View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8453_high_1 (Length: 506)

Name: NF8453_high_1
Description: NF8453
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8453_high_1
NF8453_high_1
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (9-485)||(33965-34441)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (9-485)||(32431294-32431770)
chr8 (9-485)||(7341235-7341711)
chr8 (17-485)||(30304039-30304507)
chr8 (9-485)||(32377337-32377813)
chr8 (9-483)||(8422287-8422761)
chr8 (17-483)||(35965176-35965642)
chr8 (17-480)||(43370931-43371394)
chr8 (21-472)||(2145441-2145897)
chr8 (17-472)||(7169064-7169510)
chr8 (86-480)||(22581061-22581455)
chr8 (17-354)||(43688731-43689068)
chr8 (19-360)||(45455542-45455883)
chr8 (17-189)||(1115936-1116108)
chr8 (17-170)||(39751772-39751925)
chr8 (347-480)||(43686584-43686717)
chr8 (188-403)||(45116582-45116797)
chr8 (188-349)||(44321173-44321334)
chr8 (154-402)||(14401285-14401532)
chr8 (183-299)||(17316787-17316903)
chr8 (210-298)||(17340364-17340452)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (9-485)||(43622564-43623040)
chr7 (9-485)||(617178-617654)
chr7 (17-485)||(18106552-18107020)
chr7 (9-485)||(30787695-30788171)
chr7 (17-485)||(42500571-42501039)
chr7 (9-485)||(45764535-45765011)
chr7 (126-485)||(15067162-15067521)
chr7 (17-480)||(47062047-47062511)
chr7 (17-480)||(43827040-43827503)
chr7 (17-273)||(8400750-8401006)
chr7 (245-480)||(12116803-12117038)
chr7 (17-130)||(15060777-15060890)
chr7 (365-480)||(8401016-8401131)
chr7 (188-403)||(40445076-40445291)
chr7 (188-348)||(1297321-1297481)
chr7 (188-403)||(43378819-43379034)
chr7 (188-348)||(47867065-47867225)
chr7 (188-348)||(16794179-16794339)
chr7 (163-347)||(16795663-16795847)
chr7 (188-348)||(40794258-40794418)
chr7 (188-403)||(45172420-45172635)
chr7 (188-403)||(46791660-46791875)
chr7 (175-403)||(8193790-8194019)
chr7 (102-403)||(3762154-3762455)
[»] chr3 (30 HSPs)
chr3 (17-485)||(13746150-13746618)
chr3 (9-485)||(3949899-3950375)
chr3 (17-485)||(6742051-6742519)
chr3 (9-485)||(8159412-8159888)
chr3 (9-485)||(30946071-30946547)
chr3 (17-485)||(16445784-16446252)
chr3 (17-483)||(36815947-36816413)
chr3 (17-483)||(14399719-14400187)
chr3 (19-483)||(46991677-46992141)
chr3 (17-483)||(48249297-48249764)
chr3 (17-480)||(7838760-7839223)
chr3 (19-483)||(77451-77915)
chr3 (17-472)||(6504397-6504852)
chr3 (17-480)||(21954673-21955135)
chr3 (61-480)||(29949193-29949611)
chr3 (61-480)||(29998347-29998765)
chr3 (17-420)||(7841511-7841912)
chr3 (17-237)||(9428510-9428730)
chr3 (61-303)||(29908027-29908268)
chr3 (217-373)||(28610460-28610616)
chr3 (195-347)||(9556331-9556483)
chr3 (188-403)||(4120305-4120520)
chr3 (188-403)||(51548044-51548259)
chr3 (188-348)||(2284623-2284783)
chr3 (188-348)||(33940190-33940350)
chr3 (188-348)||(40467774-40467934)
chr3 (188-348)||(12491422-12491582)
chr3 (17-65)||(29930532-29930580)
chr3 (17-65)||(29979686-29979734)
chr3 (171-273)||(8117907-8118009)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (9-485)||(5348323-5348799)
chr2 (9-485)||(41561168-41561644)
chr2 (9-485)||(211870-212346)
chr2 (9-485)||(10622883-10623359)
chr2 (17-483)||(27274791-27275257)
chr2 (15-484)||(38946925-38947394)
chr2 (17-485)||(39795134-39795602)
chr2 (17-485)||(3801995-3802463)
chr2 (17-481)||(24750822-24751287)
chr2 (17-480)||(1098260-1098723)
chr2 (17-480)||(24604523-24604986)
chr2 (102-485)||(7264229-7264612)
chr2 (17-480)||(43948716-43949179)
chr2 (19-480)||(45476524-45476984)
chr2 (17-483)||(12906923-12907389)
chr2 (17-480)||(34920216-34920679)
chr2 (17-483)||(41007407-41007877)
chr2 (17-472)||(436475-436931)
chr2 (17-480)||(9655320-9655782)
chr2 (17-483)||(11692261-11692712)
chr2 (17-478)||(17996608-17997069)
chr2 (210-480)||(24941084-24941354)
chr2 (17-267)||(28354549-28354799)
chr2 (171-403)||(21535507-21535733)
chr2 (400-480)||(28347831-28347911)
chr2 (163-403)||(28422985-28423225)
chr2 (210-301)||(3353894-3353985)
chr2 (17-55)||(7264196-7264234)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (9-485)||(3946890-3947366)
chr1 (17-485)||(29355117-29355585)
chr1 (9-485)||(44466738-44467214)
chr1 (9-485)||(20350612-20351088)
chr1 (9-485)||(3984269-3984746)
chr1 (9-485)||(38774544-38775020)
chr1 (17-485)||(5079099-5079567)
chr1 (17-485)||(13630580-13631048)
chr1 (17-484)||(41455001-41455468)
chr1 (17-483)||(12649010-12649476)
chr1 (17-480)||(37016078-37016541)
chr1 (17-483)||(50116194-50116660)
chr1 (17-480)||(38691373-38691836)
chr1 (17-480)||(46974328-46974791)
chr1 (17-480)||(51663422-51663885)
chr1 (17-480)||(13174945-13175408)
chr1 (100-480)||(19497898-19498277)
chr1 (17-301)||(21942977-21943261)
chr1 (24-403)||(32106165-32106533)
chr1 (17-112)||(44619905-44620000)
chr1 (24-178)||(26466006-26466160)
chr1 (188-348)||(36360086-36360246)
chr1 (188-348)||(45472687-45472847)
chr1 (188-348)||(7403953-7404115)
chr1 (188-403)||(28863225-28863440)
chr1 (213-403)||(27283400-27283590)
chr1 (188-348)||(18887360-18887520)
chr1 (17-58)||(7980068-7980109)
chr1 (212-300)||(20240034-20240122)
chr1 (109-218)||(25231558-25231667)
chr1 (190-303)||(31445866-31445979)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (17-485)||(2045-2513)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (17-485)||(19072086-19072554)
chr4 (17-485)||(3404954-3405422)
chr4 (17-484)||(9891186-9891653)
chr4 (17-484)||(41024363-41024832)
chr4 (17-480)||(4769298-4769761)
chr4 (9-365)||(49565013-49565369)
chr4 (17-470)||(38463281-38463734)
chr4 (17-480)||(4976919-4977382)
chr4 (17-480)||(4978392-4978851)
chr4 (17-483)||(11502670-11503136)
chr4 (17-459)||(44049774-44050216)
chr4 (17-480)||(21471958-21472421)
chr4 (17-201)||(51643211-51643395)
chr4 (50-448)||(6182875-6183273)
chr4 (17-128)||(18580117-18580225)
chr4 (188-347)||(32716628-32716787)
chr4 (212-403)||(4617916-4618107)
chr4 (188-348)||(1591168-1591328)
chr4 (171-459)||(13897238-13897526)
chr4 (188-348)||(17916521-17916681)
chr4 (188-348)||(46517000-46517160)
chr4 (223-403)||(17496893-17497073)
chr4 (209-303)||(34979909-34980003)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (9-485)||(1611180-1611656)
chr6 (92-485)||(28357557-28357950)
chr6 (17-480)||(31147486-31147949)
chr6 (17-456)||(29287411-29287845)
chr6 (17-480)||(18607160-18607623)
chr6 (17-480)||(21357784-21358244)
chr6 (17-480)||(23961766-23962226)
chr6 (17-91)||(28251060-28251134)
chr6 (188-348)||(9095463-9095623)
chr6 (17-93)||(24220332-24220408)
chr6 (150-241)||(31176265-31176356)
chr6 (188-241)||(31196905-31196958)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (17-485)||(37819306-37819774)
chr5 (17-485)||(11031881-11032349)
chr5 (17-485)||(38858619-38859087)
chr5 (17-483)||(34078944-34079410)
chr5 (17-483)||(27866276-27866742)
chr5 (17-483)||(1036515-1036981)
chr5 (17-421)||(28884901-28885305)
chr5 (17-485)||(13566536-13566988)
chr5 (17-483)||(25895528-25895998)
chr5 (17-480)||(18536770-18537233)
chr5 (17-480)||(7799440-7799903)
chr5 (17-465)||(4202388-4202836)
chr5 (17-375)||(7020419-7020777)
chr5 (24-462)||(20287439-20287878)
chr5 (24-255)||(20286180-20286410)
chr5 (188-403)||(11819551-11819766)
chr5 (188-348)||(27013235-27013395)
chr5 (188-403)||(42343826-42344040)
chr5 (188-348)||(6553124-6553284)
chr5 (188-403)||(43295549-43295764)
chr5 (447-485)||(28884867-28884905)
chr5 (163-268)||(25053043-25053148)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (17-485)||(15786-16254)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (17-480)||(17233-17696)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (257-483)||(25377-25603)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (17-170)||(12426-12580)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (264-360)||(4-100)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (188-348)||(28452-28612)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (196-403)||(4179-4386)


Alignment Details
Target: scaffold0101 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Original strand, 33965 - 34441
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33965 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 34064  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34065 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 34164  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34165 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 34264  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34265 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 34364  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34365 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 34441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 32431770 - 32431294
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431770 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 32431671  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431670 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 32431571  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32431570 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 32431471  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32431470 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 32431371  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431370 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 32431294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Original strand, 7341235 - 7341711
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341235 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 7341334  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341335 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 7341434  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7341435 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 7341534  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7341535 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgcttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 7341634  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341635 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 7341711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 30304507 - 30304039
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304507 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 30304408  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30304407 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 30304308  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30304307 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 30304208  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304207 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 30304108  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304107 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 30304039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 32377813 - 32377337
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377813 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 32377714  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377713 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 32377614  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32377613 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 32377514  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32377513 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaattttgcgtaaacttctttcgtc 32377414  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377413 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 32377337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 8422761 - 8422287
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422761 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 8422662  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422661 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 8422562  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8422561 attatattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 8422462  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8422461 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 8422362  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422361 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 8422287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 35965642 - 35965176
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35965642 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 35965543  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35965542 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacagttgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 35965443  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||    
T  35965442 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatatttgaggtagttggggtcccttcgaccgat 35965343  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35965342 ttgacatattcgattgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaatatga 35965243  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35965242 atatgcctaaggtgattgttactgacaaggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttttcc 35965176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 43370931 - 43371394
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43370931 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagctgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 43371030  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43371031 cgaagttggaggagcacagctatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 43371130  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  43371131 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgtcaacgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 43371230  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  43371231 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagataa 43371330  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43371331 atatgtctaaggtgattgtgaccgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 43371394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 2145897 - 2145441
Alignment:
Q  21 cacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaata-----ggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     | ||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  2145897 cacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatataatagaggtgacaagaagttgttgcaatatctaatc 2145798  T
Q  116 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2145797 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagt 2145698  T
Q  216 tgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccga 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  2145697 tgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccga 2145598  T
Q  316 tttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatg 415  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2145597 tttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttaaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatg 2145498  T
Q  416 aatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgca 472  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145497 aatatgcctaaggtgattgtgaccgacatggatatgtctttgatgaaagcggttgca 2145441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 17 - 472
Target Start/End: Original strand, 7169064 - 7169510
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||| | ||||||    
T  7169064 agaccacattccatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtg---------cgttgcaatatataatct 7169154  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7169155 caaagttggatgagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 7169254  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||    
T  7169255 gtttaacaattttccaacgattttggttatgaactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttagggtcactttgaccgat 7169354  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7169355 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagttttaaaaatgttgcctaaacttcttacgtcaaagatga 7169454  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgca 472  Q
    ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7169455 atatgcctaaggtgattgtgactgacaaggatatgtctttgatgaaagcggttgca 7169510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 86 - 480
Target Start/End: Original strand, 22581061 - 22581455
Alignment:
Q  86 ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagata 185  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||| |||    
T  22581061 ggtgacaagaatccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaaaata 22581160  T
Q  186 ttttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaat 285  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | |||| ||||    
T  22581161 tcttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttctaacggttttggttatggactccacctgcaaaaccaacatgtacaagatgtcaat 22581260  T
Q  286 gtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaa 385  Q
    |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22581261 gtttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgacatatttggttgggtttggatttgcgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaa 22581360  T
Q  386 atgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22581361 atgttgcgtaaacttcctacgtcaaagatgaatatgccaaaggtgattgtgactgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 22581455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43689068 - 43688731
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  43689068 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgataagaagccgttgcaatttctaattt 43688969  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43688968 cgaagttgggggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactataatcgaagatatcttttgggctcatccaaaatccgttaagtt 43688869  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  43688868 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaccgat 43688769  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatga 354  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43688768 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatga 43688731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 360
Target Start/End: Original strand, 45455542 - 45455883
Alignment:
Q  19 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  45455542 accatattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatcaacgtcaacaaatatgaaaggcaaatagaggtgacaaaaagccgttgcaatatctaatctcg 45455641  T
Q  119 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgt 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  || ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45455642 aagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtaccacaatcaaatatattttttgggctcatccaacatccgttaagttgt 45455741  T
Q  219 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgattt 318  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||    
T  45455742 ttaaaatttttccaacggttttggttatggactccaccaacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttgggatcacttcgatcgattt 45455841  T
Q  319 gacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 360  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  45455842 gacatatttggttgggtttgaatttgtgacacatgagaaaga 45455883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 1115936 - 1116108
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115936 agaccacattgcatgacaaatgtgaaacaaatgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 1116035  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1116036 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatgtttt 1116108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39751925 - 39751772
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39751925 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaaaccattgcaatatctaatct 39751826  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagta 170  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39751825 cgaagttggaggagcacaacttcacttattactcaagaacacaaagtgaaagta 39751772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 347 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 43686717 - 43686584
Alignment:
Q  347 acacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgataggg 446  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  43686717 acacatgagaaagaggaaaattttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgccaaagatgaatatgactaaggtgattgtgaccgacaggg 43686618  T
Q  447 atatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43686617 atatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 43686584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 403
Target Start/End: Original strand, 45116582 - 45116797
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  45116582 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 45116681  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaat 387  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    ||||| ||||| ||||||   |||| |||  ||||    
T  45116682 ttgaaatagttggagttacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgacgtcggagaaggaagataactttacctgggctttgcaaat 45116781  T
Q  388 gttgcgtaaacttctt 403  Q
    ||||| ||||||||||    
T  45116782 gttgcttaaacttctt 45116797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Original strand, 44321173 - 44321334
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||  | |||    
T  44321173 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgttattgt 44321272  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgaca 349  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  44321273 ttgaaatagttggagttacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgaca 44321334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 14401532 - 14401285
Alignment:
Q  154 aacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactcc 253  Q
    |||||||  |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||   |||  ||||||||||||| |||||| | |  |||||| | || |||| |    
T  14401532 aacacaatgtgaaagta-tactattcatgatatattttgggctcatcctgaatctgttaagttgtttaataatttttcgatagttttgttcatcgacttc 14401434  T
Q  254 acgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatg 353  Q
    || || || ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||| |  ||||| ||| |||||||| || |||  |||| |||| ||||   ||    
T  14401433 acctataaaaccaacacgtataggatgtcattgtttgagatagttggggtcacctcaactgatatgacatattcgattgcttttgcatttctgacggttg 14401334  T
Q  354 agaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttct 402  Q
    ||||||  || ||||||  |||| ||||| | ||||||| | |||||||    
T  14401333 agaaaggggacaactttacttggattttacagatgttgctttaacttct 14401285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 299
Target Start/End: Original strand, 17316787 - 17316903
Alignment:
Q  183 atattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgcc 282  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| | | ||| ||||| |||||| |||| | ||||||    
T  17316787 atattttttgagctcacccacaatcatttaagttgtttaacaattttccgactgttttgatcatgaatttcacatacaaaaccaacttgtacatgatgcc 17316886  T
Q  283 aatgtttgaggtagttg 299  Q
    | |||||||| ||||||    
T  17316887 attgtttgagatagttg 17316903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 210 - 298
Target Start/End: Original strand, 17340364 - 17340452
Alignment:
Q  210 ttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagtt 298  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||| | ||||| | ||| ||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  17340364 ttaagttgtttaacaatttcccgattgttttgatcatggatttcacatacaaaaccaacttgtacatgatgccattgtttgagatagtt 17340452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 43623040 - 43622564
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623040 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 43622941  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622940 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 43622841  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43622840 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 43622741  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43622740 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 43622641  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622640 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 43622564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 617654 - 617178
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  617654 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgcaatt 617555  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617554 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 617455  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  617454 attaagttgtttaacaattttccaacgattttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 617355  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  617354 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 617255  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617254 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 617178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Original strand, 18106552 - 18107020
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106552 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 18106651  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106652 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 18106751  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18106752 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgctaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 18106851  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106852 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 18106951  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18106952 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttggtgaaagcggttgcacatgtttttccgg 18107020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Original strand, 30787695 - 30788171
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787695 agaaccagataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaagcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 30787794  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787795 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 30787894  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30787895 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 30787994  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30787995 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 30788094  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788095 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 30788171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Original strand, 42500571 - 42501039
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42500571 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 42500670  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500671 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 42500770  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42500771 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 42500870  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42500871 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatattgtgtaaacttctttcgtcaaagatga 42500970  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500971 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 42501039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Original strand, 45764535 - 45765011
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764535 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgcgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 45764634  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764635 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 45764734  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45764735 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccagcatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 45764834  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45764835 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 45764934  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45764935 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatatttttccgg 45765011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 126 - 485
Target Start/End: Original strand, 15067162 - 15067521
Alignment:
Q  126 aggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067162 aggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaa 15067261  T
Q  226 ttttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15067262 ttttccaacggttttggttatggactccacatacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatat 15067361  T
Q  326 acggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgccta 425  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067362 ttggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgccta 15067461  T
Q  426 aggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067462 aggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 15067521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 47062047 - 47062511
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggt-gacaagaagccgttgcaatttctaatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  47062047 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacgatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggttgacaagaagccgttgcaatatctaatc 47062146  T
Q  116 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagt 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  47062147 tcgaagttggaagagcacaactatacttattactcaa-aacacaaagtgaaagtactacaattgaagatatctttcgggctcatccaacatccgttaagt 47062245  T
Q  216 tgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccga 315  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  47062246 tgtttaaaaaatttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaaaatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccga 47062345  T
Q  316 tttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttggg-ttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagat 414  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47062346 tttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttttaaaattgttgcgtaaacttcttacgtcaaagat 47062445  T
Q  415 gaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47062446 gaatatgcctacggtgattgtgaccgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 47062511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 43827503 - 43827040
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  43827503 agaccacattgcatgacaaatatcaagcaagtgtacaatgaacgtcagcaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatcta-tct 43827405  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43827404 cgaagttgaatgagcacaactatacttatttcacaagaacacaaagtgaaagtactacaattgaaaatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 43827305  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtga-attcaaccga 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||| |  ||| |||||    
T  43827304 gtttaacaattttccaatggttttggttatggactccacctacaaaaccaacgtgtacaagatgccaatgtttgaggtagtttgggtcactttcgaccga 43827205  T
Q  316 tttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatg 415  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  43827204 tttgacatattcggttgggtttggatttgtgacatatgagaaagataaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgttaaagatg 43827105  T
Q  416 aatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||| |||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43827104 aatatgcttaaggtgattgtcactagcagggatatgtctttgatgaaagcggttggaaatgtttt 43827040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 8400750 - 8401006
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8400750 agaccacattggatgacaaatatcaagcaagtgtacattgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagacggcgttgcaatatctaatct 8400849  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  8400850 cgaagttggaggagcacaactatacttatttctcaagaacacaaagtgaaagtactacaattaaagatattttttgggctcatccaacatctgttaagtt 8400949  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  8400950 gtttaacaattttctaacggttttggttatggatttcacctacaaaaccaacatgta 8401006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 245 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 12117038 - 12116803
Alignment:
Q  245 atggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggattta 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  12117038 atggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcggccgatttgacatattcggttgggtttggatttg 12116939  T
Q  345 tgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatag 444  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |     
T  12116938 tgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagataaatatgcctaaggtgattgtgactgacat 12116839  T
Q  445 ggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12116838 ggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 12116803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 130
Target Start/End: Original strand, 15060777 - 15060890
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15060777 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 15060876  T
Q  117 cgaagttggaggag 130  Q
    ||||||||||||||    
T  15060877 cgaagttggaggag 15060890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 365 - 480
Target Start/End: Original strand, 8401016 - 8401131
Alignment:
Q  365 aactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaag 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||||    
T  8401016 aactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaagatgcctaaggtgattgtgactgacaatgatatgtctttgatgaaag 8401115  T
Q  465 cggttgcacatgtttt 480  Q
    |||||| | |||||||    
T  8401116 cggttgaaaatgtttt 8401131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40445291 - 40445076
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||  || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  40445291 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttctgactgttttgataatggattccatgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 40445192  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaat 387  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||   ||||| || || ||||||  ||||| |||  ||||    
T  40445191 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgacatcggagaaggaggataactttacttgggctttgcaaat 40445092  T
Q  388 gttgcgtaaacttctt 403  Q
    ||||| ||||||||||    
T  40445091 gttgcttaaacttctt 40445076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 1297321 - 1297481
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | |    
T  1297321 ttttggactcatccaacatcgataaagttgtttaacatttttccaactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccatttt 1297420  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| |  |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||    
T  1297421 ttgaaatagttggagccacctcaacctatttgacatattcggttggtttttcatttatgac 1297481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 43379034 - 43378819
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| | | |||    
T  43379034 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacatacaaaaccaacttgtataggattctattgt 43378935  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaat 387  Q
    ||||  ||||||| || |  || ||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||   |||||| || || ||||||  ||||| |||  ||||    
T  43378934 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatattcggttgattttgcatttatgacgtctgagaaggaggataactttacttgggctttgtaaat 43378835  T
Q  388 gttgcgtaaacttctt 403  Q
    ||||| ||||||||||    
T  43378834 gttgcttaaacttctt 43378819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 47867225 - 47867065
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||  || | |||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||    
T  47867225 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttctgactgctttgataatggactccacgtacaaaatcaacttgtatagaatgccattgt 47867126  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  47867125 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 47867065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16794339 - 16794179
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| || ||| |||| | ||||||| |||    
T  16794339 ttttggactcatcaaacatcagtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaacaaacttgtacatgatgccattgt 16794240  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||    
T  16794239 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggtttttcatttatgac 16794179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16795847 - 16795663
Alignment:
Q  163 tgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaag 262  Q
    ||||||||| ||| || ||||  | |||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||     
T  16795847 tgaaagtaaaactgttcaagacttattttggactcatccaacatcggtaaaattgtttaacaattttccaactgttttgataatggattccatgtacaaa 16795748  T
Q  263 accaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatga 347  Q
    || ||| |||| | ||||||| |||||||  ||||||   | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  16795747 acaaacttgtacatgatgccattgtttgaaatagttgaactcacttcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatga 16795663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 40794258 - 40794418
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||  |||||   ||||| ||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||    
T  40794258 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactattttgagaatggattccacgtacaaaatcaacttgtatagaatgccattgt 40794357  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    || |  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  40794358 tttaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 40794418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 45172635 - 45172420
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | || || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | |    
T  45172635 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataattgattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattat 45172536  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaat 387  Q
    ||||  ||||| | || | ||| ||| ||||||||||| | ||||  |||| |||||||||    ||||| || || ||||||  ||||| |||  ||||    
T  45172535 ttgaaatagtttgagtcacttcgacctatttgacatattcagttgattttgcatttatgacgtcggagaaggaggataactttacttgggctttgcaaat 45172436  T
Q  388 gttgcgtaaacttctt 403  Q
    ||||| ||||||||||    
T  45172435 gttgcttaaacttctt 45172420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 403
Target Start/End: Original strand, 46791660 - 46791875
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||| |||    
T  46791660 ttttggactcatccaacatcagtaaagttatttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaactaacttgtatagaatgccattgt 46791759  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaat 387  Q
    ||||  ||||||| || |  || ||| ||||||||||| ||||||  |||  |||||||||    ||||| || || ||||||  ||||| |||  ||||    
T  46791760 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatattcggttgatttttcatttatgacggcggagaaggaggataactttacttgggctttgcaaat 46791859  T
Q  388 gttgcgtaaacttctt 403  Q
    ||||| ||||||||||    
T  46791860 gttgcttaaacttctt 46791875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8194019 - 8193790
Alignment:
Q  175 tattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtat 274  Q
    |||| |||| || |||||| ||||||||||||   | ||||||||||| |||||||| || |||||| | ||| | ||||||||||| |||||| ||||     
T  8194019 tattcaagacatattttggactcatccaacattggtaaagttgtttaataattttccgactgttttgataatgcattccacgtacaaaaccaacttgtac 8193920  T
Q  275 aggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttgg-atttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtt 373  Q
    | ||||||| |||||||  ||||| | || |  |||||  || |||||||| ||||| |||| || |||||||||    ||||| || || ||||||  |    
T  8193919 atgatgccattgtttgaaatagttagagtcacctcaactaatatgacatattcggtttggttaggcatttatgacgtcggagaaggatgataactttact 8193820  T
Q  374 tgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctt 403  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  8193819 tgggctttacaaatgttgcttaaacttctt 8193790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 403
Target Start/End: Original strand, 3762154 - 3762455
Alignment:
Q  102 tgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatcc 201  Q
    |||| |||||| | || |||||||| ||| |||| |||  ||||| | |||||||||||  ||| |||  ||||||| | || || |||||||||||| |    
T  3762154 tgcagtttctagtgtcaaagttggaagagtacaaatatgtttatttcacaagaacacaatgtgagagttctactattcaggacatattttgggctcattc 3762253  T
Q  202 aacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggg 301  Q
       |||  |||||||||||||| |||| |  |  |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| | ||||| | |||||||| || |||||    
T  3762254 cgaatcggttaagttgtttaacgatttcctgaaagttttgatcatggactccacctataaaaccaacttgtacatgatgcaattgtttgagataattggg 3762353  T
Q  302 gtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttc 401  Q
     | |  ||||||||| ||| |||| ||||||  |||| |||| ||| |  |||||| || || ||||||  ||||||||||   ||||||| | ||||||    
T  3762354 ttcacctcaaccgatatgaaatattcggttgcttttgcatttctgatagttgagaaggaggataactttacttgggttttacggatgttgcttcaacttc 3762453  T
Q  402 tt 403  Q
    ||    
T  3762454 tt 3762455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 13746618 - 13746150
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746618 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 13746519  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746518 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 13746419  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13746418 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 13746319  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746318 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 13746219  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746218 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 13746150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Original strand, 3949899 - 3950375
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949899 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 3949998  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949999 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 3950098  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3950099 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 3950198  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3950199 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgcttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 3950298  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950299 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 3950375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Original strand, 6742051 - 6742519
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742051 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 6742150  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6742151 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 6742250  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6742251 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 6742350  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742351 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 6742450  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742451 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 6742519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8159888 - 8159412
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159888 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 8159789  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159788 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 8159689  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8159688 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 8159589  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8159588 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacacgagaaagaagaaaactttgtttggattttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 8159489  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159488 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 8159412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 30946547 - 30946071
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946547 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaagtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 30946448  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946447 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 30946348  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30946347 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 30946248  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30946247 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgcgaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 30946148  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30946147 aaagatgaatatgcctaaggtgattattaccgatagggatatgtctttgatgaaagtggttgcacatgtttttccgg 30946071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Original strand, 16445784 - 16446252
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16445784 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 16445883  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445884 cgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgggctcatccaacatccattaagtt 16445983  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16445984 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 16446083  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446084 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaagatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 16446183  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16446184 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgacagcggttgcacatatttttccgg 16446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 36816413 - 36815947
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816413 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 36816314  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816313 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtaatacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 36816214  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  36816213 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 36816114  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816113 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 36816014  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816013 atatgcctaaggtgattgttaccgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 36815947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Original strand, 14399719 - 14400187
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14399719 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 14399818  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399819 cgaatttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 14399918  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagtt-ggggtgaattcaaccga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||    
T  14399919 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgggggtcacttcgaccga 14400018  T
Q  316 tttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga-agaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagat 414  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14400019 tttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagagcaaaaactttgtttgtgttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagat 14400118  T
Q  415 gaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14400119 gaatatgcctaaggggattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttttcc 14400187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 46992141 - 46991677
Alignment:
Q  19 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  46992141 accacattgcatgacaaatatgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttt 46992042  T
Q  119 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgt 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46992041 atgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgt 46991942  T
Q  219 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgattt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  46991941 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgattt 46991842  T
Q  319 gacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaat 418  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991841 gacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaat 46991742  T
Q  419 atgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  46991741 atgcctaaggtgattgttaccgacatggatatgtctttgatgaaaacgattgcaaatgtttttcc 46991677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 48249764 - 48249297
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48249764 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 48249665  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48249664 ctatgttggatgagcacaactatacttatcactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 48249565  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagtt-ggggtgaattcaaccga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||| |    
T  48249564 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgggggtcactttgaccaa 48249465  T
Q  316 tttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatg 415  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48249464 tttgacatattcggttgagtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcatcaaagatg 48249365  T
Q  416 aatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48249364 aatatgcctaaggtgattgttaccgacaaggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttttcc 48249297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 7838760 - 7839223
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7838760 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtggcaagaagccgttgcaatatctaatct 7838859  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  7838860 tgaagttggaggagcacaactatacttattacttaagaacataaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccgacatctgttaagtt 7838959  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  7838960 gtttaacaattttccaacggttttggtcatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgatcgat 7839059  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7839060 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagtggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatga 7839159  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7839160 atatgcctaaggtgattgtgaccgacagggatatgtctgtgatgaaagcggttgcaaatgtttt 7839223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 77915 - 77451
Alignment:
Q  19 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  77915 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatgaaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcg 77816  T
Q  119 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||    
T  77815 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactaccatcgaagatatcttttgggctcatccaacatttgttaagttgt 77716  T
Q  219 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgattt 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  77715 ttaacaatttttcaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgtcaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgattt 77616  T
Q  319 gacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaat 418  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  77615 gacatattcggttgggtttggatttttgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatattgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaat 77516  T
Q  419 atgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  77515 atgcctaaggtgattgttaccgacacggatgagtctttgatgaaagcggttggaattgtttttcc 77451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 6504852 - 6504397
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6504852 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcacatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaacct 6504753  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6504752 cgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 6504653  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  6504652 ttttaacaattttccaaccgttttggttatggactccacctacataaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttgaggtcacttcgaccgat 6504553  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6504552 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgaggaagaggaaaactttgtttgggtcttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgttaaagatga 6504453  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgca 472  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504452 atatgcctaaggtgattgttaacgacacggatatgtctttgatgaaagcggttgca 6504397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 21955135 - 21954673
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21955135 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatat-taatct 21955037  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955036 cgaagttggaggaccacaactatacttatttctcaagaaaacaaagtgaaagtaccacaatcgaagataccttttgggctcatccaacatccattaagtt 21954937  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  21954936 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaacgaacatgtacaggatgccaatatttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 21954837  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21954836 ttgacatattcgattgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatattgcgtaaacttcttacgtcaaatatga 21954737  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    || |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21954736 atttgcctaaggtgactgttatcgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 21954673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 61 - 480
Target Start/End: Original strand, 29949193 - 29949611
Alignment:
Q  61 tcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949193 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29949291  T
Q  161 cttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtaca 260  Q
      |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29949292 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctaca 29949391  T
Q  261 agaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 360  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29949392 aaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgagacacatgagaaaga 29949491  T
Q  361 agaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatg 460  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29949492 ggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccgacagggatatgtctttgatg 29949591  T
Q  461 aaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  29949592 aaagaggttgcaaatgtttt 29949611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 61 - 480
Target Start/End: Original strand, 29998347 - 29998765
Alignment:
Q  61 tcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29998347 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29998445  T
Q  161 cttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtaca 260  Q
      |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29998446 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctaca 29998545  T
Q  261 agaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 360  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29998546 aaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgagacacatgagaaaga 29998645  T
Q  361 agaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatg 460  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29998646 ggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccgacagggatatgtctttgatg 29998745  T
Q  461 aaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  29998746 aaagaggttgcaaatgtttt 29998765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 7841912 - 7841511
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7841912 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 7841813  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7841812 cgaagttggaggagcacaacta-acttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggttcatccaacatccgttaagtt 7841714  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||    
T  7841713 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtagaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttagaccgat 7841614  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7841613 ttgacatattcggttggatttggatttgtgacacatgagaacgaggaaaactttgtttgggtttt-aaaatgttgcgtaaacttctttcttcaaagatga 7841515  T
Q  417 atat 420  Q
    ||||    
T  7841514 atat 7841511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9428730 - 9428510
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428730 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 9428631  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428630 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 9428531  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggt 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9428530 gtttaacaattttccaacggt 9428510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Original strand, 29908027 - 29908268
Alignment:
Q  61 tcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29908027 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29908125  T
Q  161 cttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtaca 260  Q
      |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29908126 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctaca 29908225  T
Q  261 agaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggt 303  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  29908226 aaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggt 29908268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 217 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28610616 - 28610460
Alignment:
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  | | |||  || ||    
T  28610616 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtagaagatgtcaatgtttgaggtagttggaatcacttcggccaat 28610517  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtt 373  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  28610516 ttgacatattcggttggatttggatttgtgacatatgagaaagagaaaatctttgtt 28610460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9556483 - 9556331
Alignment:
Q  195 ctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggt 294  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||  |    
T  9556483 ctcatccaacatccgtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggatttcacgtacaaaaccaacttgtacaggatgtcattgtttgaaat 9556384  T
Q  295 agttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatga 347  Q
    |||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  9556383 agttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatga 9556331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 4120520 - 4120305
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || | |    
T  4120520 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgaccgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgacattct 4120421  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaat 387  Q
    ||||  ||||||| || |  | |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    ||||| || || ||||||  ||||| |||  ||||    
T  4120420 ttgaaatagttggagtcacattaacctatttgacatattcggttggttttgtatttatgacgtcggagaaggaggataactttacttgggctttgcaaat 4120321  T
Q  388 gttgcgtaaacttctt 403  Q
    ||||| ||||||||||    
T  4120320 gttgcttaaacttctt 4120305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 51548259 - 51548044
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| || ||||||||||  | ||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  51548259 ttttggacttatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 51548160  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaat 387  Q
    ||||  ||||||| || |  || ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||   ||||| || || ||||||  || || |||  ||||    
T  51548159 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgacatcggagaaggaggataactttacttaggctttgcaaat 51548060  T
Q  388 gttgcgtaaacttctt 403  Q
    ||||| ||||||||||    
T  51548059 gttgcttaaacttctt 51548044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2284783 - 2284623
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  2284783 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccgactattttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 2284684  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  || ||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  2284683 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatattcggttgattttgcatttatgac 2284623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 33940190 - 33940350
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||| |||||||| |||  | || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  33940190 ttttggactcatccaacatcggtaaagtcgtttaacactttctcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 33940289  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  33940290 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 33940350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40467934 - 40467774
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| || |||    
T  40467934 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataaaatgtcattgt 40467835  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||||||    
T  40467834 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgaaatattcggttggttttgcatttatgac 40467774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 12491422 - 12491582
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||| | |||| ||||||| ||| || |||    
T  12491422 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccaactgttttgataatggattccgcgtacaaaatcaacttgtatagaatgtcattgt 12491521  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  || ||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||||    
T  12491522 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatatttggttggttttgcatttatgac 12491582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Original strand, 29930532 - 29930580
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaac 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29930532 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaaatgtacaatgaacgtcaac 29930580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Original strand, 29979686 - 29979734
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaac 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29979686 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaaatgtacaatgaacgtcaac 29979734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 273
Target Start/End: Original strand, 8117907 - 8118009
Alignment:
Q  171 atactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacat 270  Q
    |||||||| |||| || |||| | ||||||||  |||  ||||||||||||||||||| || || |||||| | ||| | ||||||||||| |||||| |    
T  8117907 atactattcaagacatattttagactcatccacaatcagttaagttgtttaacaatttcccgactgttttgataatgaattccacgtacaaaaccaactt 8118006  T
Q  271 gta 273  Q
    |||    
T  8118007 gta 8118009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Original strand, 5348323 - 5348799
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348323 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 5348422  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348423 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 5348522  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5348523 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 5348622  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5348623 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 5348722  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348723 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 5348799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Original strand, 41561168 - 41561644
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561168 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 41561267  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561268 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 41561367  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41561368 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 41561467  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41561468 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 41561567  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561568 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 41561644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 212346 - 211870
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212346 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 212247  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212246 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 212147  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  212146 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 212047  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  212046 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 211947  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211946 aaagatgaatatgcataaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 211870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 10623359 - 10622883
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623359 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 10623260  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10623259 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatctaacatcc 10623160  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10623159 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 10623060  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10623059 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 10622960  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622959 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 10622883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 27275257 - 27274791
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275257 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 27275158  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275157 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 27275058  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27275057 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 27274958  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274957 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 27274858  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274857 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 27274791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 484
Target Start/End: Original strand, 38946925 - 38947394
Alignment:
Q  15 agagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38946925 agagaccacatttcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgcaatttctaat 38947024  T
Q  115 ctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947025 ctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaag 38947124  T
Q  215 ttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  38947125 ttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataagatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaactg 38947224  T
Q  315 atttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagat 414  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38947225 atttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttttttcgtcaaagat 38947324  T
Q  415 gaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccg 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947325 gaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccg 38947394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Original strand, 39795134 - 39795602
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39795134 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 39795233  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795234 cgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgatagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 39795333  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39795334 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 39795433  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795434 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaagatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 39795533  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795534 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 39795602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3802463 - 3801995
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802463 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacttcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 3802364  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3802363 cgaagttgaaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacttccattaagtt 3802264  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg-tttgaggtagttggggtgaattcaaccga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3802263 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgttttgaggtagtt-gggtgacttcaaccga 3802165  T
Q  316 tttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatg 415  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3802164 cttgacatattcagttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaattttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttttgtcaaagatg 3802065  T
Q  416 aatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802064 aatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 3801995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 481
Target Start/End: Original strand, 24750822 - 24751287
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24750822 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 24750921  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750922 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaatacaaagtgaaagtaatacgatcaaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 24751021  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatg-tataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  24751022 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgttataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccga 24751121  T
Q  316 tttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatg 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24751122 tttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatg 24751221  T
Q  416 aatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgttttt 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24751222 aatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgttttt 24751287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 1098723 - 1098260
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1098723 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 1098624  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1098623 cgaagttggaggagcacaactatacttattattcaagaacacaaagtgaaagtactacaaccgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 1098524  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||    
T  1098523 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttggggtcacatcgaccgat 1098424  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1098423 ttgacataatcggttgggtttagatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagagga 1098324  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1098323 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggaattgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 1098260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 24604986 - 24604523
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24604986 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatagggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 24604887  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24604886 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 24604787  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  24604786 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgatcgat 24604687  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24604686 tggacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatga 24604587  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24604586 atatgcctaaggtgattgtgaccgacagggatatttctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 24604523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 485
Target Start/End: Original strand, 7264229 - 7264612
Alignment:
Q  102 tgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatcc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7264229 tgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaataccattgaagatattttttaggctcatcc 7264328  T
Q  202 aacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggg 301  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7264329 aacatccattaagtagttaaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaattaacatgtataggatgccaatgtttgatgtagttggg 7264428  T
Q  302 gtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttc 401  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264429 gtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttc 7264528  T
Q  402 tttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264529 tttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttatcgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 7264612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 43949179 - 43948716
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  43949179 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatataggtgacaagaagccgttgcgttatctaatct 43949080  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43949079 cgaagttagaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 43948980  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||    
T  43948979 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttctactgat 43948880  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43948879 ttgacatattcggttgggtttgaatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaaattcttacgtcaaagatga 43948780  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43948779 atatgcctaaggtgattgtgaccgacagagatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 43948716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 480
Target Start/End: Original strand, 45476524 - 45476984
Alignment:
Q  19 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45476524 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaa-tatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcg 45476622  T
Q  119 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  45476623 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagttgt 45476722  T
Q  219 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgattt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |    
T  45476723 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaacgatct 45476822  T
Q  319 gacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaat 418  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45476823 gacatattcggtttggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacatcaaagatgaat 45476922  T
Q  419 atgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  45476923 atgcctaaggtgattgtgactgacagtgatatgtctttgataaaagcggttgcaaatgtttt 45476984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 12907389 - 12906923
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  12907389 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaagtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttcaaattt 12907290  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12907289 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaaaatatcttttggactcatccaacatccgttaagtt 12907190  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  12907189 gtttaacaattttccaacggatttggttatggacttcacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 12907090  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12907089 ttgacatattcggtttggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatattgcgtaaacttcttacgtcaaagatga 12906990  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    ||||||||||||||||| | || || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12906989 atatgcctaaggtgattatgactgacagtgatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatatttttcc 12906923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 34920679 - 34920216
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34920679 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaattcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaattt 34920580  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34920579 cgaagttggaggagcacacttatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 34920480  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||    
T  34920479 gtttaacaatattccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactttgaccgat 34920380  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34920379 ttgatatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatga 34920280  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34920279 atatgcctatgatgattgtgactgacagggatatgtctttgatgaaagcggatgcaaatgtttt 34920216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 41007877 - 41007407
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41007877 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtctaaaatgaacgtcaacaaatatgtaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 41007778  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41007777 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 41007678  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  41007677 gtttaacaatttctcaacggttttgattatggactccacctacaaaactaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 41007578  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41007577 ttgatatattcggttgggtttcgatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttaggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatga 41007478  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgataggg----atatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  41007477 atatgcctaaggtgattgtgaccgacagggatatatatgtcattgatgaaagcggttgcaaatatttttcc 41007407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 472
Target Start/End: Original strand, 436475 - 436931
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  436475 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaattgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 436574  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  436575 cgaagttggaggagcacatctatacttattattcaagaacacatagtgaaagtactacaatctaagatatcttttgggctcatctaacatcttttaagtt 436674  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaat-gtttgaggtagttggggtgaattcaaccga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  436675 gtttaacaattttccaacggttttgattatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatggtttgaggtagttggggtcacttcgaccga 436774  T
Q  316 tttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatg 415  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  436775 tttgacatattccgttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgttaaagatg 436874  T
Q  416 aatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgca 472  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  436875 aatatgcctaaggtgattgtgactgacagggatatgtcttttatgaaagtggttgca 436931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 9655320 - 9655782
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  9655320 agaccacattgcatgaaaaatgtgaagtaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatgt 9655419  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9655420 cgaagttgaaggagcacaactatatttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 9655519  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  9655520 gtttaacaattttccaacggttttgattatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttggggtcatttcgaccgat 9655619  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  9655620 ttgacatattcggttgggtttggatttgtaacacatgagaaa-aggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcataaacttcttacgtcaaagatta 9655718  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  9655719 atatacctaaggtgattgtgaccgacagggatatgtctatgatgaaagcagttgcaaatgtttt 9655782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 11692712 - 11692261
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11692712 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagttgacaagaagccgttgcaatatttaatct 11692613  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11692612 cgaaattggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaattactacaatagaagatatattttgggcccatccaacatccgttaagtt 11692513  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||               ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||    
T  11692512 gtttaagaattttccaacggttttggttatggactccacctacaa---------------gatgccaatgtttaaggtagttggggtcacttcgaccgat 11692428  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  11692427 ttgacatattcagttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagttga 11692328  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11692327 atatgcctaaggtgattgtgactgacagggatatgtctttgatgaaagtggttgcaaatgtttttcc 11692261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 17997069 - 17996608
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  |||| | ||||||||||    
T  17997069 agacaacattgcatgccaaatatcaagcaagtatacaatgaacgtcaacaaatatggaagtcaaatagaggtgacaagacgatgttgtagtttctaatct 17996970  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    | ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  17996969 caaagttggaggagcacaactgtgtttatttctcaagaacacaaagtgaaagtactactattgaagatatcttttaggctcatccaacatccgttacgtt 17996870  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||    
T  17996869 gtttaacaatattccaatggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgagatagttggggtcacctcgaccgat 17996770  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17996769 ttgacatatttggttggctttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtgtggtttttacaaatgatgcgtaaacttcttacgtcaaagatga 17996670  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtt 478  Q
    ||||||||| ||||  |||    || || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  17996669 atatgcctagggtggctgtgtttgacagagatatgtcttttatgaatgcggttgcaaatgtt 17996608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 210 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 24941354 - 24941084
Alignment:
Q  210 ttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24941354 ttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttc 24941255  T
Q  310 aaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtca 409  Q
     | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24941254 gatcgattggacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtca 24941155  T
Q  410 aagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24941154 aagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccgacagggatatttctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 24941084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28354799 - 28354549
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28354799 agaccacatttcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagtcaaatataggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 28354700  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28354699 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 28354600  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaa 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28354599 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaa 28354549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 403
Target Start/End: Original strand, 21535507 - 21535733
Alignment:
Q  171 atactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacat 270  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||   |||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||      || || ||||||||    
T  21535507 atactattcaagacatattttgggctcatcctcaatcagttaggttggttaacaattttccaacagttttggttatggac------tataaaaccaacat 21535600  T
Q  271 gtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaacttt 370  Q
    ||| | ||||||| | |||||| |||||||||| |  ||||| ||| |||||||| ||||||| |||| || ||||||   |||||| || || ||||||    
T  21535601 gtacatgatgccactatttgagatagttggggtcacctcaactgatatgacatattcggttggttttgcatatatgacgggtgagaaggaggataacttt 21535700  T
Q  371 gtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctt 403  Q
       |||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  21535701 acctgggctttacaaatgttgcttaaacttctt 21535733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 400 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28347911 - 28347831
Alignment:
Q  400 tctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28347911 tcttacgtcaaagatgaatatgtctaaggtgattgtgaccgacatggatatgtctttgatgaaagcggttgaaaatgtttt 28347831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 28423225 - 28422985
Alignment:
Q  163 tgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaag 262  Q
    ||||||| | |||||| |||| || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| || || |||||| | ||||  |||||||||||     
T  28423225 tgaaagtcaaactattcaagacatattttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaatttcccgactgttttgataatgggttccacgtacaaa 28423126  T
Q  263 accaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaag 362  Q
    |||||| |||| | ||||||| |||||||  ||||||| || |  ||||||||| |||||||| |  |||  |||  |||||||||    ||||| || |    
T  28423125 accaacttgtacatgatgccattgtttgaaatagttggagtcacctcaaccgatgtgacatattcaattgattttttatttatgacgtcggagaaggagg 28423026  T
Q  363 aaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctt 403  Q
    | ||||||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  28423025 ataactttacttgggctttacaaatgttgcttaaacttctt 28422985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3353985 - 3353894
Alignment:
Q  210 ttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggg 301  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||    
T  3353985 ttaaattgtttaacaatttttcgactgttttgatcatggactccacctataaaaccaacatgtacaggatgttattgtttgagatagttggg 3353894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 55
Target Start/End: Original strand, 7264196 - 7264234
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaat 55  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7264196 agaccacattgcatgacaattgtgaagcaagtgtgcaat 7264234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3947366 - 3946890
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947366 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 3947267  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947266 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 3947167  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3947166 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 3947067  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3947066 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 3946967  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3946966 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 3946890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 29355585 - 29355117
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355585 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 29355486  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355485 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 29355386  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29355385 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 29355286  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355285 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 29355186  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355185 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 29355117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Original strand, 44466738 - 44467214
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466738 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 44466837  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466838 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 44466937  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44466938 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 44467037  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44467038 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 44467137  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467138 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 44467214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Original strand, 20350612 - 20351088
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350612 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 20350711  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350712 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 20350811  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20350812 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagtttgggtgactt 20350911  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20350912 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 20351011  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351012 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 20351088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Original strand, 3984269 - 3984746
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984269 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 3984368  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984369 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 3984468  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3984469 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 3984568  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3984569 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 3984668  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgtta-ccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984669 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttacccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 3984746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 38775020 - 38774544
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38775020 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatatgggtgacaagaagccgttgcaatt 38774921  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774920 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 38774821  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38774820 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 38774721  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38774720 caaccgatttgacatattcggttgggtttgaatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtc 38774621  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774620 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 38774544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Original strand, 5079099 - 5079567
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079099 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcagataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 5079198  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079199 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 5079298  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5079299 gtttaacaattttcaaacggttttggttacggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 5079398  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079399 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 5079498  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079499 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 5079567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Original strand, 13630580 - 13631048
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13630580 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 13630679  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630680 cgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgggctcatccaacatccattaagtt 13630779  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13630780 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 13630879  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630880 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaagatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 13630979  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13630980 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgacagcggttgcacatatttttccgg 13631048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 484
Target Start/End: Original strand, 41455001 - 41455468
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455001 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 41455100  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455101 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgggctcatccaacatccattaagtt 41455200  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41455201 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtaaaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaccgat 41455300  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455301 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaattttgtttgggttttacaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 41455400  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccg 484  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455401 atatacctaaggtgattgttaccgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccg 41455468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 12649476 - 12649010
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  12649476 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatat 12649377  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649376 ctatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 12649277  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  12649276 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 12649177  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12649176 ttgacatattcggttgggtttgaatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgtgtaaacttctttcgtcaaagatga 12649077  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649076 atatgcctaaggtgattgttaccgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 12649010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 37016078 - 37016541
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37016078 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 37016177  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37016178 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 37016277  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  37016278 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcatttcgaccgat 37016377  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016378 ttgacatatttggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 37016477  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37016478 atatgcctaaggtgattgttaccaacatggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 37016541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 50116660 - 50116194
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  50116660 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatgt 50116561  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  50116560 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatctaacatccgttaagtt 50116461  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  50116460 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 50116361  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116360 ttgacatatttggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagagaaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 50116261  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50116260 atatgcttaaggtgattgttaccgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttttcc 50116194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 38691836 - 38691373
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38691836 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagagatgacaagaagccgttgcaatatctaatct 38691737  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38691736 cgatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 38691637  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  38691636 gtttaacaatttttcaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 38691537  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  38691536 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagataa 38691437  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38691436 atatgcctgaggtgattgtgaccgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 38691373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 46974328 - 46974791
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  46974328 agaccacattgcatgacaaatgtgaaacaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 46974427  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46974428 caaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 46974527  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  46974528 gtttaacaatcttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacaggtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaatcgat 46974627  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  46974628 ttgacatattcggttgggtttagatttgtgacacatgagaaagagaaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgcaaacttcttacgtcaaagatga 46974727  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||    
T  46974728 atatgcctaaggtgattgtgaccgacagggatatgtctttaattaaagtggttgcaaatgtttt 46974791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 51663422 - 51663885
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  51663422 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacattgaacgtcaacaaaaatggaaggcaaatagaggtgacaataagtcgttgcaatatctaatct 51663521  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51663522 cgaagttggaggagcacaactatacttattagtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatcctttaagtt 51663621  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  51663622 gtttaacaattttccaacggttttgattatggactctacctacaaaaccaacatgtataaaatgccagtgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 51663721  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    |||||||||  ||||| ||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51663722 ttgacatatttggttgagtttgaatatgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatga 51663821  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51663822 atatgcctaaggtgattgtgaccgacagtgatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 51663885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 13174945 - 13175408
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13174945 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaaatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaattt 13175044  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  13175045 caaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgtgctcatccaacatccgctaagtt 13175144  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  13175145 gtttaacaaatttccagcggttttggttatggactccacctacaaaaccatcatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 13175244  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13175245 ttgacatattcggttgggtgtggatttgtgacccatgagaaagaggaaaaatttgtttgagtttcaaaaatgttgcgtaaacttattacgtcaaagatga 13175344  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  13175345 atatgcctaaggtgactgtgactgacagggatatgtctttgatgaaagtggttgtaaatgtttt 13175408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 100 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 19498277 - 19497898
Alignment:
Q  100 gttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcat 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||| ||  |||||| |||| ||||||||    
T  19498277 gttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttatttctaaaaaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatactttt-gggctcat 19498179  T
Q  200 ccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttg 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19498178 ccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacccacaaaacaaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttg 19498079  T
Q  300 gggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaact 399  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19498078 gggtcacttcgaccgatttgacatattcggtaggctttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatattgcgtaaact 19497979  T
Q  400 tctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19497978 tcttacgtcaaagataaatatgcctaaggtgattgtgacagacagggatatatctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 19497898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21943261 - 21942977
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||||||    
T  21943261 agaccacattgcatgacaaatgtcaaacaagtgtacaataaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggcgacaagaaactgttgcaatatctaatct 21943162  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  21943161 cgaagttggaggagcacaactatgcttatttctcaaaaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccatcattcgttaagtt 21943062  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggg 301  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21943061 gtttaacaaattttcaacggttttggttatggattccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggg 21942977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 32106533 - 32106165
Alignment:
Q  24 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagtt 123  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| | || || |||||||||| |  | |||| | | ||||||| |||||    
T  32106533 attgcaagacaaatatcaagcaagtatgcaattaacatcaacaaatatggaagtcgaacagaggtgacaagacgatgatgcattatataatctcaaagtt 32106434  T
Q  124 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaac 223  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32106433 ggaggagcacaactatgtttatttcaccagaacacaaagtgaaagtactactattgaagacatattttaagctcatccaacatccattaagttgtttaac 32106334  T
Q  224 aattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacat 323  Q
    ||||||           ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |  |  || ||||||||||    
T  32106333 aatttt-----------ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgagatagttggggtcaccttgactgatttgacat 32106245  T
Q  324 atacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctt 403  Q
    || | ||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  32106244 attcagttgattttggatttttgacacatgagaaagatgacaactttgtttgggttttacaaatgatgcttaaacttctt 32106165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 44620000 - 44619905
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttcta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44620000 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtgcaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatcta 44619905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26466160 - 26466006
Alignment:
Q  24 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagtt 123  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | || ||| | || | |  |||||| ||||||||||| |||||    
T  26466160 attgcatgacaaatatcaagcaagtatacaatgaacgtcaataaatatggaagtcatacagaggttaaaaaacggtgttgcagtttctaatctcaaagtt 26466061  T
Q  124 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactatt 178  Q
    | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  26466060 gaaggagcacaactatgtttatttctcaagaacacaaaatgaaagtactactatt 26466006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36360246 - 36360086
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||    
T  36360246 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccaactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcactgt 36360147  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||| | || |  |||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||||||    
T  36360146 ttgaaatagtttgagtcacctcaacctatttgatatattcggttggttttgcatttatgac 36360086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 45472687 - 45472847
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | |||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||    
T  45472687 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggatcccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcattgt 45472786  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  45472787 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 45472847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 7403953 - 7404115
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgcc--aat 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||  | |    
T  7403953 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccatatt 7404052  T
Q  286 gtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||    
T  7404053 gtttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttagttttgcatttatgac 7404115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 403
Target Start/End: Original strand, 28863225 - 28863440
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||| | | || |||||||||| |||| | || |||||| | ||||| || |||||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  28863225 ttttggactcatccaacattcgtaaaattgtttaacactttttcgactgttttgataatggattctacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 28863324  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaat 387  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| |||||||||||  | |||| |||| ||||| |||    ||||| || || ||||||| ||||| |||| ||||    
T  28863325 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatatttgattggttttgcatttacgacgtcggagaaggaggataactttgcttgggctttacaaat 28863424  T
Q  388 gttgcgtaaacttctt 403  Q
    ||||| ||||||||||    
T  28863425 gttgcttaaacttctt 28863440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 403
Target Start/End: Original strand, 27283400 - 27283590
Alignment:
Q  213 agttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaac 312  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  |  |||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |  ||||||| || |  |||||    
T  27283400 agttgtttaacaattttccgactgttttaatattggattccacgcacaaaaccaacttgtataggatgccattatttaaaatagttggagtcacctcaac 27283499  T
Q  313 cgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctt 403  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||     |||| ||||| ||||||  ||||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  27283500 ctatttgacatattcggttggttttgcatttatgacgtcaaagaaggaagataactttacttgggctttgcaaatgttgcttaaacttctt 27283590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18887520 - 18887360
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |   ||||| | ||||| ||||||||||  || ||| |||||| |||| || |||    
T  18887520 ttttggtctcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgatttttttgataatggattccacgtacagaactaacttgtataagatgtcattgt 18887421  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||    
T  18887420 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattctgttggttttgcatttatgac 18887360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 7980109 - 7980068
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaa 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980109 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaa 7980068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Original strand, 20240034 - 20240122
Alignment:
Q  212 aagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgg 300  Q
    |||||||||||||||||||  || | |||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||    
T  20240034 aagttgtttaacaattttctgactgctttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataggatgtcattgtttgaaatagttgg 20240122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 218
Target Start/End: Original strand, 25231558 - 25231667
Alignment:
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||| | | | |||| ||  |||||||| ||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||| |    
T  25231558 tctaatctcaaaattggaggagcacaactatgtttatttcaccataacaaaaagtgaaagtactacaattaaagacatattttgggttcatccaacatac 25231657  T
Q  209 attaagttgt 218  Q
     |||||||||    
T  25231658 gttaagttgt 25231667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 303
Target Start/End: Original strand, 31445866 - 31445979
Alignment:
Q  190 ttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgttt 289  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||| | || ||||||||| | || |||||  ||||| | ||| || |||||    
T  31445866 ttgggctcatccaaaatctataaagttgtttaacactttttcaacagttttgatcatagactccacgcataaaaccaatgtgtattgaatgtcattgttt 31445965  T
Q  290 gaggtagttggggt 303  Q
     |||||||| ||||    
T  31445966 aaggtagttagggt 31445979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 453; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Original strand, 2045 - 2513
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 2144  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2145 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 2244  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2245 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 2344  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2345 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 2444  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2445 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 2513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 453; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 19072554 - 19072086
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072554 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 19072455  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19072454 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 19072355  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19072354 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 19072255  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072254 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 19072155  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072154 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 19072086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Original strand, 3404954 - 3405422
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3404954 agaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 3405053  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405054 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 3405153  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3405154 gtttaacaattttcaaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 3405253  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405254 ttgacatattcggttgggtttggatttatggcacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaattttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 3405353  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405354 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 3405422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 484
Target Start/End: Original strand, 9891186 - 9891653
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9891186 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 9891285  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9891286 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttggactcatccaacatccattaagtt 9891385  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9891386 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 9891485  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9891486 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtgaacttctttcgtcaaagatga 9891585  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891586 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatgtgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccg 9891653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 484
Target Start/End: Original strand, 41024363 - 41024832
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41024363 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaaaaagtcgttgcaatttctaatct 41024462  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41024463 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 41024562  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  41024563 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggaggccaatgtttgaggtggttggggtcacttcaaccgat 41024662  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024663 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 41024762  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgataggg--atatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccg 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024763 atatgcctaaggtgattgttaccgacagggatatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccg 41024832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 4769298 - 4769761
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4769298 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaatgtctacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctgattt 4769397  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4769398 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 4769497  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  4769498 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgtcaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 4769597  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4769598 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagagaaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaatcttcttacgtcaaagatga 4769697  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4769698 atatgcctaaggtgattgtgactgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 4769761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 49565369 - 49565013
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565369 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 49565270  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565269 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 49565170  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49565169 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 49565070  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaa 365  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565069 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaa 49565013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 38463734 - 38463281
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38463734 agaccacactgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatacggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 38463635  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38463634 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagtt 38463535  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||||    
T  38463534 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgctaatgtttgaggtagttggagtcacttcgaccgat 38463435  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  38463434 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatattgcgtaaacttcttacgtcaaaaatga 38463335  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttg 470  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463334 atatgcctaaggtgattgtgaccgacagggatatgtctttgatgaaagcggttg 38463281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 4976919 - 4977382
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4976919 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaatgcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 4977018  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4977019 caaagttggaggagcacaactatacttattactaaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 4977118  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  4977119 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 4977218  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt-aaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatg 415  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  4977219 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttggtttttaaaaaatgttgcgtaaacttcttacgt-tcagatg 4977317  T
Q  416 aatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4977318 aatatgcctaaggtgattgtgaccgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 4977382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4978851 - 4978392
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4978851 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaa----ggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 4978756  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
T  4978755 caaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcttccaacgtctgttaagtt 4978656  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||    
T  4978655 gtttaacaattttcgaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgtcaatgtttgaggtagttagggtcacttcgatcgat 4978556  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4978555 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgatacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaatgatga 4978456  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4978455 atatgcctaaggtgattgtgaccgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 4978392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Original strand, 11502670 - 11503136
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11502670 agaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtaaacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 11502769  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11502770 cgaagttggaagagcacaactatacttattactcaagaacacaaagagaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatcaaacatccgttaagtt 11502869  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  11502870 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 11502969  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11502970 ttgacatattcggttgggtttgaatttgtgacacatgagaaagaggaatactttgtttgggttttaaaaatgttgtgtaaacttcttacgtcaaagatga 11503069  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11503070 atatgcctaaggtgattgtgaccaacatggatatgtccttgatgaaagtggttgcaaatgtttttcc 11503136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 44049774 - 44050216
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44049774 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaacgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagctgttgcaatatctaatct 44049873  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44049874 cgaagttggaggagcgcagctatacttattactcaataacacaaagtgaaactactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 44049973  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  44049974 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgatcgat 44050073  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44050074 ttgacatattcggttgggtttaaatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatga 44050173  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgat 459  Q
    || |||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||    
T  44050174 atgtgcctaaggtgattgtgatcgacagggatatgtttttgat 44050216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 21471958 - 21472421
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  21471958 agaccacattggataa-aaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatttaatct 21472056  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21472057 cgaagttggaggagcacaactatacttattacttaagaacacaaagtgaaagtactaaaatcaaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 21472156  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtac-aagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||    
T  21472157 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaacaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgatcga 21472256  T
Q  316 tttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatg 415  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  21472257 tttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacatcaaagata 21472356  T
Q  416 aatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21472357 aatatgactaaggagattgtgaccgacagagatatgtctttaatgaaagcggttgcaaatgtttt 21472421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 51643395 - 51643211
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51643395 agaccacattgcatgacaaatgtaaagcaagtgtacgatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagttgacaagacgccgttgcaatatctaatct 51643296  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatcc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  51643295 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatatcttttgggctcatcc 51643211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 448
Target Start/End: Original strand, 6182875 - 6183273
Alignment:
Q  50 tacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattact 149  Q
    |||||||||| |||| ||||||  ||| |||| || |||||||||| |  | |||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||  ||||| |     
T  6182875 tacaatgaacatcaaaaaatattcaagtcaaacagaggtgacaagacggtgatgcaatatctaatctcaaaattggaggaacacaactatgtttatttca 6182974  T
Q  150 caagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 249  Q
    | | ||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  6182975 ccataacacaaattgaaagtactactattcaagacatattttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacagttttgattatgaa 6183074  T
Q  250 ctccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgaca 349  Q
    |||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||| ||   ||||| ||||||||| |||||    
T  6183075 ctccatctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgagatagttggggtcatctcgaccgatttgacaaatttagttggttttggatttttgaca 6183174  T
Q  350 catgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggat 448  Q
      || |||||| || || ||||||||||||||| |||   ||| ||||||||||   |||||||  |||||| |||||||| |||| || || ||||||    
T  6183175 gctgggaaagaggataattttgtttgggttttagaaacaatgcttaaacttcttaactcaaagagtaatatgtctaaggtggttgtgactgacagggat 6183273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18580225 - 18580117
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18580225 agacctcattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatgga---caaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatttaatct 18580129  T
Q  117 cgaagttggagg 128  Q
    ||||||| ||||    
T  18580128 cgaagtttgagg 18580117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 347
Target Start/End: Original strand, 32716628 - 32716787
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  32716628 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 32716727  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatga 347  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  32716728 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatga 32716787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 403
Target Start/End: Original strand, 4617916 - 4618107
Alignment:
Q  212 aagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaa 311  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||||| || |  ||||    
T  4617916 aagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataggacgccattgtttgaaatagttggagtcacctcaa 4618015  T
Q  312 ccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctt 403  Q
    |  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||   || ||| || || ||||||  ||||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  4618016 cttatttgacatattcggttggttttgcatttatgacgtctgggaaggaggataactttacttgggctttgcaaatgttgcttaaacttctt 4618107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 1591168 - 1591328
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||| | || |||||| | ||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||| |||    
T  1591168 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacaatttttcgactgttttgataatggattccacgtagaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 1591267  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||    
T  1591268 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttgtgac 1591328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 13897526 - 13897238
Alignment:
Q  171 atactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacat 270  Q
    |||||||| || | || ||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||||  | || |||||| | ||||| ||| |||| || |||||| |    
T  13897526 atactattcaatacatattttggggtcatccagaatcggttaagttgtttaacaatttctcgactgttttgatcatggattcctcgtagaaaaccaactt 13897427  T
Q  271 gtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaacttt 370  Q
    ||| | |||| || |||||||| ||||||| || |  ||| ||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||   |||||| || || ||||||    
T  13897426 gtacatgatgtcattgtttgagatagttggagtcacctcacccgatatgacatattcggtgggttttgaatttatgacgactgagaaggaggataacttt 13897327  T
Q  371 gtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgat 459  Q
       |||| |||| | ||||||| ||||||| ||  ||||||||   ||||||||||||||||||| || || ||||||| | |||||||    
T  13897326 acctgggctttacagatgttgcttaaactttttaagtcaaagagtgatatgcctaaggtgattgtgactgacagggatacgactttgat 13897238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 17916521 - 17916681
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| | ||||||||| ||||   ||||||| |||||| |||    
T  17916521 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggatttcacgtacaaaaccattttgtatagaatgccattgt 17916620  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  | |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  17916621 ttgaaatagttggagtcaccttaacccatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 17916681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 46517160 - 46517000
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||  |||||| || |||||| | ||| | |||||| |||| | |||| ||||||| ||| || |||    
T  46517160 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacgtttttccgactgttttgataatgaattccacgaacaaaatcaacttgtatagaatgtcattgt 46517061  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| |  |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  46517060 ttgaaatagttggagacacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 46517000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 403
Target Start/End: Original strand, 17496893 - 17497073
Alignment:
Q  223 caattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgaca 322  Q
    ||||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||| |||||  |||||| |||| || |||||||  ||||||| || |  |||||| ||| ||||    
T  17496893 caattttccgactattttgataatggattccacgtacaaaaccaatttgtataagatgtcattgtttgaaatagttggagtcacctcaacctattagaca 17496992  T
Q  323 tatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctt 403  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||||   ||||| || || ||||||   |||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  17496993 tattcggttggttttgcatttatgacatcagagaaggatgataactttacctgggctttgcaaatgttgcttaaacttctt 17497073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 303
Target Start/End: Original strand, 34979909 - 34980003
Alignment:
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  ||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||| |  ||| || |||||||| ||||||||||    
T  34979909 attaagttgtttaacaattttctgtctattttggtcatggacttcacctataaaaccaacatgtacataatgtcattgtttgagatagttggggt 34980003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 449; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 1611656 - 1611180
Alignment:
Q  9 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611656 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 1611557  T
Q  109 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611556 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 1611457  T
Q  209 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaatt 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1611456 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatttataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 1611357  T
Q  309 caaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1611356 caaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttagcaatgttgcgtaaacttctttcgtc 1611257  T
Q  409 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611256 aaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 1611180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 485
Target Start/End: Original strand, 28357557 - 28357950
Alignment:
Q  92 aagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatttttt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28357557 aagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatacaattgaagatatctttt 28357656  T
Q  192 gggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttga 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28357657 gggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaagaccaacatgtataggatgcaaatgtttga 28357756  T
Q  292 ggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttg 391  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357757 ggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttg 28357856  T
Q  392 cgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357857 cgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 28357950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 31147486 - 31147949
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31147486 agaccacattgcatgataaatttgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 31147585  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  31147586 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatacaacatccgttaagtt 31147685  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||    
T  31147686 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttgtgttcacttcgaccgat 31147785  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31147786 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgtttggtaaacttctttcgtcaaagatga 31147885  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31147886 atatgcctaaggtgattgttaccgacagggatatgtctttgatgaaagtggttgcaaatgtttt 31147949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 29287845 - 29287411
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||||| |    
T  29287845 agaccacattgcatgaaaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgc----tctaatat 29287750  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  29287749 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaattt 29287650  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  29287649 gtttaa-aattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgatcgat 29287551  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29287550 ttgacatattcggttggatttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatga 29287451  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtcttt 456  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29287450 atatgcctaaggtgattgtgaccgatagggatatgtcttt 29287411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 18607160 - 18607623
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  18607160 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgataagaagccgttgcaatatctaattt 18607259  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18607260 ttaagttggaggagcacaacaatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagtt 18607359  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| || |||    
T  18607360 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatatttgaagtagttggggtcacttcgacagat 18607459  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  18607460 ttgacatattcgattgggtttagatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgtgtaaacatcttacgtcaaagatga 18607559  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||   ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18607560 atcaacctaatgtgattgtgaccgacatggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 18607623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 21358244 - 21357784
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||  |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21358244 agaccacattgcatgacaaaggtcaagcaagcgtaaaatgatag---acaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 21358148  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21358147 cgaagttcgaggagcacaactatacttatttgtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatattttgggctcatccaacatccgttaagtt 21358048  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  21358047 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttcgggtcacttcgaccgat 21357948  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  21357947 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacaaatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtagacttcttacgtcaaggatga 21357848  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||| ||||| ||| || || |  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21357847 atatgcctagggtgactgtgactgacaaagatatgtctttgatgaaagcggtcgcaaatgtttt 21357784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 23962226 - 23961766
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||  |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23962226 agaccacattgcatgacaaaggtcaagcaagcgtaaaatgatag---acaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 23962130  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23962129 cgaagttcgaggagcacaactatacttatttgtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatattttgggctcatccaacatccgttaagtt 23962030  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  23962029 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttcgggtcacttcgaccgat 23961930  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  23961929 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacaaatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtagacttcttacgtcaaggatga 23961830  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||| ||||| ||| || || |  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23961829 atatgcctagggtgactgtgactgacaaagatatgtctttgatgaaagcggtcgcaaatgtttt 23961766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 28251060 - 28251134
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgac 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28251060 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgac 28251134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 9095463 - 9095623
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| |||||||||||  ||||| ||||||| ||| || |||    
T  9095463 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgatcatggattccacgtacaaagccaacttgtatagaatgtcattgt 9095562  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  9095563 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 9095623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 93
Target Start/End: Original strand, 24220332 - 24220408
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24220332 agaccacattgcatgacaaatatcaagtaagtgtaaaataaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 24220408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Original strand, 31176265 - 31176356
Alignment:
Q  150 caagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttg 241  Q
    |||||||||||  ||| |||  || |||| |||| || |||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31176265 caagaacacaatatgagagtgctattattcaagacatattttgggctcatctcgaatcgattaagttgtttaacaattttccaacagttttg 31176356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Original strand, 31196905 - 31196958
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttg 241  Q
    |||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31196905 ttttgggctcatctcgaatcgattaagttgtttaacaattttccaacagttttg 31196958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 445; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 37819774 - 37819306
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819774 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 37819675  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819674 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 37819575  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37819574 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 37819475  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37819474 ttgacatattcggttaggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagctga 37819375  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819374 atatgcctaaggtgattgttaccgagagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 37819306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 11032349 - 11031881
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11032349 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgcaatatctaatct 11032250  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032249 cgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 11032150  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11032149 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 11032050  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032049 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaagatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 11031950  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11031949 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 11031881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 38859087 - 38858619
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38859087 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 38858988  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858987 cgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 38858888  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38858887 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatatataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 38858788  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858787 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaagatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 38858688  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858687 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 38858619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Original strand, 34078944 - 34079410
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34078944 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 34079043  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079044 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacgtgaaagtaatacaattgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 34079143  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34079144 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaccgat 34079243  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34079244 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcataaacttctttcgtcaaagatga 34079343  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079344 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 34079410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 27866742 - 27866276
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27866742 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaaacctttgcaatttctaatct 27866643  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866642 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacgtgaaagtaatacaattgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 27866543  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  27866542 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggaggccaatgtttgaggtggttggggtcacttcaaccgat 27866443  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866442 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 27866343  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27866342 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcgattgcacatgtttttcc 27866276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Original strand, 1036515 - 1036981
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1036515 agaccacattgcatgacaaatgtgacacaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 1036614  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1036615 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatctaacatccattaagtt 1036714  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  1036715 gtttaacaattttccaacggttttggttacggactcaacctacaaaatcaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 1036814  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1036815 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcataaacttctttcgtcaaagatga 1036914  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1036915 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttttcc 1036981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 28885305 - 28884901
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885305 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 28885206  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885205 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 28885106  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28885105 gtttaacaattttccaacggttttggttatggattccacgtacgaaaccaacatgtattggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 28885006  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885005 ttgacataatccgttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttggattttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 28884906  T
Q  417 atatg 421  Q
    |||||    
T  28884905 atatg 28884901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 13566988 - 13566536
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566988 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 13566889  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13566888 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatacaattgaagatatcttttgggatcattcaacatccattaagtt 13566789  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||                ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13566788 gt----------------ggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtctaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaccgat 13566705  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566704 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 13566605  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566604 atatgcctaaggtgattgttaccgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 13566536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 25895998 - 25895528
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  25895998 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatat 25895899  T
Q  117 cgaa----gttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccatta 212  Q
    | |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25895898 ctatatatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgagagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccatta 25895799  T
Q  213 agttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaac 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||    
T  25895798 agttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgcttgaggtagttggggtcacttcgac 25895699  T
Q  313 cgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaag 412  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895698 cgatttgacatattcgggtgagtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttttttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaag 25895599  T
Q  413 atgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895598 atgaatatgcctaaggtgattgttaccgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 25895528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18537233 - 18536770
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18537233 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 18537134  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18537133 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 18537034  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18537033 gtttaacaattttccaatggttttggttatggactccacctacaaaactaacatgtacaagatgctaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaccgat 18536934  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  18536933 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacgcatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacatcagagatga 18536834  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18536833 atatgcctaaggtgattgtgaccgacaaggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 18536770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 7799903 - 7799440
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7799903 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 7799804  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7799803 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 7799704  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  7799703 gtttaacaattttccaacggttttggttaaggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgat 7799604  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7799603 ttaacatattcggttgggtttggatttgtgagacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatga 7799504  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||    
T  7799503 atatgcctaaggtgattgtgaccgacatggatatgtcttcgatgaaagcagatgcaaatgtttt 7799440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 4202836 - 4202388
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4202836 agaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 4202737  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4202736 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 4202637  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  4202636 gtttaacaattttccaacagttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttgaggtcacttcgaccgat 4202537  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4202536 ttgacatattctgttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatga 4202437  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagc 465  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4202436 atatgcctaaggtgattgtgaccgacagagatatgtctttgatgaaagc 4202388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7020777 - 7020419
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020777 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 7020678  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020677 cgaagttggaggagcacatctatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 7020578  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7020577 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaccgat 7020478  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttg 375  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7020477 ttgacatattcggttgggtttagatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttg 7020419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 462
Target Start/End: Original strand, 20287439 - 20287878
Alignment:
Q  24 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagtt 123  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||    
T  20287439 attgtatgacaaatatcaagcaagtatataatgaacgtcaataaatatgaaagtcaaacagaggtgacaagacggggttccagtttctaatctcaaagtt 20287538  T
Q  124 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgttt-aa 222  Q
    |||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |   | |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  20287539 ggaggagcacaattatgtttatttctcaagaacaaatggtcaaagtactactattgaagacatattttgcgctcatccaacatccgttaagtttttttaa 20287638  T
Q  223 caattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgaca 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  20287639 caattttccaacggttctggttatggactccacctaccaaaccaacatgtacaagatgcctatgtttgagatagttggggtcacctcgaccgatttgaca 20287738  T
Q  323 tatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgc 422  Q
    ||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| | |    
T  20287739 tattcggttggctttgaatttgtgacgcatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttacaaatgatgtgtaaacttcttacgtcaaggatgaatgttc 20287838  T
Q  423 ctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaa 462  Q
    |||||||| |||| || || | ||||| | ||||||||||    
T  20287839 ctaaggtggttgtgactgacaaggatacgactttgatgaa 20287878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Original strand, 20286180 - 20286410
Alignment:
Q  24 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagtt 123  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||    | |||| ||||||||||| |||||    
T  20286180 attgcatgacaaatatcaagcaagtatacaatgaacatcaacaaatatggaagtcaaacagaggtgacaagactgtggtgcagtttctaatctcaaagtt 20286279  T
Q  124 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaac 223  Q
    |||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||  | ||||| |||      
T  20286280 ggaggagcacaattatctttatttctcaataacacaaaatgaaagtactactattgaagacatattttgggctcatccaacatccgcttagttg-ttatg 20286378  T
Q  224 aattttccaacggttttggttatggactccac 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20286379 aattttccaacagttttggttatggactccac 20286410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 403
Target Start/End: Original strand, 11819551 - 11819766
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||    
T  11819551 ttttggactcatccaaaatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataggatgctattgt 11819650  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaat 387  Q
    ||||  ||||||| || |  | |||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    ||||| || || ||||||  ||||| ||| |||||    
T  11819651 ttgaaatagttggagtcaccttaacttatttgacatattcggttggttttgcatttatgacgtcggagaaggaggataactttacttgggctttgaaaat 11819750  T
Q  388 gttgcgtaaacttctt 403  Q
    ||||| ||||||||||    
T  11819751 gttgcttaaacttctt 11819766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27013395 - 27013235
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||| | || || ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||    
T  27013395 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatagattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcattgt 27013296  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||    
T  27013295 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattctgttggttttgcatttatgac 27013235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 403
Target Start/End: Original strand, 42343826 - 42344040
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  42343826 ttttggactcatccaacatc-agtatattgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacatacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 42343924  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaat 387  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||    ||||| || || ||||||  ||||| |||  ||||    
T  42343925 ttgaaatagttggagtaacctcaacctatttgacatattcggttagttttgcatttatgacgtcggagaaggaggataactttaattgggctttgcaaat 42344024  T
Q  388 gttgcgtaaacttctt 403  Q
    ||||| ||||||||||    
T  42344025 gttgcttaaacttctt 42344040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 6553124 - 6553284
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||| |||    
T  6553124 ttttggactcatccaacttcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaatttgtatagaatgccattgt 6553223  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  |||| || || |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  6553224 ttgaaatagtgggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 6553284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 403
Target Start/End: Original strand, 43295549 - 43295764
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || | |    
T  43295549 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcattat 43295648  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaat 387  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||| | | || |||||||||    ||||| || || ||||||  ||||| |||  ||||    
T  43295649 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggtttgttctgcatttatgacgtcggagaaggaggacaactttacttgggctttgcaaat 43295748  T
Q  388 gttgcgtaaacttctt 403  Q
    ||||| ||||||||||    
T  43295749 gttgcttaaacttctt 43295764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28884905 - 28884867
Alignment:
Q  447 atatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884905 atatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 28884867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 268
Target Start/End: Original strand, 25053043 - 25053148
Alignment:
Q  163 tgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaag 262  Q
    ||||||| | |||||| |||| || |||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||  | |||||| | ||||| |||||||||||     
T  25053043 tgaaagtcaaactattcaagacatattttggactcatccaatatcgataaagctgtttaacaattttccggctgttttgataatggattccacgtacaaa 25053142  T
Q  263 accaac 268  Q
    ||||||    
T  25053143 accaac 25053148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 433; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 16254 - 15786
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaacgcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 16155  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16154 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacttccattaagtt 16055  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16054 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 15955  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15954 ttgacatattcggttgggtttgaatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 15855  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 485  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15854 atgtgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttccgg 15786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 17233 - 17696
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17233 agaccacattgcatgaaaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgaaatatctaatct 17332  T
Q  117 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||    
T  17333 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttaggctcatccaacatctgttaagtt 17432  T
Q  217 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||    
T  17433 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactttgaccgat 17532  T
Q  317 ttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatga 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17533 ttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatga 17632  T
Q  417 atatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttt 480  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17633 atatgcataaggtgattgtgaccgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 17696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 257 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 25603 - 25377
Alignment:
Q  257 tacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgaga 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25603 tacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccaatttgacatattcggttgggtttggatttatgacatatgaga 25504  T
Q  357 aagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtcttt 456  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  25503 aagaggaaaactttgttttggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttacctacattgatatgtcttt 25404  T
Q  457 gatgaaagcggttgcacatgtttttcc 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25403 gatgaaagcggttgcaaatgtttttcc 25377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Original strand, 12426 - 12580
Alignment:
Q  17 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaa-ggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12426 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatcgaaaggcaaatagaggtgacaagaagctgttgcaatatctaatc 12525  T
Q  116 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagta 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12526 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagta 12580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 264 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 100 - 4
Alignment:
Q  264 ccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  100 ccaagatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaaga 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28612 - 28452
Alignment:
Q  188 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 287  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| || || || || |||||| ||||||| ||| || |||    
T  28612 ttttggactcatccaacatcggtaaaattgtttaacacttttccgactgttttgataatggattctacataaaaaaccaacttgtatagaatgtcattgt 28513  T
Q  288 ttgaggtagttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgac 348  Q
    ||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  28512 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 28452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 403
Target Start/End: Original strand, 4179 - 4386
Alignment:
Q  196 tcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggta 295  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||||||  || |||||| | ||||| ||||| || || |||||| |||| |  |||||| |||||||  ||    
T  4179 tcatccaacattggtaaagttgtttaacaattttctgactgttttgataatggattccacatataaaaccaacttgtagaaaatgccattgtttgaaata 4278  T
Q  296 gttggggtgaattcaaccgatttgacatatacggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgta 395  Q
    ||||| || |  |||||  ||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||    ||||| || || ||||||  ||||| |||  ||||||||| ||    
T  4279 gttggagtcacctcaacatatttgacatattcggttgattttgcatttacgacgtcggagaaggatgataactttacttgggctttgcaaatgttgctta 4378  T
Q  396 aacttctt 403  Q
    ||||||||    
T  4379 aacttctt 4386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University