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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8521A_low_227 (Length: 247)

Name: NF8521A_low_227
Description: NF8521A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8521A_low_227
NF8521A_low_227
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (25-247)||(1491-1714)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (25-247)||(3811466-3811695)
chr7 (25-247)||(3817608-3817837)
chr7 (25-247)||(351420-351649)
chr7 (25-247)||(339014-339242)
chr7 (25-247)||(5849163-5849392)
chr7 (25-245)||(26383304-26383531)
chr7 (25-247)||(35148306-35148535)
chr7 (48-247)||(35152849-35153055)
chr7 (27-247)||(22742229-22742456)
chr7 (25-245)||(28421256-28421483)
chr7 (150-237)||(26380751-26380838)
chr7 (28-179)||(42767505-42767661)
chr7 (32-245)||(5979479-5979701)
chr7 (118-239)||(18666880-18667006)
chr7 (25-245)||(43539630-43539839)
chr7 (148-245)||(8824446-8824542)
chr7 (147-244)||(30219501-30219598)
chr7 (99-204)||(18657029-18657132)
chr7 (28-75)||(20238762-20238809)
chr7 (38-160)||(7608146-7608276)
chr7 (25-99)||(15843733-15843809)
chr7 (25-99)||(15860842-15860918)
chr7 (121-176)||(16914037-16914092)
chr7 (144-187)||(24689729-24689772)
chr7 (46-135)||(26380837-26380925)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (33-247)||(31002009-31002230)
chr2 (33-247)||(31007987-31008208)
chr2 (32-247)||(30964960-30965182)
chr2 (25-247)||(28683242-28683471)
chr2 (28-247)||(13149990-13150216)
chr2 (28-247)||(35439671-35439897)
chr2 (28-247)||(44717106-44717332)
chr2 (99-247)||(35442211-35442359)
chr2 (27-245)||(19879229-19879458)
chr2 (28-245)||(13455734-13455958)
chr2 (28-245)||(13461675-13461899)
chr2 (28-245)||(35084980-35085204)
chr2 (28-245)||(35090953-35091177)
chr2 (48-247)||(7771508-7771713)
chr2 (32-245)||(36750049-36750269)
chr2 (26-176)||(11048853-11049010)
chr2 (25-245)||(23343198-23343416)
chr2 (117-207)||(29832878-29832968)
chr2 (169-245)||(23283878-23283955)
chr2 (109-193)||(31651318-31651402)
chr2 (140-204)||(8342606-8342671)
chr2 (152-214)||(28765248-28765311)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (28-247)||(48160592-48160818)
chr4 (28-247)||(48166811-48167037)
chr4 (28-247)||(26957104-26957330)
chr4 (25-245)||(10733649-10733874)
chr4 (25-245)||(10947418-10947643)
chr4 (28-245)||(6257506-6257729)
chr4 (28-247)||(26971856-26972081)
chr4 (25-245)||(10739636-10739861)
chr4 (25-245)||(10953405-10953630)
chr4 (32-245)||(50168230-50168450)
chr4 (33-247)||(44831920-44832141)
chr4 (28-245)||(24287622-24287845)
chr4 (99-245)||(17627153-17627299)
chr4 (33-245)||(35177425-35177650)
chr4 (25-245)||(49976236-49976449)
chr4 (32-184)||(50155657-50155813)
chr4 (99-236)||(19686696-19686833)
chr4 (147-245)||(50426882-50426980)
chr4 (24-75)||(33458563-33458614)
chr4 (25-75)||(33461689-33461739)
chr4 (111-243)||(4632012-4632140)
chr4 (203-247)||(33461797-33461841)
chr4 (203-247)||(33458672-33458716)
chr4 (34-76)||(4632192-4632234)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (28-247)||(10769270-10769496)
chr3 (25-247)||(49151245-49151474)
chr3 (25-247)||(49157312-49157541)
chr3 (32-247)||(10760955-10761177)
chr3 (28-247)||(38449364-38449590)
chr3 (28-247)||(38455851-38456077)
chr3 (25-247)||(30051399-30051627)
chr3 (25-247)||(8331420-8331649)
chr3 (25-247)||(28964513-28964742)
chr3 (99-247)||(23138795-23138943)
chr3 (28-245)||(11840026-11840250)
chr3 (28-245)||(42191521-42191745)
chr3 (28-245)||(42197463-42197687)
chr3 (109-247)||(53071640-53071778)
chr3 (28-245)||(10238513-10238737)
chr3 (28-245)||(10244635-10244859)
chr3 (28-245)||(26429718-26429942)
chr3 (25-245)||(17056090-17056316)
chr3 (121-247)||(24643891-24644017)
chr3 (103-245)||(11846359-11846502)
chr3 (36-207)||(46656353-46656531)
chr3 (25-245)||(55003706-55003926)
chr3 (121-245)||(34300073-34300197)
chr3 (129-245)||(8474543-8474660)
chr3 (120-245)||(2982625-2982751)
chr3 (99-245)||(17601912-17602058)
chr3 (26-132)||(48128338-48128451)
chr3 (120-245)||(12109067-12109191)
chr3 (198-245)||(9586490-9586537)
chr3 (128-199)||(27103272-27103344)
chr3 (34-99)||(13367144-13367209)
chr3 (33-96)||(13444847-13444911)
chr3 (26-70)||(17593487-17593531)
chr3 (130-207)||(27088019-27088097)
chr3 (185-243)||(52222937-52222995)
chr3 (34-98)||(9760506-9760570)
chr3 (25-65)||(53069346-53069386)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (32-247)||(31051177-31051399)
chr1 (32-247)||(31057677-31057899)
chr1 (25-247)||(34739619-34739848)
chr1 (25-247)||(38152261-38152484)
chr1 (25-247)||(8093143-8093372)
chr1 (43-245)||(44409635-44409844)
chr1 (28-245)||(25387805-25388027)
chr1 (28-245)||(1077879-1078103)
chr1 (28-245)||(25381836-25382060)
chr1 (27-245)||(50305832-50306057)
chr1 (120-243)||(27954798-27954921)
chr1 (99-245)||(25275425-25275571)
chr1 (102-245)||(33458290-33458434)
chr1 (43-245)||(24927076-24927293)
chr1 (36-245)||(24964017-24964229)
chr1 (156-245)||(4280165-4280254)
chr1 (120-176)||(12184013-12184069)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (25-247)||(28525683-28525912)
chr5 (25-247)||(28531779-28532008)
chr5 (27-244)||(7389847-7390071)
chr5 (32-245)||(41296914-41297134)
chr5 (25-245)||(12686476-12686703)
chr5 (25-245)||(12692578-12692805)
chr5 (27-245)||(20499773-20499998)
chr5 (26-245)||(30384684-30384908)
chr5 (32-245)||(32094526-32094746)
chr5 (31-245)||(32097326-32097546)
chr5 (43-245)||(19060086-19060298)
chr5 (99-245)||(30771918-30772063)
chr5 (126-245)||(8706792-8706911)
chr5 (123-245)||(14609766-14609888)
chr5 (24-141)||(14609909-14610032)
chr5 (25-245)||(19066409-19066632)
chr5 (154-243)||(26318676-26318765)
chr5 (149-245)||(26509492-26509584)
chr5 (191-230)||(25408435-25408474)
chr5 (165-245)||(22647931-22648012)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (28-247)||(8651104-8651330)
chr6 (27-247)||(21770865-21771091)
chr6 (41-230)||(31756533-31756728)
chr6 (28-245)||(21197341-21197566)
chr6 (27-245)||(21783624-21783850)
chr6 (28-245)||(21191170-21191395)
chr6 (28-245)||(4580622-4580846)
chr6 (25-245)||(30905878-30906105)
chr6 (32-245)||(25353848-25354066)
chr6 (128-245)||(17581239-17581356)
chr6 (32-245)||(25343262-25343479)
chr6 (27-171)||(21789847-21789999)
chr6 (124-247)||(6096943-6097067)
chr6 (101-245)||(1105948-1106093)
chr6 (45-132)||(17581384-17581477)
chr6 (139-245)||(12801956-12802063)
chr6 (130-175)||(1283280-1283325)
chr6 (27-99)||(28728071-28728143)
chr6 (155-245)||(13007350-13007441)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (25-245)||(173187-173414)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (28-247)||(10699662-10699888)
chr8 (28-247)||(22220028-22220254)
chr8 (32-247)||(10705471-10705692)
chr8 (51-247)||(39735863-39736065)
chr8 (28-245)||(5542461-5542686)
chr8 (25-247)||(42033430-42033663)
chr8 (28-245)||(32896647-32896871)
chr8 (104-247)||(39727668-39727811)
chr8 (28-245)||(32890523-32890747)
chr8 (25-245)||(36818607-36818834)
chr8 (103-245)||(14417596-14417738)
chr8 (28-245)||(42993301-42993524)
chr8 (25-245)||(9934918-9935143)
chr8 (148-245)||(1883264-1883362)
chr8 (99-245)||(17954141-17954289)
chr8 (25-65)||(14417763-14417803)
chr8 (128-166)||(11641418-11641456)
chr8 (161-222)||(30890531-30890593)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (43-245)||(13908-14117)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (28-245)||(12030-12254)
scaffold0208 (28-245)||(6157-6381)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (34-245)||(5602-5821)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (103-245)||(981-1123)
scaffold0363 (25-65)||(916-956)
[»] scaffold1114 (1 HSPs)
scaffold1114 (25-245)||(698-925)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (100-245)||(38063-38207)


Alignment Details
Target: scaffold0440 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 1491 - 1714
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccgggtcatccggacatccacccattg 123  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1491 agtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggattttccattattccgggtcatccggacatccactcattg 1590  T
Q  124 agtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1591 agtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattg 1690  T
Q  224 ataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1691 ataaatagctaatataattattgt 1714  T

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Target: chr7 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 3811466 - 3811695
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      || |||||||||||||||    
T  3811466 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 3811565  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811566 tcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 3811665  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811666 caattgataaatagctaatataattattgt 3811695  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 3817608 - 3817837
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      || |||||||||||||||    
T  3817608 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 3817707  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3817708 tcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttcatcactaatcaactaaggccca 3817807  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817808 caattgataaatagctaatataattattgt 3817837  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 351649 - 351420
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattcc------gggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||      ||| |||||||||||||||    
T  351649 agtttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccagtaatgggccatccggacatccac 351550  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  351549 tcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctga 351450  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351449 caattgataaatagctaatataattattgt 351420  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 339242 - 339014
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccacc 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||     
T  339242 agtttgtcgtgtacggtatattggggaccatgacctcttttatattggatggccattaggtttcccattattccagtaatgggccatccggacatccact 339143  T
Q  119 cattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccac 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  339142 cattgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctgac 339043  T
Q  219 aattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  339042 aattgataaatagctaatataattattgt 339014  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5849392 - 5849163
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||      |  |||||| ||||||||    
T  5849392 agtttgccgtgtacggtatattgaggaccatagcctcttttatattggatgaccattaaggtttctcattattccgttaatggaccatccgaacatccac 5849293  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5849292 tcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctca 5849193  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5849192 caattgataaataactaatataattattgt 5849163  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26383531 - 26383304
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattcc------gggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||||    
T  26383531 agtttgccgtgtccggtgtattagggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccattaatgggtcatccggacatccac 26383432  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26383431 tcattgagtccatattcattaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctca 26383332  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26383331 caattgataaatagctaatataattatt 26383304  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 35148306 - 35148535
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattag-gtttcccattattccgg------gtcatccggacatccac 117  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |       | |||||||||||||||    
T  35148306 agtttgccatgtacggtgtattggggatcatagcctcttttatattggatggccattagagtttcccattattctgttaatgagccatccggacatccac 35148405  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35148406 tcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatccaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctca 35148505  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148506 taattgataaatagctaatataattattgt 35148535  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 247
Target Start/End: Original strand, 35152849 - 35153055
Alignment:
Q  48 gggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35152849 gggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattgagtccatatcaactaat 35152948  T
Q  141 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  35152949 taaatatttaattaattatccaattagaaatcgaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatatctaatataa 35153048  T
Q  241 ttattgt 247  Q
    |||||||    
T  35153049 ttattgt 35153055  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 247
Target Start/End: Original strand, 22742229 - 22742456
Alignment:
Q  27 tttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccc 119  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| |    
T  22742229 tttgccatgtacggtatattggagaccatagtctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 22742328  T
Q  120 attgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccaca 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22742329 attgagtccatatcaactacttatatatttaattaattatctaattagaaatctaatagccttattacttaattttatcactaatcaactaaggctcaca 22742428  T
Q  220 attgataaatagctaatataattattgt 247  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22742429 gttgataaataactaatataattattgt 22742456  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 28421256 - 28421483
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || |||||||||||||||    
T  28421256 agtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 28421355  T
Q  118 ccat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaagg 213  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28421356 tcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagg 28421451  T
Q  214 cccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28421452 ctcacaattgataaatagctaatataattatt 28421483  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26380838 - 26380751
Alignment:
Q  150 aattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26380838 aattaattatccaattagaaatctaatagccttattatttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaata 26380751  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Original strand, 42767505 - 42767661
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||| |||||||||      | |||||| ||||||||| ||    
T  42767505 ttgccgtgtacggtatattcgggaccatagcctcttttatat---atggccattagggtttcctattattccgttaatggatcatccagacatccactca 42767601  T
Q  121 ttga-gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagc 179  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42767602 ttgaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattaaaaatctaatagc 42767661  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 245
Target Start/End: Original strand, 5979479 - 5979701
Alignment:
Q  32 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttat-attagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccat-- 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||  ||||||||||||| |      || |||||| ||||||| ||||      
T  5979479 cgtgtacggtgtattggggaccataacctcttttattattggatgaccattagactttcccattattctgttaattggccatccgaacatccatccatgt 5979578  T
Q  122 tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaa-ggcccac 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |      
T  5979579 tgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagggctcta 5979674  T
Q  219 aattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5979675 aattgataaataactaatataattatt 5979701  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 239
Target Start/End: Original strand, 18666880 - 18667006
Alignment:
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaat---tatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa--ctaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||    
T  18666880 ccattgagtccatatcaactaattaaaaatttaattaataactatacaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcacttatcaattataag 18666979  T
Q  213 gcccacaattgataaatagctaatata 239  Q
    || |||  |||||||||| ||||||||    
T  18666980 gctcacggttgataaataactaatata 18667006  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43539839 - 43539630
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | |||||| ||| || ||||||||      |||||||| |||||||||    
T  43539839 agtttgccgtgcacggtatattggggaccataacctcttttatattgggtgaccattagggttttccgttattccgttaatgggtcatccagacatccac 43539740  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||                 | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43539739 tcattgagtccatatcaattaattaaatatt-----------------ataaatctaaaa-ccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctca 43539658  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  43539657 caaatgataaataattaatataattatt 43539630  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8824542 - 8824446
Alignment:
Q  148 ttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8824542 ttaattaattatctaaa-agaaatctaatatccttattacctaattcgatcattaatcaattaagcctcacaattgataaatagctaatataattatt 8824446  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Original strand, 30219501 - 30219598
Alignment:
Q  147 tttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattat 244  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||    
T  30219501 tttaattaactatctaattagaaatctaataactttataacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattaataaataactactattattat 30219598  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 204
Target Start/End: Original strand, 18657029 - 18657132
Alignment:
Q  99 gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgat 197  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18657029 gggtcatccagacatccactcatagagtccatattaattaatttaaa---taattaattatccaaataaaaatctaattagccttattacttaatgtgat 18657125  T
Q  198 cactaat 204  Q
    |||||||    
T  18657126 cactaat 18657132  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 20238809 - 20238762
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatg 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20238809 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatg 20238762  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7608276 - 7608146
Alignment:
Q  38 cggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccat 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||| |||  ||||||| |      ||||||||||||||||||| |||| |  ||||    
T  7608276 cggtgtattggggaccataacatcttttatattggatggtcattagggtttttcattatttcattaatgggtcatccggacatccactcattaaccccat 7608177  T
Q  131 atcaactaatt-aaatatttaattaattatc 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7608176 atcaactaattaaaatatttaattaattatc 7608146  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15843809 - 15843733
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtac-ggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattag-gtttcccattattccg 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  15843809 agtttgccgtgtaccggtgtattggagaccataacctcttttatattggatgaccattagagtttcccattattccg 15843733  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15860918 - 15860842
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtac-ggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattag-gtttcccattattccg 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  15860918 agtttgccgtgtaccggtgtattggagaccataacctcttttatattggatgaccattagagtttcccattattccg 15860842  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 176
Target Start/End: Original strand, 16914037 - 16914092
Alignment:
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat 176  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16914037 ttgagttcatatcaattaattaaatatataattaattattcaattagaaatttaat 16914092  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24689772 - 24689729
Alignment:
Q  144 atatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattac 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24689772 atatttaattaattatcaaattaaaaatctaatagccttattac 24689729  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 26380925 - 26380837
Alignment:
Q  46 tggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccgggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaa 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||| | |||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  26380925 tggggaccatagc-tcttttatattggatgaccattaagatttcccattatat-gggtcatccggacatgcactcattgagttcatatcaa 26380837  T

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Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31002230 - 31002009
Alignment:
Q  33 gtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgag 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||    
T  31002230 gtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattgag 31002131  T
Q  126 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31002130 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat 31002031  T
Q  226 aaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31002030 aaatagctaatataattattgt 31002009  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31008208 - 31007987
Alignment:
Q  33 gtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgag 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||      |||||| ||||||||||| |||||||    
T  31008208 gtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcccattattccgttaatgggtcattcggacatccactcattgag 31008109  T
Q  126 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31008108 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat 31008009  T
Q  226 aaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31008008 aaatagctaatataattattgt 31007987  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30965182 - 30964960
Alignment:
Q  32 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||||||    
T  30965182 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggccattaggatttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattga 30965083  T
Q  125 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattga 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30965082 atccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattga 30964983  T
Q  225 taaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30964982 taaatagctaatataattattgt 30964960  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 28683242 - 28683471
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || |||||||||||||||    
T  28683242 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 28683341  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683342 tcattgagtccatatcaactaattaaatgtttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 28683441  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28683442 caattgataaataactaatataattattgt 28683471  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Original strand, 13149990 - 13150216
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||      ||||||||| |||||||| ||    
T  13149990 ttgccgtgtacggtatattggggaccataacctcttttatattagatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccgtacatccactca 13150089  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13150090 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcaataatcaactaatgcccacaa 13150189  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13150190 ttgataaatagctaatataattattgt 13150216  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Original strand, 35439671 - 35439897
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  35439671 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 35439770  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  35439771 ttaagttcatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaatcaaggctcacaa 35439870  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||    
T  35439871 ttgataaataacgaatataattattgt 35439897  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Original strand, 44717106 - 44717332
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  44717106 ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggttttccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 44717205  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  44717206 ttaagtccatatcaactaattatatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaa 44717305  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  44717306 ttgataaatagctaatataattattgt 44717332  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 35442211 - 35442359
Alignment:
Q  99 gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatc 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35442211 gggtcatccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatc 35442310  T
Q  199 actaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35442311 actaatcaatcaaggctcacaattgataaatagcgaatataattattgt 35442359  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19879458 - 19879229
Alignment:
Q  27 tttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatta-----gatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatcc 115  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||     |||||| |||| ||||||||||||||||      ||||||| |||||| |    
T  19879458 tttgccgtgtacgatgtattggcgaccataacctcttttatgttatattggatggccattaagtttcccattattccgttaatgggtcatctggacattc 19879359  T
Q  116 acccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcc 215  Q
    || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19879358 actcattgagtcaatatcaattaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggct 19879259  T
Q  216 cacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19879258 cacaattaataaatagctaatatagttatt 19879229  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13455958 - 13455734
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  13455958 ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 13455859  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  13455858 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 13455763  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13455762 acaattgataaatagctaatataattatt 13455734  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13461899 - 13461675
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  13461899 ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 13461800  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  13461799 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 13461704  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13461703 acaattgataaatagctaatataattatt 13461675  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 35084980 - 35085204
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  35084980 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 35085079  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  35085080 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 35085175  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35085176 acaattgataaatagctaatataattatt 35085204  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 35090953 - 35091177
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  35090953 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 35091052  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  35091053 tgttgagtctatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 35091148  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35091149 acaattgataaatagctaatataattatt 35091177  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 247
Target Start/End: Original strand, 7771508 - 7771713
Alignment:
Q  48 gggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtcca-tatcaactaat 140  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |      |||||||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  7771508 gggaccataacct-ttttatattggatgacgattaggtttcccattattctgttaatgggtcatccggacgtccactcatcgagtcccgtatcaactaat 7771606  T
Q  141 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  7771607 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagctttattacttaatttgatcagtaatcaactaagacttacaattgataaatagctaatataa 7771706  T
Q  241 ttattgt 247  Q
    |||||||    
T  7771707 ttattgt 7771713  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36750269 - 36750049
Alignment:
Q  32 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccat--t 122  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| |||  |    
T  36750269 cgtgtacggtgtattggagaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgtt 36750170  T
Q  123 gagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36750169 gagtccatatcaactaattaaata----attaaatatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaa 36750074  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36750073 ttgataaatagctaatataattatt 36750049  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 176
Target Start/End: Original strand, 11048853 - 11049010
Alignment:
Q  26 gtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacc 118  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||      |||||||| ||||||||||    
T  11048853 gtttgccgtgtacgatgtattggggaccatagcctcttttatattggatcgccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccagacatccacc 11048952  T
Q  119 cattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11048953 cattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatctaatcagaaatctaat 11049010  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23343416 - 23343198
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacc 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||||| |      |||||||||||||||||||    
T  23343416 agtttcccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggtttccattattctgttaatgggtcatccggacatccacc 23343317  T
Q  119 cat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaatta-tccaattagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 214  Q
     ||  |||||||||||| |            ||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23343316 tatattgagtccatatcca------------ttaattaattactctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggc 23343229  T
Q  215 ccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
     |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23343228 tccaaattgataaatagttaatataattatt 23343198  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29832968 - 29832878
Alignment:
Q  117 cccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29832968 cccattgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattaaaagtctaatagtcttattacttaattttatcactaatcaa 29832878  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23283955 - 23283878
Alignment:
Q  169 aatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23283955 aatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagactccaaattgataaataactaatataattatt 23283878  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31651402 - 31651318
Alignment:
Q  109 gacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatt 193  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |  |||||||||||||    
T  31651402 gacatcgactcattgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatctacataaaaatctaattgatttattacttaatt 31651318  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 204
Target Start/End: Original strand, 8342606 - 8342671
Alignment:
Q  140 ttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaat 204  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  8342606 ttaaacatataattaattatctaattagaaatctaattaatcttattatttaatttgatcactaat 8342671  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28765311 - 28765248
Alignment:
Q  152 ttaattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 214  Q
    |||||||||||| || |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28765311 ttaattatccaaataaaaatataattagccttatcatttaatttgatcactaatcaattaaggc 28765248  T

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Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48160818 - 48160592
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || |||||| |||||||| ||    
T  48160818 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccgaacatccactca 48160719  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160718 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 48160619  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  48160618 ttgataaatagctaatataattattgt 48160592  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48167037 - 48166811
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || |||||| |||||||| ||    
T  48167037 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccgaacatccactca 48166938  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48166937 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 48166838  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  48166837 ttgataaatagctaatataattattgt 48166811  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Original strand, 26957104 - 26957330
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccgg------gtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||       | ||||||||||||||| ||    
T  26957104 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgagccatccggacatccactca 26957203  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  26957204 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaattaattaaggctcacaa 26957303  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26957304 ttgataaatagctaatataattattgt 26957330  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 10733649 - 10733874
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || |||||||||||||||    
T  10733649 agtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctt--atattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 10733746  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10733747 tcattaagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctca 10733846  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733847 caattgataaatagctaatataattatt 10733874  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 10947418 - 10947643
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || |||||||||||||||    
T  10947418 agtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctt--atattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 10947515  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10947516 tcattaagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctca 10947615  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10947616 caattgataaatagctaatataattatt 10947643  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 6257506 - 6257729
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccat 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| || |||||||||||      || |||||||| |||||| |||    
T  6257506 ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggatatccactcat 6257605  T
Q  122 tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaat 221  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6257606 tgagcccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagctttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaat 6257705  T
Q  222 tgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6257706 tgataaatagctaatataattatt 6257729  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Original strand, 26971856 - 26972081
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||      |  ||||| ||||||||| |||    
T  26971856 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatggaccatccagacatccactcat 26971955  T
Q  122 tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  26971956 tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatatccttatcacttaatttgatcactaatcaattaagactcacaat 26972055  T
Q  222 tgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26972056 tgataaatagctaatataattattgt 26972081  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 10739636 - 10739861
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||    
T  10739636 agtttaccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctt--atattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccac 10739733  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10739734 tcattaagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaatcagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctca 10739833  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10739834 caattgataaatagctaatataattatt 10739861  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 10953405 - 10953630
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||    
T  10953405 agtttaccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctt--atattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccac 10953502  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10953503 tcattaagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaatcagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctca 10953602  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953603 caattgataaatagctaatataattatt 10953630  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 50168450 - 50168230
Alignment:
Q  32 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattga 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| ||| |||||||| ||      |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  50168450 cgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattgaatgaccattagggttttccattatttcgttaatgggtcattcggtcatccactcattga 50168351  T
Q  125 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| | |||||||||    
T  50168350 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttgttacttgatttgaccactaatcaattaagactcacaattga 50168251  T
Q  225 taaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  50168250 taaatagctaatataattatt 50168230  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Original strand, 44831920 - 44832141
Alignment:
Q  33 gtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgag 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||      |  ||||||||||| ||| |||||||    
T  44831920 gtgttcggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttccaattattccgttaatggaccatccggacatgcactcattgag 44832019  T
Q  126 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||    
T  44832020 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatctaattaaaaatcttataaccttattacttaatttgatcactaatcaactaagatctataattgat 44832119  T
Q  226 aaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  44832120 aaataactaatataattattgt 44832141  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24287845 - 24287622
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  24287845 ttgccgtgtacggtgtattggggac-atagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 24287747  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  24287746 tgttgagtccatatcaactaattaaatatttaaata----tccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 24287651  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24287650 acaatttataaatagctaatataattatt 24287622  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 17627153 - 17627299
Alignment:
Q  99 gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatc 198  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  17627153 gggtcatcctgacatcccctcattgagtccatattaattaatcaaatatttaattaattatctaattggaaatctaataggcttattacttaatttaatc 17627252  T
Q  199 actaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||| | || | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17627253 actaatcaattcagactcacaatcgataaatagctaatataattatt 17627299  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35177650 - 35177425
Alignment:
Q  33 gtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccc--attg 123  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||       |||||||| ||||| ||| |  ||||    
T  35177650 gtgtacggtgtattgaggactataacctcttttatattggatgaccattagggtttctcattattcctttaataggtcatccagacatacactcgtattg 35177551  T
Q  124 agtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc----ccaca 219  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     || |    
T  35177550 agtccatgtcaacaaattaaatatttaaataattatctaattagaaaactaacagccttattacttaatttgatcactaatcaattaatgctcgttcata 35177451  T
Q  220 attgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35177450 attgataaatatctaatataattatt 35177425  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 49976449 - 49976236
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccgggtcatccggacatccacccat-- 121  Q
    |||||||||||||||||     || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||||      
T  49976449 agtttgccgtgtacggt-----ggagaccataacctcttttatattggatggccattagggttttccattattacg--tcatccagacatccacccatat 49976357  T
Q  122 tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    ||| |||||||| | |||||||    |||||||||  || ||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||    
T  49976356 tgaatccatatccattaattaa----ttaattaatattctaaacaaaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctccaaa 49976261  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattatt 245  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  49976260 ttaataaatagctaatataattatt 49976236  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 50155813 - 50155657
Alignment:
Q  32 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattga 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||| |||||| ||||| | ||      | |||||||||||||||| |   ||    
T  50155813 cgtgtacggtgtattggggaccataacttcttttatattggatgatcattatggtttctcattagttcgttaatggatcatccggacatccactc---ga 50155717  T
Q  125 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50155716 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattaaaaatctaatagccttat 50155657  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 236
Target Start/End: Original strand, 19686696 - 19686833
Alignment:
Q  99 gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatc 198  Q
    ||||||||| |||||||||   |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   |||| |||| ||| || ||||||| |||||||||||    
T  19686696 gggtcatccagacatccactgcttgagttcatatcaattaattaaatattcaattaattattttattataaatttaacagtcttattatttaatttgatc 19686795  T
Q  199 actaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaat 236  Q
    ||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||    
T  19686796 actaatcaattaagacacacaatcgataaatagctaat 19686833  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 50426980 - 50426882
Alignment:
Q  147 tttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||  |||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  50426980 tttaattaattatctcattgaaaatttaataactttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacacttgataaataactaatataattatt 50426882  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 75
Target Start/End: Original strand, 33458563 - 33458614
Alignment:
Q  24 aagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatg 75  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33458563 aagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatg 33458614  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 75
Target Start/End: Original strand, 33461689 - 33461739
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatg 75  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33461689 agtttaccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatg 33461739  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4632140 - 4632012
Alignment:
Q  111 catccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatag-ccttattacttaatttgatcactaatcaact 209  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||    |||||||||  || || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4632140 catccactcatt-agtccatatccactaattaa----ttaattaatactctaagtagaaatctaataaaccttattacttaatttgattactaatcaatt 4632046  T
Q  210 aaggcccacaattgataaatagctaatataatta 243  Q
    ||| |    |||||||||||| ||||||||||||    
T  4632045 aagacttcaaattgataaataactaatataatta 4632012  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 247
Target Start/End: Original strand, 33461797 - 33461841
Alignment:
Q  203 atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33461797 atcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgt 33461841  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 247
Target Start/End: Original strand, 33458672 - 33458716
Alignment:
Q  203 atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33458672 atcaactaaggctcacaattgataaatagttaatataattattgt 33458716  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 4632234 - 4632192
Alignment:
Q  34 tgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatgg 76  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4632234 tgtactgtatattggggaccataacctcttttatattggatgg 4632192  T

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Target: chr3 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Original strand, 10769270 - 10769496
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  10769270 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 10769369  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10769370 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaa 10769469  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10769470 ttgataaatagctaatataattattgt 10769496  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 49151474 - 49151245
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || |||||||||||||||    
T  49151474 agtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 49151375  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49151374 tcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 49151275  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49151274 caattgataaatagctaatataattattgt 49151245  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 49157541 - 49157312
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || |||||||||||||||    
T  49157541 agtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 49157442  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157441 tcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 49157342  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157341 caattgataaatagctaatataattattgt 49157312  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Original strand, 10760955 - 10761177
Alignment:
Q  32 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||||||    
T  10760955 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattga 10761054  T
Q  125 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10761055 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattga 10761154  T
Q  225 taaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10761155 taaatagctaatataattattgt 10761177  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Original strand, 38449364 - 38449590
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||    
T  38449364 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca 38449463  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  38449464 ttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaa 38449563  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  38449564 ttgataaatagctaatataattattgt 38449590  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Original strand, 38455851 - 38456077
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||    
T  38455851 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca 38455950  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  38455951 ttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaacactcacaa 38456050  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  38456051 ttgataaatagctaatataattattgt 38456077  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 30051399 - 30051627
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||      || |||||||||||||||     
T  30051399 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccact 30051498  T
Q  119 cattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccac 218  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30051499 cgttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatatctttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcac 30051598  T
Q  219 aattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30051599 aattgataaatagctaatataattattgt 30051627  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8331649 - 8331420
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||    
T  8331649 agtttgccgtgtacagtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccac 8331550  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8331549 tcattaagtccatatcaactgattaaatatttaattaattatccaattagaaatcttatatccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggtcca 8331450  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331449 caattgataaatagctaatataattattgt 8331420  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28964742 - 28964513
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||||      |  |||||||||||||||    
T  28964742 agttttccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttctcattattccgttaatggaccatccggacatccac 28964643  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28964642 tcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaataactttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctca 28964543  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28964542 caatttataaatagctaatataattattgt 28964513  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 23138795 - 23138943
Alignment:
Q  99 gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatc 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23138795 gggtcatccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagtcttattacttaatttgatc 23138894  T
Q  199 actaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138895 actaatcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgt 23138943  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 11840026 - 11840250
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  11840026 ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 11840125  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  11840126 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 11840221  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11840222 acaattgataaatagctaatataattatt 11840250  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 42191521 - 42191745
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  42191521 ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 42191620  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  42191621 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 42191716  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42191717 acaattgataaatagctaatataattatt 42191745  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 42197463 - 42197687
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  42197463 ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 42197562  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  42197563 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 42197658  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197659 acaattgataaatagctaatataattatt 42197687  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 109 - 247
Target Start/End: Original strand, 53071640 - 53071778
Alignment:
Q  109 gacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaac 208  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53071640 gacatccactcattgagttcatatcaactaattaaatattcaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaac 53071739  T
Q  209 taaggcccacaattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53071740 taaggctcacaattgataaataactaatataattattgt 53071778  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 10238513 - 10238737
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  10238513 ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 10238612  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  10238613 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgaacactaatcaattaaggctc 10238708  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238709 acaattgataaatagctaatataattatt 10238737  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 10244635 - 10244859
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  10244635 ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 10244734  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  10244735 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgaacactaatcaattaaggctc 10244830  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244831 acaattgataaatagctaatataattatt 10244859  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 26429718 - 26429942
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  26429718 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatactggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 26429817  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  26429818 tgttgagcccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 26429913  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26429914 acaattgataaatagctaatataattatt 26429942  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 17056090 - 17056316
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccgg-----gtcatccggacatccacc 118  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      | |||||||||||||||     
T  17056090 agtttgccgtgtacgatgtattggggaccatagcctcttttatattggatgtccattagggtttcccattattccgttaataggcatccggacatccact 17056189  T
Q  119 cat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 214  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17056190 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggc 17056285  T
Q  215 ccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17056286 tcacaattgataaatagataatataattatt 17056316  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 247
Target Start/End: Original strand, 24643891 - 24644017
Alignment:
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  24643891 ttgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttgttacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaa 24643990  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24643991 ttgataaataactaatgtaattattgt 24644017  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Original strand, 11846359 - 11846502
Alignment:
Q  103 catccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 201  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11846359 catccggacatccactcattgactcaatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 11846458  T
Q  202 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||| | |||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11846459 aatccattaaggctctaaattgataaataactaatataattatt 11846502  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46656531 - 46656353
Alignment:
Q  36 tacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtcc 128  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||  | | |||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  46656531 tacggtgtattgggaaccataacctcttttatattggataaccaatagggtttcccattattccgttaataggtcatccggacatccactcatcgagtac 46656432  T
Q  129 atatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46656431 atatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagctttattacttaatttgatcactaatcaa 46656353  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 55003706 - 55003926
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacc 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |      ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||     
T  55003706 agtttgtcgtgtacggtatattggggaccataacctcttttatattggatgac------gtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 55003799  T
Q  119 cat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 214  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  55003800 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaataaattaaggc 55003895  T
Q  215 ccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
     |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  55003896 tctaaattgataaataactaatataattatt 55003926  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34300197 - 34300073
Alignment:
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  | |||||    
T  34300197 ttgagttcatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattaaaaatttaatagtcttattacttaattcaattactaatcaattaattctcacaa 34300098  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  34300097 ttgataaatagttaatataattatt 34300073  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 245
Target Start/End: Original strand, 8474543 - 8474660
Alignment:
Q  129 atatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaact-aaggcccacaattgataa 227  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  8474543 atatcaattaattaaatatttaattaattattgaattataaatctaataacattattacttaatttgatcactaatcaattaaaggcccacaattgatta 8474642  T
Q  228 atagctaatataattatt 245  Q
    | || |||||||||||||    
T  8474643 aaagttaatataattatt 8474660  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 245
Target Start/End: Original strand, 2982625 - 2982751
Alignment:
Q  120 attgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatct-aatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccac 218  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  2982625 attgagtttatatcaactaattaaatatttaattaatttttcaattagaaatctaaatatctttattatttaatttgatcactaatcaaataaggctcgc 2982724  T
Q  219 aattgataaatagctaatataattatt 245  Q
     |||||||||||| | |||||||||||    
T  2982725 tattgataaatagattatataattatt 2982751  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 17601912 - 17602058
Alignment:
Q  99 gggtcatccggacatccacccat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaattt 194  Q
    ||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17601912 gggtcattcggacatccaatcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaattt 17602007  T
Q  195 gatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    || |||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17602008 gaccactaatcaattaaggctctaaattgataaataactaatataattatt 17602058  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Original strand, 48128338 - 48128451
Alignment:
Q  26 gtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatt-aggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccacc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||     
T  48128338 gtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattaaggttttccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 48128437  T
Q  119 cattgagtccatat 132  Q
    ||||||||||||||    
T  48128438 cattgagtccatat 48128451  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 245
Target Start/End: Original strand, 12109067 - 12109191
Alignment:
Q  120 attgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccaca 219  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| || ||| | |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||    
T  12109067 attgagtccatatcaattaatcaaatgtttaatcaattatctaattagaaa-cttataacattatcacttaattttatcactaatcaattaaagatcaca 12109165  T
Q  220 attgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||    
T  12109166 attgataaataactaatacaattatt 12109191  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 245
Target Start/End: Original strand, 9586490 - 9586537
Alignment:
Q  198 cactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9586490 cactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattatt 9586537  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 199
Target Start/End: Original strand, 27103272 - 27103344
Alignment:
Q  128 catatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatc-taatagccttattacttaatttgatca 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  27103272 catatcaattaattaaatatttaattaattatccaatttaaaatcttaattgtcttattactttatttgatca 27103344  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 13367144 - 13367209
Alignment:
Q  34 tgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattccg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  13367144 tgtacggtatattggggaccatagcctc-tttatattggatggtcattagggtttcccattattccg 13367209  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13444911 - 13444847
Alignment:
Q  33 gtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattatt 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  13444911 gtgtacggtgtattggggaccataacctattttatattggatggccattagggtttcccattatt 13444847  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 17593487 - 17593531
Alignment:
Q  26 gtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatt 70  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17593487 gtttgccgtgtacggtatatttgggaccagagcctcttttatatt 17593531  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 207
Target Start/End: Original strand, 27088019 - 27088097
Alignment:
Q  130 tatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatc-taatagccttattacttaatttgatcactaatcaa 207  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  27088019 tatcaattaattagatttttaattaattatccaatttaaaatcttaattgtcttaatactttatttgatcattaatcaa 27088097  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 243
Target Start/End: Original strand, 52222937 - 52222995
Alignment:
Q  185 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataatta 243  Q
    |||||||||  ||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  52222937 tacttaattatatcactaattaattaaggccccaaattgataaatagataatataatta 52222995  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 9760570 - 9760506
Alignment:
Q  34 tgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattcc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  9760570 tgtacggtatattggggaccatatcctc-tttatattggatgaccattagggtttcctattattcc 9760506  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 65
Target Start/End: Original strand, 53069346 - 53069386
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctctttt 65  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  53069346 agtttgccatgtacggtgtattgaggaccatagcctctttt 53069386  T

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Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31051399 - 31051177
Alignment:
Q  32 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||||||    
T  31051399 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattga 31051300  T
Q  125 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31051299 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattga 31051200  T
Q  225 taaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31051199 taaatagctaatataattattgt 31051177  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31057899 - 31057677
Alignment:
Q  32 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattga 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||||||    
T  31057899 cgtgtacggtatattggggatcatagcctcttttatattgtatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattga 31057800  T
Q  125 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31057799 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattga 31057700  T
Q  225 taaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31057699 taaatagctaatataattattgt 31057677  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34739848 - 34739619
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || |||||||||||||||    
T  34739848 agtttgtcgtgtacggtatattggggaccacagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 34739749  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34739748 tcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccct 34739649  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34739648 caatttataaatagctaatataattattgt 34739619  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 38152261 - 38152484
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacc 118  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||        
T  38152261 agtttgtcgtgtacggtgtattgggaaccatagcctcttttatattggatggtcattaggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatc---- 38152356  T
Q  119 cattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccac 218  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38152357 -attgagttcatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccac 38152455  T
Q  219 aattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  38152456 aattgataaataattaatataattattgt 38152484  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 8093143 - 8093372
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||    
T  8093143 agtttgccgtgttcggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatgatcgttagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccac 8093242  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||    
T  8093243 tcattgagtccatatcaactaattaaacatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgattattaatcaactaagactca 8093342  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8093343 caattgataaataactaatataattattgt 8093372  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44409844 - 44409635
Alignment:
Q  43 tattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaa 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||      || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  44409844 tattggggaccataacctcttttatattggatggccattagggtttctcattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccatattaa 44409745  T
Q  136 ctaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44409744 ctaattaaatatttaattaattatccaattagaaacctaatagccttattacctaatttaatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaa 44409645  T
Q  236 tataattatt 245  Q
    ||||||||||    
T  44409644 tataattatt 44409635  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 25387805 - 25388027
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattcc------gggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||      ||| ||||||||||||||| ||    
T  25387805 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccattaatgggccatccggacatccactca 25387904  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccac 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  25387905 ttaagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 25388000  T
Q  219 aattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||    
T  25388001 aattgataaataaataatataattatt 25388027  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1078103 - 1077879
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||    
T  1078103 ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca 1078004  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  1078003 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 1077908  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1077907 acaattgataaatagctaatataattatt 1077879  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 25381836 - 25382060
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattcc------gggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||      ||| ||||||||||||||| ||    
T  25381836 ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccattaatgggccatccggacatccactca 25381935  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  25381936 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 25382031  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25382032 acaattgataaatagctaatataattatt 25382060  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 50306057 - 50305832
Alignment:
Q  27 tttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccc 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| |    
T  50306057 tttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 50305958  T
Q  120 at--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcc 215  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  50305957 atgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggct 50305862  T
Q  216 cacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50305861 cacaattgataaatagctaatataattatt 50305832  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 120 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27954921 - 27954798
Alignment:
Q  120 attgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccaca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  27954921 attgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcaaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagcctcaca 27954822  T
Q  220 attgataaatagctaatataatta 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  27954821 attgataaataactaatataatta 27954798  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 25275425 - 25275571
Alignment:
Q  99 gggtcatccggacatccacccat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaattt 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25275425 gggtcatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaattt 25275520  T
Q  195 gatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25275521 gatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattatt 25275571  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 245
Target Start/End: Original strand, 33458290 - 33458434
Alignment:
Q  102 tcatccggacatccacccat-tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcac 200  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33458290 tcatccggacatccactcacattagtccatatcagttaattaaatatttaagtaattatctagttagaaatctaatagcattattacttaatttgatcac 33458389  T
Q  201 taatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  33458390 taatcaattaaggctcacaattgataaataaccaatataactatt 33458434  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 245
Target Start/End: Original strand, 24927076 - 24927293
Alignment:
Q  43 tattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaa 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      || ||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  24927076 tattgggaaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccagacatccacc-attgagtccatatcca 24927174  T
Q  136 ctaattaaatatttaattaatta--------tccaattagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgata 226  Q
     ||||||| || |||||||||||        || || ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||    
T  24927175 ttaattaattaattaattaattaattaatattctaaatagaaatcttataagccttgttacttaatttgatcactaatcaattaagactccaaattgata 24927274  T
Q  227 aatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24927275 aatagctaatataattatt 24927293  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Original strand, 24964017 - 24964229
Alignment:
Q  36 tacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtcca 129  Q
    |||||| | |||| || |||||| |||||||||||||||| | |||||| || ||||| |||||      |||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  24964017 tacggtgtcttggtgatcatagcatcttttatattagatgacaattagggtttccatttttccgttaatgggtcattcagacatccacccattgagttca 24964116  T
Q  130 tatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaa 228  Q
    |||| | |||||||    |||||||||  || || ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||    
T  24964117 tatccattaattaa----ttaattaatattctaaatagaaatcttataagctttattacttaatttgatcactaatcaattaaggcttcaaattgataaa 24964212  T
Q  229 tagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||    
T  24964213 tagctaatataattatt 24964229  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 245
Target Start/End: Original strand, 4280165 - 4280254
Alignment:
Q  156 ttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4280165 ttatcaaattagatatctaataatcttattacttaatttgatcactaatcaattaaggttcacaattgataaatagttaatataattatt 4280254  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 176
Target Start/End: Original strand, 12184013 - 12184069
Alignment:
Q  120 attgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12184013 attgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaaatagaaatctaat 12184069  T

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Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 28525683 - 28525912
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || |||||||||||||||    
T  28525683 agtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 28525782  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28525783 tcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 28525882  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28525883 caattgataaatagctaatataattattgt 28525912  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 28531779 - 28532008
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || |||||||||||||||    
T  28531779 agtttgccatgtacggtatattggagaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 28531878  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531879 tcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 28531978  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531979 caattgataaatagctaatataattattgt 28532008  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 244
Target Start/End: Original strand, 7389847 - 7390071
Alignment:
Q  27 tttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattag-gtttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccc 119  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||      ||||||||| |||||||| |    
T  7389847 tttgccgtgtacagtatattgggaaccatagcctcttttatattggatggccattagagtttcccattattccgttaatgggtcatccgaacatccactc 7389946  T
Q  120 attgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccaca 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  7389947 attaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagactcaca 7390046  T
Q  220 attgataaatagctaatataattat 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  7390047 attgataaatagctaatataattat 7390071  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41297134 - 41296914
Alignment:
Q  32 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattga 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |      |||||||||||||||||| ||||||    
T  41297134 cgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattctgttaatgggtcatccggacatccactcattga 41297035  T
Q  125 gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattga 224  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41297034 gtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattga 41296935  T
Q  225 taaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41296934 taaatagctaatataattatt 41296914  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 12686476 - 12686703
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || |||||||||||||||    
T  12686476 agtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 12686575  T
Q  118 ccat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaagg 213  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12686576 tcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagg 12686671  T
Q  214 cccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686672 ctcacaattgataaatagctaatataattatt 12686703  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 12692578 - 12692805
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || |||||||||||||||    
T  12692578 agtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 12692677  T
Q  118 ccat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaagg 213  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12692678 tcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagg 12692773  T
Q  214 cccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692774 ctcacaattgataaatagctaatataattatt 12692805  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20499998 - 20499773
Alignment:
Q  27 tttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccc 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| ||| |||||||| ||      || ||||| ||||||||| |    
T  20499998 tttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatttattggatgaccattagggttttccattatttcgttaatgggccatccagacatccactc 20499899  T
Q  120 attgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccaca 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  20499898 attgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatcttactagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaatcaattaagactcaca 20499799  T
Q  220 attgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20499798 attgataaatagctaatataattatt 20499773  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Original strand, 30384684 - 30384908
Alignment:
Q  26 gtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccgg------gtcatccggacatccaccc 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||       ||||||| ||||||||| |    
T  30384684 gtttgccgtgtacggtgtattggg-accatagtctcttttatattggatgactattagattttccattattccgttaatgagtcatccagacatccactc 30384782  T
Q  120 attgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccaca 219  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  30384783 attgaatccatatctattaatgaaatatttaattaattatctaattagaaatccaatagccttattacttaatttaatcactaatcaattaaggctcaca 30384882  T
Q  220 attgataaatagctaatataattatt 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  30384883 actgataaatagctaatataattatt 30384908  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 245
Target Start/End: Original strand, 32094526 - 32094746
Alignment:
Q  32 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccat--t 122  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||| ||| |||  |    
T  32094526 cgtgtacggtgtatttgggaccatagcctcttttatattagatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatacactcatgtt 32094625  T
Q  123 gagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32094626 gagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaa 32094721  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  32094722 ttgataaatagttaatataattatt 32094746  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 32097326 - 32097546
Alignment:
Q  31 ccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccat-- 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| |||      
T  32097326 ccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgt 32097425  T
Q  122 tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  32097426 tgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagcttattatttaatttgatcactaaccaattaaggctcacaa 32097521  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32097522 ttgataaatagctaatataattatt 32097546  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 245
Target Start/End: Original strand, 19060086 - 19060298
Alignment:
Q  43 tattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccat--tgagtccatatc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  19060086 tattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggacatccagacatccactcatattgagtccatatc 19060185  T
Q  134 aactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagc 232  Q
     | ||||||| || |||||||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||| |||||||    
T  19060186 cattaattaattaattaattaatattctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagtctccaaattgacaaatagc 19060285  T
Q  233 taatataattatt 245  Q
    |||||||||||||    
T  19060286 taatataattatt 19060298  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30772063 - 30771918
Alignment:
Q  99 gggtcatccggacatccacccat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttga 196  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  30772063 gggtcatccagacatccactcatattgagtccatatcaactaattaattatttaattaattatccaataagaaactttatagccttattacttaatttga 30771964  T
Q  197 tcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  30771963 tcactaatcaattaaggctcacaactgata---agctaatataattatt 30771918  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 245
Target Start/End: Original strand, 8706792 - 8706911
Alignment:
Q  126 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  8706792 tccatatcaattaattaaatatttaataaattatctaattagaaatttaatcgtcttatcacttaatttgatcactaatcaattaagacccacagttgat 8706891  T
Q  226 aaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8706892 aaatagctaatataattatt 8706911  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14609888 - 14609766
Alignment:
Q  123 gagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14609888 gagtccatatcaattaattaaatgtttaattaattatcttactagaaatctaatagttttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaatt 14609789  T
Q  223 gataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  14609788 gataagtaactaatataattatt 14609766  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14610032 - 14609909
Alignment:
Q  24 aagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccac 117  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||      ||| |||||||||||||||    
T  14610032 aagtttgccgtgttcggtgtattggggaccataacctcttttacattagatgaccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccac 14609933  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaatt 141  Q
     ||||||||||||||||| |||||    
T  14609932 tcattgagtccatatcaattaatt 14609909  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 19066409 - 19066632
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||| ||      |||||||| |||||||||    
T  19066409 agtttgtcgtgtccggtgtattggggaccacaacctattttatattggatggtcattagggttttccattatttcgttaatgggtcatccagacatccac 19066508  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
     |||  | |||||||| | |||||||    | |||||||  || || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  19066509 tcatata-tccatatccattaattaa----tcaattaatattctaaatagaaatctaataagccttgttacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 19066603  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
       ||||| |||||  |||||||||||||    
T  19066604 cagattgacaaataattaatataattatt 19066632  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 243
Target Start/End: Original strand, 26318676 - 26318765
Alignment:
Q  154 aattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataatta 243  Q
    ||||||| || || |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||| | || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  26318676 aattatctaaataaaaatctaatatctttattaattaatttaatcactaatcaattaagtctcagaattgatagataactaatataatta 26318765  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26509584 - 26509492
Alignment:
Q  149 taattaattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||     | |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  26509584 taattaattatccaaatagaaatctaatcattcttgttacttaatttgatcact-----attaaggctccaaattgataaatagttaatataattatt 26509492  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 230
Target Start/End: Original strand, 25408435 - 25408474
Alignment:
Q  191 atttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaata 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25408435 atttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaata 25408474  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 245
Target Start/End: Original strand, 22647931 - 22648012
Alignment:
Q  165 tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| || |||| | |  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  22647931 tagaaatctaattagtcttattacttaatttgataactaattaattaagactccaaatttataaataattaatataattatt 22648012  T

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Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Original strand, 8651104 - 8651330
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  8651104 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 8651203  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  8651204 ttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaa 8651303  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  8651304 ttgataaatagctaatataattattgt 8651330  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 247
Target Start/End: Original strand, 21770865 - 21771091
Alignment:
Q  27 tttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg-----ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||| ||    
T  21770865 tttgccgtgtacggtgtattggggaccgtagcctcttttatattggttggccattagggtttcccattattccgttaatggtcatccggacatccactca 21770964  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21770965 ttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattattcaattagaaatctaatagttttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaa 21771064  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21771065 ttgataaatagctaatataattattgt 21771091  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 230
Target Start/End: Original strand, 31756533 - 31756728
Alignment:
Q  41 tatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattcc-----gggtcatccggacatccacccattgagtccatatca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31756533 tatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccttaatgggtcatccggacatccactcattgagtccatatca 31756632  T
Q  135 actaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaata 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31756633 actaattaattatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagacccacaattgataaata 31756728  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 21197341 - 21197566
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggttt-cccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  21197341 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggttttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 21197440  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccaca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  |    
T  21197441 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcagttaaggctctaa 21197540  T
Q  220 attgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21197541 attgataaataactaatataattatt 21197566  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Original strand, 21783624 - 21783850
Alignment:
Q  27 tttgccgtgtacggtatattggggac--catagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||    
T  21783624 tttgccgtgtacggtgtattggggacaccatagcctcttttatattggatgcc-attagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccac 21783722  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  21783723 tcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatttaatagttttattacttaatttgatcactaatccactaagactca 21783822  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21783823 caattgataaatagttaatataattatt 21783850  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 21191170 - 21191395
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||      || |||||| |||||||| ||    
T  21191170 ttgccgtgtaaggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcacattattccgttaatgggccatccgaacatccactca 21191269  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccaca 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |    
T  21191270 ttgaatccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagccatattacttaatttgatcactaatcaattaaggctctaa 21191369  T
Q  220 attgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21191370 attgataaataactaatataattatt 21191395  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 4580622 - 4580846
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattcc------gggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||||||| ||    
T  4580622 ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccattaatgggtcatccggacatccactca 4580721  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  4580722 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 4580817  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580818 acaattgataaatagctaatataattatt 4580846  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 30905878 - 30906105
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |      | |||||| |||||| ||    
T  30905878 agtttgtcgagtacggtgtattgggaaccatagcctcttttatattggatgaccattatggtttcccattattctgttaaaggatcatccagacatctac 30905977  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||    
T  30905978 tcatagagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattactttatttggttactaatcaactaaggctca 30906077  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30906078 caattgataaataactaatataattatt 30906105  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25354066 - 25353848
Alignment:
Q  32 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattag-gtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccat--t 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||      || |||||||| |||||| |||  |    
T  25354066 cgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattagatgaccattagagtttcccattattccgttaatgggccatccggatatccactcatgtt 25353967  T
Q  123 gagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25353966 gagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaa-ataaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaat 25353872  T
Q  222 tgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  25353871 tgataaatagctaatataattatt 25353848  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17581356 - 17581239
Alignment:
Q  128 catatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  17581356 catatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaccataatagtcttattacttaatttgatcactaatcaattgaggctcacaattgataa 17581257  T
Q  228 atagctaatataattatt 245  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17581256 atagttaatataattatt 17581239  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25343479 - 25343262
Alignment:
Q  32 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccat--t 122  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      |  |||||| |||||||| |||  |    
T  25343479 cgtgtacggtgtattggggac-atagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatggaccatccgaacatccactcatgtt 25343381  T
Q  123 gagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||    
T  25343380 gagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaa-ataaatctaattagccttattacttaatttaatcactaatcaattaaggttcacaat 25343286  T
Q  222 tgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  25343285 tgataaatagctaatataattatt 25343262  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 171
Target Start/End: Original strand, 21789847 - 21789999
Alignment:
Q  27 tttgccgtgtacggtatattggggac--catagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||    
T  21789847 tttgccgtgtacggtgtattggggacaccatagcctcttttatattggatgcc-attagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccac 21789945  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaat 171  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21789946 tcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaat 21789999  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 124 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6097067 - 6096943
Alignment:
Q  124 agtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaa-ttagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||    
T  6097067 agtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcaaaattagaaatttaatagccttattacttaatttcatcactaatcaagtaaggctgacaatt 6096968  T
Q  223 gataaatagctaatataattattgt 247  Q
    || |||||  |||||||||||||||    
T  6096967 gacaaataagtaatataattattgt 6096943  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1106093 - 1105948
Alignment:
Q  101 gtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaatt-aaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatca 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||    
T  1106093 gtcatccggacatccactcattgaatccatattaattaatttaaatatttaattaattatgtagttaaaaatttaatagccttatcatttaatttgaaca 1105994  T
Q  200 ctaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||| |||  |  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1105993 ctaatcaaataaaacttacaattgataaatatcaaatataattatt 1105948  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17581477 - 17581384
Alignment:
Q  45 ttggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17581477 ttggggaccatagcctcttttatattggacggttattaggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattgagtccatat 17581384  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Original strand, 12801956 - 12802063
Alignment:
Q  139 attaaatatttaattaattatccaattagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaata 237  Q
    |||||||| |||||||||  || || ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  12801956 attaaataattaattaatattctaaatagaaatctaataagctttattacttaaattgatcactaatcaattaaggctccaaattgacaaatagctaata 12802055  T
Q  238 taattatt 245  Q
    ||||||||    
T  12802056 taattatt 12802063  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1283325 - 1283280
Alignment:
Q  130 tatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1283325 tatcaattaattaaatatataattaattatccaattagaaatctaa 1283280  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 28728143 - 28728071
Alignment:
Q  27 tttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattccg 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28728143 tttgctgtgtacggtatattggggaccatagcctc-attatataggatggccattagggtttcccattattccg 28728071  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13007441 - 13007350
Alignment:
Q  155 attatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||| || ||||||| |||| || ||||||  |||||||||||| ||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13007441 attatctaactagaaatttaattagtcttattgtttaatttgatcattaatcaattagggctccaaattgataaataactaatataattatt 13007350  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 173187 - 173414
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      |  |||||||||||||||    
T  173187 agtttgccgtatacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatagaacatccggacatccac 173286  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  173287 tcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagaccca 173386  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  173387 caattgataaatcgctaatataattatt 173414  T

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Target: chr8 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10699888 - 10699662
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| ||||      |||||||||||||||||| ||    
T  10699888 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttatatttgatgaccattagggtttcccattactccgttaatgggtcatccggacatccactca 10699789  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10699788 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctaattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaa 10699689  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10699688 ttgataaataactagtataattattgt 10699662  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Original strand, 22220028 - 22220254
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||  ||    
T  22220028 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccattca 22220127  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  22220128 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatacccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcttacga 22220227  T
Q  221 ttgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22220228 ttgataaatagctaatataactattgt 22220254  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10705692 - 10705471
Alignment:
Q  32 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgag 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||      || ||||||||||||||| |||||||    
T  10705692 cgtgtacggtatattggagaccatagcctcttttatatttgatgactattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgag 10705593  T
Q  126 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10705592 tccatatcaactaattaaatatttaattaattattcaattagaaatctaatagttttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgat 10705493  T
Q  226 aaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10705492 aaatagctaatataattattgt 10705471  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 51 - 247
Target Start/End: Original strand, 39735863 - 39736065
Alignment:
Q  51 accatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaa 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||      ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39735863 accagagcctcttttatattagatggccattagggtttcccttattccgttaatgggtcatccggacatccactgattgagtccatatcaactaattaaa 39735962  T
Q  145 tatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39735963 tatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaatgctcacaattgataaatagctaatataattat 39736062  T
Q  245 tgt 247  Q
    |||    
T  39736063 tgt 39736065  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 5542461 - 5542686
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||    
T  5542461 ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca 5542560  T
Q  121 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccaca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |    
T  5542561 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagtcttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctctaa 5542660  T
Q  220 attgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5542661 attgataaataactaatataattatt 5542686  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 42033663 - 42033430
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg----------ggtcatccggacat 113  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||          || |||||||||||    
T  42033663 agtttgccgtgtacaatgtattggggaccatagcctcctttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggcgggccatccggacat 42033564  T
Q  114 ccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagg 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42033563 ccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatctaattagaaatctaataaccttattacttaatttgatcactaatcaattaagg 42033464  T
Q  214 cccacaattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033463 ctcacaattgataaatagctaatataattattgt 42033430  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32896871 - 32896647
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  32896871 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 32896772  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  32896771 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 32896676  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896675 acaattgataaatagctaatataattatt 32896647  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Original strand, 39727668 - 39727811
Alignment:
Q  104 atccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39727668 atccggacatccactcattgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattagaaatttaatagccttattacttaatttgatcactaa 39727767  T
Q  204 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgt 247  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39727768 tcaactaagtctcacaattgataaatagctaatataattattgt 39727811  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32890747 - 32890523
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  32890747 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 32890648  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  32890647 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagggtc 32890552  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890551 acaattgataaatagctaatataattatt 32890523  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36818834 - 36818607
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||      || |||||||||||||||    
T  36818834 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 36818735  T
Q  118 ccat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaagg 213  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36818734 tcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattaaccttattacttaatttgatcactaatcaattaagg 36818639  T
Q  214 cccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36818638 ctcacaattgataaatagctaatataattatt 36818607  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14417738 - 14417596
Alignment:
Q  103 catccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcacta 202  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14417738 catccgaacatccactcattgagcccatatcaactaattaaatattcaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcacta 14417639  T
Q  203 atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14417638 atcaactaagactcacaattgataaataactaatataattatt 14417596  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 42993301 - 42993524
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || |||| |||||||||| ||    
T  42993301 ttgccgtgttcggtatattggggaccataacctcttttatattggatggcgattagggtttcccattattccgttaatgggccatc-ggacatccactca 42993399  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  42993400 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 42993495  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42993496 acaattgataaataactaatataattatt 42993524  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9935143 - 9934918
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacc 118  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||||     
T  9935143 agtttgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttat-ttggatggccattaggtttcccattattccgttaatgggtcatccggatatccact 9935045  T
Q  119 cat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 214  Q
    |||  ||||||||||||||  |||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  9935044 catgttgagtccatatcaataaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagctttattacttaatttgatcactaatcaattaagac 9934949  T
Q  215 ccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9934948 tcacaattgataaataactaatataattatt 9934918  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 245
Target Start/End: Original strand, 1883264 - 1883362
Alignment:
Q  148 ttaattaattatccaattagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1883264 ttaattaatattctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaagtaaggctccaaattgataaatagctaatataattatt 1883362  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17954289 - 17954141
Alignment:
Q  99 gggtcatccggacatccacccatt--gagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattactt----aat 192  Q
    |||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    | |||||||||||||| ||||||||||    |||    
T  17954289 gggtcatctgaacatccactcattttgagtccatatcaactaattaattaattaattaatta----aatagaaatctaataggcttattactttagtaat 17954194  T
Q  193 ttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
     |||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17954193 ctgatcactaatcaattaagtctccaaattgataaatagctaatataattatt 17954141  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 14417803 - 14417763
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctctttt 65  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14417803 agtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctttt 14417763  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11641456 - 11641418
Alignment:
Q  128 catatcaactaattaaatatttaattaattatccaatta 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11641456 catatcaattaattaaatatttaattaattatccaatta 11641418  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 222
Target Start/End: Original strand, 30890531 - 30890593
Alignment:
Q  161 caattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt 222  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  30890531 caattagaaatctaattagtcttattaattaatttgatcactaatcaattaagactcacaatt 30890593  T

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Target: scaffold0064 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14117 - 13908
Alignment:
Q  43 tattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaa 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14117 tattggggaccataacctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattgaatccatatcaa 14018  T
Q  136 ctaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14017 ctaattaaatatttaattaattatccaattacaaatctaatagaattattacttaatttgatcactagtcaattaaggctcacgattgataaatagctaa 13918  T
Q  236 tataattatt 245  Q
    ||||||||||    
T  13917 tataattatt 13908  T

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Target: scaffold0208 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12254 - 12030
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  12254 ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 12155  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  12154 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctc 12059  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12058 acaattgataaatagctaatataattatt 12030  T

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Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6381 - 6157
Alignment:
Q  28 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  6381 ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 6282  T
Q  121 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  6281 tgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctt 6186  T
Q  217 acaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6185 taaattgataaataactaatataattatt 6157  T

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Target: scaffold0185 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5821 - 5602
Alignment:
Q  34 tgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccat--tgag 125  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |      ||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  5821 tgtacgatgtattgggaaccatagcctcttttatattgaatggccgttaggtttcccattattctgttaatgggtcatccgaacatccactcatattgag 5722  T
Q  126 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5721 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatcgaattagaaatctaatagtcatattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgat 5622  T
Q  226 aaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  5621 aaataactaatataattatt 5602  T

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Target: scaffold0363 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Original strand, 981 - 1123
Alignment:
Q  103 catccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcacta 202  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  981 catccgaacatccactcattgagcccatatcaactaattaaatattcaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcacta 1080  T
Q  203 atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1081 atcaactaagactcacaattgataaataactaatataattatt 1123  T

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Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 65
Target Start/End: Original strand, 916 - 956
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctctttt 65  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  916 agtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctttt 956  T

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Target: scaffold1114 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 925 - 698
Alignment:
Q  25 agtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccac 117  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |      |||||||  ||||| |||    
T  925 agtttgtcgtgtacagtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattctgttaatgggtcatctagacattcac 826  T
Q  118 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccca 217  Q
     |||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  825 tcattgagtacatatcagttaattaaatatttaatcaattatctgattttaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaattgaggctca 726  T
Q  218 caattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  725 caattgataaataactaatataattatt 698  T

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Target: scaffold0085 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 38207 - 38063
Alignment:
Q  100 ggtcatccggacatccaccc-attgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa--tagccttattacttaatttga 196  Q
    |||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||    ||||||||| | | |||||||||||  || |||| |||||||||||||    
T  38207 ggtcatctagacatccaccatattaagtccatatcaattaattaaata----attaattattcgaatagaaatctaaattaaccttgttacttaatttga 38112  T
Q  197 tcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 245  Q
    |||||| |||| |||||     |||||||||||| |||||| |||||||    
T  38111 tcactattcaattaaggtttcaaattgataaataactaataaaattatt 38063  T

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