View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8379_high_5 (Length: 595)

Name: NF8379_high_5
Description: NF8379
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8379_high_5
NF8379_high_5
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (18-583)||(12258560-12259129)
chr2 (20-583)||(12245385-12245952)
chr2 (42-583)||(7541870-7542415)
chr2 (20-583)||(11999030-11999583)
chr2 (18-583)||(14703028-14703597)
chr2 (89-578)||(12234380-12234873)
chr2 (119-583)||(16657496-16657964)
chr2 (52-583)||(43625066-43625601)
chr2 (39-583)||(16661971-16662519)
chr2 (433-534)||(17717979-17718080)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (18-583)||(35132076-35132637)
chr4 (83-341)||(30774937-30775195)
chr4 (400-583)||(30775258-30775441)
chr4 (445-581)||(9335872-9336008)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (20-583)||(27830854-27831421)
chr7 (42-314)||(17267583-17267855)
chr7 (47-583)||(6789161-6789701)
chr7 (42-311)||(17259885-17260154)
chr7 (49-583)||(8585685-8586223)
chr7 (47-345)||(8616330-8616628)
chr7 (39-240)||(8581341-8581542)
chr7 (38-219)||(8545273-8545454)
chr7 (49-240)||(8569962-8570153)
chr7 (38-581)||(3146904-3147451)
chr7 (39-288)||(8575967-8576216)
chr7 (49-219)||(29582188-29582358)
chr7 (52-233)||(7878066-7878247)
chr7 (468-583)||(8646951-8647066)
chr7 (217-583)||(8659182-8659552)
chr7 (49-218)||(8590289-8590458)
chr7 (448-583)||(1301514-1301649)
chr7 (116-583)||(8654168-8654639)
chr7 (432-581)||(8559371-8559520)
chr7 (471-583)||(8628609-8628721)
chr7 (469-583)||(17268014-17268128)
chr7 (137-242)||(8383200-8383305)
chr7 (75-204)||(8636705-8636834)
chr7 (467-583)||(8602047-8602163)
chr7 (47-195)||(8609566-8609714)
chr7 (468-583)||(17260315-17260430)
chr7 (39-581)||(10494355-10494901)
chr7 (146-298)||(1301208-1301360)
chr7 (41-335)||(8646520-8646814)
chr7 (20-106)||(27846566-27846652)
chr7 (433-583)||(29577651-29577801)
chr7 (146-242)||(8601722-8601818)
chr7 (445-581)||(8667470-8667606)
chr7 (47-219)||(29578019-29578191)
chr7 (433-583)||(8545672-8545822)
chr7 (467-581)||(13333437-13333551)
chr7 (442-583)||(8382855-8382996)
chr7 (145-246)||(8537783-8537884)
chr7 (398-583)||(8538040-8538225)
chr7 (427-536)||(8636369-8636478)
chr7 (52-108)||(39985300-39985356)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (39-583)||(15594675-15595223)
chr1 (47-583)||(34466772-34467307)
chr1 (52-292)||(4678831-4679071)
chr1 (18-114)||(52549398-52549494)
chr1 (448-583)||(4678537-4678672)
chr1 (225-314)||(52549264-52549353)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (39-545)||(28219559-28220069)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (39-583)||(12528145-12528693)
chr8 (39-514)||(43744457-43744936)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (467-577)||(28910655-28910765)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 533; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 12259129 - 12258560
Alignment:
Q  18 actttggaacattctggatatcttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactcttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12259129 actttggaacattctggatatcttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactcttt 12259030  T
Q  118 ccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12259029 ccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagca 12258930  T
Q  218 tcggtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgc 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12258929 tccgtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccaaatttatttcctcaaacttggcacgattgattgatgcagaaaaatcaatgc 12258830  T
Q  318 catcacataaagaatctatctcaatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctca----ctgttttcaatctcctcaaagctcttgg 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12258829 catcacataaagaatctatctcaatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctcacaagctgttttcaatctcctcaaagctcttgg 12258730  T
Q  414 atttccacttatatctactttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttcca 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12258729 atttccacttatatctactttgttctttctcttgaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgcgtgtttcca 12258630  T
Q  514 gctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12258629 gctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 12258560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 12245952 - 12245385
Alignment:
Q  20 tttggaacattctggatatcttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttcc 119  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  12245952 tttggaacattcttaacatctttactcaacaaagcagcttgaacagctgccccataagcaacagcctcgtcagggttaatgctcttgcacaattccttcc 12245853  T
Q  120 ccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatc 219  Q
    | |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| | ||||||||||| | || |||||    
T  12245852 cgttgaaaaagtcctgtaatagctgttggactttgggaatcctagaagatccaccaacaagtacaaaatcatctatagtactcttgtccatctttgcatc 12245753  T
Q  220 ggtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgcca 319  Q
      ||| |||||||||||||||||| || || ||||| | ||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| || | |||||||||||||||     
T  12245752 cataatacaactctcaacagtctttatacaatcattaagaagatctaaattcaattcctcaaactttgcccgattgatggatgaagaaaaatcaatgcct 12245653  T
Q  320 tcacataaagaatctatctcaatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctcact----gttttcaatctcctcaaagctcttggat 415  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||||     ||| ||||||||||||| ||| ||| |     
T  12245652 tgaaataaagaatctacctcaatagttgcaacaacaagaaacgaaagtattctttttgccctctcacaagcagttctcaatctcctcaaggcttttgaac 12245553  T
Q  416 ttccacttatatctactttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagc 515  Q
    || |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| | | |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12245552 ttgcactaatatccaatttgttctttctcttgaactcctgtgcaaagtagtttaccattctattatcaaaatcctctcctccaaggtgagtgtttccagc 12245453  T
Q  516 tgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
     || ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||||||||    
T  12245452 agtggccttaacttggaagatgttatccttaatagttaggatagaaacgtcaaaagtgccaccaccaa 12245385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 42 - 583
Target Start/End: Original strand, 7541870 - 7542415
Alignment:
Q  42 cacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatag 141  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||| ||||||    
T  7541870 cactcaacaatgcagcctgaacagctgccccataagcaacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaagtcctttccattgaaaaagtcctttaatag 7541969  T
Q  142 ctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagtc 241  Q
    ||| || ||| || ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||   | ||||||||| | ||||||||  ||||||| ||  ||||| ||    
T  7541970 ctgatgtactatgggaatcctcgaagacccgccgacaaggacaacatcatctatcatgctcttgtccatattagcatcaataagacagcttccaacaatc 7542069  T
Q  242 ttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatctcaa 341  Q
     |||| || || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||||| || | |||||| |||||||| | | |||||||||||| |||||    
T  7542070 gtcatacactcgttaaaaagatccatattcatctcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaagaatctacctcaa 7542169  T
Q  342 tagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctcact----gttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctactttgtt 437  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||     ||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||||||    
T  7542170 tagtggcaacaacaaggaaagaaagtgatctttttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttggattcccactaatgtccactttgtt 7542269  T
Q  438 ctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagaca 537  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||       
T  7542270 ctttctcttgaactcttgtacaaagtagttcgccattctattatcaaagtcttctccaccaaggtgagtgttgccagcagtggccttaacttggaagttg 7542369  T
Q  538 ttatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7542370 ttgcccttaatcgttagtaaagacacatcaaaagtgccaccgccaa 7542415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 583
Target Start/End: Original strand, 11999030 - 11999583
Alignment:
Q  20 tttggaacattctggatatcttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttcc 119  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11999030 tttggaacattcttaacatcttcactcaacaaagcagcttgaacagctgccccataagctacagcctcatcagggttaatgctcttgcacaactccttcc 11999129  T
Q  120 ccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatc 219  Q
    | |||||||| || ||||||||||| || |||||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| | || |||||    
T  11999130 cgttgaaaaagtcatgtaatagctgttggactttggga-tcctagaagatccaccaacaagtacaacatcatctatagtactcttgtccatctttgcatc 11999228  T
Q  220 ggtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgcca 319  Q
      ||| |||||||||||||||||| || || ||||| | ||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| || | |||||||||||||||     
T  11999229 cataatacaactctcaacagtctttatacaatcattaagaagatctaaattcaattcctcaaactttgcccgattgatggatgaagaaaaatcaatgcct 11999328  T
Q  320 tcacataaagaatctatctcaatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctca----ctgttttcaatctcctcaaagctcttggat 415  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||  ||||||||| ||||||    | ||| |||| |||||||| ||| ||| |     
T  11999329 tgaaataaagaatctacctcaatagttgcaacaacaagaaatgatagtattctttttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttgaac 11999428  T
Q  416 ttccacttatatctactttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagc 515  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||||             |||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  11999429 ttccactaatatccacttcgttctttatcttgaactcttgtacaaag-------------tattatcaaaatcctctcctccgaagtgagtgtttccagc 11999515  T
Q  516 tgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11999516 tgtggccttaacttggaagacattgtccttaattgttagtatagacaaatcaaaagtgccaccgccaa 11999583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 583
Target Start/End: Original strand, 14703028 - 14703597
Alignment:
Q  18 actttggaacattctggatatcttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactcttt 117  Q
    |||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  14703028 acttcggaacattcttgacgtcttcactcaacaaagcagcctgaacagctgccccataagctacagcttcatcagggttaatgctgttgcacaactcctt 14703127  T
Q  118 ccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagca 217  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  14703128 cccctggaaaaagtcctgtaataattgctgtactttgggaatccgagaagacccaccgacaagaacaacatcatctactctactcttgtccatcttagca 14703227  T
Q  218 tcggtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgc 317  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| || | |||||| |||||||    
T  14703228 tcaataagacaactctcaacaatcttcacacactcattaaaaaagtccatattcatttcttcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaagtcaatgc 14703327  T
Q  318 catcacataaagaatctatctcaatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctc----actgttttcaatctcctcaaagctcttgg 413  Q
      | | |||||| ||||| ||||||||| || |||||  |  ||||||||| ||||||||| |||||     | ||| |||| ||||| || ||| ||||    
T  14703328 attgaaataaagcatctacctcaatagtggcgacaacttggaaagaaagtgttctttttgccctctcgcaagcggttctcaagctccttaaggcttttgg 14703427  T
Q  414 atttccacttatatctactttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttcca 513  Q
    ||||||||| || || | | |||| |||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  14703428 atttccactaatgtccaatctgttttttctcttgaactcttgaacaaagtagttcaccattctgttatcgaagtcctctcccccgaggtgagtgtttcca 14703527  T
Q  514 gctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    || |||||||||| ||| |||||  |  ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14703528 gcagtagccttaatttggaagacggtgcccttaattgttaggagagacacgtcaaaagtaccaccaccaa 14703597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 89 - 578
Target Start/End: Original strand, 12234380 - 12234873
Alignment:
Q  89 tcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacat 188  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| |    
T  12234380 tcagggttaatactcttgcacagctccttccccttgaaaaaatcctgcaatagttgctgcactttgggaatcctagaggacccgccaataaggacaactt 12234479  T
Q  189 catctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggc 288  Q
    |||| ||  |||| |||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||| | | ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12234480 catccaccctacttttgtccatcttagcatcactaagacaactctcaacaatcttcatacactcaataagaagatccatattcatttcctcaaacttggc 12234579  T
Q  289 acgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatctcaatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctca--- 385  Q
     | |||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||||||       
T  12234580 cctattgatcgatgaagaaaaatcaatgccttcaaataaagaatctacctcaatggttgcaacaacaaggaaagacaatgatctttttgccctctcacaa 12234679  T
Q  386 -ctgttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctactttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaa 484  Q
     | ||| | || |||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||   ||| |||  | |||||||| |||||||    
T  12234680 gcagttcttaacctcctcaaggcttttggatttccactcatgtccacttttttctttctattgaactcttgagcaaggtagtttaccattctgttatcaa 12234779  T
Q  485 agtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccacc 578  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| | || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12234780 agtcctctcccccgaggtgagtgtttccggctgtggctttaacttggaagacattacctttgattgttaggagagacacatcaaaagtgccacc 12234873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 16657964 - 16657496
Alignment:
Q  119 cccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcat 218  Q
    ||||||||||| || || ||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | || ||   ||| | | || | ||    
T  16657964 cccttgaaaaagtcttgcaatagatcctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaat 16657865  T
Q  219 cggtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgcc 318  Q
    |   ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||| ||    
T  16657864 cacgaagacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattcc 16657765  T
Q  319 atcacataaagaatctatctcaatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctca----ctgttttcaatctcctcaaagctcttgga 414  Q
     | | |||||||||||| ||||| ||| |  |||| |  | |||| ||||  || ||||| ||||||    | ||| |||| |||||||| |||||||      
T  16657764 ctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttgag 16657665  T
Q  415 tttccacttatatctactttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccag 514  Q
    || |||||||| || || || |||||  | |  ||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |    
T  16657664 ttcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccgg 16657565  T
Q  515 ctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    | || || || || | ||| |||| | ||||||| || || | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16657564 cagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaa 16657496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 583
Target Start/End: Original strand, 43625066 - 43625601
Alignment:
Q  52 agcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcact 151  Q
    ||||||||| | ||| || ||| |||| |||||||||||||| || ||||| | |||  | || |||||||||||||| ||||| || ||||| |  |||    
T  43625066 agcagcctggacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggtttatgctttcgcatgattccttccccttgaaaaactcctgcaacagctgttttact 43625165  T
Q  152 ttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagtcttcatgcatt 251  Q
    ||  |||| ||||| || || || |||||||||||||| |  | |  ||||||||||   || |||||  |||||||||||| |||||| ||||  || |    
T  43625166 tttggaattctagaggagccgccaacaaggacaacatcgtggatagcactcttgtccaacttggcatcaataagacaactcttaacagttttcaaacact 43625265  T
Q  252 cattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatctcaatagttgcaac 351  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| | | | || ||||| |||    |||||||||||| ||||||||| ||       
T  43625266 cgttgaaaagatccatatttatttcatcaaatttggcacgagtgattgatgaaaagaagtcaataccacggaataaagaatctacctcaatagt-gctga 43625364  T
Q  352 aacaag-ataagaaagtgatctttttgcactctcact----gttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctactttgttctttctctt 446  Q
    |  ||| | |||| ||||  |||||| | ||||| |     ||| |||| || || |  |||||||  |||||| | ||||| || ||||||||  |||     
T  43625365 acgaagcaaaagacagtgtcctttttcctctctcgcatgccgttctcaaccttcttatggctcttgagtttccaataatatccacattgttcttcttctc 43625464  T
Q  447 taactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatcctta 546  Q
     || |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || |||||  | ||||| || ||||||    
T  43625465 aaattcttctgcaaagtagttcaccattctatcatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggctttaacacggaagaccttgtcctta 43625564  T
Q  547 atggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    || || |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43625565 attgtaagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaa 43625601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 16662519 - 16661971
Alignment:
Q  39 cttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaa 138  Q
    ||||||| |||| |||||| || | ||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |   | ||    
T  16662519 cttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaa 16662420  T
Q  139 tagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaaca 238  Q
    ||  | |||||||||  |||||||||| || || || ||||| |||| ||||| ||||   | ||||||| | || | |||   || |||||||||||||    
T  16662419 taattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaaca 16662320  T
Q  239 gtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatct 338  Q
     ||||||| || || || |||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||| | ||| || |||||| | ||  ||||| |||| ||||    
T  16662319 atcttcatacactcgttaaaaaggcccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatct 16662220  T
Q  339 caatagttgcaac-aacaagataagaaagtgatctttttgcactctcact----gttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctactt 433  Q
    ||||||  |  || ||   || |||| ||||  ||||| ||  | ||||     ||| |||| |||||||| ||||||||||| | | | ||||| ||||    
T  16662219 caatagcggtgaccaatttga-aagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactt 16662121  T
Q  434 tgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaa 533  Q
    ||||||| || || || ||||  ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||||| |||    
T  16662120 tgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaa 16662021  T
Q  534 gacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    ||||| | | ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16662020 gacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaa 16661971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 17718080 - 17717979
Alignment:
Q  433 ttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaa 532  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||   |||||||||| |||| ||| ||||| | |||||| || | || ||| |||||||| ||||| ||||    
T  17718080 ttgttctttctcttgaactcttgaacaaagtggttcaccattctgttattaaaatcctcacctccaagatgggcgtctccggctgtagctttaacctgaa 17717981  T
Q  533 ag 534  Q
    ||    
T  17717980 ag 17717979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 583
Target Start/End: Original strand, 35132076 - 35132637
Alignment:
Q  18 actttggaacattctggatatcttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactcttt 117  Q
    ||||||||||||| |  ||  ||| ||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  35132076 actttggaacattttttatgcctttactcaacaaagcagcctgaactgctgccccataagctacagcctcatcggggttaatgctcttgcacaactcctt 35132175  T
Q  118 ccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatcta-cattactcttgtccgtgttagc 216  Q
    ||| |||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | || ||||||||| | |||||    
T  35132176 ccctttgaaaaagttttgcaatagctgctgcactttgggaatcctagaagaccctccaacaagaacaacatcatctacccttgctcttgtccatcttagc 35132275  T
Q  217 atcggtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatg 316  Q
    |||  | ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  35132276 atcaatgagacaactctctacggtattcatacactcattaaaaaggtctgcattcatttcctcaaacttggcgcgattgattgatgaagaaaaatcaatg 35132375  T
Q  317 ccatcacataaagaatctatctcaatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctcactgttttcaatctcctcaaagctcttggatt 416  Q
    || | | ||||||||||||  |||||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||  | |    ||   | ||||| ||| ||| |||    
T  35132376 ccttgaaataaagaatctacttcaatattggcaacaacaaggaaagaaagtgatctctttgccctctagcag---gca--gttctcaaggcttttgaatt 35132470  T
Q  417 tccacttatatctactttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagct 516  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  || || || |||||||| ||     
T  35132471 cccactaatgtctactttgttctttctcttgaactcttgtacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccaccgagatgagtgtttccggca 35132570  T
Q  517 gtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  35132571 gtggccttaacttggaagacattatccttaatagtaagtattgaaacatcaaaagtgccaccaccaa 35132637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 341
Target Start/End: Original strand, 30774937 - 30775195
Alignment:
Q  83 gcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaagga 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||   | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  30774937 gcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaa 30775036  T
Q  183 caacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaa 282  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||    || | ||| ||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  30775037 caatatcatctacactactcttgtctacctttgaatcagtaagacaactctcaacagtctgtatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaa 30775136  T
Q  283 cttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatctcaa 341  Q
    |||| ||||| ||||||| | |||||| |||||| | | | |||||  |||||||||||    
T  30775137 cttgacacgagtgattgatgaagaaaagtcaatgtcttgaaataaattatctatctcaa 30775195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 400 - 583
Target Start/End: Original strand, 30775258 - 30775441
Alignment:
Q  400 ctcaaagctcttggatttccacttatatctactttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaa 499  Q
    ||||||||||||||||| ||  | || || || ||||||||  |||| || || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  || |    
T  30775258 ctcaaagctcttggattcccggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtaattcaacattctgttatcaaagtcctctcccccga 30775357  T
Q  500 ggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
     ||| ||||||||||| || || ||||||| ||| |||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30775358 tgtgagtgtttccagcagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaa 30775441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 445 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 9336008 - 9335872
Alignment:
Q  445 tttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatcct 544  Q
    ||||||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || || || |||| ||| | || | |||    
T  9336008 tttaactcttccacaaaatagttaaccattctgttatcaaagtcctcgcctccaaggtgcgtgtttcctgcggtggcttttacttcaaatagatcaccct 9335909  T
Q  545 taatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccacc 581  Q
    |||| || || | ||||||||||||||| || |||||    
T  9335908 taattgtgaggatagacacatcaaaagtaccgccacc 9335872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 27831421 - 27830854
Alignment:
Q  20 tttggaacattctggatatcttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttcc 119  Q
    ||||||||||||   || || ||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  27831421 tttggaacattcataatgtcatcactcaacaaagcagcctgcacagctgcaccaaaagcaacagcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatcctttc 27831322  T
Q  120 ccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatc 219  Q
    |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||  ||    
T  27831321 ccttgaaaaagtccgccaatagctgctgcactttgggaatccttgaagagccaccaacaaggacaacatcatctatactactcttgtccatcttagagtc 27831222  T
Q  220 ggtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgcca 319  Q
     || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    | | | || ||||||||     
T  27831221 agtgagacaactctcaacagtctccatacattcattgaaaaggtccatattgatttcctcaaactttgcacgagtgatcattgaaaagaagtcaatgccc 27831122  T
Q  320 tcacataaagaatctatctcaatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctcac----tgttttcaatctcctcaaagctcttggat 415  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||| |   |||||  | |||| ||||  ||||||||  ||||||     ||| |||  |||||||| |||||||| |    
T  27831121 tcaaataaggcatctatctcaatagtagtgtcaacagaaaaagagagtgtcctttttgccttctcacattaggttctcagcctcctcaaggctcttgggt 27831022  T
Q  416 ttccacttatatctactttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagc 515  Q
    | ||||| || || ||| | |||||  |||| ||| | || ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  27831021 tcccactaatgtccactcttttcttcttcttgaacacctccacaaaatagttcaccatcctattatcaaagtcctctccaccaaggtgagtgtttccagc 27830922  T
Q  516 tgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
     || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27830921 agttgccttaacttggaagaccttatccttaattgtaacaagagacacatcaaaagtcccaccaccaa 27830854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 314
Target Start/End: Original strand, 17267583 - 17267855
Alignment:
Q  42 cacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatag 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || | ||| |||||    
T  17267583 cacttaacaaagcagcctgaacagcagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatacttttgcataattccttccccttgaagaagttctgcaatag 17267682  T
Q  142 ctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagtc 241  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||  | ||||||||  |||||||  |||||||| ||    
T  17267683 ttgctgcactttcggaatcctagaagacccaccaacaaggacaacatcatcaactctgctcttgtcaatcttagcatcactaagacacttctcaacaatc 17267782  T
Q  242 ttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaa 314  Q
    | |||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17267783 tccatgcactcatcaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaatcaa 17267855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 583
Target Start/End: Original strand, 6789161 - 6789701
Alignment:
Q  47 aacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgct 146  Q
    |||||||||||||| | ||| || ||  |||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| || || ||| ||||||  || || ||||| || |    
T  6789161 aacaaagcagcctggacagctgcaccgtaagcaacagcctcatcagggttgatgctcatgcacaaatcctttcccatgaaaacttcttgcaatagttgtt 6789260  T
Q  147 gcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagtcttcat 246  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  6789261 gcactttgggaattctagaagacccaccaacaaggacaacatcatttacaatactcttgtccatcttagcgtcaacaagacaactctcaacggtcttcat 6789360  T
Q  247 gcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatctcaatagtt 346  Q
     || ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| | | ||| | |   || || ||||| | | ||||||| |||| |||||||||     
T  6789361 acactcattaaaaatatccatattgatttcctcaaacttggcccgagtaagtgatgaaatgaagtcgatgccctgaaataaagagtctacctcaatagta 6789460  T
Q  347 gcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctca----ctgttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctactttgttctttc 442  Q
    |  || |||| | |||| |||   ||||| || || |||    | ||| |||| || || || || ||||  |||||| | ||||| ||||||||||| |    
T  6789461 gtgacgacaacaaaagagagtacccttttggccctttcacacgcagttctcaaccttcttaaggcccttgagtttccagtaatatccactttgttcttcc 6789560  T
Q  443 tctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatc 542  Q
    |||| ||||| ||| |||||||  | |||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||    
T  6789561 tcttaaactcctctgcaaagtagtttaccaatcggttatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccaccggtggccttaacttggaagaccttatc 6789660  T
Q  543 cttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
     || || ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6789661 tttgattgttaagatagacacatcgaaagtgccaccaccaa 6789701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 311
Target Start/End: Original strand, 17259885 - 17260154
Alignment:
Q  42 cacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatag 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||    
T  17259885 cacttaacaaagcagcctgaacagcagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcataattccttacccttgaagaaatcctgcaatag 17259984  T
Q  142 ctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagtc 241  Q
     |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |   | ||||||||  | ||| ||||  |||||||  |||||||| ||    
T  17259985 ttgctgcactttcggaatcctagaagatccaccaacaaggacaacatcatcaattctgctcttgtcaatcttaccatcactaagacacttctcaacaatc 17260084  T
Q  242 ttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaat 311  Q
    | |||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17260085 tccatgcactcataaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaat 17260154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 8586223 - 8585685
Alignment:
Q  49 caaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgc 148  Q
    ||||| ||||||||  || ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| || ||    ||||| | |||     
T  8586223 caaagaagcctgaactgcagccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaagtcactcaatagttcctgt 8586124  T
Q  149 actttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagtcttcatgc 248  Q
    |||||| |||| || || || ||||| |||||||||| ||| ||||||  | |||| ||  | |||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  8586123 actttgggaattctggacgagccaccgacaaggacaatatcgtctacaccattcttctctatcttagaatcggtaagacaactctcaacagtatttatac 8586024  T
Q  249 attcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatctcaatagttg- 347  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||| | ||| ||||||||| |||| || |||||||| |     
T  8586023 actcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgcgtgattgatgaagagaaatcgacgccctcacataaataatcaatttcaatagtagt 8585924  T
Q  348 caacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctca----ctgttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctactttgttctttct 443  Q
     | |||   || |||||||||  ||||||||  | |||    | ||| | || | ||||||||||||||| ||   | | ||||| || |||||||||||    
T  8585923 gaccaatttga-aagaaagtgtcctttttgccttttcacatgccgttcttaaccgcctcaaagctcttgggttcttagtaatatccacattgttctttct 8585825  T
Q  444 ctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatcc 543  Q
    ||| || || || ||||||||  ||| |||||| |||||||||||| |||  |||||||| || |||||||| || || ||||||| |||||||| | |     
T  8585824 cttaaattcctcaacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcccctcccccaaggtgagtatttccagcggttgctttaacttcaaagacatcacct 8585725  T
Q  544 ttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8585724 ttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaa 8585685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 345
Target Start/End: Original strand, 8616330 - 8616628
Alignment:
Q  47 aacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgct 146  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| | |||||| ||    ||||| | ||    
T  8616330 aacaaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcacaaatccttcccatcgaaaaagtcactcaatagttcct 8616429  T
Q  147 gcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagtcttcat 246  Q
    |||||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||  | |||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||    
T  8616430 gcactttaggaatcctagacgagccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttctctatcttagaatcattaaaacaactctcaacagtctttat 8616529  T
Q  247 gcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatctcaatagt 345  Q
     || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  8616530 acactcgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttaacacgagtgattgatgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagt 8616628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 240
Target Start/End: Original strand, 8581341 - 8581542
Alignment:
Q  39 cttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaa 138  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||    
T  8581341 cttcactaaccaaagcagcctgaatagcagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcataattccttcccctggaaaaactcctgtaa 8581440  T
Q  139 tagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaaca 238  Q
    ||||||   ||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||| | ||||    
T  8581441 tagctgtctcactttaggaatcctagaagaaccaccaacaaggacaacatcatctacactacccctgtccatcttagcatcggcaagacaactattaaca 8581540  T
Q  239 gt 240  Q
    ||    
T  8581541 gt 8581542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 219
Target Start/End: Original strand, 8545273 - 8545454
Alignment:
Q  38 tcttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgta 137  Q
    |||||||| | |||||||||||| | ||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  8545273 tcttcactcagcaaagcagcctggacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggttaatgctcttgcataattccttccccttaaaaaactcctgta 8545372  T
Q  138 atagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatc 219  Q
    |||||||   ||||||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  8545373 atagctgtctcactttaggaatcctagaagaaccgccaacaaggacaacatcatctacactacccttgtccatcttagcatc 8545454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 240
Target Start/End: Original strand, 8569962 - 8570153
Alignment:
Q  49 caaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgc 148  Q
    |||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||| |||||| || ||||||||||||  |    
T  8569962 caaaacagcctgaatagctgcaccgtaagcaacagcctcatcagggttaatgctgttgcataattccttcccctggaaaaactcttgtaatagctgcctc 8570061  T
Q  149 actttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagt 240  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||| | ||||||||| | ||||||    
T  8570062 actttaggaatcctagaagaaccaccaacaaggacaacatcatctacactattcttttccatcttagcatcagcaagacaactattaacagt 8570153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 581
Target Start/End: Original strand, 3146904 - 3147451
Alignment:
Q  38 tcttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgta 137  Q
    |||||||| ||||||||||| || | ||| || ||| |||| || ||||||||||| || ||||| || ||||  |  |||||    ||||| ||||| |    
T  3146904 tcttcactcaacaaagcagcttgcacagctgcaccataagcaacggcctcatcagggttgatgctgttacacagatgcttccctgcaaaaaattcctgca 3147003  T
Q  138 atagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaac 237  Q
    |||| || ||||||||  |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||| || |  ||| |||||| | |   |||| |  | |||||||| |||    
T  3147004 atagttgttgcacttttggaattctagacgagccaccgacaaggacgacatcatgtatagcacttttgtccatttcgacatcagcgaaacaactcttaac 3147103  T
Q  238 agtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatc 337  Q
    ||| | ||  || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | | || ||||  || | | ||||||||||||||    
T  3147104 agtttccaaacactcagtgaaaagatccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgatgaaaataagtcaaatccctgaaataaagaatctatc 3147203  T
Q  338 tcaatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctcact----gttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctactt 433  Q
    ||||| || |  |  |||  | |||| |||  || |||||| || ||||     |||||||| ||||| || |||||||  ||  |||| || ||||| |    
T  3147204 tcaatggtggtgatgacagcaaaagatagtattcgttttgctctttcacacgccgttttcaacctccttaaggctcttgagttctcactaatgtctacct 3147303  T
Q  434 tgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaa 533  Q
    |||||||  |||| |||||   | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  3147304 tgttcttcttcttaaactcccgtgcaaagtagttcaccatcctattatcaaagtcctctcccccaaggtgggtgtttcctgcgatggccttaacttgaaa 3147403  T
Q  534 gacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccacc 581  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3147404 gaccttatccttaattgtaagaagagacacatcaaaagtcccaccacc 3147451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Original strand, 8575967 - 8576216
Alignment:
Q  39 cttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaa 138  Q
    ||||||| ||||||||||| || | | | || ||| |||| |||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||  ||||||||    
T  8575967 cttcactcaacaaagcagcttggacaacagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttacataattccttccccttgaaaacctcctgtaa 8576066  T
Q  139 tagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaaca 238  Q
    ||||||   ||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||| | ||||||| | | ||||    
T  8576067 tagctgtctcactttaggaatcctagaagaaccaccaacaaggacaacatcatctacactattcttgtccatcttagcatcagcaagacaaatattaaca 8576166  T
Q  239 gtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggc 288  Q
    || ||||| || |  |  || || | |||||| |||||||||||||||||    
T  8576167 gtattcatacacttttcaaagaggttcatattcatttcctcaaacttggc 8576216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29582358 - 29582188
Alignment:
Q  49 caaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgc 148  Q
    |||||||||||| | ||| || ||| |||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  29582358 caaagcagcctgcacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcatgcacaaatccttccccttgaaaaattcttgcaatagctgatgc 29582259  T
Q  149 actttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatc 219  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| | |||||| | |||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  29582258 actttgggaattctagaagagccaccaataaggacgatatcatctacactactcttgaccatgttagcatc 29582188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7878247 - 7878066
Alignment:
Q  52 agcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcact 151  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||| ||||| ||||| || || |||||  |||| |  || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7878247 agcagcctgaacagctgcaccataagcaacagcttcatccgggttgatgctactgcaaatatccttccccttaaaaaagtcctgcaatagctgctgcact 7878148  T
Q  152 ttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactct 233  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  7878147 ttgagaatcctagatgatccaccaacaagtacaacatcatctacattgttcttgtccatcatagcatcagtaagacaactct 7878066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 468 - 583
Target Start/End: Original strand, 8646951 - 8647066
Alignment:
Q  468 caccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatca 567  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  8646951 caccattctactatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccagcggtggctttaacatgaaagaccttatccttaattgtaaggagagacacatca 8647050  T
Q  568 aaagtgccaccaccaa 583  Q
    ||||| ||||||||||    
T  8647051 aaagttccaccaccaa 8647066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 583
Target Start/End: Original strand, 8659182 - 8659552
Alignment:
Q  217 atcggtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatg 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| | | | | || || ||     
T  8659182 atcgctaagacaactctcaacagttttcatacactcattaaaaagatccatattcatttcctcaaacctggcacgagtgattaatgaacagaagtctatt 8659281  T
Q  317 ccatcacataaagaatctatctcaatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctcactg----ttttcaatctcctcaaagctcttg 412  Q
    || | | |||||||||| | ||||| ||| |  |||| |  | |||| ||||  || ||||| ||||||| |    || |||| ||||| || | | |||    
T  8659282 ccctgaaataaagaatcgacctcaacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttg 8659381  T
Q  413 gatttccacttatatctactttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttcc 512  Q
    | || ||||| || || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8659382 ggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgctatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttcc 8659481  T
Q  513 agctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    ||  || || || |||| |||||||| | |||| || || || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8659482 agaagtggcttttacttcaaagacatcacccttcattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaa 8659552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Original strand, 8590289 - 8590458
Alignment:
Q  49 caaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgc 148  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| | |  || |||||| | ||||| || || ||||||||||||    
T  8590289 caaagcagcttgaacagctgcaccataagcaacagcctcatctggattgatgctattgtaaagatccttccccataaaaaagtcttgcaatagctgctgc 8590388  T
Q  149 actttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcat 218  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||||| | |||||||    
T  8590389 actttgggaatcctagaagaaccaccaacaagtacaacatcatctacaatgttcttgtccatcttagcat 8590458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 448 - 583
Target Start/End: Original strand, 1301514 - 1301649
Alignment:
Q  448 aactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaa 547  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| | || || || |||| ||||||||   |||| |    
T  1301514 aactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatttccaccagtggcttttacttcaaagacatcgcccttga 1301613  T
Q  548 tggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    |||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1301614 tggtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaa 1301649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 583
Target Start/End: Original strand, 8654168 - 8654639
Alignment:
Q  116 ttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttag 215  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||| || || ||||||||||| | || | ||||||   | || |    
T  8654168 ttccccttgaaaaactctagcaatagatcctgcactttgggaatcctagacgagccacccacgagtacaacatcatcaatatcattcttgtatatctttg 8654267  T
Q  216 catcggtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaat 315  Q
     |||  | |||||||| |||||| | || || || ||||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| | |||||| || ||    
T  8654268 aatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgat 8654367  T
Q  316 gccatcacataaagaatctatctcaatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctcactg----ttttcaatctcctcaaagctctt 411  Q
     ||   | |||||| ||||| ||||| ||| |  |||| |  | |||| |||   |||||||| ||||||| |    || |||| ||||| || | | ||    
T  8654368 tcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggatttt 8654467  T
Q  412 ggatttccacttatatctactttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttc 511  Q
    || || || || || || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  8654468 gggttaccgctaatttccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttc 8654567  T
Q  512 cagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    |||| || || || || | |||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8654568 cagcagtggcttttacgtcaaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaa 8654639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 432 - 581
Target Start/End: Original strand, 8559371 - 8559520
Alignment:
Q  432 tttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttga 531  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |  || ||||| |||| |    
T  8559371 tttgttcttcctctcaaactcttttacaaagtgtttcaccattctgttatcaaagtcctctcctccgaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttca 8559470  T
Q  532 aagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccacc 581  Q
    |||| ||||| |||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8559471 aagagattattcttaattgtgagaagagaaacatcaaaagttccaccacc 8559520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 471 - 583
Target Start/End: Original strand, 8628609 - 8628721
Alignment:
Q  471 cattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaa 570  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| || || ||||||| |||||||| | | ||||| || || |||||||||||||||    
T  8628609 cattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaa 8628708  T
Q  571 gtgccaccaccaa 583  Q
    || ||||||||||    
T  8628709 gtcccaccaccaa 8628721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 469 - 583
Target Start/End: Original strand, 17268014 - 17268128
Alignment:
Q  469 accattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaa 568  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||| || |||| |||| | || ||||||||||  ||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||    
T  17268014 accattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatccttaattgtaacgagagacacatcaa 17268113  T
Q  569 aagtgccaccaccaa 583  Q
    |||| ||||||||||    
T  17268114 aagtcccaccaccaa 17268128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8383305 - 8383200
Alignment:
Q  137 aatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaa 236  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||    
T  8383305 aatagctcttgcactttgggaatcctcgaagaaccaccgatgagaacaacatcatctacactactcttgttcatcttagcatcagtaagacagctctcaa 8383206  T
Q  237 cagtct 242  Q
    ||||||    
T  8383205 cagtct 8383200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8636834 - 8636705
Alignment:
Q  75 aagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacc 174  Q
    |||| |||||||||||||  || |||||||| ||||  || ||| |||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| || |||||    
T  8636834 aagcaacagcctcatcagcgttgatgctcttacacagttccttcgccttaaaaatgtcctgtaatagttgctgcacctttggaatcctagaggagccacc 8636735  T
Q  175 tacaaggacaacatcatctacattactctt 204  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8636734 aacaaggacaacatcatctatattgctctt 8636705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 467 - 583
Target Start/End: Original strand, 8602047 - 8602163
Alignment:
Q  467 tcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatc 566  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |  || ||||| |||| ||||| ||||| |||||| || || ||||| |||||    
T  8602047 tcaccattcggttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattcttaattgtgagaagagaaacatc 8602146  T
Q  567 aaaagtgccaccaccaa 583  Q
    |||||| ||||||||||    
T  8602147 aaaagttccaccaccaa 8602163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Original strand, 8609566 - 8609714
Alignment:
Q  47 aacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgct 146  Q
    |||||||||||||| | ||| || ||| |||| || ||||||||||| || |||||| | ||||| || || || |||||||| || || | ||||||||    
T  8609566 aacaaagcagcctggacagcagcaccataagcaaccgcctcatcagggttgatgctcatacacaaatcctttccattgaaaaagtcttgcagtagctgct 8609665  T
Q  147 gcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctac 195  Q
     ||||||  ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  8609666 tcactttcggaatcctagaagaacctccaacaagaacaacatcatctac 8609714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 468 - 583
Target Start/End: Original strand, 17260315 - 17260430
Alignment:
Q  468 caccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatca 567  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||| || |||| |||| | || ||||||||||  ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  17260315 caccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatccttaattgtaacgagagacacatca 17260414  T
Q  568 aaagtgccaccaccaa 583  Q
    ||||| || |||||||    
T  17260415 aaagtccccccaccaa 17260430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 10494901 - 10494355
Alignment:
Q  39 cttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaa 138  Q
    ||||||| || | ||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||| || || || | | || | || || |||||||||||||| ||  | ||    
T  10494901 cttcactcaaaatagcagcctgaacagctgcaccataagcaacagcctcatctgggttgatacgcatgaataattccttccccttgaaaaattctagcaa 10494802  T
Q  139 tagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaaca 238  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| | || | ||||||   | || | |||  | |||||||| ||||||    
T  10494801 tagatcctgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatccctgagacaactgtcaaca 10494702  T
Q  239 gtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatct 338  Q
     | ||||| || ||  ||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| || || ||   | |||||| ||| | ||    
T  10494701 atattcatacactcgatgaaaaagtctatattaatttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatcgacct 10494602  T
Q  339 caatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctca----ctgttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctacttt 434  Q
    |||  || |  |||| |  | |||| |||   |||||||| ||||||    | ||| |||| ||||| || | | ||||||| ||||| || || || ||    
T  10494601 caacggtggtgacaaaagaaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttggattcccactgatgtccacgtt 10494502  T
Q  435 gttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaag 534  Q
     |||||  | || ||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || || || || || |||| ||||    
T  10494501 attcttctttttgaactcctcaacaaaataattcaccattctgttatcgaagtcctctcccccaaggtgagtgttacctgcagtggcttttacttcaaag 10494402  T
Q  535 acattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccacc 581  Q
    |||| | ||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  10494401 acatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtaccaccacc 10494355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 298
Target Start/End: Original strand, 1301208 - 1301360
Alignment:
Q  146 tgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagtcttca 245  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| | || |||| ||    | || | |||| |||||||||||||||| || ||      
T  1301208 tgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcgatatcactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacggtttttg 1301307  T
Q  246 tgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgatt 298  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1301308 tacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgatt 1301360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 335
Target Start/End: Original strand, 8646520 - 8646814
Alignment:
Q  41 tcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaata 140  Q
    |||| ||| |||||||||||||  || || ||| |||| || ||| ||||||| || ||||||| ||| || || ||| | |||||||| ||||  |  |    
T  8646520 tcacataataaagcagcctgaacggctgcgccataagcaacggccacatcagggttgatgctctcgcataattccttctcattgaaaaactccttcagca 8646619  T
Q  141 gctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagt 240  Q
     ||| || |||||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||  | |  |||||||||| | || |||||  || ||||||||||||||||    
T  8646620 tctgttgtacttttggaattctagaggagccaccaacaagaacaacatcatggatagaactcttgtccatcttggcatcattatgacaactctcaacagt 8646719  T
Q  241 cttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatcta 335  Q
     | ||  |||||  |||| || |||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||||| | |  ||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  8646720 ttccaaacattcgatgaacagatccatattgattgcgtcaaatttggcacgagtgattgatgaaataaagtcaatgccattaaataaagaatcta 8646814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27846652 - 27846566
Alignment:
Q  20 tttggaacattctggatatcttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttg 106  Q
    |||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  27846652 tttggaacattcttaatgtcatcactcaacaaagcagcctgcacagctgctccaaaagcaacagcctcatcagggttgatgctcttg 27846566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 433 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 29577801 - 29577651
Alignment:
Q  433 ttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaa 532  Q
    |||||||| ||||| ||||| |  |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| || |  ||||| || ||||| |||| ||    
T  29577801 ttgttcttcctcttcaactcattcacaaagtggctcaccattttattatcgaagtcctctcctcctaggtgagtatcaccagcagtggcctttacttcaa 29577702  T
Q  533 agacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    |   || ||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29577701 aactatcatccttaagtgtgagaagagacacatcaaaggtgccaccaccaa 29577651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 242
Target Start/End: Original strand, 8601722 - 8601818
Alignment:
Q  146 tgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagtct 242  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||  | | ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  8601722 tgcactttgggaatcctagaagaaccgccaacaaggacagcatcatccacactactcttttcgatctgagcatcactaagacaactttcaacagtct 8601818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 581
Target Start/End: Original strand, 8667470 - 8667606
Alignment:
Q  445 tttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatcct 544  Q
    |||||||| || ||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| || || || || |||| |||||||| | |||    
T  8667470 tttaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcctcgcccccaaggtgagtgtttcctgcagtggctttcacttcaaagacatcaccct 8667569  T
Q  545 taatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccacc 581  Q
    |||| || || | ||||||||||||||| || |||||    
T  8667570 taattgtgaggatagacacatcaaaagtcccgccacc 8667606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29578191 - 29578019
Alignment:
Q  47 aacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgct 146  Q
    |||||||||||||| | ||| || ||| |||| |||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||  | ||||||||||| || || ||||| | |     
T  29578191 aacaaagcagcctgcacagctgcaccataagcaacagcctcgtcagggtttatgctcatgcacaaatccctacccttgaaaaagtcttgcaatagtttcc 29578092  T
Q  147 gcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatc 219  Q
    |||||||| |||| ||||| || || || ||||||||||  |||| |||  |||||| |||| ||| ||||||    
T  29578091 gcactttgggaattctagatgaacctccaacaaggacaatttcatgtaccatactctggtccatgtaagcatc 29578019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 583
Target Start/End: Original strand, 8545672 - 8545822
Alignment:
Q  433 ttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaa 532  Q
    |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |  || ||||  |||| |||||| || ||||| || | ||    
T  8545672 ttgttcttcctcttgaactccttcacaaagtaattcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtaagtgtctccagcagtggccttgacatcaa 8545771  T
Q  533 agacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    |||| ||||  ||||| || || | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8545772 agaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaa 8545822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 467 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 13333551 - 13333437
Alignment:
Q  467 tcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatc 566  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| || || || || |||| |||||||| | || |||| || || | |||||||||    
T  13333551 tcaccattctgttatcgaagtcttctcccccaaggtgagtgtttcctgcggtggcttttacttcaaagacatcacccataattgtaaggatagacacatc 13333452  T
Q  567 aaaagtgccaccacc 581  Q
    |||||| ||||||||    
T  13333451 aaaagtaccaccacc 13333437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 442 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 8382996 - 8382855
Alignment:
Q  442 ctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattat 541  Q
    ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || |||| ||| || || ||||| ||   |||||||||||    
T  8382996 ctcttgaactcgtcaacaaagtacttcacgattctgttatctaagtcttcacctcctagatgagtgtctccggcagtggccttcacaacaaagacattat 8382897  T
Q  542 ccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
     |||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8382896 tcttaattgtgaggagagacacatcaaaagttccaccaccaa 8382855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 246
Target Start/End: Original strand, 8537783 - 8537884
Alignment:
Q  145 ctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagtcttc 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| | | ||||  ||||| | ||||||||  ||| |||||||| |||||| |||    
T  8537783 ctgcactttgggaatcctagaagagccaccaactagtacaacatcatccatactactactgtccatcttagcatcattaaaacaactcttaacagttttc 8537882  T
Q  245 at 246  Q
    ||    
T  8537883 at 8537884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 398 - 583
Target Start/End: Original strand, 8538040 - 8538225
Alignment:
Q  398 tcctcaaagctcttggatttccacttatatctactttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttcc 497  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||| || || |||||||| || ||||| || || |  ||||| | | ||||||  | ||||||||||||||||| |||    
T  8538040 tcctcagagcttttgaatttccactaatgtcaactttgtttttcctcttcaattcattcacaaaatgattcaccaaccgattatcaaagtcctctcctcc 8538139  T
Q  498 aaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    |||||| || | ||| || || ||||| |||  |||| |||||| ||| |  || || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8538140 aaggtgagtatctccggcagtggccttgactgtaaaggcattattcttcaatgtaaggagagatacatcaaaagttccaccaccaa 8538225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 427 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 8636478 - 8636369
Alignment:
Q  427 tctactttgttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaa 526  Q
    ||||| |||||||| ||||| |  || |||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || || || ||||    
T  8636478 tctaccttgttcttcctcttgatttcctctacaaaatattccaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggcagtggctttaa 8636379  T
Q  527 cttgaaagac 536  Q
    ||| ||||||    
T  8636378 cttcaaagac 8636369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 108
Target Start/End: Original strand, 39985300 - 39985356
Alignment:
Q  52 agcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgca 108  Q
    ||||||||||| ||| || ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39985300 agcagcctgaacagcagcaccatatgcaacagcctcatcaggatttatgctcttgca 39985356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 583
Target Start/End: Original strand, 15594675 - 15595223
Alignment:
Q  39 cttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaa 138  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||| || ||| |||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| || || |||| |||||||||||  ||    
T  15594675 cttcactcaacaaagcagcctggacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcatgcacaattcctttccctcgaaaaaatccttcaa 15594774  T
Q  139 tagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaaca 238  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||| | | | ||||||||   |||||||||||||||     
T  15594775 tagttgttgcactttgggaatcctagaagacccaccaacaatgacaatatcatttacactactcttattcatcttagcatcatcaagacaactctcaact 15594874  T
Q  239 gtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatct 338  Q
     ||||||| || || || ||||  ||||| || ||||| |||||||||| |||| | |  || | | | || ||||| || | | ||||| |||||| ||    
T  15594875 atcttcatacaatccttaaaaaagtccatgttgatttcttcaaacttggaacgagtaaccgatgaaaagaagtcaataccgttaaataaacaatctacct 15594974  T
Q  339 caatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcact----ctcactgttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctacttt 434  Q
    |||| || |  |||  |  | |||| |||   |||||||| ||    | | | ||| ||||||||||||| || ||||| || ||| | ||||| |||||    
T  15594975 caatggtagtgacagtagtaaaagagagtaccctttttgccctttcgcacgcagttctcaatctcctcaaggcccttgggttcccagtaatatccacttt 15595074  T
Q  435 gttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaag 534  Q
    ||||||  |||| || || |   |||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  15595075 gttcttcgtcttgaattcctgcgcaaagtagttgaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccgcctgtggccttaacttggaag 15595174  T
Q  535 acattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    || || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15595175 accttgtccttaattgttaggatagacacatcaaaagtgccaccaccaa 15595223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 34467307 - 34466772
Alignment:
Q  47 aacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgct 146  Q
    ||||||||||| || | ||| ||  || |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |  || || || |||||||| ||| | ||||||||||    
T  34467307 aacaaagcagcttgcacagctgcgacataagcgacagcctcatcagggttgatgctattgcatagatccttaccattgaaaaagtcccgcaatagctgct 34467208  T
Q  147 gcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagtcttcat 246  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| | ||||||||   |||||||||| ||||| || ||||    
T  34467207 gcactttgggaatcctagaagagcccccgacaaggacagcatcatgcacactactcgtgtccatcttagcatcaacaagacaactcacaacaatcctcat 34467108  T
Q  247 gcat---tcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatctcaata 343  Q
    ||||   || || || |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |   || |||||  | ||| ||||||||||||| |||| |    
T  34467107 gcattaatctttaaagaagtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgacgaatggaagtcaattacctcatataaagaatctatttcaaca 34467008  T
Q  344 gttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactct----cactgttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctactttgttct 439  Q
    || || |||| |||       ||||  || |||||| |||    | | ||| |||| |||||||||||||| || |||||||| |||||    || | ||    
T  34467007 gtagcgacaa-aag-------agtgtcctctttgcattctcgcacgcagttctcaacctcctcaaagctctagggtttccactaatatccttattatgct 34466916  T
Q  440 ttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacatt 539  Q
    | ||||| ||||| | | ||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||  || |||||||||| |||||||||    
T  34466915 tcctcttgaactcctttgcaaagtggttcgccattctattatcaaagtcctctcgtccgaggtgagtgttaccagaagtggccttaacttcaaagacatt 34466816  T
Q  540 atccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34466815 atccttaattgtaaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaa 34466772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4679071 - 4678831
Alignment:
Q  52 agcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcact 151  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||| ||| ||||| || || ||||| | |||||||    
T  4679071 agcagcttggatagctgcaccataagcaacagcctcatctgggttgatactcttgcacaaatccttccgcttaaaaaagtcttgcaatagatcctgcact 4678972  T
Q  152 ttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaacagtcttcatgcatt 251  Q
    ||| ||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||  |  | | || | |||  |||||||||||| |||||| | ||| || |    
T  4678971 ttgggaatcctcgatgaaccacccacaagaacaacatcatcaatattactcccgcgcatctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacact 4678872  T
Q  252 cattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacga 292  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4678871 cgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacga 4678831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 52549494 - 52549398
Alignment:
Q  18 actttggaacattctggatatcttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactc 114  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52549494 actttggaacattctgaatgccttcactcaacaatgcagcctgaacagctgcgccataagctacaacctcatcaggattaatgcccttgcacaactc 52549398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 448 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 4678672 - 4678537
Alignment:
Q  448 aactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaa 547  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| || || || |||| |||||||  | |||| |    
T  4678672 aactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttga 4678573  T
Q  548 tggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    |  | || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4678572 ttttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaa 4678537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 52549353 - 52549264
Alignment:
Q  225 gacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaa 314  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||    
T  52549353 gacaactttcaacaatcttcatacactccttaaaaaggtccatattcatttcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaaatcaa 52549264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 106; Significance: 9e-53; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 545
Target Start/End: Original strand, 28219559 - 28220069
Alignment:
Q  39 cttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaa 138  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||    ||||| ||||| |     
T  28219559 cttcactcaacaaagcagcctgcacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggttaatgctcttacacaattccttccctccaaaaaattcctgcag 28219658  T
Q  139 tagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaaca 238  Q
    ||| || || |||||  |||| ||||| || || || ||||| |||||||| | ||||   ||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||||    
T  28219659 tagttgttgtacttttggaattctagaggagcctccaacaagaacaacatcgtgtacagccctcttgtccatattggcatcagtgagacacctctcaaca 28219758  T
Q  239 gtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatct 338  Q
    || ||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| | | | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  28219759 gttttcaaacactcattgaaaagatccatattgatttcctcaaacttagcacgagtaattgatgaaaagaaatcaatgccttcaaataaagaatctacct 28219858  T
Q  339 caatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactct----cactgttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctacttt 434  Q
    |||| || || ||||||  | |||| ||||  |||||||| ||||    | ||||| |||| ||||| || |||||||  |||||| | || || || ||    
T  28219859 caatggtggcgacaacagcaaaagatagtgtcctttttgctctcttgcacgctgttctcaacctccttaaggctcttgagtttccagtaatgtccacctt 28219958  T
Q  435 gttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaag 534  Q
    ||||||  |||| ||||| ||| | |||||  ||||||| ||| |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  28219959 gttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctactatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcggtggccttcacttggaag 28220058  T
Q  535 acattatcctt 545  Q
    || ||||||||    
T  28220059 accttatcctt 28220069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 583
Target Start/End: Original strand, 12528145 - 12528693
Alignment:
Q  39 cttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaa 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  12528145 cttcactcaacaaagcagcctgaacagcggcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgtataactccttgcccttgaaaaactcctgcaa 12528244  T
Q  139 tagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaaca 238  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||     
T  12528245 tagctgcttcactttgggaatcctagacgagccaccaacaagtacaatatcatctacactactcttgtccatcttagcatcggtcaaacaactttcaacg 12528344  T
Q  239 gtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatct 338  Q
    |||| ||| || |  |  || || |||||||| | || ||| |||||||| ||| ||||||| |   | || |||||||| ||||||| || |||||| |    
T  12528345 gtctccatacacttttcaaagaggtccatattcagttgctcgaacttggctcgagtgattgatgagcagaagtcaatgccctcacatatagcatctatgt 12528444  T
Q  339 caatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctcac----tgttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctacttt 434  Q
    |||| || ||  |   |   || |||||||  ||||| ||  |||| |     ||| |||||||||| |  ||| |||  || ||| | || || |||||    
T  12528445 caattgtagcctctgtatcgtatgaaagtgtccttttcgccttctcgcagttagttctcaatctccttagggcttttgagttcccaataatgtcaacttt 12528544  T
Q  435 gttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaag 534  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || || ||||| ||||  |||    
T  12528545 gttcttcctcttaaactctttcacaaagtgattcaccattcgattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttcgaag 12528644  T
Q  535 acattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaa 583  Q
    ||||||| ||| |  || || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12528645 acattattctttactgtaagaagagacacatcaaaagttccaccgccaa 12528693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 514
Target Start/End: Original strand, 43744457 - 43744936
Alignment:
Q  39 cttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaa 138  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||| || |||| ||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||    ||||| ||||| ||    
T  43744457 cttcactcaacaaagcagcctgcacagctgcaccaatagcaactgcctcatcagggttaatgttcttacacaaatccttccctgcaaaaaattcctgcaa 43744556  T
Q  139 tagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatcggtaagacaactctcaaca 238  Q
    ||| || || |||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| || |   ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  43744557 tagttgttgtacttttggaatcctagaggagccaccaacaagaacaacatcatgtatagcgctcttgtccatcttggcatcagtaagacaactctcaaca 43744656  T
Q  239 gtcttcatgcattcattgaaaagttccatatttatttcctcaaacttggcacgattgattgacgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatct 338  Q
     | ||||  || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||  | | | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  43744657 attttcaaacactcgttgaagagatccatattgatttcctcaaacttagtacgagtgattgttgtaaagaaatcaatgccctcaaataaagaatctacct 43744756  T
Q  339 caatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctc----actgttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctacttt 434  Q
    ||||||| |  ||||||  | |||| | ||  |||||||| || ||     ||||| |||| ||||| || |||||||| |||||| | || || || ||    
T  43744757 caatagtggtgacaacagcaaaagataatgtcctttttgctctttcgcatgctgttctcaacctccttaatgctcttgggtttccagtaatgtccacctt 43744856  T
Q  435 gttctttctctttaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccag 514  Q
    ||||||  |||| ||||| ||| | |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  43744857 gttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctattatcaaaatcctctcctccgaggtgagtgtttccag 43744936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 467 - 577
Target Start/End: Original strand, 28910655 - 28910765
Alignment:
Q  467 tcaccattctattatcaaagtcctctcttccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatc 566  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||    || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  28910655 tcaccatcctattatcaatgtcctcgaccccgaggtgagtgtttccagcggtggccttaacttggaagaccttatcctgaattgtaaggagagaaacatc 28910754  T
Q  567 aaaagtgccac 577  Q
    |||||| ||||    
T  28910755 aaaagtcccac 28910765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University