View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8445_low_4 (Length: 397)

Name: NF8445_low_4
Description: NF8445
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8445_low_4
NF8445_low_4
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (118-380)||(35099782-35100044)
chr8 (118-380)||(15053984-15054246)
chr8 (118-380)||(38206452-38206714)
chr8 (118-380)||(1634279-1634541)
chr8 (118-380)||(1957679-1957941)
chr8 (118-380)||(17742054-17742316)
chr8 (118-377)||(7511534-7511793)
chr8 (118-380)||(30532006-30532268)
chr8 (118-380)||(13815286-13815548)
chr8 (119-380)||(5212630-5212891)
chr8 (199-380)||(34955219-34955400)
chr8 (238-380)||(5735624-5735766)
chr8 (1-122)||(35101097-35101218)
chr8 (1-122)||(5213485-5213606)
chr8 (1-122)||(13816739-13816860)
chr8 (1-122)||(26749210-26749331)
chr8 (3-118)||(15056253-15056368)
chr8 (3-118)||(1955601-1955716)
chr8 (3-122)||(38205538-38205657)
chr8 (3-122)||(30529944-30530063)
chr8 (1-118)||(17744276-17744393)
chr8 (142-238)||(13784114-13784210)
chr8 (1-72)||(5735767-5735838)
chr8 (314-380)||(18029164-18029230)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (118-380)||(631865-632127)
chr6 (118-380)||(17960720-17960982)
chr6 (118-380)||(34838933-34839195)
chr6 (118-380)||(8219294-8219556)
chr6 (118-378)||(24932720-24932980)
chr6 (118-380)||(6379959-6380221)
chr6 (118-380)||(29427993-29428255)
chr6 (1-122)||(634370-634491)
chr6 (1-122)||(6377742-6377863)
chr6 (1-122)||(17958610-17958731)
chr6 (3-118)||(8221810-8221925)
chr6 (3-118)||(34841115-34841230)
chr6 (3-122)||(18641889-18642008)
chr6 (1-122)||(29952338-29952460)
chr6 (3-122)||(24916931-24917050)
chr6 (3-122)||(24114750-24114869)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (118-380)||(17466865-17467127)
chr3 (118-380)||(25790237-25790499)
chr3 (118-380)||(6048152-6048414)
chr3 (118-380)||(30417886-30418148)
chr3 (118-366)||(47144530-47144778)
chr3 (118-380)||(43474239-43474501)
chr3 (118-380)||(42561252-42561514)
chr3 (118-380)||(33749031-33749293)
chr3 (119-376)||(30691877-30692134)
chr3 (118-380)||(28154411-28154673)
chr3 (118-380)||(25832194-25832456)
chr3 (118-380)||(42600975-42601237)
chr3 (118-376)||(50017346-50017604)
chr3 (120-380)||(21225638-21225898)
chr3 (118-380)||(51427441-51427703)
chr3 (176-380)||(51973864-51974070)
chr3 (228-380)||(49357093-49357245)
chr3 (243-380)||(6832735-6832872)
chr3 (1-122)||(17469116-17469237)
chr3 (1-122)||(25788020-25788141)
chr3 (1-122)||(25829977-25830098)
chr3 (252-380)||(49028157-49028285)
chr3 (1-122)||(33935877-33935998)
chr3 (1-122)||(42598675-42598796)
chr3 (1-122)||(47146973-47147094)
chr3 (215-380)||(21231718-21231883)
chr3 (121-259)||(50034023-50034161)
chr3 (3-118)||(43475097-43475212)
chr3 (118-220)||(49028055-49028157)
chr3 (3-118)||(6045650-6045765)
chr3 (3-118)||(10424974-10425089)
chr3 (3-118)||(30415778-30415893)
chr3 (3-118)||(42563616-42563731)
chr3 (34-122)||(51429574-51429662)
chr3 (3-118)||(4874420-4874535)
chr3 (3-122)||(26157417-26157536)
chr3 (4-118)||(33188387-33188501)
chr3 (298-380)||(10426066-10426148)
chr3 (4-122)||(30689144-30689262)
chr3 (36-122)||(50019698-50019784)
chr3 (297-380)||(33935331-33935414)
chr3 (314-380)||(25450300-25450366)
chr3 (1-122)||(21227816-21227937)
chr3 (320-380)||(7008367-7008427)
chr3 (44-118)||(4852727-4852801)
chr3 (346-380)||(20139710-20139744)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (118-380)||(12855368-12855630)
chr2 (118-380)||(8852406-8852668)
chr2 (118-380)||(7587959-7588221)
chr2 (118-380)||(22351070-22351332)
chr2 (118-380)||(30822039-30822301)
chr2 (118-380)||(5146181-5146443)
chr2 (118-380)||(2780258-2780520)
chr2 (118-380)||(39433453-39433714)
chr2 (186-385)||(6363271-6363470)
chr2 (160-380)||(31192511-31192731)
chr2 (1-122)||(9073232-9073353)
chr2 (1-122)||(12857579-12857700)
chr2 (1-122)||(30819929-30820050)
chr2 (1-122)||(8854699-8854820)
chr2 (249-380)||(36855374-36855505)
chr2 (121-366)||(40881203-40881429)
chr2 (1-121)||(31185555-31185675)
chr2 (3-118)||(7585851-7585966)
chr2 (1-122)||(5145684-5145805)
chr2 (3-122)||(4278769-4278888)
chr2 (1-121)||(31205269-31205390)
chr2 (34-116)||(2779425-2779507)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (118-380)||(31468476-31468738)
chr1 (118-380)||(10266418-10266680)
chr1 (118-380)||(17680722-17680984)
chr1 (118-380)||(2477785-2478047)
chr1 (118-380)||(45239489-45239751)
chr1 (118-380)||(47299958-47300220)
chr1 (118-380)||(48387564-48387826)
chr1 (118-380)||(48404679-48404941)
chr1 (118-380)||(36230854-36231116)
chr1 (118-379)||(51520544-51520805)
chr1 (118-380)||(33164782-33165044)
chr1 (118-380)||(17783713-17783975)
chr1 (118-380)||(8468668-8468933)
chr1 (221-380)||(45455716-45455875)
chr1 (1-122)||(31470888-31471009)
chr1 (1-122)||(45241740-45241861)
chr1 (1-122)||(17785945-17786066)
chr1 (3-122)||(47297866-47297985)
chr1 (3-123)||(8470931-8471051)
chr1 (3-118)||(2475441-2475556)
chr1 (3-118)||(17676628-17676743)
chr1 (3-118)||(48385497-48385612)
chr1 (3-118)||(48407022-48407137)
chr1 (11-122)||(18318078-18318189)
chr1 (3-122)||(33166889-33167008)
chr1 (3-118)||(38837005-38837120)
chr1 (3-122)||(51522942-51523061)
chr1 (340-380)||(43739322-43739362)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (118-380)||(2214745-2215007)
chr4 (118-380)||(46916972-46917234)
chr4 (118-380)||(16174476-16174738)
chr4 (118-380)||(3532765-3533027)
chr4 (118-380)||(3617910-3618172)
chr4 (118-380)||(8992137-8992399)
chr4 (118-380)||(13110915-13111177)
chr4 (118-380)||(28899683-28899945)
chr4 (118-380)||(53183566-53183828)
chr4 (124-380)||(19409425-19409681)
chr4 (118-380)||(12158476-12158736)
chr4 (189-380)||(53347593-53347784)
chr4 (1-122)||(2212595-2212716)
chr4 (1-122)||(53181743-53181864)
chr4 (1-122)||(46914789-46914910)
chr4 (276-380)||(7401345-7401449)
chr4 (1-122)||(36658136-36658257)
chr4 (255-380)||(36656897-36657022)
chr4 (3-118)||(3530577-3530692)
chr4 (3-118)||(3615566-3615681)
chr4 (3-118)||(8994392-8994507)
chr4 (3-118)||(13113170-13113285)
chr4 (3-116)||(28900629-28900742)
chr4 (3-118)||(16172169-16172284)
chr4 (118-217)||(36657018-36657117)
chr4 (3-122)||(34434851-34434970)
chr4 (3-122)||(28446879-28446998)
chr4 (4-122)||(33606687-33606805)
chr4 (130-324)||(32462920-32463114)
chr4 (318-380)||(4981872-4981934)
chr4 (3-36)||(36564743-36564776)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (118-380)||(31013316-31013578)
chr5 (118-380)||(30647574-30647836)
chr5 (118-380)||(27942844-27943106)
chr5 (118-380)||(32976026-32976288)
chr5 (118-380)||(40889248-40889510)
chr5 (118-380)||(27406503-27406764)
chr5 (118-380)||(25032694-25032956)
chr5 (118-380)||(4577344-4577606)
chr5 (118-380)||(10569230-10569492)
chr5 (1-122)||(31012341-31012462)
chr5 (3-118)||(32973672-32973787)
chr5 (3-118)||(27945260-27945375)
chr5 (3-118)||(40891430-40891545)
chr5 (286-380)||(34710212-34710306)
chr5 (34-122)||(4579709-4579797)
chr5 (3-118)||(30646179-30646294)
chr5 (3-118)||(29616839-29616954)
chr5 (323-380)||(23648845-23648902)
chr5 (323-380)||(23809670-23809727)
chr5 (337-379)||(29618671-29618713)
chr5 (1-37)||(21365263-21365299)
chr5 (229-341)||(2299846-2299958)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (118-380)||(22191558-22191820)
chr7 (118-380)||(32129703-32129965)
chr7 (118-380)||(40301948-40302210)
chr7 (118-380)||(26812486-26812748)
chr7 (118-380)||(36518869-36519131)
chr7 (118-380)||(22657025-22657287)
chr7 (188-380)||(35028641-35028833)
chr7 (1-122)||(22193916-22194037)
chr7 (239-380)||(25218398-25218539)
chr7 (5-118)||(22659553-22659666)
chr7 (3-118)||(36521135-36521250)
chr7 (3-122)||(32127561-32127680)
chr7 (270-380)||(1940279-1940389)
chr7 (3-122)||(26814767-26814886)
chr7 (3-96)||(40301220-40301313)
chr7 (1-106)||(1940164-1940268)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (118-380)||(169987-170249)
scaffold0007 (34-122)||(166670-166758)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (118-352)||(30006-30239)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (181-380)||(4860-5043)
[»] scaffold1240 (2 HSPs)
scaffold1240 (1-122)||(28-149)
scaffold1240 (118-219)||(2229-2330)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (3-122)||(110521-110640)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (3-122)||(105478-105597)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (338-380)||(56811-56853)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 35100044 - 35099782
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35100044 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 35099945  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35099944 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 35099845  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35099844 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 35099782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 15054246 - 15053984
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15054246 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtgtatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 15054147  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15054146 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 15054047  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15054046 caaagtttggaatgtttcgcgattgaagatgatttgtatcgtactaagtaaattacttgtgtg 15053984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 38206452 - 38206714
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38206452 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtgaatccagtacaccgcaaccatactcgaccgag 38206551  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38206552 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 38206651  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38206652 caaagtttggaatgtatggtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 38206714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 1634279 - 1634541
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1634279 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtgaatccagtacaccgcaaccatactcgaccgag 1634378  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634379 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 1634478  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1634479 caaagtttggaatgtatagtgattgaagatgatttgtttcgtactaaataaattacttgtgtg 1634541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 1957679 - 1957941
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  1957679 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatccgagggaagtggatctagtacagcacaaccatactcgaccgag 1957778  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1957779 gtgttacccacttttgcaaatcatgcgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 1957878  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1957879 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgaactaagtaaattacttgtgtg 1957941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17742316 - 17742054
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17742316 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctgggggaagtggatctagtacaccacaaccatactcgaccgag 17742217  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17742216 gtgttaccagcttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcatgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 17742117  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17742116 caaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttctatcgtactaaataaattacttgtgtg 17742054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 118 - 377
Target Start/End: Original strand, 7511534 - 7511793
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||    
T  7511534 gattgttgaggatgaatgagatacatatgttcaacgttggaccgattttgagcaatctgaggaaagtggatctattataccgcaaccatactcgactgag 7511633  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7511634 gtgttacacacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcatgaattacaagcagatctagtgaagcacatatgga 7511733  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7511734 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgt 7511793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 30532006 - 30532268
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30532006 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctgggggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 30532105  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30532106 gtattaccagcttttgcaaatcatatgcgtgctagatccgagttgcgtgatctaaatgttcatcacgaattgtaagcagatctagtgaagcacatatgga 30532205  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30532206 caaagtttggaatgtatcatgattaaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 30532268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 13815548 - 13815286
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  13815548 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctgggggaagtggatcaagtacatcgcaatcatactcgaccgag 13815449  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13815448 gtgttactagcttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccagatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaaacacatatgga 13815349  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13815348 caaagtttgaaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcctactaaataaattacttgtgtg 13815286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 119 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5212891 - 5212630
Alignment:
Q  119 attgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgagg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5212891 attgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctgcaggaagtggatcaagtacatcgcaaccatactcgaccgagg 5212792  T
Q  219 tgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggac 318  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5212791 tgttaccagcttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccagatgttcattacgaattacaagcagatctagtgaaacacatacggac 5212692  T
Q  319 aaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5212691 aaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 5212630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 199 - 380
Target Start/End: Original strand, 34955219 - 34955400
Alignment:
Q  199 gcaaccatactcgaccgaggtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34955219 gcaaccatactcgaccgaggtgttaccagcttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagat 34955318  T
Q  299 ctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34955319 caagtgaaacacatatggacaaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 34955400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 238 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5735766 - 5735624
Alignment:
Q  238 tcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcat 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5735766 tcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgattcagatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaaacacatatggacaaagtttggaatgtatcgt 5735667  T
Q  338 gattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5735666 gattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 5735624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 35101218 - 35101097
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35101218 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 35101119  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35101118 aaaataataaataaatggattg 35101097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 5213606 - 5213485
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5213606 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatacgagc 5213507  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5213506 aaaataataaataaatggattg 5213485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13816860 - 13816739
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13816860 aacatatttgggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagc 13816761  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13816760 aaaataataaataaatggattg 13816739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 26749210 - 26749331
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26749210 aacatattggtgtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagc 26749309  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  26749310 aaagtaataaataaatggattg 26749331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15056368 - 15056253
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15056368 catattggggtaaaattgttgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 15056269  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  15056268 attaataaataaatgg 15056253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 1955601 - 1955716
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1955601 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 1955700  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  1955701 attaataaataaatgg 1955716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 38205538 - 38205657
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38205538 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatgtaattgcttgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 38205637  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  38205638 agtaataaataaatggattg 38205657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 30529944 - 30530063
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30529944 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatgtaattgcttgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 30530043  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  30530044 agtaataaatgaatggattg 30530063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17744393 - 17744276
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  17744393 aacatattagggtaaaattgctgagtattgtaatgagtatggctcatttgattctccactggatctagttgcatgccagaactgttttaattatatgagc 17744294  T
Q  101 aaaataataaataaatgg 118  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  17744293 aaagtaataaataaatgg 17744276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 13784114 - 13784210
Alignment:
Q  142 atatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgaggtgttacccacttttgcaaat 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13784114 atatgctcaacgttggaccaattttgagcaacttgggggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgaggtgttaccatcttttgcaaat 13784210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 5735838 - 5735767
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgc 72  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5735838 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcatttgattctccccgcgatcaagttgc 5735767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 380
Target Start/End: Original strand, 18029164 - 18029230
Alignment:
Q  314 tggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18029164 tggacaaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 18029230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 632127 - 631865
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  632127 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 632028  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  632027 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 631928  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  631927 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 631865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 17960720 - 17960982
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  17960720 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacagcacaaccatactcgaccgag 17960819  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17960820 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 17960919  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17960920 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgaactaagtaaattacttgtgtg 17960982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 34839195 - 34838933
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  34839195 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatccgagggaagtggatctagtacagcacaaccatactcgaccgag 34839096  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34839095 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 34838996  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  34838995 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgaactaagtaaattacttgtgtg 34838933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8219556 - 8219294
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8219556 gattgttgaggatgaacgaaatacatatgctcaacgttggaaagattttgagcaatttgagggaagtggatctagtacaccgcagccatactcgaccgag 8219457  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  8219456 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatattgtgaagcgcatatgga 8219357  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8219356 caaagtttggaatgtttcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 8219294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 118 - 378
Target Start/End: Original strand, 24932720 - 24932980
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  24932720 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtgaatccaatacactgcaatcatactcgaccgag 24932819  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24932820 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacaaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 24932919  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtg 378  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24932920 caaagtttggaatgtatagtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacctgtg 24932980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 6379959 - 6380221
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  6379959 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggactgattttgagcaacctgggggaagtggatcaagtacatcgcaaccatactcgaccgag 6380058  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6380059 gtgttaccagcttttgcaaatcatgtgcgtggtagatccgagttgcgtgatccagatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaaacacatatgga 6380158  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6380159 caaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 6380221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 29427993 - 29428255
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29427993 gattgttgaggatgaacgagatgcatatgcttaacgttggaccgattttgagcaacctgggggaagtggatctaatacaccgcaaccatactcgaccgag 29428092  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29428093 gtgttaccagcatttgcaaatcatgtgcgttctagatccgagttgcgtgatccagatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaaacacatatgga 29428192  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29428193 caaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacctgtgtg 29428255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 634491 - 634370
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  634491 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 634392  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  634391 aaaataataaataaatggattg 634370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 6377742 - 6377863
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6377742 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 6377841  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6377842 aaaataataaataaatggattg 6377863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 17958610 - 17958731
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17958610 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 17958709  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17958710 aaaataataaataaatggattg 17958731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8221925 - 8221810
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8221925 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagaattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgcaaccgttttaattatatgagcaa 8221826  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  8221825 attaataaataaatgg 8221810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 34841230 - 34841115
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34841230 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 34841131  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  34841130 attaataaataaatgg 34841115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18642008 - 18641889
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18642008 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatgtaattgcttgccgaaaccattttaattatatgagcaa 18641909  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  18641908 agtaataaataaatggattg 18641889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 29952338 - 29952460
Alignment:
Q  1 aacatatt-ggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgag 99  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29952338 aacatattaggggtaaatttgctgagtattgtaatgaatattgctcatttaattatccccgcgatctagttgtatgccgaaaccgttttaattatatgag 29952437  T
Q  100 caaaataataaataaatggattg 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  29952438 caaagtaataaataaatggattg 29952460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 24916931 - 24917050
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24916931 catattggggtaaaattgctgagtattgcaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatataattgcttgccgaaaccattttaattatatgagcaa 24917030  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  24917031 agtaataaataaatggattg 24917050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24114869 - 24114750
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24114869 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattactcattcgattctgcgctcgatgtaattgcatgccaaaaccgttttaattatatgagcaa 24114770  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  24114769 aataccgaataaatggattg 24114750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17467127 - 17466865
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17467127 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 17467028  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17467027 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 17466928  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17466927 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 17466865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 25790237 - 25790499
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25790237 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 25790336  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25790337 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 25790436  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25790437 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 25790499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 6048152 - 6048414
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6048152 gattgttgaggatgaacgcgatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatatgagggaagtggatctagtacagcgcaaccatactcgaccgag 6048251  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6048252 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 6048351  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6048352 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgtactaagtaaattacttgtgtg 6048414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 30417886 - 30418148
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  30417886 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacagcacaaccatactcgaccgag 30417985  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30417986 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 30418085  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30418086 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgaactaagtaaattacttgtgtg 30418148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 118 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 47144778 - 47144530
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47144778 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 47144679  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47144678 gtgttacccacatttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 47144579  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaat 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47144578 caaaatttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtattgtactaaat 47144530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43474501 - 43474239
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  43474501 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtaaaccgcaaccatactcgaccgag 43474402  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43474401 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgtgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaaggacatatgga 43474302  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43474301 caaagtttgaaatgtttcgtgattgaagatgatttatatcgtactaaataaattacttgtgtg 43474239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 42561514 - 42561252
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  42561514 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgatggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgactgag 42561415  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42561414 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgtgtgctatatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 42561315  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42561314 caaagtttgaaatgtttcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttctgtg 42561252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 33749293 - 33749031
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33749293 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctgggggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 33749194  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33749193 gtgttaccaacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccagatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaaacagatatgga 33749094  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33749093 caaagtttggaatgtatcgtggttgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 33749031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 119 - 376
Target Start/End: Original strand, 30691877 - 30692134
Alignment:
Q  119 attgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgagg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30691877 attgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctgggggaagtggatctagtacaccgcaaccatgctcgaccgagg 30691976  T
Q  219 tgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggac 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30691977 tgttaccaacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccagatgttcatcacgaattgcaagcagacctagtgaagcacatatggac 30692076  T
Q  319 aaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttg 376  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30692077 aaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttctatcgtactaaataaattacttg 30692134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 28154411 - 28154673
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28154411 gattgttgaggatgaacgagatacataggttcaacgttggaccgattttgagcaacctgagggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 28154510  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28154511 gtgttaccatcttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgattcaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 28154610  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28154611 caaagtttggaatgtatagtgattgaagatgatttgtattgtactaaataaattccttgtgtg 28154673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 25832194 - 25832456
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  25832194 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggactgattttgagcaacctgggggaagtggatcaagtacatcgcaaccatactcgaccgag 25832293  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25832294 gtgttaccagcttttgcaaatcatgtgcgtggtagatccgagttgcgtgatccagatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaaacacatatgga 25832393  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25832394 caaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 25832456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 42600975 - 42601237
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  42600975 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggactgattttgagcaacctgggggaagtggatcaagtacatcgcaaccatactcgaccgag 42601074  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42601075 gtgttaccagcttttgcaaatcatgtgcgtggtagatccgagttgcgtgatccagatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaaacacatatgga 42601174  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42601175 caaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 42601237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 118 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 50017604 - 50017346
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50017604 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaatgttggaccgattttgagcaacctgggggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 50017505  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50017504 gtgttaccaacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccagatgttcatcacaaattgcaagcagatctagtgaaacacatatgga 50017405  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttg 376  Q
     |||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50017404 taaagtttggaatgtattgtgattgaaaatgatttgtatcgtactaaatatattacttg 50017346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 120 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 21225898 - 21225638
Alignment:
Q  120 ttgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgaggt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21225898 ttgttaaggatgaacgagatacttatgctcaacattggaccgattttgagcaatctgaggaaaatggatctagtacaccgcaaccatactcaaccgaggt 21225799  T
Q  220 gttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggaca 319  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21225798 gttacccgcttttacaaatcatgtacgtgctagatctgagttacgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagctcatatggaca 21225699  T
Q  320 aagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21225698 aagtttggaatgtttcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaattaagttacttgtgtg 21225638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 51427703 - 51427441
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  51427703 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaaccagcgggaagtggatcacgtacatcgcaaccatactcgaccgag 51427604  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51427603 gtgttaccagcttttgcaaatcatgtgcgtgttagatccgagttgcgtgatccagatgtttatcacgaattacaagcagatctagtgaaacacatatgga 51427504  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51427503 caaagtttggaatgtatcgcgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 51427441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 176 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 51974070 - 51973864
Alignment:
Q  176 gagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgaggtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatg 275  Q
    |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51974070 gaggaaagtggatctaaaacaccgcaaccatactcgaccaaggagttacccgcttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatctaaatg 51973971  T
Q  276 ttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcac--atatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattac 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  51973970 ttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatatggacaatgtttgaaatgtttcgtgattgaagatgatttgtattgtactaattaagttac 51973871  T
Q  374 ttgtgtg 380  Q
    |||||||    
T  51973870 ttgtgtg 51973864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 228 - 380
Target Start/End: Original strand, 49357093 - 49357245
Alignment:
Q  228 cttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttgg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49357093 cttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccatatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaaacacatatggacaaagtttgg 49357192  T
Q  328 aatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49357193 aatgtatcgtgattgaagatgatttgtattgtactaaataaattacttgtgtg 49357245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 243 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 6832872 - 6832735
Alignment:
Q  243 tgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6832872 tgcgtgctagatccgagttgcgtgatgcaaatgttcatcacgaattacaagcagatctagtgaagcaaatatggacaaagtttggaatgtttcgtgattg 6832773  T
Q  343 aagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6832772 aagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 6832735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17469237 - 17469116
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17469237 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 17469138  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17469137 aaaataataaataaatggattg 17469116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 25788020 - 25788141
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25788020 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 25788119  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25788120 aaaataataaataaatggattg 25788141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 25829977 - 25830098
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25829977 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 25830076  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25830077 aaaataataaataaatggattg 25830098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 252 - 380
Target Start/End: Original strand, 49028157 - 49028285
Alignment:
Q  252 gatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  49028157 gatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtatagtgattgaagatgatt 49028256  T
Q  352 tgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49028257 tgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 49028285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33935998 - 33935877
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33935998 aacatattagggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagc 33935899  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33935898 aaaataataaataaatggattg 33935877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 42598675 - 42598796
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42598675 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgctgaaaccgttttaattatatgagc 42598774  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42598775 aaaataataaataaatggattg 42598796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 47147094 - 47146973
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47147094 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtatagctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 47146995  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47146994 aaaataataaataaatggattg 47146973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 215 - 380
Target Start/End: Original strand, 21231718 - 21231883
Alignment:
Q  215 gaggtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatat 314  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21231718 gaggtgttagccgcttttgcaaatcatgtgtgtgctagatctgagttgcgttatccaactgttcatcatgaattgcaagcagatctagtgaagaatatat 21231817  T
Q  315 ggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21231818 ggacacaatttggaatgtttcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaattaagttacttgtgtg 21231883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 50034161 - 50034023
Alignment:
Q  121 tgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgaggtg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  50034161 tgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctgggggaagtggatctagcacaccgcaaccatactcgaccgaggtg 50034062  T
Q  221 ttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgag 259  Q
    ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50034061 ttactagctttttcaaatcatgtgcgtgctagatccgag 50034023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 43475212 - 43475097
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43475212 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 43475113  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  43475112 attaataaataaatgg 43475097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 118 - 220
Target Start/End: Original strand, 49028055 - 49028157
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  49028055 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtgaatccagtacaccgcaaccatactcgaccgag 49028154  T
Q  218 gtg 220  Q
    |||    
T  49028155 gtg 49028157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 6045650 - 6045765
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6045650 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 6045749  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  6045750 attaataaataaatgg 6045765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 10424974 - 10425089
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10424974 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 10425073  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  10425074 attaataaataaatgg 10425089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 30415778 - 30415893
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30415778 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 30415877  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  30415878 attaataaataaatgg 30415893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 42563731 - 42563616
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42563731 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 42563632  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  42563631 attaataaataaatgg 42563616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 51429662 - 51429574
Alignment:
Q  34 tgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaaataataaataaatggattg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51429662 tgagtattgctcattcgattctccacgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgaacaaaataataaataaatggattg 51429574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 4874420 - 4874535
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4874420 catattgggttaaaattgttgagtattgtaatgagcatcgctcattcgattctccgcgcgactcagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 4874519  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  4874520 attaataaataaatgg 4874535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 26157417 - 26157536
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26157417 catattggggtaaaattgctgagtattgcaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatataattgcttgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 26157516  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  26157517 agtaataaataaatggattg 26157536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 118
Target Start/End: Original strand, 33188387 - 33188501
Alignment:
Q  4 atattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaa 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33188387 atattggggtaaaattgctgagtattgtaatgaacattgctaattcgattctccgcgcgatgcagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaaa 33188486  T
Q  104 ataataaataaatgg 118  Q
     ||||||||||||||    
T  33188487 ttaataaataaatgg 33188501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 298 - 380
Target Start/End: Original strand, 10426066 - 10426148
Alignment:
Q  298 tctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10426066 tctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgtactaagtaaattacttgtgtg 10426148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 30689144 - 30689262
Alignment:
Q  4 atattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaa 103  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  30689144 atattggggtgaaattgctgagtattgtaatgagtatggctcatttgattctccgcgggatctagttgcatgccgaaatcattttaattatataagcaaa 30689243  T
Q  104 ataataaataaatggattg 122  Q
     ||||||||||||||||||    
T  30689244 gtaataaataaatggattg 30689262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 50019784 - 50019698
Alignment:
Q  36 agtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  50019784 agtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaaagtaataaataaatggattg 50019698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 297 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 33935414 - 33935331
Alignment:
Q  297 atctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33935414 atctagtgaaacacatatggacaaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 33935331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 380
Target Start/End: Original strand, 25450300 - 25450366
Alignment:
Q  314 tggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25450300 tggacaaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 25450366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21227937 - 21227816
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||  |||||| || |||||||||| ||||||||||| |    
T  21227937 aacatattggggtagaattgttgattattgtaatgagaattgctcatttgatcctccgcacgatggagttgcatgtcgaaaccgttataattatatgaac 21227838  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    |||||| ||  |||||||||||    
T  21227837 aaaatactaggtaaatggattg 21227816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 7008427 - 7008367
Alignment:
Q  320 aagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7008427 aagtttggaatgtttcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 7008367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 118
Target Start/End: Original strand, 4852727 - 4852801
Alignment:
Q  44 tcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaaataataaataaatgg 118  Q
    |||||||||||||| |||||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4852727 tcattcgattctccgcgcgactcaggtgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaaattaataaataaatgg 4852801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 20139744 - 20139710
Alignment:
Q  346 atgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20139744 atgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 20139710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12855630 - 12855368
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12855630 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 12855531  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12855530 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 12855431  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12855430 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 12855368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8852668 - 8852406
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8852668 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 8852569  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8852568 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 8852469  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8852468 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttatgtg 8852406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 7587959 - 7588221
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7587959 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacagcgcaaccatactcgaccgag 7588058  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7588059 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 7588158  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7588159 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgtactaagtaaattacttgtgtg 7588221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 22351070 - 22351332
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  22351070 gattgttgaggatgaacgcgatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacagcgcaaccatactcggccgag 22351169  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22351170 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 22351269  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22351270 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgtactaagtaaattacttgtgtg 22351332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 30822039 - 30822301
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  30822039 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacagcacaaccatactcgaccgag 30822138  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30822139 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 30822238  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30822239 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgaactaagtaaattacttgtgtg 30822301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 5146181 - 5146443
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5146181 gattgttgaggataaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctgggggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 5146280  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  5146281 gtgttaccagcttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacgtatgaa 5146380  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5146381 caaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcatactaaataaattatttgtgtg 5146443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 2780258 - 2780520
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2780258 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctaggggaattggatctagtacaatgcaaccatactcgaccgag 2780357  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2780358 gtgttaccagcttttgcaaatcatgtgcgtgctagatttgagttgcgtgatccagatgttcatcacgaattgcaagtagatctagtgaaacacatatgga 2780457  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2780458 caaagtttgaaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 2780520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 39433453 - 39433714
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||    
T  39433453 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctg-gggaagtggatctaatacatcgcaaccatacttaaccgag 39433551  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||    
T  39433552 gtgttactagcttttgcaaatcatgtgcgtggtagatccgaattgtgtgatccagatgttcatcacgaattgcaaggagatataatgaaacacatatgga 39433651  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39433652 caaagtttgaaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtattaaataaattacttgtgtg 39433714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 186 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6363470 - 6363271
Alignment:
Q  186 gatctagtacacagcaaccatactcgaccgaggtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacga 285  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6363470 gatctagtacaccgcaaccatactcgaccgaggtgttacccacttttgaaaatcatgtgtgtgctagatccgagttgcgtgattcaaatgttcatcacga 6363371  T
Q  286 attgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtgatgtc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6363370 attgcaagcagatctagtgaagcgcatatggacagagtttggaatgtttcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtgttgtc 6363271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 160 - 380
Target Start/End: Original strand, 31192511 - 31192731
Alignment:
Q  160 cgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgaggtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgag 259  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31192511 cgattttgagcaacctgggggaagtggatcaagtacaccgcaaccatactcgaccggggtgttaccagcttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgag 31192610  T
Q  260 ttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgt 359  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  31192611 ttgcgtcatccagatgttcgtcacgaactgcaagtagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtatcatgattgaagatgatttctatcgt 31192710  T
Q  360 actaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  31192711 actaaataaattatttgtgtg 31192731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 9073232 - 9073353
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9073232 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 9073331  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9073332 aaaataataaataaatggattg 9073353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 12857700 - 12857579
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857700 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 12857601  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12857600 aaaataataaataaatggattg 12857579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 30819929 - 30820050
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30819929 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 30820028  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30820029 aaaataataaataaatggattg 30820050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8854820 - 8854699
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8854820 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagt 8854721  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8854720 aaaataataaataaatggattg 8854699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 249 - 380
Target Start/End: Original strand, 36855374 - 36855505
Alignment:
Q  249 ctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  36855374 ctagatccgagttgcgtgatccagatgttcatcacgaattgcaagcaaatctattgaaacacatatgaacaaagtttggaatgtatcgtgattgaagatg 36855473  T
Q  349 atttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36855474 atttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 36855505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 366
Target Start/End: Original strand, 40881203 - 40881429
Alignment:
Q  121 tgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgaggtg 220  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40881203 tgttgaggatggacaagatatatatgctcaaagttggaccgattttgagcaacctg-gggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgaggtg 40881301  T
Q  221 ttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagat-ccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggaca 319  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||               ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  40881302 ttactagcttttgcaaatcatgtgcgtgctagatcccgagttg---------------catcacgaattacaagtagatctagtgaagcacacgtggaca 40881386  T
Q  320 aagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaat 366  Q
    |||||| |||||| |     |||||||||||||||||||||||||||    
T  40881387 aagtttagaatgtat----tttgaagatgatttgtatcgtactaaat 40881429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 31185555 - 31185675
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31185555 aacatattggggtaaaattgatgagtattgtattgagtatggctcatttgattctccgcgggatctagttgcatgccaaaaccgttttaattatatgagc 31185654  T
Q  101 aaaataataaataaatggatt 121  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  31185655 aaagtaataaataaatggatt 31185675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 7585851 - 7585966
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7585851 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 7585950  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  7585951 attaataaataaatgg 7585966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 5145684 - 5145805
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5145684 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcatttgatcctccgcgtgatgtaattgcttgccgaaaccgttttaattatatgagc 5145783  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  5145784 aaagtaataaataaatggattg 5145805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4278888 - 4278769
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4278888 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagcattgctcattcgatccttcgcgtgatgtaattgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 4278789  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    | || |||||||||||||||    
T  4278788 agtactaaataaatggattg 4278769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 31205269 - 31205390
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattg-taatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgag 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31205269 aacatattggggtaaaattgatgagtattggtaatgagtacggctcatttgattctccgcgggatctagttgcatgccgaaactgttttaattatatgag 31205368  T
Q  100 caaaataataaataaatggatt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  31205369 caaagtaataaataaatggatt 31205390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 116
Target Start/End: Original strand, 2779425 - 2779507
Alignment:
Q  34 tgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaaataataaataaat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2779425 tgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaaagtaataaataaat 2779507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 31468738 - 31468476
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468738 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 31468639  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468638 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 31468539  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468538 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 31468476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 10266418 - 10266680
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  10266418 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacatcgcaaccatactcaaccgag 10266517  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266518 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 10266617  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266618 caaagtttggaatgtttcgtgattgaagattatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 10266680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 17680722 - 17680984
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17680722 gattgttgaggatgaaagagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtagaccgcaaccatactcgaccgag 17680821  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680822 gtgttacccacttttgaaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 17680921  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680922 caaagtttggaatgtttcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 17680984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 2477785 - 2478047
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  2477785 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacagcacaaccatactcgaccgag 2477884  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2477885 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 2477984  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  2477985 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgaactaagtaaattacttgtgtg 2478047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 45239751 - 45239489
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  45239751 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacagcacaaccatactcgaccgag 45239652  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239651 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 45239552  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  45239551 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgaactaagtaaattacttgtgtg 45239489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 47299958 - 47300220
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47299958 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggttctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 47300057  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47300058 gtgttacctacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatctgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgaa 47300157  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47300158 caaagtttggaatgtttcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 47300220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 48387564 - 48387826
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  48387564 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacagcacaaccatactcgaccgag 48387663  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48387664 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 48387763  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  48387764 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgaactaagtaaattacttgtgtg 48387826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 48404941 - 48404679
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48404941 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttagaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 48404842  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48404841 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgtgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaaacagatctagtgaagcacatatgga 48404742  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48404741 caaagtttggaatgtttcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacctgtgtg 48404679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 36231116 - 36230854
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  36231116 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacattggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacaccgcaatcatactcgaccgag 36231017  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36231016 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcgtcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 36230917  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36230916 caaagtttggaatgtttcgtgattgaagatgatttatatcgtactaaataaattacttatgtg 36230854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 118 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 51520805 - 51520544
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51520805 gattgttgaggatgaacgagatacatatgatcaacgttggaccgattttgagcaatctaagggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 51520706  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520705 atgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgtgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 51520606  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgt 379  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  51520605 caaagtttgggatgtttcgtgattgaagatgatttgtatggtactaaataaactacttgtgt 51520544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 33165044 - 33164782
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33165044 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctgggggaagtagatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 33164945  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33164944 gtgttaccatcttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 33164845  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33164844 caaagtttggaatgtacagtggttgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 33164782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17783975 - 17783713
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17783975 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctttgggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 17783876  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17783875 gtgttaccagcatttgcaaatcatgtgcgtgctatatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcaaatctagtgaaacacatatgga 17783776  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17783775 caaaatttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 17783713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8468933 - 8468668
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgaggg---aagtggatctagtacacagcaaccatactcgacc 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8468933 gattgttgaggatgaaccagatacatatgttcaacgttggaccgattttgagcaatctgaggggggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgacc 8468834  T
Q  215 gaggtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||| |||||    
T  8468833 gaggtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcttgatctaaatgttcatcatgaattgcaagcatattttgtgaagctcatat 8468734  T
Q  315 ggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8468733 tgataaagtttggaatgtttcgtgattgaagatgatttgtatcgtgctaaataaatgacttgtgtg 8468668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 221 - 380
Target Start/End: Original strand, 45455716 - 45455875
Alignment:
Q  221 ttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45455716 ttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgaattgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaaccacatatggacaa 45455815  T
Q  321 agtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45455816 agtttggaatgttttgtgattgaagattatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 45455875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 31471009 - 31470888
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31471009 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 31470910  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31470909 aaaataataaataaatggattg 31470888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 45241861 - 45241740
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45241861 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 45241762  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45241761 aaaataataaataaatggattg 45241740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17786066 - 17785945
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17786066 aacaaattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattatccccgcgatctagttgcatgccgaaatcgttttaattatatgagc 17785967  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  17785966 aaagtaataaataaatggattg 17785945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 47297866 - 47297985
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47297866 catattggggtaaagttgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccacgcgatgtagttgcatgccgaaactgttttaattatatgagcaa 47297965  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  47297966 attaataaataaatggattg 47297985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8471051 - 8470931
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8471051 catatttgggtataattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccgcgcgaagtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 8470952  T
Q  103 aataataaataaatggattgt 123  Q
    | |||||||||||||| ||||    
T  8470951 attaataaataaatgggttgt 8470931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 2475441 - 2475556
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2475441 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 2475540  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  2475541 attaataaataaatgg 2475556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 17676628 - 17676743
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17676628 catattggggtaaaattgctgagtattataatgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgcagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 17676727  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  17676728 attaataaataaatgg 17676743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 48385497 - 48385612
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48385497 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 48385596  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  48385597 attaataaataaatgg 48385612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 48407137 - 48407022
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48407137 catattggggtaaaattgttgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcaatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 48407038  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  48407037 attaataaataaatgg 48407022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 18318078 - 18318189
Alignment:
Q  11 ggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaaataataa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18318078 ggtaaaattgttaagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtaattgcatgccgaaactgttttaattatatgagcaaaatactaa 18318177  T
Q  111 ataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||    
T  18318178 ataaatggattg 18318189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33167008 - 33166889
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33167008 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgatcctctgcgtgatgtaattgcttgccgaaaccgttttagttatatgtgcaa 33166909  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  33166908 agtaataaataattggattg 33166889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 38837005 - 38837120
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38837005 catattggtgtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcaattctccgcgcgatgcagctgcatgccaaaaccgttttaattatatgagcaa 38837104  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  38837105 attaataaataaatgg 38837120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 51523061 - 51522942
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51523061 catattggggtaaaattgatgagtattgtaatgatcattgcttattcgatcctccgcgtgatgtaattgcatgccgaaaccgttttatttatatgagcaa 51522962  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  51522961 aatactaaataaatggattg 51522942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 340 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43739362 - 43739322
Alignment:
Q  340 ttgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43739362 ttgaagatgatttgtatcatactaaataaattacttgtgtg 43739322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 2214745 - 2215007
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2214745 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgactgag 2214844  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2214845 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 2214944  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2214945 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 2215007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 46916972 - 46917234
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46916972 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 46917071  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46917072 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgtaagcagatctagtgaagcacatatgga 46917171  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46917172 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 46917234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 16174476 - 16174738
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16174476 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 16174575  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16174576 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 16174675  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16174676 caaagtttggaatgtttcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 16174738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 3532765 - 3533027
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3532765 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacagcgcaaccatactcgaccgag 3532864  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3532865 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 3532964  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3532965 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgtactaagtaaattacttgtgtg 3533027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 3617910 - 3618172
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  3617910 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacagcacaaccatactcgaccgag 3618009  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3618010 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 3618109  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3618110 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgaactaagtaaattacttgtgtg 3618172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8992399 - 8992137
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  8992399 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacagcacaaccatactcgaccgag 8992300  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8992299 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 8992200  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8992199 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgaactaagtaaattacttgtgtg 8992137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 13111177 - 13110915
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  13111177 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacagcacaaccatactcgaccgag 13111078  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13111077 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 13110978  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13110977 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgaactaagtaaattacttgtgtg 13110915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 28899945 - 28899683
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28899945 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 28899846  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28899845 gtgttacccacttttgaaaatcatgtacatgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatacgga 28899746  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28899745 caaagtttggaatgtttcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 28899683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 53183566 - 53183828
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  53183566 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggactgattttgagcaacctgggggaagtggatcaagtacatcgcaaccatactcggccgag 53183665  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53183666 gtgttaccagcttttgcaaatcatgtgcgtggtagatccgagttgcgtgatccagatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaaacacatatgga 53183765  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53183766 caaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 53183828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 124 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 19409681 - 19409425
Alignment:
Q  124 tgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgaggtgtta 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19409681 tgaggatgaacgaggtacatatgctcaacgttagaccgattttgagcaacctgggggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgaggcgtta 19409582  T
Q  224 cccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagt 323  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19409581 ccagcttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcatgatccatatgttcatcatgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagt 19409482  T
Q  324 ttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19409481 ttggaatgtatcgtgattgaagatgatttctatcgtactaaataaattacttgtgtg 19409425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12158736 - 12158476
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  12158736 gattgttgaggataaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctg-gggaagtggatctagtacatcgcaaccatactcgaccaag 12158638  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12158637 gtgctaccagcatttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccagatgttcatcatgaattgcaagcagatctagtgaaacacatatgga 12158538  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12158537 caaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgta-cgtactaaataaattacttgtgtg 12158476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 189 - 380
Target Start/End: Original strand, 53347593 - 53347784
Alignment:
Q  189 ctagtacacagcaaccatactcgaccgaggtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaatt 288  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53347593 ctagtacaccgcaaccatactcgaccgaggtgttaccagcttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaatt 53347692  T
Q  289 gcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  53347693 gcaagcagatctagtgaagcccatatggacaaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatggtactaaataaattatttgtgtg 53347784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 2212595 - 2212716
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2212595 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 2212694  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2212695 aaaataataaataaatggattg 2212716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 53181743 - 53181864
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53181743 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 53181842  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  53181843 aaaataataaataaatggattg 53181864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 46914789 - 46914910
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46914789 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaactgttttaattatatgagc 46914888  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  46914889 aaaataataaataaatggattg 46914910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 276 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 7401449 - 7401345
Alignment:
Q  276 ttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattactt 375  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7401449 ttcaacacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtattaaataaattactt 7401350  T
Q  376 gtgtg 380  Q
    |||||    
T  7401349 gtgtg 7401345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 36658257 - 36658136
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36658257 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtgttgctcatttgattctccccgggatctagttgcatgcagaaaccgttttaattatatgagc 36658158  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  36658157 aaagtaataaataaatggattg 36658136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 255 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 36657022 - 36656897
Alignment:
Q  255 ccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgt 354  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  36657022 ccgagttgcgtgatccagatgttcatcacaaattgcaaacagatctagtgaaacacatatggataaagtttggaatgtaccgtgattgaagatgatttgt 36656923  T
Q  355 atcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  36656922 atcgtattaaataaattacttgtgtg 36656897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 3530577 - 3530692
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3530577 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 3530676  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  3530677 attaataaataaatgg 3530692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 3615566 - 3615681
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3615566 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 3615665  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  3615666 attaataaataaatgg 3615681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8994507 - 8994392
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8994507 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 8994408  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  8994407 attaataaataaatgg 8994392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 13113285 - 13113170
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13113285 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 13113186  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  13113185 attaataaataaatgg 13113170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28900742 - 28900629
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28900742 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccgtgtgatgtagttgcatgccgaaaccattttaattatatgagcaa 28900643  T
Q  103 aataataaataaat 116  Q
    | ||||||||||||    
T  28900642 attaataaataaat 28900629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 16172169 - 16172284
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  16172169 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccggtataataatatgagcaa 16172268  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  16172269 attaataaataaatgg 16172284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36657117 - 36657018
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36657117 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgaatttgagcaacctgggggaaatggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 36657018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 34434851 - 34434970
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34434851 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgcaaattcgatcctccgcgtgatgtaattgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 34434950  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  34434951 agtaataaataaatggattg 34434970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28446998 - 28446879
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || | | || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28446998 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagcattgctcattcgatcctccacgtggtgtaattgcatgcagaaaccgttttaattatatgagcaa 28446899  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    |||| |  ||||||||||||    
T  28446898 aatactgtataaatggattg 28446879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33606805 - 33606687
Alignment:
Q  4 atattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33606805 atattggggtaaaattgttgagtattgtaatgaacattactcattcgatcctccgcgtgatgtaattgcttgccgaaatcattttaattatatgagcaaa 33606706  T
Q  104 ataataaataaatggattg 122  Q
     ||||||||||||||||||    
T  33606705 gtaataaataaatggattg 33606687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32463114 - 32462920
Alignment:
Q  130 tgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgaggtgttacccact 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| || ||||||  |||||| ||||||||||   | ||||  || ||  ||||| |||| ||     
T  32463114 tgaacaagatacatatgctcaacattggacaaattatgatcagtctgagacaagtgggtctagtacacttgagccattttcaactaaggtgctacctaca 32463015  T
Q  230 tttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtt 324  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| | | || ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  32463014 tttgtgaatcatgtgcgtgctagatctgtgatgtgtgattcaaatgtacatcacgaatggcaagcagatctagtcaaacacatatgggcaaagtt 32462920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 318 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 4981934 - 4981872
Alignment:
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4981934 caaagtttggaatctatagtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 4981872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 36
Target Start/End: Original strand, 36564743 - 36564776
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatga 36  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36564743 catattggggtaaaattgttgattattgtaatga 36564776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 31013316 - 31013578
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31013316 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 31013415  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31013416 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 31013515  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31013516 caaaatttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtattgtactaaataaattatttgtgtg 31013578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 30647574 - 30647836
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  30647574 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggattgattttgagcaatctgagggaagtggatccagtacaccgcaaccatactcgaccgag 30647673  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30647674 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 30647773  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30647774 caaagtttggaatgtttcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 30647836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 27943106 - 27942844
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27943106 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacagcacaaccatactcgaccgag 27943007  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27943006 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 27942907  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27942906 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgaactaagtaaattacttgtgtg 27942844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 32976026 - 32976288
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  32976026 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatccgagggaagtggatctagtacagcacaaccatactcgaccgag 32976125  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32976126 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 32976225  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  32976226 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgaactaagtaaattacttgtgtg 32976288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 40889510 - 40889248
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  40889510 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatccgagggaagtggatctagtacagcacaaccatactcgaccgag 40889411  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40889410 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 40889311  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  40889310 caaagtttggaatgtttcacaattgaagatgatttgtatcgaactaagtaaattacttgtgtg 40889248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 27406503 - 27406764
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27406503 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgaggaaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 27406602  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27406603 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaatcgcaagcagatctagtgaaacacatatgga 27406702  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
     ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27406703 taaagtttggaatg-ttctcgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 27406764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25032956 - 25032694
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25032956 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctgggggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 25032857  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25032856 gtgttaccagcatttgcaaatcaagtgtgtgctagatccgagttgcgtgatccagatgttcatcacgaattgcaagcaaatctagtgaaacacatatgga 25032757  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25032756 caaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 25032694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 4577606 - 4577344
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  4577606 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggactgattttgagcaacctgggggaagtggatcaagtacatcgcaaccatactcgaccgag 4577507  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4577506 gtgttaccagcttttgcaaatcatgtgcgtggtagatccgagttgcgtgatccagatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaaacacatatgga 4577407  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4577406 caaagtttggaatgtatcgtaattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 4577344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 10569230 - 10569492
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  10569230 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctgggggaagtggatctagtacactgcaaccatacttgaccgat 10569329  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10569330 gtgttaccaggttttgcaaatcatgtgtgtgctaaatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgtattacaagcagatctagtgaagcacatatgga 10569429  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10569430 caaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 10569492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 31012341 - 31012462
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31012341 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 31012440  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31012441 aaaataataaataaatggattg 31012462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 32973672 - 32973787
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32973672 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccgcgcgatatagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 32973771  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  32973772 attaataaataaatgg 32973787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27945375 - 27945260
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27945375 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 27945276  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  27945275 attaataaataaatgg 27945260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 40891545 - 40891430
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40891545 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 40891446  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  40891445 attaataaataaatgg 40891430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 286 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 34710306 - 34710212
Alignment:
Q  286 attgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34710306 attgtaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcgtgattgaagatgatttgtatcgtattaaataaattacttgtgtg 34710212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4579797 - 4579709
Alignment:
Q  34 tgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4579797 tgagtattgttcattcgattctccccgcgatctagttgtctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaaataataaataaatggattg 4579709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 30646179 - 30646294
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30646179 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccgctcgatgtagttgcatgccgaaactgttttaattatatgagcaa 30646278  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    |  |||||||||||||    
T  30646279 atgaataaataaatgg 30646294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 29616839 - 29616954
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29616839 catatttgggtaaaattcctgagtattgtaacgagcattgatcattcgattctccgtgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 29616938  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  29616939 attaataaataaatgg 29616954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 380
Target Start/End: Original strand, 23648845 - 23648902
Alignment:
Q  323 tttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23648845 tttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgtactaagtaaattacttgtgtg 23648902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 23809727 - 23809670
Alignment:
Q  323 tttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23809727 tttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgtactaagtaaattacttgtgtg 23809670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 379
Target Start/End: Original strand, 29618671 - 29618713
Alignment:
Q  337 tgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29618671 tgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgt 29618713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 21365299 - 21365263
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgag 37  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21365299 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgag 21365263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2299958 - 2299846
Alignment:
Q  229 ttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttgga 328  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||| | | || ||| | || |||| ||||  |||||||||||| ||||||| || ||||||||  ||| |||  ||    
T  2299958 ttttgcgaataatgtgcatgctagatctgtgatgtgtggttcagatgtacatcgtgaattgcaagcatatctagtcaaacacatatgagcaaggttcaga 2299859  T
Q  329 atgtttcatgatt 341  Q
    |||||||||||||    
T  2299858 atgtttcatgatt 2299846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 22191820 - 22191558
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22191820 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctgagggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 22191721  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22191720 gtgttaccaacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccagatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaaacacatatgga 22191621  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22191620 caaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 22191558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 32129703 - 32129965
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  32129703 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgatggaagtgaatccagtacaccgcaaccatactccaccgag 32129802  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32129803 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 32129902  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32129903 caaagtttggaatgtatagtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 32129965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 40301948 - 40302210
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  40301948 gattgtcgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacgccgcaaccatactcgaccgag 40302047  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40302048 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccacatgttcatcacaaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 40302147  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40302148 caaagtttgaaatgtttcgtgattgaagatgatctgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 40302210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 26812748 - 26812486
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26812748 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtgaatccagtacaccgcaaccatactccaccgag 26812649  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812648 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 26812549  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26812548 caaagtttggaaagtatagtgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattagttgtgtg 26812486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 36519131 - 36518869
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  36519131 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacattggaccgattttgagcaatccgagggaagtggatctagtacatcacaaccatactcgaccgag 36519032  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36519031 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 36518932  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36518931 taaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgaactaagtaaattacttgtgtg 36518869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 22657287 - 22657025
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22657287 gattgttgaggatgaattagatacatatgctcaatgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 22657188  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22657187 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgccagatccgagttacgtgatccaaatgttcatcgcgaattgcaagcaaatctagtgaagcacatatgga 22657088  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22657087 caaagtttgaaatgtttcgtgattgaatatgatttctatcgtactaaataaattacttgtgtg 22657025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 188 - 380
Target Start/End: Original strand, 35028641 - 35028833
Alignment:
Q  188 tctagtacacagcaaccatactcgaccgaggtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaat 287  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35028641 tctaatacacagcaaccatactcgaccgaggtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaat 35028740  T
Q  288 tgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35028741 tgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 35028833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22194037 - 22193916
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22194037 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 22193938  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22193937 aaaataataaataaatggattg 22193916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 239 - 380
Target Start/End: Original strand, 25218398 - 25218539
Alignment:
Q  239 catgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatg 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  25218398 catgtgcgtgctagatccgggttgcgtgatctagatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaaacacatatcgacaaagtttggaatgtatcgtg 25218497  T
Q  339 attgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218498 attgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 25218539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22659666 - 22659553
Alignment:
Q  5 tattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22659666 tattggggtaaaattgttgagtattttaatgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaaat 22659567  T
Q  105 taataaataaatgg 118  Q
    ||||||||||||||    
T  22659566 taataaataaatgg 22659553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 36521250 - 36521135
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36521250 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 36521151  T
Q  103 aataataaataaatgg 118  Q
    | ||||||||||||||    
T  36521150 attaataaataaatgg 36521135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 32127561 - 32127680
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32127561 catattggggtaaaattgctgagtattgcaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatataattgcttgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 32127660  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  32127661 agtaataaataaatggattg 32127680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 270 - 380
Target Start/End: Original strand, 1940279 - 1940389
Alignment:
Q  270 caaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaa 369  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  1940279 caaatgttgatcatgaattgcaagcagatctagtgaaagacatatgggcaaagtttggaatgtttcgtgattgaagatgatttgtatcatactaattaag 1940378  T
Q  370 ttacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||    
T  1940379 ttacttgtgtg 1940389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 26814886 - 26814767
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||  |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26814886 catattggggtaaaattgctaagtattgcaatgagcattgctcattcgaccctccgcgtgatataattgcttgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 26814787  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  26814786 agtaataaataaatggattg 26814767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Original strand, 40301220 - 40301313
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatat 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40301220 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccgtgcgatgtagttgcatgccgaaaccattttaattatat 40301313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 1940164 - 1940268
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||  |||||  || |||||||||||||||||||||  |    
T  1940164 aacatattgaggtagaattgttgagtgt-gtaatgagcatttatcattcgatcctccgcgcgatgaagttgaatgtcgaaaccgttttaattatatgtac 1940262  T
Q  101 aaaata 106  Q
    ||||||    
T  1940263 aaaata 1940268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 169987 - 170249
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  169987 gattgttgatgatgaacgagatacatatgctcaacattggagcgattttgagaaatatgaggaaagtggatatggtacaccgcaaccatactcgaccgag 170086  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  170087 gtgttaactgcttttgcaaatcatgtgcgtgctatatctgagttgcgtgatccaaatgttcatcatgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggt 170186  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  170187 caaagtttggaatgtttcacgattgaagatgatttgtatcgtactaattaagttacttgtgtg 170249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 122
Target Start/End: Original strand, 166670 - 166758
Alignment:
Q  34 tgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||   |||||||||||    
T  166670 tgagtattgttcatttgatcctccgcgcgatggagttgcatgccgaaaccgttataattatatgaactgaataatgggtaaatggattg 166758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 118 - 352
Target Start/End: Original strand, 30006 - 30239
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  30006 gattattgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgatttagagcaatct-agggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgactgag 30104  T
Q  218 gtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatgga 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30105 gtgttaccagcttttgcaaatcatgtgtgtgctagatccgagttacgtgatccagatgttcatcacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatctgga 30204  T
Q  318 caaagtttggaatgtttcatgattgaagatgattt 352  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30205 caaagtttggaatgtatcgtgattgaagatgattt 30239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 181 - 380
Target Start/End: Original strand, 4860 - 5043
Alignment:
Q  181 aagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgaggtgttacccacttttgcaaatcatgtgcgtgctagatccgagttgcgtgatccaaatgttcat 280  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||                |||||||||||||||||||||||||    
T  4860 aagtggatctagtacaccgcaagcatactcgactgaggtgttatccacttttgcaaatc----------------cgagttgcgtgatccaaatgttcat 4943  T
Q  281 cacgaattgcaagcagatctagtgaagcacatatggacaaagtttggaatgtttcatgattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4944 cacgaattgcaagcagatctagtgaaggacctatggacaaagtttggaatgtttcgtgattgaagatgatttatatcgtactaaataaattacttgtgtg 5043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1240 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold1240
Description:

Target: scaffold1240; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 28 - 149
Alignment:
Q  1 aacatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28 aacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctctccgcgatctagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagc 127  T
Q  101 aaaataataaataaatggattg 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  128 aaagtaataaataaatggattg 149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1240; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 219
Target Start/End: Original strand, 2229 - 2330
Alignment:
Q  118 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaatctgagggaagtggatctagtacacagcaaccatactcgaccgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2229 gattgttgaggatgaacgagatacatatgctcaacgttggaccgattttgagcaacctgggggaagtggatctagtacaccgcaaccatactcgaccgag 2328  T
Q  218 gt 219  Q
    ||    
T  2329 gt 2330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 110521 - 110640
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  110521 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatgtaattgcttgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 110620  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  110621 agtaataaataaatggattg 110640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 105597 - 105478
Alignment:
Q  3 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  105597 catattggggtaaaattgctgagtattgcaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatataattgcttgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 105498  T
Q  103 aataataaataaatggattg 122  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  105497 agtaataaataaatggattg 105478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 380
Target Start/End: Original strand, 56811 - 56853
Alignment:
Q  338 gattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56811 gattgaagatgatttgtatcgtactaaataaattacttgtgtg 56853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University