View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8501_high_8 (Length: 378)

Name: NF8501_high_8
Description: NF8501
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8501_high_8
NF8501_high_8
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (1-366)||(54635062-54635428)
chr3 (1-366)||(6716437-6716805)
chr3 (1-366)||(45282920-45283291)
chr3 (1-366)||(25637365-25637736)
chr3 (1-350)||(3617386-3617739)
chr3 (27-353)||(7779880-7780208)
chr3 (1-335)||(4600638-4600975)
chr3 (9-353)||(801035-801379)
chr3 (1-347)||(4598405-4598754)
chr3 (1-347)||(10211332-10211681)
chr3 (1-347)||(10209112-10209461)
chr3 (1-347)||(10056156-10056505)
chr3 (1-347)||(10058378-10058727)
chr3 (1-347)||(10060600-10060949)
chr3 (1-347)||(10062822-10063171)
chr3 (1-347)||(10065044-10065393)
chr3 (1-349)||(23200020-23200376)
chr3 (1-347)||(23197823-23198177)
chr3 (67-346)||(19683774-19684054)
chr3 (9-348)||(5258028-5258376)
chr3 (1-346)||(9636010-9636366)
chr3 (9-346)||(45095101-45095445)
chr3 (9-349)||(5260206-5260555)
chr3 (1-155)||(10067266-10067419)
chr3 (64-342)||(37408458-37408737)
chr3 (9-346)||(7764404-7764747)
chr3 (32-346)||(7762226-7762548)
chr3 (47-346)||(9581259-9581565)
chr3 (1-98)||(6718621-6718718)
chr3 (64-234)||(34491212-34491383)
chr3 (64-237)||(49199462-49199638)
chr3 (64-230)||(4569952-4570120)
chr3 (64-346)||(5236343-5236624)
chr3 (64-234)||(29196383-29196555)
chr3 (64-234)||(44700476-44700646)
chr3 (47-234)||(39153358-39153553)
chr3 (64-237)||(43401794-43401970)
chr3 (64-234)||(40734498-40734669)
chr3 (64-234)||(44331545-44331716)
chr3 (68-237)||(30236129-30236299)
chr3 (195-347)||(10067439-10067592)
chr3 (64-237)||(43403737-43403913)
chr3 (64-230)||(6095600-6095767)
chr3 (31-234)||(760806-761018)
chr3 (47-223)||(22835010-22835194)
chr3 (47-234)||(29682335-29682530)
chr3 (66-234)||(31314447-31314616)
chr3 (64-230)||(41819523-41819691)
chr3 (64-342)||(40735383-40735660)
chr3 (64-230)||(54593704-54593871)
chr3 (68-344)||(51398818-51399094)
chr3 (64-346)||(29810868-29811150)
chr3 (9-234)||(32744433-32744658)
chr3 (64-230)||(46860474-46860642)
chr3 (64-223)||(53921511-53921671)
chr3 (64-234)||(29813063-29813234)
chr3 (66-223)||(32891105-32891264)
chr3 (47-234)||(16499006-16499200)
chr3 (122-237)||(40913352-40913467)
chr3 (83-221)||(46173377-46173515)
chr3 (47-234)||(9666463-9666659)
chr3 (64-234)||(23391906-23392077)
chr3 (67-232)||(47304254-47304420)
chr3 (64-192)||(51352150-51352278)
chr3 (124-230)||(55301972-55302079)
chr3 (31-136)||(5433971-5434086)
chr3 (64-193)||(36018852-36018982)
chr3 (69-181)||(4055813-4055926)
chr3 (9-234)||(23410326-23410561)
chr3 (76-135)||(28253363-28253423)
chr3 (122-181)||(4075520-4075581)
chr3 (304-346)||(9634707-9634750)
chr3 (164-222)||(27305719-27305777)
chr3 (84-137)||(25517069-25517121)
chr3 (163-230)||(2075076-2075143)
chr3 (84-136)||(4386875-4386926)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (1-366)||(29720301-29720667)
chr5 (1-366)||(29722461-29722827)
chr5 (1-366)||(29751024-29751391)
chr5 (1-353)||(22536169-22536518)
chr5 (1-366)||(10593195-10593564)
chr5 (1-350)||(25078057-25078410)
chr5 (1-350)||(25136026-25136379)
chr5 (9-353)||(9789101-9789448)
chr5 (1-366)||(40380029-40380397)
chr5 (1-366)||(40382240-40382608)
chr5 (9-353)||(18441521-18441872)
chr5 (9-349)||(16409419-16409764)
chr5 (1-347)||(16544346-16544697)
chr5 (1-347)||(16546568-16546919)
chr5 (9-353)||(26177827-26178175)
chr5 (9-353)||(26170718-26171055)
chr5 (9-346)||(25412698-25413042)
chr5 (9-348)||(30182525-30182872)
chr5 (9-348)||(13342997-13343344)
chr5 (9-348)||(36073927-36074276)
chr5 (9-329)||(13239688-13240016)
chr5 (83-234)||(37439161-37439313)
chr5 (64-329)||(32636824-32637088)
chr5 (64-230)||(213465-213633)
chr5 (64-230)||(40147261-40147428)
chr5 (64-232)||(28278316-28278485)
chr5 (9-346)||(30682809-30683152)
chr5 (64-234)||(13488203-13488374)
chr5 (64-234)||(42428427-42428598)
chr5 (64-230)||(5058047-5058212)
chr5 (47-234)||(8565943-8566138)
chr5 (64-234)||(533769-533940)
chr5 (64-228)||(27637615-27637781)
chr5 (9-251)||(33831616-33831866)
chr5 (47-193)||(39468587-39468741)
chr5 (64-181)||(13695740-13695859)
chr5 (64-234)||(28750652-28750823)
chr5 (47-230)||(31182949-31183138)
chr5 (64-234)||(42426232-42426403)
chr5 (67-234)||(538028-538196)
chr5 (68-230)||(16452084-16452247)
chr5 (68-234)||(38747009-38747176)
chr5 (67-230)||(3075659-3075823)
chr5 (78-230)||(16640941-16641091)
chr5 (67-181)||(9049392-9049506)
chr5 (64-230)||(27015531-27015690)
chr5 (70-232)||(316769-316933)
chr5 (154-234)||(19806454-19806534)
chr5 (118-232)||(33906028-33906144)
chr5 (118-193)||(42309973-42310048)
chr5 (118-180)||(10054867-10054929)
chr5 (149-230)||(42926977-42927058)
chr5 (166-225)||(4160702-4160762)
[»] chr1 (71 HSPs)
chr1 (1-362)||(40282314-40282676)
chr1 (1-366)||(20622102-20622469)
chr1 (1-353)||(21053895-21054248)
chr1 (1-366)||(9036354-9036721)
chr1 (1-353)||(9987139-9987492)
chr1 (1-366)||(44203570-44203938)
chr1 (9-349)||(51765332-51765684)
chr1 (63-348)||(13316236-13316521)
chr1 (47-346)||(8550670-8550979)
chr1 (9-346)||(20762608-20762950)
chr1 (9-324)||(3189267-3189590)
chr1 (9-324)||(3198084-3198407)
chr1 (9-324)||(3206923-3207246)
chr1 (9-346)||(3156802-3157147)
chr1 (64-230)||(37168297-37168465)
chr1 (64-230)||(13547090-13547257)
chr1 (64-237)||(42297968-42298143)
chr1 (9-234)||(4552634-4552869)
chr1 (64-342)||(44455160-44455438)
chr1 (64-346)||(49918350-49918632)
chr1 (64-230)||(13549001-13549168)
chr1 (64-234)||(28220223-28220394)
chr1 (64-234)||(28265551-28265722)
chr1 (64-230)||(29136247-29136415)
chr1 (64-230)||(47255340-47255508)
chr1 (47-234)||(834164-834359)
chr1 (64-230)||(7482231-7482399)
chr1 (64-346)||(31659238-31659520)
chr1 (64-230)||(11348698-11348865)
chr1 (64-230)||(31925708-31925875)
chr1 (64-234)||(37033068-37033241)
chr1 (64-232)||(19754494-19754664)
chr1 (64-210)||(23555286-23555433)
chr1 (64-230)||(47115171-47115340)
chr1 (64-346)||(37503443-37503722)
chr1 (64-346)||(37559751-37560037)
chr1 (64-234)||(28223418-28223589)
chr1 (64-234)||(45644351-45644523)
chr1 (64-234)||(50169207-50169378)
chr1 (64-230)||(193611-193778)
chr1 (47-234)||(3847118-3847313)
chr1 (64-226)||(34603576-34603740)
chr1 (64-234)||(50167172-50167343)
chr1 (15-234)||(46064861-46065089)
chr1 (64-193)||(1833522-1833652)
chr1 (47-234)||(13659333-13659528)
chr1 (47-234)||(196904-197100)
chr1 (64-234)||(19752685-19752857)
chr1 (64-175)||(41360914-41361026)
chr1 (69-195)||(22079322-22079449)
chr1 (64-234)||(13137973-13138142)
chr1 (149-230)||(28242391-28242472)
chr1 (64-234)||(30476443-30476614)
chr1 (85-230)||(927977-928123)
chr1 (82-210)||(15820326-15820455)
chr1 (67-234)||(40122193-40122363)
chr1 (118-204)||(6808507-6808595)
chr1 (78-207)||(3460710-3460841)
chr1 (118-192)||(16455676-16455750)
chr1 (64-137)||(37879005-37879079)
chr1 (67-136)||(8871143-8871213)
chr1 (149-230)||(37876767-37876848)
chr1 (69-168)||(12318585-12318685)
chr1 (86-150)||(48382441-48382505)
chr1 (82-145)||(32736952-32737015)
chr1 (82-145)||(35109493-35109556)
chr1 (64-234)||(10925223-10925397)
chr1 (118-192)||(5459961-5460035)
chr1 (149-210)||(36683766-36683828)
chr1 (78-194)||(37282728-37282846)
chr1 (307-346)||(10925464-10925504)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (1-366)||(3439441-3439805)
chr8 (1-366)||(25689892-25690259)
chr8 (1-347)||(15290461-15290810)
chr8 (1-347)||(15470830-15471179)
chr8 (1-347)||(42575207-42575555)
chr8 (9-338)||(2627679-2628012)
chr8 (9-348)||(31218193-31218541)
chr8 (9-346)||(34254217-34254560)
chr8 (11-346)||(34256393-34256734)
chr8 (9-346)||(17982589-17982935)
chr8 (22-348)||(19945243-19945578)
chr8 (31-346)||(42498153-42498477)
chr8 (9-346)||(44303790-44304137)
chr8 (78-346)||(1746105-1746371)
chr8 (64-342)||(15212786-15213064)
chr8 (64-346)||(33352150-33352432)
chr8 (64-230)||(4283524-4283691)
chr8 (64-230)||(42434992-42435159)
chr8 (78-324)||(12702542-12702787)
chr8 (64-234)||(43036423-43036594)
chr8 (66-234)||(40321082-40321251)
chr8 (64-346)||(27811278-27811560)
chr8 (64-230)||(18655400-18655567)
chr8 (64-342)||(4731658-4731936)
chr8 (64-234)||(3303667-3303838)
chr8 (64-234)||(40221745-40221916)
chr8 (64-224)||(18141821-18141981)
chr8 (70-346)||(30143346-30143622)
chr8 (64-193)||(30291606-30291737)
chr8 (64-224)||(1292471-1292631)
chr8 (68-234)||(41366612-41366778)
chr8 (64-181)||(9765745-9765863)
chr8 (67-234)||(6598975-6599143)
chr8 (67-234)||(6674428-6674596)
chr8 (67-204)||(40328782-40328922)
chr8 (68-234)||(5689275-5689442)
chr8 (67-193)||(44353796-44353923)
chr8 (66-237)||(10930193-10930365)
chr8 (68-230)||(11383989-11384152)
chr8 (64-230)||(8965692-8965859)
chr8 (139-234)||(4743211-4743306)
chr8 (67-234)||(1345368-1345536)
chr8 (64-175)||(19491755-19491867)
chr8 (118-225)||(18106087-18106191)
chr8 (9-230)||(4162436-4162663)
chr8 (118-225)||(10015136-10015241)
chr8 (123-230)||(3073875-3073981)
chr8 (64-223)||(3772192-3772352)
chr8 (149-219)||(8153844-8153914)
chr8 (149-230)||(4733792-4733873)
chr8 (69-136)||(1822297-1822365)
chr8 (69-136)||(1856742-1856810)
chr8 (69-172)||(10240159-10240264)
chr8 (88-206)||(11712024-11712145)
chr8 (68-150)||(41364927-41365011)
chr8 (88-136)||(6813771-6813818)
chr8 (118-193)||(7597669-7597745)
chr8 (149-181)||(10929874-10929906)
chr8 (69-140)||(29796413-29796485)
chr8 (287-323)||(32902096-32902132)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (1-366)||(20343834-20344201)
chr7 (1-350)||(18392075-18392426)
chr7 (1-350)||(18388639-18388990)
chr7 (1-366)||(6594420-6594788)
chr7 (1-296)||(24789778-24790075)
chr7 (1-366)||(6592202-6592570)
chr7 (1-350)||(32060201-32060556)
chr7 (22-361)||(43504025-43504365)
chr7 (9-349)||(39731313-39731656)
chr7 (9-342)||(35853851-35854194)
chr7 (141-350)||(1560544-1560757)
chr7 (22-347)||(25766842-25767175)
chr7 (1-134)||(1562103-1562234)
chr7 (22-346)||(23554990-23555323)
chr7 (9-346)||(29990991-29991335)
chr7 (1-349)||(48408731-48409092)
chr7 (9-346)||(25615799-25616137)
chr7 (9-345)||(4178711-4179054)
chr7 (64-234)||(34310712-34310884)
chr7 (64-234)||(14069830-14070001)
chr7 (64-234)||(14379858-14380029)
chr7 (64-342)||(27347817-27348095)
chr7 (64-230)||(22269973-22270140)
chr7 (64-234)||(41317431-41317602)
chr7 (9-329)||(19502114-19502443)
chr7 (64-234)||(30024729-30024900)
chr7 (64-230)||(8359316-8359485)
chr7 (64-226)||(6431971-6432134)
chr7 (64-346)||(18126644-18126928)
chr7 (64-228)||(29608737-29608902)
chr7 (47-234)||(41649008-41649202)
chr7 (9-222)||(47673953-47674175)
chr7 (64-346)||(26417316-26417598)
chr7 (64-344)||(48489431-48489711)
chr7 (64-230)||(3258995-3259162)
chr7 (64-230)||(4508707-4508874)
chr7 (64-234)||(8153342-8153513)
chr7 (118-230)||(32358055-32358167)
chr7 (64-210)||(48491579-48491727)
chr7 (64-230)||(48599335-48599502)
chr7 (64-230)||(4253529-4253697)
chr7 (64-346)||(43864244-43864526)
chr7 (82-237)||(2390301-2390456)
chr7 (64-234)||(31732966-31733137)
chr7 (64-225)||(2360978-2361140)
chr7 (64-193)||(4586161-4586291)
chr7 (64-234)||(36146405-36146576)
chr7 (64-234)||(47676133-47676304)
chr7 (291-366)||(24790230-24790303)
chr7 (47-230)||(31105394-31105585)
chr7 (47-234)||(38671219-38671414)
chr7 (67-234)||(495980-496148)
chr7 (83-223)||(23565069-23565210)
chr7 (64-220)||(23343975-23344130)
chr7 (89-233)||(2759195-2759339)
chr7 (64-230)||(4510549-4510716)
chr7 (64-230)||(4512391-4512558)
chr7 (69-225)||(22328395-22328556)
chr7 (47-234)||(1113633-1113828)
chr7 (64-230)||(36574517-36574683)
chr7 (118-237)||(6359946-6360065)
chr7 (64-135)||(24525992-24526065)
chr7 (129-230)||(18396384-18396486)
chr7 (149-234)||(24525499-24525584)
chr7 (64-234)||(12097864-12098027)
chr7 (149-223)||(31518988-31519063)
chr7 (157-232)||(30814530-30814605)
chr7 (64-173)||(31518795-31518905)
chr7 (83-136)||(28617182-28617234)
chr7 (187-231)||(28485811-28485854)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (1-366)||(6266628-6266993)
chr2 (1-350)||(12647265-12647616)
chr2 (44-350)||(13655908-13656220)
chr2 (9-349)||(32289509-32289853)
chr2 (9-349)||(4484211-4484562)
chr2 (62-354)||(30833342-30833638)
chr2 (9-348)||(4503017-4503364)
chr2 (9-346)||(45099691-45100036)
chr2 (9-342)||(5723146-5723486)
chr2 (9-346)||(36205551-36205895)
chr2 (9-346)||(36987961-36988307)
chr2 (64-346)||(6594890-6595175)
chr2 (9-234)||(2334414-2334649)
chr2 (64-230)||(45726929-45727096)
chr2 (64-329)||(29867869-29868133)
chr2 (47-234)||(34139767-34139963)
chr2 (64-346)||(38312240-38312522)
chr2 (47-234)||(723741-723936)
chr2 (47-234)||(14633822-14634018)
chr2 (64-346)||(17057255-17057537)
chr2 (64-346)||(17085238-17085520)
chr2 (64-230)||(35446885-35447052)
chr2 (64-234)||(36318006-36318177)
chr2 (64-234)||(36773562-36773733)
chr2 (64-234)||(11151588-11151759)
chr2 (64-230)||(26353184-26353351)
chr2 (64-228)||(1631735-1631900)
chr2 (69-230)||(33648176-33648340)
chr2 (47-210)||(42362328-42362500)
chr2 (64-232)||(24398055-24398228)
chr2 (47-234)||(11690477-11690672)
chr2 (64-225)||(42288117-42288278)
chr2 (64-234)||(33162447-33162618)
chr2 (64-195)||(13121769-13121899)
chr2 (156-234)||(17450671-17450748)
chr2 (118-230)||(17490149-17490261)
chr2 (64-181)||(7815323-7815441)
chr2 (64-234)||(11067305-11067476)
chr2 (118-230)||(7451173-7451284)
chr2 (157-234)||(39284930-39285007)
chr2 (68-193)||(14202450-14202569)
chr2 (163-207)||(42412118-42412162)
chr2 (73-231)||(24197906-24198065)
chr2 (122-219)||(28671989-28672088)
chr2 (82-134)||(28770730-28770781)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (1-366)||(27647800-27648157)
chr6 (1-366)||(16554806-16555173)
chr6 (1-366)||(16631362-16631729)
chr6 (1-366)||(16653049-16653416)
chr6 (1-366)||(16578382-16578749)
chr6 (1-366)||(16616631-16616998)
chr6 (1-350)||(25421242-25421595)
chr6 (1-350)||(6027185-6027535)
chr6 (9-329)||(412046-412369)
chr6 (1-347)||(34167017-34167366)
chr6 (9-353)||(3072636-3072984)
chr6 (1-350)||(33341982-33342336)
chr6 (1-347)||(34164795-34165144)
chr6 (35-347)||(13153886-13154201)
chr6 (1-353)||(6097326-6097672)
chr6 (1-353)||(2171406-2171770)
chr6 (9-346)||(31404561-31404905)
chr6 (9-346)||(16452214-16452561)
chr6 (9-348)||(30834418-30834768)
chr6 (22-324)||(5406109-5406416)
chr6 (22-324)||(5410434-5410741)
chr6 (64-346)||(5413281-5413561)
chr6 (64-230)||(21588931-21589098)
chr6 (64-230)||(21593664-21593831)
chr6 (64-329)||(33160254-33160521)
chr6 (135-346)||(5408956-5409164)
chr6 (64-237)||(3808701-3808877)
chr6 (64-346)||(9182917-9183199)
chr6 (67-230)||(17758026-17758191)
chr6 (64-230)||(2972940-2973107)
chr6 (64-230)||(17762990-17763158)
chr6 (66-230)||(26830124-26830289)
chr6 (47-234)||(16569019-16569193)
chr6 (64-230)||(22424826-22424995)
chr6 (64-230)||(28137409-28137576)
chr6 (67-230)||(5043630-5043795)
chr6 (47-234)||(26954283-26954477)
chr6 (98-237)||(603082-603222)
chr6 (64-234)||(33211182-33211353)
chr6 (64-181)||(3038953-3039071)
chr6 (64-181)||(4045423-4045542)
chr6 (118-230)||(26800642-26800755)
chr6 (47-131)||(16567182-16567265)
chr6 (316-366)||(6136165-6136216)
[»] chr4 (71 HSPs)
chr4 (1-366)||(8395542-8395910)
chr4 (1-350)||(8393333-8393684)
chr4 (1-350)||(7124838-7125191)
chr4 (1-350)||(7122619-7122972)
chr4 (9-361)||(31495177-31495541)
chr4 (1-335)||(5138227-5138565)
chr4 (1-335)||(5136001-5136340)
chr4 (1-349)||(13992174-13992525)
chr4 (9-346)||(56178522-56178868)
chr4 (9-324)||(29999719-30000037)
chr4 (83-346)||(5369968-5370232)
chr4 (64-346)||(48143042-48143330)
chr4 (64-346)||(52095248-52095530)
chr4 (68-237)||(2209717-2209889)
chr4 (9-346)||(9927345-9927689)
chr4 (64-227)||(41964415-41964580)
chr4 (64-342)||(34570304-34570582)
chr4 (64-234)||(12739547-12739718)
chr4 (64-234)||(36463386-36463557)
chr4 (64-230)||(40632445-40632612)
chr4 (64-237)||(26364236-26364410)
chr4 (66-234)||(46147388-46147557)
chr4 (64-230)||(46703500-46703669)
chr4 (64-234)||(47038408-47038577)
chr4 (64-230)||(12073392-12073560)
chr4 (66-237)||(12119540-12119714)
chr4 (83-234)||(12743922-12744073)
chr4 (83-234)||(12745311-12745462)
chr4 (64-234)||(26175633-26175804)
chr4 (64-230)||(41639426-41639593)
chr4 (64-230)||(37229722-37229890)
chr4 (64-234)||(48893635-48893810)
chr4 (64-237)||(54883020-54883194)
chr4 (64-232)||(36994524-36994693)
chr4 (67-230)||(379383-379548)
chr4 (82-230)||(6655975-6656123)
chr4 (64-230)||(8648139-8648306)
chr4 (64-210)||(8665408-8665556)
chr4 (64-234)||(45687179-45687351)
chr4 (9-232)||(37740562-37740794)
chr4 (64-230)||(6542180-6542349)
chr4 (47-234)||(52467351-52467546)
chr4 (71-230)||(5207843-5208003)
chr4 (64-234)||(5871820-5871991)
chr4 (64-234)||(27416962-27417133)
chr4 (118-230)||(50673848-50673960)
chr4 (68-237)||(50262694-50262865)
chr4 (64-346)||(52082549-52082825)
chr4 (64-193)||(4587958-4588089)
chr4 (64-193)||(12747794-12747924)
chr4 (64-232)||(54199906-54200074)
chr4 (64-234)||(5429679-5429850)
chr4 (83-191)||(12744087-12744195)
chr4 (64-191)||(12745476-12745604)
chr4 (64-222)||(35662441-35662600)
chr4 (64-230)||(31474150-31474318)
chr4 (79-225)||(26699447-26699596)
chr4 (149-329)||(29254580-29254758)
chr4 (64-181)||(24969112-24969230)
chr4 (9-230)||(51337000-51337231)
chr4 (47-234)||(3913424-3913618)
chr4 (138-234)||(13009441-13009536)
chr4 (27-66)||(35369614-35369653)
chr4 (118-206)||(33989899-33989989)
chr4 (68-136)||(48142473-48142542)
chr4 (64-152)||(41639263-41639353)
chr4 (78-136)||(1983252-1983309)
chr4 (69-150)||(44967910-44967992)
chr4 (82-133)||(5349929-5349980)
chr4 (118-204)||(33089933-33090021)
chr4 (64-150)||(55085445-55085532)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (1-366)||(2466-2834)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (1-350)||(3605-3956)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (1-366)||(6211-6581)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (9-349)||(11042-11393)
scaffold0491 (62-349)||(8616-8907)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (9-342)||(434469-434812)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (22-353)||(11508-11855)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (9-348)||(853-1200)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (9-342)||(114539-114881)
scaffold0016 (82-145)||(102450-102513)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (198-350)||(1-154)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (64-346)||(20301-20583)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (64-230)||(18004-18171)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (64-230)||(7327-7494)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (88-230)||(10515-10656)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (47-234)||(149094-149289)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (68-176)||(80338-80447)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (118-193)||(27480-27556)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 54635062 - 54635428
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635062 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 54635161  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  54635162 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagag 54635261  T
Q  200 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635262 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac 54635361  T
Q  300 ttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635362 ttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 54635428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 6716437 - 6716805
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716437 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 6716536  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6716537 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagag 6716636  T
Q  200 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||    
T  6716637 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctccccttttatcttgtgattgtatttttgagtttcaca 6716736  T
Q  299 cttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt-gttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716737 cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttggttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 6716805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 45282920 - 45283291
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282920 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgcaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 45283019  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc---ttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-c 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45283020 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccctttttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctcc 45283119  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45283120 agagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgtattgtgtt 45283218  T
Q  294 tctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45283219 tctcactagtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacaaacactttgtttggtg 45283291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 25637365 - 25637736
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25637365 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 25637462  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25637463 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccag 25637562  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattg--tgtattgtgtt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||  |||||||    
T  25637563 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtttgctttgtgtt 25637662  T
Q  294 tctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgtttggtg 366  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||| ||||    
T  25637663 tcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcctgcttgcacaatacactttgttaggtg 25637736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 3617386 - 3617739
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3617386 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 3617485  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3617486 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccag 3617585  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  3617586 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttc 3617684  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 350  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3617685 acacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 3617739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 27 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7780208 - 7779880
Alignment:
Q  27 tgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaat 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  7780208 tgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttcgtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaat 7780110  T
Q  126 ttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  7780109 ttcttgtaaccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtggg 7780010  T
Q  225 tgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtg-tttctcacttgtttcctagattagatctaggt 323  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7780009 tgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgtattgtgttttttcacttgtttcctagattagatctaggt 7779911  T
Q  324 ggtg-ttttgttgattattgcttgcacacac 353  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7779910 gctgtttttgttgattattgcttgcacacac 7779880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4600975 - 4600638
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4600975 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 4600878  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-a 196  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4600877 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcta 4600778  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||    
T  4600777 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgatt-tgtt 4600680  T
Q  294 tctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 335  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4600679 tcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttg 4600638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 353
Target Start/End: Original strand, 801035 - 801379
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattg 107  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  801035 tctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattg 801133  T
Q  108 tgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtagg 203  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  801134 tgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtagg 801233  T
Q  204 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct-cacttg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| | ||||||    
T  801234 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatc------ttgtgtattgtgtttttccacttg 801326  T
Q  303 tttcctagattagatctaggtg--gtgttttgttgattattgcttgcacacac 353  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  801327 tttcctagattagatctaggtgctgttttttgttgattattgcttgcacacac 801379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4598754 - 4598405
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4598754 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 4598657  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  4598656 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 4598557  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  | ||||    
T  4598556 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-tgctttgtt 4598459  T
Q  294 tctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  4598458 tcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgc 4598405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 10211332 - 10211681
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10211332 ttagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 10211429  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10211430 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 10211529  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |  | ||||    
T  10211530 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-tgctttgtt 10211627  T
Q  294 tctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10211628 tcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 10211681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 10209112 - 10209461
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10209112 ttagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 10209209  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10209210 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtagtccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 10209309  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtt 293  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |  | ||||    
T  10209310 gagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcatcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-tgctttgtt 10209407  T
Q  294 tctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10209408 tcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 10209461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 10056156 - 10056505
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10056156 ttagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 10056253  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10056254 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 10056353  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |  | ||||    
T  10056354 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtt 10056452  T
Q  294 tctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  10056453 tcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 10056505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 10058378 - 10058727
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10058378 ttagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 10058475  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10058476 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 10058575  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |  | ||||    
T  10058576 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtt 10058674  T
Q  294 tctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  10058675 tcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 10058727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 10060600 - 10060949
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10060600 ttagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 10060697  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10060698 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 10060797  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |  | ||||    
T  10060798 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtt 10060896  T
Q  294 tctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  10060897 tcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 10060949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 10062822 - 10063171
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10062822 ttagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 10062919  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10062920 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 10063019  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |  | ||||    
T  10063020 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtt 10063118  T
Q  294 tctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  10063119 tcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 10063171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 10065044 - 10065393
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10065044 ttagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 10065141  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10065142 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 10065241  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |  | ||||    
T  10065242 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtt 10065340  T
Q  294 tctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  10065341 tcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 10065393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23200376 - 23200020
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg------gtgagattgggaaaag-ggtagaaatt 92  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||||  ||||||||||    
T  23200376 ttagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaatggtagaaatt 23200277  T
Q  93 agggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctc 190  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23200276 agagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatct-ttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctc 23200179  T
Q  191 tcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattg 289  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  23200178 tcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttatgcttgtggtttg 23200081  T
Q  290 tgtttctca-cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac 349  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  23200080 tgtttttcattttgtttcctagattagatctaggtgttttattgttgattattgcttgcac 23200020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23198177 - 23197823
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg------gtgagattgggaaaag-ggtagaaatt 92  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||||  ||||||||||    
T  23198177 ttagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaatggtagaaatt 23198078  T
Q  93 agggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctc 190  Q
    || ||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23198077 agagtt-gttttttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatct-ttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctc 23197980  T
Q  191 tcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattg 289  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||    
T  23197979 tcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtctttgttttcctcttctctctccttttatcttgtgcttgtggtttg 23197882  T
Q  290 tgtttctca-cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    
T  23197881 tgtttttcattttgtttcctagattagatctatgtgttttattgttgattattgcttgc 23197823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19684054 - 19683774
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctt 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |    
T  19684054 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcat 19683957  T
Q  164 tgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccct 262  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||    
T  19683956 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ct 19683861  T
Q  263 ctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcacttgt-ttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    ||||||||||||| || |||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19683860 ctccttttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcacttttattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 19683774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5258376 - 5258028
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtt 98  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5258376 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt 5258277  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc- 195  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  5258276 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctcc 5258179  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  ||||| ||     
T  5258178 agagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggtttgtgcttt 5258083  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgca 348  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  5258082 tcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgca 5258028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9636366 - 9636010
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggt-------gagattggga--aaagggtagaaa 90  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||  ||||||||||||    
T  9636366 ttagagtctctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggagaaaagggtagaaa 9636267  T
Q  91 ttagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatc 188  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  9636266 ttagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgtatct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatc 9636169  T
Q  189 tctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtat 287  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||   ||| | ||| |||||||||||||| |||||  |    
T  9636168 tctcctccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctctt-ggtgtgtttgtttctctctgctctc-ccttttatcttgtgcttgtgatt 9636071  T
Q  288 tgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    | || || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9636070 tatgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 9636010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 45095101 - 45095445
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  45095101 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-g 45095199  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-ag 197  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  45095200 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctag 45095298  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||   |||   ||||||||||||||| || |||||  ||||||||  |    
T  45095299 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggcgtatttgttt--ctctattctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgttttac 45095394  T
Q  298 ac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     | ||| ||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  45095395 tctttgattcatagattagatctatgtgctgttattgttgattattgcttg 45095445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5260555 - 5260206
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggt-------gagattgggaaaa--gggtagaaattagggtt 98  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5260555 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt 5260456  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc- 195  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  5260455 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctcc 5260358  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttc 295  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  ||||| ||     
T  5260357 aaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggtttgtgcttt 5260262  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcac 349  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5260261 tcactttgattcctaaattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 5260206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 10067266 - 10067419
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10067266 ttagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 10067363  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 155  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10067364 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaa 10067419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 342
Target Start/End: Original strand, 37408458 - 37408737
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  37408458 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaact 37408555  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||     
T  37408556 cattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt- 37408652  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgtg-tattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 342  Q
     ||||||||||||||| || ||||| | | ||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37408653 -ctctccttttatcttttgcttgtgatttagtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 37408737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 7764404 - 7764747
Alignment:
Q  9 tctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  7764404 tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga--gggaaaagggtagaaattagggtt-g 7764500  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-ag 197  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  7764501 ttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatgaatctctcctccag 7764599  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttct 296  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||| || |    
T  7764600 agtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgtttgtggttttgtgctttt 7764695  T
Q  297 cac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7764696 cactttgattccaagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 7764747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 346
Target Start/End: Original strand, 7762226 - 7762548
Alignment:
Q  32 aacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagct 122  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||       |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||    
T  7762226 aacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagct 7762324  T
Q  123 aatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaac 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7762325 aatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaac 7762423  T
Q  221 tgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatc 318  Q
    |||||||||||  ||| || ||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| |||||| ||||||||    
T  7762424 tgggtgaacaa--tctatgatgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctaaattagatc 7762519  T
Q  319 taggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  7762520 taggtgttgttattgttgattattacttg 7762548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 346
Target Start/End: Original strand, 9581259 - 9581565
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct- 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||      
T  9581259 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgggattcggaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaaccca 9581357  T
Q  138 tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctct 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  9581358 tttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tct 9581454  T
Q  237 ttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgt 333  Q
    ||| ||  |||||||   ||||  |||||| ||||| ||||| |||| || ||||| || |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9581455 ttgatgtgtttgtttctctctt--ctctccctttattttgtgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcatagattagatctaggtgctgttattgt 9581552  T
Q  334 tgattattgcttg 346  Q
    |||||||||||||    
T  9581553 tgattattgcttg 9581565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 6718621 - 6718718
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718621 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt 6718718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 34491212 - 34491383
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  34491212 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 34491309  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34491310 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatct 34491383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 49199638 - 49199462
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  49199638 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 49199541  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 237  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49199540 tcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagactaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 49199462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 4569952 - 4570120
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  4569952 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 4570049  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4570050 cattgatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttggaccgaactgggtcaaca 4570120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5236624 - 5236343
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  5236624 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 5236527  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttcc 260  Q
    | |||||| |||||| |||||  |||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||       
T  5236526 cattgataatggattcgagagatcaatctttccccagattaggtcaa-tttggaccaaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctctt 5236432  T
Q  261 ctctccttttatcttgtgattgtgta-ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    ||||||||||||||| || ||||| | ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||    
T  5236431 ctctccttttatcttttgcttgtggatttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggagctcttattgttgattattgcttg 5236343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29196555 - 29196383
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29196555 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29196457  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29196456 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29196383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44700646 - 44700476
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44700646 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 44700549  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  44700548 ctttgatagtggattggagagatcaatctctccccacattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 44700476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39153553 - 39153358
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-c 136  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |    
T  39153553 gaaaatcattgagtgtcttgttcatgtgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactc 39153455  T
Q  137 ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  39153454 atttgtatcccttta-taagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 39153358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43401970 - 43401794
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||||||||    
T  43401970 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctcttt-gtaagaac 43401873  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 237  Q
    || ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43401872 tcattgatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 43401794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 40734498 - 40734669
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  40734498 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatcccttt-gtaagaact 40734595  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40734596 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40734669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 44331545 - 44331716
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  44331545 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctcttt-gtaagaact 44331642  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44331643 tattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 44331716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 237
Target Start/End: Original strand, 30236129 - 30236299
Alignment:
Q  68 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  30236129 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 30236226  T
Q  165 gatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 237  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  30236227 gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatttctt 30236299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 347
Target Start/End: Original strand, 10067439 - 10067592
Alignment:
Q  195 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |  | ||    
T  10067439 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctttg 10067537  T
Q  292 tttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  10067538 tttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 10067592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43403913 - 43403737
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||||   | || |||| |||| ||||||||    
T  43403913 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggctt-gttctttgtgagcttgttgaagctcatttcttgtaactcatgttttatctcttt-gtaagaac 43403816  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 237  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43403815 tcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 43403737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6095767 - 6095600
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  6095767 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6095670  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6095669 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgtgtgaaca 6095600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 234
Target Start/End: Original strand, 760806 - 761018
Alignment:
Q  31 aaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aag 120  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||  |||    
T  760806 aaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tctgttctttgtgagcttgtttaag 760904  T
Q  121 ctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccga 218  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||    
T  760905 ctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactga 761002  T
Q  219 actgggtgaacaatct 234  Q
    | ||||| ||||||||    
T  761003 aatgggttaacaatct 761018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22835194 - 22835010
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  22835194 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaaccc 22835096  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcc-tcagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 223  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22835095 atttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 22835010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 29682335 - 29682530
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| |||     
T  29682335 gaaaatcattgagtgtcttgtttatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcaccc 29682433  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29682434 atttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29682530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 31314447 - 31314616
Alignment:
Q  66 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 162  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  31314447 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaactct 31314544  T
Q  163 ttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| || || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  31314545 ttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct 31314616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41819691 - 41819523
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  41819691 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 41819594  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    || || |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  41819593 tcatt-atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtgaaca 41819523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 342
Target Start/End: Original strand, 40735383 - 40735660
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  40735383 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccagtttgtatctcttt-gtaagaact 40735480  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||  ||||  ||| |||      
T  40735481 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcagcaa--tctttggtgtatttg--ttcctctct 40735575  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgtgta-ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 342  Q
     |||||| |||||||| || ||||| | ||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40735576 tctctcc-tttatcttttgcttgtggatttgtgcttttcactttggttcctatattagatctaggtgctgttattgttgattattg 40735660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 54593704 - 54593871
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  54593704 ttggtgagattgggaaaatgtgcagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54593801  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  54593802 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatgtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 54593871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 344
Target Start/End: Original strand, 51398818 - 51399094
Alignment:
Q  68 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcttt 164  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  51398818 tgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 51398915  T
Q  165 gatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctc 263  Q
    |||||||||||||||||    |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||   |||    
T  51398916 gatagtggattggagagatttatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctcttctc 51399010  T
Q  264 tccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgct 344  Q
    ||| |||||||| || |||| || ||||  || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  51399011 tccctttatcttttgcttgtggttttgtacttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgct 51399094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Original strand, 29810868 - 29811150
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29810868 ttggtgagattaggaaaatatgtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29810965  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| ||  |||||| ||||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||      
T  29810966 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttaaaccgaattgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcatctct 29811060  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     |||||| |||||||| || |||| || ||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29811061 tctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 29811150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32744658 - 32744433
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatt 106  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||| |||  ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||| |||||||||||||  ||||||| ||    
T  32744658 tctcttgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatcattgagtattttg-tgagattgaaaaaatgggtagaaattag--tttgttcttt 32744562  T
Q  107 gtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtagg 203  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| | || |||| ||||    
T  32744561 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcacttt-gtaagaactctttgatagtggattgaagagataaatctatcccccagattagg 32744463  T
Q  204 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32744462 tcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 32744433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 46860474 - 46860642
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  46860474 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataact 46860571  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||   |||||||||| ||| ||||||    
T  46860572 cattgatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaattggatgaaca 46860642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 53921671 - 53921511
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  53921671 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttgtttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgtatca-ttttgtaagaact 53921574  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 223  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  53921573 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagttt-gaccgaactgg 53921511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 29813063 - 29813234
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||    
T  29813063 ttggtgagattggaaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctcttt-gtaagaact 29813160  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | || ||||||||||||||||  |||||||| || |||| | ||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  29813161 catttatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcatg-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29813234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 223
Target Start/End: Original strand, 32891105 - 32891264
Alignment:
Q  66 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactct 162  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||     
T  32891105 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcg 32891203  T
Q  163 ttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 223  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| || | |||||||||| | ||||||||||||||    
T  32891204 ttgatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggtcatg-ttggaccgaactgg 32891264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 16499006 - 16499200
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||| | |||||  ||||||||||||||| |||     
T  16499006 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttt--ttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttaccc 16499103  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16499104 atttatatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 16499200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913467
Alignment:
Q  122 taatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaa 219  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaa 40913449  T
Q  220 ctgggtgaacaatctctt 237  Q
    |||||| |||||||||||    
T  40913450 ctgggtcaacaatctctt 40913467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 221
Target Start/End: Original strand, 46173377 - 46173515
Alignment:
Q  83 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 180  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  46173377 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaattcattgatagtggattggaga 46173474  T
Q  181 gtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaact 221  Q
    |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  46173475 gatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 46173515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9666659 - 9666463
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-c 136  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||| |    
T  9666659 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattagattttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactc 9666560  T
Q  137 ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     ||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9666559 atttata-cctctttgtaagaattctttgatagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 9666463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23392077 - 23391906
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||    
T  23392077 ttggtgagtttgggaaaatgagtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaagataatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gcaagaact 23391980  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23391979 ctttgatagtggattgtagagataaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 23391906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 232
Target Start/End: Original strand, 47304254 - 47304420
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttt-tgtatcccttttgtaagaactctt 163  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  ||| |||| ||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| |    
T  47304254 gtgagattgagaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagttaatatcttgtaacccatctgtatctcttc-gtaagaactcat 47304351  T
Q  164 tgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 232  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47304352 tgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaat 47304420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 51352278 - 51352150
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactct 162  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | || | ||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||     
T  51352278 ttggtgagattaggaaaatgatagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaaccatttgtatttc-tttgtaataactca 51352180  T
Q  163 ttgatagtggattggagagtacaatctctc 192  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  51352179 ttgagagtggatttgagagatcaatctctc 51352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 55302079 - 55301972
Alignment:
Q  124 atttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaact 221  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||    
T  55302079 atttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaattcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaact 55301981  T
Q  222 gggtgaaca 230  Q
     ||||||||    
T  55301980 tggtgaaca 55301972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5434086 - 5433971
Alignment:
Q  31 aaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaag 120  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||    
T  5434086 aaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaag 5433987  T
Q  121 ctaatttcttgtaacc 136  Q
    ||||||||||||||||    
T  5433986 ctaatttcttgtaacc 5433971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 193
Target Start/End: Original strand, 36018852 - 36018982
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||    
T  36018852 ttggtgaaattgggaaaatgggttgaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaac 36018949  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 193  Q
    || || ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36018950 tcatt-atagtggattggagaggtcaatctctcc 36018982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4055926 - 4055813
Alignment:
Q  69 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgt-caagctaatttcttgtaac--cttttgtatcccttttgtaag-aactcttt 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | | ||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| ||||| ||    
T  4055926 gagattgggaaatgggtagaaattagg--ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctc-tttgtaagaaactcatt 4055830  T
Q  165 gatagtggattggagag 181  Q
    |||||||||||| ||||    
T  4055829 gatagtggattgaagag 4055813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23410561 - 23410326
Alignment:
Q  9 tctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtt 98  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||       |||| ||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  23410561 tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgaaatttggaaaatgggtagaaattatg-tt 23410463  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctc 195  Q
    | ||| |||||| |||||  ||||||||||| | |||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||| || |    
T  23410462 tattctttgtgagcttgtttaagctaatttcgtataacccatttgtatcacttt-gtaagaactcttagataatggattggagagataaatctctccccc 23410364  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | | ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  23410363 aaattaggtcaag-ttggaacgaattgggtcaacaatct 23410326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 28253423 - 28253363
Alignment:
Q  76 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac 135  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||    
T  28253423 ggaaaatggtagaaattagggttcgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaac 28253363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4075581 - 4075520
Alignment:
Q  122 taatttcttgtaacct--tttgtatcccttttgtaagaa-ctctttgatagtggattggagag 181  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4075581 taatttcttgtaacctcttttgtatcacttt-gtaagaaactctttgatagtggattggagag 4075520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 304 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9634750 - 9634707
Alignment:
Q  304 ttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9634750 ttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 9634707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305719
Alignment:
Q  164 tgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactg 222  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa-tttggaccgaactg 27305719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25517121 - 25517069
Alignment:
Q  84 gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||    
T  25517121 gtagaaattagggtttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttataacct 25517069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2075143 - 2075076
Alignment:
Q  163 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  2075143 ttgatagtggatttgagagatcaatctctccccgagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggtaaaca 2075076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 4386875 - 4386926
Alignment:
Q  84 gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc 136  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  4386875 gtagaaattaggttttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttgtaacc 4386926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 29720301 - 29720667
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29720301 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttag 29720400  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-aga 198  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29720401 ttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctctaga 29720500  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720501 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt-ggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctca 29720599  T
Q  299 cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29720600 cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgtacacacactttgtttggtg 29720667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 29722461 - 29722827
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29722461 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttag 29722560  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-aga 198  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29722561 ttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccaga 29722660  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctca 298  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722661 gtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatctctt-ggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctca 29722759  T
Q  299 cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29722760 cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgtacacacactttgtttggtg 29722827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29751391 - 29751024
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751391 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 29751292  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-aga 198  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29751291 ttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccaga 29751192  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg-cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29751191 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt-ggtgtcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtactgtgtttctc 29751093  T
Q  298 acttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29751092 acttgttttctagattatatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacacattgtttggtg 29751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22536518 - 22536169
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536518 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgcagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 22536421  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22536420 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggggagtacaatctctcctccagag 22536321  T
Q  200 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22536320 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccctccccttttatcttgtgattgtgttttgagtttctcac 22536222  T
Q  300 ttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacac 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22536221 ttgtttcctagattagatctaggt-gttttttgttgattgttgcttgcatacac 22536169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 10593195 - 10593564
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10593195 ttagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggagaagggtagaaattagggtttg 10593294  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-caga 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10593295 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccaga 10593394  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||     
T  10593395 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtatttgttttctacttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttca 10593493  T
Q  297 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgtttggtg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||    
T  10593494 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaatacactttgtttggtg 10593564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 25078057 - 25078410
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25078057 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 25078156  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25078157 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccag 25078256  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  25078257 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttc 25078355  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 350  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25078356 acacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 25078410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 25136026 - 25136379
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25136026 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 25136125  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25136126 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccag 25136225  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  25136226 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttc 25136324  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 350  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25136325 acacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 25136379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9789448 - 9789101
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattg 107  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  9789448 tctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttccttg 9789350  T
Q  108 tgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggt 204  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  9789349 tgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 9789250  T
Q  205 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  9789249 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccgtttatcttgtgcttgtgtattgtgtttttcacttctt 9789150  T
Q  305 tcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacac 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9789149 tcctagattagatctaggtgctgttttgttgatttttgcttgcacacac 9789101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 40380029 - 40380397
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40380029 ttagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 40380126  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  40380127 ttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccag 40380226  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  40380227 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttc 40380325  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgtttggtg 366  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | |||||||||||||    
T  40380326 acacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtg 40380397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 40382240 - 40382608
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  40382240 ttagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaagttagggtttg 40382337  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  40382338 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccag 40382437  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  40382438 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttc 40382536  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgtttggtg 366  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | |||||||||||||    
T  40382537 acacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtg 40382608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18441872 - 18441521
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattg 107  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  18441872 tctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttccttg 18441774  T
Q  108 tgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggt 204  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18441773 tgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctctagagtaggt 18441674  T
Q  205 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtg----tttctcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    ||| |||||    
T  18441673 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccgtttatcttgtgcttgtgtattgtgtttttttttcact 18441574  T
Q  301 tgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacac 353  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18441573 tctttcctagattagatctaggtgctgttttgttgattattgcttgcacacac 18441521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Original strand, 16409419 - 16409764
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattg 107  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  16409419 tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttg 16409517  T
Q  108 tgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggt 204  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16409518 tgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 16409617  T
Q  205 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||| ||||    
T  16409618 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgt 16409717  T
Q  304 ttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcac 349  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16409718 ttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 16409764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 16544346 - 16544697
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16544346 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 16544443  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16544444 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttctcataacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 16544543  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct---tttatcttgtgattgtgtattgtgt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||   |  | |||    
T  16544544 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctttgt 16544642  T
Q  293 ttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16544643 ttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 16544697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 16546568 - 16546919
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16546568 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattaggaaaggggtagaaattagggtttg 16546665  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16546666 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 16546765  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct---tttatcttgtgattgtgtattgtgt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||   |  | |||    
T  16546766 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctttgt 16546864  T
Q  293 ttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16546865 ttcacacttgtttcctagattggatttaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 16546919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 353
Target Start/End: Original strand, 26177827 - 26178175
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattg 107  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  26177827 tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg-aaaagggtagaaattagggtt-gttctttg 26177924  T
Q  108 tgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggt 204  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26177925 tgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 26178024  T
Q  205 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||| |||     
T  26178025 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttga 26178124  T
Q  304 ttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacacac 353  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||    
T  26178125 ttcctagattagatctaggtgttgttatcattgattattgcttgcacacac 26178175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 353
Target Start/End: Original strand, 26170718 - 26171055
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattg 107  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||    
T  26170718 tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg-aaaagggtagaaattaggatt-gttctttg 26170815  T
Q  108 tgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtc 205  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||           ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26170816 tgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact----------cttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtc 26170905  T
Q  206 aagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctca-cttgtt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||  ||| |    
T  26170906 aagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcattttgat 26171005  T
Q  305 tcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacacac 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||    
T  26171006 tcctagattagatctaggtgttgttatcatcgattattgcttgcacacac 26171055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 25412698 - 25413042
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25412698 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-g 25412796  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-ag 197  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  25412797 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccag 25412895  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctc 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || ||    
T  25412896 agtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttc 25412991  T
Q  298 ac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25412992 tctttgattcctagattagatataggtgctgttattgttgattattgcttg 25413042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 348
Target Start/End: Original strand, 30182525 - 30182872
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  30182525 tctcttgggttgggaaacattgcaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt- 30182623  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  30182624 gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctatctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 30182722  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 296  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||   ||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |    
T  30182723 gagtatgtcaagtttggaccgaactggatgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttgtgcttgtgttttgtgctttt 30182818  T
Q  297 cac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgca 348  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  30182819 cactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgtttgca 30182872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 348
Target Start/End: Original strand, 13342997 - 13343344
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtt 98  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13342997 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt 13343096  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc- 195  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  13343097 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttg--aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcc 13343193  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  ||||| ||     
T  13343194 agagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttgatgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggtttgtgcttt 13343289  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgca 348  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13343290 tcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgca 13343344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36074276 - 36073927
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa----gggtagaaattaggg 96  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  36074276 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattaggg 36074177  T
Q  97 tttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct 194  Q
    || |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36074176 tt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcct 36074080  T
Q  195 -cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtt 293  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  ||||| |    
T  36074079 ccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatgttttgcttgtgatttgtgct 36073984  T
Q  294 tctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgca 348  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36073983 tttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgca 36073927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Original strand, 13239688 - 13240016
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  13239688 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaatggtagaaattagggttt 13239787  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
     ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  13239788 -ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 13239885  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||||||     
T  13239886 gagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaa--tttttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgtttt 13239981  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 329  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  13239982 tcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 13240016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 234
Target Start/End: Original strand, 37439161 - 37439313
Alignment:
Q  83 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 180  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37439161 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaga 37439258  T
Q  181 gtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37439259 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 37439313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 329
Target Start/End: Original strand, 32636824 - 32637088
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  32636824 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 32636921  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||   |||||    
T  32636922 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctcttc 32637018  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgtg-tattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 329  Q
    |  |||| ||||||||||| ||||| | ||| |||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  32637019 c--ctccctttatcttgtgcttgtgattttgagtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 32637088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 213465 - 213633
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  213465 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 213562  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213563 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 213633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 40147261 - 40147428
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  40147261 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 40147358  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40147359 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 40147428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 28278316 - 28278485
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  28278316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 28278413  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 232  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28278414 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaat 28278485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30683152 - 30682809
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  30683152 tctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt- 30683054  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaa--ctctttgatagtggattggagagtacaatctct-cct 194  Q
       | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||     
T  30683053 ---ctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaagaatactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 30682958  T
Q  195 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta-ttgtgtt 293  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||   ||||||||||||||| || ||||| | ||||| |    
T  30682957 cagattaggtcaag-ttggaccgaact-ggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccttttatcttttgcttgtgaatttgtgct 30682864  T
Q  294 tctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30682863 tttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 30682809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 13488203 - 13488374
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  13488203 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13488300  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  13488301 cattgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatct 13488374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42428598 - 42428427
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  42428598 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42428501  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  42428500 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 42428427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 5058047 - 5058212
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||  |||||| ||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||    
T  5058047 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttc--tgtgagcttgttgaagctattttcttgtatcccatttgtatctcttt-gtaagaact 5058142  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5058143 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 5058212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8566138 - 8565943
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  8566138 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaacttagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaaccc 8566040  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  8566039 atttgtatccctct-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcacccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 8565943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 533769 - 533940
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  533769 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggt-ctttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 533866  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||| ||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  533867 cattgatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 533940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27637781 - 27637615
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  27637781 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 27637684  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 228  Q
    || || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27637683 tcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaa 27637615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 251
Target Start/End: Original strand, 33831616 - 33831866
Alignment:
Q  9 tctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtt 98  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||        |||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  33831616 tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tt 33831714  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctc 195  Q
    ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| || |    
T  33831715 tgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctccccc 33831813  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttt 251  Q
    | | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||    
T  33831814 atattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaa--tctttggtgtttttgttt 33831866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39468741 - 39468587
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  39468741 gaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaaccc 39468643  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 193  Q
     |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  39468642 atttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcc 39468587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13695859 - 13695740
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 161  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||    
T  13695859 ttggagagattgggaaaagggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactc 13695760  T
Q  162 tttgatagtggattggagag 181  Q
     || |||||||||| |||||    
T  13695759 attaatagtggattagagag 13695740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28750823 - 28750652
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||  ||| ||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  28750823 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaact 28750726  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||    
T  28750725 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaattgggtcaataatct 28750652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 31182949 - 31183138
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctt 138  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||  ||||  ||| ||||||||||||||| |    
T  31182949 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagtttgtttaagttaatttcttgtaaccat 31183047  T
Q  139 ttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31183048 ttgtatccc-tttgtaagaactcattgatactggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaaca 31183138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42426403 - 42426232
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  42426403 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42426306  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || | || ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  42426305 cattgatagtggattggagagatcaatctctccccctgattaggtcaag-ttggactgaactaggtcaacaatct 42426232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Original strand, 538028 - 538196
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |    
T  538028 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gctctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 538125  T
Q  164 tgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  538126 tgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 538196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Original strand, 16452084 - 16452247
Alignment:
Q  68 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 164  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  16452084 tgagattggaaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttctgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 16452181  T
Q  165 gatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
     ||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16452182 catagtggattggagagataaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 16452247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Original strand, 38747009 - 38747176
Alignment:
Q  68 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| | || ||||| ||    
T  38747009 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttggaaa-aactcatt 38747106  T
Q  165 gatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  38747107 gatagaggattggagagatcaatctctccctcagatcaggtcaag-ttggaccaaactgggtcaataatct 38747176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3075823 - 3075659
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 163  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |    
T  3075823 gtgagattgagaaaataggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgctgaatctaatttcttgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaattcgt 3075726  T
Q  164 tgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  3075725 tgatagtgaattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccaaattgggtgaaca 3075659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16641091 - 16640941
Alignment:
Q  78 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 175  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||    
T  16641091 aaaatggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaagctgatttctgataactcttttgtatctcttt-gtaagaact---tgatagtggatt 16640996  T
Q  176 ggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  16640995 ggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-tagggccgaactgggtaaaca 16640941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9049506 - 9049392
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcttt 164  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  9049506 gtgagtttgggaaaatgatagaaattagtgtttgttt-ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctcttt-gtaagaactcatt 9049409  T
Q  165 gatagtggattggagag 181  Q
    || ||||||||||||||    
T  9049408 gacagtggattggagag 9049392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 27015531 - 27015690
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 161  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||       | || |||||||| |||| ||||||||||    
T  27015531 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaat-------acccatttgtatctcttt-gtaagaactc 27015621  T
Q  162 tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
     |||||||||||||| | ||  ||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27015622 attgatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 27015690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 232
Target Start/End: Original strand, 316769 - 316933
Alignment:
Q  70 agattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgat 167  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||    
T  316769 agattgagaaaaaggtagaaattagg-tttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgat 316867  T
Q  168 agtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 232  Q
    | ||||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||    
T  316868 aatggatcggagggatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaacttggtaaacaat 316933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 234
Target Start/End: Original strand, 19806454 - 19806534
Alignment:
Q  154 aagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19806454 aagaactccttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 19806534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33906144 - 33906028
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggac 215  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||| | | ||||||||||||  ||||||    
T  33906144 aagctaacttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtagattggaaagatcaatctcttccctagagtaggtcaatgttggac 33906045  T
Q  216 cgaactgggtgaacaat 232  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  33906044 cgagctgggtaaacaat 33906028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42310048 - 42309973
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 193  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  42310048 aagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaacttattgatagtggattagcgagatcaatctctcc 42309973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10054929 - 10054867
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactctttgatagtggattggaga 180  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  10054929 aagctaatttcttataaccttttgtatctc-tttgtaatgaactcattgatagtgtattggaga 10054867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 230
Target Start/End: Original strand, 42926977 - 42927058
Alignment:
Q  149 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42926977 tttgtaagaactcattgacagtggattgaagaaataaatctctctctcatagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 42927058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 225
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160762
Alignment:
Q  166 atagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 225  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggt 4160762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 40282314 - 40282676
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40282314 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttag 40282413  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-aga 198  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40282414 ttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccaga 40282513  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282514 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt-ggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctca 40282612  T
Q  299 cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgttt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282613 cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgttt 40282676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20622469 - 20622102
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20622469 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagggaaaatcattgactgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-g 20622371  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccttttgtatccctttt--gtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-a 196  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20622370 ttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcca 20622271  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622270 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt-ggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 20622172  T
Q  297 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622171 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 20622102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 21053895 - 21054248
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21053895 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagaaaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagtgtagaaattagggtttg 21053994  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-caga 198  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21053995 ttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccaga 21054094  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054095 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctca 21054193  T
Q  299 cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacac 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054194 cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacac 21054248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 9036354 - 9036721
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036354 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 9036453  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9036454 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcgagag 9036553  T
Q  200 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  9036554 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcac 9036652  T
Q  298 acttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9036653 acttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaaacactttgtttggtg 9036721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 9987139 - 9987492
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9987139 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-g 9987237  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-aga 198  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9987238 ttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttgcaagaactcattgatagtggattggagagtacaatctctcctccaga 9987337  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg-cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9987338 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtatagtgtttctc 9987436  T
Q  298 acttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacac 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987437 acttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacac 9987492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 44203570 - 44203938
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44203570 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 44203667  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44203668 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccag 44203767  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  44203768 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttc 44203866  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgtttggtg 366  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | |||||||||||||    
T  44203867 acacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtg 44203938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Original strand, 51765332 - 51765684
Alignment:
Q  9 tctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||      ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  51765332 tctcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtttgattgggagaaaagggtagaaattagggttgt 51765431  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
      | ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  51765432 acctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 51765531  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || |    
T  51765532 gagtaggacaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtggtttgtgctttt 51765629  T
Q  297 cac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcac 349  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  51765630 cactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 51765684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13316521 - 13316236
Alignment:
Q  63 cttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  13316521 cttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaac 13316424  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttctt 258  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||   ||||    
T  13316423 tcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttagtgagtttgtttctctctt 13316326  T
Q  259 ccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgca 348  Q
      |||||||||||| || || |||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13316325 --ctctccttttatattttgcttgtggtttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgca 13316236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8550979 - 8550670
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-c 136  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| |    
T  8550979 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactc 8550881  T
Q  137 ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc 235  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  8550880 atttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tc 8550784  T
Q  236 tttggtgcttttgttttct-tcttccctctccttttatcttgtgattgtg-tattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-tt 331  Q
    |||||||  |||||||||| |||| | ||||  ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  8550783 tttggtgtgtttgttttctctctt-cttctctctttatcttgtgcttgtgattttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttatt 8550685  T
Q  332 gttgattattgcttg 346  Q
    |||||||||||||||    
T  8550684 gttgattattgcttg 8550670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 20762608 - 20762950
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtt 98  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||       ||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  20762608 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggtt 20762707  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-c 195  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  20762708 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttc-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctac 20762805  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgttt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||| ||    
T  20762806 agagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgctt 20762901  T
Q  295 ctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     ||||    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20762902 ttcac----ttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 20762950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 3189267 - 3189590
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||       |||||||| |||||| ||||| |||||||||||     
T  3189267 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt- 3189365  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-a 196  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || |    
T  3189366 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatcca 3189464  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||| ||     
T  3189465 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttt 3189560  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtg 324  Q
    |||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  3189561 tcactttgattactagattagatctaggtg 3189590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 3198084 - 3198407
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||       |||||||| |||||| ||||| |||||||||||     
T  3198084 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt- 3198182  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-a 196  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || |    
T  3198183 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatcca 3198281  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||| ||     
T  3198282 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttt 3198377  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtg 324  Q
    |||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  3198378 tcactttgattactagattagatctaggtg 3198407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 3206923 - 3207246
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||       |||||||| |||||| ||||| |||||||||||     
T  3206923 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt- 3207021  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-a 196  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || |    
T  3207022 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatcca 3207120  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||| ||     
T  3207121 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttt 3207216  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtg 324  Q
    |||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  3207217 tcactttgattactagattagatctaggtg 3207246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 3156802 - 3157147
Alignment:
Q  9 tctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  3156802 tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccctggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt- 3156900  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctca 196  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||    
T  3156901 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 3156999  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttc 295  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| || ||||| ||     
T  3157000 tattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttt 3157094  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3157095 tcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 3157147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 37168297 - 37168465
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  37168297 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 37168394  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37168395 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 37168465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13547257 - 13547090
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  13547257 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13547160  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13547159 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 13547090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42298143 - 42297968
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  42298143 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 42298046  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 237  Q
    | |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42298045 cattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 42297968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4552869 - 4552634
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtt 98  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  4552869 tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgggtgagggaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tt 4552771  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctc 195  Q
    ||| | |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  4552770 tgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtatcccttt-gtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctccctc 4552672  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4552671 agagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 4552634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 342
Target Start/End: Original strand, 44455160 - 44455438
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  44455160 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttgtaagaact 44455257  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||||  ||| |||      
T  44455258 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacga--tctttggtgtgtttg--ttcctctct 44455352  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 342  Q
     |||| | |||||||| || || | || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44455353 tctcttcctttatcttttgcttttggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 44455438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Original strand, 49918350 - 49918632
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  49918350 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 49918447  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||      
T  49918448 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctct 49918542  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgtgta-ttgtgtttctca-cttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     ||||||||||||||| || ||||| | ||||| || |||  ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  49918543 tctctccttttatcttttgcttgtggatttgtgcttttcattttgattcctagattagatataggtgctgttattgttgattattgcttg 49918632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13549168 - 13549001
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagc-taatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  13549168 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13549071  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13549070 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 13549001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28220394 - 28220223
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  28220394 ttggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28220297  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28220296 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28220223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28265722 - 28265551
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  28265722 ttggcgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28265625  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28265624 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28265551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 29136247 - 29136415
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||||  |||||||  |||| |||||||||    
T  29136247 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtatttcttt-gtaagaact 29136344  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29136345 cattgatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaaca 29136415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47255508 - 47255340
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  47255508 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 47255411  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  47255410 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 47255340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 834359 - 834164
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  834359 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaaccc 834261  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  834260 atttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 834164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7482399 - 7482231
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  7482399 ttggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 7482302  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcc-tcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    || ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7482301 tcattgatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaaca 7482231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Original strand, 31659238 - 31659520
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  31659238 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggct-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 31659335  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  | | | ||| ||||     
T  31659336 tattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtg--tgtttattcctcttt 31659430  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     ||||||||||||||| || || | || ||||| || | || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31659431 tctctccttttatcttttgcttatggttttgtgctttttactttgattcctagattagatcaaggtgttgttattgttgattattgcttg 31659520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 11348698 - 11348865
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||    
T  11348698 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttc-taagaact 11348795  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11348796 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaaca 11348865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31925875 - 31925708
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  31925875 ttggtgagagtggaaaaatgggtagaaattagggat-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 31925778  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31925777 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaaca 31925708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37033241 - 37033068
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||| ||||||||    
T  37033241 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctcttt-gtaagaac 37033144  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37033143 tcattgatagtggattggagagattaatctcttctccatagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatct 37033068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 19754494 - 19754664
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  19754494 ttggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctcttt-gtaagaac 19754591  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 232  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  19754592 tcattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaagtgggtcaacaat 19754664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23555433 - 23555286
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  23555433 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctcttt-gtaagaact 23555336  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  23555335 cattgatagtggattggagagttcaatctctccccatagtaggtcaagtt 23555286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 47115171 - 47115340
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||    
T  47115171 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaaaaac 47115268  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
     | |||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  47115269 ccattgatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 47115340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 37503722 - 37503443
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  37503722 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacctt--gtatctcttt-gtaagaactc 37503627  T
Q  162 tttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttcc 260  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||| ||||| |||||| ||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||       
T  37503626 attgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggatcgaactaggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctctt 37503532  T
Q  261 ctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtg-ttttgttgattattgcttg 346  Q
    |||||| |||||||| || |||  || ||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  37503531 ctctccctttatcttttgcttgcggttttgtgcttttcactttaattcctagattagatctaggtgttgatattgttgattattgcttg 37503443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 37560037 - 37559751
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc--aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  37560037 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaac 37559940  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc--agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttct 257  Q
    || ||||||||| |||||||||  |||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||  ||||||    |||    
T  37559939 tcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccccctagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaa--tctttggtgtgtttgttcctctct 37559843  T
Q  258 tccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctaga-ttagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    || ||| || |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  37559842 tctctc-ccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagatttagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 37559751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28223589 - 28223418
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || || |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  28223589 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28223492  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28223491 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28223418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45644523 - 45644351
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  45644523 ttggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 45644425  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45644424 cattgatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45644351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 50169378 - 50169207
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||    
T  50169378 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagtact 50169281  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  50169280 cattgatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 50169207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 193611 - 193778
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || | | |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  193611 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttattagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataact 193708  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  193709 cattgatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 193778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3847313 - 3847118
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  ||||||| || ||||||||     
T  3847313 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgtttaagctaaatttttgtaaccc 3847215  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctc-tcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  3847214 atttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatccatctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct 3847118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Original strand, 34603576 - 34603740
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||    
T  34603576 ttggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctcttt-gtaagaac 34603673  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 226  Q
    || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34603674 tcattgatggtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtg 34603740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 50167343 - 50167172
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  50167343 ttggtgagattgggaaaattagtagaaattagggtt-gttatttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 50167246  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  50167245 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 50167172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 234
Target Start/End: Original strand, 46064861 - 46065089
Alignment:
Q  15 gggttgaaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcat 105  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| |    
T  46064861 gggtggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatggataaaaattagg-tttgttctt 46064959  T
Q  106 tgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtag 202  Q
    ||||| || ||  |||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||    
T  46064960 tgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaactcatgtgtatctcttt-gtaagaactcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtag 46065058  T
Q  203 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  46065059 gtcaag-ttggatcgaactgggtaaacaatct 46065089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 193
Target Start/End: Original strand, 1833522 - 1833652
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaa-cttgtcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  | ||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  1833522 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 1833619  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 193  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1833620 cattgatagtggattggagagatcaatctctcc 1833652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13659528 - 13659333
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||| | |||||  ||||||||||||||| |||     
T  13659528 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggtt-gttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttaccc 13659430  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13659429 atttatatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 13659333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 197100 - 196904
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-c 136  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||| |    
T  197100 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagttaatttcttgtaactc 197002  T
Q  137 ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct--cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  197001 atttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctccccccagattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 196904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 19752685 - 19752857
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  19752685 ttggtgagattgagtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctcttt-gtaagaac 19752782  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    || ||||||| |||||||||||  ||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  19752783 tcattgatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 19752857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 175
Target Start/End: Original strand, 41360914 - 41361026
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  41360914 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 41361011  T
Q  161 ctttgatagtggatt 175  Q
    | |||||||||||||    
T  41361012 cgttgatagtggatt 41361026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 195
Target Start/End: Original strand, 22079322 - 22079449
Alignment:
Q  69 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttga 166  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||| ||||    
T  22079322 gagattggaaaaatggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactcattga 22079420  T
Q  167 tagtggattggagagtacaatctctcctc 195  Q
    || ||||||||||||  |||| |||||||    
T  22079421 tattggattggagagatcaatttctcctc 22079449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13138142 - 13137973
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 161  Q
    ||||||||||||  ||| || |||||||||||  | |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||| |    
T  13138142 ttggtgagattgaaaaatggatagaaattagg--tcgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctcttt-gtaagaacac 13138046  T
Q  162 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     |||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  13138045 attgatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaatct 13137973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 230
Target Start/End: Original strand, 28242391 - 28242472
Alignment:
Q  149 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  28242391 tttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 28242472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30476614 - 30476443
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| || |||||||||  ||| |||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  30476614 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttatgaacttgttgaagataatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 30476517  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||| ||||||||| ||  |||||||| || || |  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  30476516 cattgatactggattggacagatcaatctctaccccatatgaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 30476443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 928123 - 927977
Alignment:
Q  85 tagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagt 182  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||| || |||||||||| |||||     
T  928123 tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttggatctc-tttgtaaaaactcattaatagtggattagagaga 928025  T
Q  183 acaatctc-tcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
     ||| ||| ||| ||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  928024 ccaacctcttccccaaggtaggtcaag-ttagaccgaactgggtaaaca 927977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 210
Target Start/End: Original strand, 15820326 - 15820455
Alignment:
Q  82 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 179  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  15820326 gggtaaaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttt-taagaactcattgatagtgcattgaag 15820423  T
Q  180 agtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtt 210  Q
    ||   |||||||| | ||||||||||||||||    
T  15820424 agataaatctctcatccagagtaggtcaagtt 15820455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40122363 - 40122193
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 163  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  40122363 gtgagattggaaaaatgggtcgaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttataactcatttgtatcacttt-gtaagaactctt 40122266  T
Q  164 tg--atagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||  |||||||||| |||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  40122265 tgatatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 40122193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 204
Target Start/End: Original strand, 6808507 - 6808595
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctc-tcctcagagtaggt 204  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||   |||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  6808507 aagctaacttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctcttcctcagagtaggt 6808595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Original strand, 3460710 - 3460841
Alignment:
Q  78 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 175  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||  ||||   ||||||   |||||||| ||||    
T  3460710 aaaagggtagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttgtatatctttgtaaagaacatattgatagtcgatt 3460809  T
Q  176 ggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaa 207  Q
    ||||||  |||| ||| |  ||||||||||||    
T  3460810 ggagagatcaatatcttcctagagtaggtcaa 3460841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 192
Target Start/End: Original strand, 16455676 - 16455750
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctc 192  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16455676 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctgt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 16455750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 37879079 - 37879005
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  37879079 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacct 37879005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8871213 - 8871143
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 136  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | | | |||||||||||||||||||    
T  8871213 gtgagatttggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagttcgttgaagctaatttcttgtaacc 8871143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37876848 - 37876767
Alignment:
Q  149 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  37876848 tttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaag-ttgaaccgaactgggtgaaca 37876767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12318685 - 12318585
Alignment:
Q  69 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttga 166  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||| ||||    
T  12318685 gagatttggaaatgggtagaaattagg-tttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatgtcttctttaagaactcattga 12318587  T
Q  167 ta 168  Q
    ||    
T  12318586 ta 12318585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 150
Target Start/End: Original strand, 48382441 - 48382505
Alignment:
Q  86 agaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttt 150  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  48382441 agaaattagggtttgatctttgtgaacttgt-aagttaatttcttgtaacctatttgtatcacttt 48382505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Original strand, 32736952 - 32737015
Alignment:
Q  82 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatc 145  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32736952 gggtagaaattagggtttgttctttatgaactt-ttaagctaattttttgtaacctctttgtatc 32737015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Original strand, 35109493 - 35109556
Alignment:
Q  82 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatc 145  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35109493 gggtagaaattaaggtttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttgtaacctatttgtatc 35109556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 10925223 - 10925397
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgt---aaga 157  Q
    ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||   ||||    
T  10925223 ttggtgagattgaaaaaatggatagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaaga 10925320  T
Q  158 actctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | || ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  10925321 attcattgatagtggattggagaaatcaatctctcccctagattaggtaaag-ttggatcgaactgggtcaacaatct 10925397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 192
Target Start/End: Original strand, 5459961 - 5460035
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctc 192  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||   |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  5459961 aagctaatttcttgtaacattttatatttctttgtaaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctc 5460035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 210
Target Start/End: Original strand, 36683766 - 36683828
Alignment:
Q  149 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||| || ||||||||||||||||    
T  36683766 tttgtaagaactcattgatagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaagtt 36683828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37282846 - 37282728
Alignment:
Q  78 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 175  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||   |||||||| ||  |||||||||    
T  37282846 aaaatggtataaattagggtttgttccttgtgagcttgttgaagctaatttatggtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattagtagtggatt 37282747  T
Q  176 ggagagtacaatctctcct 194  Q
    ||||||   ||||||||||    
T  37282746 ggagagataaatctctcct 37282728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 346
Target Start/End: Original strand, 10925464 - 10925504
Alignment:
Q  307 ctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10925464 ctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 10925504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 3439441 - 3439805
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439441 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 3439540  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagag 199  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3439541 ttcattatgaacttggcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagag 3439640  T
Q  200 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3439641 taggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgttttgagtttctcac 3439740  T
Q  300 ttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  3439741 ttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattgttgcttg--cacacactttgtttggtg 3439805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 25689892 - 25690259
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25689892 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttg 25689991  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25689992 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagag 25690091  T
Q  200 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25690092 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtttgttgttttcttcttccctccccttttatcttgtgagtgtgttttgtgtttctca 25690191  T
Q  299 cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25690192 cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattcttgcttgcacacacactttgtttggtg 25690259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 15290461 - 15290810
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15290461 ttagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 15290558  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15290559 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 15290658  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgttt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  15290659 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgttt 15290757  T
Q  295 ctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  15290758 cacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgc 15290810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 15470830 - 15471179
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15470830 ttagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 15470927  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15470928 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 15471027  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgttt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  15471028 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgttt 15471126  T
Q  295 ctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  15471127 cacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgc 15471179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42575555 - 42575207
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  42575555 ttagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggattg 42575458  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  42575457 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 42575358  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |  | ||||||    
T  42575357 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgtttggttgctttgtttc 42575259  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42575258 acacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 42575207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 2627679 - 2628012
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattg 107  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2627679 tctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattg 2627777  T
Q  108 tgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtagg 203  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2627778 tgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtagg 2627877  T
Q  204 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||    
T  2627878 tcaagtttggaccgaactgggtgaataatctc-ttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcacttgt 2627976  T
Q  304 ttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatt 338  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2627977 ttcctagattagatctaggtgttgttattgttgatt 2628012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 348
Target Start/End: Original strand, 31218193 - 31218541
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtt 98  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  31218193 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt 31218292  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc- 195  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  31218293 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctcc 31218390  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||     
T  31218391 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttgtgcttatgttttgtgcttt 31218486  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgca 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  31218487 tcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgca 31218541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34254560 - 34254217
Alignment:
Q  9 tctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgt 101  Q
    |||||||||||| | |||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34254560 tctcttgggttggagacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gt 34254462  T
Q  102 tcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-aga 198  Q
    || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  34254461 tctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctcctctaga 34254363  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || ||     
T  34254362 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttct 34254267  T
Q  299 c-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  34254266 ctttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 34254217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34256734 - 34256393
Alignment:
Q  11 tcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttc 103  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  34256734 tcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgtgtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatggtagaaattagggtt-gttc 34256636  T
Q  104 attgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagt 200  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  34256635 tttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagt 34256537  T
Q  201 aggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac- 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || || |     
T  34256536 aggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttctct 34256441  T
Q  300 ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  34256440 ttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 34256393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 17982589 - 17982935
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtt 98  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17982589 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt 17982688  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc- 195  Q
     |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  17982689 -gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcc 17982786  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  ||||| ||     
T  17982787 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggtttgtgcttt 17982882  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17982883 tcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 17982935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19945578 - 19945243
Alignment:
Q  22 aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaac 112  Q
    |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  19945578 aaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattatggtt-gttctttgtgaac 19945480  T
Q  113 ttgtcaa-gctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaag 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19945479 ttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaag 19945381  T
Q  209 tttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcactt-gtttcc 307  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  ||||| || |||||| | ||||    
T  19945380 tttgaaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggtttgtgcttttcacttcgattcc 19945285  T
Q  308 tagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgca 348  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19945284 tagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgca 19945243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 42498153 - 42498477
Alignment:
Q  31 aaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aag 120  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||    
T  42498153 aaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaag 42498251  T
Q  121 ctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccga 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42498252 ctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccga 42498350  T
Q  219 actgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattaga 316  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||||| | ||||  ||||||||||||||| || |||| || |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  42498351 actgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttccctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattaga 42498446  T
Q  317 tctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  42498447 tctaggtgttgttattgttaattattgcttg 42498477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 44303790 - 44304137
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa---gggtagaaattagggt 97  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||| |||    
T  44303790 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggt 44303889  T
Q  98 ttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct- 194  Q
    | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  44303890 t-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttt-taagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctc 44303987  T
Q  195 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgttt 294  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| ||    
T  44303988 cagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgctt 44304083  T
Q  295 ctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     |||| ||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  44304084 ttcactttgatttctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 44304137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1746371 - 1746105
Alignment:
Q  78 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 175  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||    
T  1746371 aaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aagaactcattgatagtggatt 1746275  T
Q  176 ggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatct 274  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||||   ||||  |||||||||||| |    
T  1746274 ggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tcgttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatat 1746179  T
Q  275 tgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    | || |||||  ||| | || | || ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1746178 tttgcttgtggtttgcgcttttgactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 1746105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 342
Target Start/End: Original strand, 15212786 - 15213064
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  15212786 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 15212883  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||| ||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||      
T  15212884 cattgataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctct 15212978  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 342  Q
     |||||| |||||||| || |||| |  ||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  15212979 tctctccctttatcttttgcttgtggctttgtgcttttcactttgattcctagattagatcaaggtgctgttattgttgattattg 15213064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Original strand, 33352150 - 33352432
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  33352150 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 33352247  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||  ||||  ||| |||      
T  33352248 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttgatgtgtttg--ttcctctct 33352342  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgtgta-ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
      |||||||||||||| || ||||| | |||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  33352343 tatctccttttatcttttgcttgtggatttgtgtttttcactttgatttctagattagatttaggtgttgttattgttgattattgcttg 33352432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 4283524 - 4283691
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  4283524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4283621  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4283622 cattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 4283691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42435159 - 42434992
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  42435159 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42435062  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42435061 cattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 42434992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12702787 - 12702542
Alignment:
Q  78 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  12702787 aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtctcttt-gtaagaactcattgatattggatt 12702690  T
Q  176 ggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatct 274  Q
    ||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||   |||||||   ||||  |||||| |||||||    
T  12702689 ggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtatgtttgtttctctctt--ctctccctttatct 12702595  T
Q  275 tgtgattgt-gtattgtgtttctcactt--gtttcctagattagatctaggtg 324  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  12702594 tgtgcttgtggttttgtgtttttcactttgattttctagattagatctaggtg 12702542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 43036423 - 43036594
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  43036423 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 43036520  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43036521 cattgatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 43036594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 40321082 - 40321251
Alignment:
Q  66 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctttt-gtatcccttttgtaagaactct 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||    
T  40321082 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctcttt-gtaaaaactct 40321179  T
Q  163 ttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40321180 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40321251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Original strand, 27811278 - 27811560
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||     
T  27811278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaacc 27811375  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||||||||||| ||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||| ||  | ||||     
T  27811376 cattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgttttttcccctctt- 27811471  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgtg-tattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     ||||   |||||||| || ||||| | ||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27811472 -ctcttgctttatcttttgcttgtgattttgtgcttttcactttgattcctaaattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 27811560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 18655400 - 18655567
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  18655400 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 18655497  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | ||||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18655498 cattgatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 18655567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 342
Target Start/End: Original strand, 4731658 - 4731936
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  4731658 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gctctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4731755  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||||||||||||||||  | |||||| || |||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||      
T  4731756 cattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattcggtcaag-ttggaccgaattgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctct 4731850  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 342  Q
     |||||| |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4731851 tctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 4731936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3303838 - 3303667
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  3303838 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 3303741  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||| ||||  |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3303740 cattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct 3303667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 40221745 - 40221916
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  40221745 ttggtgagattggtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 40221842  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  40221843 cgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatct 40221916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Original strand, 18141821 - 18141981
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  18141821 ttggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg--ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaagaact 18141917  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactggg 224  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  18141918 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccaaactggg 18141981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 346
Target Start/End: Original strand, 30143346 - 30143622
Alignment:
Q  70 agattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttga 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  30143346 agattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattga 30143443  T
Q  167 tagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctc 265  Q
    |||||||||||||||  |||||||| || ||||  |||||||| ||| || |||||| || |||||  |||||||||  ||||  ||| |||   |||||    
T  30143444 tagtggattggagagatcaatctctcccccagataaggtcaag-ttgaactgaactgagtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctcttctctc 30143538  T
Q  266 cttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    | |||||||| || |||| || ||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30143539 cctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 30143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 193
Target Start/End: Original strand, 30291606 - 30291737
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |    
T  30291606 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcacttt-gtaagaatt 30291704  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 193  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30291705 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcc 30291737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1292631 - 1292471
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  1292631 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 1292534  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 224  Q
    | ||||||||||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1292533 cattgatagtggatttgagaaataaatctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactggg 1292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41366778 - 41366612
Alignment:
Q  68 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 164  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||| | |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  41366778 tgagattgagaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtaagcttgtttaagctaatttcttttaacctatttgtatcccttt-gtaagaactcatt 41366681  T
Q  165 gatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  41366680 tatagtggattggagagatcaatctctccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggacaacaatct 41366612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Original strand, 9765745 - 9765863
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  9765745 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 9765842  T
Q  161 ctttgatagtggattggagag 181  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  9765843 cattgatagtggattggagag 9765863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Original strand, 6598975 - 6599143
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |    
T  6598975 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaagaactcat 6599072  T
Q  164 tgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6599073 tgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6599143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Original strand, 6674428 - 6674596
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |    
T  6674428 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaagaactcat 6674525  T
Q  164 tgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6674526 tgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6674596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 204
Target Start/End: Original strand, 40328782 - 40328922
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactct 162  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||     
T  40328782 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaactca 40328879  T
Q  163 ttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggt 204  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  40328880 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 40328922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Original strand, 5689275 - 5689442
Alignment:
Q  68 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 164  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||  || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  5689275 tgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtg-gtgctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 5689372  T
Q  165 gatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5689373 gatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5689442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 193
Target Start/End: Original strand, 44353796 - 44353923
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |    
T  44353796 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctcttt-gtaagaactcat 44353893  T
Q  164 tgatagtggattggagagtacaatctctcc 193  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  44353894 tgatagtggattgaaaagatcaatctctcc 44353923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10930365 - 10930193
Alignment:
Q  66 ggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 162  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| | || |||||| || ||  |||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||| |     
T  10930365 ggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gctctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaacccatttatatctcttt-gtaagaacaca 10930268  T
Q  163 ttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 237  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10930267 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttctt 10930193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Original strand, 11383989 - 11384152
Alignment:
Q  68 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcttt 164  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| | ||    
T  11383989 tgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaacccatt 11384086  T
Q  165 gatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    |||| |||||||||||   | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11384087 gatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaagtt-ggaccgaactgggtgaaca 11384152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8965859 - 8965692
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  ||| | ||| ||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||||    
T  8965859 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttctttatgagtttgttgaagttaatttcttataacccttttatatctc-tttgtaagaactc 8965761  T
Q  162 tttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
     ||||||||| || ||||||   ||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8965760 attgatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 8965692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4743306 - 4743211
Alignment:
Q  139 ttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4743306 ttgtaacccatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 4743211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1345536 - 1345368
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttt-tgtatcccttttgtaagaactctt 163  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||  | |||||| |||| | |||||||| |    
T  1345536 gtgagattgggaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatatgtatctcttt-gaaagaactcat 1345439  T
Q  164 tgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||    
T  1345438 tgatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttagaccgaactaggtcaacaatct 1345368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19491867 - 19491755
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  19491867 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 19491770  T
Q  161 ctttgatagtggatt 175  Q
    | |||||||||||||    
T  19491769 cgttgatagtggatt 19491755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18106191 - 18106087
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggacc 216  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  18106191 aagctaatttcttgtaactcatttgtatc--ttttgtaagaactcattgatagtgt-ttggagagatcaatctctccccagaataggtcaag-ttggacc 18106096  T
Q  217 gaactgggt 225  Q
    |||||||||    
T  18106095 gaactgggt 18106087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 4162436 - 4162663
Alignment:
Q  9 tctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggttt 99  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||       ||||||  || ||| |||||||| ||||| |||    
T  4162436 tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgagcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgaga--ggaaaatgggtagaagttagg-ttt 4162532  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-a 196  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||| | |    
T  4162533 gttctttgagaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatag-ggattggagatatcaatctctccccaa 4162630  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  4162631 gagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtaaaca 4162663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 225
Target Start/End: Original strand, 10015136 - 10015241
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggacc 216  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||  || ||||||||||| |||||||    
T  10015136 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttt--aggaactcattgatagtggattggagagataaatctctctccatagtaggtcaag-ttggacc 10015232  T
Q  217 gaactgggt 225  Q
    |||||||||    
T  10015233 gaactgggt 10015241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3073981 - 3073875
Alignment:
Q  123 aatttcttgtaacctttt-gtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaact 221  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||    
T  3073981 aatttcttgtaacatttttgtatctcttt-gtaagaactcattgataatggcttggagagatcaatctctccccatagtaggtcaag-ttgggccgaact 3073884  T
Q  222 gggtgaaca 230  Q
    |||| ||||    
T  3073883 gggtaaaca 3073875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 3772192 - 3772352
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||| |    
T  3772192 ttggtgagattgagaaaattgatagaaattagg-tttgttctttgtgagcttatttaagctaatttcttgtaactcatttgtatatcttt-gtaagaatt 3772289  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 223  Q
      |||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3772290 tattgatagtggattggagagatcaatctatctctcagagtaggtcaag-ttggaccaaactgg 3772352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 219
Target Start/End: Original strand, 8153844 - 8153914
Alignment:
Q  149 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctc-tcctcagagtaggtcaagtttggaccgaa 219  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8153844 tttgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttcctcagagtaggtcaag-ttggaccgaa 8153914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 230
Target Start/End: Original strand, 4733792 - 4733873
Alignment:
Q  149 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||  | |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4733792 tttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Original strand, 1822297 - 1822365
Alignment:
Q  69 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 136  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1822297 gagattgcaaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 1822365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Original strand, 1856742 - 1856810
Alignment:
Q  69 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 136  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1856742 gagattgcaaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 1856810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 172
Target Start/End: Original strand, 10240159 - 10240264
Alignment:
Q  69 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttga 166  Q
    |||||||||| || | |||||||| |||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||||| | ||| ||| ||||   |||||||| ||||    
T  10240159 gagattgggacaaagatagaaatttgggtttgttctttgtgagcttgttgaatctaatttcttgtaaccatgttggatctctttgtaaagaactcattga 10240258  T
Q  167 tagtgg 172  Q
    ||||||    
T  10240259 tagtgg 10240264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11712145 - 11712024
Alignment:
Q  88 aaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaca 185  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||  |||||||||||||| |||| |||| |||| ||||   || ||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  11712145 aaattaggttttgttccttgagagcttgttgaagctaatttcttgaaacccttttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattgaagagatca 11712046  T
Q  186 atctct-cctcagagtaggtca 206  Q
    |||||| ||||| |||||||||    
T  11712045 atctctccctcaaagtaggtca 11712024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 41365011 - 41364927
Alignment:
Q  68 tgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttt 150  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41365011 tgagattgggaaaattggtagaaattagg-tttgttctttgtgagtttgtttaagctaatttcttgtaacacatttgtatcccttt 41364927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 6813818 - 6813771
Alignment:
Q  88 aaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc 136  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6813818 aaattaggttttgttctttgtgagcttg-caagctaatttcttgtaacc 6813771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 193
Target Start/End: Original strand, 7597669 - 7597745
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 193  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||   |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7597669 aagctaatttcttataatccttttgtatctctttgtaaagaatgcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 7597745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 181
Target Start/End: Original strand, 10929874 - 10929906
Alignment:
Q  149 tttgtaagaactctttgatagtggattggagag 181  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10929874 tttgtaagaactcattgatagtggattggagag 10929906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 29796485 - 29796413
Alignment:
Q  69 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctttt 140  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| | | ||||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  29796485 gagattgggaaaagagtagaaatcaaggtttgttcttggagaacttgttgaagctgatttcttgtaacatttt 29796413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 32902132 - 32902096
Alignment:
Q  287 ttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggt 323  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32902132 ttgtgtttttcacttggttcctagattagatctaggt 32902096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 20343834 - 20344201
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343834 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 20343933  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-caga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20343934 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccaga 20344033  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctca 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20344034 gtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgttttgtgtttctca 20344132  T
Q  299 cttgtttcctagattagatctagg---tggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  20344133 cttgtttcctagattagatctaggtgctggttttttgtcgattgttgcttg--cacacactttgtttggtg 20344201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18392426 - 18392075
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18392426 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 18392329  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18392328 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccag 18392229  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  18392228 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttc 18392130  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 350  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18392129 acacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 18392075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18388990 - 18388639
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18388990 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 18388893  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18388892 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccag 18388793  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  18388792 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctctttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttc 18388694  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 350  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18388693 acacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 18388639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6594788 - 6594420
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6594788 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 6594691  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6594690 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccag 6594591  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  6594590 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttc 6594492  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgtttggtg 366  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | |||||||||||||    
T  6594491 acacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtg 6594420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 24789778 - 24790075
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24789778 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtaagattgggaaaagggtaaaaattagggtttg 24789877  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-caga 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24789878 ttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacattttgtatcccttttgtaaaaactctttgatagtggattggagagtactatctctcctccaga 24789977  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg-cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24789978 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgtttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgcattgtgtttct 24790075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6592570 - 6592202
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6592570 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaatgggtagaaattagggtttg 6592473  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6592472 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccag 6592373  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  6592372 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctccttgtttttcttgtgattgttgctttgtgtttc 6592274  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgtttggtg 366  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | |||||||||||||    
T  6592273 acacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtg 6592202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32060556 - 32060201
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32060556 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 32060457  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc--ttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-c 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32060456 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctcc 32060357  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||  |||||||    
T  32060356 agagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtt 32060258  T
Q  294 tctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 350  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32060257 tcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 32060201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 43504365 - 43504025
Alignment:
Q  22 aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aag 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  43504365 aaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcatcgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaat 43504267  T
Q  121 ctaatttcttgtaa--ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccg 217  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  43504266 ctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcg 43504167  T
Q  218 aactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattaga 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||| ||| |||||||||||||    
T  43504166 aactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgattcctagattaga 43504068  T
Q  317 tctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtt 361  Q
    ||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43504067 tctagctg--tttttgttgattattgcttgcacacacactttgtt 43504025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Original strand, 39731313 - 39731656
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattg 107  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  39731313 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttg 39731411  T
Q  108 tgaacttgtca-agctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggt 204  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39731412 tgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 39731511  T
Q  205 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || |||| ||||    
T  39731512 caagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactttgt 39731609  T
Q  304 ttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcac 349  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39731610 ttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 39731656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 35853851 - 35854194
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  35853851 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt- 35853949  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-a 196  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  35853950 gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 35854048  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||   ||||| ||| |||||||||||||| |||||| || || || |    
T  35854049 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtgtttgtttctctcttctctc-ccttttatcttgtgcttgtgttttatgctttt 35854146  T
Q  297 cac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 342  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  35854147 cactttgcttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 35854194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 141 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1560757 - 1560544
Alignment:
Q  141 gtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  1560757 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtaaccaatctctt- 1560659  T
Q  239 ggtgcttttgttttcttcttccctctcctt--ttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 335  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560658 ggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 1560559  T
Q  336 attattgcttgcaca 350  Q
     || |||||||||||    
T  1560558 tttcttgcttgcaca 1560544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25767175 - 25766842
Alignment:
Q  22 aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg----gtgagattgg-gaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgt 116  Q
    |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||     |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25767175 aaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgagattggaaaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgt 25767077  T
Q  117 c-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttg 212  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  25767076 caaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagttta 25766978  T
Q  213 gaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatc-ttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctag 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||   | ||| ||| ||||||||| || || |||||  |||||||| |||| ||| | |||||    
T  25766977 gaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtgtttgtttctctattctctc-ccttttatctttttgcttgtgatttgtgtttttcactttgatacctag 25766880  T
Q  311 attagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgc 347  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25766879 attagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgc 25766842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1562234 - 1562103
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562234 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 1562137  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562136 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 346
Target Start/End: Original strand, 23554990 - 23555323
Alignment:
Q  22 aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaac 112  Q
    |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23554990 aaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac 23555088  T
Q  113 ttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagt 209  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23555089 ttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 23555187  T
Q  210 ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| | || ||| ||||    
T  23555188 ttggaccgaactgggtgaacaa--tctttgatgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtattgtgttttttactttgattcc 23555283  T
Q  308 tagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23555284 tagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 23555323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 29990991 - 29991335
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  29990991 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaggatagaaattagggtt-g 29991089  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-ag 197  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  29991090 ttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttc-taataactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccag 29991188  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || ||    
T  29991189 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttc 29991284  T
Q  298 ac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     | ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  29991285 tctttgattcctatattagatctaggtgttgttattgttgattattacttg 29991335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 48408731 - 48409092
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaat 91  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48408731 ttagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaat 48408830  T
Q  92 tagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatc 188  Q
    ||  ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  48408831 taatgtt-gttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaaataactcattgatagtggattggagagtttaatc 48408929  T
Q  189 tctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatc-ttgtgattgtgta 286  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||   ||||| ||| ||||||||| || || |||||      
T  48408930 tctcctccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatttc-ttggtgtgtttgtttctctcttctctc-ccttttatctttttgcttgtgat 48409027  T
Q  287 ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcac 349  Q
    ||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  48409028 ttgtgcttttcactttgatacctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcac 48409092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 25615799 - 25616137
Alignment:
Q  9 tctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcat 105  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  25615799 tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagagaaaatcattgagtgtcttg---agattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttcta 25615894  T
Q  106 tgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtag 202  Q
    ||||  |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||    
T  25615895 tgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatca-ttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctccagagtag 25615993  T
Q  203 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcactt 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||   |||| | ||||  ||||||||||| |||| || ||||| || ||||||    
T  25615994 gtcaagtttggaccgaactgggcgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt-cttctctctttatcttgtgcttgtggttttgtgcttttcactt 25616090  T
Q  302 -gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25616091 cgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 25616137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 4178711 - 4179054
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  4178711 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaggtagaaattagggtt- 4178809  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  4178810 gttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aagaactcattgatagtggattgaacagttcaatctctcctcca 4178907  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 296  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  |||||||| |    
T  4178908 gagcaggtcaagtttgaaccaaactaggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggtttgtgttttt 4179003  T
Q  297 cac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgctt 345  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4179004 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgctt 4179054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34310884 - 34310712
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  34310884 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatct-ttttgtaagaact 34310787  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310786 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34310712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14070001 - 14069830
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  14070001 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 14069904  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14069903 cattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 14069830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14380029 - 14379858
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  14380029 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 14379932  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14379931 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 14379858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 342
Target Start/End: Original strand, 27347817 - 27348095
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  27347817 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 27347914  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||||||||||| ||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||      
T  27347915 cattgatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctct 27348009  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 342  Q
     |||||  |||||||| || |||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27348010 tctctcactttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 27348095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 22269973 - 22270140
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  22269973 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 22270070  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
      |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22270071 gattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 22270140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41317602 - 41317431
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  41317602 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatcccttt-gtaagaact 41317505  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41317504 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 41317431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Original strand, 19502114 - 19502443
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtt 98  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| || |||||||||||||||||       ||||||||| |||||  || ||||||||| ||||    
T  19502114 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtggtgagattgcgaaaaaaggttagaaattaaggtt 19502213  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc- 195  Q
     |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  19502214 -gttttttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 19502311  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-tattgtgttt 294  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||   |||||  ||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||    
T  19502312 agagtaagtcaagtttggaacgaagtgggtgaacaatct--ttggtgtgtttgtttctctcttc--tctccctttattttgtgcttgtggttttgagttt 19502407  T
Q  295 ctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt 329  Q
     |||||| | || |||||||||||||||||| ||||    
T  19502408 ttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 19502443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30024900 - 30024729
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  30024900 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 30024803  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  30024802 ctttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 30024729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8359485 - 8359316
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  8359485 ttggggagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 8359388  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  8359387 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 8359316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Original strand, 6431971 - 6432134
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  6431971 ttggttagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6432068  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcc-tcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 226  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6432069 cgttgatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtg 6432134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Original strand, 18126644 - 18126928
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgt-caagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  18126644 ttggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 18126741  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||||||||||||||    |||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||||  ||||||    | ||     
T  18126742 cattgatagtggattggaggaatcaatctctcccccagactaggtcaagttt-gaccgacctgggtcaacaa--tctttggtgtgtttgttcctctattt 18126838  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     |||||| |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  18126839 tctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattcttgattattgcttg 18126928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Original strand, 29608737 - 29608902
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  29608737 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 29608834  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 228  Q
    | ||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29608835 cattgatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaa 29608902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41649202 - 41649008
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct- 137  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||      
T  41649202 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaattggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttagctaatttcttgtaaccca 41649104  T
Q  138 tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41649103 tttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 41649008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 47674175 - 47673953
Alignment:
Q  9 tctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtt 98  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47674175 tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt 47674076  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctca 196  Q
     |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  47674075 -gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccca 47673978  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactg 222  Q
     | || |||||| |||||||||||||    
T  47673977 tattaagtcaag-ttggaccgaactg 47673953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Original strand, 26417316 - 26417598
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  26417316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 26417413  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttcc 260  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||| || ||||||  ||||  ||| |||       
T  26417414 cgttgatagtggattggagagatcaatctctccccaggttaggtcaa-attggaccaaactgggtcaacaatttc-ttggtgtgtttg--ttcctctctt 26417509  T
Q  261 ctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    |||||| |||||||| || |||| || ||| | || |||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26417510 ctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattcatagattatatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 26417598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 344
Target Start/End: Original strand, 48489431 - 48489711
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| | || ||||    
T  48489431 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gcaataact 48489528  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | || ||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||      
T  48489529 cattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctct 48489623  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgct 344  Q
     ||| || |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  48489624 tctcgccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgct 48489711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 3258995 - 3259162
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||| |||     
T  3258995 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaaaaacc 3259092  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3259093 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgaaccgaactgggtgaaca 3259162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4508874 - 4508707
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  4508874 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4508777  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctc-tcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4508776 cattgagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtgaaca 4508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 8153342 - 8153513
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  8153342 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataact 8153439  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  8153440 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 8153513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32358167 - 32358055
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggac 215  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32358167 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggac 32358070  T
Q  216 cgaactgggtgaaca 230  Q
    |||||||||||||||    
T  32358069 cgaactgggtgaaca 32358055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 210
Target Start/End: Original strand, 48491579 - 48491727
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||    
T  48491579 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gaaagaact 48491676  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||    
T  48491677 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 48491727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 48599502 - 48599335
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| ||    
T  48599502 ttggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgg-aagagct 48599405  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48599404 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagatcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 48599335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4253697 - 4253529
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 161  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| | ||||||||    
T  4253697 ttggtgaaattggtaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttatatctctttggaaagaactc 4253598  T
Q  162 tttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
     |||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  4253597 attgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaa-tttggaccgaactaggtaaaca 4253529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Original strand, 43864244 - 43864526
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  43864244 ttggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 43864341  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
      |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |   |||||  ||||  ||| |||      
T  43864342 aattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tagatggtgtgtttg--ttcctctct 43864436  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     |||||| |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  43864437 tctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 43864526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 237
Target Start/End: Original strand, 2390301 - 2390456
Alignment:
Q  82 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 179  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  2390301 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataactcatatatagtggattggag 2390398  T
Q  180 agtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 237  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2390399 agatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaataatctctt 2390456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31733137 - 31732966
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  31733137 ttggtgagactgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 31733040  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||| ||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31733039 cattgatactggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31732966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2361140 - 2360978
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  2361140 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 2361043  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 225  Q
    | ||||||||||||| ||||   |||||||| || |||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2361042 cattgatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 2360978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 193
Target Start/End: Original strand, 4586161 - 4586291
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||| |||| |||| |||||||||    
T  4586161 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctcttt-gtaagaact 4586258  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 193  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4586259 cattgatagtggattggagagatcaatctctcc 4586291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36146576 - 36146405
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  36146576 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtttgttatttgtgagcttgttgaagctaatttct-gtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36146479  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | ||||||||||||| |||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  36146478 cattgatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 36146405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47676304 - 47676133
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  47676304 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 47676207  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |  |||||||||| |||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  47676206 caatgatagtggaatggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 47676133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 366
Target Start/End: Original strand, 24790230 - 24790303
Alignment:
Q  291 gtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  24790230 gtttctcacctgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattacttg--cacgcactttgtttggtg 24790303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31105585 - 31105394
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  31105585 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagatttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccc 31105487  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
     ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31105486 atttgtatct-ttttgtaagaactcattgatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 31105394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38671414 - 38671219
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-c 136  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  38671414 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacac 38671316  T
Q  137 ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||   ||||| | || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  38671315 atttgtatcacttt-gtaagaactcattgatagtggattgaagagataaatctatcccccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 38671219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 496148 - 495980
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||  ||||||||| |    
T  496148 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggta-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttta-taagaactcat 496051  T
Q  164 tgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  496050 tgatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtcaag-ttggacagaaccgggtcaacaatct 495980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23565210 - 23565069
Alignment:
Q  83 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 180  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23565210 ggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaga 23565112  T
Q  181 gtacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 223  Q
    |  ||||||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23565111 gatcaatctctctcctagagtaggtcaag-ttggactgaactgg 23565069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 220
Target Start/End: Original strand, 23343975 - 23344130
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 161  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  23343975 ttggtgagatttggaaaagggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccctttagtatatc-tttgtgagaactc 23344073  T
Q  162 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaac 220  Q
     |||||| | |||||||||    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23344074 attgataatagattggagaaattaatctctcc-cagagtaggtcaag-ttggaccgaac 23344130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759195
Alignment:
Q  89 aattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaa 186  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  2759339 aattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaa 2759242  T
Q  187 tctc-tcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 233  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  2759241 tctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatc 2759195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4510716 - 4510549
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||    
T  4510716 ttggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttta-taagaact 4510619  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4510618 cattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttggaccgtactgggtgaaca 4510549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4512558 - 4512391
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||    
T  4512558 ttggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttta-taagaact 4512461  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4512460 cattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttggaccgtactgggtgaaca 4512391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22328556 - 22328395
Alignment:
Q  69 gagattgggaa--aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcttt 164  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   | ||| || ||    
T  22328556 gagattgggaagaaaggttagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgcaaggaagtcatt 22328457  T
Q  165 gatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 225  Q
     |||||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22328456 aatagtggatttgagagatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 22328395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 1113633 - 1113828
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||     
T  1113633 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttataaccc 1113731  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || || | |||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  1113732 atttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttt-gaccgaattgagtcaacaatct 1113828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36574683 - 36574517
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactc 161  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||   ||||||||    
T  36574683 ttggagagattggggaaagg-tagaaattaagatttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaaagaactc 36574585  T
Q  162 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
     |||||||||| ||||||||  |||||  |||  |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  36574584 attgatagtggtttggagagatcaatccatccctagagtaggtcaa-tttggaccaaactgggtaaaca 36574517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6360065 - 6359946
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctc-tcctcagagtaggtcaagtttggac 215  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| ||| || | ||||||||| |||||     
T  6360065 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggtcaag-ttggat 6359968  T
Q  216 cgaactgggtgaacaatctctt 237  Q
    |||||||||| |||||| ||||    
T  6359967 cgaactgggtcaacaatttctt 6359946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24526065 - 24525992
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 135  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24526065 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaac 24525992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 230
Target Start/End: Original strand, 18396384 - 18396486
Alignment:
Q  129 ttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 227  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |    
T  18396384 ttgtaacattttgtatctctttataaagaattcattgatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggtaa 18396483  T
Q  228 aca 230  Q
    |||    
T  18396484 aca 18396486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24525584 - 24525499
Alignment:
Q  149 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||    
T  24525584 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggacggaactgggtcaataatct 24525499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12098027 - 12097864
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||| || |||||||| ||        ||||    
T  12098027 ttggttagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctct--------aact 12097937  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  12097936 ctttg-tagtggattggagagatgaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 12097864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 223
Target Start/End: Original strand, 31518988 - 31519063
Alignment:
Q  149 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaa--tctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 223  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31518988 tttgtaagaactcattgacagtggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 31519063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 232
Target Start/End: Original strand, 30814530 - 30814605
Alignment:
Q  157 aactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30814530 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 30814605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 173
Target Start/End: Original strand, 31518795 - 31518905
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaactt-gtcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||| |||  | |||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  31518795 ttggtgagattgggaaaataggtagaaatta-ggtttgttctttgtgagcttattgaagctagtttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 31518892  T
Q  161 ctttgatagtgga 173  Q
    | |||| ||||||    
T  31518893 cattgacagtgga 31518905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Original strand, 28617182 - 28617234
Alignment:
Q  83 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  28617182 ggtagaaattaggttttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttgtaacc 28617234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 231
Target Start/End: Original strand, 28485811 - 28485854
Alignment:
Q  187 tctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 231  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28485811 tctctcctcagactaggtcaa-tttggaccgaactgggtcaacaa 28485854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 6266628 - 6266993
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266628 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 6266727  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-caga 198  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6266728 ttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccaga 6266827  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg-cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  6266828 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtcttttgttttcttcttccctctccgtttatcttgtgcttgtgtattgtgtttttc 6266926  T
Q  298 acttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  6266927 acttctttcctagattagatctaggtgttgttttgttgatttttgctt--acacacactttgtttggtg 6266993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12647616 - 12647265
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12647616 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 12647519  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12647518 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccag 12647419  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  12647418 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttc 12647320  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 350  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12647319 acacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 12647265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 44 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13656220 - 13655908
Alignment:
Q  44 agagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgta 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13656220 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgta 13656121  T
Q  144 tcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggt 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13656120 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggt 13656021  T
Q  242 gctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgat 337  Q
    | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13656020 gtttgttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 13655921  T
Q  338 tattgcttgcaca 350  Q
    | |||||||||||    
T  13655920 tcttgcttgcaca 13655908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Original strand, 32289509 - 32289853
Alignment:
Q  9 tctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattg 107  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  32289509 tctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg-aaaagggtagaaattagggtt-gttctttg 32289606  T
Q  108 tgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggt 204  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  32289607 tgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtaaattagagagatcaatctctcctccagagtaggt 32289706  T
Q  205 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||| ||||    
T  32289707 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtccttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgt 32289806  T
Q  304 ttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcac 349  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32289807 ttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 32289853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4484562 - 4484211
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||      |||| |||||||  ||||||||||||||||||||     
T  4484562 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtgaaattgggagaaaagggtagaaattagggtt- 4484464  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4484463 gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 4484364  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 296  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || || |    
T  4484363 gagtaggtcaagtttggacagaactgggtgaacaa--tctttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgcttgtggtttttgctttt 4484266  T
Q  297 cac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcac 349  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4484265 cactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 4484211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 62 - 354
Target Start/End: Original strand, 30833342 - 30833638
Alignment:
Q  62 tcttggtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaaga 157  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30833342 tcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaaga 30833440  T
Q  158 actctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttc 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||    
T  30833441 actcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaa--tctttggtgtctttgttttcctc 30833538  T
Q  257 ttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacacaca 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  30833539 ttccctctccttttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcactcaca 30833638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4503364 - 4503017
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggt-------gagattgggaaaag--ggtagaaattagggtt 98  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |       |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  4503364 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggagagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt 4503265  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc- 195  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  4503264 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcc 4503168  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||     
T  4503167 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttgtgcttgtgttttgtgcttt 4503072  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgca 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4503071 tcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgca 4503017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 45099691 - 45100036
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtt 98  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45099691 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt 45099790  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc- 195  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  45099791 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcc 45099887  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  ||||| ||     
T  45099888 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtgatttgtgcttt 45099983  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45099984 tcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 45100036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5723486 - 5723146
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  5723486 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaagggtagaaattaggctt-g 5723388  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctttt-gtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-ag 197  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  5723387 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctag 5723289  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctc 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   |||   ||||||||||||||| || |||||  ||||| || ||    
T  5723288 agtaggttaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgttt--ctctattctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttc 5723193  T
Q  298 -acttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 342  Q
       ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5723192 tttttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattg 5723146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 36205895 - 36205551
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  36205895 tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt- 36205797  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-a 196  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||||| |    
T  36205796 gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaactcattgacagcggattggagagttcaatctatcctcca 36205699  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||   |||||  ||||||||||| || || |||||  || || || |    
T  36205698 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct--ttggtgtgtttgtttctctcttc--tctccttttatattttgcttgtggtttctgctttt 36205603  T
Q  297 cactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  36205602 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 36205551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 36988307 - 36987961
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||| |||||| |||| |||||||||||||||||     
T  36988307 tctcttgggttgggaaacatagtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgggattggaaaaaagggtagaaattagggtt- 36988209  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-a 196  Q
    ||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  36988208 gttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 36988110  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| |  ||||| ||     
T  36988109 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggctttgtgcttt 36988014  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  36988013 tcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 36987961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6595175 - 6594890
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  6595175 ttggtgagattaggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctcttt-gtaagaac 6595078  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttctt 258  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||   ||||    
T  6595077 tcgttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt 6594980  T
Q  259 ccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    | ||| ||||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  6594979 ctctc-ccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgatttctagattagatctaggtgctgttattgttgattattacttg 6594890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2334649 - 2334414
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  2334649 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaataagggtt- 2334551  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-a 196  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  2334550 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 2334452  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2334451 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggggaacaatct 2334414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 45726929 - 45727096
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  45726929 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 45727026  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45727027 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 45727096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 329
Target Start/End: Original strand, 29867869 - 29868133
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29867869 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29867966  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||||| ||  |||||||   ||||     
T  29867967 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataa--tctttgatgtgtttgtttctctctt- 29868062  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 329  Q
     |||||| ||||||||||| |||| || ||| |||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  29868063 -ctctccgtttatcttgtgcttgtggttttgagtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 29868133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34139963 - 34139767
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  34139963 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaaccc 34139865  T
Q  138 tt-tgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  34139864 atatgtatcccttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 34139767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Original strand, 38312240 - 38312522
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| ||    
T  38312240 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagatct 38312337  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||  ||||  ||| |||      
T  38312338 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttgatgtgtttg--ttcctctct 38312432  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     |||||| |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  38312433 tctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattgttgcttg 38312522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 723936 - 723741
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  723936 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaactgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaaccc 723838  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  723837 atttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 723741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14634018 - 14633822
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  14634018 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggtaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaaccc 14633920  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  14633919 atttgtatcccttttgtaagaactcatagatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct 14633822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17057537 - 17057255
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||  | |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  17057537 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 17057440  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||      
T  17057439 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctcg 17057345  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     |||||| |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17057344 tctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttaattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 17057255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17085520 - 17085238
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||  | |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  17085520 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 17085423  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||      
T  17085422 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctcg 17085328  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     |||||| |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17085327 tctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttaattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 17085238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35447052 - 35446885
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  35447052 ttggtgagattggtaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 35446955  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35446954 cattgatagtggattggagagatcactctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 35446885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36318177 - 36318006
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  36318177 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36318080  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36318079 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36318006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 36773562 - 36773733
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  36773562 ttggtgagattgggaaaatgggaataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 36773659  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36773660 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36773733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11151759 - 11151588
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  11151759 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaagaact 11151662  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11151661 cttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 11151588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 26353184 - 26353351
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactc 161  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  26353184 ttggtgagattgaaaaaagtgtagaaattaaggtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtat-ctttttgtaagtactc 26353282  T
Q  162 tttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
     |||||||||||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  26353283 attgatagtggattggagagatcactctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaaccgggtaaaca 26353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1631900 - 1631735
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  1631900 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 1631803  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 228  Q
    | ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1631802 cattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaa 1631735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 230
Target Start/End: Original strand, 33648176 - 33648340
Alignment:
Q  69 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttga 166  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||   |||||||| ||||    
T  33648176 gagattgagaaaatggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattga 33648275  T
Q  167 tagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  33648276 tagcggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtaaaca 33648340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 42362328 - 42362500
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  42362328 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaaccc 42362426  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtt 210  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || |||| |||||||||||    
T  42362427 atttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagtt 42362500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 24398055 - 24398228
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaa--aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||    
T  24398055 ttggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaac 24398154  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 232  Q
    || |||||| ||||||||||||  |||||||| || || |||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  24398155 tcattgataatggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaactggctgaacaat 24398228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 11690477 - 11690672
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  11690477 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaaccc 11690575  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| || || | || |||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  11690576 atttgtatcccttt-gtaagaaatcgttgatagtggattggagagatcaacctctcccccatattacgtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 11690672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42288278 - 42288117
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||  |||| |||||| ||    
T  42288278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatttcttt-gtaagagct 42288181  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 225  Q
    | |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42288180 cattgataatggattggagagatcaatctctccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 42288117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33162618 - 33162447
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||||||    
T  33162618 ttggtgaaattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctct-gtaagaact 33162521  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | ||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  33162520 cattgatagtggattagagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 33162447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Original strand, 13121769 - 13121899
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactct 162  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||     
T  13121769 ttggtgagactgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacc-tttgtatctc-tttgtagaaactca 13121866  T
Q  163 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctc 195  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  13121867 ttgatagtggattgaagaaatcaatctctcctc 13121899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Original strand, 17450671 - 17450748
Alignment:
Q  156 gaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17450671 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccacagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaacaatct 17450748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17490261 - 17490149
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggac 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  17490261 aagctaatttcttgtaactcttttgtaactcttt-gtaagaactcattgatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagtaggtcaa-tttggac 17490164  T
Q  216 cgaactgggtgaaca 230  Q
    |||||||||| ||||    
T  17490163 cgaactgggtaaaca 17490149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7815441 - 7815323
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactc 161  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||   | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  7815441 ttggtgagattgagaaaaaggttgaaattagggtttgttctttagaagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactc 7815343  T
Q  162 tttgatagtggattggagag 181  Q
     || ||||||||||||||||    
T  7815342 atttatagtggattggagag 7815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 11067305 - 11067476
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  11067305 ttggtgaaattggaaaaatgggtagaaattagtgtt-gtactttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 11067402  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | || ||| ||||||| ||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  11067403 catttataatggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactcggtcaacaatct 11067476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Original strand, 7451173 - 7451284
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggac 215  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||     
T  7451173 aagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaag-ttgga- 7451269  T
Q  216 cgaactgggtgaaca 230  Q
    |||||||||||||||    
T  7451270 cgaactgggtgaaca 7451284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 234
Target Start/End: Original strand, 39284930 - 39285007
Alignment:
Q  157 aactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39284930 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 39285007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14202569 - 14202450
Alignment:
Q  68 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttg 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||       ||||  ||||||||||||| |||    
T  14202569 tgagattgggaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaac-----tcatcc--tttgtaagaactcattg 14202478  T
Q  166 atagtggattggagagtacaatctctcc 193  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  14202477 atagtagattggagagatcaatctctcc 14202450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 207
Target Start/End: Original strand, 42412118 - 42412162
Alignment:
Q  163 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaa 207  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  42412118 ttgatagtggattggagagatcaatctctccccagagtaggtcaa 42412162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Original strand, 24197906 - 24198065
Alignment:
Q  73 ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgt--caagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaag-aactctttgatag 169  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||| | | ||||||||   | |||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||| ||||||||||||     
T  24197906 ttgggaaaagggtagaaattaaagttttttcttggagaacttgttgaaggctaatttcttgtaacc-cttgtatctc-tttgcaagaaactctttgataa 24198003  T
Q  170 tggattggagagtacaatctctcctcaga-gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 231  Q
    ||||||||||||  | |||| ||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  24198004 tggattggagagatctatct-tctccagacgtaggtcacgtttgggccgaactgggtaaacaa 24198065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 219
Target Start/End: Original strand, 28671989 - 28672088
Alignment:
Q  122 taatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaa 219  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  28671989 taatttcttgttaccgttttgtatctctttacaaagaactcactgacagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaa 28672088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 28770730 - 28770781
Alignment:
Q  82 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 134  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28770730 gggtagaaattagagtttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttgtaa 28770781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 27647800 - 27648157
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647800 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccatgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 27647897  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27647898 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagag 27647997  T
Q  200 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||    
T  27647998 tagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatc------ttgtgtattgagtttctcac 27648090  T
Q  300 ttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27648091 ttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgttcggtg 27648157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 16554806 - 16555173
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554806 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 16554905  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-caga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |    
T  16554906 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaa 16555005  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||     
T  16555006 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttca 16555105  T
Q  297 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16555106 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttg--cacacactttgtttggtg 16555173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 16631362 - 16631729
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631362 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 16631461  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-caga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |    
T  16631462 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaa 16631561  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||     
T  16631562 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttca 16631661  T
Q  297 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16631662 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttg--cacacactttgtttggtg 16631729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 16653049 - 16653416
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16653049 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtaaaaattagggtttg 16653148  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-caga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  16653149 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaga 16653248  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||     
T  16653249 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttca 16653348  T
Q  297 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16653349 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttg--cacacactttgtttggtg 16653416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16578749 - 16578382
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578749 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 16578650  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-caga 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  16578649 ctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaga 16578550  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||     
T  16578549 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttca 16578450  T
Q  297 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16578449 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttg--cacacactttgtttggtg 16578382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 16616631 - 16616998
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616631 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 16616730  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-caga 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  16616731 ctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaga 16616830  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||     
T  16616831 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttca 16616930  T
Q  297 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16616931 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttg--cacacactttgtttggtg 16616998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 25421242 - 25421595
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25421242 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 25421341  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25421342 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccag 25421441  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  25421442 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttc 25421540  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 350  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25421541 acacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 25421595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 6027185 - 6027535
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6027185 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 6027282  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6027283 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccag 6027382  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  6027383 agtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctc-cattttatcttgtgattgttgctttgtgtttc 6027480  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 350  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6027481 acacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 6027535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Original strand, 412046 - 412369
Alignment:
Q  9 tctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  412046 tctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt-gttcattgt 412144  T
Q  109 gaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggt 204  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  412145 gaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggt 412244  T
Q  205 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  412245 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgcttgtgtattgtgtttttcacttgtt 412344  T
Q  305 tcctagattagatctaggtggtgtt 329  Q
     ||||||||||||||||||| ||||    
T  412345 acctagattagatctaggtgctgtt 412369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 34167017 - 34167366
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34167017 ttagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 34167114  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaac-tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34167115 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaacttatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 34167214  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgttt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  34167215 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgttt 34167313  T
Q  295 ctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34167314 cacacttggttcctagatttgatctaggtggtgttttgttgttttttgcttgc 34167366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3072984 - 3072636
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattg 107  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3072984 tctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaatggtagaaattaggg-ttgttcattg 3072886  T
Q  108 tgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtagg 203  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3072885 tgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtagg 3072786  T
Q  204 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||    
T  3072785 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcacttgt 3072687  T
Q  304 ttcctagattagatctaggtggt-gttttgttgattattgcttgcacacac 353  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3072686 ttcctagattagatctatgtgctatttttgttgattattgcttgcacacac 3072636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33342336 - 33341982
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33342336 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 33342239  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  33342238 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtactccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 33342139  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct---tttatcttgtgattgtgtattgtgt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||   |  | |||    
T  33342138 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctttgt 33342040  T
Q  293 ttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 350  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  33342039 ttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 33341982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 34164795 - 34165144
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34164795 ttagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 34164892  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34164893 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 34164992  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |  | ||||    
T  34164993 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtt 34165091  T
Q  294 tctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 347  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  34165092 tcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 34165144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Original strand, 13153886 - 13154201
Alignment:
Q  35 accttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgta 133  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13153886 accttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgta 13153983  T
Q  134 accttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13153984 acctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgacca 13154083  T
Q  231 atctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgt 328  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13154084 atctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgt 13154182  T
Q  329 tttgttgattattgcttgc 347  Q
     |||||| || ||||||||    
T  13154183 attgttgtttcttgcttgc 13154201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6097672 - 6097326
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttt 99  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||     
T  6097672 ttagagtatctctttggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgttttggtgagattggaaaaatggtagaaattaggatt- 6097574  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-ag 197  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||           ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6097573 gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact----------cttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccag 6097484  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct- 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  6097483 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttgtatcttgtgattgtgtattgtgtttttc 6097384  T
Q  297 cacttgtttcctagattagatctaggtggtg-ttttgttgattattgcttgcacacac 353  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6097383 cacttgttacctagattagatcaaggtgctgtttttgttgattatagcttgcacacac 6097326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2171770 - 2171406
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaat 91  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||    
T  2171770 ttagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaat 2171671  T
Q  92 tagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctc 190  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2171670 tagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctc 2171573  T
Q  191 tcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattg 289  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||   ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||     
T  2171572 tcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtatttgtttatctcttctctc-ccttttatcttgtgcttgtgtttta 2171475  T
Q  290 tg---tttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacacac 353  Q
    ||   ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2171474 tgttttttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcacacac 2171406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 31404905 - 31404561
Alignment:
Q  9 tctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  31404905 tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatcagtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-g 31404807  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-ag 197  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  31404806 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccag 31404708  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtg-tttct 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||     
T  31404707 agtaggccaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgctttcc 31404612  T
Q  297 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
       ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31404611 tctttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 31404561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16452561 - 16452214
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtt 98  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16452561 tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt 16452462  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccttttg-tatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc- 195  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16452461 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcc 16452364  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttat-cttgtgattgtgtattgtgttt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||  || || |||||  ||||| ||    
T  16452363 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatatttttgcttgtggtttgtgctt 16452268  T
Q  295 ctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16452267 ttcactttgattcctagattagatctaggtgatgttattgttgattattgcttg 16452214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30834768 - 30834418
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtt 98  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30834768 tctcttgggttgagaaacattgtaaacacctcggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt 30834669  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc- 195  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  30834668 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcc 30834571  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||||   |||||  ||||||||||| || || |||||  ||||||||     
T  30834570 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatct--ttggtgtgtttgtttatctcttc--tctccttttatattttgcttgtggtttgtgtttt 30834475  T
Q  296 t--cactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgca 348  Q
    |  ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  30834474 tttcactttgattcatagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgca 30834418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5406416 - 5406109
Alignment:
Q  22 aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaactt 114  Q
    |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5406416 aaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaactt 5406318  T
Q  115 gtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagttt 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5406317 gtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttt 5406219  T
Q  212 ggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctag 310  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || || | ||| |||||||    
T  5406218 gaaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgtttgtggtttgtgcttttctctttgattcctag 5406123  T
Q  311 attagatctaggtg 324  Q
    ||||||||||||||    
T  5406122 attagatctaggtg 5406109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5410741 - 5410434
Alignment:
Q  22 aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaactt 114  Q
    |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5410741 aaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaactt 5410643  T
Q  115 gtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagttt 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5410642 gtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttt 5410544  T
Q  212 ggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctag 310  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || || | ||| |||||||    
T  5410543 gaaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgtttgtggtttgtgcttttctctttgattcctag 5410448  T
Q  311 attagatctaggtg 324  Q
    ||||||||||||||    
T  5410447 attagatctaggtg 5410434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5413561 - 5413281
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactc 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  5413561 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactc 5413464  T
Q  162 tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttcc 260  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||   ||||      
T  5413463 attgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt-- 5413369  T
Q  261 ctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    ||||||||||||||| || |||||  ||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5413368 ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttctctttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 5413281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 21588931 - 21589098
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  21588931 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21589028  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21589029 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 21589098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 21593664 - 21593831
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  21593664 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21593761  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21593762 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 21593831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33160521 - 33160254
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  33160521 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaac 33160424  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttctt 258  Q
    || ||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||   ||||    
T  33160423 tcattgatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtatttcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct--ttggtgtgtttgtttctctctt 33160326  T
Q  259 ccctctccttttatcttgtgattgtg-tattgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt 329  Q
    | ||| | ||||||||| || ||||| | ||||| || |||||| | || |||||||||||||||||| ||||    
T  33160325 ctctc-ctttttatcttttgtttgtggttttgtgcttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 33160254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5409164 - 5408956
Alignment:
Q  135 ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 233  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  5409164 ccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaa-- 5409069  T
Q  234 tctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-tt 331  Q
    |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  5409068 tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttctctttgattcctagattagatctaggtgttgttatt 5408971  T
Q  332 gttgattattgcttg 346  Q
    |||||||||||||||    
T  5408970 gttgattattgcttg 5408956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3808877 - 3808701
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  3808877 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 3808780  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 237  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3808779 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcatgattggaccgaactaggtgaacaatctctt 3808701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9183199 - 9182917
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  9183199 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 9183102  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||  | | |||      
T  9183101 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--tccctctct 9183007  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     |||||| |||||||| || |||| || ||||  || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9183006 tctctccctttatcttttgcttgtggttttgtacttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 9182917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Original strand, 17758026 - 17758191
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |    
T  17758026 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 17758123  T
Q  164 tgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17758124 tgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtgaaca 17758191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2973107 - 2972940
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  2973107 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 2973010  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  2973009 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaag-ttcgaccgaactaggtgaaca 2972940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 17762990 - 17763158
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||    
T  17762990 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttggaagaact 17763087  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17763088 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactaggtgaaca 17763158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26830289 - 26830124
Alignment:
Q  66 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactct 162  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||     
T  26830289 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctcttt-gtaagaactca 26830192  T
Q  163 ttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26830191 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagttt-gactgaactgggtgaaca 26830124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 16569019 - 16569193
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtat 144  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||         
T  16569019 gaaaatcattgagtgtcttg---agattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaaccttt----- 16569110  T
Q  145 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
           |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16569111 -------gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 16569193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22424995 - 22424826
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc---ttttgtatcccttttgtaagaa 158  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  22424995 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctcttt-gtaagaa 22424898  T
Q  159 ctctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    ||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  22424897 ctcatt-atagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcattgttggaccgtactgggtgaaca 22424826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28137576 - 28137409
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||    
T  28137576 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttcttt-gtaagaact 28137479  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  28137478 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgtgtgaaca 28137409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Original strand, 5043630 - 5043795
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |    
T  5043630 gtgagattgagaaaatgagtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcat 5043727  T
Q  164 tgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  5043728 tgatagtagattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 5043795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26954477 - 26954283
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| |     
T  26954477 gaaaatcattgagtgtcttgttcatatgtgagattgggaaattggtataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactca 26954379  T
Q  138 tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  26954378 tctgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 26954283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 603222 - 603082
Alignment:
Q  98 ttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc 195  Q
    |||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |    
T  603222 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattggagaaatcaatctctcccc 603124  T
Q  196 -agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 237  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  603123 aagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctctt 603082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33211353 - 33211182
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||||||||| | | |||||||| |||| |||||||||    
T  33211353 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctcttt-gtaagaact 33211256  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | || ||| ||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33211255 catttataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33211182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3039071 - 3038953
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  3039071 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 3038974  T
Q  161 ctttgatagtggattggagag 181  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  3038973 ctttaatagtggattggagag 3038953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Original strand, 4045423 - 4045542
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 161  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| |||| ||||   || |||||    
T  4045423 ttggagagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctctttgtaaataactc 4045522  T
Q  162 tttgatagtggattggagag 181  Q
     |||||||||||||||||||    
T  4045523 attgatagtggattggagag 4045542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Original strand, 26800642 - 26800755
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttgga 214  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||    
T  26800642 aagctaatttcttgtaactaattttgtatctcttt-gtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttgga 26800739  T
Q  215 ccgaactgggtgaaca 230  Q
    ||||||||| ||||||    
T  26800740 ccgaactggatgaaca 26800755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 131
Target Start/End: Original strand, 16567182 - 16567265
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttg 131  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||    
T  16567182 gaaaatcattgagtgtct---tgagattgggaaaatggttagaaattaggttttgttttttgtgagcttgtttaagctaatttcttg 16567265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 316 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6136216 - 6136165
Alignment:
Q  316 atctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgtttggtg 366  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||    
T  6136216 atctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatacactttgtttggtg 6136165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 71)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 8395542 - 8395910
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395542 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 8395639  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-caga 198  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8395640 ttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccaga 8395739  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcc-ttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  8395740 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccattgtatcttgtgattgttgctttgtgtttc 8395838  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgtttggtg 366  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | |||||||||||||    
T  8395839 acacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttttttgcttgcacaataaactttgtttggtg 8395910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 8393333 - 8393684
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393333 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 8393430  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-caga 198  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8393431 ttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccaga 8393530  T
Q  199 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcc-ttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  8393531 gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccattgtatcttgtgattgttgctttgtgtttc 8393629  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 350  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8393630 acacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 8393684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 7124838 - 7125191
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7124838 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 7124937  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7124938 ttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccag 7125037  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  7125038 agtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttc 7125136  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 350  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7125137 acacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 7125191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 7122619 - 7122972
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7122619 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 7122718  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  7122719 ttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccat 7122818  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    |||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  7122819 agtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatttcttt-gtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttc 7122917  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 350  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7122918 acacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 7122972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31495541 - 31495177
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattg 107  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31495541 tctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaatta-ggattgttcattg 31495443  T
Q  108 tgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtagg 203  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31495442 tgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagttgattggagagttcaatctctcctccagagtagg 31495343  T
Q  204 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctc--------tccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||        ||||||||||||||| |||||| || || ||     
T  31495342 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttt 31495244  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtt 361  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31495243 tcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtt 31495177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 5138227 - 5138565
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5138227 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaataccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 5138324  T
Q  101 ttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5138325 ttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcca 5138424  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtg-attgtgtattgtgt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||  |  | |||    
T  5138425 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgttttggttgctttgt 5138523  T
Q  293 ttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 335  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5138524 ttcacacttggttcctagattagatcta-gtgatgttttgttg 5138565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 5136001 - 5136340
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaa-catgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5136001 ttagagtatctcttgggttgaaaaacatgggaaataccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggttt 5136098  T
Q  100 gttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-c 195  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5136099 gttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctcc 5136198  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtg-attgtgtattgtg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||  |  | ||    
T  5136199 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgttttggttgctttg 5136297  T
Q  292 tttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 335  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5136298 tttcacacttggttcctagattagatcta-gtgatgttttgttg 5136340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13992525 - 13992174
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg--aaaagggtagaaattagggt 97  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  13992525 ttagagtctctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattaggg- 13992427  T
Q  98 ttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct- 194  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13992426 ttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtat--ctcttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctc 13992329  T
Q  195 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatc-ttgtgattgtgtattgtgtt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||   ||||| ||| ||||||||| || || |||||  ||||| |    
T  13992328 cagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctcttctctc-ccttttatctttttgcttgtgatttgtgct 13992232  T
Q  294 tctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcac 349  Q
    | |||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13992231 tttcactttgatacctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcac 13992174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 56178868 - 56178522
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  56178868 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt- 56178770  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-a 196  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  56178769 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 56178671  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||| ||     
T  56178670 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttt 56178575  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  56178574 tcactttcattcctagattagatctaggtgttgttattgtttattattgcttg 56178522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30000037 - 29999719
Alignment:
Q  9 tctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30000037 tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcgttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-g 29999939  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  29999938 ttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatcttttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccag 29999839  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||  |||||||   ||||  |||||||||| |||| || |||||  |||||||| ||    
T  29999838 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca------ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttgtcttttgcttgtggtttgtgtttttc 29999747  T
Q  298 ac-ttgtttcctagattagatctaggtg 324  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||    
T  29999746 tctttgattcctagattagatctaggtg 29999719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5370232 - 5369968
Alignment:
Q  83 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa--gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 179  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | |||    
T  5370232 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggactagag 5370135  T
Q  180 agtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtg 278  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| ||    
T  5370134 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa--tctttgatgtgtttgtttatctctt--ctctccttttatcttttg 5370039  T
Q  279 attgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     |||| || ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5370038 cttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 5369968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Original strand, 48143042 - 48143330
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||    
T  48143042 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttca-taagaac 48143139  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttctt 258  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||   ||||    
T  48143140 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct--ttggtgtgtttgtttctctctt 48143237  T
Q  259 ccctctccttttatcttgtgattgtg-tattgtg----tttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    |  |||||||||||||| || ||||| | |||||    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  48143238 c--tctccttttatcttttgcttgtgattttgtgcttttttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 48143330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 52095530 - 52095248
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| |    
T  52095530 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaaat 52095433  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||   ||||     
T  52095432 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaacaa--tttttggtgtgtttgtttctctctt- 52095337  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     ||||||||||||||| |  |||| || ||||| || || | |||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  52095336 -ctctccttttatcttttccttgtggttttgtgcttttctctttgactcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattacttg 52095248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 237
Target Start/End: Original strand, 2209717 - 2209889
Alignment:
Q  68 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctt 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |    
T  2209717 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcat 2209814  T
Q  164 tgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 237  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2209815 tgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 2209889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9927689 - 9927345
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  9927689 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt- 9927591  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctca 196  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||    
T  9927590 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 9927492  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta-ttgtgtttc 295  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||||  ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || ||||| | ||||| ||     
T  9927491 gattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctattctctcc-tttatcttttgcttgtggatttgtgcttt 9927398  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9927397 tcactttgattcctagattaaatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 9927345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 41964415 - 41964580
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  41964415 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatcccttt-gtaagaac 41964512  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 227  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41964513 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 41964580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34570582 - 34570304
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctt-ttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||||||    
T  34570582 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctcttt-gtaagaact 34570485  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||      
T  34570484 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggatcgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctct 34570390  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 342  Q
     ||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34570389 tctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcttagattagatctaggtgttgttattgttgattattg 34570304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12739718 - 12739547
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||| |||||    
T  12739718 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtatgaact 12739621  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12739620 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12739547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36463557 - 36463386
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  36463557 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggct-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36463460  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36463459 ctttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36463386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 40632445 - 40632612
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  40632445 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 40632542  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40632543 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 40632612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Original strand, 26364236 - 26364410
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  26364236 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 26364333  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 237  Q
    | || ||||||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||    
T  26364334 cattaatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gactgaactgggtcaacaatttctt 26364410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46147557 - 46147388
Alignment:
Q  66 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactct 162  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||    
T  46147557 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactct 46147460  T
Q  163 ttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46147459 ttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 46147388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 46703500 - 46703669
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  46703500 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 46703597  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    || || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  46703598 tcatttatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaattgggtgaaca 46703669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47038577 - 47038408
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactct 162  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||| ||||     
T  47038577 ttggtgagattggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcatttgtatctgttt-gtaaggactca 47038480  T
Q  163 ttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  47038479 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 47038408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 12073392 - 12073560
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  12073392 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 12073489  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  12073490 cattgatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaaca 12073560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 237
Target Start/End: Original strand, 12119540 - 12119714
Alignment:
Q  66 ggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactct 162  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||     
T  12119540 ggtgagattggaaaaaagagtagaaattatggtttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactca 12119639  T
Q  163 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 237  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12119640 tttatagtggattggagagatcaatctctcccaagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacaatttctt 12119714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12744073 - 12743922
Alignment:
Q  83 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 180  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12744073 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaga 12743976  T
Q  181 gtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12743975 gatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12743922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12745462 - 12745311
Alignment:
Q  83 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 180  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12745462 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaga 12745365  T
Q  181 gtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12745364 gatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12745311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26175804 - 26175633
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  26175804 ttggtgagattgggaaaatggggagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 26175707  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26175706 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 26175633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 41639426 - 41639593
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||    
T  41639426 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtaagaact 41639523  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | | |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  41639524 catcgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaaca 41639593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37229890 - 37229722
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct-tttgtaagaactc 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||| |||  || |||||||||||||    
T  37229890 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgtaagaactc 37229791  T
Q  162 tttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
     || ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  37229790 atttatagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtaaaca 37229722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48893810 - 48893635
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgt----gaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaag 156  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    || |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||    
T  48893810 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaag 48893713  T
Q  157 aactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  48893712 aactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 48893635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Original strand, 54883020 - 54883194
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  54883020 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54883117  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 237  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  54883118 cattgatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttctt 54883194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Original strand, 36994524 - 36994693
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  36994524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaact 36994621  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 232  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36994622 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 36994693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Original strand, 379383 - 379548
Alignment:
Q  67 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 163  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||  |    
T  379383 gtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgcttt-gtaagaactaat 379480  T
Q  164 tgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||    
T  379481 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactggatgaaca 379548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Original strand, 6655975 - 6656123
Alignment:
Q  82 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 179  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6655975 gggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggag 6656072  T
Q  180 agtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    ||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6656073 agatcaatctctcatccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtgaaca 6656123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 8648139 - 8648306
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  8648139 ttggtgagaatgggaaaatggatagaaattagggtt-gttcattgtgagtttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8648236  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8648237 cattgatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 8648306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 210
Target Start/End: Original strand, 8665408 - 8665556
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  8665408 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8665505  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtt 210  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8665506 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 8665556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45687351 - 45687179
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||  ||| |||||||||    
T  45687351 ttggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtatctattt-gtaagaact 45687253  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  | ||||||||| || | || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45687252 cattgatagtggattggagagatctatctctcctccatattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45687179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 232
Target Start/End: Original strand, 37740562 - 37740794
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||       |||||||| |||||| ||||| |||||||||||     
T  37740562 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt- 37740660  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctca 196  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||    
T  37740661 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 37740759  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 232  Q
    || | ||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  37740760 gatttggtcaag-ttggaccgaactgtgtcaacaat 37740794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6542349 - 6542180
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaac 159  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  6542349 ttggggagattgggaaaaaatggtagaaattaggatttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctcttt-gtaagaac 6542251  T
Q  160 tctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6542250 tcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 6542180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 52467546 - 52467351
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||     
T  52467546 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgaggttgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaaccc 52467448  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     |||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  52467447 atttgtatcacttt-gtaataactttttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 52467351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5208003 - 5207843
Alignment:
Q  71 gattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct-tttgtaagaactctttgata 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||  ||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  5208003 gattggaaaaagggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacc-cttgtatatctatttgtaagaactcattgata 5207905  T
Q  169 gtggattggagagtacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  5207904 gtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggtcaa-tttggactgaattgggtaaaca 5207843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 5871820 - 5871991
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||  ||| |||| |||| | |||||||    
T  5871820 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccatttttatcacttt-gcaagaact 5871917  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5871918 ctttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatct 5871991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27417133 - 27416962
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  27417133 ttggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 27417036  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  27417035 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct 27416962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 50673960 - 50673848
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggac 215  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50673960 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggac 50673863  T
Q  216 cgaactgggtgaaca 230  Q
    |||||| ||||||||    
T  50673862 cgaactaggtgaaca 50673848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50262865 - 50262694
Alignment:
Q  68 tgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 164  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  50262865 tgagattgggaaaatggatcgaaattacggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 50262768  T
Q  165 gatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 237  Q
    |||||| |||||||||   |||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50262767 gatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacaatctctt 50262694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 52082825 - 52082549
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| |    
T  52082825 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaaat 52082728  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    |||||||||||       |||  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||     
T  52082727 ctttgatagtg-------gagatcattctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgatttgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttatctctt- 52082638  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctc-acttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     ||||||||||||||| || |||| || || || || ||   ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  52082637 -ctctccttttatcttttgcttgtggttttatgcttttctttttgattcctagataagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 52082549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 193
Target Start/End: Original strand, 4587958 - 4588089
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  4587958 ttggtgaaattgggaaaaaaggtagaaattaagatttgttctttgtaagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaact 4588056  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 193  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4588057 cattgatagtggattggagagaacaatctctcc 4588089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12747924 - 12747794
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||| |||||    
T  12747924 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtatgaact 12747827  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 193  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12747826 cattgatagtggattggagagatcaatctctcc 12747794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 54200074 - 54199906
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  54200074 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54199977  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 232  Q
    | ||||||||| ||| |||||  || ||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  54199976 cattgatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggtcaag-ttgga-cgaactgggtcaacaat 54199906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 5429679 - 5429850
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||    
T  5429679 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtta-ttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtaagaact 5429776  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5429777 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5429850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744087
Alignment:
Q  83 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 180  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12744195 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaga 12744098  T
Q  181 gtacaatctct 191  Q
    |  ||||||||    
T  12744097 gatcaatctct 12744087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12745604 - 12745476
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  12745604 ttggcgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 12745507  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct 191  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12745506 cattgatagtggattggagagatcaatctct 12745476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 35662441 - 35662600
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  35662441 ttggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 35662538  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactg 222  Q
    | |||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  35662539 cattgatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggtcaag-ttggaccgaactg 35662600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 31474150 - 31474318
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| || |||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  31474150 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtcttgttctttttgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 31474248  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcc-tcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||| ||||||||||   |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31474249 cattgatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 31474318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26699596 - 26699447
Alignment:
Q  79 aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattg 176  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||| || ||| |||||||    
T  26699596 aaagggtatagattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttataatggattg 26699497  T
Q  177 gagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 225  Q
    |||||  ||||||||  | ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26699496 gagagatcaatctctatcccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 26699447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 329
Target Start/End: Original strand, 29254580 - 29254758
Alignment:
Q  149 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctttt 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||    
T  29254580 tttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgttt 29254676  T
Q  248 gttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 329  Q
    |  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  29254677 g--ttcctctattctctccatttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 29254758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Original strand, 24969112 - 24969230
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  24969112 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 24969209  T
Q  161 ctttgatagtggattggagag 181  Q
      |||||||||||||||||||    
T  24969210 aattgatagtggattggagag 24969230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 51337000 - 51337231
Alignment:
Q  9 tctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtc-------ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattaggg-t 97  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||| |||||||||||||||||       |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |    
T  51337000 tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcctgttcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattacggat 51337099  T
Q  98 ttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-c 195  Q
    |||||| |||||| ||| | ||| |||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||  |    
T  51337100 ttgttctttgtgagctttt-aagataatttattataacccttttgtatctctttt-taagaactcattgatagtgtattagagagatcaatctctcccac 51337197  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | | ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  51337198 acattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtaaaca 51337231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 3913424 - 3913618
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| | ||||||||||| | | |||| ||||||  ||||  ||||||||||||| |||||     
T  3913424 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgagtagaaattagagct-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttttaaccc 3913522  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     |||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  3913523 atttgtatatcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccctagagtatgtaaag-ttgtatcgaactgggtcaacaatct 3913618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13009536 - 13009441
Alignment:
Q  138 tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| || | ||||||||| || |||||||||| || ||||||||    
T  13009536 tttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtcaag-ttagaccgaactgtgtcaacaatct 13009441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 35369653 - 35369614
Alignment:
Q  27 tgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35369653 tgggaaacaccttgtagagtgaaaatcattgagtgtcttg 35369614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 33989899 - 33989989
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcc-tcagagtaggtca 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   || ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  33989899 aagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaataactcgttaatagtggattggagagatcaatctctccaccagagtaggtca 33989989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 48142542 - 48142473
Alignment:
Q  68 tgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 136  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  48142542 tgagattgggaacatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacc 48142473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 41639263 - 41639353
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttg 152  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  41639263 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtaaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttttg 41639353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 136
Target Start/End: Original strand, 1983252 - 1983309
Alignment:
Q  78 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc 136  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1983252 aaaaggatagaaattatgttttgttctttgtgagcttg-caagctaatttcttgtaacc 1983309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 44967992 - 44967910
Alignment:
Q  69 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || | | || |||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44967992 gagattgggaaaatggtagaaattaggttttgctcttggagagcttgctgaagccaatttcttgtaaccatttgtatctcttt 44967910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 133
Target Start/End: Original strand, 5349929 - 5349980
Alignment:
Q  82 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgta 133  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5349929 gggtagaaattagg-tttgttctttgtgaacttgtcgaagctaattccttgta 5349980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 204
Target Start/End: Original strand, 33089933 - 33090021
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggt 204  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| || |   |||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  33089933 aagctaatttattataaccattttgtatctctctgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctctagagtaggt 33090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 55085532 - 55085445
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgt-aaccttttgtatcccttt 150  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  55085532 ttggtgagattggaaaataggtagaaattaagg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaaccatttgtatctcttt 55085445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2834 - 2466
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2834 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 2737  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2736 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccag 2637  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  2636 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttc 2538  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgtttggtg 366  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | |||||||||||||    
T  2537 acacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtg 2466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3956 - 3605
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3956 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 3859  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  3858 ttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccag 3759  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  3758 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttc 3660  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 350  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3659 acacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 3605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 6211 - 6581
Alignment:
Q  1 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6211 ttagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttg 6308  T
Q  101 ttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cag 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6309 ttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaagcccttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccag 6408  T
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcc---ttttatcttgtgattg-tgtattgtgtt 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  |||||||    
T  6409 agtaggttaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgttattgttttcttcttccctctccttgttttatcttgtgattgttgctttgtgtt 6507  T
Q  294 tctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgtttggtg 366  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| | | |||||||||||||    
T  6508 tcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgcacaataaactttgtttggtg 6581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11393 - 11042
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  11393 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt- 11295  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  11294 gttctttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 11195  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |    
T  11194 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtggtttgtgttttt 11097  T
Q  297 cac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcac 349  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11096 cactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 11042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 62 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8907 - 8616
Alignment:
Q  62 tcttggtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaaga 157  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  8907 tcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaaga 8809  T
Q  158 actctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttc 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||    
T  8808 actcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtctttgttttcctc 8711  T
Q  257 ttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcac 349  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8710 ttccctcttcttttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 8616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 434469 - 434812
Alignment:
Q  9 tctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggg--aaaagggtagaaattagggtt 98  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  434469 tctcttgggttggaaaacatggtaaataccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggtt 434568  T
Q  99 tgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-c 195  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  434569 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcc 434666  T
Q  196 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||   ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||     
T  434667 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tatttggtgtgtttgtttctctcttctctc-ccttttatcttgtgcttgtgttttgtgcttt 434763  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 342  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  434764 tcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 434812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 353
Target Start/End: Original strand, 11508 - 11855
Alignment:
Q  22 aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaact 113  Q
    |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11508 aaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaact 11606  T
Q  114 tgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtt 210  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11607 tgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 11705  T
Q  211 tggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg---tattgtgtttct--cac-ttgt- 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||   ||||| ||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||| |  ||| ||||     
T  11706 tggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtatttgtttatctcttctctc-ccttttatcttgtgcttgtgttttattgttttttttccactttgta 11803  T
Q  304 ttcctagattag-atctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacacac 353  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11804 ttcctagattagtatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcacacac 11855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 348
Target Start/End: Original strand, 853 - 1200
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  853 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt- 951  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-a 196  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  952 gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aacaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 1049  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg-cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||   ||||  ||||||||||||  | || |||||  ||||| ||     
T  1050 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgttttgtttctctctt--ctctccttttatactttgcttgtggtttgtgcttt 1145  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgca 348  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1146 tcactttgatacctagattagatctaggtggtgttattgttgattattgcttgca 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 114539 - 114881
Alignment:
Q  9 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  114539 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggtt- 114637  T
Q  100 gttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 196  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  114638 gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 114736  T
Q  197 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 295  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||   ||||||   ||||  ||||||||||||||| |  ||| ||| ||||| ||     
T  114737 gagtaggttaagtttagaccgaactggatgaacaa--tctttggtgtgcttgtttctctctt--ctctccttttatctttttcttgttgttttgtgcttt 114832  T
Q  296 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 342  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  114833 tcactttgattcctagattagatataggtgttgttattgttgattattg 114881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Original strand, 102450 - 102513
Alignment:
Q  82 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatc 145  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  102450 gggtagaaattagggtttgttttttgtgagctt-ttaagataatttcttgtaacctctttgtatc 102513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 198 - 350
Target Start/End: Original strand, 1 - 154
Alignment:
Q  198 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  1 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttg-tgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttc 99  T
Q  296 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 350  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  100 acacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20583 - 20301
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  20583 ttggtgagattgggaaaatgagcagaaattagg-tttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 20486  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 259  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||  ||| |||      
T  20485 ctttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tttttggtgtgtttg--ttcctctct 20391  T
Q  260 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 346  Q
     |||||| |||||||| || |||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  20390 tctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttaattattgcttg 20301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18171 - 18004
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  18171 ttggtgagagtgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-aact 18075  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18074 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaaca 18004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 7327 - 7494
Alignment:
Q  64 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 160  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  7327 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 7424  T
Q  161 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    | |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7425 cattgatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtgaaca 7494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 230
Target Start/End: Original strand, 10515 - 10656
Alignment:
Q  88 aaattagggtttgttcattgtgaact--tgtcaagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtac 184  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||  |||   |||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |    
T  10515 aaattagggtttgttctttgtgagctcttgt---gctaatttattgtaaccattttgtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattgaagagatc 10610  T
Q  185 aatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10611 aatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 10656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 149289 - 149094
Alignment:
Q  47 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 137  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||| | |||||  ||||||||||||||| |||     
T  149289 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggtt-gttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttaccc 149191  T
Q  138 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 234  Q
     ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  149190 atttatatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 149094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 80447 - 80338
Alignment:
Q  68 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||| |     
T  80447 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatct-ttttgtaagaactcata 80350  T
Q  165 gatagtggattg 176  Q
    ||||||| ||||    
T  80349 gatagtgaattg 80338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27556 - 27480
Alignment:
Q  118 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 193  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||   || ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27556 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaataacttattgatagtggattggagagatcaatctctcc 27480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University