View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8373_high_19 (Length: 271)

Name: NF8373_high_19
Description: NF8373
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8373_high_19
NF8373_high_19
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (24-253)||(21481238-21481467)
chr8 (24-224)||(18811450-18811650)
chr8 (24-224)||(27827727-27827927)
chr8 (24-224)||(43080344-43080544)
chr8 (24-224)||(15069309-15069509)
chr8 (24-224)||(31577686-31577885)
chr8 (47-224)||(41383418-41383595)
chr8 (26-224)||(34255855-34256053)
chr8 (56-224)||(17848300-17848468)
chr8 (26-224)||(4732279-4732477)
chr8 (24-161)||(5591504-5591641)
chr8 (56-162)||(35744797-35744903)
chr8 (125-165)||(7099960-7100000)
chr8 (56-162)||(10684838-10684944)
chr8 (54-162)||(18853735-18853843)
chr8 (221-251)||(15069842-15069872)
chr8 (221-251)||(27828257-27828287)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (21-253)||(18536868-18537099)
chr4 (24-224)||(22782129-22782329)
chr4 (24-224)||(22134009-22134209)
chr4 (24-224)||(16933540-16933740)
chr4 (24-224)||(11007960-11008160)
chr4 (24-224)||(22046107-22046307)
chr4 (47-224)||(12402488-12402665)
chr4 (24-224)||(36920890-36921090)
chr4 (24-219)||(14788830-14789025)
chr4 (24-224)||(9175864-9176064)
chr4 (24-218)||(47563496-47563690)
chr4 (21-147)||(36379022-36379148)
chr4 (24-224)||(12395252-12395451)
chr4 (24-224)||(12400214-12400413)
chr4 (21-165)||(22802188-22802332)
chr4 (24-178)||(3578132-3578286)
chr4 (22-224)||(16454042-16454244)
chr4 (26-165)||(5136713-5136852)
chr4 (26-165)||(7123329-7123468)
chr4 (30-165)||(8394043-8394178)
chr4 (26-224)||(5872436-5872634)
chr4 (26-224)||(12743277-12743475)
chr4 (46-224)||(52094711-52094889)
chr4 (64-216)||(10113639-10113791)
chr4 (26-165)||(4588573-4588712)
chr4 (24-153)||(5207083-5207212)
chr4 (120-177)||(5350578-5350635)
chr4 (56-162)||(9224978-9225084)
chr4 (221-251)||(11007600-11007630)
chr4 (221-251)||(12402125-12402155)
chr4 (221-251)||(16933180-16933210)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (23-244)||(26944210-26944431)
chr6 (22-229)||(17012748-17012954)
chr6 (24-224)||(33309576-33309776)
chr6 (24-224)||(26931955-26932155)
chr6 (24-224)||(25462857-25463057)
chr6 (38-224)||(15533994-15534180)
chr6 (24-224)||(26067787-26067987)
chr6 (24-213)||(12936652-12936841)
chr6 (24-178)||(3395083-3395237)
chr6 (24-178)||(3631381-3631535)
chr6 (26-224)||(16553297-16553495)
chr6 (26-224)||(16629853-16630051)
chr6 (26-218)||(5408424-5408616)
chr6 (26-218)||(5412749-5412941)
chr6 (26-218)||(16651557-16651749)
chr6 (26-224)||(12157940-12158138)
chr6 (26-165)||(34165505-34165644)
chr6 (96-213)||(12910976-12911093)
chr6 (46-224)||(30444002-30444180)
chr6 (24-81)||(12911093-12911150)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (22-229)||(26278-26484)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (24-224)||(38394682-38394882)
chr7 (24-224)||(7093853-7094053)
chr7 (24-224)||(1048681-1048881)
chr7 (24-224)||(7351043-7351243)
chr7 (24-224)||(36146-36346)
chr7 (24-224)||(22135499-22135699)
chr7 (24-224)||(40550526-40550726)
chr7 (24-224)||(44725271-44725471)
chr7 (24-224)||(28486261-28486461)
chr7 (21-224)||(7471373-7471576)
chr7 (21-224)||(21678752-21678955)
chr7 (24-222)||(13289893-13290091)
chr7 (91-224)||(31159094-31159227)
chr7 (24-224)||(24749283-24749483)
chr7 (63-219)||(20298050-20298206)
chr7 (31-218)||(24816768-24816949)
chr7 (55-156)||(4295401-4295502)
chr7 (24-165)||(18391579-18391720)
chr7 (24-224)||(26213416-26213615)
chr7 (26-165)||(6593941-6594080)
chr7 (26-224)||(47675486-47675684)
chr7 (26-224)||(48490026-48490224)
chr7 (46-224)||(6047202-6047380)
chr7 (24-165)||(6570606-6570747)
chr7 (56-162)||(24261897-24262003)
chr7 (24-73)||(31159232-31159281)
chr7 (56-162)||(5817759-5817865)
chr7 (221-251)||(7093493-7093523)
chr7 (56-162)||(16884334-16884440)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (24-224)||(28841109-28841309)
chr1 (24-224)||(51750724-51750924)
chr1 (24-224)||(28203091-28203291)
chr1 (24-224)||(20300818-20301018)
chr1 (24-224)||(51758221-51758421)
chr1 (22-216)||(25250681-25250875)
chr1 (24-224)||(16226855-16227055)
chr1 (24-224)||(47178049-47178249)
chr1 (24-224)||(6996271-6996471)
chr1 (24-219)||(31736873-31737068)
chr1 (21-224)||(50078186-50078389)
chr1 (24-221)||(8348460-8348657)
chr1 (29-224)||(16429640-16429835)
chr1 (24-224)||(27338525-27338725)
chr1 (24-224)||(3805530-3805730)
chr1 (24-224)||(13127127-13127327)
chr1 (20-175)||(28997696-28997851)
chr1 (20-175)||(29003412-29003567)
chr1 (26-165)||(31657825-31657964)
chr1 (26-165)||(3157284-3157423)
chr1 (26-165)||(28222829-28222968)
chr1 (26-224)||(50168699-50168896)
chr1 (30-165)||(16456343-16456478)
chr1 (106-224)||(31424426-31424544)
chr1 (128-162)||(17346160-17346194)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (24-224)||(10750385-10750585)
chr5 (24-224)||(34478811-34479011)
chr5 (24-224)||(15356241-15356441)
chr5 (24-224)||(20043672-20043871)
chr5 (24-224)||(23665733-23665933)
chr5 (24-224)||(658705-658905)
chr5 (24-224)||(6745755-6745955)
chr5 (24-224)||(31543420-31543620)
chr5 (24-224)||(18467371-18467571)
chr5 (24-219)||(27911119-27911314)
chr5 (26-224)||(29720996-29721194)
chr5 (26-224)||(9788570-9788768)
chr5 (24-219)||(25806148-25806343)
chr5 (26-219)||(26171388-26171581)
chr5 (27-224)||(16407957-16408154)
chr5 (71-219)||(18510811-18510959)
chr5 (26-165)||(40380737-40380876)
chr5 (26-165)||(16545058-16545200)
chr5 (26-224)||(534380-534578)
chr5 (46-216)||(13694498-13694668)
chr5 (26-165)||(42427839-42427978)
chr5 (56-162)||(33790722-33790828)
chr5 (221-251)||(20505235-20505265)
chr5 (157-223)||(20505599-20505665)
chr5 (56-162)||(27449229-27449335)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (24-224)||(456573-456773)
chr3 (24-224)||(6065185-6065385)
chr3 (24-224)||(10957715-10957915)
chr3 (24-224)||(43226743-43226943)
chr3 (24-224)||(18098563-18098763)
chr3 (24-224)||(4309902-4310102)
chr3 (24-224)||(5192316-5192516)
chr3 (24-224)||(11168767-11168967)
chr3 (24-224)||(3315348-3315548)
chr3 (24-224)||(27421304-27421504)
chr3 (24-224)||(23634112-23634311)
chr3 (24-224)||(5898075-5898275)
chr3 (47-219)||(53917071-53917243)
chr3 (21-224)||(28101400-28101603)
chr3 (47-224)||(7769244-7769421)
chr3 (24-219)||(42990965-42991160)
chr3 (26-224)||(23199487-23199685)
chr3 (26-224)||(5259671-5259869)
chr3 (26-216)||(37407310-37407500)
chr3 (24-224)||(10209820-10210020)
chr3 (24-224)||(6717132-6717332)
chr3 (26-165)||(4600127-4600266)
chr3 (21-178)||(43422908-43423063)
chr3 (26-165)||(10056866-10057005)
chr3 (26-165)||(10061310-10061449)
chr3 (26-165)||(10063532-10063671)
chr3 (26-165)||(10065754-10065893)
chr3 (24-209)||(1619882-1620066)
chr3 (24-161)||(22834420-22834557)
chr3 (24-178)||(25634542-25634697)
chr3 (26-224)||(9635472-9635670)
chr3 (26-156)||(10059088-10059218)
chr3 (26-224)||(29811490-29811688)
chr3 (26-224)||(7762892-7763090)
chr3 (46-165)||(15830649-15830768)
chr3 (24-143)||(53597892-53598011)
chr3 (26-162)||(23409742-23409878)
chr3 (67-165)||(32891752-32891850)
chr3 (131-165)||(24933178-24933212)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (24-224)||(22813-23013)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (24-224)||(35217362-35217562)
chr2 (24-224)||(36560533-36560733)
chr2 (24-223)||(21520087-21520286)
chr2 (24-224)||(19503728-19503928)
chr2 (24-223)||(22405323-22405522)
chr2 (21-178)||(6263592-6263749)
chr2 (43-207)||(28569834-28569998)
chr2 (47-154)||(34574620-34574727)
chr2 (56-162)||(19348684-19348790)
chr2 (94-224)||(42019238-42019368)
chr2 (221-251)||(19503368-19503398)
chr2 (221-251)||(21519726-21519756)
chr2 (56-162)||(25403057-25403163)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (24-224)||(311-511)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (24-224)||(34237-34437)
scaffold0011 (221-251)||(34775-34805)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (21-219)||(80550-80748)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (24-224)||(72909-73109)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (24-219)||(50705-50900)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (24-219)||(849-1044)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (26-224)||(115224-115422)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (56-162)||(14883-14989)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (89-165)||(26824-26900)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (63-162)||(458-557)
[»] scaffold1991 (1 HSPs)
scaffold1991 (89-162)||(1028-1101)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Original strand, 21481238 - 21481467
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21481238 ataaatttttgagagaagtagcgaatgaaccaaccgcgacatcaatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcgccaatt 21481337  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21481338 cctaaagaaacaattttactcattcaagatggtagagtcaaagaccatcatggagaaccttgcggagttcaacagaatccttgatgacttggagtatatt 21481437  T
Q  224 gtctctgagggttatgaggatgcaggtgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21481438 gtctctgagggttatgaggatgcatgtgtt 21481467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 18811450 - 18811650
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18811450 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagatggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 18811549  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18811550 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 18811649  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  18811650 g 18811650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 27827727 - 27827927
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27827727 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 27827826  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27827827 cctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 27827926  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  27827927 g 27827927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 43080344 - 43080544
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43080344 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 43080443  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  43080444 cctaaaacaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 43080543  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  43080544 g 43080544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 15069309 - 15069509
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||  |||||||  || |||||||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15069309 ataaagttttgaaagaagtagcaaatgaaccaactgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 15069408  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15069409 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 15069508  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  15069509 g 15069509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31577885 - 31577686
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| || | | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  31577885 ataaagttttgagagaggtagcgaaggaaccaattgcgtcatcgatgtggtcaaagttggagtctgtgtatatgacaaagtctttggctcttcggcaatt 31577786  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31577785 cctaaagcaacaactctact-attcaagatggtggagtcaatggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccatgatgacttggagaatatt 31577687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 224
Target Start/End: Original strand, 41383418 - 41383595
Alignment:
Q  47 aaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcat 146  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41383418 aaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcaaatatttgtatatgacaaagtctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 41383517  T
Q  147 tcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    |  |||||||| ||||||| || |||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  41383518 ttgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattg 41383595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34256053 - 34255855
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| || |  ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  34256053 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcaacatcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattcc 34255954  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  34255953 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattg 34255855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Original strand, 17848300 - 17848468
Alignment:
Q  56 accgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatgg 155  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||     
T  17848300 accgcggaatcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaatctctttggctcatcggaaattcctaaagcaacaactctactcattgaagatgt 17848399  T
Q  156 tagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | ||||||||   |||||||||| | ||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17848400 tggagtcaaagttcatcatggagtaacttacgaagttcaatacaatccttgatgacttggagaatattg 17848468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 4732279 - 4732477
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  4732279 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaacctaccgtggcgtcgatgtggtcaaagttggagacattgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattcc 4732378  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  |  ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  4732379 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattg 4732477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Original strand, 5591504 - 5591641
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |  ||||||||||  |||| |||||||||| | |||||    
T  5591504 ataaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcgtcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgatcaagtctttggctcataggcaatt 5591603  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagt 161  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  5591604 ccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagt 5591641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35744903 - 35744797
Alignment:
Q  56 accgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatgg 155  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || |  ||||||||||| || | |||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  35744903 accgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcatagacaactcttgaagcaacaactctactcattcaagatgg 35744804  T
Q  156 tagagtc 162  Q
    | |||||    
T  35744803 tggagtc 35744797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7100000 - 7099960
Alignment:
Q  125 ctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7100000 ctaaaacaacaactttactcatttaagatggtagagtcaaa 7099960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 162
Target Start/End: Original strand, 10684838 - 10684944
Alignment:
Q  56 accgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatgg 155  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || |  ||||||||||| || | |||||||||| | ||| || | || |||||||| || |||||||||||||    
T  10684838 accgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 10684937  T
Q  156 tagagtc 162  Q
    | |||||    
T  10684938 tggagtc 10684944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 162
Target Start/End: Original strand, 18853735 - 18853843
Alignment:
Q  54 caaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagat 153  Q
    ||||||||||||||||||||   || || || |  ||||||||||| || | |||||||||| | ||| || | ||||||||||| || |||||||||||    
T  18853735 caaccgcggcatcgatgtgggctaaattggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagat 18853834  T
Q  154 ggtagagtc 162  Q
    ||| |||||    
T  18853835 ggtggagtc 18853843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 251
Target Start/End: Original strand, 15069842 - 15069872
Alignment:
Q  221 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15069842 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 15069872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 251
Target Start/End: Original strand, 27828257 - 27828287
Alignment:
Q  221 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828257 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 27828287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18537099 - 18536868
Alignment:
Q  21 ggaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgaca 120  Q
    ||||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  18537099 ggaataaagttttaagagatgtagcgaaggaaccaatcgcggcatcgatgtggtcaaagttcgtatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggca 18537000  T
Q  121 attcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaat 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||    
T  18536999 attcctaaagcaacaactttactcattcaagatggaagagtcgaaggccatcatggagcaacttgcggagttcaacagaat-cttgatgacttggaaaat 18536901  T
Q  221 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtgtt 253  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18536900 attatctctgagggttttgaggatgcaagtgtt 18536868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22782329 - 22782129
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22782329 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaatt 22782230  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22782229 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 22782130  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  22782129 g 22782129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22134209 - 22134009
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22134209 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttttatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 22134110  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22134109 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 22134010  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  22134009 g 22134009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16933740 - 16933540
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16933740 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 16933641  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16933640 cctaaaacaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 16933541  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  16933540 g 16933540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11008160 - 11007960
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11008160 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggaaaagatggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 11008061  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||| | | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11008060 cctaaagcaacgaatctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 11007961  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  11007960 g 11007960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22046307 - 22046107
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22046307 ataaagttttgagagaagtagcaaagtaagcaacctcggcatcgatgtgggcaaatttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 22046208  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22046207 cctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 22046108  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  22046107 g 22046107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12402665 - 12402488
Alignment:
Q  47 aaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcat 146  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12402665 aaggaaccaaccgtgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcat 12402566  T
Q  147 tcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    ||| |||||| ||||| || |||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12402565 tcaggatggtggagtcgaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccgtgatgacttggagaatattg 12402488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36921090 - 36920890
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |    
T  36921090 ataaagttttgagagaagcagcaaaggatccaatcgcggcatcgatgtggtcaaagtttgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaagt 36920991  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| |||||||| |||    
T  36920990 cttaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacatt 36920891  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  36920890 g 36920890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14789025 - 14788830
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  || ||  | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  14789025 ataaagttttgagagaagtagcaaaagatactaccgcggcatcgatgtggtcaaagatcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagt 14788926  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaa 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  14788925 cctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 14788830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9176064 - 9175864
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| || |||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  9176064 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccacgacatcgatgtgggaaaagtgggaatctttgtatatgacaaagtctttggctgatcggcaatt 9175965  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9175964 cctaaagcaacgactctactcattcaggatggaagactcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 9175865  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  9175864 g 9175864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Original strand, 47563496 - 47563690
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||  |||||||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  47563496 ataaagttttgagagaagtagcaaaggatacaaccgcgacatcgatgtgggaaaagttggaatctttgtatatgacaaagtcgttggctcatcgacaatt 47563595  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggaga 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| |||||||    
T  47563596 cctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaatttaaaggccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggaga 47563690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 36379022 - 36379148
Alignment:
Q  21 ggaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgaca 120  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  36379022 ggaataaagatttgagagaagtagcgaaggaaccaaccgtggcatcgatgtagtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggca 36379121  T
Q  121 attcctaaaacaacaactttactcatt 147  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||    
T  36379122 agtcctaaagcaacaactttactcatt 36379148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12395451 - 12395252
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  12395451 ataaaattttgagagaagtagcaaaggagccaaccgtgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtat-tgaaaaagtctttggctcatcggcaatt 12395353  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||| || || || |||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12395352 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggaatcgaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccgtgatgacttggagaatatt 12395253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12400413 - 12400214
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  12400413 ataaaattttgagagaagtagcaaaggagccaaccgtgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtat-tgaaaaagtctttggctcatcggcaatt 12400315  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||| || || || |||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12400314 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggaatcgaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccgtgatgacttggagaatatt 12400215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22802332 - 22802188
Alignment:
Q  21 ggaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgaca 120  Q
    ||||||||| |||||| |||| |   |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22802332 ggaataaagatttgagagaagcaacaaaggaaacaaccgcgacatcaatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggca 22802233  T
Q  121 attcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22802232 agtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaa 22802188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3578286 - 3578132
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |    
T  3578286 ataaagttttgagagatgtagtgaaggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtctttatatatgacaaagtctttggatcatcgccaact 3578187  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggag 178  Q
      |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  3578186 tttaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagacaaagtccatcatggag 3578132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Original strand, 16454042 - 16454244
Alignment:
Q  22 gaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaa 121  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  ||| |  |||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  16454042 gaataaagtttcgagagaagtagcaaagtatacaaccgcgacatcgatgtggtcaaattttgaatatttgtatacgacaaagactttggctcatcgacaa 16454141  T
Q  122 ttcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaata 221  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||    ||| |||||| |||| |||| ||| ||| |||||||| |    
T  16454142 gtcctaaagcaacaactttactaattcaagatggtaaagtcaaaggccaccatagagctaattgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaaca 16454241  T
Q  222 ttg 224  Q
    |||    
T  16454242 ttg 16454244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 5136713 - 5136852
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||    
T  5136713 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattcc 5136812  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5136813 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaa 5136852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 7123329 - 7123468
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  7123329 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaacgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattcc 7123428  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7123429 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaa 7123468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 165
Target Start/End: Original strand, 8394043 - 8394178
Alignment:
Q  30 ttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaa 129  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||    
T  8394043 ttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattcctcaa 8394142  T
Q  130 acaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8394143 gcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaa 8394178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 5872436 - 5872634
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| || |  ||| ||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  5872436 aaagttttgagggaggtcgcgaaggaaccaaccgcgccgtcgatgtggtcaaagttggagtcgttgcatatgaccaagtctttggctcataggcaattcc 5872535  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||| |  |   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  5872536 ttaagcaacaaatctactcattcaagatggtggagtcaaagaccatgatggagcaattaatggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattg 5872634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12743475 - 12743277
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||  ||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||    
T  12743475 aaagttttgagggatgtcgtgaaggaacctaccgcggcgtcgatgtggtcaaagttgaaatcattgtatatgaccaagtctttggcttataggcaattcc 12743376  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  |  ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  12743375 ttaagaaacaactatactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatctttgatgatttggagaacattg 12743277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52094889 - 52094711
Alignment:
Q  46 gaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||    
T  52094889 gaaggaacctaccgcggcatcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactca 52094790  T
Q  146 ttcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    ||||||||||| || |||||  || | |||||| |  |  ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  52094789 ttcaagatggtggattcaaagaccgtgatggagcaattgacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattg 52094711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Original strand, 10113639 - 10113791
Alignment:
Q  64 atcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtca 163  Q
    ||||||||||| |||||| || |  ||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  10113639 atcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgactaagtctttggctcacaggcaattcctaaatcaacaactctactcattcaagacggtggagtca 10113738  T
Q  164 aatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttgga 216  Q
    || ||||||||||||   ||  | ||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  10113739 aaggccatcatggagcgactaacagagttcaacaaaatccttgatgatttgga 10113791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 4588573 - 4588712
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||| | |||||||  || || ||||||||||| || |  ||||||||||| || | |||||||||| | |||||||    
T  4588573 aaagttttgaaggatgtcgtgaaggaatctaccgcggagtcaatctggtgaaagttggagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattcc 4588672  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | || |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4588673 ttaagcaacaattctactcattcaagatggtggagtcaaa 4588712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5207212 - 5207083
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||  |||||  |||||   |||  |||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  5207212 ataaagtgttgagggatgttgtgaaggaacgtaccgcaacatcggcatgggcaaagttggagtctttgtatatgacaaagtctttggctcatagacaaat 5207113  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagat 153  Q
    |||||| |||||| | |||||||| |||||    
T  5207112 cctaaatcaacaaatctactcatttaagat 5207083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Original strand, 5350578 - 5350635
Alignment:
Q  120 aattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatgga 177  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  5350578 aattcttaaaacaacaactctactcatttaagaaggtggagtcaaatgccgtcatgga 5350635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 162
Target Start/End: Original strand, 9224978 - 9225084
Alignment:
Q  56 accgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatgg 155  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| || |  ||||||||||| || | |||||||||| | ||| || | || |||||||| || |||||||||||||    
T  9224978 accgcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 9225077  T
Q  156 tagagtc 162  Q
    | |||||    
T  9225078 tggagtc 9225084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11007630 - 11007600
Alignment:
Q  221 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11007630 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 11007600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12402155 - 12402125
Alignment:
Q  221 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12402155 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 12402125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16933210 - 16933180
Alignment:
Q  221 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933210 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 16933180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Original strand, 26944210 - 26944431
Alignment:
Q  23 aataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaat 122  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26944210 aataaagttttgagagatatagcgaaggaaccaaccgcgccatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggcttatcgacaat 26944309  T
Q  123 tcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatat 222  Q
    ||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||||||  ||||    
T  26944310 tcctaaagcgacaactttaataattcaagatggtagagtcaaaggccatcatagagaactttgtggagttcaacagaatccttgataacttggattatat 26944409  T
Q  223 tgtctctgagggttatgaggat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26944410 tgtctctgagggttatgaggat 26944431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Original strand, 17012748 - 17012954
Alignment:
Q  22 gaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  17012748 gaattaagttttgagggaagtagcaaaggaaccaactgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgataaagtctttggctcatcggcaa 17012847  T
Q  122 ttcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaata 221  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  17012848 ttccaaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagaaacttgcggagttcaa-aaaatccttgatgacttggagaata 17012946  T
Q  222 ttgtctct 229  Q
    || |||||    
T  17012947 ttttctct 17012954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 33309576 - 33309776
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| |||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  33309576 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcagcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 33309675  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33309676 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 33309775  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  33309776 g 33309776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26932155 - 26931955
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26932155 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgttgtgggcaaagttgaaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 26932056  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26932055 cctaaagcaacgactctactcattcaagatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 26931956  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  26931955 g 26931955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25463057 - 25462857
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||  | | ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  25463057 ataaagttttgagagatgtagcgaaagaaccaaacgcggcatcgatgtagttaaagttatagtctttgtatatgacaaagtcttaggctcatcggcaatt 25462958  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25462957 cctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatctttgatgacttggagaatatt 25462858  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  25462857 g 25462857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15534180 - 15533994
Alignment:
Q  38 gaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaac 137  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  15534180 gaagtagcaaaggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaagtcctaaagcaacaac 15534081  T
Q  138 tttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |||| ||||||  ||| |||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  15534080 tttactcattcaagatggtagagtcaaaaaccatcatggagctacttgtggagttcgacaaaatcattggtgatttggagaacattg 15533994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26067987 - 26067787
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  26067987 ataaagttttgatagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcagcaatt 26067888  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  26067887 cctaaagcaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcattgagcaacttacggagttcaaaaaaatcctagatgacttggagaatatt 26067788  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  26067787 g 26067787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12936841 - 12936652
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||    
T  12936841 ataaagttttgagagatgtagcgaaagaaccaaccgcgccatcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaaaatctttggctcattggcaatt 12936742  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgactt 213  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12936741 cctaaagcaacaactctactcatttaagatggtggagttaaaggccatcatggagcaacttacggagtttaacaaaatccttgatgactt 12936652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Original strand, 3395083 - 3395237
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  3395083 ataaagttttgagagaagtggcaaaggaaccaaccgccgcatcgatgtgtgcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaatt 3395182  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggag 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3395183 cctaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcacggag 3395237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3631535 - 3631381
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  3631535 ataaagttttgagaaaagtagcgaaggaatccaccgcagcatcgatgtggccaaagttggaagctttgtatatgacaaagtctttgactcatcaacaatt 3631436  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggag 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3631435 cctaaagcaataactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatggag 3631381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 16553297 - 16553495
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  16553297 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattcc 16553396  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  16553397 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatccttgatgacttggagaacattg 16553495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 16629853 - 16630051
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  16629853 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattcc 16629952  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  16629953 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatccttgatgacttggagaacattg 16630051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5408616 - 5408424
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  5408616 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaactaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattcc 5408517  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggaga 218  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  5408516 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggaga 5408424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5412941 - 5412749
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  5412941 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaactaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattcc 5412842  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggaga 218  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  5412841 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggaga 5412749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 218
Target Start/End: Original strand, 16651557 - 16651749
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  16651557 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattcc 16651656  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggaga 218  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  16651657 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatccttgatgacttggaga 16651749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 12157940 - 12158138
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    ||||||||| |||| || |  |||||||||| |||| |||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  12157940 aaagttttgggggatgtcgctaaggaaccaaacgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgacaaagtctttggctcattggcaattcc 12158039  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    |||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||    
T  12158040 taaagcaagcactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccaccatggagaaacttacagagttcaacaagatccttgatgatttggagaacattg 12158138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 34165505 - 34165644
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||    
T  34165505 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattcc 34165604  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34165605 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaa 34165644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12911093 - 12910976
Alignment:
Q  96 tgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaa 195  Q
    ||||||||| |||||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||    
T  12911093 tgacaaagtctttggctcattgggaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagttaaaggccatcatggagcaacttacggagtttaa 12910994  T
Q  196 cacaatccttgatgactt 213  Q
    || |||||||||||||||    
T  12910993 caaaatccttgatgactt 12910976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 224
Target Start/End: Original strand, 30444002 - 30444180
Alignment:
Q  46 gaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactca 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |  ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  30444002 gaaggaaccaaccacggcatcgatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcatagacaatttctaaagccacaactctactca 30444101  T
Q  146 ttcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    || |||||| | || | | |  ||||||||||| | ||| || |||| |||| ||||||| || | |||||||| ||||    
T  30444102 tttaagatgatggatttatacaccatcatggagcaacttacgaagttcaacaaaatcctttataatttggagaacattg 30444180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12911150 - 12911093
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagtt 81  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12911150 ataaagttttgagagatgtagcgaaagaaccaaccgcgccatcgatgtggtcaaagtt 12911093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26484 - 26278
Alignment:
Q  22 gaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  26484 gaattaagttttgagggaagtagcaaaggaaccaactgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgataaagtctttggctcatcggcaa 26385  T
Q  122 ttcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaata 221  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  26384 ttccaaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagaaacttgcggagttcaa-aaaatccttgatgacttggagaata 26286  T
Q  222 ttgtctct 229  Q
    || |||||    
T  26285 ttttctct 26278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 38394682 - 38394882
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38394682 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 38394781  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38394782 cctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 38394881  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  38394882 g 38394882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7094053 - 7093853
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7094053 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggagtctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaatt 7093954  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7093953 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 7093854  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  7093853 g 7093853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1048881 - 1048681
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  1048881 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggcgcatcggcaatt 1048782  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1048781 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 1048682  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  1048681 g 1048681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7351243 - 7351043
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7351243 ataaagttttgaaagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 7351144  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7351143 cctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggtcatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 7351044  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  7351043 g 7351043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 36146 - 36346
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  36146 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagctaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttagctcatcggcaatt 36245  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36246 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 36345  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  36346 g 36346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 22135499 - 22135699
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||| || |||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22135499 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcaatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 22135598  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22135599 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 22135698  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  22135699 g 22135699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 40550526 - 40550726
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||| || |||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  40550526 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcaatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 40550625  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40550626 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 40550725  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  40550726 g 40550726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 44725271 - 44725471
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  44725271 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaaccaaccgcggcatcgatttgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 44725370  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    ||||||  ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| | |||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44725371 cctaaagtaacaactctacttattcaggatggtggagtcaaaggccatcatagagcaacttatggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 44725470  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  44725471 g 44725471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 28486261 - 28486461
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||| ||||||| |||| ||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  28486261 ataaaattttgagagaagcagcaacggaaacaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagt 28486360  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| |||||||| |||    
T  28486361 cctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacatt 28486460  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  28486461 g 28486461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7471576 - 7471373
Alignment:
Q  21 ggaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgaca 120  Q
    |||||||||||| ||| ||||||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  7471576 ggaataaagtttcgagagaagtaacaaaggatacaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggca 7471477  T
Q  121 attcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaat 220  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||     
T  7471476 agtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtaaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaac 7471377  T
Q  221 attg 224  Q
    ||||    
T  7471376 attg 7471373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 21678752 - 21678955
Alignment:
Q  21 ggaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgaca 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||| ||    
T  21678752 ggaataaagttttgagagaagtaacgaaagaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatctttgtattttacaaagtctttggctcatcggca 21678851  T
Q  121 attcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaat 220  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || |||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||     
T  21678852 gttcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaaataaaaggcaatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaac 21678951  T
Q  221 attg 224  Q
    ||||    
T  21678952 attg 21678955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13290091 - 13289893
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| || |  |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  13290091 ataaagttttgagagatgtagcaaaggaaccaaccgggacattgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgacaaagtctttggctcatcggtaatt 13289992  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatat 222  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13289991 cctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagttaaaggccatcatggagcaacttatggagttcaacaaattccttgatgacttggagaatat 13289893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31159227 - 31159094
Alignment:
Q  91 gtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggag 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||    
T  31159227 gtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggag 31159128  T
Q  191 ttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31159127 ttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattg 31159094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 24749283 - 24749483
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  || |||||||||  |||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  24749283 ataaagttttgagagaagtagcaaaagaaccaaccatggcatcgatgtgggcaaagttgaaatctttgtatatgacaaagtctttggctgatcggcaatt 24749382  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| |||||||| |||    
T  24749383 cctaaagcaataactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacatt 24749482  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  24749483 g 24749483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 219
Target Start/End: Original strand, 20298050 - 20298206
Alignment:
Q  63 catcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtc 162  Q
    |||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20298050 catcgatgtgggcaaagtcggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtc 20298149  T
Q  163 aaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaa 219  Q
    ||| ||| ||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  20298150 aaaggccttcatggagctgcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 20298206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24816949 - 24816768
Alignment:
Q  31 tttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaa 130  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||      ||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  24816949 tttgagagaagtaacgaaggaaccaaccgcgacatcgatgcggtcaaagttggaatttttg------acaaagtctttggctcatctacaattcctaaag 24816856  T
Q  131 caacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggaga 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| | ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  24816855 caacaactctactcattcaagatggtggattcaaaggtcatcatggagcaacttacggagttcaacaaaattcttgatgacttggaga 24816768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4295502 - 4295401
Alignment:
Q  55 aaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatg 154  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4295502 aaccgcggcatcgatgtgggaaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatg 4295403  T
Q  155 gt 156  Q
    ||    
T  4295402 gt 4295401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18391720 - 18391579
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||    
T  18391720 ataaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaatt 18391621  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18391620 ccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaa 18391579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 26213416 - 26213615
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||| ||||||| || |||| ||||||||||| || || ||| ||||||| ||| || || |  ||||||| ||| || | ||||||||||   |||||    
T  26213416 ataaatttttgagagatgtagcgaaggaaccaatcgtggaatcaatgtggtcaaatttggagtcattgtataggaccaaatctttggctcatttgcaatt 26213515  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26213516 cctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggcc-tcatggagaaacttacagagttcaacaaaatctttgatgacttggagaatatt 26213614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6594080 - 6593941
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||    
T  6594080 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattcc 6593981  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6593980 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaa 6593941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47675684 - 47675486
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |  ||||||||||| || | |||||||||| | |||||||    
T  47675684 aaagttttgagggatgtcgcaaaggaacctaccgcggcgtcgatgtggtcaaagtttgagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattcc 47675585  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||  |  | |||||| |  |  ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  47675584 ttaagcaacaactctaatcattcaagatggtggagtcaaagactgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattg 47675486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 48490026 - 48490224
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| || |  |||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||    
T  48490026 aaagtattgagggatgtcgcgaaggaacctactgcggcgtcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatattacaaaatctttggctcataggcaattcc 48490125  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  |  ||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| ||||    
T  48490126 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcatttaacggagttcaacaaaatccttaatgatttggagaacattg 48490224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 224
Target Start/End: Original strand, 6047202 - 6047380
Alignment:
Q  46 gaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactca 145  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| | | ||| || || |  ||||||||||  || | ||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6047202 gaaggaaccaatcgcggcatcaatgcgatcaaatttggagtcgttgtatatgaacaaatctttggctcatacgcaattcctaaagcaacaactctactca 6047301  T
Q  146 ttcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||  || | ||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  6047302 ttcaagatggtggagtcaaagtccatcattcagtaacttacggagttaaacaatatccttgatgacttggagaacattg 6047380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 165
Target Start/End: Original strand, 6570606 - 6570747
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||| |||||||||| || | ||||||||| |  | ||| |||||||||| ||||||  | |  ||||||||||| || | |||||||||| | |||||    
T  6570606 ataaaattttgagggatgtcgcgaaggaacctattgtggcgtcgatgtggtcaaagttgcagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaatt 6570705  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    ||| || |||||||| | |||||||||||| || ||||||||    
T  6570706 ccttaagcaacaactctcctcattcaagattgtggagtcaaa 6570747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 162
Target Start/End: Original strand, 24261897 - 24262003
Alignment:
Q  56 accgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatgg 155  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || |  ||||||||||| || | |||||||||| | ||| || | || |||||||| || |||||||||||||    
T  24261897 accgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 24261996  T
Q  156 tagagtc 162  Q
    | |||||    
T  24261997 tggagtc 24262003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 31159281 - 31159232
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtgg 73  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31159281 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgg 31159232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 162
Target Start/End: Original strand, 5817759 - 5817865
Alignment:
Q  56 accgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatgg 155  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| || |  |||||||||||||| |  ||| ||||| |  || || | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5817759 accgcggcatcgatgtgggctaagttggagtcattgtatatgacaaaatcgttgactcataggaaactcttgaaacaacaactctactcattcaagatgg 5817858  T
Q  156 tagagtc 162  Q
    | |||||    
T  5817859 tggagtc 5817865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7093523 - 7093493
Alignment:
Q  221 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7093523 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 7093493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16884440 - 16884334
Alignment:
Q  56 accgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatgg 155  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || |  ||||||||||| || | |||||||||| | ||| || | || |||||||| || ||||| |||||||    
T  16884440 accgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatgg 16884341  T
Q  156 tagagtc 162  Q
    | |||||    
T  16884340 tggagtc 16884334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 28841109 - 28841309
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28841109 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 28841208  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28841209 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 28841308  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  28841309 g 28841309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 51750724 - 51750924
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  51750724 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 51750823  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51750824 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 51750923  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  51750924 g 51750924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28203291 - 28203091
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  28203291 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaaccaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtataagacaaagtctttgactcatcgacaatt 28203192  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28203191 cctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaagccatcatggagcaactgacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 28203092  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  28203091 g 28203091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 20300818 - 20301018
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20300818 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaacaaaccgtggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgtcaatt 20300917  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20300918 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgaagacttggagaatatt 20301017  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  20301018 g 20301018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 51758221 - 51758421
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||  ||| || |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  51758221 ataaaattttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaaattggaatctttgtatacgacaaagtctttggctcatcgacaatt 51758320  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51758321 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagtaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 51758420  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  51758421 g 51758421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25250875 - 25250681
Alignment:
Q  22 gaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaa 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||    
T  25250875 gaataaagttttgagagaagtagcaaaggaaacaaccgcggtatcgatgtggttaaagttcaaatatttgtatatggcaaagtctttggctcttcggtaa 25250776  T
Q  122 ttcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttgga 216  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||||    
T  25250775 ttcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagaaacttacggagttcaacaaaatcattgatgatttgga 25250681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 16226855 - 16227055
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    |||||||||| || ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16226855 ataaagttttaagagaagtaacaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 16226954  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16226955 cctaaagcaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 16227054  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  16227055 g 16227055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 47178049 - 47178249
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  47178049 ataaagttttaagagaagtagcaaaggaagcaatcgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtcattggctcatcggcaatt 47178148  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  47178149 cctaaaacaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 47178248  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  47178249 g 47178249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 6996271 - 6996471
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  6996271 ataaagttttgagagaagtaacaaaggatccaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagt 6996370  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| |||||||| |||    
T  6996371 cctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaagaccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacatt 6996470  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  6996471 g 6996471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31737068 - 31736873
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||| ||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  31737068 ataaagtttcgagagaagcagcaaaggaacgaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagt 31736969  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaa 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  31736968 cctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 31736873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 50078389 - 50078186
Alignment:
Q  21 ggaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgaca 120  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||    
T  50078389 ggaataaagtttcgagagaagtagcgaaggaaacaactgcggcatcaatgtggtcaaagtttgaatatttgtatatgacaaaatcttgggctcatcggca 50078290  T
Q  121 attcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaat 220  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||     
T  50078289 agtcctaaagcaacaactttactcattcaagattatagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaac 50078190  T
Q  221 attg 224  Q
    ||||    
T  50078189 attg 50078186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8348657 - 8348460
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  8348657 ataaagttttgaaagaagtagcgaagaaaccaaccgtggcgtcgatgtggtcaaagttagagtctttgtatatgacaaagtctttgggacatcgacaatt 8348558  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaata 221  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || | ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  8348557 cctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatgtagcaacttacggagttcaacaaaatctttgatgacttggaaaata 8348460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 224
Target Start/End: Original strand, 16429640 - 16429835
Alignment:
Q  29 gttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaa 128  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||    
T  16429640 gttttgagagaaatagcgaaggaatctaccgcggcgtcgatgtggttaaagttcaagtgtttgtatatgacaaagtctttggctcatcagaaattcctaa 16429739  T
Q  129 aacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||| || ||||||||| ||||||| |||||    
T  16429740 agtaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttgtggagttcaacaaaacccttgatgatttggagattattg 16429835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27338725 - 27338525
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||||  || ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||    
T  27338725 ataaatttttgagagaagtagcaaaggaatgaatcgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttgactcattggcaatt 27338626  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  27338625 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggataatatt 27338526  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  27338525 g 27338525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3805730 - 3805530
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| || |  |||| |||||| || | |||||||||| | |||||    
T  3805730 ataaagttttgagagatatagcgaaggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaacgttagagttgttgtttatgaccaaatctttggctcattggcaatt 3805631  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  3805630 cctaaagcaacaactgtaatcattcaagatggcagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaattcttgatgacttggagaacatt 3805531  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  3805530 g 3805530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13127327 - 13127127
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||| ||||||| || |||| |||| ||| ||||||| |||||||||  | |||||| || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13127327 ataaaattttgagagatgtagcgaagtaactaaccgcgacatcgatgtcttcaaagttggagtctttgtatatgacaaattctttggctcatcgacaatt 13127228  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    | ||||  ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||   ||||||| || | |||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13127227 cttaaagaaacaactatactcattcaatatggcggagtcaaagatcatcatgtagcaacttatggagtttaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 13127128  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  13127127 g 13127127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28997851 - 28997696
Alignment:
Q  20 aggaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgac 119  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  |||||  ||||| || |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |    
T  28997851 aggaataaagtttcgagagaagtagcaaaggatacaaccacgacatcaatgtggtcaaagttcaaatatttgtatatgacaaaatctttgactcatcggc 28997752  T
Q  120 aattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatg 175  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  28997751 aagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatg 28997696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 29003567 - 29003412
Alignment:
Q  20 aggaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgac 119  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  |||||  ||||| || |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |    
T  29003567 aggaataaagtttcgagagaagtagcaaaggatacaaccacgacatcaatgtggtcaaagttcaaatatttgtatatgacaaaatctttgactcatcggc 29003468  T
Q  120 aattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatg 175  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  29003467 aagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatg 29003412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 31657825 - 31657964
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |  ||||||||||| || | ||||||| || |  ||||||    
T  31657825 aaagttttgagggatgtcgtgaaggaaccaaccgcggcgtcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaaatctttggcttataggaaattcc 31657924  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31657925 ttaagcaacaactttactcattcaagatggtggagtcaaa 31657964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 3157284 - 3157423
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |  || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  3157284 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaacctaccgcggcgtcgatgtggtcaaagttggagtcattctatatgaccaagtctttggctcatagacaattcc 3157383  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  3157384 ttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcaaa 3157423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28222968 - 28222829
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |  ||||||||||| || | |||||||||| | |||||||    
T  28222968 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcagcatcgatgtggtcaaagttggtgtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattcc 28222869  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  28222868 ttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcaaa 28222829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 50168896 - 50168699
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||| || | ||||| |||| |||||| || | || ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  50168896 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccacgacgtcgatatggtcaaagttggagtctt-gtatatgaccaagtttttggctcataggcaattcc 50168798  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  |   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  50168797 ttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaatggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattg 50168699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 165
Target Start/End: Original strand, 16456343 - 16456478
Alignment:
Q  30 ttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaa 129  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| ||||| | |||||| | |||||| || |  ||||||||||| |||  |||||||||| | ||| |||||||    
T  16456343 ttttgagggatgtcgcgaaggaaccaactgcggcgttgatgtgatcaaagttggagtcattgtatatgaccaagactttggctcataggcaaatcctaaa 16456442  T
Q  130 acaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16456443 gcaacaactctactcattcaagatgatagagtcaaa 16456478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31424544 - 31424426
Alignment:
Q  106 tttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatcctt 205  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||| |||||| |||| |||| ||    
T  31424544 tttggctcatcaacaatttctaaagcaacatatttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggatctacttgtggagttcaacaaaatcatt 31424445  T
Q  206 gatgacttggagaatattg 224  Q
    | ||| |||||||| ||||    
T  31424444 ggtgatttggagaacattg 31424426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 162
Target Start/End: Original strand, 17346160 - 17346194
Alignment:
Q  128 aaacaacaactttactcattcaagatggtagagtc 162  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17346160 aaacaacaactctactcattcaagatggtagagtc 17346194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 10750385 - 10750585
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10750385 ataaagttttgagagaagtaggaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 10750484  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10750485 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 10750584  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  10750585 g 10750585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34479011 - 34478811
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34479011 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaatt 34478912  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  34478911 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggaaaatatt 34478812  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  34478811 g 34478811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15356441 - 15356241
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15356441 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 15356342  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15356341 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 15356242  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  15356241 g 15356241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 20043672 - 20043871
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    |||||| |||||| || |||| ||||||||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20043672 ataaagatttgagagatgtagcgaaggaaccaact-cagcatcgatgtagtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 20043770  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20043771 cctaaagcaacaactttactcattcaagatggcagagtcaaaggccatcatggagcaacttgtggagttcaaaacaatccttgatgacttggagaacatt 20043870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 23665733 - 23665933
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23665733 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 23665832  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23665833 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 23665932  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  23665933 g 23665933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 658705 - 658905
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  658705 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagt 658804  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    ||||  ||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  658805 cctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatggacctacttgtagagttcaacaaaatcattggtgatttggagaatatt 658904  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  658905 g 658905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 6745755 - 6745955
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6745755 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaacgaaccgcggcatcaatgtgggcaaagttgtaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 6745854  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6745855 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 6745954  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  6745955 g 6745955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 31543420 - 31543620
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31543420 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttagaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 31543519  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31543520 cctaaagcaacgactctactcattcaagatggaagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 31543619  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  31543620 g 31543620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 18467371 - 18467571
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18467371 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaacgaaccgcgacatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 18467470  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |  || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18467471 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaatttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 18467570  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  18467571 g 18467571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 27911119 - 27911314
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  27911119 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaatcaactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagt 27911218  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaa 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  27911219 cctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 27911314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 29720996 - 29721194
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  29720996 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattcc 29721095  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  29721096 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattg 29721194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9788768 - 9788570
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  9788768 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattcc 9788669  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  9788668 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattg 9788570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 25806148 - 25806343
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||| ||| |||| ||  | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  || |    
T  25806148 ataaagtttcgagagaagcagcaatggaaacaaccgcagcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatattacaaagtctttggctcattggaaagt 25806247  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaa 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  25806248 cctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 25806343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 219
Target Start/End: Original strand, 26171388 - 26171581
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  26171388 aaagttttaagggatgtcgcgaaggaaccaaccgtggcatcgatatggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattcc 26171487  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaa 219  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  | |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  26171488 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaa 26171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Original strand, 16407957 - 16408154
Alignment:
Q  27 aagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcct 126  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| || | |||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||    
T  16407957 aagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggaatcgatatgatcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattcct 16408056  T
Q  127 aaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
     || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  || | |||||| |  | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  16408057 taagcaacaactctactcattcaagatggtggagtaaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattg 16408154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18510959 - 18510811
Alignment:
Q  71 tggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgcca 170  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  18510959 tggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggcttatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggcta 18510860  T
Q  171 tcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaa 219  Q
    ||||||||   |||| | |||| |||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  18510859 tcatggagctacttgtgcagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 18510811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 40380737 - 40380876
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  40380737 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattcc 40380836  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40380837 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaa 40380876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 16545058 - 16545200
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgac---aaagtatttggctcatcgacaat 122  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||  |||||||||||    ||||  ||||||||| | ||||    
T  16545058 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaacaagtcgttggctcataggcaat 16545157  T
Q  123 tcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16545158 tccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaa 16545200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 534380 - 534578
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||| || ||||| | |||||||| |||||| || |  ||||||||||| |||| ||||| | || | |||||||    
T  534380 aaagttttgagggatgtcccgaaggaacctacggcggcgttgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaagtctttggttgataggcaattcc 534479  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  |  ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  534480 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatacttgatgatttggagaacattg 534578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13694668 - 13694498
Alignment:
Q  46 gaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactca 145  Q
    ||||||||| ||||||  || |||||||| ||| || || |  ||||||||||| || | ||||||||||   ||||||||| | |||||||| |||| |    
T  13694668 gaaggaacctaccgcgatattgatgtggtcaaatttggagtcgttgtatatgaccaaatctttggctcatatgcaattcctatatcaacaactctactta 13694569  T
Q  146 ttcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttgga 216  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  13694568 tttaagatggtggagtcaaatgtcatcatggagcaactaacggagttcaacaaaatccttgatgagttgga 13694498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 42427978 - 42427839
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| |    |||||||| ||||||  | |  ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  42427978 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaacctaccgcagaggtgatgtggtcaaagttgtagtcattgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattcc 42427879  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  42427878 ttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcaaa 42427839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 33790828 - 33790722
Alignment:
Q  56 accgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatgg 155  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || |  ||||||||||| || | |||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  33790828 accgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcatagacaactcttgaagcaacaactctactcattcaagatgg 33790729  T
Q  156 tagagtc 162  Q
    | |||||    
T  33790728 tggagtc 33790722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20505265 - 20505235
Alignment:
Q  221 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505265 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 20505235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20505665 - 20505599
Alignment:
Q  157 agagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20505665 agagtcaaaggacattatggagcaacttacggagtttaacaaaatccttaatgacttggagaatatt 20505599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27449335 - 27449229
Alignment:
Q  56 accgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatgg 155  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| || |  |||||||||||||| | ||| |||||| | ||| || | || |||||||| || |||||||||||||    
T  27449335 accgcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacaaaatctttagctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 27449236  T
Q  156 tagagtc 162  Q
    | |||||    
T  27449235 tggagtc 27449229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 456573 - 456773
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  456573 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 456672  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  456673 cctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 456772  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  456773 g 456773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6065385 - 6065185
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  6065385 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatacgacaaagtctttggctcatcggcaatt 6065286  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6065285 cctaaagcaacaactctactcattcaagatcgtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 6065186  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  6065185 g 6065185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10957915 - 10957715
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10957915 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaaccaaccgtggcatcgatttgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 10957816  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10957815 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacgaagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 10957716  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  10957715 g 10957715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 43226743 - 43226943
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43226743 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaacgaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 43226842  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43226843 cctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacgaagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 43226942  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  43226943 g 43226943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18098763 - 18098563
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  18098763 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaaccaaccgcggcatcaatgtgggcaaagatggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaatt 18098664  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18098663 cctaaagcaacaactctacttattcaggatggttgagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 18098564  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  18098563 g 18098563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4310102 - 4309902
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| || |||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4310102 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaacgaaccgcggcatcaatatgggcaaagttgaaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 4310003  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4310002 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 4309903  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  4309902 g 4309902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 5192316 - 5192516
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||| ||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  5192316 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaactgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcagcaatt 5192415  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5192416 cctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcattgagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 5192515  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  5192516 g 5192516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 11168767 - 11168967
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    |||||||||||||  ||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11168767 ataaagttttgagataagtagcagaggaagcaaccgcagcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 11168866  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11168867 cctaaagcaactactctactcattctggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 11168966  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  11168967 g 11168967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 3315348 - 3315548
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3315348 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaaccaaccgcgacatcgatgtgtgcaaagttggaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 3315447  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| || ||||| |||    
T  3315448 cctaaagcaacaactttattcattcaagatggtagagtcaaaggccatcacggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttagagaacatt 3315547  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  3315548 g 3315548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 27421304 - 27421504
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || |  ||||   ||||||| | |||||||||||| |||||    
T  27421304 ataaagttttgagagatgtaacgaaggaaccaaccgcgacattgatgtggtcaaagttggagtcgttgttattgacaaaatctttggctcatcggcaatt 27421403  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27421404 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggtcatcatggagcaacttacggagttcaacaagatccttgatgacttggagaatatt 27421503  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  27421504 g 27421504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 23634112 - 23634311
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23634112 ataaagttttgagagaagtagcgaaggaaccaac-gcatcatcgatgaggtcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 23634210  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
     ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  ||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23634211 tctaaagcaacaactctagtcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaatttatagagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 23634310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 5898075 - 5898275
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5898075 ataaagttttgatagaagtagcaaaggaacgaaccgcgacatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 5898174  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    | |||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5898175 cttaaagcaacaactctactcatttaagatggtggagtcgaagaccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 5898274  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  5898275 g 5898275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 53917243 - 53917071
Alignment:
Q  47 aaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcat 146  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  53917243 aaggaaacaactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcat 53917144  T
Q  147 tcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaa 219  Q
    | ||||||||| |||||||  |||||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  53917143 ttaagatggtaaagtcaaagaccatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 53917071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28101603 - 28101400
Alignment:
Q  21 ggaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgaca 120  Q
    |||||||||||| ||  |||||||  || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  28101603 ggaataaagtttcgatagaagtagcaaaagaaccaaccgcgacatcaatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggta 28101504  T
Q  121 attcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaat 220  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||   |||  |||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||     
T  28101503 attcctaaagtaacaactctactcattcaagatggtaaagttaaaggccatcatggagctacttatggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaac 28101404  T
Q  221 attg 224  Q
    ||||    
T  28101403 attg 28101400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 224
Target Start/End: Original strand, 7769244 - 7769421
Alignment:
Q  47 aaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcat 146  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  7769244 aaggaaccaattgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagaaacaactctactcat 7769343  T
Q  147 tcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||| | ||| |||||||  | | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7769344 tcaagatggtggagtcaaaggctatcatggagcaacttacggagttctaaaaaatccttgatgacgtggagaatattg 7769421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 42990965 - 42991160
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  42990965 ataaagttttgagaaaagtagcaaaggaacgaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttatatatgacaaagtctttggctcatcggcaagt 42991064  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaa 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  42991065 cctaaagcaacaactttactcattcaatatggtaaagtcaaaggccttcttggagctgcttgtggagttcaacaaaatcattgctgatttggagaa 42991160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23199685 - 23199487
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  23199685 aaagttttgagggatgttgcgaaggaaccaaccgcgacatcgatatggtcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattcc 23199586  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||| |  | |||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  23199585 ttaagcaacaactctaatcattcaagatggtggagtcaaagaccatgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttagagaacattg 23199487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5259869 - 5259671
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |  ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  5259869 aaagttttaagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatctatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattcc 5259770  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  | || ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  5259769 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccttgatggagcaattggcagagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattg 5259671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 216
Target Start/End: Original strand, 37407310 - 37407500
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |  ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  37407310 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcaatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattcc 37407409  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttgga 216  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  || | |||||| |  | |||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  37407410 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagttaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttgga 37407500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 10209820 - 10210020
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||    
T  10209820 ataaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcattgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaatt 10209919  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  | |||||||| ||||  |||||||| || |||||||| |||    
T  10209920 ccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatccttgacgatttggagaacatt 10210019  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  10210020 g 10210020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 6717132 - 6717332
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||    
T  6717132 ataaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacattt 6717231  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    ||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | || ||| |  | |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||    
T  6717232 ccttaagcgacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatagagcaattggcggagttcaacaagatccttgatgatttggagaacatt 6717331  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  6717332 g 6717332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4600266 - 4600127
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||    
T  4600266 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattcc 4600167  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4600166 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaa 4600127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43423063 - 43422908
Alignment:
Q  21 ggaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgaca 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||   |||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  43423063 ggaataaagttttgagagaagtagcaaaggttacaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggca 43422964  T
Q  121 attcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggag 178  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||||   ||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  43422963 agtcccaaatcaacaactttactcatt--ggattgtaaagtcaaaggccatcatggag 43422908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 10056866 - 10057005
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||    
T  10056866 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattcc 10056965  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10056966 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaa 10057005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 10061310 - 10061449
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||    
T  10061310 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattcc 10061409  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10061410 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaa 10061449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 10063532 - 10063671
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||    
T  10063532 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattcc 10063631  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10063632 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaa 10063671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 10065754 - 10065893
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||    
T  10065754 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattcc 10065853  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10065854 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaa 10065893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1620066 - 1619882
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||  || |||| ||||| || ||| |||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||    
T  1620066 ataaagttttgatagatgtagcgaaggtacaaactgcggcatcgatgtggtcaaagttggagtctttgcatatgacaaagtctttggctcattggtaatt 1619967  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatg 209  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| | ||   ||||  ||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  1619966 cctaaagcaacaactctactcattcaagat-gaagcaacaaaatccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatg 1619882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22834557 - 22834420
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |  ||||||||||  |||| |||||||||| | |||||    
T  22834557 ataaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcgtcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgatcaagtctttggctcataggcaatt 22834458  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagt 161  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  22834457 ccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagt 22834420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Original strand, 25634542 - 25634697
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaac--cgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaa 121  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||   || |||||||| ||||| |||||| || | ||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||    
T  25634542 ataaagttttgagagaagtagcgaaggaactaaaatcgtggcatcga-gtggtcaaagttagagtctttatatatgacaaagtctttgactcatcagcaa 25634640  T
Q  122 ttcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggag 178  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25634641 ttcctaaagccacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatggag 25634697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9635670 - 9635472
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  9635670 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatctacgtggtcaaagttggagccgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattcc 9635571  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||| | |||||||||||||||||  | |||||  || | |||||| |  | ||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  9635570 ttaagcaacaaatctactcattcaagatggtgcattcaaagaccgtgatggagcaattggcgtagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattg 9635472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 156
Target Start/End: Original strand, 10059088 - 10059218
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||    
T  10059088 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaactgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattcc 10059187  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggt 156  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||||    
T  10059188 ttaagcaacaactctactcattcaagatggt 10059218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 29811490 - 29811688
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||| ||||| || || ||||||| |||||| || |  |||||||| || | || ||||||||||   |||||||    
T  29811490 aaagttttgagggatgtcgctaaggaacctaccgcagcgtccatgtggtcaaagttggagtcattgtatataaccaggtctttggctcataagcaattcc 29811589  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |  |  ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  29811590 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattg 29811688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 7762892 - 7763090
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||| ||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || |  || |||||||| |||| ||||||||||   ||||||     
T  7762892 aaagttttaagggatgtcgcgaaggaactaaccgcggaatcgatgtggtcaaagttggagtcattatatatgaccaagtctttggctcataagcaattct 7762991  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||  || | |||||| |  |  ||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  7762992 ttaagcaacaactctattcatttaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgattttgagaacattg 7763090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15830768 - 15830649
Alignment:
Q  46 gaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactca 145  Q
    ||||||||| ||| || |||||| ||||| |||||| || |  ||||||||||| |||| | ||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15830768 gaaggaacctaccacgacatcgaggtggtcaaagttggagttattgtatatgactaagtctatggttcataggcaattcctaaagcaagaactttactca 15830669  T
Q  146 ttcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  15830668 tttaagatggtggagtcaaa 15830649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Original strand, 53597892 - 53598011
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| || ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  | | ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||    
T  53597892 ataaagttttgagagatgtagataaggaatcaaccgcggcatcgatgtggtcaaaattgaagtctttgtatatgacaaagtctttacctcatcggcaatt 53597991  T
Q  124 cctaaaacaacaactttact 143  Q
     ||||| ||| |||| ||||    
T  53597992 tctaaagcaagaactctact 53598011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23409878 - 23409742
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| || || |  ||||||||||| || | |||||||||| | ||| |||    
T  23409878 aaagttttgagggatgtcgcgaaggaacctaccgcggcgtcgatatggtcaaattttgagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaactcc 23409779  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtc 162  Q
    | || |||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  23409778 ttaagcaacaactctacttatttaagatggtggagtc 23409742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 32891752 - 32891850
Alignment:
Q  67 gatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    |||||||| |||||| || |  ||||||||||| || | |||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||    
T  32891752 gatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcatttaaggtggtggagtcaaa 32891850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 165
Target Start/End: Original strand, 24933178 - 24933212
Alignment:
Q  131 caacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24933178 caacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaa 24933212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 22813 - 23013
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22813 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 22912  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22913 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 23012  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  23013 g 23013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35217562 - 35217362
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35217562 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttatatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 35217463  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  35217462 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 35217363  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  35217362 g 35217362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36560733 - 36560533
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36560733 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 36560634  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36560633 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatatt 36560534  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  36560533 g 36560533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21520286 - 21520087
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21520286 ataaatttttgagagaagtagcaaaggaaccaaccgcagcatcgatgtggccaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 21520187  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21520186 cctaaagcaacaactctactcatttaggatggtggagttaaatgccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 21520087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19503928 - 19503728
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  19503928 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcaatt 19503829  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||  ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19503828 cctaaagcaatgactctactcattcaggatgatagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 19503729  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  19503728 g 19503728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22405522 - 22405323
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||    
T  22405522 ataaagttttgagagaagtagcgaaggaaccaaccgcgacatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggcttatcagcaatt 22405423  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22405422 cctaaagcaacgattctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttagagaatatt 22405323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6263749 - 6263592
Alignment:
Q  21 ggaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgaca 120  Q
    |||||||||||| ||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6263749 ggaataaagtttcgagagaagcaacgaaggaaacaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttcagatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggca 6263650  T
Q  121 attcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggag 178  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6263649 agtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggag 6263592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28569998 - 28569834
Alignment:
Q  43 agtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttac 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||||| || |  | ||||||||| || | ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  28569998 agtgaaggaaccaaccgcggaatcgatatgatcaaagttggagtcgtggtatatgaccaaatctttagctcatcgacagatcctaaaacaaaaactttac 28569899  T
Q  143 tcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  28569898 tcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggatcaacttacggagttcaacaaaatccttga 28569834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 34574727 - 34574620
Alignment:
Q  47 aaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||  |||||||| |||||||    
T  34574727 aaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaaagcctttggctcataggcaattccaaatgcaacaactctactcat 34574628  T
Q  147 tcaagatg 154  Q
    | ||||||    
T  34574627 ttaagatg 34574620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19348790 - 19348684
Alignment:
Q  56 accgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatgg 155  Q
    |||||| |||||||||||  |||||| || |  ||||||||||| || | |||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  19348790 accgcgacatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcatagacaactcttgaagcaacaactctactcattcaagatgg 19348691  T
Q  156 tagagtc 162  Q
    | |||||    
T  19348690 tggagtc 19348684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42019368 - 42019238
Alignment:
Q  94 tatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttg 193  Q
    |||||| |||| ||||||| || | |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||| | |||| ||||| | ||  |  ||||     
T  42019368 tatgaccaagtctttggcttataggcaattcctaaaacaccaactttatacatttaagatggtggagtcaaaggtcatcgtggagtaactaacaaagttc 42019269  T
Q  194 aacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  42019268 aacaaaatccatgatgacttggagaacattg 42019238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19503398 - 19503368
Alignment:
Q  221 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19503398 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 19503368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21519756 - 21519726
Alignment:
Q  221 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21519756 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 21519726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25403163 - 25403057
Alignment:
Q  56 accgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatgg 155  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| || |  ||||| ||||| || | |||||||||| | ||| || | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  25403163 accgcggcatcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatgg 25403064  T
Q  156 tagagtc 162  Q
    | |||||    
T  25403063 tggagtc 25403057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 311 - 511
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  311 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgtggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagcctttggctcatcggcaatt 410  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  411 cctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 510  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  511 g 511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 34237 - 34437
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  34237 ataaagttttaagagaagtagcaaaggaaacaacaacggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatt 34336  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | ||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34337 cctaaagcaacaactccactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaactcacggagttaaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 34436  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  34437 g 34437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 251
Target Start/End: Original strand, 34775 - 34805
Alignment:
Q  221 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34775 attgtctctgagggttatgaggatgcaggtg 34805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Original strand, 80550 - 80748
Alignment:
Q  21 ggaataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgaca 120  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |    
T  80550 ggaataaagtttagagagaagtagcaaaggaaacaaccgcgccatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaacggaa 80649  T
Q  121 attcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaa 219  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  80650 agtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 80748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 73109 - 72909
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||    
T  73109 ataaagttttgagagaagtagcaaaggaacgaactgcggcatctatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaatt 73010  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatatt 223  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  73009 cctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacagagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatatt 72910  T
Q  224 g 224  Q
    |    
T  72909 g 72909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 50705 - 50900
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||  || ||  | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  50705 ataaagttttgagagaagtagcaaaagatactaccgcggcatcgatgtggtcaaagatcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagt 50804  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaa 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  50805 cctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 50900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1044 - 849
Alignment:
Q  24 ataaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaatt 123  Q
    ||||||||| ||| |||| ||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  || |    
T  1044 ataaagtttcgagagaagcagcaaaggaaacaaccgcgtcatcgatgtggtcaaattttgaatttttgtatatgacaaagtctttggcttatcggaaagt 945  T
Q  124 cctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaa 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |   |||| |||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  944 cctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggtgctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 115224 - 115422
Alignment:
Q  26 aaagttttgagggaagtagtgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcc 125  Q
    ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | |  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  115224 aaagttttgagcgatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgacgtggtcaaagttgtagtcattgtatatgaccaagtctttggctcatagacaattcc 115323  T
Q  126 taaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaatgccatcatggagaaccttgcggagttgaacacaatccttgatgacttggagaatattg 224  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || | |||||| |  |  | ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  115324 ttaagcaacaactctactcattcaagatggtggattcaaagaccgtgatggagcaattgacagagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattg 115422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 162
Target Start/End: Original strand, 14883 - 14989
Alignment:
Q  56 accgcggcatcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatgg 155  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || |  ||||||||||| || | |||||||||| | ||| || | || |||||||| || |||||||||||||    
T  14883 accgcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgg 14982  T
Q  156 tagagtc 162  Q
    | |||||    
T  14983 tggagtc 14989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26900 - 26824
Alignment:
Q  89 ttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaa 165  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  26900 ttgtatgtgacaaattctttggctcatacacaattcctaaaactacatctctactcgtttaagatggtggagtcaaa 26824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 162
Target Start/End: Original strand, 458 - 557
Alignment:
Q  63 catcgatgtggtgaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtc 162  Q
    |||||||||||  |||||| || |  ||||||||||| || | |||||||||| | ||| || | || ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  458 catcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactttattcattcaagatggtggagtc 557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1991 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1991
Description:

Target: scaffold1991; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 162
Target Start/End: Original strand, 1028 - 1101
Alignment:
Q  89 ttgtatatgacaaagtatttggctcatcgacaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtc 162  Q
    ||||||||||| || | |||||||||| | ||| || | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  1028 ttgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtggagtc 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University