View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8394_low_11 (Length: 367)

Name: NF8394_low_11
Description: NF8394
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8394_low_11
NF8394_low_11
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (1-349)||(320682-321030)
chr7 (1-349)||(8199905-8200253)
chr7 (1-349)||(14333673-14334021)
chr7 (1-349)||(8708882-8709230)
chr7 (1-349)||(11235858-11236206)
chr7 (1-349)||(15159702-15160050)
chr7 (1-351)||(15147530-15147880)
chr7 (1-349)||(18550403-18550751)
chr7 (1-349)||(23202258-23202606)
chr7 (1-349)||(23508385-23508733)
chr7 (1-349)||(13687341-13687689)
chr7 (1-349)||(44789996-44790344)
chr7 (1-349)||(15963-16311)
chr7 (1-347)||(14040974-14041320)
chr7 (1-347)||(14351004-14351350)
chr7 (1-349)||(14955831-14956179)
chr7 (1-349)||(9597334-9597682)
chr7 (1-349)||(11551747-11552095)
chr7 (1-349)||(12688777-12689126)
chr7 (1-349)||(14212951-14213299)
chr7 (1-349)||(18179019-18179370)
chr7 (1-349)||(11770886-11771234)
chr7 (1-351)||(19148487-19148837)
chr7 (1-351)||(20747886-20748236)
chr7 (1-346)||(12205423-12205768)
chr7 (136-349)||(10872272-10872485)
chr7 (1-349)||(11387051-11387399)
chr7 (1-351)||(15204894-15205244)
chr7 (1-351)||(15341707-15342057)
chr7 (1-351)||(15101226-15101576)
chr7 (54-351)||(7825175-7825472)
chr7 (54-351)||(27106472-27106769)
chr7 (54-351)||(27171556-27171853)
chr7 (1-350)||(14262867-14263216)
chr7 (1-351)||(16070918-16071268)
chr7 (2-351)||(13666813-13667162)
chr7 (1-351)||(14284999-14285349)
chr7 (1-351)||(18052576-18052926)
chr7 (1-337)||(19613965-19614301)
chr7 (16-351)||(16949110-16949445)
chr7 (2-316)||(30-344)
chr7 (27-349)||(39817-40139)
chr7 (1-351)||(23504493-23504843)
chr7 (52-351)||(12457916-12458215)
chr7 (16-351)||(11304901-11305236)
chr7 (16-351)||(13967306-13967641)
chr7 (16-351)||(49153577-49153912)
chr7 (16-351)||(13022633-13022968)
chr7 (57-351)||(17924926-17925220)
chr7 (57-346)||(4441208-4441497)
chr7 (16-351)||(26117228-26117578)
chr7 (141-251)||(15625900-15626010)
chr7 (57-351)||(14937622-14937915)
chr7 (57-351)||(15365215-15365508)
chr7 (57-278)||(23642791-23643012)
chr7 (126-278)||(15717673-15717825)
chr7 (189-308)||(15122739-15122858)
chr7 (134-351)||(21673312-21673529)
chr7 (186-259)||(17144092-17144165)
chr7 (288-351)||(15625829-15625892)
chr7 (193-346)||(13354429-13354582)
chr7 (282-351)||(13456022-13456091)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (1-351)||(23651393-23651743)
chr8 (1-349)||(17673102-17673450)
chr8 (1-349)||(20017342-20017690)
chr8 (1-349)||(18857931-18858279)
chr8 (1-349)||(19114044-19114392)
chr8 (1-351)||(21392944-21393294)
chr8 (1-351)||(21787438-21787788)
chr8 (2-351)||(21920816-21921165)
chr8 (4-351)||(21043797-21044144)
chr8 (1-349)||(19483143-19483491)
chr8 (1-349)||(30312223-30312571)
chr8 (1-349)||(22041213-22041565)
chr8 (1-351)||(21252296-21252646)
chr8 (1-349)||(21165617-21165965)
chr8 (1-349)||(22119254-22119601)
chr8 (1-349)||(22128038-22128385)
chr8 (1-349)||(32601498-32601846)
chr8 (1-349)||(22132120-22132468)
chr8 (1-349)||(19979321-19979669)
chr8 (1-349)||(15534737-15535085)
chr8 (4-274)||(16407199-16407469)
chr8 (1-351)||(20389451-20389801)
chr8 (54-349)||(20395264-20395559)
chr8 (12-351)||(20984637-20984976)
chr8 (54-351)||(16876227-16876524)
chr8 (1-349)||(22247512-22247860)
chr8 (1-351)||(20009000-20009349)
chr8 (1-351)||(21324348-21324698)
chr8 (2-351)||(22372283-22372632)
chr8 (1-351)||(23656279-23656629)
chr8 (16-351)||(29302520-29302855)
chr8 (1-351)||(20974735-20975085)
chr8 (1-351)||(31569921-31570271)
chr8 (2-351)||(22052215-22052564)
chr8 (1-334)||(23886393-23886726)
chr8 (16-351)||(6605010-6605345)
chr8 (18-337)||(21841783-21842102)
chr8 (16-351)||(16270318-16270653)
chr8 (54-353)||(21849469-21849768)
chr8 (1-351)||(31415550-31415900)
chr8 (1-238)||(19860900-19861137)
chr8 (16-351)||(14566494-14566829)
chr8 (57-351)||(20651468-20651762)
chr8 (137-351)||(22435655-22435869)
chr8 (1-349)||(22376532-22376881)
chr8 (1-349)||(22382707-22383056)
chr8 (27-349)||(19869047-19869369)
chr8 (58-348)||(21195638-21195928)
chr8 (16-279)||(27355960-27356223)
chr8 (57-256)||(23156175-23156374)
chr8 (1-115)||(22422971-22423085)
chr8 (159-351)||(12306110-12306302)
chr8 (57-345)||(22316549-22316837)
chr8 (137-346)||(23901544-23901753)
chr8 (126-241)||(22623247-22623362)
chr8 (291-351)||(22623405-22623465)
chr8 (303-350)||(23156393-23156440)
chr8 (234-351)||(19852763-19852880)
chr8 (234-351)||(19858799-19858916)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (1-351)||(17490755-17491105)
chr3 (1-349)||(14875374-14875722)
chr3 (1-349)||(5423805-5424153)
chr3 (1-349)||(16636680-16637028)
chr3 (1-349)||(43164004-43164352)
chr3 (1-349)||(15588267-15588615)
chr3 (1-349)||(15340176-15340524)
chr3 (1-349)||(15401392-15401740)
chr3 (1-349)||(16805822-16806170)
chr3 (1-349)||(48426354-48426702)
chr3 (1-349)||(53383893-53384241)
chr3 (2-349)||(15347121-15347468)
chr3 (1-349)||(13253597-13253945)
chr3 (1-349)||(20060929-20061277)
chr3 (16-349)||(15723824-15724157)
chr3 (1-349)||(6601643-6601991)
chr3 (1-349)||(10006507-10006855)
chr3 (1-349)||(10907117-10907465)
chr3 (1-349)||(16411157-16411505)
chr3 (1-349)||(14579817-14580165)
chr3 (85-351)||(16491140-16491406)
chr3 (1-351)||(16693069-16693419)
chr3 (2-349)||(12499155-12499502)
chr3 (1-302)||(3686897-3687198)
chr3 (1-238)||(5109486-5109723)
chr3 (2-349)||(15228566-15228913)
chr3 (2-349)||(15234434-15234781)
chr3 (1-349)||(15260537-15260885)
chr3 (108-349)||(14125576-14125817)
chr3 (1-351)||(16827067-16827417)
chr3 (1-351)||(31939818-31940168)
chr3 (12-351)||(12359402-12359741)
chr3 (54-351)||(30138721-30139018)
chr3 (54-351)||(30148272-30148569)
chr3 (16-351)||(11960048-11960383)
chr3 (54-351)||(8273327-8273624)
chr3 (1-349)||(10418909-10419257)
chr3 (138-349)||(15062625-15062836)
chr3 (1-351)||(16835374-16835724)
chr3 (1-351)||(44778162-44778512)
chr3 (1-351)||(31694049-31694400)
chr3 (1-351)||(18133210-18133560)
chr3 (1-351)||(41178437-41178787)
chr3 (54-351)||(13966272-13966569)
chr3 (54-351)||(15611018-15611315)
chr3 (1-337)||(13970984-13971320)
chr3 (1-183)||(16755576-16755758)
chr3 (54-351)||(16741631-16741928)
chr3 (1-351)||(13942939-13943289)
chr3 (1-351)||(16379792-16380142)
chr3 (1-351)||(47124859-47125209)
chr3 (2-351)||(12179253-12179602)
chr3 (16-351)||(28755233-28755568)
chr3 (57-351)||(6151784-6152078)
chr3 (137-351)||(16258059-16258273)
chr3 (1-337)||(14087602-14087938)
chr3 (36-351)||(13319401-13319716)
chr3 (57-351)||(12793056-12793350)
chr3 (57-351)||(18750859-18751152)
chr3 (57-351)||(25767233-25767527)
chr3 (164-351)||(14574838-14575025)
chr3 (12-351)||(16328535-16328874)
chr3 (2-349)||(17187291-17187638)
chr3 (57-351)||(17194009-17194303)
chr3 (59-343)||(55514651-55514935)
chr3 (12-351)||(15014642-15014981)
chr3 (5-121)||(12887844-12887960)
chr3 (147-351)||(16337522-16337726)
chr3 (16-207)||(10384730-10384921)
chr3 (192-350)||(15095921-15096080)
chr3 (58-239)||(6711344-6711525)
chr3 (267-351)||(17493545-17493629)
chr3 (298-349)||(16755757-16755808)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (1-349)||(22135888-22136236)
chr5 (1-349)||(27611574-27611922)
chr5 (1-351)||(25427651-25428001)
chr5 (1-349)||(14998557-14998905)
chr5 (1-349)||(27667308-27667656)
chr5 (1-349)||(34567714-34568062)
chr5 (1-349)||(16357722-16358070)
chr5 (1-349)||(19771180-19771528)
chr5 (1-349)||(22331705-22332053)
chr5 (11-351)||(18777014-18777354)
chr5 (1-349)||(27684218-27684566)
chr5 (1-349)||(27519626-27519974)
chr5 (1-349)||(40710000-40710348)
chr5 (1-349)||(41772062-41772410)
chr5 (1-349)||(29474891-29475239)
chr5 (11-349)||(23574949-23575287)
chr5 (1-349)||(37290314-37290662)
chr5 (1-307)||(20800659-20800965)
chr5 (1-349)||(23441430-23441776)
chr5 (1-348)||(21562791-21563138)
chr5 (1-349)||(21338115-21338463)
chr5 (1-351)||(24619113-24619463)
chr5 (1-351)||(24715344-24715694)
chr5 (1-351)||(24748372-24748722)
chr5 (1-349)||(22463153-22463501)
chr5 (1-349)||(23472448-23472795)
chr5 (1-349)||(20822655-20823003)
chr5 (54-351)||(21936059-21936356)
chr5 (1-349)||(26737545-26737893)
chr5 (54-351)||(24582410-24582707)
chr5 (57-349)||(20466972-20467264)
chr5 (1-351)||(22234738-22235088)
chr5 (1-349)||(28893760-28894108)
chr5 (1-349)||(28922586-28922934)
chr5 (1-349)||(28915231-28915579)
chr5 (1-349)||(28930499-28930847)
chr5 (1-351)||(21871869-21872218)
chr5 (1-351)||(21876149-21876498)
chr5 (36-337)||(21679631-21679932)
chr5 (54-351)||(27012284-27012581)
chr5 (16-351)||(14885824-14886159)
chr5 (16-351)||(20343482-20343817)
chr5 (16-351)||(24797230-24797565)
chr5 (1-351)||(17268152-17268502)
chr5 (1-242)||(20777222-20777463)
chr5 (16-351)||(22503879-22504214)
chr5 (52-351)||(23078958-23079257)
chr5 (16-343)||(37542214-37542541)
chr5 (36-351)||(25849275-25849590)
chr5 (1-351)||(21408356-21408706)
chr5 (225-349)||(21882169-21882293)
chr5 (54-237)||(23504558-23504741)
chr5 (214-316)||(820-922)
chr5 (1-67)||(22349421-22349487)
chr5 (90-241)||(21624140-21624291)
chr5 (270-346)||(21497147-21497223)
chr5 (300-348)||(21830878-21830926)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (1-349)||(8051999-8052347)
chr4 (1-349)||(23957035-23957383)
chr4 (1-349)||(29037780-29038128)
chr4 (1-348)||(12524965-12525312)
chr4 (1-349)||(27712624-27712972)
chr4 (1-349)||(40474328-40474676)
chr4 (1-349)||(8387700-8388048)
chr4 (1-349)||(14302354-14302702)
chr4 (1-349)||(18614200-18614548)
chr4 (1-349)||(12477888-12478236)
chr4 (1-349)||(14681855-14682203)
chr4 (1-349)||(15146261-15146609)
chr4 (1-349)||(19777169-19777517)
chr4 (1-349)||(18298493-18298841)
chr4 (52-349)||(16353872-16354169)
chr4 (2-349)||(18225823-18226170)
chr4 (1-349)||(14160758-14161106)
chr4 (1-351)||(8707206-8707547)
chr4 (1-202)||(56566167-56566368)
chr4 (1-349)||(14849742-14850090)
chr4 (4-351)||(15071645-15071992)
chr4 (3-349)||(16153145-16153491)
chr4 (3-349)||(16148999-16149345)
chr4 (1-351)||(15247210-15247560)
chr4 (1-349)||(14695401-14695749)
chr4 (1-349)||(15002000-15002348)
chr4 (54-351)||(15291847-15292144)
chr4 (1-351)||(15357756-15358106)
chr4 (57-351)||(9292121-9292415)
chr4 (1-351)||(51605428-51605778)
chr4 (54-351)||(14998602-14998898)
chr4 (16-351)||(3263445-3263780)
chr4 (84-351)||(33224209-33224476)
chr4 (27-349)||(27901674-27901996)
chr4 (16-351)||(11205882-11206217)
chr4 (16-351)||(29452188-29452523)
chr4 (27-349)||(18548721-18549043)
chr4 (16-351)||(44660517-44660852)
chr4 (36-349)||(1647948-1648261)
chr4 (139-350)||(12341639-12341850)
chr4 (174-351)||(15320422-15320599)
chr4 (188-349)||(15413849-15414010)
chr4 (303-351)||(13248931-13248979)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (1-349)||(44384745-44385093)
chr2 (1-349)||(21144217-21144565)
chr2 (1-349)||(24263289-24263637)
chr2 (1-349)||(22324032-22324380)
chr2 (1-349)||(27372188-27372536)
chr2 (1-349)||(10869769-10870117)
chr2 (1-349)||(16926279-16926627)
chr2 (1-349)||(16999919-17000267)
chr2 (1-349)||(24710953-24711301)
chr2 (1-349)||(27218935-27219283)
chr2 (1-351)||(23106906-23107256)
chr2 (1-349)||(41607561-41607909)
chr2 (1-349)||(21324442-21324790)
chr2 (1-349)||(24875926-24876273)
chr2 (1-349)||(24676408-24676756)
chr2 (2-349)||(24706659-24707006)
chr2 (1-351)||(23111653-23112003)
chr2 (86-349)||(16923808-16924071)
chr2 (86-349)||(16983071-16983334)
chr2 (1-250)||(23072881-23073130)
chr2 (1-349)||(23099194-23099542)
chr2 (1-351)||(23277693-23278043)
chr2 (57-351)||(12639465-12639759)
chr2 (1-351)||(19651226-19651576)
chr2 (1-300)||(25264022-25264321)
chr2 (1-351)||(23294852-23295202)
chr2 (52-351)||(45533262-45533561)
chr2 (1-351)||(12575270-12575620)
chr2 (171-349)||(17064636-17064814)
chr2 (19-351)||(20829176-20829508)
chr2 (1-349)||(27209348-27209696)
chr2 (1-351)||(31831575-31831925)
chr2 (54-351)||(24830417-24830714)
chr2 (1-337)||(27788671-27789007)
chr2 (16-351)||(1064668-1065003)
chr2 (57-348)||(22279025-22279316)
chr2 (52-351)||(24949507-24949806)
chr2 (84-348)||(22760828-22761092)
chr2 (147-334)||(30011506-30011693)
chr2 (57-351)||(24568900-24569194)
chr2 (57-351)||(25129526-25129820)
chr2 (147-334)||(30210240-30210427)
chr2 (255-351)||(23067308-23067403)
chr2 (1-75)||(9485409-9485483)
chr2 (195-291)||(17967134-17967230)
chr2 (137-224)||(25133705-25133792)
chr2 (54-118)||(17965081-17965145)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (1-351)||(30262-30612)
scaffold0026 (1-310)||(50168-50477)
scaffold0026 (149-351)||(29374-29576)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-349)||(8685-9033)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (1-349)||(16973-17321)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (1-349)||(33389737-33390085)
chr1 (1-351)||(430824-431174)
chr1 (1-349)||(21750243-21750591)
chr1 (1-349)||(21831606-21831954)
chr1 (1-349)||(21838253-21838602)
chr1 (1-349)||(41352370-41352718)
chr1 (1-349)||(16349304-16349652)
chr1 (1-349)||(19107671-19108019)
chr1 (29-351)||(22360980-22361302)
chr1 (1-349)||(51332201-51332549)
chr1 (1-349)||(21025476-21025824)
chr1 (1-349)||(17043723-17044071)
chr1 (1-349)||(21234439-21234787)
chr1 (1-334)||(24793325-24793658)
chr1 (1-351)||(21744260-21744610)
chr1 (1-351)||(20834608-20834958)
chr1 (1-351)||(23196957-23197304)
chr1 (54-351)||(20830153-20830450)
chr1 (1-351)||(19855606-19855956)
chr1 (144-349)||(22110325-22110530)
chr1 (144-349)||(22114174-22114379)
chr1 (21-349)||(20855488-20855816)
chr1 (36-351)||(24098346-24098661)
chr1 (2-351)||(19661845-19662195)
chr1 (12-351)||(20938782-20939121)
chr1 (1-337)||(20060660-20060996)
chr1 (16-351)||(21952210-21952545)
chr1 (202-351)||(16373831-16373980)
chr1 (57-351)||(22134321-22134615)
chr1 (16-343)||(31538720-31539047)
chr1 (16-351)||(37678381-37678716)
chr1 (173-349)||(19759753-19759929)
chr1 (1-207)||(16377587-16377793)
chr1 (57-351)||(20914902-20915196)
chr1 (29-218)||(50619121-50619309)
chr1 (16-351)||(20295713-20296048)
chr1 (137-295)||(41216701-41216859)
chr1 (12-217)||(52987206-52987412)
chr1 (267-349)||(16077630-16077712)
chr1 (3-88)||(22116477-22116562)
[»] scaffold0358 (3 HSPs)
scaffold0358 (21-351)||(7366-7696)
scaffold0358 (21-156)||(16757-16892)
scaffold0358 (285-349)||(3532-3596)
[»] chr6 (66 HSPs)
chr6 (1-351)||(25608642-25608992)
chr6 (1-349)||(2873584-2873932)
chr6 (1-349)||(27188588-27188936)
chr6 (1-349)||(27260304-27260652)
chr6 (1-351)||(18406725-18407075)
chr6 (1-351)||(22761236-22761586)
chr6 (1-349)||(5838000-5838348)
chr6 (1-351)||(28261978-28262328)
chr6 (1-351)||(28340727-28341077)
chr6 (1-349)||(22435021-22435369)
chr6 (1-349)||(22443419-22443767)
chr6 (1-349)||(29590701-29591049)
chr6 (3-349)||(16962228-16962574)
chr6 (1-351)||(19865837-19866187)
chr6 (1-349)||(16926419-16926769)
chr6 (11-349)||(25113704-25114042)
chr6 (58-349)||(24312006-24312297)
chr6 (1-351)||(23079619-23079969)
chr6 (1-246)||(16621861-16622106)
chr6 (1-349)||(27564612-27564950)
chr6 (1-348)||(18196514-18196861)
chr6 (104-349)||(1541968-1542213)
chr6 (1-351)||(19488053-19488403)
chr6 (1-351)||(21472751-21473101)
chr6 (1-351)||(5295987-5296337)
chr6 (1-238)||(21754481-21754714)
chr6 (1-349)||(15460488-15460836)
chr6 (1-351)||(14378697-14379048)
chr6 (1-351)||(14380247-14380598)
chr6 (154-348)||(20636235-20636429)
chr6 (54-351)||(16381207-16381504)
chr6 (1-187)||(25764009-25764195)
chr6 (54-351)||(16648803-16649100)
chr6 (12-349)||(21568783-21569120)
chr6 (1-159)||(20634721-20634879)
chr6 (54-351)||(1647648-1647945)
chr6 (140-349)||(15897246-15897454)
chr6 (85-349)||(21562997-21563261)
chr6 (16-351)||(10467645-10467980)
chr6 (1-351)||(28281594-28281944)
chr6 (1-337)||(18795854-18796190)
chr6 (16-351)||(24365562-24365897)
chr6 (57-351)||(18836745-18837039)
chr6 (54-351)||(23997398-23997695)
chr6 (58-351)||(18966133-18966423)
chr6 (22-337)||(34644388-34644703)
chr6 (57-351)||(16234178-16234472)
chr6 (22-349)||(19880450-19880777)
chr6 (137-351)||(14624274-14624488)
chr6 (1-239)||(19436264-19436502)
chr6 (132-351)||(19454570-19454789)
chr6 (84-351)||(14129619-14129886)
chr6 (57-348)||(35274923-35275214)
chr6 (137-351)||(21928355-21928569)
chr6 (59-253)||(16099257-16099451)
chr6 (57-258)||(18574432-18574633)
chr6 (160-351)||(18449660-18449851)
chr6 (57-348)||(23026553-23026844)
chr6 (255-349)||(16625752-16625846)
chr6 (275-349)||(22077745-22077819)
chr6 (186-351)||(19986388-19986553)
chr6 (272-351)||(18572803-18572882)
chr6 (221-351)||(8761934-8762064)
chr6 (1-62)||(24294563-24294624)
chr6 (288-335)||(27688210-27688257)
chr6 (303-351)||(16099200-16099248)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (2-351)||(38588-38937)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (1-349)||(7292-7640)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-349)||(8258-8606)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-349)||(7726-8074)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (1-351)||(83-433)
scaffold0319 (1-351)||(2586-2936)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-350)||(16254-16603)
scaffold0028 (1-349)||(9793-10141)
scaffold0028 (1-349)||(44470-44818)
scaffold0028 (1-337)||(49153-49489)
scaffold0028 (137-351)||(105348-105562)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (1-351)||(18980-19330)
scaffold0114 (1-351)||(21204-21554)
scaffold0114 (85-351)||(45834-46100)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-349)||(6540-6888)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (16-351)||(7689-8024)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-351)||(6970-7320)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (4-351)||(2753-3100)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (1-351)||(13375-13729)
scaffold0120 (1-349)||(7339-7687)
scaffold0120 (1-351)||(191-541)
scaffold0120 (57-351)||(23493-23787)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (3-351)||(13852-14200)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (1-349)||(25584-25931)
scaffold0243 (57-351)||(799-1093)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-349)||(112127-112475)
scaffold0040 (11-351)||(16194-16534)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (1-334)||(8298-8631)
scaffold0647 (1-351)||(2225-2568)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (1-349)||(32212-32560)
scaffold0109 (129-349)||(9915-10135)
scaffold0109 (12-128)||(39693-39809)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-349)||(1737-2085)
scaffold0044 (1-349)||(15477-15825)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (1-347)||(23712-24058)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-351)||(108450-108800)
scaffold0029 (1-337)||(113890-114226)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (1-349)||(28007-28355)
scaffold0023 (57-351)||(54636-54930)
scaffold0023 (1-205)||(3144-3348)
scaffold0023 (12-353)||(60068-60409)
scaffold0023 (287-350)||(3381-3444)
scaffold0023 (297-351)||(131423-131477)
scaffold0023 (42-92)||(150690-150740)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-347)||(102554-102900)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (38-351)||(39874-40187)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-349)||(2212-2560)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (1-349)||(8716-9064)
scaffold0080 (1-277)||(49481-49757)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-349)||(3992-4340)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-349)||(38459-38807)
scaffold0042 (1-349)||(66724-67072)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (1-349)||(57336-57684)
scaffold0017 (1-349)||(18706-19054)
scaffold0017 (1-349)||(196126-196465)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-349)||(29210-29558)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (1-349)||(3513-3861)
[»] scaffold0081 (4 HSPs)
scaffold0081 (1-349)||(19921-20269)
scaffold0081 (1-349)||(35345-35693)
scaffold0081 (64-349)||(50751-51036)
scaffold0081 (228-344)||(330-446)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (2-349)||(7333-7680)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (1-349)||(202107-202455)
scaffold0004 (1-351)||(324021-324371)
scaffold0004 (60-349)||(118545-118834)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (1-349)||(706-1054)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (66-349)||(31457-31740)
scaffold0180 (1-252)||(34390-34641)
scaffold0180 (52-351)||(12217-12516)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (1-290)||(2959-3248)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-348)||(6070-6417)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (106-349)||(79238-79481)
scaffold0022 (29-207)||(55230-55407)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (1-251)||(469-719)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-351)||(15429-15779)
scaffold0266 (57-351)||(8556-8850)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (2-351)||(41015-41363)
scaffold0102 (57-239)||(47108-47289)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (1-205)||(16103-16307)
scaffold0309 (1-351)||(11110-11460)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (1-349)||(5190-5538)
scaffold0270 (1-349)||(12320-12668)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (1-351)||(2911-3261)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (1-343)||(5101-5443)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (1-351)||(29924-30274)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-351)||(39399-39748)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (1-350)||(1187-1536)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-349)||(13787-14135)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-349)||(3233-3581)
scaffold0010 (15-351)||(46052-46388)
scaffold0010 (16-351)||(40987-41322)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (129-349)||(277597-277817)
scaffold0005 (74-351)||(261625-261902)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (1-220)||(1-220)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (1-351)||(2124-2474)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-349)||(218059-218404)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (57-350)||(22880-23173)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (1-250)||(55630-55879)
scaffold0031 (13-351)||(108947-109285)
scaffold0031 (244-349)||(62913-63018)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (1-349)||(6530-6878)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (1-349)||(16616-16964)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (126-346)||(12756-12976)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (2-316)||(23719-24033)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (1-351)||(5747-6097)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-351)||(13517-13867)
scaffold0124 (54-347)||(6500-6793)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (1-351)||(23531-23881)
scaffold0104 (171-351)||(20711-20891)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (1-351)||(47673-48023)
scaffold0053 (1-351)||(56486-56836)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (1-337)||(18680-19016)
scaffold0244 (57-351)||(25472-25766)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-349)||(9447-9795)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (1-349)||(25172-25520)
scaffold0011 (1-351)||(194343-194693)
scaffold0011 (1-351)||(149887-150236)
scaffold0011 (57-351)||(181241-181535)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (1-351)||(295-645)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-351)||(48421-48771)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-351)||(32728-33078)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (1-351)||(5728-6080)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (1-350)||(1994-2343)
scaffold0222 (36-350)||(8378-8693)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (36-351)||(44100-44415)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (16-351)||(80486-80821)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (1-351)||(3493-3843)
[»] scaffold0509 (2 HSPs)
scaffold0509 (1-251)||(1617-1867)
scaffold0509 (1-251)||(8045-8295)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-351)||(50514-50864)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (1-350)||(1493-1842)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (54-351)||(2567-2864)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (1-182)||(8332-8513)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (54-351)||(24711-25008)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (54-351)||(14225-14522)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (54-351)||(41575-41872)
scaffold0076 (16-351)||(55554-55889)
scaffold0076 (1-337)||(32316-32652)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (2-182)||(1416-1596)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (16-351)||(6799-7134)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (152-351)||(10286-10485)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (27-349)||(1202-1524)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (1-343)||(612-954)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (1-351)||(327-676)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-351)||(4429-4779)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (1-351)||(20437-20787)
scaffold0058 (147-316)||(57976-58145)
scaffold0058 (195-278)||(75948-76031)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-351)||(4975-5325)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (1-351)||(42234-42584)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (27-349)||(68689-69011)
scaffold0034 (1-351)||(3592-3942)
scaffold0034 (1-350)||(12547-12896)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-346)||(34792-35137)
scaffold0139 (225-346)||(28539-28660)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (129-349)||(3172-3392)
[»] scaffold0367 (2 HSPs)
scaffold0367 (15-351)||(5891-6227)
scaffold0367 (154-241)||(1-88)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (1-349)||(115544-115892)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (16-279)||(35-298)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (4-349)||(15123-15469)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (1-351)||(11425-11775)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (1-315)||(27977-28291)
scaffold0067 (36-351)||(59888-60203)
scaffold0067 (36-351)||(50854-51169)
scaffold0067 (36-351)||(66276-66591)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (1-337)||(6544-6880)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (1-337)||(10528-10864)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (57-348)||(19367-19658)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (1-348)||(12938-13285)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-351)||(27841-28192)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (1-351)||(641-991)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (1-351)||(10696-11046)
scaffold0298 (1-351)||(14466-14816)
scaffold0298 (1-279)||(21372-21650)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (54-351)||(6491-6788)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (57-349)||(13776-14068)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (16-351)||(1488-1823)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (16-351)||(249930-250265)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (57-351)||(8582-8876)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (1-351)||(4066-4416)
scaffold0035 (27-349)||(11861-12183)
scaffold0035 (1-351)||(42746-43096)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (54-351)||(779-1076)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-349)||(17856-18202)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (16-346)||(284-614)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-351)||(35430-35780)
[»] scaffold0077 (4 HSPs)
scaffold0077 (137-351)||(16339-16553)
scaffold0077 (137-348)||(25657-25868)
scaffold0077 (57-351)||(26961-27255)
scaffold0077 (1-242)||(20216-20457)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (113-351)||(177013-177251)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (57-351)||(25143-25437)
scaffold0008 (137-351)||(133264-133478)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (15-351)||(15366-15702)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (1-351)||(100201-100551)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (52-337)||(6375-6660)
scaffold0117 (186-349)||(248-411)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-349)||(10096-10444)
scaffold0235 (1-349)||(20310-20658)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (1-351)||(31958-32308)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (57-351)||(72506-72799)
scaffold0021 (57-351)||(32108-32402)
scaffold0021 (84-351)||(15748-16015)
scaffold0021 (84-351)||(25279-25546)
scaffold0021 (137-295)||(6584-6742)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (1-351)||(318-661)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (161-349)||(39698-39886)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (84-351)||(10611-10878)
[»] scaffold0149 (4 HSPs)
scaffold0149 (10-247)||(5997-6233)
scaffold0149 (10-247)||(10428-10664)
scaffold0149 (296-351)||(6264-6319)
scaffold0149 (296-351)||(10695-10750)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (57-345)||(13509-13797)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (137-351)||(2727-2941)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (16-337)||(20180-20501)
scaffold0090 (16-337)||(24342-24663)
[»] scaffold0876 (3 HSPs)
scaffold0876 (57-348)||(3864-4155)
scaffold0876 (215-341)||(1772-1898)
scaffold0876 (55-193)||(1639-1777)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (84-351)||(7612-7879)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (54-322)||(343-611)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (1-120)||(3474-3593)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-351)||(85158-85508)
scaffold0007 (160-258)||(92827-92925)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (16-351)||(28250-28585)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (205-349)||(9859-10003)
scaffold0083 (1-178)||(9672-9850)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (57-295)||(11405-11643)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (138-351)||(2905-3118)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (1-178)||(13978-14155)
scaffold0261 (1-178)||(22157-22334)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-184)||(492389-492572)
scaffold0001 (228-351)||(89311-89434)
scaffold0001 (228-351)||(89989-90112)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (180-349)||(2148-2317)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (57-238)||(1497-1678)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (210-351)||(45662-45803)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (210-351)||(96481-96622)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (221-351)||(4311-4441)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (192-353)||(8897-9058)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (264-349)||(26293-26378)
[»] scaffold0405 (2 HSPs)
scaffold0405 (159-247)||(7-95)
scaffold0405 (1-112)||(94-205)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (185-348)||(24699-24862)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (255-349)||(24786-24880)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (129-207)||(34675-34753)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-118)||(194796-194913)
[»] scaffold0387 (2 HSPs)
scaffold0387 (137-247)||(15479-15589)
scaffold0387 (267-344)||(15390-15467)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (288-349)||(5350-5411)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (193-349)||(64-220)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (267-350)||(8490-8573)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 320682 - 321030
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  320682 gtgatgcgttcaagttgggcttaggtggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 320781  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  320782 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatgaagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 320881  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  320882 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 320981  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  320982 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 321030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8200253 - 8199905
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  8200253 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 8200154  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200153 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 8200054  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  8200053 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 8199954  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8199953 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 8199905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14334021 - 14333673
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14334021 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 14333922  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14333921 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagc 14333822  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  14333821 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 14333722  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14333721 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 14333673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8709230 - 8708882
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8709230 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 8709131  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8709130 tacgcatgatctcgagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagt 8709031  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  8709030 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 8708931  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8708930 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtc 8708882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 11235858 - 11236206
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11235858 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 11235957  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11235958 tacgcatgatctcgagttggcggctgtcgtctttgtattgaagatatggaggcattacttgtatggttcgagatttaaggtgtttagtgatcacaagagt 11236057  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  11236058 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 11236157  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11236158 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 11236206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 15159702 - 15160050
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15159702 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcc 15159801  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159802 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 15159901  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  15159902 ttgaagtatttattcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggta 15160001  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15160002 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 15160050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 15147530 - 15147880
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15147530 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaaggagtagcctatgcttcaagacggttgagaattcacgagaagaattaccc 15147629  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||| || |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15147630 tacgcacgatttagaattagttgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagt 15147729  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15147730 ttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaaagaatttgattttgagttgagctatcatccaggta 15147829  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15147830 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtctg 15147880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 18550403 - 18550751
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18550403 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 18550502  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18550503 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagataaggagacattacttgtatgattcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagt 18550602  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  18550603 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 18550702  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18550703 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtc 18550751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 23202258 - 23202606
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  23202258 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcgagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 23202357  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23202358 tacgcatgatcttgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgagatttggggtgtttagtgatcacaagagt 23202457  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||   ||||||||||||    
T  23202458 ttgaaatatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggta 23202557  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23202558 aagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 23202606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 23508385 - 23508733
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  23508385 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcgagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 23508484  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23508485 tacgcatgatcttgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgagatttggggtgtttagtgatcacaagagt 23508584  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||   ||||||||||||    
T  23508585 ttgaaatatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggta 23508684  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23508685 aagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 23508733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13687689 - 13687341
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13687689 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcc 13687590  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13687589 tacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 13687490  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  13687489 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggta 13687390  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13687389 aagctaatgttgttgcatatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 13687341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 44789996 - 44790344
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  44789996 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttacgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 44790095  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44790096 tacgcatgatctcgagttgacggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 44790195  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  44790196 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 44790295  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  44790296 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 44790344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 15963 - 16311
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15963 gtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagagggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcgtgagaagaattaccc 16062  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||    
T  16063 gacacatgatttagagttggcggctctagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaacagt 16162  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  16163 ttgaagtatttgtttgatcagaagaaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 16262  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  16263 aagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtc 16311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14041320 - 14040974
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  14041320 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcgtcgagacagttgagaattcatgaacgaaattaccc 14041221  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| ||||||||||| || || || ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14041220 tacgcacgatttagagttagctgcagtggtcgttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaagagt 14041121  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||    
T  14041120 ttgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggta 14041021  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatg 347  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14041020 aagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatg 14040974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14351350 - 14351004
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  14351350 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcgtcgagacagttgagaattcatgaacgaaattaccc 14351251  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| ||||||||||| || || || ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14351250 tacgcacgatttagagttagctgcagtggtcgttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaagagt 14351151  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||    
T  14351150 ttgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggta 14351051  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatg 347  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14351050 aagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatg 14351004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14956179 - 14955831
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||| | || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14956179 gtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaaaaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattacct 14956080  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956079 gacgcatgatctagagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatgggtcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 14955980  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||| | || |||||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  14955979 ttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaggta 14955880  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14955879 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 14955831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9597682 - 9597334
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9597682 gtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 9597583  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  9597582 gacgcatgatttagagttggcagctgtggtctttgtattgaagatattgagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagc 9597483  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | ||| | || ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  9597482 ttgaggtatttgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaactactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 9597383  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||    
T  9597382 aagctaatgttgttgcagatgccttgagcatgaagacattgcatatgtc 9597334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 11551747 - 11552095
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551747 gtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 11551846  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11551847 gacacatgatctagagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggaaacattacttgtatggtttgagatttgaggtatttagtgatcacaagagt 11551946  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| || |||||| | ||||  ||||  |||||||  ||||    
T  11551947 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattataactttggtttgaattatcatctaggta 11552046  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  11552047 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaaaaagacattgcatatgtc 11552095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12689126 - 12688777
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12689126 gtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 12689027  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  12689026 gacgcatgatctagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtctgaagtgtttagcgatcacaagagt 12688927  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaaga-ttatgattttgaattgagctatcatccgggt 299  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||| | || || |||||| ||||  ||||  |||||||| |||    
T  12688926 ttgaagtatttgttcaatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaggatttatgactttggtttgaattatcatccaggt 12688827  T
Q  300 aaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12688826 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 12688777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14213299 - 14212951
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14213299 gtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgaaagatggtaaagtggtagcttatgtctcaagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 14213200  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14213199 gacgcatgacttagaattggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattagttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagt 14213100  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  14213099 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaaaatgaggcaaagaagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 14213000  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  14212999 aagctaattttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtc 14212951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18179370 - 18179019
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggctta-gga-ggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttga-gaattcatgagaagaatta 97  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  18179370 gtgatgcgtccaagttgggtttaaggatggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttgatgagttcatgagatgaatta 18179271  T
Q  98 ccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaag 197  Q
     || | ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  18179270 tcccacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgattacaag 18179171  T
Q  198 agtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgg 297  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| |    
T  18179170 agtttgaagtatttgttctatcagaaggaattgaacatgaggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccag 18179071  T
Q  298 gtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18179070 gtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 18179019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 11770886 - 11771234
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    ||||||||    
T  11770886 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaagtagtagcttatgcatcaagacagttggggattcatgaacgaaattaccc 11770985  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||| || || || || |||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  11770986 tatgcatgatttagagttagctgcagtggtttttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagt 11771085  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||  | ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||    
T  11771086 ttgaaatatctatttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggctcgaatttttgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggta 11771185  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11771186 aagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagatgttgcatatgtc 11771234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19148837 - 19148487
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  19148837 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 19148738  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  19148737 tacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagt 19148638  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || || |||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  19148637 ttgaaatatttgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggta 19148538  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  19148537 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 19148487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20748236 - 20747886
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  20748236 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcatatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 20748137  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  20748136 tacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagt 20748037  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || || |||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  20748036 ttgaaatatttgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggta 20747937  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  20747936 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 20747886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 12205423 - 12205768
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||    
T  12205423 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatagtaaggtggtagcttatgcttcgagacaattgaggattcatgagcggaattatcc 12205522  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| || || || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  12205523 tacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgtgttaaaaatttggagaccttatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagt 12205622  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| | || || |||||||||   || |  |||||||||||||    
T  12205623 ttgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggta 12205722  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatat 346  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12205723 aagccaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 12205768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 136 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10872485 - 10872272
Alignment:
Q  136 tattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10872485 tattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatat 10872386  T
Q  236 gaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaag 335  Q
    ||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  |||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10872385 gagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttgggttggattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaag 10872286  T
Q  336 actttgcatatgtc 349  Q
    || |||||||||||    
T  10872285 acattgcatatgtc 10872272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 11387051 - 11387399
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| ||    
T  11387051 gtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctagacaactgagagttcatgagaagaattatcc 11387150  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |||    
T  11387151 tacccatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcataaaagt 11387250  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  | || ||||||||||||| |||||  || ||||||||||    
T  11387251 ttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagagaaggtggcttgaattattgaaggattatgattttggattgaattaccatccgggta 11387350  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  11387351 aagctaatgtagttgtagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtc 11387399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15205244 - 15204894
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||   ||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    ||||| ||    
T  15205244 gtgatgcgcccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggataataatgtagttgcttatgcatcgaggcagttgagaattcatgaacgaaattatcc 15205145  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | || || || || || ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| || |||    
T  15205144 tactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgctcagtgatcataaaagt 15205045  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  15205044 ctgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggctcgaattgctgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggta 15204945  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15204944 aagctaacgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttacatatgtctg 15204894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15342057 - 15341707
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||||| ||    
T  15342057 gtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagagggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgatgattcatgaaaagaattatcc 15341958  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15341957 tacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatctgtatggttccaaatttgaggtgttcagtgatcacaagagt 15341858  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| ||||||||||| ||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  15341857 ctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattattattttggtttgaattaccatcctggta 15341758  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||  ||||||||||||    
T  15341757 aagctaatgtagttgctgatgcattgagcaggaagacgctgcatatgtctg 15341707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 15101226 - 15101576
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||||| ||    
T  15101226 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttaatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggaatcatgaaaagaattatcc 15101325  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||||||||| || || ||  | ||||| ||  | || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  15101326 tacacatgatttagagttagctgcggtgatttttgttttataaatttggaggcattatttgtacgattccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagt 15101425  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  15101426 ctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 15101525  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||    
T  15101526 aagctaatgtggttgcagatgctctgagcaggaagacgttgcatatgtctg 15101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7825472 - 7825175
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| |||||||    
T  7825472 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagac 7825373  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  7825372 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 7825273  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  7825272 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 7825175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 27106472 - 27106769
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| |||||||    
T  27106472 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagac 27106571  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  27106572 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 27106671  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  27106672 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 27106769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27171853 - 27171556
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| |||||||    
T  27171853 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagac 27171754  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  27171753 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 27171654  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  27171653 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 27171556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 14262867 - 14263216
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |     
T  14262867 gtgatgcgtccaagttgggcttagatggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatct 14262966  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  14262967 tacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagt 14263066  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||| | ||| |||||||| | || || ||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || || ||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  14263067 ttgtaatatctgtttgataaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggta 14263166  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtct 350  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  14263167 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtct 14263216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 16070918 - 16071268
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||  | |||| |||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  16070918 gtgatgcatccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcgagatgacaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 16071017  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  16071018 tacacatgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagt 16071117  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| | |||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || |||||||||||||  ||||  || ||| | ||||    
T  16071118 ttgaaatatctatttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggta 16071217  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  16071218 aagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacattgcacatgtctg 16071268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13667162 - 13666813
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  13667162 tgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctagacagttgaggatacatgaaaagaattatcct 13667063  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    | ||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||     
T  13667062 acgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtc 13666963  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||  || | || ||||||||||||   ||||  || |||||  ||||    
T  13666962 taaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatcctagtaa 13666863  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||| || || |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  13666862 agccaacgtggttgcaaatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctg 13666813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 14284999 - 14285349
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| ||||  ||||||| |||||||| ||    
T  14284999 gtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagggttcatgaaaagaattatcc 14285098  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||    
T  14285099 tactcacgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgtagtattcagtgatcacaagagt 14285198  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||  || ||||||||||||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  14285199 ctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatcctggta 14285298  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||  ||||||||||||    
T  14285299 aagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacactgcatatgtctg 14285349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 18052576 - 18052926
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||  ||||  | || || |||||||| ||    
T  18052576 gtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttaatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaaagaattatcc 18052675  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  18052676 cactcatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagc 18052775  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| | ||  || ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||| |    
T  18052776 ttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggca 18052875  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||||||  | ||||||||||    
T  18052876 aagctaatgtagtcgcggatgctttgagtaggaagacactccatatgtctg 18052926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19614301 - 19613965
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| ||||| | ||||| |||||||| ||    
T  19614301 gtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagagtgcatgaaaagaattatcc 19614202  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  || |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||     
T  19614201 tactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagc 19614102  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||  |  | || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  19614101 ttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggta 19614002  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  19614001 aagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 19613965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 16949110 - 16949445
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || |  |||||||| ||    
T  16949110 tgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagctaatgcttctaggcagttgagagttcatgagaagaattatcccactcatgatttgga 16949209  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||||||  | || || ||||| || || || | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||    
T  16949210 gttggctacggtggtgtttgttttaaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttattt 16949309  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||| |||||| | ||||| ||||    
T  16949310 tatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaaaccaatgtggttg 16949409  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  16949410 ctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctg 16949445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 30 - 344
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||    
T  30 tgatgcgtctaagctgggcttaggttgtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaattgaggatacatgagaagaattatcct 129  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    | ||||||| | |||||||| || ||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| || || |    
T  130 acgcatgatctggagttggctgcggtattgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttcctgattcgaggtgttcagtgatcataaaagct 229  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| || | || |||||||||||||  ||||  || ||||| |||||    
T  230 tgaaatatttatttgattagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaa 329  T
Q  302 agctaatgttgttgc 316  Q
    ||| |||||||||||    
T  330 agccaatgttgttgc 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 349
Target Start/End: Original strand, 39817 - 40139
Alignment:
Q  27 ggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctg 126  Q
    |||||||| |||||||||||  |  |||| |||||||| ||||||||  | |  |||||||||| ||||||||| |  |||||| | ||||| || ||||    
T  39817 ggtgtgcttatgcaagatgggcatgtggtggcttatgcctcgagacaactaaagattcatgagaggaattacccgacacatgatatggagttagcagctg 39916  T
Q  127 tagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaagga 226  Q
    |||| |||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  39917 tagtgtttgtacttaaggtatggagacattatttgtatgggtcaaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaagga 40016  T
Q  227 attgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgcctta 326  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||| || |||||||||||| |||| |||||||| || || || ||||| || || ||||||||     
T  40017 gttgaatatgagacagcggagatggttggaattcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccaggaaaggccaatgtagtagctgatgccttg 40116  T
Q  327 agtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||| | ||||| |||||    
T  40117 agtaggaagtccttgcacatgtc 40139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 23504493 - 23504843
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||  ||||  | ||||| |||||||| ||    
T  23504493 gtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcatgaaaagaattatcc 23504592  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  || ||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  23504593 cactcacgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagc 23504692  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||| | ||  || ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||| |    
T  23504693 ttgaaatatttgtttgatcagaaggaattaaacatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggca 23504792  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  23504793 aagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacgctgcatatgtctg 23504843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12458215 - 12457916
Alignment:
Q  52 tggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggag 151  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| || || || ||||| || || || |||||    
T  12458215 tggtagcatatgcttctaggcagttgaggatacatgagaagaattatcctacgcatgatctagagttggctgcggtggtatttgttttaaaaatttggag 12458116  T
Q  152 acattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtgg 251  Q
     ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||    
T  12458115 gcattatttgtacggttccagatttaaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaaaatgaggcaaaggagatgg 12458016  T
Q  252 ttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    || || || || || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||||||||    
T  12458015 ttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcagaaaaacattgcatatgtctg 12457916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 11304901 - 11305236
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  11304901 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 11305000  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  11305001 gttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 11305100  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || || |||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  11305101 gaccagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttg 11305200  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  11305201 ctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctg 11305236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 13967306 - 13967641
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||| | ||    
T  13967306 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgatctgga 13967405  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
     ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  13967406 attggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgagatgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 13967505  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| || ||  | || |||||||||||||  || |  || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  13967506 gaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttattgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaggccaatgttgttg 13967605  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| ||||   |||| |||||||| |||||||    
T  13967606 ctgatgctttaacccggaaaactttgcacatgtctg 13967641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 49153912 - 49153577
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || || |||||  |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  49153912 tgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcctctaggcagttacgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 49153813  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  49153812 gttagctgcggtagtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttattt 49153713  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || ||||||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  49153712 gaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 49153613  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| || || |||||||| |||||||| |||||||    
T  49153612 cggacgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctg 49153577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13022968 - 13022633
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||||| |  |    
T  13022968 tgggcttaggtggtgttcttatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgaggattcatgagaagaattatcttactcatgatctgta 13022869  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||||||  | || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||    
T  13022868 gttggcttcggtggtgtttgtttttaaaatttggaggcattatttgtacgtttccagatttgatgtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttgttt 13022769  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || || || |||||||| ||||| ||||    
T  13022768 gatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttg 13022669  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || ||||| || || ||||||||||    
T  13022668 ctgatgcgttgagcaggaaaacattacatatgtctg 13022633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17925220 - 17924926
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| || ||||||| | | ||||||||||| || |  |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| ||||    
T  17925220 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaactatctgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 17925121  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  ||| |||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  17925120 atctgtttggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaatgtggttgaa 17925021  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
     |  || || ||||  |||||| | ||||| |||||||| || || |  ||||||||||  || || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  17925020 gtatcttaaggatttcgattttcagttgagttatcatcctgggaaggaaaatgttgttgtcgacgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 17924926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4441497 - 4441208
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| || || |||| | | ||||||||||| || || |  ||||||||||| |||||  | || || | || ||||||||| ||||||||||    
T  4441497 gcttatgcttcaaggcaattgaaagtgcatgagaagaactatccgactcatgatttagaattggcaacagttgtgtatgcattgaagatttggagacatt 4441398  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||   |||| ||||| ||    
T  4441397 atctgtatggttctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggccaagaagatggttaga 4441298  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatat 346  Q
    ||  |  |  ||||  || ||| | ||||| ||||| || || || || ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4441297 atatcctacggatttcgactttcagttgagttatcaccccgggaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtaggaagactttgcatat 4441208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 26117228 - 26117578
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  26117228 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 26117327  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccaga---------------tttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||               ||||||||||| |||||||| || |||    
T  26117328 gttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagatttgaggtgttcagtgatcataaaagt 26117427  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| | || ||||| || || || || |||||||||||||  ||||  || |||||||||     
T  26117428 ctgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtt 26117527  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||    
T  26117528 aagccaatgttgtggctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctg 26117578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15626010 - 15625900
Alignment:
Q  141 aagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggc 240  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15626010 aagatttggagacattatttatatggttctagatttgaagtgttcagtgatcacaaaagtctaaagtatttgtttgatcagaaggaattaaatacgaggc 15625911  T
Q  241 agcgaaggtgg 251  Q
    || ||||||||    
T  15625910 agggaaggtgg 15625900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14937915 - 14937622
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| || ||||||| | | ||||||||||| || || |  |||||||| || ||||| || || |  | || ||||| ||| ||||| ||||    
T  14937915 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaactatccgactcatgatttggaattggcggcagttgagtatgcattga-gatttggaggcatt 14937817  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  14937816 atctttatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaaaagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttgga 14937717  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
     |  || || ||||  |||||| | ||||| |||||||| || || || ||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  14937716 gtatcttaaggatttcgattttcagttgagttatcatcctggaaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcaaatgtctg 14937622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15365508 - 15365215
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| || ||||||| | | ||||||||||| || || |  |||||||| || ||||| || || |  | || ||||| ||| ||||| ||||    
T  15365508 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaaatatccgactcatgatttggaattggcggcagttgagtatgcattga-gatttggaggcatt 15365410  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  15365409 atctttatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaaaagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttgga 15365310  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
     |  || || ||||  |||||| | ||||| |||||||| || || || ||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  15365309 gtatcttaaggatttcgattttcagttgagttatcatcctggaaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcaaatgtctg 15365215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23643012 - 23642791
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||| | ||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||| ||| || ||||| || || || ||||| |||||||| ||  | ||||    
T  23643012 gcttatacgtcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgttttggaattggctgcagttgtgtttgtgttgaagatttgacggcatt 23642913  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    | ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||| |    
T  23642912 atttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgatcacacaagtttgaagtatttgtttgactagaaggagttgaatatgagacagagaagattgttgaa 23642813  T
Q  257 attgctaaaagattatgatttt 278  Q
    ||| || || ||||||||||||    
T  23642812 atttcttaaggattatgatttt 23642791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 278
Target Start/End: Original strand, 15717673 - 15717825
Alignment:
Q  126 gtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaagg 225  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| |||||   ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15717673 gtagtgtttgtgttgaagatttggaggcactacttgtatggttctaagtttgaagtgttcgatgaccacaagagtttgaagtacttgttcgatcagaagg 15717772  T
Q  226 aattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgatttt 278  Q
    | ||||||| |||| || | | || |||| |||| || |||||||| ||||||    
T  15717773 agttgaataagaggtagaggaagttgttgaaatttcttaaagattacgatttt 15717825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 308
Target Start/End: Original strand, 15122739 - 15122858
Alignment:
Q  189 gatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagct 288  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||  | |||||||| ||||| |  || |||||| ||||||| ||||| |    
T  15122739 gatcataagagtttgtagtatttgtttgatcataaaaagttgaatatgaggcaaaggaggtggttagaatttcataatgattataattttgagttgagtt 15122838  T
Q  289 atcatccgggtaaagctaat 308  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  15122839 atcatccgggtaaggctaat 15122858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 351
Target Start/End: Original strand, 21673312 - 21673529
Alignment:
Q  134 tgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaat 233  Q
    |||||||||||| | ||| |||||  |||||||||| |  ||| | ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  21673312 tgtattgaagatttagaggcattatctgtatggttctaagttttaagtgttcagtgactacaagagtttgaagtacttgtttgataagaaagagttgaat 21673411  T
Q  234 atgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtagga 333  Q
    ||||||||| | |  |||||||| |  || ||  |||  || ||| | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||  || ||||  |    
T  21673412 atgaggcagaggaattggttggagtatcttaagaatttcgactttcagttcagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatggtttgagtaaaa 21673511  T
Q  334 agactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21673512 agactttgcatatgtctg 21673529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 259
Target Start/End: Original strand, 17144092 - 17144165
Alignment:
Q  186 agtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaatt 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||    
T  17144092 agtgatcataagagtttgaagtatctgtttgactagaaggagttgaatatgagagagagaaggtggttgaaatt 17144165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15625892 - 15625829
Alignment:
Q  288 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  15625892 tatcatccaggtaaagataatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctg 15625829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13354582 - 13354429
Alignment:
Q  193 acaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatca 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||  |||| ||  | || |  || |  ||||  || ||| | ||||| |||||    
T  13354582 acaagagtttgaagtatttgtttgatcataaatagttgaatatgaggcaaagaagatgaatagagtatcttagggatttcgactttcagttgagttatca 13354483  T
Q  293 tccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatat 346  Q
    ||  || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  13354482 tcacgggaaggctaatgttgttgccgatgccttgagtaggaagacgtggcatat 13354429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13456091 - 13456022
Alignment:
Q  282 ttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||| |||||||| || || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13456091 ttgagttatcatcccggaaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctg 13456022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23651743 - 23651393
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23651743 gtgatgcgttcaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 23651644  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23651643 tacgcacgatttagagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttactgatcacaagagt 23651544  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23651543 ctgaagtatctgttcgatctgaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaatttctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggta 23651444  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23651443 aagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 23651393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 17673102 - 17673450
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17673102 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 17673201  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17673202 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 17673301  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  17673302 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggta 17673401  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17673402 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 17673450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 20017342 - 20017690
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20017342 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 20017441  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017442 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 20017541  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  20017542 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 20017641  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20017642 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 20017690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18858279 - 18857931
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  18858279 gtgatgcgtccaaattgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgacaattcatgagaagaattatcc 18858180  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858179 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 18858080  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  18858079 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 18857980  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18857979 aagctaatgtcgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtc 18857931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19114392 - 19114044
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19114392 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 19114293  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19114292 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagt 19114193  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  19114192 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 19114093  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19114092 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 19114044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 21392944 - 21393294
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21392944 gtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaatttatgagaagaattatcc 21393043  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21393044 cacacacgatttagagttggcggctgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 21393143  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21393144 ttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggta 21393243  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||    
T  21393244 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctg 21393294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 21787438 - 21787788
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21787438 gtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaatttatgagaagaattatcc 21787537  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21787538 cacacacgatttagagttggcggctgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 21787637  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21787638 ttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggta 21787737  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||    
T  21787738 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctg 21787788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 351
Target Start/End: Original strand, 21920816 - 21921165
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    |||||| | |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21920816 tgatgcatccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 21920915  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    | ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  21920916 acgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagattt 21921015  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21921016 tgaagtatctgctcgatcagaaggaattgaacatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaatattatgattttgagttgaactatcatccgggtaa 21921115  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  21921116 agctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacttttcacatgtctg 21921165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21044144 - 21043797
Alignment:
Q  4 atgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctat 103  Q
    |||||| |||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  21044144 atgcgtccaagctgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagtcgagaattcatgagaagaattaccttac 21044045  T
Q  104 gcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttg 203  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21044044 gcacgatttagagttggctgatgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttg 21043945  T
Q  204 aagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaag 303  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21043944 aagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctcgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaag 21043845  T
Q  304 ctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  21043844 ctaatgttgttgcagatgctctgagtaggaagaccttgcatatgtctg 21043797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 19483143 - 19483491
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19483143 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtgatagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 19483242  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  19483243 tacgcatgatctcgagttggcggcagtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagc 19483342  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||  || ||||||||||    
T  19483343 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggta 19483442  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19483443 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 19483491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 30312223 - 30312571
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30312223 gtgatgcgtccaagatgggtttaggcggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgaggagaattaccc 30312322  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  30312323 gacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagc 30312422  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  30312423 ttgaattatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 30312522  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  30312523 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtc 30312571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22041565 - 22041213
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgc----tcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaatt 96  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22041565 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaatt 22041466  T
Q  97 accctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaa 196  Q
    |||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  22041465 acccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaa 22041366  T
Q  197 gagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccg 296  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  ||||||||     
T  22041365 gagttggaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatcca 22041266  T
Q  297 ggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  22041265 ggtaaagccaatgttgttgcggatgccttgagcaggaagacattgcatatgtc 22041213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21252646 - 21252296
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| || || |||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21252646 gtgatgcgtctaagctgggtttgggtggtgtgcttatgcaagatagaaaagtagtagtttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 21252547  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21252546 tacgcacgatttagagttagctgctgtggtctttgtattgaagatatggagatattacttgtatggttcgagattcgaggtgtttagtgatcataagagt 21252447  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||  || | | | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21252446 ttgaagtatctgttcaatcagaaggaattgaatatgaggcagcatagatagcttgaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggta 21252347  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  21252346 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctg 21252296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 21165617 - 21165965
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21165617 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatcgtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 21165716  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21165717 gacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 21165816  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || ||| | |||||||| || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  21165817 ttgaaatacttgttcgatcaaaaagagttgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 21165916  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21165917 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 21165965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 22119254 - 22119601
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22119254 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagatagttgagaattcatgagaagaattatcc 22119353  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22119354 tacgcatgatctcgagttagcggc-gtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagt 22119452  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  22119453 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 22119552  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22119553 aagctaatgttgttgcagatggcttgagtaggaagacgttgcatatgtc 22119601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 22128038 - 22128385
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22128038 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagatagttgagaattcatgagaagaattatcc 22128137  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22128138 tacgcatgatctcgagttagcggc-gtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagt 22128236  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  22128237 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 22128336  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22128337 aagctaatgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtc 22128385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 32601846 - 32601498
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||||||  |||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32601846 gtgatgcgtccaagttgggtctaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcaagacagttgagaattcatgagaaaaattaccc 32601747  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
       |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32601746 ggcgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagt 32601647  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||| | || ||||| || ||||  ||||   ||||||| ||||    
T  32601646 ttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaatcatcatccaggta 32601547  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  32601546 aagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtc 32601498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 22132120 - 22132468
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132120 gtgatgcgcccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 22132219  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22132220 gacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattaattgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 22132319  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| | || ||||| || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  22132320 ttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtaaatggctagagttgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 22132419  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||| ||||   ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  22132420 aagctaatgatgttatagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtc 22132468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19979669 - 19979321
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19979669 gtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcacgagaagaattaccc 19979570  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||     
T  19979569 cacacatgatttatagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataaaagc 19979470  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  19979469 ttgaaatatatgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtacatggctggaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 19979370  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  19979369 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtataaagacattgcatatgtc 19979321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15535085 - 15534737
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535085 gtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcaagatagttgagaattcatgagaagaattaccc 15534986  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15534985 gacgcacgatttagaattggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagt 15534886  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||  ||| |||| ||||    
T  15534885 ttgaggtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgagacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatgatccaggta 15534786  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  15534785 aagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcacatgtc 15534737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 16407199 - 16407469
Alignment:
Q  4 atgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctat 103  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  16407199 atgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagatagttgagaattcatgagaagaattacccgac 16407298  T
Q  104 gcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttg 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  16407299 gcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagctta 16407398  T
Q  204 aagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatga 274  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  | |||||||||||    
T  16407399 aagtatttgttcgatcaaaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatga 16407469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20389801 - 20389451
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20389801 gtgatgcgtccaagttgggcttatgtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttggagacagttgagaattcatgagcagaattatcc 20389702  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||| ||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20389701 cacgcacgatttggagttggctgttgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagc 20389602  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| | || || ||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  20389601 ttgaaatatttatttgatcaaaaggaattaaatatgaggcagcgaaggtggcttcaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggta 20389502  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |||||||||||||    
T  20389501 aagctaatgttgttgcagattctttgagcaggaagacgttgcatatgtctg 20389451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Original strand, 20395264 - 20395559
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||    ||||| ||||  |||||| | ||||| ||  | |||||||||||  |  |||| |||||||    
T  20395264 gtagcttatgcatctaggcagttgagaattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgagttagctacagtagtctttgtgcttgagatttggagac 20395363  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20395364 gttatttgtatggttctagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggct 20395463  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
     |||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20395464 tgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtc 20395559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 351
Target Start/End: Original strand, 20984637 - 20984976
Alignment:
Q  12 aagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatt 111  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  20984637 aagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcctacgcatgatt 20984736  T
Q  112 tagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattt 211  Q
    | |||||||| || || || ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||| |    
T  20984737 tggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatttggagacattatttgtacggttctagatttgaggtgcttagtgatcataaaagtttgaaatatct 20984836  T
Q  212 gtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgtt 311  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || || ||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  20984837 gtttgaccaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtt 20984936  T
Q  312 gttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||||    
T  20984937 gttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcacatgtctg 20984976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 16876227 - 16876524
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| ||||| || | || ||||||||| | ||| |    
T  16876227 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggctgttgtgtatgcattgaagatttagaggc 16876326  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  16876327 attatctgtatggttctaaatttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 16876426  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  16876427 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 16876524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 22247512 - 22247860
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||  ||  | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  | ||||| ||    
T  22247512 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtacttttgcaggatgacaaggtagtagcttatgcattgagacagttgaggattcatgaacaaaattatcc 22247611  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | || || || || ||  |||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  22247612 tactcatgatcttgaattagctgcagtgctctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagt 22247711  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||  ||||  ||||||||  |||    
T  22247712 ctgaagtatctgtttgatcagaaggaattaaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaagta 22247811  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22247812 aagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtc 22247860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 20009000 - 20009349
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  20009000 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 20009099  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| || |||    
T  20009100 tacccatgatttggagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttcctgatttgaagtgtttagtgatcataaaagt 20009199  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||| | |||||| | || || | ||||||||  ||||  ||||| || ||||    
T  20009200 ttgaaatatttatttgatcaaaaggaattaaacatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactgtgattttggtttgaattatcaccccggta 20009299  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    || ||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  20009300 aa-ctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 20009349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 21324348 - 21324698
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| ||    
T  21324348 gtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaggatggcaaggtagtagcttatgcttctagacagttgaggatacatgaaaataattatcc 21324447  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    |||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  21324448 tatgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagt 21324547  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| | || ||| |||||||||| |||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  21324548 ttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattacgattttggtttgaattaccatcctggta 21324647  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||||    
T  21324648 aagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcatgtgtctg 21324698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22372632 - 22372283
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  22372632 tgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttataggcagttgaggattcatgaaaagaattatcct 22372533  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    |  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  22372532 acacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtt 22372433  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    |||||||| | ||||| || ||  ||||||||||||||||| |||| ||| | |||||  | || || |||||||||   || |  || |||||||||||    
T  22372432 tgaagtatctatttgaccaaaaataattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaa 22372333  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  22372332 agctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 22372283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23656629 - 23656279
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  23656629 gtgatgcgtccaagttaggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 23656530  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  23656529 tacacatgatttggagtttgctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtattcagtgatcacaaaagc 23656430  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||| | || ||| |||| |||||||||||||  ||||  ||  |||||||||    
T  23656429 ttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggtagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattactatccgggta 23656330  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  23656329 aagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctg 23656279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 29302520 - 29302855
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| | ||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| | ||    
T  29302520 tgggcttaggtgatgttctgatgcaagatggtaaagtggtagcatatgcttctaggcagttgaggatacatgagaagaattatcctacgcatgatctgga 29302619  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
     ||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||    
T  29302620 attggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagattcgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaaatatttgttt 29302719  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  29302720 gatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttg 29302819  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  29302820 cagatgcgttaagcaggaaaacattgcatatgtctg 29302855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 20974735 - 20975085
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| ||    
T  20974735 gtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctaagaattcatgaaaagaattatcc 20974834  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  20974835 tacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagt 20974934  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || || || |||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  20974935 ctaaaatatttatttgataagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctggta 20975034  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||    
T  20975035 aagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctg 20975085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 31569921 - 31570271
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||  ||||  | || || |||||||| ||    
T  31569921 gtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaaagaattatcc 31570020  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  31570021 cactcatgatttagagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagc 31570120  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| | ||  || ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||| |    
T  31570121 ttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaa 31570220  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||||||  | ||||||||||    
T  31570221 aagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacacttcatatgtctg 31570271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22052564 - 22052215
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    ||||||||  ||||||||||| || |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  22052564 tgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagagggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcct 22052465  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    |  |||||||| |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || || || ||||||| ||||     
T  22052464 acacatgatttggagttggctgcagtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtatggtttcagatttgaagtattcagcgatcacaggagtc 22052365  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| | || ||| | || ||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||| |||||    
T  22052364 tgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgagacagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaa 22052265  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||| || ||||| ||||| || || ||||||||  ||||||||||||    
T  22052264 agctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctg 22052215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23886726 - 23886393
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    ||||| ||    
T  23886726 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatgacaaggtagtggcttatgcatcgagacaattgagaattcatgaacgaaattatcc 23886627  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | || || ||  | || ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||    
T  23886626 tactcatgatcttgaattagctacagtggtctttgtgctcaagatttggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttcggtgatcataaaagt 23886527  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  23886526 cagaagtatttgtttgatctgaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggctttaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatcctggta 23886427  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaa 334  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23886426 aaactaatgttgttgcagatgctttaagtaggaa 23886393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6605345 - 6605010
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  6605345 tgggcttatgtggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 6605246  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  6605245 gttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 6605146  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || || || ||||||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  6605145 gatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 6605046  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  6605045 ctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctg 6605010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21842102 - 21841783
Alignment:
Q  18 ggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagt 117  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  21842102 ggcttaggtggtgtattgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcggttgaggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagt 21842003  T
Q  118 tggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttga 217  Q
    |||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  21842002 tggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaaggttgaaatatttatttga 21841903  T
Q  218 tcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcg 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||  |||| ||| | ||  || | || |||||||||||    ||||  || |||||||||||||||||||| |||||     
T  21841902 tcaaaaagaattgaatatgaggcaaagaagatggcttgagatgttgaaggattatgatttctgtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgca 21841803  T
Q  318 gatgccttaagtaggaagac 337  Q
    ||||| || || ||||||||    
T  21841802 gatgctttgagcaggaagac 21841783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 16270318 - 16270653
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  || ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16270318 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaagatggtagcatatgcttctaggcaattgcgtgtttatgagaagaattatcctacacatgatttaga 16270417  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
     ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16270418 attggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgaccataaaagtttgaaatatctgttt 16270517  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| || || ||||| |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  16270518 gatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 16270617  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || ||||| || ||||| |||||||    
T  16270618 ctgatgcattgagcaggaaaacattgcacatgtctg 16270653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 353
Target Start/End: Original strand, 21849469 - 21849768
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| ||||| || | |  ||| ||||| ||||| |    
T  21849469 gtagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggctgttgtgtatacattaaagatttggaggc 21849568  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  | ||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||    
T  21849569 attatctttatggttcttagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagaggagatggtt 21849668  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgat 353  Q
    ||| |  || || || |  |||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21849669 ggagtatcttaaggacttcgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtaggacgactttgcatatgtctgat 21849768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 31415550 - 31415900
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||  | |||||||| || ||  |||||||||||||||  || || ||||| || |||||||||||||| ||    
T  31415550 gtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagacggtaaggtggtagcttatgcttataggcaattgaggatacatgagaagaattatcc 31415649  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| |  ||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||     
T  31415650 tacgcatgatctgaagttggctgcagtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtccagtgatcataaaagc 31415749  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| || | || |||||||||||||  ||||  || ||| | ||||    
T  31415750 ttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccattctggta 31415849  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||    
T  31415850 aagccaatgtggttgctgacgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctg 31415900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19861137 - 19860900
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| | |||||| ||    
T  19861137 gtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtggtagcttatacttctaggcagttgaggattcatgaaatgaattatcc 19861038  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| || |  || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  19861037 tacgcatgatttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagt 19860938  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgag 238  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19860937 ttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgag 19860900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14566829 - 14566494
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  14566829 tgggcttaggtggtgtcctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 14566730  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  14566729 gttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacgattccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 14566630  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || || |||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  14566629 gaacagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 14566530  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  14566529 ctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctg 14566494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Original strand, 20651468 - 20651762
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || || || |  || || | || ||||||||| ||||| ||||    
T  20651468 gcttatgcttcaagacagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattagcggtcgttgtgtctgcattgaagatttggaggcatt 20651567  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    || |||||||||| |  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20651568 acctgtatggttctaagtttgaggtgttcaatgaccacaagagtttgaagtaattgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttgga 20651667  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || |||| ||||||| | ||||| ||| |||  |  || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  20651668 atatcttaaggattttgattttcagttgagttataatctcgagaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 20651762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 137 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22435869 - 22435655
Alignment:
Q  137 attgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 236  Q
    ||||||||| ||||| |||||  ||||| |||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22435869 attgaagatttggaggcattatatgtatagttctaactttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaggagttgaatatg 22435770  T
Q  237 aggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaaga 336  Q
    |||||  |||| ||||||||||  || ||||||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| || |    
T  22435769 aggcaaagaagatggttggaatatcttaaagattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaaaa 22435670  T
Q  337 ctttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||    
T  22435669 ctttgcatatgtctg 22435655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 22376532 - 22376881
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||  | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    ||||| ||    
T  22376532 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgtaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagatagttgaggattcatgaacgaaattatcc 22376631  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaga-g 199  Q
    ||  |||||| | || || || || || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||| |  ||||| || | |    
T  22376632 tactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttaaacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaaag 22376731  T
Q  200 tttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggt 299  Q
    | |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||||  ||||  ||| |||   ||    
T  22376732 tctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagt 22376831  T
Q  300 aaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22376832 aaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtc 22376881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 22382707 - 22383056
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||  | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    ||||| ||    
T  22382707 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgtaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagatagttgaggattcatgaacgaaattatcc 22382806  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaga-g 199  Q
    ||  |||||| | || || || || || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||| |  ||||| || | |    
T  22382807 tactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttaaacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaaag 22382906  T
Q  200 tttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggt 299  Q
    | |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||||  ||||  ||| |||   ||    
T  22382907 tctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagt 22383006  T
Q  300 aaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22383007 aaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtc 22383056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19869369 - 19869047
Alignment:
Q  27 ggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctg 126  Q
    |||| ||| |||||||||||  |  |||| |||||||| ||||||||  | |  |||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||||| ||  |||    
T  19869369 ggtgcgcttatgcaagatgggcatgtggtggcttatgcctcgagacaactaaagattcatgagaggaattacccgacacatgatttggagttagcatctg 19869270  T
Q  127 tagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaagga 226  Q
    |||| |||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||    
T  19869269 tagtgtttgttcttaaggtatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatacttgtttgatcaaaatga 19869170  T
Q  227 attgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgcctta 326  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||| || |||||||||||| |||| |||||||| || || || ||||| || || ||||||||     
T  19869169 gttgaatatgagacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccagggaaggccaatgtagtagctgatgccttg 19869070  T
Q  327 agtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||| | ||||| |||||    
T  19869069 agtaggaagtccttgcacatgtc 19869047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 348
Target Start/End: Original strand, 21195638 - 21195928
Alignment:
Q  58 cttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatta 157  Q
    |||||||||| || ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| |||||    
T  21195638 cttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcatta 21195737  T
Q  158 cttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaa 257  Q
      |||||||||| | |||||| || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||  |||| ||| |||||    
T  21195738 tctgtatggttctaaatttgaagttttcagtgaccataagagtttgaagtacttatttgatcagaaaaagttgaatatgaggcaaagaagatgggtggaa 21195837  T
Q  258 ttgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
    |  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  21195838 tatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggcgaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgt 21195928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27356223 - 27355960
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  || |||| |||||||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  27356223 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtgttagcatatgcttctaggcaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 27356124  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  27356123 gttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttattt 27356024  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttg 279  Q
    || ||||||||| | || ||||||||| |||| ||||| ||  || | || |||||||||||||    
T  27356023 gaccagaaggaactaaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttg 27355960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 256
Target Start/End: Original strand, 23156175 - 23156374
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| || ||||||| | | |||||||||||||| ||    |||||||| || ||||| ||  | || | || ||||||||| ||||| ||||    
T  23156175 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccggctcatgatttggaattggcggcaattgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 23156274  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    | ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23156275 atttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaaggtggttgga 23156374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 22422971 - 22423085
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22422971 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttgagaattcatgagcggaattaccc 22423070  T
Q  101 tatgcatgatttaga 115  Q
    || ||| ||||||||    
T  22423071 tacgcacgatttaga 22423085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12306302 - 12306110
Alignment:
Q  159 ttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaat 258  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||  | |    
T  12306302 ttgtacggttctagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagtttgaaatatctgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttatagt 12306203  T
Q  259 tgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  | || || |||||||||||||    
T  12306202 tactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagctgtaaaacattgcatatgtctg 12306110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22316837 - 22316549
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||| || || |  ||| |||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| ||||    
T  22316837 gcttatgcgtcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaactatccaactcattatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 22316738  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  ||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22316737 atctgtatggctctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggaggtggttgga 22316638  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcata 345  Q
     |  ||  | ||||  ||| || |  |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  22316637 gtatcttcaggatttcgatcttcagctgagttatcatcccgggaaagcgaatgtagttgttgatgctttgagtagaaagactttgcata 22316549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 137 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23901753 - 23901544
Alignment:
Q  137 attgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 236  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23901753 attgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatg 23901654  T
Q  237 aggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaaga 336  Q
    || ||  |||| ||||| ||||  || || || |  || ||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||  || ||||| |||| |||||    
T  23901653 agacaaagaagatggttagaatatcttaaggacttcgactttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgacgacgccttgagtaagaaga 23901554  T
Q  337 ctttgcatat 346  Q
    ||||||||||    
T  23901553 ctttgcatat 23901544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 241
Target Start/End: Original strand, 22623247 - 22623362
Alignment:
Q  126 gtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaagg 225  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | || ||| |||||||||| |||||  |||| |    
T  22623247 gtagtttttgtacttaaaatttggagacattatctgtatggttctagatttgaagtgttcagtgattataaaagtatgaagtatttatttgactagaaag 22623346  T
Q  226 aattgaatatgaggca 241  Q
    |||| |||||||||||    
T  22623347 aattaaatatgaggca 22623362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 291 - 351
Target Start/End: Original strand, 22623405 - 22623465
Alignment:
Q  291 catccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  22623405 catccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctg 22623465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 350
Target Start/End: Original strand, 23156393 - 23156440
Alignment:
Q  303 gctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtct 350  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23156393 gctaatgttgttgcagatgccttgagtagaaagactttgcatatgtct 23156440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19852880 - 19852763
Alignment:
Q  234 atgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtagga 333  Q
    ||||||||| |||| ||| | |||||| | || || ||||||||||  ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  19852880 atgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcagga 19852781  T
Q  334 agactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  19852780 agacgttgcacatgtctg 19852763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19858916 - 19858799
Alignment:
Q  234 atgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtagga 333  Q
    ||||||||| |||| ||| | |||||| | || || ||||||||||  ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  19858916 atgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcagga 19858817  T
Q  334 agactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  19858816 agacgttgcacatgtctg 19858799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17491105 - 17490755
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17491105 gtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 17491006  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17491005 tacgcacgatttagagttggctgctgtagtctttgtattgaatatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 17490906  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17490905 ttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagattgcttgaattgcttaatgattatgattttgagttgagctatcatcctggta 17490806  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  17490805 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctg 17490755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 14875374 - 14875722
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14875374 gtgatgcgtccaagttgagtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 14875473  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14875474 gacgcatgatttagagttggcagctgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagc 14875573  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||    
T  14875574 ttgaaatatttgttcgatcagaatgaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggta 14875673  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14875674 aagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtc 14875722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 5423805 - 5424153
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||  || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  5423805 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaaggaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacaattgagaattcatgagaagaattatcc 5423904  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423905 tacgcatgatctcgagttggcagctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 5424004  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  5424005 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggta 5424104  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5424105 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 5424153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16637028 - 16636680
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16637028 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 16636929  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16636928 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 16636829  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  16636828 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 16636729  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16636728 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 16636680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 43164352 - 43164004
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  43164352 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 43164253  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43164252 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 43164153  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  43164152 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 43164053  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43164052 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 43164004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 15588267 - 15588615
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15588267 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 15588366  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15588367 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagt 15588466  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  15588467 ttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 15588566  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15588567 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 15588615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15340524 - 15340176
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15340524 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaagttaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 15340425  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15340424 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 15340325  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  15340324 ttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 15340225  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15340224 aagctaatgctgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 15340176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 15401392 - 15401740
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15401392 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 15401491  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15401492 tacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggagtttagtgatcacaagagt 15401591  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  15401592 ttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 15401691  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15401692 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 15401740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 16805822 - 16806170
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16805822 gtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcgagacaattgagaattcatgagaagaattaccc 16805921  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  16805922 gacgcatgatttagagttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagc 16806021  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||  ||||    
T  16806022 ttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggatagaattgctgaaagattatgactttgctttgaattatcatctaggta 16806121  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  16806122 aagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtc 16806170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 48426702 - 48426354
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  48426702 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 48426603  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  48426602 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 48426503  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  48426502 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 48426403  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  48426402 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 48426354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 53383893 - 53384241
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  53383893 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 53383992  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  53383993 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtgttgaaaatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 53384092  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||  ||||  || ||||||||||    
T  53384093 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattaacatccgggta 53384192  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  53384193 aagctaatgttattgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 53384241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 2 - 349
Target Start/End: Original strand, 15347121 - 15347468
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15347121 tgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcatatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcct 15347220  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    | ||||||| | |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15347221 acgcatgatctcgagttggcggcagtagtctttgtatcgaagatatggagacattacttgtttggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 15347320  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| || ||||  ||||  ||||||||||||||    
T  15347321 tgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggcttgagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaa 15347420  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  15347421 agctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaaattgcatatgtc 15347468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13253945 - 13253597
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  13253945 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaggtggtagcttacgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 13253846  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13253845 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 13253746  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  ||||| || ||||    
T  13253745 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggta 13253646  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13253645 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 13253597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 20060929 - 20061277
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  20060929 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaggaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagggttcatgagaagaattatcc 20061028  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20061029 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagt 20061128  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  20061129 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 20061228  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20061229 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 20061277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 349
Target Start/End: Original strand, 15723824 - 15724157
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||    
T  15723824 tgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcga 15723923  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15723924 gttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttc 15724023  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15724024 gatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatagcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttg 15724123  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
      |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15724124 tagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 15724157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6601991 - 6601643
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6601991 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgctttaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 6601892  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||     
T  6601891 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttaatgatcacaagaga 6601792  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||  ||||  |||||||||||||    
T  6601791 ttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggta 6601692  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6601691 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 6601643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10006855 - 10006507
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  10006855 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 10006756  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10006755 tacgcatgatctcgagttggcagctgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 10006656  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| || |  ||||  |||||||| ||||    
T  10006655 ttaaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggta 10006556  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10006555 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 10006507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10907465 - 10907117
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  10907465 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 10907366  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10907365 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 10907266  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| || |  ||||  |||||||| ||||    
T  10907265 ttgaggtattttttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggta 10907166  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10907165 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 10907117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 16411157 - 16411505
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16411157 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtaacttatgcttcaaggcagttgagagttcatgagaagaattatcc 16411256  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16411257 tacgcatgatctcgagttggcagccgtagtctttgtattgaagatatggagacactacttgtatggttcgagatttgaggtctttagtgatcacaagagt 16411356  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||| |||||||| || ||||  ||||  |||||||  ||||    
T  16411357 ttgaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatattaggcagagaagatggctagaattgctgaaagattacgactttggtttgaattatcatctaggta 16411456  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16411457 aagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtc 16411505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 14579817 - 14580165
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14579817 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcc 14579916  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| ||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14579917 tacgcacgatttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagt 14580016  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| | || ||| ||||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  14580017 ttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggta 14580116  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  14580117 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaatttacacatgtc 14580165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 85 - 351
Target Start/End: Original strand, 16491140 - 16491406
Alignment:
Q  85 atgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtt 184  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16491140 atgagaagaattaacctacgcatgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtt 16491239  T
Q  185 tagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattg 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| || |||||||||||||  |||    
T  16491240 tagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgggttg 16491339  T
Q  285 agctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  16491340 agctatcatccgggtaaagctaatgttgttgaagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctg 16491406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16693419 - 16693069
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16693419 gtgatgcgtctaagttggctttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgctactagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 16693320  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  ||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16693319 gacacatgatttagaattagcgactgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttattgatcataagagt 16693220  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  ||||| || ||||    
T  16693219 ttgaagtatctgtttgaccagaaggaattgaatatgagacagcgtagatggatagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggta 16693120  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  16693119 aagctaatgttgttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctg 16693069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12499502 - 12499155
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12499502 tgatgcttccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcctcaagacagttgagaattcatgagaagagttacccg 12499403  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    | |||||||||||| |||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12499402 acgcatgatttagaattggcgactgtggtctttgatttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 12499303  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | || ||  | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||  |||||    
T  12499302 tgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagtcaaagaaggtggctcgagttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaa 12499203  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12499202 agctaacgtcgttgcagatggcttgagtaggaagacattgcatatgtc 12499155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3687198 - 3686897
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  3687198 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaggtggtagcttacgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 3687099  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687098 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 3686999  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  3686998 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 3686899  T
Q  301 aa 302  Q
    ||    
T  3686898 aa 3686897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 5109486 - 5109723
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5109486 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 5109585  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5109586 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 5109685  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgag 238  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5109686 ttgaagtattttttcgatcagaaggaattgaatatgag 5109723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15228913 - 15228566
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||    
T  15228913 tgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaggtagtagcttatgcttcgagacagttgaggattcatgagcggaattatcct 15228814  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    |  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15228813 acacatgatttggagttggctgcggtggtttttgtgttgaaaatttggagacattatttatatggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtt 15228714  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    |||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| | || || |||||||||   || |  ||||||||||||||    
T  15228713 tgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaa 15228614  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  15228613 agccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtc 15228566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15234781 - 15234434
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||    
T  15234781 tgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaggtagtagcttatgcttcgagacagttgaggattcatgagcggaattatcct 15234682  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    |  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15234681 acacatgatttggagttggctgcggtggtttttgtgttgaaaatttggagacattatttatatggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtt 15234582  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    |||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| | || || |||||||||   || |  ||||||||||||||    
T  15234581 tgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaa 15234482  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  15234481 agccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtc 15234434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15260885 - 15260537
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    ||||| ||    
T  15260885 gtgatgcgtccaagtttggcttaggtggtgtgcttatggaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacaattgaggattcatgaacgaaattatcc 15260786  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | || || |  || || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || || |||||||||    
T  15260785 tactcatgatcttgatttagttgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttaaagtgttcagcgaccacaagagt 15260686  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  15260685 ttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgaattaccatccgggta 15260586  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15260585 aggctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtc 15260537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 349
Target Start/End: Original strand, 14125576 - 14125817
Alignment:
Q  108 gatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagt 207  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  14125576 gatttagagttggtggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttaatgatcacaagagcttaaagt 14125675  T
Q  208 atttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaa 307  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| |||||||||||    
T  14125676 atttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcttagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaa 14125775  T
Q  308 tgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  14125776 tgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtc 14125817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 16827067 - 16827417
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||||| ||    
T  16827067 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaagattcatgaaaagaattatcc 16827166  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||  || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16827167 tacacatgatttggagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagt 16827266  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || ||||||||||||   ||||  || ||||||||||    
T  16827267 ttgaaatatttatttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgacttgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatccgggta 16827366  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  16827367 aagctaatgtgtttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 16827417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31940168 - 31939818
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| || || |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  31940168 gtgatgcgtccaagttgggtttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcatctagacagttgaggattcatgaaaagaattatcc 31940069  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31940068 tacgcatgatctggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcacaagagt 31939969  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  || | || |||||||| ||||  ||||  || ||||| ||||    
T  31939968 ctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggta 31939869  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  ||||||||||||    
T  31939868 aagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgctgcatatgtctg 31939818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 351
Target Start/End: Original strand, 12359402 - 12359741
Alignment:
Q  12 aagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatt 111  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||    
T  12359402 aagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcatatgcttctaggcagttgaggatccatgagaagaattatcctacacatgatt 12359501  T
Q  112 tagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattt 211  Q
    | ||||| || || || || |||   ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  12359502 tcgagttagctgcggtggtttttactttgaaaatttggaggcattacttgtatggttccagatttgaagtatttagtaatcacaaaagtttgaaatattt 12359601  T
Q  212 gtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgtt 311  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| | ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||     
T  12359602 atttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggatagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtg 12359701  T
Q  312 gttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12359702 gttgcagattccttgagtagaaagacgttgcatatgtctg 12359741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30139018 - 30138721
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| |||||||    
T  30139018 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagac 30138919  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  30138918 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 30138819  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  30138818 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 30138721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30148569 - 30148272
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| |||||||    
T  30148569 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagac 30148470  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  30148469 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 30148370  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  30148369 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 30148272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 11960048 - 11960383
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||    
T  11960048 tgggcttaggtggtgttctaatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgaggattcatgagaagaattatcctacgcatgatctgga 11960147  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    |||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11960148 gttggctgcggtggtatttgttttaaaaatttggaggcattacttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagagtttgaaatatttgttt 11960247  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||| ||| | || || |||||||||||||  ||||  || |||||  |||| || ||||| ||||    
T  11960248 gatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagattgttagaactactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctagtaaggccaatgtggttg 11960347  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  11960348 ctgatgcattgaggaggaaaacattgcatatgtctg 11960383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 8273327 - 8273624
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| |    
T  8273327 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggc 8273426  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    | ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  8273427 actatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 8273526  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  8273527 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 8273624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 10418909 - 10419257
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | |||||| || || ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||  | ||  ||||||| |||||||| ||    
T  10418909 gtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctagacaactaagggttcatgaaaagaattatcc 10419008  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  10419009 tactcatgacctggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagt 10419108  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||| | || ||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  10419109 ttgaaatatctgtttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggtttgaactatcatccgggta 10419208  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  10419209 aagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtc 10419257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 138 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15062836 - 15062625
Alignment:
Q  138 ttgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15062836 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggttttaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 15062737  T
Q  238 ggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    | |||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||  | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  15062736 gacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatcaagttaaagctaatgttgtggtagatgccttaagtaggaagac 15062637  T
Q  338 tttgcatatgtc 349  Q
     |||||||||||    
T  15062636 attgcatatgtc 15062625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 16835374 - 16835724
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| ||||  | ||||| |||||||| ||    
T  16835374 gtgatgcgtctaagttgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagggtacatgaaaagaattatcc 16835473  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  || ||||| ||||| || || || || ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  16835474 cactcacgatttggagttagctgcagtggtttttgttttgaagatttagaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagc 16835573  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | || ||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||| | ||    
T  16835574 ttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctgata 16835673  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||    
T  16835674 aagccaatgtagttgcggatgcgttgagcagaaagactttgcacatgtctg 16835724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 44778512 - 44778162
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||  ||||  | ||||| |||||||| ||    
T  44778512 gtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcatgaaaagaattatcc 44778413  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  44778412 cactcatgatttagagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagc 44778313  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| | ||  || ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||| |    
T  44778312 ttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggca 44778213  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  44778212 aagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctg 44778162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 31694049 - 31694400
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttagga-ggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattacc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||| |    
T  31694049 gtgatgcgtccaagttgggcttggggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcatctagatagttgaggattcatgaaaagaattatc 31694148  T
Q  100 ctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 199  Q
    ||| ||||||| | |||||||| || || || ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  31694149 ctacgcatgatctggagttggctgcggtggtttttattttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagag 31694248  T
Q  200 tttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggt 299  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  || | || |||||||| ||||  ||||  || ||||| |||    
T  31694249 tctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaacatcctggt 31694348  T
Q  300 aaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  ||||||||||||    
T  31694349 aaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgctgcatatgtctg 31694400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 18133210 - 18133560
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||| || || |||||  | ||||||||||| ||  |||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  18133210 gtgatgcgtctaagttgggtttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggttgcgtatgcttctagacagttgaggatacatgaaaagaattatcc 18133309  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  18133310 tacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggctttatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagt 18133409  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||  || | || |||||||||||||   |||  || ||||||||||    
T  18133410 ctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaatggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcatgaattaccatccgggta 18133509  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| |||||  || ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18133510 aagctaatgtggttgcatataccttaagtaggaaaacgttgcatatgtctg 18133560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41178787 - 41178437
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||  ||||  | || || |||||||| ||    
T  41178787 gtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaaagaattatcc 41178688  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  41178687 cactcatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagc 41178588  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| | ||  || ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||| |    
T  41178587 ttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaa 41178488  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||||||  | ||||||||||    
T  41178487 aagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacactccatatgtctg 41178437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 13966272 - 13966569
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  ||| |||| || ||||| || || || | |  ||||| ||| ||||| |    
T  13966272 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcataatttggaattggcagccgttgtgtatacattgacgatttggaggc 13966371  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  13966372 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 13966471  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  13966472 ggaatatcttaaggattttgatttttagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 13966569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15611315 - 15611018
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| ||||| |    
T  15611315 gtagcttatgcttcgaggcagttgaaaatgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggaggc 15611216  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||    
T  15611215 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcaatgaccacaagagttcgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggtt 15611116  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || || | ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  15611115 ggaatatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtaggaagattttgcatatgtctg 15611018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 13970984 - 13971320
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||||||||  | ||||||||||| ||  | ||||| |||||||| || ||| ||||| | ||||| |||||||| ||    
T  13970984 gtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggttgtagcgtatgcttctaggcagctgagagtgcatgaaaagaattatcc 13971083  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  || |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||     
T  13971084 tactcacgatttagagttggctgcggtggtctttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagc 13971183  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||  |  | || |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||    
T  13971184 ttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgactttgggttgaactatcatccgggta 13971283  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13971284 aagccaatgtagttgcagatgccttgagtaggaagac 13971320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 16755576 - 16755758
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  16755576 gtgacgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttaatgagaagaattatcc 16755675  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgt 183  Q
    || ||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  16755676 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgt 16755758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 16741631 - 16741928
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| ||||| |    
T  16741631 gtagcttatgcttcgaggcgattgaaagtacatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggaggc 16741730  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    | ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  16741731 actatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 16741830  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||| |  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  16741831 ggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 16741928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13943289 - 13942939
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||   |||  | ||||| |||||||| ||    
T  13943289 gtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaaccgagggtgcatgaaaagaattatcc 13943190  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  || ||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  13943189 cactcacgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagc 13943090  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | ||  || ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||| |    
T  13943089 ttgaaatacttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaa 13942990  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||||||  ||||||||||||    
T  13942989 aagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctg 13942939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 16379792 - 16380142
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| ||||  | ||| | |||||||| ||    
T  16379792 gtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagggtacataaaaagaattatcc 16379891  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  || ||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  16379892 cactcacgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagc 16379991  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | || ||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||  | |    
T  16379992 ttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagca 16380091  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||  ||||||||||||    
T  16380092 aagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctg 16380142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 47125209 - 47124859
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||  | ||||||||||||||||| ||    
T  47125209 gtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttacgtattcatgagaagaattatcc 47125110  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||  | ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  47125109 tacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagt 47125010  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || || |||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  47125009 ttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggta 47124910  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||    
T  47124909 aggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctg 47124859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12179602 - 12179253
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |   ||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  12179602 tgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaagtagttgaggattcatgaaaagaattatcct 12179503  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    |  ||||||||  ||||||| || || || ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||     
T  12179502 acacatgatttgtagttggctgcggtggtttttattttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtc 12179403  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || || ||||| ||    
T  12179402 tgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccagccgggcaa 12179303  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  12179302 agccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaaacgttgcatatgtctg 12179253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28755568 - 28755233
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  28755568 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtagtagcatatgcttctagacaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 28755469  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  28755468 gttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 28755369  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || || |||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  28755368 gaccagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 28755269  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||    
T  28755268 cggatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctg 28755233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Original strand, 6151784 - 6152078
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| || || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || |||||||||  |||| ||||    
T  6151784 gcttatgcttcaaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagattcggaggcatt 6151883  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| | || ||||||||    
T  6151884 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatataaggcagaggagatggttgga 6151983  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  6151984 atatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 6152078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 137 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16258273 - 16258059
Alignment:
Q  137 attgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 236  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  16258273 attgaagatctggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatg 16258174  T
Q  237 aggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaaga 336  Q
    |||||| | || |||||| |||  || || |||| ||||||| | ||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  16258173 aggcagaggagatggttgaaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccagaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaaga 16258074  T
Q  337 ctttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||    
T  16258073 ctttgcatatgtctg 16258059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14087938 - 14087602
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| ||||| | ||||| |||||||| ||    
T  14087938 gtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagagtgcatgaaaagaattatcc 14087839  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  || |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||     
T  14087838 tactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagc 14087739  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||  |  | || |||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  14087738 ttgaaatatttatctgattagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttaaactatcatccgggta 14087639  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  14087638 aagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 14087602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 351
Target Start/End: Original strand, 13319401 - 13319716
Alignment:
Q  36 atgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttg 135  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||| || || || ||||    
T  13319401 atgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttctaggcagctgagagttcatgaaaagaattatcgtacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttg 13319500  T
Q  136 tattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatat 235  Q
    | || || |||||||| || ||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  13319501 ttttaaaaatatggaggcactatctgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagcttgaggtatttatttgatcagaaggaattgaacat 13319600  T
Q  236 gaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaag 335  Q
    ||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||| ||||  ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||||    
T  13319601 gaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcgaatgcgttgagcaggaag 13319700  T
Q  336 actttgcatatgtctg 351  Q
    || || ||||||||||    
T  13319701 accttacatatgtctg 13319716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12793350 - 12793056
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || |||||| || ||||| || |    
T  12793350 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaaaatttggaggcact 12793251  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| | || ||||||||    
T  12793250 atctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatacgaggcagaggagatggttgga 12793151  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || || | ||||||| | ||||| |||||||  || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||    
T  12793150 atatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatctcggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagtaagattttgcatatgtctg 12793056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18751152 - 18750859
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||  || ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| ||||    
T  18751152 gcttatgctttaaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagat-tggaggcatt 18751054  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  | |||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18751053 atctatatggttctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaaggtggttgga 18750954  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
     |  || || ||||   ||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  18750953 gtatcttaaggatttcaattttcagttgagttatcatccagggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 18750859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 25767527 - 25767233
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||| ||| |||||||   | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| ||||||||||    
T  25767527 gcttatgctttgaggcagttgaaggtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagacatt 25767428  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||| ||||| ||    
T  25767427 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagcttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgagacaaagaagatggtttga 25767328  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || ||||  |||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  25767327 atatcttaaggatttcgattttcaattgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 25767233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14575025 - 14574838
Alignment:
Q  164 tggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgcta 263  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| ||    
T  14575025 tggttccaggtttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgtta 14574926  T
Q  264 aaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    || |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  14574925 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctg 14574838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 351
Target Start/End: Original strand, 16328535 - 16328874
Alignment:
Q  12 aagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatt 111  Q
    ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  ||||||||||||| || ||||  ||||||     
T  16328535 aagttgggcgtaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgggttcatgagaagaactatcctacacatgatc 16328634  T
Q  112 tagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattt 211  Q
    | || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||    
T  16328635 tggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgataataaaagtttgaaatattt 16328734  T
Q  212 gtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| || || || || ||||| |||||||  ||||  || ||||| ||||| || |||||     
T  16328735 gtttgatcagaaggaattgaacatgaggcacaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 16328834  T
Q  312 gttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||    
T  16328835 gttgctgatgcattgagcaggaaaacattacatatgtctg 16328874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17187638 - 17187291
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    ||||||||  ||| |||| |||| ||||||  | ||||||| ||| ||  |||||||||||||||| || ||| ||||  | |||||||||||||| |||    
T  17187638 tgatgcgtctaagctgggtttagtaggtgtttttatgcaagttggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagctgagggtacatgagaagaattatcct 17187539  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    |   | ||||| ||||||||  | || || ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  17187538 acttacgatttggagttggcttcggtggtttttgttttgaagatttgtaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagct 17187439  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||  |  | || ||||||||||||   |||| |||||| ||||||||    
T  17187438 tgaaatatttatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttagtttgaactatcacccgggtaa 17187339  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||    
T  17187338 agccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcattgcatatgtc 17187291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17194303 - 17194009
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| || ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| ||||    
T  17194303 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 17194204  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17194203 atctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaaatacttgcttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttgga 17194104  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || ||  ||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||| ||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  17194103 atatcttaagaattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctattgttgttgatgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 17194009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 343
Target Start/End: Original strand, 55514651 - 55514935
Alignment:
Q  59 ttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattac 158  Q
    |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| || || |   ||||||| || ||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||     
T  55514651 ttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaactatccgacttatgatttggaattggcggctgttgtgtatgtgttgaagatttggaggcattat 55514750  T
Q  159 ttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaat 258  Q
     |||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||| |    
T  55514751 ctgtatggttctaaatttaaagtgttaagtgatcacaagagtttgaagtatatgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttggagt 55514850  T
Q  259 tgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgca 343  Q
      || || ||||   | ||| | ||||| ||||||||  | || ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  55514851 atcttaaggatttcaactttcagttgagttatcatccaagaaaggctaacgttgttgctgataccttgagtaggaagactttgca 55514935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 351
Target Start/End: Original strand, 15014642 - 15014981
Alignment:
Q  12 aagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatt 111  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||    || | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    ||||| ||||  ||||||     
T  15014642 aagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaggataatgaagtagtagcttatgcatcgaggcagttgaggattcatgaatgcaattatcctactcatgatc 15014741  T
Q  112 tagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattt 211  Q
    | ||||| || ||  | |  |||||| | || || ||||| |||||  | |||| ||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||    
T  15014742 ttgagttagctgcattggcttttgtaatcaaaatttggaggcattatctatatgtttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtattt 15014841  T
Q  212 gtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgtt 311  Q
     |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||    ||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  15014842 atttgactagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgctaaagaattatgatttcaggttgaattaccatccgggtaaggctaatgtt 15014941  T
Q  312 gttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||| |  |||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  15014942 gttacaaatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctg 15014981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12887960 - 12887844
Alignment:
Q  5 tgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatg 104  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12887960 tgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaaatggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcctacg 12887861  T
Q  105 catgatttagagttggc 121  Q
    |||||| | ||||||||    
T  12887860 catgatctcgagttggc 12887844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 351
Target Start/End: Original strand, 16337522 - 16337726
Alignment:
Q  147 tggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 246  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  16337522 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagga 16337621  T
Q  247 ggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatat 346  Q
    | ||||| || || || || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||| || || ||||| || || |||||    
T  16337622 gatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccgatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattacatat 16337721  T
Q  347 gtctg 351  Q
    |||||    
T  16337722 gtctg 16337726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10384921 - 10384730
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    ||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||||  ||||| || ||    
T  10384921 tgggcctaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacttgga 10384822  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagt 207  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  10384821 gttagctgcagtggtttttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagt 10384730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15096080 - 15095921
Alignment:
Q  192 cacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaatt-gagctat 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||| | ||  || |||    
T  15096080 cacaagagtttgaagtacttgttcgatcagaaggagttgaatatgaggcagaggaggtgattggaatttcttaaggattatgatttttagttaaagttat 15095981  T
Q  291 catccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtct 350  Q
    ||||| || || || ||||| || || ||||| || |||| |||  ||||||||||||||    
T  15095980 catcctggaaaggcgaatgtagtagcagatgctttgagtaagaattctttgcatatgtct 15095921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 239
Target Start/End: Original strand, 6711344 - 6711525
Alignment:
Q  58 cttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatta 157  Q
    ||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||| || || |  |||||||| || ||||| ||  | || | ||| |||||||| ||||| |||||    
T  6711344 cttatgcgtcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaactatccaactcatgatttggaattggcggccattgtgtatgtgttgaagatttggagccatta 6711443  T
Q  158 cttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagg 239  Q
      |||||||||| |  |||||  |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  6711444 tctgtatggttctaagtttgaaatgttcagtgaccacaagagattgaagtacttgtttgaccagaaagagttgaatatgagg 6711525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17493629 - 17493545
Alignment:
Q  267 gattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  17493629 gattatgattttggtttgagttaccatccgggtaaagccaacgtggttgcagatgccttgaggaggaagacgttgcatatgtctg 17493545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 349
Target Start/End: Original strand, 16755757 - 16755808
Alignment:
Q  298 gtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16755757 gtaaagcgaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 16755808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22136236 - 22135888
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22136236 gtgatgcgtccaaattgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 22136137  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    |||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136136 tatgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 22136037  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  22136036 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 22135937  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22135936 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 22135888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27611922 - 27611574
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27611922 gtgatacgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 27611823  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611822 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 27611723  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  27611722 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 27611623  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27611622 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 27611574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 25428001 - 25427651
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25428001 gtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaggatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 25427902  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25427901 tacgcacgatttagagttggctgttgtggtttttgtattgaagatatggagactttacttttatggttccagatttgaggtatttagtgatcataagagt 25427802  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  25427801 ttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaacatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccgtgta 25427702  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  25427701 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctg 25427651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 14998557 - 14998905
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14998557 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 14998656  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14998657 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtcttcgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 14998756  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  14998757 ttgaagtatttgtttgatcagaaagaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 14998856  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14998857 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 14998905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 27667308 - 27667656
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||  || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27667308 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtactaatgcaaggaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 27667407  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27667408 tacgcatgatctcgagttggtggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 27667507  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  27667508 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggta 27667607  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27667608 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 27667656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34568062 - 34567714
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  34568062 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 34567963  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34567962 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 34567863  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  34567862 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 34567763  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34567762 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 34567714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16358070 - 16357722
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16358070 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 16357971  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16357970 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 16357871  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  16357870 ttgaagtatttgttcgatcagaaggagttgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 16357771  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16357770 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 16357722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19771528 - 19771180
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||  || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19771528 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaaggaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 19771429  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19771428 tacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 19771329  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| || ||||  ||||  |||||||||||||    
T  19771328 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggta 19771229  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19771228 aagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 19771180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 22331705 - 22332053
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22331705 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagtagagaattcatgagaagaattatcc 22331804  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22331805 tacgcatgatctcgagttggtggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 22331904  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  22331905 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 22332004  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22332005 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 22332053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18777354 - 18777014
Alignment:
Q  11 caagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgat 110  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18777354 caagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattacccgacgcatgat 18777255  T
Q  111 ttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatt 210  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18777254 ctagagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatt 18777155  T
Q  211 tgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgt 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  18777154 tgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgattttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgt 18777055  T
Q  311 tgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  18777054 tgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtctg 18777014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 27684218 - 27684566
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27684218 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcc 27684317  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27684318 cacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 27684417  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  27684418 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggta 27684517  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27684518 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 27684566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27519974 - 27519626
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  27519974 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 27519875  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27519874 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 27519775  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  27519774 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 27519675  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27519674 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 27519626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 40710348 - 40710000
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  40710348 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 40710249  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  40710248 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 40710149  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  40710148 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 40710049  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40710048 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 40710000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 41772410 - 41772062
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  41772410 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgataattcatgagaagaattatcc 41772311  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  41772310 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 41772211  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  41772210 ttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 41772111  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41772110 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 41772062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 29474891 - 29475239
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474891 gtgatgcgtccaaactgggtttaggaggtgtagttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 29474990  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474991 tacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 29475090  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  29475091 ttgaattatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatgacttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 29475190  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29475191 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 29475239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23575287 - 23574949
Alignment:
Q  11 caagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgat 110  Q
    |||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  23575287 caagctgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttttgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattacccgacgcacgat 23575188  T
Q  111 ttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatt 210  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23575187 ttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatt 23575088  T
Q  211 tgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgt 310  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  23575087 tgttcaatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggctcgaattaatgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgt 23574988  T
Q  311 tgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  23574987 tgttgcagatgccttgagtaggaaggcattgcatatgtc 23574949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 37290314 - 37290662
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37290314 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaaaaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 37290413  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37290414 tacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttcagtgatcacaagagt 37290513  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | |||||| | || ||||| || ||||  ||||  ||||| || ||||    
T  37290514 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcacccaggta 37290613  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37290614 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 37290662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20800965 - 20800659
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||     
T  20800965 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagggagttgagaattaatgagaagaattacca 20800866  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20800865 gacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 20800766  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  | ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||    
T  20800765 ttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggta 20800666  T
Q  301 aagctaa 307  Q
    |||||||    
T  20800665 aagctaa 20800659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23441776 - 23441430
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23441776 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtg--cttatgtaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaggcagctgagaattcatgagaagaattaccc 23441679  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  23441678 gacgcatgatttggagttggcggctgtggcctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaagtgtttagtgatcacaagagc 23441579  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  23441578 ttaaagtatttgttcgatcagaaagaactgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 23441479  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23441478 aaactaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 23441430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 21562791 - 21563138
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  21562791 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaggtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagcggaattatcc 21562890  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||| || ||||  ||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21562891 tacgcatgatttggagttggctgctgtggtttttggtttgaaaatttggaggcattatttgtacgactccagatttgaggtgtttagcgatcacaagagt 21562990  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || | || || |||||||||   ||||  |||||||| ||||    
T  21562991 ttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaactgttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaggta 21563090  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  21563091 aagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgt 21563138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 21338115 - 21338463
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |  ||||| ||    
T  21338115 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacggttgaggattcatgaaagaaattatcc 21338214  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | ||||| || || || ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  21338215 tactcatgatcttgagttagctgcagtggtctttgtacttaagatatagagacattacttgtattgttcgagatttgaagtgttcagcgaacacaagagt 21338314  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||    
T  21338315 ttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaatgtggcttgaattgctgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggta 21338414  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||||||  |||| || || |||||||   ||||||||||    
T  21338415 aagctaatgttgttgcaaatgctttgagcaggaagatgctgcatatgtc 21338463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 24619113 - 24619463
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  24619113 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 24619212  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24619213 tacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagt 24619312  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  || | || |||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  24619313 ctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggta 24619412  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||    
T  24619413 aagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctg 24619463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 24715344 - 24715694
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  24715344 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 24715443  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24715444 tacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagt 24715543  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  || | || |||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  24715544 ctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggta 24715643  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||    
T  24715644 aagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctg 24715694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 24748372 - 24748722
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  24748372 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 24748471  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24748472 tacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagt 24748571  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  || | || |||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  24748572 ctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggta 24748671  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||    
T  24748672 aagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctg 24748722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22463501 - 22463153
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | |||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| ||||  ||||||| |||||||| ||    
T  22463501 gtgatgcttccaagtttggtttaggaggtgtgttgatgcaagatggaaaggtggtagcttatgcttctaggcagctgagggttcatgaaaagaattatcc 22463402  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||||||| |||| || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  22463401 tacgcatgatttagagctggctgcggtggtgtttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagt 22463302  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| | || ||| | || ||  ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  22463301 ttgaagtatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggta 22463202  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  22463201 aagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtc 22463153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23472795 - 23472448
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    ||||| ||    
T  23472795 gtgatgcatccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatggtaaggtagtagcttatgcatcgaaacagctgaggattcatgaacgaaattatcc 23472696  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | || || || || || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  23472695 tactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagcgatcataa-agt 23472597  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||  || |  |||||||  ||||    
T  23472596 ctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttaaattatcatctaggta 23472497  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23472496 aagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtc 23472448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20823003 - 20822655
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | |||||| || || ||||||||| | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  20823003 gtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcttctaggcagctgagagttcatgaaaagaattatcc 20822904  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  20822903 tacacatgatttggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagt 20822804  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| | || ||| | || ||  ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  20822803 ttgaaatatttgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggta 20822704  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  20822703 aagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtc 20822655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 21936059 - 21936356
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| |||||||    
T  21936059 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagac 21936158  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||    
T  21936159 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggtt 21936258  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  21936259 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 21936356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 26737545 - 26737893
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| ||    
T  26737545 gtgatgcgtccaagttgggcttatgtggtgtgcttatgcaagatggaaaggtagtagcttatgcatcgagacagttgaggattcatgaacgaaattatcc 26737644  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||   ||||| | || || || || || || || ||| | || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  26737645 tacttatgatcttgaattagctgcagtggttttcgtacttaaaatatggagacactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccataagagt 26737744  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    || || || || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| | ||||| |||||||||   ||||  ||||||||  |||    
T  26737745 ttaaaatacttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagggaaggtggcttgagttgttgaaagactatgattttagtttgaattatcatccaagta 26737844  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  26737845 aagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtc 26737893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24582707 - 24582410
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| ||||| || | |  ||||||||| |||||      
T  24582707 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggctgttgtgtatacattgaagatttggagga 24582608  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    | ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  24582607 actatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 24582508  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  24582507 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 24582410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 349
Target Start/End: Original strand, 20466972 - 20467264
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||  |||||| | || || || || || ||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  20466972 gcttatgcatcgagacaattgaggattcatgaacaaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgcttaagatttggagacatt 20467071  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||    
T  20467072 atttgtatggttctagatttgaagtgttgagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttga 20467171  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| | ||||||||    
T  20467172 attgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtcggaaaactctacatatgtc 20467264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 22234738 - 22235088
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22234738 gtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttaagaattcatgaaaagaattaccc 22234837  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  22234838 tactcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttagaggcattatttgtatggtttcagatttgaagtattcagtgatcacaaaagt 22234937  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||  || | || || ||||| ||||  ||||  || ||||  ||||    
T  22234938 ctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggactatgaatttggcttgaattaccatcttggta 22235037  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  22235038 aagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctg 22235088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 28893760 - 28894108
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | |||||| || || ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||  ||||  | ||||| |||||||| ||    
T  28893760 gtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaactgagggtccatgaaaagaattatcc 28893859  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  28893860 tacgcatgatctggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagt 28893959  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| | || ||| | || ||  |||| |||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||    
T  28893960 ttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggta 28894059  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  28894060 aagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtc 28894108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 28922586 - 28922934
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | |||||| || || ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||  ||||  | ||||| |||||||| ||    
T  28922586 gtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaactgagggtccatgaaaagaattatcc 28922685  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  28922686 tacgcatgatctggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagt 28922785  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| | || ||| | || ||  |||| |||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||    
T  28922786 ttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggta 28922885  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  28922886 aagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtc 28922934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 28915231 - 28915579
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | |||||| || || ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||   |||  | ||||| |||||||| ||    
T  28915231 gtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaaccgagggtccatgaaaagaattatcc 28915330  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  28915331 tacgcatgatctggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagt 28915430  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| | || ||| | || ||  |||| |||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||    
T  28915431 ttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggta 28915530  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  28915531 aagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtc 28915579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 28930499 - 28930847
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | |||||| || || ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||   |||  | ||||| |||||||| ||    
T  28930499 gtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaaccgagggtccatgaaaagaattatcc 28930598  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  28930599 tacgcatgatctggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagt 28930698  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| | || ||| | || ||  |||| |||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||    
T  28930699 ttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggta 28930798  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  28930799 aagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtc 28930847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 21871869 - 21872218
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  21871869 gtgatgcgtccaagtttggcttaggcggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaactatcc 21871968  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||||| |||||||| || || || ||| | ||||| || ||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  21871969 gacacatgatttggagttggctgcggtggtttttcttttgaaaatttggagacattattagtacggtttcagatttgaagtgtttagtgatcataaaagt 21872068  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||  | || ||| | || |||||||||||||  ||||  || |||||| |||    
T  21872069 ttgaaatatctgtttgatca-aaagaattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagta 21872167  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||  | ||||| ||||| |||||||    
T  21872168 aagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctg 21872218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 21876149 - 21876498
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  21876149 gtgatgcgtccaagtttggcttaggcggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaactatcc 21876248  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||||| |||||||| || || || ||| | ||||| || ||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  21876249 gacacatgatttggagttggctgcggtggtttttcttttgaaaatttggagacattattagtacggtttcagatttgaagtgtttagtgatcataaaagt 21876348  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||  | || ||| | || |||||||||||||  ||||  || |||||| |||    
T  21876349 ttgaaatatctgtttgatca-aaagaattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagta 21876447  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||  | ||||| ||||| |||||||    
T  21876448 aagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctg 21876498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Original strand, 21679631 - 21679932
Alignment:
Q  36 atgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttg 135  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| ||||| | ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||| || || || ||||    
T  21679631 atgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagagtgcatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttg 21679730  T
Q  136 tattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatat 235  Q
    | || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  21679731 ttttaaagatttggaggcagtacttgtatggttccagattcgaagtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacat 21679830  T
Q  236 gaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaag 335  Q
    ||||||| | || ||||| ||  |  | || |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  21679831 gaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaag 21679930  T
Q  336 ac 337  Q
    ||    
T  21679931 ac 21679932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27012581 - 27012284
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||  ||||| || | |  ||||||||| ||||| |    
T  27012581 gtagcttatgcttcgaggtagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggtagctgttgtgtatacattgaagatttggaggc 27012482  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    | ||  |||||||||| |  || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||    
T  27012481 actatctgtatggttctaagttcgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggtt 27012382  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  27012381 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 27012284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 14885824 - 14886159
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| |   ||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  14885824 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtagggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtattcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 14885923  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  14885924 gttagctgcagtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 14886023  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || || |||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  14886024 gaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 14886123  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| |||||||    
T  14886124 ctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctg 14886159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20343817 - 20343482
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  20343817 tgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgatttgga 20343718  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
     ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  20343717 attggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 20343618  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||  | |||||||| || || || || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  20343617 gaccagaaggaactgaacatgaggcataggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 20343518  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| |||||||    
T  20343517 ctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctg 20343482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 24797230 - 24797565
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||| |||||||| || |||||  | ||||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  24797230 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtagtagcgtatgcttctaggcagttacgtattcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 24797329  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||    
T  24797330 gttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgaccataaaagtttgaagtatttattt 24797429  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| || || || || |||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| || |    
T  24797430 gaccagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggtag 24797529  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  24797530 ctgatgctttgagtaggaagactttgcacatgtctg 24797565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 17268152 - 17268502
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||  ||||  | ||||| |||||||| ||    
T  17268152 gtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttaatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaactgagggtacatgaaaagaattatcc 17268251  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  || ||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  17268252 cactcacgatttggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagc 17268351  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||| | ||  || ||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||| |    
T  17268352 ttgaaatatttgtttgatcagacggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaatattatgattttgggttgaattaccatccgggaa 17268451  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  17268452 aagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctg 17268502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20777463 - 20777222
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | |||||| || || ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||    
T  20777463 gtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagctgagagttcatgaaaagaattctcc 20777364  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  20777363 tacgcatgatttggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagt 20777264  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcag 242  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  20777263 ttgaaatatttgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcag 20777222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22504214 - 22503879
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  22504214 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 22504115  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  22504114 gttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 22504015  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  22504014 gaccagaaggaactgaacatgaggcaaagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 22503915  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  22503914 ctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctg 22503879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 351
Target Start/End: Original strand, 23078958 - 23079257
Alignment:
Q  52 tggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggag 151  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| || || |  ||||| || || || |||||    
T  23078958 tggtagcatatgcttctaggcagttgaggatacatgagaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgcggtggggtttgttttaaaaatttggag 23079057  T
Q  152 acattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtgg 251  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | || |||    
T  23079058 gcattatttgtatggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattaaacatgaggcagaggagatgg 23079157  T
Q  252 ttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    || ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||  |||| || || ||||| || || ||||||||||    
T  23079158 ttagagctgttgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagcaggaaaacattacatatgtctg 23079257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 343
Target Start/End: Original strand, 37542214 - 37542541
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||  |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  37542214 tgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttacgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 37542313  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  37542314 gttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttgttt 37542413  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| || ||  | || |||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  37542414 gaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttattgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 37542513  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgca 343  Q
    | || || ||||||||||| ||||||||    
T  37542514 ctgacgctttaagtaggaaaactttgca 37542541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 25849590 - 25849275
Alignment:
Q  36 atgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttg 135  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||  | ||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | |||||||| || || || ||||    
T  25849590 atgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggaaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagttggctgcagtggtttttg 25849491  T
Q  136 tattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatat 235  Q
    | || || || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||    
T  25849490 ttttaaaaatttggaggcatgatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacat 25849391  T
Q  236 gaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaag 335  Q
    ||||||| | || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  25849390 gaggcagaggagatggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaa 25849291  T
Q  336 actttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||| |||||||    
T  25849290 actttgcacatgtctg 25849275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21408706 - 21408356
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| |||   ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    ||||| ||    
T  21408706 gtgatgcgtctaagttgggtttaggtgttgtgcttatgcaggataataaagtagtagcttatgcatcgaggcagttgaggattcatgaatgtaattatcc 21408607  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | | ||| |  || ||| | |||||| | || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||| ||||| || ||||| || |||    
T  21408606 tactcatgatcttgggttagttgcagtaatttttgtacttaaaatttggaggcattatctgtatggttctaaatttgacgtgttcagcgatcataaaagt 21408507  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||||||| || | |||||  || ||||||||||    
T  21408506 ctgaagtatttatttgaccagaaataattaaatatgaggcagcataggtggcttgaattgctaaaggattatgaattcggattgaattaccatccgggta 21408407  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | |||||||||||||| ||| | ||||||||||| || || ||||||||||    
T  21408406 aggctaatgttgttgcagatactttaagtaggaaaacattacatatgtctg 21408356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21882293 - 21882169
Alignment:
Q  225 gaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgcct 324  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  21882293 gaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgttgatgcct 21882194  T
Q  325 taagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||    
T  21882193 tgagtaggaagacattgaatatgtc 21882169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23504741 - 23504558
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| |  || || | || ||||||||| ||||| |    
T  23504741 gtagcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggtcgttgtgtatgcattgaagatttggaggc 23504642  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatga 237  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||    
T  23504641 attatttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccataagagtttgaagtacttgttaaatcagaaagagttgaatatga 23504558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 316
Target Start/End: Original strand, 820 - 922
Alignment:
Q  214 ttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| | || ||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||    
T  820 ttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggt 919  T
Q  314 tgc 316  Q
    |||    
T  920 tgc 922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22349487 - 22349421
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttc 67  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  22349487 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaatgtggtagcttatgcttc 22349421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21624291 - 21624140
Alignment:
Q  90 aagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtg 189  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||| || || || || ||||  ||||| || ||||| ||| | ||||||||  | |  ||||| || ||||| |    
T  21624291 aagaattaccctacgcatgatctggagttagctgcagtcgtgtttgcgttgaaaatctggaggcatcatttgtatggagcaaagtttgaagtttttagcg 21624192  T
Q  190 atcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggca 241  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||||||    
T  21624191 accacaagagtttaaagtacttgtttgatcaaaaggaactcaacatgaggca 21624140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21497223 - 21497147
Alignment:
Q  270 tatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatat 346  Q
    ||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||    
T  21497223 tatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttacatat 21497147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 348
Target Start/End: Original strand, 21830878 - 21830926
Alignment:
Q  300 aaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  21830878 aaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgt 21830926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 8051999 - 8052347
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8051999 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 8052098  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8052099 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 8052198  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  8052199 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 8052298  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8052299 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 8052347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23957383 - 23957035
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23957383 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 23957284  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23957283 tacgcatgatctcgagttggcggcagtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 23957184  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| || ||||  ||||  |||||||||||||    
T  23957183 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggta 23957084  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23957083 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 23957035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 29037780 - 29038128
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  29037780 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 29037879  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29037880 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 29037979  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  29037980 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 29038079  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29038080 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 29038128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12525312 - 12524965
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12525312 gtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 12525213  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12525212 gacgcatgatctagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaagagt 12525113  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  12525112 ttgcagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 12525013  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12525012 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 12524965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27712972 - 27712624
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||  || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27712972 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaaggaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 27712873  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27712872 tacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgaccacaagagt 27712773  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| || ||||  ||||  |||||||||||||    
T  27712772 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggta 27712673  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27712672 aagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 27712624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 40474676 - 40474328
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  40474676 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagatagttgagagttcatgagaagaattatcc 40474577  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  40474576 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 40474477  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || || || ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  40474476 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagacttactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 40474377  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40474376 aagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtc 40474328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8388048 - 8387700
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  8388048 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 8387949  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  8387948 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 8387849  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  8387848 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 8387749  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8387748 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 8387700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 14302354 - 14302702
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  14302354 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 14302453  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | ||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14302454 tacgcatgatctcgagttagcggccgtaatctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 14302553  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||| | ||||    
T  14302554 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcattcaggta 14302653  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  14302654 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagatattgcatatgtc 14302702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 18614200 - 18614548
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18614200 gtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 18614299  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18614300 gacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcataagagt 18614399  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| || | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  18614400 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggatagaactgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 18614499  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||    
T  18614500 aagctaatgttgttgctgatgccttgagcatgaagacattgcatatgtc 18614548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12478236 - 12477888
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  12478236 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 12478137  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  12478136 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 12478037  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  12478036 ttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 12477937  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12477936 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 12477888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14682203 - 14681855
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682203 gtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 14682104  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682103 gacgcatgatctagagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 14682004  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | | |||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  14682003 ttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggatgtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 14681904  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14681903 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 14681855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 15146261 - 15146609
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15146261 gtgatgcatccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 15146360  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15146361 cacgcatgatttagagttagccgccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacgagagc 15146460  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  15146461 ttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggcggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 15146560  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  15146561 aagctaatgttgttgtagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtc 15146609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 19777169 - 19777517
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19777169 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 19777268  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19777269 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 19777368  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  19777369 ttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 19777468  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19777469 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 19777517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18298841 - 18298493
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18298841 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 18298742  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18298741 tacgcatgacctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 18298642  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  18298641 ttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 18298542  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18298541 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 18298493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 52 - 349
Target Start/End: Original strand, 16353872 - 16354169
Alignment:
Q  52 tggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggag 151  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16353872 tggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattacccgacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgttttgaagatatggag 16353971  T
Q  152 acattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtgg 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16353972 acattacttgtatggttcgagattcgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtgg 16354071  T
Q  252 ttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
     | |||||  | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16354072 cttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 16354169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 349
Target Start/End: Original strand, 18225823 - 18226170
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18225823 tgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaagtacccg 18225922  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18225923 acacatgatttagagttggcggctgtggtctttgtatttaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagct 18226022  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||| | ||||||||||| | ||  ||||  |||||||| |||||    
T  18226023 tgaaatatttgttcgatcaaaaggaattaaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactatggtttgaattatcatccaggtaa 18226122  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  18226123 agctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtc 18226170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14161106 - 14160758
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||  |||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14161106 gtgatgcatccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagacggcaaggtggttggttatgtgtcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 14161007  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14161006 tacgcatgatttagagttggccgcagtagtctttgtattgaagatatggagacattacttatatggttcgaggtttgaagtgttcagtgatcacaagagt 14160907  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || || || || |||| ||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  14160906 ttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgagttactgaaggattttgattttggcttgaattatcatccgggta 14160807  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14160806 aagcgaatgtcgtagctgatgccttaagtagaaagaccttgcatatgtc 14160758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8707547 - 8707206
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  8707547 gtgatgcgtccaagttgagcttaggtggtgtgcttatgcaagatgg--------tagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagcggaattatcc 8707456  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8707455 aacgcatgatttagagttggctgctgtggtttttgcgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttatcgatcacaagagt 8707356  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| | || || ||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  8707355 ttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatga-gcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggta 8707257  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  8707256 aagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctg 8707206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 56566167 - 56566368
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56566167 gtgatgcgtccaagttgggtataggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 56566266  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56566267 tacgcacgatttagagttagctgctgtggtctttgtattgaagatatggagaaattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 56566366  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  56566367 tt 56566368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 14849742 - 14850090
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| ||    
T  14849742 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttgaggattcatgaacgaaattatcc 14849841  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | || || || || || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14849842 tactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtacttaagatatggagacattatttgtacgattctagatttgaagtgtttagcgatcacaagagt 14849941  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||  | ||||| ||||||||||  || |  |||||||| ||||    
T  14849942 ttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaatttgtgaaagactatgattttgggtttaattatcatccaggta 14850041  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14850042 aagctactgttgttgcagatgctttaagtaggaagacgttgcatatgtc 14850090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15071992 - 15071645
Alignment:
Q  4 atgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||     
T  15071992 atgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctagacagttgaggattcatgaaaagaattatcctac 15071893  T
Q  104 gcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttg 203  Q
     |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071892 acatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggctctagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttg 15071793  T
Q  204 aagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaag 303  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||  | || || |||||||||   || |  || |||||||||||||    
T  15071792 aaatatttttttgaccaaaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaag 15071693  T
Q  304 ctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  15071692 ctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 15071645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16153491 - 16153145
Alignment:
Q  3 gatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattacccta 102  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16153491 gatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggaaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagagttcatgaaaagaattacccta 16153392  T
Q  103 tgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagttt 202  Q
     ||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  16153391 cgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacatgagttt 16153292  T
Q  203 gaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaa 302  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || | || ||||| || ||| | || || ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||    
T  16153291 aaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaa 16153192  T
Q  303 gctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    || ||||| ||||| ||| | || || |||||||| |||||||||||    
T  16153191 gccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacattgcatatgtc 16153145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16149345 - 16148999
Alignment:
Q  3 gatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattacccta 102  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  16149345 gatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggaaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagagttcatgaaaagaattatccta 16149246  T
Q  103 tgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagttt 202  Q
     ||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  16149245 cgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacatgagttt 16149146  T
Q  203 gaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaa 302  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || | || ||||| || ||| | || || ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||    
T  16149145 aaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaa 16149046  T
Q  303 gctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    || ||||| ||||| ||| | || || |||||||| |||||||||||    
T  16149045 gccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacattgcatatgtc 16148999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15247560 - 15247210
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | |||||||| || ||| ||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  15247560 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagaaggtaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgagaactcatgaaaagaattatcc 15247461  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || |||||| || ||||| || || || |||||||| ||||| || |||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15247460 tacgcatgacttggagttagctgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggtattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagt 15247361  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||| | || ||| |||| |||||||| ||||  ||||  || ||| ||||||    
T  15247360 ctgaaatatttatttgatccgaaggaattgaatatggggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgactttggtttgaattaccattcgggta 15247261  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||  || || |||||||| ||||| |||||||    
T  15247260 aagctaatgtggttgcagatgttttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 15247210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14695749 - 14695401
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||  |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| ||    
T  14695749 gtgatgcgtccaagttaggcttaagtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtaatagcttatgcatcgagacagttgaggattcatgaacgaaattatcc 14695650  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  ||| || | || || || || || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| || |||    
T  14695649 tactcattatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaagt 14695550  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  14695549 ctgaagtatctgtttgatcagaaggaattggatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggta 14695450  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14695449 aagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagaagttgcatatgtc 14695401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 15002000 - 15002348
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| || |||||||| |||||| | |||||||| ||    
T  15002000 gtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatggttctaggcagttgaggattcataaaaagaattatcc 15002099  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  15002100 tacacatgatttggagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagt 15002199  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  15002200 ttgaaatatttatttgattagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 15002299  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  15002300 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtc 15002348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 15291847 - 15292144
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| ||||| || | |  ||||||||| ||||| |    
T  15291847 gtagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttagaattggcggctgttgtgtatacattgaagatttggaggc 15291946  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    | ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||    
T  15291947 actatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggtt 15292046  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  15292047 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 15292144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 15357756 - 15358106
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||| | ||  ||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  15357756 gtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatcgtaaggtggtagcttatgcttcttggtagttaagaattcatgaaaagaattatcc 15357855  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  15357856 tacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagt 15357955  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||  ||  || | ||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  15357956 ctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggtgagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggta 15358055  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  15358056 aagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctg 15358106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9292415 - 9292121
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| ||||| || | |   |||||||| ||||| || |    
T  9292415 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggctgttgtgtatacgttgaagatttggaggcact 9292316  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    | ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9292315 atttgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttgga 9292216  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || || | ||||||| | ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  9292215 atatcttaaggactttgattttcacttgagttatcatcctgggagggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 9292121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 51605428 - 51605778
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||  ||||  | || || |||||||| ||    
T  51605428 gtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaaagaattatcc 51605527  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  51605528 cactcatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagc 51605627  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| | ||  || ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||| |    
T  51605628 ttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaa 51605727  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||||||  | ||||||||||    
T  51605728 aagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacactccatatgtctg 51605778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14998898 - 14998602
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| |    
T  14998898 gtagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccaactcatgatttggaattggcggccgttgtatatgcattgaagatttggaggc 14998799  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    | || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  14998798 actatttgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgacca-aagagtttaaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 14998700  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  14998699 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 14998602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 3263445 - 3263780
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  3263445 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 3263544  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  3263545 gttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 3263644  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || || |||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  3263645 gaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 3263744  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  3263745 ctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctg 3263780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 33224476 - 33224209
Alignment:
Q  84 catgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgt 183  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  33224476 catgagaagaattatcctacgcatgatctggagttggctgctgtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattacttgtacggtttcagatttgaggtgt 33224377  T
Q  184 ttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaatt 283  Q
    | |||||||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  || | ||||||||||||||||  ||    
T  33224376 tcagtgatcataaaagcttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttagagctgttgaaagattatgattttggctt 33224277  T
Q  284 gagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||    
T  33224276 gaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattacatatgtctg 33224209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27901996 - 27901674
Alignment:
Q  27 ggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctg 126  Q
    |||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||| || |    
T  27901996 ggtgtgttgatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttctaagtagctgagagttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggaattggctgcgg 27901897  T
Q  127 tagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaagga 226  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| || || ||    
T  27901896 tggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatatgtttgaacaaaaaga 27901797  T
Q  227 attgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgcctta 326  Q
    |||||| ||||||||| | || ||| | || ||  ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  27901796 attgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttg 27901697  T
Q  327 agtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  27901696 agtaggaagacattgcacatgtc 27901674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 11205882 - 11206217
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  |||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||    
T  11205882 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtgttcatgagaaaaattatcctacacatgatctaga 11205981  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
     ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  11205982 attggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattctttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 11206081  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||||||| |||| |||||| || | |||||||| || || || || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  11206082 gaccagaaggaactgaacatgaggtagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttg 11206181  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| |||||||    
T  11206182 ctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctg 11206217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 29452188 - 29452523
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  29452188 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 29452287  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  29452288 gttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 29452387  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || || |||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  29452388 gaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 29452487  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| |||||||    
T  29452488 ctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctg 29452523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 349
Target Start/End: Original strand, 18548721 - 18549043
Alignment:
Q  27 ggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctg 126  Q
    |||||||| |||||||||||  |   |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||||| ||  |||    
T  18548721 ggtgtgcttatgcaagatgggcatgcggtagcttatgcttcgagacaactgaagattcatgagaggaattacccgacacatgatttggagttagcaactg 18548820  T
Q  127 tagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaagga 226  Q
    |||| |||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  18548821 tagtgtttgtacttaaggtatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaaga 18548920  T
Q  227 attgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgcctta 326  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||| || |||||||||||| | || |||||||  || || || ||||| || || ||||||||     
T  18548921 gttgaatatgagacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaaataagttatcatctagggaaggccaatgtagtagctgatgccttg 18549020  T
Q  327 agtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||| | ||||| |||||    
T  18549021 agtaggaagtccttgcacatgtc 18549043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 44660517 - 44660852
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    ||||||| || ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  44660517 tgggcttgggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 44660616  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  44660617 gttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttgaaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 44660716  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||||||| |||| ||||| ||| | |||||||| || || || ||||||||||||||||  ||||  || ||||| ||||| || || |||||||    
T  44660717 gaccagaaggaactgaacatgagacagaggaggtggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttg 44660816  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || | ||| ||||||||||||||||    
T  44660817 ctgatgctttgagcaagaaaactttgcatatgtctg 44660852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 349
Target Start/End: Original strand, 1647948 - 1648261
Alignment:
Q  36 atgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttg 135  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||| || || || ||||    
T  1647948 atgcaagatggcaaggtggtagcttacgcttctaggcagctgagagttcatgaaaagaattaccctacttatgatttggagttggctgcagtggtttttg 1648047  T
Q  136 tattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatat 235  Q
    | |||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||    
T  1648048 tcttgaagatttggaggcactacttgtatggttcacgatttgaagtatttagtgaccacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggagctgaacat 1648147  T
Q  236 gaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaag 335  Q
    |||| || | || ||||| ||  || | ||||| ||||| ||||  ||||  || || ||   ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  1648148 gaggtagaggagatggttagagctgttgaaagactatgactttggtttgaattaccaccctaataaggctaatgttgtggcggatgcgttgagtaggaag 1648247  T
Q  336 actttgcatatgtc 349  Q
    || ||||| |||||    
T  1648248 acattgcacatgtc 1648261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 350
Target Start/End: Original strand, 12341639 - 12341850
Alignment:
Q  139 tgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgag 238  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||  ||| |  ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12341639 tgaagatttggaggcattatttgtatcattctaagtttgaagtgttcagcgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagaattgaatatgag 12341738  T
Q  239 gcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagact 338  Q
    |||| | ||  |||||||||| || || || || |||||| | ||||| |||||||| || || || |||||||| |||||| | || |||| |||| ||    
T  12341739 gcagaggagaaggttggaatttcttaacgactacgatttttagttgagttatcatcctgggaaggcaaatgttgtggcggattctttgagtatgaagtct 12341838  T
Q  339 ttgcatatgtct 350  Q
    ||||||||||||    
T  12341839 ttgcatatgtct 12341850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15320599 - 15320422
Alignment:
Q  174 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatg 273  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| | || |||||||    
T  15320599 tttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggattatg 15320500  T
Q  274 attttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||   |||  ||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  15320499 attttggtatgaattatcacccaggtaaagctaatgtgattgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 15320422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Original strand, 15413849 - 15414010
Alignment:
Q  188 tgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagc 287  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| | ||||| ||||||||||  ||||      
T  15413849 tgatcacaaaagtttgaaatacctatttgataaaaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaat 15413948  T
Q  288 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15413949 tatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatatgtc 15414010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13248979 - 13248931
Alignment:
Q  303 gctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  13248979 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 13248931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 44384745 - 44385093
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44384745 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 44384844  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384845 tacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 44384944  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  44384945 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 44385044  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  44385045 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 44385093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 21144217 - 21144565
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21144217 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 21144316  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||  | |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21144317 tacgcatgacctcgagttggtggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 21144416  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  21144417 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 21144516  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21144517 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 21144565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24263637 - 24263289
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24263637 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 24263538  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24263537 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 24263438  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  ||||| || ||||    
T  24263437 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggta 24263338  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24263337 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 24263289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 22324032 - 22324380
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22324032 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagatagttgagaattcatgagaagaattatcc 22324131  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22324132 tacacatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagt 22324231  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||    
T  22324232 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccgggta 22324331  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22324332 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 22324380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27372536 - 27372188
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  27372536 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaactcatgagaagaattatcc 27372437  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27372436 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagt 27372337  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  27372336 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 27372237  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27372236 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 27372188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10870117 - 10869769
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  10870117 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 10870018  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10870017 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagt 10869918  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||   |||  || ||||| ||||    
T  10869917 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtctgaattaccatccaggta 10869818  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10869817 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 10869769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16926627 - 16926279
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16926627 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttacgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 16926528  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16926527 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 16926428  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  16926427 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 16926328  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16926327 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 16926279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17000267 - 16999919
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  17000267 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttacgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 17000168  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000167 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 17000068  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  17000067 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 16999968  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16999967 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 16999919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24711301 - 24710953
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24711301 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaatccatgagaagaattatcc 24711202  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24711201 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtcttcgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagt 24711102  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  24711101 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 24711002  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24711001 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 24710953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27219283 - 27218935
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  27219283 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 27219184  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27219183 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 27219084  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  27219083 ttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 27218984  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27218983 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 27218935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 23106906 - 23107256
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23106906 gtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 23107005  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23107006 cacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataagagt 23107105  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  23107106 ttgaagtatctattcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatagatagaattgctgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgcgta 23107205  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  23107206 aagctaatgttgttacagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctg 23107256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 41607561 - 41607909
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41607561 gtgatgcgtctaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaggacagttgagaattcatgagaagaattatcc 41607660  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41607661 tacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcgcaagagt 41607760  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  41607761 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 41607860  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41607861 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 41607909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 21324442 - 21324790
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21324442 gtgatgcgtccaagttaggtttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 21324541  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  21324542 gacgcatgatttagagttagcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagc 21324641  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  21324642 ttaaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggcttgaattgttaaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggta 21324741  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    | |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21324742 aggctaatgttgttgtagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtc 21324790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 24875926 - 24876273
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  24875926 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagg-ttcatgagaagaattatcc 24876024  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24876025 tacgcatgatctcgagctggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgagatttgaggtgtttagtgatcacaggagt 24876124  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||  ||||||||  |||    
T  24876125 ttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaagta 24876224  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24876225 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 24876273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24676756 - 24676408
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24676756 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcgtatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaactaccc 24676657  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  24676656 gacgcatgatttagagttggcggctgtgatctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaaaagc 24676557  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||| | |||||  | ||| ||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  24676556 ttgaaatatttgttcgatcagaaagagttgaatatgaggcagcgtagatggctcgaattatttaaaaattatgactttggtttgaattatcatccaggta 24676457  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24676456 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 24676408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 349
Target Start/End: Original strand, 24706659 - 24707006
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24706659 tgatgcgtccaagttgggtttagcaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattacccg 24706758  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24706759 acgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagct 24706858  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    | ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  | ||||||||||| ||||  ||||  ||| ||||  ||||    
T  24706859 taaagtatttgttcgatcagacagaattgaatatgaggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttggtttgaattattatccaagtaa 24706958  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
     ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  24706959 ggctaatgtttttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtc 24707006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23112003 - 23111653
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23112003 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtccttatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagcagaattatcc 23111904  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| | ||| || || || ||||| || | ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23111903 tacgcatgatttggagttggctgttgtggttttcgtgttgaaaattttgaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 23111804  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || || |||||||||   ||||  ||||||||  |||    
T  23111803 ttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaagta 23111704  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  23111703 aagccaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtctg 23111653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16924071 - 16923808
Alignment:
Q  86 tgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgttt 185  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16924071 tgagaagaattatcctacgcatgatctcgagtgggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgttt 16923972  T
Q  186 agtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||    
T  16923971 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttga 16923872  T
Q  286 gctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16923871 attatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 16923808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16983334 - 16983071
Alignment:
Q  86 tgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgttt 185  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16983334 tgagaagaattatcctacgcatgatctcgagtgggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgttt 16983235  T
Q  186 agtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||    
T  16983234 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttga 16983135  T
Q  286 gctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16983134 attatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 16983071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23073130 - 23072881
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23073130 gtgatgcgtccaagctgggattaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagatgagaattcatgagaagaattaccc 23073031  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||  | | | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23073030 tacgcacgatttagagttggttgttatggtcttcgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 23072931  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtg 250  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23072930 ttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtg 23072881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 23099194 - 23099542
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||  | || ||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  23099194 gtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatccaagagggcaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 23099293  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  23099294 tacccatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatctggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcacaaaagt 23099393  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  | |||||| | |||||| | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  23099394 ttgaaatatttgtttgattaaaaggaattgaatatgagacaaaggaggtggcttgaattgatgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggta 23099493  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  23099494 aagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtc 23099542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23278043 - 23277693
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  23278043 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgagagttcatgaaaagaattatcc 23277944  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||| |||    
T  23277943 tacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattacttgtacggatccagatttgaagtatttagttatcacaaaagt 23277844  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  23277843 ttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggta 23277744  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  23277743 aagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctg 23277693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Original strand, 12639465 - 12639759
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| ||||| || | || ||||||||| ||||| || |    
T  12639465 gcttatgcttcgaggcagttggaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagctgttgtgtatgcattgaagatttggaggcact 12639564  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12639565 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttgga 12639664  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || |||| ||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  12639665 atatcttaaggattttgattttcaattgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 12639759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 19651226 - 19651576
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||  | ||||||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  19651226 gtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggttgtagcgtatgcttctagacagttgaggatacatgagaagaattatcc 19651325  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||     
T  19651326 tacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagc 19651425  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | ||||| ||||||||||  ||||  || |||||  | |    
T  19651426 ttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcctagga 19651525  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  19651526 aagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgcatatgtctg 19651576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25264321 - 25264022
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  25264321 gtgatgcatccaagttgggcttaggtggtattttaatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 25264222  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  25264221 tacacatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagt 25264122  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | || ||| ||||||| ||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  25264121 ttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagactatgattttggtttgaattaccatccgggta 25264022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23295202 - 23294852
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||  | ||||||||||  ||  | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23295202 gtgatgcgtcgaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatgttaaggtagtagcgtatgcttctaggcagttaagaattcatgagaagaattatcc 23295103  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  23295102 tacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatatggaggcaatatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagt 23295003  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  23295002 ctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggta 23294903  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||| | || || ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  23294902 aagccaatttggtggcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctg 23294852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 45533561 - 45533262
Alignment:
Q  52 tggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggag 151  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    ||||| ||||  |||||| | ||||| || || || || |||||| | || || |||||    
T  45533561 tggtagcttatgcatcgaggcagttgaggattcatgaacgtaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtggtttttgtacttaaaatttggag 45533462  T
Q  152 acattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtgg 251  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  45533461 acattatttgtatggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtttgaagtatttatttgacaagaaagaattaaatatgaggcagcgaaggtgg 45533362  T
Q  252 ttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |  ||||  || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  |||||||||    
T  45533361 tttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattaaatatgtctg 45533262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12575620 - 12575270
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||  ||||  | || || |||||||| ||    
T  12575620 gtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaaagaattatcc 12575521  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  12575520 cactcatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttatatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagc 12575421  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| | ||  || ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||| |    
T  12575420 ttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggca 12575321  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  12575320 aagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctg 12575270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 171 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17064814 - 17064636
Alignment:
Q  171 agatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagatt 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || ||||    
T  17064814 agattggaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggatt 17064715  T
Q  271 atgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||| ||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17064714 atgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 17064636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20829508 - 20829176
Alignment:
Q  19 gcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagtt 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | |||||    
T  20829508 gcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctggagtt 20829409  T
Q  119 ggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgat 218  Q
     || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  20829408 agctgcggtggtttttgtcttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgat 20829309  T
Q  219 cagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcgg 318  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || || || ||||||| ||||||||  ||||  || ||||| ||| | || ||||| ||||| |    
T  20829308 cagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtgaggccaatgtggttgctg 20829209  T
Q  319 atgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| || |||||||| || ||||| |||||||    
T  20829208 atgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctg 20829176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 27209348 - 27209696
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | |||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||  || ||||| ||||||| ||||| || ||    
T  27209348 gtgatgcttccaagtttggtttaggtggtgtgttgatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttctaggtagctgagagttcatgaaaagaactatcc 27209447  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  27209448 tacgcatgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagt 27209547  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||  | || ||| | || ||  ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  27209548 ttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcaaaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggta 27209647  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  27209648 aagctaatgtagtcgcagatgcgttgagtagaaagacattgcacatgtc 27209696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31831925 - 31831575
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||  | ||||||||||||||||| ||    
T  31831925 gtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttacgtattcatgagaagaattatcc 31831826  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||  | ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  31831825 tacacatgacctggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagt 31831726  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || || |||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  31831725 ttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggta 31831626  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  31831625 aggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttacacatgtctg 31831575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 24830417 - 24830714
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||| |  |  |||||||| || ||||| || ||  | | |  ||||||||| |||||||    
T  24830417 gtagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcacgagaagaattatctgactcatgatttggaattggcagccgttatgtatacattgaagatttggagac 24830516  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||    
T  24830517 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggtt 24830616  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||  || || |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  24830617 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatctcggaaaggctaatgttgttacggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 24830714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27789007 - 27788671
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||  ||||  | || || |||||||| ||    
T  27789007 gtgatgcgtctaagctgggtttgggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcaactgagggtgcacgaaaagaattatcc 27788908  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  27788907 cactcatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagc 27788808  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| | ||  || ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||| |    
T  27788807 ttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaa 27788708  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||    
T  27788707 aagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagac 27788671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1065003 - 1064668
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||| |||||||| || |||||| |  | |||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  1065003 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtagtagcgtatgcttctaggcagttgcgtgtacatgagaagaattatcctacacatgacctgga 1064904  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  1064903 gttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 1064804  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || || |||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  1064803 gaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 1064704  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| |||||||    
T  1064703 ctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctg 1064668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22279316 - 22279025
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| || |    
T  22279316 gcttatgcttcgaggtagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcact 22279217  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  22279216 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatatatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggttgaa 22279117  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
    ||  || || || | ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  22279116 atatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgt 22279025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24949806 - 24949507
Alignment:
Q  52 tggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggag 151  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||  || || || ||||| ||||| || |||||    
T  24949806 tggtagcgtatgcttctaggcagttgagggttcatgaaaagaattatcctacgcaggatttagagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggag 24949707  T
Q  152 acattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtgg 251  Q
     ||||| |||||||||||||||||| | || || ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||    
T  24949706 gcattatttgtatggttccagatttaaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatgg 24949607  T
Q  252 ttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    || ||  |  | || |||||||||||||  ||||  || ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  24949606 ttagagctattgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcacatgtctg 24949507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 348
Target Start/End: Original strand, 22760828 - 22761092
Alignment:
Q  84 catgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgt 183  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| |||||  |||||||||  |  ||||||||||    
T  22760828 catgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgtggtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttataagtttgaggtgt 22760927  T
Q  184 ttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaatt 283  Q
    | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||  ||| |||||| |||  || || |||| ||||||| | ||    
T  22760928 tcagtgaccaaaagagtttgaagtacttgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagaaaagatggttgaaatatcttaaggattttgattttcagtt 22761027  T
Q  284 gagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  22761028 gagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgt 22761092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 30011506 - 30011693
Alignment:
Q  147 tggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||| || | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30011506 tggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaattttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggcagcgaa 30011605  T
Q  247 ggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaa 334  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||| |  || |  || |||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  30011606 ggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttaaattaccatccgagtaaggctaatgttgttgcagatgttttaagtaggaa 30011693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Original strand, 24568900 - 24569194
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| || ||||||| | | | |||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| || || ||||    
T  24568900 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcgtgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttgaaggcatt 24568999  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |  |||||||||||||  |||| ||||||||    
T  24569000 atctgtatggttctaagtttgaggtattaagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcaaaaaaagatgaatatgaggcaaagaagatggttgga 24569099  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  24569100 atatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaagacaaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 24569194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 25129820 - 25129526
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| || | ||||| | | ||||||||||| || || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| ||||    
T  25129820 gcttatgcttcaaggcggttgaaagtgcatgagaagaactatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 25129721  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25129720 atctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgaccaaaaagagttgaatatgaggcagagaaggtggttgga 25129621  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
     |  || || ||||  |||||| | ||||| |||||| | || || ||  |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  25129620 gtatcttaatgatttcgattttcagttgagttatcattccgggaaggcggatgttgttgctgatgctttgagtagaaagacttttcatatgtctg 25129526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 30210240 - 30210427
Alignment:
Q  147 tggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 246  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  30210240 tggagacattatctgtatggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatacgaggcatcgaa 30210339  T
Q  247 ggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaa 334  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||| |  ||||  || ||||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  30210340 ggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtatggctaatgttgttacagatgctttaagtaggaa 30210427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 255 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23067403 - 23067308
Alignment:
Q  255 gaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  23067403 gaattgctaaaagattatgattttgagttga-ctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctg 23067308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 9485483 - 9485409
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagt 75  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9485483 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagt 9485409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 291
Target Start/End: Original strand, 17967134 - 17967230
Alignment:
Q  195 aagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatc 291  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| | || || ||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17967134 aagagtctgaagtatctctttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatgtttggagtttttaaaggattatgattttgagttgagttatc 17967230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 224
Target Start/End: Original strand, 25133705 - 25133792
Alignment:
Q  137 attgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaag 224  Q
    ||||||||| ||||| |||||  || |||| || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25133705 attgaagatttggaggcattatatgcatggctctaagtttgaagtgtttagtgaccacaatagtttgaagtacttgtttgattagaag 25133792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 118
Target Start/End: Original strand, 17965081 - 17965145
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagtt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  17965081 gtagcttatgctttgagacaactgaagattcatgagaggaattatctaatgcatgatttagagtt 17965145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30612 - 30262
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||| |||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30612 gtgacgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagtttatgctttgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 30513  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30512 tacgcacgatttagagtttgctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 30413  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30412 ttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggta 30313  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  30312 aagctaatgtttttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtctg 30262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50477 - 50168
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  50477 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtagtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 50378  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || |  || ||||| || || |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  50377 tacacatgatttggagttggctgcggcggtttttgtttttaaaagttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcatacaagt 50278  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    || || ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  50277 ttaaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 50178  T
Q  301 aagctaatgt 310  Q
    ||||||||||    
T  50177 aagctaatgt 50168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29576 - 29374
Alignment:
Q  149 gagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagg 248  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| || ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||     
T  29576 gagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcatacaagtttaaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaaga 29477  T
Q  249 tggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
    ||| | || ||| | || |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||    
T  29476 tggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgt 29377  T
Q  349 ctg 351  Q
    |||    
T  29376 ctg 29374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9033 - 8685
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  9033 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 8934  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8933 tacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 8834  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  8833 ttgaagtattttttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 8734  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8733 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 8685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17321 - 16973
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17321 gtgatacgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagattgaaaagtagtagcttatacttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 17222  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| ||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17221 tacgcacgatttagagttagctgcagtggtcttcgtgttgaagatatggagacattacttgtatcgttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 17122  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17121 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggta 17022  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  17021 aagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtc 16973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 33389737 - 33390085
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33389737 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 33389836  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389837 tacgcatgatctcgagttggcggcagtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 33389936  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||| ||||| || ||||  ||||  |||||||||||||    
T  33389937 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatgactagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggta 33390036  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33390037 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 33390085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 430824 - 431174
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  430824 gtgatgcgtccaagttggatttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 430923  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  430924 cacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtacggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataagagt 431023  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  431024 ttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggta 431123  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  431124 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctg 431174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21750591 - 21750243
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21750591 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaaaatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaatacatgagaagaattaccc 21750492  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21750491 tacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggaaaaattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgaacataagagt 21750392  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21750391 ttgaagtatctgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaagaactatgattttgagttgagctatcatccgggta 21750292  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  21750291 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtc 21750243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21831954 - 21831606
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  21831954 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 21831855  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831854 tacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 21831755  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  21831754 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 21831655  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21831654 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 21831606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21838602 - 21838253
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  21838602 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 21838503  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatca-caagag 199  Q
    || ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21838502 tacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcagcaagag 21838403  T
Q  200 tttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggt 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| |||    
T  21838402 tttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggt 21838303  T
Q  300 aaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21838302 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 21838253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 41352370 - 41352718
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  41352370 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtgatagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 41352469  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  41352470 tacgcatgatctcgagttggcggcagtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagc 41352569  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||  || ||||||||||    
T  41352570 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggta 41352669  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41352670 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 41352718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 16349304 - 16349652
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16349304 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaggtggtagcttacgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 16349403  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16349404 tacgcatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 16349503  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  16349504 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 16349603  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16349604 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 16349652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19108019 - 19107671
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19108019 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcc 19107920  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19107919 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 19107820  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  19107819 ttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 19107720  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  19107719 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgtatatgtc 19107671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 351
Target Start/End: Original strand, 22360980 - 22361302
Alignment:
Q  29 tgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgta 128  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||     
T  22360980 tgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcacgatttagagttggctgttgtg 22361079  T
Q  129 gtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaat 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  22361080 gtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagatgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaagtaat 22361179  T
Q  229 tgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaag 328  Q
    |||||||||||||||| || ||  | |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  22361180 tgaatatgaggcagcgtagatgacttgaattgctgaaggactatgattttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgag 22361279  T
Q  329 taggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||| |||||||| ||||    
T  22361280 taggaagaccttgcatatatctg 22361302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 51332201 - 51332549
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  51332201 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 51332300  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51332301 tacgcatgacctcaagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 51332400  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  51332401 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 51332500  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  51332501 aagctaatgttgttgcagatgccttgattaggaagacattgcatatgtc 51332549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21025824 - 21025476
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21025824 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaggtagttgagaattcatgagaagaattaccc 21025725  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  21025724 gacgcacgatttagagttggcggctgtggtcgttatattaaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagc 21025625  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  21025624 ttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgaatttggtttgaattatcatccaggta 21025525  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21025524 aagctaatggtgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 21025476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 17043723 - 17044071
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||||||  |||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17043723 gtgatgcgtccaagttgggtctaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcaagacagttgagaattcatgagaaaaactaccc 17043822  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17043823 gatgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagatattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagt 17043922  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||| | || ||||| || ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  17043923 ttgaagtatttgttggatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcatccaggta 17044022  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  17044023 aagctaacgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtc 17044071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 21234439 - 21234787
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21234439 gtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagtttatgcttcaagacagttgagatttcatgagaagaattaccc 21234538  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21234539 gacgcatgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaagatttgaggtgtttagcgatcacaagagt 21234638  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  21234639 ttgaaatattagttcgatcaaaaggaattgaatatgagacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 21234738  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  21234739 aagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtc 21234787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 24793325 - 24793658
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24793325 gtgatgcgtccaagttgagtttaggtggtgtacttatgcaagatgataaagtggtagcttatgcctcaagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 24793424  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24793425 gacgcatgatttagagttggtggttgttgtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 24793524  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  24793525 ttgaagtatctgttcgatcagaacgaattgaacatgagacaacgaaggtggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 24793624  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaa 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24793625 aagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaa 24793658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 21744260 - 21744610
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  21744260 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 21744359  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| ||||||||  | || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  21744360 tacacatgatttggagttggctacggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtaaggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagt 21744459  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| || ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || |||||||||||||  ||||  || |||||| |||    
T  21744460 ttgaaatatctgattgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgagta 21744559  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  21744560 aagctaatgtggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctg 21744610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 20834608 - 20834958
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| ||    
T  20834608 gtgatgcgtctaagctgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctaagaattcatgaaaagaattatcc 20834707  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  20834708 tactcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagt 20834807  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||| | || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  20834808 ttgaaatatctgtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagttgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggta 20834907  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||    
T  20834908 aagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctg 20834958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 23196957 - 23197304
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  23196957 gtgatgcgtccaagttgggcataggtggtgttct--tgcaagatggcaaagtggtagcttatgtttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 23197054  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23197055 tactcacgatttggagttggctgcagtggt-tttgttttgaaaatttgaaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagt 23197153  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  23197154 ctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggta 23197253  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  23197254 aagctaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 23197304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 20830153 - 20830450
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| |||||||    
T  20830153 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagac 20830252  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  20830253 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 20830352  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  20830353 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 20830450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19855956 - 19855606
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  19855956 gtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgaggatacatgaaaagaattatcc 19855857  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  19855856 tactcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagt 19855757  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  19855756 ctaaaatatttatttgatcagaaggaattaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 19855657  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  19855656 aagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctg 19855606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 144 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22110530 - 22110325
Alignment:
Q  144 atatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 243  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22110530 atatggagacattatttgtacggttttagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatttgagacagc 22110431  T
Q  244 gaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgca 343  Q
    |||||||| | |||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22110430 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgca 22110331  T
Q  344 tatgtc 349  Q
    ||||||    
T  22110330 tatgtc 22110325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 144 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22114379 - 22114174
Alignment:
Q  144 atatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 243  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22114379 atatggagacattatttgtacggttgtagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatttgagacagc 22114280  T
Q  244 gaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgca 343  Q
    |||||||| | |||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22114279 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgca 22114180  T
Q  344 tatgtc 349  Q
    ||||||    
T  22114179 tatgtc 22114174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 349
Target Start/End: Original strand, 20855488 - 20855816
Alignment:
Q  21 ttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttgg 120  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||  |||||||||||||||| || ||| ||||   |||||| ||||| || |||| ||||||||| ||| |||    
T  20855488 ttaggaggtgtgttgatacaagatggaaaggtggtagcttatgcttctaggcagctgagggctcatgaaaagaactatcctacgcatgatttggagctgg 20855587  T
Q  121 ccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatca 220  Q
    | || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  20855588 ctgcggtggtgtttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaagtatctgtttgacca 20855687  T
Q  221 gaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggat 320  Q
     || |||||||| ||||||||| | || ||| | || ||  |||| |||||||||||||  ||||  || ||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  20855688 aaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaatgattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagat 20855787  T
Q  321 gccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    || || ||||||||||| ||||| |||||    
T  20855788 gcgttgagtaggaagacgttgcacatgtc 20855816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 351
Target Start/End: Original strand, 24098346 - 24098661
Alignment:
Q  36 atgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttg 135  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| |  || || || ||||    
T  24098346 atgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcaattgaggatacatgagaagaattatcctacgcatgatctggagttagttgcggtggtgtttg 24098445  T
Q  136 tattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatat 235  Q
    | || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24098446 ttttaaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacat 24098545  T
Q  236 gaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaag 335  Q
    ||||||| |||| ||||| ||  |  | || |||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  24098546 gaggcagagaagatggttagatcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaag 24098645  T
Q  336 actttgcatatgtctg 351  Q
    || |||||||||||||    
T  24098646 acattgcatatgtctg 24098661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 351
Target Start/End: Original strand, 19661845 - 19662195
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    ||||||||  |||||||||||||| | |||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || | |||||| || ||||| |||||||| |||    
T  19661845 tgatgcgtctaagttgggcttaggtgttgttttaatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggctgttgaggatacatgaaaagaattatcct 19661944  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttg-tattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    |  |||||||| |||||||| || || || |||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||    
T  19661945 actcatgatttggagttggctgcggtggtttttggttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagattcgaagtatttagtgatcataaaagt 19662044  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  19662045 ctaaaatatttatttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattatcatccaggta 19662144  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  19662145 aagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcatatgtctg 19662195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 351
Target Start/End: Original strand, 20938782 - 20939121
Alignment:
Q  12 aagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatt 111  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  20938782 aagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtagtagcttatgcttctaggcagttaagaattcatgaaaagaactatcctacgcatgatt 20938881  T
Q  112 tagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattt 211  Q
    | | |||||| |  || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| | || |||||    
T  20938882 tggggttggctggggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttctagatttgaggtattcagtgattacaaaagtctaaaatattt 20938981  T
Q  212 gtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgtt 311  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||||||||  || |  || ||||| |||||||| |||||     
T  20938982 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaagccaatgtg 20939081  T
Q  312 gttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  20939082 gttgcagatgccttgagtaggaaaatgttgcatatgtctg 20939121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 20060660 - 20060996
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||||||||  | ||||||||||| |   | ||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||| ||    
T  20060660 gtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtagggtagtagcgtatgcttctagacagctgagagtacatgaaaagaattatcc 20060759  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  || ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||     
T  20060760 tactcacgatttggagttggccgcggtggtttttgtattaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagc 20060859  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| | || ||  | |||||  |||| |||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||    
T  20060860 ttgaaatatctgtttgaccaaaacgaattgaacatgaggcagaggagatgacttgaattattaaaggattatgattttggcttgaactaccattcgggta 20060959  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  20060960 aagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 20060996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21952545 - 21952210
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  ||| |||||||||||| ||||  |||||| | ||    
T  21952545 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgggttcttgagaagaattatcctacacatgatctgga 21952446  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  21952445 gttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactatttgtacggttcaagatttgaggtgttctgtgatcataaaagtttgaaatatttgttt 21952346  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| || || || || ||||| |||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  21952345 gatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 21952246  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  21952245 ctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctg 21952210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 202 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16373980 - 16373831
Alignment:
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||    
T  16373980 tgaagcatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaa 16373881  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16373880 agctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 16373831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Original strand, 22134321 - 22134615
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| ||  |||||| | | |||||||||||||| |  |  |||||||| || ||||| ||||| || | || ||||||||| ||||| ||||    
T  22134321 gcttatgcttcaaggtagttgaaagtgcatgagaagaattatcacactcatgatttggaattggcagctgttgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 22134420  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||  ||    
T  22134421 atctgtatggttctaagtttgatgtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaaggtggtcaga 22134520  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
     |  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  22134521 gtaccttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 22134615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 343
Target Start/End: Original strand, 31538720 - 31539047
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||  |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  31538720 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttacgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 31538819  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  31538820 gttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 31538919  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || || |||||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || || |||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  31538920 gaccaaaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 31539019  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgca 343  Q
    | ||||| || |||||||| || |||||    
T  31539020 ctgatgctttgagtaggaaaacgttgca 31539047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 37678716 - 37678381
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  37678716 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 37678617  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  37678616 gttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 37678517  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || || || ||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || || |||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  37678516 gaccaaaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 37678417  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
      ||||| || |||||||| || ||||| |||||||    
T  37678416 ttgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctg 37678381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 349
Target Start/End: Original strand, 19759753 - 19759929
Alignment:
Q  173 atttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattat 272  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||| | |||||| | |||||||||    
T  19759753 atttgaagtgtttagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgatcagaatgaattgaatatgagacaacggaggtggcttgaattgttgaaagattat 19759852  T
Q  273 gattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||  ||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  19759853 gattttgggttgaattatcatccaggaaaagctaatgttgttgcagatgcgttaagtaggaaaactctacatatgtc 19759929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16377793 - 16377587
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||    ||||| ||    
T  16377793 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggttgcttatgcatcaagacaattgagaattcatgaacgaaattatcc 16377694  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | |  || || || || || |||||  | |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16377693 tactcatgatcttgtattagctgcagttgtatttgtgctcaagattgggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttaagtgatcacaagagt 16377594  T
Q  201 ttgaagt 207  Q
    |||||||    
T  16377593 ttgaagt 16377587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20915196 - 20914902
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| || || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| || |    
T  20915196 gcttatgcttcaaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcact 20915097  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  20915096 atctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttaaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttgga 20914997  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || || | ||||||| | ||||| ||||||||  | || |||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  20914996 atatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccaggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 20914902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Original strand, 50619121 - 50619309
Alignment:
Q  29 tgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgta 128  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |||||||||||  | || ||     
T  50619121 tgtgcttatgcaagatggcaaagtagtggcttatgcgtcgagacagttgagaattcatgagcggaattgccctacgcacgatttagagtt-actgcagtg 50619219  T
Q  129 gtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgat 218  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||| || |||||    
T  50619220 gtctttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtctgaaatatctgcttgat 50619309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20296048 - 20295713
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||  | || ||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||| | ||    
T  20296048 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctcggcaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgatctgga 20295949  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
     ||||| |  || || ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||    
T  20295948 attggctgtggtggtttttgttttggaaatttggagacattatttgtacggttccagatctgaggtgttcaatgatcataaaagtttgaagtatttattt 20295849  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || |||||||   |||| ||||||||| |||| ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || || || ||||| || ||||| ||||    
T  20295848 gaccagaaggttctgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaggccaatgtagttg 20295749  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| |||||||    
T  20295748 ctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctg 20295713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 41216701 - 41216859
Alignment:
Q  137 attgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 236  Q
    ||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41216701 attgaagatttggaggcattatctatatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccataaaagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatg 41216800  T
Q  237 aggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatcc 295  Q
    |||||| |||| ||||||||||  || |||||||  |||||  | ||||| ||||||||    
T  41216801 aggcagagaagatggttggaatatcttaaagatttcgatttccagttgagttatcatcc 41216859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 52987412 - 52987206
Alignment:
Q  12 aagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgc-atgat 110  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||||    ||||     
T  52987412 aagttgggcttaggtggtgttctaatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacattatgac 52987313  T
Q  111 ttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatt 210  Q
     | ||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  52987312 ctggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatt 52987213  T
Q  211 tgtttga 217  Q
    | |||||    
T  52987212 tatttga 52987206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 349
Target Start/End: Original strand, 16077630 - 16077712
Alignment:
Q  267 gattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  16077630 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccttgaggaggaagacattgcatatgtc 16077712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22116562 - 22116477
Alignment:
Q  3 gatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatga 88  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  22116562 gatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtagtagcttatgcattgagatagttgaggattcatga 22116477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7696 - 7366
Alignment:
Q  21 ttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttgg 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7696 ttaggtggtgtgcttatccaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttgg 7597  T
Q  121 ccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatca 220  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  7596 ctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattgcttgtacggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatca 7497  T
Q  221 gaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggat 320  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7496 gaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagat 7397  T
Q  321 gccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  7396 gctttgagtaggaagaccttgcatatgtctg 7366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16892 - 16757
Alignment:
Q  21 ttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttgg 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16892 ttaggtggtgtgcttatccaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctacgcatgatttagagttgg 16793  T
Q  121 ccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16792 ctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacatt 16757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 285 - 349
Target Start/End: Original strand, 3532 - 3596
Alignment:
Q  285 agctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3532 agctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcatatgtc 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 66)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 25608642 - 25608992
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25608642 gtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 25608741  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||| ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25608742 cacgcacgatttagagttagctgatgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaagagt 25608841  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25608842 ctgaagtatctgttcgattagaaggaattgaatatgagacagcaaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggta 25608941  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25608942 aagctaatgttgttgcagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtctg 25608992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 2873584 - 2873932
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2873584 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 2873683  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2873684 tacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 2873783  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  2873784 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 2873883  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2873884 aagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 2873932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27188936 - 27188588
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  27188936 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 27188837  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  27188836 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagc 27188737  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||  ||||  |||||||||||||    
T  27188736 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggta 27188637  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27188636 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtc 27188588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 27260304 - 27260652
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  27260304 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 27260403  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  27260404 tacgcatgatctcgagttggcggctgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagc 27260503  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||  ||||  |||||||||||||    
T  27260504 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggta 27260603  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27260604 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtc 27260652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 18406725 - 18407075
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18406725 gtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgctttgagacaattgagaattcatgagaagaattaccc 18406824  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18406825 tacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattaaaaatatggagacgttacttgtatggttcgagatttgatgtgtttagtgatcataagagt 18406924  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18406925 ttgaagtatctgttcgatcagaaggaatggaacatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggta 18407024  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||| |||||||  || || || || |||||||| |||||||||||||    
T  18407025 aagctaacgttgttgtagacgctttgagcaggaagaccttgcatatgtctg 18407075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 22761236 - 22761586
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22761236 gtgatgcgtccaagctgggtttatgtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagatagttgagaattcatgagaagaattaccc 22761335  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  22761336 tacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagatatttagtgatcataagagt 22761435  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||| | || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22761436 ttgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtatatggcttgaattgttgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggta 22761535  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22761536 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctg 22761586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 5838000 - 5838348
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5838000 gtgatgcgtctaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggttgcttatgcttcgaggcagttgaggattcatgagaagaattatcc 5838099  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5838100 tacgcatgatttagagttggccgcggtagttttcgtgttgaagatttggagacactacttgtatggttcgaggtttgaagtgtttagtgatcacaagagt 5838199  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| | |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5838200 ttgaagtatttgttcgaccagaaagaattgaatatgagacagagaaggtggctagaatcgctaaaggactatgatttcgaattgagctatcatccaggta 5838299  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5838300 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtc 5838348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 28261978 - 28262328
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  28261978 gtgatgcgtccaagttgggtttgggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 28262077  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28262078 tacgcatgatctcgagttggcagctgtagtctttgtgttaaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 28262177  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||  || |  ||||| || ||||    
T  28262178 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggta 28262277  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28262278 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctg 28262328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 28340727 - 28341077
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  28340727 gtgatgcgtccaagttgggtttgggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 28340826  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28340827 tacgcatgatctcgagttggcagctgtagtctttgtgttaaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 28340926  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||  || |  ||||| || ||||    
T  28340927 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggta 28341026  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28341027 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctg 28341077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22435369 - 22435021
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22435369 gtgatgcatccatgttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcc 22435270  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||| |||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22435269 cacgcacgatttagagttggctgttgtggtttttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagc 22435170  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||    
T  22435169 ttgaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggta 22435070  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22435069 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtc 22435021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22443767 - 22443419
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22443767 gtgatgcatccatgttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtggcttatgcttcaagacagttgaggattcatgagaagaattatcc 22443668  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||| |||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22443667 cacgcacgatttagagttggctgttgtggtttttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagc 22443568  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||    
T  22443567 ttgaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggta 22443468  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22443467 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtc 22443419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 29590701 - 29591049
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  29590701 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 29590800  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29590801 tacgcatgacctcgagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 29590900  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  29590901 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 29591000  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29591001 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 29591049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 349
Target Start/End: Original strand, 16962228 - 16962574
Alignment:
Q  3 gatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattacccta 102  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| | | ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  16962228 gatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgattacgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattacgcga 16962327  T
Q  103 tgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagttt 202  Q
     ||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16962328 cgctcgatttagagttagctgatgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaagtgtttagtgatcacaagacttt 16962427  T
Q  203 gaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaa 302  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16962428 gaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctaaaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaa 16962527  T
Q  303 gctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||  ||||| || ||||||||| | ||||| |||||    
T  16962528 gctaatgttgttggagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtc 16962574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19866187 - 19865837
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19866187 gtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 19866088  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19866087 cacgcacgattttgagttggcggctatggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttcaggtgtttagtgatcacaagagc 19865988  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  19865987 ctaaaatatttgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 19865888  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  19865887 aagctaatgttgttgctgatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctg 19865837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 16926419 - 16926769
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16926419 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttacgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgacaattcatgagaagaattaccc 16926518  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttc-cagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 199  Q
     | ||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||     
T  16926519 gacgcacgatttagagttagctgttgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaaggtttgaagtgtttagtgatcacaagac 16926618  T
Q  200 tttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaa-gattatgattttgaattgagctatcatccggg 298  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16926619 tttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatgtgagggagcgtagatggcttgaattgctaaaaggattatgattttgagttgagctatcatccagg 16926718  T
Q  299 taaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||| |||||    
T  16926719 taaagctaatgttgttgcagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtc 16926769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25114042 - 25113704
Alignment:
Q  11 caagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgat 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||     
T  25114042 caagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcctacgcatgac 25113943  T
Q  111 ttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatt 210  Q
     | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25113942 ctcgagttagcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatt 25113843  T
Q  211 tgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgt 310  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | || ||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  25113842 tgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtagatggctagagttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgt 25113743  T
Q  311 tgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25113742 tgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 25113704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 58 - 349
Target Start/End: Original strand, 24312006 - 24312297
Alignment:
Q  58 cttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatta 157  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24312006 cttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatcctacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacatta 24312105  T
Q  158 cttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaa 257  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||    
T  24312106 cttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaa 24312205  T
Q  258 ttgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24312206 ttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtttcagattccttgagtaggaagacattgcatatgtc 24312297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23079969 - 23079619
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||    
T  23079969 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtagtagcttatgcttcgagacagttgaggattcttgaaagaaattaccc 23079870  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  23079869 tacgcacgatttagagttggctgctgtggtttttgtattgaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgttcagcgatcacaagagt 23079770  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |  ||||| | || ||||||||||||   || | ||||||||| ||||    
T  23079769 ttgaaatatttgttttatcataaggaattgaatatgaaacagcgaaggtggctcaaattgttgaaggattatgattttagtttaaactatcatccaggta 23079670  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23079669 aagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtctg 23079619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 16621861 - 16622106
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16621861 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaactcatgagaagaattatcc 16621960  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16621961 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagt 16622060  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16622061 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 16622106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 27564612 - 27564950
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||          |||||||||||    
T  27564612 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagaaagttgag----------aagaattaccc 27564701  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  27564702 gacgcacgatttagagttggcagttgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagc 27564801  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  27564802 ttaaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 27564901  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  27564902 aagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtc 27564950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 18196514 - 18196861
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||    ||||| ||    
T  18196514 gtgatgcgtccaaattgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggttgcttatgcatcaagacacttgagaattcatgaacgaaattatcc 18196613  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | || || || || || || |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  18196614 tactcatgatcttgaattagctgcagtggtatttgtgcttaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagc 18196713  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||| | ||||    
T  18196714 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggctcgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcattcaggta 18196813  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18196814 aagctaatgttgttatagatgccttaagtaggaagactttacatatgt 18196861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 104 - 349
Target Start/End: Original strand, 1541968 - 1542213
Alignment:
Q  104 gcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttg 203  Q
    ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1541968 gcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttg 1542067  T
Q  204 aagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaag 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||| ||||| || ||||  ||||  || ||||| |||||||    
T  1542068 aagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgttaaaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaag 1542167  T
Q  304 ctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  1542168 ctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtc 1542213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 19488053 - 19488403
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||    
T  19488053 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttacgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgatcggaattatcc 19488152  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19488153 tacgcatgatttagagttggctgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggccccatatttgaagtgtttagtgaccacaagagt 19488252  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| | || || ||||||||||  ||||  ||||||||  |||    
T  19488253 ttgaaatatttctttgataaaaaagaattgaatatgaggcaccgaaggtggcttggattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaagta 19488352  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||||    
T  19488353 aagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgaatatgtctg 19488403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21473101 - 21472751
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  21473101 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcacgaaaagaattatcc 21473002  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21473001 tacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggctctagatttgaggtgtttagtgatcataagaga 21472902  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| | || || ||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  21472901 ttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggta 21472802  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  21472801 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 21472751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 5295987 - 5296337
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  5295987 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 5296086  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| ||||||||  | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5296087 tacacatgatttggagttggctacggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagt 5296186  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  5296187 ctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcaaagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggta 5296286  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  5296287 aagctaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 5296337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21754714 - 21754481
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||    | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21754714 gtgatgcgtccaagttgggtttagga----tacttatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgacaattcatgagaagaattaccc 21754619  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||     
T  21754618 gacgcatgatttagagttggcggctgaggtctttgtattgaatatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagcgatcacaagagc 21754519  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgag 238  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  21754518 ttaaagtatttgttcgatcagaaagaactgaatatgag 21754481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15460836 - 15460488
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | |||||| || || ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||| |||||||| ||    
T  15460836 gtgatgcttccaagtttggtttgggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctagacaactgagggttcatgaaaagaattatcc 15460737  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  15460736 tactcatgatttggagttggctgcggtggtatttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagt 15460637  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| | || ||| | |||||  |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  15460636 ttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggctagaattattaaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggta 15460537  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  15460536 aagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtc 15460488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 14378697 - 14379048
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctc-atgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattacc 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||  ||||| | |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14378697 gtgatgcgtctaagttgggcttaggaggtgtttttgatgcaagatggaaaggtggtaccgtatgtttctaggcagttgaggattcatgagaagaattatc 14378796  T
Q  100 ctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 199  Q
    ||| || |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14378797 ctacgcgtgatttggagttggctgcggtagtttttgtattgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagag 14378896  T
Q  200 tttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggt 299  Q
    | | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||  || | || || ||||||||||  ||||  || ||||| |||    
T  14378897 tctaaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggt 14378996  T
Q  300 aaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  14378997 aaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgcatatgtctg 14379048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 14380247 - 14380598
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctc-atgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattacc 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||  ||||| | |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14380247 gtgatgcgtctaagttgggcttaggaggtgtttttgatgcaagatggaaaggtggtaccgtatgtttctaggcagttgaggattcatgagaagaattatc 14380346  T
Q  100 ctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 199  Q
    ||| || |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14380347 ctacgcgtgatttggagttggctgcggtagtttttgtattgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagag 14380446  T
Q  200 tttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggt 299  Q
    | | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||  || | || || ||||||||||  ||||  || ||||| |||    
T  14380447 tctaaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggt 14380546  T
Q  300 aaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  14380547 aaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgcatatgtctg 14380598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 348
Target Start/End: Original strand, 20636235 - 20636429
Alignment:
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  20636235 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggct 20636334  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
     |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  20636335 tgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttacatatgt 20636429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 16381207 - 16381504
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| |||||||    
T  16381207 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagac 16381306  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  16381307 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 16381406  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  16381407 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 16381504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 25764009 - 25764195
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||| || ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25764009 gtgatgagtccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattacca 25764108  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttag 187  Q
     |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25764109 gacacatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttag 25764195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 16648803 - 16649100
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| ||||| || | || ||||||||| ||||| |    
T  16648803 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccaactcatgatttggaattggcggctgttgtgtatgcattgaagatttggaggc 16648902  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    | ||  |  ||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||    
T  16648903 actatctacatggttctaaatttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggtt 16649002  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  16649003 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 16649100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 349
Target Start/End: Original strand, 21568783 - 21569120
Alignment:
Q  12 aagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatt 111  Q
    ||||||||||| || |||||  | |||||||| || ||  ||||||  |||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||| ||||  |||||||    
T  21568783 aagttgggcttgggtggtgtcttgatgcaagagggtaaggtggtagtgtatgcttctagacaactgagagtttatgagaagaattatcctacccatgatt 21568882  T
Q  112 tagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattt 211  Q
    | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  21568883 tggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcaaaaaagtttgaaatattt 21568982  T
Q  212 gtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgtt 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| | |||||| | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||     
T  21568983 gtttgatcaaaaggaattgaatatgagacaaaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgta 21569082  T
Q  312 gttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  21569083 gttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtc 21569120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 20634721 - 20634879
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20634721 gtgatgcgtccaagctgtgtttaggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagatagttgagaattcatgagaagaattaccc 20634820  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattact 159  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20634821 tacgcacgatttagagttggctgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattact 20634879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 1647648 - 1647945
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| ||||| |    
T  1647648 gtagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggaggc 1647747  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||    
T  1647748 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggaggtggtt 1647847  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | |||  || || || | ||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||    
T  1647848 gaaatatcttaaggactttgattttcaattgagttatcatccaggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatgtgtctg 1647945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 140 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15897454 - 15897246
Alignment:
Q  140 gaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15897454 gaagatttggagacattacttgtatggttctagatt-gaagtgttcagtgatcataagagtctgaagtatttgtttgatcagaatgaattgaatatgaga 15897356  T
Q  240 cagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactt 339  Q
    || ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||     
T  15897355 caacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactc 15897256  T
Q  340 tgcatatgtc 349  Q
    | ||||||||    
T  15897255 tacatatgtc 15897246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 85 - 349
Target Start/End: Original strand, 21562997 - 21563261
Alignment:
Q  85 atgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtt 184  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||    
T  21562997 atgagaagaattatcctacccatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtt 21563096  T
Q  185 tagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattg 284  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| | |||||| | || |||||||||||||  |||    
T  21563097 tagcgatcacaaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagacaaaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttggcttg 21563196  T
Q  285 agctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  21563197 aattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtc 21563261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 10467645 - 10467980
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| | ||    
T  10467645 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgaggatacatgagaagaattatcctacgcatgatctgga 10467744  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    |||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||    
T  10467745 gttggctgcggtggtatttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttctagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgttt 10467844  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| || || || || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  10467845 gatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 10467944  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || || || || |||||||||||||    
T  10467945 ctgatgctttgagcagaaaaacattgcatatgtctg 10467980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 28281594 - 28281944
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| || ||||| || ||  ||||  | ||||| |||||||| ||    
T  28281594 gtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttttgatgcaagatggcaaggtggtagcataggcttctaggcaactgagggtgcatgaaaagaattatcc 28281693  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  28281694 cactcatgatttagagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccaggtttgaagtgttcagtgaccacaagagc 28281793  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | || ||| |||| |||||||||||||  ||||  || |||||||| |    
T  28281794 ttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggaa 28281893  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| || |||||||| || |||||||||||  | ||||||||||    
T  28281894 aagcaaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacactccatatgtctg 28281944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18796190 - 18795854
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| ||| |||||||  | ||||||||||| ||  | ||||| |||||||| || ||| ||||  | ||||| |||||||| ||    
T  18796190 gtgatgcgtctaagctgggtttatgaggtgttttgatgcaagatggtaaggtagtagcgtatgcttctaggcagctgagggtacatgaaaagaattatcc 18796091  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  ||  |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  18796090 tactcacaatttggagttggctgcggtagtttttgttttgaagatttggaggcactacttgtatggttccaggtttgaagtgtttagtgatcacaagagc 18795991  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  18795990 ttgaaatattcatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggta 18795891  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  18795890 aagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 18795854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24365897 - 24365562
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  24365897 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 24365798  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24365797 gttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttgttt 24365698  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||| | || ||||| || || || || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||| || || |||||||    
T  24365697 gaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttg 24365598  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || ||||| || ||||| |||||||    
T  24365597 ctgatgctttgagcaggaaaaccttgcacatgtctg 24365562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Original strand, 18836745 - 18837039
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| ||  | || | || ||||||||| ||||| || |    
T  18836745 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtacatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccattgtgtatgcattgaagatttggaggcact 18836844  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  18836845 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatgaggaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttgga 18836944  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  18836945 atatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 18837039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23997695 - 23997398
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | | || ||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| || || |    
T  23997695 gtagcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcacgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttgaaggc 23997596  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||    
T  23997595 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggtt 23997496  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || |  |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  23997495 ggaatatcttacggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 23997398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 351
Target Start/End: Original strand, 18966133 - 18966423
Alignment:
Q  58 cttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatta 157  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| ||||  |||||| | ||||| || |  || ||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  18966133 cttatgcatcgagacagttgaggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgagttagctgtagtggtctttgtgcttaagatttggagacatta 18966232  T
Q  158 cttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaa 257  Q
      |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18966233 tctgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaa 18966332  T
Q  258 ttgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  | |||||||||||||||   ||||  |||||||  ||||||||||| |||||    ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  18966333 ttattgaaagattatgatttttggttgaattatcatctaggtaaagctaacgttgt---agatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctg 18966423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 337
Target Start/End: Original strand, 34644388 - 34644703
Alignment:
Q  22 taggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggc 121  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||  | || || |||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  34644388 taggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtagtggcgtatgcttctagacagctgagagtacatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggc 34644487  T
Q  122 cgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcag 221  Q
     || || |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  34644488 tgcggtggtctttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccaggttcgaagtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttatttgaccag 34644587  T
Q  222 aaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatg 321  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| | || ||| | || ||  | || |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34644588 aaggagttgaacatgagacagaggagatggctagagttattgaaggattatgagtttgggttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatg 34644687  T
Q  322 ccttaagtaggaagac 337  Q
    |||| ||||| |||||    
T  34644688 ccttgagtagaaagac 34644703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16234472 - 16234178
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| || |    
T  16234472 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccaaatcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcact 16234373  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| ||    
T  16234372 atctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttaga 16234273  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  16234272 atatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgtggatgctttgtgtagaaagactttgcatatgtctg 16234178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19880777 - 19880450
Alignment:
Q  22 taggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggc 121  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||||  | ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  19880777 taggaggtgtgttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctagacagctgagggtacatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggc 19880678  T
Q  122 cgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcag 221  Q
     || || || ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  19880677 tgcggtggtttttgtcttaaagatttggaggcactacttgtatggttccaggttcgaagtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttatttgaccag 19880578  T
Q  222 aaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatg 321  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| ||  |  | || |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  19880577 aaggagttgaacatgagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaacgtagttgcagatg 19880478  T
Q  322 ccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    | || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  19880477 ctttgagtagaaagacgttgcacatgtc 19880450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 137 - 351
Target Start/End: Original strand, 14624274 - 14624488
Alignment:
Q  137 attgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 236  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14624274 attgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatg 14624373  T
Q  237 aggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaaga 336  Q
    |||||| | || ||||||||||  || || || |  |||||| | ||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  14624374 aggcagaggagatggttggaataccttaaggacttcgattttcagttgagttatcatcccgaaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaaga 14624473  T
Q  337 ctttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||    
T  14624474 ctttgcatatttctg 14624488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19436502 - 19436264
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  19436502 gtgatgcgtctaagttgggcttaggcggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 19436403  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || |||||||   ||||| |  || || || ||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||  ||||||| || ||     
T  19436402 tacgcatgatcgggagttcgatgcggtggtgtttgttttgaaaacttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcggtgatcataaaagc 19436303  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagg 239  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19436302 ttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaatatgagg 19436264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19454789 - 19454570
Alignment:
Q  132 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattga 231  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  19454789 tttgttttgaagatttggaggcatgatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcaaaaggaattga 19454690  T
Q  232 atatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtag 331  Q
    | ||||||||| | |||||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||    
T  19454689 acatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcag 19454590  T
Q  332 gaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  19454589 gaagacattgcatatgtctg 19454570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14129886 - 14129619
Alignment:
Q  84 catgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgt 183  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| |||||  ||| |||||| |  ||| | ||||    
T  14129886 catgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatatgtttggttctaagttttaagtgt 14129787  T
Q  184 ttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaatt 283  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||| |  || || |||| ||||||| | ||    
T  14129786 tcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagtt 14129687  T
Q  284 gagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  14129686 gagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgtgtagaaagactttgcatatgtctg 14129619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 348
Target Start/End: Original strand, 35274923 - 35275214
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||| |||| || ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||| | ||||| || | |  ||||||||| ||||| ||||    
T  35274923 gcttattcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattgtctgctgttgtgtattcattgaagatttggagtcatt 35275022  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||  ||||||||    
T  35275023 atctgtatggttctaagtttgatgtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcaaagaacatggttgga 35275122  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
    ||  || || || | ||||||| | ||||| ||||||||  | || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |||||    
T  35275123 atatcttaaggactttgattttaagttgagttatcatcctaggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcttatgt 35275214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21928569 - 21928355
Alignment:
Q  137 attgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 236  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  21928569 attgaagatttggaagcattatatgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaatgagttcaatatg 21928470  T
Q  237 aggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaaga 336  Q
    |||||| ||||||||||||| |  || || ||||  |||||| | ||||| |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| ||||    
T  21928469 aggcagagaaggtggttggagtatcttaaggatttcgattttcagttgagttatcatcccgggaaggcaaatgttgttgccgacgctttgagtagaaaga 21928370  T
Q  337 ctttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||    
T  21928369 ctttgcatatgtctg 21928355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16099451 - 16099257
Alignment:
Q  59 ttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattac 158  Q
    |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| |||||     
T  16099451 ttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccaactcatgatttcgaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattat 16099352  T
Q  159 ttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
     |||||| ||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  16099351 ctgtatgattctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 16099257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18574633 - 18574432
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||| ||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| ||||    
T  18574633 gcttatgctttgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatcctactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 18574534  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||| ||| |  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||    
T  18574533 atctgtatgattctaagtttaaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttgga 18574434  T
Q  257 at 258  Q
    ||    
T  18574433 at 18574432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18449851 - 18449660
Alignment:
Q  160 tgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaatt 259  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||||||| || |||||||| | |||||    
T  18449851 tgtatggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtttgaaatatttatttgacgagaaagaattaaatatgaggtagtgaaggtggcttgaatt 18449752  T
Q  260 gctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||| |||||| |||| |  ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  18449751 gctaaaggattataatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcatatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctg 18449660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 348
Target Start/End: Original strand, 23026553 - 23026844
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| || ||||||| | | ||||||||||| || || |  |||||||| || ||||| || || || | || | ||||||| ||||| ||||    
T  23026553 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaactatccgactcatgatttggaattggcagcagttgtgtatgcactgaagatttggaggcatt 23026652  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||  |||| |||||| |    
T  23026653 atctgtatggttataagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaagcaaagaagatggttgaa 23026752  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
     |  || || |||| ||||||| | ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||  ||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  23026753 gtatcttaaggattttgattttcagttgagttattatcccgggaaagctaatgttgttgttgatgctttgagtataaagactttgcatatgt 23026844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 255 - 349
Target Start/End: Original strand, 16625752 - 16625846
Alignment:
Q  255 gaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16625752 gaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 16625846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 22077745 - 22077819
Alignment:
Q  275 ttttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  22077745 ttttgagttgagctatcatccgagtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtc 22077819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 351
Target Start/End: Original strand, 19986388 - 19986553
Alignment:
Q  186 agtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattga 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||| | || || ||| |||  || ||||| | ||||||| | ||||    
T  19986388 agtgaccacaagagtttgaagtacttcttcgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatgattgaaatatcttaaagactttgattttcagttga 19986487  T
Q  286 gctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | |||||||| || || |||||||| ||| | ||||| || | ||| |||||||||||||||||||    
T  19986488 gttatcatcccgggaaggctaatgtagttaccgatgctttgaatagaaagactttgcatatgtctg 19986553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18572882 - 18572803
Alignment:
Q  272 tgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18572882 tgatttttagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctg 18572803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 351
Target Start/End: Original strand, 8761934 - 8762064
Alignment:
Q  221 gaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggat 320  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  8761934 gaaggatttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagat 8762033  T
Q  321 gccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||||||||||    
T  8762034 gccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctg 8762064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 24294563 - 24294624
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttat 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||    
T  24294563 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttat 24294624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 335
Target Start/End: Original strand, 27688210 - 27688257
Alignment:
Q  288 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaag 335  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27688210 tatcaccctggtaaagcaaatgttgttgcggatgctttaagtaggaag 27688257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16099248 - 16099200
Alignment:
Q  303 gctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  16099248 gctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 16099200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 351
Target Start/End: Original strand, 38588 - 38937
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  38588 tgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcgagacaattcagaattcatgagaagaattaccct 38687  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||    
T  38688 acgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgagcataacagtt 38787  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38788 tgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgagacatcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaa 38887  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  38888 agctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttggatatgtctg 38937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 7292 - 7640
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7292 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaaaatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaatacatgagaagaattaccc 7391  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7392 tacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggaaaaattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgaacataagagt 7491  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7492 ttgaagtatctgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaagaactatgattttgagttgagctatcatccgggta 7591  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  7592 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtc 7640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8606 - 8258
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  8606 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 8507  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8506 tacgcatgatctcgagttagcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 8407  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  8406 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 8307  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8306 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 8258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 7726 - 8074
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7726 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcatcgagacagttgagaattcatgagcggaattaccc 7825  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  7826 tacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttctagattcgaggtgtttaatgatcacaagagt 7925  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7926 ctgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgctgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggta 8025  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8026 aagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaacattgcatatgtc 8074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 433 - 83
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  433 gtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaacatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgataattcatgagaagaattaccc 334  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  333 tacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtactgtttgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 234  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  233 ttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatagcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggta 134  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  133 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctg 83  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2936 - 2586
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2936 gtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaacatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgataattcatgagaagaattaccc 2837  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2836 tacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtactgtttgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 2737  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2736 ttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagattgcttgaattgctgaatgattttgattttgagttgagctatcatccgggta 2637  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  2636 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctg 2586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16603 - 16254
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16603 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattatcc 16504  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16503 tacgcatgatcttgagttggcagccatagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttaaggtgtttagtgatcacaagagt 16404  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  16403 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 16304  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtct 350  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  16303 aagctaatgttgttgcagatgccttgagttggaagacattgcatatgtct 16254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10141 - 9793
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  |    
T  10141 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcacgagaagaattatac 10042  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10041 tacgcatgatcttgagttggcagccatagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 9942  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  9941 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgattatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 9842  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9841 aagctagtgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtc 9793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 44818 - 44470
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  44818 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcacgacagttgagagttcatgagaagaattatcc 44719  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44718 tacgcatgatctcgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 44619  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||| |||| ||||| || ||||  ||||  || ||||| ||||    
T  44618 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcatagatggcttgaattgttaaaggattacgactttggtttgaattaccatccaggta 44519  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  44518 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtc 44470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 49153 - 49489
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||| ||||  | ||||| |||||||| ||    
T  49153 gtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggaaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagggtgcatgaaaagaattatcc 49252  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  || |||||| ||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||     
T  49253 tactcacgatttatagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagattcgaagtgttcagtgaccataagagc 49352  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||  |  | || |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  49353 ttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcattcgggta 49452  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  49453 aagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 49489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 137 - 351
Target Start/End: Original strand, 105348 - 105562
Alignment:
Q  137 attgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 236  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  105348 attgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttaatcagaaagagttgaatatg 105447  T
Q  237 aggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaaga 336  Q
    || ||  |||| | ||||||||   | |  ||||  |||||| | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  105448 agacaaagaagatagttggaatatgttatggatttcgattttcagttaagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaaga 105547  T
Q  337 ctttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||    
T  105548 ctttgcatatgtctg 105562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 18980 - 19330
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| || |||||  |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980 gtgatgcgtctaagttggggttaggtggggtgcttgtgcaagatgggaaagtagtatcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 19079  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19080 tacgcatgatttagagttggatgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtaaggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 19179  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| || || ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19180 ttgaagtatatgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggactatgattttgtgttgagctatcatccgggta 19279  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  19280 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctg 19330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21554 - 21204
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  21554 gtgatgcgtctaagctgggcttaggaggtgttcttatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctagacagttgaggattcatgaaaagaattatcc 21455  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||| |  | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  21454 tacacatgatttggagttgactacggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgtggtgttcagcgatcacaagagt 21355  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| | || ||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||  |||    
T  21354 ctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagta 21255  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||    
T  21254 aagctaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagaccttacatatgtctg 21204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 46100 - 45834
Alignment:
Q  85 atgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtt 184  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  46100 atgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtttggttctagatttgaggtgtt 46001  T
Q  185 tagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattg 284  Q
     |||||||| || || |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| ||||||||||||||||||  |||    
T  46000 cagtgatcataaaagcttgaaacatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttg 45901  T
Q  285 agctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |  || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  45900 aattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcaggaagaccctacatatgtctg 45834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6888 - 6540
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6888 gtgatgtgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtggtagcttatgcttcgagacagttgataattcatgagaagaattaccc 6789  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | | ||||    
T  6788 tatgcacgatttagagttggctaatgtggtctttatattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgataatacgagt 6689  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||    
T  6688 ttgaagtatctattcgatcagaaggaatggaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattataactttgagttaagctatcattcgggta 6589  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  6588 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagactttgcatatgtc 6540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8024 - 7689
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8024 tgggtttaggtggcgtgcttatgcaagatggaaaagtagttgcttatgcttcgagatagttgagaattcatgagaagaattaccctacgcatgatttaga 7925  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||     
T  7924 gttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggggacattatttgtacggttcaagatttgagctgtttagtgatcataagagtttgaagtctctgttc 7825  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7824 gatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 7725  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  7724 cagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctg 7689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 6970 - 7320
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6970 gtgatgcgtctaagctgggtttaggtggtgtgcatatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcatcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 7069  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||    
T  7070 tacgcatgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtaaggttcgagatttaaggtgtttagtgaccattagagt 7169  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7170 ttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggaagcgtagatggcttgaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggta 7269  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||| ||||||    
T  7270 aagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttgcatttgtctg 7320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3100 - 2753
Alignment:
Q  4 atgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctat 103  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  3100 atgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaaaatggcaaggtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgaaaagaattaccctac 3001  T
Q  104 gcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttg 203  Q
     || |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  3000 acacgatttagagttggctgttgtggtctttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgattagtgatcataagagtttg 2901  T
Q  204 aagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaag 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2900 aagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggtagcgtaggtggcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaag 2801  T
Q  304 ctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  2800 ttaatgttgttgcggatgctttgagtaggaagactttacatatgtctg 2753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13729 - 13375
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||| |  |||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13729 gtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgtttttgcatgatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 13630  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttg----tattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaa 196  Q
    ||  || |||||||||||||| ||| ||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13629 tacacacgatttagagttggctgctatagtcttcgatcgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaa 13530  T
Q  197 gagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccg 296  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13529 gagtttgaagtatctgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccg 13430  T
Q  297 ggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13429 ggtcaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcataagtctg 13375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7687 - 7339
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||| || |||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7687 gtgatgtgtccaagctgggtttaggtggtgtggttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 7588  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  7587 tacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcataagagc 7488  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7487 ttgaagtatctgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcatagatggcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggta 7388  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  7387 aagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagactttgcatatgtc 7339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 191 - 541
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  191 gtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgtttcgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagaattcatgaaaagaattatcc 290  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  291 tacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttatacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagt 390  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || || || ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  391 ctaaaatatttatttgataagaaggaattgaacatgaggcagaggagatgcttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 490  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  491 aagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcacatgtctg 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23787 - 23493
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| || ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || |||||  | || || | || ||||||||| || || ||||    
T  23787 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtacatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcaaccgttgtgtatgcattgaagatttgaaggcatt 23688  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  23687 atctgtatggttctaagttttaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttgga 23588  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || || | ||||||| | ||||| | |||||  || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  23587 atatcttaaggactttgattttcagttgagttttcatctcgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 23493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 351
Target Start/End: Original strand, 13852 - 14200
Alignment:
Q  3 gatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattacccta 102  Q
    ||||||| |||| |||| || || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13852 gatgcgtccaagctgggtttgggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgaggcagttgagaattcatgagaagaattatccca 13951  T
Q  103 tgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagttt 202  Q
     ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13952 cgcacgatttagagttggctgatgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatgtgaggtgtttagtgatcataagagttt 14051  T
Q  203 gaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaa 302  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || ||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14052 gaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatatgaggcagggtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaa 14151  T
Q  303 gctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  14152 gctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccatgcatatgtctg 14200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 25584 - 25931
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25584 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcttcgagacaggtgagaattcatgacaagaattaccc 25683  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || |||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25684 tacgcatgatttagagttggctgttgtggtctttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttaatgatcacaagagt 25783  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25784 ttgaaatatttgtttgattagagggaattgaatattaggcagcgtaggtggcttgaattactgaaggatta-gattttgagttgagctatcatccaggta 25882  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  25883 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtc 25931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1093 - 799
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| || ||||||| | | ||||||||||| || || |  | |||||| || ||||| || || || | || | ||||||| ||||| ||||    
T  1093 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaactatccgactcctgatttggaattggcggcagttgtttatgcactgaagatttggaggcatt 994  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  | |||||||  |  ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  993 atctttatggttataagtttgaagagttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgcttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttgga 894  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || || | ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  893 atatcttaaggaatttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 112127 - 112475
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  112127 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcatcgagacagttgagaattcatgaaaggaattaccc 112226  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| ||||||||||| |||| ||| || |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  112227 tacgcacgatttagagttagccgttgtggtttttgtacttaagataaggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtatttagtgatcacaagagt 112326  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  112327 ttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtaagtggcttgaattgctgaacgactatgattttgagttgagctatcatccaggta 112426  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  112427 aagctaatgttgtagcagatgctttaagtaggaagacattgcatatgtc 112475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16534 - 16194
Alignment:
Q  11 caagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||   ||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||   |||||    
T  16534 caagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagataataaagtagttgcttatgcatcgagacagttgagaattcatgaacgaaattatcctactgatgat 16435  T
Q  111 ttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatt 210  Q
     | || || || || ||  |||||||  | ||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  16434 cttgaattagctgcagtgatctttgtgcttaagatttggagacactatttgtatgattcgagatttgaagtgttcagtgatcataagagtctgaagtatt 16335  T
Q  211 tgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgt 310  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  16334 tgtttgatcagaagcaattgaatatgagacagcgaaggtggatcaaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgt 16235  T
Q  311 tgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234 tgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 16194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 8298 - 8631
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8298 gtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaatttatgagaagaattaccc 8397  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8398 tacgcatgatttagagttgactgatgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 8497  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8498 ttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaacatgagacagcgtagatggcttgaattgctgatggactatgattttgagttgagctatcattcgggta 8597  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaa 334  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||||||    
T  8598 aagctaatgttgttgcaaatgctttgagtaggaa 8631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2568 - 2225
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||   ||  | || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||    ||||| ||    
T  2568 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcagaataacaaggtagtggcttatgcatcgagacagtcgaggattcatgaacgaaattatcc 2469  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | ||||| || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||       || || |||    
T  2468 tactcatgatcttgagttagctgcagtagtctttgtgcttaagatttggagacattatttctatggttctagatttgaagtgtt-------cataaaagt 2376  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||| |   |||  |||||||| ||||    
T  2375 ctgaagtattcatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttcgggctgaattatcatccaggta 2276  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2275 aagctaatgttcttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtctg 2225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 32212 - 32560
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32212 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaactggtagctgatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 32311  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  32312 gatgcatgacttagagttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgagcacaagagt 32411  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  32412 ttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 32511  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  32512 aagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcatatgtc 32560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10135 - 9915
Alignment:
Q  129 gtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10135 gtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggattgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttatttgatcagaaggaat 10036  T
Q  229 tgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaag 328  Q
    |||||||||| ||||  || ||| | || ||||| ||||||||||| || |  ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  10035 tgaatatgagacagcttagatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgag 9936  T
Q  329 taggaagactttgcatatgtc 349  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  9935 caggaagacattgcatatgtc 9915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 39809 - 39693
Alignment:
Q  12 aagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatt 111  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  39809 aagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattacccgacgcatgatt 39710  T
Q  112 tagagttggccgctgta 128  Q
    |||||||||| ||||||    
T  39709 tagagttggcggctgta 39693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2085 - 1737
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2085 gtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattactc 1986  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||     
T  1985 gacgcatgacttagaattggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagc 1886  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  1885 ttgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 1786  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  1785 aagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtc 1737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15825 - 15477
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15825 gtgatgcgtccaagttgggtttaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattactc 15726  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||     
T  15725 gacgcatgacttagaattggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagc 15626  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  15625 ttgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 15526  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  15525 aagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtc 15477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 23712 - 24058
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||| || ||| ||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712 gtgatgcgtccaagttaggtttatgaggtgtacttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 23811  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23812 gacgcatgatctagagttggcggacgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 23911  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| | ||||||||||| |||   ||||  |||||||  ||||    
T  23912 ttgaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatatgaggcagagaaggtggcttaaattgttgaaagattatgactttaggttgaattatcatctaggta 24011  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatg 347  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24012 aagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatg 24058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 108450 - 108800
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| || ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  108450 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagaaggtaaagtgatagcttatgcttcaagacaattaagagttcatgagaagaattatcc 108549  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  108550 tacgcatgatctcgagttggcagccgtagtatttgtattgaagatagggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 108649  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  108650 ttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtagatgattagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 108749  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  108750 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctg 108800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 114226 - 113890
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| | ||| | ||||  ||||||||  |    
T  114226 gtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctaagagtacatgtaaagaattattc 114127  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  || |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  114126 tactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcattacttgcatggttccaggtttgaagtgttcagtgaccataagagc 114027  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||  |  | || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  114026 ttgaaatatctgtttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggta 113927  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  113926 acgccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 113890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 28007 - 28355
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28007 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaagatgttaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 28106  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28107 gacgcatgatttagagttggcggctgtcgtctttatattgaagatatggagacactacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 28206  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| || |||||||| ||||  || |  |||||||| ||||    
T  28207 ttgaaatacttgttcgaccagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgactttggtttcaattatcatccaggta 28306  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  28307 aagctaatgttgttgcagattccttgagttggaagacattgcatatgtc 28355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Original strand, 54636 - 54930
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| ||||| || | |  ||||||||| ||||| ||||    
T  54636 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggctgttgtttattcattgaagatttggagtcatt 54735  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54736 atctttatggttctatttttgaggtgttcattgaccataagtgtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagcgaagatggttgga 54835  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || || | ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||| ||||||    
T  54836 atatcttaaggactttgatttttagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtataaagactttgcatgtgtctg 54930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 3144 - 3348
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  3144 gtgatgcgtcaaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagacggcaaggtagtagcttatgcgtcgagacaattgagaattcatgagcggaattaccc 3243  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  3244 tacgcacgatttagagttggctgctgtgatttttgtgttgaaaatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcgatcataagagt 3343  T
Q  201 ttgaa 205  Q
     ||||    
T  3344 ctgaa 3348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 60409 - 60068
Alignment:
Q  12 aagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatt 111  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||   ||  | ||||||||||| |||||  |||| |  ||||||||    ||||| ||||  ||||||     
T  60409 aagttgggtttaggaggtgtgcttatgcaggataataatctagtagcttatgcatcgaggtagtttacgattcatgaacgcaattatcctactcatgatc 60310  T
Q  112 tagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattt 211  Q
    | ||||| || || || || |||||| | || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||| || || |||| ||| || ||| | ||||||||    
T  60309 ttgagttagctgcagtggtttttgtactcaaaatttggaggcattatctgtatggttctagatttgaagttttcagtggtcataaaagtataaagtattt 60210  T
Q  212 gtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgtt 311  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | |||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  60209 atttgaccagaagaaattgaatatgaggcagcaaaggtggctagaattgctaaaggattatgatttcggattgaattaccatccgggtaagggtaatgtt 60110  T
Q  312 gttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgat 353  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| || || ||||||| ||||    
T  60109 gttgcagatgctttaaataggaaaacattacatatgtttgat 60068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 287 - 350
Target Start/End: Original strand, 3381 - 3444
Alignment:
Q  287 ctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtct 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3381 ctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtct 3444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 131477 - 131423
Alignment:
Q  297 ggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  131477 ggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctg 131423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 150740 - 150690
Alignment:
Q  42 gatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaag 92  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  150740 gatggaaaagtagtagcttatgcttcgaggcagttgagaattcatgagaag 150690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 102900 - 102554
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  102900 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaggtggtaacttatgcgtcgagacaattgagaattcatgagcggaattaccc 102801  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  102800 tacgcacgatttagagttgggtgctgtggtttttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagt 102701  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||    
T  102700 ttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttggtttgaactatcatccaggta 102601  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatg 347  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  102600 aagctaattttgttgcagatgcattgagtaggaagactttgcatatg 102554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 38 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 40187 - 39874
Alignment:
Q  38 gcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgta 137  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||  |||||||||| |||    
T  40187 gcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctacacacaatttagagttggctactgtagtcttcgta 40088  T
Q  138 ttgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  40087 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcataagagtttgaagtatctatttgatcagaaggaatggaatatga 39988  T
Q  238 ggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    | |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |  | ||| |||||||    
T  39987 gacagcgaaggtagcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccggttaaagctaatgttgttgcagacactctgagtgggaagac 39888  T
Q  338 tttgcatatgtctg 351  Q
     |||||||||||||    
T  39887 cttgcatatgtctg 39874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2560 - 2212
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2560 gtgatgcgtccaagttgggcttaagtggtgtgcttatgcaagatgccaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgaaaagaattaccc 2461  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  2460 tacgcacgatttagagttagccgctgtggtctttgtacttaagattcagagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagtgatcataaaagt 2361  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  2360 ttgaaatatttgctttatcagaaggaaatgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaaagattatgattttgagttgagctatcatctaggta 2261  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  2260 aagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtc 2212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9064 - 8716
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  9064 gtgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgttcttatgcaagaaggtaaagtggtagcttatgcttcaacacagttaaggattcatgagaagaattatcc 8965  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8964 tacacatgatcttgagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaagagt 8865  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  8864 ttgaagtatttgttcgattagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 8765  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8764 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 8716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 49757 - 49481
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49757 gtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 49658  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49657 cacgcacgatttagagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 49558  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattt 277  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  49557 ttgaagtatctgttcgatcagatggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgattt 49481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 3992 - 4340
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3992 gtgatgcatccaagttgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcgtatgcttcaagatagttgagaattcatgagaagaattaccc 4091  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4092 gacgcatgatttagagttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 4191  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| | |||||||| || |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  4192 ttgaaatacttgttcaatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtaaatggctagaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggta 4291  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  4292 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgaatatgtc 4340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 38459 - 38807
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38459 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtatttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagtcagttgagaattcatgagaagaattaccc 38558  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||     
T  38559 gacgcatgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacctgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcagaagagc 38658  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  38659 ttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctggtattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 38758  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  38759 aagctaatgttgttgcagatgccttgtgtaggaagacattgcatatgtc 38807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 67072 - 66724
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67072 gtgatgcgtccaagttgggattaggcggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcctcaagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 66973  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  66972 gacgcacgatttagagttggcagatgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagt 66873  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||  || ||||| ||||    
T  66872 tcgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatattagacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattaccatccaggta 66773  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || | |||||| |||||||||||    
T  66772 aagctaatgttgttgcagatgctttgagcaagaagacattgcatatgtc 66724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 57684 - 57336
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57684 gtgatgcgtccaagttgggcttaggcggcgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 57585  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  57584 aacgcatgatttagagttggcggctgttgtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagt 57485  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || || ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  57484 tcgaagtatttgttcgaccagaaggaattaaatatgagacaacgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 57385  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  57384 aagctaatgttgttgtagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtc 57336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 18706 - 19054
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | |||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18706 gtgatgcatccaagctgggtttaggaggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcattagaagaattaccc 18805  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||     
T  18806 gacgcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaatatatggagacattacttgtatggttcaaggtttcaggtgtttagcgatcacaagagc 18905  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  18906 ttaaagtatttgttcgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcatagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 19005  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  19006 aagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaatacattgcatatgtc 19054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 196126 - 196465
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  196126 gtgatgtgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtcaagtggtagcttatgcttcgaggcagttgagagttcatgagaagaattaccc 196225  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||||    
T  196226 gacacatgatttagagttagctgttgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatgg---------tgaggtgtttagtgatcataagagt 196316  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    || |||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  196317 ttaaagtacctgttcgaccagaaagaattgaatatgaggcagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 196416  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  196417 aagctaatgttgtcgcggacgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 196465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 29210 - 29558
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29210 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtccttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaggtagttgagagttcatgagaagaattaccc 29309  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  29310 gacgcatgatttagagttagcggcaatggtctttgtattgaacatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagc 29409  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  29410 ttgaaatatttgttcgatcagaaggaattaaacatgaggtagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 29509  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  29510 aagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtc 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3861 - 3513
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3861 gtgatgcttccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattaccc 3762  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  3761 gacgcatgatttagaattagccgccgtggtttttgtgttgaagatttggagacattacttatatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagc 3662  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  3661 ttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgactttggtttgaattatcatccaggta 3562  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  3561 aagctaatgttgttacagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtc 3513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 4)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20269 - 19921
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  20269 gtgatgcgtccaagttgggtttagaaggtgtacttatgtaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaggcaattgagaattcatgagaagaattatcc 20170  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||     
T  20169 gacgcatgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgaccacaagagc 20070  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  20069 ttgaaatattttttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 19970  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19969 aagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 19921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 35693 - 35345
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  35693 gtgatgcgtccaagttgggtttagaaggtgtacttatgtaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaggcatttgagaattcatgagaagaattatcc 35594  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||     
T  35593 gacgcatgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgaccacaagagc 35494  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  35493 ttgaaatattttttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 35394  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35393 aagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 35345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 64 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 51036 - 50751
Alignment:
Q  64 cttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgta 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51036 cttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctacgcacaatttagcgttggctgcggtggtctttgtattgaagatatggagaaattacttgta 50937  T
Q  164 tggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgcta 263  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||     
T  50936 tgattcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgtttgattagaaggaattgcatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctg 50837  T
Q  264 aaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    || || || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  50836 aaggactacgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcacatgtc 50751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 446 - 330
Alignment:
Q  228 ttgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaa 327  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||  || || |||| ||||||| | ||||  |||||||| || || |||||||||||||||||||| || |    
T  446 ttgaatatgaggcaaagaagatggttagaatatcttaaggattttgattttcagttgatttatcatcccgggaaggctaatgttgttgcggatgctttga 347  T
Q  328 gtaggaagactttgcat 344  Q
    |||| ||||||||||||    
T  346 gtagaaagactttgcat 330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7680 - 7333
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  7680 tgatgcgtccaagttgggtttaggaggtgtaatgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattatctg 7581  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    | |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7580 acgcatgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttttatggttctaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagct 7481  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||| | |||||| | || |||||||| ||||  ||||  |||||||| |||||    
T  7480 taaagtatttgttcgatcagaaagatttgaatatgaggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaa 7381  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7380 agctaatgttgttgcagatgccttgagtagtaagacattgcatatgtc 7333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 202107 - 202455
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  202107 gtgatgcgtccaagttgggcttatgtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagcggaattaccc 202206  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  202207 tacgcatgatttagagttggctgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagattttaggtgtttagtgatcacaggagt 202306  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || || ||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  202307 ttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggta 202406  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  202407 aagcaaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtc 202455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 324371 - 324021
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  324371 gtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctagacagttaagaattcatgaaaagaattttcc 324272  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| || || || ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  324271 tacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttattttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 324172  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||| | || ||||| ||  || | || || ||||||||||  ||||  || |||||  |||    
T  324171 ctcaaatatttatttgatcagaaggagttaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctagta 324072  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  324071 aagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcacatgtctg 324021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 118834 - 118545
Alignment:
Q  60 tatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattact 159  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||  |||||| | || || || || || ||||||||  | ||||| ||||||||||| |    
T  118834 tatgcatcgagacagttgagaattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgaattagctgcagttgtctttgtgcttaagatttggagacattatt 118735  T
Q  160 tgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaatt 259  Q
    |||||||||| |||||    ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||    
T  118734 tgtatggttctagattattagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaatt 118635  T
Q  260 gctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    | | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  118634 gttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtc 118545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 706 - 1054
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  706 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcatcgagacagttgagaattcatgaaagaaattaccc 805  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  806 tacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtacttaagatatggagaaattacttgtatggttcgagatttgaagtattcagcgatcacaagagt 905  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  906 ctaaaatatttatttgatccaaaggaattcaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggta 1005  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||| |||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  1006 aagctaatcttgtagcagatgccttgaataggaagacattgcatatgtc 1054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 66 - 349
Target Start/End: Original strand, 31457 - 31740
Alignment:
Q  66 tcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatg 165  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31457 tcgagacaattgagaattcatgagcggaattaccctacgcacgatttagagttggctgatgtggtttttgtgttgaaaatatggaaacattacttgtatg 31556  T
Q  166 gttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaa 265  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||    
T  31557 gttctagatttgaagtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttagatcagaaggaattgaatatgagccagcgaaggtggcttgaattgttgaa 31656  T
Q  266 agattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||   || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31657 agattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtc 31740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 34390 - 34641
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||   ||  | ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||   |||||| ||    
T  34390 gtgatgcgtccaagttgggtttgggtggtgtgcttatgcaagataacaaggttgtagcgtatgcatcaaggcagttgaggattcatgaatggaattatcc 34489  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34490 tacgcatgatttggagttggctgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 34589  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggt 252  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34590 ttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggt 34641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 351
Target Start/End: Original strand, 12217 - 12516
Alignment:
Q  52 tggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggag 151  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || |||||    
T  12217 tggtagcttatgcttctaggaagttgaggattcatgaaaaaaattatcctacgcatgatctggagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggag 12316  T
Q  152 acattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtgg 251  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | || |||    
T  12317 gcattatttgtatggttccagatttgaagttttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgattagaaggagttgaacatgaggcagaggagatgg 12416  T
Q  252 ttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    || ||| || | || || ||||||||||  ||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  12417 ttagaactgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgctgcatatgtctg 12516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3248 - 2959
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  3248 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatccaagatggcaaagtagtagcttctgcgtcgagatagttgagaattcatgaaagaaattaccc 3149  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3148 tatgcacgatttagagttggctgctgtggtttttatattgaaaatatggagacattacttgtatgattcgagatttgaggtgttcagtgatcacacgagt 3049  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctat 290  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3048 ttgaaatatttgttcgataagaaggagttgaatataaggcagcaaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgagctat 2959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6417 - 6070
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6417 gtgatgcgtccaagatgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatacttctaggcagttgaggattcatgagaagaattatcc 6318  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || |||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  6317 tacgcatgatttagagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggccttacttgtacggtttcagatttgaggtgttcagtgatcataaaagt 6218  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||| |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  6217 ttgaactatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgctaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 6118  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||    
T  6117 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgt 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 349
Target Start/End: Original strand, 79238 - 79481
Alignment:
Q  106 atgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaa 205  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  79238 atgatttagagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacatcacttgtatggttcgaggttcgaggtgtttagtgatcacaagagattgaa 79337  T
Q  206 gtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagct 305  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| |||||||||    
T  79338 gtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagct 79437  T
Q  306 aatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  79438 aatgttgttgcagatgccttgagtagaaagacattgcatatgtc 79481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 55407 - 55230
Alignment:
Q  29 tgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgta 128  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |||||||||||  | || ||     
T  55407 tgtgcttatgcaagatggcaaagtagtggcttatgcgtcgagacagttgagaattcatgagcggaattgccctacgcacgatttagagtta-ctgcagtg 55309  T
Q  129 gtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagt 207  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  55308 gtctttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaagt 55230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 719 - 469
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  719 gtgatgcttccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaaaactgttgagagttcatgagaagaattaccc 620  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  619 gagacatgatttagagttagccgccgttgtttttgtgttgaagatttggagacattacttatatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagc 520  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtgg 251  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  519 ttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtgg 469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15779 - 15429
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15779 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgattctaggcagttgagaattcatgaaaagaattatcc 15680  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15679 tacacatgatttggatttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagt 15580  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || |||||||||||||  ||||  || |||| |||||    
T  15579 ttgaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatctgggta 15480  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||  |||||||||||||    
T  15479 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagaggttgcatatgtctg 15429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Original strand, 8556 - 8850
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  || ||||| || |||||||| || || | || ||||||||| ||||| || |    
T  8556 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcaagatttggaattggccgccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcact 8655  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  8656 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttaatcagaaagagttgaatatgaggcacagaagatggttgga 8755  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  8756 atatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 8850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41363 - 41015
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||   ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41363 tgatgcgtccaagttgggcttaggaggtgttttgatgcaaaat-acaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattaccct 41265  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    |  |||||||| |||||||| || ||  | ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  41264 acccatgatttggagttggctgcggtgatttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtt 41165  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| | || |||||||| |||||||||||||  ||    ||||||||||||||    
T  41164 tgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggttttgattatcatccgggtaa 41065  T
Q  302 agctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  41064 agctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 41015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 239
Target Start/End: Original strand, 47108 - 47289
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  ||||||||||| ||  | ||  | || | || ||||||||| ||||| ||||    
T  47108 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttagaattaacggcaattgtatatgcattgaagatttggaggcatt 47207  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagg 239  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  47208 atctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtt-gaagtatttgtttgatcagaaatagttgaatatgagg 47289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16307 - 16103
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| || || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16307 gtgatgcgtccaagctgggttttggtggtgtgcttatgcaagatggaaaagtagtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattatcc 16208  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16207 tacgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagt 16108  T
Q  201 ttgaa 205  Q
    |||||    
T  16107 ttgaa 16103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11460 - 11110
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | |||||||| || ||| ||||||||||| |||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  11460 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagaaggcaaagtggtagcttatacttctaggcagttaaggattcatgaaaagaattatcc 11361  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  11360 tacacatgatttggagttggctgtggtggtttttgtgttgaaaatttggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagtgatcataaaagt 11261  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| |||||||||| || || ||||||||||||||| || | ||| | || ||| | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  11260 ttgaaatatctgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaggatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 11161  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  11160 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 11110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5538 - 5190
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| ||    
T  5538 gtgatgcgtccaagttgggcttaggaggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttgaggattcatgaaggaaattatcc 5439  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | || || || || ||  | |||||| | ||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  5438 tactcatgatcttgaattagctgcagtgttttttgtactcaagatatggagacattatttgtacaattctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagt 5339  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||||  ||||  ||||||||  |||    
T  5338 ctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagta 5239  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5238 aagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtc 5190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12668 - 12320
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| ||    
T  12668 gtgatgcgtccaagttgggcttaggaggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttgaggattcatgaaggaaattatcc 12569  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | || || || || ||  | |||||| | ||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  12568 tactcatgatcttgaattagctgcagtgttttttgtactcaagatatggagacattatttgtacaattctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagt 12469  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||||  ||||  ||||||||  |||    
T  12468 ctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagta 12369  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12368 aagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtc 12320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 2911 - 3261
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  2911 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtagtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 3010  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||  || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3011 tacgcatgatttggagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagt 3110  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | ||||| ||||||||||  ||||  || ||||  ||||    
T  3111 ttgaaatatttgtctgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggta 3210  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    || ||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  3211 aaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 3261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5443 - 5101
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||  ||| ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  5443 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatgttaaagtggtagcttattcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 5344  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  5343 tacacatgatttggagttggctgctgtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagt 5244  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || |||||||||||||  || |  || ||||||||||    
T  5243 ttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggta 5144  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgca 343  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || | |||||| |||||    
T  5143 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaagaagacgttgca 5101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 29924 - 30274
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  29924 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaagtagtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 30023  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||  || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30024 tacgcatgatttggagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagt 30123  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | ||||| ||||||||||  ||||  || ||||  ||||    
T  30124 ttgaaatatttgtctgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggta 30223  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    || ||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  30224 aaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 30274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 39399 - 39748
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||    
T  39399 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtggtagctgatgcttcgagacaattgaaaattcatgagcggaattatcc 39498  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39499 tacgcatgatttggagttggctgttgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttagcgatcacaagagt 39598  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| | || || ||||| |||   || |  |||||||  ||||    
T  39599 ttgagatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgacggtggcttgaattgttgaaggactatga-tttatttttaattatcatcaaggta 39697  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || | |||||| |||||||||||||    
T  39698 aagctaatgttgttgcagatgctttgagcatgaagacgttgcatatgtctg 39748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1536 - 1187
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  1536 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 1437  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| || || || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||    
T  1436 tacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgtttcgaaaatttggagacattatttgtacggttccaggtttgaagtgtttagtgatcataaaagt 1337  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| | || ||| |||| |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  1336 ttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaaaatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 1237  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtct 350  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  1236 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtct 1187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14135 - 13787
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||  ||    
T  14135 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttgaggattcatgaacgaaattgtcc 14036  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | || || || || || ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||| || |||    
T  14035 tactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcaacgatcataaaagt 13936  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  13935 ctgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggta 13836  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    || |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13835 aaactaatgttgtcgcagatgccttaagcaggaaaactttgcatatgtc 13787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3581 - 3233
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| ||    
T  3581 gtgatgcgttcaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttgaggattcatgaacgaaattatcc 3482  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||   ||||| | || || || || || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  3481 tacttatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagcgatcataaaagt 3382  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||    
T  3381 ctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatgtgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgattgtgggttgaattattatccaggta 3282  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3281 aagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtc 3233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 351
Target Start/End: Original strand, 46052 - 46388
Alignment:
Q  15 ttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttag 114  Q
    |||||||| || |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  46052 ttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctagacagttgaggatacatgaaaagaattatcctatgcatgatttgg 46151  T
Q  115 agttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtt 214  Q
    ||||||| |  || || ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| ||    
T  46152 agttggctgtggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatt 46251  T
Q  215 tgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtt 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||    
T  46252 tgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagtt 46351  T
Q  315 gcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  46352 gcacatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctg 46388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 40987 - 41322
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  40987 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 41086  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  41087 gttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttattt 41186  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || || |||| ||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  41187 gaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 41286  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| |||||||    
T  41287 ctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctg 41322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 129 - 349
Target Start/End: Original strand, 277597 - 277817
Alignment:
Q  129 gtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  277597 gtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcggaaagaat 277696  T
Q  229 tgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaag 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||  | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  277697 tgaatatgaggcagcgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 277796  T
Q  329 taggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  277797 taggaagacattgcatatgtc 277817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 261902 - 261625
Alignment:
Q  74 gttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccaga 173  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  261902 gttgaggattcatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccaga 261803  T
Q  174 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatg 273  Q
    ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||| || | || ||| | || ||| ||||||||||||    
T  261802 tttgaagtattcagtgatcacaagagtctgaagtacttatttgaccaaaaggaattgaacatgaggtagaggagatggcttgagttgttaaaagattatg 261703  T
Q  274 attttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||   ||||  || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||  ||||||||||||    
T  261702 atttttgtttgaattaccatccaggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacactgcatatgtctg 261625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 220 - 1
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | |||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  220 gtgatgcatccaagtttggtttaggcggtgtacttatgcaggatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 121  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  120 gactcatgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgcggtttgaggtgtttagcgatcacaagagt 21  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatca 220  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  20 ttgaagtatttgttcgatca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 2124 - 2474
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  2124 gtgatgcgtccaagttaggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 2223  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  2224 tacacatgatttggagttagctgcggtagtttttgttttgaaattttggaggcattatttgtacggctccagatttgaagtgtttagtgatcccaaaagt 2323  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || |||||||||||||  ||||  || |||||||||     
T  2324 ttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtg 2423  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  2424 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctg 2474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 218059 - 218404
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| |     
T  218059 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaagtagtagcttatgcatcgagacagttgaggattcatgaacgaaattatcg 218158  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | || || || || || || |||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||  |||| |   ||    
T  218159 tactcatgatcttgaattagctgcagtggtttttgtgcttaaaatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcaatcata---gt 218255  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||    
T  218256 ctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaactataatccaggta 218355  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  218356 aagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtc 218404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 57 - 350
Target Start/End: Original strand, 22880 - 23173
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    ||||| ||||  |||||| | ||||| || || |||||||||||  | |||||  |||||||||    
T  22880 gcttatgcatcgaggcagttgaggattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtagtctttgtgcttaagattaggagacatt 22979  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22980 atttgtatggttctagatttgaagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttga 23079  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtct 350  Q
    |||| | ||||| ||||||||||  ||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  23080 attgttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaattttacatatgtct 23173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 55630 - 55879
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55630 gtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtatttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttcaagacagttgagagttcatgagaagaattaccc 55729  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     | ||||||||||||||| || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||     
T  55730 gacgcatgatttagagttagctgccgtggtttttgtgttgaagatgtggagacattacttatatggttcgagttttgaggtgtttagtgaccacaagagc 55829  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtg 250  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55830 ttgaaatatttattcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtg 55879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 109285 - 108947
Alignment:
Q  13 agttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgattt 112  Q
    ||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  109285 agttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcctacacatgattt 109186  T
Q  113 agagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttg 212  Q
      ||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  109185 gaagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatattta 109086  T
Q  213 tttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttg 312  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||| | ||  || | || |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| |    
T  109085 tttgattagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgtgg 108986  T
Q  313 ttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  108985 ttgtagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 108947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 349
Target Start/End: Original strand, 62913 - 63018
Alignment:
Q  244 gaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgca 343  Q
    |||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  62913 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgca 63012  T
Q  344 tatgtc 349  Q
    ||||||    
T  63013 tatgtc 63018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 6530 - 6878
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| ||| | ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  6530 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtgatgttcttatgcaggatagcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttgagaattcatgagcgaaattatcc 6629  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||| | || || || || || ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  6630 cactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgcttaagatttggagacattacttgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagt 6729  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| | ||||| ||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  6730 ctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaaggaaggtggcttgaattgttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggta 6829  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  6830 aagctaatgtggttgcagatgcattaagtaggaagactctacatatgtc 6878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 16616 - 16964
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||  |    
T  16616 gtgatgcgtacaagttgggcttaggtagtgtgcttatgcaggatggtaaggtagtagcttatgcatcgagacagttgaggattcatgaacgaaattatgc 16715  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | || || || || || ||| ||||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  16716 tactcatgatcttgaattagctgcagtggtccttgtactcaacatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagtgatcataaaagt 16815  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||    
T  16816 ctgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgaattatcaaccaggta 16915  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  16916 aagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtc 16964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 126 - 346
Target Start/End: Original strand, 12756 - 12976
Alignment:
Q  126 gtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaagg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  12756 gtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttaaagtatttgttcgatcagaaag 12855  T
Q  226 aattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgcctt 325  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |  || | || ||||| ||||| ||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12856 aattgaatatgaggcagcgtagatggctaaaaatactgaaagaatatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcctt 12955  T
Q  326 aagtaggaagactttgcatat 346  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  12956 gagtaggaagacattgcatat 12976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 23719 - 24033
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||   | ||  |||||||||| ||||||||||   ||||| |||    
T  23719 tgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaggtggtagctgtggtttaaagacagttgaaaattcatgagcgaaattatcct 23818  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtt 201  Q
    | ||||||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23819 acgcatgatttggagttggttgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtt 23918  T
Q  202 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaa 301  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || || ||||||||||  ||||  |||||||| |||||    
T  23919 tgaaatatttattagatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaa 24018  T
Q  302 agctaatgttgttgc 316  Q
    |||||||||||||||    
T  24019 agctaatgttgttgc 24033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6097 - 5747
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||  ||||||| |||||||| | |||||| ||    
T  6097 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggcagcttatgcttctaggaagttgaggattcatgaaaggaattatcc 5998  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || |||    
T  5997 tacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccaaatttgaagtgtttagtgatcataaaagt 5898  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  5897 ttgaaatatttgtttgataaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 5798  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  5797 aagctaatgtggttgcagatgctttgagaaggaagacgttgcacatgtctg 5747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13867 - 13517
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  13867 gtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgagagttcatgaaaagaattatcc 13768  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  13767 tacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagt 13668  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  || | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  13667 ctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggta 13568  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  13567 aagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctg 13517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 54 - 347
Target Start/End: Original strand, 6500 - 6793
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| |||||||    
T  6500 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagac 6599  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  6600 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 6699  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatg 347  Q
    |||||  || || || | ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  6700 ggaatatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatg 6793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23881 - 23531
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  23881 gtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagaatgcatgagaagaactatcc 23782  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||     
T  23781 tactcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagc 23682  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  || | ||||||||||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  23681 ttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggta 23582  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||  ||||| || || |||||||| || ||||||||||    
T  23581 aagccaatgtggttgatgatgcgttgagcaggaagacattacatatgtctg 23531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20891 - 20711
Alignment:
Q  171 agatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagatt 270  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  || | |||||||    
T  20891 agatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttcgagctgttgaaagatt 20792  T
Q  271 atgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||  ||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| || || |||||||| || ||||||||||    
T  20791 atgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacattacatatgtctg 20711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 47673 - 48023
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| |||||||| ||    
T  47673 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgatgattcatgaaaagaattatcc 47772  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || |||    
T  47773 tacccatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttaaagtgtttagtgatcataaaagt 47872  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  47873 ttgaaatatttatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 47972  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  47973 aagctaatgtggtcgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 48023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 56486 - 56836
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  56486 gtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctagacagttgaggattcatgaaaaaaattatcc 56585  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  56586 tacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgttcaatgatcaaaagagt 56685  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||  || |||| |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  56686 ctaaagtatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 56785  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || | ||||||  |||| |||||||    
T  56786 aagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaagaagacgctgcacatgtctg 56836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19016 - 18680
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  19016 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaattagtagcttatgcttctagacagttgaggattcatgaaaagaattatcc 18917  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || | ||||||| || ||||  || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  18916 tacggatgatttggaattggttgcagtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagt 18817  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| |||| |||||||||||||  || |  || ||||||||||    
T  18816 ttgaaatatttattcgatctgaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggttttaattaccatccgggta 18717  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    |||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||    
T  18716 aagctaatgtcgttgtagatgctttgagcaggaagac 18680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Original strand, 25472 - 25766
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | ||| |||||||||| || |  |||||||| || |||||||| || || | || ||||||||| ||||| || |    
T  25472 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcattagaagaattatccgactcatgatttggaattggccgcagttgtgtatgcattgaagatttggaggcact 25571  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25572 atctgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccacaatagtttgaagtaattgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttgga 25671  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
     |  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || ||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  25672 gtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaacgttgttgttgatgctttgagtagaaagacattgcatatgtctg 25766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 9447 - 9795
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  9447 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggagtgcttatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttcgagaaagttgaggattcatgagcggaattatcc 9546  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || |  ||||| || || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  9547 tacacatgatttggagttggctgcggtggcttttgtgttaaaaatttggagacattatttctacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagt 9646  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| | || |||| |||||||   || |  |||||||||||||    
T  9647 ctgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggattgtgattttagtttaaattatcatccgggta 9746  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  9747 aagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatttgtc 9795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 25172 - 25520
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| ||    
T  25172 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatacaggatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttgaggattcatgaacgaaattatcc 25271  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| |||| || || || || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  25272 tactcatgatctagaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagt 25371  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  25372 ttgaataatttatttgatcagaaagaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgattttgggttgaattatcatccaggta 25471  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25472 aagttaatgttgttgcagatgccctaagtaggaagacgttgcatatgtc 25520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 194343 - 194693
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  || |||||||| || |||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  194343 gtgatgcgtctaaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtagtagcttatgcttctaggcagttaagaattcatgaaaagaattatcc 194442  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||  |||||||||| |||    
T  194443 tacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagattttaagtattcggtgatcacaaaagt 194542  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  194543 ctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggaggtgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggta 194642  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| |||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  194643 aagccaatgtggttattgatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtctg 194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 150236 - 149887
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||  | ||||||||||| ||| ||||||  |||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||    
T  150236 gtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagtgtatgcttctaggcaattgagagttcatgaaaagaattatcc 150137  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || ||| | |||||||| |||    
T  150136 tacacatgatttggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattacttgtacggttcctgatttgaagtattttgggatcacaaaagt 150037  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  150036 ctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 149937  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||||    
T  149936 aagc-aatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgaatatgtctg 149887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 181535 - 181241
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| ||  |||| || || || | |  ||||||||| ||||||||||    
T  181535 gcttgtgcttcgaggcagttgaaagtacatgagaagaattatccgactcatgatttggaactggcggccgttgtatattcattgaagatttggagacatt 181436  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  181435 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagattttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaatgaagatggttgga 181336  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
     |  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  181335 gtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttggtgctgatgctttgagtagaaaaactttgcatatgtctg 181241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 645 - 295
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  645 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctgggcagttgaggattcatgaaaagaattagcc 546  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  ||| |||| |||||||| || || || ||||| || || || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | |    
T  545 tacacataatttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatttggagatattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaatt 446  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||| | |||||| | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  445 ttgaaatatttatttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 346  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||| | ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  345 aagctaatatggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctg 295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 48771 - 48421
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | || |||||||| ||  | ||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |     
T  48771 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatccaagatggtaaggtagtagtctatgcttctaggcagttgagaattcatgaaaagaattatcg 48672  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  48671 tacacatgatttggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagt 48572  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||| ||| | || |||||||| |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  48571 ctgagatatttgtttgatcaaaaagaattgaatatgagctagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 48472  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  48471 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctg 48421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 33078 - 32728
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||||| ||    
T  33078 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgatgattcatgaaaagaattatcc 32979  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||  ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  32978 tacacatgatttggagttggctgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggcattatctgtaccgttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagt 32879  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| | ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  32878 ctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 32779  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||||||| |  | || ||||| || |||||||||||||    
T  32778 aagctaatgtggttgcggatactctgagcaggaaaacgttgcatatgtctg 32728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 5728 - 6080
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||  |    
T  5728 gtgatgagtccaagttgggcttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaagtggtaggttatgcttctaaacagttgaggattcatgaaaagaattatgc 5827  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5828 tacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgtattgaaaatttggagacattatttgtacgactctagatttgaggtgtttagcgataacaagagt 5927  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| | || || ||||||||||  ||||  ||||| || ||||    
T  5928 ttgaaatatttatttgaccaaaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggta 6027  T
Q  301 aagctaatgt--tgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||||   ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  6028 aagctaatgtacggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctg 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 1994 - 2343
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | |||||| |||| ||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  1994 gtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaaaatggcaaggtggtatcttatgcttctacacagttaagaattcatgaaaagaattatcc 2093  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||     
T  2094 tacgcatgatttggagttggctgcagtagtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagc 2193  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||  || | ||||||||||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  2194 ttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgagacagaggagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggta 2293  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtct 350  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  2294 aagccaatgtagttgcagatgccttgcgtaggaaaacgttgcatatgtct 2343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8693 - 8378
Alignment:
Q  36 atgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaa-ttaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtcttt 134  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| |||||||| || |||||  |||||| ||| || || ||| |||| ||||||||| |||||||| || || || |||    
T  8693 atgcaagatggtaaggtcgtagcgtatgcttctaggcagttatgaattcttgaaaaaaaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggttttt 8594  T
Q  135 gtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaata 234  Q
    || ||||| || ||||| || |  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  8593 gttttgaaaatctggaggcactgtttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaaca 8494  T
Q  235 tgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaa 334  Q
    |||||||| | || ||||||||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||  |||||||| ||||| ||||| |||| ||| | ||||||    
T  8493 tgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgtcttgaataggaa 8394  T
Q  335 gactttgcatatgtct 350  Q
    ||| ||||||||||||    
T  8393 gacgttgcatatgtct 8378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 44415 - 44100
Alignment:
Q  36 atgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttg 135  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || || || ||||    
T  44415 atgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgaggatacatgagaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcggtggtgtttg 44316  T
Q  136 tattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatat 235  Q
    | || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  44315 ttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaattatttatttgatcagaaggaattgaacat 44216  T
Q  236 gaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaag 335  Q
    ||||||| |||| ||||| ||  |  | || |||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||  |||| || |||||||||    
T  44215 gaggcagagaagatggttagagcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagtaggaag 44116  T
Q  336 actttgcatatgtctg 351  Q
    || |||||||||||||    
T  44115 acattgcatatgtctg 44100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 80486 - 80821
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||    
T  80486 tgggcttaggaggtgttctgatgcaagatggaaaggtggtagcttatgcttctaggcagttaagagttcatgaaaagaattatcctactcacgatttgga 80585  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    |||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  80586 gttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtatgaaatatttattt 80685  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  80686 gaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttg 80785  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || ||||||||  | ||||||||||    
T  80786 ctgatgcgttgagcaggaagacactacatatgtctg 80821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3493
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||  |    
T  3843 gtgaagcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcatgatggcaaggtggtagcttatgcttctaggaagttgaggattcatgaaaagaattattc 3744  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  3743 tacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaatat 3644  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||| | || |||||||| |||||||||||||  || |  || ||||||||||    
T  3643 ctgagatatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggta 3544  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  3543 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 3493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1867 - 1617
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||    
T  1867 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttcgagacaattgagaattcatgagcggaattatcc 1768  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| ||||||||  | || || ||||| || || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  1767 tacgcatgatttggagttggctacggtggtttttgtgttaaaaatttggagacattatttatacggttccagatttgaggtgtttagtgatcactaaagt 1668  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtgg 251  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1667 ttgaaatatttatttgatcaaaatgaattaaatatgaggcaacgaaggtgg 1617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8295 - 8045
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||    
T  8295 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtacttatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttcgagacaattgagaattcatgagcggaattatcc 8196  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| ||||||||  | || || ||||| || || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  8195 tacgcatgatttggagttggctacggtggtttttgtgttaaaaatttggagacattatttatacggttccagatttgaggtgtttagtgatcactaaagt 8096  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtgg 251  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8095 ttgaaatatttatttgatcaaaatgaattaaatatgaggcaacgaaggtgg 8045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 50514 - 50864
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  50514 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 50613  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || |||    
T  50614 tacgcatgatttggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtattcagtgatcataaaagt 50713  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||| |||||||| | || || ||||||||||||||| |||| ||| | ||| || | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  50714 ttgaaatatctgtttgataaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgaactgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggta 50813  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||  ||||| || || ||||| || ||||| |||||||    
T  50814 aagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtctg 50864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 1493 - 1842
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  1493 gtgatgcgtccaagttgagcttaggcggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcatttgaggattcatgaaaagaattatcc 1592  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || ||     
T  1593 tacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacagttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagc 1692  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||| | || ||| | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  1693 ctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 1792  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtct 350  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  1793 aagcaaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcacatgtct 1842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Original strand, 2567 - 2864
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| |||||||    
T  2567 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagac 2666  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  2667 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 2766  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  2767 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 2864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 8332 - 8513
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8332 gtgatgcatccaagttgggtttaggtggtgtacttatgcaagatggtaaagtggtagcttatggttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 8431  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtg 182  Q
     | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8432 gacgcacgatttagagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 8513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 25008 - 24711
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| |||||||    
T  25008 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagac 24909  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  24908 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 24809  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  24808 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 24711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14522 - 14225
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| |||||||    
T  14522 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagac 14423  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  14422 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 14323  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  14322 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 14225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41872 - 41575
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| |||||||    
T  41872 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattgaagatttggagac 41773  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  41772 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 41673  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  41672 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 41575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 55554 - 55889
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||  | || ||||||| | ||    
T  55554 tgggcttaggaggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattctcgtacgcatgatctgga 55653  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    |||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||    
T  55654 gttggctgcagtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcataagagtatgaaatatttattt 55753  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||||||||  || |  || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  55754 gatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttcaattaccatcctggtaaagccaatgtggttg 55853  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  55854 cagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctg 55889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 32316 - 32652
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| ||||| | ||||| |||||||| ||    
T  32316 gtgatgcgtctaagctgggtctaggaggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagagtgcatgaaaagaattatcc 32415  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  || |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||     
T  32416 tactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagc 32515  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||  |  | || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  32516 ttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggta 32615  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  32616 aagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 32652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Original strand, 1416 - 1596
Alignment:
Q  2 tgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccct 101  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1416 tgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagatagttgagaattcatgagaagaattaccct 1515  T
Q  102 atgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtg 182  Q
    | ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1516 acgcacgatttagagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 1596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 6799 - 7134
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||    
T  6799 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgaggattcatgagaagaattatcctacgcacgatctgga 6898  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    |||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  6899 gttggctgcggtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagcttgaaatatttgttt 6998  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  6999 gatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttg 7098  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  7099 ctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctg 7134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10485 - 10286
Alignment:
Q  152 acattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtgg 251  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  10485 acattacttgtatggttcgagatttcaagtgttcagcgatcataaaagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagttgg 10386  T
Q  252 ttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
     | |||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10385 ctcgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttacatatgtctg 10286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1524 - 1202
Alignment:
Q  27 ggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctg 126  Q
    |||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |    
T  1524 ggtgtgttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagctgagagttcatgaaaagaattatcctacgcatgatttggagttggctgcgg 1425  T
Q  127 tagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaagga 226  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  1424 tggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatttgtttgaccagaaaga 1325  T
Q  227 attgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgcctta 326  Q
    |||||| ||||||||| | || ||  | || ||  ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  1324 attgaacatgaggcagaggagatgacttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttg 1225  T
Q  327 agtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||    
T  1224 agtagaaagacattgcacatgtc 1202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 612 - 954
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| || |||| |||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  612 gtgatgcgttcaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtgctagcgtatgcttctaggcagttgagggttcatgaaaagaattatcc 711  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| || |||    
T  712 tacacatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttaaagtatttagtgatcataaaagt 811  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || |||||||||||||  || |  || ||| ||| ||    
T  812 ttgaaatatttatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccattcggtta 911  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgca 343  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  912 aagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgca 954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 327 - 676
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||  | |||||| ||    
T  327 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgagagttcatggaaggaattatcc 426  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| || || |||    
T  427 tacacatgatttggagttggctgcagtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttatacggttccagatttgaagtatttagtgaccataaaagt 526  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||| | ||  || | ||||||||||||||||  ||||  || ||| ||||||    
T  527 ttaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggctagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccat-cgggta 625  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  626 aagcaaatgtggttgcagatgccataagtaggaagacgttgcatatgtctg 676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4779 - 4429
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||  ||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| ||    
T  4779 gtgatgcttccaagttaagcttaggtggtgagcttatgcaggatggcaagatagtagcttatgcatcgagacagttgaggattcatgaacgaaattatcc 4680  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | || || ||  | || ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  4679 tactcatgatcttgaattagctacagtggtctttgtgctcaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagtgatcataaaagt 4580  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||  ||| ||    
T  4579 ctgaattaattgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcaaagatggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcaaacggtta 4480  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4479 aagctaatgttgttgcggataccttaagtaggaagactttacatatgtctg 4429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20787 - 20437
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||  | || |||||||| ||| |||||||||||||||  || ||||| ||| ||||||| |||||||| ||    
T  20787 gtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgattcaagatggcaaagtggtagcttatgcttataggcagttaagagttcatgaaaagaattatcc 20688  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  20687 cactcatgatctggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcataagagt 20588  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| | || ||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  20587 ctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggta 20488  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  20487 aagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctg 20437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Original strand, 57976 - 58145
Alignment:
Q  147 tggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 246  Q
    |||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  57976 tggagacattatctgtatggttttagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggcagcgaa 58075  T
Q  247 ggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgc 316  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||| |  ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  58076 ggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgc 58145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 76031 - 75948
Alignment:
Q  195 aagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgatttt 278  Q
    ||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  76031 aagagtttgaagtacctatttgattagaacgaattgaacatcaggcagaggaggtggttggaatttcttaaagattatgatttt 75948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 4975 - 5325
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||| ||    
T  4975 gtgatgcgtctaagctgggcttaggaggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcagttaagagttcatgaaaagaattatcc 5074  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5075 tacacaagatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaagagt 5174  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| | || ||  | || ||| ||||||||||||||||||  |||   || ||||  ||||    
T  5175 ctaaagtatttatttgaccagaggtaattgaatatgaggcagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttggattaccatcttggta 5274  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||    
T  5275 aagccaatgtagttgcggatgcgttgaggaggaagaccttacatatgtctg 5325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 42584 - 42234
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  42584 gtgatgcgtccaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggaaaggtagtagcttatgcttctaggcagttgagagttcatgaaaagaattatcc 42485  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  42484 tacgcaggatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgatgtttttagtgatcataagagt 42385  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| |||||| ||||||| || || ||||||||| | || ||||| ||  || | || || ||||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  42384 cttaaatatttatttgattagaaggagtttaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccaggta 42285  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||    
T  42284 aagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctg 42234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 69011 - 68689
Alignment:
Q  27 ggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctg 126  Q
    |||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||| || |    
T  69011 ggtgtgttgatgcaagatggcaaggtggtagcttatgcttttaggcagctgagagttcatgagatgaattatcctacgcatgatttggagttggctgcgg 68912  T
Q  127 tagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaagga 226  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||    
T  68911 tggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcatgatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaattatttgtttgatcataaaga 68812  T
Q  227 attgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgcctta 326  Q
    |||||| ||||||||| | || ||| | || ||  ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  68811 attgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttg 68712  T
Q  327 agtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  68711 agtaggaagacattgcacatgtc 68689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 3592 - 3942
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  || |||||||| || |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||  || ||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  3592 gtgatgcgtctaaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcgtatgcttttaggcagttgagagttcatgaaaagaattatcc 3691  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||| || || ||||||||||| |||    
T  3692 tacgcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttgcagacttgaagtattcagtgatcacaaaagt 3791  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || || |||||||    
T  3792 ctaaaatatttatttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccacccgggta 3891  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  3892 aagctaatgtggttgcagatgccttgagtagcaagacgttgcatatgtctg 3942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 12547 - 12896
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||  | |||||||| || ||| ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  12547 gtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagacggcaaagtggtagcgtatacttctaggcagttgagagttcatgaaaagaattatcc 12646  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| |  || || || || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||     
T  12647 tactcatgatttggagttggctgtggtggttttcgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagc 12746  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||  |  | || |||||||||||||  ||||  || ||||  ||||    
T  12747 ttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggta 12846  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtct 350  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  12847 aagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtct 12896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35137 - 34792
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  35137 gtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtagtagcttatgcttctaggcagttgaggattcacgaaaagaattatcc 35038  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  35037 tactcatgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagt 34938  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  34937 ctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 34838  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatat 346  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||  |||||||    
T  34837 aagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacactgcatat 34792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28660 - 28539
Alignment:
Q  225 gaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgcct 324  Q
    |||||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  28660 gaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgt 28561  T
Q  325 taagtaggaagactttgcatat 346  Q
    | || ||||||||  |||||||    
T  28560 tgagcaggaagacactgcatat 28539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 349
Target Start/End: Original strand, 3172 - 3392
Alignment:
Q  129 gtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3172 gtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggattgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttatttgatcagaaggaat 3271  T
Q  229 tgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaag 328  Q
    |||||||||| ||||  || ||| | || ||||| ||||||||||| || |  ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  3272 tgaatatgagacagcttagatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgag 3371  T
Q  329 taggaagactttgcatatgtc 349  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  3372 caggaagacattgcatatgtc 3392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 351
Target Start/End: Original strand, 5891 - 6227
Alignment:
Q  15 ttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttag 114  Q
    |||||||| || |||||  | ||||||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||| |||    
T  5891 ttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtagtagcgtatgcttctagacagttgagaattaatgaaaagaattatcctacgcatgatctag 5990  T
Q  115 agttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtt 214  Q
    ||||||| || ||  | ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | || || ||||||||||| ||| | || ||||| ||    
T  5991 agttggctgcggtgatttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttaaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatt 6090  T
Q  215 tgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtt 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||    
T  6091 tgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggtt 6190  T
Q  315 gcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    || |||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  6191 gcagatgccttgagtaggaaaatgttgcatatgtctg 6227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 1
Alignment:
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggca 241  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  88 attacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaagatttgaatatgaggca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 115544 - 115892
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||   ||  | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||| ||    
T  115544 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggataacaaggtagtgacttatgcatcgagacagttgagaattcatgaacgaaattatcc 115643  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | || || || || || ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  115644 tactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgcttaagatttggagacattatttgtatggttatagatttgaagtgttcagtgatcataaaagt 115743  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| | |||||| | |||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  115744 ctgaagtatttttttgatcagaaggaattaaatatgagaccacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttggattgaattatcatccaggta 115843  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  115844 aggctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtc 115892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 35
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||| | ||    
T  298 tgggcttaggaggtgttttgattcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggtagttgaggattcatgagaagaattatcccactcatgatctgga 199  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    |||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  198 gttggcggcagtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaagtatttattt 99  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttg 279  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | || ||| | || ||| ||||||||||||||||||    
T  98 gaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 349
Target Start/End: Original strand, 15123 - 15469
Alignment:
Q  4 atgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  | |||| |||||  | |||||||||||| ||||||||    ||||| ||||     
T  15123 atgcgtccaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaggatggcaaggtagtaggttatggattgagacagttgaggattcatgaacgaaattatcctac 15222  T
Q  104 gcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaga-gttt 202  Q
     |||||| | || || || || || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| || | || |    
T  15223 tcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaaagtct 15322  T
Q  203 gaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaa 302  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||||  ||||  ||||||||  |||||    
T  15323 gaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccatgtaaa 15422  T
Q  303 gctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15423 gctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtc 15469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 11425 - 11775
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||| ||    
T  11425 gtgatgcgtctaagctgggcttaggaggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcagttaagagttcatgaaaagaattatcc 11524  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  || ||||| |||||||  || || || ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  11525 tactcacgatttggagttgggtgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggtattatttgtatggttcgagatttgaagtattcagtgatcacaagagt 11624  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||  |||    
T  11625 ctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagta 11724  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||  ||||||||||||    
T  11725 aagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctg 11775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28291 - 27977
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  28291 gtgatgcttccaagttgggcttaggtggtttttttatgcaagatggtaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 28192  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| || || || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  28191 tacacatgatttggattttgctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagt 28092  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  28091 ctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggta 27992  T
Q  301 aagctaatgttgttg 315  Q
    |||||||||| ||||    
T  27991 aagctaatgtggttg 27977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 351
Target Start/End: Original strand, 59888 - 60203
Alignment:
Q  36 atgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttg 135  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||| || || || ||||    
T  59888 atgcaggatggcaaagtagtagcttatgcttctaggcagttgagggtacatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttg 59987  T
Q  136 tattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatat 235  Q
    | ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  59988 ttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagcgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatat 60087  T
Q  236 gaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaag 335  Q
    ||||||| | || ||| | || ||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||  ||||||  ||||| | ||||||||| || |  ||||||    
T  60088 gaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaag 60187  T
Q  336 actttgcatatgtctg 351  Q
    || || ||||||||||    
T  60188 accttacatatgtctg 60203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 351
Target Start/End: Original strand, 50854 - 51169
Alignment:
Q  36 atgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttg 135  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||| || || || ||||    
T  50854 atgcaggatggcaaagtagtagcttatgcttctaggcagttgagggtacatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttg 50953  T
Q  136 tattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatat 235  Q
    | ||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  50954 ttttgaaaatatagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagcgatcacaagagtctaaaatatttatttgaccagaaggaattgaatat 51053  T
Q  236 gaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaag 335  Q
    ||||||| | || ||| | || ||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||  ||||||  ||||| | ||||||||| || |  ||||||    
T  51054 gaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaag 51153  T
Q  336 actttgcatatgtctg 351  Q
    || || ||||||||||    
T  51154 accttacatatgtctg 51169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 351
Target Start/End: Original strand, 66276 - 66591
Alignment:
Q  36 atgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttg 135  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||| || || || ||||    
T  66276 atgcaggatggcaaagtagtagcttatgcttctaggcagttgagggtacatgaaaagaattatcctacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttg 66375  T
Q  136 tattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatat 235  Q
    | ||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  66376 ttttgaaaatatagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagcgatcacaagagtctaaaatatttatttgaccagaaggaattgaatat 66475  T
Q  236 gaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaag 335  Q
    ||||||| | || ||| | || ||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||  ||||||  ||||| | ||||||||| || |  ||||||    
T  66476 gaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaag 66575  T
Q  336 actttgcatatgtctg 351  Q
    || || ||||||||||    
T  66576 accttacatatgtctg 66591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6880 - 6544
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||| ||    
T  6880 gtgatgcgtctaagctgggcttaggaggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcagttaagagtgcatgaaaagaattatcc 6781  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| ||||||||  | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6780 tacacatgatttggagttggctacggtggtgtttgttttgaaaatctggagccattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaagagt 6681  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||| | ||  |  ||||||||||||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  6680 ctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgaggttttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggta 6581  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||    
T  6580 aagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagac 6544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 10528 - 10864
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||| | ||    
T  10528 gtgatgcgtctaagctgggcttaggaggtgttctaatgcaagatggcaaggtggtagcatatgcttctaggcagttaagagtccatgaaaagaatgatcc 10627  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  ||||||||  ||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||     
T  10628 tacacatgatttgcagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtatggttctagattggaggtgttcagtgatcataaaagc 10727  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | || ||  ||||||||||||||||||  ||||  || ||||  ||||    
T  10728 ttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagcggagatggcttgagttcttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcttggta 10827  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10828 aagccaatgtggttgcggatgcgttaagcaggaagac 10864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19658 - 19367
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||||||||    
T  19658 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggagacatt 19559  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  19558 atctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaacagttgaatatgaggcaaagaagatggttgga 19459  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
    ||  || || || | ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  19458 atatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgcttttagtagaaagactttgcatatgt 19367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 12938 - 13285
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  12938 gtgatgcgtctaagttgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaagatggtagcttatgcttctaggcagttgagagttcatgaaaagaattatcc 13037  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| ||||||||  | || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  13038 tacgcatgatttggagttggcttcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagt 13137  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || || || |||||||  ||||  || ||||| | ||    
T  13138 ctaaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctgata 13237  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  13238 aagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgt 13285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28192 - 27841
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggta-gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattacc 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |    
T  28192 gtgatgcgtccaagttgggcttaggtggtgtattgatgcaagatggcaaggtggtaagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatc 28093  T
Q  100 ctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagag 199  Q
    |||  |||||||||| |||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  28092 ctacacatgatttagtgttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcaatatttgtacggctccagatttgaggtgtttagtgatcataaaag 27993  T
Q  200 tttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggt 299  Q
    |||||| ||| | ||||| || ||||||||||| ||||||||  |||  ||| | |||||| | || || ||||||||||  ||||  || |||||||||    
T  27992 tttgaaatatctatttgaccaaaaggaattgaacatgaggcaaagaatatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggt 27893  T
Q  300 aaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||    
T  27892 aaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgtttcacatgtctg 27841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 991 - 641
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||| ||    
T  991 gtgatgcgtctaagctgggtttaggaggtgttctgatgcaagatggcaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttaagagttcatgaaaagaattatcc 892  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  891 tacacatgatttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaagcgttcagtgatcacaagagt 792  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| | || ||  | || ||| ||||||||||||||||||  ||||  || || || ||||    
T  791 ctaaaatatttatttgaccagaaggaatggaatatgagacagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccaccctggta 692  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||    
T  691 aagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagaccttacatatgtctg 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 10696 - 11046
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| ||| ||  ||| |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  10696 gtgatgcgtccaagttgggctcaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtgtaagcatatgcttctaggcagttgagagttcatgaaaagaattatcc 10795  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || | ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| | |    
T  10796 tacacatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaattttgaggcattacttgtacggatccagatttgaagtatttagtgatcacaaaaat 10895  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    || || ||||| ||||||  ||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  || | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  10896 ttaaaatatttatttgattggaaagagttgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggta 10995  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  10996 aagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctg 11046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 14466 - 14816
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| ||| ||  ||| |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  14466 gtgatgcgtccaagttgggctcaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtgtaagcatatgcttctaggcagttgagagttcatgaaaagaattatcc 14565  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || | ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| | |    
T  14566 tacacatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaattttgaggcattacttgtacggatccagatttgaagtatttagtgatcacaaaaat 14665  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    || || ||||| ||||||  ||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  || | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  14666 ttaaaatatttatttgattggaaagagttgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggta 14765  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  14766 aagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctg 14816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21650 - 21372
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  21650 gtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttaagaattcatgaaaagaattatcc 21551  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  21550 tacacatgatttggagttggctgcggttgtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagt 21451  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttg 279  Q
     | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  || | ||||||||||||||||    
T  21450 ctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttg 21372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6788 - 6491
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| |  || || | || |||||| || |||||||    
T  6788 gtagcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggtcgttgtgtatgcattgaaaatttggagac 6689  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  6688 attatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 6589  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  6588 ggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagtctttgcatatgtctg 6491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 349
Target Start/End: Original strand, 13776 - 14068
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||  |||||| | ||||| || || || ||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  13776 gcttatgcatcgagacagttgagaattcatgaacgaaattatcctactcatgatcttgagttagctgcagtggtctttgtgcttaagatttggagacatt 13875  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| | ||    
T  13876 atttgtatggctctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattaaatttgagacaacgaaggtggcttga 13975  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||| | |||||||||| |||||  ||||  ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  13976 attgttgaaagattatggttttgggttgaattatcatcctagtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtc 14068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 1488 - 1823
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  ||||||||||||| || |||| ||||||| | ||    
T  1488 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgggttcatgagaagaactatcctacgcatgatctgga 1587  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    |||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  1588 gttggccgctgtggtgtttgttttaaaaatttggagacattatttgtacggatccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatctgttt 1687  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||  | || || || ||||| |||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  1688 gatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttatagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 1787  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  1788 ctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctg 1823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 250265 - 249930
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| | ||    
T  250265 tgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcagttgaggatacatgagaagaattatcctacgcatgatctgga 250166  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    |||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||    
T  250165 gttggctgcggtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggtttcagatttgaagtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttattt 250066  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  |||| || |||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  250065 gatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttg 249966  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | ||||| || || ||||| || || ||||||||||    
T  249965 ctgatgcgttgagcaggaaaacattacatatgtctg 249930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8876 - 8582
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| ||||| || | |  ||||| ||| | ||| ||||    
T  8876 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggctgctgttgtgtattcattgatgattttgaggcatt 8777  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    | ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||  ||||||||    
T  8776 atttgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccataagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaatatggttgga 8677  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || |||| ||||||| | ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8676 atatcttaaggattttgattttcagttgagttatcacccgaggaaggctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctg 8582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4416 - 4066
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  4416 gtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgtttctaggtagttgaggattcatgaaaagaattatcc 4317  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
     |  |||||||| ||||| || || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4316 aacacatgatttggagttagctgcggtggtttttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccaaatttgaagtgtttagtgatcacaaaagt 4217  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||| || ||| | || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  4216 ttgaactatttatttgatcagaaagaaatgaacatgaggcagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggta 4117  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || | |||| | |||||||||||||    
T  4116 aagccaatgtggttgcagatgcgttgagcatgaaggcgttgcatatgtctg 4066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 349
Target Start/End: Original strand, 11861 - 12183
Alignment:
Q  27 ggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctg 126  Q
    |||||||| |||||||||||  |  |||| |||||||| ||||||||  | |  |||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||||| || ||||    
T  11861 ggtgtgcttatgcaagatgggcatgtggtggcttatgcctcgagacaactaaagattcatgagaggaattacccgacacatgatttggagttagcagctg 11960  T
Q  127 tagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaagga 226  Q
    |||| |||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  11961 tagtgtttgtacttaaggtatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaagga 12060  T
Q  227 attgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgcctta 326  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||| || |||||||||||| | || |||||||  || || || ||||| || || ||||||||     
T  12061 gttgaatatgagacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaactaagttatcatctagggaaggccaatgtagtagctgatgccttg 12160  T
Q  327 agtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||| | ||||| |||||    
T  12161 agtaggaagtccttgcacatgtc 12183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 42746 - 43096
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||  ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    ||||| ||    
T  42746 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcagaatgataaagtagtagcttatgcatcgaggcagttgaggattcatgaacgtaattatcc 42845  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | ||||| || || ||||| |||||| |  | || ||||| |||||  |||  ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||    
T  42846 tactcatgatcttgagttagctgcagtagtttttgtacttcaaatttggaggcattatctgtgcggttctagatttgaagtgttcagtaatcataaaagt 42945  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||    
T  42946 ttgaagtatttattctaccagaaagaattaaacatgagacagcgaaggtggctagaattgctaaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggta 43045  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  43046 aagctaatgtcgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctg 43096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1076 - 779
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  |||||| || ||||| |    
T  1076 gtagcttatgcttcgaggcatttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggctgccgttgtgtattcattgaatatttggagtc 977  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  976 attatctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggtt 877  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | |||  || || || | ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  876 gaaatatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 17856 - 18202
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  || | ||||| ||  | ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||    ||||| ||    
T  17856 gtgatgcatccaagttgggcttaggtggtgtgct--tgtaggatggcaaggtagtagcatatgcatcgagagagttgaggattcatgaacgaaattatcc 17953  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | || || || || |||| ||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| |  ||||| || |||    
T  17954 tactcatgatcttgaattagctgcagtagactttgtgctaaagatatggagacattatttgtaaggttctagattaaaagtgttcaaagatcataaaagt 18053  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||| | || |||| ||||||||  ||||  |||||| | ||||    
T  18054 atgaagtatatgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaggattgtgattttgggttgaattatcattcaggta 18153  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18154 aagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtc 18202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 614 - 284
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || ||| |  | ||||||||||| || |||| ||||||| | ||    
T  614 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctaggcaattgcgggtacatgagaagaactatcctacgcatgatctgga 515  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    |||||  |  ||||| ||||| || || || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||    
T  514 gttggttgtagtagtgtttgttttaaaaatttggagagattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgttt 415  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| || || || || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  414 gatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 315  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatat 346  Q
    | ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  314 ctgatgcattgagcaggaaaacattgcatat 284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 35780 - 35430
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  35780 gtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtgatagcgtatgcttctagacagttgagagttcatgaaaagaattatcc 35681  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| ||||  ||||| || |||||||| | ||| || ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  35680 tacacatgatttggagtaagccgcggtggtctttgtttagaaaatttggaagcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagt 35581  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
     | || ||||| ||  ||||||| || ||||| |||| | || |||| ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
T  35580 ctaaaatattttttcaatcagaaagatttgaacatgaagtagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggta 35481  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||  ||||| |||||||    
T  35480 aagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagatgttgcacatgtctg 35430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 351
Target Start/End: Original strand, 16339 - 16553
Alignment:
Q  137 attgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 236  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16339 attgaagatttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaggcgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatg 16438  T
Q  237 aggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaaga 336  Q
    |||||  |||| ||||||||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  16439 aggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaaga 16538  T
Q  337 ctttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||    
T  16539 ctttgcatatgtctg 16553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 348
Target Start/End: Original strand, 25657 - 25868
Alignment:
Q  137 attgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 236  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25657 attgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatg 25756  T
Q  237 aggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaaga 336  Q
    |||||  |||| ||||||||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||  || || |||||||||||||| |||||  | ||||| ||||    
T  25757 aggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatctcgggaaggctaatgttgttgctgatgctctgagtagaaaga 25856  T
Q  337 ctttgcatatgt 348  Q
    ||||||||||||    
T  25857 ctttgcatatgt 25868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Original strand, 26961 - 27255
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||| | || ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||||||||| ||||| || |    
T  26961 gcttatgctccaaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatacattgaagatttggaggcaat 27060  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27061 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttgga 27160  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || || | ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  27161 atatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 27255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 20216 - 20457
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||  | |||||||| || ||| ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  20216 gtgacgcgtccaagttgggcttaggcggtgttttgatgcaagacggtaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgagagttcatgaaaagaattatcc 20315  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  | |||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||    
T  20316 tacacgtgatttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcaaaaaagt 20415  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcag 242  Q
     | || ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  20416 ctaaaatatttatttgatcataaggaattgaacatgaagcag 20457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 351
Target Start/End: Original strand, 177013 - 177251
Alignment:
Q  113 agagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttg 212  Q
    ||||||||| | ||| || ||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  177013 agagttggctgttgtggtttttctgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatattta 177112  T
Q  213 tttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttg 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||| | ||||| ||||| ||||  ||||  |||||||| ||||| |||||||| |    
T  177113 tttgatcagaagaaattgaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttgttgaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgtcg 177212  T
Q  313 ttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  177213 ttgcagaagctttaagcaggaagacgttacatatgtctg 177251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 25437 - 25143
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| || ||||||| | | ||||||||||||||  | |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||| ||||    
T  25437 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtacatgagaagaattattcgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 25338  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  | |||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||    
T  25337 atctttatggttcgaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttgga 25238  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || ||||  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  25237 atatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaagtgaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 25143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 351
Target Start/End: Original strand, 133264 - 133478
Alignment:
Q  137 attgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 236  Q
    ||||||||| ||||| || ||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  133264 attgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatg 133363  T
Q  237 aggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaaga 336  Q
    |||||  |||| ||||||||||  || || |||| ||||||| | ||||| || ||||  || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  133364 aggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttaacatctcgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaaga 133463  T
Q  337 ctttgcatatgtctg 351  Q
    |||||||||||||||    
T  133464 ctttgcatatgtctg 133478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 351
Target Start/End: Original strand, 15366 - 15702
Alignment:
Q  15 ttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttag 114  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||  ||||||| |||||||| || |||||| |  ||| |   |||||||| ||||  |||||  | |    
T  15366 ttgggcttaggtggtgttctgatgcaagattgtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagttgcgtgttctttttaagaattatcctacacatgacctgg 15465  T
Q  115 agttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtt 214  Q
    |||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||    
T  15466 agttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatt 15565  T
Q  215 tgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtt 314  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||| || |||||||||    
T  15566 tgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgtt 15665  T
Q  315 gcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    || ||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  15666 gctgatgctttgagcaggaagactttgcatatgtctg 15702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 100201 - 100551
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  100201 gtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 100300  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||||||  | ||     
T  100301 tacacatgatctggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcaatatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcattaaagc 100400  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||  |  | || || ||  ||||||  ||||  || ||||  ||||    
T  100401 ttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaatatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggactacaattttggtttgaattaccatcatggta 100500  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  100501 aagccaatgtggttgcagatgcattgagcaggaagacattgcatatgtctg 100551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 337
Target Start/End: Original strand, 6375 - 6660
Alignment:
Q  52 tggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggag 151  Q
    ||||||| |||||||| || ||| | ||| | ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||    
T  6375 tggtagcgtatgcttctaggcagctaagagtgcatgaaaagaattatcctactcacgatttagagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggag 6474  T
Q  152 acattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtgg 251  Q
     || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | || |||    
T  6475 gcactacttgtatggttctagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttatttgaacagaaggagttgaacatgagacagaggagatgg 6574  T
Q  252 ttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    |||||  |  | || |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  6575 ttggagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcggatgctttgagtaggaagac 6660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 349
Target Start/End: Original strand, 248 - 411
Alignment:
Q  186 agtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattga 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||  || || || | ||||||| | ||||    
T  248 agtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcataaggagttgaatatgaggcaaagaagatggttggaatatctcaaggactttgattttcagttga 347  T
Q  286 gctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  348 gttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtc 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 10096 - 10444
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  || |||||||| || |||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  10096 gtgatgcgtctaaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcttctagacaattaaggatacatgaaaagaattatcc 10195  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||  || ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| || |||    
T  10196 tacgcatgatttggagttggttgcggtgatttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagagttgaagtatttcgtgatcataaaagt 10295  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  10296 ttgaaatattaatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggta 10395  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  10396 aagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtc 10444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 20310 - 20658
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  || |||||||| || |||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  20310 gtgatgcgtctaaattgggcttgggtggtgttttgatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcttctagacaattaaggatacatgaaaagaattatcc 20409  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||||| |||||||  || ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| || |||    
T  20410 tacgcatgatttggagttggttgcggtgatttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagagttgaagtatttcgtgatcataaaagt 20509  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||| ||||    
T  20510 ttgaaatattaatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggta 20609  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  20610 aagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtc 20658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 31958 - 32308
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||    
T  31958 gtgatgcgtctaagctgggtttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcatatgcttctatgcagttgaggatacatgagaagaattatcc 32057  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    || ||||||| | |||||||| | ||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||     
T  32058 tacgcatgatctggagttggctgttgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagc 32157  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||  |||| || |||||||||||||  ||||  || ||||  ||||    
T  32158 ttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggtagagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggta 32257  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || || || || || ||||||||||    
T  32258 aagccaatgtggttgctgatgcgttgagcagcaaaacattacatatgtctg 32308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 72799 - 72506
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| || ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || || |||||| ||||| ||||    
T  72799 gcttatgcttcaaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggccgttgtgtatgcat-gaagatttggaggcatt 72701  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  72700 atctgtatggttctaagttttaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttgga 72601  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || || || | ||||||| | ||||  ||||| || || || |||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  72600 atatcttaaggactttgattttcagttgatttatcaccccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 72506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Original strand, 32108 - 32402
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||| || |  |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| ||||  ||||    
T  32108 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcttgagaagaactatctgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaagatttggaagcatt 32207  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32208 atctgtatggttctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagaatttgaagtacttgtttaatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaaggtggttgga 32307  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||  || ||  |||  |||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  32308 atatcttaagcatttcgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 32402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16015 - 15748
Alignment:
Q  84 catgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgt 183  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || ||   || ||||||||| ||||| |||||| |||||||||  |  ||||| ||||    
T  16015 catgagaagaattatccaactcatgatttggaattggcggccgttgtgaatgcattgaagatttggaggcattacatgtatggttttaagtttgaagtgt 15916  T
Q  184 ttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaatt 283  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||| ||||||||||  || || |||| ||||||| | ||    
T  15915 tcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaatagttgaatatgaggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagtt 15816  T
Q  284 gagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||| |||||||  || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  15815 gagttatcatcttgggaaggctaatgtcgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 15748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 25546 - 25279
Alignment:
Q  84 catgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgt 183  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || ||   || ||||||||| ||||| |||||| |||||||||  |  ||||| ||||    
T  25546 catgagaagaattatccaactcatgatttggaattggcggccgttgtgaatgcattgaagatttggaggcattacatgtatggttttaagtttgaagtgt 25447  T
Q  184 ttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaatt 283  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||| ||||||||||  || || |||| ||||||| | ||    
T  25446 tcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaatagttgaatatgaggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagtt 25347  T
Q  284 gagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||| |||||||  || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  25346 gagttatcatcttgggaaggctaatgtcgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctg 25279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6742 - 6584
Alignment:
Q  137 attgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 236  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  6742 attgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgatttgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatg 6643  T
Q  237 aggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatcc 295  Q
     ||||  |||| |||||| |||  || |  |||| ||||||| | ||||| ||||||||    
T  6642 cggcaaagaagatggttgaaatatcttatggattttgattttcagttgagttatcatcc 6584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 661 - 318
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  661 gtgatgcgtctaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcgtatgcttctaggcagttgagttttcatgaaaagaattatcc 562  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||||| ||||| ||  | || || ||| | ||       ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  561 tacacatgatttggagttagctacggtggtttttttctt-------tggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagt 469  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || ||||||||||||   ||||  || ||||| ||||    
T  468 ttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgatttttgtttgaattaccatccaggta 369  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  368 aagccaatgtggtagcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctg 318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 161 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 39886 - 39698
Alignment:
Q  161 gtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattg 260  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||    
T  39886 gtatggttcaaggtttgaggtgtttaacgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattg 39787  T
Q  261 ctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
     | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  39786 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgctttgagcagtaagacattgcatatgtc 39698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10878 - 10611
Alignment:
Q  84 catgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgt 183  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||| |  ||||||||||    
T  10878 catgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcggcagttgtgtatgcattgaggatttggaggcataatttgtatggttctaagtttgaggtgt 10779  T
Q  184 ttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaatt 283  Q
    | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||  || || |||| ||||||| | ||    
T  10778 tcagtgaccaaaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcatagaagatggttggaatatcttaatgattttgattttcagtt 10679  T
Q  284 gagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||| ||||| ||  | || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10678 gagttatcaccctaggaaggctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctg 10611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 247
Target Start/End: Original strand, 5997 - 6233
Alignment:
Q  10 tcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatga 109  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||    
T  5997 tcaagttgcgcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcctacagatga 6096  T
Q  110 tttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtat 209  Q
    ||| |||||||| |  || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  6097 tttggagttggctgtggtggtttttgttttgaaaatgtggaggcattattta-acggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatat 6195  T
Q  210 ttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaag 247  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6196 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgaag 6233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 247
Target Start/End: Original strand, 10428 - 10664
Alignment:
Q  10 tcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatga 109  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||    
T  10428 tcaagttgcgcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaggtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcctacagatga 10527  T
Q  110 tttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtat 209  Q
    ||| |||||||| |  || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  10528 tttggagttggctgtggtggtttttgttttgaaaatgtggaggcattattta-acggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatat 10626  T
Q  210 ttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaag 247  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10627 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgaag 10664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 351
Target Start/End: Original strand, 6264 - 6319
Alignment:
Q  296 gggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  6264 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctg 6319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 351
Target Start/End: Original strand, 10695 - 10750
Alignment:
Q  296 gggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  10695 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctg 10750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 345
Target Start/End: Original strand, 13509 - 13797
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||||||| || |||| | | | |||||||||||| || |  |||||||| || |||||||  || || | || ||||||||| ||||| ||||    
T  13509 gcttatgcttcgaggcaattgaaagtgcgtgagaagaattaaccgactcatgatttggaattggccggcgttgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 13608  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||   |||| ||||||||    
T  13609 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgttttatcaaaaagagttgaatatggggccaagaagatggttgga 13708  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcata 345  Q
    ||  || || |||| ||||||| | | ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13709 atatcttaaggattttgattttcagtggagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttaagtagaaagactttgcata 13797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 351
Target Start/End: Original strand, 2727 - 2941
Alignment:
Q  137 attgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 236  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2727 attgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttaagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatg 2826  T
Q  237 aggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaaga 336  Q
    |||||  ||||||||||||| |  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| |  || ||||||||  |||  ||||| || ||||| ||||    
T  2827 aggcaaagaaggtggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgcgaaggctaatgtatttgttgatgctttgagtagaaaga 2926  T
Q  337 ctttgcatatgtctg 351  Q
    |||| ||||||||||    
T  2927 ctttacatatgtctg 2941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20501 - 20180
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| ||||  | ||||| |||||||| ||||  || |||||  |    
T  20501 tgggtttaggaggtgttttgatgcaggatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagggtacatgaaaagaattatcctactcacgatttgaa 20402  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    |||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  20401 gttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcactacttgtatggttctagattcgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttattt 20302  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||||||| | || || ||||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| |||     
T  20301 gatcagaagcagttaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagtta 20202  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    | ||||| || || ||||||||    
T  20201 cagatgctttgagcaggaagac 20180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24663 - 24342
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| ||||  | ||||| |||||||| ||||  || |||||  |    
T  24663 tgggtttaggaggtgttttgatgcaggatggtaaggtggtagcgtatgcttctaggcagctgagggtacatgaaaagaattatcctactcacgatttgaa 24564  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    |||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  24563 gttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcactacttgtatggttctagattcgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttattt 24464  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    ||||||||| | || || ||||||||| | || ||||| ||  || | || |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| |||     
T  24463 gatcagaagcagttaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagtta 24364  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    | ||||| || || ||||||||    
T  24363 cagatgctttgagcaggaagac 24342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4155 - 3864
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || |  |||||||| || |||||| | || || | || ||||||||| ||||| ||||    
T  4155 gcttaggcttcgaggcaattgaaaatgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcctccgttgtgtatgcattgaagatttggaggcatt 4056  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  4055 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcatttaccacaagagtttgaagtatttgttttatcaaaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttgga 3956  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
    ||  || || |||| ||||||| | ||||| |||| ||| || || ||||||||||||   ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  3955 atatcttaaggattttgattttcagttgagttatcttcccgggaaggctaatgttgttattgatgctttgagtagaaagactttgcatatgt 3864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 341
Target Start/End: Original strand, 1772 - 1898
Alignment:
Q  215 tgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtt 314  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||| | |  || || |||| ||||||| | || || |||||||| || || |||||| |||||    
T  1772 tgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaaggtggttgaagtaacttaaggattttgattttcagttaagttatcatcccgggaaggctaatattgtt 1871  T
Q  315 gcggatgccttaagtaggaagactttg 341  Q
    || ||||| || |||||||||||||||    
T  1872 gctgatgctttgagtaggaagactttg 1898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 193
Target Start/End: Original strand, 1639 - 1777
Alignment:
Q  55 tagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagaca 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||| || |  |||||||| || ||||  || || || | || ||||||||| ||||| ||    
T  1639 tagcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcacgagaagaattatccgaatcatgatttggaattggtggcagttgtgtatgcattgaagatttggaggca 1738  T
Q  155 ttacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatca 193  Q
    |||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||    
T  1739 ttatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgatca 1777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 351
Target Start/End: Original strand, 7612 - 7879
Alignment:
Q  84 catgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgt 183  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | |  ||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |  ||||||||||    
T  7612 catgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagccgttgtgtatacattaaagatatgaagacattaactgtatggttctaagtttgaggtgt 7711  T
Q  184 ttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaatt 283  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| |||||||| |  || || |||| ||||||| | ||    
T  7712 tcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaagcagagaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagtt 7811  T
Q  284 gagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    ||| |||||||| |  || |||||||||||||| ||||| || ||||  |||| ||||||||||||||    
T  7812 gagttatcatcccgagaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtacaaagattttgcatatgtctg 7879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 611 - 343
Alignment:
Q  54 gtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagac 153  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||    ||||||||||  |||||| | |||||||| ||  | || |||||  | ||||| ||||| |    
T  611 gtagcttatgcatcgaggaagttgaggatccatgaacgtaattaccctactcatgatcttgagttggcagcaatggtttttgtgcttaagatttggaggc 512  T
Q  154 attacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggtt 253  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  511 attatctgtattgttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgactagaaagaattaaatatgaggcagcgaaggtggct 412  T
Q  254 ggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgc 322  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |  ||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  411 ggaattgccaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttgttgcagatgc 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 3593 - 3474
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3593 gtgatgcgtccaagctgggtttaggtggtgtgcttatgcaagatggtaaagtagtagcttatgcttcgagacaattgagaattcatgagaagaattaccc 3494  T
Q  101 tatgcatgatttagagttgg 120  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  3493 tacgcacgatttagagttgg 3474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 85158 - 85508
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||   ||| |  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    ||||| ||    
T  85158 gtgatgcgtctaagttgggtttaggtggtgtgcttatgcaggataataaagtaatagcttatgcatcgaggcagttgaggattcatgaacgtaattatcc 85257  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagt 200  Q
    ||  |||||| | ||||| ||  | ||||| |||||| | || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||| || ||||| || |||    
T  85258 tactcatgatcttgagttagctacagtagtttttgtacttaaaatttggaggcattatctgtatggttctagatttgaattgttcagcgatcataaaagt 85357  T
Q  201 ttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggta 300  Q
    || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||   ||| ||||||||||| |  ||||  || ||||||||||    
T  85358 tttaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggcaacgaaggtggcttgaattaaaaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggta 85457  T
Q  301 aagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    |  |||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  85458 agactaatgttattgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctg 85508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 92925 - 92827
Alignment:
Q  160 tgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaat 258  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  92925 tgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtttgaat 92827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28585 - 28250
Alignment:
Q  16 tgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttaga 115  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||  ||  | ||||| |||||||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||  | ||    
T  28585 tgggcttaggtggtgttctgatgcaagatgataaggtagtagcatatgcttctaggcaattgcgtgttcatgagaagaattatcctacacatgacctgga 28486  T
Q  116 gttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttt 215  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  28485 gttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaattatttattt 28386  T
Q  216 gatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttg 315  Q
    || ||||||||| | || ||||||||| |||| ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || ||||  ||||| || ||||| ||||    
T  28385 gaccagaaggaacttaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaggccaatgtggttg 28286  T
Q  316 cggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
      ||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  28285 ttgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctg 28250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 349
Target Start/End: Original strand, 9859 - 10003
Alignment:
Q  205 agtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||| |||    
T  9859 agtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtatagc 9958  T
Q  305 taatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  9959 caatgttgttgcagatgaattaagtaggaaaactctacatatgtc 10003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 9672 - 9850
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttc-gagacagttgagaattcatgagaagaattacc 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||| |||   ||  | || |||||||| || |||||||||||||||||| ||    ||||| |    
T  9672 gtgatgcgtccaagttgggcttagatggtgtgcttatgcacgataacaaggtagtggcttatgcatctgagacagttgagaattcaggaacgaaattatc 9771  T
Q  100 ctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttga 178  Q
    |||  |||||| | || || || || || ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9772 ctactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtaattaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttga 9850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 295
Target Start/End: Original strand, 11405 - 11643
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || |||||||| || || | |  ||||||||| | ||| ||||    
T  11405 gcttatgcttcaagacagatgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggccgccgttgtgtatacattgaagatttagaggcatt 11504  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttgga 256  Q
    |  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||    
T  11505 atctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgagcaaaagagtttgaagtatttatttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttgga 11604  T
Q  257 attgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatcc 295  Q
    ||  || || || | ||||||| | ||||| ||||||||    
T  11605 atatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcc 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3118 - 2905
Alignment:
Q  138 ttgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatga 237  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||  ||||||| ||||    
T  3118 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttaaaatatttatttgatcagaaataattgaacatga 3019  T
Q  238 ggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 337  Q
    ||||| |||| ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  || |||| ||||||||| ||| | ||||| |||||  | || |||||||     
T  3018 ggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagccaatatggttgcagatgcgctgagcaggaagat 2919  T
Q  338 tttgcatatgtctg 351  Q
     |||||||||||||    
T  2918 gttgcatatgtctg 2905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 13978 - 14155
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  13978 gtgatgcgtcgaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaaccggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcaagaaaagaattatcc 14077  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttga 178  Q
    ||  ||||||||||||||  | || || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14078 tacacatgatttagagttaactgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttga 14155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 22157 - 22334
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  22157 gtgatgcgtcgaagttgggcttaggtggtgttttgatgcaagatggtaaaccggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcaagaaaagaattatcc 22256  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttga 178  Q
    ||  ||||||||||||||  | || || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22257 tacacatgatttagagttaactgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttga 22334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 492572 - 492389
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| ||    
T  492572 gtgatgcgttgaagttgggcttaggtggtgtgcttatgcaagatggcaaggtagtagcttatgcatcgagacagttgaggattcatgaacgaaattatcc 492473  T
Q  101 tatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtt 184  Q
    ||  |||||| | || || || || || ||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  492472 tactcatgatcttgaattagctgcagtggtctttgtgctcaagatatgaagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtt 492389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 351
Target Start/End: Original strand, 89311 - 89434
Alignment:
Q  228 ttgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaa 327  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  89311 ttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttga 89410  T
Q  328 gtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | |||||||| |||||||||||||    
T  89411 gcaggaagacgttgcatatgtctg 89434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 351
Target Start/End: Original strand, 89989 - 90112
Alignment:
Q  228 ttgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaa 327  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| | || ||| | || |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  89989 ttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttga 90088  T
Q  328 gtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | |||||||| |||||||||||||    
T  90089 gcaggaagacgttgcatatgtctg 90112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 349
Target Start/End: Original strand, 2148 - 2317
Alignment:
Q  180 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttg 279  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||  || | || ||||||||||||     
T  2148 gtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgatttta 2247  T
Q  280 aattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
      |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||    
T  2248 gtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcattgcatatgtc 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Original strand, 1497 - 1678
Alignment:
Q  57 gcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccctatgcatgatttagagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatggagacatt 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || || || | || ||||||||| | ||||||||    
T  1497 gcttatgcttcgaggcagttgaaagtgcatgagaagaattatccgactcatgatttggaattggcagcagttgtgtatgcattgaagattttgagacatt 1596  T
Q  157 acttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgag 238  Q
    | ||||||||||| |  |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  1597 atttgtatggttctaagtttgaaatgttcagtgaccacaagagtttaaagtacttgtttgataagaaatagttgaatatgag 1678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 45803 - 45662
Alignment:
Q  210 ttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatg 309  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||  || || |||| ||||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  45803 ttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggttggaataccttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaagcgaatg 45704  T
Q  310 ttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    || |||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  45703 tttttgctgatgctttgagtaaaaagactttgcatatgtctg 45662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 96622 - 96481
Alignment:
Q  210 ttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | ||  || ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||| ||||||||||    
T  96622 ttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatg 96523  T
Q  310 ttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    | || || ||||| || || ||||||||  ||||||||||||    
T  96522 tagtcgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctg 96481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 351
Target Start/End: Original strand, 4311 - 4441
Alignment:
Q  221 gaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggat 320  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||| | || ||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  4311 gaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggat 4410  T
Q  321 gccttaagtaggaagactttgcatatgtctg 351  Q
    || || || |||||||| || ||||||||||    
T  4411 gcgttgagcaggaagaccttacatatgtctg 4441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 353
Target Start/End: Original strand, 8897 - 9058
Alignment:
Q  192 cacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatc 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||   |||||||||||||| || || || ||| ||||| | || || ||||    
T  8897 cacaagagtttgaagtacttgttcgatcaaaaggcgttgaatatgaggcagatgaggtggttggaatttcttaaggactataattttcagtttagttatc 8996  T
Q  292 atccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgat 353  Q
    |||  || ||||| || || || |||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8997 atctaggaaaagcgaaagtggtggcggatgtgttgagtaggaagtctttgcatatgtctgat 9058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26378 - 26293
Alignment:
Q  264 aaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26378 aaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 26293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 95 - 7
Alignment:
Q  159 ttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaag 247  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  95 ttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaag 7  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 205 - 94
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| ||| ||    
T  205 gtgatgcgtccaagttgggtttaggtggtgttttgatgcaagatggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagagttatcc 106  T
Q  101 tatgcatgattt 112  Q
    ||  ||||||||    
T  105 tacacatgattt 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 348
Target Start/End: Original strand, 24699 - 24862
Alignment:
Q  185 tagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattg 284  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| || |||| ||||| || ||| | || |||||||||||||  |||    
T  24699 tagtgatcataaaagtttaaaatatttatttcatctgaaggaattgaacatgaggtagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttg 24798  T
Q  285 agctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgt 348  Q
    |  || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  24799 aattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcagaaagacgttgcatatgt 24862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 255 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24880 - 24786
Alignment:
Q  255 gaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  24880 gaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaagactctacatatgtc 24786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34753 - 34675
Alignment:
Q  129 gtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagt 207  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||    
T  34753 gtctttgtgctgaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtctgaagt 34675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 194913 - 194796
Alignment:
Q  1 gtgatgcgttcaagttgggcttaggaggtgtgctcatgcaagatggaaaattggtagcttatgcttcgagacagttgagaattcatgagaagaattaccc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  194913 gtgatgcgtctaagttgggcttcggtggtgttttgatgcaagagggcaaagtggtagcttatgcttctaggcagttgaggattcatgaaaagaattatcc 194814  T
Q  101 tatgcatgatttagagtt 118  Q
    ||  |||||||| |||||    
T  194813 tacacatgatttggagtt 194796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15589 - 15479
Alignment:
Q  137 attgaagatatggagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 236  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||     
T  15589 attgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaaatatttatttgattagaaagagttgaatatt 15490  T
Q  237 aggcagcgaag 247  Q
    |||||| ||||    
T  15489 aggcagagaag 15479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15467 - 15390
Alignment:
Q  267 gattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcat 344  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  15467 gattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcat 15390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 288 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5411 - 5350
Alignment:
Q  288 tatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5411 tatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttacatatgtc 5350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 349
Target Start/End: Original strand, 64 - 220
Alignment:
Q  193 acaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatca 292  Q
    |||| |||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||| | || ||  ||||||||||||||||||  ||||  || ||    
T  64 acaaaagtttgagatatctgtttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaaatacca 163  T
Q  293 tccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtc 349  Q
    ||| | ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  164 tccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtc 220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8573 - 8490
Alignment:
Q  267 gattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtct 350  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  8573 gattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtatgaagactttgcatatgtct 8490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University