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||     
T  35122665 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatggttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaaccatatga 35122566  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  35122565 gataaatgatgttgaatgacattgt 35122541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13816511 - 13816367
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  13816511 ttatataagtaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 13816412  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13816411 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 13816367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 53899605 - 53899826
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  53899605 cggttgccacttgatatggttttggatcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtat 53899703  T
Q  110 gaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt-gaatggtgaaactatatgtga 206  Q
     |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||    
T  53899704 aaatgaatacttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttggaatggtgaaaccatatgaga 53899803  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||  ||||||||||||| |||||    
T  53899804 taaatgatgttgaatgatattgt 53899826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7852993 - 7852777
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | | || ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  7852993 gccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgcgactatccttatatgactaagtgaagatg 7852895  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgt 204  Q
    | |||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7852894 tgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctattttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgt 7852795  T
Q  205 gatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7852794 gatagttgatgttgaatg 7852777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 11198653 - 11198875
Alignment:
Q  9 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||  |||| || |  | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11198653 ccggttgccacttgatacggtttttagtcagaaatgttc-cttaagtcaattgtcttaagatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaggttgta 11198751  T
Q  109 tgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||  ||| |||||| |||||||||| |    
T  11198752 tgaatgaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactatatgag 11198851  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  11198852 atagttaatgttgaatgacattgt 11198875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 12562563 - 12562781
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||| |     | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12562563 ttgccacttggtacggtttttgggcggaaatgttc-cttgagtcaattgtcttacgttctatcgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 12562661  T
Q  113 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatag 209  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||| | |||    
T  12562662 tgaatgattgtatgttggatatgatatttatcttgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaaggaatgcttgaattggtaaaactatatgaggtag 12562761  T
Q  210 ttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12562762 ttgatgttgaatgacattgt 12562781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 223
Target Start/End: Original strand, 51159475 - 51159669
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 127  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||  |    
T  51159475 tttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgactatttttgtatgactaagtgaagttgtatgaaagagtaattatattttg 51159573  T
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51159574 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatatgatagttgatgttgaatga 51159669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Original strand, 11062184 - 11062340
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  11062184 gtgactattctcatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattatggatataatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatg 11062283  T
Q  174 taaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||  ||| |||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11062284 taagaaatgcttgaaatggtaaggctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 11062340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Original strand, 19571932 - 19572075
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  19571932 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 19572031  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19572032 gaattggtgaaactatatgtg-tagttgatgttgaatgacattgt 19572075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23491530 - 23491363
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  23491530 cttatgaattgttgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 23491431  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacat 226  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23491430 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacat 23491363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14297574 - 14297353
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  | |||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14297574 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattcttatatgactaa-tgaagttgt 14297477  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||| |    
T  14297476 atgaatgaatgatattatttggatatgattcttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgattgaaatggtgaaaccatatgag 14297377  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  14297376 ataaatgatgttgaatgacattgt 14297353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14303201 - 14302980
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  | |||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14303201 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattcttatatgactaa-tgaagttgt 14303104  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||| |    
T  14303103 atgaatgaatgatattatttggatatgattcttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgattgaaatggtgaaaccatatgag 14303004  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  14303003 ataaatgatgttgaatgacattgt 14302980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 54423145 - 54423001
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  54423145 ttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatga 54423048  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgct 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  54423047 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgct 54423001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8630920 - 8630701
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||  |||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8630920 gccgtttgccacttgacacggtctttggttgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 8630822  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| |  |  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8630821 atgaatgaatgattgtttgaggcatgat-attatcatgagatgtgtatgctatcttgttcggaatgtaaggaatgtttgaatggtgaaactatatgtgat 8630723  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    | |||| |||||||||| ||||    
T  8630722 aattgacgttgaatgactttgt 8630701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Original strand, 15860308 - 15860451
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||    
T  15860308 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcataagatgtgtatgctatcttacttagaatgt-aagaaatgtt 15860406  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15860407 gaattggtgaagctatatgtgatagttgatgttggatgacattgt 15860451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40938736 - 40938586
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  40938736 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtatgttggatatagtgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttataatgtaaag 40938637  T
Q  179 aatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  40938636 aatgcttgaatggtgaaactatatgagatagtaaatgttgaatgacattgt 40938586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14294434 - 14294284
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  14294434 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgt-aag 14294336  T
Q  179 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14294335 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgt 14294284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14300061 - 14299911
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  14300061 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgt-aag 14299963  T
Q  179 aatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14299962 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgt 14299911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17937492 - 17937351
Alignment:
Q  89 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-a 187  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| || | |    
T  17937492 tatgactaagtgaagatgtatgaatgaatgattgtattggatacgatgtttatcatattatgtgtatgctatcttacataggatgtaagaaatgctagta 17937393  T
Q  188 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17937392 ttggtgaaagtatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 17937351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33340949 - 33340812
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  33340949 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 33340850  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  33340849 gaattggtgaaactatatgatgtggttgatgttgaatg 33340812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25057856 - 25057701
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||    
T  25057856 gattattcttgtatgactaagggaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgataagtgtatgctatcttacttaagatgta 25057757  T
Q  176 aagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||  ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25057756 aagaatgtttgaatttgcgaaactatatgtgatagttgatgattggatgacattgt 25057701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17138553 - 17138342
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17138553 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatgttcttttgagccaattgacttatgaattatcgtgactattcttatatgattaagtgaagttat 17138456  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |  ||| || ||| | |||||||||| ||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  17138455 atgaatgaatgattatatgttggaaatgatgtttatcaagtgatgttgcatgttctcttacttaggatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatg 17138356  T
Q  204 tgatagttgatgtt 217  Q
     | |||||| ||||    
T  17138355 aggtagttgttgtt 17138342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Original strand, 17523552 - 17523690
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  17523552 gccgtttgccacttgatatggtttttggtcggaaatg-cttcttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatgactaa-tgacgttgc 17523649  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatga 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17523650 atgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatga 17523690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15575002 - 15574896
Alignment:
Q  122 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 220  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15575002 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 15574904  T
Q  221 tgacattg 228  Q
    ||||||||    
T  15574903 tgacattg 15574896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15614021 - 15613915
Alignment:
Q  122 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 220  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15614021 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 15613923  T
Q  221 tgacattg 228  Q
    ||||||||    
T  15613922 tgacattg 15613915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19945700 - 19945481
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  19945700 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 19945602  T
Q  112 atgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||| || |||  | ||||||||||||||||||| || | || | |  | |||||| |||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19945601 atgaatggttatatgtttgatatgatgtttatcatgagatatcgttttccctattacttggaatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgat 19945503  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  19945502 agttgatgttgaataacattgt 19945481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39654925 - 39654768
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||  ||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||   |||||||||||||    
T  39654925 gtgactattcttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgttggatatgatatttgtcataagatgttgtatgtcctcttacttagaat 39654826  T
Q  173 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    || |  |||||||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||    
T  39654825 gtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttaatgttgaatgatattgt 39654768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33340740 - 33340697
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33340740 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 33340697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 38167070 - 38167007
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 126  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167070 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 38167007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16819802 - 16819760
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16819802 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 16819760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 12031164 - 12031233
Alignment:
Q  85 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12031164 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 12031233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 51159742 - 51159782
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51159742 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 51159782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 176
Target Start/End: Original strand, 14522487 - 14522538
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaa 176  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14522487 ttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaa 14522538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2048953 - 2048915
Alignment:
Q  191 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2048953 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 2048915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2049038 - 2048969
Alignment:
Q  85 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2049038 cttatataactaagtaaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 2048969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10737476 - 10737388
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || | |  ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10737476 ttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttggagtat-gagaatgcctgaaatggtgaaactatatgtgatagttga 10737388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16260261 - 16260149
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||   ||||  |||| |||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16260261 gccgtttgccaattgacacggtctttggtcgaaaatgttt-cttgaactaattgtcttacgaattgtggtgactattcttgtatgactaagtgaagttgt 16260163  T
Q  108 atgaatgaatgatt 121  Q
    |||||||| |||||    
T  16260162 atgaatgagtgatt 16260149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18909647 - 18909541
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18909647 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 18909549  T
Q  222 gacattgt 229  Q
    ||||||||    
T  18909548 gacattgt 18909541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19231036 - 19230968
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  19231036 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcataagatgtgta 19230968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 53769618 - 53769512
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  53769618 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 53769520  T
Q  222 gacattgt 229  Q
    ||||||||    
T  53769519 gacattgt 53769512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 2450590 - 2450633
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2450590 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 2450633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19230953 - 19230914
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19230953 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacgttgt 19230914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22273939 - 22273896
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22273939 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 22273896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 227
Target Start/End: Original strand, 12031249 - 12031285
Alignment:
Q  191 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12031249 gtgaaacgatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 12031285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Original strand, 17957533 - 17957639
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17957533 ttggatatgatatttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 17957631  T
Q  222 gacattgt 229  Q
    | ||||||    
T  17957632 gtcattgt 17957639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 1468885 - 1468959
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  1468885 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 1468959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7852705 - 7852662
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7852705 gaatagtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 7852662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44228354 - 44228281
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44228354 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaatcggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 44228281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 8269673 - 8269707
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8269673 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 8269707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Original strand, 8276784 - 8276818
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8276784 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 8276818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 11883518 - 11883560
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11883518 aatggtaaaactatatgagatagttgatgttgaatgatattgt 11883560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22273951 - 22273741
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22273951 acttgatatgggttttgataggagatgttttattgagtcaattacctaatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 22273852  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22273851 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgattgaattggtgaaactaaatttgatagttgatgt 22273753  T
Q  217 tgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||    
T  22273752 tgaatgacattg 22273741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22283184 - 22282974
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22283184 acttgatatgggttttgattggagatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 22283085  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22283084 gattgtattggatatgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatttgatagttgatgt 22282986  T
Q  217 tgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||    
T  22282985 tgaatgacattg 22282974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 21275503 - 21275716
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  21275503 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 21275601  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21275602 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 21275701  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  21275702 agttgatgttgaatg 21275716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 12643001 - 12643214
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  12643001 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 12643099  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12643100 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 12643199  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  12643200 agttgatgttgaatg 12643214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 42179342 - 42179555
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||| ||||||    
T  42179342 gccgtttgccacttgatacggtttttagtcggaaatgtttt-ttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtggagttgt 42179440  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42179441 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 42179540  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  42179541 agttgatgttgaatg 42179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 19887825 - 19887969
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19887825 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 19887924  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887925 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 19887969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 36891794 - 36892015
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  36891794 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattattgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgt 36891892  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatga-tgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36891893 atgattgaaagattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttac-tagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatgtg 36891991  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  36891992 atagtcgatgttgaatgacattgt 36892015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21140987 - 21140843
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  21140987 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaag 21140888  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21140887 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 21140843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 53 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27260592 - 27260416
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27260592 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaacgattttattggatatgatgtttatcatgagaggtg 27260493  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||| ||| ||||||| || | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27260492 tatgctatcatac-tagaatgcaagggatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 27260416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 3800036 - 3800195
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 162  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3800036 cttatgaattttggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatct 3800135  T
Q  163 tacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3800136 tacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 3800195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16900361 - 16900224
Alignment:
Q  89 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-a 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  16900361 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgggtatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa 16900262  T
Q  188 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16900261 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttaaatgaca 16900224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16993752 - 16993615
Alignment:
Q  89 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-a 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  16993752 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgggtatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa 16993653  T
Q  188 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16993652 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttaaatgaca 16993615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6878513 - 6878298
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||| || ||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||    
T  6878513 ccacttgatatggtttttggtcggaaatattt-cttgagccaattgtcttatgaattgtggtgaccattcttatataactaagtgaagttgtgtgaacga 6878415  T
Q  116 atgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    || ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6878414 ataattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgttgaaactatatgtgatagttg 6878315  T
Q  213 atgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||| |||||||    
T  6878314 atgttgaataacattgt 6878298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 4449312 - 4449535
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| | |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  4449312 gccgtttgccacttgatatggttttggatcggaaatgttt-cttgggccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 4449410  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgt 204  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| ||| |     
T  4449411 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaaccatagga 4449510  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  4449511 gataaatgatgttgaatgacattgt 4449535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25211988 - 25211866
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25211988 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 25211889  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaact 198  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  25211888 aggaatgcttgaatggtgaaact 25211866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8942715 - 8942501
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8942715 ccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatga 8942617  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||| |  |||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8942616 atgattgtattggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatat-gagaattgtttggaatggtgaaactatatgtgatagttg 8942518  T
Q  213 atgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||| |||||||    
T  8942517 atgttgaataacattgt 8942501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 12637255 - 12637469
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12637255 ccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggttaagtgaagttgtatgaatga 12637353  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||| |  |||||  ||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  12637354 atgattgtattggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatat-gagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttg 12637452  T
Q  213 atgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  12637453 atgttgaatgacattgt 12637469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 229
Target Start/End: Original strand, 22581094 - 22581237
Alignment:
Q  89 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||    
T  22581094 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttg 22581193  T
Q  187 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    || |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22581194 aattggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgt 22581237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 270226 - 270035
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || ||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  270226 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccagttgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtataaa 270129  T
Q  113 tgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||    
T  270128 tgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagagtgtaaggaatgcttgaaatggtgaaaccatatg 270035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34823309 - 34823165
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  34823309 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 34823211  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34823210 gaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 34823165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12727270 - 12727126
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  12727270 gattattcttgtatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 12727172  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12727171 gaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 12727126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8887099 - 8886995
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8887099 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaaaatgtaagaaata-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 8887001  T
Q  224 cattgt 229  Q
    ||||||    
T  8887000 cattgt 8886995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Original strand, 24572526 - 24572695
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||| || |||||| ||||||||| | |    
T  24572526 cttatgattgattgagaatattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattatatgttggatatgatgcttgtcatgagatgtgtatgttct 24572625  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||| | ||||  ||| |||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||    
T  24572626 cttacttagaatgtgaggaatgtttgaaatggtaaaactatatgaggtagtagatgtcgaatgacattgt 24572695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28973118 - 28972895
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||  |  |  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28973118 gccgtttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgggttttatcgtgatcatttttatatgactaagtgaagttgt 28973020  T
Q  108 atgaatgaatg----attgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatat 202  Q
    ||||| |||||    | |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||| ||||||| |    
T  28973019 atgaacgaatggccaaatgt--tggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgtgatcttacctaggatgtaaggaatgcttaaatggtaaaactatgt 28972922  T
Q  203 gtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||    
T  28972921 gaggtgtttgatgttgaatgacattgt 28972895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Original strand, 9653983 - 9654140
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 162  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||          ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  9653983 cttatgaattgttgtgaccattcttgtataactatgtgaagttgtatgaatgaatgat----------atgatatttatcatgagatgtatatgctatct 9654072  T
Q  163 tacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9654073 tacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 9654140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7320450 - 7320344
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7320450 ttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatg 7320351  T
Q  223 acattgt 229  Q
    |||||||    
T  7320350 acattgt 7320344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22862446 - 22862342
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22862446 ttggatatgatatttatcatgatatatgtatgttatcttacttagaatgt-aagaaatgttgaattggtgaaactatttgtgatagttgatattgaatga 22862348  T
Q  224 cattgt 229  Q
     |||||    
T  22862347 aattgt 22862342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20014131 - 20013975
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| | | |  | |||||| |||    
T  20014131 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaatttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt-ttttccctattacttggaa 20014033  T
Q  172 tgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    | |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  20014032 tat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 20013975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Original strand, 20628580 - 20628647
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 153  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20628580 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaataattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgt 20628647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 14907583 - 14907742
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  14907583 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 14907682  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  14907683 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 14907742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23819191 - 23819032
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  23819191 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 23819092  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  23819091 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 23819032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25600858 - 25600816
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25600858 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 25600816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 227
Target Start/End: Original strand, 25877210 - 25877252
Alignment:
Q  185 tgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25877210 tgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 25877252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12727010 - 12726906
Alignment:
Q  127 ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12727010 ggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgac 12726911  T
Q  225 attgt 229  Q
    |||||    
T  12726910 attgt 12726906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 229
Target Start/End: Original strand, 22691175 - 22691257
Alignment:
Q  148 atgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  22691175 atgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatgcttgagatagtgaaactacatgagatagttaatgttgaatgactttgt 22691257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 229
Target Start/End: Original strand, 22695822 - 22695904
Alignment:
Q  148 atgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  22695822 atgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatgcttgagatagtgaaactacatgagatagttaatgttgaatgactttgt 22695904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 22787108 - 22787331
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    | |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  22787108 gccgtttgccagttgatacggtaattg-tcggaaatgttc-cttgagtcaattgtcttatgatctatcgtgactattcttatatgactaaatgaagatgt 22787205  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
     |||||||||  || ||  ||| ||||||| |||||||| | ||| |||||| | ||||| ||||||||| |  |||||||| ||| || |||| |||||    
T  22787206 gtgaatgaattgttatatgttgaatatgatatttatcataagatgttgtatgttctcttaattagaatgtgagaaatacttgaaattgtaaaaccatatg 22787305  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
     | ||||||||||||||||| |||||    
T  22787306 aggtagttgatgttgaatgatattgt 22787331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 24827831 - 24827873
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24827831 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 24827873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 461714 - 461646
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  461714 ttatataactaaatgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 461646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Original strand, 12643223 - 12643329
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12643223 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 12643321  T
Q  222 gacattgt 229  Q
    ||||||||    
T  12643322 gacattgt 12643329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 20628662 - 20628702
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20628662 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgtcattgt 20628702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 19888041 - 19888084
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19888041 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 19888084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21140771 - 21140728
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21140771 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 21140728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 21275788 - 21275831
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21275788 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 21275831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 721407 - 721337
Alignment:
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  721407 tcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgt 721337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34823093 - 34823051
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34823093 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 34823051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 3800257 - 3800302
Alignment:
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3800257 agaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 3800302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 225
Target Start/End: Original strand, 43644243 - 43644276
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43644243 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 43644276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12727118 - 12727020
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | | |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12727118 ttggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgag-ctatatgtgatagttgatgttgaatg 12727021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 43644158 - 43644226
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43644158 ttatataactaagtgtagttgtatgaatgaatggttatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 43644226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 11232484 - 11232558
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  11232484 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 11232558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 22514331 - 22514405
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  22514331 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 22514405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 28776932 - 28777006
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  28776932 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 28777006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 5889559 - 5889601
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  5889559 aatggtgaaactatacggtatagttgatgttgaatgacattgt 5889601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Original strand, 24088566 - 24088672
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtg-tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||   ||||||||||||||| |  |||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  24088566 ttggatatgatatttatcataagatgtggtatgtcctcttacttagaatgtgagaaatacttgaagtggtaagactatatgaggtagttgatgttaaatg 24088665  T
Q  223 acattgt 229  Q
    | |||||    
T  24088666 atattgt 24088672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 461631 - 461591
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  461631 tggtgaaactatatctgatagctgatgttgaatgaaattgt 461591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 53 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7827 - 7650
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7827 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtgtatcatgagatgtg 7728  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7727 tatgctatcttacttagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatgagatagtttatgttgaatgacattgt 7650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Original strand, 32287 - 32496
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  32287 acttgatatgggttttaatcggagatgttttcttgagtcaattaccttaggaattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaat 32386  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32387 gattgtattggatatgatgtttatgatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaat-gttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgt 32484  T
Q  217 tgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||    
T  32485 tgaatgacattg 32496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40557 - 40348
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40557 acttgatatgggttttaatcggagatgttttcttgagtcaattaccttaggaattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaat 40458  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40457 gattgtattggatatgatgtttatgatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaat-gttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgt 40360  T
Q  217 tgaatgacattg 228  Q
    ||||||||||||    
T  40359 tgaatgacattg 40348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 38372 - 38522
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  38372 ttgtgattattcttgtatgactaattgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 38471  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38472 tgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgttagttgatgttgaatg 38522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 38594 - 38637
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38594 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 38637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 14842 - 15055
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  14842 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 14940  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14941 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 15040  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  15041 agttgatgttgaatg 15055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Original strand, 15064 - 15170
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15064 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 15162  T
Q  222 gacattgt 229  Q
    ||||||||    
T  15163 gacattgt 15170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 137897 - 138117
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  137897 gccggtggcaactcgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaatggtggtgagtaatcttatatgactaagtgaagttgt 137995  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  137996 atgattgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagaagtgtatgctatcttac-taaaatgtaatgaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 138094  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  138095 tagttgatgttgaatgacattgt 138117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 87504 - 87295
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||            |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  87504 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatg-tttcttgagccaatt------------gttgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgt 87418  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatga-tgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  87417 atgattgaatgattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgaga 87318  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  87317 tagttaatgttgaatgacattgt 87295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10740 - 10522
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| |  |  | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10740 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttaggttttatcgtgattatttttatatgactaagtgaagttgtataaa 10642  T
Q  113 tgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtg-tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 209  Q
     ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||  |||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| || | |||    
T  10641 cgaatggttgtatgttggatatgacgtttatcatagaatgtggtatgtgctcttacttagaatgtaaggaatgattgaatggtaaaactatgtgaggtag 10542  T
Q  210 ttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  10541 ttgatattgaatgacattgt 10522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 1925 - 2145
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  1925 gccgtttgccacttgacacggttttcggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 2023  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  2024 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatgataaaactatatgtgat 2123  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2124 agttgatgttgaatgacattgt 2145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 12826 - 13046
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  12826 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttaaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 12924  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12925 atgaatgaataattttattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttataatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 13024  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13025 agttgatgttgaatgacattgt 13046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 400 - 181
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || || |||||  ||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  400 gccggtggccacttgatatggtttttggacggaaatgtttt-ttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatgtgactaagtgaatttgt 302  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  301 atgattgaatgattgtataggatatgatgcttatcatgagaggtgtatgctaccttac-tagaatgtaatgaatgttgaaatggtgaaactatatgtgat 203  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  202 agttgatgttgaatgacattgt 181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1518 - 1367
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  1518 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 1419  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1418 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 1367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6303 - 6087
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  6303 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaata 6205  T
Q  115 aatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6204 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatcctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 6105  T
Q  212 gatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||| |||||||    
T  6104 gatgttgaataacattgt 6087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1262 - 1220
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 1220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 229
Target Start/End: Original strand, 2925 - 3098
Alignment:
Q  57 aattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  2925 aattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgtttgtattggatatgatgtgtatcatgagatgcgtatg 3024  T
Q  157 ctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3025 ctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaaatggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgt 3098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6594 - 6403
Alignment:
Q  37 cggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 136  Q
    ||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594 cggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 6496  T
Q  137 tttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6495 tttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaataatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 6403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44875 - 44655
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||  |||||   |||||||| || | || ||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  44875 gccgtttgccacttgacatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgttttatgaattgtggagactatgcttgtatgactaagtgaagttgt 44778  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44777 atgaatgaatgattgtatttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtga 44678  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  44677 tagttgatgttgaatgatattgt 44655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39392 - 39178
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||  |||||   |||||||| || | || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39392 gccgtttgccacttgacatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgttttatgaattgtggagactattcttgtatgactaagtgaagttgt 39295  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39294 atgaatgaatgattgtatttggttatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtga 39195  T
Q  207 tagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  39194 tagttgatgttgaatga 39178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39184 - 39068
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39184 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 39085  T
Q  213 atgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  39084 atgttgaatgacattgt 39068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 78558 - 78408
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||| || | |  | |||||| |||| | | |    
T  78558 attcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgattatcatgagatgttgttttccctattacttggaatatga-g 78460  T
Q  179 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  78459 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgt 78408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 20446 - 20601
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20446 ttgtgattattcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatg 20545  T
Q  174 taaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||  || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20546 taagaaaaaataaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 20601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3695 - 3479
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  3695 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaata 3597  T
Q  115 aatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3596 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatcctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 3497  T
Q  212 gatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||| |||||||    
T  3496 gatgttgaataacattgt 3479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8309 - 8256
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatga 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  8309 gccacttgatatggtttttggtcggaaatg-tttcttgagccaattgtcttatga 8256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 95545 - 95325
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  95545 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 95447  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  95446 atgaatgaatgattgtattggatatgataattatcatgagatatgtatgctatcctacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 95347  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  95346 agttgatgttgaatgacattgt 95325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 95219 - 95177
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  95219 aatggtgaaactatatgtgaaagttgatgttaaatgacattgt 95177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 129568 - 129353
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  129568 gccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatg 129470  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  129469 tgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtctgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtga 129370  T
Q  207 tagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  129369 tagttgatgttgaatga 129353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 222
Target Start/End: Original strand, 89938 - 90075
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  89938 ttatataactaagtgaagttgtatgaacgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 90037  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  90038 gaattggtgaaactatatgatgtggttgatgttgaatg 90075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 129281 - 129239
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129281 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 129239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 90147 - 90190
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  90147 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 90190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6292 - 6148
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6292 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaag 6193  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 6148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 216932 - 217000
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  216932 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgagggatatgatgtctatcatgagatgtgta 217000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6076 - 6033
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6076 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 6033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 229
Target Start/End: Original strand, 217016 - 217054
Alignment:
Q  191 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  217016 gtgaaactatatgtgatagttgattttgaatgacattgt 217054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47201 - 46982
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47201 cggtggccacttgatatggtttttgggcgaaaatgttta-ttgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtat 47103  T
Q  110 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgata 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  47102 gaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgcgata 47003  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  47002 gttgatgttgaatgacattgt 46982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 60649 - 60430
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  60649 cggtggccacttgatatggtttttgggcgaaaatgttta-ttgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtat 60551  T
Q  110 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgata 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  60550 gaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgcgata 60451  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  60450 gttgatgttgaatgacattgt 60430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 155402 - 155546
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||     
T  155402 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagttatgtatgatatcttacttagaatgtaag 155501  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155502 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 155546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 155618 - 155661
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  155618 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 155661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 1507 - 1666
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 162  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  1507 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctaact 1606  T
Q  163 tacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1607 tacttataatgtaaggaatggttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 1666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 53 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3692 - 3516
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3692 agtcaattaccttttgaattgttgtgactactcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtg 3593  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| |||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3592 tatgatatcttac-tataatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgctgaatgacattgt 3516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 13283 - 13499
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13283 ttgccacttgacatggtgtttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgttttatgaattgtggagactattcttatatgactaagtgaagttgtatgat 13381  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13382 tgaatgattgtatgggatatgatgcttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactaaatgtgatagtt 13481  T
Q  212 gatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| |||| |||||||    
T  13482 gatgtggaataacattgt 13499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29104 - 28888
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29104 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 29006  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29005 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgctattttacttggaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatctgtgatagtt 28906  T
Q  212 gatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28905 gatgttgaatgacattgt 28888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28780 - 28740
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28780 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 28740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 43051 - 43263
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43051 ccacttgatatgatttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 43149  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43150 atgattgtattaaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaatcatatgtgatagttgatg 43249  T
Q  216 ttgaatgacattgt 229  Q
    || |||||||||||    
T  43250 tttaatgacattgt 43263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 237261 - 237038
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| ||| || | |||||||||||||    
T  237261 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcgtaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaatcgtggtgaccatttttacataactaagtgaagttgt 237163  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  237162 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 237063  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  237062 gatagttgatgttgaataacattgt 237038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 271020 - 270978
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  271020 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 270978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 218
Target Start/End: Original strand, 2162 - 2319
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2162 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgaaatatgtatgctat 2261  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 218  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2262 cttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 2319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 2395 - 2437
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2395 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 2437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 113652 - 113863
Alignment:
Q  17 cacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaa 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||  ||||||| |  | |||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  113652 cacttgataaggtttttggtcggaagtgttc-cttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactactcttatatgactaagggaagttgtatgaatgaa 113750  T
Q  117 tgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  113751 tgattgtattgaatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgcttgaaacggtgaaactacatgtgatagttgatg 113849  T
Q  216 ttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||    
T  113850 ttgaatgacattgt 113863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 108739 - 108517
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  108739 gccgtttgccacttgatatggtatt--gtcggaaatgtttctttgagtcaattggcttatgattcatcgtgactattcttatatgattaagtgaagttgt 108642  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||| || | |||||||||      
T  108641 atgaatgaatgattatatgttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtgagaaatgcttgaagtgataaaactatataa 108542  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    | ||||||||||||||  |||||||    
T  108541 ggtagttgatgttgaagaacattgt 108517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 229
Target Start/End: Original strand, 7781 - 7959
Alignment:
Q  52 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7781 gagtcaattaccgtatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatcatgagatgt 7880  T
Q  152 gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  7881 gtatgatatcctacttagaatgtaaggaatgcatgaaatggtgaaaccatatgagataattgatgttgaatgacattgt 7959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 229
Target Start/End: Original strand, 13170 - 13348
Alignment:
Q  52 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13170 gagtcaattaccgtatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatcatgagatgt 13269  T
Q  152 gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13270 gtatgatatcctacttagaatgtaaggaatgcatgaaatggtgaaaccatatgagataattgatgttgaatgacattgt 13348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20351 - 20247
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgt-aagaaatgttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 20253  T
Q  224 cattgt 229  Q
    ||||||    
T  20252 cattgt 20247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18267 - 18163
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18267 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacctagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 18169  T
Q  224 cattgt 229  Q
    ||||||    
T  18168 cattgt 18163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13275 - 13055
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || ||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  13275 gccggtggccacttgatatggtttttagtcgaaaatgttt-ctcgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatggctaagtgaatttgt 13178  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13177 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacctaggatgtaggaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 13078  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  13077 taattgatgttgaatgacattgt 13055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 145757 - 145533
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| || ||||| |||||||||||||    
T  145757 gccggtggccacttgatatggtttttgatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattattgtatgactaagtgaagttgt 145659  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactata-tg 203  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||| ||||||||||||| ||    
T  145658 atgaatgaatgattttattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgtttgaattggtgaaactatattg 145559  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  145558 tgatagttgatgttaaatgaccttgt 145533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 145438 - 145386
Alignment:
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  145438 agaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgt 145386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 147769 - 147698
Alignment:
Q  85 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  147769 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgagagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 147698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Original strand, 17485 - 17697
Alignment:
Q  9 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 108  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||  ||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17485 ccggtagcaacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcct-gaaccaattgtctttcgaattatggtgactattcttatatggctaagtgaagttgta 17583  T
Q  109 tgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17584 tgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgat 17683  T
Q  208 agttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||||||    
T  17684 agttgatgttgaat 17697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Original strand, 23903 - 24116
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||  ||||  | |||| |||| |||||||  |||||||||||||    
T  23903 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcct-gaaccaattgtctttcgaattatggtgactatttttatatggctaagtgaagttgt 24001  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24002 atgaatgaataattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 24101  T
Q  207 tagttgatgttgaat 221  Q
    || ||||| ||||||    
T  24102 taattgatattgaat 24116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 52361 - 52580
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||  | |||||||| |    
T  52361 gccgtttgccacttgatatggtttg-gatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggtgaagttat 52458  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  52459 atgattgaatgattgtatccgatatgatgtttatcatgggaggtgtatgctatcttac-tagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactgtatgtga 52557  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52558 tagttgatgttgaatgacattgt 52580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 56313 - 56532
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||  | |||||||| |    
T  56313 gccgtttgccacttgatatggtttg-gatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggtgaagttat 56410  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  56411 atgattgaatgattgtatccgatatgatgtttatcatgggaggtgtatgctatcttac-tagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactgtatgtga 56509  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  56510 tagttgatgttgaatgacattgt 56532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 18510 - 18736
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgatta-ttcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18510 gccggtggccacttgatatggtttttgatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccaattcttgtatgactaagtgaagttg 18608  T
Q  107 tatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatc-ttacttagaatgtaaagaatacttgaatgg-tgaaactata- 201  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||  |||||||| ||||||||||     
T  18609 tatgaatgaatgattatattttggatatgatatttatcgtgagatgtgtatgctatctttacttaggatgtaagaaatgtttgaatggatgaaactatat 18708  T
Q  202 tgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709 tgtgatagttgatgttgaatgacattgt 18736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Original strand, 18831 - 18883
Alignment:
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18831 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgt 18883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 345 - 195
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  345 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 246  T
Q  180 atacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  245 atccttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 86 - 46
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  86 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 46  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1077 - 935
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1077 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 978  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  977 atgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15333 - 15191
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  15333 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttattttacttagaatgtaagga 15234  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233 atgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 15191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12129 - 12021
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  12129 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttcagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 12031  T
Q  108 atgaatgaat 117  Q
    ||||||||||    
T  12030 atgaatgaat 12021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 984 - 765
Alignment:
Q  11 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||| |  | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  984 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgtt--cttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatacgactaagtgaagttgtatg 887  T
Q  111 aatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||  | ||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||  ||| |||| |||||| |||||||||| |||    
T  886 aatgaatgattgtatggtgggtatgatgaatgtcacgagatgtgtatgttctcttacttagactgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgagat 787  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  786 agttaatgttgaatgacattgt 765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17764 - 17618
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  17764 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagactgta 17665  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17664 aggaatgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 17618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17545 - 17503
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17545 aatggtgaaactatatatgatagttgatgttgaatgacattgt 17503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54653 - 54486
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  54653 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttctcaggagatgtgtatgctat 54554  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54553 cttac-tagaatgtaaggaat-gttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 54486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 109344 - 109387
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  109344 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 109387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 135
Target Start/End: Original strand, 14590 - 14645
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgat 135  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  14590 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttggatatgat 14645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28028 - 27878
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |  |    
T  28028 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtaggctatcttacttggaatat-ga 27930  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27929 gaatgcttgaattggtg-aactatttgtgatagttgatgttgaatgacattgt 27878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Original strand, 2740 - 2882
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2740 attcttgtatgactaagtggagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatttttaccatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 2839  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2840 atgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 2882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 229
Target Start/End: Original strand, 2958 - 2996
Alignment:
Q  191 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2958 gtgaaactaaatgtgatagtttatgttgaatgacattgt 2996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24128 - 23929
Alignment:
Q  29 tttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||| || || | || ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24128 tttttggtcggaaatgtt--cttgagccaattgtcttatggattgtggagactattcttgtataactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtattga 24031  T
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24030 atatgatgttcatcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtactggtgaaattgtatgttatagttgatgttgaatgacatt 23931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 146005 - 145782
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttgg-tcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  || |||||||||| ||||||     | |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  146005 gccgtttgccacttgatacggtttttgggtcgaaaacgttc-ctcgagtcaattatcttatgttctatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttg 145907  T
Q  107 tatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 203  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  145906 tataaatgaatgattgtatgttggatatgatgattatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaattcttgaattggtaaaactatatg 145807  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
     |||||| |||| |||||||||||||    
T  145806 agatagtggatg-tgaatgacattgt 145782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Original strand, 5770 - 5915
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||   ||    
T  5770 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgataattatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaaggttt 5869  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgt 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5870 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgt 5915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Original strand, 11062 - 11231
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |  ||||||||| | |||||||||||    
T  11062 cttatgaattgttgtgacaattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatggtaattatcatgagaagtgtatgctat 11161  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||   |||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11162 cttacttgagatgtaaggaatgtttgaattggtgaatctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 11231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21696 - 21515
Alignment:
Q  27 ggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 126  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| | || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21696 ggttttgggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgatttgtcgtgcccattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 21598  T
Q  127 ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    ||||||||||                    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21597 ggatatgatg--------------------ctatcttacttagaatgtaaggaatgctttaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 21518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 156
Target Start/End: Original strand, 129390 - 129451
Alignment:
Q  95 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  129390 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 129451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18410 - 18263
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18410 gccgtttgccacttgatatggattttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttatgcctattcttatatgactaactgaagttgt 18312  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18311 atgattgaatgattgatttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30127 - 30044
Alignment:
Q  147 aatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30127 aatgtgtatgctatcttacttaggatgcaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 30044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 95 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8424 - 8289
Alignment:
Q  95 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||   ||  ||||| |||||    
T  8424 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggataagatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacctaggatgtaagatatgtttgaattggtg 8325  T
Q  194 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8324 aaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 8289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 222
Target Start/End: Original strand, 1575 - 1672
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1575 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttgcatagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 1672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 2540 - 2763
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||||   |||||||||  |  ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2540 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatgttcctttgagtcaatcggcttatgaattatcatgactattcttatatgactaagtgaagttgt 2637  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
    |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||  ||| |||||  | ||| |||||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||    
T  2638 atgagtgaatgattatatgttggacatgatgtttatcatgggatgttgtattttctctaacttagaatgtaaaaaatgtttgaaatggtaaaactatatg 2737  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
     | |||||||||||||||||||||||    
T  2738 aggtagttgatgttgaatgacattgt 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 14350 - 14556
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||  | || |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||| ||    
T  14350 gccggtagccacttgacatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagtggt 14448  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  14449 atgaatggatgattgttttggatatgatatttatcatgggatgtgtatgttatcttacttagaatgt-aagaaatgttgaattggtgaaactatatgtga 14547  T
Q  207 tagttgatg 215  Q
    |||||||||    
T  14548 tagttgatg 14556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28394 - 28354
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28394 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 28354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40390 - 40350
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40390 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 40350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28545 - 28503
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28545 aatggtgaaattatatgtgataattgatgttgaatgacattgt 28503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40541 - 40499
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40541 aatggtgaaattatatgtgatatttgattttgaatgacattgt 40499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Original strand, 248741 - 248845
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  248741 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgt-aagaaatgttgaattggtgaaactatttgtgatagttgatgttgaatga 248839  T
Q  224 cattgt 229  Q
    ||||||    
T  248840 cattgt 248845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6906 - 6749
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||||||     
T  6906 gtgactattcatatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagttctcttacttagaac 6807  T
Q  173 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||  ||| |||| |||| | | |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6806 gtaagaaatgcttgaaatgataagactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgt 6749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 53593 - 53462
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  53593 gccgtttgccacttgacacggtttt-ggtcggaaatgttt-cttaagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 53496  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 142  Q
    |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  53495 atgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 53462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 53203 - 53161
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  53203 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgt 53161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2442 - 2285
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||||||     
T  2442 gtgactattcatatatgactaagagaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagttctcttacttagaac 2343  T
Q  173 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||  ||| |||| |||| | | |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2342 gtaagaaatgcttgaaatgataagactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgt 2285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 59675 - 59579
Alignment:
Q  134 atgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  59675 atgtttatcatgagatgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaaatggtgaaactatataagataattgatgttgaatgacattgt 59579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32541 - 32439
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32541 atatgatatttatcatgagatgttgtatgttctcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtgaaactacatgtgatagttgatgttgaatgacat 32442  T
Q  227 tgt 229  Q
    |||    
T  32441 tgt 32439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14613 - 14536
Alignment:
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14613 tatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 14536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 467 - 317
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||| |||| || |    | |||||| |||| |   |    
T  467 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatttgattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttcctattacttggaatatgg-g 369  T
Q  179 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  368 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41737 - 41677
Alignment:
Q  162 ttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41737 ttacttagaatgtaaggaatgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 41677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41605 - 41563
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41605 aatggtgaaactatatgtgataattgatgttgaatgacattgt 41563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2152 - 2085
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 153  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  2152 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattgcatatgatgtttatcatgagatgtgt 2085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2078 - 2038
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2078 tggtgaaaccatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 2038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 119
Target Start/End: Original strand, 1817 - 1884
Alignment:
Q  52 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatga 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1817 gagtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgtatga 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 2723 - 2882
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttaga 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || || |||  |||||||||| ||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |     
T  2723 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtggttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggg 2822  T
Q  171 atgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    || | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2823 atatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 2882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Original strand, 22940 - 23009
Alignment:
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  22940 tcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtaaaactatatgagataattgatg-tgaatgacattgt 23009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Original strand, 5515 - 5676
Alignment:
Q  14 tgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaat 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||| |  |  | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5515 tgccacttgatacagtttttggtcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttaggttttatcgcgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaac 5613  T
Q  114 gaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgt 174  Q
    |||||| | ||  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||   |||||||||||||||    
T  5614 gaatgactatatgttggatgtgatg-ttatcatggaatgttgtatgtgctcttacttagaatgt 5676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Original strand, 6577 - 6646
Alignment:
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  6577 tcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtaaaactatatgagataattgatg-tgaatgacattgt 6646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 505 - 700
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||| || |||||  |||| | || ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  505 ccacttgatatcgttttaggtcggaaatgctt-cttaagccaattgtcttagggattgttgtgaatattcttatatgactaaacgaagttgtatgaatga 603  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    ||||||||||||                  | ||| |||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  604 atgattgtattg------------------agatgagtatactatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttaac 685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 6415 - 6455
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6415 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 6455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6400
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtt-tatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6332 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattat-gtggatatgatgttctatcatgagatgtgta 6400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7960 - 7890
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7960 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 7890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21660 - 21501
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  21660 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgacatgttgtttttccctattacttgg 21561  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  21560 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 21501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25915 - 25756
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  25915 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 25816  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  25815 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgt 25756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4734 - 4697
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4734 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 4697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40559 - 40502
Alignment:
Q  97 agtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40559 agtggagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtatatcatgaaatgtgta 40502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 17353 - 17396
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17353 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgt 17396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 330964 - 331021
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgt 137  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  330964 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgaatgtattttggatatgatgt 331021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 446 - 413
Alignment:
Q  194 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  446 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 156
Target Start/End: Original strand, 4788 - 4849
Alignment:
Q  95 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||||||| |||||||| |||||||||    
T  4788 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagaaatgatgtctatcatgagatgtgtatg 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 229
Target Start/End: Original strand, 27781 - 27818
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27781 tgaaactatatgtgaaagttgatgttgaatgacattgt 27818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 27696 - 27763
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27696 ttatataactaagtgcagttgtatgaatgaatgattat-gtggatatgatgtctatcatgagatgtgta 27763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34466 - 34426
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  34466 tggtgaaactatatgtgatagttaatgttgaataacattgt 34426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38213 - 38139
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  38213 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgt 38139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University