View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8516_low_28 (Length: 243)

Name: NF8516_low_28
Description: NF8516
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8516_low_28
NF8516_low_28
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (1-243)||(18412510-18412751)
chr4 (1-243)||(3393219-3393460)
chr4 (1-243)||(49791987-49792228)
chr4 (1-236)||(10312187-10312421)
chr4 (1-243)||(34153337-34153580)
chr4 (1-243)||(11288210-11288451)
chr4 (1-243)||(32937953-32938194)
chr4 (13-243)||(45939452-45939681)
chr4 (13-243)||(22436838-22437067)
chr4 (1-243)||(26591736-26591977)
chr4 (1-243)||(31824680-31824921)
chr4 (1-243)||(44560231-44560472)
chr4 (14-243)||(20778920-20779148)
chr4 (55-243)||(25762566-25762754)
chr4 (1-243)||(13850664-13850905)
chr4 (1-243)||(13866178-13866419)
chr4 (1-243)||(31324089-31324330)
chr4 (17-243)||(43889550-43889775)
chr4 (1-243)||(49423809-49424050)
chr4 (14-243)||(17211194-17211422)
chr4 (15-243)||(51027818-51028045)
chr4 (13-243)||(957506-957735)
chr4 (1-235)||(2772924-2773157)
chr4 (13-243)||(20901719-20901948)
chr4 (1-243)||(21017228-21017469)
chr4 (13-243)||(51428243-51428472)
chr4 (1-243)||(242467-242708)
chr4 (13-243)||(40353824-40354053)
chr4 (15-243)||(47657406-47657633)
chr4 (1-243)||(1042666-1042905)
chr4 (1-243)||(41794613-41794854)
chr4 (1-240)||(4785476-4785714)
chr4 (1-243)||(37866321-37866563)
chr4 (13-243)||(1226087-1226315)
chr4 (1-243)||(6177366-6177607)
chr4 (1-243)||(36776570-36776811)
chr4 (1-243)||(56138825-56139066)
chr4 (13-225)||(28082165-28082376)
chr4 (13-243)||(34529847-34530076)
chr4 (4-243)||(14330745-14330983)
chr4 (1-243)||(33163595-33163836)
chr4 (13-243)||(49817695-49817924)
chr4 (54-243)||(6282374-6282563)
chr4 (1-243)||(42886178-42886422)
chr4 (1-243)||(46816574-46816815)
chr4 (1-243)||(49094660-49094901)
chr4 (1-173)||(21412646-21412817)
chr4 (13-243)||(39588856-39589085)
chr4 (82-243)||(55796738-55796899)
chr4 (1-235)||(9489594-9489826)
chr4 (1-243)||(21169366-21169607)
chr4 (1-243)||(24606667-24606908)
chr4 (1-243)||(49063895-49064135)
chr4 (106-243)||(21711549-21711686)
chr4 (134-243)||(27759374-27759483)
chr4 (19-101)||(23124727-23124808)
chr4 (2-122)||(17291869-17291988)
chr4 (1-75)||(55794523-55794596)
chr4 (19-116)||(12227669-12227765)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (1-243)||(29906501-29906742)
chr2 (1-243)||(35491554-35491795)
chr2 (1-243)||(10364683-10364924)
chr2 (1-243)||(37312541-37312782)
chr2 (13-243)||(10360245-10360474)
chr2 (13-243)||(27130555-27130784)
chr2 (14-243)||(29111090-29111318)
chr2 (1-201)||(16253395-16253594)
chr2 (13-243)||(12968348-12968577)
chr2 (1-243)||(19471680-19471921)
chr2 (1-243)||(20148037-20148278)
chr2 (13-243)||(6976769-6976996)
chr2 (1-243)||(6901885-6902126)
chr2 (1-243)||(29067649-29067889)
chr2 (1-243)||(34521730-34521970)
chr2 (1-243)||(39393810-39394051)
chr2 (13-240)||(5420400-5420626)
chr2 (13-243)||(3941668-3941897)
chr2 (1-243)||(22493190-22493431)
chr2 (1-226)||(39799905-39800129)
chr2 (1-243)||(17796153-17796391)
chr2 (1-243)||(3937110-3937351)
chr2 (2-243)||(17424709-17424949)
chr2 (1-243)||(2919411-2919650)
chr2 (68-243)||(33404000-33404175)
chr2 (13-243)||(42119943-42120172)
chr2 (1-243)||(43982775-43983016)
chr2 (23-236)||(32734588-32734800)
chr2 (1-243)||(42241145-42241386)
chr2 (1-243)||(16581741-16581984)
chr2 (86-243)||(41499140-41499297)
chr2 (1-209)||(34638885-34639091)
chr2 (1-147)||(31770282-31770427)
chr2 (1-137)||(40678767-40678902)
chr2 (82-243)||(22001833-22001994)
chr2 (82-225)||(18392032-18392179)
chr2 (19-140)||(31992094-31992214)
chr2 (25-140)||(11718688-11718802)
chr2 (2-140)||(26617635-26617771)
chr2 (19-140)||(18036317-18036437)
chr2 (19-140)||(18878441-18878561)
chr2 (60-140)||(11679247-11679327)
chr2 (139-243)||(40677421-40677525)
chr2 (1-75)||(16706886-16706959)
chr2 (2-122)||(27650603-27650722)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (13-243)||(34614890-34615119)
chr8 (1-243)||(33799599-33799840)
chr8 (13-243)||(38033973-38034202)
chr8 (1-243)||(28706190-28706431)
chr8 (1-243)||(31171864-31172105)
chr8 (13-243)||(41363593-41363822)
chr8 (1-243)||(26452250-26452491)
chr8 (13-243)||(26484514-26484743)
chr8 (13-243)||(43693074-43693303)
chr8 (1-243)||(44943129-44943369)
chr8 (1-240)||(42603379-42603617)
chr8 (13-243)||(15032372-15032601)
chr8 (1-243)||(18440343-18440584)
chr8 (1-243)||(40702285-40702526)
chr8 (13-243)||(41857022-41857251)
chr8 (11-243)||(43638725-43638955)
chr8 (1-243)||(2416840-2417081)
chr8 (1-236)||(16575617-16575851)
chr8 (13-243)||(19242210-19242439)
chr8 (13-243)||(19315394-19315623)
chr8 (13-243)||(42169008-42169237)
chr8 (2-243)||(24861269-24861509)
chr8 (13-243)||(41275331-41275560)
chr8 (1-226)||(485323-485547)
chr8 (55-243)||(40415235-40415423)
chr8 (82-243)||(3589314-3589475)
chr8 (13-180)||(22548200-22548366)
chr8 (55-243)||(40414589-40414776)
chr8 (38-140)||(22843474-22843575)
chr8 (2-140)||(12504875-12505012)
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (13-243)||(6754145-6754374)
chr3 (13-243)||(6464394-6464623)
chr3 (1-243)||(39416997-39417238)
chr3 (1-243)||(51015206-51015447)
chr3 (14-243)||(44927405-44927633)
chr3 (1-243)||(2428416-2428657)
chr3 (1-243)||(46414383-46414624)
chr3 (1-243)||(43569839-43570080)
chr3 (13-243)||(34472125-34472354)
chr3 (1-243)||(49218785-49219026)
chr3 (2-243)||(24702321-24702560)
chr3 (1-243)||(13895919-13896160)
chr3 (1-243)||(48087601-48087842)
chr3 (1-243)||(51013327-51013568)
chr3 (14-243)||(27186890-27187118)
chr3 (14-243)||(34647316-34647544)
chr3 (1-243)||(30192467-30192708)
chr3 (13-243)||(41803844-41804072)
chr3 (1-243)||(42382200-42382441)
chr3 (1-243)||(42382980-42383221)
chr3 (13-243)||(47065628-47065857)
chr3 (1-243)||(47759940-47760181)
chr3 (1-243)||(49610418-49610659)
chr3 (1-243)||(51695655-51695896)
chr3 (1-226)||(3495095-3495319)
chr3 (1-243)||(14265337-14265575)
chr3 (13-225)||(33449206-33449417)
chr3 (84-243)||(20375931-20376090)
chr3 (1-243)||(2646925-2647166)
chr3 (1-243)||(34693339-34693579)
chr3 (85-243)||(41577918-41578076)
chr3 (1-243)||(42950069-42950310)
chr3 (1-243)||(49273328-49273569)
chr3 (1-243)||(53826745-53826986)
chr3 (13-243)||(774387-774616)
chr3 (14-236)||(8633415-8633636)
chr3 (1-243)||(45100514-45100755)
chr3 (1-243)||(49140103-49140344)
chr3 (1-243)||(54390371-54390612)
chr3 (2-243)||(46402933-46403173)
chr3 (36-243)||(25576641-25576846)
chr3 (1-243)||(2268543-2268784)
chr3 (1-243)||(4004136-4004377)
chr3 (1-243)||(19453278-19453519)
chr3 (1-162)||(15636953-15637113)
chr3 (13-243)||(14631386-14631615)
chr3 (1-243)||(34049656-34049897)
chr3 (1-243)||(37281381-37281622)
chr3 (55-243)||(43477039-43477227)
chr3 (15-243)||(10053323-10053547)
chr3 (13-243)||(7954144-7954374)
chr3 (1-243)||(36134937-36135177)
chr3 (1-243)||(44835536-44835777)
chr3 (1-243)||(52569458-52569698)
chr3 (86-243)||(55206933-55207090)
chr3 (13-243)||(7246035-7246264)
chr3 (66-243)||(36721438-36721615)
chr3 (13-128)||(11378908-11379022)
chr3 (106-243)||(25887660-25887796)
chr3 (55-243)||(50458740-50458928)
chr3 (116-243)||(42323438-42323565)
chr3 (13-120)||(42328288-42328394)
chr3 (1-127)||(46346745-46346865)
chr3 (1-90)||(20378089-20378177)
chr3 (2-147)||(17267446-17267590)
chr3 (139-243)||(50997454-50997558)
chr3 (192-243)||(46346661-46346712)
chr3 (201-243)||(18440873-18440915)
chr3 (201-243)||(19485947-19485989)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (1-243)||(5765121-5765362)
chr1 (1-243)||(38046484-38046725)
chr1 (13-243)||(48568454-48568683)
chr1 (1-243)||(18842354-18842595)
chr1 (1-243)||(35586979-35587220)
chr1 (3-243)||(24270413-24270652)
chr1 (1-243)||(13283621-13283861)
chr1 (1-243)||(14173808-14174049)
chr1 (1-243)||(47488087-47488328)
chr1 (14-243)||(29435901-29436129)
chr1 (1-243)||(13972840-13973080)
chr1 (1-243)||(17372642-17372883)
chr1 (13-243)||(45689048-45689275)
chr1 (36-243)||(49598925-49599130)
chr1 (1-243)||(6435687-6435928)
chr1 (13-243)||(29762271-29762500)
chr1 (1-243)||(36909476-36909717)
chr1 (13-243)||(39856956-39857185)
chr1 (1-243)||(41874934-41875175)
chr1 (13-243)||(42571826-42572055)
chr1 (1-226)||(13635364-13635588)
chr1 (14-243)||(39224247-39224475)
chr1 (1-240)||(35184885-35185124)
chr1 (1-243)||(23342556-23342797)
chr1 (1-243)||(44337369-44337610)
chr1 (13-243)||(44597628-44597857)
chr1 (1-243)||(50068309-50068550)
chr1 (13-239)||(51269729-51269954)
chr1 (38-243)||(21484693-21484897)
chr1 (15-235)||(12791331-12791550)
chr1 (55-243)||(35576307-35576495)
chr1 (60-243)||(17686411-17686594)
chr1 (13-243)||(27486740-27486969)
chr1 (13-243)||(41780620-41780849)
chr1 (1-243)||(49396619-49396860)
chr1 (26-243)||(27035368-27035584)
chr1 (2-243)||(35526227-35526467)
chr1 (14-243)||(49427315-49427543)
chr1 (1-147)||(16098078-16098222)
chr1 (1-243)||(19160232-19160473)
chr1 (13-243)||(48215125-48215354)
chr1 (1-241)||(18169940-18170179)
chr1 (89-243)||(3658475-3658629)
chr1 (13-243)||(16532140-16532369)
chr1 (23-243)||(17696983-17697202)
chr1 (96-239)||(16081294-16081437)
chr1 (82-243)||(49263038-49263199)
chr1 (91-243)||(49926430-49926582)
chr1 (90-242)||(24363851-24364003)
chr1 (13-226)||(30309893-30310105)
chr1 (21-140)||(15471453-15471571)
chr1 (109-243)||(46180330-46180465)
chr1 (117-243)||(37778109-37778235)
chr1 (1-114)||(46181731-46181843)
chr1 (38-121)||(48707090-48707172)
chr1 (13-98)||(4209178-4209262)
chr1 (133-218)||(13148365-13148450)
chr1 (19-147)||(14772687-14772813)
chr1 (13-91)||(13148218-13148295)
chr1 (3-55)||(24364012-24364064)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (1-243)||(1400354-1400595)
chr5 (13-243)||(1971291-1971520)
chr5 (13-243)||(33370580-33370809)
chr5 (1-176)||(12742629-12742803)
chr5 (1-177)||(12805447-12805622)
chr5 (13-243)||(541687-541916)
chr5 (13-243)||(18308186-18308415)
chr5 (2-243)||(2599134-2599374)
chr5 (1-243)||(8537868-8538109)
chr5 (1-243)||(11346623-11346864)
chr5 (1-243)||(17366788-17367028)
chr5 (1-243)||(19400277-19400518)
chr5 (1-243)||(35565186-35565426)
chr5 (1-226)||(30709512-30709736)
chr5 (1-243)||(7281-7522)
chr5 (1-243)||(4724126-4724367)
chr5 (1-243)||(40009442-40009683)
chr5 (1-226)||(11027691-11027915)
chr5 (1-226)||(38854072-38854296)
chr5 (1-243)||(8576193-8576434)
chr5 (1-243)||(28880905-28881146)
chr5 (13-243)||(3601267-3601496)
chr5 (1-243)||(19036726-19036967)
chr5 (1-243)||(27661429-27661670)
chr5 (13-243)||(35927489-35927718)
chr5 (1-180)||(3458750-3458928)
chr5 (1-243)||(6793438-6793679)
chr5 (60-243)||(3169576-3169758)
chr5 (13-180)||(36350420-36350586)
chr5 (55-128)||(7082259-7082332)
chr5 (2-100)||(25360788-25360885)
chr5 (89-166)||(1693382-1693459)
chr5 (19-166)||(15798218-15798365)
chr5 (2-140)||(12067747-12067884)
chr5 (21-121)||(36312128-36312227)
chr5 (19-140)||(19747991-19748111)
chr5 (2-149)||(18920640-18920786)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (13-243)||(2196-2425)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (25-243)||(1642636-1642853)
chr7 (1-243)||(28979071-28979312)
chr7 (1-243)||(36393873-36394114)
chr7 (1-243)||(48270565-48270806)
chr7 (1-243)||(40588466-40588707)
chr7 (1-243)||(46862243-46862484)
chr7 (31-243)||(21187348-21187559)
chr7 (1-224)||(26603273-26603495)
chr7 (13-243)||(15337954-15338183)
chr7 (1-243)||(21614809-21615050)
chr7 (1-243)||(41217531-41217772)
chr7 (13-243)||(17183141-17183370)
chr7 (13-243)||(30360446-30360674)
chr7 (13-243)||(34140794-34141023)
chr7 (1-243)||(43351149-43351389)
chr7 (6-243)||(17839245-17839481)
chr7 (18-243)||(39477289-39477513)
chr7 (13-243)||(20378752-20378981)
chr7 (1-243)||(20564676-20564917)
chr7 (1-243)||(48315229-48315470)
chr7 (1-243)||(21650440-21650682)
chr7 (1-243)||(48220793-48221032)
chr7 (17-243)||(42735196-42735420)
chr7 (55-243)||(41048753-41048941)
chr7 (1-243)||(18237481-18237722)
chr7 (1-218)||(45363317-45363533)
chr7 (1-208)||(10522985-10523191)
chr7 (85-243)||(47268899-47269056)
chr7 (55-243)||(28114442-28114630)
chr7 (26-180)||(42682898-42683051)
chr7 (55-243)||(2356259-2356447)
chr7 (1-172)||(8726338-8726508)
chr7 (102-243)||(30354864-30355005)
chr7 (1-170)||(13916751-13916918)
chr7 (2-140)||(18146877-18147014)
chr7 (23-140)||(3380835-3380950)
chr7 (2-147)||(149997-150141)
chr7 (190-243)||(2206086-2206139)
chr7 (2-136)||(12082840-12082973)
chr7 (19-140)||(11824619-11824739)
chr7 (2-140)||(28066164-28066301)
chr7 (1-55)||(47268828-47268882)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (23-243)||(32027677-32027896)
chr6 (23-243)||(32037736-32037955)
chr6 (1-243)||(13402452-13402693)
chr6 (1-243)||(29108059-29108300)
chr6 (1-226)||(22305715-22305939)
chr6 (24-243)||(14114979-14115197)
chr6 (1-243)||(34802945-34803186)
chr6 (1-243)||(6205403-6205644)
chr6 (1-243)||(27640099-27640340)
chr6 (18-243)||(29066489-29066713)
chr6 (18-243)||(29075502-29075726)
chr6 (1-243)||(11692370-11692611)
chr6 (13-243)||(12396707-12396936)
chr6 (18-243)||(29110473-29110698)
chr6 (1-243)||(801085-801325)
chr6 (95-243)||(35058784-35058932)
chr6 (1-112)||(3765901-3766011)
chr6 (2-140)||(20242287-20242426)
chr6 (2-140)||(22136271-22136410)
chr6 (19-140)||(28051295-28051415)
chr6 (142-243)||(30257628-30257729)
chr6 (1-99)||(35060161-35060258)
chr6 (64-140)||(2402172-2402248)
chr6 (19-96)||(19242734-19242810)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (13-243)||(1719-1948)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (13-243)||(24834-25063)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (85-243)||(17966-18123)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (11-205)||(63903-64095)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 18412510 - 18412751
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  18412510 gaagattcggcaccttggtgtcacgttaagaggtatcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagacacaagaagggtggaata 18412608  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  18412609 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttcggtggaattaatgaacgacgataacgtgaggagcatgttttgggagcac 18412708  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18412709 accatgtttcagtggatcgatatgcgtgtaacgttgctgagat 18412751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 3393219 - 3393460
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3393219 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactaaatgaa-ttcaaccaatgagtcaaccccggagacacaaggagggtggaata 3393317  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| | |||  |||||||||||    
T  3393318 cgttcgatataaacgtccaacgctcgaggatgggagattatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaggagcatgttttgggagcac 3393417  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3393418 aacatgttctagtggatcgatatgcatgtaacgttgctgagat 3393460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 49792228 - 49791987
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  49792228 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgattgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 49792130  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  49792129 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtattattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 49792030  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  49792029 aacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagat 49791987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 10312187 - 10312421
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  10312187 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctgaaggatgaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagtgtggaata 10312285  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  10312286 tgttcggtataaacatacaacactcgacgatgggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 10312385  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttg 236  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  10312386 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttg 10312421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34153580 - 34153337
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaa-atttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaat 99  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||     
T  34153580 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactggagattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaac 34153481  T
Q  100 atgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagca 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  ||||||||||    
T  34153480 acgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgatcatgttttgggagca 34153381  T
Q  200 caacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||||    
T  34153380 caacatgttccagtggatcaatatgcggatgacgttggtgagat 34153337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 11288210 - 11288451
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11288210 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaa-ttcaaccagggaatcaaccccgaagacacaaggagggtggaata 11288308  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  11288309 cgttccgtataaacgtccaacggtcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 11288408  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11288409 atcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagat 11288451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 32938194 - 32937953
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| |    
T  32938194 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccacatagacacaaggagggtggaaca 32938096  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  || ||||||||    
T  32938095 cgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttcgggagcac 32937996  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  32937995 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagat 32937953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 45939452 - 45939681
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  45939452 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccgaagacacaaggagggtggaacacgttcgatataa 45939550  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  45939551 acgttcaacgctcgacgagaggagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgataatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 45939650  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  45939651 tggatcgatatgcgagtaacgttgctgagat 45939681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 22436838 - 22437067
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22436838 ccttggtataacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 22436936  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| || || |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  22436937 acgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 22437036  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  22437037 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 22437067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26591977 - 26591736
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  26591977 gaagattcggtaccttggtgtaacgttaagaggtctcaagaatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 26591879  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||  |||||  |||||||||||    
T  26591878 cgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacatattttgggagcac 26591779  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  26591778 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctaagat 26591736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31824921 - 31824680
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| | ||||| || | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  | |  ||||||||||||||||    
T  31824921 gaaggttcggtgccttgatgtaaagttaagagctctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaactccagagatgcaaggagggtggaata 31824823  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  31824822 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 31824723  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31824722 aacatgttctagtggatcaatatgcgggtaacgttgcttagat 31824680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44560472 - 44560231
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  44560472 gaaggttcggtaccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 44560374  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||| ||||||| || |||  ||||||||||     
T  44560373 cgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacaagcatgttttgggagcaa 44560274  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||| ||  ||||||| || |||||||||||||    
T  44560273 agcatgttccagtgtattgatatgcgggtgacgttgctgagat 44560231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20779148 - 20778920
Alignment:
Q  14 cttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaa 113  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  20779148 cttggtgtaacgttaagaggtctcaaagatgaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggacacacaagaagggtggaacacgttcggtataaa 20779050  T
Q  114 cgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagt 213  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| | |    
T  20779049 cgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaat 20778950  T
Q  214 ggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||| ||||||| ||  ||||||||||||    
T  20778949 ggatcgatatgcgggtttcgttgctgagat 20778920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Original strand, 25762566 - 25762754
Alignment:
Q  55 aatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggt 154  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  25762566 aattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggt 25762665  T
Q  155 gaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25762666 ggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttctggtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 25762754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 13850664 - 13850905
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||| |||| | | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  13850664 gaaggtttggtaccttggtgtcacattaagaggtcttacggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaata 13850762  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||  ||||||  |||||  |||||||||||    
T  13850763 cgtttggtataaacgtccaacgtttgacgatgggagaatatcattcagttggatgaaattaacaaacgacgacgacgtgacgaacatgttttgggagcac 13850862  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||   ||||||| |||||  |||||| ||||||||||    
T  13850863 aacatgttaccgtggatcgatatgtatgtaacattgctgagat 13850905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 13866178 - 13866419
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||     
T  13866178 gaaggttcggtaccttggtgtcacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaactaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaatg 13866276  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| || |||||  ||||||  |||||  |||||||||||    
T  13866277 cgtttggtataaacgtccaacatttgacgatgggagaatatcattcagttggatggaattaacaaacgacgacgacgtgacgaacatgttttgggagcac 13866376  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||   ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  13866377 aacatgttaccgtggattgatatgtatgtaacgttgctgagat 13866419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 31324089 - 31324330
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  31324089 gaaggttcggtaccttggtgtcacgttaagaggtctcaaggatcaattgcatgaa-ttcaaccaagtagtcaaccccgaagacacaatgaggatggaata 31324187  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || ||||||  | |||  ||| |||||||    
T  31324188 ggttcagtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatattattcagttgggtggaattaacgaacgacaatgacgtgacgagcatgtttttggagcac 31324287  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||   ||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  31324288 aacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaaagttgctgagat 31324330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43889775 - 43889550
Alignment:
Q  17 ggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgt 116  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  43889775 ggtgtaacgttaagaggtctcaatgatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgt 43889677  T
Q  117 ccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtgga 216  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43889676 ccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacatcatgttccagtgga 43889577  T
Q  217 tcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    || ||||||| || |||||| ||||||    
T  43889576 tcgatatgcgggtgacgttgttgagat 43889550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 49424050 - 49423809
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  49424050 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggtggaaca 49423952  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||||| |||||||  | |||  | |||||||||    
T  49423951 tgttcggtataaatgtccagcgctcgacgaggggagattatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcac 49423852  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
      |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  49423851 ggcatgttcaagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 49423809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 17211194 - 17211422
Alignment:
Q  14 cttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaa 113  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17211194 cttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactaaatgaa-ttcaaccaaggagtcaacccatgagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaa 17211292  T
Q  114 cgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagt 213  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  | |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  17211293 cgtccaacgttcgacgagggaagaatatcattcatttgagtcgaattaacgaacgataaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagt 17211392  T
Q  214 ggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17211393 ggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 17211422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 51028045 - 51027818
Alignment:
Q  15 ttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaac 114  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  51028045 ttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggactcaaccccagagacacaaggagagtggaacacgttcggtataaac 51027947  T
Q  115 gtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtg 214  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  51027946 gtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtg 51027847  T
Q  215 gatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  51027846 gatcgatatgcgggtaacgttgttgagat 51027818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 957735 - 957506
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  957735 ccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagacataaggagggtggaatatgttctgtataa 957637  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    | |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  ||| |||||||| ||||||| ||    
T  957636 atgtccaacgctcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttaggagcacagcatgttccag 957537  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  957536 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 957506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 2772924 - 2773157
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| || | |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||| |    
T  2772924 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagagatctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaacccgagagacacaaggatggtggaaca 2773022  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||||    
T  2773023 cgttcgttataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcac 2773122  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgtt 235  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  2773123 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtt 2773157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20901948 - 20901719
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  20901948 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgattgaa-ttcaaccaaggagtcaaccctgaagacacaaggagggtagaacacgttcggtataa 20901850  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  20901849 acgtccaacgttcgacgagtggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttctag 20901750  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  20901749 tggatcgatatgcgggtaacactgctgagat 20901719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21017469 - 21017228
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  21017469 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 21017371  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  21017370 cgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 21017271  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  21017270 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 21017228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 51428472 - 51428243
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  51428472 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 51428374  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  51428373 acgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgtgtggagttaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 51428274  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  51428273 tggatcgatatgcgggtaacgttgttgagat 51428243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 242708 - 242467
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  242708 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 242610  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| || |||| | |||| ||| || || |||||||  | |||  |||||||||||    
T  242609 cgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagcatcattcacttaggtggagttaaagaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 242510  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  242509 atcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 242467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40354053 - 40353824
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||||||| | ||| |||||||    
T  40354053 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaa-ttcaaccaaagagtcaaccccagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataa 40353955  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  40353954 acgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccag 40353855  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  40353854 tggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 40353824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47657633 - 47657406
Alignment:
Q  15 ttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaac 114  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||  |||| || ||||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  47657633 ttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactggctgaa-ttcaaccaaggaatcaaccccagagacacaaggtgggtggaacacgttcggtataaac 47657535  T
Q  115 gtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtg 214  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||| | |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  47657534 atccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgaccaaaacgtgacgagcatattttgggagcacaacatgttccagtg 47657435  T
Q  215 gatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  47657434 gatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 47657406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 1042666 - 1042905
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||      
T  1042666 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaa-ttcaaccaagaagtcaaccccaaagacacaaggagggtggaacg 1042764  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||||    
T  1042765 cctt--gtataaacgtccaacgctagacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcac 1042862  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  1042863 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 1042905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41794854 - 41794613
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  41794854 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 41794756  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  41794755 catttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 41794656  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  41794655 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 41794613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4785714 - 4785476
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  4785714 gaaggttcggtgccttgatgtaaccttaagaggtctcaaggattaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 4785616  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||  |||||||| || |||| |||||||||| ||| | |||||||  |||||  |||||||||||    
T  4785615 cattcggtataaacgtcaaacccttgacgaggggagagcatcattcactttggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgaagaacatgttttgggagcac 4785516  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctga 240  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  4785515 aacatgttccagtggatcgatatgcggggaacgttgctga 4785476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 37866321 - 37866563
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| |    
T  37866321 gaaggttcggtggcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaacctcagagacacaagaagggtggaaca 37866419  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcattt-gggagca 199  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||  | |||  ||| |||||||    
T  37866420 cattcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacgtgatgagcatgttttcgggagca 37866519  T
Q  200 caacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  37866520 caacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 37866563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 1226087 - 1226315
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||| ||| ||||||| | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  1226087 ccttgatgtaacgttaagaagtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagttaaccccagagacaca-ggagggtggaatacgtttgctataa 1226184  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||| || ||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  1226185 acgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgtgtggaattaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctag 1226284  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1226285 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 1226315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6177607 - 6177366
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  6177607 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 6177509  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  6177508 catttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 6177409  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  6177408 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 6177366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36776811 - 36776570
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  36776811 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtcgcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggtggaaca 36776713  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  36776712 cgttaggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtattattcacttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatggtttgggagcac 36776613  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
      ||||||| |||||||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  36776612 ggcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagat 36776570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 56138825 - 56139066
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  56138825 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 56138923  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  56138924 catttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 56139023  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  56139024 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 56139066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 28082165 - 28082376
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| | ||| |||||||    
T  28082165 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataa 28082263  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||  | |||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  28082264 acgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacatcatgtttcag 28082363  T
Q  213 tggatcaatatgc 225  Q
    |||||||||||||    
T  28082364 tggatcaatatgc 28082376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34530076 - 34529847
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| || | |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| |  ||||||||||    
T  34530076 ccttggtgtaacgttaagagatctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaagaagggtggaacaccttcggtataa 34529978  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| || ||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  34529977 acgtccaacgctcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcattttttgggagcacaacatgttccag 34529878  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||    
T  34529877 tggatcgatatgcaggtgacgttgctgagat 34529847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14330983 - 14330745
Alignment:
Q  4 ggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgt 103  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| |||| | |||||| || | | |||| || ||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||| |  |    
T  14330983 ggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaaatcactgaa-ttcaaccaaggagtcaacgctagagacacaaggagggtggaacactt 14330885  T
Q  104 tcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaac 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||  | |||  ||||||||||||||    
T  14330884 tcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaac 14330785  T
Q  204 atgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14330784 atgttccaatggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 14330745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33163836 - 33163595
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  | |  | || ||| ||||||||||||    
T  33163836 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggtgtcagtctcagagacgcaatgagggtggaata 33163738  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||| ||||||| | |||| ||| ||||| || ||||  | |||  |||||||||||    
T  33163737 cgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtaacattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcac 33163638  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  33163637 aacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagat 33163595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 49817924 - 49817695
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| || |||| | || |||||||| ||||||||||||| || |||  | ||||||||   | ||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  49817924 ccttggtgtaacattaagatgtctcaaggatgaactgaatgaaatcta-ccagcgtgtcaaccctagagacacaaggagggtggaacacgttcagtataa 49817826  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| || |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |  | |||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  49817825 acgtccaacgctctacgaggggagagtaacattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgggagcacatcatgttctag 49817726  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  49817725 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 49817695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6282563 - 6282374
Alignment:
Q  54 aaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttggg 153  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | | |||| ||||||||| |||||    
T  6282563 aaattcaacaaaggagtcaaccccatagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacaaggagagagtatcattcacttggg 6282464  T
Q  154 tgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    || |||||||||||||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  6282463 tggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgctaagat 6282374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 42886178 - 42886422
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  | ||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |    
T  42886178 gaaggttcggtgctttggtgtaacgttaagaggtctcaagaatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaacccgggagacacaaggagggtggaaca 42886276  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggag---aatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggag 197  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||   | ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| |||  | |||  |||| |||    
T  42886277 cgttcgttataaacttccaacgctcgacgaggggagagtactatcattcacttgggtggaattaaccaacgacgaaaacatgacgagcatgctttgagag 42886376  T
Q  198 cacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  42886377 cacaacattttctagtggatcgatacgcgggtaacgttgctgagat 42886422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 46816815 - 46816574
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| || |||| || | |||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  46816815 gaaggttcggtgccttgatgtaacattaagagatctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaactacggagtcaaccccagagacgcaaggagggtggaata 46816717  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||| | |||||||  | |||  |||||||||||    
T  46816716 cgttcagtatacacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 46816617  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||    
T  46816616 aacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgttgagat 46816574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 49094660 - 49094901
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| || |||| || | ||||||||  ||||| |||| || ||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  49094660 gaaggttcggtgccttggtgtaacattaagagatctcaaggatacactgactgaa-ttcaaccaagtagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 49094758  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||  | |||  |||||||||||    
T  49094759 catttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 49094858  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  49094859 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 49094901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21412817 - 21412646
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  |||| |||| || |||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  21412817 gaaggttcggggccttagtgtaacattaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccacggagacacaaggagggtggaata 21412719  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgat 173  Q
     || |||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||    
T  21412718 cgtccggtataaacgtccaatgttcaacgaggggagaatatcatttagttggatggaattaacgaacgacgat 21412646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 39588856 - 39589085
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||| ||| |||| | |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |  ||| ||||||    
T  39588856 ccttggtataacgttaagaggtctcaatgatgaactaactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggtggaacaccttcagtataa 39588954  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| || ||||  | |||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  39588955 acgtccaacgctcgacggggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccag 39589054  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  39589055 tggatcgatatgcggatgacgttgctgagat 39589085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 55796738 - 55796899
Alignment:
Q  82 acacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgag 181  Q
    ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||     
T  55796738 acacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 55796837  T
Q  182 aaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
     | |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  55796838 gaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 55796899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 9489594 - 9489826
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| | |||| || ||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  9489594 gaaggttcggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatcaactaactgaa-ttcaacaaaggaatcaaccccggagacacaaggagggtggaaca 9489692  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| || ||||  | |||  ||| |||||||    
T  9489693 ccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcat-gttttggagcac 9489791  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgtt 235  Q
    | ||||||| |||||||  ||||||| || |||||    
T  9489792 agcatgttccagtggattgatatgcgggtgacgtt 9489826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 21169366 - 21169607
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| |||||||| || ||| |||| || ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  21169366 gaaggttcggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaattgactgaa-ttcaaccacggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 21169464  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||||| | || ||  ||| ||  | |||  |||||||||||    
T  21169465 cgttcgatataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtcgaattaacggacgatgaatacgcgacgagcatgttttgggagcac 21169564  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||| | |||||||| ||||||  || |||||||||||||    
T  21169565 agcatgtaccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagat 21169607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24606667 - 24606908
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||||||||||| || ||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  24606667 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagacttctcaaggatgaactgaatgaa-ttcaactaggtagtcaaccccggagacacaaggagggtggaaca 24606765  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||| ||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||  | |||   ||||||||||    
T  24606766 cgttcgatataaatgtccaacgctcgacaagcggagagtattattcagttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtattgggagcac 24606865  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | |||||||  ||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  24606866 atcatgttcccgtggattgatatgtgggtaacgttgctgagat 24606908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 49063895 - 49064135
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||| | |||| || ||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |    
T  49063895 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaa-aggtctaaaggatgaactcactgaa-ttcaacaaaggagtcaaccccagagacacaaggagagtggaaca 49063992  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||  | |||  ||| |||||||    
T  49063993 cgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtgtcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttttggagcac 49064092  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||   ||||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  49064093 aacatgtttccgtggatcgatatgcgggtgacgttgcttagat 49064135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 243
Target Start/End: Original strand, 21711549 - 21711686
Alignment:
Q  106 ggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacat 205  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||  | |||  ||||||||||||||||    
T  21711549 ggtataaacatctaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacat 21711648  T
Q  206 gttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  21711649 gttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 21711686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 243
Target Start/End: Original strand, 27759374 - 27759483
Alignment:
Q  134 gagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacg 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  27759374 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacg 27759473  T
Q  234 ttgctgagat 243  Q
    ||||||||||    
T  27759474 ttgctgagat 27759483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 23124808 - 23124727
Alignment:
Q  19 tgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  23124808 tgtcacgttaaaaggtctcaaggatcaactggatgaaa-tcaaccaaggactcaaccccggagacacaaggagggtgtaatat 23124727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Original strand, 17291869 - 17291988
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||| |||| |||||||||| ||  |||||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||| ||||     
T  17291869 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtctcaaggatcagctagatgaaatc-aaccaaggactcaacccccgagacacaaggagagtgaaatac 17291967  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacg 122  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  17291968 gtttggtatgaacgtccaacg 17291988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 55794523 - 55794596
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaacc 75  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  55794523 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaacc 55794596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 12227765 - 12227669
Alignment:
Q  19 tgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgt 116  Q
    ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||  | | | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12227765 tgtcacgttaaaaggtctgaagaatcaactgaattaaatc-aaccaaggactaaaccgtgaagatacaaggagggtggaatatgtttggtatgaacgt 12227669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 29906501 - 29906742
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||    
T  29906501 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagatgcaaggagggtggaata 29906599  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  29906600 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgtggggagagtatcattcacttgggtgaagttaaagaacgacgaaaacgtgacaaacatgttttgggagcac 29906699  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  29906700 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 29906742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 35491554 - 35491795
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  35491554 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 35491652  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  35491653 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 35491752  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  35491753 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 35491795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10364924 - 10364683
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  10364924 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 10364826  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  10364825 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 10364726  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||||||||    
T  10364725 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagat 10364683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37312782 - 37312541
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |    
T  37312782 gaaggttcggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaacccccgagacacaaggaggatggaaca 37312684  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  37312683 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagattatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 37312584  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  37312583 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 37312541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10360474 - 10360245
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  10360474 ccttggtataacgttaagaggtctcaaagatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggaaacacaaggagggtggaacacgttctgtataa 10360376  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| || || |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  10360375 acgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 10360276  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  10360275 tggatcgatatgcgggtaatgttgctgagat 10360245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27130784 - 27130555
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||  ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  27130784 ccttggtgcaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaacctcggagacacaaggagggtggaacacattcggtataa 27130686  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  27130685 acgtccaacgctcaacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 27130586  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  27130585 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 27130555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 29111090 - 29111318
Alignment:
Q  14 cttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaa 113  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |  ||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  29111090 cttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaactcgaac-agggagtcaaccccaaagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaa 29111188  T
Q  114 cgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  29111189 cgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagt 29111288  T
Q  214 ggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  29111289 ggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 29111318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 16253395 - 16253594
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  16253395 gaaggttcggcacgttggtgtcacgttaagaggtatcaaggatcaactgagtgaa-tttaaccaaggagtcaacccccgggacacaaggagggtggaata 16253493  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  16253494 cgttcggtataaacgcccaacacttaacgatgggagaatatcattaagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgagcagcatgttttgggagcac 16253593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12968577 - 12968348
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12968577 ccttgatgtaacgttaagaggtcttaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataa 12968479  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| ||||| |  | |||  |||||||||||||||||||| |     
T  12968478 acgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgggagcacaacatgttccat 12968379  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12968378 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 12968348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19471921 - 19471680
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  19471921 gaaggttcggtgcctttgtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgact-aaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 19471823  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  19471822 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 19471723  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  19471722 agcatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagat 19471680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 20148037 - 20148278
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||| | ||||||| |||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  20148037 gaaggttcggtgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggtgaaata 20148135  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| | |||||| ||| ||||| ||| |||  | |||  ||| |||||||    
T  20148136 tgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcatttagttggggggaattaaagaacgacgaaaacatgactagcatgttttaggagcac 20148235  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20148236 aacatgttccagtagatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 20148278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 6976769 - 6976996
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || || |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6976769 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaacaaggagtcaactccagagacacaaggagggtggaacatgttcggtataa 6976867  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  6976868 acgtccaacgctcgacga--ggagtgtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccag 6976965  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  6976966 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 6976996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 6901885 - 6902126
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  || |||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||| | | ||||||||||| | ||||||||||||| ||| |    
T  6901885 gaaggttcggtgccatggtgtaacgctaagaggtctcaaggatgaactgaatgaa-ttcaactaggaagtcaaccccggagacacaaggagggttgaaca 6901983  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  6901984 cattcggcataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 6902083  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  6902084 aacatgttccagtgaatcgatatgcgagtaacgttgttgagat 6902126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 29067649 - 29067889
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  29067649 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaag-agtcaaccccaaagacacaaggatggtggaaca 29067746  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||  | |||  |||||||||||    
T  29067747 cgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtgcaattaacgaatgacgaaaatgtgacgaccatgttttgggagcac 29067846  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  29067847 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 29067889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34521970 - 34521730
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||| |||| | |||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| || |    
T  34521970 gaaggttcggcgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactaactgaa-ttcaaccaaggagtcaacccag-agacacaaggagggtgaaaca 34521873  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  34521872 cgttcggtataaacgtcaaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 34521773  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  34521772 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagat 34521730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 39393810 - 39394051
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| || |    
T  39393810 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaagtctcaaggatcaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaacctcagagacacaaggagggtgtaaca 39393908  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||| ||| || ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  39393909 ccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaatcaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 39394008  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  39394009 aacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 39394051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 240
Target Start/End: Original strand, 5420400 - 5420626
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    |||||||||  |||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  5420400 ccttggtgtatcgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaatgagtcaaccccggagacacaaggagggtggaacacgttcgatataa 5420498  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||  |||| ||||||| ||||||| |     
T  5420499 acgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgtgagcacagcatgttccaa 5420598  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctga 240  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  5420599 tggatcgatatgcgggtgacgttgctga 5420626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 3941668 - 3941897
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| |  ||| ||||||    
T  3941668 ccttggtttaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaa-ttcaaccaagaagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacaccttcagtataa 3941766  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  3941767 acgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccag 3941866  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  3941867 tggatcgatatgcgggtgacgttgatgagat 3941897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 22493190 - 22493431
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  22493190 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaagatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaggagggtggaata 22493288  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| | ||| |||||||  | |||  |||||||| ||    
T  22493289 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacggcgaaaacgtgacgagcatgttttgggagtac 22493388  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |  |||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  22493389 agaatgttccagtggattgatatgcgggtaacgttcctgagat 22493431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39800129 - 39799905
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  39800129 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggtggaaca 39800031  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |  | |||  |||||||||||    
T  39800030 cgtttggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgggagcac 39799931  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcg 226  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||    
T  39799930 agcatgttccagtggatcgatatgcg 39799905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17796391 - 17796153
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |    
T  17796391 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaa-ttcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaaca 17796293  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||  |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||      
T  17796292 cgttaagtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagc-- 17796195  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
     |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17796194 -acatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 17796153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3937351 - 3937110
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  3937351 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 3937253  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  3937252 catttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 3937153  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  3937152 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 3937110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Original strand, 17424709 - 17424949
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||| |     
T  17424709 aaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggatggtggaacac 17424807  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcaca 201  Q
     || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  ||||||||||||    
T  17424808 atttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcaca 17424907  T
Q  202 acatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  17424908 acatgttctagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 17424949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2919650 - 2919411
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| | |||| || |||||||||||| |||    | ||||||||||||||||| |    
T  2919650 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactaactgaa-ttcaaccaaggagtctaccag--agacacaaggagggtggaaca 2919554  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  2919553 cgttctgtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 2919454  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  2919453 aacatgttacagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 2919411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 243
Target Start/End: Original strand, 33404000 - 33404175
Alignment:
Q  68 agtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaat 167  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| ||| ||| ||||||||||     
T  33404000 agtcaaccccgaagacacaaagagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaatagtatcattcagttgtgtggaattaacgaac 33404099  T
Q  168 gacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||| |||||||  | |||  ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  33404100 gacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaagatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 33404175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 42119943 - 42120172
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42119943 ccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactggatgag-ttcaaccaaggagtcaaccccagagatgcaaggagggtggaatacgttcggtataa 42120041  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | | |||| ||| ||||| || ||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  42120042 atgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 42120141  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  42120142 tggattgatatgtgggtaacgttgctgagat 42120172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 43982775 - 43983016
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||| || ||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  43982775 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaa-ttcaaccatggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 43982873  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  43982874 catttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 43982973  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  43982974 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 43983016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 32734588 - 32734800
Alignment:
Q  23 acgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacg 122  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  32734588 acgttaagaggtctcaaagatcaactgaatgaa-ttcaaccaatgagtcaaccccagagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgttcaacg 32734686  T
Q  123 ctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaata 222  Q
    |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| | |||| |||  |||| || |||| || |||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  32734687 ctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaactacgaaaatgtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttacagtggatcgata 32734786  T
Q  223 tgcgtgtaacgttg 236  Q
    |||| |||||||||    
T  32734787 tgcgggtaacgttg 32734800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42241386 - 42241145
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||||| |||| | |||||| |||| | |||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |    
T  42241386 gaaggttcggtgccttagtgtaacgttaagaggtctaaaggataaactcactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtgaaaca 42241288  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||  |||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  42241287 cattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 42241188  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  42241187 aacatgtttcagttgatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 42241145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 16581741 - 16581984
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| || |||| |||| | |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  16581741 gaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctgaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 16581839  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| || |||   | |||  |||||||||||    
T  16581840 cgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaatgtgtcgagcatgttttgggagcac 16581939  T
Q  201 aacatgttcaagtggatc--aatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| | ||||||   ||||||| || |||||||||||||    
T  16581940 atcatgttccattggatcgagatatgcgggtgacgttgctgagat 16581984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41499297 - 41499140
Alignment:
Q  86 aaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaac 185  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  |||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |    
T  41499297 aaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagc 41499198  T
Q  186 atcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||    
T  41499197 atgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagat 41499140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 34638885 - 34639091
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  | ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |    
T  34638885 gaaggttcggtgcattggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaacttactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagg-tggaaca 34638982  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  34638983 ccttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 34639082  T
Q  201 aacatgttc 209  Q
    | |||||||    
T  34639083 agcatgttc 34639091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 31770282 - 31770427
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||| || || |||||||| || |||||||||| |||||||  | ||||||||||| || ||||    
T  31770282 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaagaatgaaatgaatgaa-ttcaaccaaggagccaaccccatagacacaaggaggatgtaata 31770380  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattca 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  31770381 tgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagagtatcattca 31770427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40678902 - 40678767
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||      
T  40678902 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacg 40678804  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggaga 137  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40678803 cgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggaga 40678767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 22001833 - 22001994
Alignment:
Q  82 acacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgag 181  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| |||||||     
T  22001833 acacaaggatggtagaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggaggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 22001932  T
Q  182 aaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
     | |||  ||||||||| || ||||||| | |||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  22001933 gaccatgttttgggagctcagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 22001994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 18392032 - 18392179
Alignment:
Q  82 acacaaggagggtggaata----tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacg 177  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||| | |||| ||| ||||| ||||    
T  18392032 acacaaggagggtggaatacgttcgttcggtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcatttacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 18392131  T
Q  178 tgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgc 225  Q
    |||  | |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  18392132 tgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgc 18392179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 31992214 - 31992094
Alignment:
Q  19 tgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtcc 118  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||  || ||||| |||||||    
T  31992214 tgtcacgttaaaaggtctcaaggatcaactagatgaaatc-aaccaaggactcaaccccggagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtcc 31992116  T
Q  119 aacgctcgacgatgggagaata 140  Q
    || | | ||||| |||||||||    
T  31992115 aatgttggacgacgggagaata 31992094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 140
Target Start/End: Original strand, 11718688 - 11718802
Alignment:
Q  25 gttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgct 124  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| || |    
T  11718688 gttaaaaggtctcaatgatcaactgcatgaaatc-aaccatggactcaaccccggagacacaaggagggtggaatacatttggtatgaacgtccagcgtt 11718786  T
Q  125 cgacgatgggagaata 140  Q
     |||||||||||||||    
T  11718787 ggacgatgggagaata 11718802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26617771 - 26617635
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||  |||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||||     
T  26617771 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtctcaaggattaactaaatgaaatc-aaccaatgactcaactccagagacacaaggagggtggaatac 26617673  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaata 140  Q
    ||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  26617672 gtttggtatgaacgtccaacg-ttgacgaggggagaata 26617635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18036437 - 18036317
Alignment:
Q  19 tgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtcc 118  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||  || ||||| || ||||    
T  18036437 tgtcatgttaaaaggtctcaaggatcaactggatgaaattca-ccaaggactcaaccccgaagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaatgtcc 18036339  T
Q  119 aacgctcgacgatgggagaata 140  Q
    |||| | |||||  ||||||||    
T  18036338 aacgtttgacgacaggagaata 18036317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 18878441 - 18878561
Alignment:
Q  19 tgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtcc 118  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||    
T  18878441 tgtcacgttaaaaggtcttaaggatcaactagatgaaatc-aaccaaggactcaaccccggagacacaaggaggggggaatacatttggtatgaacgtcc 18878539  T
Q  119 aacgctcgacgatgggagaata 140  Q
    |||| | |||||  ||||||||    
T  18878540 aacgttggacgacaggagaata 18878561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11679327 - 11679247
Alignment:
Q  60 aaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaata 140  Q
    ||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11679327 aaccatggactcaaccccggagacacaaggagggtggaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacgatgggagaata 11679247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40677525 - 40677421
Alignment:
Q  139 tatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgct 238  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  40677525 tatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcacgacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgct 40677426  T
Q  239 gagat 243  Q
    |||||    
T  40677425 gagat 40677421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 16706886 - 16706959
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaacc 75  Q
    ||||||||||  ||||||| | ||||||| |||| |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  16706886 gaaggttcggtgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatgaacttaatgaa-ttcaaccaaggagtcaacc 16706959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 27650722 - 27650603
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||  ||| |||| |||||||||  ||||||  ||||||||| |||| |||| | |||||| ||||||| ||||     
T  27650722 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaatggtctcaatgatcaactgggtgaaatc-aaccaaggattcaatcccggagacacaaagagggtgaaatac 27650624  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacg 122  Q
     || ||||| |||||||||||    
T  27650623 atttggtatgaacgtccaacg 27650603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 34614890 - 34615119
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34614890 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 34614988  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  34614989 acgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatgatccag 34615088  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  34615089 tggattgatatgcgggtaacgttgctgagat 34615119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33799840 - 33799599
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||||||    
T  33799840 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaatcccatagatgcaaggagggtggaata 33799742  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  33799741 tgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 33799642  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  33799641 aacatgttccagtggatcgatatgcggataacgttgctgagat 33799599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 38034202 - 38033973
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  38034202 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaaatc-aaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 38034104  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||| |||||||| |||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  38034103 acgttcaacgctctacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctag 38034004  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38034003 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 38033973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28706431 - 28706190
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  28706431 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaaaaggtcccaaggatcaactaaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaggagggtggaata 28706333  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||  |||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  28706332 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgagtggagttaaagaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 28706233  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28706232 aacatgttttagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagat 28706190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31172105 - 31171864
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31172105 gaaggttcggtaccttggtgtcacattaaaaggtctcaaggatcaacttaatgaa-ttcaactaaggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaata 31172007  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||  || ||| ||||||  ||  | |||||    
T  31172006 cgttcggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgacgacatgacaaacatttttcagaagcac 31171907  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||   ||||||| ||||| | || |||||||||||||    
T  31171906 agcatgttaccgtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagat 31171864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 41363593 - 41363822
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  41363593 ccttggagtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaacacgttcggtatac 41363691  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  41363692 acgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 41363791  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  41363792 tggatcgatatgcgggttacgttgctgagat 41363822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 26452250 - 26452491
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  26452250 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagagatctcaaggatcaactgactgaa-ttcaaccaagaattcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 26452348  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  26452349 ccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 26452448  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  26452449 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 26452491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 26484514 - 26484743
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| || | | |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26484514 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaattaactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 26484612  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  26484613 acgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccag 26484712  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  26484713 tggatcgatatgcgcataacattgctgagat 26484743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 43693074 - 43693303
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| || |||| |||| | |||||| |||| | |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  43693074 ccttggtgtaacattaagaggtctaaaggatgaactcactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 43693172  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  43693173 acgtccaacgctcggcgaggggaggatatcattcatttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 43693272  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  43693273 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 43693303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44943369 - 44943129
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||| || ||| |||| || ||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||| || |    
T  44943369 gaaggttcggcgccttggtgtaacgttaa-aggtctcaaggatgaattgactgaa-ttcaaccaaggagttaaccccagagacacaaggatggtgtaaca 44943272  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  44943271 cgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 44943172  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  44943171 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 44943129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 42603379 - 42603617
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| |    
T  42603379 gaaggttcggtgccttggtgtgacgttaaaaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagggcggaaca 42603477  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  42603478 cgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 42603577  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctga 240  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  42603578 atcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctga 42603617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15032601 - 15032372
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| | ||| |||||||    
T  15032601 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgattgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaagtatggtggaacacgtttggtataa 15032503  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  15032502 acgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 15032403  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  15032402 tggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 15032372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18440584 - 18440343
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| | || |||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  18440584 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagatgtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaatcaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 18440486  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || |||||||  | |||  ||| |||||||    
T  18440485 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttaggagcac 18440386  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||    
T  18440385 aacatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagat 18440343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 40702285 - 40702526
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||| |||||| |||||| |    
T  40702285 gaaggttcggtgccttggtgtgacgttaaaaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagagtggaaca 40702383  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  ||||||| ||     
T  40702384 cgttcagtataaacgtccaacgttcgacgaagggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggaacaa 40702483  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  40702484 aacatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagat 40702526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41857251 - 41857022
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  41857251 ccttggtgtgacgttaagaggtcttaaggatgaactgactgaa-ttcaatcaaggagtcaaccccagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataa 41857153  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  41857152 acgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatattttgggagcacaacatgttccag 41857053  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  41857052 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 41857022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43638955 - 43638725
Alignment:
Q  11 caccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtat 110  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||  |  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  43638955 caccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggactcaaccccagag-cgcaaggagggtggaatacgttcggtat 43638858  T
Q  111 aaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttca 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| | |||| ||| ||||| || ||||  | |||  ||||||||||||||||||||     
T  43638857 aaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatccttcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcc 43638758  T
Q  211 agtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  43638757 agtgcatcgatatgcgcgtaacgttgctgagat 43638725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 2416840 - 2417081
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  2416840 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaa-ttcaaccaagaagtcaaccccagaaacacaaggagggtggaaca 2416938  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      |||||||||||||||||||  ||||| | |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  2416939 ccttcggtataaacgtccaacattcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 2417038  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||  || |||||| ||||||    
T  2417039 aacatgttccagttgatcgatatgcaggtgacgttgatgagat 2417081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 16575617 - 16575851
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  16575617 gaaggttcggtaccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggacgaactgaatgaa-ttcaaccagggagtcaacctcgaagacacaaggagggtggaata 16575715  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||| ||  | |||  ||||||| |||    
T  16575716 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtttcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgggatgagcatgttttgggaccac 16575815  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttg 236  Q
    ||||||||| |||| ||| ||| ||| |||| ||||    
T  16575816 aacatgttccagtgcatcgatacgcgcgtaatgttg 16575851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19242439 - 19242210
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19242439 cctttgtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaacccgagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 19242341  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| | |||||||  | |||  |||||||  ||||||||||| ||    
T  19242340 acgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgggaatacaacatgttccag 19242241  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  19242240 tggatcgatatgcgggtgacgttgctaagat 19242210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19315623 - 19315394
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19315623 cctttgtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaacccgagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 19315525  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| | |||||||  | |||  |||||||  ||||||||||| ||    
T  19315524 acgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgggaatacaacatgttccag 19315425  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  19315424 tggatcgatatgcgggtgacgttgctaagat 19315394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42169237 - 42169008
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| |||||||| |||  | |||| || ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  42169237 ccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaccaactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagacacgaggagggtggaacgcgttcggtataa 42169139  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||  |||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  42169138 acgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcccttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 42169039  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  42169038 tggatcgatatgcgggtaacgttgcagagat 42169008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Original strand, 24861269 - 24861509
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    |||||||||  ||| | ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |     
T  24861269 aaggttcggtgcctggatgtaacgttaagaggtatcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggagggtggaacac 24861367  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcaca 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| || ||||  | |||  ||||||||||||    
T  24861368 cttcggtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcaca 24861467  T
Q  202 acatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| || | |||||||||||    
T  24861468 acatgttcaattggattgatatgcgggtgatgttgctgagat 24861509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 41275331 - 41275560
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  41275331 ccttggtgtaaagttaagaggtcttaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataa 41275429  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||  | |||  |||| ||||||||||||||| |     
T  41275430 acgtcaaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgagagcacaacatgttccaa 41275529  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  41275530 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 41275560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 485547 - 485323
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||| || |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  485547 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaa-ttcaaccaaggagccaaccccagagacacaaggatggtggaaca 485449  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  485448 catttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 485349  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcg 226  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||    
T  485348 agcatgttctagtggatcgatatgcg 485323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Original strand, 40415235 - 40415423
Alignment:
Q  55 aatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggt 154  Q
    |||| ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  40415235 aattcaaccaaggagtcagcaccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggt 40415334  T
Q  155 gaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | |||||| ||| ||||| |||||||  | |||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  || |||||| ||||||    
T  40415335 ggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcccgtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagat 40415423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3589475 - 3589314
Alignment:
Q  82 acacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgag 181  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | | | |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||     
T  3589475 acacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtcaaacgattgtctatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgataacgtgat 3589376  T
Q  182 aaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
       |||  ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  3589375 gggcatgttttgggagcacaggatgttccagtggatcgatatgcgtgtaacattgttgagat 3589314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Original strand, 22548200 - 22548366
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| | || |||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  22548200 ccttggtgtaacgttaagatgtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaactaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacacattcgatataa 22548298  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtga 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  22548299 acgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaacgtga 22548366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Original strand, 40414589 - 40414776
Alignment:
Q  55 aatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggt 154  Q
    |||| |||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  40414589 aattcaaccaaagagtcaacccag-agacacaaggaaggtggaacacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggt 40414687  T
Q  155 gaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | |||||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||| || |||||||||||||    
T  40414688 ggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagttgattgatatgcgggtgacgttgctgagat 40414776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22843575 - 22843474
Alignment:
Q  38 aaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggaga 137  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  22843575 aaggatcaactagatgaaatc-aaccaatgacttaaccccgaaaacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccatcgtttgacgatgggaga 22843477  T
Q  138 ata 140  Q
    |||    
T  22843476 ata 22843474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12505012 - 12504875
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    ||||||||| || ||  ||||| ||||| |||| |||| |||||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  12505012 aaggttcggtacattaatgtcatgttaaaaggtctcaatgatcaactaaatgaaatc-aacgaagaactcaaccccagagacacaaggagggtggaatac 12504914  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaata 140  Q
    ||| ||||| || ||||| ||  ||| ||||||||||||    
T  12504913 gtttggtatgaatgtccatcgtacgatgatgggagaata 12504875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 6754145 - 6754374
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6754145 ccttggtgtaacgttaagaggtatcaaggatgaactgaatgaa-ttcaactaaggagtcaaccccggagacacaaagagggtggaatacgttcggtataa 6754243  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||| ||||||||||| ||    
T  6754244 acgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgatcatgttttgggagtacaacatgttctag 6754343  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6754344 ttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 6754374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6464623 - 6464394
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  6464623 ccttggtgtaacgttaagaggtatcaaagatgaactgaatgaa-ttcaactaaggagtcaaccccggtgacacaaagagggtggaatacgtttggtataa 6464525  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| || |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  6464524 acgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacaatcatgttttgggagcacaacatgttccag 6464425  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  6464424 tggatcgatatgtgggtaacgttgctgagat 6464394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39417238 - 39416997
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||     
T  39417238 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaacctcaaagacacaaggagggtggaatt 39417140  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  39417139 agttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgagcatgttttgggagcac 39417040  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39417039 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 39416997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 51015206 - 51015447
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |    
T  51015206 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcgaccccaaagacacaaggagggtggaaca 51015304  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||||    
T  51015305 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagtgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcac 51015404  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  51015405 aacatgttccagtggatcgatatgcgggaaacgttgctgagat 51015447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 44927405 - 44927633
Alignment:
Q  14 cttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaa 113  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  44927405 cttggtttaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaa 44927503  T
Q  114 cgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  44927504 cgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagt 44927603  T
Q  214 ggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  44927604 ggatcgatatgcgggtgacgttgttgagat 44927633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 2428416 - 2428657
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |    
T  2428416 gaaggttcggtgacttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagggtggaaca 2428514  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||||    
T  2428515 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcac 2428614  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  2428615 aacattttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 2428657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 46414624 - 46414383
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  46414624 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 46414526  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  46414525 cgttcggtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 46414426  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  46414425 aacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 46414383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 43569839 - 43570080
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |    
T  43569839 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagggtggaaca 43569937  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  43569938 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaactaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 43570037  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  43570038 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 43570080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34472354 - 34472125
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  34472354 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaacctcaaagacacaaggagggtggaacacattcggtataa 34472256  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  34472255 acgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 34472156  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  34472155 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 34472125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 49219026 - 49218785
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  49219026 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggagggtggaaca 49218928  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | ||| |||||||  |||||  ||||||||| |    
T  49218927 cctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacaaacggcgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcgc 49218828  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  49218827 aacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagat 49218785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24702560 - 24702321
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |     
T  24702560 aaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaagatgaactgactgaa-ttgaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggtggaacac 24702462  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||   ||||  ||||||||||||    
T  24702461 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaatt-acgaacgacgaaaacgtgacggacatgttttgggagcaca 24702363  T
Q  202 acatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  || |||||| ||||||    
T  24702362 acatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagat 24702321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13896160 - 13895919
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  13896160 gaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaatgagtcaaccctagagacacaaggagggtggaaca 13896062  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  13896061 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 13895962  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  13895961 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 13895919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48087842 - 48087601
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||     
T  48087842 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaaacgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggtggaatt 48087744  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| | |||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  48087743 agttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 48087644  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48087643 aacatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 48087601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 51013568 - 51013327
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  51013568 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaatgatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 51013470  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  ||||||| |||    
T  51013469 cgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggaacac 51013370  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  51013369 aacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagat 51013327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 27186890 - 27187118
Alignment:
Q  14 cttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaa 113  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  27186890 cttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaatacgtttagtataaa 27186988  T
Q  114 cgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagt 213  Q
     |||||| |||||  || |||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||  |||||  |||||||||||||||||||| | |    
T  27186989 tgtccaatgctcgtagaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccatt 27187088  T
Q  214 ggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27187089 ggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 27187118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34647544 - 34647316
Alignment:
Q  14 cttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaa 113  Q
    |||||||| ||||||| || | |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  34647544 cttggtgtaacgttaagagatctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaacccccgagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaa 34647446  T
Q  114 cgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  || ||||||||||||||||| |||    
T  34647445 cgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttcgggagcacaacatgttccagt 34647346  T
Q  214 ggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||    
T  34647345 ggattgatatgcgggtgacgttgctgagat 34647316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 30192467 - 30192708
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| |  |||| |||| ||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  30192467 gaaggttcggtgccttggtgtaattttaagaggtctcaagtatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 30192565  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||   | |||  |||||||| ||    
T  30192566 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgtctagcatgttttgggagtac 30192665  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  30192666 atcatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 30192708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 41803844 - 41804072
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  41803844 ccttggtgtgacgttaa-aggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacaaaaggagggtggaacacgttcggtataa 41803941  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  41803942 acgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 41804041  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||| | || |||||| ||||||    
T  41804042 tggatcgatatgagagtgacgttgatgagat 41804072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 42382200 - 42382441
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||| ||    
T  42382200 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagtggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacgtaaggagggtggacta 42382298  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  42382299 cgttcagtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 42382398  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42382399 atcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 42382441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 42382980 - 42383221
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||| ||    
T  42382980 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacgtaaggagggtggacta 42383078  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  42383079 cgttcagtataaacttccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 42383178  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42383179 atcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 42383221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 47065628 - 47065857
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||| ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  47065628 ccttgatgtaacattaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaactccagagacacaaggagggtggaatacgttcagtataa 47065726  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| || || || ||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  47065727 acgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgaggaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctag 47065826  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  47065827 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 47065857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47760181 - 47759940
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  47760181 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaatgatgaactgatt-aaattcaaccaagaagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 47760083  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| |||    
T  47760082 cgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacaaacatgttttgggaacac 47759983  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| || | || || |||||||||||||    
T  47759982 agcatgttccagtggatcgatgtacgggtgacgttgctgagat 47759940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 49610418 - 49610659
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  49610418 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 49610516  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  49610517 ccttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 49610616  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |  |||||| ||||| || ||||||| || |||||||||||||    
T  49610617 agtatgttccagtgggtcgatatgcgggtgacgttgctgagat 49610659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 51695896 - 51695655
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  51695896 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 51695798  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| || | | | ||||||| ||||||| ||||||| || |||||  ||||||  | |||  |||||||||||    
T  51695797 ccttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaaaagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaatacgtgacgagcatgttttgggagcac 51695698  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  51695697 atcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 51695655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3495319 - 3495095
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| | | ||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  3495319 gaaggttcggtaccttggtgtaacgttaaaaggtctcaaggataaactaact-aaattcaaccaatgagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 3495221  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  3495220 cgtttgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 3495121  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcg 226  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||    
T  3495120 aacatgttccagtggatcgatatgcg 3495095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 14265337 - 14265575
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||    
T  14265337 gaaggttcggtaccttggtgtcatgttaagtggtcttaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggaaggtggaata 14265435  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||   ||||||  |||||  ||||||| |||    
T  14265436 cgttcggtataaacatccaacgttcgacgatgggtgaatatcattcagttggatgaaattaaggaacgacg---acgtgacgaacatgttttgggaccac 14265532  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||   ||||||| || || |||||||||| |||||||    
T  14265533 aacatgttaccgtggatcgatttgtgtgtaacgttactgagat 14265575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33449417 - 33449206
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  33449417 ccttggtgtaacgttaaaaggtctcaaagatcaactgaatgaa-tccaatcaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggtgaaatacgttcgatataa 33449319  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  33449318 acgtcaaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacatcatgttccag 33449219  T
Q  213 tggatcaatatgc 225  Q
    |||||| ||||||    
T  33449218 tggatcgatatgc 33449206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20376090 - 20375931
Alignment:
Q  84 acaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaa 183  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |    
T  20376090 acaaggaagatggaatatgttcggtataaacgtctaatgctcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgagga 20375991  T
Q  184 acatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
      ||  |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20375990 gtatgttttgagagcacaacatgttcaagtagatcgatatgcgtgtaacgttgctgagat 20375931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2647166 - 2646925
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| | || |||||||| |||||| |||| || ||| || |||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  2647166 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagatgtctcaaggataaactgactgaa-ttcaacgaaagagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 2647068  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  2647067 cgtttggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 2646968  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  2646967 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 2646925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34693579 - 34693339
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||  | | ||||||||||||||||| |    
T  34693579 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-tttaaccaaggagttaaccttg-agacacaaggagggtggaaca 34693482  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  34693481 ccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagggttgagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 34693382  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  34693381 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 34693339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 41577918 - 41578076
Alignment:
Q  85 caaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaa 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |     
T  41577918 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgag 41578017  T
Q  185 catcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  41578018 catgttttgggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcgagtgacgttgctgagat 41578076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42950310 - 42950069
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  | || |||| |||||||||||    
T  42950310 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaatgatcaactgaatgaa-ttcaaccaatgagtcaaccccagagacgcaagaagggtggaata 42950212  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||| || | |||| ||||||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  42950211 cgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagggaagagtatcattcacttggatggagttaaagaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 42950112  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  42950111 aacatgttccagtggatcgatatgcggtttacgttgctgagat 42950069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 49273328 - 49273569
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  49273328 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggaatcaaccctagagacacaaggagggtggaaca 49273426  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||  | |||  | |||||||||    
T  49273427 cattcggtataaacgtccaacgctcgacgagggcagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcac 49273526  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  49273527 aacatgttccagttgatcaatatgtgggtgacgttgctgagat 49273569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 53826986 - 53826745
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| | | ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  53826986 gaaggttcggtgccttgatttaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaggagggtggaata 53826888  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  | |||| ||| ||||| || ||||  | |||  |||||||||||    
T  53826887 cgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaatgtgatgagcatgttttgggagcac 53826788  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53826787 aacatgttccaatggatcgatatgcatgtaacgttgctgagat 53826745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 774616 - 774387
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||| | |||||    
T  774616 ccttggtgtaacgctaagaggtctcaatgatcaacttgatgaa-ttcaaccaagtagtcaaccccggagacacgaggagagtggaatgtgtttgctataa 774518  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||| || || |||||||  |||||  ||| |||||||  ||||||| ||    
T  774517 acgtccaacgctcgacgacgggagaatatcattcagttggatggaattaacgaacgatgaaaacgtgaagaacatgttttcggagcactgcatgttccag 774418  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  774417 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 774387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8633636 - 8633415
Alignment:
Q  14 cttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaa 113  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8633636 cttggtgtaacgttaagaggtctcatggatgaactgaatgaa-ttcaaccaaggagttaacacaggagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaa 8633538  T
Q  114 cgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagt 213  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  || ||  |||||||  ||||| ||||| |||    
T  8633537 catccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaatattttttgggatgacaacgtgttccagt 8633438  T
Q  214 ggatcaatatgcgtgtaacgttg 236  Q
    ||||| ||||||| |||||||||    
T  8633437 ggatcgatatgcgggtaacgttg 8633415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 45100755 - 45100514
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||| |||  || |||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |    
T  45100755 gaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtcttaaggatgaactgactgat-ttcaaccaaggagtcaatcccatagacacaaggagggtggaaca 45100657  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||| | || ||||  | |||  |||||||||||    
T  45100656 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaatgtgacgagcatgttttgggagcac 45100557  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  45100556 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 45100514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 49140344 - 49140103
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  49140344 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 49140246  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  49140245 catttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 49140146  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  49140145 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 49140103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 54390371 - 54390612
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  54390371 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 54390469  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  54390470 catttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 54390569  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  54390570 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 54390612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Original strand, 46402933 - 46403173
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |     
T  46402933 aaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaacac 46403031  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcaca 201  Q
     || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  ||||||||||||    
T  46403032 atttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcaca 46403131  T
Q  202 acatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  46403132 gcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 46403173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25576846 - 25576641
Alignment:
Q  36 tcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggga 135  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25576846 tcaaggatcaactgaatgaa-ttcaactaaggattcaaccccagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacatccaacgctcgacgagggga 25576748  T
Q  136 gaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgtt 235  Q
    || ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  25576747 gattatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttcca-tggatcgatatgcgggtaacgtt 25576649  T
Q  236 gctgagat 243  Q
    ||||||||    
T  25576648 gctgagat 25576641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2268784 - 2268543
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  2268784 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtcttaaggatgaactgattgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggtggaaca 2268686  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||||| |||||||    |||  |||||||||||    
T  2268685 agtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgggcatgttttgggagcac 2268586  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| ||| |||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  2268585 atcatgttccagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 2268543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4004377 - 4004136
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  4004377 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 4004279  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| | |||||||  | |||  |||||||||||    
T  4004278 cgtttggtataaacattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacgtgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 4004179  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  4004178 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 4004136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19453519 - 19453278
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||| || | ||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | | | ||||||||||||| |    
T  19453519 gaaggttaggtaacttagtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagatagaaggagggtggaaca 19453421  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  | |||||||||    
T  19453420 cgttcgatataaacgtccaatgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttatgggagcac 19453321  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  19453320 aacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 19453278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 15636953 - 15637113
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| | || ||  ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  15636953 gaaggttcgacaccttcgtgtcacatttagaggtatcaaggatcaactgaatgga-ttcaagaaagtagtcaaccccatagacacaaggagggtggaata 15637051  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaa 162  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15637052 cgttcggtataaacgtccaacactcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaa 15637113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 14631386 - 14631615
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14631386 ccttgttgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaacctcagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 14631484  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||  | |||  |||||||||| ||||||||| ||    
T  14631485 acgtccaacgctcgacgagtaaagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcaaaacatgttccag 14631584  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||  ||||||| || |||||| ||||||    
T  14631585 tggattgatatgcgggtgacgttgttgagat 14631615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 34049656 - 34049897
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| || |||| |||| ||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  34049656 gaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatacactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 34049754  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  34049755 catttggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 34049854  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  34049855 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 34049897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 37281381 - 37281622
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||||   | ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||| |    
T  37281381 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcgct-aaattcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggatgatggaaca 37281479  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  37281480 cgttcggtataaacgtccaacactcgacgagggtagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 37281579  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  37281580 aacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 37281622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Original strand, 43477039 - 43477227
Alignment:
Q  55 aatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggt 154  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||    
T  43477039 aattcaaccaagaagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggt 43477138  T
Q  155 gaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  || |||||| ||||||    
T  43477139 ggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgatgagat 43477227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10053547 - 10053323
Alignment:
Q  15 ttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaac 114  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||     | |||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  10053547 ttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactggctgaa-ttcaaccaaggagtaaacttgagagacacaaggagggtggaatacattcggtataaat 10053449  T
Q  115 gtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtg 214  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||   |||||||| ||||    
T  10053448 gtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgatgagcatgttttgggagc---acatgttccagtg 10053352  T
Q  215 gatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  10053351 gatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 10053323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 7954144 - 7954374
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||| || ||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7954144 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggaagaactgaatgaa-ttcaactaggtagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatacgttcggcataa 7954242  T
Q  113 acgtccaacgctcgacga-tgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaa 211  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||  ||||||| | ||||||| ||||||| || ||||| || ||||  | |||  |||||||||||||||||||| |    
T  7954243 acgtccaacactcgatgagggggagggtatcatttagttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcca 7954342  T
Q  212 gtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||    
T  7954343 gtggatcgatatgcgggtaaagttgctaagat 7954374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 36134937 - 36135177
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| || | || |||||| ||||||||||   | ||||||||| ||||||| |    
T  36134937 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgga-ttcaaccaatgagtcaaccctagagacacaaggatggtggaaca 36135035  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  36135036 cgtttggtataaacgtccaacgctcgacgagggga-agtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 36135134  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||  ||| |||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  36135135 atcatgtttcagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 36135177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44835777 - 44835536
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||   | || ||||||||||||||||    
T  44835777 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtcttaaggatcaactaaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccctagagacgcaaggagggtggaata 44835679  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  | |||  ||||||||||     
T  44835678 cgttcgatataaacattcaacgttcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcat 44835579  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |  |||||| |||||||  ||||||| |||| |||| ||||||    
T  44835578 agaatgttccagtggatggatatgcgggtaaggttgttgagat 44835536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 52569698 - 52569458
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| | |||| || ||||||||||||| ||||  | ||| ||||| ||||||| |    
T  52569698 gaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactaactgaa-ttcaaccaaggagtcagccccagagacaaaaggatggtggaaca 52569600  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| || ||||  | |||  |||||||||||    
T  52569599 cattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcgcttgggtggaattaacgaacgacga-aaagtgacgagcatgttttgggagcac 52569501  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||||| || || ||||||||||    
T  52569500 aacatgttccggtgaatcgatatgcgggtgacattgctgagat 52569458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 55207090 - 55206933
Alignment:
Q  86 aaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaac 185  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||  | |    
T  55207090 aaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagc 55206991  T
Q  186 atcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  55206990 atgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 55206933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 7246035 - 7246264
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||| | |||| || ||||||||| |||||| |  | ||||||| || |||||| |  ||||||||||    
T  7246035 ccttggtgtaacgttaagaggtttgaaggatgaactaactgaa-ttcaaccaaggattcaacctcatagacacaagaagagtggaacacattcggtataa 7246133  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||  | ||||||||| ||    
T  7246134 acgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggattataacatgttccag 7246233  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    || ||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  7246234 tgtatcgatatgcgggtgacgttgcttagat 7246264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36721615 - 36721438
Alignment:
Q  66 ggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacga 165  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||  || ||| |||||    
T  36721615 ggagtcaaccccaaagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgattggaataaacga 36721516  T
Q  166 atgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||| |||||||  | ||   |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||    
T  36721515 acgacgaaaacgtgacgagcaatgtttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgctggtgacgttgctgagat 36721438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11379022 - 11378908
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| | || ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11379022 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcta-ccaaggagtcaacaccggagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 11378924  T
Q  113 acgtccaacgctcgac 128  Q
    ||||||||||||||||    
T  11378923 acgtccaacgctcgac 11378908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25887796 - 25887660
Alignment:
Q  106 ggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacat 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || |||||  | ||||| | |||  ||||||||||||||||    
T  25887796 ggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcactcagttgggtggaattaacaaacgacgaggatgtgaggaccatgttttgggagcacaacat 25887697  T
Q  206 gttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  25887696 gttctcgtggatc-atatgtgtggaacgttgttgagat 25887660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50458928 - 50458740
Alignment:
Q  55 aatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggt 154  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | | | ||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||| || | ||||||    
T  50458928 aattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtgggacacggtcgatataagtgtccaacgctcgacgaggggagagtatcgtttaattgggt 50458829  T
Q  155 gaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | |||  ||||| ||||| ||| |||  | |||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| || |||||| ||||||    
T  50458828 ggaatctacgaacgacgaaaacttgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatagatatgcgggtgacgttgttgagat 50458740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42323565 - 42323438
Alignment:
Q  116 tccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtgg 215  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  ||||||||| ||| |||||  |||||    
T  42323565 tccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagctcaaaatgtttcagtgg 42323466  T
Q  216 atcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||| ||||||  || |||||||||||||    
T  42323465 atcgatatgctggtgacgttgctgagat 42323438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 42328394 - 42328288
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||| |||| || | ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42328394 ccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactgactgaa-ttcagccaaggaatcaaccccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 42328296  T
Q  113 acgtccaa 120  Q
    ||||||||    
T  42328295 acgtccaa 42328288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 46346865 - 46346745
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||      | ||||||||||||||||| |    
T  46346865 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactggctgaa-ttcaaccaaggagtcaag-----agacacaaggagggtggaaca 46346772  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcga 127  Q
     |||| |||||||||||||||||||||    
T  46346771 cgttccgtataaacgtccaacgctcga 46346745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 20378177 - 20378089
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaagga 90  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20378177 gaaggttcggtgccttagtgtcacgttaagaggtctaaaggatcaactaaatg-aattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaagga 20378089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17267590 - 17267446
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| |  ||||||||| ||||||||     
T  17267590 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtcttaaggatcaaccgaatgaaa-tcaaccaaggactcaaccccgtaggcacaaggagagtggaatac 17267492  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattca 147  Q
    |||  |||| || |||||||| | || || ||||||| ||| ||||    
T  17267491 gtttagtattaatgtccaacgttggatgaggggagaacatcgttca 17267446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Original strand, 50997454 - 50997558
Alignment:
Q  139 tatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgct 238  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || | ||||||    
T  50997454 tatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcgggtgaagttgct 50997553  T
Q  239 gagat 243  Q
     ||||    
T  50997554 tagat 50997558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 46346712 - 46346661
Alignment:
Q  192 tgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  46346712 tgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 46346661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 243
Target Start/End: Original strand, 18440873 - 18440915
Alignment:
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18440873 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagat 18440915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 243
Target Start/End: Original strand, 19485947 - 19485989
Alignment:
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19485947 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagat 19485989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 5765121 - 5765362
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  5765121 gaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagatacaaggagggtggaata 5765219  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | ||| |||  | |||  ||||||||||     
T  5765220 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaacttgatgagcatgttttgggagcag 5765319  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5765320 aacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 5765362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 38046725 - 38046484
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  38046725 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 38046627  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||  |||||||||||    
T  38046626 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacaagcatgttttgggagcac 38046527  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||||||    
T  38046526 aacatgttccagtcgatcaatatgccggtgacgttgctgagat 38046484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48568683 - 48568454
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||| ||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  48568683 ccttgatgtaacgttaagagatatcaagaatcaactgaatgaactc-aaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggtggaattagttcggtataa 48568585  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| || |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  48568584 acgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaatgatgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 48568485  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48568484 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 48568454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 18842354 - 18842595
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  | ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18842354 gaaggttcggtgctttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaa-ttcaaccaaatagtcaaccccggagacacaaggagggtggaata 18842452  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  18842453 cgttcggtataaacgtccaacgctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 18842552  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
      ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18842553 ggcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 18842595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35587220 - 35586979
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| |  |||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  35587220 gaaggttcggtgccttggtgtaaaattaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 35587122  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||  |||||  |||||||||||    
T  35587121 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcac 35587022  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  35587021 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaccttgctgagat 35586979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24270652 - 24270413
Alignment:
Q  3 aggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatg 102  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |    
T  24270652 aggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacacg 24270554  T
Q  103 ttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  ||| |||||||||    
T  24270553 ttcggtataaacgtccaacactcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttaggagcacaa 24270454  T
Q  203 catgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  24270453 catgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 24270413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 13283621 - 13283861
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  13283621 gaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactgaatgaa-tttaaccaaggagtcaacccgg-agacacgaggagggtggaata 13283718  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || || ||| |||  | |||  ||||||||| |    
T  13283719 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttagttgggtgaaattaacgaacgatgaaaacatgacgagcatgttttgggagcgc 13283818  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  13283819 agcatgttctagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagat 13283861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14174049 - 14173808
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  | ||||||| ||||||| || | |||||||| |||||| | || || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  14174049 gaaggttcggtgctttggtgtaacgttaagagatctcaaggatgaactgacttaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 14173951  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||| ||    
T  14173950 cgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggaggac 14173851  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  14173850 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 14173808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47488328 - 47488087
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||    
T  47488328 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaatcaaggagtcaaccccagagatgcaaggagggtggaata 47488230  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  47488229 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 47488130  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    || || ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  47488129 aatattttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 47488087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 29435901 - 29436129
Alignment:
Q  14 cttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaa 113  Q
    |||||||| || |||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29435901 cttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaa 29435999  T
Q  114 cgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||| ||| ||||||| |||    
T  29436000 cgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagtacagcatgttccagt 29436099  T
Q  214 ggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||| ||| ||| || |||||||||||||    
T  29436100 ggatcgatacgcgggtgacgttgctgagat 29436129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 13972840 - 13973080
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||| ||||  || | |||||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  13972840 gaaggttcggcgccttggtgtaactttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa--ttcaacaaggagtcaaccccagagacgcaaggagggtggaata 13972937  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  13972938 cgttcagtataaacgtccaacactcgactaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 13973037  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  13973038 aacatgttccagtggatcaatatgcgggtgacattgctgagat 13973080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 17372642 - 17372883
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  | || ||| ||||||| ||||    
T  17372642 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-tacaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaagagggtgaaata 17372740  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || |||| ||||| |||| ||||| || ||||  |||||  |||||||||||    
T  17372741 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatataatccacttaggtggaattagcgaacgacgaaaatgtgaagaacatgttttgggagcac 17372840  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  17372841 accatattccagtggatcgatatacgtgtaacgttgatgagat 17372883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 45689048 - 45689275
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  45689048 ccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaactc-aaccaaagagtcaaccccaaagacacaaggagggtggaatatgtttggtt--a 45689144  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  45689145 acgtccaacgctcgacggggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 45689244  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||  ||||||| || |||||||||||||    
T  45689245 tggatggatatgcgggtgacgttgctgagat 45689275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 49599130 - 49598925
Alignment:
Q  36 tcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggga 135  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  49599130 tcaaggatcaactaaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgttcaacactcgacgagggga 49599032  T
Q  136 gaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgtt 235  Q
    || ||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||| ||||||| || |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  49599031 gagtatcattcacttgagtggagttaaagaatgacga-aacgtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtt 49598933  T
Q  236 gctgagat 243  Q
    ||||||||    
T  49598932 gctgagat 49598925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 6435687 - 6435928
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| || |||| || | |||||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  6435687 gaaggttcggtgccttggtgtaacattaagagttctcaaggttgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaaa 6435785  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | ||   |||||||||||    
T  6435786 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcaagttttgggagcac 6435885  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | || |||||| ||||||    
T  6435886 aacatgttccagtggatcgatatgtgagtgacgttgttgagat 6435928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29762500 - 29762271
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  29762500 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataa 29762402  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  29762401 acgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 29762302  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| |||| || || |||||| ||||||    
T  29762301 tggatcgatatacgggtgacgttgatgagat 29762271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 36909476 - 36909717
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||| | || || |||||||||||||||||   | ||| |||||||||||||||    
T  36909476 gaaggttcggtgccttagtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactcaa-ttcaaccaaggagtcaaccctagagacataaggagggtggaata 36909574  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  36909575 cgttcggtgtaaacgtccaacgctcgacgagggaagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 36909674  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  36909675 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 36909717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39857185 - 39856956
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||||  | | ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39857185 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaacaaaggagtcaaccaaggagacacaagaagggtggaacatgttcggtataa 39857087  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  39857086 acgtccaatgctcgacgaggggagagtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgatcatgttttgggagcacgacatgttccag 39856987  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  39856986 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 39856956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41875175 - 41874934
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||     
T  41875175 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggtggaatt 41875077  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||||| | ||||  || ||||| || ||||  | |||  |||||||||||    
T  41875076 agttcggtatcaacgtccaatgctcgaagaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaataacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcac 41874977  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  41874976 aacatgttctagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagat 41874934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42572055 - 42571826
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42572055 ccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaactc-aaccaaggagtcaacctcagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 42571957  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  42571956 acgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacaacatgttccag 42571857  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42571856 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 42571826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13635588 - 13635364
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  13635588 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaagataaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggtggaaca 13635490  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |  | |||  |||||||||||    
T  13635489 cgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgggagcac 13635390  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcg 226  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||    
T  13635389 aacatgttccagtggatcgatatgcg 13635364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39224475 - 39224247
Alignment:
Q  14 cttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaa 113  Q
    |||||||| ||||||| |||| | |||||| |||| | |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39224475 cttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaa 39224377  T
Q  114 cgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagt 213  Q
    |||| ||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  39224376 cgtctaacgctcaacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagt 39224277  T
Q  214 ggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  39224276 ggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 39224247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 35184885 - 35185124
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| |    
T  35184885 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtatcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcagccccaaagacacaaggagggtggaaca 35184983  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcattt-gggagca 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | || |||||||||| ||||| |||||||  |||||  ||| |||||||    
T  35184984 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttggggagca 35185083  T
Q  200 caacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctga 240  Q
    |  ||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||    
T  35185084 cggcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctga 35185124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 23342556 - 23342797
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| || |||| |||| ||| |||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| || |    
T  23342556 gaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcagggatgaactgattgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggaaggtgaaaca 23342654  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||  | |||  ||| |||||||    
T  23342655 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttttggagcac 23342754  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23342755 attatgttcgagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 23342797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44337610 - 44337369
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  44337610 gaaggttcggtgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 44337512  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||| || || ||||| |||||||  | |||  |||||| ||||    
T  44337511 ccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattcacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggtgcac 44337412  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  44337411 aacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 44337369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 44597628 - 44597857
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  44597628 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaa-ttcaaccaagaagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataa 44597726  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |  ||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  44597727 acgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgatgagtatgttttgggagcacagcatgttccag 44597826  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||| | || |||||| ||||||    
T  44597827 tggatcgatatgtgggtgacgttgatgagat 44597857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50068550 - 50068309
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  50068550 gaaggttcggtgccttgatgtaatgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaacgagtcaaccccagagacgcaaggagggtggaata 50068452  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||| | || ||||  |||||  |||||||||||    
T  50068451 tgttcggtatgaaggtccaacactcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggatttaaagaacgacaaaaatgtgacgaacatgttttgggagcac 50068352  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  50068351 atcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 50068309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Original strand, 51269729 - 51269954
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |  ||| ||||||    
T  51269729 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacaccttctgtataa 51269827  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||  | |||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  51269828 acgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccag 51269927  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctg 239  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||    
T  51269928 tggatcgatatgcgggtgacgttgctg 51269954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21484897 - 21484693
Alignment:
Q  38 aaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggaga 137  Q
    |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21484897 aaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggtgaaacttgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaga 21484799  T
Q  138 atatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgc 237  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||  | |||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||    
T  21484798 gtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgtttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgc 21484699  T
Q  238 tgagat 243  Q
    ||||||    
T  21484698 tgagat 21484693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12791550 - 12791331
Alignment:
Q  15 ttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaac 114  Q
    ||||||| || |||| |||| |||||||| | |||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  12791550 ttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgagctgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaagtagggtggaacacgttcggtataaac 12791452  T
Q  115 gtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtg 214  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  12791451 gtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatttttttggagcacaacatgttccagtg 12791352  T
Q  215 gatcaatatgcgtgtaacgtt 235  Q
    |||| ||||||| || |||||    
T  12791351 gatcgatatgcgggtgacgtt 12791331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Original strand, 35576307 - 35576495
Alignment:
Q  55 aatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggt 154  Q
    |||| |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  35576307 aattcaaccaaagagtcaaccctggagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggt 35576406  T
Q  155 gaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  35576407 ggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccggtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 35576495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17686594 - 17686411
Alignment:
Q  60 aaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaat 159  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||    
T  17686594 aaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtagaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaat 17686495  T
Q  160 taacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||    
T  17686494 taacgaatgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacaacatcttccagtggatcgatatgcgggtgacgtagctgagat 17686411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27486969 - 27486740
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||  |  ||||||||||    
T  27486969 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttaaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtagatcaccttcggtataa 27486871  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| |     
T  27486870 acgtccaacgctcgacgaggggagagtttaattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccat 27486771  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  27486770 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 27486740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 41780620 - 41780849
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  41780620 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaagaagggtggaacacgttcggtataa 41780718  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  || ||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  41780719 acgtccaacgctcgacgagaggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaatatattttgggagcacagcatgttccag 41780818  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | |||  ||||||  || |||||||| ||||    
T  41780819 tagatagatatgcaggtgacgttgctaagat 41780849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 49396619 - 49396860
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||| |    
T  49396619 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaacgagtcaaccccatagacataaggagggtggaaca 49396717  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||  |||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  49396718 cgttcggtataaacgtccaacgatttacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 49396817  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| || |||||||||||||    
T  49396818 aacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagat 49396860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27035584 - 27035368
Alignment:
Q  26 ttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctc 125  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27035584 ttaagaggtctcaaggatcaattgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaatacgtccggtataaacgtccaacgctc 27035486  T
Q  126 gacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgc 225  Q
    ||||| || ||  ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||  |  ||  |||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  27035485 gacgagggaagggtatcattcacttgggtggagttaaagaatgacgaaaacgtgacgagtatgttttgggagaacaccatattccagtggatcgatatgc 27035386  T
Q  226 gtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||||||||||||    
T  27035385 gggtaacgttgctgagat 27035368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35526467 - 35526227
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| || |||| || ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||       
T  35526467 aaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaccgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacgc 35526369  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  |||||| |||||||||| | ||| |||| ||  | |||  ||||||||||||    
T  35526368 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgtcgaaaacgagacgaccatgttttgggagcaca 35526269  T
Q  202 acatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
      |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  35526268 gaatgttgcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 35526227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 49427315 - 49427543
Alignment:
Q  14 cttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaa 113  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | | ||||||| ||||  | | ||||||||||||    
T  49427315 cttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagatacaaggatggtgttacacgttcggtataaa 49427413  T
Q  114 cgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagt 213  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  49427414 tgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagt 49427513  T
Q  214 ggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  49427514 ggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 49427543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16098222 - 16098078
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||| ||  ||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  16098222 gaaggttcgacatattggtgttac-ttaagaggtatcaaagatcaactgaatgaa-ttcaaccaagtagtcaaccctggagacacaaggagggtggaata 16098125  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattca 147  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16098124 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattca 16098078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 19160232 - 19160473
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||| |    
T  19160232 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacgaggatggtggaaca 19160330  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |  ||  ||||||| |||    
T  19160331 cgtttggtataaacgtccaacgcttgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgactatgttttgggaacac 19160430  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  19160431 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 19160473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 48215125 - 48215354
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| || |||| |||| |||||| | |||||| |||| || |||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  48215125 ccttggtgtaacattaagaggtctcaaggctgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaacctcacagacacaaggatggtggaacacgttcggtataa 48215223  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||  | |||  ||| |||||||| ||||||| ||    
T  48215224 acgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatatttttggagcacagcatgttccag 48215323  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  48215324 tggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 48215354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 18169940 - 18170179
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||| |||| | |||||| |||| | |||| || ||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  18169940 gaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtttaaaggatgaactcactgaa-ttcaaccaaggagttaaccccagagacacaaggagggtggaaca 18170038  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  18170039 cgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 18170138  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgag 241  Q
    | ||||||| ||| |||| ||||||| || || ||||||||    
T  18170139 atcatgttccagtagatcgatatgcgggtgacattgctgag 18170179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 243
Target Start/End: Original strand, 3658475 - 3658629
Alignment:
Q  89 gagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatc 188  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||  ||| |     
T  3658475 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacgtg 3658574  T
Q  189 atttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  3658575 ttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcaagtaacgttgctgagat 3658629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16532369 - 16532140
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| || | ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  16532369 ccttggtgtaacgttaagagatctcaaggatcaattaaatgaa-ttcaaccaaggagtcaactccggagacacaaggaggatggaatacgttcgatataa 16532271  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||| |||||||||| || | |||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||  | |||  | |||||||| | |||| || |     
T  16532270 acgtacaacgctcgatgaggagagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgatgagcatattatgggagcagagcatgctctaa 16532171  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16532170 tggattgatatgcgtgtaacgttgctgagat 16532140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 17696983 - 17697202
Alignment:
Q  23 acgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacg 122  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  | ||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |    
T  17696983 acgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaatgccagagacataaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaatg 17697081  T
Q  123 ctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaata 222  Q
    |||||| | || ||  ||||||||| ||||||| | |||| | | ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  17697082 ctcgacaagggtagggtatcattcacttgggtggagttaaagtacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgata 17697181  T
Q  223 tgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  17697182 tgcgggtgacgttgctgagat 17697202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 239
Target Start/End: Original strand, 16081294 - 16081437
Alignment:
Q  96 gaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttggg 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||| |||| | |||  ||| ||    
T  16081294 gaatacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggaggatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacatgaggagcatgtttttgg 16081393  T
Q  196 agcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctg 239  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16081394 agcacaacatgttctagttgatcgatatgcgtgtaacgttgctg 16081437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 49263199 - 49263038
Alignment:
Q  82 acacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgag 181  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||     
T  49263199 acacaagtagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacaaaagacgaaaacgtgac 49263100  T
Q  182 aaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
     | |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||    
T  49263099 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatctatatgctggtaacgttgttgagat 49263038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 49926582 - 49926430
Alignment:
Q  91 gggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcat 190  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| | | |||||||||| ||||| |||||||| | |||  |    
T  49926582 gggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtgtcattcacttgtgcggaattaacgaacgacgaaaacgtgaggagcatgtt 49926483  T
Q  191 ttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||    
T  49926482 ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagat 49926430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24364003 - 24363851
Alignment:
Q  90 agggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatca 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||| ||||| |||||||  |||||      
T  24364003 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcaatcacttgggtagaattaatgaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 24363904  T
Q  190 tttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgaga 242  Q
    |||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  24363903 tttgggggcacagtatgttctagtggatcgatatgcggttaacgttgttgaga 24363851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30310105 - 30309893
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||||   |||| || ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  30310105 ccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcgctgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccatagacataaggagggtggaacacgttcggtataa 30310007  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    ||||||||| |||||||  |||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||  | |||  ||||||||||||  | |||  ||    
T  30310006 acgtccaacactcgacggggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaggacgtttcag 30309907  T
Q  213 tggatcaatatgcg 226  Q
    |||||| |||||||    
T  30309906 tggatcgatatgcg 30309893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 15471453 - 15471571
Alignment:
Q  21 tcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaa 120  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  15471453 tcacgttaaaaggtgtcaaggatcaactgaatgaaa-tcaaccaaggtctcaaccccggagacacaaggagtgtggaatacgtttggtatgaacatccaa 15471551  T
Q  121 cgctcgacgatgggagaata 140  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  15471552 cgttcgacgaggggagaata 15471571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 46180465 - 46180330
Alignment:
Q  109 ataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattca-tttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| | |||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||| |||||    
T  46180465 ataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgt 46180366  T
Q  208 tcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  46180365 tccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagat 46180330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 243
Target Start/End: Original strand, 37778109 - 37778235
Alignment:
Q  117 ccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtgga 216  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||| | | ||||| |||||||  | |||  |||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  37778109 ccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaggacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagaacaacatgttccagttga 37778208  T
Q  217 tcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    || ||||||| || |||||||||||||    
T  37778209 tcgatatgcgggtgacgttgctgagat 37778235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 46181843 - 46181731
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||  | || |||||| |||||||||    
T  46181843 gaaggttcggtgccttgatgtaatgttaagaggtctcaaggatcaattgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaggaaggtggaata 46181745  T
Q  101 tgttcggtataaac 114  Q
     |||||||||||||    
T  46181744 cgttcggtataaac 46181731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 48707172 - 48707090
Alignment:
Q  38 aaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  48707172 aaggatcaactgaatgaaatc-aaccaaggactcaaccctggagacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccaac 48707090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 4209178 - 4209262
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaa 98  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  4209178 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaa 4209262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 218
Target Start/End: Original strand, 13148365 - 13148450
Alignment:
Q  133 ggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatc 218  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  13148365 ggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgagagcacaacatgttccagtggatc 13148450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14772813 - 14772687
Alignment:
Q  19 tgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtcc 118  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||  ||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||  || ||||| |||||||    
T  14772813 tgtcacgttaaaaggtctcaaggatcaactggaagaaatc-aacca-ggactcaactccggagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtcc 14772716  T
Q  119 aacgctcgacgatgggagaatatcattca 147  Q
    |||| | ||| | ||||||||||| ||||    
T  14772715 aacgttggacaacgggagaatatcgttca 14772687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Original strand, 13148218 - 13148295
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggag 91  Q
    ||||| ||| || |||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  13148218 ccttgatgtaaccttaagaggtctcaaggatcaactgaatg-aattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggag 13148295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 24364064 - 24364012
Alignment:
Q  3 aggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaa 55  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24364064 aggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa 24364012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1400595 - 1400354
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  1400595 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaatgatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaaca 1400497  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  1400496 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 1400397  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  1400396 atcatgttccagtggatccatatgcgggtgacgttgctgagat 1400354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 1971291 - 1971520
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  1971291 ccttggtataacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaacacgtttggtataa 1971389  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  1971390 acgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttcggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 1971489  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1971490 tggatcaatatgcgggtaacgttgctgagat 1971520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 33370580 - 33370809
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33370580 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaa-tttaactagggactcaaccccggagacacaaggagggtggaatacgttcgatataa 33370678  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  33370679 acgttcaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 33370778  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  33370779 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 33370809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 12742629 - 12742803
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  12742629 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaagaggtatcaaggatcaactaaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagacacaagaagggtggaata 12742727  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataac 176  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||    
T  12742728 cgttcggtataaacgtccaacgctcaacgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataac 12742803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 12805447 - 12805622
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  12805447 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaagaggtatcaaggatcaactaaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagacacaagaagggtggaata 12805545  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacg 177  Q
     |||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||    
T  12805546 cgttcggtataaacgtccaacgctcaatgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacg 12805622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 541916 - 541687
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  541916 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataa 541818  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  | |||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  541817 acgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgggacgagcatgttttgggagcacatcatgttccag 541718  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  541717 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 541687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 18308186 - 18308415
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| | || |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18308186 ccttggtgtaacgttaagaagtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 18308284  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  18308285 acgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 18308384  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || | |||||||||||    
T  18308385 tggatcgatatgcgggtgatgttgctgagat 18308415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Original strand, 2599134 - 2599374
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  2599134 aaggtttggtaccttggtgtcaccttaagagatctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatac 2599232  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||   || |||  | |||  ||||||||||||    
T  2599233 gttcggtataaacgtccaacattcgacgatgagagaatatcattcagttgggtggaattagcgaacaacggcgacatgaagagcatgttttgggagcaca 2599332  T
Q  202 acatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2599333 acatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagat 2599374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 8537868 - 8538109
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  8537868 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 8537966  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||  | |||  |||||||||||    
T  8537967 cgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcac 8538066  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  8538067 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 8538109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 11346623 - 11346864
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  11346623 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 11346721  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  11346722 cgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgaaattaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 11346821  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  11346822 agcatgttccagtggatcgatatgcgagtgaagttgcttagat 11346864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17367028 - 17366788
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17367028 gaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcta-ccaaggagtcaaccccgtagacacaaggagggtggaata 17366930  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||  |||||||||||    
T  17366929 -gttcgatataaacgtccaaccctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacaaacatgttttgggagcac 17366831  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  17366830 aacatgttctagtggattgatatgcgggtaccgttgttgagat 17366788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 19400277 - 19400518
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||    
T  19400277 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttgagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaata 19400375  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||  | |||  |||||||||||    
T  19400376 cgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtgtcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcac 19400475  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  19400476 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttggtgagat 19400518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 35565186 - 35565426
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||  |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |    
T  35565186 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggacgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacataaggagggtggaaca 35565284  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| || || |||||||  | |||  |||||||||||    
T  35565285 cgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatga-aacgtgacgagcatgttttgggagcac 35565383  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  35565384 aacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 35565426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 30709512 - 30709736
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||| |    
T  30709512 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccaaagatacaaggatggtggaaca 30709610  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  30709611 cgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 30709710  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcg 226  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||    
T  30709711 agcatgttccagtggatcgatatgcg 30709736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7522 - 7281
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| || | |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  7522 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagagatctcaaggatgaactgactgaa-ttgaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 7424  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  7423 cgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 7324  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  7323 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 7281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4724367 - 4724126
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||  |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||  |||||| |    
T  4724367 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggaaaaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggaaagtggaaca 4724269  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||  | |||  |||||||||||    
T  4724268 cattcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 4724169  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  4724168 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 4724126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 40009442 - 40009683
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||   |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||   | || ||||||||||||||||    
T  40009442 gaaggttcggtgtcttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaaatgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccctagagacgcaaggagggtggaata 40009540  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  40009541 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 40009640  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  40009641 aacatgttacagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagat 40009683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 11027691 - 11027915
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  11027691 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggtggaaca 11027789  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |  | |||  |||||||||||    
T  11027790 cgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgggagcac 11027889  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcg 226  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||    
T  11027890 agcatgttccagtggatcgatatgcg 11027915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 38854072 - 38854296
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  38854072 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggtggaaca 38854170  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |  | |||  |||||||||||    
T  38854171 cgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgggagcac 38854270  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcg 226  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||    
T  38854271 atcatgttccagtggatcgatatgcg 38854296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8576434 - 8576193
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  | ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  8576434 gaaggttcggtgctttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 8576336  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| || || |||||||  | |||  |||||||||||    
T  8576335 cgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 8576236  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  8576235 aacatgttccggtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 8576193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 28880905 - 28881146
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  28880905 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaaa 28881003  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  28881004 catttggtacaaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 28881103  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  28881104 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 28881146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 3601267 - 3601496
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||||| |||| || || |||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  3601267 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaagatgaactgactgaa-ttcaatcaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtagaacatattcggtataa 3601365  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||  ||||||||||||||| ||    
T  3601366 acgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttaagagcacaacatgttccag 3601465  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||  || ||||||| || |||||||||||||    
T  3601466 tgtttcgatatgcgggtgacgttgctgagat 3601496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19036967 - 19036726
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||| || ||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  19036967 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaa-ttcaacaaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 19036869  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  19036868 catttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 19036769  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  19036768 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 19036726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27661670 - 27661429
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  27661670 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 27661572  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||  |||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  27661571 cgtttagtataaacttccattgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 27661472  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  27661471 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 27661429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35927718 - 35927489
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| || | ||||||  |||||| || | ||||| |||||    
T  35927718 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaacctcggagacacaattagggtgtaacacgttcgttataa 35927620  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||| ||||||||| || ||| ||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||||| ||| ||  ||    
T  35927619 acgtccaatgctcgacgagggaagagtatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacatcatctttcag 35927520  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  35927519 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 35927489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 3458750 - 3458928
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  3458750 gaaggttcggcgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccaaagacgcaaggagggtggaata 3458848  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtga 180  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||  | |||| ||| ||||| |||||||    
T  3458849 cgttcggtataaatgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggttgagttaaagaacgacgaaaacgtga 3458928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6793679 - 6793438
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |    
T  6793679 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggaggatggaaca 6793581  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      ||||||||||||| | |||||||||||| | | || ||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| || ||||  | |||  |||||||||||    
T  6793580 cattcggtataaacgcctaacgctcgacgaggagtgagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcac 6793481  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||  | | |||||||||||    
T  6793480 aacatgttctagtgaatcgatatgcggatgaggttgctgagat 6793438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 243
Target Start/End: Original strand, 3169576 - 3169758
Alignment:
Q  60 aaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaat 159  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| || |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  3169576 aaccaaggagtcaaccccagagacataaagagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacga-gggagagtatcattcacttgggtggaat 3169674  T
Q  160 taacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||| ||||| |||||||  | |||  |||  ||||||||||||||| ||||||||  |||||| || |||||||||||||    
T  3169675 taacgaacgacgaaaacgtgacgagcatattttaagagcacaacatgttccagtggatcggtatgcgggtgacgttgctgagat 3169758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 36350586 - 36350420
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36350586 ccttggtgtaacgttaagaggtgtccaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaagagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 36350488  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtga 180  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||    
T  36350487 acgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtga 36350420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 128
Target Start/End: Original strand, 7082259 - 7082332
Alignment:
Q  55 aatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgac 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7082259 aattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgac 7082332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 25360885 - 25360788
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25360885 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtctcaaggatcaactggatgaaatc-aaccaaggactcaaccccgaagacacaaggagggtggaata 25360788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 166
Target Start/End: Original strand, 1693382 - 1693459
Alignment:
Q  89 gagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaa 166  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  1693382 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcactcacttgggtggaattaacgaa 1693459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15798365 - 15798218
Alignment:
Q  19 tgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtcc 118  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||||  || ||||| || | ||    
T  15798365 tgtcacgttaaaaggtctcaaggatcaactgaatgaaa-tcaactaaggactcaaccccggagacacaaggagagtgaaatacatttggtatgaatgccc 15798267  T
Q  119 aacgctcgacgatggg-agaatatcattcatttgggtgaaattaacgaa 166  Q
    |||| | ||||| ||| |||||| |||||| |||| |  ||||||||||    
T  15798266 aacgttggacgaggggcagaataacattcagttggctagaattaacgaa 15798218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12067884 - 12067747
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    ||||||||| || ||  |||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||     
T  12067884 aaggttcggtacattaatgtcgcgttaaaaggtctcaaagatcaactgaatgaaa-tcaaccaaggactgaaccccggagacacaaggagagtggaatac 12067786  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaata 140  Q
     || ||||| ||  |||| || ||||||| |||||||||    
T  12067785 atttggtatgaatatccatcgttcgacgaggggagaata 12067747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 36312227 - 36312128
Alignment:
Q  21 tcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaa 120  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  36312227 tcacgttaaaatgtctcaaggatcaacttgatgaaatc-aaccaaggactcaaccccggagacacgaggagggtggaatacatttggtatgaacgtccaa 36312129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 19747991 - 19748111
Alignment:
Q  19 tgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtcc 118  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||| || |||||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||  || | ||| |||||||    
T  19747991 tgtcacgttaaaaggtctcaaggctcaattgcatgaaatc-aaccaaggactcaaccccaaagacacaagaagggtggaatacatttgatatgaacgtcc 19748089  T
Q  119 aacgctcgacgatgggagaata 140  Q
    |||| | ||| | |||||||||    
T  19748090 aacgttggacaacgggagaata 19748111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 149
Target Start/End: Original strand, 18920640 - 18920786
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| | |||||| || ||||||||| | |||| || |||||| ||||     
T  18920640 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtctcaaggatcaactagatgaaa-tcaaccaaagactcaaccccggagacacgagaagggtgaaatac 18920738  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatt 149  Q
     || ||||| |||||  |||| | ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18920739 atttggtatgaacgtttaacgttggacgacgggagaataacgttcatt 18920786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 2196 - 2425
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2196 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 2294  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  2295 acgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccag 2394  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  2395 tggatcgatatgcgggtaacgttgatgagat 2425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1642853 - 1642636
Alignment:
Q  25 gttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgct 124  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| ||    
T  1642853 gttaagaggtctcaaggatcaattgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaatcccggagacacaaggagggtggaatacgtttgatataaacgttcaacact 1642755  T
Q  125 cgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatg 224  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||| || || |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1642754 cgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgaggagcatgttttgggagcacaacatgttcaagtggatcgatatg 1642655  T
Q  225 cgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  1642654 cgtgtaacgttgttgagat 1642636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28979312 - 28979071
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  28979312 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggtggaaca 28979214  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||  | |||  |||||||||||    
T  28979213 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgggtgaaattaacgagcgacaaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 28979114  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  28979113 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 28979071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36394114 - 36393873
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||   |||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  36394114 gaaggttcggtgtcttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggtggaaca 36394016  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  36394015 cgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagaatatcattcacttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 36393916  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    || |||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  36393915 aatatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 36393873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 48270565 - 48270806
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| | || |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |    
T  48270565 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaaaaagtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacaaaaggagggtggaaca 48270663  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  48270664 cgttcggtatagacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 48270763  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  48270764 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 48270806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 40588466 - 40588707
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  40588466 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgattgaa-ttcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggagggtggaaca 40588564  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||  | |||  |||||||||||    
T  40588565 ccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgatgagcatgttttgggagcac 40588664  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  40588665 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagat 40588707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 46862484 - 46862243
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |    
T  46862484 gaaggttcggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgattgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagggtggaaca 46862386  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||||| |||||||  | | |  |||||||||||    
T  46862385 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcttgttttgggagcac 46862286  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  46862285 agcatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagat 46862243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21187559 - 21187348
Alignment:
Q  31 aggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacga 130  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21187559 aggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacga 21187461  T
Q  131 tgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgta 230  Q
     |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||     
T  21187460 ggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgattgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtg 21187361  T
Q  231 acgttgctgagat 243  Q
    |||||||||||||    
T  21187360 acgttgctgagat 21187348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26603495 - 26603273
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||    
T  26603495 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagttaacctcagagacacaaggagggtggaata 26603397  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  26603396 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagggtatcattcacttgggtggaattaaagagcgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 26603297  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatg 224  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  26603296 aacatgttccagtggatcgatatg 26603273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15338183 - 15337954
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15338183 ccttggtgtgacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaa-ttcaaccaaggattcaaccccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataa 15338085  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    | || |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||  ||    
T  15338084 atgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgatgagcatgttttgggagcacaacatgtttcag 15337985  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15337984 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 15337954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21615050 - 21614809
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  |||||||||  |||||| |||| |||| ||| ||||||||||| || ||| | |||||||||| || | ||||||||||||||||| |    
T  21615050 gaaggttcggtgccttggtgtatcgttaagaggtctcaatgatgaactgaatgaa-ttcaactagggagtcaacctcggagacacaaggagggtggaaca 21614952  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  | |||  |||||||||||    
T  21614951 cgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagggaagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgcgacgagcatgttttgggagcac 21614852  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21614851 atcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 21614809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 41217531 - 41217772
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||     
T  41217531 gaaggttcggtgccttgatttaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaggtt-aaccaaggagtcaacctcaaagacacaaggagggtggaatt 41217629  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| || ||||  |||||  |||||||||||    
T  41217630 agttcggtataaaaattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaaagtgaagaacatgttttgggagcac 41217729  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41217730 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 41217772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 17183141 - 17183370
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||    | |||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  17183141 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccttagagacacaaggagggtgtaacacgtttggtataa 17183239  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||  ||||| |||||||||||||| ||    
T  17183240 acgtccaacactcgacgagggaagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttggaagcacaacatgttccag 17183339  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || | |||||||||||    
T  17183340 tggatcgatatgcgggtgatgttgctgagat 17183370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 30360446 - 30360674
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30360446 ccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggtggaatacgttcggtataa 30360544  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    | || ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||  || ||||| ||||| |  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  30360545 atgtacaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaaaacgacgaaaacgtaacgagcatgttttgggagcacaacatgttctag 30360644  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||  ||||||| ||  ||||||||||||    
T  30360645 tggattgatatgcgggt-gcgttgctgagat 30360674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 34140794 - 34141023
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||| |||| || | ||||| |||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  34140794 ccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcagccaagaagtcaaccctagagacacaaggagggtggaacaatttcggtataa 34140892  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  34140893 acatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacggacatgttttgggagcacaacatgttccag 34140992  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  34140993 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 34141023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43351389 - 43351149
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| | |||| || |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |    
T  43351389 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactaactgaa-ttcaaccaaggagtctaccccagagacacaaggagggtggaaca 43351291  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||  | |||  |||||||||||    
T  43351290 cgttcagtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcac 43351191  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||    
T  43351190 aacatgttccagtggatcgatatg-gggtgacgttgctgagat 43351149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 243
Target Start/End: Original strand, 17839245 - 17839481
Alignment:
Q  6 ttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttc 105  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| | |||     
T  17839245 ttcggtaccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaagacgttt 17839343  T
Q  106 ggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacat 205  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||| |||    
T  17839344 ggaataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcat 17839443  T
Q  206 gttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  17839444 gttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 17839481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39477513 - 39477289
Alignment:
Q  18 gtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtc 117  Q
    |||| ||||||| |||| | |||||| |||| | |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  39477513 gtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagatacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtc 39477415  T
Q  118 caacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggat 217  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||| |||  | |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39477414 caacgctcgacgaggggaggatatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggat 39477315  T
Q  218 caatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| || |||||||||||||    
T  39477314 cgatatgcgggtgacgttgctgagat 39477289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20378981 - 20378752
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20378981 ccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaattgaat-aaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataa 20378883  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||||||| || | |||| |||||  ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  20378882 acgtccaatgcacaacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccag 20378783  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||   ||||||| || | |||||||||||    
T  20378782 tggacagatatgcgggtgatgttgctgagat 20378752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 20564676 - 20564917
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  20564676 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 20564774  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  20564775 catttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 20564874  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  20564875 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 20564917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48315470 - 48315229
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | | | ||||||||||||| |    
T  48315470 gaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagatagaaggagggtggaaca 48315372  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  48315371 cgtttggtataaacgtccaacgctcaacgagaggagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 48315272  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  48315271 aacatgttccagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 48315229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 21650440 - 21650682
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaacc-ccgcaaacacaaggagggtggaat 99  Q
    ||||||||||  ||||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||     
T  21650440 gaaggttcggtgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccacctgagacacaaggagggtggaac 21650538  T
Q  100 atgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagca 199  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| || ||||  | |||  | ||||| ||    
T  21650539 acgttcattataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggaggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttatgggatca 21650638  T
Q  200 caacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  21650639 caacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagat 21650682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48221032 - 48220793
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||    
T  48221032 gaaggttcggtaccttgatgtaacgttaagaggtctcaatgatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagatgcaaggagggtggaata 48220934  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||| | |||| ||| ||||| |||||||  | |||   ||||||||||    
T  48220933 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcat--gttgggagcac 48220836  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  48220835 agcatgttccagtggatcaatatgcaggtgacggtgctgagat 48220793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 42735196 - 42735420
Alignment:
Q  17 ggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgt 116  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42735196 ggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgt 42735294  T
Q  117 ccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtgga 216  Q
    ||||||||||| |  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||| ||| |||| |    
T  42735295 ccaacgctcgatg-gggaagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatattctagtgaa 42735393  T
Q  217 tcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    || ||||||| || |||||||||||||    
T  42735394 tcgatatgcgggtgacgttgctgagat 42735420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Original strand, 41048753 - 41048941
Alignment:
Q  55 aatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggt 154  Q
    |||| |||||||||||||||||   | ||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  41048753 aattcaaccaaggagtcaaccctagagacagaaggaggatggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggt 41048852  T
Q  155 gaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | |||||||||| ||||| |||| ||  | |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  41048853 ggaattaacgaacgacgaaaacgcgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 41048941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 18237481 - 18237722
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||  | || |||||| |||||||||    
T  18237481 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttacgaggtctcaaggatcaactgaatgaa-ttcaaccaagaagtcaactccagagacgcaaggatggtggaata 18237579  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| ||| |||  | |||  |||||||||||    
T  18237580 cgttcggtataaacgtctaacgctcgacaaggggagaggatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacatgacgagcatattttgggagcac 18237679  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  18237680 atcatgttccagtggatcggtatgcgggtaacgttgctgagat 18237722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 45363533 - 45363317
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  45363533 gaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaa-ttcaaccaagaagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 45363435  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  45363434 ccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagcagagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 45363335  T
Q  201 aacatgttcaagtggatc 218  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  45363334 atcatgttccagtggatc 45363317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 10522985 - 10523191
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||| |    
T  10522985 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggatggtggaaca 10523083  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | || |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  10523084 cgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgttggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 10523183  T
Q  201 aacatgtt 208  Q
     |||||||    
T  10523184 cacatgtt 10523191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 47268899 - 47269056
Alignment:
Q  85 caaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaa 184  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  |     
T  47268899 caaggagggtggaatacgttcg-tataaacgtccagcgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 47268997  T
Q  185 catcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  47268998 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 47269056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28114630 - 28114442
Alignment:
Q  55 aatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggt 154  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  28114630 aattcaaccaaggagtcaaccccagagaaacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgcccgacgaggggagagtatcattcagttgggt 28114531  T
Q  155 gaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | |||||||||| ||||| ||| |||  | |||  ||| |||||||||||||||| | |||||| | ||| | || |||||||||||||    
T  28114530 ggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccaatggatcgaaatgtgggtgacgttgctgagat 28114442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Original strand, 42682898 - 42683051
Alignment:
Q  26 ttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctc 125  Q
    |||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |    
T  42682898 ttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgaac 42682996  T
Q  126 gacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtga 180  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  42682997 gacgaggggagaatatcattcactttggtggaattaacgaacaacgaaaacgtga 42683051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Original strand, 2356259 - 2356447
Alignment:
Q  55 aatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggt 154  Q
    |||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| |    
T  2356259 aattcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgaagaggggagagtatcattcacttggat 2356358  T
Q  155 gaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | |||||||||| ||| | || ||||  | |||  |||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  2356359 ggaattaacgaacgacaaaaatgtgacgagcatgttttgggagaacagcatgttccaatggatcgatatgcgagtaacgttgttgagat 2356447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8726508 - 8726338
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  8726508 gaagattcggtaccttggtgtcacgttacgaggtctcaaggatcaacttgatgaa-ttcaaccaaggagtcaaccctgtagacacaaggagggtggaata 8726410  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacga 172  Q
     |||||||||||||||||| || |||||  || |||||||  ||||| || |||| ||||||| || |||||    
T  8726409 agttcggtataaacgtccatcgttcgacactgagagaatactattcagttaggtggaattaacaaacgacga 8726338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30355005 - 30354864
Alignment:
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  ||||||||||||    
T  30355005 gttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcaca 30354906  T
Q  202 acatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |  | |||||||||||||    
T  30354905 acatgttccagtggatcgatatgtggatgacgttgctgagat 30354864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 13916751 - 13916918
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  |||||| || | ||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  13916751 gaaggttcggtgccttggcgtaatgttaagaggtttcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaag-agtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 13916848  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgac 170  Q
      || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  13916849 catttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgac 13916918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 18146877 - 18147014
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  18146877 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtctcaaggatcaactgaatgaaatc-aaccaaggactcaaccccggagacacaaggagggtggaatac 18146975  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaata 140  Q
     || ||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||    
T  18146976 ttttggtatgaacgtccaacgttggacgacaggagaata 18147014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3380950 - 3380835
Alignment:
Q  23 acgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacg 122  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||||  || ||||| |||||||||||    
T  3380950 acgttaaaaggtctcaaggatcaactggatgaaatcaa--caaggactcaaccccggagacacaaggagagtgaaatacatttggtatgaacgtccaacg 3380853  T
Q  123 ctcgacgatgggagaata 140  Q
     | ||||| |||||||||    
T  3380852 ttggacgacgggagaata 3380835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Original strand, 149997 - 150141
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||  | | ||||||| |||||||||||     
T  149997 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtctcaagaatcaactggatgaaa-tcaaccaaggactcaaccttggagacacaagaagggtggaatac 150095  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattca 147  Q
     || ||||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||| ||||||    
T  150096 atttggtatgaacgtctaacgttggacgacgggaggataacattca 150141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2206139 - 2206086
Alignment:
Q  190 tttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2206139 tttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 2206086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 12082840 - 12082973
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||| | || | |||||||| ||| |||||||  |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  12082840 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaatgtcttaaggatcagctggatgaaatc-aaccaacgactcaaccccggagacacaaggagggtggaatac 12082938  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggag 136  Q
     || ||||| ||||| ||||| | ||||| |||||    
T  12082939 atttggtatgaacgttcaacgttggacgacgggag 12082973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 11824619 - 11824739
Alignment:
Q  19 tgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtcc 118  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| | ||||||| | ||||||||  | | |||||||| ||| ||||  || ||||||||| |||    
T  11824619 tgtcacgttaaaaggtctcaaggatcaacgggatgaaa-tcaaccaagcactcaacccctgagaaacaaggagagtgaaataaatttggtataaacatcc 11824717  T
Q  119 aacgctcgacgatgggagaata 140  Q
    |||| | ||||| |||||||||    
T  11824718 aacgttggacgacgggagaata 11824739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 28066164 - 28066301
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatat 101  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||| |||| | |||||||||||  |||||||  ||||||||  |||||||||   |||||||||||||| ||||     
T  28066164 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtcttaaggatcaactagatgaaatc-aaccaaggtctcaaccccggcgacacaaggagggtgtaatac 28066262  T
Q  102 gttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaata 140  Q
     || ||||| ||| ||||||| | ||||| || ||||||    
T  28066263 atttggtatgaacatccaacgttggacgacggaagaata 28066301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 47268828 - 47268882
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaa 55  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47268828 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaa 47268882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 32027896 - 32027677
Alignment:
Q  23 acgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacg 122  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||     
T  32027896 acgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggttgaacacgttcggtataaacgtccaaca 32027798  T
Q  123 ctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaata 222  Q
     ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  32027797 ttcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgata 32027698  T
Q  223 tgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  32027697 tgcgggtgacgttgctgagat 32027677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 32037955 - 32037736
Alignment:
Q  23 acgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacg 122  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||     
T  32037955 acgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggttgaacacgttcggtataaacgtccaaca 32037857  T
Q  123 ctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaata 222  Q
     ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||  |||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  32037856 ttcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgata 32037757  T
Q  223 tgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  32037756 tgcgggtgacgttgctgagat 32037736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 13402452 - 13402693
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  13402452 gaaggttaggtaccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaagagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 13402550  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  ||||||||| |    
T  13402551 cgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagccc 13402650  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  13402651 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 13402693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 29108059 - 29108300
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  29108059 gaaggttcggtgccttggtgtaacgctaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-tttaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 29108157  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  29108158 cctgtggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcac 29108257  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  29108258 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 29108300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 22305715 - 22305939
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  22305715 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaagataaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggtggaaca 22305813  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |  | |||  |||||||||||    
T  22305814 cgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgggagcac 22305913  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcg 226  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||    
T  22305914 aacatgttccagtggatcgatatgcg 22305939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 243
Target Start/End: Original strand, 14114979 - 14115197
Alignment:
Q  24 cgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgc 123  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| || | |||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  14114979 cgttaagaggtctcaaggatgaactggatgaa-ttcaaccaaggagtcaacctcggagacacaaggagggtgcaaaacgttcagtataaacgtccaacgc 14115077  T
Q  124 tcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatat 223  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||| |||||||  | |||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14115078 tcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaagtaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcaatat 14115177  T
Q  224 gcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||| ||||||||| ||||||    
T  14115178 gcgggtaacgttgttgagat 14115197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34803186 - 34802945
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |    
T  34803186 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtcttaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaatcccagagacacaaggagggtggaaca 34803088  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |  ||||||||    
T  34803087 cgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgatgagcatgttcagggagcac 34802988  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||  ||| ||||||| || |||||||||||||    
T  34802987 aacatgttccagtaaatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 34802945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 6205403 - 6205644
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  6205403 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 6205501  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  6205502 catttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 6205601  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  6205602 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 6205644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 27640099 - 27640340
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| | |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  27640099 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactcactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtggaaca 27640197  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||  ||||| |||||    
T  27640198 catttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttggaagcac 27640297  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  27640298 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 27640340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 243
Target Start/End: Original strand, 29066489 - 29066713
Alignment:
Q  18 gtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtc 117  Q
    |||| ||| ||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  29066489 gtgtaacgctaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtc 29066587  T
Q  118 caacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggat 217  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||  | |||  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  29066588 caacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggat 29066687  T
Q  218 caatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| || | |||||||||||    
T  29066688 cgatatgcgggtgatgttgctgagat 29066713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 243
Target Start/End: Original strand, 29075502 - 29075726
Alignment:
Q  18 gtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtc 117  Q
    |||| ||| ||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  29075502 gtgtaacgctaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtc 29075600  T
Q  118 caacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggat 217  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||  | |||  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  29075601 caacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggat 29075700  T
Q  218 caatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| || | |||||||||||    
T  29075701 cgatatgcgggtgatgttgctgagat 29075726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 11692370 - 11692611
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||| |    
T  11692370 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgact-aaattcaaccaaggagtcaacccgagagacacaaggatggtggaaca 11692468  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
      || |||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||  ||||| |||||    
T  11692469 catttggtataaacgtccaacactcgacaaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttggaagcac 11692568  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  11692569 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagat 11692611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 12396707 - 12396936
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||| | |||||||  ||| |||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  12396707 ccttggtataacgttaagcggtctcaatgatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacataaggagggtggagcacgttcggtataa 12396805  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||  | |||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  12396806 acgtctaacactcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccag 12396905  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12396906 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 12396936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 243
Target Start/End: Original strand, 29110473 - 29110698
Alignment:
Q  18 gtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaagga-gggtggaatatgttcggtataaacgt 116  Q
    |||| ||| ||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  29110473 gtgtaacgctaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatgggtggaacaccttcggtataaacgt 29110571  T
Q  117 ccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtgga 216  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||||  | |||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29110572 ccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtgga 29110671  T
Q  217 tcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    || ||||||| || | |||||||||||    
T  29110672 tcgatatgcgggtgatgttgctgagat 29110698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 801085 - 801325
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || |||| || |||| |||||  | |||||||||||||||||||    
T  801085 gaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgagtgaa-ttcaaccgagaagtcgaccccagagacacaaggagggtggaata 801183  T
Q  101 tgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||| ||||||  | |||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||    
T  801184 cgtttggtataaacgtccaaagctcgacgaggggag-gtgtcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcac 801282  T
Q  201 aacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  801283 agcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 801325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 95 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35058932 - 35058784
Alignment:
Q  95 ggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgg 194  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| ||||| |  | |||  |||||    
T  35058932 ggaatacgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgg 35058833  T
Q  195 gagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35058832 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 35058784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 3766011 - 3765901
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaata 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  3766011 gaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaaca 3765913  T
Q  101 tgttcggtataa 112  Q
      ||||||||||    
T  3765912 ccttcggtataa 3765901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20242426 - 20242287
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatc--aaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaat 99  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| |||    
T  20242426 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtctctcaaggatcaactggatgaaatc-aaccaaggactcaaccccggagacacaaggagagtgaaat 20242328  T
Q  100 atgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaata 140  Q
    |  || ||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||    
T  20242327 acatttggtatgaacgtccaacgttggacgacaggagaata 20242287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22136410 - 22136271
Alignment:
Q  2 aaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatc--aaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaat 99  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| |||    
T  22136410 aaggttcggtacattaatgtcacgttaaaaggtctctcaaggatcaactggatgaaatc-aaccaaggactcaaccccggagacacaaggagagtgaaat 22136312  T
Q  100 atgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaata 140  Q
    |  || ||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||    
T  22136311 acatttggtatgaacgtccaacgttggacgacaggagaata 22136271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 28051295 - 28051415
Alignment:
Q  19 tgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtcc 118  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||  |||||||  ||||| | | ||||||||| | |||||||||||||| ||||  || ||||| |||||||    
T  28051295 tgtcacgttaaaaggtcttaaggatcaacttgatgaaatc-aaccatgaactcaaccccggagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtcc 28051393  T
Q  119 aacgctcgacgatgggagaata 140  Q
    |||| | ||||| |||||||||    
T  28051394 aacgttggacgacgggagaata 28051415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30257729 - 30257628
Alignment:
Q  142 cattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgag 241  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||  | |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||    
T  30257729 cattcagttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgag 30257630  T
Q  242 at 243  Q
    ||    
T  30257629 at 30257628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 35060258 - 35060161
Alignment:
Q  1 gaaggttcggcaccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaat 99  Q
    ||||||||||   |||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||  | || |||||||||||||||    
T  35060258 gaaggttcggtgtcttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatg-aattcaaccaacgagttaaccccagagacgcaaggagggtggaat 35060161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 140
Target Start/End: Original strand, 2402172 - 2402248
Alignment:
Q  64 aaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaata 140  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  2402172 aaggactcaaccccggagacacacggagggtggaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacgacgggagaata 2402248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 19242734 - 19242810
Alignment:
Q  19 tgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtgg 96  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||| |||||||    
T  19242734 tgtcacgttaaaagatatgaaggatcaattgaatgaaa-ttaaccaaagactcaactccggagacacaagaagggtgg 19242810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 1719 - 1948
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||| |||| || | ||||| |||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  1719 ccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactgactgaa-ttcagccaagaagtcaaccctagagacacaaggagggtggaacaatttcggtataa 1817  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  1818 acatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacggacatgttttgggagcacaacatgttccag 1917  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  1918 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagat 1948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 24834 - 25063
Alignment:
Q  13 ccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtataa 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  24834 ccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactggct-aaattcaaccagggagtcaaccccggagacacaaggagggtggaatacgttcggtatag 24932  T
Q  113 acgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacatgttcaag 212  Q
    |||| |||||||||| || |||||| || |||||| ||||||| ||||||||||  |||| || ||||  | |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  24933 acgtacaacgctcgaggaggggagagtagcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctag 25032  T
Q  213 tggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||||| || ||||  |||| ||||| ||||    
T  25033 tggatctatttgcggataacattgctaagat 25063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18123 - 17966
Alignment:
Q  85 caaggagggtggaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaa 184  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||  |     
T  18123 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacga-gggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgag 18025  T
Q  185 catcatttgggagcacaacatgttcaagtggatcaatatgcgtgtaacgttgctgagat 243  Q
    |||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18024 catgttttgggagcacaacatgttatagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagat 17966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Original strand, 63903 - 64095
Alignment:
Q  11 caccttggtgtcacgttaacaggtatcaaggatcaactgaatgaaatttaaccaaggagtcaaccccgcaaacacaaggagggtggaatatgttcggtat 110  Q
    ||||||||||| | ||||| |||  |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  63903 caccttggtgtaaggttaagaggcctcaaggatgaactgaatgaa-ttcaacaaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggagcacgttcggtat 64001  T
Q  111 aaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattcatttgggtgaaattaacgaatgacgataacgtgagaaacatcatttgggagcacaacat 205  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||| ||| || ||| ||||| |||||||  | |||  ||||||||||||||||    
T  64002 aaatgtccaacgctcgac-aagggagagtatcattcagttgagtggaatcaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacat 64095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University