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Alignment Overview

Query: NF8486_high_7 (Length: 315)

Name: NF8486_high_7
Description: NF8486
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8486_high_7
NF8486_high_7
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (1-307)||(51642117-51642423)
chr4 (1-315)||(44050737-44051066)
chr4 (1-315)||(38460525-38460840)
chr4 (1-315)||(18578722-18579047)
chr4 (4-315)||(10423066-10423377)
chr4 (124-315)||(24415392-24415583)
chr4 (1-315)||(50904821-50905136)
chr4 (46-315)||(4774262-4774531)
chr4 (49-315)||(37394861-37395131)
chr4 (49-315)||(3407897-3408154)
chr4 (91-315)||(10374240-10374454)
chr4 (49-314)||(49563999-49564256)
chr4 (101-315)||(6186859-6187073)
chr4 (49-193)||(51492230-51492374)
chr4 (52-198)||(50278588-50278734)
chr4 (52-193)||(44674299-44674440)
chr4 (49-315)||(19069345-19069615)
chr4 (49-198)||(37016057-37016206)
chr4 (49-195)||(15995880-15996026)
chr4 (236-315)||(11506752-11506831)
chr4 (49-315)||(30043081-30043346)
chr4 (1-49)||(24414934-24414982)
chr4 (98-197)||(31598700-31598798)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (69-311)||(12111394-12111636)
chr7 (1-313)||(10705347-10705670)
chr7 (1-315)||(34622598-34622913)
chr7 (4-315)||(19044395-19044721)
chr7 (4-315)||(20709915-20710241)
chr7 (1-315)||(18109451-18109767)
chr7 (49-315)||(15070008-15070265)
chr7 (49-315)||(47742647-47742903)
chr7 (49-315)||(42503496-42503753)
chr7 (49-315)||(603938-604194)
chr7 (123-315)||(47064952-47065148)
chr7 (2-198)||(5537947-5538152)
chr7 (49-198)||(17838400-17838549)
chr7 (49-314)||(30790665-30790922)
chr7 (49-197)||(40928719-40928867)
chr7 (87-314)||(45767519-45767736)
chr7 (2-191)||(34742168-34742367)
chr7 (87-314)||(43619877-43620094)
chr7 (49-188)||(29592702-29592841)
chr7 (6-198)||(13323480-13323683)
chr7 (113-198)||(10522280-10522365)
chr7 (237-315)||(29592839-29592917)
chr7 (1-49)||(36186425-36186473)
chr7 (49-88)||(12111360-12111399)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (4-315)||(43943792-43944116)
chr2 (1-315)||(12905622-12905944)
chr2 (1-313)||(41004627-41004949)
chr2 (1-315)||(28342622-28342937)
chr2 (1-315)||(24601739-24602066)
chr2 (1-315)||(24612048-24612375)
chr2 (4-315)||(41181513-41181825)
chr2 (4-315)||(439468-439792)
chr2 (1-315)||(81908-82236)
chr2 (1-315)||(45479479-45479794)
chr2 (1-219)||(41052721-41052950)
chr2 (4-313)||(9659702-9660026)
chr2 (49-315)||(1096728-1096998)
chr2 (49-315)||(24753682-24753938)
chr2 (49-307)||(38950232-38950480)
chr2 (2-315)||(7267102-7267417)
chr2 (1-188)||(25184606-25184804)
chr2 (73-315)||(39798098-39798329)
chr2 (49-314)||(41564149-41564406)
chr2 (49-198)||(39950936-39951085)
chr2 (49-315)||(3795495-3795765)
chr2 (49-198)||(10825377-10825526)
chr2 (87-314)||(5351390-5351607)
chr2 (87-314)||(10620171-10620388)
chr2 (52-198)||(32952892-32953038)
chr2 (87-314)||(209182-209399)
chr2 (52-198)||(29398071-29398213)
chr2 (99-229)||(3206956-3207086)
chr2 (87-273)||(18000430-18000606)
chr2 (66-196)||(25613379-25613508)
chr2 (235-312)||(1150692-1150769)
chr2 (98-183)||(43668329-43668414)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (1-313)||(18609893-18610206)
chr6 (46-315)||(29667481-29667750)
chr6 (1-315)||(29286302-29286617)
chr6 (1-315)||(7537286-7537615)
chr6 (1-315)||(25140763-25141079)
chr6 (1-315)||(23958990-23959305)
chr6 (52-315)||(2051189-2051456)
chr6 (51-315)||(31150723-31150977)
chr6 (1-315)||(28362375-28362703)
chr6 (52-227)||(26702448-26702622)
chr6 (49-314)||(1608451-1608708)
chr6 (50-198)||(3502429-3502577)
chr6 (2-191)||(11840022-11840222)
chr6 (57-198)||(31771505-31771646)
chr6 (49-221)||(18351385-18351557)
chr6 (49-315)||(13382786-13383056)
chr6 (49-244)||(20448506-20448701)
chr6 (93-315)||(34230682-34230895)
chr6 (49-168)||(8304596-8304715)
chr6 (49-215)||(20439753-20439919)
chr6 (49-145)||(2258444-2258540)
chr6 (49-197)||(20436063-20436211)
chr6 (93-197)||(19129180-19129281)
chr6 (143-315)||(2259338-2259499)
chr6 (4-49)||(29667758-29667803)
[»] chr1 (45 HSPs)
chr1 (1-315)||(4518052-4518389)
chr1 (1-315)||(51666324-51666639)
chr1 (1-315)||(8459057-8459372)
chr1 (1-315)||(19495139-19495467)
chr1 (1-315)||(7966082-7966404)
chr1 (1-315)||(36072468-36072787)
chr1 (46-315)||(13177784-13178051)
chr1 (1-315)||(46978892-46979231)
chr1 (46-315)||(1655738-1656007)
chr1 (1-315)||(9710678-9710992)
chr1 (93-315)||(33168106-33168328)
chr1 (1-315)||(44469669-44469984)
chr1 (49-315)||(37019054-37019310)
chr1 (49-315)||(50113466-50113736)
chr1 (98-315)||(38690117-38690323)
chr1 (49-315)||(29352392-29352648)
chr1 (49-314)||(20353594-20353849)
chr1 (49-315)||(30909687-30909943)
chr1 (49-315)||(13633530-13633787)
chr1 (46-315)||(25039739-25039998)
chr1 (52-198)||(94559-94705)
chr1 (49-214)||(46886137-46886302)
chr1 (49-314)||(38771788-38772045)
chr1 (11-198)||(16281807-16282004)
chr1 (1-194)||(22345818-22346017)
chr1 (49-315)||(5082022-5082280)
chr1 (49-198)||(22527460-22527609)
chr1 (50-315)||(6558047-6558316)
chr1 (49-221)||(15051090-15051262)
chr1 (87-314)||(3944172-3944389)
chr1 (87-314)||(3993501-3993718)
chr1 (51-198)||(31780128-31780275)
chr1 (51-315)||(12643369-12643620)
chr1 (52-194)||(19521758-19521900)
chr1 (49-198)||(52805325-52805474)
chr1 (52-198)||(21144396-21144542)
chr1 (49-198)||(470835-470984)
chr1 (52-315)||(5141528-5141780)
chr1 (64-190)||(50617376-50617503)
chr1 (155-299)||(1179878-1180022)
chr1 (1-49)||(38690030-38690078)
chr1 (49-173)||(47714877-47715001)
chr1 (49-95)||(23359217-23359263)
chr1 (99-196)||(10165606-10165703)
chr1 (55-127)||(29261529-29261601)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (1-313)||(24050126-24050449)
chr5 (49-315)||(7796736-7796992)
chr5 (46-315)||(24053309-24053578)
chr5 (1-315)||(25877720-25878045)
chr5 (49-315)||(25890153-25890409)
chr5 (49-315)||(34079789-34080045)
chr5 (49-315)||(7017670-7017926)
chr5 (46-315)||(33994807-33995066)
chr5 (52-315)||(30352589-30352845)
chr5 (49-315)||(1039449-1039719)
chr5 (49-315)||(13563800-13564056)
chr5 (49-315)||(27863562-27863818)
chr5 (49-315)||(37814741-37814997)
chr5 (49-315)||(34122683-34122953)
chr5 (79-315)||(28882177-28882403)
chr5 (1-315)||(38855815-38856130)
chr5 (49-315)||(11029167-11029422)
chr5 (52-198)||(38407308-38407454)
chr5 (49-198)||(7762008-7762157)
chr5 (52-198)||(41799534-41799679)
chr5 (49-258)||(43179605-43179814)
chr5 (49-175)||(28388307-28388433)
chr5 (51-315)||(6267635-6267889)
chr5 (1-125)||(4196654-4196790)
chr5 (166-315)||(4196792-4196929)
chr5 (179-314)||(14280637-14280762)
chr5 (253-315)||(28387913-28387975)
chr5 (64-187)||(16440192-16440315)
chr5 (106-196)||(30292292-30292382)
chr5 (4-49)||(33995074-33995119)
chr5 (279-315)||(43179523-43179559)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (49-306)||(21808-22053)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (58-315)||(43679564-43679811)
chr8 (1-315)||(43376937-43377266)
chr8 (4-315)||(4867451-4867773)
chr8 (49-313)||(39751219-39751473)
chr8 (49-315)||(2124339-2124609)
chr8 (113-315)||(7171975-7172177)
chr8 (49-315)||(39616-39872)
chr8 (89-315)||(22588100-22588316)
chr8 (4-315)||(23924069-23924380)
chr8 (50-315)||(35962467-35962722)
chr8 (49-315)||(31959705-31959975)
chr8 (49-294)||(20548938-20549173)
chr8 (49-314)||(30301292-30301549)
chr8 (49-193)||(34367070-34367214)
chr8 (1-314)||(7344215-7344530)
chr8 (1-160)||(23578534-23578704)
chr8 (87-314)||(8419602-8419819)
chr8 (53-313)||(22661234-22661484)
chr8 (52-192)||(41239010-41239150)
chr8 (87-314)||(32375849-32376066)
chr8 (49-188)||(41744023-41744162)
chr8 (66-244)||(30972593-30972771)
chr8 (49-196)||(31280969-31281118)
chr8 (237-315)||(41744160-41744238)
chr8 (49-157)||(29807044-29807152)
chr8 (1-49)||(2124277-2124325)
chr8 (1-49)||(22588324-22588372)
chr8 (49-109)||(7172465-7172525)
chr8 (1-37)||(7172550-7172586)
chr8 (4-36)||(43679499-43679531)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (1-315)||(6489428-6489758)
chr3 (1-315)||(66973-67298)
chr3 (49-315)||(4002149-4002419)
chr3 (49-313)||(21951958-21952212)
chr3 (64-315)||(46989686-46989941)
chr3 (2-315)||(9426705-9427020)
chr3 (49-314)||(6744985-6745240)
chr3 (53-314)||(13743430-13743680)
chr3 (49-315)||(36812996-36813266)
chr3 (49-315)||(48246570-48246826)
chr3 (49-198)||(600309-600458)
chr3 (2-315)||(2857640-2857955)
chr3 (52-198)||(50213619-50213765)
chr3 (49-222)||(7841254-7841427)
chr3 (52-198)||(36134048-36134194)
chr3 (1-314)||(3952873-3953188)
chr3 (49-314)||(30943348-30943605)
chr3 (87-314)||(8156706-8156923)
chr3 (49-198)||(42166177-42166326)
chr3 (49-198)||(47070627-47070776)
chr3 (49-188)||(52387958-52388097)
chr3 (49-198)||(2271513-2271663)
chr3 (52-315)||(50957337-50957604)
chr3 (49-191)||(9473721-9473863)
chr3 (49-198)||(16646939-16647087)
chr3 (1-152)||(14402808-14402970)
chr3 (234-315)||(14402663-14402744)
chr3 (234-315)||(2743789-2743870)
chr3 (127-195)||(2743678-2743746)
chr3 (99-197)||(7314585-7314683)
chr3 (49-104)||(2743556-2743611)
chr3 (49-104)||(4005003-4005058)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (1-315)||(19755-20085)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (49-315)||(15613-15869)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (49-315)||(4984-5241)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (49-312)||(22560-22826)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (49-303)||(8358-8602)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (49-198)||(236001-236150)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (49-193)||(12562-12706)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (1-130)||(1517-1657)
scaffold0169 (259-315)||(10922-10978)
[»] scaffold0794 (1 HSPs)
scaffold0794 (236-315)||(1409-1488)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 51642117 - 51642423
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagtttttaaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtc 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51642117 ttctgcataattttaaagcattttcaaaccatttttcggtcagtttttaaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcgatc 51642216  T
Q  101 ataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgtt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51642217 ataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgtt 51642316  T
Q  201 ataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatac 300  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51642317 acaaattgtccataattaaacaacacattacaactcattacatatcattaagttaaatcccaacttacattcatcacaattacatatagaacgaacatac 51642416  T
Q  301 atatata 307  Q
    |||||||    
T  51642417 atatata 51642423  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 44051066 - 44050737
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  44051066 ttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 44050967  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44050966 gaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattc 44050867  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcat 285  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||     ||  |    ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  44050866 atcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttgcattcaacgcaattgcat 44050767  T
Q  286 atagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  44050766 atggaacgaacatacatatataatatatta 44050737  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 38460525 - 38460840
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  38460525 ttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacatt 38460624  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38460625 gaaactcggtcataaacaagaaaaatataatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttgattcaaattacacaaaagtttgaaattc 38460724  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38460725 atcaaaatgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatgc 38460814  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38460815 aacaaacatacatatataatatatta 38460840  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 18578722 - 18579047
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||  ||||||||           ||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||    
T  18578722 ttctgcataattgttaagcatttccaagccatttttcggctagtttttacttgtaattcaaccagagtatttccaaaggcaatataacttatacaacatt 18578821  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
     ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18578822 taaactcactcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattc 18578921  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    ||||||| |||| | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||||||||||    
T  18578922 atcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatcacttcttacattcaacgcaattgcatatag 18579021  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18579022 aactaacatacatatataatatatta 18579047  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10423377 - 10423066
Alignment:
Q  4 tgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaa 92  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||           ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10423377 tgcataaatctaaagcaattccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaa 10423278  T
Q  93 actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10423277 actcggtcataaacaagaaaaataca-tatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacattaggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatc 10423179  T
Q  193 aaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaac 292  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||          ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  10423178 aaaacgttacaatgtgtccataattaa----------acaactcattacatatcattagattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaac 10423089  T
Q  293 gaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10423088 gaacatacatatataatatatta 10423066  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 124 - 315
Target Start/End: Original strand, 24415392 - 24415583
Alignment:
Q  124 ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||     
T  24415392 ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaa 24415491  T
Q  224 cacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24415492 cacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 24415583  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 50905136 - 50904821
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||           ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  50905136 ttctgcataattctaatgcatttccaagccatttttcggccaatttttacctgtaattaaaccagagcatttctaaatgcaatataaatcatacaacatt 50905037  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50905036 gaaactcgaacataaacaagaaaaatatgaaatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaacgtttgaaattc 50904937  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||    ||      ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  50904936 atcaaaacgatacaaagtgttcataattaaaca----at------tcatttcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatgg 50904847  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||    
T  50904846 aacaaacatacaaatataatatatta 50904821  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 46 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4774531 - 4774262
Alignment:
Q  46 tttaaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaa 145  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4774531 tttaaccagagcatttccaaagccaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaa 4774432  T
Q  146 atcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatat 245  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | |||||||   |||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  4774431 atcaaatcgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacat 4774332  T
Q  246 cattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4774331 cattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatatta 4774262  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37395131 - 37394861
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37395131 aaccagagcatttccaaaggaaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatt 37395032  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacata 244  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     ||  |    ||| ||||||||| |    
T  37395031 aaaccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacaca 37394932  T
Q  245 tcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37394931 tcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 37394861  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3408154 - 3407897
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  3408154 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 3408055  T
Q  149 aaaccgacatttt-gttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatca 247  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| ||||    
T  3408054 aaaccgacattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatca 3407965  T
Q  248 ttaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3407964 ttaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 3407897  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 315
Target Start/End: Original strand, 10374240 - 10374454
Alignment:
Q  91 aaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattca 190  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10374240 aaactcggtcataaccaagaaaaatacaataccttttacagttgtccataattaaatgaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattca 10374339  T
Q  191 tcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatataga 290  Q
    ||||||| ||| ||  |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  10374340 tcaaaacattacaaggtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatgga 10374429  T
Q  291 acgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10374430 acgaacatacatatataatatatta 10374454  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 314
Target Start/End: Original strand, 49563999 - 49564256
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaa 146  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||   |  |||||||||||| |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  49563999 aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatattttacaattgttcataattaaa 49564098  T
Q  147 tcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatc 246  Q
    | |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||    
T  49564099 ttaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatc 49564188  T
Q  247 attaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49564189 attaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatatt 49564256  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 101 - 315
Target Start/End: Original strand, 6186859 - 6187073
Alignment:
Q  101 ataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgtt 200  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| ||    
T  6186859 ataaacaagaaaaatacattatcttttatagtagtcaataattaaatcaatccgacatttcgttaaaattacacgtatgtttgaaattcatcaaaacatt 6186958  T
Q  201 ataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatac 300  Q
    | |   |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  | || |||||||| ||||||||||||    
T  6186959 aaagggtgtccataattaaacaacacattacaacatattacatatcattaaattaaatctctactgacattctacgcatttgcatatggaacgaacatac 6187058  T
Q  301 atatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||    
T  6187059 atatataatatatta 6187073  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 193
Target Start/End: Original strand, 51492230 - 51492374
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51492230 aaccagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcgaacataaacaagataagtacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 51492329  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatca 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51492330 aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 51492374  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50278734 - 50278588
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||   |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  50278734 cagagcatttcgaaaggcaaaataatctatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattattcataattaaatcaaa 50278635  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  50278634 ccgacatttggttgaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 50278588  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Original strand, 44674299 - 44674440
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    ||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44674299 cagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataagtacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 44674398  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatca 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  44674399 ccgacatttggttcaaattacacaaacatttaaaattcatca 44674440  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 19069345 - 19069615
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||  | || |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  19069345 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtaaaatatcttttacaattgttcataattaaatt 19069444  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattca--------------tcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagc 234  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||              ||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   |    
T  19069445 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---c 19069534  T
Q  235 tcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19069535 tcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatgtataatatatta 19069615  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Original strand, 37016057 - 37016206
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || |||||||  |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016057 aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacatcattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 37016156  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||| ||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  37016157 aaactgacgtttgattcaaattacagaaacgtttgaaattcatcataacg 37016206  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 195
Target Start/End: Original strand, 15995880 - 15996026
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  15995880 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaagtcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 15995979  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaa 195  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15995980 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaa 15996026  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 236 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11506831 - 11506752
Alignment:
Q  236 cattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11506831 cattacacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 11506752  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30043346 - 30043081
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| ||| | |||  |||||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30043346 aaccagagcatttcaagaggcaatactattcgtacaacatttatactaagtcataaacaagaaaaatgtattatcttttacaattatccataattaaatc 30043247  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    || ||||| |   ||| |||||||||  | |||||||||| |||||||| ||| | | || ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| |    
T  30043246 aatccgacgtagagttaaaattacacggatgtttgaaatttatcaaaacattaaagagtg-ccataattaaacaacacactacaacacattacatatcgt 30043148  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattc-atcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| | ||||| ||  | |||||| || | | ||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30043147 taaatgaaatctctggtgacattctatga-agttgcaaatggaacgaaaatacaaatataatatatta 30043081  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 24414934 - 24414982
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  24414934 ttctgcataattctaaagcatttccaagccatttatcggacagttttta 24414982  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Original strand, 31598700 - 31598798
Alignment:
Q  98 gtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaac 197  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||  || |||||||||||  ||||| || ||| ||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  31598700 gtcataaacaagaacaatacataatctttcacaattgatcaaaattaaatcaattcgaca-ttcgttaaaattacatgaatgtttgaaattcaacaaaac 31598798  T

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Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 311
Target Start/End: Original strand, 12111394 - 12111636
Alignment:
Q  69 caatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaa 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12111394 caatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttataattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaa 12111493  T
Q  169 ttacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttac 268  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12111494 ttacaccaaagtttaaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacaatacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttac 12111593  T
Q  269 attcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatat 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12111594 attcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatat 12111636  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 10705347 - 10705670
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||           |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  10705347 ttctgcataattctaaagcacttccaagtcatttttcggtcaatttttacatgtaatttaaccaaagcatttctaaaggcaatataacttatacaacatt 10705446  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
     |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10705447 taaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttaaaattc 10705546  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    ||||||| |||| | | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10705547 atcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaatacattacaactcattacacatcaataaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatag 10705646  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10705647 aacgaacatacatatataatatat 10705670  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 34622598 - 34622913
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  34622598 ttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 34622697  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34622698 gaaactcggtcataaataagaaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattc 34622797  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||| | |||||||||||      
T  34622798 atcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaaattaaacttctacttacattcaacgcaattgcatatga 34622887  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  34622888 aacgaacatacatatataatatatta 34622913  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Original strand, 19044395 - 19044721
Alignment:
Q  4 tgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaa 92  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||           ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19044395 tgcataattctaatgcatttccaagccatttttcggctagtttttacctgtaattaaaccagagaatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaa 19044494  T
Q  93 actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc 192  Q
    | | |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19044495 attgggtcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatc 19044594  T
Q  193 aaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatata 288  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||     ||  |    |||  |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||     
T  19044595 aaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaaatcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatg 19044694  T
Q  289 gaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19044695 gaacgaacatacatatataatatatta 19044721  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20710241 - 20709915
Alignment:
Q  4 tgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaa 92  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||           ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20710241 tgcataattctaatgcatttccaagccatttttcggctagtttttacctgtaattaaaccagagaatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaa 20710142  T
Q  93 actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc 192  Q
    | | |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20710141 attgggtcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatc 20710042  T
Q  193 aaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatata 288  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||     ||  |    |||  |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||     
T  20710041 aaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaaatcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatg 20709942  T
Q  289 gaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20709941 gaacgaacatacatatataatatatta 20709915  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18109767 - 18109451
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatat 88  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||           ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||    
T  18109767 ttctgcataattctaaa-catttccaaaccattttttcggccagtttttatctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagat 18109669  T
Q  89 tgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttt-gttcaaattacacaaaagtttgaaat 187  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  18109668 tgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaat 18109569  T
Q  188 tcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatat 287  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18109568 tcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatat 18109479  T
Q  288 agaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  18109478 ggaacgaacatacatatataatatatta 18109451  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15070265 - 15070008
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  15070265 aaccagagcatttccaaaggctaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 15070166  T
Q  149 aaaccgacatttt-gttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatca 247  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| ||||    
T  15070165 aaaccgacattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatca 15070076  T
Q  248 ttaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15070075 ttaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 15070008  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 47742903 - 47742647
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| ||||||||  || || ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47742903 aaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatacaacattgaaacatggacaaaaacaagataaatgcaatatcttttacaattgtccataattaaatt 47742804  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||    
T  47742803 aaaccaacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat 47742714  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47742713 taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 47742647  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 42503753 - 42503496
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    ||||||||||| || |||||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||     
T  42503753 aaccagagcatctccaaaggctaaataattcatgcaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttataattgttcatgattaaatt 42503654  T
Q  149 aaaccgacatttt-gttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatca 247  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| ||||    
T  42503653 aaaccaacattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatca 42503564  T
Q  248 ttaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42503563 ttaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 42503496  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 603938 - 604194
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||  |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  603938 aaccagaacatttccaaaggtaaaataattcatacaagattgaaactcgaacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 604037  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    ||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||    
T  604038 aaatcgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcat 604127  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  604128 taaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaacaaacatacatatataatatatta 604194  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 47065148 - 47064952
Alignment:
Q  123 cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaa-- 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||      
T  47065148 cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttgatttaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtatccataattaaatg 47065049  T
Q  221 --cagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
      ||  |    ||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47065048 tccataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 47064952  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 5537947 - 5538152
Alignment:
Q  2 tctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta---------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaa 92  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||         | ||||||||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||    
T  5537947 tctgcatgattctaaaacattttcaagccatttttcggtcagtttttacgtaattaaagcagagcatttcgaaagggaaaataattcatacaacattgaa 5538046  T
Q  93 actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc 192  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5538047 actcggacataaacaagaaaaataaaatatcttatacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattatacaaacgtttgaaattcatc 5538146  T
Q  193 aaaacg 198  Q
    | ||||    
T  5538147 ataacg 5538152  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17838549 - 17838400
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17838549 aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 17838450  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  17838449 aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcataacg 17838400  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 30790922 - 30790665
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaa 146  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||   |  |||||||||||| |||||  ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30790922 aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatagaatatcttttacaattgttcataattaaa 30790823  T
Q  147 tcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatc 246  Q
    | |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||    
T  30790822 ttaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatc 30790733  T
Q  247 attaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30790732 attaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatatt 30790665  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40928867 - 40928719
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  40928867 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 40928768  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaac 197  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40928767 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaac 40928719  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 45767736 - 45767519
Alignment:
Q  87 attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa 186  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||    
T  45767736 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 45767637  T
Q  187 ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata 286  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  45767636 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 45767547  T
Q  287 tagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  45767546 tggaacgaacatacatatataatatatt 45767519  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34742367 - 34742168
Alignment:
Q  2 tctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagtttttaacc-----------agagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattg 90  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |            |||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||    
T  34742367 tctgcatgattctaaaacatttccaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaagtagagcatttcgaaaggcaaaa-aattcatacaacattg 34742269  T
Q  91 aaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattca 190  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34742268 aaactcggacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaatcgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattca 34742169  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 314
Target Start/End: Original strand, 43619877 - 43620094
Alignment:
Q  87 attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa 186  Q
    |||||||||| | |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||    
T  43619877 attgaaactcagacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 43619976  T
Q  187 ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata 286  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  43619977 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 43620066  T
Q  287 tagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43620067 tggaacgaacatacatatataatatatt 43620094  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 188
Target Start/End: Original strand, 29592702 - 29592841
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  29592702 aaccagagcatttccaaaggaaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatattttttacaattgtccataattaaatt 29592801  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaatt 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  29592802 aaaccgacatttggttcaaattacacaaacttttgaaatt 29592841  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13323683 - 13323480
Alignment:
Q  6 cataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagtttttaac-----------cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaac 94  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |           ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||    
T  13323683 cataattctaaaacatttccaagccatttttcgggcagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggtaaaataattcatacaacgttgaaac 13323584  T
Q  95 tcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaa 194  Q
    |  | ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  13323583 tgagacattaacaagaaaaatacaatattttttacaattttccataattaaattaaaccggcatttcgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcat 13323484  T
Q  195 aacg 198  Q
    ||||    
T  13323483 aacg 13323480  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10522365 - 10522280
Alignment:
Q  113 aatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  10522365 aatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcataacg 10522280  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 315
Target Start/End: Original strand, 29592839 - 29592917
Alignment:
Q  237 attacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  29592839 attacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatgtatta 29592917  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 36186473 - 36186425
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  36186473 ttctgcataattctaaagcattttcaagccatttttcggtcagttttta 36186425  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 88
Target Start/End: Original strand, 12111360 - 12111399
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatat 88  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12111360 aaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatacaatat 12111399  T

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Target: chr2 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Original strand, 43943792 - 43944116
Alignment:
Q  4 tgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaa--tataaatcatacaatattg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||     
T  43943792 tgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaatataaatcatacaacatta 43943891  T
Q  91 aaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattca 190  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43943892 aaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaaaaaagtttgaaattca 43943991  T
Q  191 tcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatataga 290  Q
    ||||||||||| ||| |||||||   |||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  43943992 tcaaaacgttacaaagtgtccatgcataaacaacacattacaattcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatgga 43944091  T
Q  291 acgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  43944092 acgaacatacatatatattatatta 43944116  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 12905622 - 12905944
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta--------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaa 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  12905622 ttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcgaccagtttttactaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataactcatacaacatttaa 12905721  T
Q  93 actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc 192  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12905722 actcagtcataaacaagtaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatc 12905821  T
Q  193 aaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaac 292  Q
    ||||||||| | | |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  12905822 aaaacgttacatagtgtcaataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccgtacttacattcaacgcaattgcatatggaac 12905921  T
Q  293 gaacatacatatataatatatta 315  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  12905922 aaacatacatatataatatatta 12905944  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 41004627 - 41004949
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||           |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  41004627 ttctgcataattctaaagcatttcaaagccatttt-cggtcagtttttacctgtaattaaaccgaagcatttccaaagacaatataaatcatacaacatt 41004725  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41004726 gaaactcggtcataaacaagaaaaatataatatcttttacaattgtctataattaaatcaaaccaacatttggtttaaattacacaaaagtttgaaattc 41004825  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41004826 atcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattatattaaatcactacttacattcatcacaattgcatatgg 41004925  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatat 313  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  41004926 aatgaacatacatatataatatat 41004949  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 28342622 - 28342937
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||           |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  28342622 ttctgcataattctaaagaatttccaaactatttttcggccagtttttatctgtaattaaaccagaacatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 28342721  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28342722 gaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattc 28342821  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    ||      |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  28342822 atcaaaacgttacaaagtgttcataattaaaca----at------tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatgg 28342911  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28342912 aacgaacatacatatataatatatta 28342937  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 24601739 - 24602066
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  24601739 ttctacataattcaaaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 24601838  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  24601839 gaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacagacgtttgaaattc 24601938  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcat 285  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||     ||  |    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24601939 atcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcat 24602038  T
Q  286 atagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  24602039 atggaacgaacat--atatataatatatta 24602066  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24612375 - 24612048
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  24612375 ttctacataattcaaaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 24612276  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  24612275 gaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacagacgtttgaaattc 24612176  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcat 285  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||     ||  |    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24612175 atcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcat 24612076  T
Q  286 atagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  24612075 atggaacgaacat--atatataatatatta 24612048  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Original strand, 41181513 - 41181825
Alignment:
Q  4 tgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaa 92  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41181513 tgcataattctaatgcatttccaagccattttttgggcagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaa 41181612  T
Q  93 actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc 192  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41181613 actcggtcataactaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatc 41181712  T
Q  193 aaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaac 292  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  41181713 aaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaac 41181802  T
Q  293 gaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41181803 gaacatacatatataatatatta 41181825  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 439792 - 439468
Alignment:
Q  4 tgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  439792 tgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagcgcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaa 439693  T
Q  93 actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc 192  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  439692 actcggtcataaacaagaa--atacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatc 439595  T
Q  193 aaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatata 288  Q
    ||| ||||| ||| | |||||||||||     ||  |    ||| ||||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  439594 aaagcgttacaaagtatccataattaagtgttcataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctccttacattcatcacaattgcatatg 439495  T
Q  289 gaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  439494 gaacgaacatacatatataatatatta 439468  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 82236 - 81908
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||     
T  82236 ttctgcataattctaaagcattttcaaaccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcatttctaaaggcagtataaatcatccaacatc 82137  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  82136 aaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccat-attaaatcaaaccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattc 82038  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaa-acagcacatt---acagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcat 285  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||    ||| | |   ||| ||||||||| || ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  82037 atcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtgcataattaaacaactcattacacatgattatattaaatgcatacttacattcatcacaattgcat 81938  T
Q  286 atagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  81937 atggaacgaacatacatatataatatatta 81908  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 45479794 - 45479479
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||           ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||    
T  45479794 ttctgcataattctaaagcattttcaagctatttttcggccagtttttacttgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataactaatacaacatt 45479695  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
     |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  45479694 taaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacaaaaaagtttgaaattc 45479595  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||| ||          ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  45479594 atcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaaca----------cattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatgg 45479505  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  45479504 aacgaacatacatatataatatatta 45479479  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 41052721 - 41052950
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||           ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  41052721 ttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagtatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 41052820  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41052821 gaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattc 41052920  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaa 219  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  41052921 atcaaaacgttacaaagtgtccataattaa 41052950  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9660026 - 9659702
Alignment:
Q  4 tgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaa 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9660026 tgcataattctaaaacatttccaagccatttttcggccagtttttacctttaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaa 9659927  T
Q  93 actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  9659926 actcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaacgacatttggttaaaattacacaaacgcttgaaattcatc 9659827  T
Q  193 aaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatata 288  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||     ||  |    ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||     
T  9659826 aaaacgttacacagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatacctacttacattcaacgcaattgcatatt 9659727  T
Q  289 gaacgaacatacatatataatatat 313  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  9659726 gaacgaacatacaaatataaaatat 9659702  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 1096728 - 1096998
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  1096728 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcggacataaacaagataaatacagtatcttttacaattgtccataattaaatt 1096827  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacata 244  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     ||  |    ||| |||||||||||    
T  1096828 aaaccgacatttggttcaaactacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgttcataattaaacaactcattacata 1096927  T
Q  245 tcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1096928 tcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 1096998  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24753938 - 24753682
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  24753938 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactgggacataaacaagataaatacaatatcttttacaatttttcataattaaatt 24753839  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||    
T  24753838 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat 24753749  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24753748 taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacaaacatacatatataatatatta 24753682  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38950480 - 38950232
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  38950480 aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 38950381  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||    
T  38950380 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcat 38950291  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatata 307  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38950290 taaattaaatccctacttacattcaacacaattacatatggaacgaacatacatatata 38950232  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7267417 - 7267102
Alignment:
Q  2 tctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||           ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| |||    
T  7267417 tctgcataattgtaaagcatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatttatacaagatt 7267318  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    ||||||||| |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  7267317 gaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaacctacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattc 7267218  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  7267217 atcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattacatatgg 7267128  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7267127 aacgaacatacatatataatatatta 7267102  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25184804 - 25184606
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||           ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  25184804 ttctgtataattctaaaacatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagtattttcaaaggcaatataaatcatacaacatt 25184705  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaatt 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25184704 gaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgatatttggttcaaattacacaaacgtttgaaatt 25184606  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 39798329 - 39798098
Alignment:
Q  73 ataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttt-gttcaaatta 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||    
T  39798329 ataattcatacaatattgaaactcggtcataatcaagataaatgcaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaacatta 39798230  T
Q  172 cacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacatt 271  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39798229 aacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaa--gtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatctctacttacatt 39798142  T
Q  272 catcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    || | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39798141 caacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatatta 39798098  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41564406 - 41564149
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaa 146  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||   |  |||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41564406 aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaa 41564307  T
Q  147 tcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatc 246  Q
    | |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||    
T  41564306 ttaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatc 41564217  T
Q  247 attaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41564216 attaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatatt 41564149  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39951085 - 39950936
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39951085 aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 39950986  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  39950985 aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcataacg 39950936  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 3795495 - 3795765
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  3795495 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 3795594  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattca--------------tcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagc 234  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||              ||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   |    
T  3795595 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---c 3795684  T
Q  235 tcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3795685 tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 3795765  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Original strand, 10825377 - 10825526
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10825377 aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 10825476  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10825477 aaacagacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 10825526  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5351607 - 5351390
Alignment:
Q  87 attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa 186  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||    
T  5351607 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 5351508  T
Q  187 ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata 286  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  5351507 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 5351418  T
Q  287 tagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5351417 tggaacgaacatacatatataatatatt 5351390  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 314
Target Start/End: Original strand, 10620171 - 10620388
Alignment:
Q  87 attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa 186  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||    
T  10620171 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 10620270  T
Q  187 ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata 286  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  10620271 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 10620360  T
Q  287 tagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10620361 tggaacgaacatacatatataatatatt 10620388  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 198
Target Start/End: Original strand, 32952892 - 32953038
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  32952892 cagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcagacatcaacaagaaaaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaa 32952991  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32952992 ccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 32953038  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 314
Target Start/End: Original strand, 209182 - 209399
Alignment:
Q  87 attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa 186  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||    
T  209182 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 209281  T
Q  187 ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata 286  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| ||||    
T  209282 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacata 209371  T
Q  287 tagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  209372 tggaacgaacatacatatataatatatt 209399  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 198
Target Start/End: Original strand, 29398071 - 29398213
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  29398071 cagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataa----gaaaaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaa 29398166  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  29398167 ccgacatttagttcaaattacacaaatgtttgaaattcatcataacg 29398213  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 229
Target Start/End: Original strand, 3206956 - 3207086
Alignment:
Q  99 tcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3206956 tcataaacaagaaagatacattatcttttacaattgtctataattaaatcaaaccgacatttagttcaaagtatacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 3207055  T
Q  199 ttataaattgtccataattaaacagcacatt 229  Q
    ||  |   |||||||||||||| | ||||||    
T  3207056 ttgcatggtgtccataattaaaaatcacatt 3207086  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 273
Target Start/End: Original strand, 18000430 - 18000606
Alignment:
Q  87 attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa 186  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||    
T  18000430 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 18000529  T
Q  187 ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattca 273  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18000530 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattca 18000606  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 196
Target Start/End: Original strand, 25613379 - 25613508
Alignment:
Q  66 aggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttc 165  Q
    |||||||| || |||||||  ||| ||| || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| | | |||||||||     
T  25613379 aggcaatacaactcatacatcatttaaaatcagtcataaacaagaa-aatacataatcttttacaattgaccaaaattaaatcaatcaggcattttgttt 25613477  T
Q  166 aaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaa 196  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  25613478 aaattacaagaatgtttgaaattcatcaaaa 25613508  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1150769 - 1150692
Alignment:
Q  235 tcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatata 312  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1150769 tcattacacatcattaaattaaatcactacttacattcaatgaaattgcatatggaacgaacatacatatataatata 1150692  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Original strand, 43668329 - 43668414
Alignment:
Q  98 gtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttg 183  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||| |||| || ||| ||||||||||| | || ||||  || |||||||||||| |||||    
T  43668329 gtcataaacaagaacaatacataatctttcacaactgaccaaaattaaatcaatctgatatttcattaaaattacacaaatgtttg 43668414  T

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Target: chr6 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18610206 - 18609893
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  18610206 ttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacatgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacatt 18610107  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18610106 gaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatctggttcgaattacacaaacgtttgaaattc 18610007  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18610006 atcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatgg 18609917  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18609916 aacgaacatacatatataatatat 18609893  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 46 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29667750 - 29667481
Alignment:
Q  46 tttaaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaa 145  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||  || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29667750 tttaaccagagcattttcaaaggcaatataacttatacaacttttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaa 29667651  T
Q  146 atcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatat 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  29667650 atcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacat 29667551  T
Q  246 cattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29667550 cattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 29667481  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 29286302 - 29286617
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||           ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||    
T  29286302 ttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagtttttacttgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacgtt 29286401  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29286402 gaaactcggtcttaaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattc 29286501  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  29286502 atcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaaattaaacctctacttacattcaacgcaattgcatatgg 29286591  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29286592 aacgaacatacatatataatatatta 29286617  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 7537286 - 7537615
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  7537286 ttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 7537385  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7537386 gaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttaaaattacacaaacgtttgaaattc 7537485  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcat 285  Q
    ||| |||| ||| ||| |||||||||||||     ||  |    |||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  7537486 atctaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaaatcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaaatgcat 7537585  T
Q  286 atagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  7537586 atggaacgaacatacatatataatatatta 7537615  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25141079 - 25140763
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||||           |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25141079 ttctgcataattctaaagcattttcaagccatttttcggccaagttttacctgtaattaaaccagaacatttccaaaggcaatataaatcatacaatatt 25140980  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25140979 gaaactcggccataaacaagaaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattaaacaaacgtttgaaattc 25140880  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  25140879 atcaacacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatgg 25140790  T
Q  290 aacgaacataca-tatataatatatta 315  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25140789 aacgaacatacattatataatatatta 25140763  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 23958990 - 23959305
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||           ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||    
T  23958990 ttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcgaccagattttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatt 23959089  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
     |||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23959090 taaactcagtcataaacaagtaaaatacaatattttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattc 23959189  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    ||||||| |||| | | |||||||||||||||| ||          ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23959190 atcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaaca----------cattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatag 23959279  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23959280 aacgaacatacatatataatatatta 23959305  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 52 - 315
Target Start/End: Original strand, 2051189 - 2051456
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2051189 cagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcgatcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaa 2051288  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatca 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||     ||  |    ||| ||||||||| ||||    
T  2051289 ccgacattttgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgataaaaagtgttaataattaagtgttcataattaaacaactcattacacatca 2051388  T
Q  248 ttaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2051389 ttaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 2051456  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 51 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31150977 - 31150723
Alignment:
Q  51 ccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa 150  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31150977 ccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaaggtaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa 31150878  T
Q  151 accgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcatta 250  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||||    
T  31150877 accgacatttggttccaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcatta 31150788  T
Q  251 agttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  31150787 aattaaatccctacatacattcaacgcaattgcatatcgatcaaacatacatatataatatatta 31150723  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28362703 - 28362375
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||           ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||    
T  28362703 ttctgcataattctaaa-catttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataaatcatataacatt 28362605  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  28362604 gaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacagttgtctaaaattaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaccgattgaaattc 28362505  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaa----cagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcat 285  Q
    | |||||||||| ||| ||| ||||||||||    || ||    ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  28362504 aacaaaacgttacaaagtgttcataattaaatgtccatcattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacatacattctacacaattgcat 28362405  T
Q  286 atagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||    
T  28362404 atcgatcgaacatacatatataatatatta 28362375  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26702622 - 26702448
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26702622 cagagcatttccaaaggcagtataaatcatacaacatagaaattcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaat-aaa 26702524  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcaca 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  26702523 ccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaacaca 26702448  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 314
Target Start/End: Original strand, 1608451 - 1608708
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaa 146  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||   |  |||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1608451 aaccagagcatttccaaaagtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaa 1608550  T
Q  147 tcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatc 246  Q
    | |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||    
T  1608551 ttaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatc 1608640  T
Q  247 attaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1608641 attaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatatt 1608708  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3502577 - 3502429
Alignment:
Q  50 accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca 149  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3502577 accagagcatttcaaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaacttggccataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca 3502478  T
Q  150 aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3502477 aaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 3502429  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11840222 - 11840022
Alignment:
Q  2 tctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattg 90  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||           |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  11840222 tctgcataattctaaaacatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagaacatttccaaaggcaaaataattcatacaacattg 11840123  T
Q  91 aaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattca 190  Q
    |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11840122 aaactcgaacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattca 11840023  T
Q  191 t 191  Q
    |    
T  11840022 t 11840022  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31771646 - 31771505
Alignment:
Q  57 catttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgac 156  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31771646 catttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatattttttacaattgttcataattaaattaaaccgac 31771547  T
Q  157 attttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31771546 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 31771505  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18351557 - 18351385
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18351557 aaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 18351458  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaac 221  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  18351457 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac 18351385  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 13382786 - 13383056
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13382786 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagtttgaaactcggacataataaagataactacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 13382885  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattca--------------tcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagc 234  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||              ||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   |    
T  13382886 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---c 13382975  T
Q  235 tcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13382976 tcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 13383056  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20448701 - 20448506
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||  ||| | |||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20448701 aaccagagcatttacagaggcaatataactcatacaccatttatacttagtcataaacaagaagaatacattatcttttacagttgtccataattaaatc 20448602  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacata 244  Q
    || ||||||||| ||| |||||| |  || ||||||||||||| ||||| ||| | | |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  20448601 aatccgacatttcgttaaaattagaggaatgtttgaaattcataaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacatttcatatcattacata 20448506  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 315
Target Start/End: Original strand, 34230682 - 34230895
Alignment:
Q  93 actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaag-tttgaaattcat 191  Q
    |||| |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  || | ||||||||||||    
T  34230682 actcagtcataaagaataaaaatacattatcttttacaattgtctataattaaatcaaaccgacatttcgttaaaattacatgaatgctttgaaattcat 34230781  T
Q  192 caaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaa 291  Q
    |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||          ||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||  |||| ||||| || |||    
T  34230782 caaaacattaaagagtgtccataattaaacaaca----------cattacacatcgttaaattaaatctctactaacattctacacagttgcagatggaa 34230871  T
Q  292 cgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34230872 cgaacatacatatataatatatta 34230895  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 168
Target Start/End: Original strand, 8304596 - 8304715
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  |||||||| |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8304596 aaccagagcatttccaaagccaatatacctcatacaacatttgcactcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttacaattgtccataattaaatc 8304695  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaa 168  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  8304696 aaaccgacatttggttcaaa 8304715  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20439919 - 20439753
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || |||||||  ||| | |||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20439919 aaccagagcatttccagaggcaatacaactcatacaccatttatacttagtcataaacaagaggaatacattatcttttacagttgtccataattaaatc 20439820  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataa 215  Q
    || ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||| ||| | | |||||||||    
T  20439819 aatccgacattttgttaaaattacaggaatgtttgaaattcatgaaaacattaaagagtgtccataa 20439753  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 145
Target Start/End: Original strand, 2258444 - 2258540
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaa 145  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2258444 aaccagagcattttcaaaggcaatataactcatacaacatttaaactcagtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaa 2258540  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20436211 - 20436063
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| | ||  |||| || |||||||  ||| | |||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20436211 aaccagagcatttccagagaaaatacaattcatacaccatttatacttagtcataaacaagaggaatacattatcttttacagttgtccatgattaaatc 20436112  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaac 197  Q
    || |||||||||| || ||||||||  || ||||||||||||| |||||    
T  20436111 aatccgacattttattaaaattacatgaatgtttgaaattcatgaaaac 20436063  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 197
Target Start/End: Original strand, 19129180 - 19129281
Alignment:
Q  93 actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc 192  Q
    |||| |||||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  19129180 actcagtcataaacaagaatg---cattatcttttacagttgtccataattaaatcaatctgacatttcgttgaaattacacgaatgtttgaaattcatc 19129276  T
Q  193 aaaac 197  Q
    |||||    
T  19129277 aaaac 19129281  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 315
Target Start/End: Original strand, 2259338 - 2259499
Alignment:
Q  143 taaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattaca 242  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| || |||| |    
T  2259338 taaatgaaaccgacatttggttcaaaatgcacaaaatgttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaacttattaaa 2259437  T
Q  243 tatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |          ||||||| |||||||||||| |  | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2259438 t----------taaatccttacttacattcaacgta-ttgcatatggaacaaacatgcatatataatatatta 2259499  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 29667803 - 29667758
Alignment:
Q  4 tgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta 49  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29667803 tgcataattccaaagcacttccaagccatttttcggccagttttta 29667758  T

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Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 45)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4518389 - 4518052
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||           |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  4518389 ttctgcataattctaaagcattttcaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaaccaaagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 4518290  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4518289 gaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattc 4518190  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataa--------------ttaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatc 275  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||              ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  4518189 atcagaacgttacaaaatgtccataattaagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcatta--tataatccctacttacattcatc 4518092  T
Q  276 acaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4518091 acaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 4518052  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 51666639 - 51666324
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||||||           |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  51666639 ttctgcataattctaaagcattctcaagccatttttcggccaatttttacctgtaattaaaccaaagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 51666540  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  51666539 gaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacataaaagtttgaaattc 51666440  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51666439 atcaaaaagttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatgg 51666350  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  51666349 aacgaacatacatatataatatatta 51666324  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 8459057 - 8459372
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||           |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  8459057 ttctgcataattctaaagcatttctaagccatttttcgaccagtttttacctgtaattaaaccatagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 8459156  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8459157 gaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattc 8459256  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  8459257 atcaaaacgttaaaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatgattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatag 8459346  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8459347 aacgaacatacatgtataatatatta 8459372  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 19495139 - 19495467
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| |||||||||           ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||    
T  19495139 ttctgcataattgttaagcatttccaagctatttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatacaacatt 19495238  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
     |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19495239 taaactcagtcataaataagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattc 19495338  T
Q  190 atcaaa---acgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata 286  Q
    ||||||     |||| | | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19495339 atcaaacgcgtgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaagtcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcata 19495438  T
Q  287 tagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19495439 tagaacgaacatacatatataatatatta 19495467  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 7966082 - 7966404
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||           ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||    
T  7966082 ttctgcataattctaaagcacttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatt 7966181  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatctttt-acaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaatt 188  Q
     |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7966182 taaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatctttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaatt 7966281  T
Q  189 catcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatata 288  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  7966282 catcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattaca----tttacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatg 7966377  T
Q  289 gaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7966378 gaacgaacatacatatgtaatatatta 7966404  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 36072468 - 36072787
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaact 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||     ||||||     |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| | | |||||    
T  36072468 ttctgcataattctaaagcattttcaaatcatttttcgaaatttttttacctgtaccagaacatttccaaaggcaatataacttatacaacagttaaact 36072567  T
Q  96 cggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaa 195  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36072568 cagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaa 36072667  T
Q  196 acgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaa 295  Q
    || ||| | | ||||||| |||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  36072668 acattagatagtgtccatgattaaacaacatattacaactcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaa 36072767  T
Q  296 catacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36072768 catacatatataatatatta 36072787  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13178051 - 13177784
Alignment:
Q  46 tttaaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaa 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||   |||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13178051 tttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatat--tatttaaactcagtcataaacaagtaaaatataatatcttttacaattgtccataattaa 13177954  T
Q  146 atcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatat 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  13177953 atcaaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccatagttaaacaacacattacaactcattacacat 13177854  T
Q  246 cattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13177853 tattaaattaaatccctacttactttcaatgcaattgcatatggaatgaacatacatatataatatatta 13177784  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 46979231 - 46978892
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||           | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  46979231 ttctgcataattctaaaacattttcaagctatttttcggtcagtttttacttgtaattaaatcagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 46979132  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  46979131 gaaactcggtcataaacaagaaaaatagaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacagacatttgattcaaattacacaaaagtttgaaattc 46979032  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataa--------------ttaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatc 275  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||              ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  46979031 atcaaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaacacattacaattcattacacatcattatattaaatccctacttacattcatc 46978932  T
Q  276 acaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  46978931 acaattgcattaggaacgaacatacatatataatatatta 46978892  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 46 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1656007 - 1655738
Alignment:
Q  46 tttaaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaa 145  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||| ||| |  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1656007 tttaatcagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaatttagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaa 1655908  T
Q  146 atcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatat 245  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | |||||   |||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  1655907 atcaaacggacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaatcgttacatagtatccatgcataaacaacacattacaactcattacacat 1655808  T
Q  246 cattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1655807 cattaaattaaatcattacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 1655738  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 9710678 - 9710992
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||           || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||| |||    
T  9710678 ttctgcataattctaaa-catttccaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaacaagagtatttccaaaggtaaaataattcatacaacatt 9710776  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9710777 gaaactaggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaactgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattc 9710876  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  9710877 atcaaaatgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatgg 9710966  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  9710967 aaagaacatacatatataatatatta 9710992  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 93 - 315
Target Start/End: Original strand, 33168106 - 33168328
Alignment:
Q  93 actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc 192  Q
    |||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  33168106 actcagtcataaacaaggaaaatatattatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttagttcaaagtacacgaaagtttgaaaatcatc 33168205  T
Q  193 aaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaac 292  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||    
T  33168206 aaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacactcaacgcaattacatatggaac 33168305  T
Q  293 gaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33168306 gaacatacatatataatatatta 33168328  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 44469984 - 44469669
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatat 88  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||           ||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| ||    
T  44469984 ttctgcataattctaaa-catttccaagccattttttcggtcagtttttacctgtaattgaaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatacaagat 44469886  T
Q  89 tgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaatt 188  Q
    |||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  44469885 tgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaatt 44469786  T
Q  189 catcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatata 288  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  44469785 catcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatg 44469696  T
Q  289 gaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  44469695 gaacgaacatacatatataatatatta 44469669  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37019310 - 37019054
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||| ||||  ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37019310 aaccagagtattttcaaaggtaaaataattcatacaacattgaaactcggatataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatt 37019211  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||    
T  37019210 aaaccaacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat 37019121  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37019120 taaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 37019054  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 50113466 - 50113736
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50113466 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacgttgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatt 50113565  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacat-----tacagctcattacat 243  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  |||  |  |||      ||| |||||||||     
T  50113566 aaaccgacatttggttaaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataa-caaagtgtccataattaaacaactcattacac 50113664  T
Q  244 atcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50113665 attattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 50113736  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 315
Target Start/End: Original strand, 38690117 - 38690323
Alignment:
Q  98 gtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaac 197  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38690117 gtcataaataagaaaaatacaatatcttttacaattgtccatagttaaatcaaaccgacatttgattcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaac 38690216  T
Q  198 gttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaaca 297  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||          ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38690217 gttacaaagtgtccataattaaacaaca----------cattacacatcattatattaaat-cctacttacattcatcacaattgcatatggaacaaaca 38690305  T
Q  298 tacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38690306 tacatatataatatatta 38690323  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 29352392 - 29352648
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  29352392 aaccagagcatttgcaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaatt 29352491  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||    
T  29352492 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcat 29352581  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29352582 taaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatatta 29352648  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20353849 - 20353594
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  20353849 aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagacaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 20353750  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||| | |||||    
T  20353749 aaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattatacatcat 20353660  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20353659 taaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatatt 20353594  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30909943 - 30909687
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  || |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30909943 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaacataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 30909844  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  || |        ||||||||| |||||    
T  30909843 aaaccgacgtttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa--agta--------ctcattacacatcat 30909754  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30909753 taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatgaaacgaacatacatatataatatatta 30909687  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13633787 - 13633530
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||  ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13633787 aaccagacaatttccaaaggctaaataattcatacaatattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 13633688  T
Q  149 aaaccgacatttt-gttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatca 247  Q
     |||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| ||||    
T  13633687 taaccgacattttggttaacattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatca 13633598  T
Q  248 ttaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13633597 ataaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaacaaacatacatatataatatatta 13633530  T

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Target: chr1; HSP #20
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Target Start/End: Complemental strand, 25039998 - 25039739
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Q  46 tttaaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaa 145  Q
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T  25039998 tttaaccagaacatttccaaagacaatataacttgtacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaa 25039899  T
Q  146 atcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatat 245  Q
    ||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | | |||||||   |||||| ||          ||||||| ||    
T  25039898 atcaaactgatatttggttcaaaatacacaaaagtttaaaattcatcaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaaca----------cattacacat 25039809  T
Q  246 cattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25039808 cattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgtatatggaacgaacatacacatataatatatta 25039739  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 198
Target Start/End: Original strand, 94559 - 94705
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Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    ||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94559 cagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 94658  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  94659 ccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 94705  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 46886302 - 46886137
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Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46886302 aaccagagcctttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatt 46886203  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccata 214  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  46886202 aaaccgacatttggttaaaattacacaaacgtttgaaattcatcgaaacattacaaagtgtccata 46886137  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 314
Target Start/End: Original strand, 38771788 - 38772045
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Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaa 146  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||   |  |||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38771788 aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcctttacaattgttcataattaaa 38771887  T
Q  147 tcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatc 246  Q
    | |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||    
T  38771888 ttaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatc 38771977  T
Q  247 attaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38771978 attaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatatt 38772045  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 16281807 - 16282004
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Q  11 ttctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtc 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||          | ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |    
T  16281807 ttctaaaacatttccaaactatttttcggtcagtttttactgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcggac 16281906  T
Q  101 ataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16281907 ataaacaagaaaaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 16282004  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22346017 - 22345818
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagtttttaac-----------cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |           ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  22346017 ttctgcataattctaatgcatttccaagccatttttcgaccagtttttacctgtaattaagccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 22345918  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    ||||||||| |     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22345917 gaaactcggac-----caagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataagtaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattc 22345823  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5082280 - 5082022
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcg--gtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaa 146  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| ||||||||||   | |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5082280 aaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactctcagacataataaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaa 5082181  T
Q  147 tcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatc 246  Q
    | |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  || |        ||| ||||| |||    
T  5082180 ttaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa--agta--------ctccttacacatc 5082091  T
Q  247 attaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5082090 attaaattaaatccatatttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 5082022  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22527609 - 22527460
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22527609 aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatgttttacaattgtccataattaaatc 22527510  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  22527509 aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcataacg 22527460  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 315
Target Start/End: Original strand, 6558047 - 6558316
Alignment:
Q  50 accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca 149  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6558047 accagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatta 6558146  T
Q  150 aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattca--------------tcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagct 235  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||              ||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||    
T  6558147 aaccgacatttggttaaaattaaacaaatgtttgaaattcatcaaattaaaccactcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ct 6558236  T
Q  236 cattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6558237 cattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 6558316  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15051262 - 15051090
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  15051262 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 15051163  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaac 221  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  15051162 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac 15051090  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 314
Target Start/End: Original strand, 3944172 - 3944389
Alignment:
Q  87 attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa 186  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||    
T  3944172 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 3944271  T
Q  187 ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata 286  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  3944272 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 3944361  T
Q  287 tagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3944362 tggaacgaacatacatatataatatatt 3944389  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3993718 - 3993501
Alignment:
Q  87 attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa 186  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||    
T  3993718 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 3993619  T
Q  187 ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata 286  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  3993618 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 3993529  T
Q  287 tagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3993528 tggaacgaacatacatatataatatatt 3993501  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 51 - 198
Target Start/End: Original strand, 31780128 - 31780275
Alignment:
Q  51 ccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa 150  Q
    |||||||||||| || ||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31780128 ccagagcatttcgaatggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa 31780227  T
Q  151 accgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31780228 accgacattaggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 31780275  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 315
Target Start/End: Original strand, 12643369 - 12643620
Alignment:
Q  51 ccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa 150  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12643369 ccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaa 12643468  T
Q  151 accgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattca---tcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatca 247  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||  |||| |   || |    | || || |||||||||||||          ||| ||||||||| ||||    
T  12643469 accgacatttggttaaaattaaacaaacgttt--aattaagtgtcta----taattaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatca 12643552  T
Q  248 ttaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12643553 ttaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 12643620  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 194
Target Start/End: Original strand, 19521758 - 19521900
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19521758 cagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacagcattgaaactcggacataaacaagaaaaatactatatcttttacaattgtctataattaaatcaaa 19521857  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaa 194  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19521858 tcgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaa 19521900  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 52805474 - 52805325
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52805474 aaccagagtatttccaaaggcaaaataattcatataacattgaaactctgacataaataagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatt 52805375  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  52805374 aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 52805325  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21144542 - 21144396
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21144542 cagagaatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtctataattaaatcaaa 21144443  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  21144442 tcgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcgtcataacg 21144396  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 470984 - 470835
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  470984 aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataagtacaatatcttttaccattgttcataatttaatc 470885  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  470884 aaaccgacatttggttcaaattatacaaacgtttgaaattcatcataacg 470835  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5141780 - 5141528
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5141780 cagaacatttccaaaggcaatataactcatacaacatttatactcaggcataaacaagaaaattaca-tatcttttacagttgtccataattaaatcaaa 5141682  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaa 251  Q
    ||||||    |||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||| ||          ||||| ||||| ||||    
T  5141681 ccgacaaggggttcgaattactcgaatgtttgaaattcattaaaacgttaaatagtgtcaataattaaacaaca----------cattatatatcgttaa 5141592  T
Q  252 gttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
     ||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5141591 attaaatctctactgacattctacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 5141528  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 190
Target Start/End: Original strand, 50617376 - 50617503
Alignment:
Q  64 aaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataat-acaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttg 162  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  50617376 aaaggcaaaataattcatacaacattgaaactctgacataaacaaaaaaaaacacaatattttttacaattgtccatatttaaattaaaccgacatttgg 50617475  T
Q  163 ttcaaattacacaaaagtttgaaattca 190  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50617476 ttcaaattacacaaacgtttgaaattca 50617503  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 299
Target Start/End: Original strand, 1179878 - 1180022
Alignment:
Q  155 acattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagtt 254  Q
    |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| ||||  |||| ||    
T  1179878 acatttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacattaaagagtgtccacaattaaacaacacattacaacacattaaatattgttaaatt 1179977  T
Q  255 aaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacata 299  Q
    ||||   | || ||||||  | || ||||| ||||||||||||||    
T  1179978 aaatatttgctgacattctacgcagttgcagatagaacgaacata 1180022  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 38690030 - 38690078
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta 49  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38690030 ttctacataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagttttta 38690078  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 47715001 - 47714877
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| | |  |||||| | || ||||| ||| | |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  47715001 aaccagagcatttccagaaacaatattagtcgtacaacatttatactcagtcataaacaacaaaaatacattatcttttatagctgtccataattgaatc 47714902  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattaca 173  Q
    || |||||||||  || ||||||||    
T  47714901 aatccgacatttcattaaaattaca 47714877  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 23359263 - 23359217
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaact 95  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  23359263 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaact 23359217  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10165703 - 10165606
Alignment:
Q  99 tcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaa 196  Q
    |||||| |||||| ||| ||  |||||| || |||| | | |||||||||||  | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  10165703 tcataagcaagaacaatgcataatctttcaccattgacaaaaattaaatcaattcaacattttgttaaaattacacgaatgtttgaaattcaacaaaa 10165606  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 127
Target Start/End: Original strand, 29261529 - 29261601
Alignment:
Q  55 agcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatctttt 127  Q
    |||||||  ||||| ||||||| | |||||| ||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29261529 agcattttcaaaggtaatataacttatacaacatttaaattcagtcataaacaagtaaaatacaatatctttt 29261601  T

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Target: chr5 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 24050126 - 24050449
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagtttt-----------taaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||           ||||||||||||| | ||||| ||||||| | |||||| |||    
T  24050126 ttctgcataattgttaagcatttccaagccatttttcggccagttttcacatgtaatttaaccagagcattaccaaaggaaatataacttatacaacatt 24050225  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
     ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24050226 taaattcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattc 24050325  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    |||||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24050326 atcaaaacgttacatagtatccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattatatccctacttacattcaacgcaattgcatatag 24050425  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24050426 aacgaacatacatatataatatat 24050449  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 7796736 - 7796992
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7796736 aaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggttataaacaagaaaaatacaatatcttttataattgtccataattaaatc 7796835  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||    
T  7796836 aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat 7796925  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7796926 taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 7796992  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 46 - 315
Target Start/End: Original strand, 24053309 - 24053578
Alignment:
Q  46 tttaaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaa 145  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24053309 tttaaccagagcattttcaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattac 24053408  T
Q  146 atcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatat 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||    
T  24053409 atcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacatattacaactcattacacat 24053508  T
Q  246 cattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24053509 cattaaattatatccctaattacattcaacgcaattgcatatagaaagaacatacatatataatatatta 24053578  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 25877720 - 25878045
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||           ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||    
T  25877720 ttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaagcaatataaatcatacaacatt 25877819  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25877820 gaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaat--aaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattc 25877917  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcat 285  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||     ||  |    ||| |||||||||  | ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25877918 atcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacgtgattatattaaatccctacttaca--catcacaattgcat 25878015  T
Q  286 atagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25878016 atggaacaaacatacatatataatatatta 25878045  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 25890153 - 25890409
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  25890153 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttatacaattgttcataattaaatt 25890252  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||          ||| ||||||||| |||||    
T  25890253 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgttcataattaa----------acaactcattacacatcat 25890342  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25890343 taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 25890409  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34080045 - 34079789
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  34080045 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 34079946  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||    
T  34079945 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat 34079856  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34079855 taaattaaatccttacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 34079789  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 7017670 - 7017926
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  7017670 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 7017769  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||    
T  7017770 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcat 7017859  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7017860 taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 7017926  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33995066 - 33994807
Alignment:
Q  46 tttaaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaa 145  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33995066 tttaaccagaacatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaa 33994967  T
Q  146 atcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatat 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||   |||||| ||          ||||||| ||    
T  33994966 atcaaaccgacatttggttcaaaatacaaaaaagtttgaaattcttcaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaaca----------cattacacat 33994877  T
Q  246 cattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33994876 cattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 33994807  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 315
Target Start/End: Original strand, 30352589 - 30352845
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  30352589 cagagcatttccaaatgcaatataagccatacaacatttaaactcagtcataaa--agaaaaatacaatatctttt-----tgtccataattaaatcaaa 30352681  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaa 251  Q
    ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  30352682 ccagcatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaaacagcacattacaactcattacatatcaataa 30352781  T
Q  252 gttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
     |||||||  ||||||||||||   ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  30352782 attaaatctttacttacattcaatgcaattgcatatggaaaaaacatacatatataatatatta 30352845  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1039719 - 1039449
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1039719 aaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacacgataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatt 1039620  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagca--catt--acagctcattacata 244  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||    ||   |||  ||| |||||||||||    
T  1039619 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtctataattaagtgtcaataatttaacaactcattacata 1039520  T
Q  245 tcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  1039519 tcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaactgcatatggtacgaacatacatatataacatatta 1039449  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 13563800 - 13564056
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13563800 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 13563899  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||    
T  13563900 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcattaaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat 13563989  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13563990 taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggatcgaacatacatatataatatatta 13564056  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 27863562 - 27863818
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27863562 aaccagaacatttccaaaggcaaaataattcacacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 27863661  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||    
T  27863662 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat 27863751  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27863752 taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcaaatggaacgaacatacatatataatatatta 27863818  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 37814741 - 37814997
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  37814741 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 37814840  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||    
T  37814841 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcat 37814930  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37814931 taaattaaatccctacttactttcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatatta 37814997  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 34122683 - 34122953
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34122683 aaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatt 34122782  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacata 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||     ||  |    ||| ||||||||| |    
T  34122783 aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaaggttacaaggtgttcataattaagtgtccataattaaacaactcattacaca 34122882  T
Q  245 tcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34122883 tcattaaattaaattcatacttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatatatatataatatatta 34122953  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 315
Target Start/End: Original strand, 28882177 - 28882403
Alignment:
Q  79 catacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaa 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||     
T  28882177 catacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttcgttaaaattaaacaaac 28882276  T
Q  179 gtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcaca 278  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||    
T  28882277 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccccacttacattcaacgca 28882366  T
Q  279 attgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28882367 attgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 28882403  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 38855815 - 38856130
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||  ||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  38855815 ttctgcataattctaga-catttccaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagacaatttccaaaggctaaataattcatacaatatt 38855913  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttt-gttcaaattacacaaaagtttgaaatt 188  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  38855914 gaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcgtaattaaattaaaccgacattttggttaacattaaacaaacgtttgaaatt 38856013  T
Q  189 catcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatata 288  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  38856014 catcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattcaatccctacttacattcaacgcaattacatatg 38856103  T
Q  289 gaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  38856104 gaacgaacatacatatataatatatta 38856130  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 11029167 - 11029422
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||  ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  11029167 aaccagacaatttccaaaggctaaataattcatacaatattgaaactcggtcataatcaagataaatgcaatatcttttacaattgttcataattaaatt 11029266  T
Q  149 aaaccgacatttt-gttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatca 247  Q
    ||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||       ||   ||||| ||| ||||    
T  11029267 aaaccgacattttggttaacattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaa--gtccataattaaac-------ta---ctcatcacacatca 11029354  T
Q  248 ttaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11029355 ttaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatgaaacgaacatacatatataatatatta 11029422  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 198
Target Start/End: Original strand, 38407308 - 38407454
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38407308 cagaacatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcagacataaacaagaaaaatacaatatcttttagaattgtccataattaaatcaaa 38407407  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38407408 ccggcatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 38407454  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7762157 - 7762008
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    ||||| |||||||  |||||||| | || |||||||| |||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7762157 aaccaaagcattttgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagatagatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 7762058  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7762057 aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 7762008  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41799679 - 41799534
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  41799679 cagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaacttggacataaacaagaaaaatacaattt-ttttacaattgtccataattaaattaaa 41799581  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41799580 ccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 41799534  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43179814 - 43179605
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  | || ||||| ||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  43179814 aaccagagcattttcaaaggcaatactagtcgtacaacatttatactcggtcaaaaacaagaaaaatatattatcttttacacttgtccataattaatac 43179715  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    || || |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||  |    
T  43179714 aatccaacatttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacgttaaagagtgtccataattaaacaacacattacaacacattatatattgt 43179615  T
Q  249 taagttaaat 258  Q
    ||| ||||||    
T  43179614 taaattaaat 43179605  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28388433 - 28388307
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  28388433 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaattcggacataaacaaaataaatacaatattttttacaattgtccataattaaatt 28388334  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacaca 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28388333 aaaccgacatttggttcaaattacaca 28388307  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 315
Target Start/End: Original strand, 6267635 - 6267889
Alignment:
Q  51 ccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | || ||||| ||| |  ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  6267635 ccagagcatttccaaaggcaatactagtcgtacaacatttatcctcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttaccgttatccataattaaatcaa 6267734  T
Q  151 accgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcatta 250  Q
     |||||||||  || ||||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||| ||          |||||||||||||||    
T  6267735 tccgacatttcattaaaattgcaagaatgtttgaaattcatcataacattaaagagtgtccataattaaacaaca----------cattacatatcatta 6267824  T
Q  251 agttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    | ||||||| ||||| ||||||  | || ||||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  6267825 aattaaatctctactgacattctacgcagttgcagatggaacaaaaatacatatataatatatta 6267889  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 4196654 - 4196790
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  4196654 ttctgcataattctaaagcatttccaagctatttttcggtcaatttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 4196753  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaag-aataatacaatatctt 125  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  4196754 gaaactcggtcataaacaagaaaaaatacaatatctt 4196790  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 315
Target Start/End: Original strand, 4196792 - 4196929
Alignment:
Q  166 aaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctact 265  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |          ||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  4196792 aaattacacaaacgtttggtattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaac----------tcattacatatgattatattaaatccctact 4196881  T
Q  266 tacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  4196882 tacattcatcacaattgcatatggaacga--atacatatataatatatta 4196929  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14280762 - 14280637
Alignment:
Q  179 gtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcaca 278  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       |||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||    
T  14280762 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgca 14280673  T
Q  279 attgcatatagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14280672 attacatatggaacgaacatacatatataatatatt 14280637  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28387975 - 28387913
Alignment:
Q  253 ttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28387975 ttaaatccctacttacaatcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 28387913  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16440315 - 16440192
Alignment:
Q  64 aaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgt 163  Q
    |||||||||| || |||||||  ||| | | || |||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  16440315 aaaggcaatacaactcatacaccatttataatcagtcataaacaagaacaatacataatattttagaattgaccataattaaatcaatccgatatttcgt 16440216  T
Q  164 tcaaattacacaaaagtttgaaat 187  Q
    | ||||||||| || |||| ||||    
T  16440215 taaaattacacgaatgtttaaaat 16440192  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 196
Target Start/End: Original strand, 30292292 - 30292382
Alignment:
Q  106 caagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaa 196  Q
    |||||| ||||||  || || |||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  30292292 caagaacaatacataattttgtacaattgaccaaaattaaatcaattcgacatttcgttaaaattacacgaatgttcgaaattcaacaaaa 30292382  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 33995119 - 33995074
Alignment:
Q  4 tgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta 49  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33995119 tgcataattgttaagcatttccaagccatttttcggccagttttta 33995074  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43179559 - 43179523
Alignment:
Q  279 attgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  43179559 attgcagatggaacgaacatacatatataatatatta 43179523  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 49 - 306
Target Start/End: Original strand, 21808 - 22053
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||            || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808 aaccagagcatttccaaaagcaatataaatcatacaatattgaaactcg------------aaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 21895  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  21896 aaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaaaaagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcat 21995  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatat 306  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21996 tatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatat 22053  T

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Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 58 - 315
Target Start/End: Original strand, 43679564 - 43679811
Alignment:
Q  58 atttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgaca 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43679564 atttccaaaggcaatataaatcatacaaaattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgaca 43679663  T
Q  158 ttttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaa 257  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||          ||| ||||||||| |||||||  |||||    
T  43679664 tttggttcaaattacacaaaagtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtgttcataattaa----------acaactcattacacatcattatattaaa 43679753  T
Q  258 tccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43679754 tccctgcttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 43679811  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43377266 - 43376937
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Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  43377266 ttctacataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 43377167  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43377166 gaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatgaaaccgaaatttggttcaagttacacaaacgtttgaaattc 43377067  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcat 285  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||     ||  |    ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  43377066 atcaaaacgttacaaagtgtccttaattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaacgcaattgcat 43376967  T
Q  286 atagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  43376966 atggaacgaacatacatatataatatatta 43376937  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4867773 - 4867451
Alignment:
Q  4 tgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaa 92  Q
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T  4867773 tgcataattctaaagcatttccaagccattttttggccagtttttacttgtaattaaactagagcatttccaaaggcaatataactcatacaacatttaa 4867674  T
Q  93 actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc 192  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4867673 actcagtcataaacaagaaaaatacaatatctttcaccattgtccataattaaatcaaaccaacatttgatttaaaatacacaaaagtttgaaattcatc 4867574  T
Q  193 aaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaac 292  Q
    ||||| ||| | | | |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  4867573 aaaacattacatagtctccataattaaacaacagattacaactcattacttatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattggatatggaac 4867474  T
Q  293 gaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  4867473 gaacatacgtatataatatatta 4867451  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 49 - 313
Target Start/End: Original strand, 39751219 - 39751473
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39751219 aaccagagcatttccaaagacaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccgtaattaaatc 39751318  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||    
T  39751319 aaactgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat 39751408  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatat 313  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39751409 taaattaaatccctacttacattcaacgtaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 39751473  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 2124339 - 2124609
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2124339 aaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccatagttaaatc 2124438  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacata 244  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     ||  |    ||| ||||||||| |    
T  2124439 aaaccgacatttggttcaaattacacaaacatttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacaca 2124538  T
Q  245 tcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2124539 tcattaaattaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaaaatacatatataatatatta 2124609  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 113 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7172177 - 7171975
Alignment:
Q  113 aatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||    
T  7172177 aatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacccacattttgttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatgaaaacgttacatagtgtcca 7172078  T
Q  213 taattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatata 312  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7172077 taattaaacaacacattacaactcagtacacatcattaaattaaatctctacttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatata 7171978  T
Q  313 tta 315  Q
    |||    
T  7171977 tta 7171975  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 39616 - 39872
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39616 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaacctcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatt 39715  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||    
T  39716 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacatttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat 39805  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39806 taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 39872  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 89 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22588316 - 22588100
Alignment:
Q  89 tgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaatt 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22588316 tgaaactcgatcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattatccataattaaatcaaaccgacattaggttcaaattacacaaacgtttgaaatt 22588217  T
Q  189 catcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatata 288  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22588216 gatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatata 22588127  T
Q  289 gaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22588126 gaacgaacatacatatataatatatta 22588100  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Original strand, 23924069 - 23924380
Alignment:
Q  4 tgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaa 92  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||           || |||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  23924069 tgcataattctaaa-cattttcaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaactagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaa 23924167  T
Q  93 actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc 192  Q
    |||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23924168 actcggacataaaaaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatc 23924267  T
Q  193 aaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaac 292  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  23924268 aaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaactgcatatggaac 23924357  T
Q  293 gaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23924358 gaacatacatatataatatatta 23924380  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 315
Target Start/End: Original strand, 35962467 - 35962722
Alignment:
Q  50 accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca 149  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35962467 accagagtattacaaaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcggatataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatta 35962566  T
Q  150 aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcatt 249  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||          ||| |||||| || ||||||    
T  35962567 aaccgaaatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtgcataattaa----------acaactcattgcacatcatt 35962656  T
Q  250 aagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    || |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35962657 aaattaaattcctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacgtatataatatatta 35962722  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31959975 - 31959705
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  31959975 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatataagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcatgattaaatt 31959876  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacata 244  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||     ||  |    ||| ||||||||| |    
T  31959875 aaacccacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaattgtccataattaaacaactcattacaca 31959776  T
Q  245 tcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31959775 tcattaaattaaatccatacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 31959705  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20549173 - 20548938
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  20549173 aaccagagcatttccaaagacaaaataattcatacaagattgaaactcggatataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 20549074  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||    
T  20549073 aaaccgaaatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat 20548984  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacga 294  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  20548983 taaattaaatccttacttacattcaacgcaattgcatatggaacga 20548938  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 314
Target Start/End: Original strand, 30301292 - 30301549
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaa 146  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||   |  |||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30301292 aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaa 30301391  T
Q  147 tcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatc 246  Q
    | |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||    
T  30301392 ttaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatc 30301481  T
Q  247 attaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30301482 attaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatatt 30301549  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 193
Target Start/End: Original strand, 34367070 - 34367214
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || |||||||  |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34367070 aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacagcattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 34367169  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34367170 aaaccgacattttgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 34367214  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7344530 - 7344215
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aata 87  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||           ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||   |  |    
T  7344530 ttctgcataattctaa-gtatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatga 7344432  T
Q  88 ttgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaat 187  Q
    ||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||    
T  7344431 ttgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaatagacgtttgaaat 7344332  T
Q  188 tcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatat 287  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| |||||    
T  7344331 tcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatat 7344242  T
Q  288 agaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  7344241 ggaacgaacatacatatataatatatt 7344215  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 23578534 - 23578704
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||           ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  23578534 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcagccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaattatacaacatt 23578633  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattt 160  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23578634 gaaactctgtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacattt 23578704  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 314
Target Start/End: Original strand, 8419602 - 8419819
Alignment:
Q  87 attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa 186  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||    
T  8419602 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 8419701  T
Q  187 ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata 286  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  8419702 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 8419791  T
Q  287 tagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  8419792 tggaacgaacgtacatatataatatatt 8419819  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22661484 - 22661234
Alignment:
Q  53 agagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaac 152  Q
    |||||||||| ||||||| ||| | |  ||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22661484 agagcatttccaaaggcattattagttgtacaacatttatactcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttacggttgtccataattaaatcaaac 22661385  T
Q  153 cgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaag 252  Q
    ||| |||| ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| ||          ||||||||||| ||||     
T  22661384 cgatatttcgttaaaattacacgaatgtttgagattcatcaaaacattaaagagtgtccataattaaacaaca----------cattacatatcgttaaa 22661295  T
Q  253 ttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatat 313  Q
    ||||||| ||||| ||||||  | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22661294 ttaaatctctactgacattctgcgcagttgcatatggaacgaacatacatatataatatat 22661234  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 192
Target Start/End: Original strand, 41239010 - 41239150
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41239010 cagagcatttcgaaatgcaaaataattcatacaacattgaatctcggacataaacaagacaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaa 41239109  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc 192  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41239110 ccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatc 41239150  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 314
Target Start/End: Original strand, 32375849 - 32376066
Alignment:
Q  87 attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa 186  Q
    |||||||||||  |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||    
T  32375849 attgaaactcgaacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaatcgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 32375948  T
Q  187 ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata 286  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  32375949 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 32376038  T
Q  287 tagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32376039 tggaacgaacatacatatataatatatt 32376066  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 188
Target Start/End: Original strand, 41744023 - 41744162
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  41744023 aaccagagcatttccaaaggcaaaataatttatacaagattgaaactcgaacataaacaagataaatacaatattttttacaattgtccatgattaaatt 41744122  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaatt 188  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41744123 aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaatt 41744162  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30972771 - 30972593
Alignment:
Q  66 aggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttc 165  Q
    |||||||| || |||||||  ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||  | |||||| |||     
T  30972771 aggcaatacaactcatacatcatttatactcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttacggttgtcgataattaaatcaattcaacatttcgtta 30972672  T
Q  166 aaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacata 244  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | | | | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  30972671 aaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacattacagagtatacataattaaacaacacattacacatcattacata 30972593  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 196
Target Start/End: Original strand, 31280969 - 31281118
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| | || ||||| || |||||||  ||| | | ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  31280969 aaccagagcatttccagagacaatacaactcatacaccatttataatcggtcataaacaagaacaatacataatcttttacaattgactgtaattaaatc 31281068  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaa--ttacacaaaagtttgaaattcatcaaaa 196  Q
    || | ||||||| ||| |||  |||||| || ||||||||||||||||||    
T  31281069 aatctgacatttcgttaaaattttacacgaatgtttgaaattcatcaaaa 31281118  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 315
Target Start/End: Original strand, 41744160 - 41744238
Alignment:
Q  237 attacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  41744160 attacacatcattaaattaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggagcgaatatacatatataatatatta 41744238  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29807152 - 29807044
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| || ||||||| |||| | | |  |||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29807152 aaccatagcatttccagaggcaatacaactcatacactatttataataagtcataaacaagaacattacatgatcttttacaattgttcataattaaatc 29807053  T
Q  149 aaaccgaca 157  Q
     | ||||||    
T  29807052 tatccgaca 29807044  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 2124277 - 2124325
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta 49  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  2124277 ttctgcataattctaatgcatttccaagccatttttcggccacttttta 2124325  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 22588372 - 22588324
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta 49  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  22588372 ttctgtataattctaaagcattttcaatcaatttttcggtcagttttta 22588324  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 7172525 - 7172465
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaag 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  7172525 aaccagagcattttcaaaggcaatataacttatacaacatttaaacttagtcataaacaag 7172465  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 7172586 - 7172550
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttc 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7172586 ttctgcataattctaaagcatttccaagccgtttttc 7172550  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 36
Target Start/End: Original strand, 43679499 - 43679531
Alignment:
Q  4 tgcataattctaaagcatttccaaaccattttt 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43679499 tgcataattctaaagcatttccaaatcattttt 43679531  T

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Target: chr3 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 6489428 - 6489758
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6489428 ttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagtttttaccgctaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 6489527  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6489528 gaaactcggtcataaacaagaaaaatacattatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattc 6489627  T
Q  190 atcaaaacgtta-taaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgca 284  Q
    ||  ||||||||  ||| |||||||| ||||     ||  |    ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6489628 attgaaacgttacaaaagtgtccatacttaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaacacaattgca 6489727  T
Q  285 tatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6489728 tatggaacgaacatacatatataatatatta 6489758  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 66973 - 67298
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||| |||    
T  66973 ttctgcataattgttaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcaatcccaaatgcaatataattcatacaacatt 67072  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
     ||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  67073 taaactcacttataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaactacacaaaagtttgaaattc 67172  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |    
T  67173 atcaaaacggtacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaatgaaatccctacttacattcaacgcaatcacatatgg 67272  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  67273 aacgaacatacatatataatgtatta 67298  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4002419 - 4002149
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4002419 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatt 4002320  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacata 244  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||     ||  |    | | ||||||||| |    
T  4002319 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtctataactaagtgtccataattaaataactcattacaca 4002220  T
Q  245 tcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4002219 tcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 4002149  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 313
Target Start/End: Original strand, 21951958 - 21952212
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21951958 aaccagagcatttccaaatgcaatataaatcatacaacattgaaactcgaacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 21952057  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||          ||| |||||||||  ||||    
T  21952058 aaaccgacatttgattaaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaatgtgtccatgattaa----------acaactcattacacgtcat 21952147  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatat 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21952148 taaattaaatccctagttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatacaaatataatatat 21952212  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 315
Target Start/End: Original strand, 46989686 - 46989941
Alignment:
Q  64 aaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgt 163  Q
    |||||||| |||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  46989686 aaaggcaaaataattcatacaaatgtgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggt 46989785  T
Q  164 tcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatc 259  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     ||  |    ||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  46989786 tcaaattacacaaacatttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatc 46989885  T
Q  260 cctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  46989886 cctacttacattcaacacaattgcatgtggaacgaacatacatatataatatatta 46989941  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 315
Target Start/End: Original strand, 9426705 - 9427020
Alignment:
Q  2 tctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||           ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||    
T  9426705 tctgcataattataaagcatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagatt 9426804  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    ||||||||| |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  9426805 gaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattc 9426904  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  9426905 atcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatgg 9426994  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9426995 aacgaacatacatatataatatatta 9427020  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6745240 - 6744985
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  6745240 aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 6745141  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||    
T  6745140 aaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcat 6745051  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6745050 taaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatatt 6744985  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 314
Target Start/End: Original strand, 13743430 - 13743680
Alignment:
Q  53 agagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaac 152  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13743430 agagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaac 13743529  T
Q  153 cgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaag 252  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| ||||||||     
T  13743530 cgacatttggtt-aaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaa 13743618  T
Q  253 ttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13743619 ttaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatatt 13743680  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 36812996 - 36813266
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  36812996 aaccagagcatttccaaaggcaaaataatccatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttatacaattgttcataattaaatt 36813095  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacata 244  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||     ||  |    ||| ||||||||| |    
T  36813096 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcattaaaacattacaaagtttccataattaattgtccataattaaacaactcattacaca 36813195  T
Q  245 tcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36813196 tcattaaattatatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 36813266  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Original strand, 48246570 - 48246826
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| ||||| || |||||||||| | ||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48246570 aaccagagcattttcaaaggcaaaataattcataaaacattgaaactcagacataagcaatataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatt 48246669  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||    
T  48246670 aaaccgacatttggttaaaattacacaaacttttgaaattcatcaaaaaattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat 48246759  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  48246760 taaattaaatccctacttacattcaacgcagttgcatatggaacaaacatacatatataatatatta 48246826  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 600458 - 600309
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  600458 aaccagagcatttttaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 600359  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  600358 aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 600309  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2857955 - 2857640
Alignment:
Q  2 tctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||           ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||    
T  2857955 tctgcataattgtaaagcatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagatt 2857856  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc 189  Q
    |||||| || |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  2857855 gaaacttggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattc 2857756  T
Q  190 atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag 289  Q
    |||  ||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  2857755 atcttaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatgg 2857666  T
Q  290 aacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  2857665 aatgaacatacatatataatatatta 2857640  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 198
Target Start/End: Original strand, 50213619 - 50213765
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50213619 cagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatgcaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 50213718  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  50213719 ccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 50213765  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 222
Target Start/End: Original strand, 7841254 - 7841427
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  7841254 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcagacataaacaagataaatacagtatcttttacaattgtccataagtaaatt 7841353  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaaca 222  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7841354 aaaccgacatttggttaaaattacacaaacgtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaaca 7841427  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36134194 - 36134048
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36134194 cagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 36134095  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  36134094 ccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcataacg 36134048  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3953188 - 3952873
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aata 87  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||           ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||   |  |    
T  3953188 ttctgcataattctaa-gtatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatga 3953090  T
Q  88 ttgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaat 187  Q
    ||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||    
T  3953089 ttgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaatagacgtttgaaat 3952990  T
Q  188 tcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatat 287  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| |||||    
T  3952989 tcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatat 3952900  T
Q  288 agaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  3952899 ggaacgaacatacatatataatatatt 3952873  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 314
Target Start/End: Original strand, 30943348 - 30943605
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaa 146  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||   |  |||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30943348 aaccagagcatttccaaaagtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaa 30943447  T
Q  147 tcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatc 246  Q
    | |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||    
T  30943448 ttaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatc 30943537  T
Q  247 attaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30943538 attaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatatt 30943605  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 314
Target Start/End: Original strand, 8156706 - 8156923
Alignment:
Q  87 attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa 186  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||    
T  8156706 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 8156805  T
Q  187 ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata 286  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  8156806 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 8156895  T
Q  287 tagaacgaacatacatatataatatatt 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8156896 tggaacgaacatacatatataatatatt 8156923  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42166326 - 42166177
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||  |||||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42166326 aaccagagcattttgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 42166227  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||    
T  42166226 aaaccgacatttggttcaaattacactaatgtttgaaatttatcataacg 42166177  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Original strand, 47070627 - 47070776
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47070627 aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagataaatacaatatcttttccaattgtccataattaaatc 47070726  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  47070727 aaaccgacgtttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 47070776  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 188
Target Start/End: Original strand, 52387958 - 52388097
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52387958 aaccagagcatttcgaaaggcaaaccaattcatacaacattgaaactcggacataaacaatataaatacaatatcttttacaattgaccataattaaatc 52388057  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaatt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52388058 aaaccgacattttgttcaaattacacaaacgtttgaaatt 52388097  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Original strand, 2271513 - 2271663
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaaga-ataatacaatatcttttacaattgtccataattaaat 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2271513 aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaacttggacataaacaagataaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaat 2271612  T
Q  148 caaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  2271613 caaaccgacatttggttcaaattagacaaacgtttaaaattcatcataacg 2271663  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 50957604 - 50957337
Alignment:
Q  52 cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa 151  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  50957604 cagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaa 50957505  T
Q  152 ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcat--------------caaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctca 237  Q
    | ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||              |||||| ||  ||| |||||||||||||||       |||   |||    
T  50957504 cagacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattccaaagtgtccataattaaac-------tac---tca 50957415  T
Q  238 ttacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50957414 ttacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 50957337  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9473863 - 9473721
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9473863 aaccagatcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaatataaatacaatatctattacaattatccataattaaatc 9473764  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcat 191  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9473763 aaaccgacatttggttcaagttacacaaacgtttgaaattcat 9473721  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16647087 - 16646939
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||| | |||||| ||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16647087 aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcagacataaa-aagataaatataatatcttttacgattgtccataattaaatc 16646989  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16646988 aaaccgacatttggtttaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 16646939  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14402970 - 14402808
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatat 88  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||           ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||    
T  14402970 ttctgcataattctaaa-catttccaaaccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagat 14402872  T
Q  89 tgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaac 152  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14402871 tgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaac 14402808  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14402744 - 14402663
Alignment:
Q  234 ctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14402744 ctcattacacgtcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 14402663  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Original strand, 2743789 - 2743870
Alignment:
Q  234 ctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2743789 ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacgtatataatatatta 2743870  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 195
Target Start/End: Original strand, 2743678 - 2743746
Alignment:
Q  127 tacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaa 195  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2743678 tacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaa 2743746  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 7314585 - 7314683
Alignment:
Q  99 tcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaac 197  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||||||    
T  7314585 tcataaataagaacaatacataatctttcacaattgaccaaaattaaatcaattcgacattttgttaaaattatacgaatgtttgaaattcaacaaaac 7314683  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 104
Target Start/End: Original strand, 2743556 - 2743611
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataa 104  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  2743556 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataa 2743611  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 104
Target Start/End: Original strand, 4005003 - 4005058
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataa 104  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||    
T  4005003 aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataa 4005058  T

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Target: scaffold0219 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20085 - 19755
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatat 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  20085 ttctgcataattctaaagcatttccaagcttttttttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacat 19986  T
Q  89 tgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaatt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  19985 tgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaatt 19886  T
Q  189 catcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgca 284  Q
    ||||||||||||| ||| || || |||||||     ||  |    ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19885 catcaaaacgttacaaagtggccgtaattaagtgttcataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgca 19786  T
Q  285 tatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19785 tatggaacgagcatacatatataatatatta 19755  T

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Target: scaffold0116 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15869 - 15613
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15869 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatt 15770  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||    
T  15769 aaaccgacatttagttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat 15680  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15679 taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 15613  T

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Target: scaffold0494 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5241 - 4984
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  5241 aaccagagcatttccaaaggctaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 5142  T
Q  149 aaaccgacatttt-gttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatca 247  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||       ||   ||||||||| ||||    
T  5141 aaaccgacattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatgaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatca 5052  T
Q  248 ttaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5051 ttaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 4984  T

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Target: scaffold0201 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 312
Target Start/End: Original strand, 22560 - 22826
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22560 aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatcaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatt 22659  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacata 244  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||     ||  |    ||| ||||||||| |    
T  22660 aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacg-ttgaaattcatcaaaacattacaaagtgttcataattaagtgtccataattaaacaactcattacaca 22758  T
Q  245 tcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatata 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22759 tcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcaaatggaacgaacatacatatataatata 22826  T

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Target: scaffold0513 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 303
Target Start/End: Original strand, 8358 - 8602
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  8358 aaccaaagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcgggcataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatt 8457  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat 248  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| |||||    
T  8458 aaaccaacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat 8547  T
Q  249 taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacata 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8548 taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacata 8602  T

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Target: scaffold0011 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 236150 - 236001
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  236150 aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaatattgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 236051  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 198  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  236050 aaatcgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 236001  T

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Target: scaffold0199 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 193
Target Start/End: Original strand, 12562 - 12706
Alignment:
Q  49 aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | || |||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12562 aaccagagcatttcgaaaagcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc 12661  T
Q  149 aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatca 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12662 aaaccgacattttgtttaaattacacaaacgtttaaaattcatca 12706  T

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Target: scaffold0169 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1657 - 1517
Alignment:
Q  1 ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt 89  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  1657 ttctgcataattctatagcatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt 1558  T
Q  90 gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttaca 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1557 gaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttaca 1517  T

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Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10978 - 10922
Alignment:
Q  259 ccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10978 ccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacaaatataatatatta 10922  T

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Target: scaffold0794 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0794
Description:

Target: scaffold0794; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 236 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1488 - 1409
Alignment:
Q  236 cattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatta 315  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1488 cattacacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatatta 1409  T

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