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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF8324_1D_low_10 (Length: 294)
Name: NF8324_1D_low_10
Description: NF8324_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF8324_1D_low_10 |
 |  |
|
| [»] scaffold0264 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0393 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0378 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold2089 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0037 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0019 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0063 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0099 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0112 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0376 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0139 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1948 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0061 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0466 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0031 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0611 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0086 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0059 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0111 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0454 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0136 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0783 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0034 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1400 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: scaffold0264 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0264
Description:
Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 3952 - 4211
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3952 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
4051 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4052 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
4151 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4152 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
4211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0264; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 60 - 275
Target Start/End: Original strand, 10851 - 11066
Alignment:
| Q |
60 |
tttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacac |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10851 |
tttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacac |
10950 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttta |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10951 |
aaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttta |
11050 |
T |
 |
| Q |
260 |
acataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
11051 |
acataaactattggcc |
11066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 130501 - 130760
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
130501 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
130600 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
130601 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
130700 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
130701 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
130760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 257
Target Start/End: Original strand, 138471 - 138653
Alignment:
| Q |
75 |
gctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattcta |
174 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
138471 |
gctttgactacggatacatttaagaatagtgttctttaagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacaaactatctattcta |
138570 |
T |
 |
| Q |
175 |
aggactttactaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtt |
257 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
138571 |
aggactttattaacattatataaatataataaagagtgacatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtt |
138653 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21969358 - 21969099
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21969358 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
21969259 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21969258 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
21969159 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21969158 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
21969099 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 27007794 - 27008053
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27007794 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
27007893 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27007894 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
27007993 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27007994 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
27008053 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 27014937 - 27015196
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27014937 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
27015036 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27015037 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
27015136 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27015137 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
27015196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28498518 - 28498259
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28498518 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
28498419 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28498418 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
28498319 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28498318 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
28498259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12562148 - 12561889
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12562148 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
12562049 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12562048 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
12561949 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12561948 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
12561889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 22130886 - 22131145
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22130886 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggataaatttaagaatagcgttctataaga |
22130985 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22130986 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
22131085 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22131086 |
tatattattcaataataaaagtcacgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
22131145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 45534550 - 45534809
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
45534550 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagatacatttaagaatagcattctataaga |
45534649 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45534650 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
45534749 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45534750 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcc |
45534809 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26240509 - 26240250
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26240509 |
catcagtcttcatacataatagtctcgacgctttattattatcttttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaaga |
26240410 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26240409 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
26240310 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26240309 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
26240250 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 27880764 - 27881024
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttt-attcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataag |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27880764 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagcgttctataag |
27880863 |
T |
 |
| Q |
115 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27880864 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatatcattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcc |
27880963 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27880964 |
atatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
27881024 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 28020945 - 28021205
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttt-attcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataag |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28020945 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagcgttctataag |
28021044 |
T |
 |
| Q |
115 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28021045 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatatcattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcc |
28021144 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28021145 |
atatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
28021205 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25611220 - 25610957
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacattt-aagaatagcgttctataag |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25611220 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacattttaagaatagcgttctctaag |
25611121 |
T |
 |
| Q |
115 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25611120 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaggagtgcc |
25611021 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcccct |
278 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25611020 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttatcataaactatttgcccct |
25610957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 22659771 - 22660030
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
22659771 |
catcagtctacatacataatagtcttgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagtgttctttatga |
22659870 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22659871 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacaaactatctattctaaggactttattaacattatataaatataataaagagtgtca |
22659970 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22659971 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
22660030 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 8371530 - 8371789
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||| |
|
|
| T |
8371530 |
catcagtctacatacataatagtctcgatgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagacacatttaagaatagtgttatttaaga |
8371629 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
8371630 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaattatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
8371729 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8371730 |
tacattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
8371789 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21916701 - 21916524
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21916701 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
21916602 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattat |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21916601 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaattatctattctaaggactttattaacattat |
21916524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 274
Target Start/End: Original strand, 2963217 - 2963469
Alignment:
| Q |
20 |
agtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataat |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
2963217 |
agtctacatacataatagtctctacgctttattattatcct--aattatattaaag-tttgac-acgaatacatttaagaatagtgttctttatgataat |
2963312 |
T |
 |
| Q |
120 |
gtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttact-aacatta-tctaaatataataaagagtgccata |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
2963313 |
gtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaaacattactataaatataataaaaagtgtcata |
2963412 |
T |
 |
| Q |
218 |
tattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggc |
274 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2963413 |
tattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggc |
2963469 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36970253 - 36970041
Alignment:
| Q |
63 |
attcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaa |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
36970253 |
attcatattaaagctt-gactacggatacatttaagaacaacgttctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacacataatatattattacatgaa |
36970155 |
T |
 |
| Q |
163 |
ctatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaac |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36970154 |
ctatctattctagggactttattaacattactataaatataataaagagtatcatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataaatttaac |
36970055 |
T |
 |
| Q |
262 |
ataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
36970054 |
ataaactattggcc |
36970041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6430952 - 6430695
Alignment:
| Q |
31 |
ataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatg |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6430952 |
ataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacgaatacatttaagaatagtgttatttatgataatgtaatctcat- |
6430856 |
T |
 |
| Q |
131 |
attaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaat- |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6430855 |
--taagtcacacttaatatattattacacgaactatctattataaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattatttaata |
6430758 |
T |
 |
| Q |
229 |
aataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcccctcgagtttacacca |
291 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | || ||| |||||||| |
|
|
| T |
6430757 |
aataaaagttatgatacataagataaatttaacgtaaactattggtctctagagcttacacca |
6430695 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18835374 - 18835124
Alignment:
| Q |
17 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| | || | | |
|
|
| T |
18835374 |
atcagtctacatacataatagtctcgatgctttattattatt-tcaatccatattaaagctg-gactacagatatatttaagaataacgttttttatgtt |
18835277 |
T |
 |
| Q |
117 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattat-ctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| | || || |
|
|
| T |
18835276 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatactactgc---aactatctattctaagaactttattaacattataacaaatataacaaaaattgtca |
18835180 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactatt |
271 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18835179 |
tatattatttaataacaaaagtcatgataaataaaataagtttaacataaactatt |
18835124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Original strand, 20539674 - 20539932
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttt--attcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataa |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
20539674 |
catcagtctacatacataatcgtctatgcgctttattattattatcccaatttacattaaagcttt-actacaaatgtatttaagaataacgttctttat |
20539772 |
T |
 |
| Q |
114 |
gataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaat-ataataaagagtg |
212 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||| || |
|
|
| T |
20539773 |
gttaatgtaatcacatgattaagtcacacttaatattccatta-atgaactatctattctatggactttattaatcttacaacaattataataaagaatg |
20539871 |
T |
 |
| Q |
213 |
ccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattgg |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20539872 |
tcatatattatttaataataaaagtcatgatacataacacaagtttaacataaactattgg |
20539932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21914394 - 21914329
Alignment:
| Q |
210 |
gtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21914394 |
gtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
21914329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 214 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21862227 - 21862166
Alignment:
| Q |
214 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21862227 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
21862166 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 272
Target Start/End: Original strand, 8782188 - 8782343
Alignment:
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| || | |
|
|
| T |
8782188 |
taatgtaatcccatgattaagtcacatttaatattccatcacattaactatctattttaaggactttattaatcttacaacaattataataaagaatgac |
8782287 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8782288 |
atattttatt-aaaaat-aaagtaatgatacataatataagtttaacataaactattg |
8782343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18400129 - 18399870
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18400129 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
18400030 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18400029 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
18399930 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18399929 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
18399870 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18407113 - 18406854
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18407113 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
18407014 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18407013 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
18406914 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18406913 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
18406854 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 48808773 - 48809032
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48808773 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
48808872 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48808873 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
48808972 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48808973 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcc |
48809032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15729776 - 15729517
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15729776 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagtgttctataaga |
15729677 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15729676 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
15729577 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15729576 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcc |
15729517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19859147 - 19858888
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19859147 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttgttattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
19859048 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19859047 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattaaacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
19858948 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19858947 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
19858888 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30254163 - 30253904
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30254163 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgatctataaga |
30254064 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
30254063 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatattataaagagtgcca |
30253964 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30253963 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
30253904 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8465024 - 8464765
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8465024 |
catcagtctacatacataatagtctcgtcgctttattattatcctttattcatattaaagcttcgactacggatacatttaagaatagcgttctttaaga |
8464925 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8464924 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
8464825 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8464824 |
tatattattcaataataaaagtcatgattcataagataggtttaacataaactattggcc |
8464765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2204577 - 2204317
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttt-attcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataag |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2204577 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagcgttctataag |
2204478 |
T |
 |
| Q |
115 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
2204477 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtc |
2204378 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2204377 |
atatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
2204317 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 18139615 - 18139876
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat--ttaagaatagcgttctataa |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18139615 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatatatatttaagaataacgttctataa |
18139714 |
T |
 |
| Q |
114 |
gataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18139715 |
gataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgt |
18139814 |
T |
 |
| Q |
214 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18139815 |
catatattattcaataataaaggtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
18139876 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19230913 - 19230653
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
19230913 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaatgttttgactacggatacatttaagaatagcgttctttatga |
19230814 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
19230813 |
taatgtaatctcatgattaagttacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
19230714 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19230713 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacattaactattggcc |
19230653 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 10669179 - 10669437
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
10669179 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcatttattaatat-aaagatt-gactacggatacatttaagaataacgttctttatga |
10669276 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
10669277 |
taatgtaatctgatgattaagtcacacttattatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
10669376 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10669377 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
10669437 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 41681250 - 41681502
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
41681250 |
catcagtctacatacataatagtctcaaagctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagatacatttaagaataacattctataaga |
41681349 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
41681350 |
taaagtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacataaactatctattccaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtta |
41681449 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaact |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
41681450 |
tatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaatataaact |
41681502 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 47167136 - 47167394
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
47167136 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacaaatacatttaagaataacgttctttatga |
47167233 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
47167234 |
taatgtaatctcatgataaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
47167333 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47167334 |
acatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
47167394 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 275
Target Start/End: Original strand, 18259402 - 18259659
Alignment:
| Q |
17 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
116 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
18259402 |
atcagtcaacatacataatactctcgacgatttattattatccta-attcatattaaagctt-gactatggatacatttaagaataatgttctttatgat |
18259499 |
T |
 |
| Q |
117 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18259500 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgcca |
18259599 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18259600 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaattattggcc |
18259659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28130586 - 28130329
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
28130586 |
catcagtctacatgcataatagtctcgacgctttattattatcctt-attcatattaaagctt-gactacagatacatttaagaatagcgttttttatga |
28130489 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
28130488 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattataaggacttcattaacattattataaatataataaagagtgtc |
28130389 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggc |
274 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
28130388 |
acatactattcaataataaaagttatgatacataagataagttcaacataaactattggc |
28130329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34128598 - 34128341
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || || |
|
|
| T |
34128598 |
catcagtctacatacataataatctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctta-actacggatacatttaaaaataatgttctttatga |
34128502 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
34128501 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaagaactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
34128402 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34128401 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaattattggcc |
34128341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 275
Target Start/End: Original strand, 19393705 - 19393959
Alignment:
| Q |
20 |
agtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataat |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || | |||| |
|
|
| T |
19393705 |
agtctacatacataatagtctcgacgctttataattatccca-actcatattaaagctt-gactacagatacatttaagaatagcattctttatgttaat |
19393802 |
T |
 |
| Q |
120 |
gtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgccatat |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| | | |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19393803 |
gtaatctcatgattaagtcacacttaatatatcattacatgaactatctattatagagactttattaacattactacagatataataaagagtatcatat |
19393902 |
T |
 |
| Q |
219 |
attattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19393903 |
attatttaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
19393959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14586191 - 14585928
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14586191 |
catcagtctgcatacataaaagtctcgacgctttattattattcca-attcatattaaag-tttgactaaggatacatttaataatagcgttcattaaga |
14586094 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
14586093 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatataccattatacgaactatctattttagggactttattaacattacaacaaatataataaagagtgac |
14585994 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaa------taataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggc |
274 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14585993 |
atatattatttaataatagtaataaaagtcatgatacataacataaatttaacttaaactattggc |
14585928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16000007 - 15999791
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16000007 |
catcagtctgcatacataaaagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaag-tttgactaaggatacatttaataatagcgttctttaagg |
15999910 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
15999909 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatataccattatacgaactatctattttaggtacttaattaacattacaacaaatataataaagagtgac |
15999810 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataa |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15999809 |
atatattatttaataataa |
15999791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2936056 - 2935846
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
2936056 |
catcagtctacataaataacagtctcgatgctttattattatcgca-attcatattaaagctt-gactacggatacatttaagaataacgttctttatgt |
2935959 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
2935958 |
taatgtaatctcatgattaagt--cacttaatatataattacatgaactatttattctagggactttattaacattacaacaaatataatgaagagtgac |
2935861 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaata |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
2935860 |
atatattatttaata |
2935846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3587934 - 3587679
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| | || | |
|
|
| T |
3587934 |
catcggtctatatacataatagtctctacgctttattattatccca-atttatattaaagctt-gactatagattcatttaagaataacgttttttatgt |
3587837 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||| |||||||| |||||||| ||| ||| || ||||||||||| | | |
|
|
| T |
3587836 |
taaagtaatctcatgattaagtcacagttaatatttcatcacataaactacctattctatggactttattaatcttacaacaattataataaagaattgc |
3587737 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3587736 |
atatgttatttaataataaaagtcatgatacatagcataagtttcacataaactattg |
3587679 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Original strand, 24443604 - 24443768
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
24443604 |
catcagtctacatacataatagtctttacactttgttatcatccc--atttatattaaagcttgg-ctacggatacatttaagaatatcgttctttatgt |
24443700 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggacttta |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
24443701 |
taatgtaatctcgtgattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattatagggacttta |
24443768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 42150363 - 42150607
Alignment:
| Q |
24 |
tacatacataat--agtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgt |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||| |
|
|
| T |
42150363 |
tacatacataatttagtctcgacgctttattattatccca-attcatattaaagctt-gactacggatacattta-gaataacgttctttatgttaatgt |
42150459 |
T |
 |
| Q |
122 |
aatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattc--taaggactttactaacatta-----tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| | |||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
42150460 |
aatctcatgattaagtcacac-------------aca-gaactatctattctataggggctttattaacattactacctacaaatataacaaagagtgtc |
42150545 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacat-aagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42150546 |
atatattattcaataataaaagtcacgatacataaagataagtttaacataaactattggcc |
42150607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22968975 - 22968719
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||| || |
|
|
| T |
22968975 |
catcggtctacataaataatagtcttgacactttatcattatccta-atttatattaaagatt-gactacggatacatttaagaattgcattctttacat |
22968878 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
22968877 |
taatgtaatctcatgattaattaacacttaatattccatcacacgaactatctattctctggactttatttatcttacaacaaatataataaa-aatgcc |
22968779 |
T |
 |
| Q |
215 |
--atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22968778 |
atatatattattcaataataaaagtcatgatacgtagcaaaagtttaagataaactattg |
22968719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22994176 - 22994076
Alignment:
| Q |
174 |
aaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22994176 |
aaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattg |
22994077 |
T |
 |
| Q |
273 |
g |
273 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
22994076 |
g |
22994076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 15170307 - 15170561
Alignment:
| Q |
17 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcc---tttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataa |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| | || |
|
|
| T |
15170307 |
atcagtctacatatataatagtctctacgctttattattatcccaatttat--atattaaagctt-gactacaaatatatttaagaataacgttttttat |
15170403 |
T |
 |
| Q |
114 |
gataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtg |
212 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||| ||| ||| || ||||||||||| || |
|
|
| T |
15170404 |
gttaatgtaatctcatgattaagtcccacttaatattccattacatgaac-atctattttatggactttattaattttacaacaattataataaagaatg |
15170502 |
T |
 |
| Q |
213 |
ccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactatt |
271 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15170503 |
tcgtatattatttaatattaaaactcacgatacatagaataaatttaacataaactatt |
15170561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 218 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 48813825 - 48813768
Alignment:
| Q |
218 |
tattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48813825 |
tattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
48813768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 272
Target Start/End: Original strand, 24443932 - 24444052
Alignment:
| Q |
153 |
attacacgaactatctattctaaggactttactaacattatct-aaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataaga |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | | |||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |
|
|
| T |
24443932 |
attacacgaactatctattctatgaattttattaatcttataacaaatataataaagaatgcaatatattattcaataataaaaatcatgatagataaca |
24444031 |
T |
 |
| Q |
252 |
taggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24444032 |
taagtttaacataagctattg |
24444052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 31190722 - 31190926
Alignment:
| Q |
18 |
tcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagata |
117 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||| | || | || |
|
|
| T |
31190722 |
tcagcctacatacgtaatagtctcggtgctttattattatccca-atttatactaaagctt-gactaaggatatatttaataataatgttatttatgtta |
31190819 |
T |
 |
| Q |
118 |
atgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgccat |
216 |
Q |
| |
|
|||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31190820 |
atgtaagcaaacgattaagtcacacttaatataccattacatgaactatcta-tctggggactttattaacattacaacaaatataataaaaagtgccat |
31190918 |
T |
 |
| Q |
217 |
atattatt |
224 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
31190919 |
atattatt |
31190926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 59
Target Start/End: Original strand, 25845753 - 25845796
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcc |
59 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25845753 |
catcagtctacatgcataatagtctctacgatttattattatcc |
25845796 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 59
Target Start/End: Original strand, 25846172 - 25846215
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcc |
59 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25846172 |
catcagtctacatgcataatagtctctacgatttattattatcc |
25846215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 272
Target Start/End: Original strand, 25846379 - 25846436
Alignment:
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25846379 |
atattttatttaataataaaagtcatgatacatagcataaatttaacataaaatattg |
25846436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16789096 - 16788837
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16789096 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
16788997 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16788996 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
16788897 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16788896 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
16788837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 1586385 - 1586644
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1586385 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagtgttctataaga |
1586484 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1586485 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
1586584 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1586585 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcc |
1586644 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 13995220 - 13995479
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13995220 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcattctataaga |
13995319 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13995320 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
13995419 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13995420 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
13995479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 22860165 - 22860424
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22860165 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagcgttctataaga |
22860264 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22860265 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
22860364 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22860365 |
tatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
22860424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 18020118 - 18020377
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
18020118 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaaaa |
18020217 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18020218 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctgaatataataaagagtgcca |
18020317 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18020318 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
18020377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 27528210 - 27528470
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27528210 |
catcagtctacatacataacagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataata |
27528309 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
27528310 |
taatgtaatttcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
27528409 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattatt-caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27528410 |
tatattattacaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
27528470 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 27508624 - 27508884
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27508624 |
catcagtctacatacataacagtctcgacgctttattattatcctttatacatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataata |
27508723 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
27508724 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
27508823 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattatt-caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27508824 |
tatattattacaataataaaagtcatgatacataaaataggtttaacataaactattggcc |
27508884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14074505 - 14074246
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| || || |
|
|
| T |
14074505 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatactttattcatattaaagctttgactacatatacatttaagactagtgttctttatga |
14074406 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14074405 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
14074306 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14074305 |
tatattattcaataataatagtcatgatacataagatatttttaacataaactattggcc |
14074246 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8612940 - 8612683
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
8612940 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagtgttctttatga |
8612844 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8612843 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactatgaatataataaagagtgtc |
8612744 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8612743 |
atatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
8612683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 92 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13947704 - 13947520
Alignment:
| Q |
92 |
atttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatt |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13947704 |
atttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatt |
13947605 |
T |
 |
| Q |
192 |
atctaaatataataaagagtgccatatattatt-caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13947604 |
atctaaatataataaagagtgccatatattattacaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
13947520 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 5758758 - 5759015
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || || |
|
|
| T |
5758758 |
catcagtctacatacataatattctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagcttt-actacggatacatttaataatattgttctttatga |
5758854 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
5758855 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaagaactttattaacattactataaatataataaagagtatc |
5758954 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5758955 |
atatattattcaataataaaagtcatcatacataagataagtttaacataaattattggcc |
5759015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 272
Target Start/End: Original strand, 17120741 - 17120979
Alignment:
| Q |
31 |
ataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatg |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17120741 |
ataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gacaatggatacatttaagaataacgttctttatgataatataatctcatg |
17120838 |
T |
 |
| Q |
131 |
attaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaata |
229 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17120839 |
actaagtcacacttaatatattattatacgaactatctattctagggattttattaacattattataaatataataaagagt--catatattattcaata |
17120936 |
T |
 |
| Q |
230 |
ataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17120937 |
ataaaagtcatgatacataagatgagtttaacataaactattg |
17120979 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 20736605 - 20736863
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
20736605 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcccag-ttcttattaaagctt-gactacagatacatttaagaataatgttctttatgt |
20736702 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20736703 |
taatgtaatctcatgattaagtcaaacttaatataccattacacgaactatctattctaggaactttattaacattacaacaaatataataaagagtggc |
20736802 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20736803 |
atatattatttaataataaaagtcatgatacataacataagattaacataacctattggcc |
20736863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19218454 - 19218200
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||| || || |
|
|
| T |
19218454 |
catcagtctacatacataatagtctctacactttattattatccccttt--atattaaagctt-gactactgatgc-tttaagaatagcattctttatga |
19218359 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19218358 |
taatgtaatcacatgattaagtcacacttaatattctattacacgaactatctattctagagactttattaatcttacaacaaatataataaagaatgcc |
19218259 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattgg |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19218258 |
atatattatttaataataaaagtcatgatacatagcataaatttaacataaactattgg |
19218200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 146 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14997007 - 14996878
Alignment:
| Q |
146 |
atatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatac |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
14997007 |
atatattattacacgaactatctattctaaggactttattaaaattatataaatataataaagagtgtcatatattattcaataattaaagtcataatac |
14996908 |
T |
 |
| Q |
246 |
ataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14996907 |
ataagataagtttaacataaaatattggcc |
14996878 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 246
Target Start/End: Original strand, 22560461 - 22560692
Alignment:
| Q |
16 |
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113 |
Q |
| |
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|||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||| | |
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| T |
22560461 |
catcggtctacatgcataatagtctctgcgctttattattatccca-atttatattaaagctt-gactatggatacatttaaggataaaacattcttaat |
22560558 |
T |
 |
| Q |
114 |
gataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatt-atctaaatataataaagagtg |
212 |
Q |
| |
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| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22560559 |
gttaatgtcatctcatgattgagtcacacttaatatcccattacacgaactatctattctaaggaccttattaatattgcaataaatataataaaaagtg |
22560658 |
T |
 |
| Q |
213 |
ccatatattattcaataataaaagtcatgataca |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22560659 |
tcatatattatttaataatagaagtcatgataca |
22560692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4073595 - 4073340
Alignment:
| Q |
22 |
tctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgt |
121 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
4073595 |
tctacaaacataatagtctctacgttttattattatcctg-atttatattaaag-tttgactacggatacttttaagaataatgttctttccattaatgt |
4073498 |
T |
 |
| Q |
122 |
aatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggacttta-----ctaacattatctaaatataataaagagtgccat |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| |||||| |||||||| || ||| | |||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4073497 |
aatctcatgattaagtcacacttaatgttccattatatgaactatcaattctatggactttattaatcttacaacaaacaaatgtaataaagaatgccat |
4073398 |
T |
 |
| Q |
217 |
atattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggc |
274 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4073397 |
attttatttaatgataaaaatcatgatacataacataagtttaacataaattattggc |
4073340 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21994613 - 21994406
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
21994613 |
catcagtctacatatataatagtctttgcgctttattattattcca-atttatattaaagctc-gactatggatacatttaagaatagtgttctttatat |
21994516 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| || ||||||||||||| | |
|
|
| T |
21994515 |
taatgtaatctcatgattaagtcacaattaatataccattacacgaactatctattattgggactttattaatattacaacaagtataataaagagtatc |
21994416 |
T |
 |
| Q |
215 |
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224 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
21994415 |
atatattatt |
21994406 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 272
Target Start/End: Original strand, 10359410 - 10359567
Alignment:
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattat-ctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| || ||||||| ||| |||| || ||| ||||| | || | |
|
|
| T |
10359410 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatattccatcacatcaactatatattatagagactttattaatcttataacaattatgataaataatgtc |
10359509 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10359510 |
atattttatttaatattaaaaatcataatacatacgataagtttaacataaactattg |
10359567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21993786 - 21993730
Alignment:
| Q |
218 |
tattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggc |
274 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21993786 |
tattatttaataataaaagtcatgatacatatcataggtttaacataaattattggc |
21993730 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 58
Target Start/End: Original strand, 10359326 - 10359368
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatc |
58 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10359326 |
catcactctacatatataatagtctctacgctttattattatc |
10359368 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 109
Target Start/End: Original strand, 23846668 - 23846755
Alignment:
| Q |
20 |
agtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttct |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23846668 |
agtctacatacataatagtctctgtactatattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacagatacttttaagaatagtgttct |
23846755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 272
Target Start/End: Original strand, 23846851 - 23846903
Alignment:
| Q |
220 |
ttattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23846851 |
ttatttaatattaaaagtcatgatacatatgacaagtttaatataaactattg |
23846903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2677038 - 2676779
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2677038 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
2676939 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2676938 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
2676839 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2676838 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
2676779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15461522 - 15461263
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15461522 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
15461423 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15461422 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
15461323 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15461322 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
15461263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15815046 - 15814787
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15815046 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
15814947 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15814946 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
15814847 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15814846 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
15814787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 18111320 - 18111579
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18111320 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
18111419 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18111420 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
18111519 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18111520 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttcaacataaactattggcc |
18111579 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20243962 - 20243703
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20243962 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
20243863 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20243862 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
20243763 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20243762 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcc |
20243703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26531638 - 26531379
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26531638 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
26531539 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26531538 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
26531439 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26531438 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaatataaactattggcc |
26531379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 3369300 - 3369559
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3369300 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcttttattcatattaaagctttgactacggatatatttaagaatagcgttctataaga |
3369399 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3369400 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
3369499 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3369500 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
3369559 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18163187 - 18162928
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18163187 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
18163088 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18163087 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatgtaataaagagtgcca |
18162988 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18162987 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcc |
18162928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 4676260 - 4676519
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4676260 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
4676359 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
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|
| T |
4676360 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatattataaagagtgtca |
4676459 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4676460 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcc |
4676519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 17300236 - 17300495
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17300236 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactatggatacatttaagaatagcgttctataaga |
17300335 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17300336 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattatttcacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
17300435 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17300436 |
tatattattcaataataaaagtcaagatacataagataggtttaacataaactattggcc |
17300495 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5870443 - 5870178
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5870443 |
catcagtctacatacataatagtcttgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagatacatttaagaatagcgttctataaga |
5870344 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataa------taaaga |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5870343 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaaaataaaga |
5870244 |
T |
 |
| Q |
210 |
gtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5870243 |
gtgtcatatattattcaataataaaggtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
5870178 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34975576 - 34975317
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
34975576 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaaactttgactacaaatacatttaagaatagcgttctttatga |
34975477 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
34975476 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaaccatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
34975377 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34975376 |
tatattaatcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
34975317 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 60 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 38816694 - 38816479
Alignment:
| Q |
60 |
tttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacac |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38816694 |
tttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacac |
38816595 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttta |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38816594 |
gaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggttta |
38816495 |
T |
 |
| Q |
260 |
acataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
38816494 |
acataaactattggcc |
38816479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1941749 - 1941494
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
1941749 |
catcagtctatatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacgaatacatttaagaataacgttctttatga |
1941652 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1941651 |
tactgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
1941552 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1941551 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataaaataagtttaacataaactattg |
1941494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9487575 - 9487302
Alignment:
| Q |
17 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
116 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
9487575 |
atcagtcaacatacataatagtctcaacgctttattattatccta-attcatattaaatctt-gactacggatacatttaagaataacgttctttatgat |
9487478 |
T |
 |
| Q |
117 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
9487477 |
aaagtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaagggctttattaacattactataaatataataaagagtgtca |
9487378 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcccctcgagtttacacca |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| |
|
|
| T |
9487377 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaattattggcccctagggcttacacca |
9487302 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 87 - 275
Target Start/End: Original strand, 11484265 - 11484453
Alignment:
| Q |
87 |
gatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttacta |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
11484265 |
gatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttatta |
11484364 |
T |
 |
| Q |
187 |
acattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11484365 |
acattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
11484453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11421041 - 11420783
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
11421041 |
catcagtctacatacataatagtctcgaagctttattattatccta-attcatattaaag-tttgactacggatacatttaagaatagcgttctttatgt |
11420944 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11420943 |
taatgtaatctaatgattaaatcacacttaatatatcattgcacgaactatctattttagggactttattaacattacaaaaaatataataaagagtgcc |
11420844 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11420843 |
atatattatttaataataaaagtcatgatacataacataagtttaacataaaccattggcc |
11420783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 30040751 - 30041009
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
30040751 |
catcagtctatatacataatagtctcgatgctttattattatccca-attcatattaacgctt-gactatagatacatttaagaatagtgttctttatgt |
30040848 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
30040849 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatactattacacgaactatctattctaggaactttattaacattacaacaaatataataaagagtatc |
30040948 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30040949 |
atatattaattgataataaaagtcatgatacataacataagtttaacataaattattggcc |
30041009 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4546104 - 4545948
Alignment:
| Q |
17 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
116 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
4546104 |
atcagtcaacatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctta-actacggatacatttaagaataacgttctttatgat |
4546007 |
T |
 |
| Q |
117 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaa |
175 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4546006 |
aaagtattctcatgactaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaa |
4545948 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19365544 - 19365389
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
19365544 |
catcagtctacgtatataatagtctcaacactttattattacccca-atttatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagcgttctttacgt |
19365447 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattct |
173 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19365446 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattct |
19365389 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 204 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4545950 - 4545879
Alignment:
| Q |
204 |
taaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4545950 |
taaagagtgtcatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
4545879 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19362435 - 19362276
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| || | |
|
|
| T |
19362435 |
catcaatctacatacataatagtctcggcactgtattattat-------ttatattaaagctt-gactactgatacatttaagaaaagcgttccttacgt |
19362344 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggacttta |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
19362343 |
taatgtaatctcatgattaactcacacttaatattacattacatgaactatctattctaggaacttta |
19362276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9537926 - 9537729
Alignment:
| Q |
78 |
ttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaagg |
177 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| | || |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
9537926 |
ttgactacatatacatttaagaatagcgttctttatgttaatgtaaactctttatagagtcacacttgatattccattgcacgaactatctattctaggg |
9537827 |
T |
 |
| Q |
178 |
-actttactaacattatctaaat-ataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| ||| |||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9537826 |
gactttattaatcttacaacaattataataaaaa-tgacatatattatttaataataaa-gtcatgatacataacataaatttaacataaactattggcc |
9537729 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Original strand, 5528762 - 5529013
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| Q |
22 |
tctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgt |
121 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | || || ||||||||| ||||| | | || |||||||||| ||||| | | |||||| |
|
|
| T |
5528762 |
tctacaaacataatagtctatacgctttattattatcatgatttaat-ttaaagctt-gactatgaacacttttaagaatatagttctttgtgttaatgt |
5528859 |
T |
 |
| Q |
122 |
aatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaat-ataataaagagtgccatatat |
220 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| ||| ||| |||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
5528860 |
aatctcgtgattaagtcgcactgaatattccatcacatgcactatctattctagggattttattaatcttacaacaattataataaaaaatgtcatatta |
5528959 |
T |
 |
| Q |
221 |
tattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggc |
274 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5528960 |
tatttaataataaatgtcatgatacataacataagtttaacataaactattggc |
5529013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 32636509 - 32636465
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcct |
60 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32636509 |
catcagtctacatacataatagtctccacgctttattattatcct |
32636465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 246
Target Start/End: Original strand, 23056437 - 23056567
Alignment:
| Q |
117 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaa-tataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
23056437 |
aatgtaatcttacgattaagtctcacttaatgtctcattacttgaactatatattctagggactttattaattttatagaaaatataacaaagaatgcct |
23056536 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgataca |
246 |
Q |
| |
|
||| ||| | || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23056537 |
tattttaattaacaataaaagtcatgataca |
23056567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Original strand, 39422426 - 39422665
Alignment:
| Q |
26 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
125 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||| || |||| | |||||||||| |
|
|
| T |
39422426 |
cataaataatagtctatacgctttattacta-ccttaattcatattaaag-tttgtctacaaatacttttaagaataatgtcttatatgttaatgtaatc |
39422523 |
T |
 |
| Q |
126 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
224 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||| || |||| ||| ||| ||| |||||||||||| ||||| || ||||| |
|
|
| T |
39422524 |
tcacgattaagtctcgtttaattttccattacatgaactatttattttagggacattattaatcttacaacaaatataataaatagtgcgtcattttatt |
39422623 |
T |
 |
| Q |
225 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaa |
266 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
39422624 |
taataataacaatcatgatatgtaacataagtttaacataaa |
39422665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 56516255 - 56516097
Alignment:
| Q |
22 |
tctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgt |
121 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| | | |||| || |||| || ||||| | |||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||||| | ||||| |
|
|
| T |
56516255 |
tctacctacataatagtctctatgttttaatactatcgtt-attcacaataaagctt-gactatagatac-ttcaagaataatgttctatatgttaatga |
56516159 |
T |
 |
| Q |
122 |
aatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggacttta |
183 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||| ||||| | | ||||| | ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56516158 |
agtctcacaattaagtcacaattaatgtttcattactctaaccatctattctaaggacttta |
56516097 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21034263 - 21034004
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21034263 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
21034164 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21034163 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
21034064 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21034063 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
21034004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12299936 - 12299677
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12299936 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcatttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
12299837 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12299836 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagcgcca |
12299737 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12299736 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
12299677 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 15846813 - 15847072
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15846813 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaaga |
15846912 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15846913 |
aaatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggaatttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
15847012 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15847013 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
15847072 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 55427046 - 55426789
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55427046 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
55426947 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
55426946 |
taatgtaatctcatgattaagtcatacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
55426847 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattgg |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55426846 |
tatattattcaataataaaagtcataatacataagatagatttaacataaactattgg |
55426789 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14890416 - 14890157
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14890416 |
catcagtctacatacataatagtctcaacactttattattatcctttattcatattaaagctttgaatacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
14890317 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
14890316 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatataaatataataaagagtgtca |
14890217 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14890216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
14890157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 20147831 - 20148091
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttt-attcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataag |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20147831 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagtgttctataag |
20147930 |
T |
 |
| Q |
115 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20147931 |
ataatgtaatctcatgattaagttacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcc |
20148030 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20148031 |
atatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
20148091 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 20 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21398813 - 21398558
Alignment:
| Q |
20 |
agtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataat |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21398813 |
agtctacatacataatagtctcgacactttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaagataat |
21398714 |
T |
 |
| Q |
120 |
gtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgccatata |
219 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21398713 |
gtaatctcatgattaagtcacaattaatatataattacatgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtcatata |
21398614 |
T |
 |
| Q |
220 |
ttattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21398613 |
ttattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
21398558 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 275
Target Start/End: Original strand, 25979006 - 25979263
Alignment:
| Q |
17 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
116 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
25979006 |
atcagtcaacatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagcgttctttatgat |
25979103 |
T |
 |
| Q |
117 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
25979104 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtca |
25979203 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25979204 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
25979263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 48 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28088211 - 28087984
Alignment:
| Q |
48 |
ttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaat |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28088211 |
ttattattatcatttattcatattaaagctttgactacggatctatttaagaatagtgttctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacacttaat |
28088112 |
T |
 |
| Q |
148 |
atattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28088111 |
atattattacacgaactatctattctaagaactttattaatattatctaaatataataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgatacat |
28088012 |
T |
 |
| Q |
248 |
aagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28088011 |
aagataagtttaacataaactattggcc |
28087984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11787611 - 11787382
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| Q |
17 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
116 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
11787611 |
atcagtcaacatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacagatacatttaagaataacgttctttatgat |
11787514 |
T |
 |
| Q |
117 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
11787513 |
aatgtaatctcatgattaagtcacatttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtca |
11787414 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11787413 |
tatattattcaataagaaaagtcatgatacat |
11787382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14147046 - 14146788
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || | | | |
|
|
| T |
14147046 |
catcagtctacatatataatagtctctgtgctttattattatccca-atttatgttaaagctt-gactacagatacatttagaaatagctttgttaatgt |
14146949 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatct-aaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14146948 |
taatgtagtttcatgattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctatggaccgtattaatcttataacaaatataataaagagtgcc |
14146849 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14146848 |
atatattatttaataataaaagtcatgatacataacataagtttaacataaactattggcc |
14146788 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15526777 - 15526522
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17 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| || | | |
|
|
| T |
15526777 |
atcagtctacaaacataatagtctctacgctttattattatc--tcatttatattaaagctt-gactacatatgcatttaagaatagtgttctttatgtt |
15526681 |
T |
 |
| Q |
117 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattat-ctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||||| || || |
|
|
| T |
15526680 |
aatgtaatctcatgattaagtcacccttaatattccattacacgaactatatattctaggga-tttattaatcttataacaaatataataaagaatgtca |
15526582 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
15526581 |
tatattatttaataataaaagtcatgatacgtagcttaagtttaacataaattaatggcc |
15526522 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14226029 - 14225983
Alignment:
| Q |
220 |
ttattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaa |
266 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14226029 |
ttatttaataataaaagtcatgatacataacataaatttaacataaa |
14225983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30174402 - 30174143
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30174402 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
30174303 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30174302 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
30174203 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30174202 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
30174143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 24250309 - 24250568
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24250309 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
24250408 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24250409 |
taatgtaatctcatgattaagtcgcacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
24250508 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24250509 |
tattttattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
24250568 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 24229492 - 24229751
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
24229492 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggacacatttaagaataatgttctttatga |
24229591 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24229592 |
taaagtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttattaacattatttaaatataataaagagtgtca |
24229691 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24229692 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaaccattggcc |
24229751 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19616460 - 19616205
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
19616460 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctt-attattatccca-attcatattaaagctt-gactacaaatacatttaagaatagtgttctttatgt |
19616364 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataat-aaagagtgc |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| || |||||||| |
|
|
| T |
19616363 |
taatgtaatcttatgattaagtcacacttaatatatcattacacgaactatctattctaggaactttattaacattacaacaaatattataaaagagtgt |
19616264 |
T |
 |
| Q |
214 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19616263 |
catatattatttaataataaaaatcatgatacataatataagtttaacataaactattg |
19616205 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 24763834 - 24764092
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| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| |||| | || | |
|
|
| T |
24763834 |
catcagtctacataaataatagtctcgatgctttattattatc-tcaattcatattaaagctt-gagtacagatgcatttaagaatatcgttttttatgt |
24763931 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattat-ctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |
|
|
| T |
24763932 |
taatataatctcatgattaagtcacgcttaatatactattacatgaactatctattcttgggactttattaacattataacaaatataataaagatttcc |
24764031 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24764032 |
atgtattatttaataataaaagtcattatacataacataagtttaacataaactattggcc |
24764092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 15342280 - 15342538
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
15342280 |
catcaatctacatacataatagtctccacgctttattattatccca-atttatattaaatctt-gactacatatacattaaagaatagtgttctttatgg |
15342377 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaa-cattatctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||| || |||||||| || || | |
|
|
| T |
15342378 |
taatgtaatctcatgattaaatcacacttaatattccattacacgaaccatctattttagggactttattaatcatacaagaattataataacgaatgtc |
15342477 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15342478 |
atatattatttaacaataaaagtcatgatacataatataagtttaacataaactattggcc |
15342538 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21626647 - 21626451
Alignment:
| Q |
77 |
tttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaag |
176 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| | | |
|
|
| T |
21626647 |
tttgacttcggatacttttaagaatattgttctttatgttaatgtaatgtcatgattaagtcttacttaatgttccatcacatgaactatctattcgagg |
21626548 |
T |
 |
| Q |
177 |
gactttactaacattatct-aaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21626547 |
gactttattaatcttataacaaatataataaagaatgccttattttattcaataataaatgtcatgatgcatatcataagtttaacataaactattg |
21626451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29800317 - 29800197
Alignment:
| Q |
153 |
attacacgaactatctattctaaggactttactaacattatc-taaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataaga |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
29800317 |
attacacgaactatctattctagggactttattaatcttacaataattataataaagaatgacatatattattcaataataaaagtcatgatacgtagta |
29800218 |
T |
 |
| Q |
252 |
taggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29800217 |
taagtttaacataaaatattg |
29800197 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 248
Target Start/End: Original strand, 28719170 - 28719304
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| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataat-aaagagtgc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||| ||||| || |
|
|
| T |
28719170 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatgttccatcacatgaactatatattctaaggactttattaattttacaataagtataataaaagaatgt |
28719269 |
T |
 |
| Q |
214 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacata |
248 |
Q |
| |
|
| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28719270 |
cttattttgtttaataataaaagtcatgatacata |
28719304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 18852167 - 18852308
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| Q |
126 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
18852167 |
tcatgattaagtcacacttaacgtttcattactcgaactatctattatatggactttattaatcttacaaaaaatataataaagaatgcctcgtattatt |
18852266 |
T |
 |
| Q |
225 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaa |
266 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
18852267 |
tattaataaaagtcatgatagaaaacataagtttaacttaaa |
18852308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 28719053 - 28719100
Alignment:
| Q |
11 |
atggacatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatc |
58 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28719053 |
atggtcatcagtctacatacataatagtctctacgttttattattatc |
28719100 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 29800492 - 29800449
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcc |
59 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29800492 |
catcagtctacatacataatagtctttccgctttattattatcc |
29800449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9456141 - 9455882
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| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9456141 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
9456042 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9456041 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
9455942 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9455941 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
9455882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 42817266 - 42817525
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42817266 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
42817365 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42817366 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
42817465 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42817466 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
42817525 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 47667751 - 47668010
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47667751 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
47667850 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47667851 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
47667950 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47667951 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
47668010 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 20391516 - 20391775
Alignment:
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115 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20391516 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
20391615 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20391616 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
20391715 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20391716 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttctcataaactattggcc |
20391775 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 22670534 - 22670793
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22670534 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagcgttctataaga |
22670633 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22670634 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
22670733 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22670734 |
tatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
22670793 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 20779922 - 20780181
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20779922 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
20780021 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20780022 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
20780121 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20780122 |
tatattatacaataataaaagtcatgatacataagataaatataacataaactattggcc |
20780181 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 19706716 - 19706975
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16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19706716 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaaga |
19706815 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
19706816 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatatcattacacgaactatctattctaaggactttattaacattgtttaaatataataaagagtgaca |
19706915 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19706916 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
19706975 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 28135000 - 28135259
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| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28135000 |
catcagtctacatacataattgtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagatacatttaataatagcgttcttaaaga |
28135099 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28135100 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
28135199 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28135200 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
28135259 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 43802642 - 43802901
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| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43802642 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacgaatacatttaagaatagcgttctttaaga |
43802741 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
43802742 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatataattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
43802841 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43802842 |
tatattattcaatattaaaagtcatgatacataagatatgtttaacataaactattggcc |
43802901 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22612517 - 22612253
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111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22612517 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacgaatatatatatttaagaatagcgttctat |
22612418 |
T |
 |
| Q |
112 |
aagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagt |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22612417 |
aagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactttctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagt |
22612318 |
T |
 |
| Q |
212 |
gccatatatta-ttcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22612317 |
gccatatattatttcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
22612253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35930607 - 35930348
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| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
35930607 |
catcagtctatatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagttttgactacggatacatttaagaatagcgttctttatga |
35930508 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
35930507 |
taatgtaatctcatgattaagtcgcacttaatatattattacacaaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
35930408 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35930407 |
tatattattcaataataaaagtcattatacataagataagtttaacataaactattggcc |
35930348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 92 - 275
Target Start/End: Original strand, 22234827 - 22235010
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| Q |
92 |
atttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatt |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22234827 |
atttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatt |
22234926 |
T |
 |
| Q |
192 |
atctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22234927 |
atctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcc |
22235010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 633959 - 633814
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| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || || |
|
|
| T |
633959 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttgttattatcctt-attcatattaaagctt-gactacggatacatttaaaaataatgttctttatga |
633862 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaac |
163 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
633861 |
taatttaatctcatgattaagttacacttaatatattattacacgaac |
633814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 265
Target Start/End: Original strand, 26923675 - 26923871
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| Q |
66 |
catattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaacta |
165 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | || | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26923675 |
catattaaagctt-gactacggatacatttaagaataacattatttatgttaatgtaatctaatgattaagtcacactcaatatacaattacacgaacta |
26923773 |
T |
 |
| Q |
166 |
tctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacata |
264 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26923774 |
tctattctagaaactttattaacatcactacaaatataataaagagtgtcatatattatttaataataaaag---tgatacataagataagtttaacata |
26923870 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8727692 - 8727431
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| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttt--attcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataa |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
8727692 |
catcagtctacatagataatagtctcgacgctttattattattatctcaattcatattaaag-tttgactacagatagatttcagaataacgttctttat |
8727594 |
T |
 |
| Q |
114 |
gataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattat-ctaaatataataaagagtg |
212 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |
|
|
| T |
8727593 |
gttaaagtaatcttatgatttagtcacacttaatataaaattacacgaa-aatttattctagggactttattaacattataacaagtatgataaagagtg |
8727495 |
T |
 |
| Q |
213 |
ccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtt-taacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||| || |||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8727494 |
ccatatattatttaatagtaaatgttatgatatgtaatataagttataacataaaccattggcc |
8727431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 21881653 - 21881909
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||| || |
|
|
| T |
21881653 |
catcggtctacataaataatagtcttgacactttatcattatccta-atttatattaaagatt-gactacggatacatttaagaattgcattctttacat |
21881750 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
21881751 |
taatgtaatctcatgattaattaacacttaatattccatcacacgaactatctattctctggactttatttatcttacaacaaatataataaa-aatgcc |
21881849 |
T |
 |
| Q |
215 |
--atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21881850 |
atatatattattcaataataaaagtcatgatacgtagcaaaagtttaagataaactattg |
21881909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29096739 - 29096584
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25 |
acatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaat |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| | | ||||||||| |
|
|
| T |
29096739 |
acatacataatagtctctacgctttattattatc-tcgatatatat-aaagctt-gactacatatacttttaagaataaagttctttttgttaatgtaat |
29096643 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggacttta |
183 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
29096642 |
cttacgattaagtcacacttaatattccatcacatgaactatctattctagggacttta |
29096584 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
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17 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattat |
57 |
Q |
| |
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|
|
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16435877 |
atcagtctacatacatattagtctctacgctttattattat |
16435837 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 119755 - 119496
Alignment:
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16 |
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115 |
Q |
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| T |
119755 |
catcagtctacgtacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
119656 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
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|
|
| T |
119655 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
119556 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
119555 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
119496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31924 - 31665
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
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| T |
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catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
31825 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
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| T |
31824 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
31725 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
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| T |
31724 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataaaataggtttaacataaactattggcc |
31665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23545947 - 23545688
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
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|
| T |
23545947 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
23545848 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
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|
| T |
23545847 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
23545748 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
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| T |
23545747 |
tatattaatcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
23545688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 24933583 - 24933842
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
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| T |
24933583 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
24933682 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
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| T |
24933683 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
24933782 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
24933783 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcc |
24933842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 12789940 - 12790199
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12789940 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
12790039 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
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|
| T |
12790040 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaaaattatctaaatataataaagagtgcca |
12790139 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
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|
| T |
12790140 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcc |
12790199 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 25805662 - 25805921
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
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|
|
| T |
25805662 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagcttcgactacggatatatttaagaatagcgttctttaaga |
25805761 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
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|
| T |
25805762 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
25805861 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
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|
| T |
25805862 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
25805921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20941052 - 20940793
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
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|
| T |
20941052 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaataacgttctttaaga |
20940953 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
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|
| T |
20940952 |
taatgtaatctcatgattaagtcacagttaatatattattacacgaactatctattctaaggacattattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
20940853 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20940852 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
20940793 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22941275 - 22941016
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |
|
|
| T |
22941275 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcaaattaaagctttgactacggatacatttaagaataacattctttaaga |
22941176 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22941175 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
22941076 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22941075 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
22941016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31096841 - 31096582
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
31096841 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaataacgttctttaaga |
31096742 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31096741 |
taatgtaatcccatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
31096642 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31096641 |
tatattattcaataataagagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
31096582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 7865711 - 7865968
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
7865711 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagtgttctttatga |
7865807 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
7865808 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactatgaatataataaagagtgtc |
7865907 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7865908 |
atatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
7865968 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 12765271 - 12765528
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
12765271 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagtgttctttatga |
12765367 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12765368 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattttaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
12765467 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12765468 |
atatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
12765528 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 12704155 - 12704412
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || |
|
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| T |
12704155 |
catcagtctacatacatagtagtctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagtgttctttatga |
12704251 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | |
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|
| T |
12704252 |
taatgtaatctcatgattaagtcacaattaatatattattacacgaactatctattttaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
12704351 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12704352 |
atatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
12704412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 9812014 - 9812271
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |
|
|
| T |
9812014 |
catcagtctacatacatagtagtctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctt-gactacggatacatttaataatagtgttctttatga |
9812110 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
9812111 |
taatgtaatctcatgattaagtcacaattaatatattattacacgaactatctattttaaggactttattagcattactataaatataataaagagtgtc |
9812210 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9812211 |
atatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
9812271 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26245127 - 26244869
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| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||| || || |
|
|
| T |
26245127 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctt-attcatattaaagctt-gattacagatacatttaagaataacattctttatga |
26245030 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
26245029 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattcgagggactttattaacattactataaatataaaaaagagtatc |
26244930 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26244929 |
atatattattcaataataaaagtcatgatatataagataagtttaacataaactattggcc |
26244869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5097676 - 5097427
Alignment:
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16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
5097676 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaaactt-gactacaaatacatttaagaataacgttctttatgt |
5097579 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
5097578 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatatcattacatgaactatctattccagggactttattaacattactataaatataataaaaattgcc |
5097479 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaa |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5097478 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaa |
5097427 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 39535489 - 39535233
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
39535489 |
catcagtctacatacataatagtcttgacgctttattattatccca-attcatattaaag-tttgagtacggatacatttaagaatatcgttctttaagg |
39535392 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattat-ctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
39535391 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatataccattatatgaactatctattccagggactttattaacattataacaaatataataaagagtgtc |
39535292 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaat-aataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39535291 |
atatattatttaataaaaaaaattcatgatacataacgtaaatttaacataaactattg |
39535233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 20100520 - 20100776
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||| | || | |
|
|
| T |
20100520 |
catcagtctacatacataatagtcgtgacgctttattattatccca-atttatattaaag-tttaactacgaatacatttaagaataacgttatttacgt |
20100617 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| || | |
|
|
| T |
20100618 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatattccattatatgaactatctattctatggactttattaatcttacaacaaatataataaagaatgtc |
20100717 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20100718 |
--atattattgaataataaaagtcatgatacataacataagtctgacataaactattggcc |
20100776 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 275
Target Start/End: Original strand, 26129974 - 26130230
Alignment:
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20 |
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119 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| |
|
|
| T |
26129974 |
agtctacatacataatattctctgcgctttattattatccca-atttatattaaagctt-gactacggatacatttaagaagagcgttcttaatgttaaa |
26130071 |
T |
 |
| Q |
120 |
gtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatat--aataaagagtgccat |
216 |
Q |
| |
|
||||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
26130072 |
gtaatattaggattaagtcacactaaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaacaagtattaaataaagagtgtcat |
26130171 |
T |
 |
| Q |
217 |
atattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26130172 |
atattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttatcataaactattggcc |
26130230 |
T |
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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 59
Target Start/End: Original strand, 31267939 - 31267982
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| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcc |
59 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31267939 |
catccgtctacatacataatagtctccacgctttattgttatcc |
31267982 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 275
Target Start/End: Original strand, 31652244 - 31652322
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| Q |
196 |
aaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31652244 |
aaatataataaagaatgctttattttatttaataataaaagtcatgatacaaagcgtaagtttaacataaa-tattggcc |
31652322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0393 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:
Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 15100 - 15359
Alignment:
| Q |
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catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15100 |
catcagtctacatacataatagtctcgatgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaaga |
15199 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15200 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
15299 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15300 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
15359 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0378 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:
Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8330 - 8071
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8330 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactatggatacatttaagaatagcgttctataaga |
8231 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8230 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatataaatataataaagagtgcca |
8131 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8130 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
8071 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold2089 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold2089
Description:
Target: scaffold2089; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 26 - 275
Target Start/End: Original strand, 1 - 254
Alignment:
| Q |
26 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat----ttaagaatagcgttctataagataatgt |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatatatatatttaagaatagcgttctataagataatgt |
100 |
T |
 |
| Q |
122 |
aatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgccatatatt |
221 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
101 |
aatctcatgattaagtcgcacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatatt |
200 |
T |
 |
| Q |
222 |
attcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
201 |
attcaataataaaggtcatgatacataagataggtttaacaaaaactattggcc |
254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 60 - 272
Target Start/End: Original strand, 40015 - 40227
Alignment:
| Q |
60 |
tttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacac |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40015 |
tttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaataacgttctttaagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacac |
40114 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttta |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40115 |
gaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttta |
40214 |
T |
 |
| Q |
260 |
acataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
40215 |
acataaactattg |
40227 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0019 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:
Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Original strand, 19160 - 19370
Alignment:
| Q |
65 |
tcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaact |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19160 |
tcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaact |
19259 |
T |
 |
| Q |
165 |
atctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacata |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
19260 |
atctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagatattttttttata |
19359 |
T |
 |
| Q |
265 |
aactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
19360 |
aactattggcc |
19370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 67651 - 67906
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
67651 |
catcagtctatatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacgaatacatttaagaataacgttctttatga |
67748 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
67749 |
tactgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
67848 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67849 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataaaataagtttaacataaactattg |
67906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0063 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:
Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 275
Target Start/End: Original strand, 45226 - 45483
Alignment:
| Q |
17 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
116 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
45226 |
atcagtcaacatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attaatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagcgttctttatgat |
45323 |
T |
 |
| Q |
117 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
45324 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacaagaactatctattgtaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtca |
45423 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
45424 |
tatattattcaataataaaagtcatgatgcataagataagtttaacagaaactattggcc |
45483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0099 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:
Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9135 - 8866
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| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcg-acgctttatt-attatccttt-attcatattaaa-gcttt-gactacggatacattt-aagaatagcgtt-c |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
9135 |
catcagtctacatacataatagtctcgtacgctttatttattatccttttattcatattaaaagcttttgactacggatacattttaagaatagcgttac |
9036 |
T |
 |
| Q |
109 |
tataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaagg-actttactaacattatctaaatataataaa |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9035 |
tataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggtactttattaacattatctaaatataataaa |
8936 |
T |
 |
| Q |
208 |
gagtgccatatattattc-aataataaaagt-catgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8935 |
gagtgccatatattattctaataataaaagtacatgatacataagatagatttaacataaactattggcc |
8866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0112 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:
Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 208 - 1
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catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
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Q |
| |
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|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
208 |
catcagtcgacatacataatagtctcgacgctttattattatccattattcatattaaagctttgactacagatacatttaagaacagcgttctataaga |
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T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgcca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
108 |
taatgtaatctcattattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
9 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatattat |
223 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
8 |
tatattat |
1 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0376 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:
Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 11807 - 12064
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| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
11807 |
catcaatctacatacataatagtttcgacgctttattattatcct--aattatattaaagatt-gactacagatacatttaagaatagtgttctttatga |
11903 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| || | |
|
|
| T |
11904 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatacaataaagaatgtc |
12003 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12004 |
atatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
12064 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:
Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Original strand, 18786 - 18950
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| Q |
111 |
taagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagag |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18786 |
taagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagag |
18885 |
T |
 |
| Q |
211 |
tgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18886 |
tgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
18950 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1948 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold1948
Description:
Target: scaffold1948; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 86 - 275
Target Start/End: Original strand, 961 - 1150
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| Q |
86 |
ggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttact |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
961 |
ggatacatttaagaataacgttctttaagataatgtaatcacatgattaagtcacacttaatatattattaaaaaaactatctattataaggactttatt |
1060 |
T |
 |
| Q |
186 |
aacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1061 |
aacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
1150 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0061 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:
Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 76496 - 76326
Alignment:
| Q |
105 |
gttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataat |
204 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
76496 |
gttctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataat |
76397 |
T |
 |
| Q |
205 |
aaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
76396 |
aaagagtgtcatattttattcaatattaaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcc |
76326 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0466 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:
Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 13226 - 13485
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || | |
|
|
| T |
13226 |
catcggtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccca-attaatattaaagctt-gactatggatacatttaagaatactgttttttatgt |
13323 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattatt-acacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgc |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
13324 |
taatgtaatctcatgattaaatcacacttaatatatcatttacatgaactatctattctagggactttattagcattactacaaatataattaagagagc |
13423 |
T |
 |
| Q |
214 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13424 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataaatttaacataaactattggcc |
13485 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 40265 - 40523
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| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
40265 |
catcagtctacatacataatagtctcggcgctttattattatc-tcaatttatattaaagctt-gactatggatacatttaagaatagcgttctttacgt |
40362 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
40363 |
taatgtattctcatgattaagtcacacttaatataccattacatgaattatctattccagagactttattaatattacaaaaaatataataaagagtgtc |
40462 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40463 |
atatattatttaataataaaagtcatgctacatagcataagtttaacataaactattggcc |
40523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0611 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:
Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 138 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9672 - 9535
Alignment:
| Q |
138 |
cacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagt |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9672 |
cacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatattataaagagtgccacatattattccataataaaagt |
9573 |
T |
 |
| Q |
238 |
catgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9572 |
catgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
9535 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0086 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:
Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 53790 - 53543
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
53790 |
catcaatctacatacataatagtcttgacactttattattatccta-attcatattaaagctt-gaatacggatacatttaagaatagtgttctttatgt |
53693 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| |||||||| |||||||| | | ||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
53692 |
taatgtaatctcat--------cacacttaatatatcattacatgaactatttactctagggactttattaacattactatgaatcgaataaagagtgtc |
53601 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53600 |
atatattattcaataataaaagtcatgatatataagataagtttaacataaactattg |
53543 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0059 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:
Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 161 - 275
Target Start/End: Original strand, 33927 - 34041
Alignment:
| Q |
161 |
aactatctattctaaggactttactaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaa |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33927 |
aactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccacatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaa |
34026 |
T |
 |
| Q |
261 |
cataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
34027 |
cataaactattggcc |
34041 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0111 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:
Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26567 - 26413
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| Q |
82 |
ctacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactt |
181 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26567 |
ctactgatacatttaagaataacgttctttattataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatacgattacacgaactatctattctagggactt |
26468 |
T |
 |
| Q |
182 |
tactaacattatcta--aatataataaagagtgccatatattattcaataataaaa |
235 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26467 |
tattaacatta-caacgaatataataaagagtgccatatattatttaataataaaa |
26413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0454 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:
Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13861 - 13761
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| Q |
174 |
aaggactttactaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13861 |
aaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattg |
13762 |
T |
 |
| Q |
273 |
g |
273 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
13761 |
g |
13761 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0136 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:
Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8756 - 8508
Alignment:
| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
8756 |
catcaatctacatacatattagtctctacgctttattactatc-tcaatttatattaaaactt-gactacaaatacttttaagaatagtgttctttatgt |
8659 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttactaacattatct-aaatataataaagagtgcc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||| | ||||||| | || |
|
|
| T |
8658 |
taatgtaatctcatgattaagtctcacataatgt-ccattacttgaactatatattctaaggactttattaatattatatcaaatttcataaagaatacc |
8560 |
T |
 |
| Q |
215 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaa |
266 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8559 |
tcattttatttaataataaaaatcacgatacataaaataattttaacataaa |
8508 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0783 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0783
Description:
Target: scaffold0783; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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| Q |
237 |
tcatgatacataagataggtttaacataaactattggc |
274 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6284 |
tcatgatacataagataggtttaacataaactattggc |
6247 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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| Q |
16 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| | | |
|
|
| T |
83292 |
catcagtctacatacataatagtctatacactttattattat-ctcaatttatattaaa-tttcgactacggatacttttaagaatagtattctttgtgt |
83389 |
T |
 |
| Q |
116 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatat |
149 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
83390 |
gaatttaatctcacaattaagtctcacttaatat |
83423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1400 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1400
Description:
Target: scaffold1400; HSP #1
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245 |
cataagataggtttaacataaactattggcc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1875 |
cataagataggtttaacataaactattggcc |
1845 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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