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Alignment Overview

Query: NF8299_low_4 (Length: 498)

Name: NF8299_low_4
Description: NF8299
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8299_low_4
NF8299_low_4
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (38-276)||(43728836-43729074)
chr1 (65-281)||(12247376-12247592)
chr1 (57-276)||(35536020-35536239)
chr1 (78-271)||(45710018-45710211)
chr1 (68-276)||(6166069-6166277)
chr1 (66-276)||(42850177-42850388)
chr1 (75-276)||(31223340-31223542)
chr1 (65-276)||(20800235-20800447)
chr1 (65-276)||(7826312-7826524)
chr1 (75-275)||(25229973-25230173)
chr1 (65-276)||(35569160-35569372)
chr1 (100-282)||(10470581-10470763)
chr1 (66-275)||(11023289-11023498)
chr1 (101-276)||(1199819-1199995)
chr1 (65-275)||(5410596-5410806)
chr1 (75-276)||(13055964-13056165)
chr1 (66-274)||(36205148-36205357)
chr1 (75-276)||(12468179-12468379)
chr1 (75-276)||(50977298-50977499)
chr1 (78-279)||(6464577-6464778)
chr1 (104-276)||(48510903-48511076)
chr1 (104-285)||(47123381-47123563)
chr1 (65-234)||(4369803-4369972)
chr1 (98-276)||(13931612-13931789)
chr1 (103-281)||(26058235-26058414)
chr1 (104-276)||(50406125-50406298)
chr1 (66-271)||(40229433-40229639)
chr1 (109-273)||(9447533-9447696)
chr1 (124-276)||(27801610-27801763)
chr1 (100-249)||(15884217-15884368)
chr1 (110-276)||(34718452-34718619)
chr1 (65-206)||(11051339-11051480)
chr1 (113-234)||(11561826-11561948)
chr1 (180-260)||(49242956-49243036)
chr1 (75-206)||(40821791-40821922)
chr1 (104-249)||(25061221-25061367)
chr1 (66-154)||(31933684-31933772)
chr1 (101-234)||(23628706-23628839)
chr1 (134-222)||(291729-291818)
chr1 (102-276)||(41922-42093)
chr1 (169-274)||(4347034-4347139)
chr1 (195-249)||(29441271-29441325)
chr1 (194-274)||(13344859-13344938)
chr1 (169-276)||(40352451-40352558)
chr1 (194-249)||(43134536-43134591)
chr1 (180-236)||(47085905-47085961)
chr1 (212-274)||(6061246-6061308)
chr1 (167-234)||(6219966-6220034)
chr1 (121-160)||(41856950-41856989)
chr1 (101-219)||(43730059-43730178)
chr1 (86-124)||(291816-291854)
chr1 (190-276)||(7765242-7765327)
chr1 (195-249)||(15576541-15576595)
chr1 (100-138)||(46033210-46033248)
chr1 (195-276)||(29438670-29438750)
chr1 (203-244)||(43134454-43134495)
chr1 (194-242)||(34661949-34661996)
chr1 (98-138)||(50521089-50521129)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (38-279)||(25697914-25698155)
chr8 (65-275)||(27649686-27649896)
chr8 (57-275)||(36113999-36114217)
chr8 (75-276)||(3467483-3467685)
chr8 (101-276)||(3097163-3097339)
chr8 (57-276)||(38114377-38114596)
chr8 (83-249)||(44926799-44926965)
chr8 (68-276)||(8124914-8125122)
chr8 (83-275)||(4941739-4941932)
chr8 (66-281)||(22936745-22936961)
chr8 (65-276)||(28425429-28425641)
chr8 (75-274)||(24897547-24897746)
chr8 (65-276)||(440146-440358)
chr8 (70-276)||(6399065-6399272)
chr8 (112-274)||(42143323-42143486)
chr8 (100-276)||(33626991-33627168)
chr8 (100-275)||(41289016-41289192)
chr8 (65-236)||(40742064-40742236)
chr8 (65-268)||(40742260-40742462)
chr8 (73-236)||(42148953-42149117)
chr8 (65-224)||(43550831-43550991)
chr8 (100-276)||(15206671-15206848)
chr8 (130-274)||(26243129-26243274)
chr8 (66-249)||(38152159-38152342)
chr8 (150-249)||(25497717-25497816)
chr8 (164-279)||(36121499-36121614)
chr8 (104-275)||(31246273-31246445)
chr8 (86-276)||(29023200-29023375)
chr8 (75-236)||(45147247-45147409)
chr8 (66-214)||(34342873-34343019)
chr8 (69-167)||(41981101-41981199)
chr8 (69-249)||(30081635-30081815)
chr8 (180-276)||(30759262-30759358)
chr8 (100-277)||(35615684-35615862)
chr8 (102-276)||(30085596-30085755)
chr8 (104-249)||(3619053-3619198)
chr8 (75-251)||(16915011-16915184)
chr8 (65-181)||(26125512-26125628)
chr8 (103-249)||(11126494-11126641)
chr8 (209-276)||(26125842-26125909)
chr8 (195-249)||(3465424-3465478)
chr8 (101-236)||(2071565-2071700)
chr8 (100-137)||(26243066-26243103)
chr8 (169-281)||(36779435-36779547)
chr8 (65-113)||(25497655-25497703)
chr8 (122-277)||(26490930-26491086)
chr8 (128-237)||(23018099-23018209)
chr8 (104-138)||(24297687-24297721)
chr8 (100-134)||(37458403-37458437)
chr8 (194-249)||(40792188-40792243)
chr8 (103-138)||(41891915-41891950)
chr8 (211-249)||(26575890-26575928)
chr8 (211-256)||(2026176-2026221)
chr8 (169-236)||(32767481-32767547)
chr8 (209-249)||(26575903-26575943)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (277-460)||(29758424-29758607)
chr5 (57-275)||(13253038-13253256)
chr5 (69-276)||(32454487-32454695)
chr5 (86-282)||(3667821-3668018)
chr5 (65-277)||(41834838-41835051)
chr5 (86-276)||(35760156-35760347)
chr5 (75-276)||(40885166-40885369)
chr5 (65-276)||(22482135-22482347)
chr5 (65-276)||(32030662-32030872)
chr5 (110-276)||(39987921-39988088)
chr5 (102-276)||(2430251-2430425)
chr5 (75-278)||(33953854-33954057)
chr5 (104-276)||(8049005-8049178)
chr5 (83-276)||(40791024-40791217)
chr5 (83-276)||(42146272-42146465)
chr5 (65-275)||(9275439-9275650)
chr5 (67-276)||(10058022-10058232)
chr5 (75-276)||(40495312-40495513)
chr5 (86-259)||(41740564-41740738)
chr5 (104-276)||(7385886-7386059)
chr5 (75-273)||(7714896-7715095)
chr5 (75-273)||(24045787-24045985)
chr5 (77-249)||(3060205-3060376)
chr5 (105-276)||(5710340-5710511)
chr5 (100-249)||(4292130-4292280)
chr5 (100-251)||(16158444-16158596)
chr5 (76-273)||(27021085-27021283)
chr5 (110-274)||(34106903-34107068)
chr5 (101-252)||(7178760-7178911)
chr5 (144-260)||(23914224-23914341)
chr5 (65-203)||(28869530-28869668)
chr5 (145-260)||(2483684-2483800)
chr5 (102-249)||(2694741-2694889)
chr5 (100-221)||(4569089-4569212)
chr5 (100-249)||(16843519-16843660)
chr5 (195-249)||(35847871-35847925)
chr5 (100-254)||(2861618-2861776)
chr5 (104-249)||(3747572-3747717)
chr5 (128-237)||(20068923-20069033)
chr5 (98-160)||(41959440-41959502)
chr5 (189-260)||(19784884-19784955)
chr5 (209-256)||(41741597-41741644)
chr5 (211-249)||(33082344-33082382)
chr5 (100-138)||(40979999-40980037)
chr5 (169-221)||(22811076-22811129)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (69-277)||(7472628-7472836)
chr2 (75-281)||(39141420-39141626)
chr2 (86-276)||(9988456-9988647)
chr2 (86-277)||(2213468-2213660)
chr2 (65-276)||(5916197-5916408)
chr2 (65-276)||(36312218-36312429)
chr2 (86-277)||(28127241-28127433)
chr2 (78-273)||(14821117-14821312)
chr2 (66-271)||(42515936-42516141)
chr2 (105-276)||(1944994-1945166)
chr2 (86-276)||(44619016-44619207)
chr2 (66-275)||(32501928-32502137)
chr2 (78-276)||(8170267-8170465)
chr2 (65-276)||(36548141-36548352)
chr2 (76-260)||(28261246-28261431)
chr2 (100-272)||(31562646-31562816)
chr2 (86-276)||(2215216-2215405)
chr2 (86-276)||(23358220-23358410)
chr2 (76-252)||(7296107-7296284)
chr2 (65-277)||(26207883-26208096)
chr2 (65-276)||(28641583-28641795)
chr2 (135-276)||(2213658-2213800)
chr2 (65-252)||(7295327-7295513)
chr2 (101-277)||(25747836-25748012)
chr2 (112-285)||(42089474-42089652)
chr2 (134-277)||(31224690-31224834)
chr2 (100-276)||(3853876-3854053)
chr2 (126-274)||(34433263-34433413)
chr2 (100-270)||(18511078-18511249)
chr2 (104-249)||(16467066-16467212)
chr2 (65-207)||(25940265-25940408)
chr2 (172-275)||(30007509-30007613)
chr2 (104-234)||(27911386-27911517)
chr2 (134-249)||(45714650-45714766)
chr2 (101-242)||(8041257-8041397)
chr2 (125-249)||(41580692-41580817)
chr2 (103-222)||(43436290-43436410)
chr2 (104-276)||(3602415-3602587)
chr2 (67-222)||(39106678-39106833)
chr2 (145-249)||(38600425-38600530)
chr2 (104-160)||(2234907-2234962)
chr2 (195-249)||(23267346-23267400)
chr2 (101-273)||(11240648-11240820)
chr2 (180-249)||(34997218-34997287)
chr2 (169-276)||(12110919-12111026)
chr2 (103-260)||(43858183-43858341)
chr2 (66-113)||(45714767-45714814)
chr2 (169-234)||(23359927-23359993)
chr2 (211-276)||(7474196-7474261)
chr2 (98-139)||(15283350-15283391)
chr2 (209-254)||(32496578-32496623)
chr2 (180-276)||(30599859-30599955)
chr2 (100-136)||(37640236-37640272)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (69-276)||(13739142-13739349)
chr6 (78-276)||(13744651-13744849)
chr6 (78-276)||(6208020-6208218)
chr6 (57-252)||(31132388-31132583)
chr6 (65-276)||(33898962-33899174)
chr6 (81-276)||(29409208-29409404)
chr6 (75-276)||(10826033-10826235)
chr6 (100-274)||(17829957-17830132)
chr6 (75-236)||(16442347-16442509)
chr6 (65-222)||(16548071-16548229)
chr6 (100-276)||(1312396-1312573)
chr6 (65-249)||(21455814-21455997)
chr6 (86-260)||(699511-699684)
chr6 (101-276)||(21254836-21255011)
chr6 (77-249)||(7215519-7215690)
chr6 (101-282)||(5584000-5584181)
chr6 (101-274)||(16121960-16122134)
chr6 (180-277)||(29399749-29399845)
chr6 (100-249)||(26274611-26274760)
chr6 (194-249)||(32599446-32599501)
chr6 (195-249)||(15151489-15151543)
chr6 (194-276)||(3605709-3605790)
chr6 (194-274)||(8551052-8551131)
chr6 (211-251)||(10683831-10683871)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (65-276)||(42318262-42318473)
chr3 (77-276)||(10853224-10853424)
chr3 (65-276)||(20813078-20813289)
chr3 (65-276)||(38125399-38125610)
chr3 (86-277)||(26519617-26519809)
chr3 (65-281)||(53074835-53075051)
chr3 (75-276)||(38172264-38172466)
chr3 (78-276)||(48189399-48189597)
chr3 (102-274)||(8424689-8424861)
chr3 (65-276)||(10334070-10334282)
chr3 (65-276)||(52966766-52966978)
chr3 (66-276)||(3348176-3348387)
chr3 (78-276)||(44939373-44939570)
chr3 (76-249)||(35425277-35425450)
chr3 (65-276)||(15511333-15511544)
chr3 (75-276)||(50664701-50664902)
chr3 (100-276)||(30811489-30811665)
chr3 (65-281)||(23496256-23496466)
chr3 (65-270)||(35930670-35930876)
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Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
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43729074 tatgtaaaatgaaaatgataatttaggtaaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaaca 43728975  T
138 tcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattcta 237  Q
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43728974 tcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattcta 43728875  T
238 tcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
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43728874 tcaaaatcaattctctccatcgctataccaaacacacac 43728836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
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12247376 taaatacaattaaaagggtaatttggtcatttaatgttcaaaatcaattttgattcaaattctccaaacaacatcaactcataaaaatcacttttaaaca 12247475  T
165 agtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
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12247476 agtgtatccaaacataattaatttacatccaactcacttttaaccagaatcaattctcttaaactcaattctattaaaatcaattttcatcaccgctata 12247575  T
265 ccaaacacacacaaaga 281  Q
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12247576 ccaaacacacactaaga 12247592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
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Target Start/End: Original strand, 35536020 - 35536239
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35536020 aatttagttaaatacaattaaaagggtaatttggtcatttaatgttcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcact 35536119  T
157 tttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctcca 256  Q
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35536120 tttaaacgagtgtatctaaacataaccaattcacgtcaaagtcacttttaatcaaaattaattctctcaaactcaattctattaaaattaattttcatca 35536219  T
257 ccgctataccaaacacacac 276  Q
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Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
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Target Start/End: Original strand, 45710018 - 45710211
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45710018 aaggataatttagtcattagacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctagtaaagtgtattcaaac 45710117  T
178 ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaaca 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
45710118 ataatcaattcacatacaactcacttttaatcaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaaca 45710211  T

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Target: chr1; HSP #5
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Target Start/End: Original strand, 6166069 - 6166277
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68 atacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagt 167  Q
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6166069 atacaattaaaagggtaagttggtcattacccatttaaaatcaattttgattcaaactacccaaacaacatcaactcctaagaatcacttttaaatgagt 6166168  T
168 ttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctatacca 267  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
6166169 gtatccaaacataatcaattcagatcaaactcacttctaaccaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgcgatacca 6166268  T
268 aacacacac 276  Q
    |||||||||    
6166269 aacacacac 6166277  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42850388 - 42850177
Alignment:
66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataa 165  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
42850388 aaatacaattaaaaggataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaggaa 42850289  T
166 gtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
42850288 gtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccata 42850189  T
265 ccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||    
42850188 ccaaacacacac 42850177  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 31223340 - 31223542
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||    
31223340 taaaaggatagtttggtcattacacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtatcca 31223439  T
175 aacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| | ||||||||||    
31223440 aacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctattaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacaca 31223539  T
274 cac 276  Q
    |||    
31223540 cac 31223542  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20800447 - 20800235
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||  |    
20800447 taaatacaattaaaaggataatttagtcattatacattcaaaatcaatattgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataa 20800348  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| ||    
20800347 agtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccat 20800248  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
20800247 accaaacacacac 20800235  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7826524 - 7826312
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
7826524 taaatacaattaaaaggataacttggtcattacacatttaaaatcaattttgattcaacctatccaaacaacatcaattcataagaatcacttttaagtg 7826425  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||  || |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
7826424 agggtacccaaacataaatcaattcacatcaagctcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattttctccaccgccaa 7826325  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
7826324 accaaacacacac 7826312  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Original strand, 25229973 - 25230173
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| ||||||    
25229973 taaaaggataatttggtcattacacactcaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactaataagaatcacttctattaaagtgtatcca 25230072  T
175 aacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
25230073 aacataatcaattcacattcaactcacttttaactaaaatcaattctctcaaactcagttctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaacacac 25230172  T
275 a 275  Q
    |    
25230173 a 25230173  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35569372 - 35569160
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||| | || ||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||  |    
35569372 taaatacaattaaaatgatagtttagtcattatacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataa 35569273  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| ||    
35569272 agtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccat 35569173  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
35569172 accaaacacacac 35569160  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Original strand, 10470581 - 10470763
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactc 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    | || ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
10470581 attcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctgttaacgtgtatccaaacataatcaatttacattcaactc 10470680  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacacaaagac 282  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||    
10470681 acttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccctaccaaacacacactaagac 10470763  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11023498 - 11023289
Alignment:
66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataa 165  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| | |    
11023498 aaatacaattaaaagggtaagttggtcattacccatttaaaatcaattttgattcaaactacccaaacaatatcaactcgtaaaaattacttttaattga 11023399  T
166 gtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctatac 265  Q
     | |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
11023398 atgtatccaaacataatcaattcacctaaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcaccaccgccatac 11023299  T
266 caaacacaca 275  Q
    ||||||||||    
11023298 caaacacaca 11023289  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Original strand, 1199819 - 1199995
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
1199819 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaatccacaagaatcacttctaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactc 1199918  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
1199919 acttttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 1199995  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Original strand, 5410596 - 5410806
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
5410596 taaatacaattaaaaggatagtttggtcattacatattcaaaatcaattatgattcaaactatccaaacaacatcaagtcataagaatcacttttaagt- 5410694  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| || || |||| |     
5410695 agtgtattcaaacataaatcaatttacatccaactcacttttaatcaaaatcaattctttcaaattcaattatatcaaaatcaattctcgccgccgccaa 5410794  T
264 accaaacacaca 275  Q
    ||||||||||||    
5410795 accaaacacaca 5410806  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 13055964 - 13056165
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    |||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||    
13055964 taaaagggtaatttcgtcattacgcattcaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatcaactcataaaaatcacttttaa-taagcgtattca 13056062  T
175 aacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
13056063 aacataaatcaattcacactcaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactccattctatcaaaatcaattatcgccaccgccataccaaacaca 13056162  T
274 cac 276  Q
    |||    
13056163 cac 13056165  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Original strand, 36205148 - 36205357
Alignment:
66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataa 165  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
36205148 aaatacaattaaaaggttaatttggtcattaaacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaagcaacattcactcgtaagaatcacttttaaataa 36205247  T
166 gtttatccaaac-ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
    |||||||||| | | || ||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| || ||||||  |||    
36205248 gtttatccaatcaaaaaccaattcatatctaacccacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattccgttaaaatcaattctcaccaccgtcata 36205347  T
265 ccaaacacac 274  Q
    ||||||||||    
36205348 ccaaacacac 36205357  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 12468179 - 12468379
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
12468179 taaaaggataatttggtcattgtacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaa-atcaactcataaaaatcacttttaaaaaagtgtatcca 12468277  T
175 aacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |  || |||| ||||||||||||    
12468278 aatataaatcaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattatatcaaactcaattctatc-aaatcaattcttcccgccgccataccaaacaca 12468376  T
274 cac 276  Q
    |||    
12468377 cac 12468379  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 50977499 - 50977298
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    |||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||||  ||||||    
50977499 taaaagggtaatttagtcattacacattcaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatctactcataaaaatcacttgtaa-taagcgtatcca 50977401  T
175 aacataat-caattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    |||||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
50977400 aacataaaacaattcacaccaaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactccattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 50977301  T
274 cac 276  Q
    |||    
50977300 cac 50977298  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 279
Target Start/End: Original strand, 6464577 - 6464778
Alignment:
78 aagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaac 177  Q
    |||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| |||  ||||    
6464577 aaggataatttagtcattagacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctagtaaagtgtataaaaac 6464676  T
178 ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacaca 277  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||    
6464677 ataatcaattcacattaaactcacttttaaccaaaatgaactcactcaaactcaattatatcaaaatcaattctcgtcaccactataccaaacaaacaca 6464776  T
278 aa 279  Q
    ||    
6464777 aa 6464778  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Original strand, 48510903 - 48511076
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 202  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
48510903 aaaatcaattttgatacatactattcaaacaacatcaattcataagaatcacttttaagcaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcact 48511002  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
48511003 tttaaccaaaatcaattatctcaaactcaattcaatcaaaatcaattctcgccgccgccataccaaacacacac 48511076  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 104 - 285
Target Start/End: Original strand, 47123381 - 47123563
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
47123381 aaaagcaattttgatttaatgtatccaaacaacaccaacttataagaatcacttttaacgaagtgtatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcact 47123480  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacacaaagacaaa 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
47123481 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatttttgccaccgccataccaaacacacactaaaacaaa 47123563  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4369972 - 4369803
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
4369972 taaatacaattaaaaggataatttggtcattacacatttaaaatcaattttgattcaacctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtg 4369873  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaatt 234  Q
    ||  || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
4369872 agggtacccaaacataaatcaattcacat-caactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaatt 4369803  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Original strand, 13931612 - 13931789
Alignment:
98 atattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaac 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
13931612 atattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacttgtaagaatcatgtttaagtgagtatatccaaacataatcaattcacatcaaac 13931711  T
198 tcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||    
13931712 tcatttttaaacaaaatcaatttttggaaactcaattctatcaaaatcaa-tcccaccaccgccataccaaacacacac 13931789  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
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Target Start/End: Original strand, 26058235 - 26058414
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103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcac 201  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| || ||||    
26058235 caaaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaattcac 26058334  T
202 ttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacacaaaga 281  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||    
26058335 ttttaatcaaaatcaattctcttaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacactaaga 26058414  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Original strand, 50406125 - 50406298
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104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||  ||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
50406125 aaaaacaattttgattcaatgtatccaaacaacaacaacttataagaatcatttttaacgaagtgcatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcact 50406224  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
50406225 tttaatcaaaatcaaatctttcaaactcaattttatcaaaatcaattctcgccaccgctataccaaacacacac 50406298  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 40229639 - 40229433
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66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataa 165  Q
    |||||| | ||||||| || ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||    
40229639 aaatactattaaaaggatagtttggtcattacacgttcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcagaagaatcacctgtaagaaa 40229540  T
166 gtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||  |||    
40229539 gtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattccaacaaaatcaattctatcaaaatcaattttcatcaccgtcata 40229440  T
265 ccaaaca 271  Q
    |||||||    
40229439 ccaaaca 40229433  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 273
Target Start/End: Original strand, 9447533 - 9447696
Alignment:
109 caattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaag 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
9447533 caattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcgaaagaatcacttttaaatgagtatatctaaacataatccattcacatcaaactcacttttaa- 9447631  T
209 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    | ||| || |||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
9447632 ccaaaccatttctctcaaattcaattttattaaaatcaattctcttcaccgccataccaaacaca 9447696  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 124 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27801763 - 27801610
Alignment:
124 ctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctc 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
27801763 ctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcacttttaatcaaaatcaattctc 27801664  T
223 tcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||    
27801663 ttaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaacacacac 27801610  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Original strand, 15884217 - 15884368
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100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtt-tatccaaacataa-tcaattcacatccaac 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| | |   || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
15884217 attcaaaatcaattttgatccaaactatccaaacaacatgaatttataaaaatcactttttactttattgtatccaaacataaatcaattcacatccaac 15884316  T
198 tcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
15884317 tcacttttaaccaaaatcaattctgtcaaactcaactctatcaaaatcaatt 15884368  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 34718452 - 34718619
Alignment:
110 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaag 208  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||     
34718452 aattttaattcaaagtatccaaacaactataattcataagaatcacttttgtacaagtgtattcaaacataaatcaatttatatcaaactcacttttaac 34718551  T
209 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||||    
34718552 caaaattaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaattttttccaccgtcaaaccaaacacacac 34718619  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11051480 - 11051339
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| |     
11051480 taaatataattaaaaggataatttggtcattacacattcaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaacat-aactcttaagaaccatttttaagtg 11051382  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcactttta 206  Q
     || ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
11051381 tgtgtattcaaacataaatcaattcacatcaaactcactttta 11051339  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 234
Target Start/End: Original strand, 11561826 - 11561948
Alignment:
113 tttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaa 211  Q
    ||||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
11561826 tttgagtcaaactatccaaattaaatgaactcataagaatcacttttaaaatagtatattcaaatataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaa 11561925  T
212 aatcaattctctcaaactcaatt 234  Q
    ||| |||||| ||||||||||||    
11561926 aattaattctttcaaactcaatt 11561948  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 49243036 - 49242956
Alignment:
180 aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgc 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||    
49243036 aatcaattcacatccaactcatttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaattaattctcaccaccgc 49242956  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Original strand, 40821791 - 40821922
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| |||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||| |    |||| |||||     
40821791 taaaaggataatttagtcattgcacattcaaactcaattttgattcaaattatccaaataacatcaacaaataagaatcacttatgttaaagtgtatcct 40821890  T
175 aacataatcaattcacatccaactcactttta 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
40821891 aacataatcaattcacattcaactcattttta 40821922  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 249
Target Start/End: Original strand, 25061221 - 25061367
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  | |   ||||||||||| |||||||| |  | |||||||||    
25061221 aaaatcaattttgattcaaattatccaaacatcatcaattgataagaatcacttttatgttaaggtatccaaacataaatcaatttatgttcaactcact 25061320  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||| ||||||||||||   |||| |||||| || |||||||||||    
25061321 tttaaccaaaatcaattcaaccaaaatcaattttaacaaaatcaatt 25061367  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 154
Target Start/End: Original strand, 31933684 - 31933772
Alignment:
66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatca 154  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
31933684 aaatacaattaaaaggataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaatca 31933772  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23628839 - 23628706
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactc 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||| |||||  | | | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
23628839 ttcaaaagtaattttgattcaaaccacccaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactc 23628741  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaatt 234  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
23628740 acttttagtcaaaatcaattatctcaaactcaatt 23628706  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 291818 - 291729
Alignment:
134 aacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctc 222  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||    
291818 aacaacaactcataacaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataaaccaattcatctcaaactcacttttaatcaaaatcaattctc 291729  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 276
Target Start/End: Original strand, 41922 - 42093
Alignment:
102 tcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactca 200  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| | || | |||||||||||||||   | | ||    ||||||||| ||||||||| | |||||||    
41922 tcaaaataaattttgatccaagctatccaaacaacgtgaatttataagaatcacttttgtcttaatt----caaacataaatcaattcacgttcaactca 42017  T
201 cttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    | ||| |  ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||    
42018 ccttttactaaaatcaattctaacaaaatcaattttatcaaaatcaattttctccaccgcagaatcaaacacacac 42093  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 274
Target Start/End: Original strand, 4347034 - 4347139
Alignment:
169 tatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctatacca 267  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||   ||||    
4347034 tatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattct-acaaaatcaattctaccaaaatcaattttttccaccgcacaacca 4347132  T
268 aacacac 274  Q
    |||||||    
4347133 aacacac 4347139  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Original strand, 29441271 - 29441325
Alignment:
195 aactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
29441271 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatt 29441325  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 274
Target Start/End: Original strand, 13344859 - 13344938
Alignment:
194 caactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
13344859 caactcacttttaaccaaaatcaattcta-caaaatcaattcaatcaaaatcaattatcttcaccgcccaaccaaacacac 13344938  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 276
Target Start/End: Original strand, 40352451 - 40352558
Alignment:
169 tatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctatacca 267  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||   ||||    
40352451 tatccaaacataaatcactttacattaaactcacttttaaccaaaatcaattc-cacaaaatcaattctatcaaaatcaattctcctcaccgcacaacca 40352549  T
268 aacacacac 276  Q
    |||||||||    
40352550 aacacacac 40352558  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 249
Target Start/End: Original strand, 43134536 - 43134591
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194 caactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
43134536 caactcacttttaaccaaaatcaattctcttaaactcaattctatccaaataaatt 43134591  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Original strand, 47085905 - 47085961
Alignment:
180 aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattct 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||    
47085905 aatcaattcacattcaactcacttttaattaaaatcaattctatcaaaatcaattct 47085961  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 274
Target Start/End: Original strand, 6061246 - 6061308
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212 aatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||||    
6061246 aatcaattatctcaaattcaattctatcaaaatcaattttcaccaccgtcaaaccaaacacac 6061308  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6220034 - 6219966
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167 tttatccaaacata-atcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaatt 234  Q
    |||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
6220034 tttatccaaacatgtatcaatttaaatccaacacacttttaatcaaaatcaattatatcaaactcaatt 6219966  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 160
Target Start/End: Original strand, 41856950 - 41856989
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121 aaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
41856950 aaactatccaaacaaaatcaactaataagaatcactttta 41856989  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43730178 - 43730059
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactc 199  Q
    ||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| || || | ||||||||||||| |  ||||   |||||||||| || |||||| |||  ||||||    
43730178 ttcaaaaacaattttgatctcaaccatccaaacaaaataaattaataagaatcacttatgcataaaggtatccaaacacaaatcaattgacactcaactc 43730079  T
200 acttttaagcaaaatcaatt 219  Q
    |||||||| |||||||||||    
43730078 acttttaaccaaaatcaatt 43730059  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 291854 - 291816
Alignment:
86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaac 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
291854 tttggtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaac 291816  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7765327 - 7765242
Alignment:
190 catccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||   |||||||||||||    
7765327 catccaactcacttttattcataatcaattatgtaaaa-tcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgcataaccaaacacacac 7765242  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Original strand, 15576541 - 15576595
Alignment:
195 aactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||    
15576541 aactcacttttaattaaaatcaattctcttaaactcaatttaattaaaatcaatt 15576595  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 46033248 - 46033210
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 138  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
46033248 attcaaaatcaattttgataaaaactatccaaacaacat 46033210  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Original strand, 29438670 - 29438750
Alignment:
195 aactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| |   |||||||||||    
29438670 aactcacttttcatcaaaatcaattctg-caaaatcaattttatcagaatcaattctctccaccgcaaattcaaacacacac 29438750  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 244
Target Start/End: Original strand, 43134454 - 43134495
Alignment:
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaat 244  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
43134454 tttaaccaaaatcaattatctcaaactcaattctattaaaat 43134495  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 242
Target Start/End: Original strand, 34661949 - 34661996
Alignment:
194 caactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 242  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
34661949 caactcatttttaatcaaa-tcaattctctcaaactcaattttatcaaa 34661996  T

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Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 50521129 - 50521089
Alignment:
98 atattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 138  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
50521129 atattcaaaaacaattttgatcaaaactatccaaacaacat 50521089  T

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Target: chr8 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25698155 - 25697914
Alignment:
38 tatgtacaatgaaaatgataatttaggtaaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaaca 137  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25698155 tatgtaaaatgaaaatgataatttaggtaaatacaaataaaagggtaatttggttatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaaca 25698056  T
138 tcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattcta 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25698055 tcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattcta 25697956  T
238 tcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacacaaa 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
25697955 tcaaaatcaattctctccaccgctataccaagcacacacaaa 25697914  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Original strand, 27649686 - 27649896
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
27649686 taaatataattaaaagggtaatttggtcattcaatgttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaatg 27649785  T
165 agtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||   |    
27649786 agtgtatctaaacatattcaattcatatccaaatcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgcccaa 27649885  T
265 ccaaacacaca 275  Q
    |||||||||||    
27649886 ccaaacacaca 27649896  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 57 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36114217 - 36113999
Alignment:
57 aatttaggtaaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcact 156  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
36114217 aatttagttaaatacaattaaaagagtaatttggtcatttaatgttcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaatatcaactcataagaatcact 36114118  T
157 tttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctcca 256  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
36114117 tttaaacgagtgtatccaaacataaccaatctacatcaaacttacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccg 36114018  T
257 ccgctataccaaacacaca 275  Q
    |||  ||||||||||||||    
36114017 ccgtcataccaaacacaca 36113999  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 3467483 - 3467685
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
3467483 taaaaggatagtttggtcattccatatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaccaacatcaattcataagaatcacttttaaataaatatatcca 3467582  T
175 aacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
3467583 aacagaaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 3467682  T
274 cac 276  Q
    |||    
3467683 cac 3467685  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3097339 - 3097163
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
3097339 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactc 3097240  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||    
3097239 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccactgctataccaaacacacac 3097163  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 276
Target Start/End: Original strand, 38114377 - 38114596
Alignment:
57 aatttaggtaaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcact 156  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
38114377 aatttaggaaaatacaattaaaagggtaatttggtcattgaatgttcaaaatcaatttttgttcgaaatattcaaacaacctcaactcataagaatcact 38114476  T
157 tttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctcca 256  Q
    |  ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    
38114477 tgaaaccgagtgtatccaaacataatcaattcacatccaacttacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaataaattctcacca 38114576  T
257 ccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||| | |||||||||||||    
38114577 ccgccaaaccaaacacacac 38114596  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 83 - 249
Target Start/End: Original strand, 44926799 - 44926965
Alignment:
83 taatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataat 182  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
44926799 taatttggtcattttacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaataacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataat 44926898  T
183 caattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
44926899 caattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaactcaatt 44926965  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 68 - 276
Target Start/End: Original strand, 8124914 - 8125122
Alignment:
68 atacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagt 167  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
8124914 atacaattaaaagggtaagttggtcattatccatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacttcaactcctaagaatcacttttaaatgagt 8125013  T
168 ttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctatacca 267  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||   || |||||||||    
8125014 gtatccaaacataatcaattcacatcaaactcacttctaaccaaaatcaattctctcaaactcgattcaaccaaaatcaattatcaggactgctatacca 8125113  T
268 aacacacac 276  Q
    |||||||||    
8125114 aacacacac 8125122  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4941932 - 4941739
Alignment:
83 taatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aa 181  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
4941932 taatttggtcattttacattcaaaatcaattttaattcaaattattcaaacaacatcaactcataagaatcgcttttaaataattttatccaaacataaa 4941833  T
182 tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacaca 275  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||    
4941832 tcaattcacctcaaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattatatcagaatcaattctagccaccgccataccaaacacaca 4941739  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22936961 - 22936745
Alignment:
66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataa 165  Q
    |||||||| ||||||| || ||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||  ||    
22936961 aaatacaactaaaaggatagtttagtcattatatattcaaaaccaaatttgattcaaactatccaaacaacatcaatccacaagaatcacttctaataaa 22936862  T
166 gtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
22936861 gtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccata 22936762  T
265 ccaaacacacacaaaga 281  Q
    |||||||||||| ||||    
22936761 ccaaacacacactaaga 22936745  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28425641 - 28425429
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |    
28425641 taaatacaattaaaaggatagtttggtcattacacgttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacgtcaactcataagaatcacttgtaagaa 28425542  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||  ||    
28425541 agtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctaacaaaatcaattctatcaaaatcaattttcgccaccgtcat 28425442  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
28425441 accaaacacacac 28425429  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24897746 - 24897547
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
24897746 taaaagggtaagttggtcatttaatgttcaatatatattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcaattttaaataaatgtatcca 24897647  T
175 aacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||    
24897646 aacataattcattcatatccaactcacttttaaccaaaatcaattctcataaactcaattttatcaaaatcaattcttaccgccgccataccaaacacac 24897547  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 440358 - 440146
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    |||||||||  |||||| ||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |     
440358 taaatacaacaaaaaggataagttggtcattatacattcaaaatcagttttgattcaatctatccaaacaacgttaactcataagaatcatttttaactg 440259  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||        
440258 aatgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacatttaaccaaaatcaattctctcagactcaattctatcaaaatcaattatctccgccgtcca 440159  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
440158 accaaacacacac 440146  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 6399272 - 6399065
Alignment:
70 acaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagttt 169  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
6399272 acaattaaaaagataatttggtcattgcacattcaaaatcaattttgattaaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtgt 6399173  T
170 atccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaa 268  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||  |||| | |||||    
6399172 atcgaaacataaatcaattcacatcaaactcacttttaaccataatcaattctatcaaactcaattctaccagaatcaattaactctgccgccaaaccaa 6399073  T
269 acacacac 276  Q
    ||||||||    
6399072 acacacac 6399065  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 112 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 42143486 - 42143323
Alignment:
112 ttttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagca 210  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |    
42143486 ttttgtttcaaattatccaaacaacgtcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaacta 42143387  T
211 aaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||    
42143386 aaatcaattttctcaaactcaattatatcataatcaattctcgccaccgccataccaaacacac 42143323  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33627168 - 33626991
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaact 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
33627168 attcaaaatcgattttgattcaaactatccaaacaacattaactcataagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcttatccaact 33627069  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    || ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||    
33627068 cagttttaaataaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattccctccaccgccgaaccaaacacacac 33626991  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41289192 - 41289016
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaact 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||    
41289192 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacctataagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcacaatcaact 41289093  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacaca 275  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||| | ||||||| ||||    
41289092 cacttttaattaaaatcaattctctcaaactcaattctgtcaaaatcaattctcgccgccgccaaaccaaacccaca 41289016  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 236
Target Start/End: Original strand, 40742064 - 40742236
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||   |    
40742064 taaatacaattaaaaggataatttgatcattacacattcaaaatcaagtttcattcaaatcatccaaacaatatcaactcataagaatcaattttattaa 40742163  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattct 236  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
40742164 agtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 40742236  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40742462 - 40742260
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||     
40742462 taaacacaattaaaagggtaatttggtcactacacatttaaaatcaattttgatttaaaatatccaaacatcatcaactcataagaatcac--ttacatt 40742365  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||    
40742364 agtgtatccaaacataaatcaattcagatcaaactcacttttaacgaaaatcaattcttttaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgtcgctat 40742265  T
264 accaa 268  Q
    |||||    
40742264 accaa 40742260  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 236
Target Start/End: Original strand, 42148953 - 42149117
Alignment:
73 aataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatc 172  Q
    ||||||||| ||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
42148953 aataaaaggataatccgttcattttacattcaaaatcaattttgattcaaattatctaaacaacatcaactcatacgaatcacttttaaataagtctatc 42149052  T
173 caaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattct 236  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||||    
42149053 caaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattatatcagaatcaattct 42149117  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 224
Target Start/End: Original strand, 43550831 - 43550991
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |    
43550831 taaatacaattaaaaggatagtttagtctttacacattcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaacccacaagaatcacttttaataa 43550930  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctc 224  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
43550931 agtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattttctc 43550991  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Original strand, 15206671 - 15206848
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 198  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| ||| | | | ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
15206671 attcaaaatcaattttgggccaaactatccaaacaacatgaatttttaagaatcacttctaagtcaatgtatccaaacataaatcaattcacattcaact 15206770  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||    
15206771 cacttttacccaaaatcaattttgtcaaactcaattctatcaaaattaattctctccaccactgaaccaaacacacac 15206848  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 274
Target Start/End: Original strand, 26243129 - 26243274
Alignment:
130 aaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaac 228  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
26243129 aaacatcaccaactcataagaatcacttttaaacaattatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaacaaaaatcaattctcttaaac 26243228  T
229 tcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||    
26243229 tcaattctatcaaaatcaattctcactgccgctataccaaacacac 26243274  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38152342 - 38152159
Alignment:
66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataa 165  Q
    |||||||| |||| || || ||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
38152342 aaatacaattaaagggatactttggtcattacacgttcaaaatcaattttgatttaaagtatccaaaccacatcaactcataagaatcatttttaagtaa 38152243  T
166 gtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
     | | ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
38152242 atatttccaaacataaatcaatttacatcaaactcac-tttaactaaaatcaattttctcaaacttaattctatcaaaatcaatt 38152159  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 249
Target Start/End: Original strand, 25497717 - 25497816
Alignment:
150 aatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
25497717 aatcacttttaaataagtgtatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctcctaaactcaattttatcaaaatcaatt 25497816  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36121614 - 36121499
Alignment:
164 aagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |    
36121614 aagtgtatccaaacataatctattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgacaccgctgt 36121515  T
264 accaaacacacacaaa 279  Q
    ||||||||||||||||    
36121514 accaaacacacacaaa 36121499  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31246445 - 31246273
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 202  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||   | |   ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
31246445 aaaatcaattttgatccaagttatccaaacaacatgaatttataagaatcacttttgctttaaggtatccaaacataaatcaattcacattcaactcact 31246346  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacaca 275  Q
    |||||  ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
31246345 tttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaattatctccaccgcagaaccaaacacaca 31246273  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 276
Target Start/End: Original strand, 29023200 - 29023375
Alignment:
86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaa 185  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| |||| | |    
29023200 tttggtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataacaatcaattttaaacaagtgtatccaaatataaacca 29023299  T
186 ttcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
         || || ||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||    
29023300 -----attcatct----------caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccaccaccataccgaacacacac 29023375  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45147409 - 45147247
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||    
45147409 taaaaaggtaatttgatcatttaatgttcaaaatcaattttgattcaagttattcaaacaatatcaacttataagaatcacttttaaatgagagtgtcca 45147310  T
175 aacataatc-aattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattct 236  Q
    ||||||| | ||||  ||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||    
45147309 aacataaccaaatttgcattcaactcacttttaaccaaattcgattctatcaaaatcaattct 45147247  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34343019 - 34342873
Alignment:
66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataa 165  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
34343019 aaatacaattaaaagattaatttggtcattacac-ttcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatccact-ataagaatcacttttaaataa 34342922  T
166 gtttatccaaac-ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaat 214  Q
     ||||||||||| | |||||||||| || | |||||||||||| ||||||    
34342921 atttatccaaacaaaaatcaattcatat-ctactcacttttaaccaaaat 34342873  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 167
Target Start/End: Original strand, 41981101 - 41981199
Alignment:
69 tacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagt 167  Q
    ||||| ||||| | || ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
41981101 tacaattaaaaagatagtttggtcattccatatttaaaatcaattttgattcaaagtatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttagataagt 41981199  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30081815 - 30081635
Alignment:
69 tacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtt 168  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  | ||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||   | || |    
30081815 tacaattaaaaggataatttggtcattacacatctaaaatcaattttgaaacaaactatccaaacaacatcagcccataagaattgcttttgtgtcagct 30081716  T
169 tatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||    
30081715 tatccaaacataaatcaattcac-tttaactcacttttaactaaaatcaattttcacaaaatcaattttatcaaaatcaatt 30081635  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30759358 - 30759262
Alignment:
180 aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||| ||| | |||||||||||||    
30759358 aatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatattaaaatcaattcttcccatcgccaaaccaaacacacac 30759262  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 277
Target Start/End: Original strand, 35615684 - 35615862
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 198  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||    || |||||| |||||| | | | |||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
35615684 attcaaaatcaattttgagccaaactatccaaacaacaagaatatttaggaatcaattttaagtgaatgtatctaaacataaatcaattcccattcaact 35615783  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacaca 277  Q
    ||||| |   ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||    
35615784 cacttctttccaaaatcaatcttgtcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccgctgaaccaaacagacaca 35615862  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30085755 - 30085596
Alignment:
102 tcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcac 201  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||   |||||||||||| || ||| |||||||||||            || || ||||    
30085755 tcaatatcaattttgatttaaaatatccaaacatcgtcaactca---gaatcacttttacattagtgtatccaaacat------------tcaaattcac 30085671  T
202 ttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
30085670 ttttaaccaaaatcaattctcttaaactcaattatatcaaaatcaattctcaccgccgctataccaaacacacac 30085596  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3619198 - 3619053
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaaca-taatcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| | || | | ||||||||||  ||||||||  ||  |||||||||    
3619198 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatacattgataagaatcactttcatattaatgtatccaaacacaaatcaatt-tcactcaactcact 3619100  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||| | || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
3619099 tttgatcagaatcaattcattcaaaatcaattctatcaaaatcaatt 3619053  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 251
Target Start/End: Original strand, 16915011 - 16915184
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |  || ||||||    
16915011 taaaaggttaatttagtcattacacattcaaaatcaattttgatacaaaccaaccaaacatcattaactcataagaatcacttttatgttggtgtatcca 16915110  T
175 aacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattat 251  Q
    |||| ||||||||  | || ||||||| ||| |  ||||||||||||| || | |||||||||||||| || |||||    
16915111 aaca-aatcaatt-tcgtcaaactcacgttt-actaaaatcaattctcccagaatcaattctatcaaactccattat 16915184  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 181
Target Start/End: Original strand, 26125512 - 26125628
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||| | || ||| ||||||  | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||     
26125512 taaatacaattaaaaagatattttcgtcattacacattcaaaatcaattttgatttaaaccgtccaaacattatcaactcataagaatcatttttacatt 26125611  T
165 agtttatccaaacataa 181  Q
    ||| |||||||||||||    
26125612 agtgtatccaaacataa 26125628  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 249
Target Start/End: Original strand, 11126494 - 11126641
Alignment:
103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcac 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||  |    |||||  |    
11126494 caaactcaattttgattcaaactatccaaacaacacaaactcatgaaaatcacttatttataagtgtatccaaacataaatcaatctatgatcaactttc 11126593  T
202 ttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||  ||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||    
11126594 ttttaactaaaatcaattctctcgaaataaattctaacaaaatcaatt 11126641  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 276
Target Start/End: Original strand, 26125842 - 26125909
Alignment:
209 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||    
26125842 caaaatcaattctcttaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctgtaccaaagacacac 26125909  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3465478 - 3465424
Alignment:
195 aactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
3465478 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatt 3465424  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2071700 - 2071565
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactc 199  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| | || |  ||| |||||||| |   ||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||    
2071700 ttcaaaagctattttgattcaaattatccaaacaacttgaattagtaaaaatcacttctttttaaatttttccaaacatgaatcaatt-acattcaactc 2071602  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattct 236  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
2071601 acttttagtcaaaatcaattctgtcaaaatcaattct 2071565  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 137
Target Start/End: Original strand, 26243066 - 26243103
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26243066 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaaca 26243103  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 281
Target Start/End: Original strand, 36779435 - 36779547
Alignment:
169 tatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctatacca 267  Q
    ||||||||||||| | | || |||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||   ||||    
36779435 tatccaaacataaattactttacattcaactcacttttaatcaaaatcaattct-acaaaatcaattatatcaaaatcaattctcgtcaccgcacaacca 36779533  T
268 aacacacacaaaga 281  Q
    |||||| |||||||    
36779534 aacacatacaaaga 36779547  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 113
Target Start/End: Original strand, 25497655 - 25497703
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaatt 113  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
25497655 taaatacaattaaaagggtaagttggtcatttaatgttcaaaatcaatt 25497703  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 277
Target Start/End: Original strand, 26490930 - 26491086
Alignment:
122 aactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattc 220  Q
    ||||||| |||||| || || | ||||||||||||| || ||||   |||||||||| || |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
26490930 aactatctaaacaaaataaattaataagaatcacttctatataaaggtatccaaacacaaatcaatttacactcaactcacttttaaccaaaatcaattc 26491029  T
221 tctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacaca 277  Q
    |  |||| |||||| |  || |||||||| |   |||||| | ||||||||||||||    
26491030 taccaaaatcaattttgacagaatcaattctagtcaccgccacaccaaacacacaca 26491086  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 237
Target Start/End: Original strand, 23018099 - 23018209
Alignment:
128 ccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaa 226  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||  ||  || ||||||||||||| | |||| | |  |||||||||||| | ||||||||||||  ||||    
23018099 ccaaacaaaatcaattaataagaatcacttttgcattcgtgtatccaaacataaataaatttatactcaactcacttttgatcaaaatcaattcgatcaa 23018198  T
227 actcaattcta 237  Q
    |||||||||||    
23018199 actcaattcta 23018209  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24297721 - 24297687
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24297721 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 24297687  T

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Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37458437 - 37458403
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaaca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37458437 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaaca 37458403  T

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Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40792243 - 40792188
Alignment:
194 caactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||    
40792243 caactcacttttaatcaaaatcaattatatcaaaatcaattttattaaaatcaatt 40792188  T

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Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 41891950 - 41891915
Alignment:
103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
41891950 caaaatcaattttgattcaaactgtccaaacaacat 41891915  T

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Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 249
Target Start/End: Original strand, 26575890 - 26575928
Alignment:
211 aaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
26575890 aaatcaattctctcaaaatcaattctatcagaatcaatt 26575928  T

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Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 256
Target Start/End: Original strand, 2026176 - 2026221
Alignment:
211 aaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctcca 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||    
2026176 aaatcaattctctcaaaatcaattctttcagaatcaattatatcca 2026221  T

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Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 236
Target Start/End: Original strand, 32767481 - 32767547
Alignment:
169 tatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattct 236  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| | ||||||    
32767481 tatccaaacataaatcaatttacatccaactcactttta--cataatcaattcactcaaaattaattct 32767547  T

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Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 249
Target Start/End: Original strand, 26575903 - 26575943
Alignment:
209 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
26575903 caaaatcaattctatcagaatcaattctatcaaaatcaatt 26575943  T

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Target: chr5 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 277 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 29758607 - 29758424
Alignment:
277 aaagacaaacttattacaaatgttattacccgacgacacattttatatacttgctaaatatttcatcagtatgcataataacatgaaattttaaagtaca 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29758607 aaagagaaacttattacaaatgttataacccgacgacacatttaatatacttgctaaatatttcatcagtatgcataataacatgaaattttaaagtaca 29758508  T
377 tgataatatttattcacttgtgagatgttgaacgaaaacaatgataaattacataaaaaggaataaatgataaatgtttcatcg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29758507 tgataatatttattcacttgtgagatgttgaacgaaaacaatgataaattacataaaaaggaataaatgataaatgtttcatcg 29758424  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 57 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13253256 - 13253038
Alignment:
57 aatttaggtaaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcact 156  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
13253256 aatttagttaaatataattaaaagggtaatttggtcatttaatgttcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcact 13253157  T
157 tttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctcca 256  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
13253156 tttaaatgagtgtatccaaacataatcaattcatattcaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgcca 13253057  T
257 ccgctataccaaacacaca 275  Q
    ||||   ||||||||||||    
13253056 ccgcccaaccaaacacaca 13253038  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Original strand, 32454487 - 32454695
Alignment:
69 tacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtt 168  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
32454487 tacaattacaaggataatttggtcattttacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtg 32454586  T
169 tatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattct-atcaaaatcaattatctccaccgctatacca 267  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||    
32454587 tatccaaacataatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctaatcaaaatcaattctcgccaccgccatacca 32454686  T
268 aacacacac 276  Q
    |||||||||    
32454687 aacacacac 32454695  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 86 - 282
Target Start/End: Original strand, 3667821 - 3668018
Alignment:
86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tca 184  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||    
3667821 tttggtcattttacatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatca 3667920  T
185 attcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacacaaagac 282  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
3667921 attcacattcaactcactttttaacaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccactataccaaacacacacatagac 3668018  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 277
Target Start/End: Original strand, 41834838 - 41835051
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   |    
41834838 taaatacaattaaaaggataatttggtcattgcacattcaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaattcgtaagaatcacttctagtaa 41834937  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
41834938 agtgtatccaaacataaatcaattcacttccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactgaattctatcaaaatcaattctccccaccgccat 41835037  T
264 accaaacacacaca 277  Q
    ||||||||||||||    
41835038 accaaacacacaca 41835051  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 276
Target Start/End: Original strand, 35760156 - 35760347
Alignment:
86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tca 184  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||||| |||    
35760156 tttggtcattttacatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcagttttaattgagtgtatccaaacataaatca 35760255  T
185 attcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
35760256 attcacattcaactcactttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacacacac 35760347  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 40885166 - 40885369
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaa-tcacttttaaataagtttatcc 173  Q
    ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||    
40885166 taaaaggataatttgatcattacatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactcataaaaactcacttttaaacaagtgtgtcc 40885265  T
174 aaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacac 272  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
40885266 aaacataaatcaattcacatccaactcacttttaatcaaaatcaattctcttaaactcaattctaacaaaatcaattttcaccaccgccataccaaacac 40885365  T
273 acac 276  Q
    ||||    
40885366 acac 40885369  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 22482135 - 22482347
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||  |    
22482135 taaatacaattaaaaggatagtttagtcattatacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataa 22482234  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| ||    
22482235 agtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccat 22482334  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
22482335 accaaacacacac 22482347  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 32030662 - 32030872
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
32030662 taaatacaactaaaaggatagtttagtcattacaccttcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaac--ataagaatcacttttgaata 32030759  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| |||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
32030760 agtatatcaaaacaaaaatcaattcacatctaacttacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccactat 32030859  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
32030860 accaaacacacac 32030872  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39988088 - 39987921
Alignment:
110 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaag 208  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||     
39988088 aattttgatttaaatcatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaac 39987989  T
209 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||    
39987988 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgccggtataccaaacacacac 39987921  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 102 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2430425 - 2430251
Alignment:
102 tcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcac 201  Q
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2430425 tcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattgaagtgtatccaaacataatcaattcatgttcaactcac 2430326  T
202 ttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||| |||||||| ||||||    
2430325 ttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattccatcaaaatgaattctcgccaccgccataccaaatacacac 2430251  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33954057 - 33953854
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| |||||| ||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||    
33954057 taaaaggataatttagtcattacacattcaaaattaattttgattcaaactatccgaacaacatcaactcatcagaatcacttctattaaagtgtatcca 33953958  T
175 aacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || |||||||||||||    
33953957 aacataatcaatttacgttcaactcacttttaaataaaatcaattctctcaaactcaattctaccaaaatcaattttcaccactgccataccaaacacac 33953858  T
275 acaa 278  Q
    ||||    
33953857 acaa 33953854  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8049178 - 8049005
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
8049178 aaaagcaattttgatttaaatcatccaaacaacaacaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattaacctcaaactcact 8049079  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
8049078 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgccgctataccaaagacacac 8049005  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 40791217 - 40791024
Alignment:
83 taatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataat 182  Q
    |||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
40791217 taatatggtcattatacattcacaatcaattttgattcaatgtatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcgtatccaaacataat 40791118  T
183 caattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  |||||||||||||||    
40791117 caattcatatctaactcacttttaaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgtgataccaaacacacac 40791024  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 276
Target Start/End: Original strand, 42146272 - 42146465
Alignment:
83 taatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataat 182  Q
    |||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
42146272 taatatggtcattatacattcacaatcaattttgattcaatgtatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcgtatccaaacataat 42146371  T
183 caattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  |||||||||||||||    
42146372 caattcatatctaactcacttttaaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgtcataccaaacacacac 42146465  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9275650 - 9275439
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |    
9275650 taaatacaattaaaaagataatttggtcattacacattcaaaatcaagtttcattcaaatcatccaaacaacatcaactcataagaatcaattttattaa 9275551  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |     
9275550 agtgtatccaaacataaatcaattaacatctaactcacttttaaccaaaatcaattctcttaaactcaattttatcaaaatcaattttccccaccgccaa 9275451  T
264 accaaacacaca 275  Q
    ||||||||||||    
9275450 accaaacacaca 9275439  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 276
Target Start/End: Original strand, 10058022 - 10058232
Alignment:
67 aatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataag 166  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| ||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   |||    
10058022 aatacaattaaaatgataatttggtcgttgcacgttcaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaattcgtaagaatcacttctagtaaag 10058121  T
167 tttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctatac 265  Q
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10058122 tgtatccaaacataaatcaattcatttccaactcacttttaaccaaaatcaatactctcaaactcaattatatcaaaatcaattctccccaccgccatac 10058221  T
266 caaacacacac 276  Q
     ||||||||||    
10058222 taaacacacac 10058232  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 40495513 - 40495312
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
40495513 taaaaggataatttgatcattgtacattccaaatcaattttgatttaaactattcaaacaa-atcaactcataaaaatcacttttaaaaaagtgtatcca 40495415  T
175 aacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||    
40495414 aacataaatcaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattatatcaaactcaattctatcaaaatcaattcttcccgccgccataccaaacaca 40495315  T
274 cac 276  Q
    |||    
40495314 cac 40495312  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41740738 - 41740564
Alignment:
86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatca 184  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| || ||    
41740738 tttggtcattttacattcaaaatcaattttgatttaaactatccaaacaacatcaactcataacaatcacttttaaacaagtgtattcaaacataaacca 41740639  T
185 attcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccg 259  Q
    |||||  || ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
41740638 attcatctcaaactcacctataatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccg 41740564  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7386059 - 7385886
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||| || ||| ||||    
7386059 aaaagcaattttgatttaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatttaaacataaatcaattcacctcaaacccact 7385960  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
7385959 tttaaccaaaatcaattctctaaaacttaattctatcaaaatcaattctcaccgccgctatactaaacacacac 7385886  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 273
Target Start/End: Original strand, 7714896 - 7715095
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||| | || |    
7714896 taaaaggataatttagtcattatactttcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaacttataagaatcaatttcaagtgagtgtgtcaa 7714995  T
175 aacata-atcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||    
7714996 aacatatatcaattcatatctaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatttttaccaccgccatacaaaacaca 7715095  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 273
Target Start/End: Original strand, 24045787 - 24045985
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||   |||||    
24045787 taaaaggataatttagtcattgtacgttcaaaatcaattttaattcaaattatccaaacaacatcaacccataaaaatca-ttttaagtgagagcatcca 24045885  T
175 aacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
24045886 aacataaatcaattcacatcagactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaacaca 24045985  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3060376 - 3060205
Alignment:
77 aaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaa 176  Q
    ||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
3060376 aaaggataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat-aactcataagaatcacttt-aagtgagtatatccaaa 3060279  T
177 cataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||| | |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
3060278 cataaattaattcatataaaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaatt 3060205  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5710511 - 5710340
Alignment:
105 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataat-caattcacatccaactcactt 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
5710511 aaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatctactcataaaaatcacttgtaa-taagcgtatccaaacataaagcaattcacaccaaactcactt 5710413  T
204 ttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
5710412 ttaaccaaaatcaattctttcaaactccattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 5710340  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Original strand, 4292130 - 4292280
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
4292130 attcaaaattaattttgattcaaattatccaaacaatatcaaccaacaagaatcacttctaattaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaact 4292229  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
4292230 tatttttaatcaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaatt 4292280  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16158596 - 16158444
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| | |||||||||| ||||    
16158596 attcaaaatcaattttgattcaaatcatccaaagaacatcaattcctaagaatcacttttaaaaaagtgcatccaaatataaattaattcacatcaaact 16158497  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattat 251  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
16158496 cacttttaatcaaaatcaattctttcaaactcaaatctataaaaatcaattat 16158444  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Original strand, 27021085 - 27021283
Alignment:
76 aaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaact-atccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
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27021085 aaaaggataatttcgtcattatacattcaaaatcaattttgattcaatcttatccaaacaacatcaacttctaagaatcacttttaagtgagtata-cca 27021183  T
175 aacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |  ||||||| | ||||||||||    
27021184 aacataaatcaattcacatttaactcatttttaaccaaaatcaattttctcaaactcaattatatcaaaatcagttctaaccaccgccaaaccaaacaca 27021283  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34107068 - 34106903
Alignment:
110 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaag 208  Q
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34107068 aattttgattcaacctattcaaacaacattaattcataagaattacttttaaatgaatgtatttaaacattaatcaattcacatctaactcacttttaac 34106969  T
209 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| | |||||||||||    
34106968 caaaaacaattcttttaaactcaattctatcaaaatcaattttgtctgccgccaaaccaaacacac 34106903  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 252
Target Start/End: Original strand, 7178760 - 7178911
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactc 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| |||||  | | | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
7178760 ttcaaaagcaattttgattcaaactacccaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactc 7178858  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatc 252  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
7178859 acttttagtcaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaactcaattatc 7178911  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23914341 - 23914224
Alignment:
144 cataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
23914341 cataagaatcacttttaaatgggtgtatccaaacgtaaatcaattcatatccaactcaattttaagtataatcaattctctcaaaatcaattctatcaaa 23914242  T
243 atcaattatctccaccgc 260  Q
    ||||||||| ||||||||    
23914241 atcaattatgtccaccgc 23914224  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28869668 - 28869530
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  | | || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
28869668 taaatacaattaaaaggataatttggtcattacacactcgaaatctatttt-actcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagta 28869570  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcactt 203  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
28869569 agtgtattcaaacataaatcaatccacatccaactaactt 28869530  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2483800 - 2483684
Alignment:
145 ataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaa 243  Q
    |||||||||||||||   |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||   |||| |||||| | || |||    
2483800 ataagaatcacttttgcttaaagttatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaactaaaatcaattccaacaaaatcaattatgtccaaa 2483701  T
244 tcaattatctccaccgc 260  Q
    |||||| ||||||||||    
2483700 tcaattttctccaccgc 2483684  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2694889 - 2694741
Alignment:
102 tcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||  | |  ||||| ||| || ||| |||| |    |||||||    
2694889 tcaaaatcaattttgattcaaattatacaaacatcatcaattgataagaatcacttttatgttaagttatctaaaaataaattaatttatgatcaactca 2694790  T
201 cttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||    
2694789 cttttaaccaaaatcaattcaatcaaaatcaattctgacaaaatcaatt 2694741  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4569212 - 4569089
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaat--aagtttatccaaacataatcaattcacatccaac 197  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| | |  | ||||||||||||||| | |  |  |||||||||| ||||||||||||||  ||||    
4569212 attcaaaatcaatttttatcaaaattatccaaacaacgtgattttataagaatcacttttgacttgatatttatccaaatataatcaattcacactcaac 4569113  T
198 tcacttttaagcaaaatcaattct 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
4569112 tcacttttaatcaaaatcaattct 4569089  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Original strand, 16843519 - 16843660
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactc 199  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||      |||| ||| ||||||  ||   | ||||||||| ||    
16843519 attcaaaatcaattatcatttaaactatccaaacaacatcaactcgtaaaaatcattt------aagtatatacaaaca--attggtccacatccaattc 16843610  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||||||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
16843611 acttttaaccaaaatctattcgttcaaactcaattatatcaaaatcaatt 16843660  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35847925 - 35847871
Alignment:
195 aactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
35847925 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatt 35847871  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 254
Target Start/End: Original strand, 2861618 - 2861776
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcat----aagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatcc 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| || | ||    |||||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||| |||| |    
2861618 attcaaaatcaattttgatccaaattattcaaacaacataaatttatttataagaatcacttttacatat-tatatccaaacataaatcaatttacatgc 2861716  T
195 aactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctc 254  Q
    || ||| ||||||   ||||||||| | ||||| |||||||||| ||  |||||||||||    
2861717 aagtcatttttaactcaaatcaattatatcaaaatcaattctattaacctcaattatctc 2861776  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3747717 - 3747572
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||| | || | |  |||||||||| ||| ||||  ||  |||||||||    
3747717 aaaatcaattttgattaaaactatccaaacaacatacattactaagaatcactttcatattaatgcatccaaacataaattaatt-tcactcaactcact 3747619  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||| | |  |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||    
3747618 tttgatccgaatcaattcattcacaatcaattctatcaaaatcaatt 3747572  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 237
Target Start/End: Original strand, 20068923 - 20069033
Alignment:
128 ccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaa 226  Q
    |||||||| ||||| | | |||||||||||||  || ||| ||||||||||||| | |||| | |  |||||||||||| | ||||||||||||  ||||    
20068923 ccaaacaaaatcaattaacaagaatcacttttgcattagtgtatccaaacataaataaatttaaactcaactcacttttgaccaaaatcaattcgatcaa 20069022  T
227 actcaattcta 237  Q
    |||||||||||    
20069023 actcaattcta 20069033  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 160
Target Start/End: Original strand, 41959440 - 41959502
Alignment:
98 atattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 160  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
41959440 atatccaaaatcaattctatttcaaactatgaaaacaacattaactcataagaatcactttta 41959502  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 260
Target Start/End: Original strand, 19784884 - 19784955
Alignment:
189 acatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgc 260  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||    ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
19784884 acattcaactcacttttaaccaaaatcaattcaaataaaatcaattcaatcaaaatcaattatattcaccgc 19784955  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41741644 - 41741597
Alignment:
209 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctcca 256  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
41741644 caaaatcaattctatcaaaatcaattctatcagaatcaattatatcca 41741597  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33082382 - 33082344
Alignment:
211 aaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
33082382 aaatcaattctctcaaaatcaattctatcagaatcaatt 33082344  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 138
Target Start/End: Original strand, 40979999 - 40980037
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 138  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
40979999 attcaaaatcaattttgatcaaaactatccaaacaacat 40980037  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Original strand, 22811076 - 22811129
Alignment:
169 tatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattct 221  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
22811076 tatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattct 22811129  T

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Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 69 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7472836 - 7472628
Alignment:
69 tacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtt 168  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
7472836 tacaattacaaggataatttggtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtg 7472737  T
169 tatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaa 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||    
7472736 tatccaaacataatcaattcacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaa 7472637  T
269 acacacaca 277  Q
    |||||||||    
7472636 acacacaca 7472628  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 75 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 39141626 - 39141420
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
39141626 taaaagcgtaatttggtcatttaatgttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcatttttaaatgagtgtatcca 39141527  T
175 aacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||   |||||||||||    
39141526 aacataatcaattcatatccaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattatatcaaaatcaattctcgccaccgcccaaccaaacacac 39141427  T
275 acaaaga 281  Q
    || ||||    
39141426 acgaaga 39141420  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 86 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9988647 - 9988456
Alignment:
86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tca 184  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
9988647 tttggtcattacacattcaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatca 9988548  T
185 attcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||    
9988547 attcacatccaactcacttttaacaaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacacacac 9988456  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 86 - 277
Target Start/End: Original strand, 2213468 - 2213660
Alignment:
86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tca 184  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||    
2213468 tttggtcattttacatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatca 2213567  T
185 attcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacaca 277  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
2213568 attcacattcaactcactttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacacacaca 2213660  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5916408 - 5916197
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |    
5916408 taaatacaattaaaaggatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcacatgaatcacttttaataa 5916309  T
165 agtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || |||| |||    
5916308 agtgtatccaaacataatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaattaattctatcaaaatcaattctccccgccgccata 5916209  T
265 ccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||    
5916208 ccaaacacacac 5916197  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 36312218 - 36312429
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |    
36312218 taaatacaattaaaaggatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcacatgaatcacttttaataa 36312317  T
165 agtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || |||| |||    
36312318 agtgtatccaaacataatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaattaattctatcaaaatcaattctccccgccgccata 36312417  T
265 ccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||    
36312418 ccaaacacacac 36312429  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28127433 - 28127241
Alignment:
86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tca 184  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||    
28127433 tttggtcattttacatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatca 28127334  T
185 attcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacaca 277  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
28127333 attcacattcaactcactttttagcaaaatcaattctctcaaactaaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacacacaca 28127241  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 78 - 273
Target Start/End: Original strand, 14821117 - 14821312
Alignment:
78 aagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaac 177  Q
    |||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||    
14821117 aaggataatttagtcattagacattcaaaatcaattttgattcaaaatatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctagtaaagtgtatccaaac 14821216  T
178 ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
14821217 ataatcaattcacattaaactcacttttaactaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaattaattatcgtcaccgctataccaaacaca 14821312  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42516141 - 42515936
Alignment:
66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataa 165  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| |    
42516141 aaatagaattaaaaagataatttggttattatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcgaaagaatcattttttaatga 42516042  T
166 gtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctatac 265  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
42516041 gtatattcaaacataatcaattcacatcaaactcacttttaactaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattttctccaccgccatac 42515942  T
266 caaaca 271  Q
    ||||||    
42515941 caaaca 42515936  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1945166 - 1944994
Alignment:
105 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcactt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
1945166 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcactt 1945067  T
204 ttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
1945066 ttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacacacac 1944994  T

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Target: chr2; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 44619207 - 44619016
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44619207 tttggtcattttacattcaaaatcgattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataataatcatttttaaacaagtgtatccaaacataaatca 44619108  T
185 attcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||| |||||||||||    
44619107 attcccctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccatcggtatatcaaacacacac 44619016  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 275
Target Start/End: Original strand, 32501928 - 32502137
Alignment:
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32501928 aaatacaattaaaagggtaagttggtcattacccatttaaaatcaattttgattcaaactacccaaacaatatcaactcgtaaaaattacttttaattga 32502027  T
166 gtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctatac 265  Q
     | |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||    
32502028 atgtatccaaacataatcaattcacctaaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcacgaccgccatac 32502127  T
266 caaacacaca 275  Q
    ||||||||||    
32502128 caaacacaca 32502137  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 276
Target Start/End: Original strand, 8170267 - 8170465
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78 aagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaac 177  Q
    |||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    | || |||||||||    
8170267 aaggataatttagtcattatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacatctgttaacgtgtatccaaac 8170366  T
178 ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
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8170367 ataatcaatttacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcgccaccgccctaccaaacacacac 8170465  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 36548141 - 36548352
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    |||||| || ||||||| |||||| ||||||  |  ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |     
36548141 taaatataattaaaaggataatttagtcattgtacgttcaaaatcaattttaatttaaattatccaaacaacatcaacccataaaaatca-ttttaagtg 36548239  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
36548240 agagtatccaaacataaatcaattcacatcagactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcaccaccgccat 36548339  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
36548340 accaaacacacac 36548352  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Original strand, 28261246 - 28261431
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76 aaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaa 175  Q
    |||||| ||| |||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||  |||||||    
28261246 aaaaggataagttggtcattatacatttaaaattaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttctatgtgagagtatccaa 28261345  T
176 acataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgc 260  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
28261346 atataaatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattgtattaaaattaattctctccaccgc 28261431  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31562816 - 31562646
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100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactc 199  Q
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31562816 attcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaatataaactcataagaatcacttttaaacgagtgt--ccaaacataatcaattcacctcaaattc 31562719  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacac 272  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||    
31562718 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattttatcaaaatcaattctcgccaccaccataccaaacac 31562646  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 276
Target Start/End: Original strand, 2215216 - 2215405
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86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tca 184  Q
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2215216 tttggtcattttacattcaaaatcaattctaatttaaattatccaaacaacatcaactcaaaa--attatttttaaacaagtgtatccaaacataaatca 2215313  T
185 attcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
2215314 attcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaagctcaattctatcaaaatcaattctcacaaccgctataccaaacacacac 2215405  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 276
Target Start/End: Original strand, 23358220 - 23358410
Alignment:
86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatc-a 184  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |    
23358220 tttggtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacattaactcatcacaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataaacta 23358319  T
185 attcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
     ||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| | | |||||||||||||||    
23358320 tttcatctcaaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctat-taaatcaattctcgccaacaccataccaaacacacac 23358410  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 252
Target Start/End: Original strand, 7296107 - 7296284
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76 aaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaa 175  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| || ||| |||||||    
7296107 aaaaggataattcggtcattatatattcaaaatcaattttgacttaaactatccaaataacatcaagtcatgataatcacttttatatgagtgtatccaa 7296206  T
176 acat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatc 252  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
7296207 acataaatcaattcacatcaaactcatttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaagtcaattatc 7296284  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26208096 - 26207883
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    |||||||||  |||||| || ||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||    
26208096 taaatacaatcaaaaggatagtttggtcattgtacatttaaaatcaattttgattcatataatccaaacaacatcaacttgtaagaatcaattttaatta 26207997  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||  ||    
26207996 agtgtatcaaaacataaatcaattcacatccaactgacttttaaccaaaaccaattctctcaaaattaattctatcaaaatcaattttcgtcaccgtcat 26207897  T
264 accaaacacacaca 277  Q
    ||||||||||||||    
26207896 accaaacacacaca 26207883  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 28641583 - 28641795
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
28641583 taaatacaattaaaaggataatttggtcattacacatttaaaatcaattttaattcaacatatccaaacaacatcaacttataataatcacttttaaatg 28641682  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    |  ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||| | |||| ||| |     
28641683 aagttacccaaatataaatcaattcacatccaactcacatttaaccaaaatcaattctctcagaatcaattcaattaaaatcaattttatccatcgccaa 28641782  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
28641783 accaaacacacac 28641795  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 135 - 276
Target Start/End: Original strand, 2213658 - 2213800
Alignment:
135 acatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
2213658 acatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaagacaaatcaattcacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaat 2213757  T
234 tctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||||||    
2213758 tctatcaaaatcaattctctcatctgccataccaaacacacac 2213800  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7295513 - 7295327
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||    
7295513 taaatgcaattaaaaggataattcggtcattatatattcaaaatcaagtttgacttaaactatccaaacaacatcaactcatgataatcactttt--ata 7295416  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatc 252  Q
     || ||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
7295415 tgtgtatccaaacataaatcaatttacgtcaaactcatttttaaccagaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattatc 7295327  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25748012 - 25747836
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactc 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| |||||  | | | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
25748012 ttcaaaagcaattttgattcaaactacccaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactc 25747914  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacaca 277  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
25747913 acttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaactcaattatcaccaccgcggaaccaaacacacaca 25747836  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 112 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42089652 - 42089474
Alignment:
112 ttttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatc----caaacataa-tcaattcacatccaactcactttta 206  Q
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42089652 ttttgattcgatttatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatctatccaaacataaatcaattcacattcaactcactttta 42089553  T
207 agcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacacaaagacaaa 285  Q
    | |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| | | ||||||||||| || |||||    
42089552 atcaaaatcaattctcttgaacttaattctatcaaaatcaattttcatcaccgccaaatcaaacacacactaaaacaaa 42089474  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 277
Target Start/End: Original strand, 31224690 - 31224834
Alignment:
134 aacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaa 232  Q
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31224690 aacatcaactcataagaatcacttttagtaaaatatatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattctttcaaactcaa 31224789  T
233 ttctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacaca 277  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||| |||||||    
31224790 ttctatcaaaatcaattttcgtcaccgccaaaccaaatacacaca 31224834  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Original strand, 3853876 - 3854053
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 198  Q
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3853876 attcaaaagcaattttgattcaaactatccaaacaacatagattgataagaatcaattttacatgaatgtatccaaacataaatcaatttacattcaact 3853975  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| || | |||||   |||||||||||||    
3853976 cacttttaatcaaaatcaattctatcaaaatcaattccatcaaactcaattctcgctaccgcacaaccaaacacacac 3854053  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34433413 - 34433263
Alignment:
126 atccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtt-tatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctct 223  Q
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34433413 atccaaacaacatgaatttataagaatcactttttactttattgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctgt 34433314  T
224 caaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||    
34433313 caaactcaattctatcaaaatcaattctcttcaccgctgaaccaaacacac 34433263  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 270
Target Start/End: Original strand, 18511078 - 18511249
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100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 198  Q
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18511078 attcaaaatcaattttgatttaaattatccaaacaacatcactttataagaatcatttttacattgatgtatccaaacataaatcaattaacatttaaat 18511177  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaac 270  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
18511178 cacttttaaccaaaatcaattatatcaaaatcaattttatcaaaatcaattctctccaccgctgaaccaaac 18511249  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 249
Target Start/End: Original strand, 16467066 - 16467212
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 202  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
16467066 aaaattaattttgatctaaactatccaaactacatcaacccataagaatcacttttacattatcatatccaaacataaatcaatttacatctaactcact 16467165  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||    
16467166 tttaaccaaaatcaattatgccaaaatcaattctatcaaaatcaatt 16467212  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25940408 - 25940265
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||| ||| || |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| || |      
25940408 taaatgcaattagaaggataatttggtcattatatattcaaaatcaattttgattcaaactgtccaaacaacatcatctcataataatcacttctatacg 25940309  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaa 207  Q
    ||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
25940308 agtgtattcaaatataaatcaattcacatcaaactcacttttaa 25940265  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30007613 - 30007509
Alignment:
172 ccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaac 270  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||| ||    
30007613 ccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccacagccataccatac 30007514  T
271 acaca 275  Q
    |||||    
30007513 acaca 30007509  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Original strand, 27911386 - 27911517
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||   || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
27911386 aaaatcaattttaatttaaagtatccaaataacatcaacttgaaataatcacttttaaatgagtatatccaaacataaatcaattcacatcaaactcact 27911485  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaatt 234  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
27911486 tttaaccaaactcaattctatcaaaatcaatt 27911517  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45714766 - 45714650
Alignment:
134 aacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaa 232  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
45714766 aacatcaaatcatgataatcatttttaacggagtgtatccaaacataaatcaattcacatcgaactcatttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaa 45714667  T
233 ttctatcaaaatcaatt 249  Q
    || ||||||||||||||    
45714666 ttatatcaaaatcaatt 45714650  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 242
Target Start/End: Original strand, 8041257 - 8041397
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactc 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||| ||| | |||||| ||| |  |||||||||||| |||||| |||| ||| ||    
8041257 ttcaaaaacaattttgattcaaacta-ccaaacaacataaattgataaaaataaattttaagtaattgcatccaaacataaatcaatt-acattcaattc 8041354  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 242  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8041355 acttttattcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 8041397  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41580817 - 41580692
Alignment:
125 tatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctct 223  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||| ||||  | | || ||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
41580817 tatccaaacaactataattcataagaatcatttttgtacatgtgtatccaaacataaattaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctct 41580718  T
224 caaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
41580717 caaactcaattcgatcaaaatcaatt 41580692  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43436410 - 43436290
Alignment:
103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcac 201  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||  ||| |||||| |||||||| ||||| || ||||    
43436410 caaaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatcaaaacataaatcaatttacatctaattcac 43436311  T
202 ttttaagcaaaatcaattctc 222  Q
    |||||| ||||||||||||||    
43436310 ttttaatcaaaatcaattctc 43436290  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3602587 - 3602415
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||  | | | ||||||||||||| |||||| |  | |||||||||    
3602587 aaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatgaattaataaaaatcacttttattttaatatatccaaacataattcaatt-aagttcaactcact 3602489  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||  ||||||   |||||||||||||    
3602488 tttagacaaaatcaattctatcaaaatcaattcagtaaaaatcaattttcatcaccgcagaaccaaacacacac 3602415  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39106833 - 39106678
Alignment:
67 aatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataag 166  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || || | |||||||||||||| | |     
39106833 aatacaatttaaaggataatttggtcattgtatatttaaaatcaattttgattcaaattatctaaacaacttaaattcgt-agaatcacttttaagtgaa 39106735  T
167 tttatccaaaca-taatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctc 222  Q
    | |||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
39106734 tgtatccaaacattaaacaatttatatcaaactcactttttaccaaaatcaattctc 39106678  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38600530 - 38600425
Alignment:
145 ataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaa 243  Q
    |||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
38600530 ataataatcacttttgtacaagtgtattcaaacataaatcaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaacttaattcgatcaaaa 38600431  T
244 tcaatt 249  Q
    | ||||    
38600430 ttaatt 38600425  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Original strand, 2234907 - 2234962
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
2234907 aaaattaattttgattcaaactatccaaacaacat-aactcataagaatcactttta 2234962  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23267400 - 23267346
Alignment:
195 aactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
23267400 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatt 23267346  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 273
Target Start/End: Original strand, 11240648 - 11240820
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactc 199  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  || |  ||||||||| || ||| | | | ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
11240648 ttcaaaatcaattatgagccaaactatccaaacaacaagaatttttaagaatcaattctaagtgaatgtattcaaacataaatcaattcacattcaactc 11240747  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
     |||||   | ||||||||| | | |||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||    
11240748 gctttt-ttccaaatcaattttgttaaacccaattaaatcaaaatcaattctctccacggctgaaccaaacaca 11240820  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34997287 - 34997218
Alignment:
180 aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||    
34997287 aatcaattcacatccaattcatttttaacaaaaatcaattttgtcaaactaaattttatcaaaatcaatt 34997218  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 276
Target Start/End: Original strand, 12110919 - 12111026
Alignment:
169 tatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctatacca 267  Q
    ||||||||||||| ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||   ||||    
12110919 tatccaaacataaatcactttatattcaactcacttttaaccaaaatcaatt-tgacaaaatcaattctatcaaaatcaattttcgtcaccgcacaacca 12111017  T
268 aacacacac 276  Q
    |||||||||    
12111018 aacacacac 12111026  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43858341 - 43858183
Alignment:
103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta-aataagtttatccaaacataa-tcaattca-catccaactc 199  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| || || | |||||||||||||| | ||||| |  |||||||||||| ||||||   |||| |||||    
43858341 caaaatcaattttagttaaaactatccaaacaatatgaattgataagaatcactttcacaataa-tgcatccaaacataaatcaattattcatc-aactc 43858244  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgc 260  Q
    ||||||   ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
43858243 acttttgcccaaaatcaattcaattaaaatcaattctatcaaaatcaattatacccaccgc 43858183  T

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Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 45714814 - 45714767
Alignment:
66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaatt 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
45714814 aaatacaattaaaaggataatttggtcattatatattcaaaatcaatt 45714767  T

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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23359993 - 23359927
Alignment:
169 tatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaatt 234  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||    
23359993 tatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctaccaaaatcaatt 23359927  T

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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 276
Target Start/End: Original strand, 7474196 - 7474261
Alignment:
211 aaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||  |||  |||||||||||||    
7474196 aaatcaattctctcaaaatcaattctgtcagaatcaattctatccaaagctgaaccaaacacacac 7474261  T

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Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15283391 - 15283350
Alignment:
98 atattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatc 139  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
15283391 atattcaaaatcaattttaatctaaactatccaaacaacatc 15283350  T

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Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32496623 - 32496578
Alignment:
209 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctc 254  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||    
32496623 caaaatcaattctgtcataatcaattctatcagaatcaattatctc 32496578  T

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Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30599955 - 30599859
Alignment:
180 aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| | | | |||||||| |  ||||||| | |||||||| ||||    
30599955 aatcaattgacactcaactcacttttaaccaaaatcaattctatcaaaattaattttgttagaatcaattctaaccaccgccaaaccaaacatacac 30599859  T

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Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 37640272 - 37640236
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaac 136  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
37640272 attcaaaatcaattttgataaaaactatccaaacaac 37640236  T

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Target: chr6 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 276
Target Start/End: Original strand, 13739142 - 13739349
Alignment:
69 tacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtt 168  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
13739142 tacaattacaaggataatttggtcattttacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtg 13739241  T
169 tatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaa 268  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
13739242 tatccaaacataatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaa 13739341  T
269 acacacac 276  Q
    ||||||||    
13739342 acacacac 13739349  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 78 - 276
Target Start/End: Original strand, 13744651 - 13744849
Alignment:
78 aagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaac 177  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
13744651 aaggataatttggtcattttacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaac 13744750  T
178 ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
13744751 ataatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 13744849  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 78 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 6208218 - 6208020
Alignment:
78 aagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaac 177  Q
    |||| |||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||    
6208218 aaggataatttagtcattagacattcaaaattaattttgattcaaactatctaaacaacatcaactcataagaatcacttttagtaaagtgtatccaaac 6208119  T
178 ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
6208118 ataatcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattcactcaaaatcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacacacac 6208020  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 252
Target Start/End: Original strand, 31132388 - 31132583
Alignment:
57 aatttaggtaaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcact 156  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
31132388 aatttagttaaagacaattaaaagggtaatttggtcatttaaagttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccataagaatcact 31132487  T
157 tttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatc 252  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
31132488 tttaaataagtgtatccaaaaataacgaattaacatccaactcatttttagccaaaataaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaattatc 31132583  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33899174 - 33898962
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||     
33899174 taaatacaattaaaaggatattttggtcattacacattcaaaatcaattttgatttaaaccatccaaacattattaactcataagaatcacttttacatt 33899075  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
33899074 agtgtatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgctat 33898975  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
33898974 accaaacacacac 33898962  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29409404 - 29409208
Alignment:
81 ggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat- 179  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||     
29409404 ggtaatttggtcattatacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcatttttaaaaaactgtatccaaacata 29409305  T
180 aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||    
29409304 aatcaattcacatcaaactcacttttaatcaaaatcaattctttcaaactcaattctattaaaatcaattttcgccaccgtcataccaaaaacacac 29409208  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 10826033 - 10826235
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
10826033 taaaaggatagtttggtcattccatatttaaaattaattttgattcaaactatccaaacaaaatcaactcataagaatcacttttaaataagtatatcca 10826132  T
175 aac-ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||| | |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || || |||| | ||||||||||    
10826133 aacaaaaatcaattcaaattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattttatcaaaattaattctcaccgccgccaaaccaaacaca 10826232  T
274 cac 276  Q
    |||    
10826233 cac 10826235  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17830132 - 17829957
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| |||  || | || | |||||||| ||||||||||| |||||    
17830132 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacaagaacgacttctaataaactgtaactaaacataaatcaattcacattcaact 17830033  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
17830032 cacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccacagctataccaaacacac 17829957  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16442509 - 16442347
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
16442509 taaaaggatagtttggtcattacacattcaaaatcaattttcattcaaattatccaaacaatatcaactcatatgaatcacttttaaataagtgtatcca 16442410  T
175 aacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattct 236  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||    
16442409 aacataaatcaattcacattcaactcacttgtaactaaaatcaattctctcaaaatcaattct 16442347  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 222
Target Start/End: Original strand, 16548071 - 16548229
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||  |    
16548071 taaatacaattaaaaggatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataa 16548170  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctc 222  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
16548171 agtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctc 16548229  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1312573 - 1312396
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |  ||||||||| || ||| | | | ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||    
1312573 attcaaaatcaattttgggtcaaactatccaaacaacattaatttttaagaatcaattctaagtcaatgtatccgaacataaatcaattcgcattcaact 1312474  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
1312473 cacttttaaccaaaatcaattttatcaaactcgattctatcaaaatcaattttctccaccgctgaaccaaacacacac 1312396  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Original strand, 21455814 - 21455997
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||  |||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
21455814 taaatacaattaaaaagataatttaatcattacacatttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaactcatgagaatcactttt-aata 21455912  T
165 agtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||| ||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
21455913 agtgtatacaaacacaattgattcacatccaacttacttttaactaaaatcaattcttacaaactcaattatatcaaaatcaatt 21455997  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 260
Target Start/End: Original strand, 699511 - 699684
Alignment:
86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tca 184  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||   ||||  |||||||||||| |||    
699511 tttggtaattttatattcaaaatcgattttgattcaaactatccaa-caacattaacttataagaattacttttagtaaagtgcatccaaacataaatca 699609  T
185 attcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgc 260  Q
    ||||  |||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
699610 attcttatccaactcacttt-aactaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattccctccaccgc 699684  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21255011 - 21254836
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactc 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || | |||||||||| |||||  | | | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
21255011 ttcaaaagcaattttgattcaaactaccgaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactc 21254913  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    |||||||||||||    
21254912 acttttaatcaaattcaattctctcaaactcaattctatcaaactcaattatcaccaccgtggaaccaaacacacac 21254836  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 249
Target Start/End: Original strand, 7215519 - 7215690
Alignment:
77 aaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaa 176  Q
    ||||| ||||||  |||||  ||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||    
7215519 aaaggataatttaatcattacatatttaaaattaattttgattcaatttatgcaaacaacattaactcatgagaatcactttt-aataagtgtatacaaa 7215617  T
177 cataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||  |||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||    
7215618 cataattgattcacgtccaattcacttttaactaaaatcaagtcttaaaaactcaattatatcaaaatcaatt 7215690  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5584181 - 5584000
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactc 199  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| | || |  ||| |||||||| || |||| | ||||||||||||| |||||| ||||  |||||    
5584181 ttcaaaagctattttgatttaaattatccaaacaacttgaattggtaaaaatcacttctatataaatatatccaaacataaatcaatt-acattaaactc 5584083  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacacaaagac 282  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||   ||| ||||||||| |||||    
5584082 acttttagtcaaaatcaattctgtcaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgcagaacctaacacacactaagac 5584000  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16122134 - 16121960
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactc 199  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||| || || | ||||||||||||| || ||||   ||| |||||| || |||| | |||  ||| ||    
16122134 ttcaaaagcaattttgatctcaactatccaaacaaaataaattaataagaatcacttatacataaaggtattcaaacacaaatcaacttacactcaaatc 16122035  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
16122034 acttttaaccaaaatcaattctatcaaaatcaattttatcaaaatcaattataaccaccgccataccaaagacac 16121960  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29399845 - 29399749
Alignment:
180 aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacaca 277  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||    
29399845 aatcaattc-cattcaacttactctttaccaaaatcaattctatcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccgccaaaccaaacatacaca 29399749  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26274760 - 26274611
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactc 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| | || |  ||| ||||| || || |||| |||||| |||||||| | | | |||| ||||||    
26274760 attcaaaagcaattttgattcaaattattcaaataacttgaattggtaaaaatcaattctacataaatttatctaaacataaacgaattacattcaactc 26274661  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||||||  || |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
26274660 acttttagtcagaatcaattatgtcaaaatcaattctatcaaaatcaatt 26274611  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32599501 - 32599446
Alignment:
194 caactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
32599501 caactcacttttaatcaaaatcaattctcttaaattcaattctatcaaaatcaatt 32599446  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15151543 - 15151489
Alignment:
195 aactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
15151543 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatt 15151489  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3605790 - 3605709
Alignment:
194 caactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| | |||||| |   |||||||||||||    
3605790 caactcacttttaatcaaaatcaattct-acaaaatcaattatatcaaaatcaattttgtccaccacacaaccaaacacacac 3605709  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8551131 - 8551052
Alignment:
194 caactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    |||||||||||||| || |||||||| | |  || ||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||    
8551131 caactcacttttaatcagaatcaattatatggaa-tcaattctatcaaaatcaattatatccaccacacaaccaaacacac 8551052  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 251
Target Start/End: Original strand, 10683831 - 10683871
Alignment:
211 aaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattat 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
10683831 aaatcaattctctcaaaatcaattctgtcagaatcaattat 10683871  T

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Target: chr3 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 42318262 - 42318473
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |    
42318262 taaatacaattaaaaggataattttgtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacgaaatcaactcataagaatcactttcaaaca 42318361  T
165 agtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
42318362 agtgtatccaaacataatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgtcaccgctata 42318461  T
265 ccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||    
42318462 ccaaacacacac 42318473  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10853424 - 10853224
Alignment:
77 aaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaa 176  Q
    ||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
10853424 aaaggataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaa 10853325  T
177 cat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacaca 275  Q
    ||| |||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
10853324 cataaatcaatttatattaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgctataccaaacacaca 10853225  T
276 c 276  Q
    |    
10853224 c 10853224  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 20813078 - 20813289
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
20813078 taaatacaattaaaaggatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttgaata 20813177  T
165 agtttatccaaac-ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
20813178 agtatatccaaacaaaaatcaattcaaatccaactcacttttaaccaaacacaattctctcaaactc-attctatcaaaatcaattctctccaccgatat 20813276  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
20813277 accaaacacacac 20813289  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38125610 - 38125399
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |    
38125610 taaatacaattaaaaggataattttgtcattttacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacgaaatcaactcataagaatcactttcaaaca 38125511  T
165 agtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||    
38125510 agtgtatccaaacataatcaattcacctcaaacccacttttaaccaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgccata 38125411  T
265 ccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||    
38125410 ccaaacacacac 38125399  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 277
Target Start/End: Original strand, 26519617 - 26519809
Alignment:
86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tca 184  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||    
26519617 tttggtcattttacatttaaaatcaattttgtttcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatca 26519716  T
185 attcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacaca 277  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
26519717 attcacattcaactcactttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacacacaca 26519809  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 281
Target Start/End: Original strand, 53074835 - 53075051
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
53074835 taaatacaattaaaagggtaagttggtctttacgcatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatccactcataagaatcacttttaagtg 53074934  T
165 agtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  ||    
53074935 agtgtatccaaacataatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattttcaccgccgccgta 53075034  T
265 ccaaacacacacaaaga 281  Q
     ||||||||||| ||||    
53075035 tcaaacacacacgaaga 53075051  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38172466 - 38172264
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||    
38172466 taaaaggatagtttggtcattacacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtatcca 38172367  T
175 aacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| | ||||||||||    
38172366 aacataaatcaattcacatcccactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctattaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacaca 38172267  T
274 cac 276  Q
    |||    
38172266 cac 38172264  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 78 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 48189597 - 48189399
Alignment:
78 aagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaac 177  Q
    |||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    | || |||||||||    
48189597 aaggataatttagtcattatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctgttaacgtgtatccaaac 48189498  T
178 ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
48189497 ataatcaatttacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgccctaccaaacacacac 48189399  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8424861 - 8424689
Alignment:
102 tcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcac 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
8424861 tcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttctattgaagtgtatccaaacataatcaattcacgttcaactcac 8424762  T
202 ttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||    
8424761 ttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaattcaattatgaccaccgctatactaaacacac 8424689  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 10334070 - 10334282
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |    
10334070 taaatacaattaaaaggatagtttggtcattataaattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacgtcaactcataagaattacttttagtaa 10334169  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||    
10334170 agtgtatccaaacataaatcaattcatattcaactgacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgccat 10334269  T
264 accaaacacacac 276  Q
    | |||||||||||    
10334270 atcaaacacacac 10334282  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 52966978 - 52966766
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |     
52966978 taaatacaattaaaaggataatttggtcattacacatttaaaatcaattttgattcaacctatctaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtg 52966879  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||  || |||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |     
52966878 agggtacccaaacataaatcaattcacatcaaagtcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattttctccacctccaa 52966779  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
52966778 accaaacacacac 52966766  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 276
Target Start/End: Original strand, 3348176 - 3348387
Alignment:
66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataa 165  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
3348176 aaatacaattaaaaggataatttggtcaatacacattcaaaatcaattttgatataaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaa 3348275  T
166 gtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
3348276 gtgtatccaaacataaatcaatttacatccaactcacttctaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgctatg 3348375  T
265 ccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||    
3348376 ccaaacacacac 3348387  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 44939570 - 44939373
Alignment:
78 aagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaac 177  Q
    |||| |||||| ||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||    
44939570 aaggataatttagtcattagacattcaaaattaattttgattaaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttatag-taaatgtatccaaac 44939472  T
178 ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
44939471 ataatcaattcatattcaactcacttttaatcaaaatcaattcactcaaattcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacacacac 44939373  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 249
Target Start/End: Original strand, 35425277 - 35425450
Alignment:
76 aaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaa 175  Q
    |||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    |||| |||||||    
35425277 aaaaggataatttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactcataagaatcacttctgttaaagtgtatccaa 35425376  T
176 acataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35425377 acataatcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 35425450  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15511544 - 15511333
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    |||| |||| |||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
15511544 taaacacaattaaaagagtaatttcgtcattacgcattcaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatcaactcataaaaatcacttttaa-ta 15511446  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
15511445 agcgtatccaaacataaatcaattcacacccaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactccgttctatcaaaatcaattatcgccaccgccat 15511346  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
15511345 accaaacacacac 15511333  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 50664701 - 50664902
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |  || ||||||    
50664701 taaaaggataatttgatcattacacattcaaaatcaattttaatttaaactatctaaacaacat-aactcttaagaatcacttctaagtgtgtgtatcca 50664799  T
175 aacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
50664800 aacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacaca 50664899  T
274 cac 276  Q
    |||    
50664900 cac 50664902  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30811665 - 30811489
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
30811665 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaagtcataagaatcacttctgttaaagtgtatccaaacataatcaattcacattcaactc 30811566  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||    
30811565 acttttaatcaaaatcaattctctcaaattcaattatatcaaaatcaattctcgtcaccgccctaccaaacacacac 30811489  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 281
Target Start/End: Original strand, 23496256 - 23496466
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||| | || ||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||        
23496256 taaatacaattaaaatgatagtttagtcattatacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccgcaagaatcacttttag--- 23496352  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
        ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||| ||    
23496353 ----tatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcctcgccgccat 23496448  T
264 accaaacacacacaaaga 281  Q
    ||||||||||||| ||||    
23496449 accaaacacacactaaga 23496466  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 270
Target Start/End: Original strand, 35930670 - 35930876
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||| | || ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| || ||     
35930670 taaatacaattaaaatgatattttggtcattacacattcaaaatcaattttgatttaaaccatccaaacattatcaactcataagaatgacttatacatt 35930769  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
35930770 agtgtatccaagcataaatcaattcatatcaaactcacttttaataaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgatat 35930869  T
264 accaaac 270  Q
    |||||||    
35930870 accaaac 35930876  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 76 - 276
Target Start/End: Original strand, 38340749 - 38340949
Alignment:
76 aaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaa 175  Q
    |||||| ||||||||||| |  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||  |||||||    
38340749 aaaaggataatttggtcactacacatttaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaacgtcaacttataaaaattacttttaa-taagcatatccaa 38340847  T
176 acataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||    
38340848 acataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaacttcattctatcaaaatcaattctcaccaacgccataccaaacacac 38340947  T
275 ac 276  Q
    ||    
38340948 ac 38340949  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Original strand, 44224699 - 44224906
Alignment:
70 acaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagttt 169  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
44224699 acaattaaaaggataatttggtcattgcacattcaaaatcaattttgactaaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtgt 44224798  T
170 atccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaa 268  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || || |||| | |||||    
44224799 atccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaaccataatcaattatctcaaactcaattctaccggaatcaattctccccgccgccaaaccaa 44224898  T
269 acacacac 276  Q
    ||| ||||    
44224899 acaaacac 44224906  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 275
Target Start/End: Original strand, 21224940 - 21225133
Alignment:
83 taatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacata-a 181  Q
    |||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |    
21224940 taatttggtcattatacactcataatcaattttgattcaaactatcaaaacgacatcaactcgtaagaatcgcttttaagaaagtgtatccaaacatata 21225039  T
182 tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacaca 275  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| || || |||||| ||||||||||||    
21225040 tcaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatagagatcaattctcgccgccgctaaaccaaacacaca 21225133  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 242
Target Start/End: Original strand, 53179791 - 53179958
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
53179791 taaaaggataatttggtcattgtacattcaaaatcaattttgatttaaactatccaaacaa-atcaactcataaaaatcacttttaaaaaagtgtatcca 53179889  T
175 aacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 242  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
53179890 aacataaatcaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattatataaaactcaattctatcaaa 53179958  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 236
Target Start/End: Original strand, 31084140 - 31084311
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||| | || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |    
31084140 taaatacaattaaaatgatagtttggtcattacatattcaaaatcaattatgattcaaactatccaaataatatcaagtcataagaatcactttt-aaga 31084238  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattct 236  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
31084239 agtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctttcaaaatcaattct 31084311  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16246260 - 16246054
Alignment:
68 atacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagt 167  Q
    |||||| ||||||| || |||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||||    
16246260 atacaattaaaaggatagtttgatcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcctaagaatcacttctattaaagt 16246161  T
168 ttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctatacc 266  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||| || | ||||| | |||    
16246160 gtttccaaacataaatcaatttacatctaactcacttttaactaaaatcaat--tctcaaactcaattctattaatatcaattctcgctaccgccaaacc 16246063  T
267 aaacacaca 275  Q
    |||||||||    
16246062 aaacacaca 16246054  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23207235 - 23207039
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
23207235 taaatacaattaaaaggatggtttggtcattacaagttcaaaattaattttgattcaaactatc-aaacaacatcaactcataa-aatcacttgtaaaaa 23207138  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgcta 262  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||    
23207137 agtgtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcatttttaaccaaaatcaattataacaaaatcaattatatcaaaatcaattttcgccaccgcta 23207039  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Original strand, 42475680 - 42475853
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |||| ||| |||||| || |||||||||||| ||||||||    
42475680 aaaagcaattttgattcaatgtatccaaacaacaacaattcataagaatcgcttttaacaaagtgtattcaaacaaaaatcaattcacatctaactcact 42475779  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| | ||||||| |||||    
42475780 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctataaaaatcaattctcgtcaccgccaaaccaaacgcacac 42475853  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 276
Target Start/End: Original strand, 4984592 - 4984725
Alignment:
144 cataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
4984592 cataagaatcacttttaaacgagtgtatccaaacataaatcaattcacatctaactcacttttaaccaaaatcaattttctcaaattcaattatatcaaa 4984691  T
243 atcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
4984692 atcaattctccccaccgccataccaaacacacac 4984725  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 275
Target Start/End: Original strand, 34561075 - 34561251
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 198  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || |  ||||||||| || ||| | | | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
34561075 attcaaaatcaattttgggtcaaactatccaaccaacattaatttttaagaatcaattctaagtcaatgtatccaaacataaatcaattcgcattcaact 34561174  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacaca 275  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||    
34561175 cacttttaaccaaaatcaattttatcaaacttaattctatcaaaatcaattttctccactgctgaaccaaacacaca 34561251  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 276
Target Start/End: Original strand, 55154538 - 55154645
Alignment:
169 tatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaa 268  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||    
55154538 tatctaaacataatcaattcacattcaactcacttttaactaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccactgccataccaa 55154637  T
269 acacacac 276  Q
    ||||||||    
55154638 acacacac 55154645  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31619021 - 31618884
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaact 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||| ||||||||||| || || |    
31619021 attcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctaagtgagagtatccaaacataaatcaattcacttctaagt 31618922  T
199 ca----cttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaa 232  Q
     |     ||  |||||||||||||||||||||||||||    
31618921 gagagtattcaaagcaaaatcaattctctcaaactcaa 31618884  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 236
Target Start/End: Original strand, 25847983 - 25848136
Alignment:
83 taatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa- 181  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| | |   |||||||||||||     
25847983 taatttggtcattacacatttaaaatcaatttttattcaa-ctatccaaacaacacaaactcataagaatcatttttaagtgaaggtatccaaacataaa 25848081  T
182 tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattct 236  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||    
25848082 tcaattcatattaaactcactttttaccaaaattaattttctcaaactcaattct 25848136  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30810069 - 30809942
Alignment:
110 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||  ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||     
30810069 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaatttataagaatcacttttaagtaagcgtaatcaatcataaatcaattcacatttaactcacttttaac 30809970  T
209 caaaatcaattctctcaaactcaattct 236  Q
    |||| |||||| | ||||| ||||||||    
30809969 caaactcaattttatcaaaatcaattct 30809942  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 45423899 - 45423744
Alignment:
103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||  | | | ||||||||||||| | | | |  | |||||||||    
45423899 caaaatcaattttgattcaagctatccaaacaacatgaattgataagaatcacttttactttaatatatccaaacataaaccaattaagttcaactcact 45423800  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccacc 258  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | |||||| |  ||||||||||| || |||||    
45423799 tttaggcaaaatcaattctatcagaatcaattatgccaaaatcaattttcgccacc 45423744  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 249
Target Start/End: Original strand, 19877448 - 19877534
Alignment:
164 aagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
19877448 aagtatatctaaacataaatcaatttacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaataaatt 19877534  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 203
Target Start/End: Original strand, 32357479 - 32357582
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactc 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||| ||||| || ||    
32357479 ttcaaaatcaattttaattcaaagtacccaaacaacatcaacacataagaatcacttttaaatgagtgttttcaaacataaatcaatttacatcaaattc 32357578  T
200 actt 203  Q
    ||||    
32357579 actt 32357582  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 161
Target Start/End: Original strand, 22736915 - 22737009
Alignment:
67 aatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaa 161  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
22736915 aatacaattaaaagtataatttgttcattacacattcaaaatcaattttgattcaaaccatcccaacaacattaactcataataatcacttttaa 22737009  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49526803 - 49526653
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 198  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||| || | |||||||||| ||||| || | | ||||||||||||| |||||| |||  ||| |    
49526803 attcaaaagcaattttgatttagactatttaaacaacataaattgataagaatcaattttacatgaatgtatccaaacataaatcaatttacaatcaatt 49526704  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||    
49526703 cacttttaatcaaaatcaattctatcaaaatcaatttcatcaaactcaatt 49526653  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14651234 - 14651086
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactc 199  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| | || |  ||| |||||||| ||  ||||| |||| ||||| || |||||| | || ||||||    
14651234 ttcaaaagctattttgattcaaattatccaaacaacttgaattggtaaaaatcacttctatgtaagtatatcaaaacacaaatcaatt-atattcaactc 14651136  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
14651135 acttttaatcaaaatcaattctatcaaaatcaattttattaaaatcaatt 14651086  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40415401 - 40415280
Alignment:
129 caaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaa 227  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |  ||||| |  || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||  | |||    
40415401 caaacaaaatcaacttataagaattatctttaagtgggtatatccaaacataaattaatttacatccaactcacttttaactaaaatcgattcctttaaa 40415302  T
228 ctcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||    
40415301 ctcaattctatcaaaatcaatt 40415280  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Original strand, 52813278 - 52813332
Alignment:
195 aactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
52813278 aactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatt 52813332  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29716739 - 29716674
Alignment:
180 aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatc 245  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
29716739 aatcaattcatatttaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaattcaattttatcaaaatc 29716674  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 273
Target Start/End: Original strand, 35930876 - 35930929
Alignment:
220 ctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
35930876 ctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccagtataccaaacaca 35930929  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 55087630 - 55087593
Alignment:
106 aatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaact 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55087630 aatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaact 55087593  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37698519 - 37698485
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37698519 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 37698485  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Original strand, 14959686 - 14959739
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatc 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||    
14959686 attcaaaatcaagtttgattcaaatcatctaaacaacatcaactcataaaaatc 14959739  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31618422 - 31618369
Alignment:
223 tcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||    
31618422 tcaaactcaattctatcaaaatcaattcttcccaccgtcataccaaacacacac 31618369  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 160
Target Start/End: Original strand, 41459040 - 41459099
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 160  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||    
41459040 attcaaaatcaatttt-attcaaattatccaaacaccatgaattgataagaatcactttta 41459099  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 276
Target Start/End: Original strand, 44225601 - 44225708
Alignment:
169 tatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctatacca 267  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||| |   ||||    
44225601 tatccaaacataaatcactttacattaaactcacttttaacgaaaatcaattcta-caaaatcaattatattaaaatcaattttctccaccacacaacca 44225699  T
268 aacacacac 276  Q
    |||||||||    
44225700 aacacacac 44225708  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 239
Target Start/End: Original strand, 22737062 - 22737121
Alignment:
180 aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatc 239  Q
    |||||||| |||| | ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
22737062 aatcaatttacattctacttacttttaaccaaaatcaattttttcaaactcaattctatc 22737121  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 44610349 - 44610311
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatc 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
44610349 attcaaaatcaattttgat-caaactatccaaacaacatc 44610311  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 53078328 - 53078363
Alignment:
103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
53078328 caaaatcaattttgattcaaactgtccaaacaacat 53078363  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 138
Target Start/End: Original strand, 30811291 - 30811329
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 138  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
30811291 attcaaaatcaattttgatcaaaactatccaaacaacat 30811329  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 45488525 - 45488483
Alignment:
209 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattat 251  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
45488525 caaaatcaattctttcaaaatcaattctatcataatcaattat 45488483  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 151
Target Start/End: Original strand, 1218555 - 1218608
Alignment:
98 atattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaa 151  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
1218555 atatccaaaatcaattttatttcaaactatggaaacaacattaactcataagaa 1218608  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Original strand, 7012676 - 7012729
Alignment:
169 tatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattct 221  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
7012676 tatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattct 7012729  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 221
Target Start/End: Original strand, 30736172 - 30736213
Alignment:
180 aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattct 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
30736172 aatcaattcacatacaactcacttttaactaaaatcaattct 30736213  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 160
Target Start/End: Original strand, 49790222 - 49790307
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 160  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||| |||||||||| |   | ||||||||||||||| |||||    
49790222 taaaaggttaatttggtcattacacattcaaaatctgttttaattcagactatccaaatatagttaactcataagaatcaatttta 49790307  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 160
Target Start/End: Original strand, 19874675 - 19874715
Alignment:
120 caaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 160  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
19874675 caaactatgcaaacaacgtcaactcataagaataactttta 19874715  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 251
Target Start/End: Original strand, 30811371 - 30811411
Alignment:
211 aaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattat 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
30811371 aaatcaattctctcaaaatcaattctgtcagaatcaattat 30811411  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33025219 - 33025179
Alignment:
211 aaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattat 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
33025219 aaatcaattctctcaaaatcaattctgtcagaatcaattat 33025179  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 251
Target Start/End: Original strand, 48181728 - 48181768
Alignment:
211 aaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattat 251  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
48181728 aaatcaattatctcaaaatcaattctatcagaatcaattat 48181768  T

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Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48253919 - 48253879
Alignment:
209 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
48253919 caaaatcaattctgtcagaatcaattctatcaaaatcaatt 48253879  T

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Target: chr4 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 78)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 78 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43781674 - 43781477
Alignment:
78 aagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaac 177  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
43781674 aaggataatttggtcattttacattcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaac 43781575  T
178 ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacaca 275  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
43781574 ataatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacaca 43781477  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Original strand, 30842049 - 30842258
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| |    
30842049 taaatacaattaaaaggataattttgtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaatgaaatcaactcataagaatcactttcaaaca 30842148  T
165 agtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||    
30842149 agtgtatccaaacataatcaattcacctcaaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgccata 30842248  T
265 ccaaacacac 274  Q
    ||||||||||    
30842249 ccaaacacac 30842258  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 64 - 275
Target Start/End: Original strand, 39636701 - 39636913
Alignment:
64 gtaaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaat 163  Q
    ||||||| || ||||||| || ||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
39636701 gtaaatataattaaaaggatattttggtcgttacacatttaaaatcaattttgattcatactatccaaacaacatcaactcgtaagaatcacttttaagt 39636800  T
164 aagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgcta 262  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |    
39636801 aagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtca 39636900  T
263 taccaaacacaca 275  Q
    |||||||||||||    
39636901 taccaaacacaca 39636913  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 277
Target Start/End: Original strand, 14072430 - 14072632
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||    
14072430 taaaaggataatttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcattagaatcacttctattaaagtgtatcca 14072529  T
175 aacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
14072530 aacataatcaatttaccttcaactcacttttaaacaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaacacac 14072629  T
275 aca 277  Q
    |||    
14072630 aca 14072632  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 78 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 32238214 - 32238016
Alignment:
78 aagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaac 177  Q
    |||| |||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||| |||||||||    
32238214 aaggataatttagtcattagacattcaaaatcagttttgattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcacttctaatatagtgtatccaaac 32238115  T
178 ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
32238114 ataaccaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacacacac 32238016  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 29149455 - 29149259
Alignment:
86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tca 184  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||    
29149455 tttggtcattttacatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatca 29149356  T
185 attcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacacaaaga 281  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||    
29149355 attcacattcaactcactttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaatacacactaaga 29149259  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48407866 - 48407682
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| |    
48407866 taaatacaattaaaaggataattttgtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaatgaaatcaactcataagaatcactttcaaaca 48407767  T
165 agtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48407766 agtgtatccaaacataatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 48407682  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 276
Target Start/End: Original strand, 28986939 - 28987147
Alignment:
66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataa 165  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || | |    
28986939 aaatacaattaaaatggtaagttggtcattacccatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataaaaatcactt--aagtga 28987036  T
166 gtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctatac 265  Q
    || ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
28987037 gtgtattcaaacataatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcaccaccgccatac 28987136  T
266 caaacacacac 276  Q
    |||||||||||    
28987137 caaacacacac 28987147  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9889493 - 9889295
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||||    
9889493 taaaaggataatttagtcattatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatctactcataagaatcactttcaagtgagtgtatcca 9889394  T
175 aacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
9889393 aacatatacaattcatatctaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaacaca 9889295  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 6138749 - 6138577
Alignment:
105 aaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcactt 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
6138749 aaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcatttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcactt 6138650  T
204 ttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||    
6138649 ttaaccaaaatcaattatttcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacacacac 6138577  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14564315 - 14564103
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    |||||||||  |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |     
14564315 taaatacaacaaaaaggataagttggtcattatatattcaaaatcaattttgattcaatctatccaaacaacattaactcataagaatcacttttaactg 14564216  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    |   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||       
14564215 aaggtatccaaacataaatcaattcatatccaactcacatttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccgccgccca 14564116  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
14564115 accaaacacacac 14564103  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 16566222 - 16566434
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||  |    
16566222 taaatacaattaaaaggatagtttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataa 16566321  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | || ||    
16566322 agtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccctgctgccat 16566421  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
16566422 accaaacacacac 16566434  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19592400 - 19592188
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||   |    
19592400 taaatacaattaaaagaataatttggtcattgtacattcaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacgtcaattcgtaagaatcacttttagtaa 19592301  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
19592300 agtgtatccaaacataaatcaattcacttccaactcacttttaaccaaaatcaattctctaaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccat 19592201  T
264 accaaacacacac 276  Q
    | |||||||||||    
19592200 atcaaacacacac 19592188  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 46830237 - 46830026
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66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataa 165  Q
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46830237 aaatacaattaaaaggataatttggtcaatacacatttaaaatcaattttgatgtagaatatccaaacaacatcaactcataagaatcaattttaagaaa 46830138  T
166 gtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
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46830137 gtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccata 46830038  T
265 ccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||    
46830037 ccaaacacacac 46830026  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 78 - 273
Target Start/End: Original strand, 54152975 - 54153170
Alignment:
78 aagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaac 177  Q
    |||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||| |||||    
54152975 aaggataatttagtcattagacattcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcatgagaatcacttctagtaaagtgtattcaaac 54153074  T
178 ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
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54153075 ataatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattcactcaaactcaattatattaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacaca 54153170  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 43772292 - 43772075
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    |||||| || ||||||| || ||||||||||  | | | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
43772292 taaatataattaaaaggatagtttggtcattacacacttaaaatcaattttgattcatattatccaaacaacatcaactcgtaagaatcacttctaaaaa 43772193  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |     
43772192 agtgtatccaaacataaatcgattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgtcaccaccaa 43772093  T
264 accaaacacacacaaaga 281  Q
    ||||||||||||| ||||    
43772092 accaaacacacactaaga 43772075  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 276
Target Start/End: Original strand, 51922868 - 51923069
Alignment:
76 aaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaa 175  Q
    |||||| || ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||    
51922868 aaaaggatagtttggtcattatacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaattacttttagtaaagtgtatccaa 51922967  T
176 acat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||| |||||||||||||    
51922968 acataaatcaattcagattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctaacaaaatcaattctcgtcgccgccataccaaacacac 51923067  T
275 ac 276  Q
    ||    
51923068 ac 51923069  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26652005 - 26651805
Alignment:
77 aaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaa 176  Q
    ||||| || ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||   |||| |||| |||    
26652005 aaaggatagtttggtcattatacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaataacatcgactcataagaattacttttagtaaagtgtatctaaa 26651906  T
177 cataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacaca 275  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||    
26651905 cataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaattctcgccgccgccataccaaacacaca 26651806  T
276 c 276  Q
    |    
26651805 c 26651805  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26426265 - 26426072
Alignment:
83 taatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataat 182  Q
    |||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
26426265 taatatggtcattatacattcacaatcaattttgattcaatgtatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcgtatccaaacataat 26426166  T
183 caattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||    
26426165 caatttatatctaactcacttttaaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgtcataccaaacacacac 26426072  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 42945067 - 42944850
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    |||||| || ||||||| || ||||||||||  | ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
42945067 taaatataattaaaaggatagtttggtcattatacatttaaaatcaattttgatacatactatccaaacaacatcaacacataagaatcacttttaagta 42944968  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  |||||||  |    
42944967 agtatatctaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaataaattcttgccaccgccgt 42944868  T
264 accaaacacacacaaaga 281  Q
    |||||||  |||||||||    
42944867 accaaacttacacaaaga 42944850  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 49136444 - 49136647
Alignment:
70 acaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagttt 169  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
49136444 acaattaaaaggataatttggtcattgtacattcaaaatcaattttgattaaaattattcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtgt 49136543  T
170 atccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaa 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||  |||| | |||||    
49136544 atccaaacataaatcaattcacatcaaactcacttttaaccataatcaattctctcaaactcaattataccagaatcaattaactctgccgccaaaccaa 49136643  T
269 acac 272  Q
    ||||    
49136644 acac 49136647  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 276
Target Start/End: Original strand, 48908179 - 48908402
Alignment:
57 aatttaggtaaatacaaataaaagggtaa-----tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaa 151  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||     ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
48908179 aatttagttaaatacaattaaaagggtaaggtaatttggtcttttaatgttcaaaatcaattttgattcaagctatccaaacaacatcaacttatatgaa 48908278  T
152 tcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattat 251  Q
    | ||||||||   || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |    
48908279 ttacttttaagcgaggt-atccaaacataaccaattcacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaataatattaaaatcaatttt 48908377  T
252 ctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    | || |||| | |||||||||||||    
48908378 caccgccgccaaaccaaacacacac 48908402  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 273
Target Start/End: Original strand, 9893638 - 9893837
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| ||||||  |||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||    
9893638 taaaaggataatttaatcattatacattcaaaatcaattttaatttaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttcaagtgggtgtatcca 9893737  T
175 aacata-atcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
9893738 aacatatatcaattcatatctaactcacttttgacaaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaacaca 9893837  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 252
Target Start/End: Original strand, 6505118 - 6505306
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||     
6505118 taaatgcaattaaaaggataattcagtcattatatattcaaaatcaattttgacttaaactatccaaacaacatcaagtcatgataatcacttttatatg 6505217  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatc 252  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
6505218 agtgtatctaaacataaatcaattcacatcaaactcatttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaagtcaattatc 6505306  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13183219 - 13183010
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| | ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||    
13183219 taaatacaatttaaaggatagtttggtcattttacattcaaaatcaattttgatttaaattatccaaaaaacatcaacttataaaaatcatttttaaata 13183120  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||  ||    
13183119 agtgtatccaaacataaatcaattcaccttaaacttgcttttaaccaaaatcaattatctcagactcaattttatcaaaatcaattatcgtcaccgtcat 13183020  T
264 accaaacaca 273  Q
    ||||||||||    
13183019 accaaacaca 13183010  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 48550557 - 48550424
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
48550557 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtttatccaaacataaatcaattcacatccaactcact 48550458  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattct 236  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
48550457 tttaaccaaaatcaattctatcaaaatcaattct 48550424  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Original strand, 54150482 - 54150655
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
54150482 aaaagcaattttgatttaatgtatccaaacaacaccaacttataagaatcatttttaacgaagtgtatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcact 54150581  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||    
54150582 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattcttgccaccgccataccaaacacacac 54150655  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4954220 - 4954050
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||  | ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
4954220 taaatacaattaaaaggataattaggtcattacacatttaaaattaattttgattcaacctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtg 4954121  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaatt 234  Q
    ||  || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
4954120 agggtacccaaacataaatcaattcacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaatt 4954050  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 25312671 - 25312845
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
25312671 aaaagcaattttgattcaatgtatccaaacaacaacaattcataagaatcgcttttaacaaagtgtatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcact 25312770  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacaca 277  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| | ||||||||||||||    
25312771 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgttaccgccaaaccaaacacacaca 25312845  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 103 - 276
Target Start/End: Original strand, 48550172 - 48550346
Alignment:
103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcac 201  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
48550172 caaaatcaattttaatccaatctatccaaacaatatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcac 48550271  T
202 ttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
48550272 ttttaatcaaaatcaattctcttaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 48550346  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Original strand, 49519686 - 49519862
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104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
49519686 aaaatcaattttaatacatactatccaaacaatatcaattcataagaatcatttttaagcaagtgtatccaaacataaataaattcacatccaactcact 49519785  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt---atctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | | ||||||| |||||||||||||||    
49519786 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaaccaattctcaccaccaccgccataccaaacacacac 49519862  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Original strand, 13167481 - 13167654
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104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
13167481 aaaagcaattttgattcaatctatccaaacatcattaatacataagaatcacttttaaatgggtgtatccaaatataaatcaattcacattcaactcact 13167580  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||    
13167581 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaatttttcctaccgccataccaaacacacac 13167654  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Original strand, 15603312 - 15603489
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 198  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||    
15603312 attcaaaatcaattttgacttaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcatttttaagcaagtatatctaaacacaaatcaattcacatcaaact 15603411  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||||||    
15603412 cactttttaccataatcaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgtcaaaccaaacacacac 15603489  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31520519 - 31520328
Alignment:
85 atttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tc 183  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||    
31520519 atttggtcattacacatttaaaatcaatttttattcaaactacccaaaaaacatcaactcataaaaatcacttttaa-taagcatatctaaacataaatc 31520421  T
184 aattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
31520420 cattcacacccaactcacttttaaccaaaattaattctttcaaacttcattctaccaaaatcaattctcgccatcgctataccaaacacacac 31520328  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 118 - 276
Target Start/End: Original strand, 39187704 - 39187863
Alignment:
118 ttcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatca 216  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
39187704 ttcaaattattcaaacaacatcaactaacaagaatcacttctagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaaattacttttaaccaaaatca 39187803  T
217 attctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
39187804 attctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccgccaaaccaaacacacac 39187863  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 259
Target Start/End: Original strand, 46926010 - 46926160
Alignment:
110 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaag 208  Q
    |||||||||||||| |||  ||| || || || |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
46926010 aattttgattcaaaatatataaataaaattaattcataaaaatcacttttaaacgagtgtatccaaacataaatcaattcacatctaactcacttttaac 46926109  T
209 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccg 259  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
46926110 caaaaacaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattatccccaccg 46926160  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 236
Target Start/End: Original strand, 15619534 - 15619703
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| ||||||  | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||  ||    
15619534 taaatacaattaaaatgataatttagtcattacacattcaagatca-ttttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttatag-ta 15619631  T
165 agtttatccaaacata-atcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattct 236  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
15619632 a-tgtatccaaacatacatcaattcacatccaactcactttttaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 15619703  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 56242004 - 56241844
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||     
56242004 taaatacaattaaaaggatattttggtcattatacattcaaaatcaattttgatttaaatcatctaaacattatcaactcataagaatcacttttacatt 56241905  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctc 224  Q
    | | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
56241904 aatgtatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaatcaaaatcaattctctc 56241844  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 249
Target Start/End: Original strand, 14075953 - 14076116
Alignment:
86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tca 184  Q
    ||||||||||  | |||||| || |||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||| |||    
14075953 tttggtcattacacattcaagattaattttgatttaaagtactcaaacaacatcaattcataagaatcacttttaagtatatgtttccaaacataaatca 14076052  T
185 attcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
14076053 atttacatcaaactcacttt-aaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 14076116  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 54735798 - 54735635
Alignment:
86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatca 184  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||| || ||    
54735798 tttggtcattacacattcaagatcaattttgatttaaaatactcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtatatgtttccaaacataaacca 54735699  T
185 attcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
54735698 atttacatcaaactca-atttaaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 54735635  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 249
Target Start/End: Original strand, 14054806 - 14054953
Alignment:
103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcac 201  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
14054806 caaaatcaattttaatttaaagtattcaaacaacatcaacttgaaataatcacttttatataagtttatccaaacataaatcaattcacatcaaactcac 14054905  T
202 ttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||| |  ||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
14054906 ttttgactaaactcaattctttcaaactcaattatgtcaaaatcaatt 14054953  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2175315 - 2175161
Alignment:
66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataa 165  Q
    ||||| || ||||||| |||||| ||||||  |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||   |    
2175315 aaatataattaaaaggataatttagtcattgtacgttcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaacccatcaaaatcacttttaagcga 2175216  T
166 gtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaatt 219  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
2175215 gtgcatccaaacataaatcaattcacatcaaactcacttttaatcaaaatcaatt 2175161  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Original strand, 38305963 - 38306140
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||   | |   ||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
38305963 attcaaaatcaattttgatccaagttatccaaacaacatgaatttataagaatcacttttgctttaaggtatccaaacataaatcaattcgcattcaact 38306062  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
38306063 cacttttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaattatctccaccgtagaaccaaacacacac 38306140  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 276
Target Start/End: Original strand, 41866176 - 41866283
Alignment:
170 atccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaa 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
41866176 atccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaactaaactcaattccctcaaactcaattttatcaaaatcaattatcgccaccgccaaaccaa 41866275  T
269 acacacac 276  Q
    ||||||||    
41866276 acacacac 41866283  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Original strand, 54488561 - 54488734
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 202  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||| || || | |||||||||||||||   | |   ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
54488561 aaaatcaattttgatccaagttatccaaacaaaatgaatttataagaatcacttttgctttaaggtattcaaacataaatcaattcacattcaactcact 54488660  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||  ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
54488661 tttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaattatctccaccgcagaaccaaacacacac 54488734  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 254
Target Start/End: Original strand, 38263881 - 38264006
Alignment:
129 caaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaa 227  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| ||| ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
38263881 caaacaacat-aactcataagtatcacttttaagtgagtatattcaaacataaattaattcacatcaaactcaattttaagcaaaattaattttctcaaa 38263979  T
228 ctcaattctatcaaaatcaattatctc 254  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||    
38263980 ctcaattatatcaaaatcaattttctc 38264006  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19599625 - 19599487
Alignment:
103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcac 201  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
19599625 caaaagcaattttgattctaaata-ccaaacaacataaattgataagaatcaattttaagtaattgcatccaaacataaatcaatt-acattcaactcac 19599528  T
202 ttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 242  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19599527 ttttattcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 19599487  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30887312 - 30887165
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||    
30887312 taaaaggttaatttggtcattacacattcaaaatcaattttgatacaaaccatccaaacatcattaactcataagaatcacttttatattggtgtatcca 30887213  T
175 aacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctc 222  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||  ||||| |||||||    
30887212 aacataaatcaatt-tcatcaaactcacgtttaactaaaataaattctc 30887165  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 55638834 - 55638739
Alignment:
155 cttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55638834 cttttaaataagtgtatctaaacataaatcaatttacatttaactcacttttaacaaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 55638739  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 55638956 - 55638861
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 160  Q
    ||||||||| ||||| | || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
55638956 taaatacaattaaaatgatagtttggtcattacatattcaaaatcaattttgattcatattatccaaacaatatcaactcataagaatccctttta 55638861  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 243
Target Start/End: Original strand, 33574211 - 33574274
Alignment:
180 aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaa 243  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
33574211 aatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaa 33574274  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 249
Target Start/End: Original strand, 38693985 - 38694150
Alignment:
83 taatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataat 182  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||     
38693985 taatttggtcatt--acattcaaaattaattttgatttaaattattcaagcaagatcaacccataagaatcacttttaagcgagtgtatccaaacataaa 38694082  T
183 c-aattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    | ||||  ||  ||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||    
38694083 ctaatttgcactcaacttacttttagacaaaatcaattcttttaaactcaatcatatcaaaattaatt 38694150  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 276
Target Start/End: Original strand, 48556585 - 48556682
Alignment:
180 aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaa-tcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||   ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
48556585 aatcaattcacattcaagtcactttttttcaaaaatcaattttatcaaactcaattctatcaaaatcaattatttccaccgctgaaccaaacgcacac 48556682  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 273
Target Start/End: Original strand, 53532019 - 53532103
Alignment:
189 acatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||   ||||||||||    
53532019 acatccaactcacttttaactaaaatcaattatgtcaaactcaattttatcaaaatcaattctcaccaccgccgaaccaaacaca 53532103  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 278
Target Start/End: Original strand, 54655266 - 54655363
Alignment:
181 atcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacacaa 278  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||    
54655266 atcaattcacatcaaacacacttttgactaaaatcaattattttaaactcaattatgtcaaaatcaattatcgtcaccgccgtaccaaacacacacaa 54655363  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 160
Target Start/End: Original strand, 48257055 - 48257115
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
48257055 attcaaaatcaattttgatccaatttatccaaacaacatgaatttataagaatcactttta 48257115  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 276
Target Start/End: Original strand, 523172 - 523279
Alignment:
170 atccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaa 268  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||   ||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||| |||| || |||  |||||    
523172 atccaaacataaatcaattcatattgaactcactttttcccaaaatcaattttgtcaagctcaattaaatcaaaatcaattttctcaacagctgaaccaa 523271  T
269 acacacac 276  Q
    ||||||||    
523272 acacacac 523279  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 5025484 - 5025519
Alignment:
103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5025484 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 5025519  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4649967 - 4649913
Alignment:
195 aactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
4649967 aactcgcttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattttatcaaaatcaatt 4649913  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45780047 - 45779994
Alignment:
195 aactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
45780047 aactcactttttaccaaaatcaatt-tctcaaactcaattctatcgaaatcaatt 45779994  T

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Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 54487285 - 54487219
Alignment:
169 tatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaatt 234  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||    
54487285 tatccaaacataaatcaatttacattcaactcacttttgatcgaaatcaattctatcaaactcaatt 54487219  T

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Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22694636 - 22694556
Alignment:
194 caactcacttttaagcaaaatcaattct-ctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||   |||||||||||    
22694636 caactcacttttaaccaaaatcaattctacttaaa-tcaattctaccaaaatcaattctttccaccgcacaaccaaacacac 22694556  T

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Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 236
Target Start/End: Original strand, 36150625 - 36150693
Alignment:
169 tatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattct 236  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||    
36150625 tatccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaatcaaaatcaattatatcaaaatcaattct 36150693  T

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Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 236
Target Start/End: Original strand, 53914920 - 53914987
Alignment:
169 tatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattct 236  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||    
53914920 tatccaaacataaatcaatt-acattcaactcacttttagtcaaaatcgattctctgaaactcaattct 53914987  T

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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16202572 - 16202534
Alignment:
211 aaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
16202572 aaatcaattctctcaaaatcaattttatcaaaatcaatt 16202534  T

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Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 234
Target Start/End: Original strand, 16492948 - 16493014
Alignment:
169 tatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaatt 234  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||||| ||||||    
16492948 tatccaaacataaataaattcacattcaactcacttttaatcaaactcaattatttcaaaatcaatt 16493014  T

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Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 258
Target Start/End: Original strand, 39993586 - 39993664
Alignment:
180 aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccacc 258  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| | |  ||||||| ||||||||    
39993586 aatcaattcacatttaactcatttttaatcaaaatcaattctatgaaaatcaattctcttatgatcaattttctccacc 39993664  T

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Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 276
Target Start/End: Original strand, 40286329 - 40286410
Alignment:
194 caactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||    
40286329 caactcaattttaatcaaaatcaattctatagaa-tcagttctatcaaaatcaattttgtccaccgcacaaccaaacacacac 40286410  T

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Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 138
Target Start/End: Original strand, 45106360 - 45106398
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 138  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
45106360 attcaaaatcaattttgataaaaactatccaaacaacat 45106398  T

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Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 50523387 - 50523350
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 138  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
50523387 ttcaaaatcaattttgatcaaaactatccaaacaacat 50523350  T

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Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 160
Target Start/End: Original strand, 54655205 - 54655262
Alignment:
103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 160  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   || |||||||||||    
54655205 caaaatcaattttaatttaaagtatccaaacaacatcaacttgaaataatcactttta 54655262  T

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Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 257
Target Start/End: Original strand, 9064373 - 9064401
Alignment:
229 tcaattctatcaaaatcaattatctccac 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
9064373 tcaattctatcaaaatcaattatctccac 9064401  T

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Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16202559 - 16202519
Alignment:
209 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
16202559 caaaatcaattttatcaaaatcaattctatcaaaatcaatt 16202519  T

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Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26459897 - 26459853
Alignment:
232 attctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||    
26459897 attctatcaaaattaattctcgccaccgccataccaaacacacac 26459853  T

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Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33721998 - 33721938
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |  | ||||||||| ||||||    
33721998 attcaaaatcaattttgattcaaactattcgaataacatgactttataagaatcgctttta 33721938  T

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Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 126
Target Start/End: Original strand, 43628673 - 43628713
Alignment:
86 tttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaacta 126  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
43628673 tttggtaatttaacatttaaaatcaattttgattcaaacta 43628713  T

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Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 234
Target Start/End: Original strand, 46958070 - 46958110
Alignment:
194 caactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaatt 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
46958070 caactcacttttaaccaaaatcaattctatcaaaatcaatt 46958110  T

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Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 54683453 - 54683517
Alignment:
212 aatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||   |||||||||||||    
54683453 aatcaattcattcaaaatcaattctatcaaaatcaatttttttcaccgcagaaccaaacacacac 54683517  T

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Target: chr7 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 59 - 276
Target Start/End: Original strand, 34010287 - 34010503
Alignment:
59 tttaggtaaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttt 158  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
34010287 tttagttaaatataattaaaagggtaatttggtcatttaatgttcaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaaccacttt 34010386  T
159 taaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccacc 258  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
34010387 taaatgagtgtattcaaacataatcagttcatatccaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccacc 34010486  T
259 gctataccaaacacacac 276  Q
    || | |||||||||||||    
34010487 gcca-accaaacacacac 34010503  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Original strand, 9456058 - 9456268
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
9456058 taaatacaattaaaaagataatttggtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaagatcaactcataagaatcacttttaaaca 9456157  T
165 agtttatccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | |||||  ||    
9456158 agtgtatccaaacataatcaatttacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcgaacttaattctatcaaaatcaattctcactaccgccgta 9456257  T
265 ccaaacacaca 275  Q
    ||||| |||||    
9456258 ccaaagacaca 9456268  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 37562533 - 37562735
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| || ||||||||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
37562533 taaaaggatagtttggtcattacacatacaaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcacttttaaataagtgtatcca 37562632  T
175 aacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||    
37562633 aacataaatcaattcacatccaactcacttttaacaaaaatcaattctcttaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacaca 37562732  T
274 cac 276  Q
    |||    
37562733 cac 37562735  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3622616 - 3622399
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || |||| || ||  | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
3622616 taaatacaattaaaaggatactttgatcgttacacatttaaaatcaattttgatttatactatccaaacaacatcaactcgtaagaatcacttttaagta 3622517  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
3622516 agtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccat 3622417  T
264 accaaacacacacaaaga 281  Q
    | ||||||||||| ||||    
3622416 aacaaacacacactaaga 3622399  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 43738094 - 43737883
Alignment:
66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataa 165  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
43738094 aaatacaattaaaaggttaatttggtcatttcacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatccactcataagaatcacttttaaataa 43737995  T
166 gtttatccaaac-ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| || ||  ||| |||    
43737994 gtttatccaaacaaaaatcaattcatatctaactaacttttaatcaaaatcaattctcttaaactcaattatgttaaaatcaattctcaccgtcgccata 43737895  T
265 ccaaacacacac 276  Q
    | ||||||||||    
43737894 ctaaacacacac 43737883  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 3342753 - 3342955
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||    
3342753 taaaaggatagtttggtcattacatattcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtatcca 3342852  T
175 aacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||    
3342853 aacataaatcaattcatatccaactcacttttaactaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctccccaccgccaaaccaaacaca 3342952  T
274 cac 276  Q
    |||    
3342953 cac 3342955  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43631816 - 43631642
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactc 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
43631816 attcacaatcaattttgattcaatatatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcatatccaaacataatcaattcatatctaactc 43631717  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
43631716 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatccccaccgccataccaaacacac 43631642  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 37639383 - 37639595
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |    
37639383 taaatacaattaaaaggatagtttagtcattacacatttaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacaagaatcacttttaataa 37639482  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||    
37639483 agtttctccaaacataaatcaattcacattcaattcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccat 37639582  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
37639583 accaaacacacac 37639595  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 48134568 - 48134742
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||| |    
48134568 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacttataaaaatcacttttaaacaagtttatccaaacataatcaattctcctcaaaccc 48134667  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacac 274  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||    
48134668 acttttaacaaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattttcgcaaccgccataccaaacacac 48134742  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 65 - 273
Target Start/End: Original strand, 3375443 - 3375652
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
3375443 taaatacaattaaaaggataatttggtcattgcacattcaaaatcaattttgatccaaatcatccaaacaacatcgactcataagaatcacttttaagtg 3375542  T
165 agtttatccaaaca-taatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |    
3375543 agtgtatccaaacacaaatcaattcacaccaaactcacttttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccatcaccgt 3375642  T
264 accaaacaca 273  Q
    ||||||||||    
3375643 accaaacaca 3375652  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 48459663 - 48459875
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    |||||| || ||||||| || ||||||||||  | | | |||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
48459663 taaatataattaaaaggatagtttggtcattacacacttaaaatcaattttaatacatactatccaaacaacatccattcataagaatcacttttaagta 48459762  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||    
48459763 agtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaacgtcat 48459862  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
48459863 accaaacacacac 48459875  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10372079 - 10371902
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||  || | || |||||||||| ||||||||||| |||||    
10372079 attcaaaatcaattttgattcaaactatccgaacaacatcaacccacaagaatcacttctaataaactgtaaccaaacataaatcaattcacattcaact 10371980  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
10371979 cacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgttttaccaaacacacac 10371902  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12632239 - 12632031
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||       
12632239 taaatacaattaaaaggatattttggtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaacaattcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagcg 12632140  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    |||  |  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |     
12632139 agtacactcaaacataaatcaattcacatctaactcacttttaaccaaaatctattctctcaaacaaaattctatcaaaatcaattctctccaccgcgaa 12632040  T
264 accaaacac 272  Q
    |||||||||    
12632039 accaaacac 12632031  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44967545 - 44967349
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||| ||    
44967545 taaaaggataatttggtcattacaaactcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtattca 44967446  T
175 aacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaac 270  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||  |||||||||    
44967445 aacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattctcgctaccgtcataccaaac 44967349  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Original strand, 38230021 - 38230232
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| |||| || || ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||  |    
38230021 taaatacaattaaatggatagtttagtcattacacatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataa 38230120  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||    
38230121 aatgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctcttaaattcaattctatcaaaatcaattctctcggccgccat 38230220  T
264 accaaacacaca 275  Q
    ||||||||||||    
38230221 accaaacacaca 38230232  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 34366127 - 34365926
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||    
34366127 taaaagggtaatttggtcattacgccttcaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaacatcaactcataaaaatcacttttaa-taagcgtatcca 34366029  T
175 aacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||    
34366028 aacataaatcaattcacacccaactaacttttaactaaaatcaattctttcaaactccattatatcaaaatcaattctagccaccgccataccaaacaca 34365929  T
274 cac 276  Q
    |||    
34365928 cac 34365926  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39391293 - 39391083
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |    
39391293 taaatacaattaaaaggatagttaggtcattacacgttcaaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaattcataagaatcacttgtaagaa 39391194  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
39391193 agtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctaaaaaaatcaattctatcaaaatcaattttcgccaccgccat 39391094  T
264 accaaacacac 274  Q
    |||||||||||    
39391093 accaaacacac 39391083  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Original strand, 47021872 - 47022082
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| | ||   |    
47021872 taaatacaattaaaatgataatttggtcattgcacattcaaaatcaattttcattcaaattatccaaacaacatcaattcgtaagaatcacatctagtaa 47021971  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||    
47021972 agtgtatccaaacataaatcaattcactttcaacttacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatccccaccatcat 47022071  T
264 accaaacacac 274  Q
    |||||||||||    
47022072 accaaacacac 47022082  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 279
Target Start/End: Original strand, 41715648 - 41715825
Alignment:
103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcac 201  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
41715648 caaaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcac 41715747  T
202 ttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacacaaa 279  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
41715748 ttttaatcaaaatcaattctcttaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacacaaa 41715825  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47217696 - 47217487
Alignment:
66 aaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataa 165  Q
    ||||| || ||||||| |||||| ||||||  |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||   |    
47217696 aaatataattaaaaggataatttagtcattgtacgttcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaacccatcaaaatcacttttaagcga 47217597  T
166 gtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctata 264  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||   |    
47217596 gtgcatccaaacataaatcaattcacatcaaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcaccgccgccgaa 47217497  T
265 ccaaacacac 274  Q
    ||||||||||    
47217496 ccaaacacac 47217487  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 386629 - 386428
Alignment:
73 aataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaa-tcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttat 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||| |||    
386629 aataaaaggataatttggtcattatacatttaaaaatcaattttgattcaatctatccaaacaacatcaa-tcataagaatcacttttcggttagtatat 386531  T
172 ccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaac 270  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| | |||||||    
386530 ccaaacataaatcaattcacattcagctaacttttaaccaaaatcaatactctcaaactcaattatatcaaaatcaattttaaccaccgccaaaccaaac 386431  T
271 aca 273  Q
    |||    
386430 aca 386428  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 254
Target Start/End: Original strand, 3750642 - 3750829
Alignment:
67 aatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataag 166  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||  | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||   |||    
3750642 aatacaattaaaaggatagtttggtcattacacatt-aaaattaattttgatttaaactatccaaacaacatcaattcataagattcaattatattaaag 3750740  T
167 tttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctc 254  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||    
3750741 tgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattttattaaaatctattctctc 3750829  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 276
Target Start/End: Original strand, 32186931 - 32187105
Alignment:
103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcac 201  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
32186931 caaaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcac 32187030  T
202 ttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||||    
32187031 ttttaatcaaaatcaattctcttaaaattaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaacatacac 32187105  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Original strand, 39977544 - 39977717
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   || ||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||    
39977544 aaaatcaattttaatttaaagtatccaaacaacatcaacttgaaataataacttttatatgagtttatccaaaaataaatcaattcatatcaaactcact 39977643  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
39977644 tttgactaaaatcaattctttcaaactaaattctatcaaaatcaattatcgccaccgccataccaaacacacac 39977717  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 192
Target Start/End: Original strand, 19095890 - 19096016
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||      
19095890 taaatacaattaaaagagtaatttggtcatttaatgttcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacat-aactcataagaatcatttttaaacg 19095988  T
165 agtttatccaaacataatcaattcacat 192  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||    
19095989 agtgtatccaaacataaccaattcacat 19096016  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 240
Target Start/End: Original strand, 42740384 - 42740521
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcact 202  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||    
42740384 aaaatcaattttgatacatactatccaaacaatatcaacacataagaatcacttttaagtaagtatatctaaacataaatcaattaacattcaacttact 42740483  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatca 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
42740484 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatca 42740521  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 230
Target Start/End: Original strand, 32205891 - 32206044
Alignment:
77 aaagggtaatttggtcattta-atattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaa 175  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
32205891 aaaggttaatttggtcatttgcacatttaaaatcaattttgattcatactatc-aaacaacat-aactcataagaatcacttttaagtaagtgtatccaa 32205988  T
176 acat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactc 230  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
32205989 acataaatcaattcacatcaaacccacttttaattaaaatcaattctttcaaactc 32206044  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Original strand, 46541564 - 46541762
Alignment:
76 aaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaa-tcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||   | | | ||  ||    
46541564 aaaaggataatttggtcattatacatttaaaaatcaattttgattcaatctatcaaaacaatatcaa-tcataagaatcacttttcggtgaatatactca 46541662  T
175 aacataatc-aattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||    
46541663 aacataaaccaattcacattcaactcacttctaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttaaccaccgccaaaccaaacaca 46541762  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34011082 - 34010908
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatcc-aaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcaca-tccaac 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||||||||||| | |||| ||| || |||    
34011082 ttcaaaatcaattttgatttaaagtaccccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgaatgtttccaaacataaattaatttacactcaaac 34010983  T
198 tcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || | ||||||||||    
34010982 tcacttt-aaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcaccgctgccaaaccaaacaca 34010908  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36920316 - 36920149
Alignment:
83 taatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa- 181  Q
    |||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   ||| |||||||||     
36920316 taatatggtcattatatattcgcaatcaattttgattcaatgtacccaaacaacatcaactcaaaagaatcacctttaattaaacgtattcaaacataaa 36920217  T
182 tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
36920216 tcaatttatatctaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattttatcaaaattaatt 36920149  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 42904551 - 42904718
Alignment:
110 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaag 208  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||      
42904551 aattttgatttaaaatatacaaacaaaattaattcataagaatcacttttaaacgagtgtatcaaaacataaatcaattcacatctaactcatttttatc 42904650  T
209 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||| || |||||||||||||||    
42904651 caaaaacaattctctcaaactcaattctatcaaaattcatttttcccactgccataccaaacacacac 42904718  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 39634286 - 39634104
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  || | |||||||||||||||   | |  |||||||||||||| |||||||| || |||||    
39634286 attcaaaatcaattttgatccaagttatccaaacaacaagaatttataagaatcacttttgttttaagttatccaaacataaatcaattcatattcaact 39634187  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacacaaaga 281  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||    
39634186 cacttttaaccaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtccaaatcaattctctccaccgcagaaccaaacacacactaaga 39634104  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42752312 - 42752135
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaact 198  Q
    |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| || | |||||||| | ||||   | |   ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
42752312 attcaaaatcaattttgatctaagttatccaaacaacatgaatttataagaattatttttgctttaaggtatccaaacataaatcaattcacattcaact 42752213  T
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
42752212 cacttttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaattatctccaccgcagaaccaaacacacac 42752135  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 47301713 - 47301622
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcact 156  Q
    |||||| || ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
47301713 taaatataattaaaaggataatttagtcattttacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccataagaatcact 47301622  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37008447 - 37008297
Alignment:
124 ctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||      
37008447 ctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttataagaaagtgtctccaaacataaatcaat-cacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattcca 37008349  T
223 tcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
     |||| |||||||||| ||||||| || || ||||||  |||||||||||||||    
37008348 acaaaatcaattctataaaaatcagttttcgccaccg--ataccaaacacacac 37008297  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24771026 - 24770855
Alignment:
106 aatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttt 204  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||| || | |||| |||||||||||  |  || |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||    
24771026 aatcaattttgacaaaaattatccaaacaacataaattgataaaaatcacttttagttttgtatatctaaatataaatcaatttacatccaactcacttt 24770927  T
205 taagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||  |||||  ||||||||| |||||    
24770926 taaccaaaatcaattatctcaaacttaattctatcaaaattaattctcgtcaccgtcataccaaacgcacac 24770855  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 40903285 - 40903112
Alignment:
103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcact 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||  | | | ||||||||||||| | | | |  | |||||||||    
40903285 caaaatcaattttgatttgaactatccaaacaacatgaattgataaaaatcacttttactttaatatatccaaacataaaccaattaagttcaactcact 40903186  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| || |||| |  | |||||||||||||    
40903185 tttaggcaaaatcaattctatcaaaatcaattatgtcaaaatcaattttcgccactggaaaaccaaacacacac 40903112  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 276
Target Start/End: Original strand, 19097474 - 19097562
Alignment:
188 cacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || || |||| |||||||||||||||    
19097474 cacatctagctcacttttaatcaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccgccgccataccaaacacacac 19097562  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 12964667 - 12964736
Alignment:
180 aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||||||  |||| |||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
12964667 aatcaatctacattcaactcacttataacgaaaatcaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 12964736  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 236
Target Start/End: Original strand, 1766415 - 1766550
Alignment:
102 tcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactca 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||  | |   |||||||| || |||||||| |  | |||||||    
1766415 tcaaaatcaattttaattcaaattattcaaacatcatcaattgataagaatcacttttatgttaaggtatccaaatataaatcaatttaggttcaactca 1766514  T
201 cttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattct 236  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||    
1766515 cttttaatcaaaatcaatttaatcaaaatcaattct 1766550  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 37886893 - 37886854
Alignment:
98 atattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaaca 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37886893 atatttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaaca 37886854  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12212490 - 12212440
Alignment:
199 cacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
12212490 cacttctaaccaaaatcaattcactcaagctcaattctatcaaaatcaatt 12212440  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25472192 - 25472152
Alignment:
209 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
25472192 caaaatcaattctgtcaaaatcaattctatcaaaatcaatt 25472152  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 273
Target Start/End: Original strand, 16353527 - 16353589
Alignment:
210 aaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||    
16353527 aaaatcaattctg-caaaatcaattctatcagaatcaattatctccaccgcagaaccaaacaca 16353589  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 260
Target Start/End: Original strand, 20088952 - 20089018
Alignment:
194 caactcacttttaagcaaaatcaattct-ctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgc 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
20088952 caactcacttttaaccaaaatcaattatacttaaa-tcaattctatcaaaatcaattctttccaccgc 20089018  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 159
Target Start/End: Original strand, 43581627 - 43581682
Alignment:
104 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttt 159  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
43581627 aaaagcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaattaattataatcactttt 43581682  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 249
Target Start/End: Original strand, 45697670 - 45697748
Alignment:
170 atccaaacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||| | | ||||||| | ||||||| | |||||||||||| ||||||    
45697670 atccaaacataatcaatttaaattcaactcactttttatc-aaatcaactttctcaaatttaattctatcaaactcaatt 45697748  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 138
Target Start/End: Original strand, 4035922 - 4035960
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 138  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
4035922 attcaaaagcaattttgattaaaactatccaaacaacat 4035960  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25472205 - 25472167
Alignment:
211 aaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
25472205 aaatcaattctctcaaaatcaattctgtcaaaatcaatt 25472167  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 159
Target Start/End: Original strand, 12964438 - 12964483
Alignment:
114 ttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttt 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
12964438 ttgactcaaactatccaaacaacattaactcataataattactttt 12964483  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41625633 - 41625496
Alignment:
101 ttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaaca-taatcaattcacatccaactc 199  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||| || || | ||||||||||||| ||  |||   ||||||||||  ||| |||| |||  ||| ||    
41625633 ttcaaaagcaattttgatctcaactatccaaacaaaataaattaataagaatcacttctacttaaaagtatccaaacacaaattaatttacactcaagtc 41625534  T
200 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattcta 237  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||    
41625533 acttttaatcaaaatcaattttgtcagaatcaattcta 41625496  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25472177 - 25472137
Alignment:
209 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
25472177 caaaatcaattctatcaaaatcaattctatcagaatcaatt 25472137  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25472287 - 25472247
Alignment:
98 atattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat 138  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
25472287 atattcaaaagcaattttgataaaaactatccaaacaacat 25472247  T

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Target: scaffold0369 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 8391 - 8593
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
8391 taaaaggataatttggtcattgtacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataaaaatcatttttaaaaaagtgtatcca 8490  T
175 aacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
8491 aacataaatcaattcacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattatatcaaactcaattctatcaaaatcaattattcccaccgccataccaaacaca 8590  T
274 cac 276  Q
    |||    
8591 cac 8593  T

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Target: scaffold0381 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 273
Target Start/End: Original strand, 9053 - 9251
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||||    
9053 taaaaggataatttagtcattatacattcaaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatctactcataagaatcactttcaagtgagtgtatcca 9152  T
175 aacataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
9153 aacatatacaattcatatctaactcacttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaacaca 9251  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 253060 - 253272
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    |||||||||  |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |     
253060 taaatacaacaaaaaggataagttggtcattatatattcaaaatcaattttgattcaatctatccaaacaacattaactcataagaatcacttttaactg 253159  T
165 agtttatccaaacat-aatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    |   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||       
253160 aaggtatccaaacataaatcaattcatatccaactcacatttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccgccgccca 253259  T
264 accaaacacacac 276  Q
    |||||||||||||    
253260 accaaacacacac 253272  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29278 - 29079
Alignment:
78 aagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaac 177  Q
    |||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||   |||| |||||||||    
29278 aaggataatttagtcattacacattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaattcataagaataacttctattaaagtgtatccaaac 29179  T
178 ataatcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacaca 277  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||||||||||    
29178 ataatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaacttaattctatcaaaatcaattattaccaccaccaaaccaaacacacaca 29079  T

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Target: scaffold0983 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:

Target: scaffold0983; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2427 - 2225
Alignment:
75 taaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatcca 174  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| || |||||||||| |||| | ||||    
2427 taaaaggataatttggtcattacatatccaaaatcaattttgattcaaactatctaaacaacgtcaacttgtaaaaaccacttttaaacaagtgtgtcca 2328  T
175 aacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacaca 273  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||| |    
2327 aacataaatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattatgtcaaactcaattctgtcaaaatcaattttcgccaccgccataccaaacaga 2228  T
274 cac 276  Q
    |||    
2227 cac 2225  T

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Target: scaffold0217 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2196 - 1984
Alignment:
65 taaatacaaataaaagggtaatttggtcatttaatattcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaata 164  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||     
2196 taaatccaattaaaaggataattcggtctttatatattcaaaatcaattttgacttaaactatccaaacaacatcaagccatgataatcacttttatatg 2097  T
165 agtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctat 263  Q
    |||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |     
2096 agtgcatccaaacataaatcaattcatatcaaactcattttgaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgacaccgccaa 1997  T
264 accaaacacacac 276  Q
     ||||||||||||    
1996 tccaaacacacac 1984  T

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Target: scaffold0394 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5965 - 5787
Alignment:
100 attcaaaatcaattttgattcaaa-----ctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatcc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  ||   ||  |||||||   |||||||||| |    
5965 attcaaaatcaattttgattcaaattaaactatccaaacaacatcaacccacaagaatcacttctaataaacggtaatcaaacat---caattcacattc 5869  T
195 aactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| | |||||||||||||||    
5868 aactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattctccctaccaccataccaaacacacac 5787  T

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Target: scaffold0041 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 276
Target Start/End: Original strand, 46733 - 46906
Alignment:
103 caaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataatcaattcacatccaactcact 202  Q
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46733 caaaatcaattttgatttgaactatccaaacaacatgaattgataaaaatcacttttactttaatatatccaaacataaaccaattaagttcaactcact 46832  T
203 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctataccaaacacacac 276  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| || |||| |  | |||||||||||||    
46833 tttaggcaaaatcaattctatcaaaatcaattatgtcaaaatcaattttcgccactggaaaaccaaacacacac 46906  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 118501 - 118394
Alignment:
143 tcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaa 241  Q
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118501 tcataagaatcacttttgtacaagtgtatccaaacataaatcaatttacatcaaactcacttttaacaaaaatctattctatcaaactcaattcgatcaa 118402  T
242 aatcaatt 249  Q
    ||||||||    
118401 aatcaatt 118394  T

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Target: scaffold0172 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15322 - 15215
Alignment:
169 tatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatctccaccgctatacca 267  Q
    ||||||||||||| ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||   ||||    
15322 tatccaaacataaatcactttatattcaactcacttttaaccaaaatcaatt-tgacaaaatcaattctatcaaaatcaattttcgtcaccgcacaacca 15224  T
268 aacacacac 276  Q
    |||||||||    
15223 aacacacac 15215  T

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Target: scaffold0068 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 249
Target Start/End: Original strand, 38372 - 38410
Alignment:
211 aaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
38372 aaatcaattctctcaaaatcaattctgtcaaaatcaatt 38410  T

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Target: scaffold0168 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 249
Target Start/End: Original strand, 32058 - 32095
Alignment:
212 aatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 249  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
32058 aatcaattctatcaaaatcaattctatcaaaatcaatt 32095  T

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