View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8518A_low_348 (Length: 228)

Name: NF8518A_low_348
Description: NF8518A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8518A_low_348
NF8518A_low_348
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (21-228)||(17010864-17011071)
chr5 (23-228)||(22107500-22107704)
chr5 (21-226)||(262999-263203)
chr5 (23-225)||(33895711-33895912)
chr5 (23-228)||(29447854-29448058)
chr5 (23-207)||(6765700-6765883)
chr5 (23-143)||(20910982-20911102)
chr5 (23-143)||(18356131-18356251)
chr5 (25-143)||(10753203-10753321)
chr5 (23-143)||(40723734-40723854)
chr5 (23-121)||(15236982-15237080)
chr5 (23-121)||(19472867-19472965)
chr5 (23-121)||(20295708-20295806)
chr5 (96-143)||(11220587-11220634)
chr5 (96-143)||(11225173-11225220)
chr5 (96-143)||(11228996-11229043)
chr5 (21-81)||(33473270-33473330)
chr5 (96-143)||(11230985-11231032)
chr5 (163-226)||(24212326-24212388)
chr5 (96-141)||(11227008-11227053)
chr5 (179-228)||(23469779-23469828)
chr5 (23-86)||(18356308-18356370)
chr5 (23-86)||(20910863-20910925)
chr5 (183-226)||(35852581-35852624)
chr5 (186-226)||(41861565-41861605)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (21-228)||(35961594-35961801)
chr3 (23-225)||(324088-324289)
chr3 (23-226)||(52989788-52989990)
chr3 (23-228)||(43889692-43889896)
chr3 (23-228)||(16796344-16796540)
chr3 (23-228)||(12469751-12469955)
chr3 (23-226)||(11914082-11914284)
chr3 (22-225)||(14966022-14966224)
chr3 (23-209)||(18700373-18700558)
chr3 (82-215)||(16979087-16979220)
chr3 (23-207)||(54876456-54876639)
chr3 (26-205)||(21837298-21837476)
chr3 (23-207)||(17691774-17691957)
chr3 (21-162)||(22652036-22652176)
chr3 (23-143)||(12339640-12339760)
chr3 (54-207)||(17046182-17046334)
chr3 (23-143)||(4588920-4589040)
chr3 (26-143)||(5223238-5223355)
chr3 (23-140)||(15964814-15964931)
chr3 (23-140)||(15968738-15968855)
chr3 (23-140)||(15972662-15972779)
chr3 (23-143)||(11300577-11300697)
chr3 (23-143)||(37439783-37439903)
chr3 (25-143)||(19775607-19775725)
chr3 (23-143)||(11854575-11854695)
chr3 (23-114)||(16643135-16643226)
chr3 (23-121)||(4111396-4111494)
chr3 (23-121)||(7109562-7109660)
chr3 (23-121)||(7113497-7113595)
chr3 (23-121)||(11069932-11070030)
chr3 (23-121)||(11165676-11165774)
chr3 (23-121)||(22321528-22321626)
chr3 (23-121)||(22336583-22336681)
chr3 (23-121)||(27409791-27409889)
chr3 (23-121)||(28949588-28949686)
chr3 (23-121)||(55022731-55022829)
chr3 (53-160)||(14569057-14569163)
chr3 (23-121)||(4107544-4107642)
chr3 (23-120)||(30065811-30065908)
chr3 (127-226)||(24513793-24513891)
chr3 (26-120)||(15617239-15617333)
chr3 (54-216)||(6805702-6805866)
chr3 (47-121)||(14499189-14499263)
chr3 (140-228)||(24178705-24178792)
chr3 (176-225)||(324034-324083)
chr3 (21-81)||(41813-41873)
chr3 (176-228)||(10542485-10542537)
chr3 (54-150)||(13026425-13026521)
chr3 (54-150)||(13030017-13030113)
chr3 (23-86)||(14670914-14670977)
chr3 (179-228)||(5841807-5841856)
chr3 (176-225)||(10542539-10542588)
chr3 (176-225)||(12469700-12469749)
chr3 (23-84)||(15465068-15465129)
chr3 (176-225)||(18700589-18700638)
chr3 (180-225)||(43889902-43889947)
chr3 (21-81)||(16325247-16325307)
chr3 (134-226)||(36527721-36527804)
chr3 (179-228)||(10834199-10834248)
chr3 (179-226)||(3265111-3265158)
chr3 (23-86)||(14682413-14682476)
chr3 (165-226)||(6808095-6808155)
chr3 (106-143)||(15465039-15465076)
chr3 (21-59)||(16979218-16979256)
chr3 (149-207)||(17685711-17685768)
chr3 (164-226)||(49970129-49970191)
chr3 (88-117)||(4712055-4712084)
chr3 (179-224)||(15206916-15206961)
chr3 (179-224)||(15245998-15246043)
chr3 (183-228)||(32403059-32403104)
chr3 (155-216)||(41173226-41173287)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (21-219)||(5606-5804)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (22-228)||(18913795-18914001)
chr6 (22-228)||(18937053-18937259)
chr6 (21-228)||(15174161-15174368)
chr6 (23-225)||(15705509-15705710)
chr6 (23-224)||(15817587-15817785)
chr6 (23-228)||(17743228-17743432)
chr6 (26-226)||(15875236-15875435)
chr6 (23-226)||(28103964-28104167)
chr6 (23-226)||(17377863-17378065)
chr6 (23-210)||(22805801-22805987)
chr6 (23-209)||(19773608-19773784)
chr6 (54-228)||(19656109-19656282)
chr6 (23-143)||(27416005-27416125)
chr6 (23-143)||(23414819-23414939)
chr6 (23-143)||(27556577-27556697)
chr6 (23-143)||(18917413-18917533)
chr6 (23-143)||(16760134-16760254)
chr6 (23-143)||(31477957-31478077)
chr6 (23-140)||(22948950-22949067)
chr6 (23-140)||(22952906-22953023)
chr6 (23-140)||(23871394-23871511)
chr6 (23-140)||(23875350-23875467)
chr6 (23-143)||(1644547-1644667)
chr6 (23-140)||(18955910-18956027)
chr6 (23-121)||(8243722-8243820)
chr6 (23-121)||(11566723-11566821)
chr6 (23-113)||(14979453-14979543)
chr6 (23-121)||(19870451-19870549)
chr6 (23-121)||(23394929-23395027)
chr6 (23-117)||(22862811-22862905)
chr6 (23-121)||(23989781-23989879)
chr6 (23-140)||(14472113-14472230)
chr6 (23-121)||(12618991-12619087)
chr6 (107-160)||(23538745-23538798)
chr6 (65-160)||(17105771-17105865)
chr6 (23-85)||(18696480-18696542)
chr6 (21-81)||(23956148-23956208)
chr6 (176-225)||(17743177-17743226)
chr6 (46-179)||(18259918-18260053)
chr6 (46-171)||(22376646-22376774)
chr6 (179-228)||(28708500-28708549)
chr6 (176-228)||(27573086-27573138)
chr6 (23-82)||(18706301-18706360)
chr6 (54-209)||(20411538-20411695)
chr6 (164-226)||(18927751-18927812)
chr6 (54-216)||(23083039-23083203)
chr6 (165-226)||(2201077-2201137)
chr6 (165-226)||(22420925-22420985)
chr6 (176-221)||(27573194-27573239)
chr6 (176-228)||(27573140-27573192)
chr6 (179-228)||(18453158-18453207)
chr6 (179-228)||(20078266-20078315)
chr6 (155-207)||(22212369-22212421)
chr6 (183-222)||(17105737-17105776)
chr6 (164-226)||(19399671-19399733)
chr6 (179-228)||(23838151-23838199)
chr6 (183-219)||(20182715-20182751)
chr6 (183-219)||(22153240-22153276)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (21-227)||(15008105-15008311)
chr4 (22-228)||(15497100-15497306)
chr4 (21-223)||(10694953-10695155)
chr4 (21-223)||(10908719-10908921)
chr4 (21-228)||(15884121-15884328)
chr4 (23-228)||(17048200-17048404)
chr4 (25-228)||(40619676-40619872)
chr4 (23-228)||(13591992-13592195)
chr4 (23-226)||(14746649-14746851)
chr4 (63-226)||(26013334-26013498)
chr4 (54-228)||(53631353-53631526)
chr4 (23-143)||(43256224-43256344)
chr4 (23-140)||(14954314-14954431)
chr4 (23-180)||(19857419-19857576)
chr4 (23-140)||(25689712-25689829)
chr4 (23-143)||(10712695-10712815)
chr4 (23-143)||(10926465-10926585)
chr4 (23-143)||(12487550-12487670)
chr4 (23-140)||(27533868-27533985)
chr4 (23-121)||(9556391-9556489)
chr4 (23-121)||(14757569-14757667)
chr4 (23-120)||(17810134-17810231)
chr4 (23-118)||(4561481-4561576)
chr4 (45-180)||(14650718-14650856)
chr4 (23-121)||(5757085-5757183)
chr4 (23-121)||(33742241-33742337)
chr4 (21-81)||(28385529-28385589)
chr4 (54-216)||(19738228-19738391)
chr4 (54-150)||(15990254-15990350)
chr4 (164-226)||(9923224-9923285)
chr4 (54-216)||(15365050-15365214)
chr4 (93-216)||(13036559-13036683)
chr4 (179-228)||(24047395-24047444)
chr4 (164-226)||(11479574-11479635)
chr4 (134-180)||(14184994-14185040)
chr4 (155-216)||(10357291-10357352)
chr4 (179-228)||(14650679-14650728)
chr4 (183-220)||(15880661-15880698)
chr4 (179-228)||(26045389-26045438)
chr4 (179-228)||(26050570-26050619)
chr4 (176-228)||(13592197-13592248)
chr4 (132-216)||(27995892-27995975)
chr4 (46-86)||(50160275-50160315)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (21-228)||(29764344-29764551)
chr1 (21-226)||(50000615-50000819)
chr1 (26-228)||(48520362-48520563)
chr1 (21-182)||(46198431-46198592)
chr1 (23-207)||(51326664-51326847)
chr1 (23-226)||(12271407-12271609)
chr1 (23-209)||(48603322-48603507)
chr1 (23-207)||(27653288-27653471)
chr1 (23-143)||(33797456-33797576)
chr1 (23-209)||(22130972-22131146)
chr1 (23-143)||(1925276-1925396)
chr1 (23-143)||(20924290-20924410)
chr1 (23-143)||(20228956-20229076)
chr1 (23-117)||(13881447-13881541)
chr1 (95-216)||(20316499-20316619)
chr1 (23-121)||(1010584-1010682)
chr1 (23-121)||(16375606-16375704)
chr1 (23-121)||(21407216-21407314)
chr1 (23-121)||(52639402-52639500)
chr1 (170-228)||(23073013-23073071)
chr1 (179-225)||(23967693-23967739)
chr1 (173-226)||(11809466-11809519)
chr1 (176-225)||(48520311-48520360)
chr1 (179-228)||(14800505-14800554)
chr1 (179-228)||(14809379-14809428)
chr1 (176-225)||(20316434-20316483)
chr1 (179-228)||(20958084-20958133)
chr1 (179-228)||(28312490-28312539)
chr1 (23-86)||(41781654-41781718)
chr1 (134-209)||(636042-636116)
chr1 (183-226)||(25263068-25263111)
chr1 (182-228)||(21043380-21043426)
chr1 (165-226)||(8882114-8882174)
chr1 (165-226)||(43630342-43630402)
chr1 (179-228)||(47190577-47190626)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (21-227)||(26453850-26454056)
chr8 (25-228)||(23478219-23478422)
chr8 (21-228)||(19879967-19880174)
chr8 (23-226)||(22238085-22238286)
chr8 (23-225)||(37515559-37515760)
chr8 (23-226)||(23409648-23409850)
chr8 (23-225)||(18833416-18833617)
chr8 (23-207)||(17461118-17461301)
chr8 (25-197)||(19808430-19808601)
chr8 (95-228)||(22352887-22353019)
chr8 (49-228)||(5760532-5760710)
chr8 (23-143)||(21828161-21828281)
chr8 (109-228)||(44384821-44384939)
chr8 (23-140)||(18862792-18862909)
chr8 (21-180)||(19929554-19929715)
chr8 (23-143)||(21410789-21410909)
chr8 (23-143)||(21805281-21805401)
chr8 (23-114)||(23659371-23659462)
chr8 (23-121)||(21976817-21976915)
chr8 (23-121)||(22111792-22111890)
chr8 (23-121)||(43251674-43251772)
chr8 (65-143)||(14397962-14398040)
chr8 (23-121)||(19278430-19278528)
chr8 (23-105)||(16402068-16402150)
chr8 (21-81)||(8414416-8414476)
chr8 (21-81)||(11775008-11775068)
chr8 (23-86)||(23914029-23914092)
chr8 (23-121)||(21972732-21972826)
chr8 (123-216)||(18302800-18302892)
chr8 (179-228)||(22253260-22253309)
chr8 (179-228)||(22381827-22381876)
chr8 (164-221)||(27472555-27472612)
chr8 (164-221)||(38550250-38550307)
chr8 (46-86)||(21326718-21326758)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (21-228)||(10360-10566)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (21-223)||(33061-33263)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (21-226)||(22475-22680)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (21-224)||(21914765-21914968)
chr2 (23-228)||(34492200-34492405)
chr2 (23-226)||(24917963-24918165)
chr2 (23-226)||(27472272-27472474)
chr2 (23-226)||(34874278-34874480)
chr2 (23-209)||(23069349-23069534)
chr2 (23-226)||(23707354-23707556)
chr2 (23-226)||(24670848-24671050)
chr2 (23-226)||(21081802-21082004)
chr2 (23-226)||(22459628-22459830)
chr2 (23-226)||(24681269-24681469)
chr2 (23-180)||(18358799-18358956)
chr2 (62-207)||(24316190-24316333)
chr2 (23-143)||(30345138-30345258)
chr2 (23-143)||(41531151-41531271)
chr2 (82-209)||(20320723-20320849)
chr2 (23-143)||(1283228-1283348)
chr2 (23-143)||(31345051-31345171)
chr2 (23-121)||(24628626-24628724)
chr2 (23-121)||(27601657-27601755)
chr2 (25-121)||(12901661-12901757)
chr2 (23-121)||(24649218-24649316)
chr2 (23-121)||(27379580-27379678)
chr2 (23-121)||(27383626-27383724)
chr2 (23-120)||(10101792-10101889)
chr2 (164-220)||(13101727-13101783)
chr2 (54-216)||(20915189-20915353)
chr2 (23-86)||(9784673-9784736)
chr2 (179-228)||(21073588-21073637)
chr2 (123-209)||(24815507-24815592)
chr2 (53-228)||(39827970-39828138)
chr2 (187-228)||(34136916-34136957)
chr2 (123-209)||(24834908-24834993)
chr2 (179-228)||(9241903-9241951)
chr2 (176-225)||(20320872-20320921)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (21-228)||(16550710-16550917)
chr7 (23-226)||(46580741-46580943)
chr7 (23-225)||(32301141-32301342)
chr7 (23-223)||(8940105-8940304)
chr7 (21-228)||(16614745-16614952)
chr7 (23-207)||(15719867-15720050)
chr7 (23-209)||(14258320-14258505)
chr7 (23-209)||(16579628-16579813)
chr7 (23-209)||(16585850-16586035)
chr7 (21-226)||(32160908-32161111)
chr7 (22-226)||(15112796-15112999)
chr7 (23-209)||(16460831-16461016)
chr7 (23-226)||(16323904-16324105)
chr7 (23-207)||(16998464-16998647)
chr7 (63-226)||(14981541-14981703)
chr7 (23-207)||(8468589-8468772)
chr7 (23-207)||(17232790-17232973)
chr7 (63-197)||(15411017-15411150)
chr7 (23-207)||(14273386-14273569)
chr7 (23-142)||(2530202-2530320)
chr7 (47-226)||(15116336-15116511)
chr7 (23-192)||(17060490-17060658)
chr7 (23-143)||(1858897-1859017)
chr7 (23-143)||(13918591-13918711)
chr7 (23-143)||(25927314-25927434)
chr7 (54-207)||(1490151-1490303)
chr7 (23-140)||(45170153-45170270)
chr7 (23-143)||(39722105-39722225)
chr7 (45-143)||(15084035-15084133)
chr7 (22-121)||(26292256-26292355)
chr7 (23-121)||(32968-33066)
chr7 (23-121)||(12704806-12704904)
chr7 (23-121)||(12714725-12714823)
chr7 (23-121)||(12718529-12718627)
chr7 (23-121)||(16907348-16907446)
chr7 (23-121)||(18283227-18283325)
chr7 (23-121)||(12723440-12723538)
chr7 (23-121)||(16114102-16114200)
chr7 (23-121)||(16117255-16117353)
chr7 (23-121)||(18279264-18279362)
chr7 (23-120)||(70912-71009)
chr7 (23-120)||(75021-75118)
chr7 (176-228)||(32301084-32301136)
chr7 (176-225)||(16461047-16461096)
chr7 (176-225)||(16579548-16579597)
chr7 (176-225)||(16586066-16586115)
chr7 (23-86)||(20487533-20487596)
chr7 (54-216)||(709296-709460)
chr7 (179-228)||(11392103-11392152)
chr7 (48-216)||(16462183-16462353)
chr7 (54-209)||(41055629-41055785)
chr7 (183-226)||(11084957-11085000)
chr7 (187-228)||(38519348-38519389)
chr7 (179-228)||(42461925-42461974)
chr7 (134-226)||(14157164-14157247)
chr7 (179-226)||(9033442-9033489)
chr7 (183-226)||(9320580-9320623)
chr7 (182-228)||(11661248-11661294)
chr7 (182-228)||(14421926-14421972)
chr7 (179-228)||(130913-130962)
chr7 (179-228)||(18607430-18607478)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (23-209)||(125825-126010)
scaffold0011 (176-225)||(125745-125794)
scaffold0011 (179-228)||(38247-38296)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (23-226)||(7007-7209)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (23-226)||(53904-54106)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (23-228)||(268-472)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (23-209)||(722-907)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (21-226)||(4172-4376)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (21-226)||(4172-4376)
scaffold0306 (23-224)||(14852-15052)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (23-223)||(169815-170014)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (23-209)||(119878-120063)
scaffold0034 (180-228)||(117207-117255)
scaffold0034 (176-225)||(117156-117205)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (23-226)||(1358-1560)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (23-228)||(1231-1435)
scaffold0017 (23-228)||(7982-8186)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (23-207)||(2779-2962)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (23-226)||(67114-67316)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (23-180)||(3393-3550)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (23-207)||(15613-15797)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (21-226)||(70534-70732)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (23-196)||(1940-2112)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (23-207)||(409-592)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (22-226)||(24662-24863)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (23-207)||(85417-85600)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (23-226)||(6968-7170)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (28-207)||(10155-10333)
scaffold0107 (22-103)||(15479-15560)
scaffold0107 (179-228)||(36156-36205)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (56-226)||(6851-7020)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (23-181)||(21063-21221)
scaffold0096 (176-225)||(20981-21030)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (54-228)||(1347-1520)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (23-172)||(465-614)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (71-209)||(13490-13627)
scaffold0452 (176-225)||(13658-13707)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (23-216)||(7698-7889)
scaffold0278 (176-225)||(7633-7682)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (45-228)||(15431-15615)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (23-143)||(71236-71356)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (93-226)||(78256-78388)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (23-143)||(20276-20396)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (23-143)||(36233-36353)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (23-143)||(189524-189644)
scaffold0012 (179-228)||(221302-221351)
[»] scaffold0290 (2 HSPs)
scaffold0290 (23-144)||(93-214)
scaffold0290 (127-180)||(51-104)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (22-143)||(207648-207769)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (23-143)||(14234-14354)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (23-143)||(31058-31178)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (106-209)||(20672-20774)
scaffold0018 (123-209)||(7481-7566)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (23-143)||(234-354)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (23-143)||(11648-11768)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (45-228)||(7526-7703)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (23-143)||(32807-32927)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (45-228)||(56824-57001)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (23-125)||(39205-39307)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (65-143)||(6854-6932)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (23-143)||(80554-80674)
scaffold0029 (23-121)||(65675-65773)
scaffold0029 (23-121)||(61759-61857)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (23-144)||(36089-36208)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (23-121)||(58866-58964)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (25-121)||(12283-12379)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (26-121)||(5251-5346)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (45-228)||(166436-166613)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (23-121)||(311-409)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (23-121)||(67449-67546)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (23-120)||(4022-4119)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (46-209)||(11557-11722)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (135-226)||(21804-21894)
scaffold0019 (179-228)||(132893-132941)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (84-143)||(80562-80621)
scaffold0037 (23-105)||(80482-80564)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (23-92)||(17559-17628)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (21-81)||(176078-176138)
scaffold0001 (21-81)||(168724-168784)
scaffold0001 (54-216)||(446473-446637)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (23-89)||(6225-6291)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (179-228)||(2654-2703)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (53-150)||(8934-9033)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (149-209)||(3573-3632)
scaffold0165 (149-209)||(7637-7696)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (54-209)||(21235-21392)
scaffold0026 (155-216)||(145871-145932)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (164-226)||(5620-5681)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (134-228)||(8007-8092)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (164-226)||(732-793)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (23-80)||(105078-105135)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (134-226)||(10451-10534)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (179-226)||(126880-126927)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (179-226)||(625-672)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (179-228)||(18263-18312)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (179-228)||(3233-3282)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (187-228)||(8137-8178)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (183-226)||(7785-7828)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (57-216)||(12878-13039)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (183-226)||(69-112)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (183-226)||(362750-362793)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (134-216)||(55001-55082)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (59-123)||(1122-1187)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (179-228)||(10139-10188)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (155-216)||(11299-11359)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (187-228)||(1870-1911)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (179-228)||(9816-9864)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (155-216)||(20780-20840)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17011071 - 17010864
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17011071 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattg 17010972  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17010971 cttgtgctgcttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgccgttccaaagtattggagtcttaa 17010872  T
Q  221 gttgttga 228  Q
    ||||||||    
T  17010871 gttgttga 17010864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 22107500 - 22107704
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107500 tgttgttggttatgtcaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 22107599  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22107600 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagt 22107698  T
Q  223 tgttga 228  Q
    ||||||    
T  22107699 tgttga 22107704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 263203 - 262999
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  263203 aatgttgttggttatgtgaaataattatgtgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattg 263104  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | | ||| ||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  263103 cttgtgctgtttctgttgttgttgcatatagatcaagttgcaggtataggtctaagttgt-aaaaatgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaa 263005  T
Q  221 gttgtt 226  Q
    ||||||    
T  263004 gttgtt 262999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Original strand, 33895711 - 33895912
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    |||||| |||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33895711 tgttgtgggttttgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaactgct 33895810  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  33895811 tgtgctgtttatgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtattggtctaagttgt-aaagtcgtaagttgttgttccaaagtattggagtcttaagt 33895909  T
Q  223 tgt 225  Q
    |||    
T  33895910 tgt 33895912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29448058 - 29447854
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttg-ttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29448058 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaa-tgtataatgtttaaattgattgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 29447960  T
Q  122 ttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaag 221  Q
    ||||| || | |||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29447959 ttgtgttgctcctgttgatgttgagtattgattaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaag 29447861  T
Q  222 ttgttga 228  Q
    |||||||    
T  29447860 ttgttga 29447854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6765883 - 6765700
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||| ||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765883 tgttgttggttgtgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 6765784  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  6765783 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcatgtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagt 6765700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 20910982 - 20911102
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20910982 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtt 20911081  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  20911082 tgtgttgtttctgttgctgtt 20911102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18356251 - 18356131
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18356251 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttgagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtt 18356152  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  18356151 tgtgatgtttctgttgctgtt 18356131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10753321 - 10753203
Alignment:
Q  25 ttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttg 124  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10753321 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgctatgttgtgaattgcttg 10753222  T
Q  125 tgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  10753221 tgctgtttctgttgttgtt 10753203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 40723734 - 40723854
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   | || ||||||||||||||||||||||    
T  40723734 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataatagtattgttatgttgtgaattgct 40723833  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  40723834 tgtgttgtttctgttgctgtt 40723854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 15236982 - 15237080
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15236982 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 15237080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 19472867 - 19472965
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19472867 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 19472965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 20295806 - 20295708
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20295806 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 20295708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11220634 - 11220587
Alignment:
Q  96 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11220634 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11220587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11225220 - 11225173
Alignment:
Q  96 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11225220 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11225173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11229043 - 11228996
Alignment:
Q  96 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11229043 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11228996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Original strand, 33473270 - 33473330
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 81  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33473270 aatgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 33473330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11231032 - 11230985
Alignment:
Q  96 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11231032 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 11230985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24212388 - 24212326
Alignment:
Q  163 gatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  24212388 gatgttggtctaagttgta-aagttgtaagttgtcttttcaaagtattggagtcttaagttgtt 24212326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11227053 - 11227008
Alignment:
Q  96 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  11227053 attaatattgttatgttgtgaatttcatgtgctgtatctgttgctg 11227008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23469828 - 23469779
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23469828 gtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtgttggagtcttaagttgttga 23469779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18356370 - 18356308
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 86  Q
    ||||||||||||| ||| | | |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18356370 tgttgttggttatctgaaatatttatatgctttat-tggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 18356308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 86
Target Start/End: Original strand, 20910863 - 20910925
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 86  Q
    |||||||| |||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20910863 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttat-tggaaaatgtatgatgtataagttgttg 20910925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35852624 - 35852581
Alignment:
Q  183 aagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  35852624 aagttgtaagttgtcttttcaaagtattggagtcttaagttgtt 35852581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 41861565 - 41861605
Alignment:
Q  186 ttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41861565 ttgtaagttgtctttccaaagtattggaatcttaagttgtt 41861605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 35961594 - 35961801
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  35961594 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatatttttatgttgagaattg 35961693  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35961694 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaa 35961793  T
Q  221 gttgttga 228  Q
    ||||||||    
T  35961794 gttgttga 35961801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 324289 - 324088
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  324289 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 324190  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  324189 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagt 324091  T
Q  223 tgt 225  Q
    |||    
T  324090 tgt 324088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 52989788 - 52989990
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989788 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 52989887  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  52989888 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 52989986  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  52989987 tgtt 52989990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 43889692 - 43889896
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43889692 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtagaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtctctcattaatattgttatgttgtgaattgct 43889791  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43889792 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaaattgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagt 43889890  T
Q  223 tgttga 228  Q
    ||||||    
T  43889891 tgttga 43889896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16796540 - 16796344
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16796540 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 16796441  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16796440 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg---------gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagt 16796350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12469955 - 12469751
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12469955 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtgtgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattggt 12469856  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12469855 tgtgttgtttttgttgctgttgaatatttataaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttcaaaagtattggagtcttaagt 12469757  T
Q  223 tgttga 228  Q
    ||||||    
T  12469756 tgttga 12469751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 11914082 - 11914284
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||| ||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11914082 tgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 11914181  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11914182 tgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 11914280  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  11914281 tgtt 11914284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14966224 - 14966022
Alignment:
Q  22 atgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  14966224 atgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgt 14966125  T
Q  122 ttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  14966124 ttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagtttactttccaaagtattggagtcttaag 14966026  T
Q  222 ttgt 225  Q
    ||||    
T  14966025 ttgt 14966022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 18700373 - 18700558
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18700373 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgggaaatgtatgatgtttaagtttttgatgtttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 18700472  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18700473 agtgctgtttctgttgctgttgaatatagatcaagttgcaggtgttgatctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 18700558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 82 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16979220 - 16979087
Alignment:
Q  82 tgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtc 181  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16979220 tgttgttggttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtc 16979121  T
Q  182 taagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16979120 taagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagt 16979087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Original strand, 54876456 - 54876639
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  54876456 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttccttaatattgttatgttgtaaattgct 54876555  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  54876556 tgtactgtttctgttgctgttgcataatgatcaagttgcaggtgttgatctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagt 54876639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21837476 - 21837298
Alignment:
Q  26 tgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 125  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||    
T  21837476 tgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttatgttgttgatgcttttcatgaatattattatgttgtgaatgacttgt 21837377  T
Q  126 gctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaa 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  21837376 actgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgttgatgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaa 21837298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Original strand, 17691774 - 17691957
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  17691774 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttcgttaatattgttatgtgttgaattgct 17691873  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  17691874 tgtactgtttctgttgctgttgcataatgatcaagttgcaggtgttgatctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagt 17691957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22652176 - 22652036
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22652176 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgcattatgtggaaa-tgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatactgttatgttgtgaattg 22652078  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 162  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22652077 cttgtgttgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgca 22652036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12339760 - 12339640
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339760 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 12339661  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12339660 tgtgctgtttctgttgctgtt 12339640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17046334 - 17046182
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgat 153  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17046334 ttatgtggaatatatatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgattgtactgtttctgttgctgttgaatattgat 17046235  T
Q  154 caagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  17046234 caagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagt 17046182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 4588920 - 4589040
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    |||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588920 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 4589019  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4589020 tgtgctgtttctgttgctgtt 4589040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5223355 - 5223238
Alignment:
Q  26 tgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 125  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5223355 tgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtttgt 5223256  T
Q  126 gctgtttctgttgctgtt 143  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  5223255 gctgtttttgttgctgtt 5223238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15964931 - 15964814
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15964931 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgttgtgaattgct 15964832  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgct 140  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15964831 tgtgctgtttctgttgct 15964814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15968855 - 15968738
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15968855 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgttgtgaattgct 15968756  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgct 140  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15968755 tgtgctgtttctgttgct 15968738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15972779 - 15972662
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15972779 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgttgtgaattgct 15972680  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgct 140  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15972679 tgtgctgtttctgttgct 15972662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 11300577 - 11300697
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  11300577 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 11300676  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  11300677 tgtgttgtttctgttgctgtt 11300697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 37439783 - 37439903
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  37439783 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 37439882  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  37439883 tgtgctgtttatgttgctgtt 37439903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19775725 - 19775607
Alignment:
Q  25 ttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttg 124  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19775725 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgctatgttgtgaattgtttg 19775626  T
Q  125 tgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19775625 tgctgtttctgttgctgtt 19775607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11854695 - 11854575
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11854695 tgttgttggttatgtgaaatgtttatatgtcttatgaggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctccgtattaatattgttatgttgtgaattgct 11854596  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    || ||||||| ||||||||||    
T  11854595 tgagctgtttatgttgctgtt 11854575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16643226 - 16643135
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 114  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16643226 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcagtaatattgttatgttgt 16643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 4111396 - 4111494
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4111396 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 4111494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 7109660 - 7109562
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7109660 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 7109562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 7113595 - 7113497
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7113595 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 7113497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11070030 - 11069932
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11070030 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 11069932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 11165676 - 11165774
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11165676 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 11165774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22321626 - 22321528
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22321626 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 22321528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22336681 - 22336583
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22336681 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 22336583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 27409791 - 27409889
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27409791 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 27409889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 28949686 - 28949588
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28949686 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 28949588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 55022829 - 55022731
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  55022829 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 55022731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 160
Target Start/End: Original strand, 14569057 - 14569163
Alignment:
Q  53 cttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattga 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14569057 cttatgtggaaaatgtatgatgttaaaga-gttgatgtttgtcattattattcatatgttgtgaattacttgtgttgtttctgttgctgttgaatattga 14569155  T
Q  153 tcaagttg 160  Q
    ||||||||    
T  14569156 tcaagttg 14569163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 4107544 - 4107642
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4107544 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 4107642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 30065908 - 30065811
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    |||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30065908 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 30065811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24513891 - 24513793
Alignment:
Q  127 ctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24513891 ctgttgctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtggta-aagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagttgtt 24513793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15617333 - 15617239
Alignment:
Q  26 tgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15617333 tgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 15617239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 6805702 - 6805866
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt-ttcattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgtttctgttgctgttgaatatt 150  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || || ||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||  ||||||| |||||||||||    
T  6805702 ttatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttattcattaaagttgttatgttgtgagttgtttatgtgctgcatctgttgttgttgaatatt 6805801  T
Q  151 gatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
     || ||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  6805802 aattaagttgcaagtgttggtctaagtt-acaaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtc 6805866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 14499263 - 14499189
Alignment:
Q  47 atatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14499263 atatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagtggttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 14499189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Original strand, 24178705 - 24178792
Alignment:
Q  140 tgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24178705 tgttgaatattaattaatttgcaggtgttggtttaagttgta-aagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaaggtgttga 24178792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 324083 - 324034
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  324083 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgt 324034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 41873 - 41813
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 81  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41873 aatgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 41813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 228
Target Start/End: Original strand, 10542485 - 10542537
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10542485 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtactggagtcttaagttgttga 10542537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Original strand, 13026425 - 13026521
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatatt 150  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| | || || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  13026425 ttatgtggaatatgtatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttattatgtgaattgcttgtgctgtttctgctgttgttgattatt 13026521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Original strand, 13030017 - 13030113
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatatt 150  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| | || || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  13030017 ttatgtggaatatgtatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttattatgtgaattgcttgtgctgtttctgctgttgttgattatt 13030113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14670977 - 14670914
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 86  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14670977 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 14670914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5841856 - 5841807
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5841856 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagccttaagttgttga 5841807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 10542539 - 10542588
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10542539 gttgtctaagttgtaagttgttgttccaaagtattggagtcttaagttgt 10542588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12469749 - 12469700
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12469749 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaattattggagtcttaagttgt 12469700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15465129 - 15465068
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgt 84  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15465129 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttatgttgt 15465068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 18700589 - 18700638
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18700589 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggaatcttaagttgt 18700638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Original strand, 43889902 - 43889947
Alignment:
Q  180 tctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43889902 tctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgt 43889947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Original strand, 16325247 - 16325307
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 81  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16325247 aatgttgttggttatgtgaaataactatatgccttacgtggaaaatgtatgatgtttaagt 16325307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36527804 - 36527721
Alignment:
Q  134 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  36527804 tgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggt---------ctaagttgtaagttgtctttccaaagtattggaatcttaagttgtt 36527721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 10834199 - 10834248
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10834199 gtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 10834248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Original strand, 3265111 - 3265158
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3265111 gtctaagttgtaagttgtctttccaaagtattggaatcttaagttgtt 3265158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14682476 - 14682413
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 86  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  14682476 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaattgacgatgtttaagttgttg 14682413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6808155 - 6808095
Alignment:
Q  165 tgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6808155 tgttggtctaagttgta-aagttgtaagttgtctttccaaagtattgaagtcttaagttgtt 6808095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15465076 - 15465039
Alignment:
Q  106 ttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15465076 ttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 15465039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 16979256 - 16979218
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgt 59  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16979256 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgt 16979218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 207
Target Start/End: Original strand, 17685711 - 17685768
Alignment:
Q  149 ttgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  17685711 ttgatcaagttgcaggtgttgatctaagttgta-aagttgtaagttgtctttccaaagt 17685768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 49970129 - 49970191
Alignment:
Q  164 atgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  49970129 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaagtattggaattttaagttgtt 49970191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 117
Target Start/End: Original strand, 4712055 - 4712084
Alignment:
Q  88 tgcttttcattaatattgttatgttgtgaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4712055 tgcttttcattaatattgttatgttgtgaa 4712084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15206961 - 15206916
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttg 224  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15206961 gtctaagatgaaagttgtcgttccaaagtattggagtcctaagttg 15206916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15246043 - 15245998
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttg 224  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15246043 gtctaagatgaaagttgtcgttccaaagtattggagtcctaagttg 15245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 228
Target Start/End: Original strand, 32403059 - 32403104
Alignment:
Q  183 aagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  32403059 aagttgtaagatgtcgttccaaagtgttggattcttaagttgttga 32403104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Original strand, 41173226 - 41173287
Alignment:
Q  155 aagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||| ||||||    
T  41173226 aagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtc 41173287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5804 - 5606
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5804 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatagttatgttgtgaattg 5705  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtctta 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5704 cttgtgatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtctta 5606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18914001 - 18913795
Alignment:
Q  22 atgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18914001 atgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgc 18913902  T
Q  122 ttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18913901 ttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaag 18913802  T
Q  222 ttgttga 228  Q
    |||||||    
T  18913801 ttgttga 18913795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18937259 - 18937053
Alignment:
Q  22 atgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18937259 atgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgc 18937160  T
Q  122 ttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18937159 ttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaag 18937060  T
Q  222 ttgttga 228  Q
    |||||||    
T  18937059 ttgttga 18937053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 15174161 - 15174368
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15174161 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgacttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgagaatta 15174260  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15174261 cttgtgctatttatgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaa 15174360  T
Q  221 gttgttga 228  Q
    ||||||||    
T  15174361 gttgttga 15174368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Original strand, 15705509 - 15705710
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15705509 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtataagttgatgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 15705608  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  15705609 tgtgctgtttctgttgctgtttaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaaat 15705707  T
Q  223 tgt 225  Q
    |||    
T  15705708 tgt 15705710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 15817587 - 15817785
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15817587 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtagttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 15817686  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    | || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15817687 tttg-tgtttct-atgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagt 15817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17743432 - 17743228
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17743432 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 17743333  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17743332 tgtgttgtttctattgctgttgaagattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttg-caaagttgcaggttgtcgttccaaagtattggagtcttaagt 17743234  T
Q  223 tgttga 228  Q
    ||||||    
T  17743233 tgttga 17743228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15875435 - 15875236
Alignment:
Q  26 tgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 125  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15875435 tgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgataattttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 15875336  T
Q  126 gctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| || |||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15875335 gttgtttctgttgctgttacatattgatcaagttgcaagtgttggtctatgttgt-aaaattgtaagttgtctttccaaagtatcggagttttaagttgt 15875237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 28103964 - 28104167
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28103964 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 28104063  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  28104064 tgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagtttcaggtgttggtctaagtttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtatttgagtcttaagt 28104163  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  28104164 tgtt 28104167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 17377863 - 17378065
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377863 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttatgttcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 17377962  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17377963 tgtattgtttctgttgttgttgtatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 17378061  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  17378062 tgtt 17378065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22805987 - 22805801
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22805987 tgttgttggttatgtgaaatatttatattcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 22805888  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22805887 cgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcattccaaagtatc 22805801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 19773608 - 19773784
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773608 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 19773707  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19773708 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgtaggt----------gttgtctaagttgtaagttatcgttccaaagtat 19773784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 228
Target Start/End: Original strand, 19656109 - 19656282
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgat 153  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || || || |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19656109 ttatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcatgtgttgtttctgttgctgttgaatattgat 19656208  T
Q  154 caagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||||||||  |||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19656209 caagttgcaagtgttggtcaaagttgt-aaagttgtaagttgtcattccaaagtattggagtcttaagttgttga 19656282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 27416005 - 27416125
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27416005 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 27416104  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27416105 tgtgctgtttctgttgctgtt 27416125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23414939 - 23414819
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414939 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 23414840  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23414839 tgtgctgtttctgttgctgtt 23414819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27556697 - 27556577
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556697 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 27556598  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27556597 tgtgctgtttctgttgctgtt 27556577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 18917413 - 18917533
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917413 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 18917512  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18917513 tgtgctgtttctgttgctgtt 18917533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16760254 - 16760134
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16760254 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 16760155  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16760154 tgtgctgtttctgttgctgtt 16760134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 31477957 - 31478077
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  31477957 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 31478056  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31478057 tgtgctgtttctgttgctgtt 31478077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22949067 - 22948950
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22949067 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 22948968  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgct 140  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22948967 tgtgctgtttctgttgct 22948950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22953023 - 22952906
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22953023 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgagaattgct 22952924  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgct 140  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22952923 tgtgctgtttctgttgct 22952906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23871511 - 23871394
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23871511 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgagaattgct 23871412  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgct 140  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23871411 tgtgctgtttctgttgct 23871394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23875467 - 23875350
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23875467 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgagaattgct 23875368  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgct 140  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23875367 tgtgctgtttctgttgct 23875350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1644667 - 1644547
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  1644667 tgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgct 1644568  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1644567 tgtgctgtttctgttgctgtt 1644547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Original strand, 18955910 - 18956027
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||     
T  18955910 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgca 18956009  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgct 140  Q
    || |||||||||||||||    
T  18956010 tgcgctgtttctgttgct 18956027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 8243820 - 8243722
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8243820 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 8243722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11566821 - 11566723
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11566821 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 11566723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 113
Target Start/End: Original strand, 14979453 - 14979543
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttg 113  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14979453 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgattttcattaatattgttatgttg 14979543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 19870549 - 19870451
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19870549 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 19870451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23395027 - 23394929
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23395027 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 23394929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22862905 - 22862811
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaa 117  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22862905 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 22862811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23989879 - 23989781
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    |||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23989879 tgttgttggttaggtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 23989781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14472230 - 14472113
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||     
T  14472230 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtataatgttgaagttattgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgca 14472131  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgct 140  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14472130 tgtgctgtttctgttgct 14472113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 12618991 - 12619087
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12618991 tgttgttggttatgtga-aatatt-tatgtcttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgctgtgaattgc 12619087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23538798 - 23538745
Alignment:
Q  107 tatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23538798 tatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 23538745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17105865 - 17105771
Alignment:
Q  65 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 160  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17105865 atgtatgatgttaaagt-gttgatgtttgtcattattattgatatgttgagaattgcctgtgttgtttctgttgctgttgaacattgatcaagttg 17105771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18696542 - 18696480
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 85  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18696542 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 18696480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23956208 - 23956148
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 81  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23956208 aatgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 23956148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17743226 - 17743177
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17743226 gttgtctaagttttaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgt 17743177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 179
Target Start/End: Original strand, 18259918 - 18260053
Alignment:
Q  46 tatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaat-attgttatgttgtgaattgct--tgtgctgtttctgttgctgt 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| | ||||  |||| ||| |||| || ||     
T  18259918 tatatgtattatgtggaaaatgtatgatgttcaagttgttgttgattatcattgatcattgttatgttgtg-agtgcttatgtgatgtctctgctgttgc 18260016  T
Q  143 tgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttg 179  Q
    |||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  18260017 tgaatattaattaagttgcaagtgttggtctaagttg 18260053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 171
Target Start/End: Original strand, 22376646 - 22376774
Alignment:
Q  46 tatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcatt-aatattgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgt 142  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| || ||  |||| | |||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||| || |||    
T  22376646 tatatgtattatgtgaaaaatgtatgatgttgaggttgttgttgattaccattgattattgttatgttgtgagttgcttacgtgctgcctctgctgttgt 22376745  T
Q  143 tgaatattgatcaagttgcagatgttggt 171  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  22376746 tgaatattgattaagttgcaagtgttggt 22376774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28708549 - 28708500
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28708549 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagccttaagttgttga 28708500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 228
Target Start/End: Original strand, 27573086 - 27573138
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27573086 gttgtctaagttgtgagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagttattga 27573138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18706360 - 18706301
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtt 82  Q
    |||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18706360 tgtttttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtt 18706301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Original strand, 20411538 - 20411695
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt-ttcattaatattgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatatt 150  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||  || || ||||||||  ||||||||||||||  || ||  ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  20411538 ttatgtggaatatgtatgatgttggagttgttattgtttattcattaacgttgttatgttgtgagctgtttatgtgctgcctctgttgttgttgaatatt 20411637  T
Q  151 gatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
     || ||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20411638 aattaagttgcaagtgttggtctaagtt-acaaagttgtaagatgttgttccaaagtat 20411695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18927812 - 18927751
Alignment:
Q  164 atgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18927812 atgttggtctaagttgta-aagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagttgtt 18927751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 23083039 - 23083203
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt-ttcattaatattgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatatt 150  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||  || || |||||| || || |||||||||||  || ||  ||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  23083039 ttatgtggaatatgtctgatgttgaagttgttattgtttattcattgatgttattatgttgtgagctgtttatgtgctgcctctattgttgttgaatatt 23083138  T
Q  151 gatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
     || ||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23083139 aattaagttgcaagtgttggtctaagtta-caaagttgtaagatgtcgttccaaagtattggagtc 23083203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2201137 - 2201077
Alignment:
Q  165 tgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2201137 tgttggtctaagttgta-aagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagttgtt 2201077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22420985 - 22420925
Alignment:
Q  165 tgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22420985 tgttggtctaagttgta-aagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagttgtt 22420925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 221
Target Start/End: Original strand, 27573194 - 27573239
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaag 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27573194 gttgtctaagttgtaagttttcgttccaaagtattggagtcttaag 27573239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 228
Target Start/End: Original strand, 27573140 - 27573192
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27573140 gttgtctaagttgtgagctgtcgttccaaagtatttgagtcttaagttgttga 27573192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18453207 - 18453158
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18453207 gtctaagatgtaagatgtcgtttcaaagtattggagtcttaagttgttga 18453158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 20078266 - 20078315
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20078266 gtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtactggagtcttaagttgttga 20078315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Original strand, 22212369 - 22212421
Alignment:
Q  155 aagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22212369 aagttgcaagtgttggtctaagttgtctaagttgtaagtcgttgttccaaagt 22212421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17105776 - 17105737
Alignment:
Q  183 aagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17105776 aagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 17105737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19399733 - 19399671
Alignment:
Q  164 atgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  19399733 atgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaagtattggaattttaagttgtt 19399671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23838199 - 23838151
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23838199 gtctaagatgtaagatgtcgt-ccaaagtattggagtcttaagttgttga 23838151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20182751 - 20182715
Alignment:
Q  183 aagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtctta 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20182751 aagttgttagttgtcgttccaaagtattggagtctta 20182715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Original strand, 22153240 - 22153276
Alignment:
Q  183 aagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtctta 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22153240 aagttgttagttgtcgttccaaagtattggagtctta 22153276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15008311 - 15008105
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15008311 aatgttgttggttatgtgaaataattatatatcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattg 15008212  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  15008211 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgtttcaaagtattggagtcttac 15008112  T
Q  221 gttgttg 227  Q
    |||||||    
T  15008111 gttgttg 15008105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Original strand, 15497100 - 15497306
Alignment:
Q  22 atgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  15497100 atgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgagaattga 15497199  T
Q  122 ttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaag 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15497200 ttgtgatgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttttccttccaaagtattggagtcttaag 15497299  T
Q  222 ttgttga 228  Q
    |||||||    
T  15497300 ttgttga 15497306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Original strand, 10694953 - 10695155
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10694953 aatgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattg 10695052  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10695053 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtccaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaa 10695152  T
Q  221 gtt 223  Q
    |||    
T  10695153 gtt 10695155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Original strand, 10908719 - 10908921
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908719 aatgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattg 10908818  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10908819 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtccaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaa 10908918  T
Q  221 gtt 223  Q
    |||    
T  10908919 gtt 10908921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 15884121 - 15884328
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15884121 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgagaattg 15884220  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  15884221 cttgtgttgtttctgttgatgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagatgtctaagtcgtaagttgtcgttccaaattattggaatcttaa 15884320  T
Q  221 gttgttga 228  Q
    ||||||||    
T  15884321 gttgttga 15884328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 17048200 - 17048404
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048200 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 17048299  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17048300 tgtgctgtttctgttgttgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagt 17048398  T
Q  223 tgttga 228  Q
    ||||||    
T  17048399 tgttga 17048404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40619872 - 40619676
Alignment:
Q  25 ttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttg 124  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40619872 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaggttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgtgaattgcttg 40619773  T
Q  125 tgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttg 224  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40619772 tgctgtttctgttactgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaag-------ttgtcgttccaaagtattggagtcttaagttg 40619680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 13591992 - 13592195
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13591992 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaa-tgtatgatgtttaagttgatgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgct 13592090  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13592091 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgaaggtgttggtctaagttgt-agagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagt 13592189  T
Q  223 tgttga 228  Q
    ||||||    
T  13592190 tgttga 13592195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 14746649 - 14746851
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746649 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 14746748  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  14746749 tgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttttctttccaaagtattggagtcttaagt 14746847  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  14746848 tgtt 14746851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26013498 - 26013334
Alignment:
Q  63 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct--gttgaatattgatcaagttg 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  26013498 aaatgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgggttgcatattgatcaagttg 26013399  T
Q  161 cagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26013398 cagatgttggtttaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggattcttaagttgtt 26013334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 228
Target Start/End: Original strand, 53631353 - 53631526
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgat 153  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53631353 ttatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgat 53631452  T
Q  154 caagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53631453 caagttgcaagtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcattccaaagtattggagtcttaagttgttga 53631526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 43256224 - 43256344
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43256224 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgttgtgaattgct 43256323  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43256324 tgtgctgtttctgttgctgtt 43256344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Original strand, 14954314 - 14954431
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14954314 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 14954413  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgct 140  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14954414 tgtgctgtttctgttgct 14954431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19857576 - 19857419
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| |   | ||| | |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19857576 tgttgttggttatgtgaaatgttcataagccttatgtggagaatatatgatatttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttgtgaattact 19857477  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgt 180  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  19857476 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaggatgcaggtgttggtttaagttgt 19857419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 25689829 - 25689712
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25689829 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 25689730  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgct 140  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25689729 tgtgctgtttctgttgct 25689712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10712815 - 10712695
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10712815 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttgtgttgtgaattgct 10712716  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10712715 tgtgctgtttctgttgctgtt 10712695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10926585 - 10926465
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10926585 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttgtgttgtgaattgct 10926486  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10926485 tgtgctgtttctgttgctgtt 10926465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12487670 - 12487550
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  12487670 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 12487571  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12487570 tgtgctgtttctgttgctgtt 12487550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27533985 - 27533868
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||     
T  27533985 tgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgca 27533886  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgct 140  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27533885 tgtgctgtttctgttgct 27533868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 9556489 - 9556391
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9556489 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 9556391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 14757569 - 14757667
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14757569 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 14757667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 17810231 - 17810134
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    |||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17810231 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 17810134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 118
Target Start/End: Original strand, 4561481 - 4561576
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaat 118  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  4561481 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaataatgttatgttgtgaat 4561576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14650856 - 14650718
Alignment:
Q  45 ttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgttt-ctgttgctg 141  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||| ||    
T  14650856 ttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgctatttcctgttgttg 14650757  T
Q  142 ttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgt 180  Q
    |||||||||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  14650756 ttgaatattagtcaagctgcaagtgttggtctaagttgt 14650718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 5757085 - 5757183
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5757085 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttggtgcttcacattaatattgttatgttgtggattgc 5757183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 33742337 - 33742241
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33742337 tgttgttggttatgtga-aatatt-tatgtcttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgctgtgaattgc 33742241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28385589 - 28385529
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 81  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28385589 aatgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 28385529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19738391 - 19738228
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt-ttcattaatattgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatatt 150  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || || ||||||||  ||||||||||||||  || ||  ||||||  ||||||| | |||||||||    
T  19738391 ttatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttattcattaacgttgttatgttgtgagatgtttatgtgctgcctctgttgtt-ttgaatatt 19738293  T
Q  151 gatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  19738292 aatcaagttgcaagtgttggtctaagtta-caaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtc 19738228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15990350 - 15990254
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatatt 150  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| | || || || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  15990350 ttatgtggaatatgtatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttataatgtgaattgcttgtgttgtttctgctgttgttgattatt 15990254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9923285 - 9923224
Alignment:
Q  164 atgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9923285 atgttggtctaagttgta-aagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagttgtt 9923224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15365214 - 15365050
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt-ttcattaatattgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatatt 150  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  | ||| || |  |||||||||||||| ||| ||  ||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  15365214 ttatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttaatgtatattcgttgacgttgttatgttgtgagttgtttatgtgttgcctctgttgttgttgaatatt 15365115  T
Q  151 gatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
     || ||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  15365114 aattaagttgcaagtgttggtctaagtt-acaaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtc 15365050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 216
Target Start/End: Original strand, 13036559 - 13036683
Alignment:
Q  93 ttcattaatattgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgta 190  Q
    ||||||||  ||||||||||||||  || ||  ||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||  | ||||||||    
T  13036559 ttcattaacgttgttatgttgtgagctgtttatgtgctgcctctgttgttgttgaatattaattaagttgcaagtgttggtctaagtt-acaaagttgta 13036657  T
Q  191 agttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||    
T  13036658 agatgttgttccaaagtattggagtc 13036683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 24047395 - 24047444
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24047395 gtctaagatgtaagatttcgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 24047444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 11479574 - 11479635
Alignment:
Q  164 atgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||    
T  11479574 atgttggtctaagttgta-aagttgtaagttgtctctctaaagtattggagtcttaagttgtt 11479635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14185040 - 14184994
Alignment:
Q  134 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgt 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  14185040 tgttgctgttgtatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgt 14184994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Original strand, 10357291 - 10357352
Alignment:
Q  155 aagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||| ||||||    
T  10357291 aagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtc 10357352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14650728 - 14650679
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||    
T  14650728 gtctaagttgtaacttgtcgttccaaagtattggattattaaattgttga 14650679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15880698 - 15880661
Alignment:
Q  183 aagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15880698 aagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaa 15880661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 26045389 - 26045438
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  26045389 gtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtgttggagtcctaagttgttga 26045438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 26050570 - 26050619
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  26050570 gtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtgttggagtcctaagttgttga 26050619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 228
Target Start/End: Original strand, 13592197 - 13592248
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13592197 gttgtctaagttgtt-gatgttgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 13592248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27995975 - 27995892
Alignment:
Q  132 tctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  27995975 tctgttgttgttgaatattaattaagttgcaagtgttggtctaagtt-acaaagttgtaagatgttattccaaagtattggagtc 27995892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 50160315 - 50160275
Alignment:
Q  46 tatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 86  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  50160315 tatatgtgttatgtggaaaatgtatgaagttgaagttgttg 50160275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 29764344 - 29764551
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29764344 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgttttcaattaatattgttatgttgtgaattg 29764443  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29764444 cttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaa 29764543  T
Q  221 gttgttga 228  Q
    ||||||||    
T  29764544 gttgttga 29764551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 50000819 - 50000615
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50000819 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgtgaattg 50000720  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50000719 cttgtgctatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtggt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaa 50000621  T
Q  221 gttgtt 226  Q
    ||||||    
T  50000620 gttgtt 50000615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48520563 - 48520362
Alignment:
Q  26 tgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 125  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48520563 tgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgatatgttgtgaattgcttgt 48520464  T
Q  126 gctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48520463 gctgtttctattgccgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaaattgt-aaagttgcaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgt 48520365  T
Q  226 tga 228  Q
    |||    
T  48520364 tga 48520362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Original strand, 46198431 - 46198592
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198431 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgaggcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 46198530  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtct 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  46198531 cttgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtct 46198592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 51326847 - 51326664
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51326847 tgttgttggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 51326748  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  51326747 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtataagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagt 51326664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12271609 - 12271407
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| |   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12271609 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaattttgttatgctgtgaattgct 12271510  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  12271509 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggaatcttaagt 12271411  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  12271410 tgtt 12271407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 48603507 - 48603322
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||    
T  48603507 tgttgttggctatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgatggaaattgct 48603408  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603407 tgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-taagttgtaagttgtcgttccaaagtat 48603322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Original strand, 27653288 - 27653471
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27653288 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtagaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 27653387  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  27653388 tgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagatgcagatgttggtctaagttat-aaagttgtaagttgtctttccaaagt 27653471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33797576 - 33797456
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33797576 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 33797477  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33797476 tgtgctgtttctgttgctgtt 33797456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 22130972 - 22131146
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgttt-aagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||            ||||||||||||    
T  22130972 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttttaagttgttgatgcttctcat------------gttgtgaattgc 22131059  T
Q  122 ttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22131060 ttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttctcgttccaaagtat 22131146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 1925276 - 1925396
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  1925276 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 1925375  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1925376 tgtgctgtttctgttgctgtt 1925396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 20924290 - 20924410
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  20924290 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 20924389  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20924390 tgtgctgtttctgttgctgtt 20924410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 20228956 - 20229076
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  20228956 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgct 20229055  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20229056 tgtgctgtttctgttgctgtt 20229076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Original strand, 13881447 - 13881541
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaa 117  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13881447 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaa 13881541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20316619 - 20316499
Alignment:
Q  95 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagtt 194  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  20316619 cattgatattgacatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagtttcaggtgttggtctaaattgt-aaagttgtaagtt 20316521  T
Q  195 gtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  20316520 atcgttccaaagtattggagtc 20316499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1010682 - 1010584
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1010682 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 1010584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 16375606 - 16375704
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16375606 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16375704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 21407314 - 21407216
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21407314 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 21407216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 52639500 - 52639402
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  52639500 tgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaagatgtttgatgtctaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 52639402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23073071 - 23073013
Alignment:
Q  170 gtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23073071 gtttaagttgtctaagttgtaatttatcgttccaaagtattggagacttaagttgttga 23073013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23967739 - 23967693
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23967739 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgt 23967693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 226
Target Start/End: Original strand, 11809466 - 11809519
Alignment:
Q  173 taagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11809466 taagttgtctaagttgtaagttgtatttccaaagtattggagtcttaagttgtt 11809519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48520360 - 48520311
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48520360 gttgtctaagttgtaagttgccgttccaaagtattggagtcttaagttgt 48520311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14800554 - 14800505
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14800554 gtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 14800505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14809428 - 14809379
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14809428 gtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 14809379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20316483 - 20316434
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20316483 gttgtctaagttgtgagttgtcgttccaaagtattagagtcttaagttgt 20316434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20958133 - 20958084
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20958133 gtctaagttgtaagatttcgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 20958084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28312539 - 28312490
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28312539 gtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 28312490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 86
Target Start/End: Original strand, 41781654 - 41781718
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtgg-aaaatgtatgatgtttaagttgttg 86  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41781654 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaaatgtacgatgtttaagttgttg 41781718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 636042 - 636116
Alignment:
Q  134 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  636042 tgttgctgttgtatattgatcaagttgtacgtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttctaaagtat 636116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 226
Target Start/End: Original strand, 25263068 - 25263111
Alignment:
Q  183 aagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25263068 aagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagttgtt 25263111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 182 - 228
Target Start/End: Original strand, 21043380 - 21043426
Alignment:
Q  182 taagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21043380 taagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 21043426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8882174 - 8882114
Alignment:
Q  165 tgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  8882174 tgttggtctaagttgta-aagttgtaagttgtcttttcaaagtattggagtcttaagttgtt 8882114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 43630342 - 43630402
Alignment:
Q  165 tgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43630342 tgttggtctaagttgta-aagttgtaagttatctttccaaagtattggagtcttaagttgtt 43630402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47190626 - 47190577
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47190626 gtctaagatgaaagatgttgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 47190577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26454056 - 26453850
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26454056 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 26453957  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  26453956 cttgtgttgtttctgttgcagttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttggctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttac 26453857  T
Q  221 gttgttg 227  Q
    |||||||    
T  26453856 gttgttg 26453850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23478422 - 23478219
Alignment:
Q  25 ttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttg 124  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478422 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttg 23478323  T
Q  125 tgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttg 224  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23478322 tgctgtttcttttgatgttgaatattgatcaagttggagatgttggtttaagttgtctaagttataagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagttg 23478223  T
Q  225 ttga 228  Q
    ||||    
T  23478222 ttga 23478219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19880174 - 19879967
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19880174 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgagaattg 19880075  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19880074 cttgtgttgtttctgttgatgttgaatattgaccaagttgcagatgttggtttaagtggtctgagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaa 19879975  T
Q  221 gttgttga 228  Q
    ||||||||    
T  19879974 gttgttga 19879967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 22238085 - 22238286
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22238085 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaa-tgtatgatgtttaagttgttgatcctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 22238183  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22238184 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 22238282  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  22238283 tgtt 22238286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37515760 - 37515559
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37515760 tgttgttggttatgtgaaatatttatgtgccttatgtggaaaaagtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgct 37515661  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37515660 tgtgatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-agagttgcaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagt 37515562  T
Q  223 tgt 225  Q
    |||    
T  37515561 tgt 37515559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23409850 - 23409648
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23409850 tgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatatttaagttgttgatgttcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 23409751  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23409750 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 23409652  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  23409651 tgtt 23409648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18833617 - 18833416
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18833617 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttttttatgcttctcattaatattgatatgttgtgaattgct 18833518  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18833517 tgtgctgtttatgttgttgttgaatattgatcaagttgtaggagttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttccgaagtattggagtcttaagt 18833419  T
Q  223 tgt 225  Q
    |||    
T  18833418 tgt 18833416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Original strand, 17461118 - 17461301
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17461118 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 17461217  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  17461218 tgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagt 17461301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Original strand, 19808430 - 19808601
Alignment:
Q  25 ttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttg 124  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19808430 ttgttggttatgtgaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatatttttatgttgtgaattgcttg 19808529  T
Q  125 tgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtc 197  Q
    |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  19808530 taatggttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtc 19808601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22353019 - 22352887
Alignment:
Q  95 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagtt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  22353019 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagtt 22352921  T
Q  195 gtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22352920 gtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 22352887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5760710 - 5760532
Alignment:
Q  49 atgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaata 148  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5760710 atgtattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtagttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtgttgtttctgttgttgttgaata 5760611  T
Q  149 ttgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5760610 ttgatcaagttgcaagtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcattccaaagtattggagtcttaagttgttga 5760532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 21828161 - 21828281
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21828161 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 21828260  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21828261 tgtgctgtttctgttgctgtt 21828281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 44384821 - 44384939
Alignment:
Q  109 tgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagta 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44384821 tgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagtcgtcgttccaaagta 44384919  T
Q  209 tcggagtcttaagttgttga 228  Q
    | ||||||||||| ||||||    
T  44384920 ttggagtcttaagctgttga 44384939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Original strand, 18862792 - 18862909
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18862792 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 18862891  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgct 140  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18862892 tgtgctgtttctgttgct 18862909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Original strand, 19929554 - 19929715
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttat-gtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaatt 119  Q
    |||||||||| |||| |||| | | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19929554 aatgttgttgattattgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattaatattgttatgctgtgaatt 19929653  T
Q  120 gcttgtgctg-tttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgt 180  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||  |||||||    
T  19929654 gcttgtgctgttttatgttgctgttgaatattaattaagttgcaagtgttggtccaagttgt 19929715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21410909 - 21410789
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21410909 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 21410810  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21410809 tgtgctgtttctgttgctgtt 21410789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21805401 - 21805281
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21805401 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 21805302  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21805301 tgtgctgtttctgttgctgtt 21805281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23659462 - 23659371
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 114  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23659462 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgttatgttgt 23659371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 21976817 - 21976915
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21976817 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 21976915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22111890 - 22111792
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22111890 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 22111792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 43251772 - 43251674
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43251772 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 43251674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 143
Target Start/End: Original strand, 14397962 - 14398040
Alignment:
Q  65 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14397962 atgtatgatgtttaagttgttgttgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtttgtgctgtttctgttgctgtt 14398040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 19278430 - 19278528
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19278430 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttctgaattgc 19278528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Original strand, 16402068 - 16402150
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattg 105  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16402068 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatactcttcattaatattg 16402150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Original strand, 8414416 - 8414476
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 81  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8414416 aatgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 8414476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 11775068 - 11775008
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 81  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11775068 aatgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 11775008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23914092 - 23914029
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 86  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23914092 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 23914029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 21972732 - 21972826
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    || ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21972732 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa----ttaatgcttcacataaatattgttatgttgtgaattgc 21972826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 216
Target Start/End: Original strand, 18302800 - 18302892
Alignment:
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  18302800 tgtgttgtctctgttgttgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctaagtt-acaaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtc 18302892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 22253260 - 22253309
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22253260 gtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagatgttga 22253309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 22381827 - 22381876
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22381827 gtctaagatgtaagatgtcgtcccaaagtattggagtcttaagttcttga 22381876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 221
Target Start/End: Original strand, 27472555 - 27472612
Alignment:
Q  164 atgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaag 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||| ||||    
T  27472555 atgttggtttaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataag 27472612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 221
Target Start/End: Original strand, 38550250 - 38550307
Alignment:
Q  164 atgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaag 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||| ||||    
T  38550250 atgttggtttaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcataag 38550307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 21326718 - 21326758
Alignment:
Q  46 tatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 86  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21326718 tatatgtattatgtggaaaatatatgatgttgaagttgttg 21326758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10566 - 10360
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10566 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttta-gtttttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 10468  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10467 cttgtgctatttctgttgctgttgaatattcatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaa 10368  T
Q  221 gttgttga 228  Q
    ||||||||    
T  10367 gttgttga 10360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33263 - 33061
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33263 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgcttttaattaatattgttatgttgagaattg 33164  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33163 cttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaa 33064  T
Q  221 gtt 223  Q
    |||    
T  33063 gtt 33061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 22475 - 22680
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22475 aatgttgttgattatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 22574  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22575 tttgtgctgtttttgttgctgttgaatatttatcaagttgcagatgtttgtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttac 22674  T
Q  221 gttgtt 226  Q
    ||||||    
T  22675 gttgtt 22680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21914968 - 21914765
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  21914968 aatgttgtaggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttatttaatattgttatgttgagaattg 21914869  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21914868 cttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaa 21914769  T
Q  221 gttg 224  Q
    ||||    
T  21914768 gttg 21914765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 34492200 - 34492405
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  34492200 tgttgttggttatgtgaaataattatataccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgctttttattaatattgttatgttgagaattgct 34492299  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34492300 tctgatgtttctgttgttgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagtcgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagt 34492399  T
Q  223 tgttga 228  Q
    ||||||    
T  34492400 tgttga 34492405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24918165 - 24917963
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918165 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 24918066  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24918065 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 24917967  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  24917966 tgtt 24917963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27472474 - 27472272
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27472474 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttgtgaattgct 27472375  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27472374 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 27472276  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  27472275 tgtt 27472272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 34874278 - 34874480
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34874278 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 34874377  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  34874378 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 34874476  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  34874477 tgtt 34874480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 23069349 - 23069534
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23069349 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 23069448  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23069449 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagctgtcgttccaaagtat 23069534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 23707354 - 23707556
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707354 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcattatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 23707453  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23707454 tgtactatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 23707552  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  23707553 tgtt 23707556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24671050 - 24670848
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671050 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgggttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 24670951  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  24670950 tgtactgtttctgttgctgttgtatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttcacaagtattggagtcttaagt 24670852  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  24670851 tgtt 24670848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 21081802 - 21082004
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21081802 tgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttattgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 21081901  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  21081902 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtgttaagt 21082000  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  21082001 tgtt 21082004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 22459628 - 22459830
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    |||||| |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22459628 tgttgtcggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtataatgttgaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 22459727  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  22459728 tgtactgtttcggttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggaatcttaagt 22459826  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  22459827 tgtt 22459830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24681469 - 24681269
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24681469 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcgtcattagtattgttatgttgtgaattgct 24681370  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  24681369 tgtactgtttctgttgctgttg--tattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgcaagttttctttccaaagtattggagtcttaagt 24681273  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  24681272 tgtt 24681269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 180
Target Start/End: Original strand, 18358799 - 18358956
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||| ||||| |   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18358799 tgttgttggttttgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattattatgttgtgaatttct 18358898  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgt 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18358899 tgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcagatgttggtctaagttgt 18358956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 24316190 - 24316333
Alignment:
Q  62 aaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24316190 aaaatgtatgatgtttaagttgt-gatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgc 24316288  T
Q  162 agatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    || ||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||    
T  24316289 aggtgttggtctaagtt-acaaagttgtaagttgtctttccaaagt 24316333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 30345138 - 30345258
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  30345138 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 30345237  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30345238 tgtgctgtttctgttgctgtt 30345258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 41531151 - 41531271
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41531151 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 41531250  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  41531251 tgtgctgtttatgttgctgtt 41531271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Original strand, 20320723 - 20320849
Alignment:
Q  82 tgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtc 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||     
T  20320723 tgttgatgcttttcattaatattgtcatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgaatactgatcaagttgcaggtgttggtctaaattgt- 20320821  T
Q  182 taagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20320822 aaagttataagttgtcgttccaaagtat 20320849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1283348 - 1283228
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  1283348 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 1283249  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  1283248 tgtgttgtttctgttgctgtt 1283228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31345171 - 31345051
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  31345171 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttaatgcttcacactaatattgttatgttgtgaattact 31345072  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31345071 tgtgctgtttctgttgctgtt 31345051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 24628626 - 24628724
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24628626 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 24628724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 27601755 - 27601657
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27601755 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 27601657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Original strand, 12901661 - 12901757
Alignment:
Q  25 ttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12901661 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12901757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24649316 - 24649218
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24649316 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgcttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 24649218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 27379580 - 27379678
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27379580 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgcgaattgc 27379678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 27383626 - 27383724
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27383626 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgcgaattgc 27383724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 120
Target Start/End: Original strand, 10101792 - 10101889
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    |||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10101792 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtttcacattaatattgttatgttgtgaattg 10101889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 13101727 - 13101783
Alignment:
Q  164 atgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13101727 atgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaa 13101783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20915353 - 20915189
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt-ttcattaatattgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatatt 150  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||  || || |||||| || |||||||||||||| ||| ||  ||| || |||||||| |||||||||||    
T  20915353 ttatgtggaatatgtatgatgttgtagttgttattgtttattcatttatgttgttatgttgtgagttgtttatgtgttgcttctgttgttgttgaatatt 20915254  T
Q  151 gatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
     || ||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||    
T  20915253 aattaagttgcaagtgttggtctaagtt-acaaagttgtaagatgttgttctaaagtattggagtc 20915189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 9784736 - 9784673
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 86  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9784736 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaaattgttg 9784673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 21073588 - 21073637
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21073588 gtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 21073637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Original strand, 24815507 - 24815592
Alignment:
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24815507 tgtgctgcgtctgttgttgttgaatattgattaagttgcaagtgttggtctaagtt-acaaagttgtaagatgtagttccaaagtat 24815592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Original strand, 39827970 - 39828138
Alignment:
Q  53 cttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatatt 150  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||| |||| |||||| |||||||| | |  ||| ||  | ||||||||||| |||||    
T  39827970 cttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttaattcttatcattgatatggttatgctgtgaattacctatgtgttgcctatgttgctgttgtatatt 39828069  T
Q  151 gatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
     || ||| ||||  ||| |||||||| ||          ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39828070 aattaagctgcatgtgtcggtttaagatga---------aagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 39828138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34136957 - 34136916
Alignment:
Q  187 tgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34136957 tgtaagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 34136916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Original strand, 24834908 - 24834993
Alignment:
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24834908 tgtgctgcctctattgttgttgaatattgattaagttgcaagtgttggtctaagtt-acaaagttgtaagatgtagttccaaagtat 24834993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9241951 - 9241903
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9241951 gtctaagatgtaagatgtcgt-ccaaagtattggagtcttaagttgttga 9241903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 20320872 - 20320921
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  20320872 gttgtttaagttgtgagttgtcgttctaaagtattggagttttaagttgt 20320921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 16550710 - 16550917
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16550710 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattg 16550809  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16550810 cttgtgttgtttctattgatgttgaataatgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcattccaaagtattggagtcttaa 16550909  T
Q  221 gttgttga 228  Q
    | ||||||    
T  16550910 ggtgttga 16550917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 46580741 - 46580943
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46580741 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgctgtgaattgct 46580840  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  46580841 tgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 46580939  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  46580940 tgtt 46580943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32301342 - 32301141
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301342 tgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 32301243  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32301242 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtggtggtctaagttgt-aaagttgcaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagt 32301144  T
Q  223 tgt 225  Q
    |||    
T  32301143 tgt 32301141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8940304 - 8940105
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940304 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 8940205  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8940204 tgtactgtttatgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 8940106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16614952 - 16614745
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16614952 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattg 16614853  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgc--agatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtctt 218  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| ||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16614852 cttgtgttgtttctattgatgttaaata--aatcaagttgcgaagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcattccaaagtattggagtctt 16614755  T
Q  219 aagttgttga 228  Q
    ||| ||||||    
T  16614754 aaggtgttga 16614745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15720050 - 15719867
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15720050 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 15719951  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  15719950 tgtactgtttctgttgctgatgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagt 15719867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14258505 - 14258320
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258505 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttgagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 14258406  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14258405 tgtaatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcattccaaagtat 14258320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16579813 - 16579628
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579813 tgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 16579714  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16579713 tgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 16579628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 16585850 - 16586035
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16585850 tgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 16585949  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16585950 tgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 16586035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 32160908 - 32161111
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32160908 aatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaat-tgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattg 32161006  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||  || |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  32161007 cttgtgctgtttctgttgctgttgcatattgattaagttacaggtgttggtctaagttgt-aaaattgtaagttgtctttctaaagtattggagtcttaa 32161105  T
Q  221 gttgtt 226  Q
    ||||||    
T  32161106 gttgtt 32161111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15112999 - 15112796
Alignment:
Q  22 atgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    |||||||||||||||||| |   | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15112999 atgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtagaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaatttc 15112900  T
Q  122 ttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  15112899 ttgtactgtttctgttgctgttgcacattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggaatcttaag 15112801  T
Q  222 ttgtt 226  Q
    |||||    
T  15112800 ttgtt 15112796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 16460831 - 16461016
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16460831 tgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcatcaatattgttatgttgtgaattgct 16460930  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16460931 tttgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 16461016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16324105 - 16323904
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324105 tgttgttggttatgtga-aatgttatatgccttttgtggaaaatgcatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 16324007  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  16324006 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcgggtgttggtctaagttgt-aaagttgttagttgtctttccaaagtattggaatcttaagt 16323908  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  16323907 tgtt 16323904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16998647 - 16998464
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998647 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgttgaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 16998548  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  16998547 tgtaatgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtatttccaaagt 16998464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 14981541 - 14981703
Alignment:
Q  63 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 162  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14981541 aaatgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgca 14981640  T
Q  163 gatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14981641 ggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagttgtt 14981703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8468772 - 8468589
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| |   | ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8468772 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 8468673  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  8468672 tgtattgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagt 8468589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17232973 - 17232790
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| |   | ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  17232973 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttataaattgct 17232874  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  17232873 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagt 17232790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 197
Target Start/End: Original strand, 15411017 - 15411150
Alignment:
Q  63 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 162  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15411017 aaatgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgtatattgatcaagttgca 15411116  T
Q  163 gatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtc 197  Q
    | ||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  15411117 ggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtc 15411150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14273569 - 14273386
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||   |    
T  14273569 tgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgttatgttgcgaatattt 14273470  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  14273469 tgtactatttctgttgctattgcatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagt 14273386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 142
Target Start/End: Original strand, 2530202 - 2530320
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2530202 tgttgttggttatgtga-aatattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 2530300  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgt 142  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2530301 tgtgctgtttctgttgctgt 2530320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15116511 - 15116336
Alignment:
Q  47 atatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaa 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |    
T  15116511 atatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttacgttgttgatgtttttcattaatattgttattttgtgaatttcttgtattgtttctgttgctgttgca 15116412  T
Q  147 tattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
     |||||||||||||||  ||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15116411 cattgatcaagttgcaagtgttggtct---ttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggaatcttaagttgtt 15116336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 17060490 - 17060658
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||    
T  17060490 tgttgttggttatgtgaaatatttatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatgttggtct-ttgtgaattgct 17060588  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaag 192  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  17060589 tgtactgtttctattgctgttgaatattgatcaaattacaagtgttggtctaaattgtttaagttgtaag 17060658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 1858897 - 1859017
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1858897 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgttgtgaattgct 1858996  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1858997 tgtgctgtttctgttgctgtt 1859017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 13918591 - 13918711
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918591 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatatggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 13918690  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13918691 tgtgctgtttctgttgctgtt 13918711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 25927314 - 25927434
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25927314 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 25927413  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  25927414 tgtgctgtttctgttgatgtt 25927434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 207
Target Start/End: Original strand, 1490151 - 1490303
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgat 153  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||| | || || || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  1490151 ttatgtggaatatatatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtactttttctgttgttgttgaatattgat 1490250  T
Q  154 caagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  1490251 caagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagt 1490303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Original strand, 45170153 - 45170270
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  45170153 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgtt 45170252  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgct 140  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  45170253 tgtactgtttctgttgct 45170270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39722225 - 39722105
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  39722225 tgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgct 39722126  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  39722125 tgtgctgtttatgttgctgtt 39722105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15084133 - 15084035
Alignment:
Q  45 ttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15084133 ttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 15084035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 26292355 - 26292256
Alignment:
Q  22 atgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26292355 atgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 26292256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 33066 - 32968
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33066 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 32968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 12704806 - 12704904
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12704806 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12704904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12714823 - 12714725
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12714823 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12714725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12718627 - 12718529
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12718627 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12718529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 16907348 - 16907446
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16907348 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16907446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18283325 - 18283227
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18283325 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 18283227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12723538 - 12723440
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12723538 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagctgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12723440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16114200 - 16114102
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    |||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16114200 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16114102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16117353 - 16117255
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    |||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16117353 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16117255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18279362 - 18279264
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18279362 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttttgaattgc 18279264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 120
Target Start/End: Original strand, 70912 - 71009
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  70912 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 71009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 120
Target Start/End: Original strand, 75021 - 75118
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  75021 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 75118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32301136 - 32301084
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32301136 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 32301084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 16461047 - 16461096
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16461047 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgt 16461096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16579597 - 16579548
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16579597 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtttcggagtcttaagttgt 16579548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 16586066 - 16586115
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16586066 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtttcggagtcttaagttgt 16586115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20487596 - 20487533
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 86  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20487596 tgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 20487533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 709296 - 709460
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt-ttcattaatattgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatatt 150  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || || ||||||||  ||||||||||||||  || ||  ||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  709296 ttatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttattcattaacgttgttatgttgtgagctgtttatgtgttgcctctgttgttgttgaatatt 709395  T
Q  151 gatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
     || ||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  709396 aattaagttgcaagtgttggtctaagtt-acaaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtc 709460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 11392103 - 11392152
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11392103 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagccttaagttgttga 11392152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16462353 - 16462183
Alignment:
Q  48 tatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt-ttcattaatattgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttg 144  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||  || || ||||||||  ||||||||||||||  || ||  ||||||  ||||||| |||||    
T  16462353 tatgtattatgtggaatatgcatgatgttgaaggtgttattgtttattcattaacgttgttatgttgtgagatgtttatgtgctgcctctgttgttgttg 16462254  T
Q  145 aatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
    |||||| || ||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  16462253 aatattaattaagttgcaagtgttggtctaagtt-acaaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtc 16462183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41055785 - 41055629
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgtttctgttgctgttgaatattg 151  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || | || |||||  |||||||||||||| ||| |  |||| ||  ||||||| |||||||||||     
T  41055785 ttatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgttatttattaacgttgttatgttgtgagttgtttatgtgatgcctctgttgttgttgaatatta 41055686  T
Q  152 atcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    || ||||||||  ||||||| |||||| |  |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  41055685 attaagttgcaagtgttggtctaagttat-aaagttgtaagatgttgctccaaagtat 41055629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11085000 - 11084957
Alignment:
Q  183 aagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11085000 aagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagttgtt 11084957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38519389 - 38519348
Alignment:
Q  187 tgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38519389 tgtaagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 38519348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42461974 - 42461925
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42461974 gtctaagatgtaagatgtcgttccaatgtattggagtcttaagttgttga 42461925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 226
Target Start/End: Original strand, 14157164 - 14157247
Alignment:
Q  134 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||         ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  14157164 tgttgctgttgcatattgatcaagttccaggtgttggt---------ctaagttgtaagttgtctttgcaaagtattggaatcttaagttgtt 14157247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Original strand, 9033442 - 9033489
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9033442 gtctaagatgaaagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgtt 9033489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 226
Target Start/End: Original strand, 9320580 - 9320623
Alignment:
Q  183 aagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9320580 aagttgtaagttgtctttccaaaatattggagtcttaagttgtt 9320623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11661294 - 11661248
Alignment:
Q  182 taagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11661294 taagatgtaagatgttgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 11661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14421972 - 14421926
Alignment:
Q  182 taagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14421972 taagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagccttaagttgttga 14421926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 130913 - 130962
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  130913 gtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtgttggagtcctaagttgttga 130962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18607478 - 18607430
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18607478 gtctaagatgtaagatgtcgt-ccaaagtattggagtcttaagttgttga 18607430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 126010 - 125825
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  126010 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 125911  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  125910 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 125825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 125794 - 125745
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  125794 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgt 125745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 38247 - 38296
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38247 gtctaagatgaaagatgttgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 38296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 7007 - 7209
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7007 tgttgttggttatgtgaaatatgtatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 7106  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7107 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 7205  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  7206 tgtt 7209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 53904 - 54106
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53904 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 54003  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54004 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 54102  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  54103 tgtt 54106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 472 - 268
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  472 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttacgtcgtgaatttct 373  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  372 tgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttccaaagtattatagtcttaagt 274  T
Q  223 tgttga 228  Q
    ||||||    
T  273 tgttga 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 907 - 722
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  907 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 808  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  807 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4376 - 4172
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4376 aatgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattg 4277  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4276 cttgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgt-aaaattgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaa 4178  T
Q  221 gttgtt 226  Q
    ||||||    
T  4177 gttgtt 4172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4376 - 4172
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4376 aatgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattg 4277  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4276 cttgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgt-aaaattgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaa 4178  T
Q  221 gttgtt 226  Q
    ||||||    
T  4177 gttgtt 4172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15052 - 14852
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||| ||||||| |||| ||  |||||||    
T  15052 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgggaaaaatgtatgatgttaaagttgtagacgctctccataaatattgatatgatgaaaattgct 14953  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |  || |||   ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  14952 tgcactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagtcgcacgtgttgctcaaatttg-aaaagttataagttgtctttcaaaagtatcggactctaaagt 14854  T
Q  223 tg 224  Q
    ||    
T  14853 tg 14852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 223
Target Start/End: Original strand, 169815 - 170014
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169815 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 169914  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  169915 tgtactgtttctgttactgttacatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 170013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 120063 - 119878
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  120063 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattattatgttgtgaattgct 119964  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  119963 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtat-agttgtaagttgtcgttccaaagtat 119878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 117255 - 117207
Alignment:
Q  180 tctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  117255 tctatgttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 117207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 117205 - 117156
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  117205 gttgtctatgttgtaagttgtagttccaaagtattggagtcttaagttgt 117156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 1358 - 1560
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||| ||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1358 tgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 1457  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1458 tgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 1556  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  1557 tgtt 1560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 1231 - 1435
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1231 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaattgct 1330  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||   |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1331 tgtgttgtttctgttgctgttcaatattgatcaagttgcatgggttgacctaagtt-ttaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagt 1429  T
Q  223 tgttga 228  Q
    ||||||    
T  1430 tgttga 1435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 7982 - 8186
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7982 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaattgct 8081  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||   |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8082 tgtgttgtttctgttgctgttcaatattgatcaagttgcatgggttgacctaagtt-ttaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaagt 8180  T
Q  223 tgttga 228  Q
    ||||||    
T  8181 tgttga 8186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Original strand, 2779 - 2962
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 2878  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  2879 tgtactgtttctgttgctcttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagt 2962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 67316 - 67114
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67316 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgaataatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 67217  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  67216 tgtactgtttctgttgttgttgcatattgatccagttgcaggtgttggtctaagttat-aaagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagt 67118  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  67117 tgtt 67114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 180
Target Start/End: Original strand, 3393 - 3550
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3393 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgaattatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 3492  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgt 180  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3493 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcagatgttggtctaagttgt 3550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15797 - 15613
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaa-attatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15797 tgttgttggttatgtgaaaaatattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 15698  T
Q  122 ttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  || ||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  15697 ttgtattgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaagtgttggtcgaatttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagt 15613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 70534 - 70732
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70534 aatgttcttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 70633  T
Q  121 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaa 220  Q
     ||||| ||||||||||||      |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  70634 tttgtgttgtttctgttgc------atattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaaattgtaagttgtctttcaaaagtattggagtcttaa 70726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Original strand, 1940 - 2112
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    |||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940 tgttattggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 2039  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgt 196  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  2040 tgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttacaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgt 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 592 - 409
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  592 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 493  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    
T  492 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagctgt-aaagttgtaagttgtctttcaaaagt 409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 24662 - 24863
Alignment:
Q  22 atgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    |||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24662 atgttgatggttatgtgaaatatttatatgccttatctggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttt-cattaatattgttatgttctgaattgc 24760  T
Q  122 ttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaag 221  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24761 ttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgtt-gtttaagttgt-aaagtttgaagttgtctttccaaagtattggagtcttaag 24858  T
Q  222 ttgtt 226  Q
    |||||    
T  24859 ttgtt 24863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 85600 - 85417
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| |   | | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85600 tgttgttggttatgtgaaatgttcagatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 85501  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  85500 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagt 85417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 6968 - 7170
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||    
T  6968 tgttgttggttatgtgaaatttttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatactgttacgatgtgtattgct 7067  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagt 222  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||    
T  7068 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttcaaaagaattggagtcttaagt 7166  T
Q  223 tgtt 226  Q
    ||||    
T  7167 tgtt 7170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Original strand, 10155 - 10333
Alignment:
Q  28 ttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgc 127  Q
    |||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  10155 ttggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaattttgttattttgtgaattgcttgtac 10254  T
Q  128 tgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 207  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  10255 tgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttg-caaagttgtaagttgtctttccaaagt 10333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Original strand, 15479 - 15560
Alignment:
Q  22 atgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatat 103  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15479 atgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcgcattaatat 15560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36205 - 36156
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36205 gtctaagatgtaagatgtctttccaaagtattggagtcttaagttgttga 36156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 56 - 226
Target Start/End: Original strand, 6851 - 7020
Alignment:
Q  56 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6851 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgatgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatca 6950  T
Q  156 agttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  6951 agttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaatgtattggagtcttaatttgtt 7020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21221 - 21063
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21221 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcagtaatattgttatgttgtgaattgct 21122  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtc 181  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21121 tgtgctatttttgttgctgttgaatattaatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtc 21063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21030 - 20981
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21030 gttgtctaagttgtaagttgttgttccaaagtattggagtcttaagttgt 20981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 228
Target Start/End: Original strand, 1347 - 1520
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgat 153  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1347 ttatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgat 1446  T
Q  154 caagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1447 caagttgcaagtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcattccaaagtattggagtcttaagttgttga 1520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 614 - 465
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  614 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttgtgaattgct 515  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtt 172  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  514 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtt 465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 209
Target Start/End: Original strand, 13490 - 13627
Alignment:
Q  71 gatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttgg 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  13490 gatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcatgtgttgg 13589  T
Q  171 tttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13590 tctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 13627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 13658 - 13707
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13658 gttgtctaagttgtaagttgtcattccaaagtattggagtcttaagttgt 13707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7889 - 7698
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  7889 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgaagtt-aagtggttgatgcttctcattaatattgacatgttgtgaattgtt 7791  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7790 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttgctctaaattgt-aaagttataagttgtcgttccaaagtattggagtc 7698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7682 - 7633
Alignment:
Q  176 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgt 225  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7682 gttgtctaagttgtgagtggtcattccaaagtattggagtcttaagttgt 7633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15615 - 15431
Alignment:
Q  45 ttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgttt-ctgttgctg 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  || ||    
T  15615 ttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgatgtgaattgcttatgtgctgtttcctaatgttg 15516  T
Q  142 ttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15515 ttgaatattaatcaagttgcaggtgttggtctaagttg--taagttgtaagttgtcgttccaaagtattggattcttaagttgttga 15431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 71356 - 71236
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  71356 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 71257  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  71256 tgtgctgtttctgttgctgtt 71236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 78388 - 78256
Alignment:
Q  93 ttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaag 192  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  78388 ttcattaatattgctatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaag 78290  T
Q  193 ttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  78289 ctgtctttccaaagtattggagtcttaagttgtt 78256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 20276 - 20396
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20276 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 20375  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20376 tgtgctgtttctgttgctgtt 20396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 36233 - 36353
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  36233 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 36332  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36333 tgtgctgtttctgttgctgtt 36353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 189524 - 189644
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  189524 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 189623  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  189624 tgtgctgtttctgttgctgtt 189644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 221302 - 221351
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  221302 gtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggaggcttaagttgttga 221351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 214 - 93
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  214 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttaggtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 115  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttg 144  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  114 tgtactgtttctgtttctgttg 93  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 104 - 51
Alignment:
Q  127 ctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgt 180  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  104 ctgtttctgttgctgttgcatattaagcaagttgcaggtgttggtctaatttgt 51  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Original strand, 207648 - 207769
Alignment:
Q  22 atgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  207648 atgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatcttgtgaattgc 207747  T
Q  122 ttgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  207748 ttgtgctgtttttgttgctgtt 207769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 14234 - 14354
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14234 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 14333  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14334 tgtgctgtttctgttgctgtt 14354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31178 - 31058
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31178 tgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttttgaattgct 31079  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31078 tgtgctgtttctgttgctgtt 31058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20774 - 20672
Alignment:
Q  106 ttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20774 ttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtcgttccaaa 20676  T
Q  206 gtat 209  Q
    ||||    
T  20675 gtat 20672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Original strand, 7481 - 7566
Alignment:
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7481 tgtgctgcgtctgttgttgttgaatattgattaagttgcaagtgttggtctaagtt-acaaagttgtaagatgtagttccaaagtat 7566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 354 - 234
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  354 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 255  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  254 tgtgctgtttctgttgctgtt 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 11648 - 11768
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  11648 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 11747  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11748 tgtgctgtttctgttgctgtt 11768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7703 - 7526
Alignment:
Q  45 ttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgttt-ctgttgctg 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| || ||||||    
T  7703 ttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgttgtttcctattgctg 7604  T
Q  142 ttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||         |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7603 ttgaatattaatcaagttgcaagtgttg---------gtctgagttgtaagttgtcgttccaaagtattggattcttaagttgttga 7526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 32807 - 32927
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  32807 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 32906  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32907 tgtgctgtttctgttgctgtt 32927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 57001 - 56824
Alignment:
Q  45 ttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgttt-ctgttgctg 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||| |||||||||    
T  57001 ttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtcgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgtttatgtgttgtttcctgttgctg 56902  T
Q  142 ttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  56901 ttgaatattaatcaagttgcaagtgttg---------gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggattcgtaagttgttga 56824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 39307 - 39205
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39307 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 39208  T
Q  123 tgt 125  Q
    |||    
T  39207 tgt 39205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6932 - 6854
Alignment:
Q  65 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6932 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 6854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 80674 - 80554
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||| |    
T  80674 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgat 80575  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  80574 tgtgctatttctgttgctgtt 80554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 65675 - 65773
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  65675 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 65773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 61759 - 61857
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||  ||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  61759 tgttgttgaatatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 61857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 36089 - 36208
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 122  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||     
T  36089 tgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgca 36188  T
Q  123 tgtgctgtttctgttgctgttg 144  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  36189 tgtgctgtt--tgttgctgttg 36208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 58866 - 58964
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  58866 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 58964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12379 - 12283
Alignment:
Q  25 ttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12379 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 121
Target Start/End: Original strand, 5251 - 5346
Alignment:
Q  26 tgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5251 tgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 5346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Original strand, 166436 - 166613
Alignment:
Q  45 ttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttc-tgttgctg 141  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||| ||    
T  166436 ttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgctatttcctgttgttg 166535  T
Q  142 ttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||||||||  ||||| ||||  |||||||         ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||    
T  166536 ttgaatattagtcaagctgcaagtgttggt---------ctaagttgtaacttgtcgttccaaagtattggattattaaattgttga 166613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 409 - 311
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  409 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaagatgtttgatgtttaagttattgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 121
Target Start/End: Original strand, 67449 - 67546
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 121  Q
    ||||||||||||||| | | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  67449 tgttgttggttatgtaa-atatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 67546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 120
Target Start/End: Original strand, 4022 - 4119
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 120  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  4022 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttaatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttatgaattg 4119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 11557 - 11722
Alignment:
Q  46 tatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaat-attgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgt 142  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| || |||| |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||| |||    
T  11557 tatatgtattatgtgaaaagtgtatgatgttgaagttgttgttgattatcattgattattgatatgttgtgagttgcttacgtgctgcctctgttgttgt 11656  T
Q  143 tgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11657 tgaatattgattaagttgcaagtgttggtctaagtt-acaaagttgtaagatgttgttccaaagtat 11722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21894 - 21804
Alignment:
Q  135 gttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21894 gttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgta-aagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagttgtt 21804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 132941 - 132893
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  132941 gtctaagatgtaagatgtcgt-ccaaagtattggagtcttaagttgttga 132893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 143
Target Start/End: Original strand, 80562 - 80621
Alignment:
Q  84 ttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 143  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80562 ttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 80621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Original strand, 80482 - 80564
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattg 105  Q
    ||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  80482 tgttgttggttatatgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattg 80564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 17628 - 17559
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt 92  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17628 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctt 17559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 176138 - 176078
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 81  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  176138 aatgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 176078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 168784 - 168724
Alignment:
Q  21 aatgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 81  Q
    |||||||||| |||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  168784 aatgttgttgcttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 168724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 446637 - 446473
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt-ttcattaatattgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatatt 150  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || || |||||| |  ||| ||||||||||  || ||  ||| || |||||||| |||||||||||    
T  446637 ttatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttattcattgacgttgatatgttgtgagctgtttatgtgttgcttctgttgttgttgaatatt 446538  T
Q  151 gatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
     || ||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  446537 aattaagttgcaagtgttggtctaagtt-acaaagttgtaaaatgttgttccaaagtattggagtc 446473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 89
Target Start/End: Original strand, 6225 - 6291
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatg 89  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6225 tgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatgtggaaaatatacgatgtttaagttgttgatg 6291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 2654 - 2703
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2654 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagccttaagttgttga 2703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 9033 - 8934
Alignment:
Q  53 cttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgtttctgttgctgttgaatatt 150  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||  | ||||||||||| |||||    
T  9033 cttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtgaattcttatcattgatattgttatgttgtgaattacttatgtgctgcctatgttgctgttgtatatt 8934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3632 - 3573
Alignment:
Q  149 ttgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3632 ttgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgta-aagttgtaagttgtcgttccaaagtat 3573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7696 - 7637
Alignment:
Q  149 ttgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  7696 ttgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aaagttgtaagttgtctttccaaagtat 7637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21392 - 21235
Alignment:
Q  54 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt-ttcattaatattgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatatt 150  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || || |||||| |  ||||||||||||||  || ||  ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  21392 ttatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttattcatttacgttgttatgttgtgagctgtttatgtgctgcctctgttgttgttgaatatt 21293  T
Q  151 gatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtat 209  Q
     || ||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21292 aattaagttgcaagtgttggtctaagtt-acaaagttgtaagatgttgttccaaagtat 21235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 145932 - 145871
Alignment:
Q  155 aagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||| ||||||    
T  145932 aagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtc 145871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 5620 - 5681
Alignment:
Q  164 atgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5620 atgttggtctaagttgta-aagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagttgtt 5681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8092 - 8007
Alignment:
Q  134 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||         ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8092 tgttgctgttgcatattgataaagttgcaggtgttggt---------ctaagttgtaagttgtctttccaaagtgttggagtcttaagttgttga 8007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 793 - 732
Alignment:
Q  164 atgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  793 atgttggtctaagttgta-aagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtcttaagttgtt 732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 105135 - 105078
Alignment:
Q  23 tgttgttggttatgtgagaaaattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaag 80  Q
    |||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  105135 tgttgtcggttatgcgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaag 105078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10534 - 10451
Alignment:
Q  134 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10534 tgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggt---------ctaagttgtaagttgtctttccaaagtattggaatcttaagttgtt 10451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 126927 - 126880
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  126927 gtctaagttgtaagttgtctttccaaagtattggaatcttaagttgtt 126880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 672 - 625
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  672 gtctaagatgtaagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgtt 625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 18263 - 18312
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18263 gtctaagatgtaagatgtcgtcccaaagtattggagtcttaagttgttga 18312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3282 - 3233
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3282 gtctaagatgtaagatgtcgtcccaaagtattggagtcttaagttgttga 3233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8178 - 8137
Alignment:
Q  187 tgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8178 tgtaagatgtcgttccaaagtattggagtcttaagttgttga 8137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7828 - 7785
Alignment:
Q  183 aagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7828 aagttgtaagttgtctttccaaagtattggagtctttagttgtt 7785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 216
Target Start/End: Original strand, 12878 - 13039
Alignment:
Q  57 tgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaat-attgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatattgat 153  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||| | || ||  |||| || ||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||| || ||||||||||| ||    
T  12878 tgtggaaaatgtttgatcttgaagttgtcgttgattaccattgattattgttatgttgtgagttgcttatgtgctgcctctgctgatgttgaatattaat 12977  T
Q  154 caagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
     ||||||||  ||| ||| ||||||  |  ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  12978 taagttgcaagtgtcggtctaagtta-cagagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtc 13039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 112 - 69
Alignment:
Q  183 aagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  112 aagttgtaagttgtcttttcaaagtattggagtcttaagttgtt 69  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 362793 - 362750
Alignment:
Q  183 aagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgtt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  362793 aagttgtaagttgtctttccaaagtattggaatcttaagttgtt 362750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 55082 - 55001
Alignment:
Q  134 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  55082 tgttgttgttgaatattaattaagttgcaagtgttggtctaagtta-caaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtc 55001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1187 - 1122
Alignment:
Q  59 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcatt-aatattgttatgttgtgaattgctt 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| | ||||| |||||||||| ||||||    
T  1187 tggaaaatgtatgatgttgaagttgttgttgattatcattgattattgctatgttgtgagttgctt 1122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10188 - 10139
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10188 gtctaagatgtaatatgtcgttccaaagtgttggagtcttaagttgttga 10139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11359 - 11299
Alignment:
Q  155 aagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  11359 aagttgcatatgttggtcaaagttgtc-aagttgtaagttgttgatccaaagtattggagtc 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1911 - 1870
Alignment:
Q  187 tgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1911 tgtaaggtgtcgtcccaaagtattggagtcttaagttgttga 1870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 9816 - 9864
Alignment:
Q  179 gtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtcttaagttgttga 228  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9816 gtctaagatgtaagatgtcgt-ccaaagtattggagtcttaagttgttga 9864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20840 - 20780
Alignment:
Q  155 aagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatcggagtc 216  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  20840 aagttgcatatgttggtcaaagttgtc-aagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtc 20780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University