View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8545_low_5 (Length: 253)

Name: NF8545_low_5
Description: NF8545
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8545_low_5
NF8545_low_5
[»] chr8 (71 HSPs)
chr8 (1-246)||(15046919-15047164)
chr8 (29-246)||(4808989-4809208)
chr8 (29-253)||(27746955-27747179)
chr8 (29-246)||(23851334-23851553)
chr8 (29-246)||(11464196-11464415)
chr8 (29-246)||(2655895-2656114)
chr8 (29-246)||(9619197-9619416)
chr8 (24-246)||(33298880-33299103)
chr8 (29-246)||(43889964-43890183)
chr8 (50-246)||(32724342-32724540)
chr8 (50-246)||(42447888-42448086)
chr8 (30-246)||(43192188-43192405)
chr8 (36-246)||(34611829-34612041)
chr8 (29-246)||(9498439-9498658)
chr8 (28-246)||(33896107-33896331)
chr8 (29-246)||(11196914-11197127)
chr8 (50-246)||(35580482-35580679)
chr8 (29-246)||(44099776-44099993)
chr8 (29-246)||(14906763-14906982)
chr8 (28-246)||(33342462-33342679)
chr8 (50-248)||(9072741-9072941)
chr8 (29-246)||(28239858-28240085)
chr8 (29-246)||(37565719-37565938)
chr8 (29-213)||(11725739-11725924)
chr8 (29-213)||(29777277-29777463)
chr8 (24-246)||(16794317-16794540)
chr8 (29-209)||(43135419-43135600)
chr8 (50-166)||(44578136-44578253)
chr8 (72-244)||(17949262-17949434)
chr8 (29-206)||(39152982-39153161)
chr8 (86-246)||(19876236-19876397)
chr8 (51-246)||(15597030-15597226)
chr8 (29-177)||(24186519-24186666)
chr8 (29-119)||(11267162-11267252)
chr8 (37-177)||(31013474-31013613)
chr8 (35-174)||(14544759-14544905)
chr8 (65-166)||(10377784-10377884)
chr8 (65-166)||(20553135-20553235)
chr8 (28-164)||(23230740-23230875)
chr8 (29-139)||(8441319-8441428)
chr8 (28-166)||(37971378-37971515)
chr8 (65-166)||(7883135-7883235)
chr8 (65-166)||(20559638-20559738)
chr8 (65-166)||(20571200-20571300)
chr8 (43-165)||(3673537-3673658)
chr8 (31-177)||(27110325-27110470)
chr8 (37-166)||(16928623-16928751)
chr8 (88-177)||(39657538-39657626)
chr8 (29-177)||(15344392-15344539)
chr8 (29-177)||(15433457-15433604)
chr8 (29-177)||(15524761-15524908)
chr8 (37-177)||(42046305-42046444)
chr8 (37-177)||(43833862-43834001)
chr8 (29-166)||(3240475-3240611)
chr8 (68-166)||(40211199-40211296)
chr8 (88-177)||(471083-471171)
chr8 (65-166)||(14585772-14585872)
chr8 (29-166)||(45445669-45445805)
chr8 (186-246)||(15889581-15889641)
chr8 (65-177)||(40618967-40619078)
chr8 (66-177)||(16247118-16247228)
chr8 (103-209)||(35812723-35812830)
chr8 (56-99)||(43431913-43431956)
chr8 (29-177)||(1236555-1236702)
chr8 (64-177)||(28086705-28086818)
chr8 (50-206)||(12184343-12184499)
chr8 (50-206)||(12428771-12428927)
chr8 (103-164)||(36533005-36533066)
chr8 (133-177)||(7198156-7198200)
chr8 (65-177)||(18890593-18890704)
chr8 (24-168)||(25190918-25191061)
[»] chr4 (79 HSPs)
chr4 (29-246)||(25273913-25274132)
chr4 (29-246)||(9528717-9528936)
chr4 (29-246)||(53616490-53616709)
chr4 (29-246)||(4643888-4644107)
chr4 (29-246)||(44947442-44947661)
chr4 (50-246)||(43153875-43154073)
chr4 (50-246)||(10389615-10389813)
chr4 (65-246)||(47417692-47417875)
chr4 (29-246)||(49410253-49410472)
chr4 (65-246)||(50766388-50766571)
chr4 (50-246)||(18138775-18138972)
chr4 (50-246)||(49125988-49126185)
chr4 (29-246)||(9283941-9284160)
chr4 (32-210)||(10359391-10359570)
chr4 (29-246)||(51318015-51318234)
chr4 (30-246)||(1531938-1532156)
chr4 (29-246)||(43444423-43444641)
chr4 (37-209)||(52097764-52097938)
chr4 (65-246)||(868192-868376)
chr4 (56-243)||(35964843-35965031)
chr4 (60-246)||(6972840-6973028)
chr4 (29-246)||(38706550-38706769)
chr4 (86-246)||(29965665-29965827)
chr4 (50-204)||(49680610-49680765)
chr4 (30-206)||(2115429-2115607)
chr4 (29-213)||(34024278-34024463)
chr4 (29-238)||(46990971-46991181)
chr4 (50-213)||(27593690-27593853)
chr4 (50-243)||(12265487-12265690)
chr4 (29-246)||(20569285-20569506)
chr4 (64-211)||(32952626-32952774)
chr4 (29-206)||(45227881-45228060)
chr4 (31-213)||(37188437-37188620)
chr4 (86-235)||(14183843-14183993)
chr4 (95-246)||(31381578-31381731)
chr4 (29-246)||(35261221-35261441)
chr4 (29-236)||(3336004-3336205)
chr4 (29-135)||(9645364-9645470)
chr4 (29-149)||(21090271-21090391)
chr4 (29-158)||(56199215-56199345)
chr4 (37-166)||(2520892-2521020)
chr4 (127-246)||(2624526-2624646)
chr4 (37-166)||(19853380-19853508)
chr4 (65-177)||(32766616-32766727)
chr4 (50-177)||(33921156-33921282)
chr4 (51-166)||(53811141-53811255)
chr4 (65-131)||(1931627-1931693)
chr4 (103-246)||(8009275-8009420)
chr4 (65-166)||(52944424-52944524)
chr4 (103-236)||(23100719-23100853)
chr4 (88-166)||(22611296-22611373)
chr4 (37-167)||(48257500-48257629)
chr4 (86-151)||(7273711-7273776)
chr4 (119-246)||(9645479-9645608)
chr4 (88-166)||(43510309-43510386)
chr4 (36-177)||(47320279-47320419)
chr4 (103-235)||(28834164-28834295)
chr4 (50-166)||(56040527-56040642)
chr4 (88-166)||(24098986-24099063)
chr4 (45-210)||(36184599-36184764)
chr4 (186-248)||(43853458-43853520)
chr4 (65-166)||(10496448-10496548)
chr4 (37-166)||(31891155-31891283)
chr4 (103-159)||(21662557-21662613)
chr4 (103-159)||(21671321-21671377)
chr4 (66-166)||(29120276-29120375)
chr4 (37-157)||(36194830-36194949)
chr4 (47-159)||(40068729-40068840)
chr4 (103-166)||(4142685-4142748)
chr4 (127-166)||(13634228-13634267)
chr4 (127-166)||(21686199-21686238)
chr4 (160-246)||(56194631-56194718)
chr4 (139-177)||(36204348-36204386)
chr4 (103-177)||(36700378-36700452)
chr4 (182-219)||(36204411-36204448)
chr4 (37-177)||(9048766-9048905)
chr4 (186-246)||(18048901-18048961)
chr4 (103-159)||(26123380-26123436)
chr4 (123-159)||(29474160-29474196)
[»] chr2 (83 HSPs)
chr2 (29-246)||(9986182-9986401)
chr2 (36-246)||(7015558-7015770)
chr2 (29-246)||(27248991-27249210)
chr2 (29-214)||(84021-84207)
chr2 (51-246)||(2808334-2808531)
chr2 (29-246)||(8805888-8806107)
chr2 (30-246)||(32678952-32679169)
chr2 (86-246)||(36234030-36234192)
chr2 (58-246)||(459144-459333)
chr2 (24-246)||(32913263-32913486)
chr2 (28-246)||(8971467-8971686)
chr2 (70-246)||(6173654-6173832)
chr2 (29-246)||(17319344-17319561)
chr2 (29-246)||(41431050-41431269)
chr2 (29-246)||(20046922-20047141)
chr2 (29-246)||(40659772-40659991)
chr2 (37-212)||(21570256-21570432)
chr2 (28-246)||(27477170-27477390)
chr2 (60-246)||(37613997-37614184)
chr2 (100-244)||(3269022-3269168)
chr2 (100-244)||(3269581-3269727)
chr2 (100-244)||(3270140-3270286)
chr2 (50-213)||(45128259-45128424)
chr2 (30-177)||(38575326-38575474)
chr2 (29-246)||(3725202-3725421)
chr2 (29-246)||(27949448-27949667)
chr2 (97-246)||(8308193-8308342)
chr2 (112-246)||(30420700-30420836)
chr2 (61-246)||(4192860-4193046)
chr2 (55-177)||(33229006-33229129)
chr2 (28-246)||(4228155-4228365)
chr2 (108-246)||(32197715-32197854)
chr2 (29-202)||(40625897-40626072)
chr2 (29-209)||(25087096-25087277)
chr2 (29-213)||(22421790-22421969)
chr2 (96-253)||(39641766-39641924)
chr2 (148-246)||(34599009-34599108)
chr2 (60-130)||(34600354-34600424)
chr2 (29-166)||(7646581-7646717)
chr2 (110-246)||(26025331-26025469)
chr2 (28-173)||(41712628-41712774)
chr2 (50-166)||(9169140-9169255)
chr2 (32-166)||(1421779-1421912)
chr2 (65-157)||(37876503-37876594)
chr2 (88-166)||(4778856-4778933)
chr2 (68-166)||(36943022-36943118)
chr2 (24-166)||(37994387-37994528)
chr2 (29-166)||(33585596-33585732)
chr2 (29-166)||(38445269-38445405)
chr2 (65-177)||(19062244-19062360)
chr2 (88-177)||(17994650-17994738)
chr2 (37-166)||(27097276-27097403)
chr2 (37-177)||(10237085-10237224)
chr2 (37-177)||(10929757-10929896)
chr2 (178-246)||(31580580-31580648)
chr2 (72-253)||(9374450-9374622)
chr2 (103-177)||(29173654-29173728)
chr2 (103-208)||(44881657-44881763)
chr2 (29-166)||(7677734-7677870)
chr2 (142-246)||(18113891-18113996)
chr2 (37-166)||(18763571-18763699)
chr2 (37-166)||(31788559-31788687)
chr2 (37-177)||(3309037-3309176)
chr2 (50-158)||(4904027-4904134)
chr2 (37-177)||(29279439-29279578)
chr2 (103-166)||(7448350-7448413)
chr2 (29-100)||(31580495-31580566)
chr2 (32-166)||(1415660-1415793)
chr2 (28-114)||(30399889-30399974)
chr2 (28-177)||(19028774-19028922)
chr2 (29-166)||(24461546-24461682)
chr2 (88-177)||(31128700-31128788)
chr2 (29-177)||(17249008-17249155)
chr2 (37-165)||(32190769-32190895)
chr2 (30-177)||(25508930-25509076)
chr2 (88-166)||(31210527-31210604)
chr2 (38-103)||(3268684-3268749)
chr2 (29-158)||(11985094-11985222)
chr2 (104-208)||(36323915-36324019)
chr2 (65-177)||(23933516-23933627)
chr2 (133-177)||(29574592-29574636)
chr2 (28-84)||(30420855-30420911)
chr2 (147-210)||(39285253-39285317)
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (29-246)||(16419176-16419395)
chr6 (29-246)||(33110629-33110848)
chr6 (35-246)||(12652962-12653175)
chr6 (29-253)||(8496978-8497205)
chr6 (60-246)||(7880973-7881161)
chr6 (29-246)||(4088478-4088697)
chr6 (29-246)||(4984407-4984626)
chr6 (29-246)||(25064254-25064473)
chr6 (29-246)||(10228697-10228916)
chr6 (29-246)||(17237126-17237344)
chr6 (29-246)||(35001608-35001827)
chr6 (60-246)||(7875915-7876103)
chr6 (65-246)||(4468576-4468759)
chr6 (29-246)||(8027958-8028177)
chr6 (29-244)||(33740418-33740635)
chr6 (28-246)||(8196246-8196466)
chr6 (29-246)||(23947157-23947377)
chr6 (50-246)||(33543485-33543679)
chr6 (29-177)||(16892656-16892805)
chr6 (29-172)||(17334846-17334990)
chr6 (97-246)||(12165858-12166008)
chr6 (30-246)||(25337588-25337801)
chr6 (29-246)||(28634953-28635180)
chr6 (29-136)||(12059613-12059720)
chr6 (41-213)||(1704004-1704176)
chr6 (69-177)||(7027951-7028060)
chr6 (29-158)||(30608375-30608503)
chr6 (30-177)||(7976048-7976194)
chr6 (86-216)||(4351902-4352025)
chr6 (37-166)||(33053036-33053164)
chr6 (65-135)||(34489352-34489421)
chr6 (68-177)||(23128701-23128809)
chr6 (29-166)||(29319737-29319874)
chr6 (50-177)||(29255327-29255453)
chr6 (70-136)||(20619597-20619663)
chr6 (65-166)||(606298-606398)
chr6 (35-177)||(546114-546255)
chr6 (67-177)||(30493615-30493724)
chr6 (182-248)||(31296817-31296883)
chr6 (88-177)||(1523491-1523579)
chr6 (50-166)||(3913455-3913570)
chr6 (57-177)||(8266718-8266837)
chr6 (103-177)||(25398651-25398725)
chr6 (65-166)||(67897-67997)
chr6 (65-166)||(12170562-12170662)
chr6 (88-161)||(31296919-31296991)
chr6 (37-177)||(14801910-14802049)
chr6 (186-246)||(26588503-26588563)
chr6 (103-166)||(31852126-31852189)
chr6 (187-246)||(34489268-34489327)
chr6 (88-166)||(127763-127840)
chr6 (139-177)||(1933661-1933699)
chr6 (88-166)||(34018654-34018731)
chr6 (37-166)||(30776757-30776885)
chr6 (194-246)||(17334796-17334848)
[»] chr1 (85 HSPs)
chr1 (35-244)||(50271986-50272197)
chr1 (65-246)||(39987411-39987592)
chr1 (29-246)||(5701281-5701500)
chr1 (29-246)||(7997811-7998030)
chr1 (29-246)||(40880853-40881071)
chr1 (29-246)||(35584462-35584677)
chr1 (37-253)||(18569159-18569376)
chr1 (28-246)||(50148392-50148612)
chr1 (29-246)||(19715735-19715954)
chr1 (29-246)||(45425906-45426125)
chr1 (29-246)||(51871885-51872104)
chr1 (50-246)||(28035161-28035359)
chr1 (51-246)||(5324420-5324617)
chr1 (32-235)||(7311949-7312153)
chr1 (29-246)||(25406124-25406343)
chr1 (29-253)||(9687045-9687270)
chr1 (29-213)||(50165939-50166125)
chr1 (29-246)||(38520375-38520590)
chr1 (36-246)||(30879098-30879309)
chr1 (29-246)||(9172512-9172731)
chr1 (29-246)||(9180494-9180713)
chr1 (29-246)||(7342744-7342963)
chr1 (29-246)||(33291258-33291477)
chr1 (29-246)||(51868485-51868704)
chr1 (30-246)||(39927396-39927613)
chr1 (50-253)||(48365627-48365831)
chr1 (56-214)||(30818218-30818378)
chr1 (29-214)||(20266356-20266543)
chr1 (50-238)||(40646700-40646894)
chr1 (29-213)||(45805669-45805854)
chr1 (101-246)||(31836829-31836975)
chr1 (29-245)||(41081544-41081762)
chr1 (28-246)||(9919411-9919630)
chr1 (63-213)||(14545573-14545724)
chr1 (29-244)||(34519156-34519369)
chr1 (50-246)||(3871430-3871628)
chr1 (29-246)||(11453957-11454178)
chr1 (29-177)||(19723405-19723554)
chr1 (29-130)||(11709547-11709648)
chr1 (29-246)||(27872760-27872978)
chr1 (29-177)||(32676975-32677119)
chr1 (50-177)||(33817029-33817157)
chr1 (50-177)||(33876499-33876627)
chr1 (29-166)||(47132999-47133135)
chr1 (28-137)||(31130432-31130541)
chr1 (28-111)||(48217596-48217679)
chr1 (37-166)||(14872735-14872863)
chr1 (29-166)||(37720009-37720145)
chr1 (37-177)||(36775578-36775717)
chr1 (37-166)||(7337531-7337659)
chr1 (50-130)||(27914965-27915045)
chr1 (50-166)||(32395094-32395209)
chr1 (50-166)||(35484272-35484387)
chr1 (28-115)||(31836989-31837076)
chr1 (35-166)||(32679007-32679137)
chr1 (88-166)||(21947537-21947614)
chr1 (88-166)||(45415654-45415731)
chr1 (65-166)||(5983932-5984032)
chr1 (28-177)||(13144671-13144819)
chr1 (37-166)||(48750281-48750409)
chr1 (37-177)||(39888267-39888406)
chr1 (29-177)||(44543357-44543504)
chr1 (29-177)||(44915724-44915871)
chr1 (30-177)||(19060994-19061140)
chr1 (126-177)||(24597280-24597331)
chr1 (103-162)||(35461982-35462041)
chr1 (37-202)||(31317795-31317960)
chr1 (103-212)||(31984208-31984320)
chr1 (88-167)||(4413209-4413287)
chr1 (29-159)||(5856012-5856141)
chr1 (182-244)||(16262864-16262926)
chr1 (108-166)||(26535445-26535503)
chr1 (37-163)||(34412960-34413085)
chr1 (35-140)||(6017652-6017756)
chr1 (29-78)||(27456667-27456716)
chr1 (178-211)||(33817172-33817205)
chr1 (178-211)||(33876642-33876675)
chr1 (65-166)||(49504491-49504591)
chr1 (142-213)||(4397025-4397097)
chr1 (30-166)||(7836657-7836792)
chr1 (186-246)||(12635171-12635231)
chr1 (65-177)||(24583035-24583146)
chr1 (103-159)||(32873797-32873853)
chr1 (123-159)||(44513834-44513870)
chr1 (186-246)||(44637443-44637503)
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (30-246)||(34881738-34881955)
chr5 (29-246)||(27266699-27266918)
chr5 (29-246)||(41184280-41184499)
chr5 (50-246)||(2057699-2057897)
chr5 (29-246)||(3271242-3271461)
chr5 (28-246)||(4954012-4954232)
chr5 (56-246)||(10649664-10649856)
chr5 (36-246)||(16981310-16981524)
chr5 (50-214)||(19259673-19259839)
chr5 (35-246)||(18677311-18677524)
chr5 (29-228)||(20257536-20257736)
chr5 (29-246)||(7246979-7247198)
chr5 (65-246)||(26578272-26578455)
chr5 (65-246)||(42579908-42580091)
chr5 (35-219)||(15570956-15571140)
chr5 (50-246)||(19280807-19281004)
chr5 (28-246)||(43148751-43148967)
chr5 (35-213)||(781442-781621)
chr5 (29-246)||(7241803-7242023)
chr5 (50-246)||(42886498-42886696)
chr5 (56-246)||(30298228-30298421)
chr5 (50-246)||(7150196-7150394)
chr5 (29-230)||(22978764-22978966)
chr5 (86-246)||(43261716-43261878)
chr5 (56-213)||(35475205-35475363)
chr5 (29-213)||(27751979-27752164)
chr5 (56-209)||(21060150-21060304)
chr5 (28-246)||(28235605-28235827)
chr5 (35-206)||(11768062-11768232)
chr5 (29-159)||(30298952-30299083)
chr5 (29-213)||(7612898-7613084)
chr5 (29-234)||(7886779-7886985)
chr5 (144-253)||(30371739-30371849)
chr5 (37-166)||(13007321-13007449)
chr5 (37-166)||(38597889-38598017)
chr5 (37-166)||(34945485-34945613)
chr5 (139-246)||(36344442-36344550)
chr5 (65-166)||(9113621-9113721)
chr5 (37-177)||(2979174-2979313)
chr5 (29-177)||(13422014-13422161)
chr5 (29-112)||(43008155-43008238)
chr5 (37-175)||(14211310-14211447)
chr5 (136-245)||(27576298-27576408)
chr5 (65-166)||(6012034-6012134)
chr5 (88-177)||(6216979-6217067)
chr5 (37-166)||(25980250-25980377)
chr5 (72-157)||(41418605-41418690)
chr5 (103-246)||(19100552-19100696)
chr5 (28-166)||(11976794-11976931)
chr5 (104-177)||(6445963-6446036)
chr5 (37-166)||(31391621-31391749)
chr5 (30-158)||(13468708-13468835)
chr5 (29-177)||(26877969-26878115)
chr5 (37-177)||(35920864-35921003)
chr5 (50-177)||(41630583-41630709)
chr5 (88-177)||(10722842-10722930)
chr5 (65-166)||(24229680-24229780)
chr5 (65-177)||(28540802-28540913)
chr5 (60-171)||(14082287-14082397)
chr5 (103-177)||(15571567-15571641)
chr5 (126-159)||(33486404-33486437)
chr5 (65-156)||(10332443-10332534)
chr5 (123-159)||(41554733-41554769)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (28-246)||(25631365-25631585)
chr3 (29-246)||(39917238-39917456)
chr3 (50-246)||(12116113-12116311)
chr3 (29-246)||(25162451-25162670)
chr3 (29-246)||(32607484-32607703)
chr3 (29-246)||(44907239-44907457)
chr3 (65-246)||(36734569-36734751)
chr3 (29-221)||(46178609-46178802)
chr3 (28-246)||(29503477-29503696)
chr3 (32-246)||(42719532-42719748)
chr3 (29-246)||(36906137-36906356)
chr3 (29-246)||(49552064-49552283)
chr3 (50-246)||(17237820-17238018)
chr3 (35-242)||(14464529-14464738)
chr3 (29-246)||(3848759-3848978)
chr3 (29-214)||(38854876-38855063)
chr3 (60-244)||(31794088-31794272)
chr3 (29-246)||(46934657-46934873)
chr3 (60-246)||(4178580-4178768)
chr3 (29-246)||(35499040-35499257)
chr3 (35-246)||(21488106-21488321)
chr3 (60-214)||(50611289-50611445)
chr3 (29-246)||(22803037-22803264)
chr3 (30-213)||(30648560-30648745)
chr3 (34-246)||(25849825-25850038)
chr3 (65-246)||(37169246-37169427)
chr3 (86-246)||(51202151-51202313)
chr3 (86-202)||(2342522-2342640)
chr3 (65-166)||(52923013-52923113)
chr3 (30-157)||(4711583-4711709)
chr3 (29-166)||(50194195-50194331)
chr3 (28-177)||(21916559-21916708)
chr3 (104-208)||(38440496-38440602)
chr3 (65-166)||(21431705-21431805)
chr3 (37-166)||(40487417-40487545)
chr3 (50-177)||(51923808-51923934)
chr3 (65-166)||(21533705-21533805)
chr3 (37-177)||(51303511-51303650)
chr3 (67-166)||(54149083-54149181)
chr3 (28-166)||(48650593-48650730)
chr3 (37-166)||(6954564-6954692)
chr3 (99-209)||(6910622-6910731)
chr3 (30-177)||(32701572-32701718)
chr3 (36-166)||(4821899-4822027)
chr3 (37-166)||(7448782-7448910)
chr3 (37-166)||(7456924-7457052)
chr3 (65-154)||(9998571-9998659)
chr3 (37-166)||(45568313-45568441)
chr3 (30-158)||(30293348-30293474)
chr3 (29-177)||(53807718-53807865)
chr3 (37-136)||(44959841-44959939)
chr3 (65-155)||(10108339-10108428)
chr3 (127-177)||(14859571-14859621)
chr3 (37-166)||(40556794-40556922)
chr3 (88-177)||(45424879-45424967)
chr3 (29-78)||(51628988-51629037)
chr3 (29-177)||(628783-628930)
chr3 (65-177)||(8914793-8914904)
chr3 (50-177)||(16235507-16235633)
chr3 (28-78)||(6903105-6903155)
chr3 (37-159)||(7546714-7546835)
chr3 (65-155)||(10233173-10233262)
chr3 (29-99)||(43017046-43017116)
chr3 (65-159)||(46304416-46304509)
chr3 (65-166)||(10229568-10229668)
chr3 (29-158)||(19619814-19619941)
chr3 (29-114)||(27856309-27856393)
chr3 (133-166)||(43016947-43016980)
chr3 (29-166)||(43488450-43488586)
chr3 (183-244)||(46322353-46322414)
chr3 (186-246)||(4396365-4396425)
chr3 (65-177)||(21313117-21313228)
chr3 (129-177)||(31271768-31271816)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (29-246)||(32684686-32684905)
chr7 (29-246)||(42311298-42311515)
chr7 (29-246)||(46822033-46822252)
chr7 (28-246)||(22927709-22927929)
chr7 (29-246)||(34773729-34773948)
chr7 (30-209)||(35261353-35261533)
chr7 (29-246)||(26492383-26492602)
chr7 (56-244)||(1448697-1448887)
chr7 (50-246)||(35496036-35496234)
chr7 (29-236)||(2843081-2843290)
chr7 (60-246)||(6558895-6559083)
chr7 (28-194)||(13592348-13592515)
chr7 (29-209)||(433531-433713)
chr7 (30-246)||(17222841-17223058)
chr7 (24-253)||(32521764-32521993)
chr7 (29-246)||(20116600-20116818)
chr7 (29-246)||(35667072-35667291)
chr7 (29-246)||(46339072-46339291)
chr7 (28-246)||(20083356-20083576)
chr7 (29-246)||(23786593-23786812)
chr7 (29-213)||(23085572-23085758)
chr7 (36-246)||(31235631-31235851)
chr7 (56-246)||(42066929-42067120)
chr7 (29-246)||(48207919-48208138)
chr7 (29-213)||(1485096-1485283)
chr7 (101-246)||(42408380-42408527)
chr7 (65-209)||(19560053-19560199)
chr7 (29-244)||(45198873-45199089)
chr7 (29-246)||(26583732-26583947)
chr7 (50-247)||(46818279-46818476)
chr7 (29-191)||(7640615-7640779)
chr7 (87-244)||(14627777-14627936)
chr7 (29-213)||(21266442-21266627)
chr7 (47-246)||(6002039-6002246)
chr7 (60-246)||(23425244-23425431)
chr7 (37-166)||(19296965-19297093)
chr7 (29-157)||(43369614-43369741)
chr7 (29-166)||(12141167-12141304)
chr7 (72-246)||(17611143-17611303)
chr7 (37-166)||(34899475-34899603)
chr7 (65-166)||(39171486-39171586)
chr7 (56-131)||(17499548-17499623)
chr7 (56-131)||(17553591-17553666)
chr7 (37-166)||(38798876-38799004)
chr7 (51-166)||(30756701-30756815)
chr7 (37-166)||(9450005-9450133)
chr7 (50-159)||(13796810-13796918)
chr7 (51-166)||(42978705-42978819)
chr7 (66-177)||(46700119-46700229)
chr7 (28-177)||(19404616-19404764)
chr7 (65-177)||(24069290-24069401)
chr7 (43-166)||(47590406-47590528)
chr7 (103-177)||(24350772-24350846)
chr7 (88-210)||(46244171-46244292)
chr7 (65-166)||(8001442-8001542)
chr7 (65-166)||(37837354-37837454)
chr7 (65-166)||(48316708-48316808)
chr7 (186-246)||(24069425-24069485)
chr7 (58-166)||(28044645-28044752)
chr7 (103-177)||(4999962-5000036)
chr7 (50-120)||(27341691-27341760)
chr7 (50-99)||(5348473-5348522)
chr7 (37-166)||(40993252-40993380)
chr7 (37-159)||(3267085-3267206)
chr7 (1-29)||(42978876-42978904)
chr7 (1-29)||(42979049-42979077)
[»] scaffold0495 (1 HSPs)
scaffold0495 (29-246)||(5416-5635)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (50-246)||(16181-16379)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (65-210)||(8745-8892)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (29-246)||(83276-83497)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (56-246)||(361666-361858)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (50-246)||(6323-6521)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (68-210)||(201252-201395)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-166)||(50869-51037)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (35-207)||(34628-34800)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (29-166)||(57948-58084)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (65-166)||(15585-15685)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (168-246)||(453950-454029)
scaffold0002 (85-137)||(454042-454094)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (28-246)||(6028-6260)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (88-166)||(32666-32743)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (88-177)||(92415-92503)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (81-177)||(1731-1826)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (65-156)||(65938-66028)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (37-166)||(1437-1565)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (103-157)||(31207-31261)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (88-162)||(93204-93277)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (193-246)||(20402-20455)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (37-157)||(1546-1665)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (123-159)||(35336-35372)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 71)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15047164 - 15046919
Alignment:
Q  1 caaaaacaaaacgatattcattcaaattgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15047164 caaaaacaaaacgatattcattcaaatcgtaaaagatgaatctgcgaacaaacttacaacattcaagttaatagcatataacggtataatgcctacaaaa 15047065  T
Q  101 atatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaaaatcgatttttcaatatgaatca 200  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15047064 atatatgataaaattaaagtaatcggaatacacatgcctctggatctgcaacgttgacgtccaaaacttttattggaaatcgatttttcaatatcaatca 15046965  T
Q  201 aatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| |||| |||||||| |||| ||||| |||| | ||||||||||    
T  15046964 aataaacatcgcaccaagacaggaaatcaaacagcaccgcacaaga 15046919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4809208 - 4808989
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4809208 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaa 4809109  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  4809108 tatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatccttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaa 4809009  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  4809008 tcaaacaacgccgcacaaga 4808989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 253
Target Start/End: Original strand, 27746955 - 27747179
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27746955 gtaaatgatgaatctgcaaataaatttacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgat-aaataaaagtgaccggaa 27747053  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaat 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27747054 tacccatgcatccggatctacaacgttgatgcccaaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaaaacaggaaat 27747153  T
Q  228 ccaacaacgccgcacaagatgccgaa 253  Q
    | ||||  | ||||||||||| ||||    
T  27747154 caaacactgtcgcacaagatgacgaa 27747179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 23851334 - 23851553
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  23851334 gtaaaagataaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagttaccgaaa 23851433  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  23851434 tatccattgcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 23851533  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  23851534 tcaaacaacgtcgcacaaga 23851553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11464415 - 11464196
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| | | || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11464415 gtaaaggatgaatctacgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaa 11464316  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||    
T  11464315 tatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagactagaaa 11464216  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  11464215 tcaaacaacgccgcacaaga 11464196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2656114 - 2655895
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2656114 gtaaatgatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaa 2656015  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  2656014 tatccattgcctccggatctgcgacgttgacacccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 2655915  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  2655914 tcaaacaacgctgcacaaga 2655895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 9619197 - 9619416
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9619197 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatacttacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaa 9619296  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  9619297 tatccattgcctccggatctgcaaagttgacgcccaaatctttgatttaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 9619396  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  9619397 tcaaacaacgccgcacaaga 9619416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33299103 - 33298880
Alignment:
Q  24 aaattgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 123  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33299103 aaattgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacggcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtgac 33299004  T
Q  124 cggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacag 222  Q
      |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||      
T  33299003 tagaatactcatgcatccgtatctgcaacgttgacgaccaaatctttaattgaataatcactctttcgatatgaatcaaatgaacaccgcagcaagacga 33298904  T
Q  223 aaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     ||||| |||||| || |||||||    
T  33298903 gaaatcaaacaacaccacacaaga 33298880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 43889964 - 43890183
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43889964 gtaaaggatgaatctgcaaacaaaatcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaa 43890063  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || || | |||    
T  43890064 tatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaaaatgaatcaaatgaacaccgtacgaagacgggaaa 43890163  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || || |||| |||||||||    
T  43890164 tcaaataacgtcgcacaaga 43890183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Original strand, 32724342 - 32724540
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  32724342 aaactcacaacatccaagttaatagtatataacgacataatgcctacaaaaatataagataagattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctg 32724441  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || | ||||| |||||||||||||||||    
T  32724442 caacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatatttcaatatgaatcaaatgaacactgcacgaagactggaaatcaaacaacgccgcacaaga 32724540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Original strand, 42447888 - 42448086
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| || | ||||||||    
T  42447888 aaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgtctggaatattcatggccttcggatctg 42447987  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||| |||||||||||    
T  42447988 caacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatatttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgaaaaatcaaacaatgccgcacaaga 42448086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 43192188 - 43192405
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43192188 taaaggatgaatctgcgaacaaactcagaacatccaagttaatagcatataacggcataatggatacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcggaat 43192287  T
Q  130 acccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatc 228  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  || || |||||||    
T  43192288 attcatgtctccggatctgcaacgttgacacccaaatatttgatcgaataatcgatctttcaaaatgaatcaaatgaacaccacaagaagacggaaaatc 43192387  T
Q  229 caacaacgccgcacaaga 246  Q
     |||||||||||||||||    
T  43192388 aaacaacgccgcacaaga 43192405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34612041 - 34611829
Alignment:
Q  36 atgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat 135  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34612041 atgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacaagataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccat 34611942  T
Q  136 -gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaaca 233  Q
     || |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |   || ||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||| ||||    
T  34611941 cgcctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaattacttatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgacgacggaaaatcaaaca 34611842  T
Q  234 acgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||||    
T  34611841 acgccgcacaaga 34611829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 9498439 - 9498658
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||  || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9498439 gtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataatggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgacaggaa 9498538  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  9498539 tatccattgccttcggatctacaacgttgtcgtccaaatctttgattgaacaatcgatcttttaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 9498638  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  9498639 tcaaacaaagccgcacaaga 9498658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33896331 - 33896107
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatat----gataaaattaaagtgac 123  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||    
T  33896331 tgtaaaggatgaatctgcgaaaaaactcacaacatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgatagataaaattaaagtcac 33896232  T
Q  124 cggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaataca 221  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||  || ||     
T  33896231 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaattggaataaaatgaacaccgcaagaagacg 33896132  T
Q  222 gaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | ||| | |||||||||||||||||    
T  33896131 ggaaaacaaacaacgccgcacaaga 33896107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11197127 - 11196914
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||| ||| || ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11197127 gtaaatgataaatctgtaaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatataataaaattaaagtgatcggaa 11197028  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaat 227  Q
    |    || ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||    
T  11197027 t----atccatccggatctgcaacgttgacgcccaaatcgttgattgaataatcga-tcttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacggaaaat 11196933  T
Q  228 ccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | |||||||||||||||||    
T  11196932 caaacaacgccgcacaaga 11196914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35580679 - 35580482
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35580679 aaactcactacatctaaattaatagcgtataatggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatatccatgcatccggatctgc 35580580  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||| | | | |||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  35580579 aacgttcatgcctaaatctttgagtgaataatcgatcattcaatatgaatcaaacgaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacaacgtcgcacaaga 35580482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 44099776 - 44099993
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  44099776 gtaaaggatgaatctgctaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtg--cggaa 44099873  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||  ||| || ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  || || | |||    
T  44099874 tattcatggcctccggatctgcaacgttcacgcccaactctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaaaaagacgggaaa 44099973  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  44099974 tcaaacaacgccgcacaaga 44099993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 14906763 - 14906982
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906763 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaggatccaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 14906862  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| || || | |||    
T  14906863 tatccattgcctccaaatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaacaatcgatcttttaatacgaatcaaatgaacatcgcacgaagacgggaaa 14906962  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  14906963 tcaaacaacgccgcacaaga 14906982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33342679 - 33342462
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  33342679 tgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcattcaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaatatatatgataaaattaaagtgacctga 33342580  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||    
T  33342579 atactcatgcctccagatctgcaacg-tgacgtccaattctttgattgaataattga-tcttcaatatgaatcaaataaacaccgcaacaatacgggaaa 33342482  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || || ||||||||| ||||    
T  33342481 tcaaaaaacgccgcataaga 33342462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9072941 - 9072741
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| || |||| |||||    
T  9072941 aaactcacagcatccaagttaatagcatataacggaataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtcatcggaatatccatggcctccgaatctg 9072842  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaagat 247  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || |  | ||| | ||||||||||||||||||    
T  9072841 caacgttgacatccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagatgggaaagcaaacaacgccgcacaagat 9072742  T
Q  248 g 248  Q
    |    
T  9072741 g 9072741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28240085 - 28239858
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||  || ||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28240085 gtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatctaagttaatagaatataacggcataatgcttacaaaaataaatgataaaattaaagtgaccggaa 28239986  T
Q  129 tacc---------catgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaat 218  Q
    ||||         ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28239985 tacccatgtcttccatgcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaataattgatctttcaatattaatcaaatgaacaccgcaacaat 28239886  T
Q  219 acagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||    |||| |||||||||||||||||    
T  28239885 acgaggaatcaaacaacgccgcacaaga 28239858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 37565719 - 37565938
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37565719 gtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaatcaaagtgaccggaa 37565818  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||  |   || |||||||||||||||||||||| |||||| |  |  |||||    
T  37565819 tatccatcgcattcggatctgcaacgttaacgcccaaatctttaattgaattacttatctttcaatatgaatcaaatgaacgccgcacgacgaaggaaaa 37565918  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  37565919 tcaaacaatgccgcacaaga 37565938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11725924 - 11725739
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||  || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11725924 gtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccggag 11725825  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11725824 tatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttaattgaataatcga-tcttcaatatgaatcagatgaacaccgca 11725739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29777463 - 29777277
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29777463 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctccaaaaatatatgataatattaaagtcaccggaa 29777364  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    || |||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29777363 tatccatggtctccggatctgcaatgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgca 29777277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16794540 - 16794317
Alignment:
Q  24 aaattgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 123  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  16794540 aaatagtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataccatataacgtcataatgtctacaaaaatatatgataaaattatatagac 16794441  T
Q  124 cggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacag 222  Q
    | |||||||||||| | ||  ||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  16794440 cagaatacccatgccttcgattctgcaacgttgatgttcaattctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgtaacaatacgg 16794341  T
Q  223 aaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     ||||| ||| |||  ||||||||    
T  16794340 gaaatcaaacgacgttgcacaaga 16794317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Original strand, 43135419 - 43135600
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43135419 gtaaatgatgaatttgcgaacatactcacaacatccaagttaataacatataacggcataatgcctacgaaaatatatgataaaattaaagtgaccagaa 43135518  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacac 209  Q
    ||  ||| || |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  43135519 tatacatggcttccggatctgaaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcga-tcttcactatgaatcagatgaacac 43135600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44578253 - 44578136
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg-catccggatctg 148  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  44578253 aaacttacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgtcattcggatctg 44578154  T
Q  149 caacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  44578153 caacgttgacgcccaaat 44578136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17949434 - 17949262
Alignment:
Q  72 tagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatattt 170  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| | |    
T  17949434 tagcatataacagcataatgcctacaaa--tatatgataaaattaaagtgaccgtaatatccatggcctccggatctggaacgttgacgcccaaatctct 17949337  T
Q  171 gattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaa 244  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| || || | ||||| |||||||||||||||    
T  17949336 gattgaataatcgatctttcaatatgaataaaatgaacaccacacgaagacggcaaatcaaacaacgccgcacaa 17949262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 39152982 - 39153161
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaa-atatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||   ||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39152982 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcttaacatctaagttaatagcacataacaacataatgcctacaaaaaatatatgataaaattaaagtgatcgga 39153081  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaa 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||| |||||| |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  39153082 atacccatgcctccggatctgcaacgctgacacccaaatttttaattgaataatcaatctttcaatgtgaatcaaatgaa 39153161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19876397 - 19876236
Alignment:
Q  86 ataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcga 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||||    
T  19876397 ataatgcctacaaaaatatatgatcaaattaaagtgaccggaatatccatggtctccggatctgcaacgttcaggcccaaatctttgattgaataatcga 19876298  T
Q  184 tttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||  || || |  |||| |||||||||||||||||    
T  19876297 -tcttcaatatgaatcaaatgaacaccacaagaagacggggaatcaaacaacgccgcacaaga 19876236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 246
Target Start/End: Original strand, 15597030 - 15597226
Alignment:
Q  51 aacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgca 150  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | |||  |  |||||| ||    
T  15597030 aacttacaacatccgagttaatagcatatatcgacataatgcatacaaaagtatatgagaaaattaaagtgaccgaaatatctatgactatggatctaca 15597129  T
Q  151 acgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||  ||||| || ||||||| || ||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||| | ||| ||| |||||||    
T  15597130 acgttgacgctcaaatcttcgattgaataaccgatcgtttaatatgaatcaaatgaacaccgtaacaaaacggaaaatcaaccaaggcctcacaaga 15597226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 24186519 - 24186666
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || | ||    
T  24186519 gtaaaagatgaatctgctaacaaactcataacacctaagttaatagtatacgacggcaaaatgcctataaata-atatgataaaatttaagtcactgaaa 24186617  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  24186618 tacccatgctttcggatctgcaacgttgacgcccaaattattgattgaa 24186666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 11267252 - 11267162
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaag 119  Q
    ||||| ||||||  ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11267252 gtaaaggatgaaactgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaag 11267162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 31013474 - 31013613
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| || | ||||| ||||    
T  31013474 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcactgaaatacacatg 31013572  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31013573 cttccgaatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 31013613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 174
Target Start/End: Original strand, 14544759 - 14544905
Alignment:
Q  35 gatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaa------aaata-tatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |  |||| | |||||||||||      ||||| |||||||||||| |||| |||| |    
T  14544759 gatgaatctgcaaacaaactcacaccatccaagttaatagcaaacaacggcaaaatgcctacaagactacaaataatatgataaaatttaagtcaccgaa 14544858  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgatt 174  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14544859 attcccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaataattgatt 14544905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10377884 - 10377784
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10377884 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcgccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgatgtccaa 10377786  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  10377785 at 10377784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 20553135 - 20553235
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20553135 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 20553233  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  20553234 at 20553235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23230875 - 23230740
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| |    
T  23230875 tgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaa 23230777  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23230776 atacccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaa 23230740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 8441428 - 8441319
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||  ||| || ||| ||| |||| | |||||||||||||||||| | |||||    
T  8441428 gtaaaagatgaatttgcaaataaactcatatcatctaaattaatagcatacaacgataaaatacctgcaaata-atatgataaaattaaagttatcggaa 8441330  T
Q  129 tacccatgcat 139  Q
    ||  |||||||    
T  8441329 tattcatgcat 8441319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 37971515 - 37971378
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | || ||||||||   |||| |||| |    
T  37971515 tgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atgtgataaaacctaagtcaccgaa 37971417  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37971416 atactcatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 37971378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 7883135 - 7883235
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    |||||||||| |||  |||| | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7883135 aagttaataggatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgctgacgtccaa 7883233  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  7883234 at 7883235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 20559638 - 20559738
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||| ||||| | |||||||||||   |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20559638 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcccacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 20559736  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  20559737 at 20559738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 20571200 - 20571300
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||| ||||| | |||||||||||   |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20571200 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcccacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 20571298  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  20571299 at 20571300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3673658 - 3673537
Alignment:
Q  43 tgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccg 142  Q
    |||||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||  |||| | |||||||||||| | ||||||| ||| | |||| || | ||||| ||||| ||||    
T  3673658 tgcaaacaaactcacagcatccaagttaataggatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgattaaacttaagtcactgaaatactcatgcttccg 3673560  T
Q  143 gatctgcaacgttgacgtccaaa 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  3673559 gatctgcaacgttgacgcccaaa 3673537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 177
Target Start/End: Original strand, 27110325 - 27110470
Alignment:
Q  31 aaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaata 130  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  ||| || |||| ||||||| | ||||||||||||  |||| ||   ||||    
T  27110325 aaaagatgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgataaaatgtctacaaata-atatgataaaatctaagtcactaaaata 27110423  T
Q  131 cccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||    
T  27110424 cacatgcttccagatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaa 27110470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 16928623 - 16928751
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  | || | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| |||||||| |    
T  16928623 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccacg 16928721  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16928722 ctttcggatctgcaacgttgatgtccaaat 16928751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39657626 - 39657538
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  39657626 aatgcctacaaata-atatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 39657538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15344539 - 15344392
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| || | ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| | |||||||| |||  || | ||| |||    
T  15344539 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgatataatctaaatcaccagaa 15344441  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15344440 tactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 15344392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15433604 - 15433457
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| || | ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| | |||||||| |||  || | ||| |||    
T  15433604 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgatataatctaaatcaccagaa 15433506  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15433505 tactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 15433457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15524908 - 15524761
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| || | ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| | |||||||| |||  || | ||| |||    
T  15524908 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgatataatctaaatcaccagaa 15524810  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15524809 tactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 15524761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 42046444 - 42046305
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | |||||||||||||| || |  | |||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||| |||||||||||    
T  42046444 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacgatgtcaaaatgcctacaaata-atatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatg 42046346  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    | || ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||    
T  42046345 cttctggatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 42046305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 43833862 - 43834001
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||||||   || | ||| |||||| ||||    
T  43833862 tgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaaactaaatcaccagaatactcatg 43833960  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  43833961 cttctagatctgcaacgttgacgtctaaatcattgattgaa 43834001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3240611 - 3240475
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctac-aaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| | |||||||   |||| | ||| ||    
T  3240611 gtaaaggatgaatctgcgaataaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatg-ctacaaaaaaaaaatgataattctaaa-tcaccaga 3240514  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||| | || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  3240513 atacccatacttctggatctgcaacattggcgtccaaat 3240475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 166
Target Start/End: Original strand, 40211199 - 40211296
Alignment:
Q  68 ttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||  |||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  40211199 ttaatagcatacaacggcataatgcttacaaata-atatgataaaatccaagtcaacgaaatactcatgcttccggatctacaacgttgacgcccaaat 40211296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 177
Target Start/End: Original strand, 471083 - 471171
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  || | | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||    
T  471083 aatgcctacaaata-atatgataaaatctaaatcatcagaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgcacaaatcattgattgaa 471171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14585872 - 14585772
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | || ||||||||| | ||||||| ||||  || | ||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14585872 aagttaatagcatacaacggcaaaacgcctacaaata-atatgatgaaatctaaatcaccaggatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaa 14585774  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  14585773 at 14585772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Original strand, 45445669 - 45445805
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||   | |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||  ||    
T  45445669 gtaaaaggtgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacaacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccaaaa 45445767  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | | ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  45445768 ttcacatgcttccggattttcaacgttgacgcccaaat 45445805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15889641 - 15889581
Alignment:
Q  186 tttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | | |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  15889641 tttcaatatgaatcaaatgaacatcgcaaccagaaggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 15889581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Original strand, 40618967 - 40619078
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | ||||| |||| | | ||||||||||||| ||||   || ||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  40618967 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacacata-atatgataaaatttaagtctgcgaaatactcatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaa 40619065  T
Q  165 atatttgattgaa 177  Q
    ||  |||||||||    
T  40619066 attattgattgaa 40619078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 177
Target Start/End: Original strand, 16247118 - 16247228
Alignment:
Q  66 agttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaa 165  Q
    |||||||||||||  |||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||  |||| | || ||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||    
T  16247118 agttaatagcatacaacggcaaaatgccttcaaata-atatgatcaaatctaagtcagcgaaatacccatgcttccggatctgcaacattgatgcccaaa 16247216  T
Q  166 tatttgattgaa 177  Q
    |  |||||||||    
T  16247217 tcattgattgaa 16247228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35812830 - 35812723
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaa 201  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||| ||||  |  | |||| ||||||| ||||||||||  || |||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  35812830 atatgataaaattaaagtcactgaaatactcatgtctttgtatcttcaacgttaacgtccaaatcattaattgaataaccgatctttcaatatgaatcaa 35812731  T
Q  202 atgaacac 209  Q
    || |||||    
T  35812730 ataaacac 35812723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 43431956 - 43431913
Alignment:
Q  56 acaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  43431956 acaacatccaagttaatagcatatgacggtaaaatgcttacaaa 43431913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 1236555 - 1236702
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaata-tatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| || | ||||||||||||||  |||| | ||||||||  |||||| ||||||| |||  || | ||| ||    
T  1236555 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgccta--aaaatagtatgatataatctaaatcaccaga 1236652  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||| | ||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  1236653 atactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccagatcattgattgaa 1236702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 177
Target Start/End: Original strand, 28086705 - 28086818
Alignment:
Q  64 taagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaat-taaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtcc 162  Q
    |||||||||||||||  |||  | |||||||||||| | |||||||||||| |||| | || | |||||| |||  | |||||||||||||||||| |||    
T  28086705 taagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaaaatcactgaaataccaatgtttacggatctgcaacgttgacttcc 28086803  T
Q  163 aaatatttgattgaa 177  Q
    ||||  |||||||||    
T  28086804 aaatcattgattgaa 28086818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12184499 - 12184343
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||||  || | | ||| |||||||| | |||||||||||||||| || || ||||||  |||| |||| ||| ||    
T  12184499 aaactcacatcatccaagtcaatagcatacaacagcaaaatacctacaaata-atatgataaaattaaaatgtccagaatacatatgcctccgaatcagc 12184401  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaa 206  Q
    |||| ||||| ||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||  || ||||||||    
T  12184400 aacggtgacgcccaaatcattgatggaatagtcgatttttcaatagaaaccaaatgaa 12184343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12428927 - 12428771
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||||  || | | ||| |||||||| | |||||||||||||||| || || ||||||  |||| |||| ||| ||    
T  12428927 aaactcacatcatccaagtcaatagcatacaacagcaaaatacctacaaata-atatgataaaattaaaatgtccagaatacatatgcctccgaatcagc 12428829  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaa 206  Q
    |||| ||||| ||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||  || ||||||||    
T  12428828 aacggtgacgcccaaatcattgatggaatagtcgatttttcaatagaaaccaaatgaa 12428771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 36533066 - 36533005
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||  || ||||||||| ||||| ||||||    
T  36533066 atatgataaaattaaagtgacatgaatgcccatgccaccagatctgcaatgttgatgtccaa 36533005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 177
Target Start/End: Original strand, 7198156 - 7198200
Alignment:
Q  133 catgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  7198156 catgcttccggatctgcaacgttgacatccaaatcattgattgaa 7198200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Original strand, 18890593 - 18890704
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| | ||||||||||||  || | |||  |||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  18890593 aagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaaatcaccataatacctatgtttctggatctgcaacgttgacgcccaa 18890691  T
Q  165 atatttgattgaa 177  Q
    ||  |||||||||    
T  18890692 atcattgattgaa 18890704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 168
Target Start/End: Original strand, 25190918 - 25191061
Alignment:
Q  24 aaattgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 123  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| || ||||| ||| || | ||||||||||||||  |  | | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |     
T  25190918 aaatcgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaatagaaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcat 25191016  T
Q  124 cggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatat 168  Q
    || ||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25191017 cgcaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatat 25191061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 79)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25274132 - 25273913
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25274132 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 25274033  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  25274032 tatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatttttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 25273933  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  25273932 tcaaacaacgccgcacaaga 25273913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 9528717 - 9528936
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9528717 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacattcaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 9528816  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || | |||    
T  9528817 tatccatgacctccagatctgcaacgttgacggccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacatcgcacgaagacgggaaa 9528916  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  9528917 tcaaacaacgccgcacaaga 9528936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 53616490 - 53616709
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  53616490 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatataatgaaattaaagtgaccggaa 53616589  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  53616590 tatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 53616689  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  53616690 tcaaacaacgccgcacaaga 53616709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4644107 - 4643888
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || || || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4644107 gtaaaggatgaatctgcgaacaagctcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaataatatatgataaaattaaattgaccggaa 4644008  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||  |||| | |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  4644007 tattcatgacctccggatctgcaactttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaa 4643908  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  4643907 tcaaacaacgccgcacaaga 4643888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44947661 - 44947442
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44947661 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataacatataacggcacaatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 44947562  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || || | |||    
T  44947561 tatccatggccttcggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatattaatcaaatgaacaccacacgaagacgggaaa 44947462  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  44947461 tcaaacaacgccgcacaaga 44947442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Original strand, 43153875 - 43154073
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  43153875 aaactcacaacatccaagttaacagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctg 43153974  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||||||||| |||||||    
T  43153975 taacgttgacgctcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccacacaaga 43154073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Original strand, 10389615 - 10389813
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||    
T  10389615 aaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatggcctccggatctg 10389714  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  10389715 caacgttgacgctcaaatcgttgattgaataatcgatatttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 10389813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47417875 - 47417692
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtcca 163  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  47417875 aagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaatggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgccca 47417776  T
Q  164 aatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||    
T  47417775 aatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaaga 47417692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 49410472 - 49410253
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| |||||||  || || ||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49410472 gtaaaggatgaatcagcgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgacaggaa 49410373  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  49410372 tattcacggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 49410273  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  49410272 tcaaacaacgctgcacaaga 49410253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 246
Target Start/End: Original strand, 50766388 - 50766571
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtcca 163  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  50766388 aagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgctca 50766487  T
Q  164 aatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||    
T  50766488 aatctttgattgaacaatagatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaaga 50766571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Original strand, 18138775 - 18138972
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  || |||||||    
T  18138775 aaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgactacaaaaatatatgataaaatttaagtgatcggaataccaatgcccccagatctgc 18138874  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| ||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  18138875 aacgttgacgcccaaatatgtgattgaataatcgatctttcaatagaaatcaaatgaacactgcaacaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 18138972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Original strand, 49125988 - 49126185
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  || |||||||    
T  49125988 aaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgactacaaaaatatatgataaaatttaagtgatcggaataccaatgcccccagatctgc 49126087  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| ||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  49126088 aacgttgacgcccaaatatgtgattgaataatcgatctttcaatagaaatcaaatgaacactgcaacaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 49126185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9284160 - 9283941
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||||||||| | | || ||||| |||||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  9284160 gtaaaagatgaatctacgaacaaactcacaacatccatgataatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgactgaaa 9284061  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||  || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  9284060 tattcattgcctccagatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 9283961  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  9283960 tcaaacaacgccacacaaga 9283941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Original strand, 10359391 - 10359570
Alignment:
Q  32 aaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatac 131  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  10359391 aaagatgaatttgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaaataaagtgactggaatat 10359490  T
Q  132 ccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacacc 210  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10359491 ccatgcctcaagatctgcaacgttgatgcccaaatcttttattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacacc 10359570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 51318234 - 51318015
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||  || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51318234 gtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 51318135  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||  || || | |||    
T  51318134 tatccatgacctccggatctgcaacgttgacgcccaaattgttgattgaacaatcaatctttcaatatgaatcaaattaacaccgcaagaagacgggaaa 51318035  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  51318034 tcaaacaatgccgcacaaga 51318015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1532156 - 1531938
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| || || || |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  1532156 taaaggatgaatctgcgaacaagctcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtgtccagaat 1532057  T
Q  130 acccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaat 227  Q
    | ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || |||| ||||    
T  1532056 atccatgacctccggttctgcaacgttgacgcccaaatttttgattgaataattgatctttcaacatgaatcaaataaacaccgcacgaagacaggaaat 1531957  T
Q  228 ccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  1531956 caaacaacgccacacaaga 1531938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43444641 - 43444423
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||  || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43444641 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcattcaaattaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaa 43444542  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaat 227  Q
    ||  |||     ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||    
T  43444541 tattcattgtctcggatctgcaacgttgacgcccatatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgtagacggaaaat 43444442  T
Q  228 ccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | |||||||||||||||||    
T  43444441 caaacaacgccgcacaaga 43444423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 209
Target Start/End: Original strand, 52097764 - 52097938
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52097764 tgaatatgcgaataaactcacaacatccaagttaataccatataacgtcataatgcctacaaagatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatg 52097863  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgac-gtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacac 209  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52097864 catccagatctgcaacgttgacggcccaaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacac 52097938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 868376 - 868192
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctac-aaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtcc 162  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| || |||    
T  868376 aagttaatagcatataacggcataatgcctaccaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctacaacgttcacatcc 868277  T
Q  163 aaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||| |||||||||||||||||    
T  868276 aaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaaga 868192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 243
Target Start/End: Original strand, 35964843 - 35965031
Alignment:
Q  56 acaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgtt 155  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35964843 acaacatccaagttaatagcatataacaacataattcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactgaaatactcatgcctccggatctgcaacgtt 35964942  T
Q  156 gacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcaca 243  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  || || | ||||| ||||||||| ||||    
T  35964943 gacgtccaaatctttgattgaataatcgatcttttaatatgaatcaaatgaacaccacaataagacgggaaatcaaacaacgccacaca 35965031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6973028 - 6972840
Alignment:
Q  60 catctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgac 158  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  6973028 catccaagttaatagcatataacggcataatacctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgac 6972929  T
Q  159 gtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | |||||  |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||  || |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  6972928 gcccaaacctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacactgcaagaagacaggaaagcaaacaacgccgcacaaga 6972840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 38706550 - 38706769
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38706550 gtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgaaa 38706649  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || ||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| || || | |||    
T  38706650 tatccatggcctccggatttgcaacgttgatgcccaaatcttcgattgaataatcgatctttcaatataaatcaaattaacaccgcacgaagacgggaaa 38706749  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |  |||||||| ||||||||    
T  38706750 tgaaacaacgctgcacaaga 38706769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 86 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29965827 - 29965665
Alignment:
Q  86 ataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcga 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||| |    
T  29965827 ataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattacctccggatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaacaatcaa 29965728  T
Q  184 tttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||    
T  29965727 tctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaaga 29965665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 49680765 - 49680610
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  49680765 aaactcacaacattcaagttaataacatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccgaaatatcattgcatccggatctgc 49680666  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatg 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  49680665 aacgttgacgcccaaatatttgattgaacaatctatctttcaatatgaatcaaatg 49680610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Original strand, 2115429 - 2115607
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  2115429 taaaggatgaatctgcgaacaaactcacagtatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgactggaat 2115528  T
Q  130 accca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaa 206  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2115529 atccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatttttgattgaacaatcgatctttcaatatgaattaaatgaa 2115607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Original strand, 34024278 - 34024463
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34024278 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacaacataatgcttacaaaaatatatgataaaattaaaatgaccggaa 34024377  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34024378 tatccatggcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatcgttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaa-gaacaccgca 34024463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 238
Target Start/End: Original strand, 46990971 - 46991181
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||  ||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  46990971 gtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacattcaagttaacagcatagaacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcggga 46991070  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaat 227  Q
    |||  |||  ||  ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||    
T  46991071 tacatatgtctctagatctgcaacgttgacacccaaatctttgattgaataatcgatatttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagatgggaaat 46991170  T
Q  228 ccaacaacgcc 238  Q
    | |||||||||    
T  46991171 caaacaacgcc 46991181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Original strand, 27593690 - 27593853
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||    
T  27593690 aaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataattcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgacaggaatactcatggctccagatctgc 27593789  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    || |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  27593790 aatgttgac-tccaaatcttttattgaataatcgatctttcaatatgaattaaataaacatcgca 27593853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12265690 - 12265487
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacc---------catgcatc 140  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||         ||||| ||    
T  12265690 aaactcacaacatcaaagttaatagcatataacggcataatgcctaaaaaaatatatgataaaattaaagtgattggaatacccatgtcttccatgcctc 12265591  T
Q  141 cggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccg 239  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||   ||||| ||||||||||    
T  12265590 cggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaagtgaacaccacaacgatacgagaaatcaaacaacgccg 12265491  T
Q  240 caca 243  Q
    ||||    
T  12265490 caca 12265487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20569506 - 20569285
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatat--gataaaattaaagtgaccgg 126  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  20569506 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacattatccaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatatgatgaaattaaagtgaccgg 20569407  T
Q  127 aatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaa 224  Q
    |||| |||| || |  |||| ||||||||||||  | |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  20569406 aatatccattgcctttggatttgcaacgttgacaccaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaa 20569307  T
Q  225 aatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||| |||||| ||||| ||||    
T  20569306 aatcaaacaaccccgcagaaga 20569285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 211
Target Start/End: Original strand, 32952626 - 32952774
Alignment:
Q  64 taagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtcca 163  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||  ||    
T  32952626 taagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatataagataaaattaaattgaccggaatatccatgactccggacctgcaacattgacgctca 32952725  T
Q  164 aatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccg 211  Q
    ||| |||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32952726 aatctttgattgaataatcgtattttcaatatgaattaaatgaacaccg 32952774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 45227881 - 45228060
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| | | || ||||| |||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45227881 gtaaaggatgaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaataacatataaccgcataatgcccacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 45227980  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaa 206  Q
    ||  ||| |  |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  45227981 tattcatggtctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatgtaaatcaaatgaa 45228060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 213
Target Start/End: Original strand, 37188437 - 37188620
Alignment:
Q  31 aaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaata 130  Q
    ||||||| ||| ||| || | ||| ||| |||| ||||||||||||||| | |  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37188437 aaaagataaatctgcgaacacactcacagcatccaagttaatagcatataatgacacaatgcctacaaaattatatgataaaattaaagtgacaggaata 37188536  T
Q  131 cccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37188537 tccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcga-tcttcaaaatgaatcagatgaacaccgca 37188620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14183993 - 14183843
Alignment:
Q  86 ataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgca-tccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaaaa-tcga 183  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||| | ||||    
T  14183993 ataatgcctacaaaaa-atttgataaaattaaagtgaccggaatatccatggtctccggttctgcaacgttgacgccaaaatctttgattgaatagtcga 14183895  T
Q  184 tttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaac 235  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  14183894 tctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcatgaagacagaaaatcaaacaac 14183843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 246
Target Start/End: Original strand, 31381578 - 31381731
Alignment:
Q  95 acaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaat 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||    
T  31381578 acaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggagtattcatgacctccgaatttgcaatgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatcttttaat 31381677  T
Q  193 atgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  31381678 atgaatcaaattaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgctgcacaaga 31381731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35261441 - 35261221
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |  | |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  35261441 gtaaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataagtgcataatgtctacaaacatatctgataaaattaaaatgaccgaaa 35261342  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-----aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacaga 223  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||     | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  35261341 ta-ccatgtctccggatctgcaacgttga-aaccaattctttgattgaatgaatagttgatcttttaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgga 35261244  T
Q  224 aaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  35261243 aaatcaaacaacgccgcagaaga 35261221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 236
Target Start/End: Original strand, 3336004 - 3336205
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| | |||||  |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||     
T  3336004 gtaaaggatgaatctgcaaacaaactcaaaacattcaagttattagcatataacggcgtaatgcctacaaatatatatgataaaattaaaatgatcgga- 3336102  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaat 227  Q
         |||  ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||    
T  3336103 -----atgtctccggatctgcaatgctgacg-ccaaatctttgattgaataatcaatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagatggaaaat 3336196  T
Q  228 ccaacaacg 236  Q
    | |||||||    
T  3336197 caaacaacg 3336205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 9645364 - 9645470
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9645364 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatacctacaaaagtatatgataaaattaaagtgaccggaa 9645463  T
Q  129 tacccat 135  Q
    || ||||    
T  9645464 tatccat 9645470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21090391 - 21090271
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| |||  ||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21090391 gtaaaggatgaatctgcaaacaaactcacactatccaagttaataacatataacgacataatgcctacaaaagtagatgataaaattaaagtgaccggaa 21090292  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||  ||||| |||||||||||    
T  21090291 tattcatgcttccggatctgc 21090271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 56199345 - 56199215
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  56199345 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatgtaacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtcatcggaa 56199246  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgac 158  Q
    ||  ||| || | ||||||||||||||||||    
T  56199245 tattcatggctttcggatctgcaacgttgac 56199215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2521020 - 2520892
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||| ||||||||  || | |||| ||||||||||    
T  2521020 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atacgataaaatctaaatcaccgaaatacccatg 2520922  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2520921 cttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 2520892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2624646 - 2624526
Alignment:
Q  127 aatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatt-tttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaa 224  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || | |    
T  2624646 aatacccatgc-tccagatctgcaacgttgacgcccaattctttgattgaataatcgaatctttcaatatgaatcaaataaacaccgcaacaagacggga 2624548  T
Q  225 aatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||| ||| |||||||||||||    
T  2624547 aatcaaactacgccgcacaaga 2624526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 19853380 - 19853508
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | |||||||| ||| | ||||||||||| | |||| |||| |||| |||||    
T  19853380 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctagaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatatccatg 19853478  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19853479 cttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 19853508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32766727 - 32766616
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  32766727 aagttaatagcatacaacgacataatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacattgacgtccaa 32766629  T
Q  165 atatttgattgaa 177  Q
    ||  |||||||||    
T  32766628 atcattgattgaa 32766616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33921282 - 33921156
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||  || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| || | ||||||||||| |||||||||||    
T  33921282 aaactcacaacatccaagttaatagcatacaactatacaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcactgaaatacccatgcttccggatctgc 33921184  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||||||||  |||||  |||||||||    
T  33921183 aacgttgacgctcaaattattgattgaa 33921156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 53811255 - 53811141
Alignment:
Q  51 aacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgca 150  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  53811255 aactcacaacacccaagttaatagcatacaacgccaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgca 53811157  T
Q  151 acgttgacgtccaaat 166  Q
    ||||||||||||||||    
T  53811156 acgttgacgtccaaat 53811141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 131
Target Start/End: Original strand, 1931627 - 1931693
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatac 131  Q
    ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1931627 aagttaatagcatataacgacattatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatac 1931693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 246
Target Start/End: Original strand, 8009275 - 8009420
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatca 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  | ||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||  || ||||||    
T  8009275 atatgataaaattaaagtgatcggaatatccatggtcttcggatatacaacgttgacgcccaaatttttgattgaataatcaatctttctgtaagaatca 8009374  T
Q  201 aatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||| |  || || | ||||| |||||||||||||||||    
T  8009375 aatgaacaccgtatgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaaga 8009420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 52944524 - 52944424
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52944524 aagttaatagcatataactacaaaatgcctacaaaaa-atatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 52944426  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  52944425 at 52944424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23100853 - 23100719
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatca 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||   |||||  ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  23100853 atatgatacaattaaattgaccgaaatacccatgacatc-ggatctgcaactttgacactcaaatcattgattgaataattgatctttcaatatgaatca 23100755  T
Q  201 aatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacg 236  Q
    |||||||||| || | | | |||||||| |||||||    
T  23100754 aatgaacaccacaaccaaatagaaaatcaaacaacg 23100719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22611373 - 22611296
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22611373 aatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 22611296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 167
Target Start/End: Original strand, 48257500 - 48257629
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||| | ||| |||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  48257500 tgaatctgcgaacaaactcacaaaatccaagttaatagcatacaacggcaaaatacctacaaata-atatgataaaactcaagtcaccgaaatacccatg 48257598  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaata 167  Q
      | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  48257599 ttttcggatctgtaacgttgacgtccaaata 48257629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Original strand, 7273711 - 7273776
Alignment:
Q  86 ataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  7273711 ataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaaataactgaaatactcatgcttccggatctgcaa 7273776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 246
Target Start/End: Original strand, 9645479 - 9645608
Alignment:
Q  119 gtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaaaatcg-atttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacca 216  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||   |  || | ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9645479 gtgaccggaatatccatcgcctccggatctgcaatgttgacgcccaaatcttttattgaattacttatctctcaatatgaatcaaatgaacagcgcacga 9645578  T
Q  217 atacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
      || ||||||| |||||||||||||||||    
T  9645579 cgacggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 9645608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 43510386 - 43510309
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  43510386 aatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttcaggatctgcaacattgacgtccaaat 43510309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 177
Target Start/End: Original strand, 47320279 - 47320419
Alignment:
Q  36 atgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat 135  Q
    |||||| ||| || ||||| ||| || | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||| |||  || | ||| |||||| | |    
T  47320279 atgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgatataatctaaatcaccagaatactctt 47320377  T
Q  136 gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47320378 gcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 47320419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 235
Target Start/End: Original strand, 28834164 - 28834295
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaaaatcgatttttcaatatgaatcaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||    ||||  |||||||||| | ||| |||||||| ||| ||||    
T  28834164 atatgataaaattaaagtgaccggaatagtcatgtctccggatctacaacgttgacactaaaatcgttgattgaaact-gatgtttcaataagaaccaaa 28834262  T
Q  203 tgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaac 235  Q
     |||   |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  28834263 cgaatttcgcaacaagacagaaaatcaaacaac 28834295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 166
Target Start/End: Original strand, 56040527 - 56040642
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  56040527 aaactcacagcatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttctggatctgc 56040625  T
Q  150 aacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||||||| || ||||||    
T  56040626 aacgttgccgcccaaat 56040642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 166
Target Start/End: Original strand, 24098986 - 24099063
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||| | |||||||||||   |||| || | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24098986 aatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcactgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 24099063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36184764 - 36184599
Alignment:
Q  45 caaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccgga 144  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||  | |||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||||  ||||   |||| ||| ||    
T  36184764 caaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctagaaata-gtatgataaaatcaaagtgaccataatatttatgcctcctga 36184666  T
Q  145 tctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacacc 210  Q
    ||| ||||||||||  | ||||  ||||||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  36184665 tctacaacgttgacaccaaaatcattgattgaataaccgatctttcaatagaaatcaaatgaacacc 36184599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43853520 - 43853458
Alignment:
Q  186 tttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaagatg 248  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  43853520 tttcaatatgaaccaaatgagcaccgcaacaatacgcgaaatcaaacaacgccgcacaagatg 43853458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10496548 - 10496448
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| | |||||||||||   || | |||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  10496548 aagttaatagcatacgacagcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaactcaccgaaatacccatgcttacggatctgcaaagttgacgcccaa 10496450  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  10496449 at 10496448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 31891155 - 31891283
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||| || ||||  || | ||| |||||| ||||    
T  31891155 tgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atataatgaaatctaaatcaccagaatactcatg 31891253  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | || |||| ||||||||||||| ||||||    
T  31891254 cttctggatttgcaacgttgacgcccaaat 31891283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21662613 - 21662557
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    |||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21662613 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacg 21662557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21671377 - 21671321
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    |||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21671377 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacg 21671321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 166
Target Start/End: Original strand, 29120276 - 29120375
Alignment:
Q  66 agttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaa 165  Q
    |||||||||||||  |||  | |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  29120276 agttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagttaccgaaatactcatgcttccagatctgcaatgttgacgcccaaa 29120374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 36194949 - 36194830
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||| |||||||||||    
T  36194949 tgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatg 36194851  T
Q  137 catccggatctgcaacgttga 157  Q
      || ||||||||||| ||||    
T  36194850 tttctggatctgcaactttga 36194830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40068840 - 40068729
Alignment:
Q  47 aataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatc 146  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| ||| ||| ||| |||||| | ||| | |||| | ||||||||||||| |||||||  ||||  || |||||    
T  40068840 aataaactcacaacattcaagttaatagtatacgacagtaaaatgccaataaata-atataacaaaattaaagtgatcggaatattcatgtctctggatc 40068742  T
Q  147 tgcaacgttgacg 159  Q
    |||||||||||||    
T  40068741 tgcaacgttgacg 40068729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 4142685 - 4142748
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  4142685 atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgtttctggatctgcaacgttgacgtccaaat 4142748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13634267 - 13634228
Alignment:
Q  127 aatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13634267 aatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 13634228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 166
Target Start/End: Original strand, 21686199 - 21686238
Alignment:
Q  127 aatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21686199 aatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 21686238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 56194718 - 56194631
Alignment:
Q  160 tccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || || | ||| | |||||||||||||||||    
T  56194718 tccaaatctttgattaaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaaga 56194631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 177
Target Start/End: Original strand, 36204348 - 36204386
Alignment:
Q  139 tccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36204348 tccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 36204386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36700452 - 36700378
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||||||||||| |||| | || |||||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  36700452 atatgataaaatttaagtcatcgaaatacccacgcttccagatttgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 36700378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 219
Target Start/End: Original strand, 36204411 - 36204448
Alignment:
Q  182 gatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaata 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36204411 gatttttcaatatgaaccaaatgaacaccgcaacaata 36204448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9048905 - 9048766
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||| || | | | |||||||||||    
T  9048905 tgaatctgtaaacaaactcacaacacccaagtttatagcacatgacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatttaaatcatcagaatacccatg 9048807  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
      | | ||| |||||||||||||  |||||  |||||||||    
T  9048806 ttttcagatttgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaa 9048766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18048961 - 18048901
Alignment:
Q  186 tttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||  |  |||||| ||||||||| |||||||    
T  18048961 tttcaatatgaatcaaacgaacaccgcaacaaggcgcaaaatcaaacaacgccacacaaga 18048901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26123436 - 26123380
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  26123436 atatgataaaattaaagtgacaataatactcatgcctccggatttgcaacattgacg 26123380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 159
Target Start/End: Original strand, 29474160 - 29474196
Alignment:
Q  123 ccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29474160 ccggaatacccatgtctccggatctgcaacgttgacg 29474196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 83)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 9986182 - 9986401
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9986182 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 9986281  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  9986282 tacccatggcctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttaattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaa 9986381  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  9986382 tcaaacaacgccgcacaaga 9986401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 246
Target Start/End: Original strand, 7015558 - 7015770
Alignment:
Q  36 atgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat 135  Q
    |||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  7015558 atgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagcgacgggaatatccat 7015657  T
Q  136 -gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaaca 233  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||    
T  7015658 ggcattcggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatatttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaaca 7015757  T
Q  234 acgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||||    
T  7015758 acgccgcacaaga 7015770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 27248991 - 27249210
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27248991 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcgtacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaa 27249090  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  27249091 tatccattgcctcaggatctgcaacgctgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 27249190  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  27249191 tcaaacaacgccgcacaaga 27249210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Original strand, 84021 - 84207
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  84021 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacgaaaatatatgataaaattaaagtggccggaa 84120  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcac 214  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  84121 tatccatgacatccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcga-ttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcac 84207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 51 - 246
Target Start/End: Original strand, 2808334 - 2808531
Alignment:
Q  51 aacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgc 149  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||    
T  2808334 aactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatggcttccggatctgc 2808433  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  2808434 aacgttgacgccaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacatcgcaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 2808531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8806107 - 8805888
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || || || |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8806107 gtaaaggatgaatctgcgaacaatctcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 8806008  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||||| | |||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||    
T  8806007 tatccatgacctccgaatctgcaacgttgacgccaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccacacgaagacgggaaa 8805908  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  8805907 tcaaacaacgtcgcacaaga 8805888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 32678952 - 32679169
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32678952 taaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatc-aagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaat 32679050  T
Q  130 acccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaat 227  Q
    | | || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||  || |||| |||     
T  32679051 atctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataagaataaaatgaacatcgcaagaagacaggaaag 32679150  T
Q  228 ccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  32679151 caaacaacgccacacaaga 32679169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36234192 - 36234030
Alignment:
Q  86 ataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcga 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  36234192 ataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcga 36234093  T
Q  184 tttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||    
T  36234092 tctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaaga 36234030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 58 - 246
Target Start/End: Original strand, 459144 - 459333
Alignment:
Q  58 aacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttga 157  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  459144 aacatcaaagttaatagcatataatggcataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaaatgactgaaatacctatgcatccggatctgcaacgttga 459243  T
Q  158 cgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || | |||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| || ||||||    
T  459244 cgcctaaatctttgattaaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtcgtacaaga 459333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32913486 - 32913263
Alignment:
Q  24 aaattgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 123  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32913486 aaatcgtaaaggatgaatctgcgaacatactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 32913387  T
Q  124 cggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaataca 221  Q
    || |||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||| |  || ||     
T  32913386 cgtaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcga-tcttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaagacg 32913288  T
Q  222 gaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
T  32913287 gaaaatcaaacagcgccgcacaaga 32913263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Original strand, 8971467 - 8971686
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8971467 tgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 8971566  T
Q  128 atacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaaaatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||| | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  | |||    
T  8971567 atatcaatgacatctggatctgcaacgttgacatccaaatctttaattgataattgatctttcattatgaatcaaatgaacatcgcacgaagatgggaaa 8971666  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  8971667 tcaaacaacgctgcacaaga 8971686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6173832 - 6173654
Alignment:
Q  70 aatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatat 168  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  6173832 aatagcatataactgcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatct 6173733  T
Q  169 ttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  6173732 ttgattgaatgatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagatggaaaatcaaacaacgccacacaaga 6173654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17319561 - 17319344
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17319561 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacgacatccaagttaataacatataacgacataatgcctatacaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 17319462  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat-atttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||    
T  17319461 tacccatgctttcggatctgcaacgttgacgctcaaatcttttgattgaataatcga-tcttcaatatgagtcaaatgaacaccgcaacaagacggaaaa 17319363  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | ||||||||| ||||||||    
T  17319362 t-caacaacgctgcacaaga 17319344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41431269 - 41431050
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  41431269 gtaaaggataaatctgcgaataaactcacaacatccaagttaatagtatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcatcggaa 41431170  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| |  || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||  || || | |||    
T  41431169 tatccatggtctctggatctgcaacgttgacatccaaatctttgattgaataatcgatctttcaattggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaa 41431070  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | |||||||||||||||||    
T  41431069 gcaaacaacgccgcacaaga 41431050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 20046922 - 20047141
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||| | ||| |||| |||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20046922 gtaaaggatgaatctgcgaacaaaatcacagcatccaagttaataagatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaa 20047021  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||  ||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |  || |||  |||    
T  20047022 tattcatggcctccggatctgcaacgttgatgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgtaagaagacatgaaa 20047121  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  20047122 tcaaacaacgccgcacaaga 20047141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 40659772 - 40659991
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  40659772 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatggctacagaaataaattatgaaattaaagtgaccggaa 40659871  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| || || || || || | |||    
T  40659872 tatccatggcctccggatctccaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcagtaagaatcaaatgagcatcggacgaagacgggaaa 40659971  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  40659972 tcaaacaacgccgcacaaga 40659991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Original strand, 21570256 - 21570432
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat- 135  Q
    ||||| ||| || ||||||||| |||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||     
T  21570256 tgaatctgcgaacaaacttacagcattcaagttaatagcatacaacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaacggaatattcatg 21570355  T
Q  136 gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgc 212  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21570356 gcctccggatctgcaacattgacgcccaaatctttgattgaataatcga-tcttcaatatgaatcaaatgaacaccgc 21570432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27477390 - 27477170
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||| ||| || | ||| |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27477390 tgtaaatgatgaatctgcgaacatactcacaacatccaagttaatagtatttaacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgaa 27477291  T
Q  128 atacccatg--catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgc-accaatacaga 223  Q
    ||| | |||  | ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  || || ||    
T  27477290 atatctatggtcttcc-gatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaataatcga-tcttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaaagaagacgga 27477193  T
Q  224 aaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  27477192 aaatcaaacagcgccgcacaaga 27477170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 246
Target Start/End: Original strand, 37613997 - 37614184
Alignment:
Q  60 catctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||     
T  37613997 catccaagttaataacatataacaacataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtgattggaatactcatgtctcccgatctgcaacgttgaca 37614096  T
Q  160 tccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
       ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  37614097 caaaaatatttgattgaataatcaatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgacgcacaaga 37614184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 244
Target Start/End: Original strand, 3269022 - 3269168
Alignment:
Q  100 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaa 197  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3269022 aatatatagtaaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 3269121  T
Q  198 tcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaa 244  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||    
T  3269122 tcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccccacaa 3269168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 244
Target Start/End: Original strand, 3269581 - 3269727
Alignment:
Q  100 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaa 197  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3269581 aatatatagtaaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 3269680  T
Q  198 tcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaa 244  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||    
T  3269681 tcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccccacaa 3269727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 244
Target Start/End: Original strand, 3270140 - 3270286
Alignment:
Q  100 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaa 197  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3270140 aatatatagtaaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 3270239  T
Q  198 tcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaa 244  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||    
T  3270240 tcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccccacaa 3270286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 45128424 - 45128259
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  45128424 aaactcacaacatccaaattaatagcatataacaacataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcttccggatctg 45128325  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45128324 caacgttaacgtccaaatctttgattgaataattgatatttcaataggaataaaatgaacaccgca 45128259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Original strand, 38575326 - 38575474
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38575326 taaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagataatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaat 38575425  T
Q  130 accca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  38575426 atccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 38575474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3725421 - 3725202
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3725421 gtaaaggatgaatctgtaaacaaacttacatcatccaaactaatagcatataacggcgtaatgcctacaaaaatatatgaaaaaattaaagtgatcggaa 3725322  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || | || || || |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||   |||    
T  3725321 tatctatggcctctggatctacaacgttgacgctcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaacgaacaccacacaaagacgagaaa 3725222  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||| ||||||    
T  3725221 tcaaacaacgccgtacaaga 3725202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27949667 - 27949448
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| | | || ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27949667 gtaaatgatgaatctccgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgtcataatgtctataaaaatatatgataaaattaaagtgactggaa 27949568  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||  || || | |||    
T  27949567 tatccatggcctttggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataattgatctttcgatatgaatcaaatgaacatcgcaagaagacgggaaa 27949468  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||| ||||||    
T  27949467 tcaaacaacgccgtacaaga 27949448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8308342 - 8308193
Alignment:
Q  97 aaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatg 195  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8308342 aaaaatatatgataaagttaaagtgattggaatagttatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaattctttgattgaataatcgatctttcaatatg 8308243  T
Q  196 aatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  8308242 aatcaaatgaaaactgcaacaatacag-aaatcaaacaacgctgcacaaga 8308193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30420836 - 30420700
Alignment:
Q  112 aattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacac 209  Q
    |||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  30420836 aattaaagtgactggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatctatctttcaatatgaatcaaatgaacac 30420737  T
Q  210 cgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||| || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  30420736 cgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 30420700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4193046 - 4192860
Alignment:
Q  61 atctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||    
T  4193046 atctaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacg 4192947  T
Q  160 tccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
      ||||| |||||  ||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||| |||  || || | ||||| |||||| || |||||||    
T  4192946 ctcaaatctttgacggaataatcga-tcttcaaaatgaatcagatgaacactgcaagaagacgggaaatcaaacaacaccacacaaga 4192860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 177
Target Start/End: Original strand, 33229006 - 33229129
Alignment:
Q  55 tacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacg 153  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  33229006 tacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatggcctccggatctgcaacg 33229105  T
Q  154 ttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  33229106 ttgacgcccaaatctttgattgaa 33229129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4228365 - 4228155
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgat-aaaattaaagtgaccgg 126  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4228365 tgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaaattaaagtgatcgg 4228266  T
Q  127 aatacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaa 224  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||   | | |||| |||||||||| |||||        || ||||||||||||||||||||| || || |||    
T  4228265 aatatccatgacctccggatctgcaacgtt---gcctaaatctttgattgaataatcg--------atctgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaa 4228177  T
Q  225 aatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4228176 aatcaaacaacgccgcacaaga 4228155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
Target Start/End: Original strand, 32197715 - 32197854
Alignment:
Q  108 ataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaa 206  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | || || ||| |||||||||||||||||    
T  32197715 ataaaattagagtgaccagaataaccatgcatccggatctgcaacattgacgcccaaatatttgattaaatagtcaatattttaatatgaatcaaatgaa 32197814  T
Q  207 caccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  32197815 caccgcaacaagacaggaaatcaaacaatgccgcgcaaga 32197854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 202
Target Start/End: Original strand, 40625897 - 40626072
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| | |||||  ||||||||||||||| |    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  40625897 gtaaatgatgaatctgcgaacaaactcataacattcaagttaatagcatataaaaagataatgcctacaaaaacataacataaaattaaagtgaccggaa 40625996  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaa 202  Q
    || |||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  40625997 tatccatggccgccggatctgcaacgttgacgatcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaa 40626072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25087277 - 25087096
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||  || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25087277 gtaaaggatgaatctgggaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcttaatgcctac-aaaatatatgataagattaaagtgactggaa 25087179  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacac 209  Q
    || |||| || || | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||||||    
T  25087178 tatccatggcttctgaatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaataatcgatcttttaatatgaataaattgaacac 25087096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22421969 - 22421790
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||  || ||||| ||| |||| |||||||| |||||| |  | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22421969 gtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaattgcatataatagcatagtgtctacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccggaa 22421870  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    || |      |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22421869 tatc------tccggatctgtaacgttgacgcccaaatcattgattgaataatcgatctttcaatacgaatcaaatgaacaccgca 22421790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 253
Target Start/End: Original strand, 39641766 - 39641924
Alignment:
Q  96 caaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatat 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  39641766 caaaaatatatgataaaataaaagtgactgaaatactcgtgcctccggatctgcaacgttgatgcccaaattttggattgaataattgatctttcaatat 39641865  T
Q  195 gaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaagatgccgaa 253  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| || | ||||| ||||| | ||||||||||| ||||    
T  39641866 gaattaaatgaataccgcaacaagacgggaaatcaaacaatgacgcacaagatgacgaa 39641924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34599108 - 34599009
Alignment:
Q  148 gcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  34599108 gcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 34599009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 34600424 - 34600354
Alignment:
Q  60 catctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaata 130  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34600424 catccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaata 34600354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7646717 - 7646581
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||    
T  7646717 gtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaa 7646619  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7646618 tactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 7646581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 246
Target Start/End: Original strand, 26025331 - 26025469
Alignment:
Q  110 aaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaac 207  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||    
T  26025331 aaaattaaagtgactggaatattcatcgcctccggatctgcaacattgacacccaaatttttgattgaataaccgatctttcaagatgaatcaaatgaac 26025430  T
Q  208 accgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||  || ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  26025431 accgcaagaagacgaaaaatcaaacaacgccgcacaaga 26025469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Original strand, 41712628 - 41712774
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||| ||| ||| || ||||| |||| || |||||||||| ||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41712628 tgtaaatgataaatctgcgaacaaactcacaatatataagttaataacatataactgcataatacctacaaaaatatatgataaaattaaaatgaccgga 41712727  T
Q  128 atacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgat 173  Q
    |||  ||| || |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  41712728 atattcatggcctccgtatctgcaacgttgacgctcaaatctttgat 41712774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 166
Target Start/End: Original strand, 9169140 - 9169255
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||| | | |||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9169140 aaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataagacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgc 9169238  T
Q  150 aacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||||||||    
T  9169239 aacgttgacgtccaaat 9169255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1421912 - 1421779
Alignment:
Q  32 aaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatac 131  Q
    |||| ||||| |||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| | |||||||||||   || | |||| |||||    
T  1421912 aaaggtgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcaccgaaatac 1421814  T
Q  132 ccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1421813 ccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 1421779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 157
Target Start/End: Original strand, 37876503 - 37876594
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttga 157  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  37876503 aagttaatagcatacgacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaatttaagtcaccgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttga 37876594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4778933 - 4778856
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778933 aatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 4778856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 166
Target Start/End: Original strand, 36943022 - 36943118
Alignment:
Q  68 ttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36943022 ttaatagcatac-acggcataatgcctacaaata-atatgataaaattcaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgcccaaat 36943118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 37994528 - 37994387
Alignment:
Q  24 aaattgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 123  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||| || | | |||||||||||| | ||||||||||||  || | ||    
T  37994528 aaatcgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatataacagcaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaaatcac 37994430  T
Q  124 cggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||  | | | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37994429 cggaatattctttcttccggatctgcaacgctgacgtccaaat 37994387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Original strand, 33585596 - 33585732
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | ||||| |||||| | ||||||||||| | || | |||| |     
T  33585596 gtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacaaata-atatgataaaacttaaatcaccgaat 33585694  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33585695 tactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 33585732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38445405 - 38445269
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| || | ||||||||| ||||  | || | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||    
T  38445405 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcaccaaagttaataacatacaatggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaa 38445307  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38445306 tacccacgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 38445269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Original strand, 19062244 - 19062360
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaa---aata-tatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgt 160  Q
    ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||   |||| |||||||||| | |||| |||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  19062244 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaattaaataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgctttcggatctgaaacgttgacgt 19062343  T
Q  161 ccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||||  |||||||||    
T  19062344 ccaaatcattgattgaa 19062360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 177
Target Start/End: Original strand, 17994650 - 17994738
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17994650 aatgcctacaaata-atatgataaaatttaagtcaccgaaatacctatggttccggatgtgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 17994738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 27097276 - 27097403
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| | |||||||||| |||  |||| | ||| |||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||| |||    
T  27097276 tgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagtatacaacggcaaaattcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacc-atg 27097373  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27097374 cttccagatctgcaacgttgacgtccaaat 27097403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 10237085 - 10237224
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| | ||||||| ||||  || | | | |||||||||||    
T  10237085 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgatgaaatctaaatcatcagaatacccatg 10237183  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10237184 cttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 10237224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10929896 - 10929757
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||   ||   | |||||||| ||| | ||||||||||||| || | ||| |||||| ||||    
T  10929896 tgaatatgcaaacaaactcacagcatccaagttaatagcattcaacaacaaaatgcctataaata-atatgataaaatttaaatcaccagaatacacatg 10929798  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  10929797 cttccggatctgcaacgttgatgtccaaatcattgattgaa 10929757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Original strand, 31580580 - 31580648
Alignment:
Q  178 aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||    
T  31580580 aatcgatctttcaatataaatcaaatgaacaccgcacgaatacgggaaataaaacaacgccgcacaaga 31580648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 253
Target Start/End: Original strand, 9374450 - 9374622
Alignment:
Q  72 tagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttg 171  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||   |||          ||| ||||| |||| ||||    
T  9374450 tagcatataacgacataatgcctacaaaaatacatgataaaattaaagtgtctggaatactcatgtccccg----------gtttacgtcaaaatctttg 9374539  T
Q  172 attgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaagatgccgaa 253  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||| || ||| || ||||| | ||||| | ||||||||||| ||||    
T  9374540 attgaataatcgttctttcaaaatgaatcaaatgaacaccacaacaagacggaaaaacaaacaatgacgcacaagatgacgaa 9374622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 177
Target Start/End: Original strand, 29173654 - 29173728
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  29173654 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacacccaaataattgattgaa 29173728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 208
Target Start/End: Original strand, 44881657 - 44881763
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| ||| | || |||||  ||||||||| ||   || ||| ||||||||||||    
T  44881657 atatgataaaattaaagtgaccgaaatactcatgtctccggatctgcaatgttaatgtgcaaattattgattgaataactaatcttttaatatgaatcaa 44881756  T
Q  202 atgaaca 208  Q
    |||||||    
T  44881757 atgaaca 44881763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Original strand, 7677734 - 7677870
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||  |||| | |||||||| ||| | |||||||||||   || | || | ||    
T  7677734 gtaaaaggtgaacttgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaaaaata-atatgataaaacctaattcacggaaa 7677832  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7677833 tacccatgctttcggatctgcaacgttgatgtccaaat 7677870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18113996 - 18113891
Alignment:
Q  142 ggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaaaatc-gatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgc 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || |||||| | | ||| |||||||||||| || || |||||||||  || || ||||||| |||||||||||    
T  18113996 ggatctgcaacgttgacatccaaatcatttattgaataactgatatttcaatatgaaccatattaacaccgcaataagacggaaaatcaaacaacgccgc 18113897  T
Q  241 acaaga 246  Q
    ||||||    
T  18113896 acaaga 18113891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18763699 - 18763571
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| ||| | ||||    
T  18763699 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatg 18763601  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18763600 cttccggatctgtaacgttgacgcccaaat 18763571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 31788687 - 31788559
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||| |||||   |||| || | ||||| ||||    
T  31788687 tgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgttaaaacctaagtcactgaaatactcatg 31788589  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31788588 ctttcggatctgcaacgttgacgtccaaat 31788559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3309176 - 3309037
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||  |||| | |||| ||||||| | ||||||| ||||  || | ||| |||||||||||    
T  3309176 tgaatctgcgaataaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgactacaaata-atatgatgaaatataaatcaccagaatacccatg 3309078  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    | || |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  3309077 cttctggatctgcaacgttaacgcccaaatcattgattgaa 3309037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 158
Target Start/End: Original strand, 4904027 - 4904134
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||  | |||| ||||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||| |||||| || ||||||||    
T  4904027 aaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatatccatgcttctggatctgc 4904125  T
Q  150 aacgttgac 158  Q
    |||||||||    
T  4904126 aacgttgac 4904134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 29279439 - 29279578
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| |  |||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| || || ||||    
T  29279439 tgaatatgcgaacaaactcacaacaccatagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaatttaagtcaccgaaaaactcatg 29279537  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
      |||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||    
T  29279538 tttccggatctgcaacattgacgcacaaatcattgattgaa 29279578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7448413 - 7448350
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||||||||||| | |||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7448413 atatgataaaacttaagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 7448350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Original strand, 31580495 - 31580566
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31580495 gtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaa 31580566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1415793 - 1415660
Alignment:
Q  32 aaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatac 131  Q
    |||| ||||| ||| || ||||| |||||| | |||||||||||||   |||||| |||||||||||| | || ||||||||   |||| |||| ||| |    
T  1415793 aaaggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcattaaacggtaaaatgcctacaaata-atctgataaaacctaagtcaccgaaattc 1415695  T
Q  132 ccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1415694 acatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaat 1415660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 114
Target Start/End: Original strand, 30399889 - 30399974
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaat 114  Q
    |||||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||||    
T  30399889 tgtaaaggatgaatctgcgaacaaacttacaacacctaagttaatgacatacgacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaat 30399974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Original strand, 19028774 - 19028922
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||||| ||||||||| || || || ||||||   ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| |  |||||||||||  |||| |||| |    
T  19028774 tgtaaaaggtgaatttgcgaacaatctcacaacactcaagttaatagcataaaacgaaaaaatgcctacaaatag-tatgataaaatctaagttaccgaa 19028872  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||| |||||| || |||| |||||||||||||  |||||  |||||||||    
T  19028873 atatccatgcttctggatttgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaa 19028922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24461682 - 24461546
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||  ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||| ||||||| ||||  || | |||  ||    
T  24461682 gtaaaggatgaacctgcgaacaaactcacaacaccaaagttaatagcatataacgacaaaatacctacaaaaa-atatgatgaaatctaaatcaccaaaa 24461584  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24461583 tactaatgcttccggatctgcaacgttggcgtccaaat 24461546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 177
Target Start/End: Original strand, 31128700 - 31128788
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  |||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  31128700 aatgcctacaaata-atatgataaaatataagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgcctaaatcattgattgaa 31128788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 17249008 - 17249155
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| || | ||||||||||||||  |||| | |||| ||||||| | |||||||| |||  || | ||| |||    
T  17249008 gtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaata-atatgatataatctaaatcaccagaa 17249106  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||| | ||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17249107 tactcttgcttatggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 17249155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 32190895 - 32190769
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |  | | ||||| |||||| | |||||||||||| ||| | | || |||||  |||    
T  32190895 tgaatctgcaaataaactcacaacatttaagttaatagcatacaatagaaaaatgcttacaaata-atatgataaaatgaaaataatcgaaatacttatg 32190797  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaa 165  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32190796 cctcctgatctgcaacgtt-acgtccaaa 32190769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Original strand, 25508930 - 25509076
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||| ||| || | ||||||||| ||||  |||| | |||||||||||| | ||| ||||||||  |||| | || |||    
T  25508930 taaacgatgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaataacatacaacggcaaaatgcctacaaata-atacgataaaatctaagtcatcgaaat 25509028  T
Q  130 acccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||    
T  25509029 acccatgtttccggatttgcaacgttgacgcccagatcattgattgaa 25509076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 166
Target Start/End: Original strand, 31210527 - 31210604
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||| | |||||||||||   || | |||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  31210527 aatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgctttctgatctgcaacgttgacgtccaaat 31210604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 103
Target Start/End: Original strand, 3268684 - 3268749
Alignment:
Q  38 gaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaata 103  Q
    |||| |||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||    
T  3268684 gaatctgcaaacaaactcacagcatccaagttaataccatataaaggcataatgcctacaaaaata 3268749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 158
Target Start/End: Original strand, 11985094 - 11985222
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||| |||  || | | |||||||||||| | |||||||||||   |||| || | ||    
T  11985094 gtaaatgatgaatttgcgaacaaattcacaacatccaagttaataggatacaacagcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcactgaaa 11985192  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgac 158  Q
    ||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  11985193 tactcattcttctggatctgcaacgttgac 11985222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36324019 - 36323915
Alignment:
Q  104 tatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaa 202  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||| ||| | || | ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  ||| |||||||| ||| ||||    
T  36324019 tatgataaaattaaaatgtctggaatactcattcctcag-atctgcaacgttgacgtccaaaccattgattgaataacagatctttcaataggaaccaaa 36323921  T
Q  203 tgaaca 208  Q
    ||||||    
T  36323920 tgaaca 36323915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Original strand, 23933516 - 23933627
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||| ||  |||| | ||| |||||||| | ||||||||||||  || | ||| || || |||||| ||| ||| || |||||||||||||||    
T  23933516 aagttaatagcttacaacggcaaaattcctacaaata-atatgataaaatctaaatcaccagattatccatgcttccagatatgtaacgttgacgtccaa 23933614  T
Q  165 atatttgattgaa 177  Q
    ||| |||||||||    
T  23933615 ataattgattgaa 23933627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 177
Target Start/End: Original strand, 29574592 - 29574636
Alignment:
Q  133 catgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  29574592 catgcttccggatctgcaacgttggcgtccaaatcattgattgaa 29574636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 30420911 - 30420855
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacgg 84  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30420911 tgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgg 30420855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 210
Target Start/End: Original strand, 39285253 - 39285317
Alignment:
Q  147 tgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacacc 210  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  39285253 tgcaatgttgtcgtccaaattattgattgaataatctatatttcaataggaatcaaatgaacacc 39285317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16419395 - 16419176
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16419395 gtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacaacaatcaagttaatagcatatgacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaa 16419296  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||    
T  16419295 tatccattgcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatttttcaatatgaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaa 16419196  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | |||||||||||||||||    
T  16419195 gcaaacaacgccgcacaaga 16419176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33110848 - 33110629
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33110848 gtaaaggatgaatatgcaaataaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 33110749  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||   |||    
T  33110748 tatccatgacctccggatctgcaacgttgacgccaaaatctttgattgaataatcgatcttttaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgagaaa 33110649  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  33110648 tcaaacaacaccgcacaaga 33110629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12653175 - 12652962
Alignment:
Q  35 gatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca 134  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12653175 gatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcgtacaaaaatatatgataaaattaaagcgaccggaatatcca 12653076  T
Q  135 tg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaac 232  Q
    || | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||    
T  12653075 tgacctccagatctgcaacgttgacggccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagatggaaaatcaaac 12652976  T
Q  233 aacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||||||    
T  12652975 aacgccgcacaaga 12652962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8497205 - 8496978
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaa-tatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8497205 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccgga 8497106  T
Q  128 atacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaa 225  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||    
T  8497105 atatccattgcatcaggatctgcaacgttgccgcccaaatctttgattgaagaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgagaa 8497006  T
Q  226 atccaacaacgccgcacaagatgccgaa 253  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8497005 atcaaacaacgccgcacaagatgacgaa 8496978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 246
Target Start/End: Original strand, 7880973 - 7881161
Alignment:
Q  60 catctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca-tgcatccggatctgcaacgttgac 158  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7880973 catccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgac 7881072  T
Q  159 gtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  || |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  7881073 gcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaattgaacaccgcatgaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 7881161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4088697 - 4088478
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4088697 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatggcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 4088598  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| || || | |||    
T  4088597 tatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttctgtaagaatcaaatgaacatcgcacgaagacgggaaa 4088498  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  4088497 tcaaacaacgccgcacaaga 4088478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 4984407 - 4984626
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4984407 gtaaaggatgaatctgcgaacaaacttacatcatctaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcggaa 4984506  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||||| | |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||    
T  4984507 tatccatgacctccgaatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacacctcacgaagacgggaaa 4984606  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  4984607 tcaaacaacaccgcacaaga 4984626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25064473 - 25064254
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |    
T  25064473 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgccgggca 25064374  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  25064373 tatccattgcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaaaacgggaaa 25064274  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  25064273 tcaaacaacgccgcacaaga 25064254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10228916 - 10228697
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10228916 gtaaaggatgaatttgcgaacaaacttacagtatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaa 10228817  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||  ||| ||||||||||| ||  || || | |||    
T  10228816 tatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcaatctttcaatagaaataaaatgaacaccacaagaagacgggaaa 10228717  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | |||||||||||||||||    
T  10228716 gcaaacaacgccgcacaaga 10228697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 17237126 - 17237344
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17237126 gtaaaggatgaatctgcgaacacactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 17237225  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||  || || | |||    
T  17237226 tatccatggcctccggatctgcaacgttgacacccaaatctttgattgaataatcga-tcttcaaaatgaatcagatgaacaccgcaagaagacgggaaa 17237324  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  17237325 tccaacagcgccgcacaaga 17237344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35001827 - 35001608
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||| ||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35001827 gtaaaggattaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaa 35001728  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || || | |||    
T  35001727 tattcatgaccttcggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataattgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaa 35001628  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | |||||||||||||||||    
T  35001627 gcaaacaacgccgcacaaga 35001608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 246
Target Start/End: Original strand, 7875915 - 7876103
Alignment:
Q  60 catctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca-tgcatccggatctgcaacgttgac 158  Q
    |||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7875915 catccaagttaatagcatataactgcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgatcggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgac 7876014  T
Q  159 gtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  7876015 gcccaaatctttgattgaacaatcgatcttttaatatgaatcaattgaacaccgcacgaagatggaaaatcaaacaacgtcgcacaaga 7876103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4468759 - 4468576
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtcca 163  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| |||    
T  4468759 aagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtggccggaatatccatgacctctggatctgcaacgttgacggcca 4468660  T
Q  164 aatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||  || || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  4468659 aatctttgattgaataatcgatccttcaatataaatcaaatgaacactgcatgaagacggaaaatcaaacaacgctgcacaaga 4468576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 8027958 - 8028177
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8027958 gtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacatcatcaaagttaatagcatataatggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaa 8028057  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||||| | | ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||| || |  || | |||    
T  8028058 tatccatgaccttcggatctgcaatgttaacgcccaaatctttgattgaataaccgatcttttaatatgaatcaaatgaacaccgtacgatgacgggaaa 8028157  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  8028158 tcaaacaacgccgcacaaga 8028177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 244
Target Start/End: Original strand, 33740418 - 33740635
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33740418 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacattatccaagttaatagcatataacggcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtgaccgaaa 33740517  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |  || | |||    
T  33740518 tatccatggcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatcttcgattgaataatcgatctttcaatataaatcaaatgaacaccgcacgaggacggtaaa 33740617  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaa 244  Q
    |  |||||||||||||||    
T  33740618 tgaaacaacgccgcacaa 33740635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Original strand, 8196246 - 8196466
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||||||| || | ||| ||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8196246 tgtaaaggatgaatttgcgaacacactcacagcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatgcgataaaattaaagtgaccgga 8196345  T
Q  128 atacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaa 225  Q
    |||  ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| || || | ||    
T  8196346 atatacatggcctccggatctacaacgttgacgcccaaatcgttgattgaataatcgatctttctgtaagaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaa 8196445  T
Q  226 atccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  8196446 atcaaacaacgccgcacaaga 8196466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 23947157 - 23947377
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaa-ttaaagtgaccgga 127  Q
    ||||| ||||||| | | || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23947157 gtaaaggatgaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaatttaaagtgaccaga 23947256  T
Q  128 atacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgatt-gaaaatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaa 225  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |  | ||    
T  23947257 atatccatggcctccggatctgcaacattgacgcccaaatcgttgattggattatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaaaaagatgggaa 23947356  T
Q  226 atccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  23947357 atcaaacaacgccgcacaaga 23947377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Original strand, 33543485 - 33543679
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| ||||  |  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  33543485 aaactcacaacatccgagttaatagtatatagcaatataatgtctacaaaaatatataataaaattaaa-tggtcggaatacccatgcttccggatctgc 33543583  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| |||||  |||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33543584 aacattgacacccaaatttttgattgaatagtcgatctttcaatatgaat--aatgaacaccgcaacaagacagaaaatcaaacaacgccgcacaaga 33543679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 16892656 - 16892805
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16892656 gtaaatgatgattctgcgaacaaacttacgacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaa 16892755  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  16892756 tatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcctaaatctttaattgaa 16892805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17334990 - 17334846
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17334990 gtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgactggaa 17334891  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttga 172  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  17334890 tatccattgcctccggatctgcaacgttgacacccaaatctttga 17334846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12166008 - 12165858
Alignment:
Q  97 aaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||| || |||||||||    
T  12166008 aaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatagcatccggatctgcaacgttgacgcccaaatcttcgattgaataatcaatctttcaatat 12165909  T
Q  195 gaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||| ||||||||||||||  || ||   ||||| |||||||||||||||||    
T  12165908 gaattaaatgaacaccgcaagaa-acgtgaaatcgaacaacgccgcacaaga 12165858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25337801 - 25337588
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25337801 taaatgatgaatgtgcgaacaaacttacaccattcaagttaatatcatataacaatataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaggtgactggaat 25337702  T
Q  130 acccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaaaatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatcc 229  Q
    ||| |||| || |||| |||||| |||| |  ||||| ||| |   | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||     
T  25337701 accaatgcctctggatttgcaaccttgatgctcaaatctttca---ataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagacgaaaaatca 25337605  T
Q  230 aacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||| |||| |||||    
T  25337604 aacaacaccgcgcaaga 25337588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 28634953 - 28635180
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||  || ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  28634953 gtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatcgcatataacggcataatgcctacaaaaatacatgataaaattaaagtgaccggag 28635052  T
Q  129 ta---------cccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaat 218  Q
    ||          |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  28635053 tatccatgtcttccatgcctccggatctgcaacattgacgctcaaatctttgattgaataattaatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacgat 28635152  T
Q  219 acagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||   ||||| |||||| ||| ||||||    
T  28635153 acgagaaatcaaacaacaccgtacaaga 28635180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 136
Target Start/End: Original strand, 12059613 - 12059720
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12059613 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataattcctacaaaaaaatatgataaaattaaagtgaccggaa 12059712  T
Q  129 tacccatg 136  Q
    || |||||    
T  12059713 tatccatg 12059720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 213
Target Start/End: Original strand, 1704004 - 1704176
Alignment:
Q  41 tttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatc 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||  | |||| ||| ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  1704004 tttgcaaataaacttacaacatttaagttaatagcgtacaacgacaaaatgtctataaata-atatgatacaattaaagtgactggaatattcatgcatc 1704102  T
Q  141 cggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||  || |||||| ||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  1704103 cggatctacaacgttgatgttcaaatcatttattgaataatcgatatttcgattagaaccaaatgaacaccgca 1704176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7028060 - 7027951
Alignment:
Q  69 taatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaata 167  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||| ||| |||||||  |||||     
T  7028060 taatagcatataacgccataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatctatggcctccggatctacaaggttgacgctcaaatc 7027961  T
Q  168 tttgattgaa 177  Q
    ||||||||||    
T  7027960 tttgattgaa 7027951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 158
Target Start/End: Original strand, 30608375 - 30608503
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||    
T  30608375 gtaaaggatgaatttgcaaacaatctcacaacatccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctacaaata-atatgataaaatataagtcaccgaaa 30608473  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgac 158  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  30608474 tacccatgattccagatctgcaacgttgac 30608503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Original strand, 7976048 - 7976194
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||    |||||||||||| || | ||| ||||    
T  7976048 taaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaacgg-tatgataaaatttaaatcaccagaat 7976146  T
Q  130 acccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7976147 acccatgcttccggatctacaacgttgacgtccaaataattaattgaa 7976194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 216
Target Start/End: Original strand, 4351902 - 4352025
Alignment:
Q  86 ataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgat 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||        |||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  4351902 ataatgcctacaaaaatatatgataacattaaagcgactgaaatacccatgcttccgga--------gttgacgtccaaatctttgattaaataatcgat 4351993  T
Q  185 ttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacca 216  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4351994 ctttcaatatgaattaaatgaataccgcacca 4352025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 33053036 - 33053164
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| || | ||||||||||    
T  33053036 tgaatatgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcactgaaatacccatg 33053134  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33053135 cttccggatctgcaacgttgacgttcaaat 33053164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 34489421 - 34489352
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat 135  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34489421 aagttaatagcatataacgacataatggctacaaaaatata-gataaaattaaagtgaccggaatacccat 34489352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23128809 - 23128701
Alignment:
Q  68 ttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaata 167  Q
    |||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  23128809 ttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctacaacgttgacatccaaatc 23128711  T
Q  168 tttgattgaa 177  Q
     |||||||||    
T  23128710 attgattgaa 23128701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Original strand, 29319737 - 29319874
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||| | |||| | ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||  ||||||||||| | |||| |||  ||    
T  29319737 gtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcataacaaccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcttacaaaataatatgataaaacttaagtcaccaaaa 29319836  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29319837 tacacatgcttccggatttgcaacgttgacgttcaaat 29319874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 177
Target Start/End: Original strand, 29255327 - 29255453
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||  || ||  |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||  ||||||||||     
T  29255327 aaactcacaacacccaagttaatagcatacaacagtgaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgt 29255425  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  29255426 aacgttgacgcccaaatcattgattgaa 29255453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20619663 - 20619597
Alignment:
Q  70 aatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    |||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20619663 aatagcatataacgacataattcatacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatg 20619597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 606398 - 606298
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  | || | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  606398 aagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgatgtccaa 606300  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  606299 at 606298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 546255 - 546114
Alignment:
Q  35 gatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca 134  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||| || | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||| ||||  ||   ||| |||||||||    
T  546255 gatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgatgaaatctaaaccaccagaataccca 546157  T
Q  135 tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  546156 tgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 546114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30493724 - 30493615
Alignment:
Q  67 gttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||||||||| | | ||||||||||  || | |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30493724 gttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaaca-acatgataaaatataaatcaccaaaatacccatgcttccggatttgcaacgttgacgtccaaat 30493626  T
Q  167 atttgattgaa 177  Q
      |||||||||    
T  30493625 cattgattgaa 30493615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31296883 - 31296817
Alignment:
Q  182 gatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaagatg 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |   |||||| |||||||||||||||||||    
T  31296883 gatttttcaatatgaatcaaatgaacactgcaacaagatgcaaaatcaaacaacgccgcacaagatg 31296817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1523579 - 1523491
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  || | ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  1523579 aatgcctacaaata-atatgataaaatctaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgttcaaatcattgattgaa 1523491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 166
Target Start/End: Original strand, 3913455 - 3913570
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||  | || | |||||||||||| | |||||||||||   || | |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  3913455 aaactcacaacacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgcttctggatctgc 3913553  T
Q  150 aacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||| ||||    
T  3913554 aacgttgacgtctaaat 3913570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8266837 - 8266718
Alignment:
Q  57 caacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttg 156  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||    
T  8266837 caacatttaaattaataacatataacggtaaaattcacacaaata-atatgataaaattaaagtgattggaatacccttgcctccgggtctacaatgttg 8266739  T
Q  157 acgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||| ||||||  |||||||||    
T  8266738 acgcccaaatcattgattgaa 8266718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25398725 - 25398651
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  25398725 atatgataaaattaaagtgatcggaaaacttatgtctccggatcagcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 25398651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 67897 - 67997
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||| ||| | ||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||    
T  67897 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctataaata-atatgataaaacttaagtcgccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttaacgtacaa 67995  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  67996 at 67997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 12170662 - 12170562
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  || | | |||||||||||| | ||||||| |||   || | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12170662 aagttaatagcatacaacagcaaaatgcctacaaata-atatgatcaaacctaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacatccaa 12170564  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  12170563 at 12170562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31296991 - 31296919
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtc 161  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  || | ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31296991 aatgcctacaaaca-atatgataaaatataaatcaccagaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtc 31296919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14802049 - 14801910
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||| ||||  || | |||  ||||| |||     
T  14802049 tgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgatgaaatctaaatcaccaaaatacacatt 14801951  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  14801950 cttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 14801910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Original strand, 26588503 - 26588563
Alignment:
Q  186 tttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || | ||||| |||||||||||||||||    
T  26588503 tttcaatatgaaccaaacgaacaccgcaacaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaaga 26588563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 31852126 - 31852189
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||||||||||||| || | ||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31852126 atatgataaaatttaaatcaccagaatactcatgcttccggatctgcaactttgacgttcaaat 31852189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34489327 - 34489268
Alignment:
Q  187 ttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||| ||||||| |||||||||    
T  34489327 ttcaatatgaatcaaatgaacaccacaacaatatgggaaatcaaacaacgtcgcacaaga 34489268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 127840 - 127763
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  || | |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  127840 aatgcctacaaata-atatgataaaatctaaatcaccgaaatactcatgcttccgaatctgcaacgttgacgcccaaat 127763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 177
Target Start/End: Original strand, 1933661 - 1933699
Alignment:
Q  139 tccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1933661 tccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 1933699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34018731 - 34018654
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||| | |||||||||||   |||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34018731 aatgcctacaaata-atatgataaaacataagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaat 34018654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30776885 - 30776757
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | |||||||||||||   |||| | |||||||||||| | ||||||||||||  || | ||| |||||||||||    
T  30776885 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcattccacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaaatcaccagaatacccatg 30776787  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||  ||| ||||||||| ||| ||||||    
T  30776786 cttctagatttgcaacgttcacgcccaaat 30776757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17334848 - 17334796
Alignment:
Q  194 tgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||| || ||||| || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  17334848 tgaatcaaatgatcatcgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 17334796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 85)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 244
Target Start/End: Original strand, 50271986 - 50272197
Alignment:
Q  35 gatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca 134  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||    
T  50271986 gatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgacaaaattaaagtgactggaatattca 50272085  T
Q  135 -tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaac 232  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||    
T  50272086 ttgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaac 50272185  T
Q  233 aacgccgcacaa 244  Q
    ||||||||||||    
T  50272186 aacgccgcacaa 50272197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 65 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39987592 - 39987411
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39987592 aagttaatagcatataacagcataatgcctataaaa-tatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcctccggatctgcaacgttgacgcccaa 39987494  T
Q  165 atatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  39987493 ttctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcagcaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 39987411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5701500 - 5701281
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5701500 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacacaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaa 5701401  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  5701400 tatccattgtctccggatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaacaatcgatatttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 5701301  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  5701300 tcaaacaacgccgcacaaga 5701281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7998030 - 7997811
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7998030 gtaaaggatgaatctgcaaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaa 7997931  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || | |||    
T  7997930 tattcattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttggttgaacaatcgatatttcaatatgaatcaaatgaacactgcacgaagacgggaaa 7997831  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  7997830 tcaaacaacgccgcacaaga 7997811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 40880853 - 40881071
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| |||| || ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40880853 gtaaatgatgcatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccagaa 40880952  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  40880953 tatccatggccttcggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgattttt-aatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 40881051  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  40881052 tcaaacaacgccgcacaaga 40881071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 35584462 - 35584677
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||    ||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35584462 gtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaat----tataacagcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaa 35584557  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  35584558 tatccattggctccggatctgcaacgttgacgcccaaatatttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaa 35584657  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  35584658 tcaaacaacgccgcacaaga 35584677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 253
Target Start/End: Original strand, 18569159 - 18569376
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569159 tgaatttgcgaataaactcacaacatccaaattaatagcatataacgacataatgcctacaaaagtatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 18569258  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaac 235  Q
    | || |||||||||||||||||  |||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||    
T  18569259 cctctggatctgcaacgttgacacccaaatcttcaattgaataatcgatctttcaatatgaattaaatgaacaccgcaacaagacgggaaatctaacaac 18569358  T
Q  236 gccgcacaagatgccgaa 253  Q
     ||| |||||||| ||||    
T  18569359 accggacaagatgacgaa 18569376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 50148612 - 50148392
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||| ||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50148612 tgtaaaggatgaatctgcgaaacaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccgga 50148513  T
Q  128 ataccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaa 225  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||    
T  50148512 atatccattgcttccggatctgcaacgttgacgcccacatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaa 50148413  T
Q  226 atccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  50148412 atcaaacaatgtcgcacaaga 50148392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 19715735 - 19715954
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19715735 gtaaaggatgaatctgcgaataaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaa 19715834  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  19715835 tatccattgcctctagatctgcaacgttgacgcccaaatctttgatttaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 19715934  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  19715935 tcaaacaacgctgcacaaga 19715954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 45425906 - 45426125
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45425906 gtaaatgatgaatctgcgaataaactcacagcatccaagttaatagcatataacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgaaa 45426005  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||  ||| || | |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  |  | |||    
T  45426006 tattcatggccttcggatctgcaacgttgacgctcaaatttttgattgaataatcgatctttcgatatgaatcaaatgaacaccgcacgatgatgggaaa 45426105  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  45426106 tcaaacaacgccgcacaaga 45426125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 51872104 - 51871885
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51872104 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaa 51872005  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || || |||||    
T  51872004 tatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttcaaatatttgattgaataatcgatctttcaataagaataaaatgaacaccgcaagaagacggaaaa 51871905  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | ||||||| |||||||||    
T  51871904 gcaaacaacgtcgcacaaga 51871885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28035359 - 28035161
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||    
T  28035359 aaactcacaacatcaaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatttatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctg 28035260  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || | ||||| |||||||||||||||||    
T  28035259 caatgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgtacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaaga 28035161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 51 - 246
Target Start/End: Original strand, 5324420 - 5324617
Alignment:
Q  51 aacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgc 149  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||    
T  5324420 aactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgaaatatccatggcccccggatctgc 5324519  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||| |||||  ||||||||||    
T  5324520 aacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaaaaagacgggaaatcaaacaataccgcacaaga 5324617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Original strand, 7311949 - 7312153
Alignment:
Q  32 aaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatac 131  Q
    |||||| ||| ||| || ||||||| || ||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7311949 aaagataaatctgcgaacaaacttataatatccaagttaatagtatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccgaaatac 7312048  T
Q  132 ccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatcca 230  Q
     |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |    
T  7312049 tcatgcaaccggatctgcaatgttgacgtccaaatctttgtttgaattatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagacggaaaatcaa 7312148  T
Q  231 acaac 235  Q
    |||||    
T  7312149 acaac 7312153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 25406124 - 25406343
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25406124 gtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaa 25406223  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||||| | || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || || | |||    
T  25406224 tatccatgacctctggatctgcaacgttgacgtcgaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaa 25406323  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | ||||||||| |||||||    
T  25406324 gcaaacaacgccacacaaga 25406343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 253
Target Start/End: Original strand, 9687045 - 9687270
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9687045 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 9687144  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||  ||| || || ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |  | |||    
T  9687145 tattcatggcctctggatctgcaac-ttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagatgggaaa 9687243  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaagatgccgaa 253  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||    
T  9687244 tcaaacaacgccgcacaagatgacgaa 9687270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Original strand, 50165939 - 50166125
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  50165939 gtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccagaa 50166038  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  50166039 tacccatggcctccggatctacaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgca 50166125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 38520375 - 38520590
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  38520375 gtaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggtataatgcctacaaaaatatacgataaaattaaagtgactggaa 38520474  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaat 227  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||   |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||| | ||||    
T  38520475 tatccatgcctccgaatctgcaacgttgacgcaca---atttgatttaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacgggaaat 38520571  T
Q  228 ccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  38520572 caaacaacgccacacaaga 38520590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30879309 - 30879098
Alignment:
Q  36 atgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat 135  Q
    |||||| ||| || ||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  30879309 atgaatctgcgaacaaactcacaacatcatagttaatagtatataacaacataatgtctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgatcggaatatccat 30879210  T
Q  136 -gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaaca 233  Q
     || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||    
T  30879209 tgcctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatatttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaaca 30879110  T
Q  234 acgccgcacaaga 246  Q
    ||| |||||||||    
T  30879109 acg-cgcacaaga 30879098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9172731 - 9172512
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9172731 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcaaatagcggcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaa 9172632  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || | || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || || | |||    
T  9172631 tatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaa 9172532  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | |||||||||||||||||    
T  9172531 gcaaacaacgccgcacaaga 9172512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9180713 - 9180494
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9180713 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcaaatagcggcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaa 9180614  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || | || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || || | |||    
T  9180613 tatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaa 9180514  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | |||||||||||||||||    
T  9180513 gcaaacaacgccgcacaaga 9180494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7342963 - 7342744
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7342963 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacatcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaa 7342864  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||  || || | |||    
T  7342863 tatccatggtctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaacgcaagaagacgggaaa 7342764  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | |||||||||||||||||    
T  7342763 acaaacaacgccgcacaaga 7342744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 33291258 - 33291477
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33291258 gtaaatgatgaatctgctaacaaactcacagcatccaagttaacagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 33291357  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |   || ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||    
T  33291358 tatccatcgcctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaattacttatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgacgacggaaaa 33291457  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  33291458 tcaaacaacaccgcacaaga 33291477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 51868485 - 51868704
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  51868485 gtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcatcggaa 51868584  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||  ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || ||   |||    
T  51868585 tattcatggtctccagatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataagaataaaatgaacaccgcaagaagacgagaaa 51868684  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | |||||||||||||||||    
T  51868685 gcaaacaacgccgcacaaga 51868704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 39927396 - 39927613
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| || ||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  39927396 taaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccaaattaataagatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgattggaat 39927495  T
Q  130 acccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgatt-gaaaatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatc 228  Q
    || ||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| || || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || | |||||    
T  39927496 actcatgtcttcggatctgcaacgttgacatccaaattttttattggataaccgatctttcaatatgaaacaaatgaacaccgcaacaagacgggaaatc 39927595  T
Q  229 caacaacgccgcacaaga 246  Q
     ||||||||| |||||||    
T  39927596 aaacaacgccacacaaga 39927613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 253
Target Start/End: Original strand, 48365627 - 48365831
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| | ||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||  ||||||||||    
T  48365627 aaactcacagcatccaagttaataacttataacgacataattcctacaaaaatatatgataaaattaaagtaatcggaatacttatgctcccggatctgc 48365726  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaagatg 248  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  48365727 aacgttgacgttcaaatctttgattgaataatcgatccttcaatatgaatcaaatgaacaccgctacaagacaaaaaatcaaacaacgttgcacaagatg 48365826  T
Q  249 ccgaa 253  Q
     ||||    
T  48365827 acgaa 48365831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Original strand, 30818218 - 30818378
Alignment:
Q  56 acaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgt 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||| ||||||    
T  30818218 acaacatccaagttaatagcatataacgctataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggccaccggatctacaacgt 30818317  T
Q  155 tgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcac 214  Q
    | ||| | |||| |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30818318 taacgcctaaatctttgattgaataatcgatctttcgataagaatcaaatgaacaccgcac 30818378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20266543 - 20266356
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20266543 gtaaaggatgaatctgcgaataaactcacaacatccaagttaattgcatataacggcataatgtctacaaaagtatatgatgaaattaaagtgactggaa 20266444  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcac 214  Q
     | ||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20266443 catccattgcctccgaatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgtccaccgcac 20266356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40646894 - 40646700
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca-tgcatccggatctg 148  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||    
T  40646894 aaactcacaacatccaagataatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattatagtgaccagaatatccattgcctccggatctg 40646795  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-----aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgcc 238  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||      |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || || | ||||| |||||||||    
T  40646794 caacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatcgatctttcaatatgaatcaaataaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgcc 40646700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Original strand, 45805669 - 45805854
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45805669 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaata-catataacgacataatacctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaa 45805767  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  45805768 tatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatcggaatgaaatgaacaccgca 45805854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 101 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31836975 - 31836829
Alignment:
Q  101 atatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatc 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31836975 atatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgctccggttctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaacaatcgatttttcaatatgaatc 31836876  T
Q  200 aaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||||||| || || | ||||| |||||| ||||||||||    
T  31836875 aaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacaccgcacaaga 31836829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 245
Target Start/End: Original strand, 41081544 - 41081762
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    |||||| |||||| ||  || ||||| ||||||||  |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  41081544 gtaaaacatgaatctgtgaacaaactcacaacatccgagttaataacatataactgcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaaatgaccagaa 41081643  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgat-ttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||  ||  |||    
T  41081644 tacacatgcctccggatctgcaacattgatgctcagatttttgattgaataatcgatcttttcaatatgaatcatatgaacactgcaacaaggcatgaaa 41081743  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaag 245  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  41081744 ttaaacaacgccgcacaag 41081762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9919630 - 9919411
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||| ||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9919630 tgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgc-tacaaaaatatatgatcaaattaaagtcaccgga 9919532  T
Q  128 atacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaa 225  Q
    |||  ||| || ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || || | ||    
T  9919531 atattcatggcctccggatttgcaacattgacgttcaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaa 9919432  T
Q  226 atccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | | |||||||||| ||||||    
T  9919431 agcaaacaacgccgtacaaga 9919411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14545724 - 14545573
Alignment:
Q  63 ctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  14545724 ctaagttaatagcgtataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaaatgatcggaatactcatggcctccggatctgcaacgttgacgcc 14545625  T
Q  162 caaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  14545624 caaatctttgattgaataatcga-tcttcaaaataaatcagatgaacaccgca 14545573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34519369 - 34519156
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||  ||| |||||||||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34519369 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaggatccaagttaatagcaaataatgacataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 34519270  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || ||||||||||||||||    ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||   |||    
T  34519269 tatccatggcctccggatctgcaacgt----gtccaaatcgttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccacaagaagacgagaaa 34519174  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaa 244  Q
    || |||||||||||||||    
T  34519173 tcaaacaacgccgcacaa 34519156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3871628 - 3871430
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg-catccggatctg 148  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||| | || |||||||    
T  3871628 aaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgttaaaattatagtgaccgaaatatacatgacctctggatctg 3871529  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttc-aatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||  || || | ||||| |||||||| ||||||||    
T  3871528 caacgttgacacccaaatctttgattgaataatcgatctttcaaatataaatcaaa-gaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacaacgctgcacaaga 3871430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11454178 - 11453957
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatg--acggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgg 126  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||   | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  11454178 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatatataatggcataatgcctacataaatatatgataaaattaaagtgaccag 11454079  T
Q  127 aatacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaa 224  Q
    |||| | ||| | ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||  || || | |    
T  11454078 aatatctatgacctccggatctgcaatgttgacgctcaaatctttgattgaataatcgctctttcaagatgaatcaaatgaataccgcaaaaagacggga 11453979  T
Q  225 aatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||| |||| ||| ||||||||    
T  11453978 aatcaaacagcgctgcacaaga 11453957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19723554 - 19723405
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  19723554 gtaaaggatgaatctgcgaataaactcacagcatccaagttaataacatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtaaccgaaa 19723455  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19723454 tatccatcgcctccggatctgctacgttgacgcccaaatctttgattgaa 19723405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Original strand, 11709547 - 11709648
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11709547 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaaattaatagcatatcacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 11709646  T
Q  129 ta 130  Q
    ||    
T  11709647 ta 11709648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27872978 - 27872760
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  27872978 gtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacattcaagttaataacatataacggcataatgcttacaaaaatatatgataaaattaaaatgattggaa 27872879  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaat 227  Q
    ||  || || | | ||||| |||||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||  || ||| |||||    
T  27872878 tattcacgccttccgatctacaacgttgacgctcaaatctttaattgaataatcgatccttcaatttgaattaaatgaacaccgcaagaagacaaaaaat 27872779  T
Q  228 ccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | ||||||| || ||||||    
T  27872778 caaacaacgtcgaacaaga 27872760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 32676975 - 32677119
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||| |||||||||     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32676975 gtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaata-----taacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaa 32677069  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    || |||| || |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32677070 tatccatcgcctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 32677119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 177
Target Start/End: Original strand, 33817029 - 33817157
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||    
T  33817029 aaactcacatcatccaagttaataacatataatgacataatgcctacaaaaatatatgagaaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctg 33817128  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  33817129 caacgttgatatccaaatctttgattgaa 33817157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 177
Target Start/End: Original strand, 33876499 - 33876627
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||    
T  33876499 aaactcacatcatccaagttaataacatataatgacataatgcctacaaaaatatatgagaaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctg 33876598  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  33876599 caacgttgatatccaaatctttgattgaa 33876627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 47133135 - 47132999
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||| ||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||| |||    
T  47133135 gtaaaggataaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaa-atatgatgaaatctaaatcaccagaa 47133037  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47133036 tactcatgcttccggatctgcaatgttgacgtccaaat 47132999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Original strand, 31130432 - 31130541
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||| ||  || ||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  31130432 tgtaaaggatgaatatgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagaatataacgacataatgcctacaaaaatacataataaaattaaagtgaccgga 31130531  T
Q  128 atacccatgc 137  Q
    | ||||||||    
T  31130532 acacccatgc 31130541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 48217679 - 48217596
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataa 111  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  48217679 tgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataa 48217596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14872863 - 14872735
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||  ||||||||||    
T  14872863 tgaatatgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccaaaatacccatg 14872765  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14872764 cttccggatctgcaacgttgacgcccaaat 14872735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Original strand, 37720009 - 37720145
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||   || | | |||||||||||| | ||||||||||||  || | ||| |||    
T  37720009 gtaaaaggtgaatttgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcattccacagaaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaaataaccagaa 37720107  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||    
T  37720108 tacccatgcttttggatctgcaacgttgacgcccaaat 37720145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 36775578 - 36775717
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||||| |||||||||    
T  36775578 tgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgatgaaatctaaatcaccgggatacccatg 36775676  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
      || |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  36775677 tttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 36775717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 7337531 - 7337659
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | |||||||||||||   || | | |||||||||||| | |||||||||||  ||| | |||| ||||||||||    
T  7337531 tgaatctgcgaacaaactcacaacagccaagttaatagcatgcaacagcaaaatgcctacaaata-atatgataaaaccaaaatcaccgaaatacccatg 7337629  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  7337630 cttccggatctgcaacgttgacgtgcaaat 7337659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 130
Target Start/End: Original strand, 27914965 - 27915045
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaata 130  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27914965 aaactcacagcatccaaattaatagcatataacgacaaaatacctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaata 27915045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 32395209 - 32395094
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||   ||| | |||||||| ||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| | || ||||||    
T  32395209 aaacttacagcacccaagttaatagcatacagcggcaaaatgcctataaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgctttcgaatctgc 32395111  T
Q  150 aacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||||||||    
T  32395110 aacgttgacgtccaaat 32395094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 166
Target Start/End: Original strand, 35484272 - 35484387
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | ||||| |||||| | |||||||||||   || | |||| ||||||||||| | |||||||||    
T  35484272 aaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcttacaaata-atatgataaaaccgaaatcaccgaaatacccatgctttcggatctgc 35484370  T
Q  150 aacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||||||||    
T  35484371 aacgttgacgtccaaat 35484387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 31837076 - 31836989
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaatt 115  Q
    |||||| ||| ||| ||| || ||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31837076 tgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacagtatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaatt 31836989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 166
Target Start/End: Original strand, 32679007 - 32679137
Alignment:
Q  35 gatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca 134  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||  || | |||  ||||| ||    
T  32679007 gatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatggcatataacggcaaaatgcctacaaaaa-atatgatgaaatctaaatcaccataatactca 32679105  T
Q  135 tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  32679106 tgcttccggatttgcaatgttggcgtccaaat 32679137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 166
Target Start/End: Original strand, 21947537 - 21947614
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21947537 aatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatattcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 21947614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 45415731 - 45415654
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45415731 aatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatacctatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 45415654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 5984032 - 5983932
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  5984032 aagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaacataagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcagcgttgacgcccaa 5983934  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  5983933 at 5983932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Original strand, 13144671 - 13144819
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||  | || | |||||||||||| || |||||||||||  |||| || | |    
T  13144671 tgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaatggcaaaatgcctacaaatat-tatgataaaatctaagtcactgaa 13144769  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||| ||||| | | |||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  13144770 atactcatgctttcagatctgcaaaattgacgtccaaatcattgattgaa 13144819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 48750409 - 48750281
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||| |||||||||||    
T  48750409 tgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatg 48750311  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | |  |||||||||||||||||| ||||||    
T  48750310 cttatggatctgcaacgttgacgcccaaat 48750281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39888406 - 39888267
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| || ||| | ||||||||||||  |||| |||| ||||||  ||    
T  39888406 tgaatctgcgaataaactcacaacatctaagttaatagcatacaacgataaaatgcatataaaga-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacctgtg 39888308  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |   ||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  39888307 cgctcggatctacaacgtggacgcccaaatcattgattgaa 39888267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44543504 - 44543357
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| || | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||| |||  || | ||  |||    
T  44543504 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata-atatgatataatctaaatcactagaa 44543406  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  44543405 tactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 44543357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44915871 - 44915724
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| || | ||||  ||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||||  |||  |||| ||    
T  44915871 gtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacatcacccaagtcgatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagaaaccgaaa 44915773  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||    
T  44915772 tactcatgcttccggatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 44915724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19061140 - 19060994
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||| |||  || | ||| ||||    
T  19061140 taaaagatgaatgtgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgatataatctaaatcaccagaat 19061042  T
Q  130 acccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    || | | | || |||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  19061041 actcttccttctggatctacaacattgatgtccaaattattgattgaa 19060994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 177
Target Start/End: Original strand, 24597280 - 24597331
Alignment:
Q  126 gaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24597280 gaatacccatgcttccggatctacaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 24597331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 35461982 - 35462041
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtcc 162  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35461982 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacacatgcttccggatctgcaacgttgacgtcc 35462041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31317960 - 31317795
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||||||| || ||||| ||| || | |||||||||| ||   ||| || |||||||||||| | |||||||||| |  || | |||| |||| |||||    
T  31317960 tgaatttgcgaacaaactcacatcacccaagttaataggatgcaacgataaaatgcctacaaata-atatgataaattctaaatcaccgaaatatccatg 31317862  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaaaa-tcgatttttcaatatgaatcaaa 202  Q
    | ||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  31317861 cttccgggtctgtaacgttgacgcccaaatcattgattgaaaagttgatctttcaataggaatcaaa 31317795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31984320 - 31984208
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattga---aaatcgatttttcaatatgaatc 199  Q
    |||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||   |  ||||| |||||||| |||      
T  31984320 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatttgcaacgttgacgcccaaatcattgattgactgatgtcgatatttcaataggaact 31984221  T
Q  200 aaatgaacaccgc 212  Q
    |||||||||||||    
T  31984220 aaatgaacaccgc 31984208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4413287 - 4413209
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaata 167  Q
    |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4413287 aatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatattcatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaata 4413209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5856141 - 5856012
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||  ||||||||||||||  |||| | |||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||    
T  5856141 gtaaatgatgaatttgtgaacaaatttgcaacattcaagttaatagcatacaacggcaaaatttctacaaata-atatggtaaaattaaagtgattggaa 5856043  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    |||| ||||||||  | |||||| |||||||    
T  5856042 taccaatgcatccaaacctgcaatgttgacg 5856012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16262926 - 16262864
Alignment:
Q  182 gatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||   ||||| |||||||||||||||    
T  16262926 gatttttcaatatgaatcaaacgaacaccacaacaagacgcgaaatcaaacaacgccgcacaa 16262864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26535503 - 26535445
Alignment:
Q  108 ataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26535503 ataaaatctaagtcaccggaatactcatgcttccggatctgcaacgttgaagcccaaat 26535445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 163
Target Start/End: Original strand, 34412960 - 34413085
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||| ||||  || | | |||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||| |||||||||||    
T  34412960 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaaccgcaaaatgcctacaaata-atatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatg 34413058  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtcca 163  Q
    | || |||||| |||||||||||||||    
T  34413059 cttctggatctacaacgttgacgtcca 34413085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 6017756 - 6017652
Alignment:
Q  35 gatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca 134  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||  || ||||| || ||| | |||||||||||| || || || | ||||||||    
T  6017756 gatgaatctgcaaataaattcacaacatccaagttaatagtatataacaataaaatgcatataaata-atatgataaaataaatgtaactgaaataccca 6017658  T
Q  135 tgcatc 140  Q
    ||||||    
T  6017657 tgcatc 6017652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 27456716 - 27456667
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcata 78  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  27456716 gtaaaagatgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcata 27456667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 211
Target Start/End: Original strand, 33817172 - 33817205
Alignment:
Q  178 aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccg 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33817172 aatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccg 33817205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 211
Target Start/End: Original strand, 33876642 - 33876675
Alignment:
Q  178 aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccg 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33876642 aatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccg 33876675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 49504491 - 49504591
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| || |||| |||||   || | |||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  49504491 aagttaatagcatacaacggtaaaatgcctaaaaatat-tatgttaaaacccaaatcaccgaaacactcatgcttccggatctgcaacgttgacatccaa 49504589  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  49504590 at 49504591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4397097 - 4397025
Alignment:
Q  142 ggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaaa-atcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  4397097 ggatctgcaacgttcacgcccaaatcattcattgaatgatcgatttttcaataagaatcaaaggaacatcgca 4397025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 166
Target Start/End: Original strand, 7836657 - 7836792
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||| ||| || | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| |||    
T  7836657 taaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaat 7836755  T
Q  130 acccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
     | ||||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||    
T  7836756 tcacatgcctccagatattcaacgttgacgcccaaat 7836792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12635231 - 12635171
Alignment:
Q  186 tttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  ||| ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  12635231 tttcaatatgaaccaaatgaacaccactacaaaacgtaaaatcaaacaacgccgcacaaga 12635171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24583146 - 24583035
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||| ||||  |||| | |||||||||||| | |||||||| |||  || | ||| |||||  | ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24583146 aagttaatatcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgatataatctaaatcaccagaatattcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaa 24583048  T
Q  165 atatttgattgaa 177  Q
    ||  |||||||||    
T  24583047 atcattgattgaa 24583035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 159
Target Start/End: Original strand, 32873797 - 32873853
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  32873797 atatgataaaatcaaagtgatcgaaatacccatgtttctggatctgcaacattgacg 32873853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 159
Target Start/End: Original strand, 44513834 - 44513870
Alignment:
Q  123 ccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44513834 ccggaatacccatgtctccggatctgcaacgttgacg 44513870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44637503 - 44637443
Alignment:
Q  186 tttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| || | ||| | ||||||| |||||||||    
T  44637503 tttcaatatgaatcaaatgaacaccgtaacaagacgggaaaccaaacaacgtcgcacaaga 44637443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34881955 - 34881738
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34881955 taaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatataattaaagtga-cggaat 34881857  T
Q  130 acccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaat 227  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||    
T  34881856 atccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaat 34881757  T
Q  228 ccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | |||||||||||||||||    
T  34881756 caaacaacgccgcacaaga 34881738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 27266699 - 27266918
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27266699 gtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 27266798  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  27266799 tatccatgacctccggatctgcaacgttgacggtcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 27266898  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  27266899 tcaaacagtgccgcacaaga 27266918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 41184280 - 41184499
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41184280 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgccggcaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaa 41184379  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || || | |||    
T  41184380 tatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaacgaacaccacacgaagacgggaaa 41184479  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  41184480 tcaaacaacgccgcacaaga 41184499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Original strand, 2057699 - 2057897
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  2057699 aaactcacaacatctaagttaactgcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattatagtgaccggaatatccatggcatctggatctg 2057798  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||| |||||    
T  2057799 caacgttgacgctcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcgcaaga 2057897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 3271242 - 3271461
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| | |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3271242 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcataacatccaagttaatagcatataacgacataatgcttacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcggaa 3271341  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  3271342 tatccatggtctcctgatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattaaataatggatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaa 3271441  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  3271442 tcaaacaacgctgcacaaga 3271461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4954232 - 4954012
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||| ||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4954232 tgtaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatcaaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccgga 4954133  T
Q  128 atacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaa 225  Q
    |||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || || | ||    
T  4954132 atattcatggcctccgaatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaa 4954033  T
Q  226 atccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |   |||||||||||||||||    
T  4954032 agaaaacaacgccgcacaaga 4954012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10649856 - 10649664
Alignment:
Q  56 acaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgt 154  Q
    |||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  10649856 acaacatccaatttaataccatataacggcataatgcctacaaaaacatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgt 10649757  T
Q  155 tgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||  || |||||||||||||||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||    
T  10649756 tgacgcccaaatatttgattgaataataaatttttctgtaagaatcaaatgaacaccgcacgaagacggtaaatcaaacaacgccgcacaaga 10649664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16981524 - 16981310
Alignment:
Q  36 atgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaat--atatgataaaattaaagtgaccggaataccc 133  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16981524 atgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgatataatgcctacaaaaatatatatgataaaattaaagtcaccggaatatcc 16981425  T
Q  134 atg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaa 231  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||||  ||    
T  16981424 atgacctccggatctgcaacgatgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaaggaacaccgcaagaagacggaaaattaaa 16981325  T
Q  232 caacgccgcacaaga 246  Q
    ||| |||||||||||    
T  16981324 caatgccgcacaaga 16981310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Original strand, 19259673 - 19259839
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  19259673 aaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctttggatctg 19259772  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcac 214  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19259773 caacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaataaacaccgcac 19259839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 246
Target Start/End: Original strand, 18677311 - 18677524
Alignment:
Q  35 gatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca 134  Q
    ||||||| ||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18677311 gatgaatctgcgaacaaacacacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcttacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatcca 18677410  T
Q  135 t-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaac 232  Q
    | |  ||||||||||||| ||||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||| |||    
T  18677411 tggtctccggatctgcaatgttgacgccaaattatttgattaaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgtacgaagacggaaaatcaaac 18677510  T
Q  233 aacgccgcacaaga 246  Q
    |||| | |||||||    
T  18677511 aacgtcccacaaga 18677524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 228
Target Start/End: Original strand, 20257536 - 20257736
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||  || ||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20257536 gtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 20257635  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaat 227  Q
    |||||| |  ||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  20257636 tacccacgtttccggatctacaacgttgacgcgcaaatctttgattgaataatcgatacttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagacggaaaat 20257735  T
Q  228 c 228  Q
    |    
T  20257736 c 20257736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7247198 - 7246979
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7247198 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaa 7247099  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattg-aaaatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||  || |||| |||    
T  7247098 tatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattgtataatcgatctatcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacaggaaa 7246999  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
       || ||||||||||||||    
T  7246998 aaaaataacgccgcacaaga 7246979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26578455 - 26578272
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtcca 163  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  26578455 aagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccgaaatattcattgcttccggatctgcaacattgacgccca 26578356  T
Q  164 aatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || | ||||| ||||||| |||||||||    
T  26578355 aatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacactgcacgaagacgggaaatcaaacaacgtcgcacaaga 26578272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42580091 - 42579908
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtcca 163  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  42580091 aagttaatagcatataacggcataatatctgcaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttgacgccca 42579992  T
Q  164 aatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42579991 aatctttgattgaataatcgatctttaaatatgaataaaatgaacactgcacgaagacagaaaatcaaacaacgtcgcacaaga 42579908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15571140 - 15570956
Alignment:
Q  35 gatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca 134  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15571140 gatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatacaca 15571041  T
Q  135 tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaata 219  Q
    ||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15571040 tgactccggatgtgcaacgttaacgtccaattatttgattgaataataga-tcttcaatatgaatcaaatgaacaccacaacaata 15570956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Original strand, 19280807 - 19281004
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  19280807 aaactcacaacatccaagttaatagcatataacgc-ataatgcctacaaaaatatatgataatattaaagtcaccggaatatccatagcctccggatctg 19280905  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||  || |  ||||| | |||||||| ||||||||    
T  19280906 caacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacactgcaagaagatggaaaagcaaacaacgctgcacaaga 19281004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43148967 - 43148751
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43148967 tgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccgga 43148868  T
Q  128 atacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaaaatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||   | ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||  || || | |||    
T  43148867 atatccatggcctccagatctgcaacgttgaggtccaaatctttga---ataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaacgcaagaagacgggaaa 43148771  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | |||||| ||||||||||    
T  43148770 gcaaacaacaccgcacaaga 43148751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 781621 - 781442
Alignment:
Q  35 gatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca 134  Q
    ||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  781621 gatgaatctgcgaatatactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatcca 781522  T
Q  135 t-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    | || |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  781521 tggcttccggatctgcaacgttgacgctcaaatttttgattgaataattga-tcttcaaaatgaatcagatgaacaccgca 781442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7242023 - 7241803
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagt-gaccgga 127  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  7242023 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaaccgga 7241924  T
Q  128 atacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattg-aaaatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaa 225  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||  || |||| ||    
T  7241923 atatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattgtataatcgatctatcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacaggaa 7241824  T
Q  226 atccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |   || ||||||||||||||    
T  7241823 agaaaataacgccgcacaaga 7241803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42886696 - 42886498
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgc---atccggatc 146  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    | ||||||    
T  42886696 aaactcacaacattcaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatattataaaattaaattgaccggaata-ccatgccgtcttcggatc 42886598  T
Q  147 tgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaag 245  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||    
T  42886597 tgcaacgttgacgt-caaatctttgattgaataatcgatcttttaatatgaatcaaatgaacactgcaacaaggcgggaaatcaaacaacgccgcacaag 42886499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30298421 - 30298228
Alignment:
Q  56 acaacatctaagttaatagcatatg--acggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaac 152  Q
    |||||||| |||||||||||||||   || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||    
T  30298421 acaacatccaagttaatagcatatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtggccggaatatccatggcctccagatctgcaac 30298322  T
Q  153 gttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||| |||| ||||||||||||    
T  30298321 gttgacgcccaaatctttgattgaataatc-aatcttcaatatgaatcaaataaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacagcgccgcacaaga 30298228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Original strand, 7150196 - 7150394
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |  ||||||||||    
T  7150196 aaactcacagcatccaaattaatagcatataacggcataatgactacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccgaaatatccatggtctccggatctg 7150295  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||  |||| ||||||||||||||  || || | ||| | |||||||||||||||||    
T  7150296 caacgttgacgtccaaatctttgattgaataattgatctttcaatgggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaaga 7150394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 230
Target Start/End: Original strand, 22978764 - 22978966
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||| ||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  22978764 gtaaaggatgaatttgcgaataaacttaaatcatccaaactaatagcatataacggcataatggctacaaaaatattttataaaatgaaagtgaccgaaa 22978863  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaat 227  Q
    ||||||||| || | |||||||| ||||||| |||||| ||||||| || |||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  22978864 tacccatgcctcagaatctgcaatgttgacgcccaaatctttgatttaataatttttctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaaaacggaaaat 22978963  T
Q  228 cca 230  Q
    |||    
T  22978964 cca 22978966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 246
Target Start/End: Original strand, 43261716 - 43261878
Alignment:
Q  86 ataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcga 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  43261716 ataatgcctacaaaaatatatgataacattaaagtgaccggaatatccatgaccttcggatctgcaactttgactcccaaatctttgattgaataatcga 43261815  T
Q  184 tttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  43261816 tttttcaatatgaatcaaataaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacaacaccgcataaga 43261878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 213
Target Start/End: Original strand, 35475205 - 35475363
Alignment:
Q  56 acaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgt 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || | |||||||||||    
T  35475205 acaacatccaagttaatagcatataacgacgttatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatggcttctgaatctgcaacgt 35475304  T
Q  155 tgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35475305 tgacgcccaaatctttgattgaataatcgatcttt-aatatgaatcaaatgaacaccgca 35475363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27752164 - 27751979
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||||||||| | | || | ||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27752164 gtaaaagatgaatctacgaacatactcacagcatccaagttaatagcatataatggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 27752065  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    || | || || ||| ||||||||||||||||  ||| || |||||| ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27752064 tatctatggcctccagatctgcaacgttgacacccatatctttgatcgaataatc-aatattcaatatgaatcaaatgaacaccgca 27751979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 21060150 - 21060304
Alignment:
Q  56 acaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgt 154  Q
    |||||||| ||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  21060150 acaacatccaagttgatagaatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgt 21060249  T
Q  155 tgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacac 209  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||| |||||| | ||||||||    
T  21060250 tgacgcccaaatctttgattgaataatcga-tcttcaaaatgaattagatgaacac 21060304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28235827 - 28235605
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatg--acggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccg 125  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28235827 tgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcg 28235728  T
Q  126 gaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacaga 223  Q
     |||| |||| || ||| ||||| || | |||||| |  ||| |||||||||| | | ||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || |  ||    
T  28235727 aaatatccatggcctccagatctacatctttgacgcctgaatctttgattgaatacttgatctttcaataagaataaaatgaacaccgcaagaagatgga 28235628  T
Q  224 aaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  28235627 aaatcaaacaacgccgcacaaga 28235605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11768232 - 11768062
Alignment:
Q  35 gatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca 134  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||    
T  11768232 gatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagataatagcatataacggcataatggctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccataata--ca 11768135  T
Q  135 tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaa 206  Q
    ||| ||| ||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11768134 tgcctccagatttgcaacattgacgctcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaattaaatgaa 11768062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30299083 - 30298952
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || | ||| | |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30299083 gtaaaggatgaatctgcgaacatactcagaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccagaa 30298984  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    || |||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  30298983 tatccatggcatccagatctgcaatgttgacg 30298952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Original strand, 7612898 - 7613084
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgacc-gga 127  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||  || |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |    
T  7612898 gtaaaagatgaatttgcgaacaaactcacaacattcaatttaatagcatagaacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaacttggccaaaa 7612997  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| ||||||  || ||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7612998 atactcatgccttcggatctgcaatgttgacaccccaatcttaaattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 7613084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 7886779 - 7886985
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||||||||| ||  || ||||| |||  ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  7886779 gtaaaagatgaatctgtgaacaaactcacagtatccaagttaatagcatataacagaataatgcctacaaaaa-atatgataaaactatagtgaccggaa 7886877  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||  || || |||||    
T  7886878 tatccatgacctccggatctgcaacgttaatgccaaaatctttgattgaataatcgatcttttaatatgaatcagacaaacaccgcaagaagacggaaaa 7886977  T
Q  227 tccaacaa 234  Q
    || |||||    
T  7886978 tcaaacaa 7886985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30371849 - 30371739
Alignment:
Q  144 atctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcac 242  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |  | ||||| |||||||||||||    
T  30371849 atctgcaatgttgacgtccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaattaaatgaacaccgcacgaagatgggaaatcaaacaacgccgcac 30371750  T
Q  243 aagatgccgaa 253  Q
    |||||| ||||    
T  30371749 aagatgacgaa 30371739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13007449 - 13007321
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  13007449 tgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatg 13007351  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13007350 cttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 13007321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38598017 - 38597889
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||||||   |||| || | ||||||||||    
T  38598017 tgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcactgaaatacccatg 38597919  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38597918 cttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 38597889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34945613 - 34945485
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||  | |||||||| ||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  34945613 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctataaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatg 34945515  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34945514 cttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 34945485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 246
Target Start/End: Original strand, 36344442 - 36344550
Alignment:
Q  139 tccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaaaa-tcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgc 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||    
T  36344442 tccggatctgcaatgttcacgcccaactctttgattgaaaaattaatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaaaaaaacggaaaatcaaacaacgc 36344541  T
Q  238 cgcacaaga 246  Q
    |||||||||    
T  36344542 cgcacaaga 36344550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 9113621 - 9113721
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9113621 aagttaatagcatacaacggaaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatatctatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 9113719  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  9113720 at 9113721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 2979174 - 2979313
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||| |||||||| ||    
T  2979174 tgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcacaatgcctacaaata-atatgatgaaatctaaatcaccagaatacccgtg 2979272  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  2979273 cttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 2979313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13422161 - 13422014
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||| | | ||||||||||||  |||| |||| ||    
T  13422161 gtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacggaaaaatgcctacatata-atatgataaaatataagtcaccgaaa 13422063  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||| ||||| || | ||||||||| |||||| ||||||  |||||||||    
T  13422062 tacacatgcttcagaatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 13422014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 112
Target Start/End: Original strand, 43008155 - 43008238
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaa 112  Q
    ||||| ||| ||||||  || ||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43008155 gtaaaggataaatttgagaacaaactcataacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 43008238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14211447 - 14211310
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  || | | |||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||| |||||||||||    
T  14211447 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacagaaaaatgcctacaaata-atatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatg 14211349  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattg 175  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14211348 cttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattg 14211310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 245
Target Start/End: Original strand, 27576298 - 27576408
Alignment:
Q  136 gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaa 234  Q
    ||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||| || | ||||| |||||    
T  27576298 gcatccgcatatgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatataaaataaatgaacaccgcaacaagacgggaaatcaaacaa 27576397  T
Q  235 cgccgcacaag 245  Q
    || ||||||||    
T  27576398 cgtcgcacaag 27576408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 6012034 - 6012134
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||| ||| | |||| || | ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  6012034 aagttaatagcataaaacggtagaatgcctacaaata-atatgatcaaacttaagtcactgaaatacccatgcttccggatctacaacattgacgtccaa 6012132  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  6012133 at 6012134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6217067 - 6216979
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  6217067 aatgcctacaaata-atatgataaaatttaagtcaccgaaatacacatgcttccgaatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 6216979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 25980377 - 25980250
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| | || ||||||||||    
T  25980377 tgaatctgcaaacaaactcacatcacccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtca-cgaaatacccatg 25980280  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | |||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  25980279 cttccgaatctgcaactttgacgcccaaat 25980250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 157
Target Start/End: Original strand, 41418605 - 41418690
Alignment:
Q  72 tagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttga 157  Q
    |||||||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| ||| |||||    
T  41418605 tagcatataacgacataatgtccacaaaaatatatgataaaattaaagtgagcggaatatccatgtctccggatctacaatgttga 41418690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 246
Target Start/End: Original strand, 19100552 - 19100696
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaaaatcgatt-tttcaatatgaatcaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |   |||||| |||||||| || |||||  ||||||||| | | | | |||||||| |||||||    
T  19100552 atatgataaaattaaagtgactggaatactcatgtcttaagatctggaacgttgatgttcaaatcattgattgaataaccactctttcaataggaatcaa 19100651  T
Q  202 atgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||| | ||||||| |||||||||    
T  19100652 atgaacaccgtaccaagacaagaaaccgaacaacgtcgcacaaga 19100696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 166
Target Start/End: Original strand, 11976794 - 11976931
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||  |||| | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| |    
T  11976794 tgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataacataaaacgggaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaa 11976892  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    || | ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  11976893 attcacatgcttccagatcttcaacgttcacgtccaaat 11976931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6446036 - 6445963
Alignment:
Q  104 tatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || | |||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  6446036 tatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgtcttcgaaactgcaacgttgacgtctaaacctttgattgaa 6445963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 31391621 - 31391749
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||  || | | |||||||||| | | |||||||||||   |||| |||| ||||| |||     
T  31391621 tgaatttgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacagaaaaatgcctacatata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatc 31391719  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||    
T  31391720 cttctggatctgcaacgttgacgcccaaat 31391749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13468835 - 13468708
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  | |||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |  |||    
T  13468835 taaatgatgaatttacgaacaaactcacaaaatcaaagttaatagcatatgacgacaaaatgcctacacata-atatgataaaactaaagtgatcaaaat 13468737  T
Q  130 acccatgcatccggatctgcaacgttgac 158  Q
    ||  |||  |||| |||||||||||||||    
T  13468736 actgatgtttccgaatctgcaacgttgac 13468708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 26877969 - 26878115
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||  |||  | | |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||  ||    
T  26877969 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatag-atacaacgacaaagtgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccaaaa 26878066  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  26878067 tacccatgcttctggatctgcaatgttgacgcccaaatcattgattgaa 26878115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 35920864 - 35921003
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||| | || |||||||||||  | |  | |||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||  ||||| | |||    
T  35920864 tgaatctgcaaacaaatttacaacaccaaatttaatagcatacaatgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatcaaaatcactagaatatcgatg 35920962  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  35920963 cttccggatctgcaacgttgacgttcaaatcattgattgaa 35921003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41630709 - 41630583
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||  | |||| ||||||| | ||||||||||||  |||| || | ||||| ||||| || |||| |||    
T  41630709 aaactcacaacacctaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacaaata-atatgataaaatctaagtcacggaaatacacatgcttctggatgtgc 41630611  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  41630610 aacgttgacgcccaaatcattgattgaa 41630583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10722930 - 10722842
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  10722930 aatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttttggatctacaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 10722842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 24229680 - 24229780
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||||||   |||| || | |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  24229680 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcacagaaatatccatgctaccggatctgcaacattgacgtccaa 24229778  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  24229779 at 24229780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Original strand, 28540802 - 28540913
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||| ||||||| | ||||||| ||||  || | |||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  28540802 aagttaatagcatacaacggaaaaatgtctacaaata-atatgatgaaatctaaatcaccaaaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaa 28540900  T
Q  165 atatttgattgaa 177  Q
    ||  |||||||||    
T  28540901 atcattgattgaa 28540913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 171
Target Start/End: Original strand, 14082287 - 14082397
Alignment:
Q  60 catctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    |||| ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |  | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14082287 catcgaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcattgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgatg 14082385  T
Q  160 tccaaatatttg 171  Q
     |||||| ||||    
T  14082386 cccaaatctttg 14082397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15571641 - 15571567
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||||||||||| |||| || | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  15571641 atatgataaaatttaagtcactgaactactcatgcttccggatctgcaacgttgacacccaaatcattgattgaa 15571567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 159
Target Start/End: Original strand, 33486404 - 33486437
Alignment:
Q  126 gaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33486404 gaatacccatgcctccggatctgcaacgttgacg 33486437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 156
Target Start/End: Original strand, 10332443 - 10332534
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaat-taaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttg 156  Q
    ||||||||||||||| | |  | |||||||||||||| ||||||| |||| |||| | | | |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10332443 aagttaatagcatataaagacaaaatgcctacaaaaa-atatgatgaaatctaaaatcatcagaatactcatgcttccggatctgcaacgttg 10332534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 41554769 - 41554733
Alignment:
Q  123 ccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41554769 ccggaatacccatgtctccggatctgcaacgttgacg 41554733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Original strand, 25631365 - 25631585
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25631365 tgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 25631464  T
Q  128 atacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaa 225  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || || | ||    
T  25631465 atatccatggcatccggatctacaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatataaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaa 25631564  T
Q  226 atccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  25631565 atgaaacaacgccgcacaaga 25631585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 39917238 - 39917456
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39917238 gtaaaggatgaatctgtgaataaactcacaacatccaagttaatagcatataaaggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaa 39917337  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  39917338 tatccatgacctccggatctgcaacgttgacggtcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagac-gaaaa 39917436  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || ||||||| || ||||||    
T  39917437 tcaaacaacgtcgtacaaga 39917456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12116311 - 12116113
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca-tgcatccggatctg 148  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||    
T  12116311 aaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgactagaatatccattgcctccggatctg 12116212  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||    
T  12116211 caacgttgacgctcaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaaga 12116113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25162670 - 25162451
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| |||||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25162670 gtaaaggatgaatccgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 25162571  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| | | |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |  | |||    
T  25162570 tatccattacctccggatctgcaacgttgacggtcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaaacaaatgaacaccgcacgaagatgggaaa 25162471  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  25162470 tcaaacaacgccgcacaaga 25162451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32607703 - 32607484
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| | ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  32607703 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaggttaatagcatataatggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgatcggaa 32607604  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  32607603 tattcattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcaatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 32607504  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  32607503 tcaaacaacgccacacaaga 32607484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 44907239 - 44907457
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44907239 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaaattaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaa 44907338  T
Q  129 ta-cccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||  |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || | || |||    
T  44907339 tattcgttgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatatttgattgaacaatcgatctttcaatatgaattaaatgaacaccgcacgaagataggaaa 44907438  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  44907439 tcaaacaacg-cgcacaaga 44907457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 246
Target Start/End: Original strand, 36734569 - 36734751
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  36734569 aagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtaaccgaaatactcatgcctccagatctgcaacgttgacgcccaa 36734668  T
Q  165 atatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  36734669 atctttgattcaataatcgatctttcattatgaatcaaatgaacaccgcaataagacggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 36734751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46178802 - 46178609
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||||| ||  ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46178802 gtaaaagataaaactgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcttacaaaaatatatgataaaataaaagtgaccggaa 46178703  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaataca 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  46178702 tacccatgcctccggatctgcaacgttgacgcccaattctttgattgaataatcaatatttcaatatgaatcaaatgaacactgcaacaataca 46178609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29503696 - 29503477
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||| ||| || | ||| |||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29503696 tgtaaaggatgaatatgcgaacatactcacagaatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 29503597  T
Q  128 atacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaa 225  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||  || || ||||    
T  29503596 atatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcga-tcttcaaaatgaatcagatgaacaccgcaagaagacggaaa 29503498  T
Q  226 atccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| |||| ||||||||||||    
T  29503497 atcaaacagcgccgcacaaga 29503477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42719748 - 42719532
Alignment:
Q  32 aaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatac 131  Q
    |||||||||| | | || |||||||||  ||  |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42719748 aaagatgaatctacgaacaaacttacagtattcaagttaatggcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatat 42719649  T
Q  132 ccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatcc 229  Q
     || | | |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||     
T  42719648 tcacgacctccgaatctgcaacgttgacctccgaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatca 42719549  T
Q  230 aacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||||||||    
T  42719548 aacaacgccgcacaaga 42719532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36906356 - 36906137
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36906356 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgactggaa 36906257  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || | | ||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| || || | |||    
T  36906256 tatctattgcctccggaactgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaattgatctttcaatatgaatcaaatgaacactacacgaagacgggaaa 36906157  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  36906156 tcaaacaacgccgcacaaga 36906137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 49552064 - 49552283
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  49552064 gtaaaggatgaatctgcgaacaaacttacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtcaccggaa 49552163  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  || ||   |||    
T  49552164 tatccatggcctccggatctgcaacgttgatgctcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatgtgaataaaatgaacaccgcaagaaaacgagaaa 49552263  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  49552264 tcaaacaacgccgcacaaga 49552283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17238018 - 17237820
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  17238018 aaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatataataaaattaaagtgaccggaatatccatagcctccggatctg 17237919  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | || |||  | ||| |||||||||||||||||    
T  17237918 caacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatattttaatatgaatcaaatcaacaccgcgcgaaaacaagatatcaaacaacgccgcacaaga 17237820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14464738 - 14464529
Alignment:
Q  35 gatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca 134  Q
    ||||||| ||| || ||||| | |||||| |||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  14464738 gatgaatctgcgaacaaactcagaacatccaagttaatagtatataacagcataatgcctacaaaaatatatgacaaaattaaagtgactggaacatcca 14464639  T
Q  135 -tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaac 232  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||  |||    
T  14464638 ttgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaattaaac 14464539  T
Q  233 aacgccgcac 242  Q
    ||||||||||    
T  14464538 aacgccgcac 14464529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 3848759 - 3848978
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3848759 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatatagcggcataatgcctacaaatatatatgataaaattaaagtcaccggaa 3848858  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || | || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || |  | |||    
T  3848859 tatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagatgggaaa 3848958  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | |||||||||||||||||    
T  3848959 gcaaacaacgccgcacaaga 3848978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Original strand, 38854876 - 38855063
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38854876 gtaaaggatgaatatgcgaaaaaactcacatcatccaagttaataacatataacggtataatgactacaaaaatatatgataaaattaaagtgcccggaa 38854975  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcac 214  Q
    || | || || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38854976 tatcaatggcctccggatttgcaacgttgacgcccaaatattcgattgaataatcgatctttcaatataaatcaaatgaacaccgcac 38855063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31794272 - 31794088
Alignment:
Q  60 catctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    |||| ||||||||||||||| |||   || ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |    
T  31794272 catccaagttaatagcatataacgacgta-tgcctacaacagtatatgataaaattaaactgaccggaatactcatgcctccgaatctgcaacgttgatg 31794174  T
Q  160 tccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaa 244  Q
     |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  31794173 cccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagatagaaaatcaaacaacgccgcacaa 31794088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 46934873 - 46934657
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| | | || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46934873 gtaaaggatgaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacg---acatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 46934777  T
Q  129 tacccatgca-tccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || || | |||    
T  46934776 tatccatgaactccggatctgcaatgttgacgcccaaatcgttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgggaaa 46934677  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  46934676 tcaaacaacaccgcacaaga 46934657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4178768 - 4178580
Alignment:
Q  60 catctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgac 158  Q
    |||| ||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  4178768 catccaagttaatagcatataacagcataatgcctagaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaatgttgac 4178669  T
Q  159 gtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | |||||| |||| ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||  |||||||||||||||||    
T  4178668 gcccaaatctttgtttgaataatggatctttcaatataaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatgaaacaacgccgcacaaga 4178580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 35499040 - 35499257
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| || |||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35499040 gtaaaggatgaatctgcgaaaaaacttacaacatccaaattaatagcatataacgacataatgc--acaaaaatatatgatgaaattaaagtgatcggaa 35499137  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| |  ||||||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  35499138 tatccattgtctccggatttgcaatgttaacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaa 35499237  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  35499238 tcaaacaacgccgcacaaga 35499257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21488321 - 21488106
Alignment:
Q  35 gatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca 134  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||  ||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||    
T  21488321 gatgaatctgcgaataaactcacagtattcaagttaatagcatataagagtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactagaatgctca 21488222  T
Q  135 tgcatccg---gatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatcca 230  Q
    ||| |||    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || | ||||| |    
T  21488221 tgcctcctccagatctacaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatttttcaatatgaatcaaataaacaccgcaagaagacgggaaatcaa 21488122  T
Q  231 acaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||||||||    
T  21488121 acaacgccgcacaaga 21488106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 214
Target Start/End: Original strand, 50611289 - 50611445
Alignment:
Q  60 catctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgac 158  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  50611289 catccaagttaatagcatataactgtataatgcctacaaaaacatatgataaaatttaagtgacccgaatatccatggcctccggatctgcaacgttgac 50611388  T
Q  159 gtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcac 214  Q
    | |||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50611389 gcccaaatcttcgattgaataatcgatctttcaatataaatcaaatgaacaccgcac 50611445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22803264 - 22803037
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||| ||||||  || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22803264 gtaaaggataaatttgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatacatgataaaattaaagtgatcggaa 22803165  T
Q  129 tacc---------catgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaat 218  Q
    ||||         ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22803164 tacccatgtcttccatgcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacgat 22803065  T
Q  219 acagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||   ||||| |||||||||||| ||||    
T  22803064 acgagaaatcaaacaacgccgcataaga 22803037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 30648560 - 30648745
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  30648560 taaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacatattgcctataaaaatatatgataaaattaaagttaccgaaat 30648659  T
Q  130 acccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    |  ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30648660 attcatggccgccggatttgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaataaaatgaacaccgca 30648745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25850038 - 25849825
Alignment:
Q  34 agatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccc 133  Q
    |||||||| ||| || ||||| |||||| | |||||||||| |||| |||  ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||  |    
T  25850038 agatgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagtatataacgacataatgcttacaaaaatatacaataaagttaaagtgactggaatattc 25849939  T
Q  134 atgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaac 232  Q
    |||  |||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||  |||    
T  25849938 atgtctccggatctgcaacgttgacgctaaaatctttaattgaataatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgggaaataaaac 25849839  T
Q  233 aacgccgcacaaga 246  Q
    ||||| ||||||||    
T  25849838 aacgctgcacaaga 25849825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 37169427 - 37169246
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  37169427 aagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgatcaaattaaaatgattggaatacacatatctccggatctgcaacgttgacgtctaa 37169328  T
Q  165 atatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | ||| |||||| ||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  37169327 ttctttaattgaataattga-tcttcgatatgaatcaaatgagcaccgcaacaatacggaaaatcaaacaacgctgcacaaga 37169246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 246
Target Start/End: Original strand, 51202151 - 51202313
Alignment:
Q  86 ataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |  ||    
T  51202151 ataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgggatattcatcgcctccggatttgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaattactga 51202250  T
Q  184 tttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |  |  | ||||| |||||||||||||||||    
T  51202251 tctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgacgatgggaaatcaaacaacgccgcacaaga 51202313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2342640 - 2342522
Alignment:
Q  86 ataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  2342640 ataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatatcctccgaatttgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcga 2342541  T
Q  184 tttttcaatatgaatcaaa 202  Q
    | |||||||||||||||||    
T  2342540 tatttcaatatgaatcaaa 2342522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 52923013 - 52923113
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52923013 aagttaatagcatacaacggtaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 52923111  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  52923112 at 52923113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4711709 - 4711583
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||    
T  4711709 taaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaat 4711611  T
Q  130 acccatgcatccggatctgcaacgttga 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4711610 acccatgcttccggatctgcaacgttga 4711583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Original strand, 50194195 - 50194331
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| | ||  || | ||| |||    
T  50194195 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaa-atatgatgatatctaaatcaccagaa 50194293  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50194294 tactcatgcttccggatctgcaacgttaacgtccaaat 50194331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21916708 - 21916559
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||| ||  || ||||| ||| |||| ||||||||||||||    || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21916708 tgtaaaggatgaatctgagaacaaactcacatcatccaagttaatagcatacaggggcataatatctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgaa 21916609  T
Q  128 atacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  21916608 atatccatggtttccggatctgcaacgttgacgctcaaat-tttgattgaa 21916559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Original strand, 38440496 - 38440602
Alignment:
Q  104 tatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaa 201  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||  |||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38440496 tatgacaaaattaaagtgatcggaatattcatggcctccagatctgcaatgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaa 38440595  T
Q  202 atgaaca 208  Q
    |||||||    
T  38440596 atgaaca 38440602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21431805 - 21431705
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||| ||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21431805 aagttaatatcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 21431707  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  21431706 at 21431705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 40487545 - 40487417
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| |||||| |||    
T  40487545 tgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatataacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatacctatg 40487447  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40487446 cttccggatctgcaatgttgacgtccaaat 40487417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 51923934 - 51923808
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||| |||||||||||| || ||||||||    
T  51923934 aaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgc 51923836  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||    
T  51923835 aacgttgacgtccaaatcattgattgaa 51923808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 21533705 - 21533805
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21533705 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaa 21533803  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  21533804 at 21533805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 51303511 - 51303650
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||| |||||||||||    
T  51303511 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatg 51303609  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  51303610 cttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 51303650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 54149181 - 54149083
Alignment:
Q  67 gttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54149181 gttaatagcatacaacgacataatgcctacaaata-atatgataaaatccaagtcaccgaaatagccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaat 54149083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 166
Target Start/End: Original strand, 48650593 - 48650730
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |    
T  48650593 tgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaa 48650691  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||    
T  48650692 atactcattctttcagatctgcaacgttgacgtccaaat 48650730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 6954564 - 6954692
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | || ||||||||   |||| |||| ||||||||||    
T  6954564 tgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atttgataaaacataagtcaccgaaatacccatg 6954662  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||    
T  6954663 cttccggatctgcagcattgacgtccaaat 6954692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 209
Target Start/End: Original strand, 6910622 - 6910731
Alignment:
Q  99 aaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaa 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||  |||  |||| |||| ||||||  ||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6910622 aaatatatgataaaattaaattgactggaatac--atgtctccatatctacaacattgacgctcaaatctatgattgaataatcgatctttcaatatgaa 6910719  T
Q  198 tcaaatgaacac 209  Q
    ||||||||||||    
T  6910720 tcaaatgaacac 6910731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32701718 - 32701572
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||||||  |||| | |||||||||| | | |||| |||||| | ||||  ||| |||    
T  32701718 taaaaggtgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttcatagcatacaacggcaaaatgcctacagata-atatcataaaacttaagtcgccgaaat 32701620  T
Q  130 acccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  32701619 acccatgcttccggatctacaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 32701572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4822027 - 4821899
Alignment:
Q  36 atgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat 135  Q
    |||||| ||| || ||||| ||| || | ||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||||    
T  4822027 atgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatataacagcaaaatgcctacaaaaa-atatgatgaaattaaa-tcaccagaatacccat 4821930  T
Q  136 gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    || ||||||| || |||||||  ||||||||    
T  4821929 gcctccggatttgtaacgttggtgtccaaat 4821899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 7448782 - 7448910
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| ||| || ||||||||||||||||   ||| | |||| ||||||| | ||||||| ||| | |||| |||| ||||| ||||    
T  7448782 tgaatctgcgaacaaactcacatcacctaagttaatagcatacagcggcaaaatgtctacaaata-atatgatgaaacttaagtcaccgaaatactcatg 7448880  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7448881 cttccggatatgcaacgttgacgtccaaat 7448910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 7456924 - 7457052
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| ||| || ||||||||||||||||   ||| | |||| ||||||| | ||||||| ||| | |||| |||| ||||| ||||    
T  7456924 tgaatctgcgaacaaactcacatcacctaagttaatagcatacagcggcaaaatgtctacaaata-atatgatgaaacttaagtcaccgaaatactcatg 7457022  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7457023 cttccggatatgcaacgttgacgtccaaat 7457052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9998659 - 9998571
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgt 154  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  9998659 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttctggatctgcaacgt 9998571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 45568313 - 45568441
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||||||   || | |||  |||| |||||    
T  45568313 tgaatctgcgaataaactcacatcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcacccaaatatccatg 45568411  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45568412 cttccggatctgcaaagttgacgtccaaat 45568441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Original strand, 30293348 - 30293474
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| || | | ||  | |||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||    
T  30293348 taaaagatgaatctgcaaataaactcatgacatccaagttaatagcatataac-gcaaaacacttacaaata-atatgataaagttaatgtgaccgaaat 30293445  T
Q  130 acccatgcatccggatctgcaacgttgac 158  Q
    || |||||||||| || |||||| |||||    
T  30293446 actcatgcatccgaatttgcaacattgac 30293474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 53807718 - 53807865
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| || | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||| |||  || | ||| |||    
T  53807718 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaccacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgatataatctaaatcaccagaa 53807816  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  53807817 tactcttgcttctggatatgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 53807865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Original strand, 44959841 - 44959939
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  | || | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  44959841 tgaatctgcaaataaactcacagcatccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatg 44959939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10108428 - 10108339
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgtt 155  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||||  ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10108428 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcgccgaaatactcatgcatctggatctgcaacgtt 10108339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14859621 - 14859571
Alignment:
Q  127 aatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14859621 aatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 14859571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 40556922 - 40556794
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||  ||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||  ||||| ||||    
T  40556922 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagtgcatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccaaaatacacatg 40556824  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40556823 cttccggatttacaacgttgacgtccaaat 40556794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 45424967 - 45424879
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  45424967 aatgcctacaaata-atatgataaaatcgaagtcaccgaagtacccatgattccggatctgcaatgttgacgcccaaatcattgattgaa 45424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Original strand, 51628988 - 51629037
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcata 78  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||    
T  51628988 gtaaaagatgaatttgcaaataaattcacatcatttaagttaatagcata 51629037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 628783 - 628930
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||| | |||||||||| |||  |||| | |||||||||||| | |||||||| |||  || | ||| |||    
T  628783 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagaatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgatataatctaaatcaccagaa 628881  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||| | ||| || |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  628882 tactcttgcttctggatctacaacgttgatgtccaaatcattgattgaa 628930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8914904 - 8914793
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||| ||||    
T  8914904 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgatgaaatctaaatcaccagaatacacattcttctggatctgcaacgttgacgcccaa 8914806  T
Q  165 atatttgattgaa 177  Q
    ||  |||||||||    
T  8914805 atcattgattgaa 8914793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16235633 - 16235507
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||  | |||||||||||  | ||||||| ||||  || | ||| |||||||||||| ||  |||||||    
T  16235633 aaactcacaccatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaagta-atatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgcttcttgatctgc 16235535  T
Q  150 aacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  16235534 aacgttgacgcccaaatcattgattgaa 16235507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 6903155 - 6903105
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcata 78  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6903155 tgtaaaggatgaatttacaaacaaactcacaatatctaagttaatagcata 6903105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 7546835 - 7546714
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||| |||||||||||    
T  7546835 tgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatg 7546737  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    | |  ||||| ||||||||||||    
T  7546736 cttttggatcggcaacgttgacg 7546714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10233262 - 10233173
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgtt 155  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  10233262 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgtttctggatctgcaacgtt 10233173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 43017116 - 43017046
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaa 99  Q
    ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  43017116 gtaaaggatgaatatgtgaataaactcacaacacctaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 43017046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Original strand, 46304416 - 46304509
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    ||||||||||||||  |||| |  ||||||||| | | |||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  46304416 aagttaatagcatacaacggcaacatgcctacatata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaatgttgacg 46304509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10229668 - 10229568
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||  ||||| |  ||||||||||||||  |||||||    
T  10229668 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaataatcatgcttttggatctgcaacgttatcgtccaa 10229570  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  10229569 at 10229568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19619941 - 19619814
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| |  ||||| | ||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||    
T  19619941 gtaaatgatgaatctgcgatcaaactcaaaacatcttagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaa 19619843  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgac 158  Q
    | | ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  19619842 ttctcatgc-ttcggatctacaacgttgac 19619814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27856393 - 27856309
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaat 114  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||   |||| | |||||||||||| | ||||||||||||    
T  27856393 gtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatgcaacggaaaaatgcctacaaata-atatgataaaat 27856309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 43016980 - 43016947
Alignment:
Q  133 catgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43016980 catgcatccggatctgcaacgttgacgcccaaat 43016947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Original strand, 43488450 - 43488586
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| || | || |||||||||||  |||| | || ||||| ||| | |||||||||||   || | |||| ||    
T  43488450 gtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaaattaatagcatacaacggcaaaaagcctaaaaata-atatgataaaacctaaatcaccgaaa 43488548  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43488549 tactcatgcttccggatctgcaacgttgacgttcaaat 43488586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Original strand, 46322353 - 46322414
Alignment:
Q  183 atttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaa 244  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||| ||| ||||    
T  46322353 atttttcaatatgaaccaaatgaacaccgcaacaagacggaaaaacaaacaacaccgtacaa 46322414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Original strand, 4396365 - 4396425
Alignment:
Q  186 tttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||  |  |||||| ||||||||| |||||||    
T  4396365 tttcaatatgaatcaaacgaacaccgcaacaaggcgcaaaatcaaacaacgccacacaaga 4396425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21313228 - 21313117
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||| ||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||  | | ||| ||| ||||||||||||||    
T  21313228 aagttaatagcatacaacggcaaaatggctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatactcatgatttcagatatgctacgttgacgtccaa 21313130  T
Q  165 atatttgattgaa 177  Q
    ||  |||||||||    
T  21313129 atcattgattgaa 21313117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 177
Target Start/End: Original strand, 31271768 - 31271816
Alignment:
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  31271768 tacccatgcttccggatctgcattgttgacgcccaaatctttgattgaa 31271816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32684905 - 32684686
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| | | || ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32684905 gtaaaggatgaatctacgaacaaacttacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccggaa 32684806  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || ||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  32684805 tatccatggcctccagatctgtaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatatttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaa 32684706  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  32684705 tcaaacaacgccgcacaaga 32684686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42311515 - 42311298
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||  || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42311515 gtaaaggatgaatttgcgaacaaact--cagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcgtacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 42311418  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||    
T  42311417 tatccatgacctccggatctgcaacgttgacggccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacatcgcacgaagacggaaaa 42311318  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||| ||| ||||    
T  42311317 tcaaacaacgctgcataaga 42311298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 46822252 - 46822033
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  46822252 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgatcggaa 46822153  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    ||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  46822152 tattcattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatcttttaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 46822053  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  46822052 tcaaacaacgccgcacaaga 46822033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Original strand, 22927709 - 22927929
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| ||| || | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22927709 tgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcaaccaagttgatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccgga 22927808  T
Q  128 atacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaa 225  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || || | ||    
T  22927809 atatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaa 22927908  T
Q  226 atccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  22927909 agcaaacaacgccgcacaaga 22927929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34773948 - 34773729
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34773948 gtaaaggataaatctgcaaacaaactcacagcatccaagttaatagtatataacgatataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgactggaa 34773849  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||    
T  34773848 tatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacgatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacaggaaa 34773749  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  34773748 tcaaacaacgccgcataaga 34773729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35261533 - 35261353
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261533 taaaggatgaatctgcgaacaaactcacaatatccaagttaatagcatacaacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 35261434  T
Q  130 acccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacac 209  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  35261433 acacatgcctccggatctgcaacattgacgtctaaatctttgattgaataatcgatcttttaatatgaatcaaatgaacac 35261353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26492602 - 26492383
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||||||||||| ||  || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26492602 gtaaaagatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 26492503  T
Q  129 ta-cccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | || || | |||    
T  26492502 tatccaaggcatccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgacctttcaatatgaatcaaatgaacatcgcgcgaagacgggaaa 26492403  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  26492402 tcaaacaacgcagcacaaga 26492383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Original strand, 1448697 - 1448887
Alignment:
Q  56 acaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgt 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  1448697 acaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatagggtccggatctgcaacgt 1448796  T
Q  155 tgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaa 244  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||| |||||||||||||||    
T  1448797 tgacatccaaatctttgattgaataatggatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgagaaatcaaacaacgccgcacaa 1448887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Original strand, 35496036 - 35496234
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||    
T  35496036 aaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccgaaatatccatggcctccggatctg 35496135  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |  || | ||||  |||||||||||||||||    
T  35496136 caacgttgacgcccaaatcttcgattgaataatcgatctttcaatataaatcaaatgaacaccgcacgaggacgggaaatgaaacaacgccgcacaaga 35496234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 236
Target Start/End: Original strand, 2843081 - 2843290
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||  || ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2843081 gtaaaggatgaatatgtgaacaaactcacagcatctaagctaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaa 2843180  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| |||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  2843181 tatccattgcctccggatctgcaacattgacgctcaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaa 2843280  T
Q  227 tccaacaacg 236  Q
    || |||||||    
T  2843281 tcaaacaacg 2843290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6559083 - 6558895
Alignment:
Q  60 catctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgac 158  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  6559083 catccaagttaatagcatataacgacataatgcttgcaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttgac 6558984  T
Q  159 gtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||||||| || ||||||    
T  6558983 gcccaaatctttgattgaataatcgatttttcaaaatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcgaacaacgtcgtacaaga 6558895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 194
Target Start/End: Original strand, 13592348 - 13592515
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13592348 tgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatcgaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccaga 13592447  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| || ||||||    
T  13592448 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaataatcgatcttccaatat 13592515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Original strand, 433531 - 433713
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  433531 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaa 433630  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacac 209  Q
    ||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  433631 tattcatggcctccggatctgcaacgttaacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacac 433713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 17222841 - 17223058
Alignment:
Q  30 taaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17222841 taaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttactagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccagaat 17222940  T
Q  130 acccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaat 227  Q
    | ||||| | | |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || |  ||||||    
T  17222941 atccatggccttcaaatctgcaacgttgacatccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacac-gcatgaagaaggaaaat 17223039  T
Q  228 ccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  17223040 caaaccacgccgcacaaga 17223058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Original strand, 32521764 - 32521993
Alignment:
Q  24 aaattgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 123  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  32521764 aaatcgtaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaataaaagtgtc 32521863  T
Q  124 cggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacag 222  Q
     ||||||| |||||  ||||| | ||||| |||| | | |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| || |    
T  32521864 tggaatactcatgc-cccggaacagcaacattgatgcctaaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccacaacaaaacgg 32521962  T
Q  223 aaaatccaacaacgccgcacaagatgccgaa 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32521963 aaaatcaaacaacgccgcacaagatgacgaa 32521993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20116818 - 20116600
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20116818 gtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatat-acgacataatgcctacaaaaatatttgataaaattaaagtgaccggaa 20116720  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || | ||| | || || ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || || | |||    
T  20116719 tatctatgacctctgggtctgcaacgttgacgcccaaagttttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacggtaaa 20116620  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  20116619 tcaaacaacgacgcacaaga 20116600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 35667072 - 35667291
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35667072 gtaaatgatgaatttgtgaacaaactcacgacatccaagttaatatcatataacaacataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 35667171  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||    
T  35667172 tatccatggcctccgaatctgcaacattgacgctcaaatcgttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacggaaaa 35667271  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || || ||||||||||||||    
T  35667272 tcaaaaaacgccgcacaaga 35667291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 46339291 - 46339072
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||  || ||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||  ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46339291 gtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacgacataatgcatgcaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaa 46339192  T
Q  129 taccca-tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||| ||| | || |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||    
T  46339191 tatccattgccttcgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatagatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgtacgaagacggaaaa 46339092  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||||||||    
T  46339091 tcaaacaacgccgcacaaga 46339072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20083576 - 20083356
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||||| | |||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20083576 tgtaaatgatgaatctgcgaacaaactaataacatcaaagttaatagcgtataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccgga 20083477  T
Q  128 ata--cccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaaaatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaa 225  Q
    |||  | ||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || || ||| ||||||||||| ||| || | ||    
T  20083476 atactcacatgtctccggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaaaatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacgggaa 20083377  T
Q  226 atccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| ||||||| | |||||||    
T  20083376 atcaaacaacgtctcacaaga 20083356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23786812 - 23786593
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23786812 gtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcatctaagttgatagcatataacaacataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtgacaggaa 23786713  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || ||||| | || ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||    
T  23786712 tatccatgacctcgggatctggaacgttgacgtttaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgagaaa 23786613  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  23786612 tcaaacaacgccgcagaaga 23786593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23085758 - 23085572
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||  ||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23085758 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagtatccaaattaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaa 23085659  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    || |||| |  ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23085658 tatccatggtctccagatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaataaaatgaacaccgca 23085572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 246
Target Start/End: Original strand, 31235631 - 31235851
Alignment:
Q  36 atgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatac---- 131  Q
    |||||||||  || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||        
T  31235631 atgaatttgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatacatgataaaattaaagtgatcggaatacccat 31235730  T
Q  132 -----ccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaa 225  Q
         |||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||    
T  31235731 gtcttccatgcctccggatttgcaacgttgacgctcaaagatttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacgatacgagaa 31235830  T
Q  226 atccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| |||||||| ||||||||    
T  31235831 atcaaacaacgctgcacaaga 31235851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 246
Target Start/End: Original strand, 42066929 - 42067120
Alignment:
Q  56 acaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgt 154  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  42066929 acaacatccaagttaatagcacatatcggcgttatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcttccggatctgcaacgt 42067028  T
Q  155 tgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||| |||| ||||||||||||    
T  42067029 tgacgcccaaatctttgattgaataatcga-tcttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgagaaatcaaacagcgccgcacaaga 42067120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48208138 - 48207919
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaa-tagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    ||||| ||||||| ||| || | ||| |||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48208138 gtaaaggatgaatctgcgaaaatactcacaacatccaagttaaatagcatataacggcataatgccaacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 48208039  T
Q  128 atacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattg-aaaatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaa 225  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || | ||||| |||||||||||||||||||||  || || | ||    
T  48208038 atatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgtataatgga-tcttcaaaatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgggaa 48207940  T
Q  226 atccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| |||| ||| ||||||||    
T  48207939 atcaaacagcgcagcacaaga 48207919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Original strand, 1485096 - 1485283
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatg-ataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  1485096 gtaaaggatgaatctgcgaacaagtttacaacatccaagttaatagcatataagggcataatgcctacaaaaatatatgaaaaaaattaaagtcaccgga 1485195  T
Q  128 atacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    ||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  1485196 atatccatggcctccggatctgcaatgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatttttcaattggaataaaatgaataccgca 1485283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 101 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42408527 - 42408380
Alignment:
Q  101 atatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaat 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42408527 atatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatggcattcggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaat 42408428  T
Q  199 caaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  42408427 caaatgaataccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgctgcacaaga 42408380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19560199 - 19560053
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtcca 163  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||| |||||||||||    
T  19560199 aagttaatagcatataacggcataatgtgtacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggtctccggatctgcaaggttgacgtcca 19560100  T
Q  164 aatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacac 209  Q
    ||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  19560099 aatctttgattgaataatcaatctttcaatatgaatcaaatgaacac 19560053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 244
Target Start/End: Original strand, 45198873 - 45199089
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || | ||| |||||||| |||||||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45198873 gtaaaggatgaatctgcgaacatactcacaacatccaagttaatagtatataacgacataatacctacaaaaatatatgataaaatcaaagtgaccggaa 45198972  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||||||||||  || || | |||    
T  45198973 tatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataaccga-tcttcaaaatgaatcagatgaacaccgcaagaagacgggaaa 45199071  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaa 244  Q
    || |||| ||||||||||    
T  45199072 tcaaacagcgccgcacaa 45199089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26583947 - 26583732
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacat-ctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| || ||| ||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26583947 gtaaaggatgaatctgcgaataagctcacagcattcaaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 26583848  T
Q  128 atacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaa 225  Q
    |||  |||| | |||| ||||||||||||||||      | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || || | ||    
T  26583847 atattcatgacctccgaatctgcaacgttgacg-----ctctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacattgcacgaagactggaa 26583753  T
Q  226 atccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  26583752 atcaaacaacgccgcacaaga 26583732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 247
Target Start/End: Original strand, 46818279 - 46818476
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcc-tacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctg 148  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||    
T  46818279 aaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgtcgtacaaaaatatatgataaaattaaagtgaacggaatacacatgactctggatctg 46818378  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaagat 247  Q
    |||||||| || |||| | ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  46818379 caacgttg-cg-ccaattctttgactgaacaatcgatcttttaatatgaattaaatgaacaccgcaacaatacgagaaatcaaacaacgccgcacaagat 46818476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Original strand, 7640615 - 7640779
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  7640615 gtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctataaaaatatatgatgaaattaaagtgaccagaa 7640714  T
Q  129 tacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaa 191  Q
    || ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7640715 tatccatgacatccagatttgcaatgttgacgcccaaatatttgattgaataatcgatctttcaa 7640779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 244
Target Start/End: Original strand, 14627777 - 14627936
Alignment:
Q  87 taatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgat 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||    
T  14627777 taatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatattcatggcctccgaatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaataatcgat 14627876  T
Q  185 ttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaa 244  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| || || ||   ||||| |||||||||||||||    
T  14627877 ctttcaatatgaatcaaataaacaccgtactaagacgagaaatcaaacaacgccgcacaa 14627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21266627 - 21266442
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||| ||  || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  21266627 gtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtcaccgaaa 21266528  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgca 213  Q
    ||  ||| || ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21266527 tattcatggcctccggatctgcaacgttgatgctcaaatctttgattgaataatcga-tcttcaatatgaatcagatgaacaccgca 21266442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6002246 - 6002039
Alignment:
Q  47 aataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg---------c 137  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||         |    
T  6002246 aataaactcacatcatccaagttaatagcata--atggcataatgcctacaaaaatacatgataaaattaaggtgaccggaatactcatgtcttccatac 6002149  T
Q  138 atccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacg 236  Q
     | |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||   ||||| |||||||    
T  6002148 cttcggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcgacgatacgagaaatcaaacaacg 6002049  T
Q  237 ccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||    
T  6002048 ccgcacaaga 6002039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 246
Target Start/End: Original strand, 23425244 - 23425431
Alignment:
Q  60 catctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgac 158  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||| ||||     
T  23425244 catccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaagtaaagtgactagaatatccatggcctccggatctgcaacattgat 23425343  T
Q  159 gtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | |||||| |||| || || |||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||  || || | ||||| |||| | ||||||||||    
T  23425344 gcccaaatctttgttttaataatcga-tcttcaaaataaatcagatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacagcaccgcacaaga 23425431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19297093 - 19296965
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | || |||||||||||| || | | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  19297093 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaaattaatagcatataacagcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagttaccgaaatacccatg 19296995  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19296994 cttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 19296965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 157
Target Start/End: Original strand, 43369614 - 43369741
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||| |||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||  |||| | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  |||    
T  43369614 gtaaaggataaatttgtaaacaaacttacatcatacaagttaatatcatacaacggcaaaatgcctataaata-atatgataaaattaaagtgactagaa 43369712  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttga 157  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43369713 tactcatgcatccggatctgcaacgttga 43369741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Original strand, 12141167 - 12141304
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatct-aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||| |||||| |  ||||||||||||||  |||| | ||||| |||||| | ||||||||||||  |||| |||| |    
T  12141167 gtaaaaggtgaatatgcgaacaaactcacaacaacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaa 12141265  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12141266 atacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 12141304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17611303 - 17611143
Alignment:
Q  72 tagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttg 171  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||               | || ||||  ||||| ||||    
T  17611303 tagcatatagcgatataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaaatgaccgaaatacccat---------------atgtcgacgctcaaatctttg 17611219  T
Q  172 attgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17611218 attgaataatcaatctttcaatatgaatcaaatgaacactgcaacaagacagaaaatcaaacaactccgcacaaga 17611143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 34899475 - 34899603
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| | ||||| |||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  34899475 tgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatg 34899573  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||    
T  34899574 cttccgaatttgcaacgttgacgtccaaat 34899603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 39171486 - 39171586
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39171486 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 39171584  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  39171585 at 39171586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Original strand, 17499548 - 17499623
Alignment:
Q  56 acaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatac 131  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17499548 acaacaacaaagttaatagcatataacgacattatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatac 17499623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17553666 - 17553591
Alignment:
Q  56 acaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatac 131  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17553666 acaacaacaaagttaatagcatataacgacattatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatac 17553591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38799004 - 38798876
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||| | ||||    
T  38799004 tgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataagacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaattcacatg 38798906  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  38798905 cttccggatcttcaatgttgacgcccaaat 38798876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 166
Target Start/End: Original strand, 30756701 - 30756815
Alignment:
Q  51 aacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgca 150  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |||  | |||||||| ||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  30756701 aacttacaacacctaagttaacagcataaaacgacaaaatgcctataaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgca 30756799  T
Q  151 acgttgacgtccaaat 166  Q
    ||||||| ||||||||    
T  30756800 acgttgatgtccaaat 30756815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 9450005 - 9450133
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||||||   || | ||   ||||||||||    
T  9450005 tgaatatgcgaacaaactcacaacacctaaattaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcactaaaatacccatg 9450103  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9450104 cttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 9450133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 159
Target Start/End: Original strand, 13796810 - 13796918
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgc 149  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  13796810 aaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcacctaaatactcatgcttccggatctgc 13796908  T
Q  150 aacgttgacg 159  Q
    ||||||||||    
T  13796909 aacgttgacg 13796918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 42978819 - 42978705
Alignment:
Q  51 aacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgca 150  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||  |||| | |||||||||| | | |||||||||||   |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  42978819 aactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacatata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatccttccggatctgca 42978721  T
Q  151 acgttgacgtccaaat 166  Q
    ||||||||| ||||||    
T  42978720 acgttgacgcccaaat 42978705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 46700229 - 46700119
Alignment:
Q  66 agttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaa 165  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| ||| | ||||||||||||  |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  46700229 agttaatagcatataacggcaaaatgcctataaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatatccatgcttccggatctgcaacgctgatgcccaaa 46700131  T
Q  166 tatttgattgaa 177  Q
    |  |||||||||    
T  46700130 tcattgattgaa 46700119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Original strand, 19404616 - 19404764
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| |   |||| | || ||||||||| | ||||||||||||  |||| || | |    
T  19404616 tgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcgtgcaacggcaaaaagcctacaaata-atatgataaaatctaagtcactgaa 19404714  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||    
T  19404715 atactcatgcttccggatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 19404764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Original strand, 24069290 - 24069401
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||||||||||| | ||||||||||||  || | ||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  24069290 aagttaatagcatacaacgataaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaaatcaccagaatcctcatgcttccgggtctgcaacgttgacgttcaa 24069388  T
Q  165 atatttgattgaa 177  Q
    ||  |||||||||    
T  24069389 atcattgattgaa 24069401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 47590528 - 47590406
Alignment:
Q  43 tgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccg 142  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||  |||| | |||||||||||| | |||||||||||   ||||  ||| ||||| ||||| ||||    
T  47590528 tgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcttacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcgccgaaatactcatgcttccg 47590430  T
Q  143 gatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||    
T  47590429 gatgtgcaacgttgacgcccaaat 47590406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 177
Target Start/End: Original strand, 24350772 - 24350846
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||||| ||||| || | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  24350772 atatgatgaaatttaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 24350846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 210
Target Start/End: Original strand, 46244171 - 46244292
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaaaatcgatttt 187  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| | |||  | || | ||||||||||||||  |||||  |||||  | || |||||||    
T  46244171 aatgcctacaaata-atatgataaaattaaagtgaccaaaatatcaatgtcttcgaacctgcaacgttgacgctcaaatcattgatgaataaccgatttt 46244269  T
Q  188 tcaatatgaatcaaatgaacacc 210  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  46244270 tcaataggaaccaaatgaacacc 46244292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 8001442 - 8001542
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||| ||| | |||||||||||   |||| |||| ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  8001442 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctataaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgattccgaatctgcaacgttgacgtccaa 8001540  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  8001541 at 8001542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 37837354 - 37837454
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||||||  | |||||||||||   |||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37837354 aagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaagta-atatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaa 37837452  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  37837453 at 37837454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 48316708 - 48316808
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| | |||||||||||   || |  ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  48316708 aagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcgccgaaatacccatgcttccggatctgcagcgttgacgtccaa 48316806  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  48316807 at 48316808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Original strand, 24069425 - 24069485
Alignment:
Q  186 tttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||||||    
T  24069425 tttcaatatgaatcaaacgaacaccgcaacaatacgccaaatcaaaaaacgccgcacaaga 24069485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 166
Target Start/End: Original strand, 28044645 - 28044752
Alignment:
Q  58 aacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttga 157  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||| | |||| ||| ||| | |||||||||||   || | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28044645 aacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctaaaaata-atatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttga 28044743  T
Q  158 cgtccaaat 166  Q
    ||| |||||    
T  28044744 cgttcaaat 28044752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 177
Target Start/End: Original strand, 4999962 - 5000036
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    ||||||||||||| || | ||| |||||  ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4999962 atatgataaaatttaaatcaccagaatattcatgcttccagatcagcaacgttgaagtccaaataattgattgaa 5000036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 27341760 - 27341691
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagt 120  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||| |||||||| ||||    
T  27341760 aaacttataacatcaaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaata-atattataaaatttaagt 27341691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 99
Target Start/End: Original strand, 5348473 - 5348522
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaa 99  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  5348473 aaactaacaacatccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctacaaa 5348522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 40993380 - 40993252
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||| ||||  |||  | |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  40993380 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatg 40993282  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | || | || |||||||||||  |||||||    
T  40993281 cttctgaatatgcaacgttgaaatccaaat 40993252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Original strand, 3267085 - 3267206
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaata-tatgataaaattaaagtgaccggaatacccat 135  Q
    ||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||||  ||||||| |||||||||||  |||| |||| |||  ||||    
T  3267085 tgaatttacgaacaaactcacaacttctaagttaatagcatatagcggtaacatgcct--aaaaatagtatgataaaatataagtcaccgaaatctccat 3267182  T
Q  136 gcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    || | ||||| ||||| |||||||    
T  3267183 gctttcggatgtgcaatgttgacg 3267206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 42978904 - 42978876
Alignment:
Q  1 caaaaacaaaacgatattcattcaaattg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42978904 caaaaacaaaacgatattcattcaaattg 42978876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 42979077 - 42979049
Alignment:
Q  1 caaaaacaaaacgatattcattcaaattg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42979077 caaaaacaaaacgatattcattcaaattg 42979049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0495 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0495
Description:

Target: scaffold0495; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5635 - 5416
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5635 gtaaaggatgaatttgcgaacaaacttacagtatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaa 5536  T
Q  129 tacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaa 226  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||  ||| ||||||||||| ||  || || | |||    
T  5535 tatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcaatctttcaatagaaataaaatgaacaccacaagaagacgggaaa 5436  T
Q  227 tccaacaacgccgcacaaga 246  Q
     | |||||||||||||||||    
T  5435 gcaaacaacgccgcacaaga 5416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Original strand, 16181 - 16379
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctg 148  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  16181 aaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatataataaaattaaagtgaccggaatatccatagcctccggatctg 16280  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | || |||  | ||| |||||||||||||||||    
T  16281 caacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatattttaatatgaatcaaatcaacaccgcgcgaaaacaagatatcaaacaacgccgcacaaga 16379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8892 - 8745
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtcca 163  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| |||    
T  8892 aagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccagaatatccatggtctccggatctgcaacgttgacgccca 8793  T
Q  164 aatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacacc 210  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8792 aatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacacc 8745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 83276 - 83497
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataat--gcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgg 126  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  83276 gtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatatgcctacaaaaatgtatggtaaaattaaagtgaccgg 83375  T
Q  127 aatacccatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaa 224  Q
    || | ||||| | || | |||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||   |    
T  83376 aaaatccatgacctctgaatctgcaacgttgacggccaaatcttcgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaataccgcacgaagacgaga 83475  T
Q  225 aatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  83476 aatcaaacaacgccgcacaaga 83497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 246
Target Start/End: Original strand, 361666 - 361858
Alignment:
Q  56 acaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgt 154  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| || ||||||||| ||||||    
T  361666 acaacatccaagttaacaacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgagaaaattaaagtgactggagtatccatggcctccggatctacaacgt 361765  T
Q  155 tgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||  || ||||  || ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  361766 tgacgtccaaatctttgattgaataattaatctttctgtaagaatcaaatgaacactgcaccaagacaggaaatcaaacaacgccgcacaaga 361858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6521 - 6323
Alignment:
Q  50 aaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg-catccggatctg 148  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| | |  |||||||    
T  6521 aaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcatacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccggattattcatggcctttggatctg 6422  T
Q  149 caacgttgacgtccaaatatttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||| ||||| |||| ||||||    
T  6421 caacgttgatgcccaaatatttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacaatgccgtacaaga 6323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 210
Target Start/End: Original strand, 201252 - 201395
Alignment:
Q  68 ttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccat-gcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  201252 ttaatagcatataacggcatgatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctacggatctacaacgttgacgcccaaat 201351  T
Q  167 atttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacacc 210  Q
     |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  201352 ctttgattgaataatcga-tcttcaatatgaatcaaatgaacacc 201395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 51037 - 50869
Alignment:
Q  1 caaaaacaaaacgatattcattca----aattgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctac 96  Q
    |||||||||||||| |||||||||    || |||||| | ||||| ||| || ||||| ||| || | ||||||||||||||  | || | |||||||||    
T  51037 caaaaacaaaacgacattcattcattaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctac 50938  T
Q  97 aaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||| | ||||||||||| | |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50937 aaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatatccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaat 50869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 207
Target Start/End: Original strand, 34628 - 34800
Alignment:
Q  35 gatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaataccca 134  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||  ||   | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  34628 gatgaatctgcgaacaaacttacaacatctaagttaaaggcatacaacaacaaaatgcctacaaata-atatgataaaattaaagtgactggaaaactca 34726  T
Q  135 tgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattg-aaaatcgatttttcaatatgaatcaaatgaac 207  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||   ||||  ||||||| | | | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  34727 tgtctccggatttgcaacgttgacgcataaatcattgattgcatagtagatctttcaatatgaatcaaatgaac 34800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Original strand, 57948 - 58084
Alignment:
Q  29 gtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 128  Q
    ||||| ||| ||| ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||| |||    
T  57948 gtaaaggataaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaa-atatgatgaaatctaaatcaccagaa 58046  T
Q  129 tacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  58047 tactcatgcttccggatctgcaatgttgacgtccaaat 58084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15685 - 15585
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaa 164  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15685 aagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatatccatgcttccggatctgcaatgttgacgtccaa 15587  T
Q  165 at 166  Q
    ||    
T  15586 at 15585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 454029 - 453950
Alignment:
Q  168 tttgattgaa-aatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  454029 tttgattgaataatcgatctttcaatatgagtcaaatgaacaccgcaacaagactgaaaatcaaacaacgccgcccaaga 453950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 454094 - 454042
Alignment:
Q  85 tataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||    
T  454094 tataatgcttacaaaaatatataataaaattaaagtgacgaaaatacccatgc 454042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6260 - 6028
Alignment:
Q  28 tgtaaaagatgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgga 127  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | | ||   | |||| ||||||| | ||||||||||||  || | ||| ||    
T  6260 tgtaaaaggtgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagcttgtaacaacaaaatgtctacaaata-atatgataaaatctaaatcaccaga 6162  T
Q  128 atacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaaaatc-gatt--------------tttcaatatgaatcaaatgaacaccgc 212  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||  ||||              |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6161 atacacatgcttccggatctgcaacattgacatccaaatcattgattgaatatgtgattgactgaagttaacatttcaatatgaaccaaatgaacaccgc 6062  T
Q  213 accaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    | ||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  6061 aacaatacgcgaaatcaaacaacgccgcacaaga 6028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 166
Target Start/End: Original strand, 32666 - 32743
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32666 aatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatactcatgcttccagatctgcaacgttgacgtccaaat 32743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 177
Target Start/End: Original strand, 92415 - 92503
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  92415 aatgcctacaaaca-atatgataaaatttaaactaccagaatacccatgcttctggatctacaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 92503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 177
Target Start/End: Original strand, 1731 - 1826
Alignment:
Q  81 acggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaaatatttgattgaa 177  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||    
T  1731 acggtaaaatgcctacaaata-atatgataaaatataagtcatcgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttggtgcccaaatcattgattgaa 1826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 156
Target Start/End: Original strand, 65938 - 66028
Alignment:
Q  65 aagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttg 156  Q
    ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  65938 aagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaacataagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttg 66028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1565 - 1437
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | |||||||||||   || | |||| ||| | ||||    
T  1565 tgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcaccgaaattcacatg 1467  T
Q  137 catccggatctgcaacgttgacgtccaaat 166  Q
    | ||  || |||||||||||||| ||||||    
T  1466 cttctagaactgcaacgttgacgcccaaat 1437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 157
Target Start/End: Original strand, 31207 - 31261
Alignment:
Q  103 atatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttga 157  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31207 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacattga 31261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 93277 - 93204
Alignment:
Q  88 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgtcc 162  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| || | ||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  93277 aatgcctacaaaca-atatgataaaatttaaatcaccagaatacccatatttctggatctgcaacgttgacgtcc 93204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 20402 - 20455
Alignment:
Q  193 atgaatcaaatgaacaccgcaccaatacagaaaatccaacaacgccgcacaaga 246  Q
    |||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  20402 atgaatcaaatgaacaccgcaagaaaacggaaaatcaaacaacgtcgcacaaga 20455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1665
Alignment:
Q  37 tgaatttgcaaataaacttacaacatctaagttaatagcatatgacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg 136  Q
    ||||| ||| || ||||| ||| |||| || |||||||||||| ||| || |||||||||||| | ||||||||||||  || | ||| |||||||||||    
T  1546 tgaatctgcgaacaaactcacatcatcaaaattaatagcatataacgataaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaaatcaccagaatacccatg 1644  T
Q  137 catccggatctgcaacgttga 157  Q
      || |||||| | |||||||    
T  1645 tttctggatctactacgttga 1665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35372 - 35336
Alignment:
Q  123 ccggaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacg 159  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  35372 ccggaatactcatgtatccggatctgcaacgttgacg 35336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University