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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF8404_low_12 (Length: 239)
Name: NF8404_low_12
Description: NF8404
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF8404_low_12 |
 | |
|
| [»] scaffold0340 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0002 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0113 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15830694 - 15830486
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15830694 |
atgaaagtcaacatagtaaagtacaaccacacttgtgagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataac |
15830595 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15830594 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaaatttcacttcctttatattgtgagcggtgcacaccat |
15830495 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
15830494 |
caacacact |
15830486 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9708723 - 9708505
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9708723 |
atgaaagtcagcatagtaaagtagaatcacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataac |
9708624 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtc----------aaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcgg |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9708623 |
caagaattaccaagatgtcaaaggatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcacttcctttatattgtgagcgg |
9708524 |
T |
|
| Q |
206 |
tacacaccatcaacacact |
224 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9708523 |
tgcacaccatcaacacact |
9708505 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 36207315 - 36207492
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |
|
|
| T |
36207315 |
atgaaagtcagcatagcaaagtacaaccacacctgtcacatggaaaattaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattgacata-- |
36207412 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
36207413 |
--------accaagatgtcaacatatatgcctttgttattgctaattttaaccacaccaaaaatttcaacttcctttatattgtgagc |
36207492 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Original strand, 38937701 - 38937804
Alignment:
| Q |
17 |
tgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataacc |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| | | || |||| ||||||| |
|
|
| T |
38937701 |
tgaaagtcagcataataaagtacaactacacctgtcagatgaaaaactaatgcatagcatacacgatgaaacacataaatgacatataattggcataacc |
38937800 |
T |
|
| Q |
117 |
aaga |
120 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
38937801 |
aaga |
38937804 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 46295267 - 46295059
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
46295267 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacatttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataac |
46295168 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
46295167 |
caagaattatcaagatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatattgtgagcggtgcacaccgt |
46295068 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
46295067 |
caacacact |
46295059 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 44431529 - 44431737
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44431529 |
atgaaagtcaacatagtaaagtacaaccgcacttgttagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataac |
44431628 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44431629 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaaatttcacttcctttatattgtgagcggtgcacaccat |
44431728 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
44431729 |
caacacact |
44431737 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16835207 - 16834999
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16835207 |
atgaaagtcagcataataaagtacaaccacatttgtcagatggaaaactaatacatgtcttacataatgaagcacataaataatacatgattgacatacc |
16835108 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16835107 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttctacttcctttatattgtgagcggtgcacaccat |
16835008 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
16835007 |
caacacact |
16834999 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21247289 - 21247081
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
21247289 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacagccatacttgtcagatggaaaactaatacatgtgatacataatgaagcacataaataatatatgattggcataac |
21247190 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
21247189 |
caagaataaccaagatgtcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatattgtgagcggtgcacaacac |
21247090 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
21247089 |
caacacact |
21247081 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Original strand, 39365183 - 39365362
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39365183 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataat |
39365282 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttata |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
39365283 |
taagaattaccaagatgtcatagtatatggctttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttata |
39365362 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1799544 - 1799355
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
1799544 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatatatgattggcataat |
1799445 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtc----------aaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttata |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
1799444 |
caagaattaccaagatgtcaaaggatgtcaaagtatatggctttcctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttata |
1799355 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Original strand, 29487629 - 29487751
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
29487629 |
atgaaagtcagcatagcaaagtacagccacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgatatatgattcgcataac |
29487728 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaag |
138 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29487729 |
caagaattaccaagatgtcaaag |
29487751 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Original strand, 42775065 - 42775206
Alignment:
| Q |
20 |
aagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaag |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| | | ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42775065 |
aagtcagcatagcaaagtacagccacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacatacataataaagcacagaaatgacatatgattggcataaccaag |
42775164 |
T |
|
| Q |
120 |
aattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaat |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
42775165 |
aattaccaagatgtcaaaatatatggctttgctattggtaat |
42775206 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 25377074 - 25377260
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | | | ||| |||||| |
|
|
| T |
25377074 |
atgaaagtcaacatagcaaagtacagtcacacctgtcggatagaaaactaatgcatgacatacatagtgaagcacataaatcacatagaatttgcataac |
25377173 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagc |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
25377174 |
caagaattactaagatgtcaaaatatat-gattttctattgttaattttaaccacaccaataatttccacttcctttacattgtgagc |
25377260 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16797973 - 16797891
Alignment:
| Q |
43 |
cacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattac |
125 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16797973 |
cacacctgtcagatgaaaaactaatatatggcatacataatgaagcacataaatggcacatgattgacataaccaagaattac |
16797891 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16797428 - 16797356
Alignment:
| Q |
55 |
atgaaaaactaatacatgtcatacata--atgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattac |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16797428 |
atgaaaaactaatgcatggtatacatataatgaagcacataaatgacatatgattgacataatcaagaattac |
16797356 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15565366 - 15565158
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15565366 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataac |
15565267 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||| || |
|
|
| T |
15565266 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttacacgtcctttatattgtgaccggtgcacactat |
15565167 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
15565166 |
caacacact |
15565158 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 44308451 - 44308655
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44308451 |
atgaaagtcaacatagtaaagtacaaccac----gttagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataac |
44308546 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44308547 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccatttcatttatattgtgagcggtgcacaccat |
44308646 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
44308647 |
caacacact |
44308655 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 20832057 - 20832263
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20832057 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatgcatgattgacataac |
20832156 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||| ||||| |||| |||| || |
|
|
| T |
20832157 |
caaaaattaccaagatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaac--caccaaaaatttccacttcctttatactgtgaccggtgcacatcac |
20832254 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
20832255 |
caacacact |
20832263 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Original strand, 26163 - 26353
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26163 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacgcttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataac |
26262 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaa----------gatgtcaaagtatgtggctttgctattgc-taattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttata |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |
|
|
| T |
26263 |
caagaattaccaagatgtcaaaggatgtcaaagtatatggctttgctattgcttaattttaaccacaccaaaaatcttcacttcctttata |
26353 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 12502431 - 12502608
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| |
|
|
| T |
12502431 |
atgaacgtcagcataacaaagtacaaccacacatgtcagatggaaaactaatgcataacatacataataaagcacataaatgacatatgattgacataac |
12502530 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagc |
203 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12502531 |
caagaa----------gtcaaaatatatcgctttgctattgctcattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatattgtgagc |
12502608 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 25630519 - 25630696
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| | |||||| | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |
|
|
| T |
25630519 |
atgaaagtcagcatagcaaagtagagccacacctttcagatggaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcata-- |
25630616 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagc |
203 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25630617 |
--------aacaagatgtcaaaatatatggctttgttattgctaattttaaccacaccataaatttccacttcctttatattgtgagc |
25630696 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14103660 - 14103452
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14103660 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaatcatacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaaacacataaataatacatgattgacataac |
14103561 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14103560 |
caagaattaccaagatatcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatattgtgagcggtgcacaccat |
14103461 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
14103460 |
caacacact |
14103452 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14413677 - 14413469
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14413677 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaatcatacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaaacacataaataatacatgattgacataac |
14413578 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14413577 |
caagaattaccaagatatcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatattgtgagcggtgcacaccat |
14413478 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
14413477 |
caacacact |
14413469 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 26831874 - 26832082
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26831874 |
atgaaagtcaacatagtaaagtacagccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataac |
26831973 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26831974 |
caagaattaccaagatgtcacagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatattgtgagcggtgcacaccac |
26832073 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
26832074 |
caacacact |
26832082 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 36897737 - 36897943
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
36897737 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttg--agatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcatagt |
36897834 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
36897835 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatatgactttgctattgcaaattttaaccacaccaaaaattttcacttcctttatattgtgagcggtgcacaccat |
36897934 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
36897935 |
caacacact |
36897943 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Original strand, 26928418 - 26928510
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattg |
108 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26928418 |
atgaaaatcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattg |
26928510 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 203
Target Start/End: Original strand, 15752604 - 15752748
Alignment:
| Q |
59 |
aaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgct |
158 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15752604 |
aaaagtaatgcatatcatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcataaccaagaattaccgagatgtcgaaatatatggctttgttattgct |
15752703 |
T |
|
| Q |
159 |
aattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagc |
203 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15752704 |
aatcttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatattgtgagc |
15752748 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 163
Target Start/End: Original strand, 42261113 - 42261242
Alignment:
| Q |
34 |
aagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgt |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| | | ||| ||| |||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
42261113 |
aagtacaaccacacatgtcagatagaaaaataatgcatgacatacataataaagcacataaatgacatatgtttggtataaccaaaaattatcaagatgt |
42261212 |
T |
|
| Q |
134 |
caaagtatgtggctttgctattgctaattt |
163 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42261213 |
caaaatatatggttttgctattgctaattt |
42261242 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 12)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54602967 - 54602755
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
54602967 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataagacatgattggcataac |
54602868 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcgg----tacaca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
54602867 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatatgactttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcctttatattgtgagcggtgcatgcaca |
54602768 |
T |
|
| Q |
212 |
ccatcaacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
54602767 |
ccatcaacacact |
54602755 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 20819567 - 20819772
Alignment:
| Q |
18 |
gaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataacca |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20819567 |
gaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcaaacataatgaagcacataaataatacatgattggcataacca |
20819666 |
T |
|
| Q |
118 |
agaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccatca |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20819667 |
agaattaccaagatgtcaaagtatatggccttgctattgctaattttaaccacaccaaaaa-tttcacttcctttatattgtgagcggtgcacaccatca |
20819765 |
T |
|
| Q |
218 |
acacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
20819766 |
acacact |
20819772 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 1092356 - 1092564
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
1092356 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgccagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacttaattgacataac |
1092455 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1092456 |
caagaattaccaagatgtcacaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcacttcctttatattgtgagcggtgcacaccac |
1092555 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
1092556 |
caacacact |
1092564 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 35235186 - 35235393
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35235186 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacatgtcagatggaaaactaatacatgtcaaacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
35235285 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
35235286 |
caagaattaccaagatgtcaaattatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatattgtgagcggtgcacacc-t |
35235384 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
35235385 |
caacacact |
35235393 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32751528 - 32751320
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32751528 |
atgaaagtcaatgtagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
32751429 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
32751428 |
caacaattatcaacatgtcaaaatatatggttttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatattgtgagcggtgcacaccat |
32751329 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
32751328 |
caacacact |
32751320 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40066331 - 40066123
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
40066331 |
atgaaagtcaacatagtaaagtacaaccacacttgtcaaatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggtgtaac |
40066232 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
40066231 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatatgactttgatattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatattgtgagcggtgcacaccat |
40066132 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
40066131 |
caacacact |
40066123 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54627863 - 54627659
Alignment:
| Q |
20 |
aagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaag |
119 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
54627863 |
aagtctgcatagtaaagtacaaccacatttgtctgatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaaacacatatataatacatgattggcataaccaag |
54627764 |
T |
|
| Q |
120 |
aattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccatcaac |
219 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
54627763 |
aattaccaagatgtcaaagtatattgctttgctattgctaattttaaccacacaaaaaatttccacttcctttatattgtgagcggtgcacaccatcaac |
54627664 |
T |
|
| Q |
220 |
acact |
224 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
54627663 |
acact |
54627659 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24782925 - 24782708
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagat--------gaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaa-taatacatgat |
106 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24782925 |
atgagagtcagcatagtaaagtacaatcacacttgtcagattgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataataaagcacataaaataatacatgat |
24782826 |
T |
|
| Q |
107 |
tgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggt |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24782825 |
tgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatattgtgagcggt |
24782726 |
T |
|
| Q |
207 |
acacaccatcaacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24782725 |
gcacaccatcaacacact |
24782708 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 35234087 - 35234280
Alignment:
| Q |
19 |
aaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaa |
118 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35234087 |
aaagacagcatagcaaagtacagccacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaa |
35234186 |
T |
|
| Q |
119 |
gaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacac |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
35234187 |
gaattaccaagatgtcaaaatatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccactccctttatattgtgagcactacacac |
35234280 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Original strand, 54493060 - 54493208
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| | |
|
|
| T |
54493060 |
atgaaagtcagcataacaaagtataaccacacctgtcaaatgaaaaactaatgcatggtatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcatagc |
54493159 |
T |
|
| Q |
116 |
c-aagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattt |
163 |
Q |
| |
|
| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54493160 |
caaaaaattatcaagatgtcaaaatatatggctttgctattgctaattt |
54493208 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 55482139 - 55482038
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
55482139 |
atgaaagtcagcatagcaacgtacagccacacttgtcatatgaaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcataac |
55482040 |
T |
|
| Q |
116 |
ca |
117 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
55482039 |
ca |
55482038 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 55481641 - 55481556
Alignment:
| Q |
45 |
cacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaaga |
130 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
55481641 |
cacttgttagattaaaaactaatgcattacatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcataaccaataattaccaaga |
55481556 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 5574308 - 5574516
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5574308 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacagccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
5574407 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5574408 |
cgataattaccaagatgtcacagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatattgtgagcggtgcacaccac |
5574507 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
5574508 |
caacacact |
5574516 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17648128 - 17647921
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17648128 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcaaacataatgaagcacataaataatatatgattgacataac |
17648029 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17648028 |
caagaattaacaagatgtcagagtatatggccttgctattgctaattttaaccacaccaaaaa-tttcacttcctttatattgtgagcggtgcacaccat |
17647930 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
17647929 |
caacacact |
17647921 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6915193 - 6915016
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |
|
|
| T |
6915193 |
atgaaagtcaacataacaaagtacaaccacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattgacataac |
6915094 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagc |
203 |
Q |
| |
|
| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
6915093 |
c----------aagacgtcaaaatatatggctttgttattgctaattttaaccacaccaaaaattcccacttcctttatattgagagc |
6915016 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20731544 - 20731469
Alignment:
| Q |
53 |
agatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaa |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20731544 |
agatgaaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattgacataactaagaattaccaa |
20731469 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 20731163 - 20731095
Alignment:
| Q |
27 |
catagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaat |
96 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20731163 |
catagcaaagtacaaccacactc-tcggatggaaaaataatacatgacatgcataatgaagcacataaat |
20731095 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6336812 - 6336604
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6336812 |
atgaaagtcaccatagtaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataac |
6336713 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
6336712 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacactaaaaatttccacttcctttatattatgagtggtgcacaccat |
6336613 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
6336612 |
caacacact |
6336604 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 56443471 - 56443679
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
56443471 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaacacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataac |
56443570 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccat |
215 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
56443571 |
caaaaattacaaagatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacatcaaaaatttccacttcctttatattgtgggcggtgcacaccat |
56443670 |
T |
|
| Q |
216 |
caacacact |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
56443671 |
caacacact |
56443679 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Original strand, 55082779 - 55082958
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
55082779 |
atgaaagtcaacatagtaaaggacaaccatacttgtcagatagaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataac |
55082878 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttata |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
55082879 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttata |
55082958 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 1613791 - 1613940
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1613791 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtgagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataac |
1613890 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaatttta |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
1613891 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatatggctttgttattgttaatttta |
1613940 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 48083287 - 48083474
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtca--tacataatgaagcacataaataatacatgattgacata |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |
|
|
| T |
48083287 |
atgaaagtcagcatagcaaaatacagtcacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacacatacataatgaagcacataaatgacatatgattgacata |
48083386 |
T |
|
| Q |
114 |
accaagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagc |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
48083387 |
accaagaattaccaagatgtcaaaatatatggctttgc--ttgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttctcttatattgtgagc |
48083474 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Original strand, 12800528 - 12800675
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
12800528 |
atgaaagtcaacatagcaaagtacaaccacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacatacaaaatgaagcacataaataacatatgattgacataac |
12800627 |
T |
|
| Q |
116 |
caagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattt |
163 |
Q |
| |
|
||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12800628 |
caaaaactacaaagatgtcaaaatatatggctttgctattgctaattt |
12800675 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 42260057 - 42259977
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaat |
96 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42260057 |
atgaaagtcagcatagcaaagtacagtcacacctgtcagaaggaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaat |
42259977 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Original strand, 1614324 - 1614390
Alignment:
| Q |
158 |
taattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccatcaacacact |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1614324 |
taattttaaccacaccaaaaatttccactttctttatattgtgagcggtgcacaccatcaacacact |
1614390 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42259968 - 42259925
Alignment:
| Q |
160 |
attttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42259968 |
attttaaccacacaaaaaatttccatttcctttatattgtgagc |
42259925 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 120
Target Start/End: Original strand, 17215246 - 17215306
Alignment:
| Q |
60 |
aaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaaga |
120 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | | || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17215246 |
aaactaatgcatggcatacataatgaaacacataaatgacatataattggcataaccaaga |
17215306 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0340 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:
Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Original strand, 1652 - 1845
Alignment:
| Q |
20 |
aagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaag |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
1652 |
aagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattcgcataactaag |
1751 |
T |
|
| Q |
120 |
aattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacacc |
213 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1752 |
aattatcaagatgtcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcacttcctttatattgtgagcggtgcacacc |
1845 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11099733 - 11099568
Alignment:
| Q |
59 |
aaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgct |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11099733 |
aaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatatggcttcgctattgct |
11099634 |
T |
|
| Q |
159 |
aattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagcggtacacaccatcaacacact |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11099633 |
aattttaaccacacaaaaaatttccacttcctttatattgtgagcggtgcacacaatcaacacact |
11099568 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1563707 - 1563563
Alignment:
| Q |
59 |
aaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgct |
158 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1563707 |
aaaagtaatgcatatcatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcataaccaagaattaccgagatgtcgaaatatatggctttgttattgct |
1563608 |
T |
|
| Q |
159 |
aattttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagc |
203 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1563607 |
aatcttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatattgtgagc |
1563563 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:
Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 425158 - 425054
Alignment:
| Q |
16 |
atgaaagtcagcatagtaaagtacaaccacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| |
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|
| T |
425158 |
atgaaagtcagcatagcaaagtacaacaacacctgtcagattgaaaactaatccatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcataac |
425059 |
T |
|
| Q |
116 |
caaga |
120 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
425058 |
caaga |
425054 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0113 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:
Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13098 - 12965
Alignment:
| Q |
60 |
aaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatgtggctttgctattgcta |
159 |
Q |
| |
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|||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |
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|
| T |
13098 |
aaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcataaccaaga----------tgtcaaaatatatggctttgttattgcta |
13009 |
T |
|
| Q |
160 |
attttaaccacaccaaaaattttcatttcttttatattgtgagc |
203 |
Q |
| |
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|
| T |
13008 |
attttaaccacacaaaaaatttccacttcctttatattgtgagc |
12965 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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