View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8443_low_11 (Length: 420)

Name: NF8443_low_11
Description: NF8443
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8443_low_11
NF8443_low_11
[»] chr6 (74 HSPs)
chr6 (1-407)||(27187546-27187952)
chr6 (1-407)||(27261288-27261694)
chr6 (1-407)||(1542849-1543255)
chr6 (1-407)||(28292137-28292543)
chr6 (1-405)||(24312935-24313339)
chr6 (1-405)||(2874570-2874974)
chr6 (1-407)||(28262962-28263368)
chr6 (1-407)||(28341711-28342117)
chr6 (1-405)||(25112662-25113066)
chr6 (1-405)||(29591687-29592091)
chr6 (1-405)||(16626484-16626888)
chr6 (8-405)||(5838986-5839383)
chr6 (1-402)||(19864797-19865198)
chr6 (1-393)||(25609640-25610032)
chr6 (1-400)||(22433979-22434378)
chr6 (7-396)||(27331209-27331598)
chr6 (7-396)||(27391949-27392338)
chr6 (8-396)||(16927416-16927804)
chr6 (2-396)||(18407718-18408113)
chr6 (1-384)||(22078478-22078859)
chr6 (1-396)||(22762231-22762626)
chr6 (8-384)||(16963155-16963531)
chr6 (1-396)||(23078579-23078974)
chr6 (97-384)||(17032589-17032876)
chr6 (1-191)||(12498136-12498326)
chr6 (1-191)||(12510575-12510765)
chr6 (11-396)||(25768311-25768696)
chr6 (61-396)||(14381243-14381578)
chr6 (17-396)||(34645362-34645741)
chr6 (1-396)||(19453530-19453925)
chr6 (53-331)||(1640934-1641212)
chr6 (1-191)||(12505465-12505655)
chr6 (17-396)||(19879424-19879803)
chr6 (60-396)||(17415655-17415991)
chr6 (53-396)||(21471763-21472106)
chr6 (18-396)||(21563908-21564286)
chr6 (53-395)||(28282590-28282932)
chr6 (17-400)||(11280277-11280660)
chr6 (53-395)||(27560394-27560736)
chr6 (56-396)||(10468625-10468965)
chr6 (8-150)||(25765312-25765454)
chr6 (59-396)||(22796408-22796745)
chr6 (69-396)||(5296982-5297308)
chr6 (62-393)||(24364583-24364914)
chr6 (74-395)||(27559765-27560086)
chr6 (53-396)||(18794852-18795195)
chr6 (53-393)||(15459498-15459838)
chr6 (180-396)||(15896383-15896599)
chr6 (177-396)||(21569767-21569986)
chr6 (290-405)||(21836964-21837079)
chr6 (243-396)||(8762709-8762862)
chr6 (305-396)||(20637077-20637168)
chr6 (290-396)||(18197504-18197610)
chr6 (59-209)||(8766111-8766261)
chr6 (62-384)||(16382161-16382483)
chr6 (53-384)||(25742876-25743207)
chr6 (8-210)||(18801059-18801261)
chr6 (62-384)||(18837696-18838018)
chr6 (334-400)||(22442710-22442776)
chr6 (11-111)||(18197608-18197708)
chr6 (53-171)||(15078365-15078483)
chr6 (62-384)||(23996419-23996741)
chr6 (62-170)||(1648786-1648894)
chr6 (53-384)||(16098212-16098543)
chr6 (53-384)||(18571813-18572144)
chr6 (65-171)||(21412939-21413045)
chr6 (62-139)||(16233380-16233457)
chr6 (281-366)||(23027522-23027607)
chr6 (92-171)||(1652274-1652353)
chr6 (263-384)||(21927577-21927698)
chr6 (264-384)||(1648602-1648722)
chr6 (194-342)||(14625068-14625216)
chr6 (17-90)||(11287680-11287753)
chr6 (60-169)||(25655651-25655760)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (1-396)||(53384888-53385283)
chr3 (1-407)||(15589251-15589657)
chr3 (1-407)||(20061913-20062319)
chr3 (1-407)||(10005465-10005871)
chr3 (1-407)||(16756444-16756850)
chr3 (1-407)||(10906075-10906481)
chr3 (1-407)||(16635638-16636044)
chr3 (1-407)||(43162962-43163368)
chr3 (1-407)||(48425312-48425718)
chr3 (1-405)||(12498113-12498517)
chr3 (1-405)||(15348106-15348510)
chr3 (7-405)||(16806787-16807185)
chr3 (1-405)||(5424791-5425195)
chr3 (1-405)||(13252555-13252959)
chr3 (1-405)||(14876360-14876764)
chr3 (1-405)||(15402371-15402775)
chr3 (1-405)||(16412143-16412547)
chr3 (1-405)||(26792260-26792664)
chr3 (1-407)||(6600612-6601007)
chr3 (10-405)||(15724795-15725190)
chr3 (1-402)||(16371278-16371679)
chr3 (1-405)||(15339134-15339538)
chr3 (1-405)||(16692025-16692433)
chr3 (1-396)||(17489715-17490110)
chr3 (11-396)||(9522594-9522979)
chr3 (1-396)||(16492051-16492446)
chr3 (95-402)||(11564545-11564852)
chr3 (1-396)||(15248012-15248407)
chr3 (1-396)||(15208756-15209151)
chr3 (116-396)||(14126464-14126744)
chr3 (157-402)||(15061777-15062022)
chr3 (11-388)||(15015634-15015999)
chr3 (62-396)||(15227585-15227919)
chr3 (17-396)||(13971979-13972358)
chr3 (17-396)||(14086564-14086943)
chr3 (59-396)||(11303632-11303969)
chr3 (8-396)||(15952827-15953215)
chr3 (53-393)||(28754245-28754585)
chr3 (59-396)||(17492563-17492900)
chr3 (17-396)||(12850138-12850517)
chr3 (53-395)||(8758942-8759284)
chr3 (53-395)||(41177449-41177791)
chr3 (59-395)||(16836370-16836706)
chr3 (58-396)||(13322511-13322849)
chr3 (86-396)||(14573889-14574199)
chr3 (59-396)||(12360401-12360738)
chr3 (53-393)||(10383896-10384235)
chr3 (65-393)||(13941963-13942291)
chr3 (53-390)||(4678365-4678702)
chr3 (35-395)||(44777156-44777516)
chr3 (56-297)||(11960992-11961233)
chr3 (53-393)||(47123871-47124211)
chr3 (62-395)||(16380788-16381121)
chr3 (59-386)||(18134215-18134542)
chr3 (56-396)||(16329520-16329858)
chr3 (53-393)||(10419907-10420247)
chr3 (17-288)||(13001800-13002070)
chr3 (59-300)||(26008948-26009189)
chr3 (242-396)||(16828061-16828215)
chr3 (176-396)||(16338371-16338591)
chr3 (62-384)||(8274281-8274603)
chr3 (62-383)||(15576686-15577007)
chr3 (62-384)||(16742585-16742907)
chr3 (53-377)||(18748592-18748916)
chr3 (1-171)||(14183007-14183177)
chr3 (62-139)||(13975172-13975249)
chr3 (53-136)||(6712539-6712622)
chr3 (235-384)||(6152733-6152882)
chr3 (214-384)||(13967222-13967392)
chr3 (65-139)||(17193033-17193107)
chr3 (65-139)||(6152978-6153052)
chr3 (257-351)||(17193224-17193318)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-407)||(109434-109840)
scaffold0029 (17-396)||(112852-113231)
scaffold0029 (53-396)||(95636-95979)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (1-407)||(10871230-10871636)
chr7 (1-407)||(18177977-18178383)
chr7 (1-405)||(15160688-15161092)
chr7 (1-407)||(8198863-8199269)
chr7 (1-407)||(44790980-44791386)
chr7 (1-405)||(13686299-13686703)
chr7 (1-405)||(11236844-11237248)
chr7 (1-405)||(18551389-18551793)
chr7 (1-405)||(8707840-8708244)
chr7 (1-405)||(14332632-14333036)
chr7 (1-405)||(16947-17351)
chr7 (1-407)||(11552731-11553137)
chr7 (1-405)||(9596292-9596696)
chr7 (1-407)||(12687736-12688142)
chr7 (1-407)||(14954855-14955261)
chr7 (1-399)||(15154294-15154687)
chr7 (1-285)||(23516520-23516804)
chr7 (56-396)||(14039986-14040326)
chr7 (56-396)||(14350016-14350356)
chr7 (1-396)||(11771881-11772276)
chr7 (26-396)||(21662221-21662591)
chr7 (11-396)||(15624797-15625182)
chr7 (53-396)||(12206418-12206761)
chr7 (38-396)||(13021630-13021988)
chr7 (59-396)||(15102221-15102558)
chr7 (17-396)||(11388046-11388425)
chr7 (53-396)||(14263862-14264205)
chr7 (59-396)||(6413805-6414142)
chr7 (56-393)||(8211749-8212086)
chr7 (35-396)||(16071912-16072273)
chr7 (50-395)||(18053572-18053917)
chr7 (53-393)||(11305884-11306224)
chr7 (53-393)||(49152589-49152929)
chr7 (61-396)||(14285994-14286329)
chr7 (38-395)||(14130146-14130503)
chr7 (11-276)||(15204124-15204389)
chr7 (56-396)||(16950089-16950429)
chr7 (53-393)||(23505491-23505831)
chr7 (59-396)||(13665831-13666168)
chr7 (38-395)||(14433964-14434321)
chr7 (59-396)||(1025-1362)
chr7 (11-240)||(35964646-35964875)
chr7 (35-396)||(19147481-19147842)
chr7 (35-396)||(20746880-20747241)
chr7 (38-396)||(12455975-12456333)
chr7 (53-339)||(23199418-23199704)
chr7 (8-393)||(26118226-26118611)
chr7 (56-393)||(13968289-13968626)
chr7 (281-407)||(23203242-23203368)
chr7 (281-407)||(23509369-23509495)
chr7 (59-395)||(15340725-15341061)
chr7 (8-284)||(12457022-12457298)
chr7 (55-384)||(14936636-14936965)
chr7 (65-384)||(7824199-7824518)
chr7 (65-384)||(27107426-27107745)
chr7 (53-384)||(21674185-21674516)
chr7 (65-384)||(15364239-15364558)
chr7 (194-384)||(4440356-4440546)
chr7 (53-342)||(45146842-45147131)
chr7 (263-384)||(17924148-17924269)
chr7 (269-377)||(23641951-23642059)
chr7 (68-139)||(12368473-12368544)
chr7 (54-108)||(12193844-12193898)
chr7 (236-358)||(15171642-15171764)
chr7 (313-392)||(40790-40869)
chr7 (53-171)||(13353438-13353556)
chr7 (302-360)||(17144936-17144994)
chr7 (7-51)||(14038048-14038092)
chr7 (7-51)||(14348078-14348122)
[»] chr2 (55 HSPs)
chr2 (1-407)||(16982029-16982435)
chr2 (1-407)||(16998877-16999283)
chr2 (1-407)||(17063594-17064000)
chr2 (1-407)||(17067252-17067658)
chr2 (1-407)||(9610013-9610419)
chr2 (1-407)||(10868727-10869133)
chr2 (1-405)||(44385731-44386135)
chr2 (1-407)||(27217893-27218299)
chr2 (1-405)||(24262247-24262651)
chr2 (1-405)||(24709910-24710314)
chr2 (1-405)||(27371146-27371550)
chr2 (1-405)||(22325018-22325422)
chr2 (19-405)||(41608547-41608933)
chr2 (11-396)||(23188895-23189279)
chr2 (1-402)||(24707647-24708048)
chr2 (1-402)||(21325431-21325832)
chr2 (1-402)||(24675366-24675767)
chr2 (1-407)||(21145201-21145596)
chr2 (1-393)||(23063954-23064346)
chr2 (7-402)||(22756630-22757023)
chr2 (1-242)||(16925137-16925378)
chr2 (1-377)||(24825472-24825848)
chr2 (11-396)||(45529398-45529783)
chr2 (62-396)||(30211088-30211422)
chr2 (1-243)||(24878319-24878561)
chr2 (17-396)||(27365250-27365629)
chr2 (59-396)||(23276711-23277048)
chr2 (59-396)||(23293893-23294230)
chr2 (245-407)||(16923010-16923172)
chr2 (243-407)||(16925479-16925643)
chr2 (59-396)||(19652223-19652557)
chr2 (250-405)||(20442675-20442830)
chr2 (238-405)||(24876911-24877078)
chr2 (56-393)||(20832917-20833254)
chr2 (61-395)||(12574290-12574624)
chr2 (53-395)||(27787670-27788012)
chr2 (53-393)||(31830587-31830927)
chr2 (92-393)||(20828227-20828528)
chr2 (56-384)||(11358057-11358385)
chr2 (62-393)||(1063689-1064020)
chr2 (99-396)||(24948564-24948861)
chr2 (27-285)||(23087353-23087611)
chr2 (215-393)||(21125331-21125509)
chr2 (308-396)||(23107901-23107989)
chr2 (281-396)||(23110892-23111007)
chr2 (242-396)||(24641860-24642014)
chr2 (62-384)||(22276217-22276538)
chr2 (235-384)||(25128758-25128907)
chr2 (61-329)||(23817291-23817559)
chr2 (53-384)||(24569851-24570182)
chr2 (62-384)||(24831370-24831692)
chr2 (53-384)||(22761752-22762083)
chr2 (62-171)||(12640315-12640424)
chr2 (53-170)||(25128576-25128693)
chr2 (95-171)||(23890753-23890829)
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (1-405)||(37291300-37291704)
chr5 (1-405)||(19770138-19770542)
chr5 (1-407)||(34566672-34567078)
chr5 (1-405)||(27668294-27668698)
chr5 (1-405)||(40708958-40709362)
chr5 (1-407)||(16356680-16357086)
chr5 (1-407)||(27518585-27518991)
chr5 (1-405)||(27685204-27685608)
chr5 (1-405)||(27610532-27610936)
chr5 (1-405)||(14999543-14999947)
chr5 (8-405)||(22332691-22333088)
chr5 (1-405)||(22134846-22135250)
chr5 (1-405)||(41771020-41771424)
chr5 (1-405)||(22348601-22349005)
chr5 (1-384)||(29475898-29476281)
chr5 (1-402)||(23573920-23574321)
chr5 (17-384)||(23516735-23517102)
chr5 (1-405)||(18775955-18776352)
chr5 (1-377)||(20798938-20799314)
chr5 (7-364)||(23440409-23440766)
chr5 (1-393)||(25423367-25423759)
chr5 (1-396)||(21339099-21339494)
chr5 (1-396)||(21497850-21498244)
chr5 (1-396)||(23471407-23471802)
chr5 (11-396)||(20467909-20468294)
chr5 (1-266)||(21984248-21984513)
chr5 (1-396)||(26738540-26738913)
chr5 (63-396)||(21563786-21564119)
chr5 (17-393)||(24749370-24749746)
chr5 (8-393)||(22502846-22503231)
chr5 (53-393)||(14886807-14887147)
chr5 (8-396)||(22235733-22236121)
chr5 (11-286)||(21405008-21405285)
chr5 (56-396)||(22381414-22381754)
chr5 (56-396)||(21831574-21831896)
chr5 (35-396)||(23079902-23080263)
chr5 (8-396)||(21890572-21890960)
chr5 (56-393)||(25848290-25848627)
chr5 (53-369)||(37545336-37545652)
chr5 (56-393)||(20342497-20342834)
chr5 (53-393)||(24798213-24798553)
chr5 (59-395)||(17269148-17269483)
chr5 (87-318)||(919-1150)
chr5 (53-360)||(22462164-22462471)
chr5 (158-393)||(24716342-24716577)
chr5 (93-396)||(28923581-28923884)
chr5 (164-393)||(24620111-24620340)
chr5 (93-396)||(20821705-20822008)
chr5 (93-384)||(20774012-20774302)
chr5 (105-396)||(28916226-28916517)
chr5 (93-396)||(28894755-28895058)
chr5 (164-396)||(21496481-21496713)
chr5 (282-396)||(21407597-21407711)
chr5 (65-384)||(21937013-21937332)
chr5 (62-384)||(24581432-24581753)
chr5 (63-384)||(27011306-27011627)
chr5 (17-138)||(24735682-24735803)
chr5 (236-384)||(25244175-25244323)
chr5 (236-384)||(25308327-25308475)
chr5 (62-171)||(11210732-11210841)
chr5 (74-141)||(21229241-21229308)
chr5 (53-351)||(23503655-23503952)
chr5 (236-297)||(16065604-16065665)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (1-405)||(51333187-51333591)
chr1 (1-405)||(16350293-16350697)
chr1 (1-405)||(19106628-19107032)
chr1 (1-405)||(33390723-33391127)
chr1 (1-405)||(17044709-17045113)
chr1 (1-405)||(21837211-21837615)
chr1 (1-405)||(21830564-21830968)
chr1 (1-366)||(41354202-41354567)
chr1 (1-405)||(16078350-16078750)
chr1 (1-384)||(50619959-50620342)
chr1 (18-396)||(16369575-16369953)
chr1 (11-396)||(19760569-19760954)
chr1 (1-278)||(20137039-20137316)
chr1 (1-268)||(20250111-20250378)
chr1 (147-396)||(21749348-21749597)
chr1 (176-396)||(22361947-22362167)
chr1 (56-393)||(37677396-37677733)
chr1 (59-393)||(19854633-19854966)
chr1 (8-396)||(20835591-20835979)
chr1 (59-398)||(22432817-22433156)
chr1 (59-392)||(20939770-20940103)
chr1 (56-393)||(20294728-20295065)
chr1 (125-396)||(24099306-24099577)
chr1 (63-326)||(41308148-41308411)
chr1 (1-141)||(21747795-21747935)
chr1 (53-384)||(20856476-20856807)
chr1 (92-396)||(19662844-19663143)
chr1 (149-393)||(31539703-31539947)
chr1 (271-396)||(20139361-20139486)
chr1 (314-384)||(20250376-20250446)
chr1 (65-384)||(20831107-20831426)
chr1 (53-384)||(20914523-20914854)
chr1 (53-144)||(31550136-31550227)
chr1 (235-384)||(22135272-22135421)
chr1 (359-404)||(41353357-41353402)
chr1 (53-137)||(22135520-22135604)
chr1 (242-351)||(20184683-20184792)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (1-405)||(18297451-18297855)
chr4 (1-407)||(8386658-8387064)
chr4 (1-407)||(12476846-12477252)
chr4 (1-407)||(29038764-29039170)
chr4 (1-405)||(27711582-27711986)
chr4 (1-407)||(12523922-12524328)
chr4 (1-405)||(14303340-14303744)
chr4 (1-403)||(19778157-19778559)
chr4 (1-407)||(14680813-14681219)
chr4 (1-405)||(8052985-8053389)
chr4 (5-405)||(40473290-40473690)
chr4 (1-405)||(23955993-23956397)
chr4 (1-402)||(16251810-16252211)
chr4 (1-405)||(18226808-18227212)
chr4 (1-396)||(16354816-16355211)
chr4 (28-402)||(15147249-15147623)
chr4 (1-399)||(7090678-7091076)
chr4 (1-399)||(1639793-1640191)
chr4 (1-298)||(14266368-14266665)
chr4 (1-396)||(14850737-14851132)
chr4 (26-396)||(8706189-8706559)
chr4 (53-396)||(15414657-15415000)
chr4 (35-396)||(15077915-15078276)
chr4 (61-396)||(1648908-1649243)
chr4 (53-396)||(15246222-15246565)
chr4 (206-396)||(14691353-14691543)
chr4 (56-393)||(3264428-3264765)
chr4 (56-393)||(29453171-29453508)
chr4 (8-396)||(15002995-15003383)
chr4 (56-396)||(20891283-20891623)
chr4 (59-396)||(15358721-15359058)
chr4 (56-393)||(11206865-11207202)
chr4 (1-218)||(14159738-14159955)
chr4 (53-396)||(27900684-27901027)
chr4 (8-396)||(33223171-33223564)
chr4 (56-393)||(44661500-44661837)
chr4 (1-201)||(14652554-14652754)
chr4 (255-396)||(14159970-14160111)
chr4 (59-300)||(16146216-16146459)
chr4 (245-396)||(15319641-15319792)
chr4 (35-204)||(15070693-15070862)
chr4 (62-384)||(14997623-14997945)
chr4 (53-210)||(51605998-51606155)
chr4 (65-342)||(13247955-13248232)
chr4 (53-342)||(12342548-12342837)
chr4 (53-171)||(15293013-15293131)
chr4 (1-53)||(16676417-16676469)
chr4 (53-384)||(9291133-9291464)
chr4 (53-171)||(55375214-55375332)
chr4 (253-393)||(18549694-18549834)
chr4 (53-139)||(12132298-12132383)
chr4 (59-171)||(16685557-16685669)
chr4 (257-296)||(15423974-15424013)
chr4 (23-138)||(18549949-18550064)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-407)||(43431-43837)
scaffold0028 (1-405)||(8762-9155)
scaffold0028 (18-405)||(15241-15617)
scaffold0028 (17-396)||(50148-50527)
scaffold0028 (65-377)||(106226-106538)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (1-405)||(691-1095)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (1-405)||(19113002-19113406)
chr8 (1-403)||(17674090-17674492)
chr8 (7-386)||(15533698-15534077)
chr8 (1-405)||(18856889-18857293)
chr8 (1-384)||(22133127-22133510)
chr8 (1-405)||(22120239-22120643)
chr8 (1-405)||(30313209-30313613)
chr8 (1-366)||(19484974-19485339)
chr8 (1-405)||(22046685-22047089)
chr8 (1-405)||(32600456-32600860)
chr8 (1-384)||(16408131-16408514)
chr8 (1-355)||(20017865-20018219)
chr8 (1-405)||(22040171-22040575)
chr8 (1-384)||(22164278-22164660)
chr8 (1-396)||(21921809-21922204)
chr8 (1-405)||(19978279-19978683)
chr8 (1-402)||(21166606-21167006)
chr8 (1-396)||(23650353-23650748)
chr8 (1-396)||(21251253-21251648)
chr8 (1-396)||(21788433-21788827)
chr8 (1-396)||(21393939-21394334)
chr8 (1-396)||(22377528-22377922)
chr8 (1-396)||(22383703-22384097)
chr8 (1-394)||(23949232-23949624)
chr8 (9-396)||(22987521-22987903)
chr8 (11-396)||(20396199-20396584)
chr8 (62-384)||(20388472-20388794)
chr8 (35-384)||(19851757-19852106)
chr8 (35-384)||(19857793-19858142)
chr8 (59-396)||(20975725-20976062)
chr8 (59-396)||(31416548-31416885)
chr8 (53-396)||(23655291-23655634)
chr8 (53-393)||(14565506-14565846)
chr8 (59-396)||(1266608-1266945)
chr8 (59-395)||(22051233-22051569)
chr8 (56-396)||(29303500-29303840)
chr8 (56-393)||(803750-804087)
chr8 (56-393)||(16271301-16271638)
chr8 (59-396)||(22061507-22061844)
chr8 (53-395)||(31570917-31571259)
chr8 (56-393)||(6679478-6679815)
chr8 (56-393)||(12305125-12305462)
chr8 (35-396)||(21840763-21841124)
chr8 (56-393)||(6604025-6604362)
chr8 (35-396)||(20009974-20010335)
chr8 (120-396)||(22371371-22371647)
chr8 (176-393)||(27355035-27355252)
chr8 (278-405)||(22129005-22129132)
chr8 (62-384)||(21850423-21850745)
chr8 (62-384)||(16877181-16877503)
chr8 (53-384)||(22315555-22315886)
chr8 (65-384)||(21196588-21196907)
chr8 (53-384)||(23157098-23157428)
chr8 (56-384)||(22982801-22983128)
chr8 (53-168)||(20652635-20652750)
chr8 (359-404)||(19484130-19484175)
chr8 (235-384)||(23900822-23900971)
chr8 (272-398)||(19863639-19863765)
chr8 (272-398)||(19868276-19868402)
chr8 (89-138)||(19863457-19863506)
chr8 (89-138)||(19868094-19868143)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-405)||(14637-15041)
scaffold0044 (1-405)||(897-1301)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-405)||(7216-7620)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-405)||(12764-13168)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (1-405)||(7674-8078)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (1-405)||(8067-8471)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (1-405)||(4030-4434)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-405)||(8873-9277)
scaffold0109 (1-405)||(33198-33602)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-405)||(65682-66086)
scaffold0042 (1-384)||(39466-39848)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (1-405)||(17719-18122)
scaffold0106 (17-396)||(14332-14711)
scaffold0106 (53-396)||(31739-32082)
scaffold0106 (328-396)||(18489-18557)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (7-405)||(22150-22548)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (1-396)||(6649-7044)
scaffold0403 (86-391)||(3153-3458)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-405)||(7654-8047)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (1-402)||(278458-278859)
scaffold0005 (59-395)||(260643-260979)
scaffold0005 (1-201)||(164538-164738)
scaffold0005 (1-46)||(308936-308981)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-401)||(6291-6691)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (1-396)||(6300-6695)
scaffold0120 (59-396)||(1158-1495)
scaffold0120 (53-110)||(23023-23080)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-402)||(451-852)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-402)||(63659-64060)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-396)||(5498-5893)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (1-398)||(953-1350)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (11-384)||(6336-6709)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (1-396)||(328-723)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (1-396)||(229320-229715)
scaffold0012 (1-396)||(219051-219446)
scaffold0012 (236-360)||(32667-32791)
scaffold0012 (62-171)||(32856-32965)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (38-396)||(10-368)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (7-396)||(15938-16327)
scaffold0333 (7-61)||(15775-15829)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (1-396)||(49770-50165)
scaffold0081 (243-402)||(19121-19280)
scaffold0081 (302-402)||(34604-34704)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (17-396)||(9636-10015)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-402)||(180494-180877)
scaffold0020 (118-396)||(101186-101464)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (47-396)||(7963-8311)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (11-396)||(1552-1937)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-396)||(15154-15549)
scaffold0040 (164-396)||(113121-113353)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (27-276)||(46531-46780)
scaffold0007 (11-386)||(86154-86523)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (2-396)||(9248-9642)
scaffold0507 (53-168)||(216-331)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (11-396)||(14713-15098)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (11-396)||(25353-25738)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (14-399)||(4085-4470)
scaffold0023 (108-396)||(130532-130820)
scaffold0023 (69-396)||(59099-59426)
scaffold0023 (246-402)||(29008-29163)
scaffold0023 (108-210)||(134626-134728)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (33-384)||(1308-1659)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-396)||(32387-32781)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (11-396)||(1195-1580)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (104-402)||(197106-197404)
scaffold0017 (53-171)||(21927-22045)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (1-396)||(26167-26562)
scaffold0011 (59-396)||(195338-195674)
scaffold0011 (59-392)||(148905-149238)
scaffold0011 (53-171)||(180253-180371)
scaffold0011 (65-139)||(121841-121915)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-396)||(16050-16445)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (11-396)||(112308-112693)
scaffold0004 (56-396)||(203102-203442)
scaffold0004 (59-396)||(117903-118240)
scaffold0004 (35-396)||(386130-386491)
scaffold0004 (59-396)||(323039-323376)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (17-399)||(24702-25084)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (11-396)||(5225-5610)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (11-396)||(116539-116924)
scaffold0037 (62-321)||(98353-98612)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (1-392)||(4309-4699)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (164-402)||(4727-4965)
scaffold0761 (53-384)||(32-363)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (56-396)||(3472-3812)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (1-374)||(12633-13006)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (1-318)||(126911-127228)
scaffold0022 (205-396)||(80128-80319)
[»] scaffold0894 (2 HSPs)
scaffold0894 (1-273)||(1416-1688)
scaffold0894 (264-396)||(2914-3046)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (155-402)||(3442-3689)
scaffold0375 (1-55)||(3694-3748)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (156-396)||(19636-19876)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (54-320)||(1-267)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (116-396)||(18839-19119)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (8-396)||(90566-90954)
scaffold0001 (164-396)||(390834-391066)
scaffold0001 (86-339)||(114542-114795)
scaffold0001 (1-180)||(448336-448515)
scaffold0001 (311-396)||(89888-89973)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (8-396)||(27509-27897)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (17-396)||(33311-33690)
scaffold0076 (65-384)||(40599-40918)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-182)||(628-809)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (143-392)||(2340-2589)
scaffold0010 (59-393)||(41970-42304)
scaffold0010 (59-396)||(47033-47370)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (81-396)||(28402-28717)
scaffold0064 (81-396)||(40393-40708)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (38-396)||(20297-20655)
scaffold0298 (61-396)||(12995-13330)
scaffold0298 (61-396)||(16765-17100)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (35-396)||(10104-10465)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (8-396)||(5034-5422)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (214-396)||(25464-25646)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (35-396)||(4186-4547)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (38-396)||(43097-43455)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (38-396)||(248927-249285)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (59-396)||(19455-19792)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (8-396)||(18171-18559)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (8-396)||(47408-47796)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (8-396)||(13535-13923)
scaffold0034 (61-396)||(4587-4922)
scaffold0034 (251-396)||(67897-68042)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (17-396)||(821-1200)
scaffold0104 (329-396)||(12582-12649)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (38-396)||(40053-40410)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (35-396)||(2105-2466)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (35-396)||(48841-49202)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-396)||(51497-51882)
[»] scaffold0235 (4 HSPs)
scaffold0235 (59-396)||(21305-21642)
scaffold0235 (65-171)||(26147-26253)
scaffold0235 (206-342)||(26288-26424)
scaffold0235 (323-396)||(11091-11164)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (59-396)||(51814-52150)
scaffold0067 (59-396)||(60848-61184)
scaffold0067 (59-396)||(67236-67572)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (47-396)||(48668-49016)
scaffold0053 (59-336)||(57511-57788)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (53-396)||(199-541)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (35-366)||(27830-28161)
scaffold0139 (35-392)||(787-1144)
scaffold0139 (242-366)||(34290-34414)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (59-393)||(2992-3326)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (62-396)||(26480-26814)
scaffold0192 (62-396)||(26862-27196)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (59-396)||(6872-7209)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (63-396)||(6523-6856)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (56-393)||(16350-16687)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (17-396)||(6670-7049)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (38-396)||(11083-11441)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (11-345)||(10425-10759)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (1-383)||(37479-37861)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (167-396)||(11302-11531)
scaffold0149 (176-396)||(6871-7091)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (59-396)||(3086-3423)
scaffold0035 (272-393)||(12833-12954)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (59-396)||(433-770)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (155-396)||(2509-2750)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (7-396)||(26544-26933)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (38-396)||(5086-5444)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (59-396)||(5548-5885)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (59-396)||(43840-44177)
scaffold0114 (59-396)||(44852-45189)
scaffold0114 (38-339)||(20436-20737)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (1-197)||(279-475)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (60-396)||(5969-6307)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (53-384)||(19178-19509)
scaffold0090 (53-384)||(23340-23671)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (63-384)||(25511-25832)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (35-395)||(12420-12776)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (101-383)||(4945-5227)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (245-396)||(1988-2139)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (61-396)||(38-368)
scaffold0124 (61-396)||(11225-11560)
scaffold0124 (62-384)||(7456-7778)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (53-331)||(9782-10060)
scaffold0483 (290-396)||(12060-12166)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (155-396)||(41350-41589)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (68-384)||(880-1196)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (242-395)||(844-997)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (115-384)||(1618-1887)
scaffold0249 (63-120)||(4912-4969)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (8-358)||(173-523)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (59-287)||(13994-14222)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (1-187)||(17264-17450)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (178-396)||(4884-5102)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (53-384)||(7497-7828)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-120)||(16375-16494)
scaffold0138 (323-396)||(8721-8794)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (278-396)||(4425-4543)
scaffold0270 (278-396)||(11555-11673)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (194-396)||(68225-68427)
scaffold0066 (62-384)||(46492-46814)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (156-396)||(32953-33193)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (242-357)||(17877-17992)
scaffold0244 (53-228)||(25959-26134)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (35-188)||(5756-5909)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (311-396)||(39645-39730)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (62-384)||(23732-24054)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (65-384)||(3521-3840)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (323-402)||(24097-24176)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (269-392)||(81470-81593)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (92-204)||(136278-136390)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (53-384)||(3488-3818)
[»] scaffold0305 (2 HSPs)
scaffold0305 (235-377)||(11167-11309)
scaffold0305 (53-139)||(10985-11071)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (56-156)||(38761-38861)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (38-170)||(71533-71665)
scaffold0021 (269-384)||(33059-33174)
scaffold0021 (290-384)||(24529-24623)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (65-384)||(14383-14702)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (242-384)||(5693-5835)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (194-384)||(9507-9697)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (214-384)||(18541-18711)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (65-384)||(14478-14798)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (53-161)||(1293-1401)
scaffold0117 (214-342)||(1112-1240)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (56-384)||(24212-24540)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (65-384)||(13249-13568)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (53-171)||(9316-9434)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (62-384)||(3590-3912)
[»] scaffold0808 (2 HSPs)
scaffold0808 (257-384)||(700-827)
scaffold0808 (53-171)||(913-1031)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (205-384)||(3565-3744)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (65-169)||(2897-3001)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (65-173)||(8748-8856)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (205-384)||(44019-44198)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (53-384)||(27912-28243)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (92-171)||(17-96)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (53-139)||(14852-14938)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (323-396)||(2187-2260)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (311-396)||(470-555)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (281-377)||(19-115)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 27187546 - 27187952
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27187546 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgacca 27187645  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187646 tacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 27187745  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27187746 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 27187845  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27187846 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctcc 27187945  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  27187946 ttgatgt 27187952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27261694 - 27261288
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27261694 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgacca 27261595  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261594 tacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 27261495  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27261494 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 27261395  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27261394 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctcc 27261295  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  27261294 ttgatgt 27261288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1543255 - 1542849
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1543255 catcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttatgcatctccgacca 1543156  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1543155 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgct 1543056  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1543055 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcga 1542956  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  1542955 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 1542856  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    || ||||    
T  1542855 ttaatgt 1542849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28292543 - 28292137
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28292543 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 28292444  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28292443 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaatggaagatgactgtccgaagttcctccttgct 28292344  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28292343 caagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 28292244  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  28292243 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctct 28292144  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  28292143 ttgatgt 28292137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24313339 - 24312935
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24313339 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 24313240  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24313239 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgtt 24313140  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24313139 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 24313040  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  24313039 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 24312940  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  24312939 ttgat 24312935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 2874974 - 2874570
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2874974 catccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacccgactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgacca 2874875  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874874 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 2874775  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2874774 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcga 2874675  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||    
T  2874674 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaagttcacaatctcc 2874575  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  2874574 ttgat 2874570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28263368 - 28262962
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  28263368 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgacca 28263269  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28263268 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgct 28263169  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28263168 caagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 28263069  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||     
T  28263068 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctct 28262969  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  28262968 ttgatgt 28262962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28342117 - 28341711
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  28342117 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgacca 28342018  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28342017 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgct 28341918  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28341917 caagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 28341818  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||     
T  28341817 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctct 28341718  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  28341717 ttgatgt 28341711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 25112662 - 25113066
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25112662 catctgaactttctcagtagtttgctgaacgatcgctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcataacggaattctgcatctccgacca 25112761  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25112762 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 25112861  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25112862 caagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataggccgaacttaatctcaacttcga 25112961  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  25112962 acccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 25113061  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  25113062 ttgat 25113066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 29592091 - 29591687
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29592091 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 29591992  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29591991 tacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 29591892  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29591891 cgagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcactctcaacttcga 29591792  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||    
T  29591791 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagggacaccatgcaacttcacaatctcc 29591692  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  29591691 ttgat 29591687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16626888 - 16626484
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16626888 catctgaactttctcaatagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16626789  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626788 tacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16626689  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  16626688 caagaacacaaattttcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcatctttga 16626589  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  16626588 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 16626489  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  16626488 ttgat 16626484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 8 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 5839383 - 5838986
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5839383 actttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccaccctatctcctgattcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgaccatacaaag 5839284  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5839283 cctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactattattatacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccctgctcaagaac 5839184  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5839183 acaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaa 5839084  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 405  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5839083 gcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctaactgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttgat 5838986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 19864797 - 19865198
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19864797 catcttaaccttctcagtagtctgctgaccaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 19864896  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19864897 tataaagccgcaaaaggtgccattccaataccaaaatgataactattattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactagcccaggttcctccttgct 19864996  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19864997 caagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctatccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttaga 19865096  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||    
T  19865097 acccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgtaggaacaccatgaaacttcacaatctcc 19865196  T
Q  401 tt 402  Q
    ||    
T  19865197 tt 19865198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25610032 - 25609640
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25610032 catcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgacca 25609933  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25609932 tacaaagcatcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 25609833  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  25609832 caagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttaga 25609733  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  25609732 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcac 25609640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 22433979 - 22434378
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22433979 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 22434078  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22434079 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtaagtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgct 22434178  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  22434179 caagtacacaaaccctcaacaaatcttctaacgacttaatcgtcctctccgactaatcatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttaga 22434278  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  22434279 acccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatccagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttcc 22434378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 27331598 - 27331209
Alignment:
Q  7 aactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27331598 aactttctcagtagtttgttgaacattctcgggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa 27331499  T
Q  107 gcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaa 206  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27331498 gcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagca 27331399  T
Q  207 cacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaa 306  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | |||    
T  27331398 cacaaaccctcaacaagtcctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaa 27331299  T
Q  307 agcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  27331298 agcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 27331209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 27392338 - 27391949
Alignment:
Q  7 aactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27392338 aactttctcagtagtttgttgaacattctcgggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa 27392239  T
Q  107 gcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaa 206  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27392238 gcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagca 27392139  T
Q  207 cacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaa 306  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | |||    
T  27392138 cacaaaccctcaacaagtcctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaa 27392039  T
Q  307 agcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  27392038 agcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 27391949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16927804 - 16927416
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927804 actttccctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 16927705  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| || ||    
T  16927704 cctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattgttatacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagttccagcttgctctagcac 16927605  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||    
T  16927604 acaaatcctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttggtacctaaa 16927505  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  16927504 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcgggtctctatttgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaat 16927416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 2 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 18408113 - 18407718
Alignment:
Q  2 atctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccat 101  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408113 atcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaataccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccat 18408014  T
Q  102 acaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatta-taagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408013 ataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactagtatttgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 18407914  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  18407913 caagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccctctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 18407814  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18407813 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagacgtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 18407718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22078859 - 22078478
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22078859 catcttaaccttctcagtggtttgttgaacaatctctagtcctaagaccactttttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 22078760  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22078759 tacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa--ataactattattgtacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 22078662  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    | ||  |||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  22078661 cgagttcacaaactttcaacaaatcttccagcgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 22078562  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22078561 gcctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatg 22078478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22762626 - 22762231
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22762626 catcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 22762527  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  22762526 cacaaagtctcgtaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatctcaagttcctccttcct 22762427  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |    
T  22762426 caagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatcagtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttata 22762327  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22762326 acctaaagcctctggcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 22762231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16963531 - 16963155
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963531 actttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaatcaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 16963432  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| || ||    
T  16963431 cctcataaggtgccattccaatactagaatgatagctattgttagacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagtttcaccttgctctagcac 16963332  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    |||||| || ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||    
T  16963331 acaaatccttaacaaattctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttggtacctaaa 16963232  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16963231 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcgggtctctatctgatataatgctcgaaggaacaccatg 16963155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 23078579 - 23078974
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23078579 catcttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttatgcatctccgacca 23078678  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078679 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctataaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 23078778  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |  || | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  |    
T  23078779 caagtacacaaactctcaacaagtattccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctctctgcggacgatacgccgaactcaacctcaacttata 23078878  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23078879 acctaaagactcttgtaaactcttcaaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 23078974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 97 - 384
Target Start/End: Original strand, 17032589 - 17032876
Alignment:
Q  97 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 196  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032589 accatataaagcttcaaaaggtgccattctgatactagaatgataactattagtgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 17032688  T
Q  197 tgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 296  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17032689 tgttcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaact 17032788  T
Q  297 tcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032789 tcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 17032876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 12498136 - 12498326
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498136 catcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 12498235  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 191  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498236 tacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12498326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12510765 - 12510575
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510765 catcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 12510666  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 191  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510665 tacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12510575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Original strand, 25768311 - 25768696
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    ||||| |||||||| ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  25768311 ttctccgtagtttgatgaactaaatccggtccaaagaccacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccacacaaagctt 25768410  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| || |  || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  25768411 cgaacggtgccataccaatactcgaatggtaacagttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagcacaca 25768510  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
     | ||| | ||||||||| |  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||     
T  25768511 cactcttagcaaatcctcgaatgactgaatcgttttctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggca 25768610  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  25768611 tcttggaaactcttccaaaatcttgaattaaacctcggatctctatcggacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaat 25768696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 61 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14381578 - 14381243
Alignment:
Q  61 tgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaac 160  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||||    
T  14381578 tgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaac 14381479  T
Q  161 tcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccat 260  Q
    || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |  || |||||||||||||||||||    
T  14381478 tctatcaacggtaggtgactgtcccaagttccaccttgcttaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgatttgatcgtcctctccgactgaccat 14381379  T
Q  261 ctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 360  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||  ||    
T  14381378 ctgtctgaggatgataagctgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctattcga 14381279  T
Q  361 tacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  14381278 cacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 14381243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 34645741 - 34645362
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || |    
T  34645741 gtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcatctgcgaccatacaatgcttcaaacg 34645642  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| |  || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |  ||    
T  34645641 gtgccataccaatactcgaatggtaactattgttataagtaaattctatcaacggtaagtggctatcccacgctccaccttgctcaagtacacataccct 34645542  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
     | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||     
T  34645541 tagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgt 34645442  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  34645441 aaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttggatccctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 34645362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 19453530 - 19453925
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  19453530 catcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgacca 19453629  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || | |||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||    
T  19453630 tacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaattgttgttgtatgcgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgct 19453729  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||| | ||||   |||||||| |  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19453730 caagcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcga 19453829  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19453830 acccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 19453925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 53 - 331
Target Start/End: Original strand, 1640934 - 1641212
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || |    
T  1640934 ctttcacccgacttaaaccaacataacggagttctgcacctccgtccatgcaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgt 1641033  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  1641034 atgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccga 1641133  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1641134 ctgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaat 1641212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 12505465 - 12505655
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505465 catcttaacattctcagtagtatgatgaacaatctcgggtcctaagaccaatctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 12505564  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 191  Q
    || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505565 taaaaaacctcaaaaggtgacattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Original strand, 19879424 - 19879803
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || | ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || || |    
T  19879424 gtagtttgttgaactatgtctggccccaacatcacactttctcccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccatacaatgcttcaaacg 19879523  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||    
T  19879524 gtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccct 19879623  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    ||| | ||||||||  || || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19879624 caatagatcctctaaggattgtatcgtcctctctgactgtccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcttgc 19879723  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  19879724 aaactcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 19879803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 60 - 396
Target Start/End: Original strand, 17415655 - 17415991
Alignment:
Q  60 ctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaa 159  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||| ||||| || || || || || |||||    
T  17415655 ctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcatatcaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaa 17415754  T
Q  160 ctcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacca 259  Q
    ||| ||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||| |  || || || ||||||| ||||||||||    
T  17415755 ctctatcgacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcagcaaatcctccaatgattggatcgtcctcttcgactgacca 17415854  T
Q  260 tctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctg 359  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  17415855 tctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccg 17415954  T
Q  360 atacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17415955 acacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 17415991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 396
Target Start/End: Original strand, 21471763 - 21472106
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || |    
T  21471763 ctttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgtccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgt 21471862  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| |  || |||||||  |||||||| || |||||| |    
T  21471863 acgtgaactctatcaacggtaaatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagaaagtcctctaatgactgaatagttctctccca 21471962  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||    
T  21471963 ctgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatct 21472062  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21472063 ctatccgacacaatactcgatggaactccatgaaacttcacaat 21472106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21564286 - 21563908
Alignment:
Q  18 tagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaagg 117  Q
    |||| |||||||| || |||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  21564286 tagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtccggcacctccgaccgtacaaagcttcgaacgg 21564187  T
Q  118 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 217  Q
      |||| |||||||| ||||| || |||||  | || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||    
T  21564186 aaccataccaatactcgaatggtaactattgatgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatactctc 21564087  T
Q  218 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 317  Q
    | |||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  21564086 agcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgca 21563987  T
Q  318 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||    
T  21563986 aactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaagcttaacaat 21563908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28282932 - 28282590
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  28282932 ctttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgt 28282833  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||    
T  28282832 aggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccga 28282733  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||     
T  28282732 ctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcc 28282633  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28282632 ctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 28282590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11280660 - 11280277
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || || || |    
T  11280660 gtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgatcatacaatgcttcaaacg 11280561  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||    
T  11280560 gtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaattctgtcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccct 11280461  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    ||| | ||| ||||  || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11280460 caaaagatcttctaaggattgcattgtcctctctgactggccatcggtctgaggatggtaagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgc 11280361  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| | |||||||||||||    
T  11280360 aaactcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgatgtaataccatgcaacttcacaatttcc 11280277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 53 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 27560736 - 27560394
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  27560736 ctttctcctgattcaaaccaacacaatggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgt 27560637  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||    
T  27560636 aggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccga 27560537  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||     
T  27560536 ctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcc 27560437  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27560436 ctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27560394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 10468965 - 10468625
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  10468965 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 10468866  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||| | | |||||||| || ||||| |  ||||||||||| || |  || || || ||||||||||||||    
T  10468865 tgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagcttcaccttgctcgagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactg 10468766  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||    
T  10468765 accatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccaaaacctagaggtgaacctcggatcccta 10468666  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  10468665 tccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 10468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25765454 - 25765312
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765454 actttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactttttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaag 25765355  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25765354 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattatt 25765312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22796745 - 22796408
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  22796745 cctgactcaaatcaacataaaggagtcctgcacctccgaccgtacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtga 22796646  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22796645 actctatcaacggtaggtgactatcccaatctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctgacgattgaatcgttctctccgactgacc 22796546  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    || ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||     
T  22796545 atatgtttgcgaatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatcc 22796446  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  22796445 gacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 22796408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 69 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 5297308 - 5296982
Alignment:
Q  69 accagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaa 168  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||    
T  5297308 accagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaa 5297209  T
Q  169 cggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgc 268  Q
    ||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  5297208 cggtaggtgactatccca-gctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctga 5297110  T
Q  269 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 368  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  5297109 ggatgataagccgaacccaacctcaatttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatac 5297010  T
Q  369 tcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5297009 tcgaaggaactccatgtagcttcacaat 5296982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 393
Target Start/End: Original strand, 24364583 - 24364914
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||    
T  24364583 gactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacgatgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaact 24364682  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24364683 caatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaacgattgaatcgtcctctccgactgaccatc 24364782  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||     
T  24364783 tgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctattcgac 24364882  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  24364883 acaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 24364914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 27560086 - 27559765
Alignment:
Q  74 cacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaa 173  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| |    
T  27560086 cacaatggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaacggta 27559987  T
Q  174 gatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 273  Q
    | ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27559986 ggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatg 27559887  T
Q  274 atatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaa 373  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  27559886 ataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaa 27559787  T
Q  374 ggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  27559786 ggaactccatgtagcttcacaa 27559765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 53 - 396
Target Start/End: Original strand, 18794852 - 18795195
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
T  18794852 ctttctcctaactcaaaccaacacaaaggagttatgcaccttcgaccgtacaaggcttcaaatggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgt 18794951  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || |||||||||||    
T  18794952 aggtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccga 18795051  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
     |||||||| || || |||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  18795052 ttgaccatccgtatgaggatgataagccaaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaacgcttccataatctagaagtgaacctcggatct 18795151  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  18795152 ctatctgacacagtactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 18795195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Original strand, 15459498 - 15459838
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || ||||||||||| || |  ||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |    
T  15459498 ctttctcccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttattgt 15459597  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || |  ||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  15459598 atgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatcctctaaagattggattgtcctctccga 15459697  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  15459698 ctgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacttcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtct 15459797  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  15459798 ctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcac 15459838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 180 - 396
Target Start/End: Original strand, 15896383 - 15896599
Alignment:
Q  180 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 279  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || | |||||||||  | || |||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  15896383 tatcccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcattctttccgactgattatctgtctgcggatgatacgc 15896482  T
Q  280 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 379  Q
    |||||||||  ||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15896483 cgaactcaacttcaacttagaacctacagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtatacctcacatctctatctgatacaatgctcgacggaaca 15896582  T
Q  380 ccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||||    
T  15896583 ccatgtagcttcacaat 15896599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 177 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21569986 - 21569767
Alignment:
Q  177 gactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 276  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21569986 gactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 21569887  T
Q  277 tgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagga 376  Q
     | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  |     
T  21569886 agtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccgt 21569787  T
Q  377 acaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  21569786 acaccatgaagcttaacaat 21569767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 290 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21837079 - 21836964
Alignment:
Q  290 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 389  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21837079 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaact 21836980  T
Q  390 tcacaatttccttgat 405  Q
    ||||||| ||||||||    
T  21836979 tcacaatctccttgat 21836964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 243 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8762862 - 8762709
Alignment:
Q  243 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  8762862 tcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaa 8762763  T
Q  343 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  8762762 cctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacgccatgtagcttcacaat 8762709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 305 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20637168 - 20637077
Alignment:
Q  305 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20637168 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 20637077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 290 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 18197610 - 18197504
Alignment:
Q  290 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 389  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18197610 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgatggaacaccatgtagct 18197511  T
Q  390 tcacaat 396  Q
    |||||||    
T  18197510 tcacaat 18197504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8766261 - 8766111
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||    
T  8766261 cctgactcaaaccagcataaatgagtcctgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtga 8766162  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacac 209  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8766161 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagaacac 8766111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16382483 - 16382161
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  16382483 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 16382384  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  16382383 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 16382284  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| ||     
T  16382283 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 16382184  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  16382183 acaatactagaaggaataccatg 16382161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25743207 - 25742876
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | || || || |    
T  25743207 ctttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacagctccgaccatacaaagcctcaaacggagccattccaatactagaatgaaaactgttgttgt 25743108  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    ||  || ||||||||||     
T  25743107 aagtaaactcaattaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctagatagtcctctccgt 25743008  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || |  || |||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||| ||  ||||     
T  25743007 ctgcccatcggtctgaggatggtaagtagatctcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaactctcccaaaacgtagaagtaaacctcagatcc 25742908  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25742907 cgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25742876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Original strand, 18801059 - 18801261
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18801059 actttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaag 18801158  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || || || || ||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| || ||    
T  18801159 cttcgaacgaggccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtaaatgaactctataaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctctagtac 18801258  T
Q  208 aca 210  Q
    |||    
T  18801259 aca 18801261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18838018 - 18837696
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||| | || || || ||||| ||||    
T  18838018 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattcggatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaact 18837919  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  18837918 caatcaatggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 18837819  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| ||     
T  18837818 ggtctgaggatggtaagcagaactcaaactcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaagtaaacctcggatcccgatccgac 18837719  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  18837718 acaatactagaaggaataccatg 18837696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 334 - 400
Target Start/End: Original strand, 22442710 - 22442776
Alignment:
Q  334 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  22442710 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttcc 22442776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 18197708 - 18197608
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    ||||||||||| || | ||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18197708 ttctcagtagtctgttaaacaatcgctggtcctaaaaccacattctcacctgacttaaacgaacacaacggagttctgcacctccgaccatacaaagcct 18197609  T
Q  111 c 111  Q
    |    
T  18197608 c 18197608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15078483 - 15078365
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || || || |    
T  15078483 ctttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcttacacctccgatcatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaactgttgttgt 15078384  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacgg 171  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  15078383 aagtaaactcaatcaacgg 15078365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Original strand, 23996419 - 23996741
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  23996419 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaggcctcaaacagtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 23996518  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| | |      || |||    | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||  ||| |||||    
T  23996519 caatcaacggtaaacattcgtctcaaccaacaccttgctctaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccatctgcccatc 23996618  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| ||  |||| | ||||||     
T  23996619 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcagatcccgatctgac 23996718  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  23996719 acaatactagaaggaataccatg 23996741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1648894 - 1648786
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  1648894 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 1648795  T
Q  162 cgatcaacg 170  Q
    | |||||||    
T  1648794 caatcaacg 1648786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Original strand, 16098212 - 16098543
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||| |  | || || |    
T  16098212 ctttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggagccataccgatactagaatgaaaattgttgttgt 16098311  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  | ||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||        
T  16098312 aagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactaacaccttgctccaacatacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctcttttt 16098411  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||     
T  16098412 ctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcc 16098511  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    | |||||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  16098512 cgatctgacacaatactagaaggtataccatg 16098543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Original strand, 18571813 - 18572144
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | || || || |||| ||||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||| | || || || |    
T  18571813 ctttcacctgactcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagtcattccgatactagaatgaaaactgttgttgt 18571912  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| || ||| | | ||     |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |     || || ||||||||||     
T  18571913 aagtaaactcaattaactgtaaatattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactttggatagtcctctccgt 18572012  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
     |  ||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||     
T  18572013 tttcccatcggtctgaggatggtaagcagaaatcaatctcaacttggttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcc 18572112  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
      |||||| ||||| ||  |||||| ||||||    
T  18572113 tgatctgacacaatactataaggaataccatg 18572144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21413045 - 21412939
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||| |||||||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  21413045 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacagtgccataccgatattagaatgaaaactgttattgtaagtaaactcaa 21412946  T
Q  165 tcaacgg 171  Q
    |||||||    
T  21412945 tcaacgg 21412939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 139
Target Start/End: Original strand, 16233380 - 16233457
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 139  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  16233380 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacaccttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatga 16233457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23027607 - 23027522
Alignment:
Q  281 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 366  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  23027607 gaactcaacctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatccctatctgacacaat 23027522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 171
Target Start/End: Original strand, 1652274 - 1652353
Alignment:
Q  92 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 171  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  1652274 ctccgaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 1652353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 384
Target Start/End: Original strand, 21927577 - 21927698
Alignment:
Q  263 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 362  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  21927577 gtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaatgcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 21927676  T
Q  363 caatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  21927677 caatactagaaggaataccatg 21927698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1648722 - 1648602
Alignment:
Q  264 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 363  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||    
T  1648722 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacac 1648623  T
Q  364 aatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||| || ||||||| ||||||    
T  1648622 aatactagaaggaataccatg 1648602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14625216 - 14625068
Alignment:
Q  194 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 293  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  14625216 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcatctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 14625117  T
Q  294 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 342  Q
    | || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  14625116 atttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 14625068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 11287753 - 11287680
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgca 90  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11287753 gtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgca 11287680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 169
Target Start/End: Original strand, 25655651 - 25655760
Alignment:
Q  60 ctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaa 159  Q
    ||||||||||||| |||||||   | || || ||||||||||||||| |||| ||||||  |||| | |||||||||||| | || || || ||||| ||    
T  25655651 ctgactcaaaccaacacaacgacatcctacacctccgaccatacaaatcctcaaaaggtttcatttcgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaa 25655750  T
Q  160 ctcgatcaac 169  Q
    ||| ||||||    
T  25655751 ctccatcaac 25655760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 53385283 - 53384888
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53385283 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 53385184  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53385183 tacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgct 53385084  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53385083 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 53384984  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53384983 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 53384888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15589657 - 15589251
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15589657 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 15589558  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589557 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 15589458  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15589457 taagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 15589358  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  15589357 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctct 15589258  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  15589257 ttgatgt 15589251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20062319 - 20061913
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20062319 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 20062220  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062219 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 20062120  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20062119 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 20062020  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  20062019 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctct 20061920  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  20061919 ttgatgt 20061913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 10005465 - 10005871
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10005465 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 10005564  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10005565 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgtt 10005664  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10005665 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 10005764  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  10005765 acccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctct 10005864  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  10005865 ttgatgt 10005871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16756850 - 16756444
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16756850 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcatctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16756751  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16756750 tacaaggcctcgaacgatgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgct 16756651  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16756650 caagcacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 16756551  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  16756550 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctct 16756451  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  16756450 ttgatgt 16756444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 10906075 - 10906481
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10906075 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaacca 10906174  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  10906175 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctcgtt 10906274  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10906275 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 10906374  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  10906375 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctct 10906474  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  10906475 ttgatgt 10906481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 16635638 - 16636044
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16635638 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16635737  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635738 tacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16635837  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16635838 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 16635937  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  16635938 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctct 16636037  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  16636038 ttgatgt 16636044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 43162962 - 43163368
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43162962 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 43163061  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163062 tacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 43163161  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43163162 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 43163261  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  43163262 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctct 43163361  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  43163362 ttgatgt 43163368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 48425312 - 48425718
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48425312 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctagtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 48425411  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425412 tacaaagccttgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 48425511  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48425512 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 48425611  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  48425612 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 48425711  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  48425712 ttgatgt 48425718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 12498113 - 12498517
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12498113 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 12498212  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498213 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 12498312  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12498313 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 12498412  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  12498413 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctct 12498512  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  12498513 ttgat 12498517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15348510 - 15348106
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15348510 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 15348411  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348410 tacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 15348311  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15348310 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 15348211  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||    
T  15348210 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatctcc 15348111  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  15348110 ttgat 15348106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16807185 - 16806787
Alignment:
Q  7 aactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16807185 aactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa 16807086  T
Q  107 gcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaa 206  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16807085 gcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaa 16806986  T
Q  207 cacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaa 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  16806985 cacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaa 16806886  T
Q  307 agcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 405  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  16806885 agcctcttgctaacttttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgat 16806787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 5425195 - 5424791
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5425195 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgacca 5425096  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5425095 tacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgtt 5424996  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5424995 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 5424896  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  5424895 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctcc 5424796  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  5424795 ttgat 5424791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 13252555 - 13252959
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13252555 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgacca 13252654  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  13252655 tacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgtt 13252754  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13252755 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 13252854  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  13252855 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 13252954  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  13252955 ttgat 13252959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14876764 - 14876360
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876764 catcttaaccttctcggtagtctgctgaacaatctcgggtcctaagaccgctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 14876665  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14876664 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaatatgactatcccaagttcctccttgct 14876565  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14876564 caagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 14876465  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||    
T  14876464 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctcc 14876365  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  14876364 ttgat 14876360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15402775 - 15402371
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402775 catctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 15402676  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402675 tgtaaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 15402576  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15402575 cgagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccagctgtctatggatgatacgccgaactcaatctcagcttcga 15402476  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||    
T  15402475 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctcc 15402376  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  15402375 ttgat 15402371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16412547 - 16412143
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16412547 catctgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccaacca 16412448  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16412447 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16412348  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16412347 gaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggttgatactccgaactcaacctcaacttcga 16412248  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  16412247 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 16412148  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  16412147 ttgat 16412143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 26792664 - 26792260
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26792664 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcataatggagttctgcatctccgacca 26792565  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792564 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 26792465  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  26792464 taagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaactttga 26792365  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  26792364 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctggaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 26792265  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  26792264 ttgat 26792260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 6600612 - 6601007
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6600612 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgacca 6600711  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600712 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgaaagatgactatcccaagttcctccttgct 6600811  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6600812 caagaac-----------acaaatcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 6600900  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  6600901 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctct 6601000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 10 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15725190 - 15724795
Alignment:
Q  10 tttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcc 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15725190 tttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcc 15725091  T
Q  110 tcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725090 tcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacac 15724991  T
Q  210 aaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15724990 aaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagc 15724891  T
Q  310 ctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  15724890 ctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcctgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 15724795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 16371278 - 16371679
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16371278 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16371377  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16371378 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaatgaaagatgaatatcccaagttcctccttgct 16371477  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16371478 caagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctttccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttaga 16371577  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16371578 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttcc 16371677  T
Q  401 tt 402  Q
    ||    
T  16371678 tt 16371679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 15339134 - 15339538
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15339134 catctgaaccttctcagtagtttgatgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgtatctccgacca 15339233  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15339234 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 15339333  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  15339334 cgagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctcttcgactgaccatctgtctgtcgatgatacgccgaactcaatctcagctacga 15339433  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||    
T  15339434 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctcc 15339533  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  15339534 ttgat 15339538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 16692025 - 16692433
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16692025 catcttaactttttcagtagtctgctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgacca 16692124  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16692125 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcccccttgct 16692224  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16692225 caagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgataagctgaactcaatctcaacttcga 16692324  T
Q  301 gcccaaagcct----cttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  16692325 acccaaagcctctagcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaat 16692424  T
Q  397 ttccttgat 405  Q
     ||||||||    
T  16692425 ctccttgat 16692433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 17489715 - 17490110
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17489715 catcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 17489814  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489815 tacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 17489914  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  17489915 caagtacacaaactctcaacagatcttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 17490014  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17490015 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 17490110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Original strand, 9522594 - 9522979
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522594 ttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctctcacctgactcaaaccaagacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 9522693  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9522694 cataaggtgccattccaatactagaatgataaatattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacaca 9522793  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  9522794 aactctcaacaaatcttctagcgactgaaacgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcc 9522893  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9522894 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 9522979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16492446 - 16492051
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16492446 catcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatacaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16492347  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16492346 tacaaagcctcacaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgct 16492247  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||    
T  16492246 caagaacacaaacccttaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacaccgaactcaacctcaacttaga 16492147  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16492146 acctaaagcctcttgcaaacttttccataatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16492051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 95 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 11564852 - 11564545
Alignment:
Q  95 cgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctc 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11564852 cgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctc 11564753  T
Q  195 cttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaa 294  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  11564752 ctttctcaagaacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatttcaa 11564653  T
Q  295 cttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcaca 394  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11564652 cttcgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaatctagaagaaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcaca 11564553  T
Q  395 atttcctt 402  Q
    || |||||    
T  11564552 atctcctt 11564545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 15248012 - 15248407
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  15248012 catcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgacta 15248111  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15248112 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactatatcaatagaagatgactatcccaagttcctccttgct 15248211  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  15248212 caattacacaaactctcaacaaatcctctaacgactaaatcgttctctccaactgaccatctgtctgctgatgatacgccgagctcaacctcaacttaga 15248311  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  15248312 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaat 15248407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 15208756 - 15209151
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15208756 catcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgtcca 15208855  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15208856 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatagaagatgactatcccaagttcctccttgct 15208955  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  15208956 caaatacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcattctctcagactgaccatctgtctgcggatgatacgccgagctcaacctcaacttaga 15209055  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || | | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15209056 acctacaacctcttgcaaaatcttccaaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 15209151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 116 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14126744 - 14126464
Alignment:
Q  116 ggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14126744 ggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactc 14126645  T
Q  216 tcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14126644 tcaacaaatcctctagcgactgaatcctcctcaccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttg 14126545  T
Q  316 caaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14126544 aaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14126464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 157 - 402
Target Start/End: Original strand, 15061777 - 15062022
Alignment:
Q  157 gaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactga 256  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15061777 gaactcaatcaatggaaaatgactatcccaagttccaccttgctcaagaacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctttccgactga 15061876  T
Q  257 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 356  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15061877 ccatctgtctgcgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactattccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 15061976  T
Q  357 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15061977 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttcctt 15062022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15015999 - 15015634
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||  | ||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  15015999 ttctctgtagtttgttgaacaatttctggtcctagtaccacattctcaccggattcataccaacacaatggagttctgcatctccgatcatacaatgctt 15015900  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15015899 cgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactgttattgcaagtgaactcgatcaatgagagatgactatcccaagttccgccttgctcaagtacaca 15015800  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    |||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||    
T  15015799 aattctcaacaagtcctccaacgtctgaattgtcctctccga------------ctgcggatgatatgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcc 15015712  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagc 388  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15015711 tcctgcaaactcttcctaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgtagc 15015634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 62 - 396
Target Start/End: Original strand, 15227585 - 15227919
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||    
T  15227585 gactcaaaccaacataacggagttctgcacctccaaccatacaaatcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaact 15227684  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||      
T  15227685 ctatcaacggcaggtgactatcccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccaat 15227784  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
    ||| ||||||||||| || |||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15227785 tgtttgcggatgataagctgaactccacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgat 15227884  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  15227885 acaatactcgatggaacaccatgcagcttcgcaat 15227919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13972358 - 13971979
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || |    
T  13972358 gtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacg 13972259  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||    
T  13972258 gtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccct 13972159  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    ||| | ||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13972158 caatagatcctctaaggattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctggggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgc 13972059  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  13972058 aaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 13971979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Original strand, 14086564 - 14086943
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || |    
T  14086564 gtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacg 14086663  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||    
T  14086664 gtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccct 14086763  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    ||| | ||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14086764 caatagatcctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgc 14086863  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  14086864 aaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 14086943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11303969 - 11303632
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| || || ||||| || ||||    
T  11303969 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccttaccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtga 11303870  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||  |||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  11303869 actatatcaacggtaggtgactatcccaagctccaacttgctcaagtacacacactcttaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgacc 11303770  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||     
T  11303769 atctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaggcgtcctgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatcc 11303670  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11303669 gacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 11303632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15953215 - 15952827
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15953215 actttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaacaaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaag 15953116  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| |||||  | || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  15953115 cttcgaacggtgccataccaatactcgaatggcaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtac 15953016  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||| | ||||| ||| |||||||  || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  15953015 acacactctcagcaactcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatatgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaat 15952916  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  15952915 gcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaat 15952827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Original strand, 28754245 - 28754585
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  28754245 ctttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttat 28754344  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||    
T  28754345 aagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccga 28754444  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  28754445 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcggatct 28754544  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  28754545 ctatctgacacaatactagacggaacaccatgaagcttcac 28754585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Original strand, 17492563 - 17492900
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| | |||||||| ||||| || || ||||    
T  17492563 cctgactcaaaccagcttaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgatcggtgccataccaatattcgaatgataactattgttgtatgtga 17492662  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  17492663 actctatcaacggtaggtgactatcccaagatccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgacc 17492762  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  17492763 atctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaagttcgaccccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatcc 17492862  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||  | | | ||||||||||| | |||||||||    
T  17492863 gaaacaacacacaacggaacaccatgcaacttcacaat 17492900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12850517 - 12850138
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| |    
T  12850517 gtagtttgatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaatctttgaacg 12850418  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || |||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||    
T  12850417 gtgccataccaatacttgaatggtaattgttgttgtacgtgaactctatcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacaatct 12850318  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||     
T  12850317 cagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctacggattataagccgaactcaacctcaactttgaatccaaggcctcttgt 12850218  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || |||||||| || || |||||||| | |||||||||    
T  12850217 aaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatgcttgatgggacaccatgcaacttcacaat 12850138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 53 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8759284 - 8758942
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  8759284 ctttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgt 8759185  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||    
T  8759184 aggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccga 8759085  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||     
T  8759084 ctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcc 8758985  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8758984 ctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 8758942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 53 - 395
Target Start/End: Original strand, 41177449 - 41177791
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  41177449 ctttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgt 41177548  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||    
T  41177549 aggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccatgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccga 41177648  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||     
T  41177649 ctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcc 41177748  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41177749 ctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 41177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 59 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16836706 - 16836370
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || ||||    
T  16836706 cctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtga 16836607  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| | ||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||  | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  16836606 actctaccaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacgcactctcaacaaatcctccaaggattggatcgtcctctccgactgacc 16836507  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||     
T  16836506 atctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatcc 16836407  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  16836406 gatgcaatactcgacggaactccatgaagcttcacaa 16836370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 58 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13322849 - 13322511
Alignment:
Q  58 acctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtg 157  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || ||     
T  13322849 acctgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccgtacaaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaattgttgttgtaggta 13322750  T
Q  158 aactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 257  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||| |  ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||    
T  13322749 aactctatcaaaggtaggtgactatcccaagcttcaccttgctcaagcacacatactcttaggaaatcctctaaggattgaatcgtcctctccgactgac 13322650  T
Q  258 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 357  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||    
T  13322649 catctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacctcgaacccaaaacatcttgcaaactcttccagaatctagaagtaaacctcagatccctatc 13322550  T
Q  358 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13322549 tgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 13322511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 86 - 396
Target Start/End: Original strand, 14573889 - 14574199
Alignment:
Q  86 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14573889 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgattggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccc 14573988  T
Q  186 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 285  Q
    ||| ||| ||||||||||| | ||| |   ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14573989 aagctccaccttgctcaagtatacacaccatcagcaaatcctctaacgactgaatcgtactctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaact 14574088  T
Q  286 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 385  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||    
T  14574089 caacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctgaaatctctatctgacacaatactcgacgaaactccatgt 14574188  T
Q  386 agcttcacaat 396  Q
    | |||||||||    
T  14574189 aacttcacaat 14574199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12360738 - 12360401
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  12360738 cctgactcaaaccagcataatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 12360639  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | | |||| |||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  12360638 actctatcaacggtaggtgactatccgaagctccaccttgctcaagtacacacactttcaataaatcctccaaagattgtatggtcctctccgactgacc 12360539  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||     
T  12360538 atctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaatctcttccataatctagatgtgaacctcggatccctatcc 12360439  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  12360438 gacacaatactctacggtacaccatgtagcttcacaat 12360401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Original strand, 10383896 - 10384235
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  10383896 ctttcacccgactcaaaccagcacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttat 10383995  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||||||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||    
T  10383996 aagtgaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccga 10384095  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| || |||||||| || || ||||||    
T  10384096 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgcaaacatttccagaacctagaagtgaacctcggatct 10384195  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||| || ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  10384196 ctatccgacacaatact-aacggaacaccatgaagcttcac 10384235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 393
Target Start/End: Original strand, 13941963 - 13942291
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| |    
T  13941963 tcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactcta 13942062  T
Q  165 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 264  Q
    |||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||    
T  13942063 tcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccattgattggatcgtcctctccgactgaccatctgt 13942162  T
Q  265 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 364  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || |||    
T  13942163 ctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacaca 13942262  T
Q  365 atgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13942263 atactcgaaggaactccatgtagcttcac 13942291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 53 - 390
Target Start/End: Original strand, 4678365 - 4678702
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  4678365 ctttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgt 4678464  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||    
T  4678465 aggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccga 4678564  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||     
T  4678565 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcc 4678664  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagctt 390  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4678665 ctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctt 4678702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 395
Target Start/End: Original strand, 44777156 - 44777516
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || || || ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  44777156 tctggtcccaacacaacactttctcctgtctcgaaccaacacaaaggagtcctgcaccttcgaccatataatgcttcgaatggtgccattcctatactcg 44777255  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    ||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  ||    
T  44777256 aatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatga 44777355  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||    
T  44777356 ttggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcctgtaaactcttccagaaccta 44777455  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44777456 gaagtaaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgtagcttcacaa 44777516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11961233 - 11960992
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  11961233 tcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatgccaatactcgaatgatagctgttgttataag 11961134  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |  || || || ||||| ||||||||    
T  11961133 tgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaatcctccaatgattggatcgtcctttccgactg 11961034  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaactt 297  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11961033 accatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactt 11960992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Original strand, 47123871 - 47124211
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  47123871 ctttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttat 47123970  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| || || ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||    
T  47123971 aagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccga 47124070  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  47124071 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatct 47124170  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  47124171 ctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 47124211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 62 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16381121 - 16380788
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || |||||||    
T  16381121 gactcaaaccagcacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaacggtgcgatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaact 16381022  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | ||||| || || ||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |  || || ||  |||||||||||||||||||    
T  16381021 ctatcaatggtaggtgattatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcatcctctccgactgaccatc 16380922  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||  | ||||| ||||| ||     
T  16380921 tgtctgagaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacatcggatccctatccgac 16380822  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  16380821 acaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaa 16380788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18134542 - 18134215
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  18134542 cctgactcaaaccagcataaaggattcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 18134443  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||    
T  18134442 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccgctccgactgacc 18134343  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| |||||     
T  18134342 atctgtctgaggatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaaagtgtcctgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatcc 18134243  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgta 386  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  18134242 gacacaatactcgacggtacaccatgta 18134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 56 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16329858 - 16329520
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  16329858 tcacctgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 16329759  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||    ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||     
T  16329758 tgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacc--ctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgacta 16329661  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||| | || || ||||| |||    
T  16329660 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaactcttccagaacctagaaatgaacctcggatcccta 16329561  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  16329560 tccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 16329520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 10420247 - 10419907
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || ||||||||||| || |  ||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || || || |    
T  10420247 ctttctcccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttgttgt 10420148  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || |  ||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  10420147 atgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatcctctaaagattggattgtcctctccga 10420048  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  10420047 ctgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtct 10419948  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  10419947 ctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcac 10419907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 288
Target Start/End: Original strand, 13001800 - 13002070
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  13001800 gtagtttgatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataatggagttttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacg 13001899  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  13001900 gtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctattaacggtaaatgactatcccaagctcc-ccttgctcaagtacacacactct 13001998  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaa 288  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  13001999 catcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgaatgaccatctgtttgcgggtgataagccgaactcaa 13002070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26009189 - 26008948
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |    
T  26009189 cctgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaa 26009090  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  26009089 actctctcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgacc 26008990  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  26008989 atctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcga 26008948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 242 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16828215 - 16828061
Alignment:
Q  242 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16828215 gtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaattcttccaaaatctagaagtga 16828116  T
Q  342 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  16828115 acctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 16828061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 176 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16338591 - 16338371
Alignment:
Q  176 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 275  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16338591 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctaaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 16338492  T
Q  276 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 375  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||| | || || ||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  16338491 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaactgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacgg 16338392  T
Q  376 aacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  16338391 tacaccgtgcagcttcacaat 16338371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8274603 - 8274281
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  8274603 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 8274504  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |     ||||| |||||||| | ||| |||||    
T  8274503 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactttgaatagtcctctctgtctgcccatc 8274404  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| ||     
T  8274403 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 8274304  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  8274303 acaatactagaaggaataccatg 8274281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 383
Target Start/End: Original strand, 15576686 - 15577007
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||  | || || || ||||| ||||    
T  15576686 gactcaaaccaacataacggtgttctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgcaaactgttgttgtaagtaaact 15576785  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||  | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  15576786 caatcaacgataaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 15576885  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| ||     
T  15576886 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 15576985  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccat 383  Q
    ||||| || ||||||| |||||    
T  15576986 acaatactagaaggaataccat 15577007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16742907 - 16742585
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  16742907 gactcaaaccaacaaaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 16742808  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| | |||||||||    
T  16742807 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 16742708  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| ||     
T  16742707 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctgggatcccgatccgac 16742608  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  16742607 acaatactagaaggaataccatg 16742585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 377
Target Start/End: Original strand, 18748592 - 18748916
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||  || || || ||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||||||||||| |  | || || |    
T  18748592 ctttcacctgattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaaccctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaattgttgttgt 18748691  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    || | ||||| |||||||| | |       ||||| |  | |||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |    |||||| |||||||| |     
T  18748692 aactaaactcaatcaacggtaaacattcgacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgt 18748791  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||     
T  18748792 ctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcc 18748891  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaa 377  Q
      |||||| ||||| || |||||||    
T  18748892 tgatctgacacaatactagaaggaa 18748916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14183177 - 14183007
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| || | ||| || || || |||||||  |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||   ||    
T  14183177 catcttaaccttctcaatagtctgctgaacaatttccgatcccaacacaacactttcactcgactcataccaacacaaaggtgttctacatctcctctca 14183078  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 171  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  14183077 tacaaagcatcgaaaggagccataccaatacttaaatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacgg 14183007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13975249 - 13975172
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 139  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  13975249 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatga 13975172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 6712622 - 6712539
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaa 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| || || | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  6712622 ctttcgcctgactcataccaacacaacggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaa 6712539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6152882 - 6152733
Alignment:
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
    |||||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||||| |  | ||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  6152882 ctgaatagtcctctctgtttgcccatcagtctgaggatagtaagcagaactcaatctcaacttagttctcaaagcagcttgcaaactttcccaaaactta 6152783  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
     |||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  6152782 taagtaaatctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 6152733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13967392 - 13967222
Alignment:
Q  214 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 313  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  13967392 tctcaacaaatcctccagactctgaatagtcctcttcgtctgcccatccgtctgaggatggttagcagaactcaatctcaacttagttccaaaagcagct 13967293  T
Q  314 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||| || || || | ||  || |||||||| ||||||| ||||||    
T  13967292 tgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggttcccgatacgacacaatgctagaaggaataccatg 13967222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 139
Target Start/End: Original strand, 17193033 - 17193107
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 139  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||    
T  17193033 tcaaaccaacacaacggcgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatga 17193107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 6153052 - 6152978
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 139  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||    
T  6153052 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggagccatctcgatactagaatga 6152978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 351
Target Start/End: Original strand, 17193224 - 17193318
Alignment:
Q  257 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 351  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||||   |||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||    
T  17193224 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagaagcttgcaaactttccctaaacttagaagtaaaccttggatc 17193318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 109840 - 109434
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109840 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 109741  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  109740 tataaagcctcgaaaggtgccgttccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgct 109641  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  109640 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 109541  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  109540 acccaaagcgtcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggttctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctcc 109441  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  109440 ttgatgt 109434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Original strand, 112852 - 113231
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || |    
T  112852 gtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttcccccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaatgcttcaaacg 112951  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |  ||    
T  112952 gtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgcacaagtacacacaccct 113051  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    ||||| ||| ||||  || || || ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  113052 caacagatcttctaaggattgtatcgtcctctctaactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgc 113151  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  113152 aaactcttccagaatctagatgtgaacctcgaatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaat 113231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 53 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 95979 - 95636
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || ||||||||||| || |  |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || |    
T  95979 ctttctcccgactcaaaccaacatagaggagttctacacctccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgt 95880  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || |||||||| |||||    
T  95879 atgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctttccga 95780  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  95779 ctgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttgggtct 95680  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  95679 ctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 95636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 10871230 - 10871636
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10871230 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 10871329  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871330 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 10871429  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10871430 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 10871529  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  10871530 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgcagcttcacaatctct 10871629  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  10871630 ttgatgt 10871636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 18177977 - 18178383
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18177977 catctaaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 18178076  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18178077 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 18178176  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18178177 caagaacacaaatcctcaacagatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 18178276  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18178277 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgttcgaaggaacaccatgtagcttcacaatctcc 18178376  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  18178377 ttgatgt 18178383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15161092 - 15160688
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161092 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 15160993  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15160992 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 15160893  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15160892 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcga 15160793  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  15160792 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 15160693  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  15160692 ttgat 15160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 8198863 - 8199269
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8198863 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 8198962  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198963 tacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 8199062  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8199063 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 8199162  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  8199163 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctct 8199262  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  8199263 ttgatgt 8199269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 44791386 - 44790980
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44791386 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 44791287  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791286 tacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 44791187  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44791186 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 44791087  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  44791086 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctct 44790987  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  44790986 ttgatgt 44790980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 13686299 - 13686703
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13686299 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccatcacaacggagttctgcatctccgacca 13686398  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686399 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 13686498  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13686499 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcga 13686598  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  13686599 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 13686698  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  13686699 ttgat 13686703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 11237248 - 11236844
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11237248 catccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgacca 11237149  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237148 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatggtaactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 11237049  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11237048 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcga 11236949  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||    
T  11236948 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctcc 11236849  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  11236848 ttgat 11236844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 18551793 - 18551389
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18551793 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 18551694  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551693 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 18551594  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18551593 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 18551494  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  18551493 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 18551394  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  18551393 ttgat 18551389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 8707840 - 8708244
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8707840 catctgaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 8707939  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707940 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 8708039  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8708040 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaatctcaacttcga 8708139  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  8708140 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 8708239  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  8708240 ttgat 8708244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 14332632 - 14333036
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14332632 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctccttattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 14332731  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14332732 tacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 14332831  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14332832 caagaacacaaattctcaataaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 14332931  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  14332932 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 14333031  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  14333032 ttgat 14333036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 17351 - 16947
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17351 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatttcgggtcctaagaccactctttcacctgactgaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 17252  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17251 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaaactgactatcccaagttcctccttgct 17152  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17151 caagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcga 17052  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  17051 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcctcacaatctcc 16952  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  16951 ttgat 16947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11553137 - 11552731
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11553137 catcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 11553038  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553037 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 11552938  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11552937 caagaacacggatcctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctctccgactgtccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 11552838  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  11552837 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaaggaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 11552738  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    || ||||    
T  11552737 ttaatgt 11552731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 9596292 - 9596696
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9596292 catcttaactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgacca 9596391  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596392 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaataatagaatgatgactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 9596491  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9596492 caagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcga 9596591  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||    
T  9596592 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagggacaccatgtaacctcacaatctcc 9596691  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  9596692 ttgat 9596696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 12687736 - 12688142
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12687736 catcttaactttctcagtagtctgttggacaatctctggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 12687835  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687836 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 12687935  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12687936 caagcacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcga 12688035  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||    
T  12688036 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctcc 12688135  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    || ||||    
T  12688136 ttaatgt 12688142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 14954855 - 14955261
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14954855 catcttaactttctcagtagtctgctggacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 14954954  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954955 tacaaagtctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 14955054  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14955055 caagcacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcga 14955154  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| | | ||||||| |||    
T  14955155 acccaaagcctgttgcaaacttttgaaaatcctagaagtaaatcttggatctctatccaatacaatgctcgaaggaataccatgcaacgtcacaatctcc 14955254  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    || ||||    
T  14955255 ttaatgt 14955261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15154687 - 15154294
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15154687 catcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc-----ctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 15154593  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154592 tacaaagcttcataaggtgccatcccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 15154493  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  15154492 caagtacacaaactctcaacaagtcctctagcgattgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 15154393  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 399  Q
     || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15154392 acctaaagcctgctgcaaacttttccaaaatctagaagtgaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttc 15154294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23516804 - 23516520
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516804 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctcttgtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccggcacaacggagttctgcatctccgacca 23516705  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23516704 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgct 23516605  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 285  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  23516604 caagaacacaaatcctcaacaaatgctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgtggatgatacgccgaact 23516520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 56 - 396
Target Start/End: Original strand, 14039986 - 14040326
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  14039986 tcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacg 14040085  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  14040086 tgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactg 14040185  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14040186 accatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggatctcta 14040285  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14040286 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14040326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 56 - 396
Target Start/End: Original strand, 14350016 - 14350356
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  14350016 tcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacg 14350115  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  14350116 tgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactg 14350215  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14350216 accatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggatctcta 14350315  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14350316 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14350356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11772276 - 11771881
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |  |||    
T  11772276 catcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttccggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaatcaacacaacgaagttctgcaccttcttcca 11772177  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
     |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11772176 cacaaagccttaaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtttctccttgct 11772077  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| || |  |||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  11772076 caagtacacaaactctcaacaaatcttccaatgactgaatcgttttttccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 11771977  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11771976 acctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 11771881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 396
Target Start/End: Original strand, 21662221 - 21662591
Alignment:
Q  26 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattc 125  Q
    |||||||| |||||||| |  ||||| || ||||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  21662221 tgaacaatgtctggtcccagtaccacactctcaccggactcatcacaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattc 21662320  T
Q  126 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 225  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  21662321 caatgctagaatggtaactattattgtaagtgaactcgattaatggaagatgactatcccaagatcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 21662420  T
Q  226 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 325  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||| | |||||| |||    
T  21662421 ctccaacgactgaattgtcctctccgtctatccatctgtctgcggatgatacgcctaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctacaaactcttc 21662520  T
Q  326 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21662521 caaaatctagaagtaaatcttggatccctatctaatacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaat 21662591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Original strand, 15624797 - 15625182
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    |||| ||||||||| ||||| || |||||||| || |  || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||  || |    
T  15624797 ttctaagtagtttgatgaacgatttctggtcccaaaattacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagtgctt 15624896  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  15624897 cgaatggtgtcattctaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacagaagatgactatcccaagttcctccatgctcaagtacata 15624996  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    || ||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| ||    
T  15624997 aactctcaacaagtcctccaacgactggattgttctttccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacccaaaacc 15625096  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15625097 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcggcggaacaccatgtagcttcacaat 15625182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 53 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12206761 - 12206418
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||  |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
T  12206761 ctttcacccgactcaaaccaacataacggagtattgcacctccgatcatacaaaacttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgt 12206662  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  12206661 acgtgaactctatcaacggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccga 12206562  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12206561 ctgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctcgatgtaaatcttggatct 12206462  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12206461 ctatccaacacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaat 12206418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 396
Target Start/End: Original strand, 13021630 - 13021988
Alignment:
Q  38 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 137  Q
    |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  13021630 ggtcctaacaccacactctttcctgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccataccaatactcgaat 13021729  T
Q  138 gatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 237  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||| | || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || ||    
T  13021730 gatagctgttgttataagtgaactctatcaacagtaggtgattatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattg 13021829  T
Q  238 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 337  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||     
T  13021830 gatagtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaacttttccagaacctagag 13021929  T
Q  338 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  13021930 gtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 13021988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15102558 - 15102221
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  15102558 cctgactcgaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtga 15102459  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  15102458 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgacc 15102359  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  15102358 atctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatcc 15102259  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || |||||  |||| || | ||||||||||||||||||    
T  15102258 gacacaatattcgatggtaaaccatgtagcttcacaat 15102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11388425 - 11388046
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| |    
T  11388425 gtagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaacatacaaagcttcgaacg 11388326  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||| ||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  11388325 gtgtcataccaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactct 11388226  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    ||  | ||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  11388225 cagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgc 11388126  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  11388125 aaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 11388046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 53 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14264205 - 14263862
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || |    
T  14264205 ctttctcctgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgt 14264106  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||| | | ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  14264105 acgtgaactctatcaacagtagatgactatcccaagctccaccttgctcgagtacagacactctcatcaaatcctctaacgattgaattgttctctccga 14264006  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |    
T  14264005 ctgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggattt 14263906  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  14263905 ctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaat 14263862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Original strand, 6413805 - 6414142
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||    
T  6413805 cctgattcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtga 6413904  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  6413905 actctatcaacggtaggtgactatcccaagccccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgacc 6414004  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||| |||||     
T  6414005 ttctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcagatccctatcc 6414104  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6414105 gacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 6414142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8212086 - 8211749
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  8212086 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggcgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 8211987  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    | ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  8211986 taaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 8211887  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||    
T  8211886 accatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctcta 8211787  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8211786 tctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 8211749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16072273 - 16071912
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  16072273 tctggtcccaacactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttatgcgcctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccataccaatactcg 16072174  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || || || || || |||||||| ||||||   || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||    
T  16072173 aatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaaccataggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacga 16072074  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  16072073 ttgaatcgtcctctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcta 16071974  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||| | || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  16071973 gaactgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaat 16071912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18053917 - 18053572
Alignment:
Q  50 actctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattat 149  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  18053917 actctttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccctcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgt 18053818  T
Q  150 tataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctc 249  Q
    | || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || ||||||||    
T  18053817 tgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctc 18053718  T
Q  250 cgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 349  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||    
T  18053717 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcgga 18053618  T
Q  350 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18053617 tccctatctgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 18053572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11306224 - 11305884
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  11306224 ctttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttat 11306125  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||| |||||    
T  11306124 aagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctttccga 11306025  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  11306024 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatct 11305925  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  11305924 ctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 11305884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Original strand, 49152589 - 49152929
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  49152589 ctttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttat 49152688  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||    
T  49152689 aagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccga 49152788  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  49152789 ctgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatct 49152888  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  49152889 ctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 49152929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 61 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14286329 - 14285994
Alignment:
Q  61 tgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaac 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  14286329 tgactcaaaccagcacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaac 14286230  T
Q  161 tcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccat 260  Q
    || ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||  || || || ||||||| |||||||||||    
T  14286229 tctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaatcctctaaagattgtatcgtcctcttcgactgaccat 14286130  T
Q  261 ctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 360  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || |||| ||||||||| || || || ||||||||||| ||    
T  14286129 ctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccgaaatctagatgtgaacctcggatctctatccga 14286030  T
Q  361 tacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14286029 cacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 14285994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 395
Target Start/End: Original strand, 14130146 - 14130503
Alignment:
Q  38 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 137  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  14130146 ggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaat 14130245  T
Q  138 gatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 237  Q
    | || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |  || ||    
T  14130246 ggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattg 14130345  T
Q  238 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 337  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| || |||||     
T  14130346 gatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagag 14130445  T
Q  338 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  14130446 gtgaacctcggatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaa 14130503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Original strand, 15204124 - 15204389
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || || || |||||| |||| ||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||  || |    
T  15204124 ttctctgtagtttgctgaacaaaatctggtcccaaaactacactatcaccttactcgaaccaacacaacggagtcctacacctctgaccatacagcgctt 15204223  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    | || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15204224 caaatggttccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactattccaagttcctccttgctcaagtacaca 15204323  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 276  Q
    || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15204324 aactctcaacaaatcctccaacgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgata 15204389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16950429 - 16950089
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |    
T  16950429 tcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatg 16950330  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||| |||   ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||    
T  16950329 tgaactctatcaatggtaggtgactattccatactccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactg 16950230  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || | |||||||    
T  16950229 accatctgtctgaggatgataatccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcgaatctcta 16950130  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || ||||| |||||  | || |||||||||||||||||    
T  16950129 tccgacacaatactcgacagtactccatgtagcttcacaat 16950089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23505831 - 23505491
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  23505831 ctttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgt 23505732  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||    
T  23505731 aggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccga 23505632  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||     
T  23505631 ctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcc 23505532  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  23505531 ctatccgacacaatacacgaaggaactccatgtagcttcac 23505491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Original strand, 13665831 - 13666168
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  13665831 cctgactcaaaccagcataaaggagtcatgcccctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 13665930  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || |||||||| ||||||||    
T  13665931 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctctaatgattggatcgtcctctctgactgacc 13666030  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||     
T  13666031 atctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatcc 13666130  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  13666131 gacacaatactcgacgatacaccatgtagcttcacaat 13666168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 38 - 395
Target Start/End: Original strand, 14433964 - 14434321
Alignment:
Q  38 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 137  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  14433964 ggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaat 14434063  T
Q  138 gatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 237  Q
    | || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |  || ||    
T  14434064 ggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattg 14434163  T
Q  238 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 337  Q
     || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| || |||||     
T  14434164 gatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagag 14434263  T
Q  338 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  14434264 gtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaa 14434321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1362 - 1025
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  1362 cctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctctgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 1263  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||| | ||||||| |||    
T  1262 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcttttccgactaacc 1163  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||     
T  1162 atctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccttgtatccctatcc 1063  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  1062 gacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35964875 - 35964646
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |  || || || || || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  35964875 ttctcagtagtttgttgaacaatgtctggtcccagtactacactatcgccagactcataccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaacgctt 35964776  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35964775 cgaacggtgccattccaatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaatagaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacaca 35964676  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaat 240  Q
    || ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  35964675 aactctcaacaagtcctccaacgactgaat 35964646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Original strand, 19147481 - 19147842
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  19147481 tctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcg 19147580  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||    
T  19147581 aatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactattccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaatcctctaacga 19147680  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  19147681 ttgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctt 19147780  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  19147781 gaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 19147842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Original strand, 20746880 - 20747241
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  20746880 tctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcg 20746979  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||    
T  20746980 aatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactattccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaatcctctaacga 20747079  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  20747080 ttgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctt 20747179  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  20747180 gaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 20747241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 396
Target Start/End: Original strand, 12455975 - 12456333
Alignment:
Q  38 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 137  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||||    
T  12455975 ggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctcctaccatacaaagcttcgaacggtaccatacctatactcgaat 12456074  T
Q  138 gatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 237  Q
    | || || ||||| || |||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||| |  || ||    
T  12456075 ggtaactgttattgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactgtcaacaattcctccaatgattg 12456174  T
Q  238 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 337  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| || ||||||    
T  12456175 gatcgtcctctccgactgaccatctgtctggggatgataagccgagctcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgtaaattcttccagaacctagaa 12456274  T
Q  338 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  12456275 gtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 12456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23199704 - 23199418
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  23199704 ctttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgt 23199605  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||    
T  23199604 aggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccga 23199505  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagt 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  23199504 ctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagt 23199418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 26118611 - 26118226
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |    
T  26118611 actttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaagg 26118512  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||    
T  26118511 cttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgttcaagcac 26118412  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||| | |||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  26118411 acacactctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaag 26118312  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||| || |||||    
T  26118311 gcgtcctgtaaacgcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgccggaacaccatgaagtttcac 26118226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13968626 - 13968289
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||  | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  13968626 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcatacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 13968527  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||| | ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  13968526 tgaacccaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 13968427  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||    
T  13968426 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcccta 13968327  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  13968326 tccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcac 13968289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 281 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23203368 - 23203242
Alignment:
Q  281 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 380  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23203368 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23203269  T
Q  381 catgtagcttcacaatttccttgatgt 407  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23203268 catgcagcttcacaatctccttgatgt 23203242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 281 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23509495 - 23509369
Alignment:
Q  281 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 380  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509495 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23509396  T
Q  381 catgtagcttcacaatttccttgatgt 407  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23509395 catgcagcttcacaatctccttgatgt 23509369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 395
Target Start/End: Original strand, 15340725 - 15341061
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||  | || || || ||||    
T  15340725 cctgactcaaactagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaaacttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaaatgttgttgtaggtga 15340824  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |   | |  || ||||| |||||||||||    
T  15340825 actctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaattatttgatcgtcctttccgactgacc 15340924  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||||     
T  15340925 atctgtctgaggatgataagccgaactcatcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagatgtgaacctcggatccctatcc 15341024  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    || ||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  15341025 gacacaatactagaaggaactctatgtagcttcacaa 15341061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Original strand, 12457022 - 12457298
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || ||||| || || |||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  12457022 actttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaactagcataaaggagtcctatacctccgaccatacaaag 12457121  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  12457122 cttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactcaatcaacggtaggtgactatctcaagttccaccttgctcaagcac 12457221  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaac 284  Q
    | | | |||||| ||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12457222 agacactctcaataaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaac 12457298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 384
Target Start/End: Original strand, 14936636 - 14936965
Alignment:
Q  55 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataa 154  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || || |||    
T  14936636 ttcacctgattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaa 14936735  T
Q  155 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 254  Q
    || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | | |||||| |  ||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||    
T  14936736 gtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacattgctccaacacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtct 14936835  T
Q  255 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 354  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| |     
T  14936836 gcccatcggtctggggatgataagaagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccg 14936935  T
Q  355 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  14936936 atccgatacaatactagaaggaataccatg 14936965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 384
Target Start/End: Original strand, 7824199 - 7824518
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| |    
T  7824199 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 7824298  T
Q  165 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 264  Q
    ||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||    
T  7824299 tcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggt 7824398  T
Q  265 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 364  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || |||    
T  7824399 ctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacaca 7824498  T
Q  365 atgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    || || ||||||| ||||||    
T  7824499 atactagaaggaataccatg 7824518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27107745 - 27107426
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| |    
T  27107745 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 27107646  T
Q  165 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 264  Q
    ||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||    
T  27107645 tcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggt 27107546  T
Q  265 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 364  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |||    
T  27107545 ctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacaca 27107446  T
Q  365 atgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    || || ||||||| ||||||    
T  27107445 atactagaaggaataccatg 27107426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21674516 - 21674185
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  ||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || |    
T  21674516 ctttctcctgactcaaaccaacacaacgttgtcttacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgt 21674417  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacgg--aagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctcc 250  Q
    |||| || || ||||||||  || ||  | |||| || |  |  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    |||||| ||||||||     
T  21674416 aagtaaattcaatcaacggtaaacatt-cgatcc-aactgacatcttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctca 21674319  T
Q  251 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 350  Q
    | ||| ||||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||    
T  21674318 gtctggccatcggtctgggcatgataagcataactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggat 21674219  T
Q  351 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    | | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21674218 cccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21674185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 384
Target Start/End: Original strand, 15364239 - 15364558
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| |||||||  || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| |    
T  15364239 tcaaaccaacacaacgtcgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 15364338  T
Q  165 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 264  Q
    ||||||| | |      |||||| |  | | |||||| |  ||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||    
T  15364339 tcaacggtaaacattcgtcccaactgacacattgctccaacacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggt 15364438  T
Q  265 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 364  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| ||||||    
T  15364439 ctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgataca 15364538  T
Q  365 atgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    || || ||||||| ||||||    
T  15364539 atactagaaggaataccatg 15364558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 384
Target Start/End: Original strand, 4440356 - 4440546
Alignment:
Q  194 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 293  Q
    |||||||| | |||||||  |||||| |||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  4440356 ccttgctccaaaacacaagctctcaataaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctca 4440455  T
Q  294 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  4440456 acttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 4440546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 342
Target Start/End: Original strand, 45146842 - 45147131
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || ||||||||||||| |||||| || |||| ||| || |||||||||||  | || || || |    
T  45146842 ctttcacctgattcaaaccaacacaatggcgtcctacacctccgaccatacagagcctccaacggtgtcataccgatactagaatgcaaactgttgttgt 45146941  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactat-cccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccg 251  Q
    |||| ||||| |||||||| | |  | | | ||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| |    
T  45146942 aagtaaactcaatcaacggtaaac-attctgcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctg 45147040  T
Q  252 actgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 342  Q
     ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  45147041 tctgcccatccgtctgaggatgataagcagaactcaacctcaacttggttccaaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaa 45147131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 384
Target Start/End: Original strand, 17924148 - 17924269
Alignment:
Q  263 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 362  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  17924148 gtctggggatgataagccgaactcaacctcaacttatttcccaaagcagcttgcaaactttttcaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 17924247  T
Q  363 caatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  17924248 caatactagaaggaataccatg 17924269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 377
Target Start/End: Original strand, 23641951 - 23642059
Alignment:
Q  269 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 368  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| |  ||||| ||| |||||||||| | ||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  23641951 ggatgataagcagaactcaaccttaacttagtccccaacgccgcttgcaaactctcccaaaatgtcggagtaaactttggatctctatctgacacaatgc 23642050  T
Q  369 tcgaaggaa 377  Q
    | |||||||    
T  23642051 tagaaggaa 23642059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12368544 - 12368473
Alignment:
Q  68 aaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 139  Q
    ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  12368544 aaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggagccataccaatactagaatga 12368473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 108
Target Start/End: Original strand, 12193844 - 12193898
Alignment:
Q  54 tttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagc 108  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  12193844 tttcacctgactcataccaacacaaaggagttctacacctccgaccatacaaagc 12193898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15171764 - 15171642
Alignment:
Q  236 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 335  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||  |||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |   |||||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  15171764 tgaatagtcctcttcgtctgaccatcgatctgaggctgataagcaaaactcaatctcaacttagtttccaaagccgcttgaaaacttttccgaaacatag 15171665  T
Q  336 aagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||| ||  |||||||||||    
T  15171664 aagtaaacctcagatctctatct 15171642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 313 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40869 - 40790
Alignment:
Q  313 ttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 392  Q
    ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  40869 ttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaagaccatgcagcttca 40790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 171
Target Start/End: Original strand, 13353438 - 13353556
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  || || || || | ||||||||||||||| || ||||||||  |  || |||||||| | || |||||||    
T  13353438 ctttcacctgactcataccaacacaacgacgtcctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccatatcggtaatagaatgaaaactcttattat 13353537  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacgg 171  Q
    |||| ||||| ||| ||||    
T  13353538 aagtaaactcaatcgacgg 13353556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17144994 - 17144936
Alignment:
Q  302 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 360  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||    
T  17144994 cccaaagcctcttgcatactcttccaaaactttgaagtaaacctcggatctctatctga 17144936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 51
Target Start/End: Original strand, 14038048 - 14038092
Alignment:
Q  7 aactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccac 51  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  14038048 aactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcccaaaaccac 14038092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 51
Target Start/End: Original strand, 14348078 - 14348122
Alignment:
Q  7 aactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccac 51  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  14348078 aactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcccaaaaccac 14348122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 16982029 - 16982435
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16982029 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16982128  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982129 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16982228  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16982229 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 16982328  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  16982329 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 16982428  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  16982429 ttgatgt 16982435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 16998877 - 16999283
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16998877 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16998976  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998977 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16999076  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16999077 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 16999176  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  16999177 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctct 16999276  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  16999277 ttgatgt 16999283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 17063594 - 17064000
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17063594 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 17063693  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063694 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 17063793  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17063794 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 17063893  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  17063894 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 17063993  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  17063994 ttgatgt 17064000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 17067252 - 17067658
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17067252 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 17067351  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067352 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 17067451  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17067452 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 17067551  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  17067552 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 17067651  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  17067652 ttgatgt 17067658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 9610013 - 9610419
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9610013 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 9610112  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610113 tacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 9610212  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9610213 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 9610312  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  9610313 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctct 9610412  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  9610413 ttgatgt 9610419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 10868727 - 10869133
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  10868727 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccaccctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccg 10868826  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868827 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattgttataagtgaactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgct 10868926  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10868927 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 10869026  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  10869027 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctct 10869126  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  10869127 ttgatgt 10869133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 44386135 - 44385731
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44386135 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 44386036  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44386035 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgct 44385936  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44385935 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 44385836  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||    
T  44385835 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatcccc 44385736  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  44385735 ttgat 44385731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 27217893 - 27218299
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27217893 catctgaactttctcagtagtttgctgaaaaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 27217992  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217993 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 27218092  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27218093 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctgtccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 27218192  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  27218193 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctct 27218292  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  27218293 ttgatgt 27218299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 24262247 - 24262651
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262247 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 24262346  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262347 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtggactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgct 24262446  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24262447 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcga 24262546  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  24262547 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 24262646  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  24262647 ttgat 24262651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 24709910 - 24710314
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24709910 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 24710009  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710010 tacaaggcctcaaacggtgtcattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 24710109  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24710110 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 24710209  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  24710210 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 24710309  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  24710310 ttgat 24710314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 27371146 - 27371550
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  27371146 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacatagttcttcatctccgacca 27371245  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27371246 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 27371345  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27371346 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 27371445  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  27371446 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 27371545  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  27371546 ttgat 27371550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22325422 - 22325018
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22325422 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggccctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacaccacggagttctgcatctccgacca 22325323  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22325322 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgtt 22325223  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22325222 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 22325123  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  22325122 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 22325023  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  22325022 ttgat 22325018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 41608933 - 41608547
Alignment:
Q  19 agtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41608933 agtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggt 41608834  T
Q  119 gccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 218  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608833 gccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 41608734  T
Q  219 acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41608733 acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaa 41608634  T
Q  319 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  41608633 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctgtctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgat 41608547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Original strand, 23188895 - 23189279
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188895 ttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacaca-cggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 23188993  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23188994 caaaaggtgccattcctaaactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaaaaacaca 23189093  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189094 aactctcaataaatcctctagcgactgaactgtcctctccgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 23189193  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23189194 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 23189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 24708048 - 24707647
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24708048 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 24707949  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24707948 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 24707849  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24707848 caagaacacaaaccctcaataaatcttctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttaga 24707749  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  24707748 acccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatttcc 24707649  T
Q  401 tt 402  Q
    ||    
T  24707648 tt 24707647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21325832 - 21325431
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21325832 catcttaactttctcagtggtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacccgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 21325733  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325732 gataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaataataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 21325633  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  21325632 caagcacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccggactcaatctcaacttaga 21325533  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  21325532 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatataatgctcgacagaacaccatgcaacttcacaatttcc 21325433  T
Q  401 tt 402  Q
    ||    
T  21325432 tt 21325431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 24675366 - 24675767
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24675366 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgacca 24675465  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675466 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 24675565  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24675566 caagaacacagactctcagcaaatcctctagcgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttaga 24675665  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||    
T  24675666 acccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatctcc 24675765  T
Q  401 tt 402  Q
    ||    
T  24675766 tt 24675767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21145596 - 21145201
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21145596 catctgaactttctcagtagtttgctggacaatctttggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttttgcatctccgacca 21145497  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21145496 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatggctatcccaagttcctccttgct 21145397  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21145396 caagaacac-----------aaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 21145308  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  21145307 acccaaagcatcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 21145208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Original strand, 23063954 - 23064346
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23063954 catcttaaccttctcggtagtttgttcaacaatctctggtcctaagaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 23064053  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23064054 tataaagcctcataaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgct 23064153  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  23064154 caagtacacaaactctcaacaaatcttcaaaagactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttaga 23064253  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23064254 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaacttggatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcac 23064346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22757023 - 22756630
Alignment:
Q  7 aactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22757023 aactttctcagtaatctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactca--ccaacacaacggagttctacatctccgaccatataaa 22756926  T
Q  107 gcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaa 206  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |    
T  22756925 gcctcaaagggtgccattccaatactagaacggtaactgttattgtacgtgaagtctatcaacggaagatgactatccgaagtccctcctttctcaagta 22756826  T
Q  207 cacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaa 306  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  22756825 cacaaaccctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaa 22756726  T
Q  307 agcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 402  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  22756725 agcctcttgaaaactcttccaaaatctagaggtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 22756630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 16925137 - 16925378
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16925137 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16925236  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925237 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16925336  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925337 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 16925378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24825848 - 24825472
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  24825848 catcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcccaaaactacactctcacctgactcaacccaacacaacggagtcctacacctccgacca 24825749  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24825748 tacagagcttcaaaaggtgccataccaatactagaatgttaactattattatacgtgaactctatcaacgggagatgactatcccaagttccaccttgct 24825649  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  24825648 caagtacacaaactctcaacaagtcttccagcgactgaatcgttctttccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttaga 24825549  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 377  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24825548 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 24825472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Original strand, 45529398 - 45529783
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    |||| |||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  45529398 ttcttagtagtctgttgaacaatgtccggtcccaataccacactctcaccggactcataccaacacaatggagttttgcatctccgaccatacaacgctt 45529497  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45529498 cgaacggtgccattccaatgctaaaatggtaactgttattataaatgaactcgatcaatggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacaca 45529597  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    || ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||    
T  45529598 aactctgaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctacgtctgtccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcc 45529697  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45529698 tcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgatgcaacaccatgtagcttcacaat 45529783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 62 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 30211422 - 30211088
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  30211422 gactcataccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaacgtttcgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactgttattgtaagtgaact 30211323  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30211322 cgaccaatggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatc 30211223  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30211222 tgtctgcggatgatacaccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgat 30211123  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30211122 acaatactcgatggaacaccatgtagcttcacaat 30211088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24878561 - 24878319
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24878561 catccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccgacca 24878462  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878461 tataaagcctcgaaaggtgtcattccaatactataatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 24878362  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgt 243  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24878361 caagaacacaaatcctcaacaaatcctcgagcgactgaattgt 24878319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 27365629 - 27365250
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || || |    
T  27365629 gtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccatacaaggcttcaaacg 27365530  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||    
T  27365529 gtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccct 27365430  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    ||| | ||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27365429 caatagatcctctaaggattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgc 27365330  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  27365329 aaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 27365250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Original strand, 23276711 - 23277048
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||    
T  23276711 cctgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgataactgttgttgtacgtga 23276810  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | | | ||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  23276811 actctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacaaacactttcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgacc 23276910  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || | ||| |||||     
T  23276911 atctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcgaatcactatcc 23277010  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  23277011 gacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 23277048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Original strand, 23293893 - 23294230
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    |||||||||||||  || || ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  23293893 cctgactcaaaccgacataaaggagtcctcaacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 23293992  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  23293993 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagcaaaccctccaaagattgtatcgtcctctccgactgacc 23294092  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||     
T  23294093 atctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatcc 23294192  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23294193 gacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 23294230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 245 - 407
Target Start/End: Original strand, 16923010 - 16923172
Alignment:
Q  245 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16923010 ctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 16923109  T
Q  345 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16923110 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 16923172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 243 - 407
Target Start/End: Original strand, 16925479 - 16925643
Alignment:
Q  243 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 342  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925479 tcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 16925578  T
Q  343 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16925579 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16925643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 19652557 - 19652223
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |   | ||||    
T  19652557 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgt---atgtga 19652461  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  19652460 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgacc 19652361  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||     
T  19652360 atctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatccttatcc 19652261  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| || || |||| || |||||||||    
T  19652260 gacacaatactcgacggtactccatataacttcacaat 19652223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 250 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 20442830 - 20442675
Alignment:
Q  250 cgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 349  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20442830 cgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 20442731  T
Q  350 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20442730 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacatcacaatctccttgat 20442675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 238 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24877078 - 24876911
Alignment:
Q  238 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24877078 aattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatgtagaa 24876979  T
Q  338 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24876978 gtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24876911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Original strand, 20832917 - 20833254
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  20832917 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 20833016  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    |||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||    
T  20833017 tgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactg 20833116  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||    
T  20833117 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctcta 20833216  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  20833217 tccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 20833254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 395
Target Start/End: Original strand, 12574290 - 12574624
Alignment:
Q  61 tgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaac 160  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || ||||||    
T  12574290 tgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaac 12574389  T
Q  161 tcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccat 260  Q
    || ||||| || || ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||    
T  12574390 tctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccat 12574489  T
Q  261 ctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 360  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||    
T  12574490 ctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccga 12574589  T
Q  361 tacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12574590 cacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 12574624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 53 - 395
Target Start/End: Original strand, 27787670 - 27788012
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || || |    
T  27787670 ctttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgagtgataactgttgttgt 27787769  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||    
T  27787770 aggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccga 27787869  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||     
T  27787870 ctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcc 27787969  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27787970 ctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27788012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Original strand, 31830587 - 31830927
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  31830587 ctttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttat 31830686  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| || || ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||    
T  31830687 aagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccga 31830786  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  31830787 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatct 31830886  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  31830887 ctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 31830927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 92 - 393
Target Start/End: Original strand, 20828227 - 20828528
Alignment:
Q  92 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 191  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  20828227 ctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctc 20828326  T
Q  192 ctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatct 291  Q
    | ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  20828327 caccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacct 20828426  T
Q  292 caacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttc 391  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||    
T  20828427 caacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttc 20828526  T
Q  392 ac 393  Q
    ||    
T  20828527 ac 20828528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11358385 - 11358057
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  11358385 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 11358286  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    | ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||    
T  11358285 taaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctctagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactg 11358186  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||    
T  11358185 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcccta 11358086  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    || || |||||||| || |||||||||||    
T  11358085 tccgacacaatgctagacggaacaccatg 11358057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 393
Target Start/End: Original strand, 1063689 - 1064020
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  1063689 gactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatacttgaatgatagctgttgttataagtaaact 1063788  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1063789 caatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttcccatgattgaattgtcctctccgactgaccatc 1063888  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||     
T  1063889 tgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaatttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgac 1063988  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  1063989 acaatactagacggaacaccatgaagtttcac 1064020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 396
Target Start/End: Original strand, 24948564 - 24948861
Alignment:
Q  99 catacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttg 198  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||    
T  24948564 catacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttg 24948663  T
Q  199 ctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttc 298  Q
    |||||| ||||| | ||||   |||||||| |  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  24948664 ctcaagcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacatc 24948763  T
Q  299 gagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||  |||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  24948764 gaaaccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 24948861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 285
Target Start/End: Original strand, 23087353 - 23087611
Alignment:
Q  27 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcc 126  Q
    ||||||| |||||||| || |  || |||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  23087353 gaacaatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagttccgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccatacc 23087452  T
Q  127 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 226  Q
    |||| | ||||| || || || || || |||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||    
T  23087453 aatagtcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacgataggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagcaaatcc 23087552  T
Q  227 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 285  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  23087553 tctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgccgatgataagctgaact 23087611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 215 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21125509 - 21125331
Alignment:
Q  215 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 314  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  21125509 ctcaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatctt 21125410  T
Q  315 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21125409 gcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaaccccatgtaacttcac 21125331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 308 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23107989 - 23107901
Alignment:
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23107989 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 23107901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Original strand, 23110892 - 23111007
Alignment:
Q  281 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 380  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  23110892 gaactcaaccttaactttgaacccaatgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacac 23110991  T
Q  381 catgtagcttcacaat 396  Q
     ||| | |||||||||    
T  23110992 aatgcaacttcacaat 23111007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 396
Target Start/End: Original strand, 24641860 - 24642014
Alignment:
Q  242 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 341  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  24641860 gtcctatccgactaaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaagtcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 24641959  T
Q  342 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    | || ||| ||||||| || | ||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  24641960 acctcggacctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtaacttcacaat 24642014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Original strand, 22276217 - 22276538
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||    
T  22276217 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaact 22276316  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||  |||||    
T  22276317 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctacccatc 22276416  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| ||     
T  22276417 agtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatc-gac 22276515  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  22276516 acaatactagaaggaataccatg 22276538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 384
Target Start/End: Original strand, 25128758 - 25128907
Alignment:
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
    |||||| ||||||||   ||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||    
T  25128758 ctgaatagtcctctctatctgcccatcggtatggggatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaactta 25128857  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25128858 gaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25128907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23817559 - 23817291
Alignment:
Q  61 tgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaac 160  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| |||    
T  23817559 tgactcaaaccaacacaacggtgtcctacatctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaac 23817460  T
Q  161 tcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccat 260  Q
    || ||||| || | |      ||||||    | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| || ||||  | ||||||||    
T  23817459 tcaatcaatggtaaacatacgtcccaacagacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagttctctttgtctgaccat 23817360  T
Q  261 ctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaa 329  Q
    | ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  23817359 cggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaa 23817291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24570182 - 24569851
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||| || || || ||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || || |    
T  24570182 ctttctcctaactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctctgacgatataaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttgt 24570083  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgacta-tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccg 251  Q
    |||| ||||| |||||||| | |  |||  ||| || |    |||||||| | |||||||| |||||||||||| || |    |||||| ||||| || |    
T  24570082 aagtaaactcaatcaacggtaaac-actcgtccgaactgaaaccttgctccaaaacacaaactctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctttctg 24569984  T
Q  252 actgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 351  Q
      || ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||    
T  24569983 tttgcccatcggtgtgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatc 24569884  T
Q  352 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
     | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  24569883 ccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 24569851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24831692 - 24831370
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||| | || || || ||||| ||||    
T  24831692 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactaacatgaaaactgttgttgtaagtaaact 24831593  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  24831592 caatcaatggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 24831493  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
     | ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  |||||||   |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||  |||| | ||| ||     
T  24831492 ggactgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaaggagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcagatcccgatccgac 24831393  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  24831392 acaatactagaaggaataccatg 24831370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22762083 - 22761752
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||  || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | || || || |    
T  22762083 ctttctcctgattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgt 22761984  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||  | |||||||  ||||||||||||||| |     ||||  |||||||| |     
T  22761983 aagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgcttcaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactttgaagagtcctctctgt 22761884  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||     
T  22761883 ctgcccatcggtctgaggatggtaagaagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcc 22761784  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22761783 cgatccgacacaatactaaaaggaataccatg 22761752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12640424 - 12640315
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  12640424 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 12640325  T
Q  162 cgatcaacgg 171  Q
    | ||||||||    
T  12640324 caatcaacgg 12640315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 170
Target Start/End: Original strand, 25128576 - 25128693
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||| |||||| | || || || |    
T  25128576 ctttcacccgactcaaaccaacataacggcgtcctacacctccgaccatacaaagcatcaaacggtgtcataccgatacttgaatgaaaactgttgttgt 25128675  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacg 170  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  25128676 aagtaaactcaatcaacg 25128693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 171
Target Start/End: Original strand, 23890753 - 23890829
Alignment:
Q  95 cgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 171  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  23890753 cgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 23890829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 37291704 - 37291300
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291704 catctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 37291605  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291604 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 37291505  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37291504 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcga 37291405  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  37291404 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 37291305  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  37291304 ttgat 37291300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 19770138 - 19770542
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19770138 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 19770237  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770238 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 19770337  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19770338 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 19770437  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  19770438 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 19770537  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  19770538 ttgat 19770542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 34566672 - 34567078
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34566672 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 34566771  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566772 tacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 34566871  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34566872 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 34566971  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  34566972 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctct 34567071  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  34567072 ttgatgt 34567078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 27668698 - 27668294
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27668698 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 27668599  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27668598 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgtt 27668499  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27668498 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 27668399  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  27668398 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 27668299  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  27668298 ttgat 27668294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 40708958 - 40709362
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40708958 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 40709057  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709058 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 40709157  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40709158 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 40709257  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  40709258 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttaacaatctcc 40709357  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  40709358 ttgat 40709362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 16356680 - 16357086
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16356680 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16356779  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356780 tacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16356879  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16356880 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 16356979  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  16356980 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctct 16357079  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  16357080 ttgatgt 16357086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 27518585 - 27518991
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27518585 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaacca 27518684  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27518685 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcccccttgct 27518784  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27518785 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgtcgaactcaatctcaacttcga 27518884  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  27518885 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctct 27518984  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  27518985 ttgatgt 27518991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 27685608 - 27685204
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685608 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 27685509  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685508 tataaggcctcgaaaggtgtcattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 27685409  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27685408 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcga 27685309  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  27685308 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 27685209  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  27685208 ttgat 27685204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 27610532 - 27610936
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27610532 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 27610631  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27610632 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagtccctccttgct 27610731  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27610732 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacaccgaactcaatctcaacttcga 27610831  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  27610832 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 27610931  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  27610932 ttgat 27610936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14999947 - 14999543
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999947 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 14999848  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14999847 tataaagtctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaaattcctccttgct 14999748  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14999747 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatatgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcga 14999648  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  14999647 acccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 14999548  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  14999547 ttgat 14999543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22333088 - 22332691
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22333088 actttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaag 22332989  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332988 cctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtctgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 22332889  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22332888 acaaattctgaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaa 22332789  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  22332788 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 22332691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 22134846 - 22135250
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134846 catctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaactagcacaacggagttctgcatctccgacca 22134945  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134946 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 22135045  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22135046 caagaacaaaaattctcaacaaattctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcga 22135145  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||    
T  22135146 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctcc 22135245  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  22135246 ttgat 22135250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 41771020 - 41771424
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41771020 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 41771119  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  41771120 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgagctcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgtt 41771219  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41771220 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctgaacttcga 41771319  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  41771320 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 41771419  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  41771420 ttgat 41771424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 22348601 - 22349005
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22348601 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagactactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcacctccgacca 22348700  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22348701 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 22348800  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  22348801 caagaacacaaatccccaacaaatcattgagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctctgcttcga 22348900  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  22348901 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 22349000  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  22349001 ttgat 22349005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29476281 - 29475898
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476281 catccgaactttttcagtagtctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 29476182  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476181 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 29476082  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  29476081 caagaacacaaattctcaaaaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttcga 29475982  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29475981 accccaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatg 29475898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 23573920 - 23574321
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23573920 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 23574019  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23574020 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 23574119  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23574120 caagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttaga 23574219  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23574220 acccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatcaataaatgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcc 23574319  T
Q  401 tt 402  Q
    ||    
T  23574320 tt 23574321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 384
Target Start/End: Original strand, 23516735 - 23517102
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23516735 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataccaagcctcaaaag 23516834  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  23516835 gtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactct 23516934  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  23516935 caacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaaccctcttgc 23517034  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23517035 aaactctttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 23517102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 18775955 - 18776352
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775955 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 18776054  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  18776055 tacaaagcctcaaaaggtgccattcgaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa-------tgactatcccaagttcctccttgct 18776147  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18776148 caagaacacaaagtttcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcga 18776247  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||    
T  18776248 acctaaggcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcataatctcc 18776347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Original strand, 20798938 - 20799314
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20798938 catcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctttggtcctaagacctctctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 20799037  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799038 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 20799137  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  20799138 caagaacacaaactcgcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtccgcggataataagccaaactcaatctcaacttaga 20799237  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 377  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799238 acccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 20799314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 364
Target Start/End: Original strand, 23440409 - 23440766
Alignment:
Q  7 aactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23440409 aactttctcagtagtttgctgaacaatctctggttttaagaccactctttctcctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaa 23440508  T
Q  107 gcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaa 206  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23440509 gcctgaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtaaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttccaccttgctcaagaa 23440608  T
Q  207 cacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaa 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||    
T  23440609 cacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatttttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaatctcaacttagaacccaa 23440708  T
Q  307 agcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440709 agcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 23440766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Original strand, 25423367 - 25423759
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25423367 catcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctttggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 25423466  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25423467 tacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatccctagttcctccttgct 25423566  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  25423567 caagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcttctctgtctgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 25423666  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25423667 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcac 25423759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21339494 - 21339099
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21339494 catcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 21339395  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339394 tacaaagcctcgaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 21339295  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  21339294 caagtacacaaactctcaacaagttctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 21339195  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21339194 acctaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21339099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21498244 - 21497850
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21498244 catcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgacca 21498145  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498144 tacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacttttattttacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 21498045  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  21498044 caagtacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgttctctccggctgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 21497945  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  21497944 acctaaagcctcttgcaaaattttccaaaatccagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaa-gaacaccatgcaacttcacaat 21497850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 23471407 - 23471802
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| | ||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23471407 catcttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttatggccccaaaactacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 23471506  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23471507 tacaaagcatcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctgttattgtacgtgaactctattaatgggagatgactatcccaagttcccccttgct 23471606  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||| ||    
T  23471607 caagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctacggatgatacgcctaactaaacctcaacttaga 23471706  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23471707 acctaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgaaggaaaaccatgtagcttcacaat 23471802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20468294 - 20467909
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||| || ||| |    
T  20468294 ttctcagtagtttgctgaacgatttatggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatgcagagctt 20468195  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20468194 caaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacaca 20468095  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    || ||||||||| ||||| | |||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  20468094 aaatctcaacaagtcctccaacgactgaatcatcctttcagactggccatctgtctgcggataatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcc 20467995  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  20467994 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgacagaacaccatgtagcttcacaat 20467909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21984513 - 21984248
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21984513 catcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgacca 21984414  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21984413 tacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgattactattattgtacgtgaactctatcaatgaaagatgactatcccaagttcctccttgct 21984314  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtct 266  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21984313 caagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtct 21984248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26738913 - 26738540
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26738913 catcttaactttctcagtagtttgttgtacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgcatctccaacca 26738814  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||| |||| |||| ||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26738813 tacaaagccttaaattgtgccattccattactggaataataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 26738714  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26738713 caagtacataaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttaga 26738614  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||||                      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26738613 acctaaagcc----------------------tataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 26738540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 63 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21564119 - 21563786
Alignment:
Q  63 actcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactc 162  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||||    
T  21564119 actcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactc 21564020  T
Q  163 gatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatct 262  Q
     |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||| |    
T  21564019 tatcaacggtagatgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgctttctccgactgaccatat 21563920  T
Q  263 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 362  Q
    || ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  21563919 gtttgcggatgataagctgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgaca 21563820  T
Q  363 caatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21563819 caatgctcgatggaacaccatgcagcttcacaat 21563786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24749746 - 24749370
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  24749746 gtagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacg 24749647  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||    
T  24749646 gtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccct 24749547  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    ||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24749546 caacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgc 24749447  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24749446 aaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24749370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Original strand, 22502846 - 22503231
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |  |||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || |||||  | || |||||||||||||| |    
T  22502846 actttctcagtagtctcatgaaccaagtctggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcttacacctccgaccatacaagg 22502945  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  22502946 cttcgaacggtgccatgccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcac 22503045  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22503046 acacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaat 22503145  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22503146 gcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgaagcttcac 22503231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14887147 - 14886807
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  14887147 ctttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccggccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttat 14887048  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||    
T  14887047 aagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccga 14886948  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  14886947 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatct 14886848  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14886847 ctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 14886807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22236121 - 22235733
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || || || || ||||||||||||||| | || |||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22236121 actttctctgtagtctgatgaaccaactccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagaataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaag 22236022  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | ||||| | |||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  22236021 cttcgaacgatgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtac 22235922  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||| | |||||  |||||||| |  || || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  22235921 acacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaa 22235822  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22235821 gcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 22235733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 286
Target Start/End: Original strand, 21405008 - 21405285
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa--gc 108  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| |  | |||  | ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||    
T  21405008 ttctcagtagtctgttgaacaatgtctggtcccagtatcacaatctcaccggactcataccaacacaacgaagttctgcatctccgaccatacaacacgc 21405107  T
Q  109 ctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaaca 208  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21405108 ttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaatgaaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtaca 21405207  T
Q  209 caaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 286  Q
     ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21405208 taaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 21405285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 396
Target Start/End: Original strand, 22381414 - 22381754
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| |    
T  22381414 tcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaatagtgccatacctatactcgagtgatagctgttgttatatg 22381513  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || ||||||||||||||    
T  22381514 tgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactg 22381613  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    |||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||    
T  22381614 accatctgcctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatcccta 22381713  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22381714 tccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 22381754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21831896 - 21831574
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||| | || || || || || |    
T  21831896 tcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcaaatggtgtcattcctatactagaaaggtaactgttgttgtacg 21831797  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||                     
T  21831796 tgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactga----------------- 21831714  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
     |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21831713 -ccatgtgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttcgatctcta 21831615  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||    
T  21831614 tctgacacaatgctcgacagaacacggtgcagcttcacaat 21831574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23080263 - 23079902
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  23080263 tctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccataccaatactcg 23080164  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  ||    
T  23080163 agtgatagctgttgttatatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatga 23080064  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
     || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || |||    
T  23080063 ttggatcgtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaaccta 23079964  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || || || | ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  23079963 gaggtgaacctcgaatccctatccgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 23079902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21890960 - 21890572
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |  |||| ||| || || || ||||| || ||||||||||| || || |||||  || | ||||||||||||||||    
T  21890960 actttctctgtagtctgatgaaccaaatctgttcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataatggagtcttgtacctccgaccatacaaag 21890861  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| | |||||||||  |    
T  21890860 cttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgagtatcccaagctccacgttgctcaagtgc 21890761  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||     
T  21890760 acacattctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaag 21890661  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21890660 gcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatggaacttcacaat 21890572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Original strand, 25848290 - 25848627
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  25848290 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 25848389  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    | ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || |  || |||||||| |||||||||||    
T  25848390 taaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcatacacatcctcaacaaatcttccaatgattgaattgttctctccgactg 25848489  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| | ||||| || |||||||| || || |||||||||    
T  25848490 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcggatctcta 25848589  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25848590 tccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 25848627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37545652 - 37545336
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  37545652 ctttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaggcttcgaacagtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttat 37545553  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||    
T  37545552 aagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccga 37545453  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  37545452 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaaattttccagaacctagaagtgaacctcggatct 37545353  T
Q  353 ctatctgatacaatgct 369  Q
    ||||| || ||||||||    
T  37545352 ctatccgacacaatgct 37545336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Original strand, 20342497 - 20342834
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  20342497 tcacccgactcaaactagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 20342596  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  20342597 tgaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 20342696  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||||    
T  20342697 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctcta 20342796  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  20342797 tccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcac 20342834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24798553 - 24798213
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  24798553 ctttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttat 24798454  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||| |||||    
T  24798453 aagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctcctccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctttccga 24798354  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||     
T  24798353 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcagtttcgaccccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcc 24798254  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  24798253 ctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 24798213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 59 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17269483 - 17269148
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || || || ||||    
T  17269483 cctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtga 17269384  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||    
T  17269383 actctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgacc 17269284  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| | | |||||| ||||| |||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||||     
T  17269283 atctgtctgaggatgataagccgaa-ttagtctcaatttcgaacccagagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatcc 17269185  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17269184 gacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 17269148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 87 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1150 - 919
Alignment:
Q  87 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 186  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  1150 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccta 1051  T
Q  187 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 286  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1050 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactc 951  T
Q  287 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 318  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  950 aacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaa 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 53 - 360
Target Start/End: Original strand, 22462164 - 22462471
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || || || || |    
T  22462164 ctttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaacactcgaatggtaactgttgttgt 22462263  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | || || || ||||| || || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  || || || ||||| |||||    
T  22462264 atgtaaattctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaatcctctaatgattggatcgtcctttccga 22462363  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  22462364 ctgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttgggtct 22462463  T
Q  353 ctatctga 360  Q
    ||||||||    
T  22462464 ctatctga 22462471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 158 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24716577 - 24716342
Alignment:
Q  158 aactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 257  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||    
T  24716577 aactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgac 24716478  T
Q  258 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 357  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | |||||||||    
T  24716477 catctgtctgaggatgctaagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatc 24716378  T
Q  358 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24716377 cgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24716342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 93 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28923884 - 28923581
Alignment:
Q  93 tccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcc 192  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  28923884 tccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctcc 28923785  T
Q  193 tccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctc 292  Q
     || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  28923784 accctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttc 28923685  T
Q  293 aacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 392  Q
    || ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| | |||||    
T  28923684 aatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttca 28923585  T
Q  393 caat 396  Q
    ||||    
T  28923584 caat 28923581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 164 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24620340 - 24620111
Alignment:
Q  164 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 263  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||    
T  24620340 atcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctg 24620241  T
Q  264 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 363  Q
    |||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||    
T  24620240 tctgaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacac 24620141  T
Q  364 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24620140 aatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24620111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 396
Target Start/End: Original strand, 20821705 - 20822008
Alignment:
Q  93 tccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcc 192  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||  || ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  20821705 tccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttgttgtatgtgagttctatcaatggtagatgactatcccaagctcc 20821804  T
Q  193 tccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctc 292  Q
     || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20821805 accctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctc 20821904  T
Q  293 aacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 392  Q
    || || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| | |||||    
T  20821905 aattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttca 20822004  T
Q  393 caat 396  Q
    ||||    
T  20822005 caat 20822008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 384
Target Start/End: Original strand, 20774012 - 20774302
Alignment:
Q  93 tccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcc 192  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  20774012 tccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctcc 20774111  T
Q  193 tccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctc 292  Q
     || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  20774112 accctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggat-gtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttc 20774210  T
Q  293 aacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    || ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  20774211 aatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttgggtctctgtctgacactatactcgacggaaccccatg 20774302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28916517 - 28916226
Alignment:
Q  105 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 204  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  28916517 aagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaag 28916418  T
Q  205 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 304  Q
     ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||    
T  28916417 tacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatccc 28916318  T
Q  305 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  28916317 aacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaat 28916226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28895058 - 28894755
Alignment:
Q  93 tccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcc 192  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  28895058 tccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctcc 28894959  T
Q  193 tccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctc 292  Q
     || |||||||| ||||| |  || | ||||| | |||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  28894958 accctgctcaagtacacatacccttagcaaattcactaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttc 28894859  T
Q  293 aacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 392  Q
    || ||||| |||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| | |||||    
T  28894858 aatttcgatcccaacacatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttca 28894759  T
Q  393 caat 396  Q
    ||||    
T  28894758 caat 28894755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 396
Target Start/End: Original strand, 21496481 - 21496713
Alignment:
Q  164 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 263  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || |||||| |||||||||||     
T  21496481 atcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctcctactgaccatcta 21496580  T
Q  264 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 363  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  21496581 tttgcgaatgataagccgaactcaaccttaacttagaacccagggcattttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacac 21496680  T
Q  364 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||| || || ||||| ||||| | |||||||||    
T  21496681 aatacttgatggaaccccatgcaacttcacaat 21496713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 282 - 396
Target Start/End: Original strand, 21407597 - 21407711
Alignment:
Q  282 aactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacacc 381  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21407597 aactcaaactcaacttaggacccaacgcctcctgcaaactcttccgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacacc 21407696  T
Q  382 atgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||    
T  21407697 atgtagcttcacaat 21407711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21937332 - 21937013
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| |    
T  21937332 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 21937233  T
Q  165 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 264  Q
    ||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||    
T  21937232 tcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggt 21937133  T
Q  265 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 364  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |||    
T  21937132 ctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacaca 21937033  T
Q  365 atgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    || || ||||||| ||||||    
T  21937032 atactagaaggaataccatg 21937013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Original strand, 24581432 - 24581753
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  24581432 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 24581531  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| | |      ||||||    | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  24581532 caatcaacggtaaacattcgtcccaaccaacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctg-ccatc 24581630  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| ||     
T  24581631 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccaatccgac 24581730  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  24581731 acaatactagaaggaataccatg 24581753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 384
Target Start/End: Original strand, 27011306 - 27011627
Alignment:
Q  63 actcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactc 162  Q
    |||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||| | || || || ||||| |||||    
T  27011306 actcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactc 27011405  T
Q  163 gatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatct 262  Q
     |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||| ||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| |||||     
T  27011406 aatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctctaacacataagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcg 27011505  T
Q  263 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 362  Q
    ||||| ||||| || ||  |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  27011506 gtctgaggatggtaagcaaaactcaatctcaacttagttcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 27011605  T
Q  363 caatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  27011606 caatactagaaggaataccatg 27011627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24735803 - 24735682
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || | ||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  24735803 gtagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttcttccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacg 24735704  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatg 138  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  24735703 gtgccataccaatactcgaatg 24735682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25244323 - 25244175
Alignment:
Q  236 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 335  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25244323 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25244224  T
Q  336 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25244223 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25244175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25308475 - 25308327
Alignment:
Q  236 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 335  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25308475 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25308376  T
Q  336 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25308375 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25308327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 11210841 - 11210732
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||  || || || |||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||    
T  11210841 gactcaaaccaacacaacgatgtcctacacctcctaccatacaaggcctcaaacggtgtcattccaatactagaatgaaaactattgttgtaagtaaact 11210742  T
Q  162 cgatcaacgg 171  Q
    | ||||||||    
T  11210741 caatcaacgg 11210732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21229308 - 21229241
Alignment:
Q  74 cacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgata 141  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21229308 cacaaaggagtcctgcatctgcgaccatacaatgcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgata 21229241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 351
Target Start/End: Original strand, 23503655 - 23503952
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||  | |||||||||||||||||||  || || ||||| || | |||||||||| |  | || || |    
T  23503655 ctttcaccagactcaaaccaacacaacggtgtcctagacctccgaccatacaaagccttaaacggagccataccgacactagaatgaaaattgttgttgt 23503754  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
     ||| ||||| |||||||| | |    | |||||| |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |    |||||| ||||||||||     
T  23503755 tagtaaactcaatcaacggtaaacatttgtcccaactaacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctccgt 23503854  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 351  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||    
T  23503855 ctgcctatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttag-ttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatc 23503952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16065665 - 16065604
Alignment:
Q  236 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaactt 297  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  16065665 tgaattgttctctccgcatgaccatcagtctgaggataataagcagaactcaatctcaactt 16065604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 51333591 - 51333187
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51333591 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 51333492  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333491 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 51333392  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51333391 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 51333292  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  51333291 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 51333192  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  51333191 ttgat 51333187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16350697 - 16350293
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16350697 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16350598  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350597 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16350498  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16350497 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 16350398  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  16350397 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 16350298  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  16350297 ttgat 16350293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 19106628 - 19107032
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106628 catcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 19106727  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106728 tacaaagactcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 19106827  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19106828 caagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 19106927  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  19106928 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatattggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 19107027  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  19107028 ttgat 19107032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 33391127 - 33390723
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33391127 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 33391028  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391027 tacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 33390928  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33390927 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 33390828  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  33390827 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 33390728  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  33390727 ttgat 33390723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 17045113 - 17044709
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17045113 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 17045014  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17045013 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgct 17044914  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17044913 caagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgataagccgaactcaatctcaacttcga 17044814  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  17044813 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctgtctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctcc 17044714  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  17044713 ttgat 17044709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 21837211 - 21837615
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21837211 catctgaactgtctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttgtgcatctccgacca 21837310  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837311 tacaaagcgtcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 21837410  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21837411 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 21837510  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  21837511 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 21837610  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  21837611 ttgat 21837615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 21830564 - 21830968
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21830564 catctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgacca 21830663  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21830664 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 21830763  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21830764 cgagaacacaaatcctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcga 21830863  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||    
T  21830864 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctcc 21830963  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  21830964 ttgat 21830968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 41354567 - 41354202
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41354567 catctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 41354468  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41354467 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttact 41354368  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41354367 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 41354268  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 366  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354267 acccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 41354202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16078750 - 16078350
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078750 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 16078651  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16078650 tacaaagccttaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgct 16078551  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16078550 caagaacacaaactctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcga 16078451  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| | ||||||| |||    
T  16078450 agccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag----accatgtaacctcacaatctcc 16078355  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  16078354 ttgat 16078350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 50620342 - 50619959
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50620342 catcttaaccttctcagtagtttattgaacaatctcaggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 50620243  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50620242 tacaaagcctcaaaaggtgcaattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaatttcctccttgct 50620143  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  50620142 caagtacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 50620043  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620042 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 50619959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 396
Target Start/End: Original strand, 16369575 - 16369953
Alignment:
Q  18 tagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaagg 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |    
T  16369575 tagtttgttgaacaatctctggtcctaaaaccacattctcacctcactcaaaccaacacaacgaagttctgcacctcctaccatacaaagcctcaaaaag 16369674  T
Q  118 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 217  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16369675 tgtcattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccacgttcctccttgctcaagtacacaaactctc 16369774  T
Q  218 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 317  Q
    ||||| || || | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  16369775 aacaagtcttccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttatagcctaaagcctcttgca 16369874  T
Q  318 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369875 aacccttccaaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 16369953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 19760954 - 19760569
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |    
T  19760954 ttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacagagctt 19760855  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19760854 cgaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacatgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacaca 19760755  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    || ||||| ||| || || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| || || |||||     
T  19760754 aactctcagcaagtcttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacttcaacttagaacctaaagct 19760655  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19760654 tcttgcaaactcttctaaaatctagaggtaaacctcggatttctatccgatacaatgttcgatggaacaccatgtagcttcacaat 19760569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 20137039 - 20137316
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20137039 catcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccaacacaacgaagttctgcatctccgacca 20137138  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20137139 tacaaagcttcataaggcgccattcctatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgct 20137238  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 278  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20137239 caagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctacggatgatatg 20137316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 20250111 - 20250378
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20250111 catcttaactttctcagtagtttgttgaacgatctctggtcctaagaccactctttcgcttgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 20250210  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20250211 tacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttccaccttgct 20250310  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgc 268  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20250311 caagtacataaactctcaacaaatcctccaacgactgaatcgtcctctccaactgaccatctgtctgc 20250378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 147 - 396
Target Start/End: Original strand, 21749348 - 21749597
Alignment:
Q  147 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 246  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  21749348 tattatacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcct 21749447  T
Q  247 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21749448 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 21749547  T
Q  347 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21749548 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21749597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 176 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22362167 - 22361947
Alignment:
Q  176 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362167 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaaatcttccaacaactaaatcgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgat 22362068  T
Q  276 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 375  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362067 acgccgaactcaacctcaacttagatcttaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatctgacacaatgctcgaagg 22361968  T
Q  376 aacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  22361967 aacaccatgcaacttcacaat 22361947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Original strand, 37677396 - 37677733
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  37677396 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 37677495  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    |||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| || || | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  37677496 tgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacgcacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 37677595  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||||    
T  37677596 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctcta 37677695  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  37677696 tccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 37677733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 393
Target Start/End: Original strand, 19854633 - 19854966
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  19854633 cctgactcaaaccagcgtaaaggagtcctgcacctccgactatacaaagcttcgaaccgtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 19854732  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || | |||||  |||||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  19854733 actc-atcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacgcacactctcagtaaatcctccagtgattggatcgtcctctccgactgacc 19854831  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||     
T  19854832 atctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatcc 19854931  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  19854932 gacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcac 19854966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20835979 - 20835591
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  20835979 actttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaaaacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagttctacacctccgaccatacaaag 20835880  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  20835879 cttcgaacggagccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtac 20835780  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||| | ||||| ||||||||| |  ||  | || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  20835779 acacactctcagcaaatcctccaaggatggtatcgttctctccgattgaccgtctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaat 20835680  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || |||||  | || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20835679 gcatcttgtcagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaattctcgacggtacaccatgtagcttcacaat 20835591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22433156 - 22432817
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||    
T  22433156 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccaaccatacaaagcttcgaatggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttatatgtga 22433057  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |  ||||||||||| || |  || || ||||||||||||||||||||    
T  22433056 actctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaaccacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggattgtcctctccgactgacc 22432957  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| || || ||||| |||||     
T  22432956 atctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctataagtgaacctcggatccctatcc 22432857  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaattt 398  Q
    || ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  22432856 gacacaatactcgaaggaacttcatgcagcttcacaattt 22432817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20940103 - 20939770
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  20940103 cctgactcaaactagcataaaggagtcctatacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataacaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtga 20940004  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  20940003 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaataaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgacc 20939904  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||   ||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  20939903 atctgtttgcggatgataagtcgaactcggcctcaacttctaacccaaaacgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatcc 20939804  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 392  Q
    || ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  20939803 gacacaatacttgacggtacaccatgtagcttca 20939770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Original strand, 20294728 - 20295065
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  20294728 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccaaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 20294827  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||    
T  20294828 tgaactcaatcaatggaaggtgactatccgaagctccaccctgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactg 20294927  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || | ||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||    
T  20294928 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtagactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcccta 20295027  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  20295028 tccgacacaatactcgacggtacaccatgaagcttcac 20295065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 125 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 24099577 - 24099306
Alignment:
Q  125 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 224  Q
    |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  24099577 ccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaat 24099478  T
Q  225 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 324  Q
    |||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  24099477 cctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactctt 24099378  T
Q  325 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  24099377 ccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 24099306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 326
Target Start/End: Original strand, 41308148 - 41308411
Alignment:
Q  63 actcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactc 162  Q
    |||||||||| || || |||||  |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || ||||||||    
T  41308148 actcaaaccaacataaaggagtcatgcaccttcgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgctaattgttgttgtacgtgaactc 41308247  T
Q  163 gatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatct 262  Q
     |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||    
T  41308248 tatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatct 41308347  T
Q  263 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 326  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||    
T  41308348 gtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttcc 41308411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 21747795 - 21747935
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21747795 catcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcgcctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgagca 21747894  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgata 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21747895 tacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgata 21747935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20856807 - 20856476
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| || || || || |    
T  20856807 ctttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcaaacggtgccataccaacactcgaatggtaactgttgttgt 20856708  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | || || || ||||| || || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  || || || ||||| |||||    
T  20856707 atgtaaattctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaatcctctaatgattggatcgtcctttccga 20856608  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  20856607 ctgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttgggtct 20856508  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||    
T  20856507 ctatctgacactatacttgacggaacaccatg 20856476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 92 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 19663143 - 19662844
Alignment:
Q  92 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  19663143 ctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccgatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctc 19663044  T
Q  192 ctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatct 291  Q
    | ||||| ||||| ||||| | |||||        || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  19663043 caccttgttcaagcacacacactctcagtt-----tccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacct 19662949  T
Q  292 caacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttc 391  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  19662948 caacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttc 19662849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 149 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 31539947 - 31539703
Alignment:
Q  149 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 248  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||    
T  31539947 ttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctct 31539848  T
Q  249 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||    
T  31539847 ccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacttcattttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcgg 31539748  T
Q  349 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  31539747 atctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 31539703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 271 - 396
Target Start/End: Original strand, 20139361 - 20139486
Alignment:
Q  271 atgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 370  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20139361 atgatacgccaaactcaacctcaactcagaacctaaagcttcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 20139460  T
Q  371 gaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  20139461 gaaggaacaccatgcaacttcacaat 20139486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 314 - 384
Target Start/End: Original strand, 20250376 - 20250446
Alignment:
Q  314 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250376 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatttctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 20250446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20831426 - 20831107
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| |    
T  20831426 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 20831327  T
Q  165 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 264  Q
    ||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||    
T  20831326 tcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggt 20831227  T
Q  265 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 364  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |||    
T  20831226 ctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacaca 20831127  T
Q  365 atgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    || || ||||||| ||||||    
T  20831126 atactagaaggaataccatg 20831107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Original strand, 20914523 - 20914854
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |  | || || |    
T  20914523 ctttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagtatgaaaattgtttttgt 20914622  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| ||||| || | |      | |||| || | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    || ||| |||||||| |     
T  20914623 aagtaaactcaatcaatggtaaactttcgttccaacttacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctaaatagtcctctcagt 20914722  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||| || |||||     
T  20914723 ctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccagaacttagaagtaaacctcggatcc 20914822  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  20914823 cgatccgacacaatactagaaggaataccatg 20914854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31550227 - 31550136
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagct 144  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  31550227 ctttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 31550136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22135421 - 22135272
Alignment:
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  22135421 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 22135322  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22135321 gaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 22135272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 41353402 - 41353357
Alignment:
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41353402 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 41353357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22135604 - 22135520
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||    
T  22135604 ctttcacctgactcaaaccaacacaatggcgtcctacaccttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccatatcgatactagaat 22135520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 351
Target Start/End: Original strand, 20184683 - 20184792
Alignment:
Q  242 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 341  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||    
T  20184683 gtcctctctgtctgcctatcagtctgggaatgataagcagaactcaatctcaacttggttcccaaagctacttgtaaactctcccaaaacatagaagtaa 20184782  T
Q  342 atcttggatc 351  Q
    |||| |||||    
T  20184783 atctcggatc 20184792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 18297451 - 18297855
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18297451 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 18297550  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297551 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 18297650  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18297651 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 18297750  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  18297751 acccaaggcctcttgcaaacttttccgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 18297850  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  18297851 ttgat 18297855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 8386658 - 8387064
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8386658 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 8386757  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386758 tacaaagcttcgaacggcgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 8386857  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8386858 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 8386957  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  8386958 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 8387057  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  8387058 ttgatgt 8387064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 12476846 - 12477252
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12476846 catctgaacttcctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 12476945  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476946 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 12477045  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12477046 caagaacacaaattctcaacaaatcctcttgcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 12477145  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  12477146 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctct 12477245  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  12477246 ttgatgt 12477252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 29039170 - 29038764
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29039170 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 29039071  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039070 tacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 29038971  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29038970 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 29038871  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||     
T  29038870 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctct 29038771  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  29038770 ttgatgt 29038764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 27711582 - 27711986
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27711582 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 27711681  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711682 tacaaagtctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 27711781  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27711782 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 27711881  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  27711882 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 27711981  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  27711982 ttgat 27711986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 12523922 - 12524328
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12523922 catcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaaaaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 12524021  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12524022 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 12524121  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12524122 caagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 12524221  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  12524222 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 12524321  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    |||||||    
T  12524322 ttgatgt 12524328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14303744 - 14303340
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303744 catccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 14303645  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303644 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagcatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 14303545  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14303544 caagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcga 14303445  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||    
T  14303444 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctcc 14303345  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  14303344 ttgat 14303340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 19778559 - 19778157
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19778559 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 19778460  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778459 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 19778360  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19778359 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 19778260  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  19778259 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 19778160  T
Q  401 ttg 403  Q
    |||    
T  19778159 ttg 19778157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 14680813 - 14681219
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14680813 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 14680912  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680913 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatatgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 14681012  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14681013 caagcacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcga 14681112  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||    
T  14681113 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctcc 14681212  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    || ||||    
T  14681213 ttaatgt 14681219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 8053389 - 8052985
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8053389 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagaccactctctctcctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgacca 8053290  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8053289 tacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 8053190  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8053189 gaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 8053090  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  8053089 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 8052990  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  8052989 ttgat 8052985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 405
Target Start/End: Original strand, 40473290 - 40473690
Alignment:
Q  5 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40473290 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 40473389  T
Q  105 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473390 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaataataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 40473489  T
Q  205 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  40473490 aacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcaaaccc 40473589  T
Q  305 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  40473590 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 40473689  T
Q  405 t 405  Q
    |    
T  40473690 t 40473690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 23955993 - 23956397
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23955993 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 23956092  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |    
T  23956093 tacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgacggtcctaagttcctccttgtt 23956192  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23956193 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaacttaatctcaacttcga 23956292  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  23956293 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 23956392  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  23956393 ttgat 23956397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16252211 - 16251810
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252211 catcttaaccttctcagtagtctgctgaagaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 16252112  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252111 tacaaagcctcaaaaggtgtcattccaataatagaatgataactattattgtacgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16252012  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16252011 caagaacacaaacttacaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcgaatgataagccgaactcaatctcaacttcga 16251912  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  16251911 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctcc 16251812  T
Q  401 tt 402  Q
    ||    
T  16251811 tt 16251810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 18227212 - 18226808
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18227212 catcttaactttcttagtagtcttctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactaaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 18227113  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18227112 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 18227013  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18227012 caagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcga 18226913  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||    
T  18226912 acctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaatcttggatctcgatctgatacaatgctcgaaggcacaccatgtaacctcacaatctcc 18226813  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  18226812 ttgat 18226808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16355211 - 16354816
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16355211 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggaattctccatctccgacca 16355112  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355111 tataaagcctcaaaaggtgccattcaaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16355012  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16355011 taagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttaga 16354912  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16354911 acccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaat 16354816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 15147623 - 15147249
Alignment:
Q  28 aacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcca 127  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15147623 aacaatatctggtcctaagaacactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcca 15147524  T
Q  128 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15147523 atactagaatgataactattattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcct 15147424  T
Q  228 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  15147423 ctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttcca 15147324  T
Q  328 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 402  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15147323 aaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcctt 15147249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 7090678 - 7091076
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7090678 catcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaactgagttctgcatctccgacca 7090777  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7090778 tataaagcctcataaggttccattctaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 7090877  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
     |||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  7090878 aaagaacccaaaccctcaacaaatcttctaacgactaaatcgtcctctccgactgactatctgtctgcggatgatatgctgaactcaacctcaacttaga 7090977  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 399  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7090978 acctaaagcctcttgcaaacttttctaaaatctagaagtaaattttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttc 7091076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 1640191 - 1639793
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1640191 catcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccaccctctcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatcttcgacca 1640092  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1640091 tacaaagcctcaaaaggtgacattccaatactagaatgataaatattattgtaagtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgct 1639992  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  1639991 caagtacacaaactctcaacaagtcctccagcgactgaatcgttctttccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccaaactccacctcaacttcga 1639892  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 399  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1639891 acccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaatttc 1639793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14266665 - 14266368
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266665 catctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 14266566  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266565 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactggaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 14266466  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14266465 caagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttc 14266368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14851132 - 14850737
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |  |||    
T  14851132 catcttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgagccaacacaacggagttctgcaccttcttcca 14851033  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14851032 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 14850933  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || || | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  14850932 caagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcattctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 14850833  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14850832 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 14850737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 396
Target Start/End: Original strand, 8706189 - 8706559
Alignment:
Q  26 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattc 125  Q
    |||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  8706189 tgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccgactcaaaccaacataacgaagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgtcattc 8706288  T
Q  126 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 225  Q
      ||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8706289 atatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 8706388  T
Q  226 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  8706389 ctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaactcaacgcctcttgcaaacttttc 8706488  T
Q  326 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8706489 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcagcttcacaat 8706559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 53 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15415000 - 15414657
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || || |    
T  15415000 ctttcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgt 15414901  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||| |||| ||| ||||| || ||||||||    
T  15414900 acgtgaactctatcaacggcagatgactatcccaaactccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcatctaacgattgaatcgttctctccga 15414801  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||| | |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15414800 ctggctatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttggatct 15414701  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  15414700 ctatccgacacaatacttgacggaacaccatgcagcttcacaat 15414657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Original strand, 15077915 - 15078276
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  15077915 tctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcg 15078014  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||    
T  15078015 aatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacga 15078114  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  15078115 ctgaatcgttctcttcgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctt 15078214  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  15078215 gaagtaaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaat 15078276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 61 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1649243 - 1648908
Alignment:
Q  61 tgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaac 160  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  1649243 tgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgacataccaatactcgaatggtaactgttgttgtaagtgaac 1649144  T
Q  161 tcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccat 260  Q
    || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||    
T  1649143 tctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccat 1649044  T
Q  261 ctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 360  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||||||||| ||    
T  1649043 ctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttctaaaatctggaagtgaacctcggatctctatccga 1648944  T
Q  361 tacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  1648943 cacaatactcgatggtacaccatgaagcttcacaat 1648908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 396
Target Start/End: Original strand, 15246222 - 15246565
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| |||||||||||| || | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |  || || || |    
T  15246222 ctttctcctgactcaaactagaataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtgactgttgttgt 15246321  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | || ||||| |||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || || ||||||||    
T  15246322 acgtcaactctatcaacggtagttgactatcccaacctccaccttgctcaagtacacacactctcaccaaatcctctaatgattggatcgttctctccga 15246421  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||    
T  15246422 ctgaccatctgtctggggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcgaatct 15246521  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  15246522 ctatccgatacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaat 15246565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 206 - 396
Target Start/End: Original strand, 14691353 - 14691543
Alignment:
Q  206 acacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccca 305  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |    
T  14691353 acacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaaccta 14691452  T
Q  306 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14691453 aagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 14691543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3264765 - 3264428
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  3264765 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 3264666  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    | ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  3264665 taaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 3264566  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||    
T  3264565 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctcta 3264466  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  3264465 tccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 3264428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29453508 - 29453171
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  29453508 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 29453409  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    | ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||    
T  29453408 taaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactg 29453309  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||    
T  29453308 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctcta 29453209  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  29453208 tccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 29453171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15003383 - 15002995
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||||||||    
T  15003383 actttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctccacttccgaccatacaaag 15003284  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | | ||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  15003283 ctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtac 15003184  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||| |  || | ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||     
T  15003183 acatacgcttagcaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaat 15003084  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  15003083 gcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgggtctctttccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 15002995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 56 - 396
Target Start/End: Original strand, 20891283 - 20891623
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  20891283 tcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccggccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatgatagctattgttatatg 20891382  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || ||||||||||||||    
T  20891383 tgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactg 20891482  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||| ||    
T  20891483 accatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcttta 20891582  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || ||||| || || || ||||| || | |||||||||    
T  20891583 tccgacacaatacttgacggtacaccgtgcaacttcacaat 20891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15359058 - 15358721
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| || || || || || ||||    
T  15359058 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacatgaatggtaactgttgttgtatgtga 15358959  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| | | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  15358958 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacagacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgacc 15358859  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    |||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||| |||||| ||||| || || |||||||||||     
T  15358858 atctctctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttcccaaatcttgaagtgaacctcggatctctatcc 15358759  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15358758 gacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 15358721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11207202 - 11206865
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  11207202 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 11207103  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| | ||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  11207102 tgaactcaaccaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 11207003  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || |||||||| || ||  ||||||||    
T  11207002 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttcaagaacctagaagtgaacctcagatctcta 11206903  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11206902 tccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 11206865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 14159738 - 14159955
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  14159738 catcttaaccttttcagtagtctgttgaacaatctccggtcccaaaaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccg 14159837  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14159838 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctattaatggaaggtgactatcccaagttccaccttgct 14159937  T
Q  201 caagaacacaaattctca 218  Q
    |||| ||| ||| |||||    
T  14159938 caagtacataaactctca 14159955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 396
Target Start/End: Original strand, 27900684 - 27901027
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || |    
T  27900684 ctttctcccgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgt 27900783  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || || |||||||||||    
T  27900784 atgtgaactctatgaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatacccttagcaaatcctctaaagattggatcgtcctctccga 27900883  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||    
T  27900884 ctgaccatctgtctacggatgataagctgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccccgggtct 27900983  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  27900984 ctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 27901027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 396
Target Start/End: Original strand, 33223171 - 33223564
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  33223171 actttctcagtagtttcatgaaccaagtctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaatg 33223270  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | | ||| |||| ||| ||||||||  | || ||  | || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  33223271 ctttgaatggtgtcataccaatactctattgttattttttgttttatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtac 33223370  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct-----ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagc 302  Q
    ||| | |||||  ||||| || |  || || || |||||     ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  33223371 acacactctcagtaaatcttccaatgattggatcgtcctctcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaac 33223470  T
Q  303 ccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33223471 ccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgggacaccatgtagcttcacaat 33223564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 44661837 - 44661500
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  44661837 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 44661738  T
Q  156 tgaactcgatcaacgg-aagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 254  Q
    | ||||| ||||| |  |||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || | ||| ||||| ||||||| |||||    
T  44661737 taaactcaatcaaagacaaga-gactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaacgattgaatcgtcctcttcgact 44661639  T
Q  255 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 354  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  44661638 gaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctct 44661539  T
Q  355 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  44661538 atccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 44661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 14652554 - 14652754
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  14652554 catcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgacca 14652653  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  14652654 tacagagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgaatatcccaagttcatctttgct 14652753  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  14652754 c 14652754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 255 - 396
Target Start/End: Original strand, 14159970 - 14160111
Alignment:
Q  255 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 354  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14159970 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctct 14160069  T
Q  355 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  14160070 gtctaatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14160111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 16146216 - 16146459
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||    
T  16146216 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaatcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtga 16146315  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag--aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactga 256  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||| | ||| |  |||||||| |  || ||||| ||||||| |||||||    
T  16146316 attctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcttagtaaatcctccaaagattgaatcgtcctcttcgactga 16146415  T
Q  257 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16146416 ccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccccaacttcga 16146459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 396
Target Start/End: Original strand, 15319641 - 15319792
Alignment:
Q  245 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |    
T  15319641 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacc 15319740  T
Q  345 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  15319741 tcggatctctatctgacacaatgctcgatgggacaccatgcaacttcacaat 15319792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Original strand, 15070693 - 15070862
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  15070693 tctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcg 15070792  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 204  Q
    |||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15070793 aatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaag 15070862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Original strand, 14997623 - 14997945
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  14997623 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 14997722  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| |||||    
T  14997723 caatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatc 14997822  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| ||     
T  14997823 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttgccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 14997922  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||| | ||||||    
T  14997923 acaatactagaaggtataccatg 14997945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 51606155 - 51605998
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || || |    
T  51606155 ctttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgagtgataactgttgttgt 51606056  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  51606055 aggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacaca 51605998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 342
Target Start/End: Original strand, 13247955 - 13248232
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || || ||||| | ||||||||||||| | || || || ||||| ||||| |    
T  13247955 tcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccatcctaatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 13248054  T
Q  165 tcaacggaagatgacta-tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 263  Q
    ||||||| | |  | || |||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| |    
T  13248055 tcaacggta-aacattagtcccaactgacaccttgctctaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcgg 13248153  T
Q  264 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 342  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||| ||  ||||||||||    
T  13248154 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccagaacttagaagtaaa 13248232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12342837 - 12342548
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |  | || || |    
T  12342837 ctttcacctgactcataccaacacaacgacgttctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggtgccatcccaatactagaatgaaaattgttgttgt 12342738  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| |||||||| | |     | ||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    ||||||  |||||||||     
T  12342737 aagtaaactcaatcaacggtaaacattcaacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttcaaaactctgaatattcctctccgt 12342638  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 342  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||| || ||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  12342637 ctgcccatcagtatggggatgataagcataactcaaccttaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaa 12342548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15293131 - 15293013
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || |    
T  15293131 ctttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgt 15293032  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacgg 171  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  15293031 aagtaaactcaatcaacgg 15293013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16676469 - 16676417
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 53  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676469 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 16676417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Original strand, 9291133 - 9291464
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | ||  | || |    
T  9291133 ctttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgctgttgt 9291232  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| |||||||  | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    || ||| ||||||||||     
T  9291233 aagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctaaatagtcctctccgt 9291332  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||     
T  9291333 ctgtccatcggtctgaggatggtaagcagtactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcc 9291432  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  9291433 cgatccgacacaatactataaggaataccatg 9291464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 55375332 - 55375214
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | || || || |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  | || || || |    
T  55375332 ctttcacctgattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgtaaactgttgttgt 55375233  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacgg 171  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  55375232 aagtaaactcaatcaacgg 55375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18549834 - 18549694
Alignment:
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||||||||| || || || |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||    
T  18549834 ctgaccatcagtttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagttcccaaagcacattgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatct 18549735  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  18549734 ctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 18549694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12132383 - 12132298
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 139  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||    
T  12132383 ctttcacctgactcataccaacacaacgacgttctacatc-ccgatcatacaaagcctcaaacggtgtcataccgatactagaatga 12132298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 171
Target Start/End: Original strand, 16685557 - 16685669
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||| |||| || ||||  ||||| || ||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| | || || || ||||| |    
T  16685557 cctgactcataccaacataacgacgttctacacctccttccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaa 16685656  T
Q  159 actcgatcaacgg 171  Q
    |||| ||||||||    
T  16685657 actcaatcaacgg 16685669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15424013 - 15423974
Alignment:
Q  257 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 296  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15424013 ccatctgtctgtggatggtatgccgaactcaatctcaact 15423974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18550064 - 18549949
Alignment:
Q  23 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 122  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  |  |||| || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| |||||||||  |||| || |||||||    
T  18550064 tgctgaacaatctctggtcccaacactgcaatttcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaatacctcaaatggtgcca 18549965  T
Q  123 ttccaatactagaatg 138  Q
    | ||||||||||||||    
T  18549964 tcccaatactagaatg 18549949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 43431 - 43837
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43431 catcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaaca 43530  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43531 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgct 43630  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43631 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcga 43730  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  43731 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 43830  T
Q  401 ttgatgt 407  Q
    || ||||    
T  43831 ttaatgt 43837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 8762 - 9155
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8762 catctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctaactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 8861  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8862 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 8961  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||           |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8962 caagaac-----------acaaatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 9050  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  9051 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 9150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 405
Target Start/End: Original strand, 15241 - 15617
Alignment:
Q  18 tagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaagg 117  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15241 tagtctgctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaagg 15340  T
Q  118 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  15341 tgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac---------- 15430  T
Q  218 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15431 -acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgatcccaaagcctcttgca 15529  T
Q  318 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15530 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 50527 - 50148
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || |    
T  50527 gtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttcccccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacg 50428  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||    
T  50427 gtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccct 50328  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    ||| | ||||| ||  || || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  50327 caatagatcctttaaggattgtatcgttctctccgactgaccatccgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgg 50228  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  50227 aaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 50148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 106538 - 106226
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||| ||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| |    
T  106538 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggagccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 106439  T
Q  165 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 264  Q
    ||||||| | |      |||||| |    ||||| || |  ||||||  ||||||||||||||| |    ||| || ||||||| || ||| ||||| ||    
T  106438 tcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgttccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctggatagtcctcttcgtctgcccatcggt 106339  T
Q  265 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 364  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||| ||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| |||    
T  106338 ctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcagactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacaca 106239  T
Q  365 atgctcgaaggaa 377  Q
    || || |||||||    
T  106238 atactagaaggaa 106226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 691 - 1095
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  691 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 790  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  791 tacaaagcctcgaacggtgtcattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgct 890  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  891 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 990  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||    
T  991 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatcccc 1090  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  1091 ttgat 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 19113002 - 19113406
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19113002 catctgaactttctcagtagtttgctgaataatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 19113101  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19113102 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccctgct 19113201  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19113202 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 19113301  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  19113302 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 19113401  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  19113402 ttgat 19113406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17674492 - 17674090
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17674492 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 17674393  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674392 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 17674293  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17674292 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 17674193  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  17674192 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 17674093  T
Q  401 ttg 403  Q
    |||    
T  17674092 ttg 17674090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 15533698 - 15534077
Alignment:
Q  7 aactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533698 aactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa 15533797  T
Q  107 gcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaa 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533798 gcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaa 15533897  T
Q  207 cacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaa 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15533898 cacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctttctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaa 15533997  T
Q  307 agcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15533998 agcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgta 15534077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 18856889 - 18857293
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18856889 catccgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacgactctttcacctgactcaaaccagcacaacagagttatgcatctccgacca 18856988  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18856989 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatacctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 18857088  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18857089 caagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcgggtgatacgccgaactcaatctcaacttcga 18857188  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||    
T  18857189 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctcc 18857288  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  18857289 ttgat 18857293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22133510 - 22133127
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22133510 catcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacttgactcaaacccgcacaacggagttctgcatcaccgacca 22133411  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133410 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 22133311  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22133310 caagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttcga 22133211  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22133210 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatg 22133127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22120643 - 22120239
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120643 catccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgatcctaagaccactctttcacctcactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 22120544  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120543 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 22120444  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22120443 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcga 22120344  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | |||| || |||    
T  22120343 acccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaataccatgcaacctcacgatctcc 22120244  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  22120243 ttgat 22120239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 30313613 - 30313209
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30313613 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctcgagccctaagaccactctttcacctgactcaaaccaccacaatggagttctgcatctccgacca 30313514  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313513 tacaaagcctcaaaaggtgccgttccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 30313414  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30313413 caagaacacaaactctcaactaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcga 30313314  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  30313313 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctcc 30313214  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  30313213 ttgat 30313209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19485339 - 19484974
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19485339 catctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 19485240  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19485239 tacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttact 19485140  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19485139 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 19485040  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 366  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485039 acccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 19484974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 22046685 - 22047089
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22046685 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttctgcatctctgacca 22046784  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046785 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataaccattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 22046884  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22046885 caagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcga 22046984  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  22046985 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatatgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctcc 22047084  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  22047085 ttgat 22047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 32600456 - 32600860
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32600456 catcttaaccttctcagtagtctactgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgaccgaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 32600555  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600556 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 32600655  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32600656 caagaacacaaactctcaacaaatcctataacgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcga 32600755  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  32600756 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctcc 32600855  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  32600856 ttgat 32600860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16408514 - 16408131
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16408514 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctccggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgtatctccgacca 16408415  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408414 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16408315  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16408314 caagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttaga 16408215  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408214 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctataagtaaatcttgggtctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 16408131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20018219 - 20017865
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20018219 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 20018120  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018119 tacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 20018020  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20018019 caagaacacaaattctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 20017920  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017919 acccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 20017865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 22040171 - 22040575
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22040171 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacctcattcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 22040270  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22040271 tacaaagcctcaaaaggtgccattcgaatactagaatgataactaatattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgct 22040370  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22040371 caagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgattgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcga 22040470  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  22040471 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatgttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctcc 22040570  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  22040571 ttgat 22040575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22164660 - 22164278
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  22164660 catcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctcgggtccgaagaccactctttcacttgactcaaacctgcacaacggagttctgcatcaccgaccg 22164561  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164560 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 22164461  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  22164460 caagaacacaaactctcaacaaatcttc-agcgactgaattgtcctctctgactgaccatatgtctgcggatgacacgctgaactcaatctcaacttcga 22164362  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22164361 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatg 22164278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21922204 - 21921809
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21922204 catcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactcttccacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 21922105  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21922104 tagaaagcctcataaggtgccattccaatagtagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 21922005  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  21922004 caagtacacaaactctcaacaaatcctctagctattgaatcgtcctctacgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 21921905  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21921904 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21921809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 19978279 - 19978683
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19978279 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgacca 19978378  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978379 tataaagcctccaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 19978478  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  19978479 caagtacactaaatctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgagctcaatctcaacttaga 19978578  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  19978579 acccaaagcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgttacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttca 19978678  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  19978679 ttgat 19978683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21167006 - 21166606
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  21167006 catcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactcttccacctgattcaaaccaacacaattgagttctgcatcttcgacca 21166907  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166906 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtaaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 21166807  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21166806 caagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttaga 21166707  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  21166706 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata-aatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctcc 21166608  T
Q  401 tt 402  Q
    ||    
T  21166607 tt 21166606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 23650353 - 23650748
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23650353 catcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 23650452  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23650453 tacaaagcttcataaggcgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 23650552  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  23650553 caagtacgcaaactctcaacaagtcctctagcgactgaatcgttctctccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 23650652  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23650653 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 23650748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 21251253 - 21251648
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21251253 catcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgacca 21251352  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| |   |||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251353 tacaaagcgtaataaggtgtcatctcaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 21251452  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||    
T  21251453 caagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttaga 21251552  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21251553 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21788827 - 21788433
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21788827 catcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 21788728  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21788727 tacaa-gcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgct 21788629  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |    
T  21788628 caagaacacaaaccctcaacaaatcttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaa 21788529  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21788528 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21788433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21394334 - 21393939
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacc- 99  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  21394334 catcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccc 21394235  T
Q  100 atacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgc 199  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21394234 atacaa-gcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgc 21394136  T
Q  200 tcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcg 299  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||      
T  21394135 tcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaa 21394036  T
Q  300 agcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21394035 aacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21393939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22377922 - 22377528
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  |||    
T  22377922 catcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttcca 22377823  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377822 tacaa-gcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataactattgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 22377724  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  22377723 caagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 22377624  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377623 accaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 22377528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22384097 - 22383703
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  |||    
T  22384097 catcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttcca 22383998  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383997 tacaa-gcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataactattgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 22383899  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  22383898 caagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 22383799  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383798 accaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 22383703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 23949232 - 23949624
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  23949232 catcttaactttctcagtagtttgct-aacgatttctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgacca 23949330  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23949331 tatagagcttcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 23949430  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  23949431 caagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttatttccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 23949530  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcaca 394  Q
     || ||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23949531 acctaaaacctattgcatactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcaca 23949624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 396
Target Start/End: Original strand, 22987521 - 22987903
Alignment:
Q  9 ctttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagc 108  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | || |||||| ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22987521 ctttctcaatagtttgttgaacaatttatgctcctaaaaccacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagc 22987620  T
Q  109 ctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaaca 208  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22987621 ctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataattgttattgtacatgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtaca 22987720  T
Q  209 caaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaag 308  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || || ||||    
T  22987721 caaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcaacctcaacttagaacctaaag 22987820  T
Q  309 cctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||| |||||| |||||||||||     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22987821 cctcttacaaactcttccaaaatct-----taaatctcgaatctctatctcatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 22987903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20396584 - 20396199
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||| || || || || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  20396584 ttctcagtagtttgttgaacgatatctagtcccaaaactacactctcgcctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacaaagctt 20396485  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  20396484 cgaatggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagtcgcaccttgctcaagtacaca 20396385  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    || ||||||||| ||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || ||| || |||||||||    
T  20396384 aactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaaccacagcttagaacccaaagcc 20396285  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||| | |||||||||    
T  20396284 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcggcaggacaccatgcaacttcacaat 20396199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Original strand, 20388472 - 20388794
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || ||  ||||||    
T  20388472 gactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgccatgccaatactcgaatggtaactgttgttgtacatgaact 20388571  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||    
T  20388572 ctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaaaaaatcctctaacgactgaatctttctctccgactgaccatc 20388671  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20388672 tgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttacaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 20388771  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||||  |||| |||||||||||    
T  20388772 acaattatcgacggaacaccatg 20388794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 384
Target Start/End: Original strand, 19851757 - 19852106
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  19851757 tctggtcccaacaccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccataccaatactag 19851856  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||    
T  19851857 aatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacga 19851956  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||     
T  19851957 ctgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaacctt 19852056  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19852057 gaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatg 19852106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 384
Target Start/End: Original strand, 19857793 - 19858142
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  19857793 tctggtcccaacaccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccataccaatactag 19857892  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||    
T  19857893 aatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacga 19857992  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||     
T  19857993 ctgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaacctt 19858092  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19858093 gaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatg 19858142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20976062 - 20975725
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  20976062 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtga 20975963  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  20975962 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattgtatcgtcctctccgactgacc 20975863  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||    
T  20975862 atctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcatgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctccatct 20975763  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20975762 gacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 20975725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 31416885 - 31416548
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| || || || || || ||||    
T  31416885 cctgactcaaaccagcataaaggagtcatgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatactaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 31416786  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  31416785 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgacc 31416686  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||     
T  31416685 atctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatcc 31416586  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  31416585 gacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 31416548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 53 - 396
Target Start/End: Original strand, 23655291 - 23655634
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||| || || || |    
T  23655291 ctttcacccgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatactaatactcgaatgataactgttgttgt 23655390  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||| ||    
T  23655391 acgtgaactctatcaacggtaggtgactgtcccaggctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctctga 23655490  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  23655491 ctgaccatctgtctgcggatgataacccgaactcaacctcaactccgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatct 23655590  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  23655591 ctatccgacacaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaat 23655634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Original strand, 14565506 - 14565846
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  14565506 ctttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttat 14565605  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||| |||||    
T  14565606 aagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctttccga 14565705  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||    
T  14565706 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatct 14565805  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14565806 ctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 14565846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Original strand, 1266608 - 1266945
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  1266608 cctgactcaaactagcacaaaggagtcctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 1266707  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || |||||||||||| ||||    
T  1266708 actctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaaagattggatcgtcctctccgaccgacc 1266807  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||     
T  1266808 atctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccataatctagaagtgaacctcggatctctatcc 1266907  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  1266908 gacacaatgctcgacggtacaccatgcagcttaacaat 1266945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 59 - 395
Target Start/End: Original strand, 22051233 - 22051569
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || ||||    
T  22051233 cctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtga 22051332  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| || || || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| | ||| || || |||||||||||||||||    
T  22051333 actctataaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaacgattggatcgtcctctccgactgacc 22051432  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||||     
T  22051433 atctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttggaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatcc 22051532  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22051533 gacacaatactcgaaggaactccatttagcttcacaa 22051569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 29303840 - 29303500
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||    
T  29303840 tcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccatacctatactcgaatgatagttgttgttataag 29303741  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||| || |  || || || ||||||||||||||    
T  29303740 tgaactctatcaacggtaggtggctatcccaagctccaccttgctcaagtacacacacccttaacaaatcatccaatgattggatcgtcctctccgactg 29303641  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||    
T  29303640 accatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcccta 29303541  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29303540 tccgacacaatactcgaaggaaccccatgtagcttcacaat 29303500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 804087 - 803750
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  804087 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 803988  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    | ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  803987 taaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 803888  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  803887 accatctgtttgaggatgataagccaaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctcta 803788  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  803787 tccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 803750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16271638 - 16271301
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  16271638 tcacccgacgcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 16271539  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    |||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  16271538 tgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 16271439  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||    
T  16271438 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccataacctagaagtgaacctcggatcccta 16271339  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16271338 tccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 16271301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22061844 - 22061507
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  22061844 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 22061745  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||| |  || || || ||||||| |||||||||    
T  22061744 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttcctcaagcacacacactctcaacaaatactccaatgattggatcgtcctcttcgactgacc 22061645  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||| || |||||||| |||||     
T  22061644 atctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcagactcttccagaacctagaagtgaaccttggatccctatcc 22061545  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  22061544 gacacaatactcgacggaactccatgtagtttcacaat 22061507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 31571259 - 31570917
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  31571259 ctttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactattgttgt 31571160  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||    
T  31571159 aggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccga 31571060  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||     
T  31571059 ctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcc 31570960  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31570959 ctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 31570917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Original strand, 6679478 - 6679815
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  6679478 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 6679577  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    | ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  6679578 taaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 6679677  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||    
T  6679678 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctcta 6679777  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  6679778 tccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 6679815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Original strand, 12305125 - 12305462
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  12305125 tcacccgactcaaaccagcataaaggggtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatgctcgagtgatagctgttgttataag 12305224  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  12305225 tgaactcaatcaatggcatgtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 12305324  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || || ||||| ||||| ||  ||||||| || || ||||| |||    
T  12305325 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgtgtcctgtaaactcttccagaacatagaagtgaacctcggatcccta 12305424  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12305425 tctgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 12305462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Original strand, 21840763 - 21841124
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  21840763 tctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcg 21840862  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || || || || || ||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||    
T  21840863 aatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatga 21840962  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
     ||||| || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||  ||||| |||||||||||     
T  21840963 ttgaatcgttctctccgactgaccatttgtttgcagatgatgagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttttaaactcttccaaaatctt 21841062  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21841063 gaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 21841124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Original strand, 6604025 - 6604362
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |    
T  6604025 tcacccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttatacg 6604124  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    | ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  6604125 taaactcaatcaaaggtaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 6604224  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||    
T  6604225 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctcta 6604324  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  6604325 tccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 6604362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20010335 - 20009974
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |    
T  20010335 tctggtcccaacaacacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaagtttcgaacggtgccataccaatacttg 20010236  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||    
T  20010235 aatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacga 20010136  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  20010135 ctgaatcgttctctccgaatgaccatctgcctgcggatgataagccgaactcacccttaactttgaacccaaggcatcttgtaaactcttccaaaacctt 20010036  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || ||   || |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  20010035 gaagtgaacctgaaatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaat 20009974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 120 - 396
Target Start/End: Original strand, 22371371 - 22371647
Alignment:
Q  120 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 219  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||     
T  22371371 ccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaaatctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacgttgctcaagtacacacattctcag 22371470  T
Q  220 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 319  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| || |||||||||    
T  22371471 caaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactcaccatctgtttgcggattataagccgaacccaacctcaactttgaacccaacgcatcttgcaaa 22371570  T
Q  320 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || |||||||| || |||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  22371571 ctcttccaaaaccttgaagtaaacctcggatctctattcgacacaatactcgatggaagcccatgaaacttcacaat 22371647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 176 - 393
Target Start/End: Original strand, 27355035 - 27355252
Alignment:
Q  176 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 275  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  27355035 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgat 27355134  T
Q  276 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 375  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27355135 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 27355234  T
Q  376 aacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  27355235 aacaccatgaagcttcac 27355252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22129132 - 22129005
Alignment:
Q  278 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 377  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22129132 gccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaa 22129033  T
Q  378 caccatgtagcttcacaatttccttgat 405  Q
     |||||| | | |||| || ||||||||    
T  22129032 taccatgcaacctcacgatctccttgat 22129005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21850745 - 21850423
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  21850745 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtaccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 21850646  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| |||||    
T  21850645 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatc 21850546  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| ||     
T  21850545 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 21850446  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  21850445 acaatactagaaggaataccatg 21850423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16877503 - 16877181
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  16877503 gactcaaaccaacataacggtgtcctgcacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 16877404  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  16877403 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 16877304  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| ||     
T  16877303 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatcttaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 16877204  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  16877203 acaatactagaaggaataccatg 16877181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Original strand, 22315555 - 22315886
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || || | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || ||||    
T  22315555 ctttcacctgactcataccaacacaatggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttat 22315654  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| |||||||| |||     | ||||| |  | |||||||| | |||||||  ||| |||||||| || |    || ||| ||||||||||     
T  22315655 aagtaaactcaatcaacggtagacattcaacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcttccaaactctaaatagtcctctccgt 22315754  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||| |||||  |||| |||||||| || | |||||| |||||||| |  ||||||||   ||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||     
T  22315755 ctgcccatcactctggggatgataagcaggactcaacctcaacttagttcccaaagcagtttgcaaactttcccaaaacctaaaagtaaacctcggatcc 22315854  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22315855 cgatccgacacaatactggaaggaataccatg 22315886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21196907 - 21196588
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || || || ||||| ||||| |    
T  21196907 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 21196808  T
Q  165 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 264  Q
    ||||||| | |      |||||| |    |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    || ||| |||||||  | ||| ||||| ||    
T  21196807 tcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctaaatagtcctctatgtctgcccatcggt 21196708  T
Q  265 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 364  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||| |   |||||||   |||||| || | ||||||  |||||||||| || ||||  | |||||| |||    
T  21196707 ctggggatgataagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagtttgcaagctctcccaaaacgtagaagtaaacctcggattccgatctgacaca 21196608  T
Q  365 atgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    || || ||||||| ||||||    
T  21196607 atactagaaggaataccatg 21196588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23157428 - 23157098
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||||||| | || || || |    
T  23157428 ctttcacctgattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcataccgatactagaatgaaaactgttgttgt 23157329  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||  || ||||||     
T  23157328 aagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctcca-aacacaagttctcaacaaatcctctaaactctgaataatcttctccgt 23157230  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    | | ||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||| |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || | |||     
T  23157229 cggcccatcagtctgggggtgataagtagaactcaatctctacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcgaatcc 23157130  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  23157129 cgatccgacacaatactagaaggaataccatg 23157098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 384
Target Start/End: Original strand, 22982801 - 22983128
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || | |||||||||| |  | || || ||||    
T  22982801 tcacttgactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgacactagaatgaaaattgttgttgtaag 22982900  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    | ||||| |||||||| |||    | |||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| |  ||    
T  22982901 taaactcaatcaacggtagacatttgtcccaactgacaccttgctccaagacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtttg 22983000  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
     ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||| |||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |    
T  22983001 cccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgc-aactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccga 22983099  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    || || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22983100 tccgacacaatactagaaggaataccatg 22983128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20652750 - 20652635
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || |||| |||||| |||||||| || || || |||| ||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | ||||| || |    
T  20652750 ctttctccggacttaaaccaacacaacggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactattgttgt 20652651  T
Q  153 aagtgaactcgatcaa 168  Q
    |||| ||||| |||||    
T  20652650 aagtaaactcaatcaa 20652635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19484175 - 19484130
Alignment:
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19484175 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 19484130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 384
Target Start/End: Original strand, 23900822 - 23900971
Alignment:
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||  |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  23900822 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctggggatgataagtagaactcagcctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 23900921  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||||||| ||  |||| | |||||| |||||  | ||||||| ||||||    
T  23900922 gaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatattagaaggaataccatg 23900971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 398
Target Start/End: Original strand, 19863639 - 19863765
Alignment:
Q  272 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 371  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19863639 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19863738  T
Q  372 aaggaacaccatgtagcttcacaattt 398  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19863739 aaggaacaccatgcaacttcactattt 19863765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 398
Target Start/End: Original strand, 19868276 - 19868402
Alignment:
Q  272 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 371  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19868276 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19868375  T
Q  372 aaggaacaccatgtagcttcacaattt 398  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19868376 aaggaacaccatgcaacttcactattt 19868402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 138
Target Start/End: Original strand, 19863457 - 19863506
Alignment:
Q  89 catctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatg 138  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  19863457 catctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatg 19863506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 138
Target Start/End: Original strand, 19868094 - 19868143
Alignment:
Q  89 catctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatg 138  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  19868094 catctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatg 19868143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 14637 - 15041
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14637 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgacca 14736  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatgactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 14836  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  14837 caagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcaa 14936  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||    
T  14937 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaccccatgtaacctcacaatctcc 15036  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  15037 ttgat 15041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 897 - 1301
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  897 catctgaactttcttactagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 996  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  997 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactttaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcctaagttcctccttgct 1096  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  1097 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaattcaacctcaacttcga 1196  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||    
T  1197 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctcc 1296  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  1297 ttgat 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 7216 - 7620
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7216 catctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgacca 7315  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7316 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 7415  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7416 cgagaacacaaatcctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcga 7515  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||    
T  7516 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctcc 7615  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  7616 ttgat 7620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 12764 - 13168
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12764 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 12863  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12864 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgtctatcccaagttcctccttgct 12963  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12964 caagaacacacactctcagcaaatcctctagtgactaaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcga 13063  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13064 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatctcc 13163  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  13164 ttgat 13168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 7674 - 8078
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7674 catcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 7773  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7774 taaaaaacctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 7873  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7874 caagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 7973  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||    
T  7974 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatacaacttcacaatctcc 8073  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  8074 ttgat 8078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 8067 - 8471
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8067 catcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttctgcatcaccgacca 8166  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8167 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 8266  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8267 caagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacatcga 8366  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  ||    
T  8367 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaaactagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgtaacctcacaatcacc 8466  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  8467 ttgat 8471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 4434 - 4030
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4434 catcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgacca 4335  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4334 tacaaagcttcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 4235  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4234 caagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 4135  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| |||    
T  4134 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctcc 4035  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  4034 ttgat 4030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 8873 - 9277
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8873 catcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgacca 8972  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8973 tacaaagcttcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 9072  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9073 caagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 9172  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| |||    
T  9173 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctcc 9272  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  9273 ttgat 9277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 33602 - 33198
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33602 catcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccaacca 33503  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33502 tacaaagcttcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 33403  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33402 caagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattttcgtttccggctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 33303  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| |||    
T  33302 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctcc 33203  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  33202 ttgat 33198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 65682 - 66086
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  65682 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 65781  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  65782 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcttccttgct 65881  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  65882 caagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttctaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcga 65981  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || |||    
T  65982 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctcc 66081  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  66082 ttgat 66086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39848 - 39466
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  39848 catcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactttttcacctgattcaaaccaacacgacggagttctgcatctccgacca 39749  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39748 tataaagcctcaaaaggtaccattccaatactagaatgataactgttattgtatgtgaaatctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 39649  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  39648 caagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactga-catctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcttaacttaga 39550  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39549 acccaaagcctcttgcaaacttttcgaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 39466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 17719 - 18122
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  17719 catcttaactttcttagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaa-ccaacacaacgaagttctacatctctgacca 17817  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattttatgtgaactcgatcagtggaagatgactatcccaagttcctccttgct 17917  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17918 caagaacacaaactctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcga 18017  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||    
T  18018 acccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccgtgtaacctcacaatctcc 18117  T
Q  401 ttgat 405  Q
    |||||    
T  18118 ttgat 18122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Original strand, 14332 - 14711
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  14332 gtagtttgctgaacaatctatggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataag 14431  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  14432 gtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactatatcaatggaagatgactttcccaagttcctccttactcaagaacacaaaccct 14531  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||    
T  14532 caacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgagcatctgtttgcggctgatacgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgc 14631  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  14632 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaatgaacaccatgcaacttcacaat 14711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 396
Target Start/End: Original strand, 31739 - 32082
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| || || || || |    
T  31739 ctttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcatgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatatcaatactcgaatggtaactgttgttgt 31838  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||    
T  31839 acgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccactttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccga 31938  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  31939 ctgacaatctgtttgcggatgataagctgaactcaaccccaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatct 32038  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  32039 ctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 32082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 328 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 18557 - 18489
Alignment:
Q  328 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  18557 aaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 18489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 7 - 405
Target Start/End: Original strand, 22150 - 22548
Alignment:
Q  7 aactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa 106  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22150 aactttctcaatagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagatctgcatctccgaccatacaaa 22249  T
Q  107 gcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaa 206  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  22250 gcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagga 22349  T
Q  207 cacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaa 306  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||    
T  22350 cacaaactcgcaacaaatcctctagcgactgaattgtccactccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaacttcgaacctaa 22449  T
Q  307 agcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22450 agcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagaaacaccatgtaacctcacaatctccttgat 22548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 6649 - 7044
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6649 catcttaaccttctctgtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgacca 6748  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6749 tacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 6848  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  6849 caagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 6948  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6949 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 7044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 391
Target Start/End: Original strand, 3153 - 3458
Alignment:
Q  86 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  3153 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttcttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccc 3252  T
Q  186 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 285  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  3253 aagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagacgaact 3352  T
Q  286 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 385  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  3353 caacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgt 3452  T
Q  386 agcttc 391  Q
    | ||||    
T  3453 aacttc 3458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 7654 - 8047
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7654 catctgaactttctcagtagtctgttgaacagtctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 7753  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7754 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 7853  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7854 caagaac-----------acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgcctgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcga 7942  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  7943 acccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggacctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 8042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 278859 - 278458
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  278859 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctcttgtcctaggaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 278760  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278759 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgcgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 278660  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  278659 caagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaatttaga 278560  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  278559 accgaaggcctcttgcaaactcttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 278460  T
Q  401 tt 402  Q
    ||    
T  278459 tt 278458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 395
Target Start/End: Original strand, 260643 - 260979
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || ||||    
T  260643 cctgactcaaaccagcataacagagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtga 260742  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| ||||  || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |  || ||||| |||||||||||    
T  260743 actctatcagtggtaggtgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattagatcgtcctttccgactgacc 260842  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||||     
T  260843 atctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatcc 260942  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  260943 gacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaa 260979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 164738 - 164538
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  164738 catcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgacca 164639  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  164638 tacagagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgaatatcccaagttcatctttgct 164539  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  164538 c 164538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 308936 - 308981
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 46  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  308936 catccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaag 308981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Original strand, 6291 - 6691
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6291 catcttaactttctcagtagtttgctgcacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgacca 6390  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6391 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataaatgttattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgat 6490  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  6491 caagaacataaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctacggatgatacgccgaacacaatctcaacttaga 6590  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  6591 acccaaagcctcttgcaaactcttccaaattctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 6690  T
Q  401 t 401  Q
    |    
T  6691 t 6691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 6300 - 6695
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6300 catcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctttggtcctaagaccactctttcaccagactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 6399  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6400 tacaaagcctcgtaaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 6499  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  6500 caagtacacaaactctcaacaagtcctctagtgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttaga 6599  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6600 acctaaagcctcatgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1495 - 1158
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  1495 cctgactcaaaccagcataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 1396  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || || ||||||||||||||    
T  1395 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgttctctccgactgacc 1296  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||     
T  1295 atctgtctgaggatgataagccgaactcaaccacaacttcgaacccaaagcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctgtcc 1196  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1195 gacacgatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 110
Target Start/End: Original strand, 23023 - 23080
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |  || |||| ||||||||||||||    
T  23023 ctttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtccaacacctcctaccatacaaagcct 23080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 852 - 451
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  852 catcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaagatgactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 753  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  752 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactggaatgataattgttattgtacgtgaactctatccatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 653  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  652 caagtacacaaacactcaacaaatcctctagcaactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttaga 553  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  552 acccaaagcctctttcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 453  T
Q  401 tt 402  Q
    ||    
T  452 tt 451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 64060 - 63659
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  64060 catcttaattttctcagtagtctgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttctcctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 63961  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  63960 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgttaattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctctttgct 63861  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  63860 caagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttaga 63761  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  63760 acccagagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctttttctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 63661  T
Q  401 tt 402  Q
    ||    
T  63660 tt 63659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 5498 - 5893
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5498 catcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgaatcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 5597  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5598 tacaaagcctcataaggtgccattccgatactggaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 5697  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| || |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  5698 caagtacgcaaactctcaacaagtcttctagcgactgaatcgtcctctccgactaacaatctgtctacagatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 5797  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5798 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 5893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 953 - 1350
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  953 catcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaaaaccacactatcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaaca 1052  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1053 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatagaagatgactatcccaagttccttcttgct 1152  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  1153 caagtacgcaaaccctcaacaagtcctctagcgactgaatcgtcctttcggactgaccatatgtctgaggatgatacgccaaactcaatctcaacttaga 1252  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaattt 398  Q
     || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1253 acctaaagcctcctgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaattt 1350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 384
Target Start/End: Original strand, 6336 - 6709
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6336 ttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 6435  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6436 catagggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 6535  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||    
T  6536 aaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctatttgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcc 6635  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6636 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatggtcgaaggaacaccatg 6709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 723 - 328
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  723 catcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgacca 624  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  623 tacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgattatctcaagttccttcttgct 524  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| ||    
T  523 caagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacctcagcttaga 424  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  423 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcacacacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaat 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 229320 - 229715
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  229320 catcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 229419  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  229420 tacaaaacctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgaatatcccaagttcctccttgct 229519  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  229520 caagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatttgtctgcgaatgatacgccgaactcaaccttaacttaga 229619  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  229620 acctaaatcctcttgcaaacttttccaaactctataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 229715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 219446 - 219051
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |  |||    
T  219446 catcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcctaaaaccacactctcacctgacttgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttcca 219347  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    | |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  219346 ttcaaaacctcaaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctataaacggaagatgattatcccaagttcctccttgct 219247  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||    
T  219246 caagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgaatgaatcgttctcttcgactgaccatctgtctgcggatgataccccgaactcaacctcaacttaga 219147  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  219146 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtcacttcacaat 219051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 32791 - 32667
Alignment:
Q  236 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 335  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||    
T  32791 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 32692  T
Q  336 aagtaaatcttggatctctatctga 360  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||    
T  32691 aagtaaacctcggatcccgatctga 32667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 32965 - 32856
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||  || |||||||| || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  32965 gactcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagccttaaatggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 32866  T
Q  162 cgatcaacgg 171  Q
    | | ||||||    
T  32865 caaccaacgg 32856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 38 - 396
Target Start/End: Original strand, 10 - 368
Alignment:
Q  38 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  10 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacataatgaagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaat 109  T
Q  138 gatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 237  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||    
T  110 gataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttcaagagactg 209  T
Q  238 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 337  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  210 aatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaggctcttgcaaactcttccaaaatctagaa 309  T
Q  338 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  310 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 396
Target Start/End: Original strand, 15938 - 16327
Alignment:
Q  7 aactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15938 aactttctcagtagtttgttgaacaatctcgtgtcctaaaaccaccctttcacctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccaaaaaaa 16037  T
Q  107 gcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaa 206  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16038 gcctcataagatgccattccaatactagaatgataaatattattgtacgtgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagta 16137  T
Q  207 cacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaa 306  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||    
T  16138 cacaaactctcaacaagtcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaa 16237  T
Q  307 agcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16238 agcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtatatcttggatctctatatgatgcaattctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 61
Target Start/End: Original strand, 15775 - 15829
Alignment:
Q  7 aactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 61  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  15775 aactttctcagtagtttgttgaacaatctcgagtcctaaaaccaccctttcacct 15829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 49770 - 50165
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  49770 catcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgagtcctaaaacaaccctttaacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgacca 49869  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||    
T  49870 tacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaacactatcaatggaggataactatcgaaagttcctccttgct 49969  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  49970 caagtacacaaactcttaacaaatcttcttacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 50069  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  50070 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaat 50165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Original strand, 19121 - 19280
Alignment:
Q  243 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19121 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaa 19220  T
Q  343 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19221 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 19280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 302 - 402
Target Start/End: Original strand, 34604 - 34704
Alignment:
Q  302 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcct 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  34604 cccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcct 34703  T
Q  402 t 402  Q
    |    
T  34704 t 34704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Original strand, 9636 - 10015
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9636 gtagtttgttaaacaatctctggtcctaaaaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgtaag 9735  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||  ||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  9736 gtgcccttccaatactagaatgataactatcattgtacgtgaactttatcaatggtagatgattaaccctagttcctccttgctcaagtacacaagctct 9835  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||    
T  9836 caacaagtcttctagcgactgaatcgtcctctccgactgatcatctgtttgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacgtaaagcctcttgc 9935  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9936 aaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 10015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 180494 - 180877
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  180494 catcttaactttctcaatagtctgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgacca 180593  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180594 tataaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 180693  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  180694 caagtacccaaactctcaacaaatcctctag------------------cgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttaga 180775  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 400  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  180776 acccaaagcctcttgcaaactgttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcc 180875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 118 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 101464 - 101186
Alignment:
Q  118 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 217  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||    
T  101464 tgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctc 101365  T
Q  218 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 317  Q
    |||||||||||||  || || ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  101364 aacaaatcctctaatgattggatcatcctctctgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgca 101265  T
Q  318 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  101264 aactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 101186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 47 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8311 - 7963
Alignment:
Q  47 accactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8311 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactgt 8212  T
Q  147 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 246  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8211 tattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacataccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcct 8112  T
Q  247 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 346  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8111 ctccgactgaccatttttctttggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgc-aacttttccaaaatctagaagtaaatctt 8013  T
Q  347 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  8012 ggatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaat 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Original strand, 1552 - 1937
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1552 ttctcagtggtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcct 1651  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    |  ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1652 cataaggtgccattccaacactggaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacaca 1751  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    || |||||| ||||| || |   | |||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  1752 aactctcaaaaaatcatcaaaaaaatgaatcatcctcaacgacagaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcc 1851  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  1852 tcttgcaaacttttacaaaatctagaagtaaatcttggatctatatctgatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 1937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 15154 - 15549
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||    
T  15154 catcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgcacttcctacca 15253  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15254 tacaaagcctcaaatggtgccattccaatactggaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgattatcccaagttcctccttgct 15353  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||  ||||||||| ||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  15354 caagtacacaacctctcaacaagtccttcaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgatatgtcgaactcaacctcaacttaga 15453  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15454 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaactttacaat 15549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 164 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 113353 - 113121
Alignment:
Q  164 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 263  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  113353 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaaatcttctagagaccgaatcgttctctctgactgaccatctg 113254  T
Q  264 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 363  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  113253 tctgcggatgacacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgatac 113154  T
Q  364 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  113153 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 113121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 27 - 276
Target Start/End: Original strand, 46531 - 46780
Alignment:
Q  27 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46531 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctcctaccatataaagcctcgaaaggtgccattcc 46630  T
Q  127 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46631 aatactagaatgataactattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcc 46730  T
Q  227 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46731 tctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatgata 46780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 86523 - 86154
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    ||||||||||| || |||| ||| |||||||| |  |||||  | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  86523 ttctcagtagtctgttgaaaaatgtctggtcccagtaccacagtctcaccggactcataccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaacgctt 86424  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    |||| ||| ||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  86423 cgaacggtaccattgcaatgctagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacaca 86324  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    || ||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||     | |||    |||||||  | ||||| |||    
T  86323 aactctcaacaagtcctccaatgattgaattgtcctctccgcctgtccacccgtctgtggatgata----cacctc--cgtcaacttataacccaacgcc 86230  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 386  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  86229 tcctgcaaactcttcaaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgta 86154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 396
Target Start/End: Original strand, 9248 - 9642
Alignment:
Q  2 atctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccat 101  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||    
T  9248 atcttaaccttctcagcagtttgttgaacaatttctggtgctaaaaccagactctcacctgaatcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttctaccat 9347  T
Q  102 acaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9348 acaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtatgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctc 9447  T
Q  202 aagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgag 301  Q
    ||| |||||||  |||||||| || || | ||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||     
T  9448 aagtacacaaaccctcaacaagtcttccaacgattgaatcgttctttccgactgacaatctgtctgcggatgatatgccgaacttaacctaaacttagaa 9547  T
Q  302 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9548 cctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaatgaacaccatgtagcttcacaat 9642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 331 - 216
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | || || || || |||||| |||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || |    
T  331 ctttcacctgaatcaaaccaacataaccgcgtcctacaccttcgaccacacaaagcctcaaatggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgt 232  T
Q  153 aagtgaactcgatcaa 168  Q
    |||| ||||| |||||    
T  231 aagtaaactcaatcaa 216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15098 - 14713
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  15098 ttctcagtagtttgttgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacgaagttctgcacctccgaccatacagagctt 14999  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14998 caaatggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacaca 14899  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    || ||||||||| ||| |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| ||    
T  14898 aactctcaacaagtcccccggcgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtccgcgggtgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaatcc 14799  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  14798 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgataaaatgtttgacggaacaccatgtagcttcacaat 14713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25738 - 25353
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||||||| |    
T  25738 ttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctacacttctgaccatacaaagctt 25639  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  25638 cgaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttccaccttgctaaagtacaca 25539  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    || ||||||||| ||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  25538 aactctcaacaagtcctccaacgactgaattgttctttcagactgaccatctgtctccggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcc 25439  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25438 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccatggaactctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaat 25353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4470 - 4085
Alignment:
Q  14 tcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcga 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |    
T  4470 tcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaaaggagttctacaaatccaaccatacaaagcctcaa 4371  T
Q  114 aaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||     
T  4370 atggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactatatcaatggatgatgactagcccaagttactccttgctgaagtaaacaaac 4271  T
Q  214 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  4270 tctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccaactgaccatctgtgtgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctct 4171  T
Q  314 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 399  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4170 tgcaaactcttccaaaatctataagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttc 4085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 108 - 396
Target Start/End: Original strand, 130532 - 130820
Alignment:
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  130532 cctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaac 130631  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||| |  |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||    
T  130632 acataccctcagcaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaa 130731  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  130732 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 130820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 69 - 396
Target Start/End: Original strand, 59099 - 59426
Alignment:
Q  69 accagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaa 168  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||  |||||||||||||    
T  59099 accaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaatgcttcgaatggtgccatcccaatgctagaatggtaactgttattgtacatgaactcgatcaa 59198  T
Q  169 cggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgc 268  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  59199 tgagagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctctgtctgcccatctgtctgc 59298  T
Q  269 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 368  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  59299 ggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactctcccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatac 59398  T
Q  369 tcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    | || |||||||||| ||| || |||||    
T  59399 ttgacggaacaccatatagttttacaat 59426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 246 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 29163 - 29008
Alignment:
Q  246 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29163 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag-aaatct 29065  T
Q  346 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  29064 tggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 29008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 210
Target Start/End: Original strand, 134626 - 134728
Alignment:
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  134626 cctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaac 134725  T
Q  208 aca 210  Q
    |||    
T  134726 aca 134728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 33 - 384
Target Start/End: Original strand, 1308 - 1659
Alignment:
Q  33 tctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatact 132  Q
    ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1308 tctctggtcctaaaaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatact 1407  T
Q  133 agaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagc 232  Q
    |||||||||  | ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |    
T  1408 agaatgataaatgttatagtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaaattcctcctttctcaagtacacaaactcttaacaaatcttctaac 1507  T
Q  233 gactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatc 332  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1508 gactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactaaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatc 1607  T
Q  333 tagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608 tagaagtaaaactaagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 1659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 32781 - 32387
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  32781 catcttaaccttcttagtagtttgttgaacaatttctggccctaaaaccacactcccacctgactcaaaccaacacaacggagttcttcatctccgatca 32682  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32681 tacaaagcctcaaaagatgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 32582  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||    
T  32581 caagtacacaaactctcaacaagtcttctaacgactggatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttaga 32482  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  32481 acctaaagcttcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatac-attctcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 32387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Original strand, 1195 - 1580
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  1195 ttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcacctccaaccatacaaagctt 1294  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||    
T  1295 cgaatggtgccattccaatactaaaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatctcaagttccaccttattcaagtacaca 1394  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  1395 aactctcaacaaatcctccaacgactgaattgttcttttcgactaaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacttcaacttagaacccaaagcc 1494  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1495 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgttcgatggaacaccttgtagcttcacaat 1580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 104 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 197404 - 197106
Alignment:
Q  104 aaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197404 aaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 197305  T
Q  204 gaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcc 303  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  197304 gtacacaaactctcagcaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacc 197205  T
Q  304 caaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 402  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||    
T  197204 taaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacgccatacaacttcacaatctcctt 197106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 171
Target Start/End: Original strand, 21927 - 22045
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||| || | || ||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||| |  | || ||||    
T  21927 ctttcacctgactcataccaacacaatggcattctacaccccctaccatacaaagcctcaaatggtgccatatcgatactagaatgaaaattgttgttat 22026  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacgg 171  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  22027 aagtaaactcaatcaacgg 22045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26562 - 26167
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||    
T  26562 catcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttattgtcctaaaaccacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttcca 26463  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26462 tacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacagaacatgactatcccaagttcctccttgct 26363  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || || |   ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  26362 caagtacacaaactctcaacaagtcttccaataactgaatcgttttttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 26263  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26262 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 26167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 195674 - 195338
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| || || || || || ||||    
T  195674 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccataccaatactcggatggtaactgttgttgtatgtga 195575  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||  |||||||  |  || || || |||||||||||| ||||    
T  195574 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaggtacacacactctcagtaaatccttcaaagattgtatcgtcctctccgac-gacc 195476  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||     
T  195475 atctgtctgaggatggtaagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatgttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatcc 195376  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  195375 gacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 195338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 392
Target Start/End: Original strand, 148905 - 149238
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||  | || || ||||    
T  148905 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaaggttcgaacggagccataccaatactcgaatggtaactgctgttgtatgtga 149004  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||| |||||||||||    
T  149005 actctatcaatggtaggtgactatcccaacctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctttccgactgacc 149104  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||     
T  149105 atctttctgaggatgataagccgaactcaactccaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatcc 149204  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 392  Q
    || | ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  149205 gacataatactcgacggtacaccatgtagcttca 149238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 171
Target Start/End: Original strand, 180253 - 180371
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || || |    
T  180253 ctttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttgt 180352  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacgg 171  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  180353 aagtaaactcaatcaacgg 180371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 121915 - 121841
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 139  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||    
T  121915 tcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccaatccgatactagaatga 121841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16445 - 16050
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||   |||    
T  16445 catcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctgttcttaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttttgcacctcgttcca 16346  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16345 tacaaagcctcaaatggtgtcattgcaatactagaatgataactattattgtacgtgaattctattaatggaagatgactatcccaagtccctccttgct 16246  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| || |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  16245 caagtacgcaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatttgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttaga 16146  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16145 acctaaagcctattgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 16050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Original strand, 112308 - 112693
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    |||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  112308 ttctcaatagtttgttgaacgatatctggtcccaaaactacactctctcctgactcgaaccaacacaacggagttctgcacctccgaccatacagagctt 112407  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    | || |||| |||| |||||||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  112408 caaatggtgtcatttcaatactagaatgataactgttattgcatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacaca 112507  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| || || ||||||    
T  112508 aactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgtccttttcgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctaaagcc 112607  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  112608 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgcttggcggaacaccatgtagcttcacaat 112693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 56 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 203442 - 203102
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| || || || || || |    
T  203442 tcacccgactcaaaccaacataacagagttctgcacctccgaccatacaaagctttgaatggtgccattcctatactagaatggtaacttttgttgtacg 203343  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | | |||| ||||||||||||||    
T  203342 tgaactctatcagcggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaatggcagaatcgtcctctccgactg 203243  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  203242 accatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggatctcta 203143  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  203142 tttgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaat 203102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Original strand, 117903 - 118240
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    |||||||||||||| || || |||||  | || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||    
T  117903 cctgactcaaaccaacataaaggagtcttacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtatgtga 118002  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||    
T  118003 actctatcaacggtaggtgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctccgactgacc 118102  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||     
T  118103 atctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatcc 118202  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  118203 gacacaatactcgatggtacaccatgtagcttcacaat 118240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Original strand, 386130 - 386491
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||| |    
T  386130 tctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttagaacagtgccataccaatactcg 386229  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||    
T  386230 aatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacga 386329  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||     
T  386330 ctgaatcgttatctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaacctt 386429  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  386430 gaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 386491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Original strand, 323039 - 323376
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  323039 cctgattcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgatcatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactggaatggtaactgttgttgtatgtga 323138  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  323139 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaaagattggatcgtcctctccgactgacc 323238  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||     
T  323239 atctgtctgcggatgataagccaaactcagcctcaacttcgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatcc 323338  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || | ||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  323339 gacaaaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaat 323376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 25084 - 24702
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |    
T  25084 gtagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccgactcaaaccaacagaacggagttctgcacctccgaccatgcaaagcttcgaatg 24985  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||    
T  24984 gtgtcatccaaatactagaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgcttaagtacacaaactct 24885  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||    
T  24884 caacaaatcctctaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtttacggatgataagccgaactcaacctcaacttagatcccaacgcctcttgc 24785  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||    
T  24784 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcaatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaactacacaatttc 24702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 5610 - 5225
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || |||||||  |||||  | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  5610 ttctctgttgtttgttgaacaatttcaggtcctagtaccacattctcaccggactcataccaacacaacggagttctgcatctccgaccaaacaacgctt 5511  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  5510 cgaacggtgtcattccaatgctagaatggtaactgttattatacgtgaactcaatcaatggaagattactatcccaagttcctccttgctcgagtacaca 5411  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    || ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| || ||||| |||    
T  5410 aactctcaacaaatcctcgaacgaatgaattgtcctctctgtctgtccatcggtctgcggatgatacgtcgaactcaaactcagcttagaacccaacgcc 5311  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5310 tcctgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgtagcttcacaat 5225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 116924 - 116539
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| | | |    
T  116924 ttctcagtagtttgctgaacgatttatggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacagagtcctacacctccgaccatacagaactt 116825  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  116824 caaatggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacgtcaactctatcaacggaagatgactaacccaagttcctccttgctctagtacaca 116725  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
    || ||||||||| ||||| | |||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  116724 aactctcaacaagtcctccaacgacggaatcgttcttttcgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcc 116625  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  116624 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacgaaacaccatgtagcttcacaat 116539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 321
Target Start/End: Original strand, 98353 - 98612
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||| |||| || ||| |||| || ||||||| |||| | || || ||  |||| ||||    
T  98353 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaaacctcaaacggtaccataccgatactagcatgaaaactgttgttgaaagtaaact 98452  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  98453 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 98552  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 321  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  98553 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 98612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 4309 - 4699
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| || |  |||    
T  4309 catcttaaccttctcagtagtttattgaacgatttctggtcctaaaactacactctcacctgattcgaaccaacacaacgaagttctgca-cttcttcca 4407  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4408 tacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagtttctccttgct 4507  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| | ||||| |||||| || ||||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |    
T  4508 caagtaaacaaactctcaagaagtccttcaacgactgaatcgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttata 4607  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 392  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4608 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttca 4699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 164 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4965 - 4727
Alignment:
Q  164 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 263  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4965 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctg 4866  T
Q  264 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 363  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4865 tctgtggatgatacgccgaactcaatcccaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 4766  T
Q  364 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 402  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  4765 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 4727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 363 - 32
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |  | || || |    
T  363 ctttcaccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgccattccgatacaagaatgaaaattgttgttgt 264  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||||| |     
T  263 aagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagttctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgt 164  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||||    
T  163 ctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatct 64  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  63 cgatctgacacaatactagaaggaataccatg 32  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 56 - 396
Target Start/End: Original strand, 3472 - 3812
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||      
T  3472 tcacttgactcaaactaacacaatggagttctgcatctccggccatacaaagcctcgaatggtgccattccaatactagaatggtaactgttattgtaca 3571  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |  | ||||| ||| || || ||||||||    
T  3572 tgaactctattaacggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtacagaaactctcaacaagtctttcaacgactaaatcgttctttccgactg 3671  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3672 accatttgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctcta 3771  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3772 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 3812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13006 - 12633
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||  | || | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||    
T  13006 catctaaactttctcagtagtttgctgaagaatttctggtcccaaaactgcactctaacctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgacca 12907  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12906 tacagagcttcgaatggtgccattccaatactagaatggtaactgttattatatgtgaactctatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgct 12807  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || || | |||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| ||    
T  12806 caagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgtatcgttctttccgactgaccatctatctgcggatgatacgctgaactgaacatcaacttaga 12707  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 374  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12706 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacgatgctcgaag 12633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 127228 - 126911
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  127228 catcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgacttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 127129  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  127128 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgcgaactctatcaatggacgatgactatcccaagtccctccttgct 127029  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||    
T  127028 caagtacacaaactctcaacaagtcctataacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgttgaactcaacctcaacttaga 126929  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaa 318  Q
     |  ||||||||||||||    
T  126928 acataaagcctcttgcaa 126911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 205 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 80319 - 80128
Alignment:
Q  205 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  80319 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgaatgaccatctgtccgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaaccc 80220  T
Q  305 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  80219 aaagcctctttcaaactcttccaaaatctttaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctctaaggaacaccatgcaacttcacaat 80128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 1416 - 1688
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1416 catcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctagtcctaagaccactctttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgacca 1515  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1516 tacaaagcctcataaggtgccatttcaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 1615  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 273  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| || | ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1616 caagtacacaaactctcaacaaatcttccaacgagtgcatcgtcctctccaactgaccatctgtctgctgatg 1688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 264 - 396
Target Start/End: Original strand, 2914 - 3046
Alignment:
Q  264 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 3013  T
Q  364 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3014 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 3046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 155 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3689 - 3442
Alignment:
Q  155 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 254  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3689 gtgaactctatgaacggaagatgactatccgaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgact 3590  T
Q  255 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 354  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  3589 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctttatgtaaatcttggatctct 3490  T
Q  355 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 402  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  3489 atttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctcctt 3442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 3748 - 3694
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctt 55  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3748 catcttaactttctcgttagtttgctgaactatctctggtcctaagaccactctt 3694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 156 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 19876 - 19636
Alignment:
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  19876 tgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcttcaccgactg 19777  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19776 accatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaacttttccataatctagaagtaaatcttggatctcta 19677  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19676 tctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 19636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 320
Target Start/End: Original strand, 1 - 267
Alignment:
Q  54 tttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattata 153  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1 tttcacctgattcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaatgataactattattata 100  T
Q  154 agtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgac 253  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||  || || ||||||    
T  101 cgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcatcaaaagactgaaacgtactatccgac 200  T
Q  254 tgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 320  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  201 taaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaac 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 116 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 19119 - 18839
Alignment:
Q  116 ggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19119 ggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaaaggaagatgactatcctaagttcctccttgctcaagtacacaaactc 19020  T
Q  216 tcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttg 315  Q
    |||| || ||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |  ||||||||||     
T  19019 tcaataagtcctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacgcaacctcaacttagaacttaaagcctcttt 18920  T
Q  316 caaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18919 caaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 18839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 90954 - 90566
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  90954 actttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacgctacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaag 90855  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  90854 cttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagaac 90755  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||| | ||||| |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||     
T  90754 acacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcacacccaag 90655  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  90654 ccatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 90566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 164 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 391066 - 390834
Alignment:
Q  164 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 263  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  391066 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctg 390967  T
Q  264 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  390966 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctttatctgatac 390867  T
Q  364 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  390866 aatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaat 390834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 339
Target Start/End: Original strand, 114542 - 114795
Alignment:
Q  86 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||  | ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  114542 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtggtaagtgttattgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccc 114641  T
Q  186 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 285  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  114642 aagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccactccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaact 114741  T
Q  286 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagt 339  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  114742 caacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagt 114795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 448336 - 448515
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||    
T  448336 catcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcaaaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttcca 448435  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgact 180  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  448436 tacaaagcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacgggaggtgact 448515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 89973 - 89888
Alignment:
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  89973 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 89888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 396
Target Start/End: Original strand, 27509 - 27897
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || ||  |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27509 actttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacacaacattttctcctgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaag 27608  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  27609 cttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtac 27708  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||| | ||||| ||||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  27709 acacactctcagcaaatcctccaatgattgtatagtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaag 27808  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27809 gcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 27897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 33690 - 33311
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || |    
T  33690 gtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacg 33591  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||    
T  33590 gtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccct 33491  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    ||| | ||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33490 caatagatcctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgc 33391  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  33390 aaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 33311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 384
Target Start/End: Original strand, 40599 - 40918
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| |    
T  40599 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 40698  T
Q  165 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 264  Q
    ||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||    
T  40699 tcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggt 40798  T
Q  265 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 364  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |||    
T  40799 ctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacaca 40898  T
Q  365 atgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    || || ||||||| ||||||    
T  40899 atactagaaggaataccatg 40918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 809 - 628
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  809 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgacca 710  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactat 182  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  709 tataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaacgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactat 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 143 - 392
Target Start/End: Original strand, 2340 - 2589
Alignment:
Q  143 ctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 242  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2340 ctattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactaccccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcg 2439  T
Q  243 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 342  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  2440 ttctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttacaacctaaagcctcttgcacactcttccaaaatctagaggtaaa 2539  T
Q  343 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 392  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2540 cctcggatctctatctgatacattgctcgaaggaacaccatgtagcttca 2589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 59 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 42304 - 41970
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  42304 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 42205  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  42204 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgacc 42105  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||     
T  42104 atctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatcc 42005  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  42004 gacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 41970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 47370 - 47033
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  47370 cctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 47271  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  47270 actctatcaacggtaggtgactatcttaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgacc 47171  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| |||||     
T  47170 atctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaaccttggatccctatcc 47071  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  47070 gacacaatacttgacggtacaccatgcagcttcacaat 47033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 81 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28717 - 28402
Alignment:
Q  81 gagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgact 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  28717 gagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgact 28618  T
Q  181 atcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgcc 280  Q
    |||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  28617 atcccaagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagcc 28518  T
Q  281 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 380  Q
    |||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  28517 gaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacac 28418  T
Q  381 catgtagcttcacaat 396  Q
    |||| | |||||||||    
T  28417 catgcaacttcacaat 28402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 81 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 40708 - 40393
Alignment:
Q  81 gagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgact 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  40708 gagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgact 40609  T
Q  181 atcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgcc 280  Q
    |||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  40608 atcccaagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagcc 40509  T
Q  281 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 380  Q
    |||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  40508 gaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacac 40409  T
Q  381 catgtagcttcacaat 396  Q
    |||| | |||||||||    
T  40408 catgcaacttcacaat 40393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 396
Target Start/End: Original strand, 20297 - 20655
Alignment:
Q  38 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 137  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  20297 ggtcccaagacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaat 20396  T
Q  138 gatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 237  Q
    | || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||    
T  20397 ggtaacttttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctccaatgattg 20496  T
Q  238 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 337  Q
     || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20497 gatcgtcctctccgactaaacatctgtctgcggatgataaaccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaa 20596  T
Q  338 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  20597 gtgaacctcggatcgctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 20655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13330 - 12995
Alignment:
Q  61 tgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaac 160  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || || || ||||||    
T  13330 tgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatagtaactgttgttgtatgtgaac 13231  T
Q  161 tcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccat 260  Q
    || ||| |||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||||    
T  13230 tctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccat 13131  T
Q  261 ctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 360  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| ||    
T  13130 ctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccga 13031  T
Q  361 tacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13030 cacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 12995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17100 - 16765
Alignment:
Q  61 tgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaac 160  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || || || ||||||    
T  17100 tgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatagtaactgttgttgtatgtgaac 17001  T
Q  161 tcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccat 260  Q
    || ||| |||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||    
T  17000 tctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccat 16901  T
Q  261 ctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 360  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| ||    
T  16900 ctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccga 16801  T
Q  361 tacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16800 cacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 16765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Original strand, 10104 - 10465
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || | ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  10104 tctggtcccaacaccacactttctcccgtctcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcg 10203  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| | ||||| ||||||||||| |||    
T  10204 aatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgttcaagtagacacactctcagcaaatcctctaacga 10303  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||     
T  10304 ttgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgaaaactcttccaaaatctt 10403  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  10404 gaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 10465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 396
Target Start/End: Original strand, 5034 - 5422
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||||||||| || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5034 actttctcagtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacaccacactttctcctgactcaaaccattataaaggagttctgcacctctgaccatacaaag 5133  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  5134 cttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtac 5233  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||| | ||||   |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||     
T  5234 acacactctcggaaaatcctctaacgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaat 5333  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  5334 gcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 5422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 214 - 396
Target Start/End: Original strand, 25464 - 25646
Alignment:
Q  214 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25464 tctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctct 25563  T
Q  314 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25564 tgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaat 25646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Original strand, 4186 - 4547
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||      
T  4186 tctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacgaagcttcgaacggtgccataccaatactca 4285  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| |||    
T  4286 aatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcaacaaatcctctaacga 4385  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||     
T  4386 ttgaatcgttctctccgactgaccatctctctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaacctt 4485  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  4486 gaagtgaacctcggatctctttccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaat 4547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 396
Target Start/End: Original strand, 43097 - 43455
Alignment:
Q  38 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 137  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  43097 ggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcctacacctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccataccaatactcgaat 43196  T
Q  138 gatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 237  Q
    | || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || ||    
T  43197 ggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattg 43296  T
Q  238 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 337  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  43297 gatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaaattcagcttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaa 43396  T
Q  338 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  43397 gtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 43455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 396
Target Start/End: Original strand, 248927 - 249285
Alignment:
Q  38 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 137  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  248927 ggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctcctaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaat 249026  T
Q  138 gatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 237  Q
    | || || ||||| || |||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||| ||    
T  249027 ggtaactgttattgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaacgattg 249126  T
Q  238 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 337  Q
     || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||     
T  249127 gatcgtcctctcagactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagag 249226  T
Q  338 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  249227 gtaaacctcggatccctatctgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 249285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Original strand, 19455 - 19792
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||    
T  19455 cctgactcaaaccagaataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgataactgttgttgtatgtga 19554  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||| |||||||||||||    
T  19555 actctatcaacagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcgtctccgactgacc 19654  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||||     
T  19655 atctgtctgaggatcataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatca 19754  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19755 gacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaat 19792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 18559 - 18171
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18559 actttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaactctacactttctcctgactcaaatcaacataaaggagttttgcacctccgaccatacaaag 18460  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||    
T  18459 cttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcatgtac 18360  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||| | | | | |||||||||||  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||     
T  18359 acacacttttagcaaatcctctaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaag 18260  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  18259 gcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaaccttggatctctatacgacacaatactcgacggaactccatgaaacttcacaat 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 396
Target Start/End: Original strand, 47408 - 47796
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47408 actttctccgtagtctgatgaactaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaag 47507  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  47508 cttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtac 47607  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||     
T  47608 acacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctctgactgaccatttgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaat 47707  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  47708 gcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcgggtctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 47796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13923 - 13535
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13923 actttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcatctccgaccatacaagg 13824  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | ||||| |||||||| | |||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||    
T  13823 cttcgaacggtgccatactaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccactttgctcaagcac 13724  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||| | ||||||||||||||| | ||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||     
T  13723 acacactctcaacaaatcctccaacgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaat 13624  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||  ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13623 gcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctctgattcctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 13535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 4922 - 4587
Alignment:
Q  61 tgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaac 160  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||  |||| || || || || || ||||||    
T  4922 tgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagattcgaacggtgccataccaatactcaaatggtaactgttgttgtatgtgaac 4823  T
Q  161 tcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccat 260  Q
    || |||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||||    
T  4822 tctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacctttctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccat 4723  T
Q  261 ctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 360  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||| ||    
T  4722 ctgtctgaggacgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctaaaagtgaacctcggatccctatccga 4623  T
Q  361 tacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     | ||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  4622 cataatactcgacggtacaccatgtagctttacaat 4587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 396
Target Start/End: Original strand, 67897 - 68042
Alignment:
Q  251 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |    
T  67897 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgggt 67996  T
Q  351 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  67997 ctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 68042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Original strand, 821 - 1200
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  821 gtagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaaag 920  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  921 gagccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcgcaagctccaccttgctcaagtacacacactct 1020  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    ||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  1021 cagtaaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgc 1120  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || ||||  ||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  1121 aagctcttcctgaatctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaat 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 329 - 396
Target Start/End: Original strand, 12582 - 12649
Alignment:
Q  329 aatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  12582 aatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaat 12649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 396
Target Start/End: Original strand, 40053 - 40410
Alignment:
Q  38 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 137  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||   || ||| |||||||| ||||    
T  40053 ggtcccaataccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagt-ctgcacctccgaccatacagagcttcaaacattgtcataccaatactcgaat 40151  T
Q  138 gatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 237  Q
    | || || || || || |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  |||||    
T  40152 ggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaaaggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctccaatgactg 40251  T
Q  238 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 337  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  40252 aatcgtcctctccgactgaccatctctttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaa 40351  T
Q  338 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  40352 gtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaat 40410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Original strand, 2105 - 2466
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  2105 tctggtcccaacaccacactttctcctgactcgaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcg 2204  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || || |  || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||    
T  2205 aatggtaactgtagttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctacaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatga 2304  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||      
T  2305 ttaaatcgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcgt 2404  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  2405 gaagtgaacctcggatgtctatccgacacaatactcgatggaagtccatgtaacttcacaat 2466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 49202 - 48841
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |    
T  49202 tctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcg 49103  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||  ||    
T  49102 aatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaatcctctaaaga 49003  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||    
T  49002 ttgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaaccta 48903  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || || ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  48902 gaagtgaacctcggattcctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctttacaat 48841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 51882 - 51497
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    ||||| |||||||| ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||| |    
T  51882 ttctccgtagtttgatgaaccaaatccggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcatgcacctccgactatacaaagctt 51783  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    |||| |||| ||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||    
T  51782 cgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacaca 51683  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
     | ||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| ||     
T  51682 cactctcagcaaatcctctactgattgaattgttctctccgactaaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgca 51583  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  51582 tcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaat 51497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21642 - 21305
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  21642 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtga 21543  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |  || || || ||| |||||||||||||    
T  21542 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaaagattgtatcgtcgtctccgactgacc 21443  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||     
T  21442 gtctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatcc 21343  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  21342 gacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaat 21305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Original strand, 26147 - 26253
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || || || ||||| || ||||    
T  26147 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaattcga 26246  T
Q  165 tcaacgg 171  Q
    |||||||    
T  26247 tcaacgg 26253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 342
Target Start/End: Original strand, 26288 - 26424
Alignment:
Q  206 acacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccca 305  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||    
T  26288 acacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttccca 26387  T
Q  306 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 342  Q
    ||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  26388 aagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 26424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11164 - 11091
Alignment:
Q  323 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  11164 ttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaat 11091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 52150 - 51814
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || ||||    
T  52150 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 52051  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  52050 actctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataa-tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgacc 51952  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||     
T  51951 atctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatcc 51852  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51851 gacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 51814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 61184 - 60848
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || ||||    
T  61184 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 61085  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  61084 actctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataa-tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgacc 60986  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||     
T  60985 atctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatcc 60886  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  60885 gacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 60848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 67572 - 67236
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || ||||    
T  67572 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 67473  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  67472 actctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataa-tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgacc 67374  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||     
T  67373 atctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatcc 67274  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  67273 gacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 67236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 49016 - 48668
Alignment:
Q  47 accactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctat 146  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  49016 accacactttcacgtgactcgaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgtacggtgccataccaatactcgaatggtaactgt 48917  T
Q  147 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 246  Q
    | || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||| |||||||  || ||||| |||||    
T  48916 tgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctaagcaa-tcctctaatgattgaatcgtcct 48818  T
Q  247 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 346  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||     
T  48817 ttccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaacatcttgaagtgaacctc 48718  T
Q  347 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  48717 ggatctttatccgacacaatactcgacggaaccccatgtaacttcacaat 48668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 57788 - 57511
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  57788 cctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtaggtga 57689  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||| |||||||||||||    
T  57688 actctatcaatggtaggtgactatcccaagctccacctcgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcttctccgactgacc 57589  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctaga 336  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||| || |||||    
T  57588 atctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgttctgcaaactcttccagaacctaga 57511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 396
Target Start/End: Original strand, 199 - 541
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||||  ||||||| ||||| || || || || |    
T  199 ctttctcctgactcaaaccaacataatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgtt-ccataacaatactcgaatggtaactgttgttgt 297  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  298 acgtgaactctatcatcggtagatgactatcccaagctccaccttggtcaagtacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaatcgttctctccga 397  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  398 ctgaccatctgtttgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatct 497  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||| |||| | |||||||||    
T  498 ctatccgacacaatactcgatggtacatcatgcaacttcacaat 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 366
Target Start/End: Original strand, 27830 - 28161
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| |    
T  27830 tctggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaaacttcgaacggtgccataccaatactcg 27929  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || || || || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||||| |  ||    
T  27930 aatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatga 28029  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  28030 ttggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatcta 28129  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 366  Q
     |||| || || |||||||||||||| |||||    
T  28130 taagtgaacctcggatctctatctgacacaat 28161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1144 - 787
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || |||||  |||| | |||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |    
T  1144 tctggtcccaacaccacattttctcttgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccataccaatactcg 1045  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||| || |||||||| |||    
T  1044 aatggtaactattgttgtacatgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcgagtacacacactctcagcagatcctctaacga 945  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||     
T  944 ttgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggacgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaacctt 845  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 392  Q
    ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  844 gaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgaaacaccatgtaacttca 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 366
Target Start/End: Original strand, 34290 - 34414
Alignment:
Q  242 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  34290 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtga 34389  T
Q  342 atcttggatctctatctgatacaat 366  Q
    | || |||||||||||||| |||||    
T  34390 acctcggatctctatctgacacaat 34414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3326 - 2992
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  3326 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttctatgtga 3227  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |  || || || || | ||||||||||||    
T  3226 actctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcgcaacaaatcctccaaagattggatcgtgccctccgactgacc 3127  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| |||||     
T  3126 atctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcatgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatcc 3027  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || ||||| || || || |||||||||||||||||    
T  3026 gacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcac 2992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 396
Target Start/End: Original strand, 26480 - 26814
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||  ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||    
T  26480 gactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaact 26579  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| ||||||||||   ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  26580 ctatcaacggtagatgactataaaaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatc 26679  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||     
T  26680 tgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgac 26779  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  26780 acaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 26814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 396
Target Start/End: Original strand, 26862 - 27196
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||  ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||    
T  26862 gactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaact 26961  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  26962 ctatcaacggtagatgactatctgaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatc 27061  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||     
T  27062 tgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgac 27161  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  27162 acaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 27196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7209 - 6872
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    |||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  7209 cctgacacaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggcgccataccaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtga 7110  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||    
T  7109 actctatcaacgttagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgtccactccgactgacc 7010  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||     
T  7009 atctgtctgcggatgataagccgaacgcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactctttcagaatctagaagtgaacctcggatctctatcc 6910  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  6909 gacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcacaat 6872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 396
Target Start/End: Original strand, 6523 - 6856
Alignment:
Q  63 actcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactc 162  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||    
T  6523 actcaaacaagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactattgttgtatgtgaattc 6622  T
Q  163 gatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatct 262  Q
     ||||| || || ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||    
T  6623 tatcaatggtaggtgactatcccaaactcctccctgctcaagtacacatatcctcagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatct 6722  T
Q  263 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 362  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  6723 gtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtgaactcttccaaaatctagaagtgaaccttgggtctctatcggaca 6822  T
Q  363 caatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    | || ||||| || | |||||| | |||||||||    
T  6823 ctatactcgaggggataccatgcaacttcacaat 6856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16687 - 16350
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    ||||| |||| ||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  16687 tcacccgacttaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 16588  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    | ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||    
T  16587 taaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactg 16488  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||||    
T  16487 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctcta 16388  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16387 tccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 16350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7049 - 6670
Alignment:
Q  17 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 116  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| |||||    ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  7049 gtagtttgatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctgtcgactcaaaccaacacaattgagttctgcacctccgaccatacaatgcttcgaacg 6950  T
Q  117 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 216  Q
    ||  ||| |||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  6949 gtatcataccaatactcgaatggtaattgttgttatacgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactct 6850  T
Q  217 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 316  Q
    || ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||     
T  6849 cagcaaatcctctaacggctgaatcgttctctccgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgt 6750  T
Q  317 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  6749 aaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatgttcgatggaaccccatgtaacttcacaat 6670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 38 - 396
Target Start/End: Original strand, 11083 - 11441
Alignment:
Q  38 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 137  Q
    ||||| || ||||| || || ||| ||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  11083 ggtcccaacaccacactctctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaat 11182  T
Q  138 gatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 237  Q
    | ||  | || || || |||||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || ||    
T  11183 ggtaaatgttgttgtatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattg 11282  T
Q  238 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 337  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || |||    
T  11283 gatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactgaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctcgaa 11382  T
Q  338 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || || ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11383 gtgaacctcggatctccatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 11441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10759 - 10425
Alignment:
Q  11 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 110  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||| || |  || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  10759 ttctctgtagtctgttgaactatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacgtaacggagttctgcacctccgaccacacaaagctt 10660  T
Q  111 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 210  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  10659 cgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtaaacactatcaacgacaagtgactattccaagctccaccttgctcaagtacaca 10560  T
Q  211 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 310  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  10559 cactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaatctcaactttgaacccaacgcc 10460  T
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10459 tcttgcaaacttttcgaaaatctagatgtaaatct 10425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 37479 - 37861
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || ||  |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  37479 catcttaactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacagtttctcctgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgacca 37578  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  37579 tacaaagcttcgaacggtgcgataccaatactcgaatggtaattgttgttgtacgtgaactccatcaacggtagatgactatctcaagctccaccttgct 37678  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||| ||||| | ||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  37679 caagtacacacactctcagcaaatcctctagtgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataggctgaactgaacctcaactttga 37778  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 383  Q
     ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  37779 acccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgatggaaccccat 37861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 167 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11531 - 11302
Alignment:
Q  167 aacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtct 266  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  11531 aacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtct 11432  T
Q  267 gcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 366  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||    
T  11431 gcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaat 11332  T
Q  367 gctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  11331 actcgatggaactccatgtaacttcacaat 11302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 176 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7091 - 6871
Alignment:
Q  176 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 275  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7091 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 6992  T
Q  276 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 375  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  6991 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaatactcgatgg 6892  T
Q  376 aacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  6891 aactccatgtaacttcacaat 6871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Original strand, 3086 - 3423
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  3086 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 3185  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || |||||||||| |||||||||    
T  3186 actctatcaacggtaggtgactatcccaagcaccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggattgtcctcttcgactgacc 3285  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||  |||| |||||     
T  3286 atctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcattttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatcactatcc 3385  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  3386 gacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 3423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12954 - 12833
Alignment:
Q  272 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 371  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| | ||    
T  12954 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatacacg 12855  T
Q  372 aaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  12854 aaggaacaccatgcaacttcac 12833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Original strand, 433 - 770
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| || || || || || ||||    
T  433 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccgtacaaagcttcgaacggtgccatacgaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 532  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |  || || ||  ||||||||| ||||||    
T  533 actctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaatcctccaaagattggatcatcctctccgtctgacc 632  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  633 atctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatcc 732  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
       ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  733 accacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 2750 - 2509
Alignment:
Q  155 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 254  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||    
T  2750 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgact 2651  T
Q  255 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 354  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  2650 gaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggaatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttggatctct 2551  T
Q  355 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  2550 atccgatacaatactcgacggtacaccatgtaacttcacaat 2509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 396
Target Start/End: Original strand, 26544 - 26933
Alignment:
Q  7 aactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa 106  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| |  |||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||     
T  26544 aactttctcagtagtctcatgaaccaaatctggtcccaacacaacattttcacctgactcaaaccaacataaaggagtcctacacctccgaccatacaag 26643  T
Q  107 gcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaa 206  Q
    || ||||| ||| |||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  26644 gcttcgaacggtaccatcccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagta 26743  T
Q  207 cacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaa 306  Q
    |||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26744 cacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaa 26843  T
Q  307 agcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| || || |  ||||| || |||||||||||    
T  26844 agcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcagatccctatccgacacaatacttgacgatacaccgtgcagcttcacaat 26933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 5444 - 5086
Alignment:
Q  38 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 137  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  5444 ggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccatcagaaaggagtcctacacctccgaccatccaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaat 5345  T
Q  138 gatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 237  Q
    | || || || || || |||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || ||    
T  5344 ggtaactgttgttgtatgtgaactctatcattggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattg 5245  T
Q  238 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 337  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || ||||||    
T  5244 gatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacatcctgcaaactcttccagaacctagaa 5145  T
Q  338 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || || ||   ||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5144 gtgaacctcaaatccctatccgacacaatactcgaaagaactccatgtagcttcacaat 5086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Original strand, 5548 - 5885
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| |||| ||||| || || || || || ||||    
T  5548 cctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacttccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccattactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 5647  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||| |||    
T  5648 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaagttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctctaacgattggatcgtcctttccgactaacc 5747  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    |||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||| | || ||||| || || |||||||| |||||     
T  5748 atctttctgacgatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtccagcaagctcttcaagaacctagaggtgaaccttggatccctatcc 5847  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  5848 gacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaat 5885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Original strand, 43840 - 44177
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| || | ||    
T  43840 cctgactcataccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttattgtatgcga 43939  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || |   ||||||||||||||||    
T  43940 actctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcctccaatgattggaccatcctctccgactgacc 44039  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    || | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||||     
T  44040 atgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatcc 44139  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44140 gacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 44177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 396
Target Start/End: Original strand, 44852 - 45189
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| || | ||    
T  44852 cctgactcataccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttattgtatgcga 44951  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || |   ||||||||||||||||    
T  44952 actctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcctccaatgattggaccatcctctccgactgacc 45051  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    || | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||||     
T  45052 atgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatcc 45151  T
Q  359 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45152 gacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 45189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 339
Target Start/End: Original strand, 20436 - 20737
Alignment:
Q  38 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 137  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||| ||||||||| |||||   || ||| || ||||| ||||    
T  20436 ggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgactatacaaagcttcgaacaatgtcatacctatactcgaat 20535  T
Q  138 gatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 237  Q
    | || || ||||| || |||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || ||    
T  20536 ggtaactgttattgtatgtgaactctatcagtggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattg 20635  T
Q  238 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 337  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |  || ||||| ||||| || ||||||    
T  20636 gatcgtcctctccgattgaccacctgtctgacaatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcgttctgtaaactcttccagaaactagaa 20735  T
Q  338 gt 339  Q
    ||    
T  20736 gt 20737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 279 - 475
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  279 catcttaactttctcaatagtctgctgaacaatatctagtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaacca 378  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctt 197  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  379 tataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaattataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatggctatcacaagttccacctt 475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 6307 - 5969
Alignment:
Q  60 ctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaa 159  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  6307 ctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacgatgccatacctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaa 6208  T
Q  160 ctcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat--tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 257  Q
    ||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||    
T  6207 ctctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgac 6108  T
Q  258 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 357  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||  |||| || |||||||| || ||  |||| |||||    
T  6107 catctatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcatccagaacctagaagtgaacctcagatccctatc 6008  T
Q  358 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6007 cgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 5969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Original strand, 19178 - 19509
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
T  19178 ctttctcccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgt 19277  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| |||||   |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| || || || ||||||| |||    
T  19278 aagtaaactcttccaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacattctcagtaaatcctctagagattgtatcgtcctcttcga 19377  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||    ||||||    
T  19378 ctgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcggatct 19477  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19478 ctatccgacacaatactcgacggaacaccatg 19509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Original strand, 23340 - 23671
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
T  23340 ctttctcccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgt 23439  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| |||||   |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| || || || ||||||| |||    
T  23440 aagtaaactcttccaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacattctcagtaaatcctctagagattgtatcgtcctcttcga 23539  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||    ||||||    
T  23540 ctgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcggatct 23639  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  23640 ctatccgacacaatactcgacggaacaccatg 23671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25832 - 25511
Alignment:
Q  63 actcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactc 162  Q
    ||||||||||||| || ||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||||    
T  25832 actcaaaccagcataaaggattcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactc 25733  T
Q  163 gatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatct 262  Q
     |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | || || | |||||  |||||||| |  || || ||  ||||||| ||| ||||||||    
T  25732 tatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcatgtacccacactctcagtaaatcctccaatgattggatcatcctctctgaccgaccatct 25633  T
Q  263 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 362  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |    
T  25632 gtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaatctcttccataatctagaagtgaacctcggatctctatccgaca 25533  T
Q  363 caatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  25532 caatactcgacggaacaccatg 25511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12776 - 12420
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |    
T  12776 tctggtcctaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaagagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcg 12677  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 234  Q
    |||| || || || || || |||||||| ||||| || || |    | | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |  ||    
T  12676 aatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggt----agcacaagctccaccatgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatga 12581  T
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  12580 ttggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccaaaatcta 12481  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12480 gatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaa 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 5227 - 4945
Alignment:
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 200  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||    
T  5227 tacaaagcttcgaacgatgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaacttgct 5128  T
Q  201 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 300  Q
    |||||||||| | |||||  |||| |||||  || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  5127 caagaacacacactctcagtaaatactctaaagattgaatcgtcatctcagactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcga 5028  T
Q  301 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 383  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  5027 acccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccat 4945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 396
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2139
Alignment:
Q  245 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988 ctctccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 2087  T
Q  345 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  2088 ttgggtctctatctgatacaatgctcgacggaacacgatgcaacttcacaat 2139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 368 - 38
Alignment:
Q  61 tgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaac 160  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  368 tgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccgatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaac 269  T
Q  161 tcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccat 260  Q
    || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||        || |  || || || |||||||||||||||||||    
T  268 tctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcagtt-----tccaatgattggatcgtcctctccgactgaccat 174  T
Q  261 ctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 360  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||    
T  173 ctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccga 74  T
Q  361 tacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  73 cacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 38  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 396
Target Start/End: Original strand, 11225 - 11560
Alignment:
Q  61 tgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaac 160  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || || || ||||||    
T  11225 tgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatagtaactgttgttgtatgtgaac 11324  T
Q  161 tcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccat 260  Q
    || ||| |||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||    
T  11325 tctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccat 11424  T
Q  261 ctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 360  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| ||    
T  11425 ctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccga 11524  T
Q  361 tacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11525 cacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 11560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 7778 - 7456
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  7778 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 7679  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| |||||    
T  7678 caatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatc 7579  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||||| ||| ||     
T  7578 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatctcgatccgac 7479  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  7478 acaatactagaaggaataccatg 7456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10060 - 9782
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || |    
T  10060 ctttctcccgacccaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgt 9961  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  9960 atgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccga 9861  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 331  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  9860 ctgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaat 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 290 - 396
Target Start/End: Original strand, 12060 - 12166
Alignment:
Q  290 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 389  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12060 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 12159  T
Q  390 tcacaat 396  Q
    |||||||    
T  12160 tcacaat 12166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 155 - 396
Target Start/End: Original strand, 41350 - 41589
Alignment:
Q  155 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 254  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||    
T  41350 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaaagattggatcgtcctctccgact 41449  T
Q  255 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 354  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||    
T  41450 gaccatctgtctgcggatgataagccgaa--caacctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccccggatctct 41547  T
Q  355 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||  || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41548 attcgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 41589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1196 - 880
Alignment:
Q  68 aaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatca 167  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || || || ||||    
T  1196 aaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtaaattctatca 1097  T
Q  168 acggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctg 267  Q
    | || || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||| |  ||||||||||  || || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1096 atggtaggtgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatactcttagtaaatcctctaaagattggatcgtcctttccgaatgaccatctgtctg 997  T
Q  268 cggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatg 367  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||| || ||     
T  996 cggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttcaagtaaactttgggtctctatttgacactata 897  T
Q  368 ctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  896 ctcgacggaaccccatg 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 242 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 844
Alignment:
Q  242 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  997 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 898  T
Q  342 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 395  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  897 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaa 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 115 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1887 - 1618
Alignment:
Q  115 aggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || |||||||  |||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |    
T  1887 aggtgccataccaatactcgaatggtaattgttgttgtacgtgaactttatcaacgacaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacact 1788  T
Q  215 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 314  Q
    || | ||||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||| || ||||    
T  1787 cttagcaaatcctctaacggttaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacttcaactttgaactcaatgcatctt 1688  T
Q  315 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  1687 gcaaactcttccaaaacctcgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaactccatg 1618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4969 - 4912
Alignment:
Q  63 actcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgc 120  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4969 actcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgc 4912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 358
Target Start/End: Original strand, 173 - 523
Alignment:
Q  8 actttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaag 107  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  173 actttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggattcctgcacctccgaccatataaag 272  T
Q  108 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 207  Q
    | ||||| |||||||| | |||||| ||||| || |  || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||    
T  273 cttcgaacggtgccatacaaatactcgaatggtaacggttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacattgctcaagcac 372  T
Q  208 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 307  Q
    ||| | ||| |  ||||||||||  || || || |||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||     
T  373 acacactcttactaaatcctctaaagattgtatcgtcctctccatttgaccatctgtgtgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcctaag 472  T
Q  308 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 358  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||||    
T  473 gcgtcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatct 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14222 - 13994
Alignment:
Q  59 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 158  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  14222 cctgactcaaaccaggataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 14123  T
Q  159 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 258  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  || || || || |||| |||||||||    
T  14122 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacattctcagtaaatcctccaaagattggatcgttctcttcgactgacc 14023  T
Q  259 atctgtctgcggatgatatgccgaactca 287  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  14022 atctgtctacggatgataagctgaactca 13994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 17264 - 17450
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||| ||||  || |||||||| || || ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  17264 catcttaaccttcacagtagtttgttgaatgatttctggtcccaaaactacaatctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctacacctccgacca 17363  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 187  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17364 tacagagcctcaaaaggtgccattccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaa 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 178 - 396
Target Start/End: Original strand, 4884 - 5102
Alignment:
Q  178 actatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatat 277  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4884 actattccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataa 4983  T
Q  278 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 377  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | |  ||||||||||| |||||||| || |||||||| || | ||||||||| || || |||||||| ||||    
T  4984 gccgaactcaacctcaacttagaacccgaggaatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcgaatctctatccgacacgatgctcgatggaa 5083  T
Q  378 caccatgtagcttcacaat 396  Q
    | ||||| | |||||||||    
T  5084 ccccatgcaacttcacaat 5102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Original strand, 7497 - 7828
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |  | || || |    
T  7497 ctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaattgttgttgt 7596  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| |||||||| | |      |||||| |    |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| |     
T  7597 aagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgctccaagacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctcggt 7696  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||     
T  7697 ctgcccatctgtctggggatgataagcagaactcaatctcaaattagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacatagaagtaaacctcggatcc 7796  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
      ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7797 ggatccgacacaatactagaaggaataccatg 7828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16375
Alignment:
Q  1 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16494 catcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttttggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16395  T
Q  101 tacaaagcctcgaaaggtgc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  16394 tacaaagcctcaaaaggtgc 16375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8794 - 8721
Alignment:
Q  323 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8794 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 8721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4543
Alignment:
Q  278 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 377  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4425 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 4524  T
Q  378 caccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  4525 caccatgtaacttcacaat 4543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 11555 - 11673
Alignment:
Q  278 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 377  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 11654  T
Q  378 caccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  11655 caccatgtaacttcacaat 11673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 194 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 68427 - 68225
Alignment:
Q  194 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 293  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||| |||||||||    
T  68427 ccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctttaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctatttgtgggtgataagccgaagtcaatctca 68328  T
Q  294 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 393  Q
    |||| || |||||   |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  68327 actttgaacccaagttctcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcac 68228  T
Q  394 aat 396  Q
    |||    
T  68227 aat 68225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Original strand, 46492 - 46814
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  46492 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 46591  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| |  ||||||||    
T  46592 caatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtatgaccatc 46691  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
     || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||| |||| || ||||| | ||| ||     
T  46692 ggtatgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaaataaacctcggatcccgatccgac 46791  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  46792 acaatactagaaggaataccatg 46814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 33193 - 32953
Alignment:
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || ||||||||||||||    
T  33193 tgaactctatcaacggtaggtgattatcccaagctccaccttgctcaagcacacataccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactg 33094  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||    
T  33093 accatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaatcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatcccta 32994  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    || ||   ||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  32993 tccgacgaaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 32953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 357
Target Start/End: Original strand, 17877 - 17992
Alignment:
Q  242 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17877 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtga 17976  T
Q  342 atcttggatctctatc 357  Q
    |||| |||||||||||    
T  17977 atctcggatctctatc 17992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26134 - 25959
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||| || | |||||| |||||||| || || || ||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || || || |    
T  26134 ctttcaccggattaaaaccaacacaacggtgtcctacacctcggaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgt 26035  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctc 228  Q
    |||| ||||| |||||||| | |   ||||||||| |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||||||||    
T  26034 aagtaaactcaatcaacggtaaacatctatcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctc 25959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5909 - 5756
Alignment:
Q  35 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 134  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  5909 tctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcg 5810  T
Q  135 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaag 188  Q
    |||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5809 aatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 5756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 311 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 39730 - 39645
Alignment:
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  39730 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaat 39645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Original strand, 23732 - 24054
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |  | || || ||||| ||||    
T  23732 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaaatgttgttgtaagtaaact 23831  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| |    |||||| |||||||||| ||| |||||    
T  23832 caatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatactccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatc 23931  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| ||     
T  23932 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 24031  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  24032 acaatactagaaggaataccatg 24054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3840 - 3521
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| |    
T  3840 tcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 3741  T
Q  165 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 264  Q
    ||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||    
T  3740 tcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggt 3641  T
Q  265 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 364  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || |||    
T  3640 ctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacaca 3541  T
Q  365 atgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    || || ||||||| ||||||    
T  3540 atactagaaggaataccatg 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 323 - 402
Target Start/End: Original strand, 24097 - 24176
Alignment:
Q  323 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24097 ttccaaaatctagaagttaatcttggatctctatccgatccaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 24176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 81593 - 81470
Alignment:
Q  269 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 368  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  81593 ggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaagctcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatac 81494  T
Q  369 tcgaaggaacaccatgtagcttca 392  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  81493 tcgacggtacaccatgtagcttca 81470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 204
Target Start/End: Original strand, 136278 - 136390
Alignment:
Q  92 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  136278 ctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaattgtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctc 136377  T
Q  192 ctccttgctcaag 204  Q
    | |||||||||||    
T  136378 caccttgctcaag 136390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Original strand, 3488 - 3818
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || |    
T  3488 ctttctcctgattcaaactaacacaacggtgtcttacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgt 3587  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| ||||| || | |    | |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    | |||| |||||||| |     
T  3588 aagtaaactcaatcaaaggtaaacatttgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactcggaatagtcctctctgt 3687  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
     || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||     
T  3688 ttgcccatcggtctg-ggatgataagcagaactcaacgtcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcc 3786  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    | |||| | ||||| || ||||||| ||||||    
T  3787 cgatcttacacaatactagaaggaataccatg 3818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 235 - 377
Target Start/End: Original strand, 11167 - 11309
Alignment:
Q  235 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 334  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  ||| |||||| | ||||||  ||    
T  11167 ctgaatggtcctctccatctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttacaaactctcccaaaactta 11266  T
Q  335 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 377  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||    
T  11267 gaagtaaatcttggatctcgatctgacataatactagaaggaa 11309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 139
Target Start/End: Original strand, 10985 - 11071
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 139  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||| || |||| ||||||||||| ||| || |||| ||| || ||||||||||||    
T  10985 ctttcacctgactcataccaacacaacagcgttctacacctcctaccatacaaagtctcaaacggtgtcatcccgatactagaatga 11071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38861 - 38761
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  38861 tcacctgactcaaaccagcataaaggagtcttacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 38762  T
Q  156 t 156  Q
    |    
T  38761 t 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 170
Target Start/End: Original strand, 71533 - 71665
Alignment:
Q  38 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 137  Q
    |||||||| || || ||||| || || |||||||| |||||| | || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  71533 ggtcctaacacaacactttctccagattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaat 71632  T
Q  138 gatagctattattataagtgaactcgatcaacg 170  Q
    || | || || || ||||| ||||| |||||||    
T  71633 gaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacg 71665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33174 - 33059
Alignment:
Q  269 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 368  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| |    
T  33174 ggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 33075  T
Q  369 tcgaaggaacaccatg 384  Q
    | ||||||| ||||||    
T  33074 tagaaggaataccatg 33059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 384
Target Start/End: Original strand, 24529 - 24623
Alignment:
Q  290 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||| || || |||| ||||||    
T  24529 ctcaacttagtgcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaatatagaagtaaatcttgggtgtcgatctgacacaatactagatggaataccatg 24623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14702 - 14383
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||||| | || || || ||||| ||||| |    
T  14702 tcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatagtagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 14603  T
Q  165 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 264  Q
    ||| ||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||    
T  14602 tcatcggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggt 14503  T
Q  265 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 364  Q
    ||| | | | || || ||||||| ||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||| || ||||| | |||||| |||    
T  14502 ctgagaacggtaagcagaactcagtctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaactctcccagaacttagaagtaaacctcggatcacgatctgacaca 14403  T
Q  365 atgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    || || ||||||| ||||||    
T  14402 atactagaaggaataccatg 14383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 384
Target Start/End: Original strand, 5693 - 5835
Alignment:
Q  242 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 341  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  5693 gtcctatccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacatagaagtaa 5792  T
Q  342 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    | || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  5793 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9697 - 9507
Alignment:
Q  194 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 293  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||    
T  9697 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgtggttggtaagcagaactcaatctca 9598  T
Q  294 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  9597 actttgtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 9507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 384
Target Start/End: Original strand, 18541 - 18711
Alignment:
Q  214 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 313  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  18541 tctcaacaaatcttctaacctctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccgaaagcagct 18640  T
Q  314 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||  ||||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  18641 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacgttggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 18711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 384
Target Start/End: Original strand, 14478 - 14798
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| |    
T  14478 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggcgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 14577  T
Q  165 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 264  Q
    ||||| | | |  |   |||||| |  |  ||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |    |||||| | ||||||   ||| ||||||||    
T  14578 tcaacagtaaacaatcgtcccaactgacagcttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctccaaactctgaatagccctctcgatctgcccatctgt 14677  T
Q  265 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc-aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 363  Q
    ||  |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||| |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||| | |||| | ||    
T  14678 cttgggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaaccttgaatcccgatctaacac 14777  T
Q  364 aatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||| || ||||||| ||||||    
T  14778 aatactagaaggaataccatg 14798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1401 - 1293
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||| | |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| | || || || |    
T  1401 ctttcacctgactcaaactaacacaacggtgtcctacacctcagtccatacaaagcctcaaacggtgtcattccgatactagaatgaaaactgttgttgt 1302  T
Q  153 aagtgaact 161  Q
    |||||||||    
T  1301 aagtgaact 1293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1240 - 1112
Alignment:
Q  214 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 313  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | |||  |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  1240 tctcaacaaatcctccaaactctgaatcgtcctctctgtctgctcatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaagcagct 1141  T
Q  314 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 342  Q
    | |||||| | ||||||  ||||||||||    
T  1140 ttcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 1112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 384
Target Start/End: Original strand, 24212 - 24540
Alignment:
Q  56 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 155  Q
    |||| |||||| ||| | |||||||| || || || ||| |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| |  |||| || ||||    
T  24212 tcacttgactcgaactaacacaacggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccgatactagaatgaaaattattgttgtaag 24311  T
Q  156 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 255  Q
    | ||||| | ||| || | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    ||| || |||||||||| |||    
T  24312 taaactctaccaaaggtaaacattcatcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctggatagtcctctccgtctg 24411  T
Q  256 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 355  Q
     ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||    ||||||||  |||||||||| | ||||||   |||||| || |||||||| | |    
T  24412 cccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaaattaattcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactgagaagtgaaccttggatcccga 24511  T
Q  356 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  24512 tctgacacaatactagaaggaataccatg 24540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 384
Target Start/End: Original strand, 13249 - 13568
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| ||||| || || || || ||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || || || ||||| |    
T  13249 tcaaaccaacacaatggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaggtaaactcaa 13348  T
Q  165 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 264  Q
    ||||||| | |       ||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||||||||  || ||||| ||    
T  13349 tcaacggtaaacattcgacccaaataacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtttgcccatcggt 13448  T
Q  265 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 364  Q
     || ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||| ||||| | ||| || |||    
T  13449 atgaggatggtaagcagaactcaatctgaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaatctcggatcccgatccgacaca 13548  T
Q  365 atgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    || || ||||||| ||||||    
T  13549 atactagaaggaataccatg 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 171
Target Start/End: Original strand, 9316 - 9434
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    || ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||  | |||||||||||| | || || ||||    
T  9316 ctttcacctgactcaaaccaacacaacggtaacctacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatcgcgatactagaatgaaaactgttgttat 9415  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacgg 171  Q
    |||| ||||  ||||||||    
T  9416 aagtaaactaaatcaacgg 9434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3912 - 3590
Alignment:
Q  62 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 161  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||| | | || || || ||||| ||||    
T  3912 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggagccatgccgatactagaataaaaactgttgttgtaagtaaact 3813  T
Q  162 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 261  Q
    | ||||| || | |      |||||| || | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||| | ||||| |  | ||| |||||    
T  3812 caatcaatggtaaacattcgtcccaacttacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgattagtcctttttgtctgcccatc 3713  T
Q  262 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 361  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || ||||   |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||  |     
T  3712 tgtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccgaaagtagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccaac 3613  T
Q  362 acaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  3612 acaatactagaaggaataccatg 3590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 827 - 700
Alignment:
Q  257 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 356  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||    
T  827 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 728  T
Q  357 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||| ||||| || |||| || ||||||    
T  727 ctgacacaatactagaagaaataccatg 700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1031 - 913
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||  || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| | |||| | || || || |    
T  1031 ctttcacctaactcaaaccaacacattggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattctgatacttgtatgaaaactgttgttgt 932  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacgg 171  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  931 aagtaaactcaatcaacgg 913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3744 - 3565
Alignment:
Q  205 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 304  Q
    |||||||  |||||||||||| || |  || | |||||||||||  |  |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||  |||||||| |  |||    
T  3744 aacacaagctctcaacaaatcttccaaagatttaattgtcctcttggtttgaccatcagtctgaggatgataagcaaaactcagcctcaacttagttccc 3645  T
Q  305 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||  |  ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  3644 aaagctgcttgcaaactctcccaaaactttaaagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 169
Target Start/End: Original strand, 2897 - 3001
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  ||| |||||||| | || || || ||||| ||||| |    
T  2897 tcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaaaagagccattctgatagtagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 2996  T
Q  165 tcaac 169  Q
    |||||    
T  2997 tcaac 3001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8856 - 8748
Alignment:
Q  65 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 164  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||| ||| |||| | || || || ||||| ||||| |    
T  8856 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaactgtgtcattccgatattagtatgaaaactgtttttgtaagtaaactcaa 8757  T
Q  165 tcaacggaa 173  Q
    |||||||||    
T  8756 tcaacggaa 8748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Original strand, 44019 - 44198
Alignment:
Q  205 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 304  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||    |||||| |||||||||  ||| ||||| || |  ||||| || || ||||||||||||||||| |  |||    
T  44019 aacacaagctctcaacaaatcttctaaactctgaatagtcctctccatctgcccatcggtataaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccc 44118  T
Q  305 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||   ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  44119 aaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatccagatccgacacaatactagaaggaataccatg 44198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28243 - 27912
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || | ||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||| |||| |  | || || |    
T  28243 ctttcacctgactcaaaccaacacaatggtgtcctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgtcataccgatactagcatgaaaattgttgttgt 28144  T
Q  153 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 252  Q
    |||| ||||| |||||| | | |      |||||| |  | |||||| | | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||||||||     
T  28143 aagtaaactcaatcaacagtaaacattcgtcccaactaacaccttgcaccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgt 28044  T
Q  253 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 352  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||| ||  ||||||||||  | |||||     
T  28043 ctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaactctcccagaacttagaagtaaacatcggatcc 27944  T
Q  353 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 384  Q
    | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27943 cgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 92 - 171
Target Start/End: Original strand, 17 - 96
Alignment:
Q  92 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  17 ctccgaccatacaaggcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 96  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 139
Target Start/End: Original strand, 14852 - 14938
Alignment:
Q  53 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 139  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||   | || || ||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||    
T  14852 ctttcacctgactcaaacaaacacaacgacatcctacacctcggaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatacaagaatga 14938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Original strand, 2187 - 2260
Alignment:
Q  323 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  2187 ttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatttgaaacaatactcgacgggactccatgcaacttcacaat 2260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 396
Target Start/End: Original strand, 470 - 555
Alignment:
Q  311 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 396  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  470 tcttgtaaactctttcaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 377
Target Start/End: Original strand, 19 - 115
Alignment:
Q  281 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 377  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || |||||||    
T  19 gaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaa 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University