View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8532_low_2 (Length: 536)

Name: NF8532_low_2
Description: NF8532
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8532_low_2
NF8532_low_2
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (15-498)||(21792013-21792496)
chr7 (17-491)||(21788233-21788725)
chr7 (15-498)||(21681652-21682156)
chr7 (15-354)||(15713625-15713964)
chr7 (15-474)||(21652071-21652542)
chr7 (15-491)||(21992175-21992681)
chr7 (86-354)||(21623266-21623534)
chr7 (15-483)||(21646745-21647238)
chr7 (15-356)||(21807970-21808311)
chr7 (15-357)||(21689415-21689757)
chr7 (15-357)||(21785408-21785750)
chr7 (86-510)||(21764135-21764559)
chr7 (15-498)||(21771963-21772467)
chr7 (15-357)||(21628127-21628469)
chr7 (15-354)||(21704645-21704984)
chr7 (15-354)||(21664100-21664442)
chr7 (39-356)||(21714209-21714526)
chr7 (15-357)||(21725898-21726240)
chr7 (15-354)||(21745534-21745873)
chr7 (390-510)||(21628526-21628646)
chr7 (387-498)||(21689808-21689919)
chr7 (390-498)||(21785804-21785912)
chr7 (390-482)||(15714015-15714107)
chr7 (390-482)||(21623591-21623683)
chr7 (390-498)||(21714581-21714689)
chr7 (390-498)||(21726294-21726402)
chr7 (390-483)||(21745924-21746017)
chr7 (390-498)||(21664505-21664613)
chr7 (400-505)||(21705045-21705150)
chr7 (400-505)||(21807797-21807902)
chr7 (436-510)||(21656895-21656969)
[»] scaffold0182 (3 HSPs)
scaffold0182 (228-358)||(25588-25718)
scaffold0182 (390-498)||(25771-25879)
scaffold0182 (15-175)||(25312-25472)
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (277-351)||(18192049-18192123)
chr1 (48-161)||(18192233-18192346)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 498
Target Start/End: Original strand, 21792013 - 21792496
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21792013 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagagaaaattttgagaagcattacatcccaaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 21792112  T
Q  115 aaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgat 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21792113 agatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaaaactgaaagcattctgaaagatctgcacaaaaagattgccgat 21792212  T
Q  215 aacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatgga 314  Q
    |||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21792213 aacattgatacgctgaaggatcgttttagcgatgatgttttaactttaacccgcaagtctcttgacggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatgga 21792312  T
Q  315 tgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttggagaattggaagcattttgaaccagggcacatgactattgtgatgatggatgtgcttttgtt 414  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21792313 tattgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttggagaaatggaagcattttgaacaagagcacatgactattgtgatgatggatgtgcttttgtt 21792412  T
Q  415 ggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaaaagcatgacgaattt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  21792413 ggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagacgacaaccagagtgcattaatagaaagcatgacgaattt 21792496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 491
Target Start/End: Original strand, 21788233 - 21788725
Alignment:
Q  17 atacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtacaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | || | |||  | ||  ||||||| |||||||||| ||  ||||    
T  21788233 atacaaagggtggcagagtatctcagaaatagaaaaaactttgagaagcattactcgcccaagttgttgtcggtaggtcctatccatcatgacaacacaa 21788332  T
Q  117 atctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgataa 216  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||   | |||||||||||||||||||| |||||    
T  21788333 atttgaagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcaaaatacatcgaaaacactggacacattccagaggatctgcacaaaaagattgcagataa 21788432  T
Q  217 cattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatggatg 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21788433 cattgatgaactgaagggtcattttggcgacgatgttttaactttaactggcaagtctcttgaaggctttggaagcctcgaagaaaagctgtcgtggatg 21788532  T
Q  317 ttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttggagaattggaagcattttgaaccagggcacatgactat---------------------tgtga 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    |||| |  |||||| |||||||||| |||                     |||||    
T  21788533 ttgttcgtggatggatgttctttgttgtatatcttagagaaagccaagcttgatgaacctgggcacatgaatattaaagttgatcaactggttcttgtga 21788632  T
Q  396 tgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaaaagcatga 491  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21788633 tgatggatgtgcttctgttggagaatcaacttccttacgtagtactcaagctattgtggaaagat---aacgatagtgaattgataaaaagcatga 21788725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 498
Target Start/End: Original strand, 21681652 - 21682156
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||| ||| |||| ||| ||| || || |||||| ||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  21681652 agatacaaagggtgccacggtatgtcaaaaatagaacaaaatttaaggagcattacagccccaagtttgtgtcaataggtcctatccatcatggcaatac 21681751  T
Q  115 aaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgat 214  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||| ||||| |||    
T  21681752 agatctaaagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcaaaatacatcaaaaacactggaagcattcaaaaggatctatacaaaaaaattgctgat 21681851  T
Q  215 aacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatgga 314  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||||    
T  21681852 aacattgatgaattgaagggccattttagcgacgatgttttaactttaaccggcgagtctcttgaaggctatcatagccttgaagaaaagttatcatgga 21681951  T
Q  315 tgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttggagaattggaagcattttgaaccagggcacatgactatt---------------------gt 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    | || || ||||||||||||||||| | ||                     ||    
T  21681952 tgttgttcgtggatggatgttctttgctacatatcttggagaaaaccatgctttatgaaccagggcacatgaatgttaaggttgatcaactggttcttgt 21682051  T
Q  394 gatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaaaagcatgacg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  21682052 gatgatggatgtgcttttgttggagaatcaacttccttatcaagtactcaagctattgtggaaagatagcaatgagagtgaattgataaaaattatgacg 21682151  T
Q  494 aattt 498  Q
    |||||    
T  21682152 aattt 21682156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 354
Target Start/End: Original strand, 15713625 - 15713964
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||| | || | ||| || |||||||| || |||||||||| || |||    
T  15713625 agatacaaagggtgccaggctatctcagaaaaagtaaaaattatgagatgcattacgcacctaagttggtttcaataggccctatccatcatgacaatac 15713724  T
Q  115 aaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgat 214  Q
    ||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||   | || ||||||||||||||||| |||    
T  15713725 aaatctaaagtcaggggagaagtacaagcttatgtgggcggcaaaatacatcaaaaacactggaagcattctagaggaactgcacaaaaagattgctgat 15713824  T
Q  215 aacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatgga 314  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15713825 aacattgatgaactgaagtgtcattttagtgacgatgttttaactttaaccggaaagtcacttcaaggatttggtagcctagaagaaaagctgtcatgga 15713924  T
Q  315 tgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttgga 354  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15713925 tgttgttcgtggatggatgctctttgctgcatatcttgga 15713964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 474
Target Start/End: Original strand, 21652071 - 21652542
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| || |||    
T  21652071 agatacaaagggtgccacagtatctcagaaatagaaacaattttgagaaacattacacccccaagtttgtttcaataggtcctatccatcatgacaatac 21652170  T
Q  115 aaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgat 214  Q
    |||| || |   ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||  |     ||||   | ||||  ||||||||||||||||||    
T  21652171 aaatatgaaaccaggagaggagtataagcttatgtgggcagcaaaatacatagaaaacaacggctttattctagaggatcgacacaaaaagattgccgat 21652270  T
Q  215 aacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatgga 314  Q
    || ||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  21652271 aaaattaacgaactaaagggtcattttagcgacgatgttttaactttaactggcaagtctcttgaaggctttgatagccttgaagaaaagttgtcgtgga 21652370  T
Q  315 tgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttggagaattggaagcattttgaaccagggcacatgactatt------------gtgatgatgga 402  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||   |  |||| |||||||||||| ||||             ||||||||||    
T  21652371 tgttgttcgtggatggatgttcgttgctgcatatcttggagaaagccaacgttgatgaagcagggcacatgaatattaaggttgatcaactgatgatgga 21652470  T
Q  403 tgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtga 474  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21652471 tgtgcttttgttggaaaatcaacttccttatcaagtactcaagcttttgtggaaagacgacaacgagagtga 21652542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 491
Target Start/End: Original strand, 21992175 - 21992681
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| | ||| | || |  || || ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  21992175 agatacaaagggtggcagagtatctcaaaaatagaaaagactttgagaagcactactcacccaaattggtgtcaataggtcctatccatcatggcaatac 21992274  T
Q  115 aa---------atctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaag 205  Q
    ||         ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  | | |   | ||     ||||| |||||||||    
T  21992275 aagcaatgcaaatctgaagttaggagagaagtacaagcttacgtgggcagcaaaatacatcgaaaatgcaggacttaatccatgcgatctacacaaaaag 21992374  T
Q  206 attgccgataacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagc 305  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21992375 attatcgataacattgatgaactgaagggtcattttagtgacgatgttttaactttagctggaaagtctcttgaaggctttggaagcctcgaagaaaagc 21992474  T
Q  306 tgtcatggatgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttggagaattggaagcattttgaaccagggcacatgactat--------------- 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    |||| |  |||||| |||||||||| |||                   
T  21992475 tgtcatggatgttgttcgtggatggatgttctttgttgtatatcttagagaaagccaagcttgatgaacctgggcacatgaatattaaagttgatcaact 21992574  T
Q  391 ------tgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaaa 484  Q
          ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21992575 ggttcttgtgatgatggatgtgcttctgttggagaatcaacttccttacgtagtactcaagctattgtggaaagataacaatgagagtgaattgataaaa 21992674  T
Q  485 agcatga 491  Q
    |||||||    
T  21992675 agcatga 21992681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 86 - 354
Target Start/End: Original strand, 21623266 - 21623534
Alignment:
Q  86 tcaataggtcccatccatcatggcagtacaaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattc 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||   |||    
T  21623266 tcaataggtcctatccatcatggcaatacaaatctgaagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcaaaatacatcaaaaacaccagaaaagttc 21623365  T
Q  186 agaaagatctgcacaaaaagattgccgataacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctt 285  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21623366 agaaggatatgcacaacaagattgctgataatattgatgaactgaagggtcattttagtgacgatgttttaactttaaccggaaagtctcttgaaggctt 21623465  T
Q  286 tggtagcctcgaagaaaagctgtcatggatgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttgga 354  Q
    ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21623466 tggtagcattaaagaaaagctgtcgtggatgttgttcgtggatggatgttctttgctgcatatcatgga 21623534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 483
Target Start/End: Original strand, 21646745 - 21647238
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||| | ||| || ||||||||||| |||||||||| || | |    
T  21646745 agatacaaagggtgccacagtatctcagaaatagaacaaaatttgaggagcattacacccccaagttggtgtcaataggtcctatccatcatgacaatcc 21646844  T
Q  115 aaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgat 214  Q
    ||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||  |||    
T  21646845 aaagctgaagataggagagaaatacaagcttatgtgggcagcaaaatacatcaaaaacacgggaagaattaagaaggatctacacaaaaagattgtagat 21646944  T
Q  215 aacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatgga 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  21646945 aacattgatgaactgaagggtcattttagcgacgacgttttaactttgaccggcaagtctcttaaaggcttccgtagccttgaagaaaagttgtcgtgga 21647044  T
Q  315 tgttgttcgtgg----atggatgttctttgttgcatatcttggagaattggaagcattttgaaccagggcacatgactat-------------------- 390  Q
    | ||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||||    |||| |  |||||||||||| |||| |||                        
T  21647045 tattgttcgtggatatatggatgttctttgctgcatatcttagagaaagccaagcttcatgaaccagggcagatgaatattaaggttgataaactggttc 21647144  T
Q  391 -tgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaa 483  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  21647145 ttgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactcccttacatagtactcaaactattattgaaagataacaatgagaatgaattgataaa 21647238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21808311 - 21807970
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||     
T  21808311 agatacaaagggtggctgagtatctcagaaatagaacaaatcttgagaagcattactcacccaagttggtatcaataggtcctatccatcatggaaatat 21808212  T
Q  115 aaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgat 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||  ||||||  |     ||||   | ||||| |||||||||||||| |||    
T  21808211 aaatctgaagttaggagagaagtacaagcttatgtggtctgcgaaatacatagaaaacagcggctttattctagaggatctacacaaaaagattgctgat 21808112  T
Q  215 aacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatgga 314  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21808111 aacatcgatgaactgaagggtcattttggcgacgatgttttaactttaaccggccagtctcttgaaggctttggtagccttgaagaaaagctgtcatgga 21808012  T
Q  315 tgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttggaga 356  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  21808011 tgttgttcgtggatggatgctctttgctttatatcttggaga 21807970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 21689415 - 21689757
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||| ||     
T  21689415 agatacaaagggtgcaagagtatctcagaaatagagaaaaatttgagaagcattagaccccgaggttgatgtcaaaaggtcctatccatcatggcaataa 21689514  T
Q  115 aaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgat 214  Q
    |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||    
T  21689515 atctctaaagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcaaaatacatcaaaaacactggaagcattcagagggatctacacaaaaacattgttgat 21689614  T
Q  215 aacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatgga 314  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||   || ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||    
T  21689615 aacattgataaactgaagggtcattttgatgacgatgttttaacattgaccggaaattctctcgaaggctttgatagtcttgaagaaaagctatcgtgga 21689714  T
Q  315 tgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttggagaa 357  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  21689715 tgttgttggtggatggatgctctttgctttatatcttggagaa 21689757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 21785408 - 21785750
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||| | || | ||| || ||||||||||| |||||||||| || | |    
T  21785408 agatacaaagggtgcaagagtatctaagaaataggaaaaactttgagaagcattactcacccaagttagtgtcaataggtcctatccatcatgacaatcc 21785507  T
Q  115 aaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgat 214  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || | || |  |   ||| ||     ||||| ||||||||||||||||||    
T  21785508 aaatctgaagacaggagagaagtacaagcttatgtgggccgcaaaatacctcgagaatataggccgcaatccacgcgatctacacaaaaagattgccgat 21785607  T
Q  215 aacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatgga 314  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21785608 aacattaatgaactgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggccagtctcttgaagactttggtagccttgaagaaaagctgtcgtgga 21785707  T
Q  315 tgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttggagaa 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21785708 tgttgtttgtggatggatgttctttgctacatatcttggagaa 21785750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 86 - 510
Target Start/End: Original strand, 21764135 - 21764559
Alignment:
Q  86 tcaataggtcccatccatcatggcagtacaaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattc 185  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| | |   | ||    
T  21764135 tcaataggtcctatccatcatgacagatcagatctgaagttaggagagaagtacaagcttaagtgggcagcagaatacatagaaaacaccgcacttaatc 21764234  T
Q  186 agaaagatctgcacaaaaagattgccgataacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctt 285  Q
       | || || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21764235 cagaggaactacaccaaaagattgctgataacatcgatgaactgaagggtcgttttagcgatgatgttttaactttaactggaaagtctcttgaaggctt 21764334  T
Q  286 tggtagcctcgaagaaaagctgtcatggatgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttggagaattgg---aagcattttgaaccagggcac 382  Q
    |  |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  ||   | | |  || |    || ||     
T  21764335 tcatagccttgaagaaaagttgtcgtggatgttgttcgtggatggatgctctttgctttatctcttggagaaagggcacatgaagattaaggttggtcaa 21764434  T
Q  383 atgactattgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataa 482  Q
     ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  21764435 ctggttcttgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaacttccttacgaagtactcaagctattgtggaaaaat---aacgagagtgaattgataa 21764531  T
Q  483 aaagcatgacgaattttcccaacgatct 510  Q
    || |||||| || |||||||||| ||||    
T  21764532 aatgcatgatgagttttcccaactatct 21764559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 498
Target Start/End: Original strand, 21771963 - 21772467
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | || | || ||| ||||||||||| || ||||||   |  ||    
T  21771963 agatacaaagggtgctaaagtctctcagaaatagaaaaaactttgagaagcattactcacccaagtgtgtgtcaataggtcctattcatcatcataacac 21772062  T
Q  115 aaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgat 214  Q
    |||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| |  | |  |||||   | ||||| |||||||||||||| |||    
T  21772063 aaatctgatattagcagagaagtacaaacttatgtgggcagcaaaatacatagaaaataacggatacattccagaggatctacacaaaaagattgctgat 21772162  T
Q  215 aacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatgga 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |   |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  21772163 aacattgatgaactgaagggtcattttgacgatgatgttttaacttcaaccagatggtctcttgcaggctttcgtagccttgaagaaaagttgtcgtgga 21772262  T
Q  315 tgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttggagaattggaagcattttgaaccagggcacatgactat---------------------tgt 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||| | |  ||||||| ||||||||| |||                     |||    
T  21772263 tgttgttcgtggatggatgttctttgctgtatatcttggagaaagcgaatcttaatgaaccatggcacatgaatattaaggttgatcaactggttcttgt 21772362  T
Q  394 gatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaaaagcatgacg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  21772363 gatgatggatgtgcttttgttggagaatcaacttccttatcaagtactcaagctattgtggaaagatgaagacgagagtggcttgatagaaagcatgatg 21772462  T
Q  494 aattt 498  Q
    |||||    
T  21772463 aattt 21772467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 21628127 - 21628469
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||| |||||||||| | || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21628127 agatacaaagggtggccgatcatctcagaaataaaaaagattttgggaagtattactcacccaagtttgtgtcaataggtcctatccatcatggcagtac 21628226  T
Q  115 aaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgat 214  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||| || |   ||||   | || || |||||||||||||| |||    
T  21628227 aaatctgaacataggagagaagtacaagcttgtgtgggcatcaaaatacatagaaaacattggacttattccagaggaactacacaaaaagattgctgat 21628326  T
Q  215 aacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatgga 314  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  21628327 aacattgatgaactgaagggtcgttttagcgacgatgttttaaatttaacgggaaactctcttcaaggctttggatgccttgaagaaaagctgtcgtgga 21628426  T
Q  315 tgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttggagaa 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  21628427 tgttgttcgtggatggatgctctttgctttatatcttggagaa 21628469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 354
Target Start/End: Original strand, 21704645 - 21704984
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||| | || | ||| || || |||||||| |||||||||| || | |    
T  21704645 agatacaaagggtgcaagagtatctcagaagtagaaaaaactttgagcagcattactcacccaagttagtgtcgataggtcctatccatcatgacaatcc 21704744  T
Q  115 aaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgat 214  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | |   ||||   | || || |||||||||||||| |||    
T  21704745 aactctgaagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcaaaatacatagaaaacaccggacttattccagaggaactacacaaaaagattgcagat 21704844  T
Q  215 aacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatgga 314  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||   |||| || ||||||||||| ||||    
T  21704845 aacattgatgaactgaagggtcgttttagcgatgatgttttaactctaaccggaaactctcttcaaggctttgagtgccttgatgaaaagctgtcgtgga 21704944  T
Q  315 tgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttgga 354  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21704945 tattgttcatggatggatgttctttgctccatatcttgga 21704984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 354
Target Start/End: Original strand, 21664100 - 21664442
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || | |||  | ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  21664100 agatacaaagggtgccacacaatctcagaaacagaaaaaactttgagaagtattactcacccaagttcctgtcaataggtcctatccatcatggcaatac 21664199  T
Q  115 aaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgat 214  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||   |  || ||     ||||| ||||||||||||   |||    
T  21664200 agatctgaagttaggagggaagtacaagcttatgtgggcagcaaaatacattgaaaatacaagactcaatccacgggatctacacaaaaagatttttgat 21664299  T
Q  215 aacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgt---tttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcat 311  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  21664300 aacatcgatgaactgaagggtcattttgacgatgatgtaattttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggaagccttgaagaaaagctgtcgt 21664399  T
Q  312 ggatgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttgga 354  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  21664400 ggatattgttcgtggatggatgctctttgctttatatcttgga 21664442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 356
Target Start/End: Original strand, 21714209 - 21714526
Alignment:
Q  39 tcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtacaaatctggagttaggagagaagta 138  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | || | |||||| ||| ||||||| |||||||||| || | |||||||| ||  ||||||||||||    
T  21714209 tcagaaatagaacaaattttgagaagcattactcacccaagtttgtgtcattaggtcctatccatcatgacaatccaaatctgaagaaaggagagaagta 21714308  T
Q  139 caagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgataacattgatgatctgaagggtcat 238  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||   |  |||||   | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21714309 caaacttatgtgggcagcaaaatacatagaaaacaccagacacattccagaggatctacacaaaaagattgcagataacattgatgaactgaagggtcat 21714408  T
Q  239 tttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatggatgttgttcgtggatggatgttctt 338  Q
    |||  | | ||||||||| ||| |||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21714409 tttgacaacgatgttttagcttcaaccagttggtctcttgaaggctttggtagccttgaagaaaagctatcgtggatgttgttcgtggatggatgttctt 21714508  T
Q  339 tgttgcatatcttggaga 356  Q
    || | |||||||||||||    
T  21714509 tgcttcatatcttggaga 21714526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 21725898 - 21726240
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | || | || ||| ||||||||||| || ||||||   |  ||    
T  21725898 agatacaaagggtgctaaagtctctcagaaatagaaaaaactttgagaagcattactcacccaagtgtgtgtcaataggtcctattcatcatcagaacac 21725997  T
Q  115 aaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgat 214  Q
    |||||||   |||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| | |  |||||   | ||||| |||||||||||||| |||    
T  21725998 aaatctgatattagcagagtagtacaaacttatgtgggcagcaaaatacatagaaaacaccggacacattccagaggatctacacaaaaagattgctgat 21726097  T
Q  215 aacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatgga 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||| |   |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21726098 aacattgatgaactgaagggtcattttgacgacgatgttttagcttcaaccagatggtctcttgcaggctttcgtagccttgaagaaaagctgtcgtgga 21726197  T
Q  315 tgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttggagaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21726198 tgttgttcgtggatggatgttctttgctgtatatcttggagaa 21726240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 354
Target Start/End: Original strand, 21745534 - 21745873
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| | || | ||| || ||| ||||||| |||||||||| || | |    
T  21745534 agatacaaagggtggtagaccatctcataaatagaacaaattttgagaagcattactcacccaagttggtgtcattaggtcctatccatcatgacaatcc 21745633  T
Q  115 aaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacactgaaagcattcagaaagatctgcacaaaaagattgccgat 214  Q
    ||||||  ||  ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| || | || || |    || ||   | |||||||||||||||||||  |||    
T  21745634 aaatctaaagacaggagaagagtataagcttatgtgggcagcaaaatacctcgagaatacaggccacaatccacacgatctgcacaaaaagattgttgat 21745733  T
Q  215 aacattgatgatctgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatgga 314  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||   |||| |||||||||||||| ||||    
T  21745734 aacattgatgaactgaagggtcgttttagcgacgatgttttaactttaactggaaattctcttcaaggctttgaatgccttgaagaaaagctgtcgtgga 21745833  T
Q  315 tgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatcttgga 354  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21745834 tgttattcgtagatggatgttctttgctccatatcttgga 21745873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 390 - 510
Target Start/End: Original strand, 21628526 - 21628646
Alignment:
Q  390 ttgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaaaagcat 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  21628526 ttgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaacttccttatgaagtactcaagctattgtggaaagataacaatgagaatgaattgataaaatgcat 21628625  T
Q  490 gacgaattttcccaacgatct 510  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  21628626 gacgagttttcccaactatct 21628646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 387 - 498
Target Start/End: Original strand, 21689808 - 21689919
Alignment:
Q  387 ctattgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaaaag 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21689808 ctattgtgatggtggatgtgcttttgttagagaatcaacttccttatgaagtactcgagctattgtggaaagataacaacaagagtgaattgataaaaag 21689907  T
Q  487 catgacgaattt 498  Q
    || |||||||||    
T  21689908 cacgacgaattt 21689919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 390 - 498
Target Start/End: Original strand, 21785804 - 21785912
Alignment:
Q  390 ttgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaaaagcat 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  21785804 ttgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaacttccttatgaagtcctcaaactattgtggaaagatagcgacgagagtgaattgataaaaagcat 21785903  T
Q  490 gacgaattt 498  Q
    || ||||||    
T  21785904 gaagaattt 21785912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 390 - 482
Target Start/End: Original strand, 15714015 - 15714107
Alignment:
Q  390 ttgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataa 482  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15714015 ttgtgataatggatgtgcttttgttggagaatcaacttccttatgaagtactcaagctattgtggaaagataacaacgagagtgagttgataa 15714107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 390 - 482
Target Start/End: Original strand, 21623591 - 21623683
Alignment:
Q  390 ttgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataa 482  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21623591 ttgtgatgattgatgtggttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagataacaacgagaatgaattgataa 21623683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 390 - 498
Target Start/End: Original strand, 21714581 - 21714689
Alignment:
Q  390 ttgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaaaagcat 489  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  21714581 ttgtaatgatggatgtgcttttgttggagaatcaacttccttatcaagtactcaagctattgtggaaagatgaagaccagagtggattgataaaaagcat 21714680  T
Q  490 gacgaattt 498  Q
    || ||||||    
T  21714681 gatgaattt 21714689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 390 - 498
Target Start/End: Original strand, 21726294 - 21726402
Alignment:
Q  390 ttgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaaaagcat 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  21726294 ttgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaacttccttatcaagtactcaagctattgtggacagatgaagacgagagtggattgatagaaagcat 21726393  T
Q  490 gacgaattt 498  Q
    || ||||||    
T  21726394 gatgaattt 21726402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 390 - 483
Target Start/End: Original strand, 21745924 - 21746017
Alignment:
Q  390 ttgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaa 483  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21745924 ttgtgatgatcgatgtacttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactctagctattgtgaaaagataacaacgagagtgaattgataaa 21746017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 390 - 498
Target Start/End: Original strand, 21664505 - 21664613
Alignment:
Q  390 ttgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaaaagcat 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||    
T  21664505 ttgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactaccttatcaagtactcaagctattgtggaaagatgaagacaagagtggattgatagaaagcat 21664604  T
Q  490 gacgaattt 498  Q
     | ||||||    
T  21664605 catgaattt 21664613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 400 - 505
Target Start/End: Original strand, 21705045 - 21705150
Alignment:
Q  400 ggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaaaagcatgacgaatttt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||    
T  21705045 ggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagcttttgtggaaagatgaagatgagagtggattaataaaaagcatgaggagtttt 21705144  T
Q  500 cccaac 505  Q
    | ||||    
T  21705145 cacaac 21705150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 400 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 21807902 - 21807797
Alignment:
Q  400 ggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaaaagcatgacgaatttt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  21807902 ggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttataaagtacttaagctattgtgggaagataacaatgagggtgaattgataaaaatcatgaggaatttc 21807803  T
Q  500 cccaac 505  Q
    ||||||    
T  21807802 cccaac 21807797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 21656895 - 21656969
Alignment:
Q  436 agtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaaaagcatgacgaattttcccaacgatct 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||    
T  21656895 agtactcaagctattgtggaaagatgacaacaagagtgaattgataaaaagcatgaggagttttcgcaaccatct 21656969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 228 - 358
Target Start/End: Original strand, 25588 - 25718
Alignment:
Q  228 tgaagggtcattttagcgatgatgttttaactttaaccggcaagtctcttgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatggatgttgttcgtgga 327  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25588 tgaagggtcattttagcgaggatgttttaactttaactaaaaagtctcttgaaggctttggtacccttgaagaaaagctgtcgttgatgttgttcgtgga 25687  T
Q  328 tggatgttctttgttgcatatcttggagaat 358  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25688 tggatgttctttgctacatatcttggagaat 25718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 390 - 498
Target Start/End: Original strand, 25771 - 25879
Alignment:
Q  390 ttgtgatgatggatgtgcttttgttggagaatcaactgccttatgaagtactcaagctattgtggaaagatgacaacgagagtgaattgataaaaagcat 489  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| |||||||    
T  25771 ttgtgatggtggatgtggttttgttggaaaatcaacttccttatgaagtactcaagctattgtggaaaaacgagaatgagagtgaattgatacaaagcat 25870  T
Q  490 gacgaattt 498  Q
    |||| ||||    
T  25871 gacggattt 25879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Original strand, 25312 - 25472
Alignment:
Q  15 agatacaaagggtggcagagtatctcagaaagagaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtac 114  Q
    ||||||||||||||||| | || | |||||||| |  ||||||   |||||| ||||  || | ||| || ||||||||||| |||||||||| || ||     
T  25312 agatacaaagggtggcatattaccgcagaaagataccaaatttgaggaagtactacaaacccaagttggtgtcaataggtcctatccatcatgacaataa 25411  T
Q  115 aaatctggagttaggagagaagtacaagcttatgtgggcagcagaatacatcaaaaacact 175  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25412 aaatctgaagttaggagagaagtacaagcttaagtgggcagcagaatacatagaaaacact 25472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18192123 - 18192049
Alignment:
Q  277 tgaaggctttggtagcctcgaagaaaagctgtcatggatgttgttcgtggatggatgttctttgttgcatatctt 351  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18192123 tgaaggctttgataacttggaagaaaagctatcatggatgttgtttgtggatggatgttctttgttgcgtatctt 18192049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18192346 - 18192233
Alignment:
Q  48 gaaaaaattttgagaagtattacaccccgaggtttgtatcaataggtcccatccatcatggcagtacaaatctggagttaggagagaagtacaagcttat 147  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | || |  || |||||||| ||||| |||||||||||  |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||       
T  18192346 gaaaagattttgagaagcattactcgcccaaattggtatcaatgggtcctatccatcatggtcgcccaaatttggagttatgagagaagtacaagctaca 18192247  T
Q  148 gtgggcagcagaat 161  Q
    |||||||||| |||    
T  18192246 gtgggcagcaaaat 18192233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University