View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8395_high_2 (Length: 949)

Name: NF8395_high_2
Description: NF8395
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8395_high_2
NF8395_high_2
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (1-229)||(14422702-14422931)
chr8 (1-232)||(18594533-18594765)
chr8 (1-230)||(39206584-39206814)
chr8 (1-230)||(10836734-10836964)
chr8 (1-229)||(29938060-29938289)
chr8 (1-212)||(144411-144622)
chr8 (1-226)||(13110406-13110632)
chr8 (1-230)||(24113145-24113375)
chr8 (1-230)||(39218775-39219005)
chr8 (1-228)||(34842344-34842572)
chr8 (1-231)||(4035844-4036075)
chr8 (1-231)||(6144252-6144483)
chr8 (1-230)||(22260609-22260839)
chr8 (1-229)||(33278399-33278628)
chr8 (1-224)||(2042503-2042727)
chr8 (1-212)||(7774781-7774991)
chr8 (1-227)||(7791412-7791639)
chr8 (1-229)||(35118010-35118239)
chr8 (1-225)||(41575516-41575741)
chr8 (1-212)||(34679436-34679647)
chr8 (1-212)||(34998875-34999086)
chr8 (1-212)||(44804923-44805134)
chr8 (1-230)||(7811993-7812223)
chr8 (5-229)||(5320563-5320788)
chr8 (1-231)||(36491154-36491385)
chr8 (1-211)||(38167135-38167344)
chr8 (1-230)||(33287016-33287234)
chr8 (1-224)||(42571598-42571819)
chr8 (73-231)||(40117903-40118062)
chr8 (1-226)||(8021721-8021939)
chr8 (1-212)||(28639295-28639508)
chr8 (23-212)||(66180-66370)
chr8 (90-231)||(26783801-26783943)
chr8 (1-150)||(9807339-9807486)
chr8 (78-231)||(2322068-2322222)
chr8 (101-204)||(5005191-5005294)
chr8 (78-212)||(39220273-39220407)
chr8 (142-212)||(9806890-9806960)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (1-229)||(26704318-26704547)
chr6 (1-229)||(30691850-30692079)
chr6 (1-230)||(6086578-6086808)
chr6 (1-230)||(21893453-21893683)
chr6 (1-230)||(2837543-2837773)
chr6 (1-229)||(26946855-26947084)
chr6 (1-231)||(3347502-3347733)
chr6 (1-227)||(3955748-3955972)
chr6 (1-212)||(34887271-34887482)
chr6 (1-229)||(9459562-9459791)
chr6 (1-231)||(18613535-18613766)
chr6 (1-230)||(11167238-11167468)
chr6 (1-226)||(17261052-17261278)
chr6 (1-229)||(20726790-20727015)
chr6 (1-212)||(1153610-1153821)
chr6 (1-230)||(16306987-16307217)
chr6 (1-159)||(33464399-33464557)
chr6 (1-212)||(28199488-28199699)
chr6 (1-212)||(30698908-30699119)
chr6 (1-230)||(35198282-35198512)
chr6 (809-932)||(26259234-26259357)
chr6 (66-230)||(52834-52999)
chr6 (1-136)||(53001-53136)
chr6 (230-314)||(26259853-26259937)
chr6 (535-640)||(26259524-26259623)
chr6 (681-750)||(26259406-26259475)
chr6 (151-231)||(33463698-33463779)
chr6 (404-464)||(26259701-26259761)
chr6 (230-293)||(26590155-26590218)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (1-231)||(12101147-12101378)
chr7 (1-229)||(33359059-33359288)
chr7 (1-231)||(42964965-42965196)
chr7 (1-230)||(24792301-24792531)
chr7 (6-231)||(30180998-30181224)
chr7 (1-231)||(43067942-43068173)
chr7 (1-229)||(22649663-22649892)
chr7 (1-231)||(42204150-42204382)
chr7 (1-231)||(5280856-5281086)
chr7 (2-228)||(20346487-20346714)
chr7 (1-229)||(25748485-25748714)
chr7 (1-212)||(933301-933512)
chr7 (1-227)||(7164184-7164411)
chr7 (1-212)||(38866560-38866771)
chr7 (1-228)||(8630665-8630893)
chr7 (1-212)||(1803042-1803253)
chr7 (1-231)||(15655908-15656139)
chr7 (24-231)||(3511319-3511527)
chr7 (1-231)||(6394747-6394978)
chr7 (1-207)||(12097559-12097765)
chr7 (1-212)||(42673481-42673688)
chr7 (1-225)||(4477290-4477515)
chr7 (11-231)||(36890809-36891029)
chr7 (1-212)||(9452606-9452817)
chr7 (1-230)||(32041539-32041769)
chr7 (1-230)||(33846498-33846723)
chr7 (1-231)||(4347269-4347499)
chr7 (1-212)||(43156729-43156939)
chr7 (1-212)||(46134273-46134484)
chr7 (2-191)||(16894477-16894666)
chr7 (1-172)||(48865689-48865858)
chr7 (1-212)||(17753616-17753827)
chr7 (1-226)||(46891308-46891535)
chr7 (1-231)||(43021549-43021776)
chr7 (83-231)||(19828266-19828415)
chr7 (78-231)||(37005857-37006011)
chr7 (133-212)||(37704996-37705075)
chr7 (78-212)||(43405036-43405170)
chr7 (134-216)||(27691428-27691510)
chr7 (85-204)||(36849590-36849709)
chr7 (78-231)||(15655458-15655612)
chr7 (78-229)||(30075277-30075426)
chr7 (94-161)||(20163886-20163953)
chr7 (230-267)||(22851551-22851588)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (1-231)||(42307870-42308101)
chr3 (1-230)||(37698108-37698338)
chr3 (1-229)||(25999382-25999611)
chr3 (1-231)||(8042599-8042830)
chr3 (1-230)||(46452127-46452357)
chr3 (1-231)||(15520107-15520338)
chr3 (1-212)||(21581054-21581265)
chr3 (1-231)||(12117623-12117854)
chr3 (1-230)||(15520629-15520859)
chr3 (1-230)||(22174955-22175185)
chr3 (5-230)||(29445481-29445707)
chr3 (1-230)||(50528922-50529152)
chr3 (1-229)||(25494250-25494479)
chr3 (1-227)||(38856089-38856316)
chr3 (1-230)||(54870139-54870369)
chr3 (27-231)||(32244112-32244317)
chr3 (1-231)||(20842313-20842544)
chr3 (1-212)||(2895197-2895412)
chr3 (1-228)||(20699144-20699372)
chr3 (1-230)||(24835664-24835894)
chr3 (1-230)||(38933939-38934168)
chr3 (11-231)||(32359251-32359472)
chr3 (1-212)||(44609298-44609509)
chr3 (1-203)||(44688782-44688983)
chr3 (1-230)||(54534293-54534521)
chr3 (1-212)||(42104936-42105147)
chr3 (1-230)||(34700334-34700564)
chr3 (1-211)||(35226460-35226669)
chr3 (1-229)||(26122808-26123037)
chr3 (1-212)||(48924968-48925177)
chr3 (1-212)||(53028237-53028440)
chr3 (1-191)||(16354379-16354569)
chr3 (73-228)||(35643212-35643368)
chr3 (6-201)||(12915930-12916124)
chr3 (90-212)||(50529827-50529949)
chr3 (1-110)||(24366143-24366252)
chr3 (1-103)||(13696914-13697016)
chr3 (96-231)||(49128041-49128177)
chr3 (1-69)||(50528847-50528915)
chr3 (233-287)||(30600446-30600500)
chr3 (175-212)||(24366104-24366141)
chr3 (248-282)||(27456363-27456397)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (1-231)||(33491175-33491406)
chr5 (1-230)||(27679148-27679378)
chr5 (1-232)||(4120934-4121166)
chr5 (1-231)||(9008036-9008267)
chr5 (1-230)||(1579035-1579265)
chr5 (1-230)||(1605550-1605780)
chr5 (1-231)||(24105650-24105881)
chr5 (1-212)||(16069371-16069582)
chr5 (1-212)||(16737426-16737637)
chr5 (1-231)||(19358524-19358755)
chr5 (1-229)||(5202972-5203200)
chr5 (1-231)||(27420856-27421087)
chr5 (1-212)||(31883162-31883373)
chr5 (1-230)||(8374318-8374547)
chr5 (1-212)||(3386465-3386676)
chr5 (1-231)||(3921579-3921810)
chr5 (1-231)||(20992125-20992356)
chr5 (2-231)||(35782624-35782854)
chr5 (1-212)||(1165580-1165791)
chr5 (1-212)||(33991158-33991369)
chr5 (1-230)||(38598429-38598659)
chr5 (1-229)||(31410476-31410705)
chr5 (1-185)||(27025001-27025185)
chr5 (1-191)||(26602921-26603111)
chr5 (95-231)||(20992354-20992495)
chr5 (89-212)||(33284642-33284765)
chr5 (1-80)||(35420403-35420482)
chr5 (94-201)||(31638174-31638281)
chr5 (78-230)||(25634581-25634732)
chr5 (111-163)||(41818552-41818604)
chr5 (230-269)||(10585693-10585732)
chr5 (29-60)||(27024822-27024853)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (1-231)||(54189540-54189771)
chr4 (1-230)||(15240995-15241225)
chr4 (5-230)||(53717435-53717661)
chr4 (1-213)||(31969695-31969907)
chr4 (1-228)||(40428687-40428915)
chr4 (1-231)||(20877042-20877273)
chr4 (1-231)||(45424501-45424732)
chr4 (1-229)||(19913597-19913826)
chr4 (1-229)||(38055154-38055383)
chr4 (1-232)||(44784884-44785116)
chr4 (1-216)||(37968724-37968939)
chr4 (1-230)||(6611327-6611557)
chr4 (1-228)||(11639545-11639773)
chr4 (1-227)||(1756731-1756958)
chr4 (1-231)||(14987787-14988018)
chr4 (1-212)||(28032679-28032890)
chr4 (1-231)||(50353796-50354027)
chr4 (1-230)||(27488615-27488845)
chr4 (1-225)||(16700782-16701007)
chr4 (1-229)||(23776426-23776655)
chr4 (1-227)||(54412627-54412854)
chr4 (1-230)||(2481375-2481605)
chr4 (1-230)||(37464717-37464947)
chr4 (1-230)||(48909842-48910072)
chr4 (1-212)||(8591059-8591270)
chr4 (1-226)||(1617084-1617310)
chr4 (1-225)||(19164940-19165164)
chr4 (1-230)||(43289927-43290157)
chr4 (1-231)||(23704176-23704407)
chr4 (1-229)||(6688594-6688817)
chr4 (1-230)||(15669179-15669409)
chr4 (1-226)||(35490740-35490966)
chr4 (1-230)||(27536071-27536297)
chr4 (1-228)||(47632032-47632261)
chr4 (31-230)||(50055098-50055298)
chr4 (1-231)||(30423532-30423762)
chr4 (6-212)||(33703856-33704062)
chr4 (1-231)||(53353050-53353289)
chr4 (1-225)||(53875658-53875883)
chr4 (1-226)||(52139203-52139427)
chr4 (5-231)||(8932149-8932376)
chr4 (1-212)||(44379154-44379365)
chr4 (5-212)||(27583603-27583810)
chr4 (1-212)||(38071293-38071498)
chr4 (5-212)||(40680009-40680216)
chr4 (1-212)||(55344792-55345003)
chr4 (1-225)||(30171581-30171805)
chr4 (1-150)||(23269013-23269162)
chr4 (1-205)||(16703843-16704045)
chr4 (56-212)||(28360445-28360602)
chr4 (31-227)||(44375844-44376041)
chr4 (78-230)||(50053439-50053592)
chr4 (1-109)||(53408137-53408246)
chr4 (1-85)||(23261853-23261937)
chr4 (5-125)||(9595873-9595982)
chr4 (79-161)||(51780763-51780845)
chr4 (1-69)||(50055303-50055371)
chr4 (142-231)||(23265865-23265955)
chr4 (78-212)||(44548185-44548319)
chr4 (1-83)||(34615904-34615984)
chr4 (23-88)||(48748197-48748262)
chr4 (1-56)||(55344660-55344715)
chr4 (78-190)||(17493370-17493482)
chr4 (94-212)||(46257269-46257387)
chr4 (83-136)||(55344724-55344777)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-230)||(36701-36931)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (1-230)||(39260325-39260555)
chr1 (1-231)||(20089466-20089697)
chr1 (1-212)||(29078531-29078742)
chr1 (1-230)||(29288145-29288373)
chr1 (5-230)||(25897370-25897596)
chr1 (1-230)||(52753126-52753356)
chr1 (1-227)||(26663257-26663484)
chr1 (1-230)||(33510480-33510710)
chr1 (1-209)||(7145226-7145433)
chr1 (1-231)||(16052091-16052322)
chr1 (1-230)||(26580249-26580479)
chr1 (1-229)||(970503-970734)
chr1 (1-230)||(2347652-2347883)
chr1 (1-230)||(1940726-1940956)
chr1 (1-230)||(41928474-41928704)
chr1 (1-231)||(32671574-32671804)
chr1 (1-212)||(38829084-38829295)
chr1 (1-226)||(19715140-19715366)
chr1 (1-229)||(42370774-42371003)
chr1 (1-229)||(52696788-52697017)
chr1 (23-230)||(1168499-1168707)
chr1 (1-230)||(1170423-1170653)
chr1 (1-226)||(8079688-8079914)
chr1 (1-225)||(8120870-8121095)
chr1 (1-232)||(43905648-43905880)
chr1 (1-212)||(46760981-46761192)
chr1 (4-231)||(49146167-49146395)
chr1 (5-212)||(12682835-12683042)
chr1 (1-231)||(13996702-13996933)
chr1 (1-212)||(15203127-15203338)
chr1 (1-230)||(17591687-17591914)
chr1 (1-212)||(23498475-23498686)
chr1 (1-226)||(2473722-2473948)
chr1 (1-211)||(17587484-17587694)
chr1 (1-212)||(46409450-46409663)
chr1 (1-227)||(5215384-5215611)
chr1 (1-212)||(40092506-40092717)
chr1 (1-191)||(40149499-40149689)
chr1 (1-227)||(6765458-6765685)
chr1 (15-229)||(51359210-51359424)
chr1 (1-230)||(15554131-15554353)
chr1 (1-212)||(15717800-15718010)
chr1 (2-228)||(29695673-29695896)
chr1 (1-212)||(38171847-38172045)
chr1 (98-212)||(52086282-52086396)
chr1 (79-212)||(23322897-23323030)
chr1 (230-293)||(12542902-12542965)
chr1 (230-288)||(1848393-1848451)
chr1 (78-160)||(5217840-5217921)
chr1 (1-35)||(23323036-23323070)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (1-231)||(26323165-26323396)
chr2 (1-230)||(42937715-42937946)
chr2 (5-229)||(31517198-31517423)
chr2 (1-212)||(33906026-33906237)
chr2 (1-230)||(2178748-2178978)
chr2 (1-230)||(18806863-18807093)
chr2 (42-231)||(1108275-1108464)
chr2 (1-229)||(3873223-3873452)
chr2 (1-226)||(4016039-4016265)
chr2 (1-216)||(5733410-5733625)
chr2 (1-212)||(16066273-16066484)
chr2 (1-231)||(30270658-30270889)
chr2 (1-230)||(39635448-39635678)
chr2 (1-230)||(4232121-4232351)
chr2 (2-230)||(6174808-6175037)
chr2 (1-212)||(28329818-28330027)
chr2 (1-212)||(19383914-19384125)
chr2 (1-231)||(19901117-19901347)
chr2 (1-212)||(851012-851223)
chr2 (2-212)||(1482883-1483092)
chr2 (1-212)||(429831-430042)
chr2 (2-227)||(30420159-30420373)
chr2 (1-230)||(16588755-16588985)
chr2 (1-212)||(44947528-44947732)
chr2 (78-204)||(3585313-3585439)
chr2 (78-191)||(42446625-42446738)
chr2 (85-194)||(22101210-22101319)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (1-228)||(3708-3936)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (1-231)||(10233-10464)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (1-227)||(274-501)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (27-229)||(22956-23159)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-212)||(145224-145435)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (18-207)||(2-191)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (17-212)||(1-197)
[»] scaffold0257 (1 HSPs)
scaffold0257 (230-295)||(20640-20705)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-102; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14422931 - 14422702
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422931 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 14422832  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14422831 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 14422732  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14422731 agctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 14422702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18594765 - 18594533
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594765 tatgttttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 18594666  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18594665 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 18594566  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggccttg 232  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18594565 agctcaaaataagccaatccaaacggggccttg 18594533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39206814 - 39206584
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39206814 tatgttttgaaaaggtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttatt 39206715  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39206714 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 39206615  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39206614 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 10836734 - 10836964
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836734 tatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 10836833  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10836834 aaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacata 10836933  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  10836934 agctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 10836964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29938289 - 29938060
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938289 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 29938190  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  29938189 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacata 29938090  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29938089 agctcaaaataagccaatccaaacggggcc 29938060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 144622 - 144411
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  144622 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 144523  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  144522 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacata 144423  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
     |||||||||||    
T  144422 tgctcaaaataa 144411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13110632 - 13110406
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110632 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 13110533  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  13110532 aaaatatggcataagcagcttattaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacata 13110433  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggg 226  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  13110432 agctcaaaataagccaatccaaacggg 13110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24113145 - 24113375
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113145 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 24113244  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  24113245 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacata 24113344  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcct 230  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  24113345 agctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 24113375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39219005 - 39218775
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39219005 tatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 39218906  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  39218905 gaaatatggcataagcagcttatgaagctatgataaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacata 39218806  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39218805 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39218775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 34842344 - 34842572
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||    
T  34842344 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttatt 34842443  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34842444 gaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 34842543  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggc 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||    
T  34842544 agctcaaaataagccaatccaaacggggc 34842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4036075 - 4035844
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  4036075 tatgttttgaaaaattggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttatt 4035976  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| |||| |||    
T  4035975 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatata 4035876  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4035875 agctaaaaataaaccaatccaaacggggcctt 4035844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 6144252 - 6144483
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6144252 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttatt 6144351  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  6144352 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatata 6144451  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 231  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  6144452 agctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 6144483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22260609 - 22260839
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260609 tatgttttgaaaaattggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 22260708  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  22260709 aaaatatggcataagcagcttatgaaactaggataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacata 22260808  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22260809 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 22260839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33278628 - 33278399
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278628 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 33278529  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  ||| |||    
T  33278528 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatata 33278429  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  33278428 aactcaaaataagccaatccaaacggggcc 33278399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 2042503 - 2042727
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042503 tatgttttgaaaaagtggatccggagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 2042602  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  2042603 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacata 2042702  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacg 224  Q
    |||||||||||| || |||||||||    
T  2042703 agctcaaaataagccaatccaaacg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7774991 - 7774781
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  7774991 tatgttttgaaaaagtggatc-agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaat 7774893  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7774892 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcata 7774793  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  7774792 agctcaaaataa 7774781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7791639 - 7791412
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7791639 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttatt 7791540  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7791539 gaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacata 7791440  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgggg 227  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  7791439 aactcaaaataagccaatccaaacgggg 7791412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 35118010 - 35118239
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  35118010 tatgttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttatt 35118109  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35118110 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 35118209  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  35118210 agctcaaaataagccaatccaaacggggcc 35118239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41575741 - 41575516
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41575741 tatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 41575642  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||    
T  41575641 gaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacata 41575542  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgg 225  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    
T  41575541 agctcaaaataagccaatccaaacgg 41575516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 34679436 - 34679647
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34679436 tatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 34679535  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  34679536 aaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatata 34679635  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  34679636 agctcaaaataa 34679647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 34998875 - 34999086
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34998875 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttatt 34998974  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||    
T  34998975 aaaatatggcataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtata 34999074  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  34999075 agctcaaaataa 34999086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 44804923 - 44805134
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44804923 tatgttttgaaaaagtgaatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttatt 44805022  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  44805023 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacata 44805122  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  44805123 agctcaaaataa 44805134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7812223 - 7811993
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7812223 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttatt 7812124  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
T  7812123 gaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacata 7812024  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    | |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  7812023 aactcaaaataagccaatcaaaacggggcct 7811993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5320788 - 5320563
Alignment:
Q  5 ttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  5320788 ttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaa 5320689  T
Q  105 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagct 204  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5320688 catgacataagcaacttatgaaactatgataaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagct 5320589  T
Q  205 caaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||| || ||||||||||||||    
T  5320588 caaaataagccaatccaaacggggcc 5320563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36491385 - 36491154
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36491385 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 36491286  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| || ||||||| ||||||||    
T  36491285 aaaatatggcataaacaagttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacata 36491186  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||| ||||||| || ||||||| ||||||||    
T  36491185 agcttaaaataagccaatccaaatggggcctt 36491154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 38167135 - 38167344
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38167135 tatgttttgaaaaa-tggttccagcgagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttatt 38167233  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38167234 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacata 38167333  T
Q  201 agctcaaaata 211  Q
    | |||||||||    
T  38167334 aactcaaaata 38167344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 33287016 - 33287234
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287016 tatgttttgaaaaagtggattcaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagct------------agagggtaagctgaaaatttaggcttatt 33287103  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  33287104 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcatatgggagtagataaacccacata 33287203  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcct 230  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  33287204 agctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 33287234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42571819 - 42571598
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||  |||    
T  42571819 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaagaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--att 42571722  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  42571721 gaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacata 42571623  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacg 224  Q
    |||||||||||| || |||||||||    
T  42571622 agctcaaaataagccaatccaaacg 42571598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118062
Alignment:
Q  73 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  173 gtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 40118062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8021939 - 8021721
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||        ||||||||||||||||||    
T  8021939 tatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaagtaggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttatt 8021848  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  8021847 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatata 8021748  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggg 226  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  8021747 agctcaaaataagccaatccaaacggg 8021721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28639508 - 28639295
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28639508 tatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 28639411  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtct----tatgggagtagataaaccca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||    ||| ||||||||||| | ||    
T  28639410 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctca 28639311  T
Q  197 cataagctcaaaataa 212  Q
    |||||||| |||||||    
T  28639310 cataagcttaaaataa 28639295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 212
Target Start/End: Original strand, 66180 - 66370
Alignment:
Q  23 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtc-agagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 121  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  66180 agagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagctt 66279  T
Q  122 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 212  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || ||| || ||||||||||    
T  66280 atgaaactattataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataa 66370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783943
Alignment:
Q  90 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagat 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  190 aaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcctt 26783943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 9807486 - 9807339
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9807486 tatgttttgaaaaagtggatccagagaaa--cgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttatt 9807389  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttattta 150  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9807388 aaaatatgacataagcagcttatgaagctatgataagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 231
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322222
Alignment:
Q  78 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  178 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||  |||||||||| ||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatccaaacggggcctt 2322222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005191
Alignment:
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||  |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  201 agct 204  Q
    ||||    
T  5005194 agct 5005191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220273
Alignment:
Q  78 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 177  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  178 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 212  Q
    ||||  ||||||||   || |||||||||||||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataa 39220273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806890
Alignment:
Q  142 ttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataa 9806890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-102; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26704318 - 26704547
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704318 tatgttttggaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 26704417  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  26704418 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgta 26704517  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26704518 agctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 26704547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30692079 - 30691850
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30692079 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttatt 30691980  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30691979 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 30691880  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  30691879 agctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 30691850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 6086578 - 6086808
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086578 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 6086677  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6086678 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacata 6086777  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6086778 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 6086808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21893683 - 21893453
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21893683 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttatt 21893584  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21893583 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacata 21893484  T
Q  201 agctcaaaataaa-ccatccaaacggggcct 230  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21893483 agctcaaaataaatcgatccaaacggggcct 21893453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2837773 - 2837543
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837773 tatgttttgaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 2837674  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2837673 aaaatatggcatgagcagctcatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 2837574  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2837573 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 2837543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26946855 - 26947084
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946855 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 26946954  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  26946955 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatata 26947054  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26947055 agctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26947084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 3347502 - 3347733
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347502 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 3347601  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3347602 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacata 3347701  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3347702 agctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 3347733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 3955748 - 3955972
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955748 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 3955844  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3955845 aaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacata 3955944  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgggg 227  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  3955945 agctcaaaataagccaatccaaacgggg 3955972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 34887271 - 34887482
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34887271 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 34887370  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  34887371 gaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacata 34887470  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  34887471 agctcaaaataa 34887482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9459791 - 9459562
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459791 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 9459692  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||    
T  9459691 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacata 9459592  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  9459591 aactcaaaataagccaatccaaacggggcc 9459562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18613766 - 18613535
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613766 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 18613667  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  || ||||    
T  18613666 aaaatatgacataagcagcttatggaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcata 18613567  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 231  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  18613566 agctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 18613535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11167468 - 11167238
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11167468 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttatt 11167369  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  | || |||| | ||||||    
T  11167368 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacata 11167269  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11167268 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 11167238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 17261052 - 17261278
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17261052 tatgttttaaaaaaggggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 17261151  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17261152 aaaatatagcataagcagcttatgaaaatattataagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacata 17261251  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggg 226  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  17261252 agctcaaaataagccaatccaaacggg 17261278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20727015 - 20726790
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20727015 tatgttttgaaaaagtggacccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttatt 20726916  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  20726915 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagttattttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatata 20726820  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20726819 agctcaaaataagccaatccaaacggggcc 20726790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1153821 - 1153610
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153821 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaaacgaaggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 1153722  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||    
T  1153721 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacata 1153622  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    |||| |||||||    
T  1153621 agcttaaaataa 1153610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16306987 - 16307217
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16306987 tatgttttgaaaaagtggatccagaaataatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttatt 16307086  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||||||||| || |||||    
T  16307087 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacata 16307186  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcct 230  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  16307187 agctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 16307217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33464557 - 33464399
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464557 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 33464458  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaa 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33464457 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 28199488 - 28199699
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199488 tatgttttg-aaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 28199586  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagta---gataaacccac 197  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||   |||||  ||||    
T  28199587 gaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccac 28199684  T
Q  198 ataagctcaaaataa 212  Q
    |||||||||||||||    
T  28199685 ataagctcaaaataa 28199699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 30698908 - 30699119
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30698908 tatgttttgaaaaagtggatccaaaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 30699007  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | | || |||| | ||||||    
T  30699008 aaaatatggcataagcagctaataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacata 30699107  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    | |||| |||||    
T  30699108 aactcataataa 30699119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35198512 - 35198282
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatcta-gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttat 99  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35198512 tatgttttgaaaaagtggatccaagagagaatcgaatgagatcacataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttat 35198413  T
Q  100 taaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacat 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  35198412 tgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaag-cttatggaagtagataagcccacat 35198314  T
Q  200 aagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    ||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  35198313 aagttcaaaataagccaattcaaacggggcct 35198282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 809 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 26259357 - 26259234
Alignment:
Q  809 agtcaatttggaagcaaagaaatgacgttatttggcgtaatgaacgccaaccagaactgttgtttgtaagagaagtttgaatatactatcgagttggcat 908  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26259357 agtcaatttggaagcaaagaaatgacgttatttggcgtaatgaacgccaaccagaactgttgtttgtaagagaagtttgaatatactatcgagttggcat 26259258  T
Q  909 gatgtataggaaaaccacaatagc 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26259257 gatgtataggaaaaccacaatagc 26259234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52834
Alignment:
Q  66 taagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacactt 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  166 ttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 52834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 53136 - 53001
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53136 tatgttttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 53037  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53036 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 230 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26259937 - 26259853
Alignment:
Q  230 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaatgggccaacaaagaactaaacctttaatatatttttaagcttttgt 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26259937 ttgaactccctttagtgacatcacgtgataaattctaaatgggccaacaaagaactaaacctttaatatatttttaagcttttgt 26259853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 535 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 26259623 - 26259524
Alignment:
Q  535 gcttatttggttttgacatcttttatctatatctatatctatagtatataacaaaccaactaactttttatttattgaggatatgtaggaattgcaatta 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26259623 gcttatttggttttgacatcttttatctatatctata------gtatataacaaaccagctaactttttatttattgaggatatgtaggaattgcaatta 26259530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 681 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 26259475 - 26259406
Alignment:
Q  681 gttgtagcgtgtggggttgtgggatcgcataaaacataatacgattatagctacaaatccatcaaaggtt 750  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  26259475 gttgcagcgtgtggggttgtgggatcgcataaaacataatacgattatagctataaatccatcgaaggtt 26259406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463698
Alignment:
Q  151 tttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 33463698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 26259761 - 26259701
Alignment:
Q  404 aaggatggccgccttcttcaccttgcctcagataaggcttgggtatctggcttcatggcag 464  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26259761 aaggacggtcgccttcttcaccttacctcagataaggcttgggtatctggcttcttggcag 26259701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26590218 - 26590155
Alignment:
Q  230 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaatgggccaacaaagaactaaaccttt 293  Q
    ||||||| |||||| | | |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26590218 ttgaacttcctttagtaatatcaagtgataaattttaaatggaccaacaaataactaaaccttt 26590155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12101147 - 12101378
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  12101147 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttatt 12101246  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12101247 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacata 12101346  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12101347 agctcaaaataagccaatccaaatggggcctt 12101378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 33359059 - 33359288
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359059 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 33359158  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33359159 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacata 33359258  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33359259 agctcaaaataagccaatccaaacggggcc 33359288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 42964965 - 42965196
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42964965 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttatt 42965064  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42965065 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacata 42965164  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  42965165 agctcaaaataagccaatccaaaaggggcctt 42965196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24792301 - 24792531
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792301 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 24792400  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  24792401 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagata 24792500  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  24792501 agctcaacttaagccaatccaaacggggcct 24792531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Original strand, 30180998 - 30181224
Alignment:
Q  6 tttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaat 105  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30180998 tttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagggggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaat 30181097  T
Q  106 atggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30181098 atggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctc 30181197  T
Q  206 aaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||    
T  30181198 aaaataagccaatccaaacggggcctt 30181224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 43067942 - 43068173
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43067942 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 43068041  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  43068042 aaaatatgacataagaagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatata 43068141  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 231  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  43068142 agctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 43068173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22649663 - 22649892
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22649663 tatgttttgaaaaagtggatccagagaaaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttatt 22649762  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22649763 aaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 22649862  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||    
T  22649863 agctcaaaataagccaattcaaacggggcc 22649892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42204382 - 42204150
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204382 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 42204283  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  42204282 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacat 42204183  T
Q  200 aagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42204182 aagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 42204150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5281086 - 5280856
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5281086 tatgttttg-aaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 5280988  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| | ||||||    
T  5280987 gaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacata 5280888  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  5280887 agctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 5280856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20346714 - 20346487
Alignment:
Q  2 atgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatta 101  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20346714 atgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttatta 20346615  T
Q  102 aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  20346614 aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataa 20346515  T
Q  202 gctcaaaataaacc-atccaaacggggc 228  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||    
T  20346514 gctcaaaataagccaatccaaacggggc 20346487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25748714 - 25748485
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748714 tatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 25748615  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||    
T  25748614 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatata 25748515  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  25748514 agctcaacttaagccaatccaaacggggcc 25748485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 933512 - 933301
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  933512 tatgttttgaaaaagtggatccagagagattcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttatt 933413  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||     
T  933412 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatg 933313  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  933312 agctcaaaataa 933301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7164411 - 7164184
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164411 tatgttttgaaaaagtggattcagatagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 7164312  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||    
T  7164311 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatata 7164212  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgggg 227  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  7164211 agctcaaaataagccaatccaaacgggg 7164184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38866771 - 38866560
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  38866771 tatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttatt 38866672  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  38866671 aaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacata 38866572  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  38866571 agctcaaaataa 38866560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8630893 - 8630665
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8630893 tatgttttgaaaaagttgatccagagagaatcgaaggggattacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttatt 8630794  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8630793 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacata 8630694  T
Q  201 agctcaaaataaac-catccaaacggggc 228  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  8630693 acctcaaaataaacaaatccaaacggggc 8630665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1803253 - 1803042
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1803253 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaat 1803154  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1803153 aaaatatcgtataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 1803054  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  1803053 agctcaaaataa 1803042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15656139 - 15655908
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  15656139 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttatt 15656040  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||    
T  15656039 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacata 15655940  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15655939 agctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 15655908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3511527 - 3511319
Alignment:
Q  24 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511527 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 3511428  T
Q  124 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaa 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  3511427 gaaactatgataagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaaa 3511328  T
Q  223 cggggcctt 231  Q
    |||| ||||    
T  3511327 cgggacctt 3511319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6394978 - 6394747
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6394978 tatgtttggaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttatt 6394879  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6394878 gaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacata 6394779  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  6394778 agctcaaaataagccaatctaaacggggcctt 6394747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 12097559 - 12097765
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097559 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 12097658  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || |||    
T  12097659 aaaatatgacataagtagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatata 12097758  T
Q  201 agctcaa 207  Q
    |||||||    
T  12097759 agctcaa 12097765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42673688 - 42673481
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673688 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 42673589  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  42673588 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtt----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacata 42673493  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||| ||||||    
T  42673492 agctccaaataa 42673481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 4477290 - 4477515
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4477290 tatgtttggaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttatt 4477389  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4477390 gaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacata 4477489  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgg 225  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    
T  4477490 agctcaaaataagccaatccaaacgg 4477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Original strand, 36890809 - 36891029
Alignment:
Q  11 aaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36890809 aaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggc 36890908  T
Q  111 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaat 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||      
T  36890909 ataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaata 36891008  T
Q  211 aaaccatccaaacggggcctt 231  Q
    |  | ||||||||||||||||    
T  36891009 agtcaatccaaacggggcctt 36891029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9452817 - 9452606
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9452817 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttatt 9452718  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||   ||||||    
T  9452717 aaaatatggcatagacagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacata 9452618  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  9452617 agctcaaaataa 9452606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32041769 - 32041539
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||     
T  32041769 tatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaataaggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatg 32041670  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32041669 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacata 32041570  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  32041569 agcacaaaataagccaatccaaacggggcct 32041539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 33846498 - 33846723
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||||||||||||    
T  33846498 tatgtcttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttatt 33846592  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33846593 aaaatatgacataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 33846692  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33846693 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33846723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4347499 - 4347269
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4347499 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatagaagg-ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgtt 4347401  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  4347400 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacata 4347301  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 231  Q
    |||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  4347300 agcttaaaataagtcaatccaaacggggcctt 4347269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43156939 - 43156729
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156939 tatgttttg-aaaagtggatccggagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 43156841  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43156840 gaaatttgccataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacata 43156741  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  43156740 agctcaaaataa 43156729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 46134273 - 46134484
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46134273 tatgttttgaaaaagtgcatccagagagaatcgaatgaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 46134372  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  46134373 gaaatatggcgtaaacagcttatgaaactataataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacata 46134472  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  46134473 agctcaaaataa 46134484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Original strand, 16894477 - 16894666
Alignment:
Q  2 atgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatta 101  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894477 atgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttatta 16894576  T
Q  102 aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataa 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  16894577 aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataa 16894666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 48865858 - 48865689
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||    
T  48865858 tatgttttggaaaaatggatc--gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttatt 48865761  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48865760 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 48865689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17753827 - 17753616
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17753827 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttatt 17753728  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||| |    |||    
T  17753727 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgttaagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtata 17753628  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  17753627 agctcaaaataa 17753616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 46891308 - 46891535
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||    
T  46891308 tatgttttgaaaaagtggatccagagacaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaatt 46891407  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacat 199  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||||| || | ||    
T  46891408 aaaatatgacataagcagcttataaaactatgacaaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatat 46891507  T
Q  200 aagctcaaaataaacc-atccaaacggg 226  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||    
T  46891508 aagctcaaaataagccaatccaaacggg 46891535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 43021549 - 43021776
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    |      
T  43021549 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttag----acc 43021644  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||  |||||||    
T  43021645 gaaatatgccataagcagcttatgaaactataataagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacata 43021744  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    | || ||||||| || ||||||| ||||||||    
T  43021745 aacttaaaataagccaatccaaatggggcctt 43021776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828266
Alignment:
Q  83 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatggg 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  183 agtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaattcaaacggggcctt 19828266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 231
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37006011
Alignment:
Q  78 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 177  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||  |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  178 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    || | ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaaacggagcctt 37006011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704996
Alignment:
Q  133 ataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataa 37704996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405036
Alignment:
Q  78 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 177  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||| | | || || ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  178 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 212  Q
    || ||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaataa 43405036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Original strand, 27691428 - 27691510
Alignment:
Q  134 taaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacca 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  27691428 taaaatatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataaacca 27691510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849709
Alignment:
Q  85 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggag 184  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | ||||  ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  185 tagataaacccacataagct 204  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagct 36849709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 231
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655612
Alignment:
Q  78 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 177  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | || ||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  178 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||  |||||| || | |||||||| | | ||||| || ||||||||| ||||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaacgcggcctt 15655612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075426
Alignment:
Q  78 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 177  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||   | | ||| | |||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tat-ataagctattttta-ttatttacccaaacgtatctgaaagggctt 30075373  T
Q  178 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcc 229  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||    
T  30075374 atgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcc 30075426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163886
Alignment:
Q  94 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaac 161  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaac 20163886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 267
Target Start/End: Original strand, 22851551 - 22851588
Alignment:
Q  230 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaa 267  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22851551 ttgaactccctttagtaacatcacgtgataaattctaa 22851588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 42307870 - 42308101
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307870 tatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 42307969  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42307970 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 42308069  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42308070 agctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 42308101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 37698108 - 37698338
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698108 tatgttttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 37698207  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37698208 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 37698307  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  37698308 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 37698338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25999611 - 25999382
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999611 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 25999512  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25999511 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacata 25999412  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25999411 agctcaaaataagccaatccaaacggggcc 25999382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8042830 - 8042599
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042830 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 8042731  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||    
T  8042730 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacata 8042631  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 231  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8042630 agctcaaaataagcccatccaaacggggcctt 8042599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 46452127 - 46452357
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  46452127 tatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttatt 46452226  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  46452227 aaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatata 46452326  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  46452327 agctcaacttaagccaatccaaacggggcct 46452357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15520107 - 15520338
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520107 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 15520206  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15520207 aaaatatggcataagcagtttatgaaacgatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 15520306  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15520307 agctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 15520338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21581265 - 21581054
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21581265 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttatt 21581166  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21581165 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 21581066  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  21581065 agctcaaaataa 21581054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12117623 - 12117854
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12117623 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttatt 12117722  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12117723 aaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacata 12117822  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||    
T  12117823 agctcaaaataagccaattcaaacggggcctt 12117854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15520859 - 15520629
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  15520859 tatgttttgaaaaagtggatcgagagagaatcgaaggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttatt 15520760  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15520759 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacata 15520660  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15520659 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15520629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22174955 - 22175185
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  22174955 tatgttttgaaaaagttgatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttatt 22175054  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  22175055 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacata 22175154  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22175155 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 22175185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29445707 - 29445481
Alignment:
Q  5 ttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29445707 ttttgaaaaagtggatccagatagaatggaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa 29445608  T
Q  105 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagct 204  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29445607 tagggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagct 29445508  T
Q  205 caaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||| || |||||||||||||||    
T  29445507 caaaataagccaatccaaacggggcct 29445481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 50529152 - 50528922
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  50529152 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttatt 50529053  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  50529052 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacata 50528953  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  50528952 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50528922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 25494250 - 25494479
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494250 tatgttttgaaaaactggattcagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 25494349  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25494350 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacata 25494449  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcc 229  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  25494450 agctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 25494479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38856316 - 38856089
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856316 tatgttttgaaaaagtggattcagagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 38856217  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||    
T  38856216 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatata 38856117  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgggg 227  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  38856116 agctcaaaataagccaatccaaacgggg 38856089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 54870139 - 54870369
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54870139 tatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttatt 54870238  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  54870239 aaaatatgacataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacata 54870338  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  54870339 aactcaaaataagccaatccaaacggggcct 54870369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32244317 - 32244112
Alignment:
Q  27 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244317 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 32244218  T
Q  127 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32244217 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 32244118  T
Q  226 ggcctt 231  Q
    | ||||    
T  32244117 gacctt 32244112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20842313 - 20842544
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842313 tatgttttgaaaaagttgatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 20842412  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  20842413 aaaatatgatataagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacata 20842512  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20842513 agctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 20842544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2895412 - 2895197
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcata----agctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggct 96  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2895412 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggct 2895313  T
Q  97 tattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaaccca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2895312 tattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaaccca 2895213  T
Q  197 cataagctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||||||    
T  2895212 cataagctcaaaataa 2895197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20699372 - 20699144
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  20699372 tatgttttgaaaaagtggatcgagagagaatcgaaggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttatt 20699273  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  20699272 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacata 20699173  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggc 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||    
T  20699172 agctcaaaataagccaatccaaacggggc 20699144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24835664 - 24835894
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24835664 tatgttttgaaaaagtggatctagagataatcgaaggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 24835763  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  | | |||    
T  24835764 gaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatata 24835863  T
Q  201 agctcaaaataaa-ccatccaaacggggcct 230  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24835864 agctcaaaataaatcaatccaaacggggcct 24835894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38934168 - 38933939
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  38934168 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttatt 38934069  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  38934068 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagat-aagccacata 38933970  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  38933969 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 38933939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32359472 - 32359251
Alignment:
Q  11 aaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359472 aaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 32359373  T
Q  111 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  32359372 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaat 32359273  T
Q  211 aaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    || || ||||||||||| ||||    
T  32359272 aagccaatccaaacgggacctt 32359251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 44609298 - 44609509
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  44609298 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttatt 44609397  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||||||  |||||||    
T  44609398 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacata 44609497  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  44609498 agctcaaaataa 44609509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 44688983 - 44688782
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  44688983 tatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttatt 44688884  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  44688883 aaaatat-gcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacata 44688785  T
Q  201 agc 203  Q
    |||    
T  44688784 agc 44688782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 54534293 - 54534521
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54534293 tatgtttggaaaaagtggctccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 54534392  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
      ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  54534393 -gaatatggcataagcagcttat-aaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacata 54534490  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  54534491 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 54534521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 42104936 - 42105147
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42104936 tatgttttgaaaaactgaattcagagggaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttatt 42105035  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  42105036 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacata 42105135  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  42105136 agctcaaaataa 42105147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34700564 - 34700334
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  34700564 tatgttttgaaaaaatggatccagagataatcaaaggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttatt 34700465  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  34700464 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacata 34700365  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34700364 agctcaaaataaaccaatctaaacggggcct 34700334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35226669 - 35226460
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226669 tatgttttgaaaaa-tggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 35226571  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  35226570 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacata 35226471  T
Q  201 agctcaaaata 211  Q
    |||||||||||    
T  35226470 agctcaaaata 35226460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26123037 - 26122808
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26123037 tatgttttgaaaaagtagacctagagagaatcgaagaatgttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttatt 26122938  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  26122937 gaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacata 26122838  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  26122837 agctcaaaataagccaatccaaactgggcc 26122808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 48924968 - 48925177
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  48924968 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttatt 48925067  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  48925068 aaaatatgacataaacagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatata 48925165  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    | ||| ||||||    
T  48925166 aactctaaataa 48925177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 53028440 - 53028237
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53028440 tatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 53028341  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||        | ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  53028340 aaaatatgacataagcagtttatgaaaatatgataagctatttttatttatttacc--------tctaaaaagacttatgggaatagataagcccacata 53028249  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  53028248 agctcaaaataa 53028237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16354569 - 16354379
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16354569 tatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgcaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttatt 16354470  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataa 191  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||    
T  16354469 aaaacatggcattagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagtgtagataa 16354379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35643368 - 35643212
Alignment:
Q  73 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  35643368 gagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaaa 35643269  T
Q  173 gtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggc 228  Q
    | ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  35643268 ggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 35643212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12916124 - 12915930
Alignment:
Q  6 tttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaat 105  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  12916124 tttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaagggggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaat 12916025  T
Q  106 atggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataa 201  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||    
T  12916024 atgacataagcagtttatgaaattatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttat-ggagtaaataagcccacataa 12915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 212
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529949
Alignment:
Q  90 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagat 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  190 aaacccacataagctcaaaataa 212  Q
    ||  |||||||| ||||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataa 50529949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 24366252 - 24366143
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24366252 tatgttttgaaaaagtggatcaagagagaatctaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttatt 24366153  T
Q  101 aaaatatggc 110  Q
    ||||||||||    
T  24366152 aaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 13697016 - 13696914
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13697016 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcaaaggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 13696917  T
Q  101 aaa 103  Q
    |||    
T  13696916 aaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128041
Alignment:
Q  96 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaaccc 195  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  196 acataagctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 231  Q
    ||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaaacggggcctt 49128041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 50528847 - 50528915
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaag 69  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528847 tatgttttgaaaaagtggatccagatagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaag 50528915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 287
Target Start/End: Original strand, 30600446 - 30600500
Alignment:
Q  233 aactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaatgggccaacaaagaactaa 287  Q
    ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30600446 aactccctttactaaaatcatgtgataaattctaaataggccaacaaagaactaa 30600500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24366141 - 24366104
Alignment:
Q  175 cttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24366141 cttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataa 24366104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27456397 - 27456363
Alignment:
Q  248 catcacgtgataaattctaaatgggccaacaaaga 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27456397 catcgcgtgataaattctaaatgggccaacaaaga 27456363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 184; Significance: 4e-99; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 33491175 - 33491406
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491175 tatgttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 33491274  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33491275 aaaatatggcaaaagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacata 33491374  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33491375 agctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 33491406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27679148 - 27679378
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679148 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 27679247  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  27679248 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacata 27679347  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27679348 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27679378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4121166 - 4120934
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121166 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 4121067  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4121066 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacata 4120967  T
Q  201 agctcaaaataaacca-tccaaacggggccttg 232  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4120966 agctcaaaataagccattccaaacggggccttg 4120934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 9008036 - 9008267
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008036 tatgttttgaaaaagtagatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 9008135  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9008136 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 9008235  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9008236 agctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 9008267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1579265 - 1579035
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579265 tatgttttgaaaaagtggattcaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 1579166  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  1579165 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatata 1579066  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1579065 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1579035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 1605550 - 1605780
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605550 tatgttttgaaaaagtggattcaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 1605649  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  1605650 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatata 1605749  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1605750 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1605780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24105650 - 24105881
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24105650 tatgttttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttatt 24105749  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24105750 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 24105849  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  24105850 agctcaaaataagccaatccaaacggagcctt 24105881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16069582 - 16069371
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069582 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 16069483  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  16069482 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacata 16069383  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  16069382 agctcaaaataa 16069371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16737426 - 16737637
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737426 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 16737525  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||    
T  16737526 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatata 16737625  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  16737626 agctcaaaataa 16737637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19358755 - 19358524
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19358755 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttact 19358656  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  19358655 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacata 19358556  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 231  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  19358555 agctcaaaataaggcaatccaaacggggcctt 19358524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5203200 - 5202972
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5203200 tatgttttg-aaaagtggatctagagagaatcgaagaaggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 5203102  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5203101 gaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacata 5203002  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcc 229  Q
    | ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  5203001 aactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 5202972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27421087 - 27420856
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421087 tatgttttaaaaatgtggatccagggagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 27420988  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  27420987 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatata 27420888  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27420887 agctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 27420856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31883373 - 31883162
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31883373 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttatt 31883274  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||    
T  31883273 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacata 31883174  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  31883173 agctcaaaataa 31883162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 8374318 - 8374547
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8374318 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttatt 8374416  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8374417 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacata 8374516  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcct 230  Q
    |||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  8374517 agcttaaaataaggcaatccaaacggggcct 8374547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 3386465 - 3386676
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386465 tatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 3386564  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||    
T  3386565 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacata 3386664  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  3386665 agctcaaaataa 3386676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3921810 - 3921579
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921810 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 3921711  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  3921710 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatata 3921611  T
Q  201 agctcaaaataaa-ccatccaaacggggcctt 231  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  3921610 aactcaaaataaatcaatccaaacgggacctt 3921579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20992125 - 20992356
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992125 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 20992224  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||    
T  20992225 aaaatatggcataatcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacata 20992324  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||    
T  20992325 agctcaaaataagccaattcaaacggggcctt 20992356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 35782624 - 35782854
Alignment:
Q  2 atgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatta 101  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35782624 atgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgtaagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttatta 35782723  T
Q  102 aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  35782724 aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataa 35782823  T
Q  202 gctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  35782824 gctcaaaataaggcaatccaaacggggcctt 35782854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 1165580 - 1165791
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165580 tatgttttgaaaaactggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 1165679  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||    
T  1165680 aaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacata 1165779  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  1165780 agctcaaaataa 1165791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33991369 - 33991158
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33991369 tatgttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttatt 33991270  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  33991269 aaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacata 33991170  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    | ||||||||||    
T  33991169 aactcaaaataa 33991158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 38598429 - 38598659
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38598429 tatgttttgaaaaaacggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttatt 38598528  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  38598529 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacata 38598628  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  38598629 agttcaaagtaagccaatccaaaccgggcct 38598659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31410705 - 31410476
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31410705 tatgttttgaaaaagtggatcaaaagagaatcgaaggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttatt 31410606  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  31410605 gaaatatggcataagcagcttataaaactatgataagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatata 31410506  T
Q  201 agctcaaaataaa-ccatccaaacggggcc 229  Q
    | ||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  31410505 aactcaaaataaatcaatccaaacgcggcc 31410476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27025185 - 27025001
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025185 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 27025086  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagt 185  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  27025085 aaaaaatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 26602921 - 26603111
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||| |||||||    
T  26602921 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttatt 26603020  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataa 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26603021 aaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataa 26603111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 95 - 231
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992495
Alignment:
Q  95 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  195 c----acataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcctt 20992495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 212
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284765
Alignment:
Q  89 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtaga 188  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  189 taaacccacataagctcaaaataa 212  Q
    ||| |||| |||||||||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataa 33284765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 35420403 - 35420482
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaa 80  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  35420403 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaa 35420482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638174
Alignment:
Q  94 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaac 193  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||| |    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T
Q  194 ccacataa 201  Q
     |||||||    
T  31638181 tcacataa 31638174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25634732 - 25634581
Alignment:
Q  78 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 177  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | |||| |||||||   ||||||||||||||   ||| |||   |||    
T  25634732 taagctcaaaattatggtttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttt--attatttacccaaacgtatttgaaagagctt 25634635  T
Q  178 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||  ||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  25634634 atgttagtagataaactctcataagcttaaaataagccaatctaaacggggcct 25634581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 163
Target Start/End: Original strand, 41818552 - 41818604
Alignment:
Q  111 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacac 163  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41818552 ataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacac 41818604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10585732 - 10585693
Alignment:
Q  230 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaat 269  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10585732 ttgaactccctttaataacatcacatgataaattctaaat 10585693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 27024853 - 27024822
Alignment:
Q  29 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024853 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 27024822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 4e-99; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54189771 - 54189540
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189771 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 54189672  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  54189671 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacata 54189572  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  54189571 agctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 54189540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 15240995 - 15241225
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15240995 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 15241094  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15241095 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacata 15241194  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  15241195 agctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 15241225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 53717435 - 53717661
Alignment:
Q  5 ttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717435 ttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa 53717534  T
Q  105 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagct 204  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53717535 tagggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagct 53717634  T
Q  205 caaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||| || |||||||||||||||    
T  53717635 caaaataagccaatccaaacggggcct 53717661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31969907 - 31969695
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969907 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 31969808  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  31969807 aaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatata 31969708  T
Q  201 agctcaaaataaa 213  Q
    |||||||||||||    
T  31969707 agctcaaaataaa 31969695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 40428687 - 40428915
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||     
T  40428687 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatc 40428786  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40428787 aaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacata 40428886  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggc 228  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||    
T  40428887 agctcaaaataagccaattcaaacggggc 40428915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20877273 - 20877042
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20877273 tatgttttgaaaaagtggatctagagagaatctaaggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 20877174  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20877173 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 20877074  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  20877073 agctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 20877042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 45424501 - 45424732
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424501 tatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 45424600  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| || |||||    
T  45424601 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacata 45424700  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 231  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  45424701 agctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 45424732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 19913597 - 19913826
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913597 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 19913696  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19913697 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 19913796  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19913797 agctcaaaataagccaatccaaacggggcc 19913826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38055383 - 38055154
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38055383 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttatt 38055284  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38055283 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 38055184  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcc 229  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  38055183 agctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 38055154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 44784884 - 44785116
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44784884 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttatt 44784983  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44784984 aaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacata 44785083  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggccttg 232  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  44785084 agctcaaaataagccaatccaaacggggccttg 44785116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 37968724 - 37968939
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37968724 tatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 37968823  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37968824 gaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacata 37968923  T
Q  201 agctcaaaataaacca 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  37968924 agctcaaaataaacca 37968939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 6611327 - 6611557
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  6611327 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatc 6611426  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  6611427 aaaatatgacataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacata 6611526  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6611527 agctcaaaataaaccaatccaaacggggcct 6611557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 11639545 - 11639773
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639545 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 11639644  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  11639645 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacata 11639744  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggc 228  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||    
T  11639745 agttcaaaataaaccaatccaaacggggc 11639773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 1756731 - 1756958
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756731 tatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 1756830  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||    
T  1756831 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatata 1756930  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgggg 227  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  1756931 agctcaaaataagccaatccaaacgggg 1756958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14988018 - 14987787
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14988018 tatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 14987919  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||    
T  14987918 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacata 14987819  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14987818 agctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 14987787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 28032679 - 28032890
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28032679 tatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttatt 28032778  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28032779 aaaatatggcataagcagcttatgatactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 28032878  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  28032879 agctcaaaataa 28032890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50354027 - 50353796
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  50354027 tatgttttgaaaaagtgaatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttatt 50353928  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |    
T  50353927 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatcataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacaga 50353828  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  50353827 agctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 50353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27488615 - 27488845
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27488615 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttatt 27488714  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  27488715 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagata 27488814  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  27488815 agctcaacttaagccaatccaaacggggcct 27488845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16701007 - 16700782
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16701007 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 16700908  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  16700907 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacata 16700808  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgg 225  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    
T  16700807 agctcaaaataagccaatccaaacgg 16700782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23776426 - 23776655
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776426 tatgttttgaaagagtggatcctgagagaatcgaagaaggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 23776525  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23776526 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 23776625  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23776626 agctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 54412854 - 54412627
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54412854 tatgttttgaaaaagtggttccagagagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttatt 54412755  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  54412754 agaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 54412655  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgggg 227  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  54412654 agctcaaaataagccaatccaaacgggg 54412627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 2481375 - 2481605
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||    
T  2481375 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttatt 2481474  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  2481475 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacata 2481574  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2481575 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 2481605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37464947 - 37464717
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  37464947 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttatt 37464848  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||    
T  37464847 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacata 37464748  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||    
T  37464747 agctcaaaataagccaattcaaacggggcct 37464717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 48910072 - 48909842
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||    
T  48910072 tatgtattgaaaaagtggatctggagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgtt 48909973  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  48909972 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacata 48909873  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  48909872 agctcaaaataagccaatccaaacagggcct 48909842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 8591059 - 8591270
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591059 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaaccgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 8591158  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  8591159 aacatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacata 8591258  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    | ||||||||||    
T  8591259 aactcaaaataa 8591270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1617310 - 1617084
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1617310 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 1617211  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| | ||||||    
T  1617210 aaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacata 1617111  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggg 226  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  1617110 agctcaaaataagccaatccaaacggg 1617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 19164940 - 19165164
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19164940 tatgttttgaaaaagtggatccagagaaaaacgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc-gagggtaagctgaaaatttaggcttatt 19165038  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19165039 aaa-tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacat 19165137  T
Q  200 aagctcaaaataaacc-atccaaacgg 225  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    
T  19165138 aagctcaaaataagccaatccaaacgg 19165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 43289927 - 43290157
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43289927 tatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 43290026  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || | |    
T  43290027 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaa 43290126  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  43290127 agctcaaaataagccaatccaaacggagcct 43290157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 23704176 - 23704407
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704176 tatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcaaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 23704275  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| | || |||    
T  23704276 aaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatata 23704375  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  23704376 agctcaaaataagccaatccaaacagggcctt 23704407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 6688594 - 6688817
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688594 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 6688693  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6688694 aaaatatggcataagca------gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 6688787  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcc 229  Q
    | ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  6688788 aactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 6688817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15669409 - 15669179
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  15669409 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatggaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttatt 15669310  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| | ||||||    
T  15669309 aaagtatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacata 15669210  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15669209 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15669179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 35490740 - 35490966
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35490740 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggtggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 35490839  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||| |||| |||    
T  35490840 aaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatata 35490939  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggg 226  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  35490940 agctcaaaataagccaatccaaacggg 35490966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27536071 - 27536297
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536071 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 27536170  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    ||| |||  |||    
T  27536171 aaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtata 27536266  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27536267 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27536297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47632261 - 47632032
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  47632261 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttatt 47632162  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||    
T  47632161 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgagaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacat 47632062  T
Q  200 aagctcaaaataaacc-atccaaacggggc 228  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||    
T  47632061 aaactcaaaataagccaatccaaacggggc 47632032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 230
Target Start/End: Original strand, 50055098 - 50055298
Alignment:
Q  31 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50055098 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacca 50055197  T
Q  131 tgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  50055198 tgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 50055297  T
Q  230 t 230  Q
    |    
T  50055298 t 50055298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30423532 - 30423762
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  30423532 tatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttatt 30423630  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30423631 gaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacata 30423730  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    | |||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  30423731 aactcaaaataagccaatccaaacgggacctt 30423762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33704062 - 33703856
Alignment:
Q  6 tttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaat 105  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33704062 tttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaat 33703963  T
Q  106 atggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctc 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  33703962 atgacataagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctc 33703863  T
Q  206 aaaataa 212  Q
    |||||||    
T  33703862 aaaataa 33703856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53353289 - 53353050
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttat- 99  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  53353289 tatgttttgaaaaagtggatttagagagaatcgaaggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttata 53353190  T
Q  100 ---taaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaaccca 196  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  53353189 tattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagccca 53353090  T
Q  197 ca----taagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
     |    |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  53353089 tataattaagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 53353050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 53875883 - 53875658
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53875883 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttatt 53875784  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  53875783 gaaatatgacataagcagcttataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacata 53875684  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgg 225  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||    
T  53875683 agcttaaaataagccaatccaaacgg 53875658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 52139427 - 52139203
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  52139427 tatgttttgaaaaagtgtatccagaga--atcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttatt 52139330  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||    
T  52139329 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacata 52139230  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggg 226  Q
    || ||||||||| || |||||||||||    
T  52139229 agttcaaaataagccaatccaaacggg 52139203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 8932149 - 8932376
Alignment:
Q  5 ttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa 104  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8932149 ttttgaaaaagtggatgcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaa 8932248  T
Q  105 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  8932249 tatggcataagcagcttatgaaactacgttaagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagct 8932348  T
Q  205 caaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||    
T  8932349 caaaataagccaatccaaacggggcctt 8932376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 44379154 - 44379365
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  44379154 tatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttatt 44379253  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| || | |||    
T  44379254 aaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatata 44379353  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    | ||||||||||    
T  44379354 aactcaaaataa 44379365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 27583603 - 27583810
Alignment:
Q  5 ttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27583603 ttttgaaaaagtggatccagagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaa 27583702  T
Q  105 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagct 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27583703 tatggcataagcagcttatgcaactatgataagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagct 27583802  T
Q  205 caaaataa 212  Q
    ||||||||    
T  27583803 caaaataa 27583810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 38071293 - 38071498
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |     |||| ||||||||| |||||||||    
T  38071293 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttatt 38071386  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||    
T  38071387 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacata 38071486  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  38071487 agctcaaaataa 38071498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 40680009 - 40680216
Alignment:
Q  5 ttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40680009 ttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaa 40680108  T
Q  105 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||  |    
T  40680109 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaatt 40680208  T
Q  205 caaaataa 212  Q
    ||||||||    
T  40680209 caaaataa 40680216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 55344792 - 55345003
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||    
T  55344792 tatgtcttgaaaaagtggatccagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttatt 55344891  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||| |||| || || ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  55344892 aaaatatggtataaacaactcatgcaaatatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacata 55344991  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  55344992 agctcaaaataa 55345003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30171805 - 30171581
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||    
T  30171805 tatgttttg-aaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttatt 30171707  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |  |||||| | ||||||    
T  30171706 gaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacata 30171607  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgg 225  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    
T  30171606 agctcaaaataagccaatccaaacgg 30171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 23269013 - 23269162
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23269013 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 23269112  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttattta 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23269113 aaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16704045 - 16703843
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16704045 tatgttttgaaaaagtggat--acagagaatcgaagggggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttatt 16703948  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||   ||||||    
T  16703947 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacata 16703848  T
Q  201 agctc 205  Q
    |||||    
T  16703847 agctc 16703843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360445
Alignment:
Q  56 agctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttattta 154  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  155 cccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 212  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataa 28360445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44376041 - 44375844
Alignment:
Q  31 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44376041 tcgaaggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaacta 44375942  T
Q  131 tgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  44375941 tgataaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgggg 44375844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053439
Alignment:
Q  78 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 177  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  178 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50053439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 53408246 - 53408137
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcag-agggtaagctgaaaatttaggcttat 99  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||     
T  53408246 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaa 53408147  T
Q  100 taaaatatgg 109  Q
    ||||||||||    
T  53408146 taaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 23261853 - 23261937
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctga 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23261853 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 125
Target Start/End: Original strand, 9595873 - 9595982
Alignment:
Q  5 ttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||           | ||||||||||||||||    
T  9595873 ttttggaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggag-----------agtttaggcttattaaaa 9595961  T
Q  105 tatggcataagcagcttatga 125  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  9595962 tatgacataagcagcttatga 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  79 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaac 161  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 50055371 - 50055303
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaag 69  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055371 tatgttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaag 50055303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265955
Alignment:
Q  142 ttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 23265955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 212
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548319
Alignment:
Q  78 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 177  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| | ||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  178 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 212  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataa 44548319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 34615984 - 34615904
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagct 83  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  34615984 tatgttttgaaaaagtggatcaagagaaaatcgaaggaggttacataaatt--taagctctttattaaggcagaggataagct 34615904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 48748262 - 48748197
Alignment:
Q  23 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaa 88  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  48748262 agagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 55344660 - 55344715
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataa 56  Q
    ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344660 tatgtcttgaaaaactggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataa 55344715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493370
Alignment:
Q  78 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 177  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||  |||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  178 atgggagtagata 190  Q
    || ||||||||||    
T  17493382 ataggagtagata 17493370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 212
Target Start/End: Original strand, 46257269 - 46257387
Alignment:
Q  94 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaac 193  Q
    |||||||||| ||| | |||| |||||||||||| | ||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||  |||  ||||||  |||||||||||    
T  46257269 gcttattaaactatagaataaacagcttatgaaattgtgataaactctttcaattgatttacccaaacaattttgtaaatgcttatgtcagtagataaac 46257368  T
Q  194 ccacataagctcaaaataa 212  Q
      |||||| || |||||||    
T  46257369 ttacataaacttaaaataa 46257387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344777
Alignment:
Q  83 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 136  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataa 55344777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 183; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36931 - 36701
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36931 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 36832  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36831 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacata 36732  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36731 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 36701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 2e-98; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 39260325 - 39260555
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260325 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 39260424  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39260425 aaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacata 39260524  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39260525 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39260555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20089697 - 20089466
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089697 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 20089598  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20089597 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacata 20089498  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20089497 agctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 20089466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29078742 - 29078531
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29078742 tatgttttgaaaaagtggatcaagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttatt 29078643  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29078642 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 29078543  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  29078542 agctcaaaataa 29078531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29288373 - 29288145
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288373 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 29288276  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29288275 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 29288176  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcct 230  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  29288175 agctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 29288145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25897596 - 25897370
Alignment:
Q  5 ttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897596 ttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa 25897497  T
Q  105 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25897496 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagct 25897397  T
Q  205 caaaataa-accatccaaacggggcct 230  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||    
T  25897396 caaaataagtcaatccaaacggggcct 25897370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 52753126 - 52753356
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52753126 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttatt 52753225  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  52753226 aaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacata 52753325  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52753326 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 52753356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26663484 - 26663257
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663484 tatgttttgaaaaaatggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 26663385  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26663384 aaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 26663285  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgggg 227  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  26663284 agctcaaaataagccaatccaaacgggg 26663257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33510710 - 33510480
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510710 tatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 33510611  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||    
T  33510610 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatata 33510511  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33510510 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33510480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7145433 - 7145226
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145433 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 7145334  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  7145333 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacata 7145235  T
Q  201 agctcaaaa 209  Q
    |||||||||    
T  7145234 agctcaaaa 7145226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16052322 - 16052091
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16052322 tatgttttgaaaaagtggatcaagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttatt 16052223  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16052222 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 16052123  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16052122 aactcaaaataagccaatccaaacggggcctt 16052091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26580249 - 26580479
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26580249 tatgttttgaaaatgtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttatt 26580348  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26580349 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacata 26580448  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26580449 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 26580479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 970503 - 970734
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  970503 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttatt 970602  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaac--tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  970603 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaca 970702  T
Q  199 taagctcaaaataa-accatccaaacggggcc 229  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  970703 taagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 970734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2347883 - 2347652
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2347883 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 2347784  T
Q  101 aaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacat 199  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  2347783 aaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcat 2347684  T
Q  200 aagctcaaaataaac-catccaaacggggcct 230  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2347683 aaactcaaaataaacaaatccaaacggggcct 2347652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 1940726 - 1940956
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940726 tatgttttgaaaaagtagatccagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 1940825  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  1940826 aaaatatgacataaacaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatata 1940925  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1940926 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1940956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 41928474 - 41928704
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41928474 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgtt 41928573  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||    
T  41928574 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacata 41928673  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    || ||||||||| || |||||||||||||||    
T  41928674 agttcaaaataagccaatccaaacggggcct 41928704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32671804 - 32671574
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  32671804 tatgttttg-aaaagtggatccagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttatt 32671706  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  32671705 aaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacata 32671606  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32671605 agctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 32671574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38829295 - 38829084
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829295 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 38829196  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||    
T  38829195 aaaatatggcacaagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacata 38829096  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  38829095 agctcaaaataa 38829084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 19715140 - 19715366
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19715140 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttatt 19715239  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  19715240 aaaatatgacataagcagcttatgaaacaatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacata 19715339  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggg 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19715340 agctcaaaataaaccaatccaaacggg 19715366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 42370774 - 42371003
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42370774 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 42370873  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  42370874 aaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgataagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacata 42370973  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcc 229  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  42370974 agctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 42371003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52697017 - 52696788
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  52697017 tatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttatt 52696918  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  52696917 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacata 52696818  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  52696817 agctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52696788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1168707 - 1168499
Alignment:
Q  23 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 122  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168707 agagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 1168608  T
Q  123 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaa 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1168607 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 1168508  T
Q  222 acggggcct 230  Q
    |||||||||    
T  1168507 acggggcct 1168499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 1170423 - 1170653
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  1170423 tatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttatt 1170522  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |    
T  1170523 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaa 1170622  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1170623 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1170653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 8079688 - 8079914
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8079688 tatgttttgaaaaagtggattaagagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttatt 8079787  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  8079788 aaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacata 8079887  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggg 226  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  8079888 agctcaaaataagccaatccaaacggg 8079914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8121095 - 8120870
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  8121095 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttatt 8120996  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||    
T  8120995 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacata 8120896  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgg 225  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    
T  8120895 agctcaaaataagccaatccaaacgg 8120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43905880 - 43905648
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  43905880 tatgttttgaaaaagtggatccagagacaatcgaaggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttatt 43905781  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||    
T  43905780 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaata 43905681  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggccttg 232  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  43905680 agctcaaaataagccaatccaaacggagccttg 43905648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46761192 - 46760981
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46761192 tatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 46761093  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| | || |||    
T  46761092 aaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatata 46760993  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    || |||||||||    
T  46760992 agttcaaaataa 46760981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 49146395 - 49146167
Alignment:
Q  4 gttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 103  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  49146395 gttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgacgttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaa 49146296  T
Q  104 atatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  49146295 atatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagc 49146196  T
Q  204 tcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  49146195 tcaaaataaaccaatccaaacggagcctt 49146167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12683042 - 12682835
Alignment:
Q  5 ttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa 104  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  12683042 ttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaa 12682943  T
Q  105 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12682942 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaact 12682843  T
Q  205 caaaataa 212  Q
    ||||||||    
T  12682842 caaaataa 12682835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13996702 - 13996933
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13996702 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttatt 13996801  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13996802 aaaatatggcataagcagcttatgaaaccattataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacata 13996901  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |  ||||||||| || |||||||| |||||||    
T  13996902 atttcaaaataagccaatccaaacagggcctt 13996933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15203338 - 15203127
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15203338 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttatt 15203239  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  15203238 gaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaa 15203139  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    |||| |||||||    
T  15203138 agcttaaaataa 15203127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17591914 - 17591687
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17591914 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttatt 17591815  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  17591814 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagat-aagccacata 17591716  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  17591715 agctc--aataagccaatccaaacggggcct 17591687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23498686 - 23498475
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23498686 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 23498587  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  23498586 aaaatatgatataagcaacttatgaaactatgatgaactatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacata 23498487  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    |||| |||||||    
T  23498486 agcttaaaataa 23498475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2473948 - 2473722
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2473948 tatgttttgaaaatgtggatccaaagagactcgaaggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 2473849  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  2473848 gaaatatgacataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacata 2473749  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggg 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2473748 agctcaaaataaaccgatccaaacggg 2473722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 17587484 - 17587694
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17587484 tatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttatt 17587583  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| | ||||||    
T  17587584 aaaatatggcataagcagcttatgaaaatatgataagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacata 17587683  T
Q  201 agctcaaaata 211  Q
    |||||||||||    
T  17587684 agctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46409663 - 46409450
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa--gtcagagggtaagctgaaaatttaggctta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  46409663 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggctta 46409564  T
Q  99 ttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccaca 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||  |||||    
T  46409563 ttgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccaca 46409464  T
Q  199 taagctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||||    
T  46409463 taagctcaaaataa 46409450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5215611 - 5215384
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||    
T  5215611 tatgttttgaaaaggtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttatt 5215512  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  5215511 aaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacata 5215412  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgggg 227  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  5215411 agctcaaaataagccaatccaaacgggg 5215384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40092717 - 40092506
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||    
T  40092717 tatgttttgaaaaagtggatccagagaaaatcgaaaaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttatt 40092618  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||    
T  40092617 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatata 40092518  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  40092517 agctcaaaataa 40092506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40149689 - 40149499
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40149689 tatgttttgaaaaagtggattcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttatt 40149590  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataa 191  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  40149589 aaaatatgacataagcagcttataaaactatgataaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataa 40149499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6765685 - 6765458
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765685 tatgttttaaaaaagtggatcgagatagaatcgaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 6765586  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||  ||||||    
T  6765585 aaaatatgacataagcagctcatgaaaatatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacata 6765486  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgggg 227  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  6765485 aactcaaaataagccaatccaaacgggg 6765458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 51359210 - 51359424
Alignment:
Q  15 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51359210 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 51359309  T
Q  115 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaac 214  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| |    
T  51359310 gcaccttatgaaactatgataagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagc 51359408  T
Q  215 c-atccaaacggggcc 229  Q
    | ||||||||||||||    
T  51359409 caatccaaacggggcc 51359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 15554131 - 15554353
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15554131 tatgttttgaaaaaatggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttatt 15554230  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||   |||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  15554231 aaaatatggcatcagcagtttatgaa---atg-----ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatata 15554322  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  15554323 agctcaacttaagccaatccaaacggggcct 15554353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15718010 - 15717800
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15718010 tatgttttgaaaaagtggatccaaagagaattgaaggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 15717911  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||  || |||||    
T  15717910 aaattatggcataagcagcttatgaaactatga-aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacata 15717812  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    | ||||||||||    
T  15717811 aactcaaaataa 15717800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29695896 - 29695673
Alignment:
Q  2 atgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatta 101  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||      || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29695896 atgttttgaaaaagtagatctagagagaattgaatgaggttacataatttt-----cttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttatta 29695802  T
Q  102 aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtc-ttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||||||||||||||| ||||| ||    
T  29695801 aaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgta 29695702  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggc 228  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||    
T  29695701 agctcaaaataagccaatccaaacagggc 29695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38172045 - 38171847
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||||||         
T  38172045 tatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggc----- 38171951  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||   ||||||    
T  38171950 --------acataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacata 38171859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086282
Alignment:
Q  98 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccac 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  198 ataagctcaaaataa 212  Q
    ||||||| |||||||    
T  52086296 ataagcttaaaataa 52086282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 212
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323030
Alignment:
Q  79 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctta 178  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| | || |||||   |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  179 tgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataa 23323030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12542965 - 12542902
Alignment:
Q  230 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaatgggccaacaaagaactaaaccttt 293  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12542965 ttgaactcccttaaaaaacatcacgtgataaattttaaatggaccaacaaagaactaagccttt 12542902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 288
Target Start/End: Original strand, 1848393 - 1848451
Alignment:
Q  230 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaatgggccaacaaagaactaaa 288  Q
    |||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1848393 ttgagctccctttaaaaatatcaggtgataaattctaaatgggccaacaatgaactaaa 1848451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 160
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217921
Alignment:
Q  78 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaa 160  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |   |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctattttta-ttatttacccaaa 5217921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 23323070 - 23323036
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaa 35  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23323070 tatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaa 23323036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 3e-94; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26323165 - 26323396
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323165 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 26323264  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  26323265 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacata 26323364  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26323365 agctcaaaataaaccaatccaaacggggcctt 26323396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42937946 - 42937715
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggctt-at 99  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42937946 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttat 42937847  T
Q  100 taaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  42937846 taaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacat 42937747  T
Q  200 aagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  42937746 aagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 42937715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 31517198 - 31517423
Alignment:
Q  5 ttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517198 ttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa 31517297  T
Q  105 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagct 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31517298 tatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagct 31517397  T
Q  205 caaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||| || ||||||||||||||    
T  31517398 caaaataagccaatccaaacggggcc 31517423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 33906026 - 33906237
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906026 tatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 33906125  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33906126 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacata 33906225  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    || |||||||||    
T  33906226 agttcaaaataa 33906237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 2178748 - 2178978
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178748 tatgttttgaaaaagtgaatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 2178847  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||  |||||||    
T  2178848 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacata 2178947  T
Q  201 agctcaaaataaa-ccatccaaacggggcct 230  Q
    | || |||||||| | |||||||||||||||    
T  2178948 aacttaaaataaatcaatccaaacggggcct 2178978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 18806863 - 18807093
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18806863 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttatt 18806962  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || |||    
T  18806963 aaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatata 18807062  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18807063 agctcaaaataagccaatccaaacggggcct 18807093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108275
Alignment:
Q  42 tacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactat 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  142 ttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaaccatccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccatccaaacggggcctt 1108275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 3873223 - 3873452
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873223 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaatgaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 3873322  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  3873323 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacata 3873422  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 229  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  3873423 agctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 3873452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4016265 - 4016039
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  4016265 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgtt 4016166  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4016165 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacata 4016066  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggg 226  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  4016065 agctcaaaataagccaatccaaacggg 4016039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5733625 - 5733410
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5733625 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 5733526  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  5733525 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacata 5733426  T
Q  201 agctcaaaataaacca 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  5733425 agctcaaaataaacca 5733410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16066273 - 16066484
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066273 tatgttttgaaaaagtggatccagagattatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 16066372  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||||| ||||||||    
T  16066373 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacata 16066472  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  16066473 agctcaaaataa 16066484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30270658 - 30270889
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30270658 tatgttttgaaaaagtggatccagagataatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttatt 30270757  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  30270758 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatata 30270857  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  30270858 agcttaaaataagccaatccaaacggggcctt 30270889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39635678 - 39635448
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  39635678 tatgttttgaaaaagtgaatctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaat 39635579  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  39635578 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacata 39635479  T
Q  201 agctcaaaataaac-catccaaacggggcct 230  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  39635478 agctcaaaataagctaatccaaacggggcct 39635448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 4232121 - 4232351
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |     
T  4232121 tatgttttgaaaaagtggattcagagataatcgaatgaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtg 4232220  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4232221 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacata 4232320  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4232321 agcacaaaataagccaatccaaacggggcct 4232351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 6174808 - 6175037
Alignment:
Q  2 atgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatta 101  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |     
T  6174808 atgttttgaaaatgtggatccagagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatg 6174907  T
Q  102 aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataa 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||    
T  6174908 aaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataa 6175007  T
Q  202 gctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6175008 gctcaaaataagccaatccaaacggggcct 6175037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 28329818 - 28330027
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28329818 tatgttttgaaaaagtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagctag--ggtaagctgaaaatttaggcttatt 28329915  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  28329916 aaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacata 28330015  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    ||||||||||||    
T  28330016 agctcaaaataa 28330027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 19383914 - 19384125
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19383914 tatgttttgaaaaagtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 19384013  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| | || |||    
T  19384014 aaaatatggcataaacaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatata 19384113  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    | ||||||||||    
T  19384114 aactcaaaataa 19384125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19901117 - 19901347
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  19901117 tatgttttgaaaaagtggatctagaaagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttatt 19901216  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||    
T  19901217 gaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacata 19901315  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 231  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19901316 agctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 19901347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 851223 - 851012
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  851223 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttatt 851124  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||    
T  851123 aaaatatggcataagcagcttataaaattatgataagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacata 851024  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    |||| |||||||    
T  851023 agcttaaaataa 851012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 1482883 - 1483092
Alignment:
Q  2 atgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatta 101  Q
    |||||||| ||| || |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1482883 atgttttgaaaatgtagatacagagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttatta 1482982  T
Q  102 aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1482983 aaatatggcataagcagcttatgaaacaataataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataa 1483081  T
Q  202 gctcaaaataa 212  Q
    |||||||||||    
T  1483082 gctcaaaataa 1483092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 430042 - 429831
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  430042 tatgttttgaaaaagtggatccagcgagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttatt 429943  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  429942 aaaatatcgcataagcaacttatgaaattatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacata 429843  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    |  |||||||||    
T  429842 aattcaaaataa 429831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Original strand, 30420159 - 30420373
Alignment:
Q  2 atgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatta 101  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||    
T  30420159 atgttttgaaaaagtggatcctgagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaag------------ctgaaaatttaggcttatta 30420246  T
Q  102 aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30420247 aaatatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataa 30420346  T
Q  202 gctcaaaataaacc-atccaaacgggg 227  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  30420347 gctcaaaataagccaatccaaacgggg 30420373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16588755 - 16588985
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  16588755 tatgttttgaaaaagtggattcagagataatcgacggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatg 16588854  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  16588855 aaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacata 16588954  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 230  Q
    | | |||||||| || |||||||||| ||||    
T  16588955 aacacaaaataagccaatccaaacggagcct 16588985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 44947528 - 44947732
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||           
T  44947528 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc------ 44947621  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||    
T  44947622 -aaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacata 44947720  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    || |||||||||    
T  44947721 agatcaaaataa 44947732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585313
Alignment:
Q  78 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 177  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||  ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  178 atgggagtagataaacccacataagct 204  Q
    |||  ||| |||||| |||||||||||    
T  3585339 atgttagtggataaatccacataagct 3585313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 191
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446738
Alignment:
Q  78 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 177  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  178 atgggagtagataa 191  Q
    |||  |||||||||    
T  42446725 atgttagtagataa 42446738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 194
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101319
Alignment:
Q  85 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggag 184  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| |||||  |||| || ||||||||| ||||||  ||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatgttag 22101309  T
Q  185 tagataaacc 194  Q
    ||||||||||    
T  22101310 tagataaacc 22101319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 169; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3708
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3936 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 3837  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  3836 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacata 3737  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacggggc 228  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||    
T  3736 agttcaaaataaaccaatccaaacggggc 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 168; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10464 - 10233
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10464 tatgttttgaaaatgtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 10365  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  10364 aaaatatggtataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatata 10265  T
Q  201 agctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 231  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  10264 agctcaaaataagtcaatccaaacggggcctt 10233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 164; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 274 - 501
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  274 tatgttttgaaaaagtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttatt 373  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  374 gaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacata 473  T
Q  201 agctcaaaataaacc-atccaaacgggg 227  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  474 aactcaaaataagccaatccaaacgggg 501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 160; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 27 - 229
Target Start/End: Original strand, 22956 - 23159
Alignment:
Q  27 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22956 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 23055  T
Q  127 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23056 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 23155  T
Q  226 ggcc 229  Q
    ||||    
T  23156 ggcc 23159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 160; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 145224 - 145435
Alignment:
Q  1 tatgttttggaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  145224 tatgttttgaaaaagtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttatt 145323  T
Q  101 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  145324 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacata 145423  T
Q  201 agctcaaaataa 212  Q
    | ||||||||||    
T  145424 aactcaaaataa 145435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Original strand, 2 - 191
Alignment:
Q  18 gatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2 gatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagca 101  T
Q  118 gcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaa 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  102 gcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaa 191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 129; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 1 - 197
Alignment:
Q  17 ggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagc 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1 ggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagc 99  T
Q  117 agcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagta---gataaacccacataagctcaaaataa 212  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||   |||||  |||||||||||||||||||    
T  100 agcatatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataa 197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0257 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0257
Description:

Target: scaffold0257; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 295
Target Start/End: Original strand, 20640 - 20705
Alignment:
Q  230 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaatgggccaacaaagaactaaacctttaa 295  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||    
T  20640 ttgaattccctttagtaacaccacatgataaattctaaattggccaacaaagatataaacttttaa 20705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University