View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8526_low_8 (Length: 375)

Name: NF8526_low_8
Description: NF8526
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8526_low_8
NF8526_low_8
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (153-361)||(13720907-13721115)
chr8 (153-361)||(16873030-16873238)
chr8 (153-361)||(22006237-22006445)
chr8 (153-361)||(13662244-13662452)
chr8 (153-350)||(271339-271536)
chr8 (153-350)||(644384-644581)
chr8 (153-350)||(830119-830316)
chr8 (153-350)||(22088773-22088970)
chr8 (4-156)||(13721108-13721260)
chr8 (153-341)||(15319138-15319326)
chr8 (153-341)||(15499507-15499695)
chr8 (153-341)||(16195319-16195508)
chr8 (7-156)||(16873234-16873383)
chr8 (4-156)||(3431461-3431613)
chr8 (4-107)||(22886298-22886402)
chr8 (4-107)||(18612379-18612481)
chr8 (4-107)||(18619284-18619386)
chr8 (4-107)||(21494629-21494732)
chr8 (71-156)||(15319406-15319491)
chr8 (71-156)||(15499775-15499860)
chr8 (76-156)||(22006510-22006590)
chr8 (4-107)||(22147411-22147513)
chr8 (71-156)||(13662512-13662597)
chr8 (71-156)||(271607-271692)
chr8 (71-156)||(644228-644313)
chr8 (71-156)||(829963-830048)
chr8 (153-293)||(6774233-6774371)
chr8 (153-292)||(21844547-21844684)
chr8 (153-293)||(24549120-24549258)
chr8 (91-156)||(24717130-24717195)
chr8 (153-292)||(21851940-21852077)
chr8 (71-139)||(22089041-22089109)
chr8 (4-120)||(23837156-23837273)
chr8 (153-262)||(16674367-16674476)
chr8 (153-262)||(30120890-30120999)
chr8 (12-120)||(2544909-2545016)
chr8 (4-98)||(38635820-38635915)
chr8 (4-113)||(26011459-26011569)
chr8 (4-108)||(27233239-27233344)
chr8 (4-115)||(21198324-21198436)
chr8 (4-99)||(38533628-38533724)
chr8 (4-113)||(5854579-5854689)
chr8 (172-293)||(17345707-17345826)
chr8 (4-108)||(37653788-37653891)
chr8 (111-156)||(39115041-39115087)
chr8 (4-112)||(18041704-18041813)
chr8 (4-108)||(18261643-18261748)
chr8 (4-108)||(33611225-33611330)
chr8 (111-156)||(4233826-4233872)
chr8 (216-262)||(16405025-16405071)
chr8 (111-156)||(17502112-17502158)
chr8 (216-262)||(24928841-24928887)
chr8 (216-293)||(16193766-16193841)
chr8 (216-293)||(43373518-43373593)
chr8 (4-63)||(33528442-33528500)
chr8 (4-56)||(39446938-39446990)
[»] chr6 (53 HSPs)
chr6 (153-361)||(18086802-18087010)
chr6 (153-361)||(16231961-16232169)
chr6 (153-361)||(13620773-13620981)
chr6 (153-361)||(1556074-1556282)
chr6 (153-361)||(23977838-23978046)
chr6 (153-361)||(19610087-19610295)
chr6 (153-350)||(22225717-22225914)
chr6 (153-350)||(16376352-16376549)
chr6 (153-350)||(16383676-16383873)
chr6 (153-350)||(10488779-10488976)
chr6 (153-350)||(16556118-16556315)
chr6 (153-350)||(16632674-16632871)
chr6 (4-156)||(16231816-16231968)
chr6 (4-156)||(18087003-18087155)
chr6 (4-156)||(13620974-13621126)
chr6 (4-156)||(23977693-23977845)
chr6 (153-292)||(19299375-19299514)
chr6 (153-339)||(29665964-29666150)
chr6 (153-256)||(22251545-22251648)
chr6 (4-107)||(32276944-32277046)
chr6 (4-95)||(16300161-16300252)
chr6 (153-295)||(29869755-29869896)
chr6 (4-113)||(4991037-4991147)
chr6 (71-156)||(16556386-16556471)
chr6 (71-156)||(16632942-16633027)
chr6 (71-156)||(22225985-22226070)
chr6 (4-96)||(19629314-19629405)
chr6 (71-156)||(10488623-10488708)
chr6 (71-156)||(16376620-16376705)
chr6 (71-156)||(16383944-16384029)
chr6 (91-156)||(35015425-35015490)
chr6 (91-151)||(19983559-19983619)
chr6 (172-293)||(14626124-14626243)
chr6 (4-120)||(18381855-18381972)
chr6 (153-262)||(1650080-1650189)
chr6 (4-112)||(25651203-25651312)
chr6 (247-316)||(27740952-27741021)
chr6 (153-229)||(16825727-16825803)
chr6 (4-98)||(19854135-19854230)
chr6 (172-293)||(15862609-15862728)
chr6 (153-262)||(25175731-25175840)
chr6 (172-293)||(1657754-1657873)
chr6 (4-113)||(22361937-22362047)
chr6 (172-262)||(35009445-35009535)
chr6 (153-262)||(27653958-27654067)
chr6 (4-108)||(29605420-29605525)
chr6 (4-112)||(34966833-34966942)
chr6 (4-63)||(18398954-18399013)
chr6 (4-98)||(33324673-33324768)
chr6 (4-98)||(35136184-35136279)
chr6 (216-262)||(23153614-23153660)
chr6 (4-108)||(33538541-33538646)
chr6 (9-108)||(18629788-18629888)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (153-361)||(7132044-7132252)
chr4 (153-361)||(18169039-18169247)
chr4 (153-361)||(19020555-19020763)
chr4 (153-361)||(20000792-20001000)
chr4 (153-361)||(15287224-15287432)
chr4 (153-361)||(15294333-15294541)
chr4 (4-156)||(7132245-7132397)
chr4 (153-341)||(17145636-17145824)
chr4 (153-341)||(18248307-18248495)
chr4 (7-156)||(20000647-20000796)
chr4 (153-309)||(22738390-22738546)
chr4 (214-341)||(8374597-8374724)
chr4 (4-107)||(8044913-8045017)
chr4 (4-107)||(14996100-14996202)
chr4 (4-107)||(19697553-19697655)
chr4 (4-107)||(19708138-19708240)
chr4 (4-113)||(16522783-16522893)
chr4 (153-295)||(22352043-22352184)
chr4 (153-310)||(26339140-26339296)
chr4 (4-113)||(9295659-9295769)
chr4 (70-156)||(18168894-18168980)
chr4 (153-216)||(8378365-8378428)
chr4 (153-291)||(10644360-10644496)
chr4 (91-156)||(5682795-5682860)
chr4 (91-156)||(25119476-25119541)
chr4 (216-316)||(40885604-40885703)
chr4 (27-107)||(32460880-32460960)
chr4 (4-98)||(15044808-15044903)
chr4 (4-98)||(15109521-15109616)
chr4 (153-262)||(47357822-47357931)
chr4 (172-262)||(54118250-54118340)
chr4 (172-293)||(122027-122146)
chr4 (9-86)||(9795207-9795283)
chr4 (4-108)||(40905105-40905210)
chr4 (172-262)||(15675095-15675185)
chr4 (71-107)||(19020459-19020495)
chr4 (4-106)||(15013454-15013557)
chr4 (4-98)||(38764689-38764784)
chr4 (4-98)||(41256541-41256636)
chr4 (4-113)||(7964883-7964993)
chr4 (216-262)||(10104300-10104346)
chr4 (111-156)||(15213877-15213923)
chr4 (216-262)||(31115796-31115842)
chr4 (216-292)||(13048271-13048345)
chr4 (4-112)||(18238329-18238438)
chr4 (4-100)||(19821948-19822045)
chr4 (4-112)||(54398349-54398458)
chr4 (4-115)||(14901195-14901307)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (153-361)||(18911062-18911270)
chr3 (153-361)||(25058808-25059016)
chr3 (153-361)||(22275278-22275486)
chr3 (153-361)||(49232505-49232713)
chr3 (153-361)||(15468319-15468527)
chr3 (153-361)||(12902069-12902277)
chr3 (153-361)||(5228382-5228589)
chr3 (153-350)||(1467718-1467915)
chr3 (153-341)||(12264771-12264960)
chr3 (4-156)||(18910917-18911069)
chr3 (153-333)||(12811938-12812118)
chr3 (153-348)||(54651539-54651734)
chr3 (153-341)||(44229074-44229262)
chr3 (4-156)||(16934154-16934306)
chr3 (153-260)||(18897023-18897130)
chr3 (4-107)||(11477371-11477474)
chr3 (4-107)||(8268925-8269027)
chr3 (4-107)||(8276025-8276127)
chr3 (4-108)||(9303280-9303385)
chr3 (4-107)||(14284933-14285036)
chr3 (71-156)||(49232360-49232445)
chr3 (172-295)||(11986172-11986295)
chr3 (71-156)||(1467986-1468071)
chr3 (91-156)||(17956252-17956317)
chr3 (153-262)||(55316387-55316496)
chr3 (92-156)||(16821063-16821127)
chr3 (153-292)||(15614973-15615110)
chr3 (153-291)||(16821280-16821416)
chr3 (153-262)||(15936614-15936723)
chr3 (153-262)||(41270243-41270352)
chr3 (4-108)||(6228797-6228902)
chr3 (4-108)||(12952934-12953039)
chr3 (308-361)||(18897133-18897186)
chr3 (4-101)||(4162377-4162475)
chr3 (172-293)||(51158024-51158143)
chr3 (4-63)||(12488898-12488957)
chr3 (4-63)||(38811180-38811239)
chr3 (4-98)||(41661545-41661640)
chr3 (117-156)||(45581397-45581436)
chr3 (4-105)||(11329133-11329235)
chr3 (172-262)||(15859030-15859120)
chr3 (216-293)||(17912532-17912607)
chr3 (4-113)||(34559864-34559974)
chr3 (153-262)||(15938456-15938565)
chr3 (111-156)||(28557972-28558017)
chr3 (112-149)||(54038569-54038606)
chr3 (166-262)||(13839061-13839157)
chr3 (5-100)||(47784920-47785016)
chr3 (4-98)||(3576610-3576705)
chr3 (172-262)||(12030153-12030243)
chr3 (4-101)||(17191518-17191616)
chr3 (7-108)||(17204670-17204772)
chr3 (6-113)||(1990767-1990876)
chr3 (4-100)||(14059385-14059482)
chr3 (172-293)||(14842567-14842686)
chr3 (4-112)||(31412505-31412614)
chr3 (4-56)||(17139531-17139583)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (153-361)||(18980000-18980208)
chr7 (153-361)||(14250877-14251085)
chr7 (153-361)||(15927637-15927845)
chr7 (153-361)||(13758439-13758647)
chr7 (153-361)||(15950770-15950978)
chr7 (153-361)||(15760093-15760301)
chr7 (153-350)||(7822808-7823005)
chr7 (153-350)||(7830119-7830316)
chr7 (153-350)||(27101616-27101813)
chr7 (153-350)||(27108964-27109161)
chr7 (153-350)||(27176513-27176710)
chr7 (153-350)||(38783708-38783905)
chr7 (4-156)||(15927492-15927644)
chr7 (4-156)||(14251078-14251230)
chr7 (4-156)||(18980201-18980353)
chr7 (4-156)||(13758294-13758446)
chr7 (4-156)||(371012-371164)
chr7 (154-298)||(48622646-48622789)
chr7 (155-310)||(10000351-10000505)
chr7 (153-295)||(16418633-16418774)
chr7 (172-316)||(13321129-13321273)
chr7 (71-152)||(15951038-15951119)
chr7 (93-156)||(1937270-1937333)
chr7 (71-156)||(7822652-7822737)
chr7 (71-156)||(7829963-7830048)
chr7 (153-262)||(13910999-13911108)
chr7 (71-156)||(27101884-27101969)
chr7 (71-156)||(27109232-27109317)
chr7 (71-156)||(27176357-27176442)
chr7 (71-156)||(38783976-38784061)
chr7 (153-292)||(13572816-13572953)
chr7 (153-262)||(2437625-2437734)
chr7 (4-112)||(13377495-13377604)
chr7 (153-262)||(10989577-10989686)
chr7 (4-120)||(17224110-17224227)
chr7 (153-262)||(18253822-18253931)
chr7 (153-293)||(16478937-16479075)
chr7 (111-156)||(32494490-32494535)
chr7 (172-293)||(47481037-47481156)
chr7 (4-98)||(20583726-20583821)
chr7 (4-105)||(15358770-15358872)
chr7 (4-113)||(48356609-48356719)
chr7 (4-63)||(16915100-16915159)
chr7 (4-98)||(28390292-28390387)
chr7 (216-262)||(11580789-11580835)
chr7 (39-108)||(14940723-14940793)
chr7 (39-108)||(15368316-15368386)
chr7 (166-262)||(295966-296062)
chr7 (4-52)||(13274814-13274862)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (153-361)||(23514630-23514838)
chr5 (153-361)||(10777949-10778157)
chr5 (153-361)||(1219499-1219707)
chr5 (153-361)||(17471567-17471775)
chr5 (153-361)||(7425393-7425601)
chr5 (153-350)||(22883063-22883260)
chr5 (153-350)||(21932360-21932557)
chr5 (153-350)||(21938530-21938727)
chr5 (153-350)||(35582116-35582313)
chr5 (153-341)||(35791077-35791266)
chr5 (153-350)||(36989749-36989946)
chr5 (4-156)||(10778150-10778302)
chr5 (153-341)||(11212044-11212232)
chr5 (4-156)||(23514485-23514637)
chr5 (4-156)||(9730563-9730715)
chr5 (4-107)||(7528872-7528975)
chr5 (4-113)||(109013-109123)
chr5 (153-295)||(23328693-23328834)
chr5 (4-113)||(16105608-16105718)
chr5 (153-295)||(24616297-24616438)
chr5 (153-295)||(24712673-24712814)
chr5 (153-295)||(24745691-24745832)
chr5 (71-156)||(1219767-1219852)
chr5 (71-156)||(22883331-22883416)
chr5 (4-107)||(17909478-17909580)
chr5 (172-295)||(32950828-32950952)
chr5 (71-156)||(21932628-21932713)
chr5 (71-156)||(21938798-21938883)
chr5 (71-156)||(35581960-35582045)
chr5 (71-156)||(36990017-36990102)
chr5 (153-292)||(27009981-27010118)
chr5 (153-293)||(29188259-29188397)
chr5 (153-262)||(12542-12651)
chr5 (153-262)||(4199960-4200069)
chr5 (4-112)||(23493885-23493994)
chr5 (153-262)||(25426796-25426905)
chr5 (153-262)||(18777967-18778076)
chr5 (153-262)||(19500067-19500176)
chr5 (153-262)||(22366456-22366565)
chr5 (172-293)||(23507103-23507222)
chr5 (153-262)||(43443370-43443479)
chr5 (4-112)||(3673828-3673937)
chr5 (153-262)||(21073570-21073679)
chr5 (6-112)||(5451017-5451124)
chr5 (175-293)||(34939415-34939531)
chr5 (172-262)||(18531073-18531163)
chr5 (4-110)||(23981688-23981794)
chr5 (4-100)||(7728398-7728495)
chr5 (6-63)||(29917981-29918038)
chr5 (4-112)||(11337358-11337465)
chr5 (4-98)||(6456604-6456699)
chr5 (4-63)||(26559987-26560046)
chr5 (111-156)||(28902140-28902186)
chr5 (111-156)||(28938535-28938581)
chr5 (4-100)||(1168376-1168473)
chr5 (4-112)||(19873810-19873919)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (153-361)||(8943915-8944123)
chr2 (153-361)||(12635847-12636055)
chr2 (153-361)||(42177948-42178156)
chr2 (153-361)||(3798582-3798790)
chr2 (153-361)||(12641621-12641829)
chr2 (153-361)||(12728461-12728669)
chr2 (153-361)||(34824544-34824752)
chr2 (153-361)||(23778024-23778232)
chr2 (153-361)||(16935662-16935870)
chr2 (153-361)||(17006322-17006530)
chr2 (153-350)||(11231317-11231514)
chr2 (153-350)||(22513164-22513361)
chr2 (153-350)||(24685760-24685957)
chr2 (153-350)||(28775786-28775983)
chr2 (4-156)||(12636048-12636200)
chr2 (4-156)||(8943770-8943922)
chr2 (4-156)||(12641822-12641974)
chr2 (4-156)||(42178149-42178301)
chr2 (4-156)||(3798783-3798935)
chr2 (153-341)||(21141984-21142172)
chr2 (4-107)||(28031419-28031523)
chr2 (4-107)||(15633186-15633288)
chr2 (166-293)||(7507844-7507969)
chr2 (153-295)||(5888609-5888750)
chr2 (153-295)||(23774272-23774413)
chr2 (4-85)||(25213042-25213123)
chr2 (71-151)||(24686028-24686108)
chr2 (4-106)||(17204303-17204406)
chr2 (4-113)||(24826899-24827009)
chr2 (71-156)||(12728316-12728401)
chr2 (71-156)||(34824399-34824484)
chr2 (70-156)||(22274645-22274731)
chr2 (71-156)||(11231585-11231670)
chr2 (70-151)||(22283883-22283964)
chr2 (71-156)||(22513432-22513517)
chr2 (71-156)||(28776054-28776139)
chr2 (4-100)||(3413-3509)
chr2 (4-113)||(19433504-19433614)
chr2 (153-262)||(19886636-19886745)
chr2 (41-106)||(22256270-22256332)
chr2 (172-262)||(43642963-43643053)
chr2 (4-115)||(25305408-25305520)
chr2 (172-262)||(25265396-25265486)
chr2 (4-112)||(67958-68067)
chr2 (172-293)||(462876-462995)
chr2 (4-112)||(23821777-23821886)
chr2 (4-112)||(23830856-23830965)
chr2 (4-100)||(28974027-28974124)
chr2 (111-156)||(22775457-22775503)
chr2 (111-156)||(22780835-22780881)
chr2 (4-113)||(24884651-24884761)
chr2 (216-292)||(17396702-17396776)
[»] scaffold1500 (2 HSPs)
scaffold1500 (153-361)||(1493-1701)
scaffold1500 (4-42)||(1694-1732)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (153-361)||(17148636-17148844)
chr1 (153-361)||(46523458-46523666)
chr1 (153-361)||(18059737-18059945)
chr1 (153-350)||(17004718-17004915)
chr1 (153-350)||(38055070-38055267)
chr1 (4-156)||(17148491-17148643)
chr1 (4-156)||(21650220-21650372)
chr1 (153-292)||(19962478-19962617)
chr1 (153-293)||(22227947-22228085)
chr1 (153-293)||(22232644-22232782)
chr1 (153-295)||(7640913-7641054)
chr1 (153-295)||(22035583-22035724)
chr1 (71-156)||(18060005-18060090)
chr1 (71-156)||(17004562-17004647)
chr1 (71-156)||(38055338-38055423)
chr1 (153-262)||(5072363-5072472)
chr1 (91-156)||(44035238-44035303)
chr1 (155-293)||(2116393-2116529)
chr1 (153-262)||(18601093-18601202)
chr1 (4-120)||(20177133-20177250)
chr1 (153-293)||(45051561-45051699)
chr1 (4-63)||(36356465-36356524)
chr1 (172-262)||(20445846-20445936)
chr1 (4-120)||(13377012-13377129)
chr1 (4-120)||(41229111-41229228)
chr1 (172-293)||(20913168-20913287)
chr1 (172-293)||(20931483-20931602)
chr1 (8-98)||(21194994-21195085)
chr1 (117-156)||(21859214-21859253)
chr1 (111-156)||(16656587-16656633)
chr1 (216-262)||(20531611-20531657)
chr1 (216-262)||(37844500-37844546)
chr1 (6-98)||(49997455-49997548)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (153-350)||(1554-1751)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (153-361)||(153986-154194)
scaffold0023 (71-156)||(154254-154339)
scaffold0023 (153-259)||(36264-36370)
scaffold0023 (153-204)||(169887-169938)
scaffold0023 (172-262)||(48765-48855)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (153-361)||(10318-10526)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (153-361)||(2461-2669)
scaffold0383 (7-112)||(7137-7243)
[»] scaffold0107 (4 HSPs)
scaffold0107 (153-361)||(39715-39923)
scaffold0107 (153-350)||(31389-31586)
scaffold0107 (71-156)||(39570-39655)
scaffold0107 (71-156)||(31233-31318)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (153-361)||(29231-29439)
scaffold0213 (71-149)||(29093-29171)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (153-350)||(39183-39380)
scaffold0076 (71-156)||(39027-39112)
scaffold0076 (153-292)||(43137-43274)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (179-361)||(1-183)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (156-339)||(34140-34323)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (153-341)||(7435-7623)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (153-341)||(45119-45307)
scaffold0066 (153-341)||(54505-54693)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (153-299)||(54006-54151)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (153-299)||(3545-3690)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (4-106)||(6396-6498)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (4-107)||(50028-50131)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (153-262)||(3890-3999)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (153-293)||(5191-5329)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (153-310)||(6718-6874)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (4-108)||(5761-5865)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (4-107)||(5194-5296)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (153-295)||(7345-7486)
scaffold0003 (30-101)||(147530-147602)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (12-107)||(17673-17768)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (4-95)||(11730-11820)
scaffold0162 (172-258)||(8186-8272)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (172-295)||(56105-56228)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (4-113)||(130521-130631)
scaffold0028 (172-262)||(89460-89550)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (153-295)||(23728-23869)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (153-262)||(3130-3239)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (4-107)||(165146-165245)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (153-292)||(21091-21228)
scaffold0139 (153-292)||(14037-14173)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (153-290)||(177-312)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (91-156)||(31548-31613)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (91-156)||(41231-41296)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (153-293)||(13300-13438)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (27-107)||(34597-34677)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (153-262)||(1279-1388)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (91-156)||(6351-6416)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (91-156)||(162447-162512)
scaffold0016 (91-156)||(166525-166590)
scaffold0016 (6-120)||(116687-116802)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (172-300)||(3319-3447)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (153-293)||(9324-9462)
scaffold0215 (153-293)||(16222-16360)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (153-204)||(10727-10778)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (4-112)||(2421-2530)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (153-262)||(107914-108023)
scaffold0026 (153-292)||(64498-64640)
scaffold0026 (27-112)||(90039-90125)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (93-156)||(721-783)
scaffold0342 (4-112)||(5906-6015)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (4-98)||(107991-108085)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (111-156)||(15910-15955)
scaffold0077 (4-108)||(6514-6619)
scaffold0077 (216-293)||(36963-37038)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (4-120)||(77019-77136)
[»] scaffold0521 (2 HSPs)
scaffold0521 (4-98)||(11074-11169)
scaffold0521 (111-156)||(10877-10922)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (4-98)||(1118-1213)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (9-120)||(13472-13582)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (4-113)||(28501-28611)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (4-113)||(43970-44080)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (172-262)||(123170-123260)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (153-259)||(31650-31756)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (4-112)||(4529-4638)
scaffold0447 (4-112)||(9143-9252)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (172-293)||(3588-3707)
scaffold0266 (216-293)||(1262-1337)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (172-323)||(13613-13763)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (4-120)||(4899-5016)
scaffold0075 (172-262)||(34466-34556)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (111-156)||(19345-19390)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (111-156)||(40446-40491)
scaffold0034 (111-156)||(45929-45974)
scaffold0034 (7-63)||(40674-40730)
scaffold0034 (111-151)||(79632-79672)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (166-292)||(5668-5792)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (172-263)||(12279-12370)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (4-98)||(37538-37633)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (172-262)||(540-630)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (172-293)||(9016-9135)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (172-262)||(6070-6160)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (4-105)||(4578-4680)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (172-262)||(962-1052)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (172-262)||(41815-41905)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (172-262)||(9016-9106)
scaffold0025 (172-293)||(148859-148978)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (4-113)||(69422-69532)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (4-112)||(7847-7956)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (4-108)||(7372-7477)
scaffold0253 (4-108)||(16797-16902)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (4-112)||(2488-2597)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (172-293)||(19344-19463)
scaffold0195 (172-293)||(21428-21547)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (111-156)||(33429-33474)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (4-120)||(35437-35553)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (8-112)||(68058-68162)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (4-98)||(3232-3327)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (153-196)||(12106-12149)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (111-156)||(344-390)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (216-262)||(48354-48400)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (172-262)||(51188-51278)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (4-108)||(279-384)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (4-113)||(3265-3374)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (4-56)||(748-800)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (4-56)||(33900-33952)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 13720907 - 13721115
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13720907 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 13721006  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13721007 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 13721106  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  13721107 aattgatgt 13721115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 16873030 - 16873238
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16873030 tgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 16873129  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16873130 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgt 16873229  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     || |||||    
T  16873230 aatcgatgt 16873238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 22006237 - 22006445
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006237 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 22006336  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  22006337 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattc 22006436  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  22006437 cattgatgt 22006445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 13662244 - 13662452
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13662244 tgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaa 13662343  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  13662344 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattc 13662443  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  13662444 cattgatgt 13662452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 271339 - 271536
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  271339 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 271438  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  271439 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 271536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 644581 - 644384
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  644581 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 644482  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  644481 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 644384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 830316 - 830119
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  830316 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 830217  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  830216 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 830119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 22088773 - 22088970
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22088773 tgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaa 22088872  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  22088873 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatat 22088970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 13721108 - 13721260
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13721108 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggtggt 13721207  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13721208 tttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 13721260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Original strand, 15319138 - 15319326
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15319138 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 15319237  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgt 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15319238 attacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgt 15319326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Original strand, 15499507 - 15499695
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15499507 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 15499606  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgt 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15499607 attacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgt 15499695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16195508 - 16195319
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195508 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 16195409  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaa-tttgatatgttttgattgaaatgagatgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  16195408 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaatttatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgt 16195319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 16873234 - 16873383
Alignment:
Q  7 gatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgtttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16873234 gatgttgttgttgctgagatatgttgttgagtatgatttgaggcttgggtgttcatataccataattattgatgagaaataagatgttattggtggtttt 16873333  T
Q  107 gtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16873334 gtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 16873383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 3431461 - 3431613
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  3431461 attgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgtttgtgagaaataagatgttgttggtggt 3431560  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3431561 tttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 3431613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22886402 - 22886298
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaa-taagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22886402 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgtttatgatttatgacttgggtgttcatatatcatgattgttgatgagaaattaagatgttgttggttg 22886303  T
Q  103 ttttg 107  Q
    |||||    
T  22886302 ttttg 22886298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18612481 - 18612379
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18612481 attgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggcttgagtgttcatatatcatgattgttggtgagaaataagatgttgttggttgt 18612383  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  18612382 tttg 18612379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18619386 - 18619284
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18619386 attgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggcttgagtgttcatatatcatgattgttggtgagaaataagatgttgttggttgt 18619288  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  18619287 tttg 18619284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 21494629 - 21494732
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  21494629 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgtttatgatttataacttgggtgtgcatatatcatgattgttggtgagaattgagatgttgttggttgt 21494728  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  21494729 tttg 21494732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 15319406 - 15319491
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15319406 attgatgatgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 15319491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 15499775 - 15499860
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15499775 attgatgatgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 15499860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 156
Target Start/End: Original strand, 22006510 - 22006590
Alignment:
Q  76 tgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22006510 tgatgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaagtgaa 22006590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22147513 - 22147411
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22147513 attgatgttgttgttgctgagacatgtcgttgtatattatt-atggcttaggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaataagatgttgttggttgt 22147415  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  22147414 tttg 22147411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 13662512 - 13662597
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13662512 attgatgatgagaactaaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 13662597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 271607 - 271692
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  271607 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 271692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 644313 - 644228
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  644313 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 644228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 830048 - 829963
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  830048 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 829963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Original strand, 6774233 - 6774371
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  6774233 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 6774332  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  6774333 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 6774371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 292
Target Start/End: Original strand, 21844547 - 21844684
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  21844547 tgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaa 21844646  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 292  Q
    |||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  21844647 attacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21844684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24549258 - 24549120
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  24549258 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 24549159  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  24549158 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 24549120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Original strand, 24717130 - 24717195
Alignment:
Q  91 tgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24717130 tgttgttggtggttttgtaaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 24717195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 292
Target Start/End: Original strand, 21851940 - 21852077
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  21851940 tgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaa 21852039  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 292  Q
    |||| ||||||  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  21852040 attaaatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21852077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 139
Target Start/End: Original strand, 22089041 - 22089109
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatg 139  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22089041 attgatgatgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatg 22089109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23837273 - 23837156
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||||||| || ||||| |||| |    
T  23837273 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttggtggtgg 23837174  T
Q  103 ttttgtgaaattgatgaa 120  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  23837173 ttttgtgaaattggtgaa 23837156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 16674367 - 16674476
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||| ||| || || |||||||||| ||| |  | ||||| |||| ||||||    
T  16674367 tgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaa 16674466  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  16674467 attacatgtt 16674476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30120999 - 30120890
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||| ||| |  | ||||| |||| ||||||    
T  30120999 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaa 30120900  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  30120899 attacatgtt 30120890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 2545016 - 2544909
Alignment:
Q  12 tgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaa 111  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||    ||||||| || ||||||||||    
T  2545016 tgttgttgttgatacatgttgttgtttatgatt-atggcttgggtgttgatatatcatgattgttgttgagaaatggactgttgttagtggttttgtgaa 2544918  T
Q  112 attgatgaa 120  Q
    |||| ||||    
T  2544917 attggtgaa 2544909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Original strand, 38635820 - 38635915
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataa-ttgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  38635820 attgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcataatttgttgatgagaaacaagttgttgttg 38635915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 26011569 - 26011459
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||| |||| |||||||| | |    
T  26011569 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaattaagttgttgttgttgg 26011470  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  26011469 ttttgtaaaat 26011459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 27233239 - 27233344
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| | |||||||||||| |||||||| | |    
T  27233239 attgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgataatgagaaataagttgttgttgttgg 27233338  T
Q  103 ttttgt 108  Q
    ||||||    
T  27233339 ttttgt 27233344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 115
Target Start/End: Original strand, 21198324 - 21198436
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||| || | |||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||| |||||||||| || |||||||||| |    
T  21198324 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgctgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtgg 21198423  T
Q  103 ttttgtgaaattg 115  Q
    ||| || ||||||    
T  21198424 tttggtaaaattg 21198436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 38533724 - 38533628
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttgg 99  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||   ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38533724 attgatgttgttgttgctaggtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttgg 38533628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5854689 - 5854579
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||| | || |||||||| | |    
T  5854689 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaattgagttgttgttgttgg 5854590  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  5854589 ttttgtaaaat 5854579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17345826 - 17345707
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||| ||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||    
T  17345826 aattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattat 17345729  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| |||||| |||||||||||    
T  17345728 gtaaaaatgtgaagttatgaaa 17345707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 37653788 - 37653891
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||| | ||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||| |||||| ||||||| |||||||| | |    
T  37653788 attgatgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgatttatggcttgggtgttcatat--catgatttgatgatgaaaaataagttgttgttgttgg 37653885  T
Q  103 ttttgt 108  Q
    ||||||    
T  37653886 ttttgt 37653891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39115087 - 39115041
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagt-gttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  39115087 aattgatgaagttgagttaagtggttcatgtgaaggaccaaaatgaa 39115041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 18041704 - 18041813
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||| | |||||| || |||| |||||||||| | ||| | ||  ||||| |||||||| |||||||| | |    
T  18041704 attgatgttgttgttgttaagatatattgttgttgatgattcatagcttaggtgttcataaatcatgagtttatgatgtgaaataagttgttgttgttgg 18041803  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||||||||||    
T  18041804 ttttgtgaaa 18041813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 18261643 - 18261748
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| || ||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||| |||| |||||||| | |    
T  18261643 attgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgagttgatgatgagaattaagttgttgttgttgg 18261742  T
Q  103 ttttgt 108  Q
    ||||||    
T  18261743 ttttgt 18261748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 33611225 - 33611330
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| |||||||| ||||||||| | ||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| | |    
T  33611225 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgtgtgttcataaatcatgatttgatgatgagatataagttgttgttgttgg 33611324  T
Q  103 ttttgt 108  Q
    ||||||    
T  33611325 ttttgt 33611330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4233872 - 4233826
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtg-ttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4233872 aattggtgaagttgagttaagtggttcatgtgaaggaccaaaatgaa 4233826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 262
Target Start/End: Original strand, 16405025 - 16405071
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16405025 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 16405071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17502158 - 17502112
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagt-gttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  17502158 aattgatgaagttgagttaagtggttcatctgaaggaccaaaatgaa 17502112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 262
Target Start/End: Original strand, 24928841 - 24928887
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24928841 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 24928887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 293
Target Start/End: Original strand, 16193766 - 16193841
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16193766 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16193841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 293
Target Start/End: Original strand, 43373518 - 43373593
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  43373518 tgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 43373593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 33528500 - 33528442
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgct--gagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcata 63  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  33528500 attgatgttgttgttgctaagagatattttgttgat---gattcatggcttgggtgttcata 33528442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 56
Target Start/End: Original strand, 39446938 - 39446990
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggt 56  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  39446938 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggt 39446990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 18086802 - 18087010
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086802 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 18086901  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086902 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 18087001  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  18087002 aattgatgt 18087010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16232169 - 16231961
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232169 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 16232070  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232069 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 16231970  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  16231969 aattgatgt 16231961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 13620773 - 13620981
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620773 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 13620872  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620873 attgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 13620972  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  13620973 aattgatgt 13620981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1556282 - 1556074
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556282 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 1556183  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||      
T  1556182 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattc 1556083  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  1556082 cattgatgt 1556074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23978046 - 23977838
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23978046 tgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 23977947  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23977946 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgt 23977847  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  23977846 aattgatgt 23977838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19610295 - 19610087
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19610295 tgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaa 19610196  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  19610195 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttataaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtagttcatattc 19610096  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  19610095 cattgatgt 19610087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 22225717 - 22225914
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22225717 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 22225816  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22225817 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgaaatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 22225914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 16376352 - 16376549
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16376352 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 16376451  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  16376452 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatat 16376549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 16383676 - 16383873
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16383676 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 16383775  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  16383776 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatat 16383873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10488976 - 10488779
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10488976 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 10488877  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  10488876 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 10488779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 16556118 - 16556315
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16556118 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 16556217  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  16556218 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatat 16556315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 16632674 - 16632871
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16632674 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 16632773  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  16632774 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatat 16632871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16231968 - 16231816
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16231968 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggtggt 16231869  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231868 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 16231816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 18087003 - 18087155
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18087003 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatatatcataattgttgatgagaaataagatgttggtggtggt 18087102  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18087103 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 18087155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 13620974 - 13621126
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13620974 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatgacttgggtgttcatataccataattgttgatgagcaataagatgttgttggtggt 13621073  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13621074 tttgtgaaattaatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 13621126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23977845 - 23977693
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23977845 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgagtatgatttgaggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttattggtggt 23977746  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23977745 tttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 23977693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 153 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19299514 - 19299375
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  19299514 tgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgga 19299415  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19299414 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19299375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 29666150 - 29665964
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  29666150 tgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaa 29666051  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagat 339  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| || ||| |  ||||||||||||    
T  29666050 attacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagat 29665964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 153 - 256
Target Start/End: Original strand, 22251545 - 22251648
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22251545 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 22251644  T
Q  253 atta 256  Q
    ||||    
T  22251645 atta 22251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 32276944 - 32277046
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32276944 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgtttatgatt-atggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaataagatgctgttggttgt 32277042  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  32277043 tttg 32277046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Original strand, 16300161 - 16300252
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16300161 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgtatatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgatgaaaaataagatgttg 16300252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Original strand, 29869755 - 29869896
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29869755 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaa 29869853  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  29869854 attacatggttcaatgtatgtataagtgtcaagttgtgaaatt 29869896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 4991147 - 4991037
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||| |    
T  4991147 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgatcatgaattttggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgg 4991048  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  4991047 ttttgtaaaat 4991037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 16556386 - 16556471
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16556386 attgatgatgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtaaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 16556471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 16632942 - 16633027
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16632942 attgatgatgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtaaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 16633027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 22225985 - 22226070
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22225985 attgatgatgagaaataaattcttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 22226070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 19629405 - 19629314
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgt 96  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||    
T  19629405 attgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaatgagttgttgt 19629314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10488708 - 10488623
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10488708 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 10488623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 16376620 - 16376705
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16376620 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 16376705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 16383944 - 16384029
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16383944 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 16384029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Original strand, 35015425 - 35015490
Alignment:
Q  91 tgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35015425 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 35015490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 151
Target Start/End: Original strand, 19983559 - 19983619
Alignment:
Q  91 tgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983559 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaa 19983619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Original strand, 14626124 - 14626243
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  14626124 aattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 14626221  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  14626222 gtaaaaatgataagttatgaaa 14626243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Original strand, 18381855 - 18381972
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataatt-gttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||   ||| ||| ||||||||||||| || |||||||||| |    
T  18381855 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgg 18381954  T
Q  103 ttttgtgaaattgatgaa 120  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  18381955 ttttgtgaaattggtgaa 18381972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 1650080 - 1650189
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  ||||||| ||  ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  1650080 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 1650179  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  1650180 attacatgtt 1650189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25651312 - 25651203
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataatt-gttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||||| |||| |||||||| | |    
T  25651312 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgattggatgatgagaattaagttgttgttgttgg 25651213  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||||||||||    
T  25651212 ttttgtgaaa 25651203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 247 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740952
Alignment:
Q  247 ggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttg 316  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||| |||| ||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaattttg 27740952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 229
Target Start/End: Original strand, 16825727 - 16825803
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  16825727 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 16825803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 19854230 - 19854135
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  19854230 attgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaattgatgatgagaaatgagttgttgttg 19854135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15862728 - 15862609
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||| ||||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||    
T  15862728 aattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattat 15862631  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  15862630 gtataaatgtgaagttatgaaa 15862609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25175840 - 25175731
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||    
T  25175840 tgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 25175741  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  25175740 attacatgtt 25175731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Original strand, 1657754 - 1657873
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||    
T  1657754 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattat 1657851  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| |||||| |||||||||||    
T  1657852 gtaaaaatgtgaagttatgaaa 1657873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Original strand, 22361937 - 22362047
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||| | || |||||||| | |    
T  22361937 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgagaattgagttgttgttgttag 22362036  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  22362037 ttttgtaaaat 22362047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Original strand, 35009445 - 35009535
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||  ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  35009445 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 35009535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 27653958 - 27654067
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||| ||||||| |||  |  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||    
T  27653958 tgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 27654057  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  27654058 attacatgtt 27654067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 29605525 - 29605420
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||||| |||| |||||||| |||| | ||| ||||| | |||||||||||| |||| ||| | |    
T  29605525 attgatgttgttgttgctaagaaatattgttgttgatgattcatggtttgggtgtgcataaatcatgaattgataatgagaaataagttgttcttgttgg 29605426  T
Q  103 ttttgt 108  Q
    ||||||    
T  29605425 ttttgt 29605420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 34966942 - 34966833
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| || ||||||||||||||| | ||| | ||  ||||| |||||||| |||||||| | |    
T  34966942 attgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgagttcgtgatgtgaaataagttgttgttgttgg 34966843  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||||||||||    
T  34966842 ttttgtgaaa 34966833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 18399013 - 18398954
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcata 63  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||    
T  18399013 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtgtgcata 18398954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 33324768 - 33324673
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||   ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  33324768 attgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgttg 33324673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Original strand, 35136184 - 35136279
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||   ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  35136184 attgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgttg 35136279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23153660 - 23153614
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23153660 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 23153614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 33538541 - 33538646
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||| ||||| ||  || |||||| | |||||| |||||||| ||||||||| | ||| | ||| ||||||||||| || |||||||| | |    
T  33538541 attgatgttgttattgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttgg 33538640  T
Q  103 ttttgt 108  Q
    ||||||    
T  33538641 ttttgt 33538646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Original strand, 18629788 - 18629888
Alignment:
Q  9 tgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataatt-gttgatgagaaataagatgttgttggttgttttg 107  Q
    ||||||||||| | ||  || |||||| | |||||| |||| ||||||||||||| | ||| ||| | |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  18629788 tgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttg 18629887  T
Q  108 t 108  Q
    |    
T  18629888 t 18629888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 7132044 - 7132252
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132044 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 7132143  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132144 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 7132243  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  7132244 aattgatgt 7132252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18169247 - 18169039
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169247 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 18169148  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  18169147 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattc 18169048  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  18169047 cattgatgt 18169039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19020763 - 19020555
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19020763 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 19020664  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  19020663 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatccttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattc 19020564  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  19020563 cattgatgt 19020555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20001000 - 20000792
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20001000 tgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaa 20000901  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20000900 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgt 20000801  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     || |||||    
T  20000800 aatcgatgt 20000792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 15287224 - 15287432
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15287224 tgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaa 15287323  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  15287324 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattc 15287423  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  15287424 cattgatgt 15287432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 15294333 - 15294541
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15294333 tgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaa 15294432  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  15294433 attacatgtttcaaagtatatataaatgttaagttatgaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattc 15294532  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  15294533 cattgatgt 15294541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 7132245 - 7132397
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7132245 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggtggt 7132344  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132345 tgtgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 7132397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Original strand, 17145636 - 17145824
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17145636 tgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 17145735  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  17145736 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaattatactcaattagtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgt 17145824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18248495 - 18248307
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18248495 tgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaa 18248396  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  18248395 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagatatgaaattatactcaattagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgt 18248307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20000796 - 20000647
Alignment:
Q  7 gatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgtttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20000796 gatgttgttgttgctgagatatgttgttgagtatgatttgaggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttattggtggtttt 20000697  T
Q  107 gtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20000696 gtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 20000647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22738546 - 22738390
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738546 tgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 22738447  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22738446 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaattatgcttaattgatg 22738390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8374724 - 8374597
Alignment:
Q  214 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |    
T  8374724 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattagtgaatt 8374625  T
Q  314 ttgatatgttttgattgaaatgagatgt 341  Q
    || ||||||| |  ||||||||||||||    
T  8374624 ttaatatgttgttgttgaaatgagatgt 8374597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 8045017 - 8044913
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8045017 attgatgttgttgctgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgaattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 8044918  T
Q  103 ttttg 107  Q
    |||||    
T  8044917 ttttg 8044913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14996202 - 14996100
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14996202 attgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaataagatgttgttggttgt 14996104  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  14996103 tttg 14996100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 19697553 - 19697655
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19697553 attgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaataagatgttgttggttgt 19697651  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  19697652 tttg 19697655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 19708138 - 19708240
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19708138 attgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaataagatgttgttggttgt 19708236  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  19708237 tttg 19708240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16522893 - 16522783
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggttg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||| |    
T  16522893 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgg 16522794  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  16522793 ttttgtaaaat 16522783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Original strand, 22352043 - 22352184
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  |||||  |||||||||| || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22352043 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttgttatgttgctgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaa 22352141  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22352142 attacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 22352184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26339296 - 26339140
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26339296 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaa 26339198  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 310  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  26339197 attacatggttcaatctatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattaatga 26339140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 9295769 - 9295659
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||| |    
T  9295769 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgataatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgg 9295670  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    || ||| ||||    
T  9295669 ttatgtaaaat 9295659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18168980 - 18168894
Alignment:
Q  70 aattgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18168980 aattgatgatgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaagtgaa 18168894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8378428 - 8378365
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8378428 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgt 8378365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10644496 - 10644360
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||    
T  10644496 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 10644397  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 291  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10644396 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 10644360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Original strand, 5682795 - 5682860
Alignment:
Q  91 tgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5682795 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 5682860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Original strand, 25119476 - 25119541
Alignment:
Q  91 tgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25119476 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 25119541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 316
Target Start/End: Original strand, 40885604 - 40885703
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaattt 315  Q
    ||||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  40885604 tgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgtt-caaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattatgctcaattggtgaacttt 40885702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 107
Target Start/End: Original strand, 32460880 - 32460960
Alignment:
Q  27 atgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttg 107  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32460880 atgttgttgtttatgatttatgacttgggtgtgcatatatcatgattgttggtgagaattgagatgttgttggttgttttg 32460960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15044903 - 15044808
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  15044903 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttg 15044808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Original strand, 15109521 - 15109616
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  15109521 attgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttg 15109616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 47357931 - 47357822
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||| ||||||| |  | ||||  |||| ||||||    
T  47357931 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaa 47357832  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  47357831 attacatgtt 47357822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Original strand, 54118250 - 54118340
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  54118250 aattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 54118340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 122146 - 122027
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  122146 aattgttgctaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 122049  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  122048 gtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 9795283 - 9795207
Alignment:
Q  9 tgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaat 86  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  9795283 tgttgttgttgttgatacatgttgttgtttatgatt-atggcttgggtgttgatatatcatgattgttgttgagaaat 9795207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 40905105 - 40905210
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||| |  ||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||| | |    
T  40905105 attgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgactcgtggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgg 40905204  T
Q  103 ttttgt 108  Q
    ||||||    
T  40905205 ttttgt 40905210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Original strand, 15675095 - 15675185
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15675095 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15675185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 19020495 - 19020459
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttg 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19020495 attgatgatgagaaataagatgttgttggttgttttg 19020459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 15013454 - 15013557
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||| ||||||||| | ||| || |||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||| |  |||||||| |||    
T  15013454 attgatattgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgacttgttgttgtttg 15013553  T
Q  103 tttt 106  Q
    ||||    
T  15013554 tttt 15013557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 38764784 - 38764689
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||| | ||  || |||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| | |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  38764784 attgatgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgaagatgagaaataagttgttgttg 38764689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Original strand, 41256541 - 41256636
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| |||| ||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  41256541 attgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttg 41256636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Original strand, 7964883 - 7964993
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||| ||||||||||| ||  || |||||| | |||||| |||||||| ||||||||| | ||| | ||| ||||||||||| || |||||||| | |    
T  7964883 attgattttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttgg 7964982  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  7964983 ttttgtaaaat 7964993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 262
Target Start/End: Original strand, 10104300 - 10104346
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10104300 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 10104346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Original strand, 15213877 - 15213923
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtg-ttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15213877 aattggtgaagttgagttaagtggttcatgtgaaggaccaaaatgaa 15213923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31115842 - 31115796
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31115842 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 31115796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 13048271 - 13048345
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 292  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||| ||| | |||||||||||    
T  13048271 tgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaaggataagttatgaa 13048345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 18238329 - 18238438
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| || ||||||||||||||| | ||| | ||  ||||| |||||||| |||||||| | |    
T  18238329 attgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgagttagtgatgtgaaataagttgttgttgttgg 18238428  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||| ||||||    
T  18238429 tttcgtgaaa 18238438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Original strand, 19821948 - 19822045
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggt 100  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||||||| || |||| |||||    
T  19821948 attgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtttttggt 19822045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 54398458 - 54398349
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||  ||||  |||||||| |||| ||| | |    
T  54398458 attgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttataaatcatgaatttgtgatctgaaataagttgttattgttgg 54398359  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||||||||||    
T  54398358 ttttgtgaaa 54398349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 14901307 - 14901195
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| ||||| | |||||| ||| | ||||||| ||||   ||| ||||| |||||||||||  | |||||||||| |    
T  14901307 attgatgttgttgttgctaagtgatgctgttgttgatgattcatgacatgggtgtgcataattcatgaattgatgatgagaaatgggttgttgttggtgg 14901208  T
Q  103 ttttgtgaaattg 115  Q
    |||||| ||||||    
T  14901207 ttttgtaaaattg 14901195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18911270 - 18911062
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911270 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 18911171  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911170 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 18911071  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  18911070 aattgatgt 18911062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25059016 - 25058808
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25059016 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 25058917  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  25058916 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattc 25058817  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  25058816 cattgatgt 25058808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22275486 - 22275278
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275486 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 22275387  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  22275386 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattc 22275287  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  22275286 cattgatgt 22275278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 49232713 - 49232505
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232713 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 49232614  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  49232613 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattc 49232514  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  49232513 cattgatgt 49232505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 15468319 - 15468527
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15468319 tgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 15468418  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  15468419 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattc 15468518  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  15468519 cattgatgt 15468527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 12902069 - 12902277
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902069 tgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 12902168  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  12902169 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgattaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattc 12902268  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  12902269 cattgatgt 12902277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5228589 - 5228382
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5228589 tgaaaatgggttgatgaaca-ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 5228491  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  5228490 attacatgtttcaaaatatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgaggtgtaattcatattc 5228391  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  5228390 cattgatgt 5228382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 1467718 - 1467915
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1467718 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 1467817  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  1467818 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatat 1467915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Original strand, 12264771 - 12264960
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264771 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 12264870  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaa-tttgatatgttttgattgaaatgagatgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  12264871 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgt 12264960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18911069 - 18910917
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18911069 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggtggt 18910970  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18910969 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 18910917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 153 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12812118 - 12811938
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  12812118 tgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgga 12812019  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaa 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12812018 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaatttatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaa 12811938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 153 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 54651734 - 54651539
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  54651734 tgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaa 54651635  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 348  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  54651634 attgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 54651539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44229262 - 44229074
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44229262 tgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaa 44229163  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||    
T  44229162 attacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgt 44229074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 16934154 - 16934306
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  16934154 attgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatttatggcttgggtattcataaatcatgattgtttgtgagaaataagatgttgttggtggt 16934253  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16934254 tttgtgaaattggtgaagttgagttaactgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 16934306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 260
Target Start/End: Original strand, 18897023 - 18897130
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18897023 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgga 18897122  T
Q  253 attacatg 260  Q
    ||||||||    
T  18897123 attacatg 18897130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 11477371 - 11477474
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11477371 attgatgttgttgctgctgagatatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgatgaaaaataagatgttgttggttgt 11477470  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  11477471 tttg 11477474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 8268925 - 8269027
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8268925 attgatgttattgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaataagatgttgttggttgt 8269023  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  8269024 tttg 8269027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 8276025 - 8276127
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8276025 attgatgttattgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaataagatgttgttggttgt 8276123  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  8276124 tttg 8276127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 9303280 - 9303385
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggttg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || |||||||||| |    
T  9303280 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgactatgaattatggcttgggtgttcatataccatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgg 9303379  T
Q  103 ttttgt 108  Q
    ||||||    
T  9303380 ttttgt 9303385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14285036 - 14284933
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  14285036 attgatgttgttgttgctcagatatgttgttgtttatgatttatgacttgggtgttcatatatcatgaatgttggtgtgaattgagatgttgttggttgt 14284937  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  14284936 tttg 14284933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 49232445 - 49232360
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49232445 attgatgatgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 49232360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Original strand, 11986172 - 11986295
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    |||||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11986172 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtat 11986271  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaatt 295  Q
    |||| ||||| |||||||||||||    
T  11986272 gtattaatgtcaagttatgaaatt 11986295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 1467986 - 1468071
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1467986 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 1468071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Original strand, 17956252 - 17956317
Alignment:
Q  91 tgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17956252 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgagaaggaccaaaatgaa 17956317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 55316496 - 55316387
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||    
T  55316496 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaa 55316397  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  55316396 attacatgtt 55316387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16821127 - 16821063
Alignment:
Q  92 gttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16821127 gttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgaattaagtgttcatgtgaaggaccaaagtgaa 16821063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15615110 - 15614973
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||| || ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||    
T  15615110 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaa 15615011  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 292  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  15615010 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaa 15614973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16821416 - 16821280
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||  ||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  16821416 tgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 16821317  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 291  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  16821316 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagctatga 16821280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 15936614 - 15936723
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  15936614 tgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 15936713  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  15936714 attacatgtt 15936723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41270352 - 41270243
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||| |    
T  41270352 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgga 41270253  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  41270252 attacatgtt 41270243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 6228797 - 6228902
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||| |||| |||||||| | |    
T  6228797 attgatgttgttgttgctaagaaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaattaagttgttgttgttgg 6228896  T
Q  103 ttttgt 108  Q
    ||||||    
T  6228897 ttttgt 6228902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12953039 - 12952934
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||| || |||||||| | |    
T  12953039 attgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttgg 12952940  T
Q  103 ttttgt 108  Q
    ||||||    
T  12952939 ttttgt 12952934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 308 - 361
Target Start/End: Original strand, 18897133 - 18897186
Alignment:
Q  308 tgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtcattgatgt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  18897133 tgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgt 18897186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Original strand, 4162377 - 4162475
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggtt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||  | |||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  4162377 attgatgttgttgttgctaagaactattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaattaagttgttgttggtt 4162475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Original strand, 51158024 - 51158143
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  51158024 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 51158121  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  51158122 gtaaaaatgataagttgtgaaa 51158143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 12488898 - 12488957
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcata 63  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  12488898 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtgttcata 12488957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 38811180 - 38811239
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcata 63  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  38811180 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtgcata 38811239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 41661640 - 41661545
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||| || ||||| ||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  41661640 attgatgttgttgttgttgagagatattgttgttgatgattcatagcttgagtgttcataaatcatgaattgatgatgataaataagttgttgttg 41661545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45581436 - 45581397
Alignment:
Q  117 tgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45581436 tgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 45581397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Original strand, 11329133 - 11329235
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcat-ataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||| || |   | ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  11329133 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtag 11329232  T
Q  103 ttt 105  Q
    |||    
T  11329233 ttt 11329235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Original strand, 15859030 - 15859120
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15859030 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15859120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 293
Target Start/End: Original strand, 17912532 - 17912607
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||| |||||  |||||||||||    
T  17912532 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 17912607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 34559974 - 34559864
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataa-ttgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||| | || |||||||| | |    
T  34559974 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcataatttgatgatgagaattgagttgttgttgttgg 34559875  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  34559874 ttttgtaaaat 34559864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 15938456 - 15938565
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    ||| ||| ||| ||  |   |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  15938456 tgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 15938555  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  15938556 attacatgtt 15938565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28558017 - 28557972
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28558017 aattggtgaagtcgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 28557972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 54038569 - 54038606
Alignment:
Q  112 attgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggacca 149  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54038569 attggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggacca 54038606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13839157 - 13839061
Alignment:
Q  166 atgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  13839157 atgaataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgtt 13839061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Original strand, 47784920 - 47785016
Alignment:
Q  5 ttgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggt 100  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  47784920 ttgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttggtgagaaatgagttgttgttggt 47785016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Original strand, 3576610 - 3576705
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||| | | |||||| ||||||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||| || ||||||||    
T  3576610 attgatgttgttgttgctaagtaatattgtggttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttg 3576705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Original strand, 12030153 - 12030243
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12030153 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 12030243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 17191616 - 17191518
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataatt-gttgatgagaaataagatgttgttggtt 101  Q
    |||||||||| ||||||| ||  ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||   ||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  17191616 attgatgttgctgttgctaagtaatgttgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttggtggtt 17191518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 17204772 - 17204670
Alignment:
Q  7 gatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttgttt 105  Q
    ||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| |||||||||||||| |||   ||| | ||||||||||||||| || ||||||| || ||||    
T  17204772 gatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttagtggttt 17204673  T
Q  106 tgt 108  Q
    |||    
T  17204672 tgt 17204670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 1990876 - 1990767
Alignment:
Q  6 tgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggt-gttcatataccataatt-gttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| ||||||||| | ||||||| | ||| ||| | ||||||||||| || |||||||||| ||    
T  1990876 tgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttggtttgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggt 1990777  T
Q  104 tttgtgaaat 113  Q
    ||||| ||||    
T  1990776 tttgtaaaat 1990767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Original strand, 14059385 - 14059482
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataat-tgttgatgagaaataagatgttgttggt 100  Q
    ||||||||| ||||||||  |  ||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||   ||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14059385 attgatgttattgttgctatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcatgatctgttgatgagaaatgagatgttgttggt 14059482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Original strand, 14842567 - 14842686
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||||| |||| |||||| | |    
T  14842567 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatg-ttcaaa-tgt 14842664  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  14842665 gtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 31412505 - 31412614
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| || ||||| ||||||||| | ||| | ||  ||||| |||||||| |||||||| | |    
T  31412505 attgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgagtgttcataaatcatgagtttgtgatgtgaaataagttgttgttgttgg 31412604  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||||||||||    
T  31412605 ttttgtgaaa 31412614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 17139583 - 17139531
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggt 56  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  17139583 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggt 17139531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 18980000 - 18980208
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980000 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 18980099  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980100 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 18980199  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  18980200 aattgatgt 18980208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 14250877 - 14251085
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14250877 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaa 14250976  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250977 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 14251076  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  14251077 aattgatgt 14251085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15927845 - 15927637
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15927845 tgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaa 15927746  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927745 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 15927646  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  15927645 aattgatgt 15927637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13758647 - 13758439
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13758647 tgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 13758548  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13758547 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgt 13758448  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  13758447 aattgatgt 13758439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 15950770 - 15950978
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950770 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 15950869  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  15950870 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattc 15950969  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  15950970 cattgatgt 15950978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 15760093 - 15760301
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15760093 tgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaa 15760192  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||      
T  15760193 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattc 15760292  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  15760293 cattgatgt 15760301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7823005 - 7822808
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7823005 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 7822906  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  7822905 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 7822808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7830316 - 7830119
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7830316 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 7830217  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  7830216 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 7830119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 27101616 - 27101813
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27101616 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 27101715  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  27101716 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 27101813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 27108964 - 27109161
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27108964 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 27109063  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  27109064 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 27109161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27176710 - 27176513
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27176710 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 27176611  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  27176610 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 27176513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 38783708 - 38783905
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38783708 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 38783807  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  38783808 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 38783905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15927644 - 15927492
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15927644 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatctatggcttgggtgttcacataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggtggt 15927545  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927544 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 15927492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 14251078 - 14251230
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14251078 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgacttatggcttgggtgttcagataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggtggt 14251177  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14251178 tttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 14251230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 18980201 - 18980353
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18980201 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatatatcataattgttgatgagaaataagatgttggtggtggt 18980300  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18980301 tttgtgaaattgatgaagttgagttgagtattcatgtgaaggaccaaattgaa 18980353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13758446 - 13758294
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13758446 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgagtatgatttgaggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttattggtggt 13758347  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13758346 tttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 13758294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 371164 - 371012
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  371164 attgatgttgttgttgccgagacatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgtttgtgagaaataagatgttgttggtggt 371065  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  371064 tttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 371012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 298
Target Start/End: Original strand, 48622646 - 48622789
Alignment:
Q  154 gaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48622646 gaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaa 48622745  T
Q  254 ttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattata 298  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  48622746 ttacatg-ttcaaagcatgcataattgttaagttgtgaaattata 48622789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Original strand, 10000351 - 10000505
Alignment:
Q  155 aaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaat 254  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| || || | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10000351 aaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaat 10000449  T
Q  255 tacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 310  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  10000450 tacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattgatga 10000505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16418774 - 16418633
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| || |||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16418774 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaa 16418676  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16418675 attacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 16418633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 172 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13321273 - 13321129
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13321273 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtat 13321174  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttg 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | || ||||| |||| ||||    
T  13321173 gtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaattttg 13321129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 152
Target Start/End: Original strand, 15951038 - 15951119
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaat 152  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951038 attgatgatgagaaataaattgttgttggtggttttctgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaat 15951119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 156
Target Start/End: Original strand, 1937270 - 1937333
Alignment:
Q  93 ttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1937270 ttgttggtggttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 1937333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7822737 - 7822652
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7822737 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 7822652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7830048 - 7829963
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7830048 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 7829963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 13910999 - 13911108
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||    
T  13910999 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaa 13911098  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  13911099 attacatgtt 13911108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 27101884 - 27101969
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27101884 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 27101969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 27109232 - 27109317
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27109232 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 27109317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27176442 - 27176357
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27176442 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 27176357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 38783976 - 38784061
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38783976 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 38784061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13572953 - 13572816
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || || || |||| ||||||    
T  13572953 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaa 13572854  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 292  Q
    |||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  13572853 attacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 13572816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 2437734 - 2437625
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||    
T  2437734 tgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaa 2437635  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  2437634 attacatgtt 2437625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 13377604 - 13377495
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||| | |    
T  13377604 attgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgg 13377505  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||| ||||||    
T  13377504 tttggtgaaa 13377495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10989686 - 10989577
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||    
T  10989686 tgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaa 10989587  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  10989586 attacatgtt 10989577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Original strand, 17224110 - 17224227
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  17224110 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgg 17224209  T
Q  103 ttttgtgaaattgatgaa 120  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  17224210 ttttgtaaaattggtgaa 17224227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 18253822 - 18253931
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  18253822 tgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 18253921  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  18253922 attacatgtt 18253931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Original strand, 16478937 - 16479075
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||| ||||||||  || |||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  16478937 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 16479036  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16479037 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16479075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Original strand, 32494490 - 32494535
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32494490 aattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 32494535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Original strand, 47481037 - 47481156
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||    
T  47481037 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tat 47481134  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  47481135 gtaaaaatgataagttgtgaaa 47481156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Original strand, 20583726 - 20583821
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||| | ||  || |||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20583726 attgatgttgttgttgttaagggatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttg 20583821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 15358872 - 15358770
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatata-ccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||| | |||  | |||||| | |||||| |||||||||||||||||||| | | | ||| |||||| ||||||| |||||||| |||    
T  15358872 attgatgttgttgttgttaagaagttttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatatatcaagatttgatgatgaaaaataagttgttgttgtttg 15358773  T
Q  103 ttt 105  Q
    |||    
T  15358772 ttt 15358770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 48356719 - 48356609
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||| | || |||||||| | |    
T  48356719 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaattgagttgttgttgttgg 48356620  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  48356619 ttttgtaaaat 48356609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 16915100 - 16915159
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcata 63  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  16915100 attgatgttgttgttgctaagtcatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcata 16915159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 28390387 - 28390292
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| || | ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  28390387 attgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtgttcataaatcatgaattgatgatgagaaatgagttgttgttg 28390292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 262
Target Start/End: Original strand, 11580789 - 11580835
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11580789 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 11580835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14940793 - 14940723
Alignment:
Q  39 atgatttatggcttgggtgttcatataccataatt-gttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgt 108  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  14940793 atgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaataagttgttgttgttagttttgt 14940723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15368386 - 15368316
Alignment:
Q  39 atgatttatggcttgggtgttcatataccataatt-gttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgt 108  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  15368386 atgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaataagttgttgttgttagttttgt 15368316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 262
Target Start/End: Original strand, 295966 - 296062
Alignment:
Q  166 atgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||| | || ||| ||  ||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  295966 atgaataattgttgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgtt 296062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 13274862 - 13274814
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggctt 52  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||    
T  13274862 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggctt 13274814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23514838 - 23514630
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514838 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 23514739  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514738 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 23514639  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  23514638 aattgatgt 23514630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 10777949 - 10778157
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10777949 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 10778048  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778049 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 10778148  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  10778149 aattgatgt 10778157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 1219499 - 1219707
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219499 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 1219598  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  1219599 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattt 1219698  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  1219699 cattgatgt 1219707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 17471567 - 17471775
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17471567 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 17471666  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||      
T  17471667 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtaatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaataagatgtaattcatattc 17471766  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  17471767 cattgatgt 17471775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7425601 - 7425393
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7425601 tgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaa 7425502  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  7425501 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattc 7425402  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  7425401 cattgatgt 7425393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 22883063 - 22883260
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22883063 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggatgaa 22883162  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  22883163 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatat 22883260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 21932360 - 21932557
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21932360 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 21932459  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21932460 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 21932557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 21938530 - 21938727
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21938530 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 21938629  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21938630 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 21938727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35582313 - 35582116
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35582313 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 35582214  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  35582213 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 35582116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Original strand, 35791077 - 35791266
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35791077 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaa 35791176  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaa-tttgatatgttttgattgaaatgagatgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  35791177 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgt 35791266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 36989749 - 36989946
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36989749 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 36989848  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  36989849 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 36989946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 10778150 - 10778302
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  10778150 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttggtggtggt 10778249  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778250 tttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 10778302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Original strand, 11212044 - 11212232
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212044 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 11212143  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  11212144 attacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttatgaaattatactcaagtagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgt 11212232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23514637 - 23514485
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23514637 attgatgttgttgttcttgagagatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattattgatgagaaataagatgttgttggtggt 23514538  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23514537 tttgtgaaattggtgaagttgagttaaatattcatgtgaaggaccaaattgaa 23514485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 9730563 - 9730715
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  9730563 attgatgttgttgttgctgagacatattgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgtttgtgagaaataagatgttgttggtggt 9730662  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9730663 tttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 9730715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 7528975 - 7528872
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  7528975 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgtttatgatttatgacttgggtgttcatatatcatgattgttggtgtgaattgagatgttgttggttgt 7528876  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  7528875 tttg 7528872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Original strand, 109013 - 109123
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggttg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||| |    
T  109013 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgg 109112  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  109113 ttttgtaaaat 109123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23328834 - 23328693
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23328834 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaa 23328736  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23328735 attacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 23328693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16105718 - 16105608
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggttg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||| |    
T  16105718 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttaggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgg 16105619  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  16105618 ttttgtaaaat 16105608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24616438 - 24616297
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24616438 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaa 24616340  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24616339 attacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 24616297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24712814 - 24712673
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24712814 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaa 24712716  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24712715 attacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 24712673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24745832 - 24745691
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24745832 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaa 24745734  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24745733 attacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 24745691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 1219767 - 1219852
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1219767 attgatgatgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaagtgaa 1219852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 22883331 - 22883416
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22883331 attgatgatgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 22883416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17909580 - 17909478
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17909580 attgatgttgttgctgatgcgacatgttgttgtttatgatt-atggcttgggtgttcatatatcatgattggtggtgagaaataagatgttgttggttgt 17909482  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  17909481 tttg 17909478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32950952 - 32950828
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    |||||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32950952 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtat 32950853  T
Q  272 gtataaatgt-taagttatgaaatt 295  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||    
T  32950852 gtataaaggtcaaagttatgaaatt 32950828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 21932628 - 21932713
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21932628 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 21932713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 21938798 - 21938883
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21938798 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 21938883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35582045 - 35581960
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35582045 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 35581960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 36990017 - 36990102
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36990017 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 36990102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27010118 - 27009981
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||    
T  27010118 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaa 27010019  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 292  Q
    |||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  27010018 attacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 27009981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Original strand, 29188259 - 29188397
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||| ||||||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  29188259 tgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 29188358  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  29188359 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 29188397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12651 - 12542
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||    
T  12651 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 12552  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  12551 attacatgtt 12542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 4199960 - 4200069
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||    
T  4199960 tgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaa 4200059  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  4200060 attacatgtt 4200069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23493994 - 23493885
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||| | ||| |||||||||||||| |||||||| | |    
T  23493994 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgg 23493895  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||| ||||||    
T  23493894 tttggtgaaa 23493885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25426905 - 25426796
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||    
T  25426905 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 25426806  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  25426805 attacatgtt 25426796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 18777967 - 18778076
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||    
T  18777967 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 18778066  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  18778067 attacatgtt 18778076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19500176 - 19500067
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||    
T  19500176 tgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 19500077  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  19500076 attacatgtt 19500067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 22366456 - 22366565
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||    
T  22366456 tgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 22366555  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  22366556 attacatgtt 22366565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23507222 - 23507103
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  23507222 aattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 23507125  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  23507124 gtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 43443370 - 43443479
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||    
T  43443370 tgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaa 43443469  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  43443470 attacatgtt 43443479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 3673937 - 3673828
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatatacca-taattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  | || |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||  | ||| |||||||||||||| |||||||| | |    
T  3673937 attgatgttgttgttgctaagcgaggtggttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcacgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgg 3673838  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||| ||||||    
T  3673837 tttggtgaaa 3673828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 21073570 - 21073679
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| ||||||    
T  21073570 tgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaa 21073669  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  21073670 attacatgtt 21073679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 112
Target Start/End: Original strand, 5451017 - 5451124
Alignment:
Q  6 tgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttgtt 104  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||| | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  5451017 tgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcttggcttggatgatcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtt 5451116  T
Q  105 ttgtgaaa 112  Q
    | ||||||    
T  5451117 tggtgaaa 5451124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34939531 - 34939415
Alignment:
Q  175 tgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgta 274  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || ||||||    
T  34939531 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgta 34939434  T
Q  275 taaatgttaagttatgaaa 293  Q
     |||||| |||||||||||    
T  34939433 aaaatgtgaagttatgaaa 34939415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Original strand, 18531073 - 18531163
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18531073 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 18531163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 110
Target Start/End: Original strand, 23981688 - 23981794
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| ||||||||||||||||||   ||| |||  ||||| |||||||| |||||||  | ||    
T  23981688 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataactcatgatttgtgatgtgaaataagttgttgttattggt 23981787  T
Q  104 tttgtga 110  Q
    |||||||    
T  23981788 tttgtga 23981794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 7728495 - 7728398
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  7728495 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataatttatcgcttgggtgtgcataattcatgaattgttggtgagagatgaggtgttgttggt 7728398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 29918038 - 29917981
Alignment:
Q  6 tgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcata 63  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  29918038 tgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcata 29917981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 11337358 - 11337465
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||||||| || | |||    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  11337358 attgatgttgttgttgctaagtcatgtcgttgatgataattcatggcttgagtttacatgattcatgattgttgttgagaaatgagatgttgttgg-tgt 11337456  T
Q  104 tttgtgaaa 112  Q
    |||||||||    
T  11337457 tttgtgaaa 11337465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 6456699 - 6456604
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||| | ||| || | |||| | |||||| |||||||||||||||||  | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6456699 attgatgttgttgttgttaagagatatcgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttg 6456604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 26559987 - 26560046
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcata 63  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||| | ||||||  |||||||||||||||||    
T  26559987 attgatgttgttgttgctaagagatattgttggtgatgattcttggcttgggtgttcata 26560046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28902186 - 28902140
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtg-ttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28902186 aattggtgaagttgagttaagtggttcatgtgaaggaccaaaatgaa 28902140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28938581 - 28938535
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtg-ttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28938581 aattggtgaagttgagttaagtggttcatgtgaaggaccaaaatgaa 28938535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Original strand, 1168376 - 1168473
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcat-ataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||| || |   | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1168376 attgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggt 1168473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19873919 - 19873810
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||  ||||| ||| |||| |||||||| ||     
T  19873919 attgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaatttgtgatgtgaattaagttgttgttgtttt 19873820  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    || |||||||    
T  19873819 ttctgtgaaa 19873810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8944123 - 8943915
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8944123 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaa 8944024  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8944023 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 8943924  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  8943923 aattgatgt 8943915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 12635847 - 12636055
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12635847 tgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 12635946  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12635947 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 12636046  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  12636047 aattgatgt 12636055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 42177948 - 42178156
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42177948 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaa 42178047  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42178048 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 42178147  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  42178148 aattgatgt 42178156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 3798582 - 3798790
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3798582 tgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 3798681  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3798682 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgt 3798781  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  3798782 aattgatgt 3798790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 12641621 - 12641829
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12641621 tgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaa 12641720  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12641721 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgt 12641820  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  12641821 aattgatgt 12641829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12728669 - 12728461
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728669 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 12728570  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||      
T  12728569 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattc 12728470  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  12728469 cattgatgt 12728461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 34824752 - 34824544
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824752 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 34824653  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||      
T  34824652 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattc 34824553  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  34824552 cattgatgt 34824544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 23778024 - 23778232
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23778024 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaa 23778123  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||      
T  23778124 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgatttgattgaaatgagatgtaattcatattc 23778223  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  23778224 cattgatgt 23778232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16935870 - 16935662
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16935870 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaa 16935771  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  16935770 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattc 16935671  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  16935670 cattgatgt 16935662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17006530 - 17006322
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17006530 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaa 17006431  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  17006430 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattc 17006331  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  17006330 cattgatgt 17006322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 11231317 - 11231514
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11231317 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 11231416  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  11231417 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatat 11231514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 22513164 - 22513361
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22513164 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 22513263  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  22513264 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 22513361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 24685760 - 24685957
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24685760 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 24685859  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  24685860 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatgtgttttgattgaaaagagatgtgattcatat 24685957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 28775786 - 28775983
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28775786 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 28775885  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  28775886 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 28775983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 12636048 - 12636200
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12636048 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggattgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggtggt 12636147  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12636148 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 12636200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8943922 - 8943770
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8943922 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggattgggtgttcatataccataattgttaatgagaaataagatgttgttggtggt 8943823  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8943822 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 8943770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 12641822 - 12641974
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12641822 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgagtatgatttatggcttgggtgttcatataccataagtgttgatgagaaataagatgttgttggtggt 12641921  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12641922 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 12641974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 42178149 - 42178301
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42178149 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgacttatggcttgggtgttcatataccaaaattgttgatgagaaataagatgttgttggtggt 42178248  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42178249 tttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 42178301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 3798783 - 3798935
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3798783 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgagtatgatttgaggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttattggtggt 3798882  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3798883 tttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 3798935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21142172 - 21141984
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21142172 tgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaa 21142073  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||    
T  21142072 attacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgt 21141984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 28031419 - 28031523
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28031419 attgatgttgttgttgttgagatatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgatgagaaaatgagatgttgttggttg 28031518  T
Q  103 ttttg 107  Q
    |||||    
T  28031519 ttttg 28031523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15633288 - 15633186
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15633288 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgct-atgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgttagtgagaaataagatgttgttggttgt 15633190  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  15633189 tttg 15633186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 293
Target Start/End: Original strand, 7507844 - 7507969
Alignment:
Q  166 atgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 265  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  7507844 atgaataattattgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 7507942  T
Q  266 aagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    || |||||| ||||  ||||||||||||    
T  7507943 aa-tatgtaaaaataataagttatgaaa 7507969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Original strand, 5888609 - 5888750
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| || |||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5888609 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaa 5888707  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5888708 attacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 5888750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23774413 - 23774272
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23774413 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaa 23774315  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23774314 attacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 23774272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 25213123 - 25213042
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  25213123 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgataatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaa 25213042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 151
Target Start/End: Original strand, 24686028 - 24686108
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaa 151  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24686028 attgatgatgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaa 24686108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 17204406 - 17204303
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggttg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  17204406 attgatgttgttgttgctgagatatattgttgattatgaattatggcttatatgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagatgttgttggttg 17204307  T
Q  103 tttt 106  Q
    ||||    
T  17204306 tttt 17204303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Original strand, 24826899 - 24827009
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||| |    
T  24826899 attgatgttgttgttgctgagatacgttgttgattatgaattatggcttgggtgctcatttatcatgattgttgttgagaaaatgagctgttgttggtgg 24826998  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  24826999 ttttgtaaaat 24827009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12728401 - 12728316
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12728401 attgatgatgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcaggtgaaggaccaaagtgaa 12728316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 34824484 - 34824399
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34824484 attgatgatgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttaagttaagtgttcatgtgaaggaccaaagtgaa 34824399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22274731 - 22274645
Alignment:
Q  70 aattgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||| ||||||||    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22274731 aattgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 22274645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 11231585 - 11231670
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11231585 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 11231670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22283964 - 22283883
Alignment:
Q  70 aattgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaa 151  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22283964 aattgctgttgagaaatgaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaa 22283883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 22513432 - 22513517
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22513432 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 22513517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 28776054 - 28776139
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28776054 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 28776139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Original strand, 3413 - 3509
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  3413 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgattgtagatgagaaatgagttgttgttggt 3509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Original strand, 19433504 - 19433614
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||||| ||||||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  19433504 attgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgg 19433603  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  19433604 ttttgtaaaat 19433614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 19886636 - 19886745
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||    
T  19886636 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 19886735  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  19886736 attacatgtt 19886745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22256332 - 22256270
Alignment:
Q  41 gatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgtttt 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22256332 gatttatggcttgggtgtttatatatcataattg---atgagaaataagatgttgttggttgtttt 22256270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Original strand, 43642963 - 43643053
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43642963 aattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 43643053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 25305520 - 25305408
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataatt-gttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||   ||| ||| ||||||||||||| || |||||||||| |    
T  25305520 attgatgttgttgtggctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcctgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtag 25305421  T
Q  103 ttttgtgaaattg 115  Q
    ||||| |||||||    
T  25305420 ttttgcgaaattg 25305408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Original strand, 25265396 - 25265486
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||   | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25265396 aattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 25265486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 68067 - 67958
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataatt-gttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| |  ||||| |||||||| |||||||||   ||| ||| | |||||||||||||| |||||||| | |    
T  68067 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgattcatggcttgcgtgttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgg 67968  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||||||||||    
T  67967 ttttgtgaaa 67958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 462995 - 462876
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  462995 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 462898  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  462897 gtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 23821777 - 23821886
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||   ||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| | |    
T  23821777 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttgg 23821876  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||||||||||    
T  23821877 ttttgtgaaa 23821886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 23830856 - 23830965
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||   ||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| | |    
T  23830856 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttgg 23830955  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||||||||||    
T  23830956 ttttgtgaaa 23830965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 28974124 - 28974027
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcat-ataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||| || |   | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28974124 attgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggt 28974027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Original strand, 22775457 - 22775503
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtg-ttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22775457 aattggtgaagttgagttaagtggttcatgtgaaggaccaaaatgaa 22775503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Original strand, 22780835 - 22780881
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtg-ttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22780835 aattggtgaagttgagttaagtggttcatgtgaaggaccaaaatgaa 22780881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 24884761 - 24884651
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| | | || |||||| | |||||| ||| |||||||||||||| | ||| | ||| ||| ||||||| || |||||||| | |    
T  24884761 attgatgttgttgttgctaatagatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcataaatcatgatttgatgaggagaaatgagttgttgttgttgg 24884662  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  24884661 ttttgtaaaat 24884651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 17396702 - 17396776
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 292  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || || ||| ||||| |||||||||||    
T  17396702 tgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaataagtaaaaatgataagttatgaa 17396776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 1493 - 1701
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1493 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 1592  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1593 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 1692  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  1693 aattgatgt 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 42
Target Start/End: Original strand, 1694 - 1732
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatga 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1694 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatga 1732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17148844 - 17148636
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17148844 tgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 17148745  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17148744 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 17148645  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
     ||||||||    
T  17148644 aattgatgt 17148636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 46523666 - 46523458
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  46523666 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaa 46523567  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  46523566 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattc 46523467  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  46523466 cattgatgt 46523458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 18059737 - 18059945
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18059737 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 18059836  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  18059837 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattc 18059936  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  18059937 cattgatgt 18059945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17004915 - 17004718
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17004915 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 17004816  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  17004815 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 17004718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 38055070 - 38055267
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38055070 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgcttttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 38055169  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  38055170 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatat 38055267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17148643 - 17148491
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  17148643 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatatatcataattgttgatgagaaataagatgttggtggtggt 17148544  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17148543 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgatggaccaaattgaa 17148491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 21650220 - 21650372
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  21650220 attgatgttgttgttgttgagacatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgtttgtgagaaataagatgttgttggtggt 21650319  T
Q  104 tttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21650320 tttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 21650372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 153 - 292
Target Start/End: Original strand, 19962478 - 19962617
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  19962478 tgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgga 19962577  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19962578 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19962617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22228085 - 22227947
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||    
T  22228085 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22227986  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22227985 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 22227947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22232782 - 22232644
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||    
T  22232782 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22232683  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22232682 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 22232644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Original strand, 7640913 - 7641054
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7640913 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaa 7641011  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7641012 attacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 7641054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22035724 - 22035583
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22035724 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaa 22035626  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22035625 attacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 22035583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 18060005 - 18060090
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18060005 attgatgatgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 18060090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17004647 - 17004562
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17004647 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 17004562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 38055338 - 38055423
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38055338 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 38055423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 5072363 - 5072472
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||    
T  5072363 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaa 5072462  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  5072463 attacatgtt 5072472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Original strand, 44035238 - 44035303
Alignment:
Q  91 tgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44035238 tgttgttggtggttttgtgcaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 44035303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2116529 - 2116393
Alignment:
Q  155 aaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaat 254  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  2116529 aaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaat 2116430  T
Q  255 tacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  2116429 tacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 2116393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 18601093 - 18601202
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||    
T  18601093 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaa 18601192  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  18601193 attacatgtt 18601202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 20177250 - 20177133
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||   ||| | ||||||| ||||||| || |||||||||| |    
T  20177250 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttggatattcataattcatgatttgttgaagagaaatgagttgttgttggtgg 20177151  T
Q  103 ttttgtgaaattgatgaa 120  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  20177150 ttttgtgaaattggtgaa 20177133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 45051699 - 45051561
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||  ||||||| ||  ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  45051699 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 45051600  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  45051599 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 45051561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 36356465 - 36356524
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcata 63  Q
    ||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36356465 attgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgatgatttatggcttgggtgttcata 36356524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20445936 - 20445846
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20445936 aattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 20445846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Original strand, 13377012 - 13377129
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||   ||| | ||||||||||||||| |  |||||||||  |    
T  13377012 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgttgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgaattgttgttggcgg 13377111  T
Q  103 ttttgtgaaattgatgaa 120  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  13377112 ttttgtgaaattggtgaa 13377129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Original strand, 41229111 - 41229228
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||   ||| | |||| |||||||||| || |||||||||| |    
T  41229111 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtag 41229210  T
Q  103 ttttgtgaaattgatgaa 120  Q
    ||| || |||||| ||||    
T  41229211 tttggtaaaattggtgaa 41229228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20913287 - 20913168
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  20913287 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcata-tat 20913190  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  20913189 gtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20931602 - 20931483
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  20931602 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcata-tat 20931505  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  20931504 gtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 21195085 - 21194994
Alignment:
Q  8 atgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  21195085 atgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttg 21194994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21859253 - 21859214
Alignment:
Q  117 tgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21859253 tgaagatgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 21859214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16656633 - 16656587
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtg-ttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16656633 aattggtgaagttgagttaagtggttcatgtgaaggaccaaaatgaa 16656587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20531657 - 20531611
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20531657 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 20531611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 262
Target Start/End: Original strand, 37844500 - 37844546
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37844500 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 37844546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 98
Target Start/End: Original strand, 49997455 - 49997548
Alignment:
Q  6 tgatgttgttgttgctga-gatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||| | || || |||||| | || ||| |||| || |||||||||| | |||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  49997455 tgatgttgttgttgcttaagagatattgttgttgatcattcatggatttggtgttcataaatcatggttgttgatgagaaataagttgttgttg 49997548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 1554 - 1751
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1554 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 1653  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1654 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 1751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 153986 - 154194
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  153986 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 154085  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  154086 gttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgaatcatattc 154185  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  154186 cattgatgt 154194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 154254 - 154339
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  154254 attgatgatgagaaataaattgttgatggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 154339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36370 - 36264
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||  | || ||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||    
T  36370 tgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtagtgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaa 36271  T
Q  253 attacat 259  Q
    |||||||    
T  36270 attacat 36264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 204
Target Start/End: Original strand, 169887 - 169938
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  169887 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 169938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 48855 - 48765
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48855 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 48765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Original strand, 10318 - 10526
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10318 tgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 10417  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  10418 attacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattc 10517  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  10518 cattgatgt 10526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2669 - 2461
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2669 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctcttgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaa 2570  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||      
T  2569 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtaattcatattc 2470  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  2469 cattgatgt 2461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 7243 - 7137
Alignment:
Q  7 gatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttgttt 105  Q
    ||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||    
T  7243 gatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataatccatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttggttt 7144  T
Q  106 tgtgaaa 112  Q
     ||||||    
T  7143 ggtgaaa 7137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39923 - 39715
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39923 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatttttgtgggtgaa 39824  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| |    
T  39823 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgttttttttgaaatgagatgttattcatattt 39724  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  39723 cattgatgt 39715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31586 - 31389
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31586 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 31487  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  31486 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 31389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39655 - 39570
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39655 attgatgatgagaaataatttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaagtgaa 39570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31318 - 31233
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31318 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattagtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 31233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 29439 - 29231
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  29439 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgttgattatgttatgtttatgggtgaa 29340  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  29339 attacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattc 29240  T
Q  353 cattgatgt 361  Q
    |||||||||    
T  29239 cattgatgt 29231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 29171 - 29093
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggacca 149  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29171 attgatgatgagatataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggacca 29093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39380 - 39183
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39380 tgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaa 39281  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  39280 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatat 39183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39112 - 39027
Alignment:
Q  71 attgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39112 attgatgatgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 39027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 43274 - 43137
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||  ||||| ||||||||| || |||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  43274 tgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 43175  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 292  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43174 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgaa 43137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 179 - 361
Target Start/End: Original strand, 1 - 183
Alignment:
Q  179 gctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaa 278  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1 gctaaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaa 100  T
Q  279 tgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtcattgatgt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  101 tgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattacattgatgt 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 339
Target Start/End: Original strand, 34140 - 34323
Alignment:
Q  156 aaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaatt 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34140 aaatgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaatt 34239  T
Q  256 acatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagat 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |  ||||||||||||    
T  34240 acatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaagttatacttaattgatgaatttggatatgttgttgttgaaatgagat 34323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Original strand, 7435 - 7623
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7435 tgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaa 7534  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||    
T  7535 attacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgt 7623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45307 - 45119
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  45307 tgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgcccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaa 45208  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  45207 attacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgt 45119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 54693 - 54505
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  54693 tgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgtccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaa 54594  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgt 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  54593 attgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgt 54505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 54151 - 54006
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54151 tgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 54052  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatac 299  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  54051 attacatg-ttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaaattatac 54006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 153 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3690 - 3545
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3690 tgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatgattatggtatgattgtgggtgaa 3591  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatac 299  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3590 attacatg-ttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaaattatac 3545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 6396 - 6498
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6396 attgatgttgttgatgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatatatcataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 6495  T
Q  104 ttt 106  Q
    |||    
T  6496 ttt 6498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 50028 - 50131
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50028 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgatgaaaaataagatgttgttggttgt 50127  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  50128 tttg 50131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3999 - 3890
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  3999 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 3900  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  3899 attacatgtt 3890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Original strand, 5191 - 5329
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  5191 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 5290  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  5291 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 5329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6874 - 6718
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6874 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaa 6776  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 310  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  6775 attacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattaatga 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 5761 - 5865
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5761 attgatgttgttgttgctgagaaatgttgttgtttatgatttatgacttgggtgttcatatgtcatgattgttggtgagaaatgagatgttgttggttgt 5860  T
Q  104 tttgt 108  Q
    |||||    
T  5861 tttgt 5865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 5296 - 5194
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5296 attgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtaagaaataagatgttgttggttgt 5198  T
Q  104 tttg 107  Q
    ||||    
T  5197 tttg 5194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7486 - 7345
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| || |||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7486 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaa 7388  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7387 attacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 7345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 147602 - 147530
Alignment:
Q  30 ttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggtt 101  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  147602 ttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataatccatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttggtt 147530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17768 - 17673
Alignment:
Q  12 tgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttg 107  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17768 tgttgttgctgagacaagttgttgtttatgatttatggcttgggtgctcatatatcatgattgttggtgagaaataagatgttgttggttgttttg 17673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 11820 - 11730
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttg 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11820 attgatgttgttgttgctgagacatgttgttg-ttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaataagatgttg 11730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 258
Target Start/End: Original strand, 8186 - 8272
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattaca 258  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  8186 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattaca 8272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Original strand, 56105 - 56228
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    |||||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  56105 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtat 56204  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaatt 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  56205 gtataaatgtcaagttatgaaatt 56228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 130631 - 130521
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgag-aaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||| |    
T  130631 attgatgttgttgttgttgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtgg 130532  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  130531 ttttgtaaaat 130521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Original strand, 89460 - 89550
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  89460 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 89550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Original strand, 23728 - 23869
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| ||||||| ||| || || | ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23728 tgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctctggttatgttgttgttt-cttatacatggattgatgattatggtatgtttgtggatgaa 23826  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23827 attacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 23869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3239 - 3130
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | | |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  3239 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 3140  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  3139 attacatgtt 3130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 165146 - 165245
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  165146 attgatgttgttgttgctgagacatgttgtt---tatgatt-atggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaaaaagatgatgttggttgt 165241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 292
Target Start/End: Original strand, 21091 - 21228
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | | ||| |||||||||| ||  |||| ||||  |||||    
T  21091 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaa 21190  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 292  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  21191 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaa 21228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 292
Target Start/End: Original strand, 14037 - 14173
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |   | |||||||||||||||| ||  |||| ||||  |||||    
T  14037 tgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaa-tcgtgctcttgctgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaa 14135  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 292  Q
    ||||||||||   || |||||| ||||| |||||||||||    
T  14136 attacatgtt--gaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 14173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 312 - 177
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  312 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaa 213  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 290  Q
    |||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||    
T  212 attacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatg 177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Original strand, 31548 - 31613
Alignment:
Q  91 tgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31548 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 31613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41296 - 41231
Alignment:
Q  91 tgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41296 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 41231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Original strand, 13300 - 13438
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  13300 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 13399  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  13400 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 13438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 107
Target Start/End: Original strand, 34597 - 34677
Alignment:
Q  27 atgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttg 107  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34597 atgttgttgtttatgatttatgacttgggtgttcatataacatgattgttggtgagaattgagatgttgttggttgttttg 34677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Original strand, 1279 - 1388
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||    
T  1279 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaa 1378  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  1379 attacatgtt 1388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Original strand, 6351 - 6416
Alignment:
Q  91 tgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6351 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaagttgagttaagtgttcatgagaaggaccaaaatgaa 6416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Original strand, 162447 - 162512
Alignment:
Q  91 tgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  162447 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaaattgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 162512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Original strand, 166525 - 166590
Alignment:
Q  91 tgttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  166525 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaaattgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 166590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 120
Target Start/End: Original strand, 116687 - 116802
Alignment:
Q  6 tgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttgtt 104  Q
    |||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||||||||| ||||    |||||||||| |||    
T  116687 tgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgaaaaatggattgttgttggtggtt 116786  T
Q  105 ttgtgaaattgatgaa 120  Q
    |||| |||||| ||||    
T  116787 ttgtaaaattggtgaa 116802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3319
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||  ||  | |||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3447 aattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttcaaagtat 3348  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaattatact 300  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  3347 gtataaatatcaagttatgaaattgtact 3319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Original strand, 9324 - 9462
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  9324 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 9423  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  9424 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 9462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Original strand, 16222 - 16360
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  16222 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 16321  T
Q  253 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16322 attacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 204
Target Start/End: Original strand, 10727 - 10778
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10727 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2530 - 2421
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcat-ataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| |||||||||||||| |||||||| | |    
T  2530 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattccttatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgg 2431  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||||||||||    
T  2430 ttttgtgaaa 2421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 108023 - 107914
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  108023 tgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 107924  T
Q  253 attacatgtt 262  Q
    ||||||||||    
T  107923 attacatgtt 107914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 292
Target Start/End: Original strand, 64498 - 64640
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatga-----attgatgattatggtatgtttgtgg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||     ||||||||| || ||||| |||| |    
T  64498 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttg 64597  T
Q  248 gtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 292  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  64598 gtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 64640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 112
Target Start/End: Original strand, 90039 - 90125
Alignment:
Q  27 atgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgtgaaa 112  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  90039 atgttgttgttgatgattcatgacttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 90125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 156
Target Start/End: Original strand, 721 - 783
Alignment:
Q  93 ttgttggttgttttgtgaaattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  721 ttgttggtggttttgtgaa-ttggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 6015 - 5906
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| |||||||| |||||||||  |||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| | |    
T  6015 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataatccatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttgg 5916  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||| ||||||    
T  5915 tttggtgaaa 5906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 108085 - 107991
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||| | |||||| || ||||||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||| ||||||||    
T  108085 attgatgttgttgttgttaagatatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaattttgatgagaaataagttgttgttg 107991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Original strand, 15910 - 15955
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15910 aattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 15955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 6619 - 6514
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataatt-gttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || |||||| | |||||| ||||||| |||||||||| | ||| ||| | |||||||||||||| |||||||| | |    
T  6619 attgatgatgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttaggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgg 6520  T
Q  103 ttttgt 108  Q
    ||||||    
T  6519 ttttgt 6514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 293
Target Start/End: Original strand, 36963 - 37038
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  36963 tgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 37038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Original strand, 77019 - 77136
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataatt-gttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||  | |||||| ||||||||||| ||||||   ||| ||| ||||||||||||| || |||||||||| |    
T  77019 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgg 77118  T
Q  103 ttttgtgaaattgatgaa 120  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  77119 ttttgtgaaattggtgaa 77136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 11169 - 11074
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11169 attgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgtttatgattcatggcttaggtgttcatagatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttg 11074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10922 - 10877
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10922 aattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 10877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Original strand, 1118 - 1213
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1118 attgatgttgttgttgctaaggaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttg 1213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 120
Target Start/End: Original strand, 13472 - 13582
Alignment:
Q  9 tgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttgt 108  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||    ||||||| || |||||||    
T  13472 tgttgttgttgttgatacatgttgttgtttatgatt-atggcttgggtgttgatatatcatgattcttgttgagaaatggattgttgttagtggttttgt 13570  T
Q  109 gaaattgatgaa 120  Q
    ||||||| ||||    
T  13571 gaaattggtgaa 13582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28611 - 28501
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   ||| | || ||| |||||||| || |||||||||| |    
T  28611 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttattggtgagaaatgagttgttgttggtgg 28512  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  28511 ttttgtaaaat 28501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Original strand, 43970 - 44080
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||| || |||||||| | |    
T  43970 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttgg 44069  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  44070 ttttgtaaaat 44080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Original strand, 123170 - 123260
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  123170 aattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 123260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 259
Target Start/End: Original strand, 31650 - 31756
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||    |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||    
T  31650 tgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtggtgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaa 31749  T
Q  253 attacat 259  Q
    |||||||    
T  31750 attacat 31756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 4638 - 4529
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| | |    
T  4638 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataatccatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttgg 4539  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||| ||||||    
T  4538 tttggtgaaa 4529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9252 - 9143
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| | |    
T  9252 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataatccatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttgg 9153  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||| ||||||    
T  9152 tttggtgaaa 9143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Original strand, 3588 - 3707
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  3588 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 3685  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  3686 gtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1337 - 1262
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||||||||||||| || || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  1337 tgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 1262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13763 - 13613
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||   | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||   || |||    
T  13763 aattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattat 13666  T
Q  272 gtataaatgttaagttatg-aaattatacttaattgatgaaatttgatatgtt 323  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| | || |||||||||| |||| ||||||    
T  13665 gtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgtt 13613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 5016 - 4899
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||   ||| | ||| |||||||||||    |||||||||| |    
T  5016 attgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggttgttcataattcatgatttgctgatgagaaatggattgttgttggtgg 4917  T
Q  103 ttttgtgaaattgatgaa 120  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  4916 ttttgtgaaattggtgaa 4899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Original strand, 34466 - 34556
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    |||| |||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34466 aattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 34556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Original strand, 19345 - 19390
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19345 aattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 19390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40491 - 40446
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40491 aattggtgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 40446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45974 - 45929
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45974 aattggtgaagttaagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 45929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 40730 - 40674
Alignment:
Q  7 gatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcata 63  Q
    ||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  40730 gatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcata 40674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 79672 - 79632
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaa 151  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  79672 aattggtgaagttaagttaagtgttcatgtgaaggatcaaa 79632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5792 - 5668
Alignment:
Q  166 atgaacaattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 265  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||    | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||      
T  5792 atgaataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt-- 5695  T
Q  266 aagtatgtataaatgttaagttatgaa 292  Q
    || |||||| ||||| ||||| |||||    
T  5694 aaatatgtaaaaatgataagtcatgaa 5668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12370 - 12279
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  12370 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgttt 12279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 37633 - 37538
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  37633 attgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaattgatgatgagaaatgagttgttgttg 37538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Original strand, 540 - 630
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  540 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9135 - 9016
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||| |||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||   || |||    
T  9135 aattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt--caattat 9038  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  9037 gtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Original strand, 6070 - 6160
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6070 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 4680 - 4578
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatata-ccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||| | |||  | |||||| | |||||| |||||||||||||||||||| | | | ||| |||||| ||||||| |||||||| |||    
T  4680 attgatgttgttgttgttaagaagttttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatatatcaagatttgatgatgaaaaataagttgttgttgtttg 4581  T
Q  103 ttt 105  Q
    |||    
T  4580 ttt 4578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Original strand, 962 - 1052
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  962 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41905 - 41815
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    |||||||| |||||| |||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41905 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 41815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9106 - 9016
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9106 aattgttgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 9016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 148978 - 148859
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  148978 aattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 148881  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  148880 gtaaaaatgataagttgtgaaa 148859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 69532 - 69422
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||| | || |||||||| | |    
T  69532 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaattgaggtgttgttgttgg 69433  T
Q  103 ttttgtgaaat 113  Q
    |||||| ||||    
T  69432 ttttgtaaaat 69422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 7847 - 7956
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| || ||||||||||||||| | ||| | ||  ||||| |||||||| |||||||| | |    
T  7847 attgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgagtttgtgatgtgaaataagttgttgttgttgg 7946  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||||||||||    
T  7947 ttttgtgaaa 7956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 7477 - 7372
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || |||||| | |||||| |||||||||||  ||||| | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||| | |    
T  7477 attgatgttggtgttgctaagagatattgttgctaatgattcatggcttgggtactcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgg 7378  T
Q  103 ttttgt 108  Q
    ||||||    
T  7377 ttttgt 7372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16902 - 16797
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || |||||| | |||||| |||||||||||  ||||| | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||| | |    
T  16902 attgatgttggtgttgctaagagatattgttgctaatgattcatggcttgggtactcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgg 16803  T
Q  103 ttttgt 108  Q
    ||||||    
T  16802 ttttgt 16797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 2488 - 2597
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    ||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||   |||   ||| |||||||||||||| |||||||| | |    
T  2488 attgatgttgttgttcctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggcgttcataattcatgttttgatgatgagaaataagttgttgttgttgg 2587  T
Q  103 ttttgtgaaa 112  Q
    ||| ||||||    
T  2588 tttggtgaaa 2597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19463 - 19344
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  19463 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 19366  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  19365 gtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21547 - 21428
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  21547 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 21450  T
Q  272 gtataaatgttaagttatgaaa 293  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  21449 gtaaaaatgataagttgtgaaa 21428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33474 - 33429
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtgttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33474 aattggtgaagttaagttaagtgttcatgtgaaggaccaaaatgaa 33429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 35553 - 35437
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||||||| || || ||||||| |    
T  35553 attgatgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttg-tgttggtgg 35455  T
Q  103 ttttgtgaaattgatgaa 120  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  35454 ttttgtaaaattggtgaa 35437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 112
Target Start/End: Original strand, 68058 - 68162
Alignment:
Q  8 atgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgttttg 107  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |  ||||| ||| |||| |||||||| | ||||||    
T  68058 atgttgttgttgttaagatacattgttgttgatgatttatagcttgggtgttcataaatcatgagttgtgatgtgaagtaagttgttgttgttggttttg 68157  T
Q  108 tgaaa 112  Q
    |||||    
T  68158 tgaaa 68162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3327 - 3232
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccat-aattgttgatgagaaataagatgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||| || ||||||||||||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  3327 attgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgagttgatgatgtgaaataagttgttgttg 3232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 196
Target Start/End: Original strand, 12106 - 12149
Alignment:
Q  153 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatttgtgctcttg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  12106 tgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Original strand, 344 - 390
Alignment:
Q  111 aattgatgaagttgagttaagtg-ttcatgtgaaggaccaaattgaa 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  344 aattggtgaagttgagttaagtggttcatgtgaaggaccaaaatgaa 390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 48400 - 48354
Alignment:
Q  216 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48400 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 48354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Original strand, 51188 - 51278
Alignment:
Q  172 aattgttgctaaatttgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  51188 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 51278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 384 - 279
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataatt-gttgatgagaaataagatgttgttggttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| ||| | || ||| ||| |||||||| |||||   ||| ||| ||||||||||||| || |||||||||| |    
T  384 attgatgttgttgttgctaagtgatgtttttgttgattattcatgccttgggtgctcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgg 285  T
Q  103 ttttgt 108  Q
    ||||||    
T  284 ttttgt 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 3374 - 3265
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggtgttcatataccataattgttgatgagaaataagatgttgttggttgt 103  Q
    |||||||||||||||| |  |  ||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||    ||| ||||||| |||||||| || |||||||||| ||    
T  3374 attgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggt 3275  T
Q  104 tttgtgaaat 113  Q
    ||||| ||||    
T  3274 tttgtaaaat 3265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 56
Target Start/End: Original strand, 748 - 800
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggt 56  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  748 attgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggt 800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 56
Target Start/End: Original strand, 33900 - 33952
Alignment:
Q  4 attgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgatttatggcttgggt 56  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  33900 attgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggt 33952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University